View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1200_low_16 (Length: 342)

Name: NF1200_low_16
Description: NF1200
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1200_low_16
NF1200_low_16
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (13-195)||(41653895-41654077)
chr8 (13-197)||(32984075-32984259)
chr8 (13-195)||(24079901-24080083)
chr8 (13-200)||(40435148-40435335)
chr8 (13-196)||(43328707-43328890)
chr8 (14-195)||(10646124-10646305)
chr8 (13-194)||(37301326-37301507)
chr8 (13-197)||(9303572-9303756)
chr8 (13-197)||(33730639-33730823)
chr8 (13-197)||(37956421-37956605)
chr8 (13-196)||(5946047-5946230)
chr8 (13-196)||(6365986-6366169)
chr8 (14-209)||(44088429-44088624)
chr8 (13-195)||(41862220-41862402)
chr8 (14-191)||(31830959-31831136)
chr8 (16-196)||(25185902-25186082)
chr8 (13-197)||(33981661-33981845)
chr8 (12-199)||(2275912-2276098)
chr8 (12-195)||(9734254-9734435)
chr8 (14-197)||(17718720-17718903)
chr8 (18-193)||(32114254-32114429)
chr8 (13-200)||(9013684-9013870)
chr8 (13-197)||(13760644-13760830)
chr8 (13-196)||(45236564-45236747)
chr8 (13-195)||(37419940-37420122)
chr8 (14-195)||(2714550-2714730)
chr8 (13-197)||(13356118-13356302)
chr8 (13-197)||(41231946-41232130)
chr8 (13-194)||(41639914-41640095)
chr8 (13-197)||(45066590-45066774)
chr8 (13-172)||(29048426-29048585)
chr8 (13-195)||(35628777-35628959)
chr8 (13-194)||(22878391-22878572)
chr8 (13-195)||(25248039-25248215)
chr8 (13-196)||(45258510-45258692)
chr8 (69-197)||(12032986-12033114)
chr8 (62-195)||(3904126-3904258)
chr8 (79-195)||(41981534-41981650)
chr8 (13-196)||(4447294-4447466)
chr8 (13-195)||(10378309-10378480)
chr8 (82-198)||(31336163-31336279)
chr8 (14-183)||(42701301-42701471)
chr8 (14-200)||(3211207-3211381)
chr8 (13-208)||(31940315-31940498)
chr8 (13-195)||(2379140-2379311)
chr8 (28-189)||(40649837-40649987)
chr8 (13-201)||(33896837-33897013)
chr8 (14-195)||(117329-117499)
chr8 (13-195)||(9713689-9713857)
chr8 (13-200)||(40458767-40458943)
chr8 (13-200)||(41843253-41843429)
chr8 (13-120)||(39915887-39915994)
chr8 (13-197)||(3490397-3490570)
chr8 (13-178)||(38631652-38631806)
chr8 (13-89)||(27243234-27243310)
chr8 (13-89)||(27254809-27254885)
chr8 (13-197)||(26196315-26196487)
chr8 (46-112)||(41981466-41981532)
chr8 (15-190)||(4975412-4975576)
chr8 (13-196)||(9509399-9509571)
chr8 (18-189)||(32373733-32373892)
chr8 (14-78)||(33622571-33622635)
chr8 (19-82)||(164728-164791)
chr8 (13-89)||(31148985-31149061)
chr8 (130-195)||(39901674-39901739)
chr8 (126-195)||(33622467-33622535)
chr8 (123-195)||(41425429-41425500)
[»] chr1 (112 HSPs)
chr1 (13-195)||(25058688-25058870)
chr1 (13-199)||(31308001-31308187)
chr1 (13-197)||(17994949-17995133)
chr1 (13-201)||(45538153-45538341)
chr1 (14-196)||(38790196-38790378)
chr1 (13-197)||(44661970-44662154)
chr1 (13-195)||(3611136-3611318)
chr1 (13-195)||(25678259-25678441)
chr1 (13-197)||(31040709-31040893)
chr1 (13-195)||(21139412-21139594)
chr1 (13-195)||(24245025-24245207)
chr1 (12-198)||(26524886-26525072)
chr1 (13-198)||(49253972-49254157)
chr1 (13-197)||(5981170-5981354)
chr1 (13-196)||(39646568-39646751)
chr1 (15-189)||(4068689-4068863)
chr1 (13-195)||(5980068-5980250)
chr1 (13-195)||(26277177-26277359)
chr1 (13-191)||(26794304-26794482)
chr1 (15-193)||(43251713-43251891)
chr1 (13-195)||(47671586-47671768)
chr1 (13-197)||(6327546-6327729)
chr1 (13-197)||(23984755-23984939)
chr1 (13-196)||(33884088-33884271)
chr1 (13-196)||(33959981-33960164)
chr1 (13-195)||(46967041-46967223)
chr1 (13-197)||(23932507-23932691)
chr1 (13-197)||(24885501-24885685)
chr1 (13-197)||(38331857-38332041)
chr1 (13-195)||(26085398-26085579)
chr1 (13-195)||(33112818-33112999)
chr1 (13-195)||(37620192-37620374)
chr1 (14-196)||(50774218-50774400)
chr1 (13-197)||(47187105-47187289)
chr1 (13-196)||(41999815-41999998)
chr1 (13-195)||(35273596-35273778)
chr1 (13-195)||(36566330-36566512)
chr1 (13-195)||(51057071-51057253)
chr1 (13-194)||(3285402-3285582)
chr1 (13-200)||(35692658-35692846)
chr1 (12-195)||(47383732-47383915)
chr1 (13-191)||(23220939-23221111)
chr1 (15-182)||(42863867-42864034)
chr1 (13-196)||(46616549-46616732)
chr1 (14-192)||(28888582-28888760)
chr1 (13-167)||(31844376-31844530)
chr1 (13-195)||(49398988-49399170)
chr1 (13-195)||(27983603-27983769)
chr1 (14-195)||(47317316-47317497)
chr1 (13-195)||(46784423-46784605)
chr1 (13-197)||(42313359-42313547)
chr1 (14-197)||(36003131-36003317)
chr1 (13-197)||(48373504-48373679)
chr1 (14-151)||(25518815-25518952)
chr1 (48-195)||(2450529-2450676)
chr1 (54-195)||(51045596-51045737)
chr1 (13-198)||(33073211-33073385)
chr1 (13-195)||(33187340-33187505)
chr1 (13-201)||(41467626-41467803)
chr1 (12-178)||(51403034-51403190)
chr1 (67-198)||(4808699-4808830)
chr1 (13-197)||(10928067-10928240)
chr1 (13-195)||(2657303-2657474)
chr1 (50-192)||(45475848-45475987)
chr1 (63-197)||(47772170-47772304)
chr1 (12-194)||(6626025-6626196)
chr1 (13-199)||(26685856-26686031)
chr1 (91-208)||(4156472-4156589)
chr1 (13-196)||(5961266-5961438)
chr1 (15-132)||(31979998-31980115)
chr1 (103-195)||(13312531-13312623)
chr1 (13-195)||(38716247-38716418)
chr1 (13-132)||(2556909-2557028)
chr1 (13-198)||(29770670-29770844)
chr1 (13-197)||(2954855-2955028)
chr1 (13-189)||(26472185-26472350)
chr1 (14-197)||(4953053-4953225)
chr1 (13-195)||(4243490-4243661)
chr1 (13-112)||(27924730-27924829)
chr1 (13-198)||(42234840-42235013)
chr1 (13-121)||(39475846-39475953)
chr1 (13-189)||(34752320-34752485)
chr1 (16-195)||(1388476-1388644)
chr1 (13-94)||(24649812-24649893)
chr1 (16-195)||(30289910-30290078)
chr1 (14-94)||(44544136-44544216)
chr1 (14-195)||(7561528-7561712)
chr1 (13-198)||(51155587-51155760)
chr1 (13-195)||(52323938-52324110)
chr1 (13-98)||(13281648-13281733)
chr1 (28-195)||(48683330-48683486)
chr1 (13-195)||(10920200-10920371)
chr1 (123-195)||(41895164-41895236)
chr1 (125-201)||(44293449-44293525)
chr1 (13-72)||(4156188-4156247)
chr1 (13-89)||(13313269-13313347)
chr1 (15-94)||(32448650-32448729)
chr1 (13-112)||(52367883-52367982)
chr1 (12-94)||(46428343-46428425)
chr1 (158-199)||(31844818-31844859)
chr1 (15-178)||(35991616-35991768)
chr1 (13-94)||(39637900-39637977)
chr1 (142-195)||(31286504-31286557)
chr1 (140-192)||(32448755-32448807)
chr1 (13-65)||(10919313-10919365)
chr1 (120-172)||(24215859-24215911)
chr1 (154-197)||(52368013-52368056)
chr1 (28-98)||(44293541-44293611)
chr1 (142-195)||(24649732-24649785)
chr1 (123-195)||(38718167-38718239)
chr1 (142-195)||(39475783-39475836)
chr1 (15-80)||(41895268-41895333)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (13-198)||(13759-13944)
[»] chr7 (99 HSPs)
chr7 (13-194)||(33423276-33423457)
chr7 (13-196)||(37846015-37846198)
chr7 (14-197)||(49171360-49171543)
chr7 (13-195)||(22979647-22979829)
chr7 (13-195)||(25893917-25894099)
chr7 (13-195)||(33695821-33696003)
chr7 (13-197)||(33839713-33839897)
chr7 (13-201)||(40670564-40670752)
chr7 (13-200)||(17855429-17855616)
chr7 (13-195)||(27018117-27018299)
chr7 (13-197)||(47066975-47067159)
chr7 (13-196)||(35355889-35356072)
chr7 (13-197)||(46913110-46913296)
chr7 (14-195)||(23393051-23393232)
chr7 (13-197)||(31586849-31587033)
chr7 (13-197)||(45482659-45482843)
chr7 (15-195)||(45690097-45690277)
chr7 (13-196)||(35328068-35328251)
chr7 (13-195)||(47740331-47740513)
chr7 (13-195)||(48609677-48609859)
chr7 (13-197)||(2341659-2341844)
chr7 (13-195)||(10028489-10028673)
chr7 (14-195)||(20165814-20165995)
chr7 (13-197)||(33332790-33332973)
chr7 (33-197)||(36389377-36389541)
chr7 (15-186)||(15877553-15877724)
chr7 (13-195)||(33411261-33411443)
chr7 (13-197)||(26579715-26579899)
chr7 (13-195)||(43499486-43499668)
chr7 (13-197)||(35757018-35757202)
chr7 (13-194)||(33870246-33870424)
chr7 (13-195)||(5712169-5712351)
chr7 (13-195)||(19563448-19563630)
chr7 (14-196)||(31625706-31625887)
chr7 (29-197)||(5183823-5183991)
chr7 (14-183)||(41990870-41991039)
chr7 (13-195)||(45063357-45063537)
chr7 (37-195)||(29446863-29447020)
chr7 (13-196)||(10618299-10618475)
chr7 (13-195)||(31429475-31429657)
chr7 (13-197)||(35767482-35767659)
chr7 (64-196)||(30076526-30076658)
chr7 (58-195)||(28233936-28234073)
chr7 (13-161)||(33720070-33720218)
chr7 (13-197)||(35752032-35752205)
chr7 (13-199)||(24923020-24923195)
chr7 (13-197)||(46898014-46898187)
chr7 (30-171)||(44564356-44564497)
chr7 (13-195)||(36816845-36817016)
chr7 (13-194)||(45502817-45502987)
chr7 (13-196)||(48085859-48086031)
chr7 (13-195)||(43489219-43489390)
chr7 (17-198)||(7876325-7876495)
chr7 (13-194)||(33393329-33393499)
chr7 (13-201)||(24228542-24228719)
chr7 (13-196)||(46817420-46817592)
chr7 (14-196)||(37127939-37128110)
chr7 (79-198)||(41904272-41904391)
chr7 (13-200)||(2332020-2332196)
chr7 (13-196)||(44003369-44003541)
chr7 (76-197)||(44405412-44405533)
chr7 (13-195)||(7257382-7257553)
chr7 (14-191)||(41855061-41855228)
chr7 (14-195)||(47460772-47460942)
chr7 (14-198)||(45237530-45237703)
chr7 (13-112)||(15644018-15644117)
chr7 (13-112)||(16482855-16482954)
chr7 (13-186)||(26941541-26941703)
chr7 (14-112)||(29863017-29863115)
chr7 (13-94)||(47906849-47906930)
chr7 (13-195)||(498188-498359)
chr7 (29-195)||(26371066-26371221)
chr7 (13-199)||(44659845-44660019)
chr7 (18-194)||(46103127-46103291)
chr7 (13-94)||(29098752-29098833)
chr7 (13-94)||(39453565-39453646)
chr7 (13-195)||(21718118-21718288)
chr7 (13-195)||(29610636-29610807)
chr7 (13-89)||(32556701-32556777)
chr7 (13-197)||(25037506-25037679)
chr7 (13-94)||(39323617-39323698)
chr7 (13-77)||(30077043-30077107)
chr7 (14-94)||(33455098-33455178)
chr7 (14-94)||(39866667-39866747)
chr7 (13-80)||(35557731-35557798)
chr7 (52-200)||(37443597-37443734)
chr7 (13-193)||(35484637-35484807)
chr7 (28-197)||(38448446-38448604)
chr7 (126-193)||(39453484-39453551)
chr7 (13-75)||(35823291-35823353)
chr7 (127-197)||(39323712-39323781)
chr7 (120-191)||(29098844-29098915)
chr7 (148-193)||(15643948-15643993)
chr7 (60-94)||(26456157-26456191)
chr7 (140-181)||(39866765-39866806)
chr7 (130-195)||(42272180-42272244)
chr7 (142-197)||(16482783-16482836)
chr7 (13-80)||(21649482-21649550)
chr7 (123-198)||(47906755-47906831)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (12-201)||(34518365-34518554)
chr2 (13-195)||(45370989-45371171)
chr2 (13-206)||(1091940-1092133)
chr2 (13-202)||(6430472-6430661)
chr2 (13-196)||(14660445-14660628)
chr2 (13-195)||(746465-746647)
chr2 (13-199)||(4034591-4034777)
chr2 (13-198)||(17600835-17601020)
chr2 (13-197)||(6594456-6594640)
chr2 (15-195)||(23901780-23901960)
chr2 (13-192)||(10424594-10424773)
chr2 (12-195)||(38997099-38997282)
chr2 (13-197)||(2324887-2325071)
chr2 (13-200)||(11184971-11185158)
chr2 (13-196)||(27651033-27651216)
chr2 (13-196)||(40635217-40635400)
chr2 (13-195)||(13815218-13815400)
chr2 (13-195)||(26710344-26710526)
chr2 (13-195)||(10244582-10244764)
chr2 (13-195)||(27400402-27400584)
chr2 (27-201)||(32856430-32856604)
chr2 (13-198)||(27024414-27024599)
chr2 (12-200)||(7892683-7892871)
chr2 (13-195)||(5726128-5726310)
chr2 (13-195)||(14697537-14697719)
chr2 (14-195)||(2914138-2914319)
chr2 (14-195)||(32327361-32327542)
chr2 (14-197)||(33427645-33427828)
chr2 (13-196)||(37255336-37255514)
chr2 (13-195)||(40735463-40735645)
chr2 (14-195)||(4609626-4609807)
chr2 (13-201)||(32948445-32948632)
chr2 (13-197)||(40037142-40037325)
chr2 (13-195)||(37620867-37621052)
chr2 (17-195)||(11159625-11159802)
chr2 (14-201)||(9444683-9444880)
chr2 (13-198)||(32608379-32608559)
chr2 (13-169)||(8432942-8433098)
chr2 (13-189)||(15925079-15925255)
chr2 (65-197)||(25294886-25295018)
chr2 (13-194)||(39103046-39103216)
chr2 (14-168)||(12842103-12842257)
chr2 (13-138)||(42899914-42900039)
chr2 (62-196)||(1229675-1229810)
chr2 (14-197)||(27331298-27331474)
chr2 (13-195)||(28641292-28641463)
chr2 (13-198)||(21734897-21735071)
chr2 (14-195)||(35158050-35158220)
chr2 (30-161)||(41172474-41172605)
chr2 (12-193)||(145280-145450)
chr2 (13-197)||(44481827-44482000)
chr2 (107-195)||(447633-447721)
chr2 (13-89)||(12814613-12814689)
chr2 (13-195)||(29687040-29687211)
chr2 (13-195)||(2000339-2000508)
chr2 (13-195)||(4258489-4258659)
chr2 (13-195)||(27764863-27765033)
chr2 (13-195)||(43898971-43899141)
chr2 (13-198)||(12730060-12730234)
chr2 (30-197)||(13543622-13543778)
chr2 (28-195)||(19428426-19428582)
chr2 (13-195)||(12333497-12333666)
chr2 (29-198)||(34249280-34249438)
chr2 (13-112)||(35126779-35126878)
chr2 (14-195)||(39301197-39301367)
chr2 (106-195)||(12827154-12827243)
chr2 (13-94)||(40544166-40544247)
chr2 (13-190)||(28566703-28566869)
chr2 (13-198)||(2688726-2688900)
chr2 (123-198)||(3711731-3711806)
chr2 (14-80)||(3266296-3266362)
chr2 (13-195)||(43356098-43356266)
chr2 (13-124)||(30545820-30545931)
chr2 (13-73)||(8056625-8056685)
chr2 (85-157)||(28014856-28014928)
chr2 (139-197)||(42900780-42900837)
chr2 (140-193)||(3266402-3266455)
chr2 (12-80)||(10176557-10176625)
chr2 (13-57)||(28019959-28020003)
chr2 (46-80)||(38985381-38985415)
chr2 (46-94)||(3711665-3711713)
chr2 (152-196)||(30545948-30545992)
chr2 (142-190)||(35126897-35126945)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (13-197)||(5882506-5882690)
chr6 (13-196)||(24168091-24168274)
chr6 (13-191)||(14891383-14891561)
chr6 (13-195)||(22551061-22551243)
chr6 (13-198)||(26377201-26377386)
chr6 (13-197)||(34527860-34528044)
chr6 (16-195)||(18101495-18101674)
chr6 (13-197)||(7393584-7393768)
chr6 (28-196)||(11988973-11989141)
chr6 (14-193)||(2892189-2892368)
chr6 (13-195)||(959904-960086)
chr6 (13-195)||(8615240-8615422)
chr6 (13-195)||(28947087-28947269)
chr6 (13-197)||(2593850-2594034)
chr6 (13-193)||(7345114-7345294)
chr6 (14-198)||(30743445-30743629)
chr6 (13-198)||(19415530-19415715)
chr6 (13-186)||(16703366-16703539)
chr6 (14-197)||(5294799-5294982)
chr6 (14-197)||(5299351-5299534)
chr6 (13-195)||(599892-600074)
chr6 (13-194)||(19281056-19281237)
chr6 (28-198)||(22341785-22341957)
chr6 (13-196)||(1970711-1970894)
chr6 (13-196)||(10507907-10508090)
chr6 (14-195)||(33452572-33452753)
chr6 (13-195)||(24224070-24224253)
chr6 (46-210)||(23261914-23262078)
chr6 (13-195)||(28948845-28949016)
chr6 (13-138)||(30467660-30467785)
chr6 (13-195)||(7167582-7167753)
chr6 (13-94)||(929659-929740)
chr6 (13-196)||(15965433-15965605)
chr6 (13-188)||(13329381-13329545)
chr6 (13-195)||(1398553-1398724)
chr6 (12-195)||(3786748-3786920)
chr6 (14-197)||(3291009-3291181)
chr6 (14-195)||(4487528-4487698)
chr6 (123-195)||(18661833-18661905)
chr6 (123-197)||(24913094-24913168)
chr6 (29-109)||(1939579-1939659)
chr6 (154-198)||(34262360-34262404)
chr6 (13-193)||(375729-375895)
chr6 (13-69)||(11743070-11743126)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (13-195)||(24253382-24253564)
chr5 (13-196)||(35626038-35626221)
chr5 (13-196)||(3466680-3466863)
chr5 (13-196)||(7722049-7722232)
chr5 (13-195)||(43326379-43326561)
chr5 (14-195)||(18479668-18479849)
chr5 (14-194)||(15398483-15398663)
chr5 (13-195)||(12648797-12648979)
chr5 (13-193)||(6901799-6901979)
chr5 (13-196)||(39932579-39932762)
chr5 (13-195)||(5184972-5185154)
chr5 (13-195)||(15683791-15683973)
chr5 (13-195)||(27501055-27501237)
chr5 (13-195)||(40886028-40886209)
chr5 (13-196)||(739703-739886)
chr5 (13-196)||(25831521-25831703)
chr5 (13-195)||(27938897-27939080)
chr5 (13-196)||(43262182-43262365)
chr5 (14-195)||(2484292-2484473)
chr5 (15-195)||(13504742-13504922)
chr5 (13-194)||(27278474-27278659)
chr5 (13-196)||(5137715-5137898)
chr5 (28-195)||(31938912-31939079)
chr5 (28-195)||(40278858-40279025)
chr5 (50-200)||(29789290-29789440)
chr5 (21-198)||(38756484-38756662)
chr5 (55-195)||(34451292-34451432)
chr5 (13-197)||(28424793-28424975)
chr5 (13-196)||(890906-891088)
chr5 (13-198)||(763723-763908)
chr5 (13-193)||(40110234-40110413)
chr5 (13-176)||(4149694-4149847)
chr5 (14-200)||(31293984-31294170)
chr5 (13-197)||(33617585-33617758)
chr5 (14-201)||(38015508-38015684)
chr5 (12-197)||(6973062-6973236)
chr5 (13-194)||(9424593-9424763)
chr5 (13-197)||(5497273-5497446)
chr5 (13-111)||(40632499-40632597)
chr5 (13-195)||(2585462-2585633)
chr5 (13-195)||(19295730-19295901)
chr5 (13-195)||(27503379-27503550)
chr5 (13-203)||(38637902-38638081)
chr5 (13-198)||(1402502-1402676)
chr5 (13-186)||(42658671-42658833)
chr5 (13-197)||(23195246-23195419)
chr5 (18-194)||(33623940-33624105)
chr5 (13-199)||(13957670-13957845)
chr5 (13-121)||(12558093-12558200)
chr5 (21-196)||(27390605-27390769)
chr5 (29-195)||(14971994-14972149)
chr5 (13-195)||(18327173-18327344)
chr5 (13-120)||(36472347-36472455)
chr5 (13-105)||(42247861-42247953)
chr5 (14-195)||(9374502-9374672)
chr5 (13-196)||(36365444-36365616)
chr5 (14-197)||(40686900-40687071)
chr5 (13-195)||(24167784-24167955)
chr5 (120-198)||(612754-612833)
chr5 (46-195)||(3656568-3656706)
chr5 (14-80)||(9527124-9527190)
chr5 (13-172)||(6206884-6207032)
chr5 (16-101)||(9171108-9171193)
chr5 (42-193)||(36948492-36948630)
chr5 (28-124)||(5120040-5120135)
chr5 (47-195)||(38492647-38492783)
chr5 (37-101)||(3940414-3940478)
chr5 (28-80)||(15300977-15301029)
chr5 (44-120)||(20207080-20207156)
chr5 (17-73)||(28756082-28756138)
chr5 (13-73)||(27584385-27584447)
chr5 (161-196)||(40633525-40633560)
chr5 (166-195)||(21786003-21786032)
chr5 (148-196)||(42247790-42247838)
[»] chr3 (117 HSPs)
chr3 (13-195)||(40643800-40643982)
chr3 (14-198)||(38416721-38416905)
chr3 (13-197)||(47257793-47257977)
chr3 (13-203)||(49330037-49330227)
chr3 (13-197)||(7855112-7855296)
chr3 (13-195)||(24100283-24100464)
chr3 (13-195)||(28048392-28048574)
chr3 (13-194)||(51170034-51170215)
chr3 (13-197)||(32234396-32234579)
chr3 (13-197)||(40130957-40131141)
chr3 (13-197)||(53943586-53943769)
chr3 (13-196)||(29625826-29626009)
chr3 (13-196)||(40419835-40420018)
chr3 (14-196)||(40804509-40804691)
chr3 (13-198)||(44806684-44806869)
chr3 (13-197)||(47809594-47809779)
chr3 (13-201)||(22399097-22399284)
chr3 (13-196)||(35748310-35748493)
chr3 (13-195)||(41464352-41464534)
chr3 (13-199)||(43612043-43612229)
chr3 (13-195)||(52628954-52629135)
chr3 (13-198)||(39634569-39634753)
chr3 (13-197)||(42291842-42292026)
chr3 (15-197)||(41293317-41293498)
chr3 (36-198)||(46126010-46126171)
chr3 (12-193)||(53832486-53832667)
chr3 (13-197)||(7755305-7755488)
chr3 (13-197)||(35594121-35594305)
chr3 (13-197)||(51452749-51452932)
chr3 (13-197)||(52638842-52639026)
chr3 (13-196)||(2666000-2666183)
chr3 (13-196)||(27066977-27067160)
chr3 (22-193)||(48609732-48609903)
chr3 (13-196)||(48739232-48739415)
chr3 (13-199)||(20754389-20754575)
chr3 (13-195)||(37324541-37324723)
chr3 (13-170)||(24376573-24376730)
chr3 (13-194)||(55453245-55453426)
chr3 (13-195)||(37313399-37313581)
chr3 (13-195)||(51102378-51102560)
chr3 (14-194)||(43021715-43021896)
chr3 (13-197)||(39053394-39053578)
chr3 (18-193)||(43183917-43184092)
chr3 (14-201)||(46134357-46134544)
chr3 (14-197)||(52215077-52215260)
chr3 (13-195)||(41732528-41732710)
chr3 (13-199)||(43125831-43126016)
chr3 (13-195)||(44222829-44223011)
chr3 (13-193)||(47894822-47895002)
chr3 (13-195)||(36368939-36369120)
chr3 (13-197)||(41216455-41216639)
chr3 (196-332)||(52911109-52911245)
chr3 (13-195)||(5560025-5560214)
chr3 (14-196)||(18946904-18947086)
chr3 (13-162)||(53637841-53637990)
chr3 (13-195)||(51146215-51146397)
chr3 (13-199)||(48546836-48547011)
chr3 (13-193)||(54159000-54159170)
chr3 (13-200)||(42589830-42590006)
chr3 (17-178)||(46949379-46949538)
chr3 (13-197)||(25641646-25641819)
chr3 (13-159)||(37758929-37759075)
chr3 (80-197)||(33550465-33550582)
chr3 (73-197)||(52864550-52864673)
chr3 (13-195)||(55379985-55380156)
chr3 (13-198)||(49130578-49130752)
chr3 (13-198)||(51415969-51416143)
chr3 (13-197)||(53115447-53115620)
chr3 (13-196)||(25353554-25353726)
chr3 (13-196)||(54707219-54707391)
chr3 (13-195)||(34279721-34279892)
chr3 (13-195)||(38156632-38156803)
chr3 (13-203)||(41635792-41635971)
chr3 (13-197)||(54401187-54401360)
chr3 (13-197)||(55000176-55000349)
chr3 (13-120)||(28576176-28576283)
chr3 (14-198)||(31286790-31286963)
chr3 (14-190)||(40022075-40022240)
chr3 (14-120)||(41882055-41882161)
chr3 (13-200)||(47510935-47511111)
chr3 (13-197)||(39141123-39141297)
chr3 (13-112)||(21597220-21597319)
chr3 (13-197)||(30251499-30251672)
chr3 (14-194)||(51143818-51143987)
chr3 (12-195)||(24688113-24688285)
chr3 (13-170)||(17665549-17665695)
chr3 (62-144)||(47182049-47182131)
chr3 (108-201)||(30429221-30429314)
chr3 (13-195)||(37028723-37028894)
chr3 (15-119)||(50731979-50732083)
chr3 (15-119)||(50780773-50780877)
chr3 (13-195)||(51224038-51224208)
chr3 (13-112)||(42998861-42998959)
chr3 (14-195)||(43176738-43176908)
chr3 (13-193)||(45058883-45059052)
chr3 (123-200)||(48534002-48534079)
chr3 (13-120)||(48726062-48726169)
chr3 (29-94)||(44946019-44946084)
chr3 (13-89)||(52434139-52434216)
chr3 (14-110)||(177162-177258)
chr3 (13-89)||(48752085-48752161)
chr3 (147-195)||(50731914-50731962)
chr3 (147-195)||(50780894-50780942)
chr3 (14-195)||(40165653-40165822)
chr3 (123-198)||(44945932-44946007)
chr3 (13-87)||(2228032-2228106)
chr3 (15-121)||(8847721-8847827)
chr3 (135-195)||(52756067-52756127)
chr3 (153-196)||(41882010-41882053)
chr3 (22-121)||(47402813-47402911)
chr3 (147-201)||(40688435-40688489)
chr3 (13-65)||(37741435-37741487)
chr3 (154-194)||(37760346-37760386)
chr3 (142-194)||(42998790-42998842)
chr3 (142-193)||(43260841-43260892)
chr3 (46-110)||(41609100-41609164)
chr3 (13-57)||(51942543-51942587)
[»] chr4 (125 HSPs)
chr4 (14-194)||(6019929-6020109)
chr4 (13-197)||(34276547-34276731)
chr4 (13-196)||(2826681-2826863)
chr4 (13-195)||(41560328-41560510)
chr4 (15-195)||(21366609-21366789)
chr4 (13-195)||(9798465-9798647)
chr4 (13-195)||(23437592-23437774)
chr4 (13-195)||(31532135-31532317)
chr4 (13-198)||(47662099-47662284)
chr4 (13-198)||(50234000-50234185)
chr4 (13-197)||(237477-237661)
chr4 (14-198)||(22618511-22618693)
chr4 (13-197)||(42765840-42766023)
chr4 (13-196)||(42085207-42085390)
chr4 (13-195)||(29478360-29478542)
chr4 (13-195)||(47344656-47344838)
chr4 (13-195)||(53854430-53854611)
chr4 (13-198)||(3692207-3692392)
chr4 (13-194)||(32366661-32366842)
chr4 (13-198)||(53461813-53461998)
chr4 (15-195)||(44984763-44984943)
chr4 (13-192)||(6285307-6285486)
chr4 (13-196)||(39077545-39077728)
chr4 (13-195)||(18462013-18462195)
chr4 (13-195)||(51363007-51363188)
chr4 (13-195)||(54574940-54575122)
chr4 (13-195)||(55519827-55520009)
chr4 (13-198)||(29777254-29777439)
chr4 (13-197)||(146427-146611)
chr4 (13-201)||(2243458-2243646)
chr4 (13-193)||(41702461-41702641)
chr4 (13-200)||(19387683-19387870)
chr4 (13-196)||(31914198-31914380)
chr4 (13-196)||(43471694-43471877)
chr4 (13-196)||(55056258-55056441)
chr4 (13-195)||(26091258-26091440)
chr4 (13-195)||(48313557-48313737)
chr4 (13-199)||(50457806-50457992)
chr4 (13-195)||(54607962-54608144)
chr4 (13-195)||(41949382-41949566)
chr4 (13-193)||(397402-397582)
chr4 (13-198)||(38591668-38591849)
chr4 (13-197)||(55776045-55776228)
chr4 (13-197)||(55840223-55840406)
chr4 (13-195)||(27373076-27373257)
chr4 (13-191)||(50536628-50536806)
chr4 (13-195)||(54086410-54086590)
chr4 (13-197)||(45797479-45797663)
chr4 (13-196)||(3170626-3170809)
chr4 (16-195)||(31972336-31972515)
chr4 (13-195)||(407754-407934)
chr4 (13-199)||(31070070-31070255)
chr4 (14-195)||(42222292-42222473)
chr4 (13-195)||(49881059-49881245)
chr4 (14-177)||(22468788-22468951)
chr4 (13-195)||(23609087-23609269)
chr4 (13-195)||(41632007-41632188)
chr4 (13-195)||(56022998-56023180)
chr4 (14-191)||(50534632-50534809)
chr4 (15-186)||(33897504-33897675)
chr4 (13-191)||(35446506-35446683)
chr4 (13-195)||(42033175-42033357)
chr4 (13-197)||(14017374-14017556)
chr4 (53-197)||(48657858-48658002)
chr4 (13-195)||(54424982-54425163)
chr4 (13-178)||(39587796-39587961)
chr4 (14-194)||(53834055-53834235)
chr4 (14-202)||(48654815-48655009)
chr4 (14-200)||(48259507-48259691)
chr4 (13-197)||(1932763-1932947)
chr4 (13-195)||(54805614-54805800)
chr4 (53-195)||(52728307-52728448)
chr4 (13-195)||(9997931-9998102)
chr4 (13-197)||(36532828-36533002)
chr4 (13-202)||(54715035-54715213)
chr4 (14-193)||(51951683-51951861)
chr4 (13-195)||(52688349-52688520)
chr4 (13-198)||(34835177-34835351)
chr4 (14-197)||(43890929-43891101)
chr4 (103-195)||(35595777-35595869)
chr4 (13-195)||(45633779-45633950)
chr4 (14-199)||(20351838-20352012)
chr4 (13-193)||(54216313-54216482)
chr4 (13-197)||(37239088-37239261)
chr4 (13-196)||(38547600-38547772)
chr4 (13-195)||(5117438-5117609)
chr4 (13-195)||(15060289-15060460)
chr4 (13-195)||(22620593-22620764)
chr4 (13-195)||(33289703-33289873)
chr4 (123-194)||(33048991-33049062)
chr4 (68-195)||(42509351-42509478)
chr4 (13-197)||(4486579-4486752)
chr4 (13-201)||(46720025-46720205)
chr4 (118-200)||(48259699-48259780)
chr4 (13-200)||(47811906-47812082)
chr4 (13-195)||(34552319-34552490)
chr4 (12-197)||(6371247-6371421)
chr4 (13-198)||(31881311-31881485)
chr4 (14-112)||(27580120-27580218)
chr4 (13-197)||(1662259-1662430)
chr4 (13-121)||(27398666-27398774)
chr4 (14-94)||(42557583-42557663)
chr4 (13-195)||(54216736-54216907)
chr4 (42-195)||(27872608-27872750)
chr4 (17-202)||(46708734-46708908)
chr4 (61-151)||(52396774-52396865)
chr4 (13-113)||(43231503-43231602)
chr4 (13-197)||(27873548-27873719)
chr4 (14-112)||(14335173-14335271)
chr4 (28-195)||(49014113-49014269)
chr4 (46-196)||(52461396-52461535)
chr4 (103-194)||(35344878-35344968)
chr4 (17-205)||(573807-573984)
chr4 (13-94)||(3293113-3293194)
chr4 (13-94)||(11972219-11972300)
chr4 (14-177)||(33557960-33558112)
chr4 (14-119)||(49057933-49058038)
chr4 (128-198)||(42558300-42558370)
chr4 (127-198)||(3291802-3291873)
chr4 (13-64)||(17555617-17555668)
chr4 (152-196)||(14335100-14335144)
chr4 (123-195)||(51981479-51981551)
chr4 (142-191)||(27398607-27398656)
chr4 (154-195)||(18206512-18206553)
chr4 (50-91)||(51981572-51981613)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (15-195)||(1871-2051)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (13-197)||(39554-39738)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (15-195)||(11133-11312)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (13-201)||(18848-19036)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (13-197)||(75242-75426)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (13-195)||(2432-2614)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (13-197)||(278006-278192)
scaffold0007 (28-196)||(176669-176837)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (13-167)||(32561-32715)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (55-195)||(4596-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (14-196)||(3089-3262)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (13-195)||(20477-20648)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (13-195)||(14744-14915)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (13-195)||(7090-7262)
[»] scaffold2003 (2 HSPs)
scaffold2003 (13-112)||(102-201)
scaffold2003 (143-195)||(221-272)
[»] scaffold0684 (2 HSPs)
scaffold0684 (13-120)||(4618-4726)
scaffold0684 (153-195)||(4554-4596)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (13-120)||(3392-3500)
scaffold0163 (153-195)||(3522-3564)
[»] scaffold0271 (1 HSPs)
scaffold0271 (13-161)||(17906-18043)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 41653895 - 41654077
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41653895 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggatacca 41653994  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41653995 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32984259 - 32984075
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  32984259 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 32984160  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32984159 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24080083 - 24079901
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  24080083 gttttttgtagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24079984  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24079983 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40435335 - 40435148
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||    
T  40435335 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 40435236  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40435235 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcaccgtatt 40435148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 43328707 - 43328890
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  43328707 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43328806  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43328807 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 10646124 - 10646305
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  10646124 ttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 10646223  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10646224 ttaaaaatgttcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37301507 - 37301326
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  37301507 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggatacca 37301408  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| || ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37301407 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9303756 - 9303572
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  9303756 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 9303657  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303656 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33730823 - 33730639
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33730823 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33730724  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33730723 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 33730639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 37956421 - 37956605
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  37956421 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 37956520  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37956521 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacctt 37956605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 5946047 - 5946230
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  5946047 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 5946146  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  5946147 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacct 5946230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 6365986 - 6366169
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  6365986 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggatacca 6366085  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6366086 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44088624 - 44088429
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  44088624 ttttttctagattacctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 44088525  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttctttcttt 209  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||||| |||||||    
T  44088524 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctaattgtcgccctatttttttcttt 44088429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 41862220 - 41862402
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  41862220 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 41862319  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41862320 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31831136 - 31830959
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  31831136 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 31831037  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31831036 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Original strand, 25185902 - 25186082
Alignment:
Q  16 ttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattt 115  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||    
T  25185902 ttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccactt 25186001  T
Q  116 aaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  25186002 aaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacct 25186082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33981845 - 33981661
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33981845 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33981746  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33981745 cttaaaaatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 33981661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 2275912 - 2276098
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  2275912 tgttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 2276011  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2276012 actt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcaccttat 2276098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 9734254 - 9734435
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| |    
T  9734254 tgttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-c 9734352  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734353 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17718903 - 17718720
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||| || ||||||||||     
T  17718903 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccac 17718804  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17718803 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacctt 17718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 32114254 - 32114429
Alignment:
Q  18 ttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||| ||||    
T  32114254 ttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaa 32114353  T
Q  118 aaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32114354 aaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 9013684 - 9013870
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  9013684 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 9013783  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9013784 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 9013870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13760830 - 13760644
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  13760830 gttttttcaagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13760731  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg--gtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  13760730 tttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtgtaccctagttgtcacctt 13760644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45236747 - 45236564
