View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12017_high_2 (Length: 785)

Name: NF12017_high_2
Description: NF12017
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12017_high_2
NF12017_high_2
[»] chr6 (95 HSPs)
chr6 (19-785)||(27604149-27604916)
chr6 (28-785)||(26802418-26803174)
chr6 (28-782)||(27592475-27593228)
chr6 (28-782)||(27678925-27679678)
chr6 (28-782)||(27677074-27677822)
chr6 (28-782)||(27705858-27706610)
chr6 (377-785)||(27698297-27698705)
chr6 (414-785)||(27718219-27718590)
chr6 (414-785)||(27610842-27611213)
chr6 (28-719)||(27427066-27427751)
chr6 (423-782)||(28781118-28781477)
chr6 (423-782)||(28786257-28786616)
chr6 (423-782)||(28792378-28792737)
chr6 (504-785)||(27724775-27725056)
chr6 (19-782)||(26646458-26647216)
chr6 (19-782)||(26752426-26753184)
chr6 (344-782)||(26884142-26884580)
chr6 (19-317)||(28786677-28786975)
chr6 (19-317)||(28792798-28793096)
chr6 (357-784)||(27530983-27531407)
chr6 (19-314)||(28781543-28781838)
chr6 (51-783)||(25579697-25580427)
chr6 (423-782)||(26861595-26861951)
chr6 (51-779)||(25538522-25539248)
chr6 (19-231)||(27717944-27718156)
chr6 (51-779)||(26142847-26143573)
chr6 (19-236)||(27610565-27610782)
chr6 (514-782)||(31284267-31284535)
chr6 (432-785)||(26655965-26656318)
chr6 (432-785)||(26761936-26762289)
chr6 (422-779)||(25481724-25482081)
chr6 (28-291)||(27698040-27698301)
chr6 (397-784)||(26055903-26056290)
chr6 (397-784)||(26075873-26076260)
chr6 (432-782)||(27337923-27338273)
chr6 (432-782)||(27398663-27399013)
chr6 (463-782)||(28234543-28234861)
chr6 (463-761)||(28226950-28227248)
chr6 (541-779)||(26048827-26049065)
chr6 (541-779)||(26069996-26070234)
chr6 (514-782)||(26622955-26623223)
chr6 (514-782)||(26728933-26729201)
chr6 (34-209)||(27530761-27530936)
chr6 (525-782)||(28242783-28243040)
chr6 (525-783)||(28325459-28325717)
chr6 (580-761)||(26823840-26824021)
chr6 (489-782)||(26848639-26848932)
chr6 (480-782)||(28181093-28181395)
chr6 (654-785)||(27229208-27229339)
chr6 (480-782)||(28185345-28185647)
chr6 (571-761)||(28139541-28139731)
chr6 (480-782)||(28297619-28297921)
chr6 (480-782)||(28514152-28514454)
chr6 (423-782)||(27214396-27214758)
chr6 (423-782)||(27234470-27234832)
chr6 (535-782)||(26937073-26937320)
chr6 (507-744)||(28098302-28098539)
chr6 (640-757)||(25506975-25507092)
chr6 (590-782)||(28149917-28150108)
chr6 (50-189)||(31285126-31285265)
chr6 (482-782)||(26949640-26949940)
chr6 (514-782)||(29826006-29826274)
chr6 (537-782)||(26341894-26342142)
chr6 (28-192)||(26623835-26623999)
chr6 (28-192)||(26729812-26729976)
chr6 (50-189)||(26656532-26656671)
chr6 (50-189)||(26762503-26762642)
chr6 (559-782)||(26811488-26811711)
chr6 (590-761)||(2184288-2184459)
chr6 (51-206)||(25483609-25483764)
chr6 (482-780)||(26975033-26975331)
chr6 (590-779)||(2184880-2185069)
chr6 (482-782)||(26635669-26635969)
chr6 (482-782)||(26741635-26741935)
chr6 (482-782)||(27665025-27665325)
chr6 (54-206)||(25511488-25511640)
chr6 (646-782)||(26893543-26893679)
chr6 (51-207)||(27215001-27215157)
chr6 (51-206)||(26056472-26056627)
chr6 (51-206)||(26076442-26076597)
chr6 (50-205)||(26884621-26884776)
chr6 (48-114)||(27337569-27337635)
chr6 (48-114)||(27398309-27398375)
chr6 (482-679)||(25071741-25071938)
chr6 (48-115)||(25492793-25492860)
chr6 (34-115)||(26824460-26824541)
chr6 (482-677)||(26959250-26959445)
chr6 (487-553)||(25506897-25506963)
chr6 (490-679)||(24715667-24715856)
chr6 (50-106)||(26862230-26862286)
chr6 (714-761)||(28491660-28491707)
chr6 (714-761)||(29804070-29804117)
chr6 (736-782)||(26617305-26617351)
chr6 (736-782)||(26723233-26723279)
chr6 (712-782)||(29467806-29467876)
[»] scaffold0349 (4 HSPs)
scaffold0349 (414-785)||(3260-3633)
scaffold0349 (414-785)||(14196-14566)
scaffold0349 (19-231)||(2984-3196)
scaffold0349 (183-236)||(14082-14135)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (28-719)||(59612-60297)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (28-719)||(18073804-18074489)
chr4 (27-782)||(18698849-18699595)
chr4 (27-782)||(18730953-18731699)
chr4 (19-782)||(18679001-18679762)
chr4 (27-782)||(18654926-18655672)
chr4 (27-782)||(18723534-18724280)
chr4 (522-782)||(5090902-5091162)
chr4 (544-719)||(17989013-17989185)
[»] scaffold0277 (4 HSPs)
scaffold0277 (432-782)||(4529-4879)
scaffold0277 (432-782)||(13490-13840)
scaffold0277 (19-314)||(13120-13415)
scaffold0277 (31-317)||(4169-4457)
[»] scaffold0419 (2 HSPs)
scaffold0419 (432-782)||(7504-7854)
scaffold0419 (19-314)||(7929-8224)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (28-782)||(267794-268552)
chr1 (424-745)||(28127516-28127837)
chr1 (424-779)||(28164200-28164554)
chr1 (54-115)||(28163855-28163916)
chr1 (54-207)||(28127155-28127308)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (432-782)||(29273628-29273978)
chr8 (33-208)||(29273297-29273472)
chr8 (643-761)||(31903851-31903969)
chr8 (66-115)||(16440694-16440743)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (463-782)||(34704-35023)
scaffold0038 (480-761)||(27448-27729)
scaffold0038 (525-782)||(42945-43202)
scaffold0038 (525-783)||(116774-117032)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (667-782)||(10-125)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (537-782)||(58245-58490)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (538-780)||(16688992-16689234)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (626-782)||(3279667-3279823)
chr2 (483-782)||(17993593-17993892)
chr2 (643-760)||(17711967-17712084)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 584; Significance: 0; HSPs: 95)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 584; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 785
Target Start/End: Original strand, 27604149 - 27604916
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27604149 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagagatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaataggataattggcaacatgtaaggg 27604248  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27604249 ctgacgactgatcttgttggagatttctttcactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtatgtaacaaca 27604348  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggt 317  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27604349 tcataatcacatccatgtacactcagaatatattatacatttctaactattttgacatataaataactaatacttgtttaaaaacgtaaataaaaaaggt 27604448  T
Q  318 atttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtac 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27604449 atttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggtaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttatgtagtgttgagtac 27604548  T
Q  418 ctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacc 517  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||    
T  27604549 ccaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctttatgttatcctcatcattttgaaacc 27604648  T
Q  518 tcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctt 617  Q
    | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27604649 tttttttatgctcagccaatgcttgaccgtaactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctt 27604748  T
Q  618 tgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttca 717  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27604749 tgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaaacacaggaataaaaatcctggattcatca 27604848  T
Q  718 atggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  27604849 atggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatg 27604916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 26803174 - 26802418
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26803174 ggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttcttgtactcgagagtgcaatccaacagggtaattagcaacatgtaagggctgacgatt 26803075  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgta---acaacgtcacaa 224  Q
     ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  26803074 gatcttgttggagatgtatttgactatctctccaatcaacttgtattcatatctattcatgtccaacaagataagttagtatgtactaacaacatcacaa 26802975  T
Q  225 tcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttga 323  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||      
T  26802974 tcacatccatgta--ctcataatatattatacatttctaactatttcaacatataaataactaatacttgtttaaaaacgtatataagaaaggtattt-- 26802879  T
Q  324 tctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctagga 423  Q
     | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26802878 -cccatttaacctttaagatgagattattgggaaattgaagttgaagaaataaaatataaaagggaaaaataggatttaagtaaagttgggtaccgagga 26802780  T
Q  424 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 523  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  26802779 ggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctccaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctttttt 26802680  T
Q  524 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26802679 catgctcagccaatgcttcaccatagctacatgtatgatggcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtctt 26802580  T
Q  624 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 723  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26802579 atagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagattcttcaatggcc 26802480  T
Q  724 ttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802479 ttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 26802418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 782
Target Start/End: Original strand, 27592475 - 27593228
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  27592475 ggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatttaagggctgtcgact 27592574  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatca 227  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  27592575 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcacaatca 27592674  T
Q  228 catccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaata---ctttttaaaaac-gtaaataaaaaaggtatttga 323  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| || ||||| ||| |||||||||||||||      
T  27592675 catccatgta--ctaagaatgtattatacatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttgtttaaaactgtatataaaaaaggtattt-- 27592770  T
Q  324 tctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctagga 423  Q
     | | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27592771 -cccttttaacctttaagatgagattattgtaaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagtaaagttgggtacccagga 27592869  T
Q  424 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 523  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27592870 ggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcgtctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctctttt 27592969  T
Q  524 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27592970 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtctt 27593069  T
Q  624 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 723  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27593070 gtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcc 27593169  T
Q  724 ttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27593170 ttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggt 27593228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 27679678 - 27678925
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27679678 ggaccccatcatcggatccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgtcgact 27679579  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatca 227  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  27679578 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcacaatca 27679479  T
Q  228 catccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaata---ctttttaaaaac-gtaaataaaaaaggtatttga 323  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| || ||||| ||| |||||||||||||||      
T  27679478 catccatgta--ctaagaatgtattatacatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttgtttaaaactgtatataaaaaaggtattt-- 27679383  T
Q  324 tctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctagga 423  Q
     | | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27679382 -cccttttaacctttaagatgagattattgtaaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagtaaagttgggtacccagga 27679284  T
Q  424 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 523  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27679283 ggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctttttccatccttgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctctttt 27679184  T
Q  524 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27679183 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaacagtaggttccacaccaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtctt 27679084  T
Q  624 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 723  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27679083 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcc 27678984  T
Q  724 ttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  27678983 ttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggt 27678925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 782
Target Start/End: Original strand, 27677074 - 27677822
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||    
T  27677074 ggaccccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcatttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggttgttgact 27677173  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatca 227  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  27677174 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcacaatca 27677273  T
Q  228 catccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatact--ttttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatc 325  Q
    ||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||| |||||||||||||||   |    
T  27677274 catccatgta--ct---aatgtattatacatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttttaaaactgtatataaaaaaggtattt---c 27677365  T
Q  326 tcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggagg 425  Q
     | ||||||||| || |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27677366 ccttttaacctttaagatgagattattgtgaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagtaaagttgggtacccaggagg 27677465  T
Q  426 actatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttca 525  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27677466 actatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgcttttcggatcattttgaaacctcttttca 27677565  T
Q  526 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgt 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27677566 tgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacaatagtaggttccacagcaaagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgt 27677665  T
Q  626 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 725  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27677666 agcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagcaataaaaatcctagactcttcaatggcctt 27677765  T
Q  726 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  |||||||||||    
T  27677766 gagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggt 27677822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 782
Target Start/End: Original strand, 27705858 - 27706610
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  27705858 ggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagtgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaagggatgtcgact 27705957  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatca 227  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||    
T  27705958 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagcttgtattcatatctattcatgtgcaataagataagttagtgtctaacaacatcccaatca 27706057  T
Q  228 catccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaata---ctttttaaaaac-gtaaataaaaaaggtatttga 323  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||| || ||||| ||| |||||||||||||||      
T  27706058 catccatgta--ctaagaatgtattattcatttctaactatttcgacatataaataactaatagtacttgtttaaaactgtatataaaaaaggtatttc- 27706154  T
Q  324 tctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctagga 423  Q
       | ||||| ||| || |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  27706155 ---cctttaaactttaagatgagattattgtgaaattgaagttgaagaaataaaatagaaaagggaaaaataggatttaagtaaagttgggtacccagga 27706251  T
Q  424 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 523  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27706252 ggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctctttt 27706351  T
Q  524 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27706352 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttctacaccaaataaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtctt 27706451  T
Q  624 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 723  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27706452 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcc 27706551  T
Q  724 ttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  |||||||||||    
T  27706552 ttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggt 27706610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 377 - 785
Target Start/End: Original strand, 27698297 - 27698705
Alignment:
Q  377 aatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttcca 476  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27698297 aatacaaaagggaaatataggatttaagtaaagttgggtacctgggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttcca 27698396  T
Q  477 tcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaa 576  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||      
T  27698397 tccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgctttgccataactacctttatgatgtctcacattagtt 27698496  T
Q  577 ggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcat 676  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27698497 ggttccacaccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcat 27698596  T
Q  677 agttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaat 776  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698597 agttgagagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaat 27698696  T
Q  777 gaaggtatg 785  Q
    |||||||||    
T  27698697 gaaggtatg 27698705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 414 - 785
Target Start/End: Original strand, 27718219 - 27718590
Alignment:
Q  414 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttga 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27718219 gtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttattcttatcattttga 27718318  T
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27718319 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 27718418  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718419 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 27718518  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718519 atcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 27718590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 414 - 785
Target Start/End: Original strand, 27610842 - 27611213
Alignment:
Q  414 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttga 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27610842 gtacccaggaggactatcatggtagccggaaaagtttgcagcctggctcagagccactttccatccctgcaacctctccatgttattcttatcattttga 27610941  T
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27610942 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcactttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 27611041  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611042 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 27611141  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611142 atcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 27611213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 28 - 719
Target Start/End: Original strand, 27427066 - 27427751
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  27427066 ggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgact 27427165  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgt--cacaat 225  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  27427166 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataatataagttagtatgtaacaacatcacacaat 27427265  T
Q  226 cacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgat 324  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||        
T  27427266 cacatccatgt--actcataatatattatacatttttaactattttgacatataaataactaacaattgtttaaaaacataaataaaaaaggtgtt---a 27427360  T
Q  325 ctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggag 424  Q