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  45236747 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 45236648  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  45236647 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 37419940 - 37420122
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  37419940 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacta 37420039  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37420040 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 2714550 - 2714730
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||     
T  2714550 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccac 2714649  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2714650 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtactttagttgtcacc 2714730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13356302 - 13356118
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  13356302 gttttttttagattacatttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13356203  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13356202 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 41231946 - 41232130
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  41231946 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41232045  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41232046 cttaaaaatgtgcttatgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacctt 41232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 41639914 - 41640095
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||     
T  41639914 gttttttttagattacctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccg 41640013  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41640014 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45066774 - 45066590
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  45066774 gttttttatagattacctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45066675  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  45066674 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacctt 45066590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29048585 - 29048426
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  29048585 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacca 29048486  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattctt 172  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29048485 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 35628777 - 35628959
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | | ||||||    
T  35628777 gttttttttagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaatacca 35628876  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35628877 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 22878391 - 22878572
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||| || ||||||||||    
T  22878391 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggatacca 22878490  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22878491 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 25248039 - 25248215
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  25248039 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 25248132  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     || ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25248133 ctttaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 45258510 - 45258692
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||    
T  45258510 gttttttttagattacttttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacca 45258609  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  45258610 tttaaaaatgtgtttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttatcacct 45258692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 69 - 197
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033114
Alignment:
Q  69 aatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccat 168  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  169 tcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacctt 12033114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 195
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904258
Alignment:
Q  62 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattac 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  162 ccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 195
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981650
Alignment:
Q  79 ttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
    ||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  179 gtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||||||||    
T  41981634 ataccctagttgtcacc 41981650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4447466 - 4447294
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||| || ||| |||       
T  4447466 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata--- 4447370  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
            | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4447369 --------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 10378309 - 10378480
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||| || ||| |||       
T  10378309 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata--- 10378405  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10378406 --------tgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336279
Alignment:
Q  82 ttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 181  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  182 ccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacctta 31336279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 42701471 - 42701301
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||| ||||||     
T  42701471 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccac 42701372  T
Q  114 ttaaaaata---tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 183  Q
    ||||||| |   |||||  ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42701371 ttaaaaaaaatgtgctt--gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggtacc 42701301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Original strand, 3211207 - 3211381
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | || ||| || ||| |||        
T  3211207 ttttttctaaattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaata---- 3211301  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
           | |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3211302 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccttatt 3211381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 31940315 - 31940498
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  31940315 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 31940407  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttctttctt 208  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||    
T  31940408 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatatttttttctt 31940498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 2379140 - 2379311
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||           
T  2379140 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg------- 2379232  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2379233 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40649987 - 40649837
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||           || || |||||    
T  40649987 cctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatg-----------aatatgtgctt 40649899  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 189  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  40649898 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagcctagtt 40649837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 33897013 - 33896837
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||    
T  33897013 gttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagatacca 33896915  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
      |||||| |||           ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33896914 cctaaaaagatg-----------aatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccttattt 33896837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 117499 - 117329
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||            
T  117499 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 117408  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
       || || |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  117407 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 9713689 - 9713857
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || ||| |||       
T  9713689 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata--- 9713782  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9713783 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40458943 - 40458767
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  40458943 gttttttctcaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 40458851  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
        || || || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  40458850 ----aatatgtgtttttgtggctaatatgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatatt 40458767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 41843253 - 41843429
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| || |||           
T  41843253 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatg------- 41843345  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  41843346 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcttagttatcaccatatt 41843429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 39915994 - 39915887
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  39915994 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 39915895  T
Q  113 tttaaaaa 120  Q
     |||||||    
T  39915894 cttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3490570 - 3490397
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3490570 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttacca 3490471  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  3490470 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaactacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 3490397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 38631652 - 38631806
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| || |||           
T  38631652 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatg------- 38631744  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  38631745 ----aatatatgcttatgtggttaatatgtattggttgggataaattatccaccattcttcaatgg 38631806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27243310 - 27243234
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27243310 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 27243234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 27254885 - 27254809
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27254885 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg 27254809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26196487 - 26196315
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26196487 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 26196389  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||    
T  26196388 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacctt 26196315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 46 - 112
Target Start/End: Original strand, 41981466 - 41981532
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  41981466 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41981532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4975576 - 4975412
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||             
T  4975576 tttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg--------- 4975486  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 190  Q
      || || ||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  4975485 --aatatgtgcttatatggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttg 4975412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9509571 - 9509399
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | || ||| || |||           
T  9509571 gttttttctaaattacctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatg------- 9509479  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
        || || || ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  9509478 ----aatatgtgtttatgtggcaaatttttattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttttcacct 9509399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32373892 - 32373733
Alignment:
Q  18 ttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaa 117  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||           |    
T  32373892 ttctaaattacctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatg-----------a 32373804  T
Q  118 aaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 189  Q
    | || ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  32373803 atatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttggggtaaatta-ccaccattcttccatggataacctagtt 32373733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33622635 - 33622571
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 78  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622635 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaat 33622571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 82
Target Start/End: Original strand, 164728 - 164791
Alignment:
Q  19 tctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgt 82  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  164728 tctagattacctttaaggaatgatgggtaatttatccaccaaccaataaaaatgagcaatttgt 164791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 31149061 - 31148985
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  31149061 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggg 31148985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Original strand, 39901674 - 39901739
Alignment:
Q  130 gtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  39901674 gtggctaatgtttattggttgaggtaaattatccaccattcttcaatggataccttagttgtcacc 39901739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33622535 - 33622467
Alignment:
Q  126 ttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||    
T  33622535 ttatgtgactaatgtgtattggttgggataaattacccatcattttttcat-ggtagcctagttgtcacc 33622467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41425500 - 41425429
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||  ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  41425500 tgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattatccataattcttttatgggtagcctagttgccacc 41425429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 112)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 25058688 - 25058870
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  25058688 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggatacca 25058787  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25058788 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 31308001 - 31308187
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  31308001 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31308100  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31308101 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 31308187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17995133 - 17994949
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17995133 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacca 17995034  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17995033 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacctt 17994949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 45538153 - 45538341
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  45538153 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45538252  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45538253 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatattt 45538341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38790378 - 38790196
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  38790378 ttttttctagattacctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccac 38790279  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38790278 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 44661970 - 44662154
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  44661970 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 44662069  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44662070 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 44662154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 3611136 - 3611318
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  3611136 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 3611235  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3611236 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25678441 - 25678259
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  25678441 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 25678342  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25678341 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 31040709 - 31040893
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  31040709 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31040808  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31040809 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacctt 31040893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21139594 - 21139412
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  21139594 gttttttctagattacctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 21139495  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21139494 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 21139412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24245207 - 24245025
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  24245207 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24245108  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24245107 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26525072 - 26524886
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  26525072 tgttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagatacc 26524973  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26524972 acttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacctta 26524886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 49254157 - 49253972
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  49254157 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 49254058  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  49254057 cttaaaaatgtgcttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcacctta 49253972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 5981170 - 5981354
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  5981170 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 5981269  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5981270 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5981354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 39646568 - 39646751
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||    
T  39646568 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggatacca 39646667  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39646668 cttaaaaatgtgcttatgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39646751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4068863 - 4068689
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  4068863 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 4068764  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 189  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4068763 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 4068689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 5980068 - 5980250
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  5980068 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacca 5980167  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  5980168 cttaaaaattagcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 26277177 - 26277359
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  26277177 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26277276  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26277277 cttaaaaatttgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 26794304 - 26794482
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  26794304 gttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 26794403  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794404 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 43251713 - 43251891
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||| |    
T  43251713 tttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccact 43251812  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251813 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 47671586 - 47671768
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||    
T  47671586 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggatacca 47671685  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47671686 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6327729 - 6327546
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  6327729 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 6327630  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6327629 cttaaaaatgtgcttat-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 6327546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 23984755 - 23984939
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  23984755 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23984854  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23984855 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23984939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 33884088 - 33884271
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  33884088 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33884187  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33884188 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33884271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33960164 - 33959981
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  33960164 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 33960065  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33960064 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacct 33959981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46967223 - 46967041
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  46967223 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 46967124  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46967123 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23932691 - 23932507
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  23932691 gttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacacca 23932592  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23932591 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 24885501 - 24885685
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  24885501 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24885600  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24885601 cttaaaaatatgtttatgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 24885685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38332041 - 38331857
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  38332041 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 38331942  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38331941 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26085579 - 26085398
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  26085579 gtttttactagattacctt-gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 26085481  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085480 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33112999 - 33112818
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33112999 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33112900  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33112899 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37620374 - 37620192
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  37620374 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 37620275  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37620274 cttaaaaatgtccttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 50774218 - 50774400
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  50774218 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 50774317  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50774318 ttaaaaatatgcttatgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 47187105 - 47187289
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  47187105 gttttttctagattacctttgaagattgatgagtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 47187204  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  47187205 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcacctt 47187289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 41999815 - 41999998
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||    
T  41999815 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatacca 41999914  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41999915 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 35273596 - 35273778
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  35273596 gttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35273695  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35273696 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 36566330 - 36566512
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  36566330 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36566429  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36566430 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 51057071 - 51057253
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  | ||||||||||    
T  51057071 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggatacca 51057170  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51057171 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 3285402 - 3285582
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  3285402 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 3285501  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     || ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3285502 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35692846 - 35692658
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataattta-cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  35692846 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 35692747  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
      |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35692746 gcttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcaccttatt 35692658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47383915 - 47383732
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  47383915 tgttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 47383816  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47383815 acttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23221111 - 23220939
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  23221111 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23221012  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||      || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221011 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggg------tatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 23220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Original strand, 42863867 - 42864034
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |||||||| | |    
T  42863867 tttttctagactacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactact 42863966  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac 182  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42863967 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtac 42864034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 46616549 - 46616732
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  46616549 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 46616648  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46616649 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacct 46616732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Original strand, 28888582 - 28888760
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  28888582 ttttttctagattaactttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 28888681  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 192  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888682 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtc 28888760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 31844376 - 31844530
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||    
T  31844376 gttttttctagattacctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggatacca 31844475  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccacca 167  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31844476 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 31844530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49399170 - 49398988
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| |||||||||||||    
T  49399170 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggatacca 49399071  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49399070 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27983769 - 27983603
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||    
T  27983769 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg----------------gatacca 27983686  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27983685 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 47317316 - 47317497
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||     
T  47317316 ttttttttatattacctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccac 47317415  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47317416 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 46784423 - 46784605
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   | || ||| || ||||||||||    
T  46784423 gttttttctagattacctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggatacca 46784522  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46784523 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42313547 - 42313359
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggata----atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggat 108  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| || ||  ||    
T  42313547 gttttttctagattatctttgaagaatggtggatatataatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaat 42313448  T
Q  109 accatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42313447 accacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 36003131 - 36003317
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  36003131 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccac 36003230  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttc---catgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  36003231 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacctt 36003317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 48373504 - 48373679
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  48373504 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 48373603  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||         |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  48373604 cttaaaaatgtgcttatg---------tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 151
Target Start/End: Original strand, 25518815 - 25518952
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  25518815 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 25518914  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttgg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25518915 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450676
Alignment:
Q  48 atttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  148 ttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045596
Alignment:
Q  54 ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttgggg 153  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  154 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 33073211 - 33073385
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||| ||| || ||| |||       
T  33073211 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaata--- 33073307  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
            | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073308 --------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 33073385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 33187340 - 33187505
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  33187340 gttttttctagattatctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagatacca 33187439  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||                 |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33187440 cttaaa-----------------aatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41467803 - 41467626
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  41467803 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 41467707  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41467706 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccatattt 41467626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51403190 - 51403034
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  51403190 tgttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 51403091  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
    | |||||         |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51403090 acttaaa---------atgt-gcttatatgtattggttgggataaattactcaccattcttccatgg 51403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 198