    | ||||||  ||| || |||    ||||| | ||| |||||| ||||||  |||| |||||  | |||| |||| ||||||||    | ||||| | ||     
T  27427361 cacatttaggctttaagatg---gtattgaggaatagaaattaaataaattaaatgcaaaa-agcaaaacaggaattaagtaaataggcgtacccatgac 27427456  T
Q  425 gactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttc 524  Q
     |  ||||||||||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27427457 tatcatcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttc 27427556  T
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  27427557 atgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttg 27427656  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaat 719  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27427657 tagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 27427751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 423 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28781477 - 28781118
Alignment:
Q  423 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 522  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28781477 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttt 28781378  T
Q  523 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 622  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28781377 tcatgtccagccaatgcttcaccataaggacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtct 28781278  T
Q  623 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggc 722  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28781277 tgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggc 28781178  T
Q  723 cttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28781177 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 28781118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 423 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28786616 - 28786257
Alignment:
Q  423 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 522  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28786616 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttt 28786517  T
Q  523 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 622  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28786516 tcatgcccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtct 28786417  T
Q  623 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggc 722  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28786416 tgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggc 28786317  T
Q  723 cttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786316 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 28786257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 423 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28792737 - 28792378
Alignment:
Q  423 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 522  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28792737 aggactagaatggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaacctcttt 28792638  T
Q  523 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 622  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28792637 tcatgcccagccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatcgacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtct 28792538  T
Q  623 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggc 722  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28792537 tgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggc 28792438  T
Q  723 cttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792437 cttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 28792378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 504 - 785
Target Start/End: Original strand, 27724775 - 27725056
Alignment:
Q  504 atcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaa 603  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27724775 atcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaa 27724874  T
Q  604 acgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724875 acgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaa 27724974  T
Q  704 tcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724975 tcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 27725056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26647216 - 26646458
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||       
T  26647216 ctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaat 26647117  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagta--tgtaacaa 216  Q
       |||| | ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  || | |||    
T  26647116 gacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttcccaataaacttgtattcatatctattcatgtcccacaagataagttagtacatgcaccaa 26647017  T
Q  217 cgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaag 315  Q
    | ||||||  ||||  |||||  |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||      
T  26647016 catcacaaatacattgatgta--ccgagaatatattatacagttctaactcttttgacatataaataatttatacttgtttaaaaacattaataaaaa-- 26646921  T
Q  316 gtatttgatctc-atttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgag 414  Q
     ||| || |  | |||||| ||| || |||||||| ||| | ||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||| || | |    
T  26646920 -tatgtgtttcctatttaagctttaagatgagatt-ttgtggaaaaaaaattaaataaagaaaatataaaaaggaaaaacaaggtttaagtaaagtgggg 26646823  T
Q  415 tacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaa 514  Q
    |||| ||||   |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| |  ||| |||||||||| | |||||| |    
T  26646822 tacccagga---ctataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttgga 26646726  T
Q  515 acctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    | |||| ||| |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26646725 aactctcttcgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgac 26646627  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26646626 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 26646527  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  26646526 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggt 26646458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26753184 - 26752426
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||| || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||       
T  26753184 ctaccatatggaccccttcatcagattctttatcaagaagcaatttcacttgttctaatcgggactctaatccaacagggtatttggctacatgtaaaat 26753085  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagta--tgtaacaa 216  Q
       |||| | ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||  || | |||    
T  26753084 gacacgattgatcttgttggagatgtcttcgactatcttcccaataaacttgtattcatatctattcatgtcccacaagataagttagtacatgcaccaa 26752985  T
Q  217 cgtcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaag 315  Q
    | ||||||  ||||  |||||  |  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||      
T  26752984 catcacaaatacattgatgta--ccgagaatatattatacagttctaactcttttgacatataaataatttatacttgtttaaaaacattaataaaaa-- 26752889  T
Q  316 gtatttgatctc-atttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgag 414  Q
     ||| || |  | |||||| ||| || |||||||| ||| | ||   ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||||| || | |    
T  26752888 -tatgtgtttcctatttaagctttaagatgagatt-ttgtggaaaaaaaattaaataaagaaaatataaaaaggaaaaacaaggtttaagtaaagtgggg 26752791  T
Q  415 tacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaa 514  Q
    |||| ||||   |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| |  ||| |||||||||| | |||||| |    
T  26752790 tacccagga---ctataatggtatccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgttccttgtttttcttgttattttgga 26752694  T
Q  515 acctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    | |||| ||| |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26752693 aactctcttcgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgccgtatctgagtaggatccacgccatagaaaacgggcaaaacgagacgac 26752595  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752594 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 26752495  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   ||||||||||||||    
T  26752494 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggt 26752426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 344 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26884580 - 26884142
Alignment:
Q  344 gagattattgggcaatt-gaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccgg 442  Q
    |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| ||||  | |||||| ||||||||||| || |  |||| | ||   |||  |||||||||||    
T  26884580 gagattattggggaatttgaaattaaagaaagaaaatataaaaaaggaaaatatgatttaagtaaagtgggatacccaaga---ctaaaatggtagccgg 26884484  T
Q  443 aaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttc 542  Q
    | ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26884483 acaagttagcaacttgcctcatagccattttccatcgctgcaacctctccatgttatccttatcattttgaaaccttttttcatggtcagccaatgcttc 26884384  T
Q  543 accataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatg--atgt 640  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  26884383 accataactacctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaacaaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgt 26884284  T
Q  641 gaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgt 740  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884283 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaatattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgt 26884184  T
Q  741 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  26884183 gatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggt 26884142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28786975 - 28786677
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28786975 ctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 28786876  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  28786875 ctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatctccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaaca 28786776  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28786775 tcacaatcacatccatgt--actcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaaataattaaatacttgtttaaaaacgtaaatagaaaagg 28786678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28793096 - 28792798
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28793096 ctaccatgcggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 28792997  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  28792996 ctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatctccaataaacttgtattcatatctattaatgtccgataagataagttagtatgtaacaaca 28792897  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaagg 316  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28792896 tcacaatcacatccatgt--actcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaaataattaaatacttgtttaaaaacgtaaatagaaaagg 28792799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 357 - 784
Target Start/End: Original strand, 27530983 - 27531407
Alignment:
Q  357 aattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagca 456  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||| | |     ||| ||| | ||| || |||||||| ||     
T  27530983 aattgaaattaaagaaagaaaatataaaagggaaaaataggatttaagtaaagtgggctacccatgtt---tataatgctggccagacaagttagccgct 27531079  T
Q  457 tggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctt 556  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||     
T  27531080 tggctcagagcttctttccattgctgcaacctctcagtgttatccttatcattttgaaacttttttttatgcacagctaatgcttcaccatatctacctg 27531179  T
Q  557 tatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaa 656  Q
    | ||||||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27531180 tgtgatgtcgcacatcagtaggatccacaccaataaaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaa 27531279  T
Q  657 acaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctt 756  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27531280 acaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaatacgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctt 27531379  T
Q  757 tgaagatcattgtcatcaatgaaggtat 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531380 tgaagatcattgtcatcaatgaaggtat 27531407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28781838 - 28781543
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  28781838 ctaccatcctgactccattatcatatccttcaccaagaagcgatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagtg 28781739  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  28781738 ctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaaca 28781639  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaa 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  28781638 tcacaatcacatccatgt--actcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaaataattaaataattgtttaaaaacgtaaatagaaaa 28781543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 25580427 - 25579697
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || | |||      | || | || |||||||||||||  || |    
T  25580427 tcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcga 25580328  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgta-ac-aacgtcacaatcacatccatgtagactcagaata 248  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |  || || ||  ||| |||||||||||||||   | |||| |    
T  25580327 ctatcttctcaataaacttgtattcatatctattcgtgtccaataagataagttagaacatacactaaaatcaaaatcacatccatgtat--tgagaaaa 25580230  T
Q  249 tattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt--tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgag 346  Q
    |||||| || ||||| || || ||| |||||| ||||| | ||||  ||||||||| | |||| ||||    | || ||  |||||| |||||| || ||    
T  25580229 tattattcaattctaccttttttgaaatataattaacttacacttgttttaaaaacattaatagaaaa----tctgttcctatttaagcttgaagattag 25580134  T
Q  347 attattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaa 446  Q
    ||||||| |  ||   |||| || ||| |||||| | || ||||||| | | ||||||||| || | ||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  25580133 attattgaggcataacaattaaagaaataaaatatagaaaggaaaaagaagttttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaa 25580034  T
Q  447 gttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcacc 545  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |  |||||| |  |||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||    
T  25580033 gttagcagcttgggtaagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatact-cacc 25579935  T
Q  546 ataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaaca 645  Q
    |||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  25579934 ataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggaca 25579835  T
Q  646 agttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 745  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25579834 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 25579735  T
Q  746 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggta 783  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25579734 catctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggta 25579697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 423 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26861951 - 26861595
Alignment:
Q  423 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 522  Q
    |||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||    
T  26861951 aggactaaaatggtagcctgacaagttagcagcttggttcagagcaactttccatctctgcaacctctccatgttatccatatcattttgaaaccttttt 26861852  T
Q  523 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct 622  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  26861851 tcatgcttagccaatgcttcaccataaatacctctatgatgtcgcacattagtaggatccatgccatagaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttcct 26861752  T
Q  623 tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggc 722  Q
    |   ||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26861751 t---gcagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaacacaggaatgaaaattctagactcttcaatggc 26861655  T
Q  723 cttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
     |||  |||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||    
T  26861654 attgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggt 26861595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 51 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 25539248 - 25538522
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||      | || | || |||||||||||||  || |    
T  25539248 tcaagaagcaatttcacttgttctattggggactgtaatccaacagggtatttggccacatataaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcga 25539149  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaac--aacgtcacaatcacatccatgtagactcagaata 248  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||   ||  ||| |||||||||||||||   | ||||||    
T  25539148 ctatcttctcaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagaacataaactaaaatcaaaatcacatccatgtat--tgagaata 25539051  T
Q  249 tattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt--tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgag 346  Q
    |||||| || |||||| | || |||||||||||||||| | ||||  ||||||||| | |||| |||| || ||    |  ||||||  || || |  ||    
T  25539050 tattatgcaattctaatttttttgacatataaataacttacacttgttttaaaaacattaatagaaaatgtgtt----cctatttaagttttaagagtag 25538955  T
Q  347 attattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaa 446  Q
    ||||||  |  ||  ||||| |  ||| |||||| | || ||||||| | ||||||||||| || | ||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  25538954 attatttaggcataaaaattaatgaaataaaatatagaaaggaaaaacaagatttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaa 25538855  T
Q  447 gttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcag-ccaatgcttcacc 545  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |  |||||| |  |||| | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||   ||||| |||||    
T  25538854 gttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcattattttgaaacctctcttcatgcttagtaaaatgc-tcacc 25538756  T
Q  546 ataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaaca 645  Q
    |||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  25538755 ataactcccactctgatgtcgtaactgagtaggttccacatcatagaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggaca 25538656  T
Q  646 agttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 745  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25538655 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgattt 25538556  T
Q  746 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  25538555 catctcctctttcaagatcattatcatctatgaa 25538522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Original strand, 27717944 - 27718156
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27717944 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 27718043  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||     
T  27718044 ttgacgactggtcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccagtaagataagttagtatgtgacaaca 27718143  T
Q  219 tcacaatcacatc 231  Q
    |||||||||||||    
T  27718144 tcacaatcacatc 27718156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 26143573 - 26142847
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||      | || | || |||||||||||||  || |    
T  26143573 tcaagaagcaatttcacttcttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacatttaaaaaaacatgattgatattgttggagatgtcttcga 26143474  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgta-ac-aacgtcacaatcacatccatgtagactcagaata 248  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  || || ||  ||| |||||||||||||||   | ||||||    
T  26143473 ctatcttctcaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataaattagaaaatacactaaaatcaaaatcacatccatgtat--tgagaata 26143376  T
Q  249 tattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt--tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgag 346  Q
    |||||| || |||||||| || |||||||||||||||| | ||||  ||||||||| | |||| |||| || ||    |  |||||| |||  | |  ||    
T  26143375 tattatgcaattctaacttttttgacatataaataacttacacttgttttaaaaacattaatagaaaatgtgtt----cctatttaagctttgagagtag 26143280  T
Q  347 attattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaa 446  Q
    ||||||  |  ||  ||||| |  ||| |||||| | || ||||||| | | ||||||||| || | ||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||    
T  26143279 attatttaggcataaaaattaatgaaataaaatatagaaaggaaaaacaagttttaagtaaagtggggtacccatgaggactataatgatagccggacaa 26143180  T
Q  447 gttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcacc 545  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |  |||||| |  |||| | ||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||  | ||||| ||||    
T  26143179 gttagcagcttggataagagctatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttgaaacctctcttcatgcttagtaagatgct-cacc 26143081  T
Q  546 ataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaaca 645  Q
    |||| | ||  | |||| ||| |  |||| |||||||||| || ||||||| || || || | || || ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26143080 ataaatcccactctgatttcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaacgggaaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggaca 26142981  T
Q  646 agttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 745  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26142980 agttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgattt 26142881  T
Q  746 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26142880 catctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 26142847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Original strand, 27610565 - 27610782
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27610565 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttcttgtacttgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 27610664  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||     
T  27610665 ttgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatctctccagtaaactcgtattcatatctattcatgcccaataagataagttagtatgtgacaaca 27610764  T
Q  219 tcacaatcacatccatgt 236  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27610765 tcacaatcacatccatgt 27610782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 514 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 31284535 - 31284267
Alignment:
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31284535 aacctctcttcatgcttagccaatgcttctccataactacctctatgatgtcgcacatgagaaggatccacgccaaagaaaacgggcaaaacgaggcgac 31284436  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    | |||  ||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  31284435 cattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaaacacggggataaaaatcctagactc 31284336  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  31284335 ttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggt 31284267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 432 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 26656318 - 26655965
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  26656318 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 26656219  T
Q  532 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 630  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  26656218 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaa 26656120  T
Q  631 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatga 730  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  26656119 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 26656020  T
Q  731 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26656019 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatg 26655965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 432 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 26762289 - 26761936
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| | | |||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||| |    
T  26762289 atggtagccagacaagttggcagctttggtcagagccatcttccattgctccaacctctgcatgttttccttgttattttggaacttcttttcatgctta 26762190  T
Q  532 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 630  Q
    |  | ||||| |||| ||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||||    
T  26762189 gtaagatgct-caccgtaacttccagtctgatgtcgtatgtgagtaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaa 26762091  T
Q  631 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatga 730  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  26762090 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacga 26761991  T
Q  731 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26761990 gtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatg 26761936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 422 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 25482081 - 25481724
Alignment:
Q  422 gaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctt 521  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||| ||  | |||||||  |||||| |  |||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||     
T  25482081 gaggactataatgatagccggacaaattagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgtttttctcgttattttggaacccctc 25481982  T
Q  522 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtc 621  Q
    |||||||| || ||    |||||||||||||| | ||||| |||| |||| || ||| ||||||||| ||||||| || || || | || || |||||||    
T  25481981 ttcatgcttagtcagatattcaccataactacatgtatgacgtcgaacatcagtaggatccacaccatagaaaacgggtaatactaagcaactctttgtc 25481882  T
Q  622 ttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatgg 721  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  25481881 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattcttcaatgg 25481782  T
Q  722 ccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25481781 ccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaa 25481724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 291
Target Start/End: Original strand, 27698040 - 27698301
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||||   ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698040 ggaccccatcatcagatccattatcaagaattgatttcactctttgtacttgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgact 27698139  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatca 227  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27698140 gatcttgttggagatgtatttgactatctcttcaataaacttgtattcatatctactcgtgtcgagtaagaaaagttagtatgaaacaacatcacaatca 27698239  T
Q  228 catccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatac 291  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27698240 catctatgt--actcagaatatattataaatttctaactatttcgacatataaataactaatac 27698301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 26056290 - 26055903
Alignment:
Q  397 gatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgt 496  Q
    ||||||||||| || | ||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||  |||||| |  |||| | ||||||||    
T  26056290 gatttaagtaaagtagggtactcatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgt 26056191  T
Q  497 ttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaa 595  Q
    ||||||  | |||||| |||| || || ||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||    
T  26056190 ttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaa 26056092  T
Q  596 caggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagg 695  Q
    | ||||| || | || || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||    
T  26056091 cgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatggg 26055992  T
Q  696 aataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtat 784  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26055991 aataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtat 26055903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 397 - 784
Target Start/End: Complemental strand, 26076260 - 26075873
Alignment:
Q  397 gatttaagtaatgttgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgt 496  Q
    ||||||||||| || | ||||  | ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||  |||||| |  |||| | ||||||||    
T  26076260 gatttaagtaaagtagggtactcatgaggactataatgatagccggacaagttagcagcttgagtaagagccatcttccattgacgcaatcgctccatgt 26076161  T
Q  497 ttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaa 595  Q
    ||||||  | |||||| |||| || || ||||| ||  | ||||| |||||||||| ||  | |||||||| |  |||| |||||||||| || ||||||    
T  26076160 ttttctcgttattttggaacccctctttatgcttagtaagatgct-caccataactcccactctgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcatagaaaa 26076062  T
Q  596 caggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacagg 695  Q
    | ||||| || | || || |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||    
T  26076061 cgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatggg 26075962  T
Q  696 aataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtat 784  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26075961 aataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtat 26075873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 432 - 782
Target Start/End: Original strand, 27337923 - 27338273
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| | | |||||||| |    
T  27337923 atggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgctta 27338022  T
Q  532 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 630  Q
    |  | |||| ||||||||||| ||  | |||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    | |||| |||||||||||||     
T  27338023 gtaagatgc-tcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcag 27338121  T
Q  631 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatga 730  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  27338122 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaa 27338221  T
Q  731 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27338222 gtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggt 27338273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 432 - 782
Target Start/End: Original strand, 27398663 - 27399013
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||  ||||||  || ||||||||||||||||| ||| | |||||| ||| | | |||||||| |    
T  27398663 atggtggccggagaagttagcagcttgggtaagagccatcttccatttcttcaacctctccatgttttccttgttattttggaacttatcttcatgctta 27398762  T
Q  532 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 630  Q
    |  | |||| ||||||||||| ||  | |||||||| || |||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    | |||| |||||||||||||     
T  27398763 gtaagatgc-tcaccataactcccagtctgatgtcgtacgtgagtaggatccgcaccatagaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcag 27398861  T
Q  631 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatga 730  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  27398862 tgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaatatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaa 27398961  T
Q  731 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27398962 gtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggt 27399013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 463 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28234861 - 28234543