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808830
Alignment:
Q  67 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccacc 166  Q
    ||||||| |||||| ||| | || |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  167 attcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctta 4808830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 10928067 - 10928240
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||| || ||| |||       
T  10928067 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata--- 10928163  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10928164 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 10928240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 2657303 - 2657474
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  2657303 gttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 2657399  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2657400 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45475987 - 45475848
Alignment:
Q  50 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagtt 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  45475987 ttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 45475888  T
Q  150 ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 192  Q
     |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  45475887 -gggtaaattacccaccattctttc--tggtaccctagttgtc 45475848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772170
Alignment:
Q  63 aatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacc 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  163 caccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcacctt 47772170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6626196 - 6626025
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||          
T  6626196 tgttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 6626103  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
         || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6626102 -----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 26685856 - 26686031
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  26685856 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 26685955  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
      ||||||  ||           ||| | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26685956 cctaaaaaagtg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttat 26686031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 208
Target Start/End: Original strand, 4156472 - 4156589
Alignment:
Q  91 tcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 190  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  4156472 tcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcatttttccatgggtactctagttg 4156571  T
Q  191 tcaccttatttctttctt 208  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  4156572 tcacctaatttcattctt 4156589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5961438 - 5961266
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5961438 gttttttctagattacttttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 5961339  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5961338 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttgaggtaaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacct 5961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31980115 - 31979998
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| ||| || |||||||||| |    
T  31980115 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccact 31980016  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtg 132  Q
    ||||||| | ||||||||    
T  31980015 taaaaatgtccttatgtg 31979998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13312623 - 13312531
Alignment:
Q  103 atggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13312623 atggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38716418 - 38716247
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38716418 gttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 38716319  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38716318 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtacccttgttgtcacc 38716247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2557028 - 2556909
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  2557028 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 2556929  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtg 132  Q
     |||||||| || |||||||    
T  2556928 cttaaaaatgtgtttatgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 29770670 - 29770844
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  29770670 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 29770766  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  29770767 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacctta 29770844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 2954855 - 2955028
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  2954855 gttttttctagattacctttgacaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggatacca 2954954  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||           ||  | | | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2954955 cttaaaaa-----------ggtgattgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 2955028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26472350 - 26472185
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  26472350 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 26472258  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 189  Q
        || || |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  26472257 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagtt 26472185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 4953053 - 4953225
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |||            
T  4953053 ttttctctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 4953144  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
       || || ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  4953145 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 4953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4243661 - 4243490
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||||           
T  4243661 gttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatg------- 4243569  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  4243568 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27924829 - 27924730
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27924829 gttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 27924730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 42234840 - 42235013
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  42234840 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 42234932  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
        || || ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42234933 ----aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggtt-gggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 42235013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 39475953 - 39475846
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  39475953 gttttttctagagtacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg-tcaagatagtttatggatacca 39475855  T
Q  113 tttaaaaat 121  Q
      |||||||    
T  39475854 cctaaaaat 39475846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34752485 - 34752320
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| | || ||| || |||           
T  34752485 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatg------- 34752393  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 189  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  34752392 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagtt 34752320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 1388476 - 1388644
Alignment:
Q  16 ttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattt 115  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||  |    
T  1388476 ttttctagattacatttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacct 1388575  T
Q  116 aaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||           ||  ||| | |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1388576 aaaaa-----------ggtgaatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 1388644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24649893 - 24649812
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  24649893 gttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaa 24649812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30290078 - 30289910
Alignment:
Q  16 ttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattt 115  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| || ||| |||          
T  30290078 ttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaata------ 30289985  T
Q  116 aaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
         | ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30289984 -----tgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccatgagtaccttagttgtcacc 30289910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44544216 - 44544136
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  44544216 ttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 44544136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7561712 - 7561528
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa-----aataatttatggat 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      ||||||||| | |    
T  7561712 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaattacccataatttatagtt 7561613  T
Q  109 accatttaaaaatatgctta--tgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||  | || || ||||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7561612 --ca--tgaatatgtgcttacgtggggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51155760 - 51155587
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||| ||| || |||           
T  51155760 gttttttctaaattacctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatg------- 51155668  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
        || || || ||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  51155667 ----aatatgtgtttatgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccttagctgtcacctta 51155587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 52323938 - 52324110
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  52323938 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaatacca 52324037  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||  ||           ||| |  |||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52324038 cctaaaaaggtga----------aatgttcattgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcacc 52324110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13281733 - 13281648
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaata 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  13281733 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaata 13281648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48683486 - 48683330
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| |||       
T  48683486 cctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatg--- 48683390  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            ||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48683389 --------aatgtttattggttgggataaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48683330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 10920200 - 10920371
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||  |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  10920200 gttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 10920299  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  10920300 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattaccgaccatttttccatggataccttagttgtcacc 10920371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41895236 - 41895164
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41895236 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44293525 - 44293449
Alignment:
Q  125 cttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||    
T  44293525 cttatgtggctaatatatattagttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgccaccttattt 44293449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 4156247 - 4156188
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatg 72  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4156247 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 13313347 - 13313269
Alignment:
Q  13 gttttttctagattg--cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13313347 gttttttctagattatacctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggg 13313269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 32448650 - 32448729
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  32448650 tttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 32448729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 52367883 - 52367982
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||| |||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  52367883 gttttttctggattacctttaaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggatacca 52367982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 46428425 - 46428343
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  46428425 tgttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaa 46428343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 158 - 199
Target Start/End: Original strand, 31844818 - 31844859
Alignment:
Q  158 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844818 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 31844859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 35991768 - 35991616
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||         
T  35991768 tttttttaaattacctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata----- 35991674  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
          ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  35991673 ------tatgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattagctatcattctttcatgg 35991616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 39637900 - 39637977
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39637900 gttttttctagattacctatgaagaatggtgggtaatttaccc----accaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaa 39637977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31286557 - 31286504
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31286557 tattggttggggtaaattatccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 31286504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 140 - 192
Target Start/End: Original strand, 32448755 - 32448807
Alignment:
Q  140 tgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 192  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32448755 tgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtc 32448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 10919365 - 10919313
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaat 65  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10919365 gttttttctagattatctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 24215859 - 24215911
Alignment:
Q  120 atatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattctt 172  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  24215859 atatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 24215911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 197
Target Start/End: Original strand, 52368013 - 52368056
Alignment:
Q  154 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52368013 taaattacccatcatttttccataggtaccctagttgtcacctt 52368056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 44293611 - 44293541
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaata 98  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||    
T  44293611 cctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagata 44293541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24649785 - 24649732
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  24649785 tattagttgatgtaaattatccaccattctttcaaggataccctagttgtcacc 24649732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38718239 - 38718167
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  38718239 tgcttatgtggctaatgtatatcggttgggagtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 38718167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39475836 - 39475783
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39475836 tattggttgggataaataacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 39475783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41895333 - 41895268
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  41895333 tttttctaaattacctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaattt 41895268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13944 - 13759
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  13944 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13845  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13844 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 13759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 99)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33423457 - 33423276
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33423457 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33423358  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33423357 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37846198 - 37846015
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37846198 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggatacca 37846099  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37846098 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 37846015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 49171543 - 49171360
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  49171543 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 49171444  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49171443 ttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 49171360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22979829 - 22979647
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  22979829 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 22979730  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22979729 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25894099 - 25893917
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  25894099 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 25894000  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25893999 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33696003 - 33695821
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33696003 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33695904  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33695903 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33839897 - 33839713
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33839897 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33839798  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33839797 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 40670564 - 40670752
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  40670564 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 40670663  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40670664 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcaccttattt 40670752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 17855429 - 17855616
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  17855429 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacta 17855528  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17855529 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 17855616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 27018117 - 27018299
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||    
T  27018117 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggatacca 27018216  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27018217 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47067159 - 47066975
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  47067159 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47067060  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47067059 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 35355889 - 35356072
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  35355889 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 35355988  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35355989 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 35356072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 46913110 - 46913296
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  46913110 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 46913209  T
Q  113 tttaaaaa--tatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||  | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913210 cttaaaaatgtgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 46913296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23393232 - 23393051
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  23393232 ttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 23393133  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393132 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 31586849 - 31587033
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  31586849 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 31586948  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  31586949 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcacctt 31587033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 45482659 - 45482843
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  45482659 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 45482758  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||||||||||||||| || || |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45482759 cttaaaaatatgcttatgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45690277 - 45690097
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  45690277 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 45690178  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45690177 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35328251 - 35328068
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  35328251 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35328152  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35328151 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47740513 - 47740331
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  47740513 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 47740414  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47740413 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48609859 - 48609677
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  48609859 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatacca 48609760  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609759 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2341844 - 2341659
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  2341844 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaa 2341745  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccat-gggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2341744 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacctt 2341659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 10028489 - 10028673
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  10028489 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 10028588  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatggg--taccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10028589 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtataccctagttgtcacc 10028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20165995 - 20165814
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  20165995 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 20165896  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20165895 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 33332790 - 33332973
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  33332790 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 33332888  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33332889 cttaaaaatatgcttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 33332973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389541
Alignment:
Q  33 gaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtg 132  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  133 gctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 15877553 - 15877724
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  15877553 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 15877652  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15877653 taaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtacccta 15877724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 33411261 - 33411443
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  33411261 gttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 33411360  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33411361 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 33411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26579899 - 26579715
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||    
T  26579899 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtatacca 26579800  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26579799 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 26579715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 43499486 - 43499668
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  43499486 gttttttttagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43499585  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43499586 cttaaaaatatacttatgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttctcacc 43499668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35757202 - 35757018
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  35757202 gttttttctagattaactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 35757104  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35757103 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 35757018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 33870246 - 33870424
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  33870246 gttttttctagatcacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 33870345  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  33870346 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct---atgggtactctagttgtcac 33870424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 5712169 - 5712351
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  5712169 gttttttctaaattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 5712268  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  5712269 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 19563448 - 19563630
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  19563448 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 19563547  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19563548 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 31625706 - 31625887
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  31625706 ttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 31625805  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31625806 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5183991 - 5183823
Alignment:
Q  29 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctta 128  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| || |||||||| ||||||    
T  5183991 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 5183892  T
Q  129 tgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5183891 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacctt 5183823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41991039 - 41990870
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||     
T  41991039 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 41990940  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacc 183  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41990939 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggtacc 41990870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45063537 - 45063357
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||| || ||||||||||    
T  45063537 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggatacca 45063438  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  45063437 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  37 aatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggcta 136  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  137 atatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    || |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 10618299 - 10618475
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| || ||| ||||||    
T  10618299 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaatacca 10618391  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10618392 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31429657 - 31429475
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  31429657 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggatacca 31429558  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31429557 cttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 31429475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 35767482 - 35767659
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||       | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  35767482 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggta-------ccccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35767574  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| || |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35767575 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 35767659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076526
Alignment:
Q  64 atgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattaccc 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  164 accattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 58 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233936
Alignment:
Q  58 caaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaa 157  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  158 ttacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33720218 - 33720070
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| ||| || ||||||||||    
T  33720218 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggatacca 33720119  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattac 161  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  33720118 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattac 33720070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 35752205 - 35752032
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  35752205 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 35752109  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35752108 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24923195 - 24923020
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||           
T  24923195 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------- 24923103  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24923102 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcaccttat 24923020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 46898187 - 46898014
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||       
T  46898187 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata--- 46898091  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46898090 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 46898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 171
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  30 tttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttat 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||  |||| ||| || || ||||||| ||||||||||||||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  130 gtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattct 171  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36817016 - 36816845
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  36817016 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 36816924  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  36816923 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45502987 - 45502817
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||           |||||||    
T  45502987 gttttttctagattaactttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaa-----------gatacca 45502899  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45502898 tttaaaaatatgcttatgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggataccttagttgtcac 45502817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 48085859 - 48086031
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |||           
T  48085859 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 48085951  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||    
T  48085952 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacct 48086031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 43489219 - 43489390
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  43489219 gttttttctaaattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 43489311  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  43489312 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7876495 - 7876325
Alignment:
Q  17 tttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattta 116  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || ||| |||           
T  7876495 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata------- 7876403  T
Q  117 aaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
        | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  7876402 ----tgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacctta 7876325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 33393329 - 33393499
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  33393329 gttttttctagattacctttaaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 33393428  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
      ||||||           || |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393429 cctaaaaa-----------ggttaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 24228542 - 24228719
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  24228542 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 24228634  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  24228635 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctcattt 24228719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 46817592 - 46817420
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  46817592 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 46817500  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  46817499 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 46817420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 37127939 - 37128110
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |              
T  37127939 ttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca---------- 37128028  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||| || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37128029 -taaatatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904391
Alignment:
Q  79 ttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
    ||||||||| | |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||      
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  179 gtaccctagttgtcacctta 198  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacctta 41904391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 2332020 - 2332196
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||           
T  2332020 gttttttctaaattatctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatg------- 2332112  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
        || || ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  2332113 ----aatatgtgcttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcaccatatt 2332196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44003541 - 44003369
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  44003541 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 44003442  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44003441 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 44003369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 76 - 197
Target Start/End: Original strand, 44405412 - 44405533
Alignment:
Q  76 aatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttcca 175  Q
    ||||| ||||| || |||| ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44405412 aatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttcca 44405511  T
Q  176 tgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  44405512 tgggtattctagttgtcacctt 44405533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 7257382 - 7257553
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  7257382 gttttttctagattaccttcgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 7257481  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  |||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7257482 cctaaaaa-----------ggtgaatgattattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacc 7257553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 41855061 - 41855228
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||| ||| || |              
T  41855061 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttca---------- 41855150  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtac-cctagttgt 191  Q
     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41855151 -taaatatatgcttatgtggctaatgtgtattagtttggataaattacccatcattcttccatggatactcctagttgt 41855228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47460942 - 47460772
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  47460942 ttttttttagattacttttaaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccac 47460843  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||| |||           ||| | |||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  47460842 ctaaaaagatg-----------aatgtttattggttgaggtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcacc 47460772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 45237703 - 45237530
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| |||||| |||            
T  45237703 ttttttctaaattacctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatg-------- 45237612  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
       || || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||| | ||||||||||||||    
T  45237611 ---aatatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacctta 45237530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15644117 - 15644018
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15644117 gttttttctagattatctttaaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggatacca 15644018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 16482954 - 16482855
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||    
T  16482954 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggatacca 16482855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26941703 - 26941541
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  26941703 gttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 26941611  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 186  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  26941610 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26941541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 29863017 - 29863115
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  29863017 ttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggatacca 29863115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 47906930 - 47906849
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  47906930 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaa 47906849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 498359 - 498188
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  498359 gttttttataaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 498267  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  498266 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatggctagcctagttgccacc 498188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 26371066 - 26371221
Alignment:
Q  29 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctta 128  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||           || || ||||||    
T  26371066 ctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg-----------aatatgtgctta 26371154  T
Q  129 tgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  26371155 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 26371221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 44659845 - 44660019
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || |||           
T  44659845 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgg-taatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 44659936  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  44659937 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccaccttat 44660019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Original strand, 46103127 - 46103291
Alignment:
Q  18 ttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaa 117  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || ||| |||            
T  46103127 ttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-------- 46103217  T
Q  118 aaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  46103218 ---tgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 29098752 - 29098833
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  29098752 gttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 29098833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39453646 - 39453565
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  39453646 gttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 39453565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 21718118 - 21718288
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  21718118 gttttttctaaattacctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 21718210  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||    
T  21718211 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccattatt-tttcatgggtagcctagttgtcacc 21718288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 29610636 - 29610807
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| || ||| |||       
T  29610636 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata--- 29610732  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  29610733 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcatagttgccacc 29610807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 32556777 - 32556701
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  32556777 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggg 32556701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25037679 - 25037506
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| || |||           
T  25037679 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatg------- 25037587  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
        || || ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  25037586 ----aatatgtgcttatgtggctgatgtgtattgattggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaggtgccacctt 25037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 39323617 - 39323698
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  39323617 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaa 39323698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30077107 - 30077043
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaa 77  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30077107 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgggcaa 30077043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 33455098 - 33455178
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  33455098 ttttttctaaattacctatgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaa 33455178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 39866667 - 39866747
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  39866667 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 39866747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Original strand, 35557731 - 35557798
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    ||||||| |||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35557731 gttttttttagaatacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443597
Alignment:
Q  52 acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttgg 151  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||||||  ||||||           ||  ||| | |||| |||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttgg 37443646  T
Q  152 ggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37443645 ggtaaattacccaccatttttttatgggtaccctagttgtcaccttatt 37443597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 35484637 - 35484807
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || |||          
T  35484637 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------ 35484730  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
         || || |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  35484731 -----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattatttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattgtca 35484807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38448604 - 38448446
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||| ||  ||||||| ||       
T  38448604 cctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaatgtg--- 38448508  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  38448507 --------aatatttattgattggggtaaattatccaccatttttccataagtaccctaattgtcacctt 38448446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39453551 - 39453484
Alignment:
Q  126 ttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    ||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39453551 ttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Original strand, 35823291 - 35823353
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagc 75  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35823291 gttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagc 35823353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 197
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323781
Alignment:
Q  127 tatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttggg-taaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 39323781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 191
Target Start/End: Original strand, 29098844 - 29098915
Alignment:
Q  120 atatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || |||| || ||||| || |||||||||    
T  29098844 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattttttcatggatagcctagttgt 29098915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15643993 - 15643948
Alignment:
Q  148 ttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15643993 ttggggtaaattacccaccattttttcatgggtacactagttgtca 15643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 94
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456191
Alignment:
Q  60 accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaa 26456191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 181
Target Start/End: Original strand, 39866765 - 39866806
Alignment:
Q  140 tgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 181  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39866765 tgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggta 39866806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 195
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272244
Alignment:
Q  130 gtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat-gataccctagttgtcacc 42272244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16482836 - 16482783
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||  ||||||||||||||    
T  16482836 tattagttggggtaaattacccagcatttttccatgaata--ctagttgtcacctt 16482783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21649550 - 21649482
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaa-tgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    ||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  21649550 gttttttttagattacctttgaaaaaatgatgggtaatttacttattaaccaatgaaaatgagcaattt 21649482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47906831 - 47906755
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggt-aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||    
T  47906831 tgcttatgtggctaatgtgtattgattagggtaaaattacccatcattttttcatggatagcctagttgccacctta 47906755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 34518365 - 34518554
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  34518365 tgttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 34518464  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34518465 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 34518554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 45370989 - 45371171
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||||    
T  45370989 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggatacca 45371088  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45371089 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1092133 - 1091940
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  1092133 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 1092034  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttctttc 206  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1092033 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttttttctttc 1091940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 6430472 - 6430661
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  6430472 gttttttctagattaccttcgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 6430571  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttc 202  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  6430572 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttattaccttatttc 6430661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 14660445 - 14660628
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  14660445 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14660544  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14660545 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 746465 - 746647
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  746465 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 746564  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746565 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 4034591 - 4034777
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||    
T  4034591 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 4034690  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4034691 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 4034777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 17600835 - 17601020
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  17600835 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 17600934  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600935 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 17601020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6594640 - 6594456
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  6594640 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 6594541  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6594540 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 6594456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 23901780 - 23901960
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  23901780 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 23901879  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23901880 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 10424594 - 10424773
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  10424594 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 10424693  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 192  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10424694 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 38997099 - 38997282
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  38997099 tgttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacc 38997198  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38997199 acttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2325071 - 2324887
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  2325071 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2324972  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2324971 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 2324887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 11184971 - 11185158
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  11184971 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 11185070  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
     |||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11185071 cttaaaaatgtgcttatatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccctatt 11185158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27651216 - 27651033
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  27651216 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27651117  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27651116 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 27651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 40635217 - 40635400
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  40635217 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 40635316  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40635317 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13815400 - 13815218
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  13815400 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 13815301  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13815300 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 13815218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 26710344 - 26710526
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  26710344 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26710443  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26710444 cttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10244764 - 10244582
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  10244764 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 10244665  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10244664 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 27400402 - 27400584
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  27400402 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27400501  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27400502 cttaaaaatgtacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32856604 - 32856430
Alignment:
Q  27 gcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgct 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||| |||| ||||    
T  32856604 gcctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgct 32856505  T
Q  127 tatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    |||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32856504 tatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttattt 32856430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 27024414 - 27024599
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  27024414 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 27024513  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27024514 cttaaaaatatgattatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 27024599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7892871 - 7892683
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||    
T  7892871 tgttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggatacc 7892772  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7892771 acttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcaccttatt 7892683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 5726128 - 5726310
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||    
T  5726128 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttacca 5726227  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5726228 cttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14697719 - 14697537
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  14697719 gttttttttagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggatacca 14697620  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14697619 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2914319 - 2914138
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||     
T  2914319 ttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 2914220  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  2914219 ttaaaaatgtgcttatgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 32327361 - 32327542
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||     
T  32327361 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 32327460  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32327461 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33427828 - 33427645
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||     
T  33427828 ttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccac 33427729  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33427728 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 33427645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37255514 - 37255336
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  37255514 gttttttctagattacctttgaagaatgg-----aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 37255420  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37255419 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 37255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 40735463 - 40735645
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  40735463 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 40735562  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| | |||||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40735563 cttaaaaatgtacttatgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacc 40735645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 4609626 - 4609807
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  4609626 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 4609725  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4609726 ttaaaaatgtgcttatgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 32948445 - 32948632
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||||||    
T  32948445 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggatacca 32948543  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  32948544 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcaccatattt 32948632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 40037142 - 40037325
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  40037142 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 40037241  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40037242 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37621052 - 37620867
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg---atcaaaataatttatggata 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| || |||||||    
T  37621052 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggata 37620953  T
Q  110 ccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37620952 ccacttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 195
Target Start/End: Original strand, 11159625 - 11159802
Alignment:
Q  17 tttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattta 116  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||| |||    
T  11159625 tttcttgattacctttgaaaaatggtgg-taatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccactta 11159723  T
Q  117 aaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||| || ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11159724 aaaatgtgtttatgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 9444683 - 9444880
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttac-------ccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatgg 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||    
T  9444683 ttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttaccaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatgg 9444782  T
Q  107 ataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccacc---attcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9444783 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattattcttccatggataccctagttgtcacctaattt 9444880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 32608379 - 32608559
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||| ||||||    
T  32608379 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtatacca 32608478  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||     ||||||||| ||||| ||||||||    
T  32608479 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccatt-----atgggtaccttagttatcacctta 32608559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8433098 - 8432942
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||    
T  8433098 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggatacca 8432999  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccatt 169  Q
     || ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8432998 ctttaaaatatacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatt 8432942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 15925079 - 15925255
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  15925079 gttttttctagattacctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 15925178  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagtt 189  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||    
T  15925179 cttaaaaatatgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatagataccctagtt 15925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 197
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295018
Alignment:
Q  65 tgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattaccca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  165 ccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtcccctt 25295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 39103046 - 39103216
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||       
T  39103046 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata--- 39103142  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
            | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39103143 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 168
Target Start/End: Original strand, 12842103 - 12842257
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||  |||||||||     
T  12842103 ttttttcttgattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaa 12842202  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccat 168  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12842203 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat 12842257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 42899914 - 42900039
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  42899914 gttttttctagattaccttcgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 42900013  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaat 138  Q
     ||||||||  |||||||||||||||    
T  42900014 cttaaaaatgcgcttatgtggctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 196
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229810
Alignment:
Q  62 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattac 161  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  162 ccaccattcttccatggg-taccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccatgggttacccaagttgtcacct 1229810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 27331298 - 27331474
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || |||| ||| || ||| |||        
T  27331298 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaatat--- 27331394  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
        | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  27331395 ----atatgtgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 27331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28641463 - 28641292
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  28641463 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 28641371  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28641370 ----aatatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21735071 - 21734897
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||| || ||| |||       
T  21735071 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaata--- 21734975  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
            | |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21734974 --------tgtgcttatgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctta 21734897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35158220 - 35158050
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||            
T  35158220 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 35158129  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
       || || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  35158128 ---aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 30 - 161
Target Start/End: Original strand, 41172474 - 41172605
Alignment:
Q  30 tttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttat 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||| || |  | ||||| |||||||| |||||||    
T  41172474 tttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgtgcttat 41172573  T
Q  130 gtggctaatatgtattagttggggtaaattac 161  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41172574 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 145280 - 145450
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| ||||     
T  145280 tgttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac- 145378  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
               |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  145379 ----------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 44481827 - 44482000
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  44481827 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 44481926  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
      ||||||           ||  ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44481927 cctaaaaa-----------ggtgaaagtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacctt 44482000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 447721 - 447633
Alignment:
Q  107 ataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  447721 ataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctagttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 12814613 - 12814689
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12814613 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 12814689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 29687040 - 29687211
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  29687040 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 29687132  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29687133 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2000508 - 2000339
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |             
T  2000508 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttca--------- 2000418  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      |||| || |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  2000417 --taaatatgtgcttacgtggctcatatgtatt-gttggggtaaattactcatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 2000339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 4258489 - 4258659