Alignment:
Q  463 agagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgat 562  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  28234861 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgat 28234762  T
Q  563 gtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaa 662  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  || | |||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28234761 gtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtctattttcctcgaagca-taaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaa 28234663  T
Q  663 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaaga 762  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  28234662 tgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagc 28234563  T
Q  763 tcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  28234562 tccctgtcatcaatgaaggt 28234543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 463 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28227248 - 28226950
Alignment:
Q  463 agagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgat 562  Q
    |||||||  ||||||  ||||||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  28227248 agagccatcttccatttctgcaacctatccatgctatgcttgttattttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgat 28227149  T
Q  563 gtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaa 662  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  28227148 gtcgcacatgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaacaaggcgccgattttccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaa 28227049  T
Q  663 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||    
T  28227048 tgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaag 28226950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 541 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 26049065 - 26048827
Alignment:
Q  541 tcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgt 640  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||| |||||||||| || | ||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26049065 tcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 26048966  T
Q  641 gaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgt 740  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||   |||||    
T  26048965 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgt 26048866  T
Q  741 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26048865 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 26048827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 541 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 26070234 - 26069996
Alignment:
Q  541 tcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgt 640  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |  |||| |||||||||| || | ||||| ||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26070234 tcaccataacttccactatgatgtcgtatgtgagtaggttccacatcataaaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgt 26070135  T
Q  641 gaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgt 740  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||   |||||    
T  26070134 ggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattcttccatggccttgacaagtttgggtgt 26070035  T
Q  741 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26070034 gatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaa 26069996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 514 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26623223 - 26622955
Alignment:
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  26623223 aacctctttgcatgcttagcaagtgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgac 26623124  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26623123 cctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactc 26623024  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||| || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  26623023 ttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggt 26622955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 514 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26729201 - 26728933
Alignment:
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    ||||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||| ||  | ||||| || |  |||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  26729201 aacctctttgcatgcttagcaagtgcttcgccataactcccagtttgatgccgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaacgagacgac 26729102  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26729101 cctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaataaaaatcctagactc 26729002  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||| || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  26729001 ttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggt 26728933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 209
Target Start/End: Original strand, 27530761 - 27530936
Alignment:
Q  34 catcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatctt 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  27530761 catcatcagatttttcatcaagatgccctttcacatgttgtactcgggactgtaatccaacaggatatttggcaacatctaagggctcacgactaatcct 27530860  T
Q  134 gttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtat 209  Q
    |||||| ||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27530861 gttggaaatgtcttcgactatctttccaataaactcgtattcatatctattcatgtccaataagataagttagtat 27530936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 525 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28243040 - 28242783
Alignment:
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  28243040 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 28242941  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28242940 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 28242841  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||    
T  28242840 tgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggt 28242783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 525 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 28325717 - 28325459
Alignment:
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||| || |||   |||    
T  28325717 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 28325618  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  28325617 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 28325518  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggta 783  Q
    |||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  28325517 tgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggta 28325459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 580 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 26824021 - 26823840
Alignment:
Q  580 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26824021 tccacaccatagaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 26823922  T
Q  680 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||    
T  26823921 tggcagaaaacacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaag 26823840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 489 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26848932 - 26848639
Alignment:
Q  489 ctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacacca 588  Q
    ||||||| ||| ||| | ||||||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  26848932 ctccatgctttccttgttattttgaaacacctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactactattctgatgtcgcacatgagaaggttctatgcca 26848833  T
Q  589 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaa 688  Q
     |||||||||| | ||| | || |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||| |    
T  26848832 tagaaaacaggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagaga 26848733  T
Q  689 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    | ||| ||||  ||||||| || |||||||||  ||||| ||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||    
T  26848732 atacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggt 26848639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 480 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28181395 - 28181093
Alignment:
Q  480 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 579  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  28181395 ctgcaacctatccatgctatgcttgttattttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggt 28181296  T
Q  580 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28181295 tccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28181196  T
Q  680 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  28181195 tgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaa 28181096  T
Q  780 ggt 782  Q
    |||    
T  28181095 ggt 28181093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 654 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 27229339 - 27229208
Alignment:
Q  654 caaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcct 753  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27229339 caaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgatttcgtctcct 27229240  T
Q  754 ctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27229239 ctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 27229208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 480 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28185647 - 28185345
Alignment:
Q  480 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 579  Q
    |||||||||||||||| | | ||| | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  28185647 ctgcaacctctccatgctatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccgtgtgatgtcgcacgtgagaaggt 28185548  T
Q  580 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28185547 tccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28185448  T
Q  680 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| |||||    
T  28185447 tgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaa 28185348  T
Q  780 ggt 782  Q
    |||    
T  28185347 ggt 28185345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 571 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 28139731 - 28139541
Alignment:
Q  571 tgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaag 670  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |  |  |||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  28139731 tgagaaggatccacaccatagaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaag 28139632  T
Q  671 aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||| || |||| ||||||    
T  28139631 aggcatagttgatggaaaacacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaag 28139541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 480 - 782
Target Start/End: Original strand, 28297619 - 28297921
Alignment:
Q  480 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 579  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |  ||| ||| ||| ||||| | ||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  28297619 ctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttctctatatgatcatccagtgctttagcataacttccatgttgatgtcgcacatgagaaggt 28297718  T
Q  580 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    |||||| || | ||||  |||||||| || || |   ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28297719 tccacatcataaaaaatcggcaaaactagacggctactttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28297818  T
Q  680 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    || |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  |||||||||||||    
T  28297819 tggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaa 28297918  T
Q  780 ggt 782  Q
    |||    
T  28297919 ggt 28297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 480 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28514454 - 28514152
Alignment:
Q  480 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 579  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| |  ||| ||| ||| ||||| | ||||||| || |  |||||||||||||||||||||    
T  28514454 ctgcaacctctccatgttattcttgttattttggaacttctctatatgatcatccagtgctttagcataacttccatgttgatgtcgcacatgagaaggt 28514355  T
Q  580 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    |||||| || | ||||  |||||||| || || |   ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  28514354 tccacatcataaaaaatcggcaaaactagacggctactttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 28514255  T
Q  680 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    || |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  |||||||||||||    
T  28514254 tggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatgtgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaa 28514155  T
Q  780 ggt 782  Q
    |||    
T  28514154 ggt 28514152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 423 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 27214758 - 27214396
Alignment:
Q  423 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 522  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  27214758 aggactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctct 27214659  T
Q  523 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttat---gatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 619  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||    || |   |||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||     
T  27214658 tcatgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgaccttttt 27214559  T
Q  620 tcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaat 719  Q
     |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||| || ||||||||    
T  27214558 ccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcctcgagtcttcaat 27214459  T
Q  720 ggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
       ||||  ||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  27214458 tttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggt 27214396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 423 - 782
Target Start/End: Original strand, 27234470 - 27234832
Alignment:
Q  423 aggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttt 522  Q
    |||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||||| |  ||||||  |||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |    
T  27234470 aggactataatgatagccagataagttagcagcttggttaagagctatcttccatttctgcaaccgctccatgttttccttgttattttgaaacctctct 27234569  T
Q  523 tcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttat---gatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttg 619  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||    || |   |||||||||  ||||||||||| || ||| |||||||||| | ||| |||||||| |||     
T  27234570 tcatgcttagcaagcgcttcaccataactgttgttgttcagatgtcgcaagtgagaaggttcaacgccatagaaaacaggtagaacaaggcgaccttttt 27234669  T
Q  620 tcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaat 719  Q
     |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    || || |||  || | ||||||| || ||||||||    
T  27234670 ccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaatacaataacagaaatcctcgagtcttcaat 27234769  T
Q  720 ggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
       ||||  ||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  27234770 tttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggt 27234832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 535 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26937320 - 26937073
Alignment:
Q  535 aatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaa 634  Q
    |||||| |||||||||| ||  | || ||||| || |||||||| |||||  || |||||| ||||||||  ||  |||| ||||||||| |||| | ||    
T  26937320 aatgctgcaccataactcccagtttggtgtcgaacgtgagaaggatccacttcatagaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaa 26937221  T
Q  635 tgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtga 734  Q
     |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||   |||||  || |||||||| |||||||  |||||    
T  26937220 cgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaatacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtga 26937121  T
Q  735 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937120 tggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 507 - 744
Target Start/End: Original strand, 28098302 - 28098539
Alignment:
Q  507 attttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacg 606  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||||||||||||  || | |||| ||| ||||||    
T  28098302 attttggaacctctcttcatgcttagctaatgcttcaccataactccccgtctgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcacaaaaaataggaaaaacg 28098401  T
Q  607 aggcgaccctttgtctt-gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatc 705  Q
    | || ||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||||    
T  28098402 aagcaacccttt-tcttcgtaacggtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatc 28098500  T
Q  706 ctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatt 744  Q
    || || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||    
T  28098501 ctggactcttcgatggccttgacaagggattgtgtgatt 28098539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 640 - 757
Target Start/End: Original strand, 25506975 - 25507092
Alignment:
Q  640 tgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtg 739  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  25506975 tgaacaagttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtg 25507074  T
Q  740 tgatttcatctcctcttt 757  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25507075 tgatttcatctcctcttt 25507092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 590 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 28150108 - 28149917
Alignment:
Q  590 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 689  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  28150108 agaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaa 28150009  T
Q  690 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
     |  ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | ||||||||||||||    
T  28150008 gattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggt 28149917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31285265 - 31285126
Alignment:
Q  50 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactct 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |      
T  31285265 atcaagaagcaatttcacttgttgtattcgaaacttaaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggcacacgattgatcttgttggagatgtatttg 31285166  T
Q  150 actatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgt 189  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  31285165 actatgtctccaataaaatcatattcatatctgttcatgt 31285126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 482 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26949940 - 26949640
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| |||||||||||| ||    ||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||    
T  26949940 gcaaccgctccatgttttttttgctcttttggaacctctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactataattctgatgtcgcacgtgagaaggttc 26949841  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 681  Q
     ||| || ||||||| |||| ||| |||||||| |||  |||| || | |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |      
T  26949840 tacatcatagaaaactggcagaacaaggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattcc 26949741  T
Q  682 atagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaagg 781  Q
     ||||||| ||   |||   ||| || |||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || |||||||||||||    
T  26949740 ttagaaaagacgataatggcaattctcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaagg 26949641  T
Q  782 t 782  Q
    |    
T  26949640 t 26949640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 514 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 29826274 - 29826006
Alignment:
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    ||||||| |||| | |||| || | ||| ||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||    
T  29826274 aacctctcttcaagatcagtcattcctttaccataactcccagtctgatgtcgcacatgagaaggatccacatcatagaaaataggcaaaacgagacgac 29826175  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    ||||  |||||   || | ||  || || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || | ||||||    |||||||||||    
T  29826174 ccttcctcttgacacactcaactatatgcacaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaaaataggaatggctatcctagattc 29826075  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    || ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29826074 ttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggt 29826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 537 - 782