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  4258489 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatg------- 4258580  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  4258581 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27765033 - 27764863
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||           
T  27765033 gttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------- 27764941  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||| ||||    
T  27764940 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaaccatca-tctttcatgggtagcctagttgccacc 27764863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43899141 - 43898971
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || |||           
T  43899141 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg------- 43899049  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43899048 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 43898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 12730060 - 12730234
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |             
T  12730060 gttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 12730150  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
      |||| || |||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  12730151 --taaatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacctta 12730234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13543778 - 13543622
Alignment:
Q  30 tttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttat 129  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||           | |||||||    
T  13543778 tttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttat 13543690  T
Q  130 gtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13543689 gtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19428582 - 19428426
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| || ||| |||           | |||||    
T  19428582 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctt 19428494  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  19428493 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 19428426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12333666 - 12333497
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || ||| ||        
T  12333666 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat---- 12333571  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
           || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  12333570 -------atgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt-gggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 198
Target Start/End: Original strand, 34249280 - 34249438
Alignment:
Q  29 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctta 128  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||| |||           | ||||||    
T  34249280 ctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata-----------tgtgctta 34249368  T
Q  129 tgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||| ||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34249369 tgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 34249438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 35126779 - 35126878
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  35126779 gttttttctagattacctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 35126878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39301367 - 39301197
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||            
T  39301367 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 39301276  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
       || || ||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  39301275 ---aatatgtgcttatatgactaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 39301197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Original strand, 12827154 - 12827243
Alignment:
Q  106 gataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||    
T  12827154 gataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggtgctctagttgtcacc 12827243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40544247 - 40544166
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  40544247 gttttttctaaattacctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 40544166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28566869 - 28566703
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || |||           
T  28566869 gttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatg------- 28566777  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 190  Q
        || || |||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||    
T  28566776 ----aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttg 28566703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2688900 - 2688726
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| || || || |||| ||| || |||           
T  2688900 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatg------- 2688808  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  2688807 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctta 2688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 3711731 - 3711806
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  3711731 tgcttatgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 3711806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Original strand, 3266296 - 3266362
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3266296 ttttttctaaattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 3266362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 43356098 - 43356266
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  43356098 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 43356187  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  43356188 ----aatatgtgcttatgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacc 43356266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 30545820 - 30545931
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||  ||||||| |    
T  30545820 gttttttttagattatttttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaa 30545919  T
Q  113 tttaaaaatatg 124  Q
    | ||||||||||    
T  30545920 tctaaaaatatg 30545931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 8056625 - 8056685
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatga 73  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8056625 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 8056685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  85 gtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaa 157  Q
    ||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 197
Target Start/End: Original strand, 42900780 - 42900837
Alignment:
Q  139 atgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  42900780 atgtattggttgagataaattacccaccattcttccatgtgta-cctagttgtcacctt 42900837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 193
Target Start/End: Original strand, 3266402 - 3266455
Alignment:
Q  140 tgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3266402 tgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaacctagttgtca 3266455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Original strand, 10176557 - 10176625
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||    
T  10176557 tgttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaacttattcaccaattaatgaaaatgagcaattt 10176625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 28020003 - 28019959
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccac 57  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28020003 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccac 28019959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 38985415 - 38985381
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38985415 taatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaattt 38985381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Original strand, 3711665 - 3711713
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  3711665 taatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 3711713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Original strand, 30545948 - 30545992
Alignment:
Q  152 ggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  30545948 ggtaaattacccatcattcctccatagataccctagttgtcacct 30545992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 190
Target Start/End: Original strand, 35126897 - 35126945
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 190  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35126897 tattggttgggataaattacccaccatttttccatagataccctagttg 35126945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 5882506 - 5882690
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  5882506 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 5882605  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5882606 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5882690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 24168091 - 24168274
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  24168091 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24168190  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24168191 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14891561 - 14891383
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  14891561 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14891462  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14891461 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22551243 - 22551061
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  22551243 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 22551144  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22551143 cctaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26377386 - 26377201
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  26377386 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26377287  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26377286 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 26377201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34528044 - 34527860
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  34528044 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacca 34527945  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34527944 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34527860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18101674 - 18101495
Alignment:
Q  16 ttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||    
T  18101674 ttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccactt 18101575  T
Q  116 aaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18101574 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 18101495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7393768 - 7393584
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  7393768 gttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 7393669  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7393668 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacctt 7393584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 28 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11989141 - 11988973
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  11989141 cctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctt 11989042  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11989041 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 2892189 - 2892368
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  2892189 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 2892288  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2892289 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 960086 - 959904
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||    
T  960086 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagatacca 959987  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  959986 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 959904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 8615240 - 8615422
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  8615240 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 8615339  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8615340 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 28947087 - 28947269
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  28947087 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtatacca 28947186  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28947187 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2594034 - 2593850
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  2594034 gttttttctagattatctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2593935  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2593934 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7345294 - 7345114
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  7345294 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggatacca 7345195  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  7345194 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtctaccttagttgtca 7345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30743629 - 30743445
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  30743629 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccac 30743530  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  30743529 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacctta 30743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19415715 - 19415530
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||    
T  19415715 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggatacca 19415616  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19415615 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 19415530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 16703366 - 16703539
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  16703366 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 16703465  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 186  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16703466 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatccta 16703539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5294982 - 5294799
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  5294982 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5294883  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5294882 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5299534 - 5299351
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  5299534 ttttttctagattacttttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccac 5299435  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5299434 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5299351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 599892 - 600074
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  599892 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 599991  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  599992 cttaaaaatgtgtttatgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 600074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19281237 - 19281056
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  19281237 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 19281138  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  19281137 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22341957 - 22341785
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccacca--accaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgc 125  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||    
T  22341957 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 22341858  T
Q  126 ttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22341857 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctta 22341785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 1970711 - 1970894
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  1970711 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 1970810  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1970811 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactttagttgtcacct 1970894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10508090 - 10507907
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  10508090 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 10507991  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10507990 cttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33452753 - 33452572
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||     
T  33452753 ttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccac 33452654  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33452653 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24224253 - 24224070
Alignment:
Q  13 gttttttctagattg-cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||||    
T  24224253 gttttttctagatttacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacc 24224154  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24224153 acttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23262078 - 23261914
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| || ||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  23262078 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtatt 23261979  T
Q  146 agttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttctttctttc 210  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23261978 ggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcaccttttttcattctttc 23261914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28949016 - 28948845
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||           
T  28949016 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------- 28948924  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28948923 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 30467785 - 30467660
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  30467785 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 30467686  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaat 138  Q
     ||||| || ||||||||||||||||    
T  30467685 cttaaacatgtgcttatgtggctaat 30467660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 7167582 - 7167753
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  7167582 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggatacca 7167681  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7167682 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 929659 - 929740
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  929659 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaa 929740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 15965433 - 15965605
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| || ||| |||       
T  15965433 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaata--- 15965529  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
            | || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15965530 --------tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 188
Target Start/End: Original strand, 13329381 - 13329545
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | || ||| || |             
T  13329381 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca--------- 13329471  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagt 188  Q
      |||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  13329472 --taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagt 13329545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 1398553 - 1398724
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||| ||| || |||           
T  1398553 gttttttctaaattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatg------- 1398645  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  1398646 ----aatatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 3786748 - 3786920
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||      
T  3786748 tgttttttctaaattacttttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaata-- 3786845  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
             | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3786846 ---------tgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 3291009 - 3291181
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| | || ||| || |              
T  3291009 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca---------- 3291098  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||| || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  3291099 -taaatatgtgcttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 3291181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 4487528 - 4487698
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| || ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||        
T  4487528 ttttttttaaatttcctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata---- 4487623  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
           | | || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  4487624 -------tgtactcatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 18661833 - 18661905
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18661833 tgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24913168 - 24913094
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  24913168 tgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgagtagcttagttgtcacctt 24913094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1939659 - 1939579
Alignment:
Q  29 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggata 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  1939659 ctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatggata 1939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Original strand, 34262360 - 34262404
Alignment:
Q  154 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34262360 taaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctta 34262404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 375895 - 375729
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| | |||||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||| | |||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||     
T  375895 gttttttttagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc- 375797  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
      |||||| |||           ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  375796 --taaaaagatg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccttaattgtca 375729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11743126 - 11743070
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaa 69  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  11743126 gttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaa 11743070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 24253382 - 24253564
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  24253382 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 24253481  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24253482 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 35626038 - 35626221
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  35626038 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 35626137  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35626138 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3466863 - 3466680
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  3466863 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 3466764  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3466763 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 7722049 - 7722232
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  7722049 gttttttctagattgcctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 7722148  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7722149 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43326561 - 43326379
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  43326561 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43326462  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43326461 cttaaaaatgtgcctatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18479849 - 18479668
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||     
T  18479849 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 18479750  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18479749 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagtagtcacc 18479668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15398663 - 15398483
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  15398663 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 15398564  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15398563 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 12648797 - 12648979
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||    
T  12648797 gttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 12648896  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12648897 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 6901799 - 6901979
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  6901799 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 6901898  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901899 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 39932579 - 39932762
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  39932579 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 39932678  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39932679 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 39932762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 5184972 - 5185154
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  5184972 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 5185071  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5185072 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 15683791 - 15683973
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  15683791 gttttttctagattacctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 15683890  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15683891 cttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27501237 - 27501055
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  27501237 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27501138  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27501137 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40886209 - 40886028
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  40886209 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 40886110  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40886109 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 739886 - 739703
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  739886 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 739787  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  739786 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 25831521 - 25831703
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  25831521 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaaa-tagttcatggatacca 25831619  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  25831620 attaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacct 25831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 27938897 - 27939080
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  27938897 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 27938996  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatggg-taccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27938997 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggttaccctagttgtcacc 27939080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43262365 - 43262182
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  43262365 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 43262266  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43262265 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 43262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2484473 - 2484292
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || |||||||| |     
T  2484473 ttttttctagattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactac 2484374  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2484373 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13504922 - 13504742
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  13504922 tttttctagattaccatcgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccact 13504823  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13504822 taaaaatgtgcttatgtgactaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27278659 - 27278474
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaata----atttatggat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    ||| ||||||    
T  27278659 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggat 27278560  T
Q  109 accatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27278559 accacttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 5137715 - 5137898
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  5137715 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 5137814  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  5137815 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccattaataccctagttgtcacct 5137898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 31938912 - 31939079
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| || ||    
T  31938912 cctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttt 31939011  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    || || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31939012 atatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40279025 - 40278858
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  40279025 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgtgctt 40278926  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40278925 atgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccatgaataccctagttgtcacc 40278858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789290
Alignment:
Q  50 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  150 ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 29789290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38756662 - 38756484
Alignment:
Q  21 tagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaa 120  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  38756662 tagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaa 38756563  T
Q  121 tatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattctt-ccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38756562 tgtgtttatgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacctta 38756484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451432
Alignment:
Q  55 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  155 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 28424975 - 28424793
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  28424975 gttttttctagattacctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatg--caatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 28424878  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  28424877 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacctt 28424793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 890906 - 891088
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| || ||||||||||    
T  890906 gttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggatacca 891005  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  891006 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacct 891088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 763723 - 763908
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | || ||| || ||||||| ||    
T  763723 gttttttctagattatttttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatca 763822  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  763823 cttaaaaatgtacttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccatcattctttgatggatactctagttgtcacctta 763908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 40110234 - 40110413
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  40110234 gttttttctatattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatagatacca 40110332  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  40110333 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 4149694 - 4149847
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||    
T  4149694 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggg----------gttatggatacca 4149783  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccat 176  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4149784 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccat 4149847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 31294170 - 31293984
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||    || |  ||| ||||||     
T  31294170 ttttttctagattacctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccac 31294071  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||   |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31294070 ttaaaaatatgcttacgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcaccatatt 31293984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 33617585 - 33617758
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||| |||       
T  33617585 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata--- 33617681  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33617682 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 33617758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 38015684 - 38015508
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||        
T  38015684 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata---- 38015589  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
           | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38015588 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttattt 38015508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Original strand, 6973062 - 6973236
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || |||          
T  6973062 tgttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------ 6973155  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
         || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  6973156 -----aatatgtgcttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacctt 6973236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9424763 - 9424593
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  9424763 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 9424667  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
            |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9424666 --------tatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 5497273 - 5497446
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| || ||| |||       
T  5497273 gttttttctaaattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata--- 5497369  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5497370 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 5497446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 40632499 - 40632597
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  40632499 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 2585462 - 2585633
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  2585462 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 2585561  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    | ||||||  ||           ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  2585562 tctaaaaagttg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 19295730 - 19295901
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||| || ||| |||       
T  19295730 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtata--- 19295826  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19295827 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 27503379 - 27503550
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  27503379 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 27503471  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27503472 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38638081 - 38637902
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  38638081 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38637982  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttct 203  Q
      ||||||           ||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38637981 actaaaaa-----------ggtgaatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcaccttttttct 38637902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1402676 - 1402502
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1402676 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 1402577  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
       |||||           ||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1402576 cccaaaaa-----------ggtgaatgtttattagttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttatcacctta 1402502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 42658833 - 42658671
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  42658833 gttttttcaaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 42658741  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 186  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  42658740 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 42658671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23195419 - 23195246
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  23195419 gttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 23195327  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23195326 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33624105 - 33623940
Alignment:
Q  18 ttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaa 117  Q
    ||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |             
T  33624105 ttctaaattacctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgggt--------- 33624015  T
Q  118 aaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
      || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  33624014 --atgtgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 13957670 - 13957845
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  13957670 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 13957762  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
        || ||  ||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13957763 ----aatatgcgcttatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttat 13957845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 12558200 - 12558093
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||| ||| || || |||||||    
T  12558200 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcat-gatacca 12558102  T
Q  113 tttaaaaat 121  Q
     ||||||||    
T  12558101 cttaaaaat 12558093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 27390605 - 27390769
Alignment:
Q  21 tagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaa 120  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||    
T  27390605 tagattacctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T
Q  121 tatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
               ||  ||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27390705 -----------ggtgaatgttcattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 27390769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Original strand, 14971994 - 14972149
Alignment:
Q  29 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctta 128  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||           || || ||||||    
T  14971994 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg-----------aatatgtgctta 14972082  T
Q  129 tgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||| ||||| ||||||  || || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14972083 tgtgactaatgtgtattgattaggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 14972149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18327344 - 18327173
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  18327344 gttttttctagattatctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggatacca 18327245  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18327244 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccttagttatcacc 18327173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 36472455 - 36472347
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  36472455 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 36472356  T
Q  113 -tttaaaaa 120  Q
     ||||||||    
T  36472355 ctttaaaaa 36472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42247953 - 42247861
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatg 105  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||    
T  42247953 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatg 42247861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9374672 - 9374502
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || |||            
T  9374672 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatg-------- 9374581  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
       || || || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  9374580 ---aatatgtgtttaggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36365616 - 36365444
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  36365616 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 36365524  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| |||||    
T  36365523 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattagccatcattctttcatggatagtctagttgccacct 36365444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 40686900 - 40687071
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  40686900 ttttttctagattacctttgagaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccat 40686999  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||         |||   ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  40687000 ctaaaaa---------gtg---aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacctt 40687071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24167955 - 24167784
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  24167955 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 24167856  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24167855 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattactcaacatttttccatgggtaccctagttgtcacc 24167784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 612833 - 612754
Alignment:
Q  120 atatgcttatgtggctaatatgtattagttggg-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  612833 atatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacctta 612754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3656706 - 3656568
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtatt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||| || ||| |||           | |||||||||||||||| ||||||    
T  3656706 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatt 3656618  T
Q  146 agttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  3656617 ggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9527190 - 9527124
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9527190 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaattt 9527124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Original strand, 6206884 - 6207032
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||| || |||           
T  6206884 gttttttttaaattacttttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatg------- 6206976  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattctt 172  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6206977 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt 6207032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9171193 - 9171108
Alignment:
Q  16 ttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatt 101  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  9171193 ttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataatt 9171108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36948630 - 36948492
Alignment:
Q  42 tggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || ||| || ||||||           || |||||||||||||||| ||    
T  36948630 tggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatggat-----------atgtgcttatgtggctaatgtg 36948543  T
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||| | | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  36948542 tatt-ggtagggtaaattacccaccattcttgcatgagtaccctagctgtca 36948492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 5120040 - 5120135
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatg 124  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||| || || ||||||| |||||||||||    
T  5120040 cctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccacttaaaaatatg 5120135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 195
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492783
Alignment:
Q  47 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtatta 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||           | |||||||||| ||||| ||||||     
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtgactaatgtgtattg 38492735  T
Q  147 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||    
T  38492736 gttggggtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgccacc 38492783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940414
Alignment:
Q  37 aatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatt 101  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataatt 3940414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15301029 - 15300977
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 80  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15301029 cctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaattt 15300977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20207156 - 20207080
Alignment:
Q  44 gataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaa 120  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||| || ||| || ||||||||||| ||||||    
T  20207156 gataatttatccatcaaccaatgaaaatgaacaatttattgatgtgattaagatagttcatggataccatctaaaaa 20207080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 28756082 - 28756138
Alignment:
Q  17 tttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatga 73  Q
    |||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28756082 tttctagatcacctttaaagaaaggtggataatttacccaccaagcaatgaaaatga 28756138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 27584385 - 27584447
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatgg--ataatttacccaccaaccaatgaaaatga 73  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  27584385 gttttttctatatttcctttgaagaatggtgggtatagtttacccaccaaccagtgaaaatga 27584447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 196
Target Start/End: Original strand, 40633525 - 40633560
Alignment:
Q  161 cccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40633525 cccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 40633560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Original strand, 21786003 - 21786032
Alignment:
Q  166 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21786003 cattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21786032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42247838 - 42247790
Alignment:
Q  148 ttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  42247838 ttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgacacct 42247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 117)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 40643800 - 40643982
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  40643800 gttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatca 40643899  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643900 tttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 40643982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38416905 - 38416721
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  38416905 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 38416806  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38416805 ttaaaaatgtgcttacgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 38416721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 47257793 - 47257977
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  47257793 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatacca 47257892  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47257893 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47257977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 49330037 - 49330227
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  49330037 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 49330136  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttct 203  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49330137 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttct 49330227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7855296 - 7855112
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  7855296 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggatacca 7855197  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7855196 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 7855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 24100283 - 24100464
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  24100283 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-atacca 24100381  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24100382 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28048574 - 28048392
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  28048574 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 28048475  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28048474 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 51170215 - 51170034
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  51170215 gttttttttagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 51170116  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51170115 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32234579 - 32234396
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  32234579 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 32234480  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32234479 ctt-aaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32234396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40131141 - 40130957
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  40131141 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggatacca 40131042  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40131041 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53943769 - 53943586
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  53943769 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 53943670  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53943669 cttaaaaatatacttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacctt 53943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29626009 - 29625826
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  29626009 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 29625910  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  29625909 cttaaaaatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacct 29625826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 40419835 - 40420018
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  40419835 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 40419934  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40419935 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40804691 - 40804509
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||     
T  40804691 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccac 40804592  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40804591 ttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 44806684 - 44806869
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  44806684 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggatacca 44806783  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44806784 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 44806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 47809779 - 47809594
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  47809779 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47809680  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagtt-ggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47809679 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47809594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 22399097 - 22399284
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  22399097 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaacca 22399196  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
     || ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22399197 ctt-aaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatattt 22399284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35748493 - 35748310
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  35748493 gttttttttagattagctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 35748394  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35748393 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 41464352 - 41464534
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  41464352 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 41464451  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41464452 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43612229 - 43612043
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||| || ||||||||||    
T  43612229 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggatacca 43612130  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43612129 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 43612043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 52628954 - 52629135
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  52628954 gtttattctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 52629053  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52629054 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39634753 - 39634569
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||    
T  39634753 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaaa-tagttcatggatacca 39634655  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39634654 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 39634569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 42291842 - 42292026
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  42291842 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 42291941  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     || ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42291942 cttgaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 42292026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41293498 - 41293317
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |    
T  41293498 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccact 41293399  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    | ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41293398 t-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacctt 41293317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 198
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126171
Alignment:
Q  36 gaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggct 135  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  136 aatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctta 46126171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53832667 - 53832486
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  53832667 tgttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggatacc 53832568  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    | |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53832567 aattaaaaaggggcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgtgttccctagttgtca 53832486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7755488 - 7755305
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  7755488 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggatacca 7755389  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7755388 ctt-aaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacctt 7755305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 35594121 - 35594305
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  35594121 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatca 35594220  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35594221 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgttacctt 35594305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51452932 - 51452749
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  51452932 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatacca 51452833  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  51452832 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacctt 51452749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 52638842 - 52639026
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  52638842 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggatacca 52638941  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  52638942 cttaaaaatgtgcttctgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacctt 52639026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 2666000 - 2666183
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  2666000 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2666099  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2666100 cttaaaactgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27067160 - 27066977
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  27067160 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 27067061  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27067060 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 27066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 48609732 - 48609903
Alignment:
Q  22 agattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaat 121  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || |||||||||| ||||||||    
T  48609732 agattaccttcgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaat 48609831  T
Q  122 atgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48609832 gtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48739415 - 48739232
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||    
T  48739415 gttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatacca 48739316  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48739315 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20754575 - 20754389
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| || ||||||| ||    
T  20754575 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatca 20754476  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20754475 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcaccttat 20754389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 37324541 - 37324723
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  37324541 gttttttctaaattacctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacca 37324640  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37324641 cttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Original strand, 24376573 - 24376730
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  24376573 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 24376672  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattc 170  Q
     |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24376673 cttaaaaatgtgcttatgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 55453426 - 55453245
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  55453426 gttttttctaggttacctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 55453327  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55453326 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 37313399 - 37313581
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  37313399 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 37313498  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37313499 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaggtgtcacc 37313581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51102560 - 51102378
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  51102560 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 51102461  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  51102460 cttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 43021715 - 43021896
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggga-tcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||| || ||| ||||||    
T  43021715 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaatacca 43021814  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43021815 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 39053394 - 39053578
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||||    
T  39053394 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatacca 39053493  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||||||    
T  39053494 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattacccatcatttttttatggatactctagttgtcacctt 39053578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 43183917 - 43184092
Alignment:
Q  18 ttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaa 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  43183917 ttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaa 43184016  T
Q  118 aaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43184017 aaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 46134357 - 46134544
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  46134357 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccac 46134456  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  46134457 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcaccatattt 46134544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 52215077 - 52215260
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||     
T  52215077 ttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccac 52215176  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || || |||||||    
T  52215177 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatgggtgccttaattatcacctt 52215260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 41732528 - 41732710
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  41732528 gttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacca 41732627  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41732628 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccatggataccccagttgtcacc 41732710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Original strand, 43125831 - 43126016
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  43125831 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 43125930  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||    
T  43125931 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcaccttat 43126016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 44222829 - 44223011
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || ||| ||||||    
T  44222829 gttttttctaaattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaatacca 44222928  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44222929 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47895002 - 47894822
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  47895002 gttttttttagattacctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47894903  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47894902 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 36368939 - 36369120
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  36368939 gttttttctagattacctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36369038  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  36369039 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccacca-tcttccatgggtgctctagttatcacc 36369120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 41216455 - 41216639
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||    
T  41216455 gttttttctagattacctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggatacca 41216554  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41216555 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacctt 41216639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 196 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52911245 - 52911109
Alignment:
Q  196 ttatttctttctttcttcactactttctcacttcaaatgttgtgtttctttgtccactctgccttcatgttgttcccattgaaaaaggnnnnnnnnnnnt 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  52911245 ttatttctttctttcttcactactttctcacttcaaatgttgtgtttctttgtccattctgccttcatgttgttcccattgaaaaaggaaaaaaaaatat 52911146  T
Q  296 ggtactcatacaatttcaacatgcttaattgttcatc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52911145 ggtactcatacaatttcaacatgcttaattgttcatc 52911109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5560214 - 5560025
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatga-----aaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatgga 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||    
T  5560214 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatgga 5560115  T
Q  108 taccatttaaaaatatgcttatgtggc--taatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5560114 taccacttaaaaatatgcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 18946904 - 18947086
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  18946904 ttttttctagattatctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccag 18947003  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18947004 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacct 18947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 53637841 - 53637990
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  53637841 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggatacca 53637940  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacc 162  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||    
T  53637941 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51146397 - 51146215
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||| || ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  51146397 gttttttctagattatctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggatacca 51146298  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51146297 cttaaaaatttgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccacc 51146215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48547011 - 48546836
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  48547011 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tc-aaatagttcatggatacca 48546914  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| ||||||||         ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  48546913 cttaaaaatgtgcttatg---------tgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcatcttat 48546836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54159170 - 54159000
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||| || || |||||||    
T  54159170 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagatacca 54159071  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| ||||||||         |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54159070 cttaaaaatgtgcttatg---------tgtattggttggggt-aattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtca 54159000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 42589830 - 42590006
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  42589830 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 42589922  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  42589923 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttatt 42590006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 46949379 - 46949538
Alignment:
Q  17 tttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattta 116  Q
    ||||||||||  ||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||||| |||    
T  46949379 tttctagattatctttgaaga-tggtgtgtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccactta 46949477  T
Q  117 aaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  46949478 aaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggtt-ggataaattacccaccattcttccatgg 46949538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 25641646 - 25641819
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |             
T  25641646 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca--------- 25641736  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
      |||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  25641737 --taaatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 25641819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 37758929 - 37759075
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||| || || |||||||    
T  37758929 gttttttctagattgcttttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagatacca 37759028  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaatt 159  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37759029 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550465
Alignment:
Q  80 tgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatggg 179  Q
    |||||||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  180 taccctagttgtcacctt 197  Q
    ||||||||||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacctt 33550465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 197
Target Start/End: Original strand, 52864550 - 52864673
Alignment:
Q  73 agcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattctt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  52864550 agcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgag-taaattacccaccattctt 52864648  T
Q  173 ccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52864649 ccatgggtaccctagttgtcacctt 52864673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 55379985 - 55380156
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  55379985 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 55380084  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55380085 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 49130578 - 49130752
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || | |||| ||| || ||| |||       
T  49130578 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaata--- 49130674  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
            | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  49130675 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctcctta 49130752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 51415969 - 51416143
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  51415969 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtata--- 51416065  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
            | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  51416066 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 51416143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 53115447 - 53115620
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  53115447 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 53115546  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||           ||  ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53115547 cttaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacctt 53115620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 25353554 - 25353726
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  25353554 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 25353653  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
      ||||||           ||  ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353654 cctaaaaa-----------ggtgaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 25353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 54707391 - 54707219
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  54707391 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 54707295  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  54707294 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 54707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34279892 - 34279721
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  34279892 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 34279800  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  34279799 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacc 34279721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38156803 - 38156632
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  38156803 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 38156707  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38156706 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41635971 - 41635792
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  41635971 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 41635879  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttct 203  Q
        || || |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41635878 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcaccttatttct 41635792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 54401187 - 54401360
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  54401187 gttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 54401279  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  54401280 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacctt 54401360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55000349 - 55000176
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| || ||| |||       
T  55000349 gttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata--- 55000253  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55000252 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 55000176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28576283 - 28576176
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  28576283 gttttttctagattacctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T
Q  113 tttaaaaa 120  Q
    | ||||||    
T  28576183 tctaaaaa 28576176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31286963 - 31286790
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||            
T  31286963 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 31286872  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
       || || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31286871 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctta 31286790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 40022075 - 40022240
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||            
T  40022075 ttttttctaaattacctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-------- 40022166  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttg 190  Q
       || || |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| | ||||||    
T  40022167 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcgtagttg 40022240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41882161 - 41882055
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  41882161 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccat 41882062  T
Q  114 ttaaaaa 120  Q
     ||||||    
T  41882061 ctaaaaa 41882055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47511111 - 47510935
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  47511111 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 47511019  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
        || || |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  47511018 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccatatt 47510935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39141297 - 39141123
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| ||        
T  39141297 gttttttctaaattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat---- 39141202  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
         | || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| |||||||    
T  39141201 -----atatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacctt 39141123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21597319 - 21597220
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21597319 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30251672 - 30251499
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  30251672 gttttttctagactacctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 30251573  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
      ||||||           ||  ||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30251572 cctaaaaa-----------ggtgaatgttcattggttgggctaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 30251499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 51143818 - 51143987
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||     
T  51143818 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccac 51143917  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     ||||||           ||  ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  51143918 ctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 24688113 - 24688285
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||          
T  24688113 tgttttttctaaattacctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatg------ 24688206  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
         || || || ||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  24688207 -----aatatgtgtttatgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 17665695 - 17665549
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  17665695 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 17665603  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattc 170  Q
        || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17665602 ----aatatatgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattc 17665549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  62 caatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429221
Alignment:
Q  108 taccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacctaattt 30429221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 37028723 - 37028894
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| ||| || ||| |||       
T  37028723 gttttttttaaattacctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaata--- 37028819  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  37028820 --------tgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37028894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 50732083 - 50731979
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||     
T  50732083 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatc 50731984  T
Q  115 taaaa 119  Q
    |||||    
T  50731983 taaaa 50731979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 119
Target Start/End: Original strand, 50780773 - 50780877
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||     
T  50780773 tttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggataccatc 50780872  T
Q  115 taaaa 119  Q
    |||||    
T  50780873 taaaa 50780877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51224208 - 51224038
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  51224208 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 51224117  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  51224116 ----aatatgtgcttatgtgactaatatatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 51224038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 42998959 - 42998861
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  42998959 gttttttctagattacctttgaa-aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 42998861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43176908 - 43176738
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||   |||| ||| |||||||||||||     
T  43176908 ttttttctagattacctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccac 43176809  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||        | ||||   || | |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43176808 ctaaaa--------aggtgg---atgtttattggttgggataaattacccatcatttttccatgggtaccctagttgtcacc 43176738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 45058883 - 45059052
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  45058883 gttttttttaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 45058975  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
        || || ||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||    
T  45058976 ----aatatgtgcttatgttgctaatgtatattgattggggtaaattacccatcattctttcatgggcagcctagttgtca 45059052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48534079 - 48534002
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  48534079 tgcttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttatt 48534002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48726169 - 48726062
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |  |||| | | || ||||||||||    
T  48726169 gttttttctaaattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T
Q  113 tttaaaaa 120  Q
    | ||||||    
T  48726069 tctaaaaa 48726062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44946084 - 44946019
Alignment:
Q  29 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  44946084 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 44946019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 52434139 - 52434216
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataattt-acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  52434139 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Original strand, 177162 - 177258
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatac 110  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  177162 ttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatac 177258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 48752085 - 48752161
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg 89  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  48752085 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50731962 - 50731914
Alignment:
Q  147 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50731962 gttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 50780894 - 50780942
Alignment:
Q  147 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50780894 gttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 40165653 - 40165822
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||     
T  40165653 ttttttctaaattatctttgaaaaataatgg-taatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccac 40165751  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||  ||           ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  40165752 ctaaaaaggtg-----------aatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtaccctggttgtcacc 40165822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44946007 - 44945932
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  || ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  44946007 tgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacctta 44945932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2228106 - 2228032
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtg 87  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2228106 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtg 2228032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 8847827 - 8847721
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||  || |||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | | |||||| |    
T  8847827 tttttttaaattacctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccact 8847728  T
Q  115 taaaaat 121  Q
    |||||||    
T  8847727 taaaaat 8847721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52756127 - 52756067
Alignment:
Q  135 taatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  52756127 taatgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41882053 - 41882010
Alignment:
Q  153 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41882053 gtaaattatccaccattcttccacgggtaccctagttgtcacct 41882010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47402911 - 47402813
Alignment:
Q  22 agattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaat 121  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  47402911 agattacctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcat-gataccatttaaaaat 47402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 201
Target Start/End: Original strand, 40688435 - 40688489
Alignment:
Q  147 gttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40688435 gttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcaccttattt 40688489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 37741435 - 37741487
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaat 65  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37741435 gttttttttagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 194
Target Start/End: Original strand, 37760346 - 37760386
Alignment:
Q  154 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37760346 taaattacccaccattcttccataggtaccctagttatcac 37760386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42998842 - 42998790
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  42998842 tattggttgggataaattacccaccatttttccatgagtaccttagttgtcac 42998790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43260892 - 43260841
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43260892 tattaattgaggtaaattacccactatttttccatggataccctagttgtca 43260841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 110
Target Start/End: Original strand, 41609100 - 41609164
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatac 110  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| || ||||||||    
T  41609100 taatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatac 41609164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 51942587 - 51942543
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccac 57  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  51942587 gttttttctagattacctttgaagaatggtaggtaatttacccac 51942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 125)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 6019929 - 6020109
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||     
T  6019929 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccac 6020028  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020029 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 34276547 - 34276731
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  34276547 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 34276646  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34276647 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34276731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2826863 - 2826681
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  2826863 gttttttctagattccctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 2826764  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2826763 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 41560328 - 41560510
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  41560328 gttttttttaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 41560427  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41560428 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 41560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21366789 - 21366609
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  21366789 tttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 21366690  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366689 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 9798465 - 9798647
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  9798465 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 9798564  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9798565 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 23437592 - 23437774
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  23437592 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 23437691  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23437692 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31532317 - 31532135
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  31532317 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31532218  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31532217 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47662284 - 47662099
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  47662284 gttttttctagattacctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggatacca 47662185  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47662184 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctta 47662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 50234000 - 50234185
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  50234000 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggatacca 50234099  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50234100 cttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacctta 50234185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 237477 - 237661
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  237477 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataaca 237576  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  237577 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22618693 - 22618511
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  22618693 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccac 22618595  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22618594 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggtt-aggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 22618511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42766023 - 42765840
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  42766023 gttttttctagattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcat-gatacca 42765925  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42765924 cttaaaaatgtgctaatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 42765840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 42085207 - 42085390
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  42085207 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 42085306  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42085307 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 29478360 - 29478542
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  29478360 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 29478459  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29478460 cttaaaaatgtgcttatatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 47344656 - 47344838
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  47344656 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 47344755  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47344756 cttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 53854611 - 53854430
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  53854611 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 53854512  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53854511 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3692392 - 3692207
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  3692392 gttttttctagattacctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgatacca 3692293  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3692292 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 3692207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 32366842 - 32366661
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  32366842 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 32366743  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366742 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 53461998 - 53461813
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  53461998 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 53461899  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53461898 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 53461813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 44984763 - 44984943
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  44984763 tttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 44984862  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44984863 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 6285307 - 6285486
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  6285307 gttttttctatattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggatacca 6285406  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 192  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6285407 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 39077545 - 39077728
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||    
T  39077545 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 39077644  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39077645 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18462195 - 18462013
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  18462195 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatca 18462096  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18462095 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 51363007 - 51363188
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  51363007 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 51363106  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51363107 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54575122 - 54574940
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  54575122 gttttttctagattatcttagaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggatacca 54575023  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54575022 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 55519827 - 55520009
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  55519827 gttttttctagattacttttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggatacca 55519926  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55519927 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29777439 - 29777254
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||| ||||||||    
T  29777439 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggatacca 29777340  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
     |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29777339 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctta 29777254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 146611 - 146427
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  146611 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 146512  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  146511 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttctatgcgtactctagttgtcacctt 146427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 2243458 - 2243646
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2243458 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggatacca 2243557  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
     |||||||| |  |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2243558 cttaaaaatgtatttatgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccttattt 2243646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41702641 - 41702461
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| || ||||||||||    
T  41702641 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggatacca 41702542  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41702541 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19387870 - 19387683
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||    
T  19387870 gttttttctagattacgtttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggatacca 19387771  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19387770 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 19387683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 31914198 - 31914380
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  31914198 gttttttttagattacctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 31914297  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31914298 cttaaaaatgtgcttatg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43471877 - 43471694
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||| || ||||||||||    
T  43471877 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggatacca 43471778  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43471777 cttaaaaatgtgattatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 43471694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 55056441 - 55056258
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| |    
T  55056441 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaa 55056342  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  55056341 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26091440 - 26091258
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  26091440 gttttttctaaattatcttggaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 26091341  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091340 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 48313557 - 48313737
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  48313557 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 48313655  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     || ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48313656 ctt-aaaatatgcttatgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50457992 - 50457806
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  50457992 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 50457893  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50457892 cttaaaaatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcatcttat 50457806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 54607962 - 54608144
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  54607962 gttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtatacca 54608061  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54608062 cttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatggataccctagtagtcacc 54608144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 41949382 - 41949566
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  41949382 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 41949481  T
Q  113 tttaaaaatatgct--tatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41949482 cttaaaaatgtgcttatatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 397402 - 397582
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  397402 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 397501  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
     |||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  397502 cttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 38591668 - 38591849
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  38591668 gttttttctagattacatttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 38591767  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    ||    ||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591768 tt----aatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 38591849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 55776045 - 55776228
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  55776045 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 55776143  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  55776144 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55776228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 55840223 - 55840406
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  55840223 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatacca 55840321  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  55840322 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcacctt 55840406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 27373076 - 27373257
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  27373076 gttttttctagattacctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 27373175  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  27373176 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtcacc 27373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50536806 - 50536628
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  50536806 gttttttttagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggatacca 50536707  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50536706 cttaaaaatatgtttatgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 54086410 - 54086590
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||     
T  54086410 gttttttctagattac-tttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccg 54086507  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54086508 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 45797479 - 45797663
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  45797479 gttttttttagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 45797578  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45797579 cttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 45797663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 3170626 - 3170809
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||| ||    
T  3170626 gttttttctagattacctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatca 3170725  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3170726 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacct 3170809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31972515 - 31972336
Alignment:
Q  16 ttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattt 115  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||| ||    
T  31972515 ttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccactt 31972416  T
Q  116 aaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31972415 aaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 407754 - 407934
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  407754 gttttttctagattacctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-ca 407852  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  407853 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31070255 - 31070070
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| || ||| ||||||    
T  31070255 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-atacca 31070157  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
     |||||||| |||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070156 cttaaaaatgtgctcatgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 31070070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 42222292 - 42222473
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| || || |||||||     
T  42222292 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccac 42222391  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42222392 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49881245 - 49881059
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  49881245 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 49881146  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttgggg----taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49881145 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22468951 - 22468788
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||     
T  22468951 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccac 22468852  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatg 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22468851 ttaaaaatatgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccatg 22468788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 23609087 - 23609269
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  23609087 gttttttctagattatctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggatacca 23609186  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23609187 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41632188 - 41632007
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||| |     
T  41632188 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcg 41632090  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41632089 cttaaaaatgtacttatatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 56023180 - 56022998
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  56023180 gttttttctagattacctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggatacca 56023081  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  56023080 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 191
Target Start/End: Original strand, 50534632 - 50534809
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||||||||||     
T  50534632 ttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccac 50534731  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50534732 ttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgt 50534809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 33897675 - 33897504
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  33897675 tttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 33897576  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 186  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33897575 taaaaatatgattatatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtacccta 33897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 35446506 - 35446683
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||||| ||    
T  35446506 gttttttctagattaccttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatca 35446604  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35446605 cttaaaaatgtgcttatttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 42033175 - 42033357
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| || ||||||||||    
T  42033175 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggatacca 42033274  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| || |||||| |||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42033275 cttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14017556 - 14017374
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  14017556 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 14017457  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     ||  || | || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14017456 ctt--aagtgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 14017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 53 - 197
Target Start/End: Original strand, 48657858 - 48658002
Alignment:
Q  53 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggg 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  48657858 cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggg 48657957  T
Q  153 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48657958 gtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 48658002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 54424982 - 54425163
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||    
T  54424982 gttttatctagattccctatgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagatacca 54425081  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  54425082 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat-ggtacactagttgtcacc 54425163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39587961 - 39587796
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  39587961 gttttttctagattacctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 39587862  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgg 178  Q
     |||||||| ||||||| |  ||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587861 cttaaaaatgtgcttatataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccatgg 39587796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53834235 - 53834055
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||||||     
T  53834235 ttttttctagattacttttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccac 53834136  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| | ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53834135 ttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 202
Target Start/End: Original strand, 48654815 - 48655009
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || || |||||||     
T  48654815 ttttttttagattacctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccac 48654914  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggcta------atatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttc 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||      || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  48654915 ttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcaccttgtttc 48655009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48259691 - 48259507
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| || ||| ||||||     
T  48259691 ttttttctagattacccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccac 48259592  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  48259591 tt-aaaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctacttatcaccttatt 48259507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 1932763 - 1932947
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || || |||||||    
T  1932763 gttttttctagattacctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagatacca 1932862  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  1932863 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacctt 1932947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54805800 - 54805614
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| || || |||||||    
T  54805800 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagatacca 54805701  T
Q  113 tttaaaaatatg----cttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| ||     ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  54805700 cttaaaaatgtgtttatttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728307
Alignment:
Q  53 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggg 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||| |    
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  153 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52728307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9998102 - 9997931
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||| |||       
T  9998102 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata--- 9998006  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9998005 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36533002 - 36532828
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||        | ||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  36533002 gttttttctaaattacctttgaagaatgatgggtaattta--cacc--------acaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 36532913  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36532912 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacctt 36532828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 54715035 - 54715213
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || ||| |||       
T  54715035 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaata--- 54715131  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttc 202  Q
            | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54715132 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcaccttctttc 54715213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 51951683 - 51951861
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||  |||| ||| || ||||||| ||     
T  51951683 ttttttctagattacttttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcag 51951782  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  51951783 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 52688349 - 52688520
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||           
T  52688349 gttttttctaaattaccttagaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatg------- 52688441  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  52688442 ----aatatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Original strand, 34835177 - 34835351
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  34835177 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 34835276  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    | ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835277 tctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctta 34835351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 43890929 - 43891101
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||| || ||| |||        
T  43890929 ttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaata---- 43891024  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
           | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43891025 -------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacctt 43891101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 195
Target Start/End: Original strand, 35595777 - 35595869
Alignment:
Q  103 atggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35595777 atggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 35595869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 45633950 - 45633779
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||       
T  45633950 gttttttttaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata--- 45633854  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45633853 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20352012 - 20351838
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| || |||            
T  20352012 ttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatg-------- 20351921  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 199  Q
       || || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  20351920 ---aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcaccttat 20351838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 193
Target Start/End: Original strand, 54216313 - 54216482
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| || |||           
T  54216313 gttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatg------- 54216405  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 193  Q
        || || ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54216406 ----aatatgtgcttatgttgctaatgtgtattggttggggtaaattatcgatcattctttcatgggtaacctagttgtca 54216482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37239261 - 37239088
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  37239261 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 37239169  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  37239168 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 37239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38547772 - 38547600
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  38547772 gttttttttagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 38547673  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  38547672 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacct 38547600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5117609 - 5117438
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  5117609 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 5117517  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||||||||||||    
T  5117516 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttaatggatagtctagttgtcacc 5117438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15060460 - 15060289
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  15060460 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 15060368  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15060367 ----aatatgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 22620593 - 22620764
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  22620593 gttttttctaaattatctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 22620685  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  22620686 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccatcattcttttatgggtagcctagttgccacc 22620764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 33289703 - 33289873
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||| || ||| ||||      
T  33289703 gttttttctaaattacctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-- 33289800  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
              |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  33289801 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta-ttgtcacc 33289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 194
Target Start/End: Original strand, 33048991 - 33049062
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33048991 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Original strand, 42509351 - 42509478
Alignment:
Q  68 aaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccacca 167  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  42509351 aaatgaccaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccacca 42509450  T
Q  168 ttcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42509451 ttcttccatgagtaccctagttatcacc 42509478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4486752 - 4486579
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| |||           
T  4486752 gttttttctaaattatctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg------- 4486660  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  4486659 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacctt 4486579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 46720025 - 46720205
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||||    
T  46720025 gttttttctagattaactttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggatacca 46720124  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
      ||||||  ||  |||       || | |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46720125 cctaaaaaggtg-atat-------atgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgttaccttattt 46720205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 48259780 - 48259699
Alignment:
Q  118 aaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48259780 aaatgtgcttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccttatt 48259699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 47811906 - 47812082
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| | |  |||| ||| || ||| |||       
T  47811906 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata--- 47812002  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatt 200  Q
            | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  47812003 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcaccttatt 47812082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 34552319 - 34552490
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||| || |||           
T  34552319 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatg------- 34552411  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34552412 ----aatatgtgcttatgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6371421 - 6371247
Alignment:
Q  12 tgttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||    
T  6371421 tgttttttctagattacctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttacc 6371322  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
    |  ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  6371321 acctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 6371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31881485 - 31881311
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||           
T  31881485 gttttttctaaattacctatgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg------- 31881393  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
        || || |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  31881392 ----aatatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 31881311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 27580120 - 27580218
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27580120 ttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27580218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1662430 - 1662259
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  1662430 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 1662331  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
      |||||| ||             || |  ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1662330 cctaaaaagat-------------atgttcattggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcacctt 1662259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 27398774 - 27398666
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  27398774 gttttttctagattacttttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 27398675  T
Q  113 tttaaaaat 121  Q
     ||||||||    
T  27398674 cttaaaaat 27398666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 42557583 - 42557663
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42557583 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa 42557663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54216907 - 54216736
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| ||| || |||           
T  54216907 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatg------- 54216815  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
        || || ||||||||||  |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  54216814 ----aatatgtgcttatgtgattaatgtgtattggttgggataaattaccctccattcttccatggataccctagttatcacc 54216736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 195
Target Start/End: Original strand, 27872608 - 27872750
Alignment:
Q  42 tggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||           ||  ||| |     
T  27872608 tggataatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaa-----------ggtgaatgtt 27872696  T
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  27872697 tattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccgtagttgtcacc 27872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 46708908 - 46708734
Alignment:
Q  17 tttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattta 116  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| || |||               
T  46708908 tttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatg----------- 46708820  T
Q  117 aaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttc 202  Q
    || || |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||    
T  46708819 aatatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacctcatttc 46708734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 151
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396865
Alignment:
Q  61 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaa-ataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttgg 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgg 52396865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Original strand, 43231503 - 43231602
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  43231503 gttttttctagattac-tttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27873719 - 27873548
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| | || ||| || ||| |||       
T  27873719 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata--- 27873623  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
            | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  27873622 --------tgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctt--ttgggtagcctagttgtcacctt 27873548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14335271 - 14335173
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| || || |||||||    
T  14335271 ttttttctagattacctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagatacca 14335173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 195
Target Start/End: Original strand, 49014113 - 49014269
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| || |||           || || | |||    
T  49014113 cctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatg-----------aatatgtactt 49014201  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  49014202 atgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 196
Target Start/End: Original strand, 52461396 - 52461535
Alignment:
Q  46 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtatt 145  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||           | |||||||||||||||| ||||||    
T  52461396 taatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggctaatgtgtatt 52461484  T
Q  146 agttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  52461485 ggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgccacct 52461535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 194
Target Start/End: Original strand, 35344878 - 35344968
Alignment:
Q  103 atggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 194  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35344878 atggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttgg-taaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtcac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 205
Target Start/End: Original strand, 573807 - 573984
Alignment:
Q  17 tttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccattta 116  Q
    |||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||    
T  573807 tttctagattacctttaaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaccta 573906  T
Q  117 aaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatttcttt 205  Q
    ||||  ||           ||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| | |||||||    
T  573907 aaaaagtg-----------aatgtttattggttggggtaaattacccactatttttccatgagtacactagttgtcaccatttttcttt 573984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3293194 - 3293113
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  3293194 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaa 3293113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11972300 - 11972219
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaa 94  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||    
T  11972300 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaa 11972219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33558112 - 33557960
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||| ||| || |||            
T  33558112 ttttttctaaattatctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatg-------- 33558021  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatg 177  Q
       || || |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33558020 ---aatatgtatttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatg 33557960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 49058038 - 49057933
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || | | |||||| || || ||||||||    
T  49058038 ttttttctagattacctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccat 49057939  T
Q  114 ttaaaa 119  Q
    ||||||    
T  49057938 ttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 198
Target Start/End: Original strand, 42558300 - 42558370
Alignment:
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    ||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42558300 atgtggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgtcacctta 42558370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291802
Alignment:
Q  127 tatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 198  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcacctta 3291802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 17555668 - 17555617
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaa 64  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  17555668 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14335144 - 14335100
Alignment:
Q  152 ggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14335144 ggtaaattacccaccattctttcatgggtactctagttgtcacct 14335100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51981551 - 51981479
Alignment:
Q  123 tgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||  |||||| |||||    
T  51981551 tgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcattggtagactagttatcacc 51981479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 142 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 27398656 - 27398607
Alignment:
Q  142 tattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  27398656 tattggttggggtaaattacccaccattttttcattggtaccctagttgt 27398607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18206553 - 18206512
Alignment:
Q  154 taaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18206553 taaattacccatcatttttccatgggtaccttagttgtcacc 18206512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981572
Alignment:
Q  50 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggat 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggat 51981572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 1871 - 2051
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  1871 tttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 1970  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971 taaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 39738 - 39554
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||    
T  39738 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacca 39639  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39638 cttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11312 - 11133
Alignment:
Q  15 tttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatt 114  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |    
T  11312 tttttctagattaccttt-aagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccact 11214  T
Q  115 taaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11213 taaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19036 - 18848
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  19036 gttttttctagattatctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggatacca 18937  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 201  Q
     |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18936 cttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcaccttattt 18848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 75426 - 75242
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  75426 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcatacca 75327  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     |||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  75326 cttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcacctt 75242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2614 - 2432
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2614 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatacca 2515  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2514 cttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Original strand, 278006 - 278192
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc- 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||     
T  278006 gttttttttagattacctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccc 278105  T
Q  112 -atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 197  Q
     | |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278106 cacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 196
Target Start/End: Original strand, 176669 - 176837
Alignment:
Q  28 cctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgctt 127  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| || ||||| | |||    
T  176669 cctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgtactt 176768  T
Q  128 atgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  176769 atgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 32561 - 32715
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  32561 gttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacca 32660  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccacca 167  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32661 tttaaaaatgtgtttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccacca 32715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4596
Alignment:
Q  55 caccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccatttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggt 154  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  155 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4636 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 3089 - 3262
Alignment:
Q  14 ttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggataccat 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||  |||         |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||     
T  3089 ttttttctagattacctttgaagaatggtgggtaatttattcac---------aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcac 3179  T
Q  114 ttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 196  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  3180 ttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttctatggataccttagttgtcacct 3262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20648 - 20477
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20648 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggatacca 20549  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20548 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 14744 - 14915
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  14744 gttttgtctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacca 14843  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
      ||||||           ||  ||| | |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14844 cctaaaaa-----------ggtgaatgtttattggttggggtaaattacctaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Original strand, 7090 - 7262
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||| || ||| |||      
T  7090 gttttttctaaattacctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-- 7187  T
Q  112 atttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
             | |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7188 ---------tgtgcttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 102 - 201
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  |||| ||| |||||| ||||||    
T  102 gttttttctagattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaatacca 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 195
Target Start/End: Original strand, 221 - 272
Alignment:
Q  143 attagttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  221 attggttgaggtaaatt-cccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 4726 - 4618
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||| ||| || |||||||||    
T  4726 gttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacc 4627  T
Q  112 atttaaaaa 120  Q
    |||||||||    
T  4626 atttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4596 - 4554
Alignment:
Q  153 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4596 gtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 4554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3500
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatg-aaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacc 111  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||| ||| || |||||||||    
T  3392 gttttttctagattacctttcaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggatacc 3491  T
Q  112 atttaaaaa 120  Q
    |||||||||    
T  3492 atttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 195
Target Start/End: Original strand, 3522 - 3564
Alignment:
Q  153 gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3522 gtaaattatccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 3564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 161
Target Start/End: Original strand, 17906 - 18043
Alignment:
Q  13 gttttttctagattgcctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaataatttatggatacca 112  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||  |||||||| |||||| ||||      
T  17906 gttttttctaaattacctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac-- 18003  T
Q  113 tttaaaaatatgcttatgtggctaatatgtattagttggggtaaattac 161  Q
              |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18004 ---------gtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University