Target Start/End: Original strand, 26341894 - 26342142
Alignment:
Q  537 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgacc---ctttgtcttgtagcaatga 633  Q
    ||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    ||||||   ||||| |||| ||||||||    
T  26341894 tgcttcaccgtaactcccaatctgacgtcgtacatgagaaggttccatgtcatagaaaacaggcaaaattttgcgacccttctttgccttgaagcaatga 26341993  T
Q  634 atgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtg 733  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||  ||||    
T  26341994 atgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactcttcaatggctttgacaagtg 26342093  T
Q  734 atggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    || |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  26342094 attgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggt 26342142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26623999 - 26623835
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||| |    
T  26623999 ggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgatt 26623900  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtcca 192  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  26623899 gatcttgttggagatgtatttgactatcttttcaataaaatcatattcatatctgttcatgtcca 26623835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26729976 - 26729812
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  |||| |    
T  26729976 ggaccccatcatcagatccattatcaagaagtgatttcacttgttgtagttgagactgtaatccaacagggtatttagcaacatgtaagggcacacgatt 26729877  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtcca 192  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  26729876 gatcttgttggagatgtatttgactatcttttcaataaaatcatattcatatctgttcatgtcca 26729812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26656671 - 26656532
Alignment:
Q  50 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactct 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||      |||| | ||||||| ||||||||  |      
T  26656671 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatgtctttg 26656572  T
Q  150 actatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgt 189  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26656571 actatattctcaataaacttgtattcatatctattcatgt 26656532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 26762642 - 26762503
Alignment:
Q  50 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactct 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||      |||| | ||||||| ||||||||  |      
T  26762642 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactctaatccaacagggtatttggcaacatgtaaaaaaacacgattgatcttgtcggagatgtctttg 26762543  T
Q  150 actatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgt 189  Q
    ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26762542 actatattctcaataaacttgtattcatatctattcatgt 26762503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26811711 - 26811488
Alignment:
Q  559 tgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaac 658  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||| |||||||| |||  |||| || | | ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26811711 tgatgtcgcacgtgagaaggttccacaccatagaaaactggtagaacaaggcgacctttttccttgaagtagttaatgatgtggacaagctcatctaaac 26811612  T
Q  659 aaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttg 758  Q
    |||| || ||||  ||||||||   ||| || |||  |||   ||||||||| | |||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||    
T  26811611 aaaacgacgaagttgcatagttctcagagaatacaataatggcaatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctg 26811512  T
Q  759 aagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  26811511 aagctccttgtcatcaatgaaggt 26811488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 590 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 2184459 - 2184288
Alignment:
Q  590 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 689  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||    
T  2184459 agaaaactggtagaaccaggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaa 2184360  T
Q  690 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
     ||||| || ||||| || || ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | |||| ||||||    
T  2184359 aacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataagtgatgctgttatttcaccccctcgttgaag 2184288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25483764 - 25483609
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| || ||||| || | |||    | | || | || |||||||||||||| |  |    
T  25483764 tcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgtaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaatcatgattgatattgttggagatgtattgga 25483665  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttag 206  Q
    ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25483664 ctatcttctcaataaacttgtgttcatatctattcatgtccaataagataagttag 25483609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 482 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 26975331 - 26975033
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| ||||| |||||  || | ||||||||||| || |||||||| ||| | | |||||||||||||  | ||  | |  |||||||||||||||||    
T  26975331 gcaaccgctccaagttttcatttttattttgaaacccctcttcatgcttagcaagtacttcaccataactgtcattcagtttacgcacatgagaaggttc 26975232  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 681  Q
        ||| |||||||||| | ||| | || |||||||   ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||      
T  26975231 tgtgccatagaaaacaggaataactatgctacccttttcattggaacaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtct 26975132  T
Q  682 atagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaag 780  Q
     |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  26975131 ttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaag 26975033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 590 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 2185069 - 2184880
Alignment:
Q  590 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 689  Q
    ||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||| ||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||   | || ||    
T  2185069 agaaaactggcagaaccgggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaa 2184970  T
Q  690 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||| || |  || |||||||| |||||| | |||| |||||| || | |||||| |||||    
T  2184969 aacagggatgaaaattctggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttcaccccctcgttgaagctcttcgtcatccatgaa 2184880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26635969 - 26635669
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||   | |||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||  | | ||||||||||||||||||    
T  26635969 gcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgtcatttagttttcgcacatgagaaggttc 26635870  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 681  Q
        ||| |||||||||| | |||   || |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |      
T  26635869 ggtgccatagaaaacaggaataaccttgctacccttttcattggagcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattcc 26635770  T
Q  682 atagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaagg 781  Q
     |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||    
T  26635769 ttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagg 26635670  T
Q  782 t 782  Q
    |    
T  26635669 t 26635669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 482 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26741935 - 26741635
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||   | |||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||  | | ||||||||||||||||||    
T  26741935 gcaaccactccatgttttccttgctattttgaaactgatcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgtcatttagttttcgcacatgagaaggttc 26741836  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 681  Q
        ||| |||||||||| | |||   || |||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |      
T  26741835 ggtgccatagaaaacaggaataaccttgctacccttttcattggagcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattcc 26741736  T
Q  682 atagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaagg 781  Q
     |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||    
T  26741735 ttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagg 26741636  T
Q  782 t 782  Q
    |    
T  26741635 t 26741635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 482 - 782
Target Start/End: Original strand, 27665025 - 27665325
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  |  |||||||| ||| | |||||||||||||||  |||   | | ||||||||||||||||||    
T  27665025 gcaaccgctccatgttttccatgtcattttgaaactccacttcatgcttagcaagtgcttcaccataactgtcttccagttttcgcacatgagaaggttc 27665124  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtct-tgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagtt 680  Q
        ||| |||||||||| | |||   |  | ||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  27665125 ggtgccatagaaaacaggaataaccttggtaaccttt-tctctgaagcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagtt 27665223  T
Q  681 gatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaag 780  Q
      |||| || | |  |||   |||||| ||||||||||||  |||   |||||| ||||||||||| || ||  || |||| || |||||||||||||||    
T  27665224 cttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctcttccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaag 27665323  T
Q  781 gt 782  Q
    ||    
T  27665324 gt 27665325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25511640 - 25511488
Alignment:
Q  54 agaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctacta 153  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||| || |  ||      | || | ||||||||||||||||  || ||||    
T  25511640 agaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgttcaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgtcttcgacta 25511541  T
Q  154 tctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttag 206  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25511540 tcttctcaataaacttgtattcagatctattcatgtccaataaggtaagttag 25511488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 646 - 782
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893679
Alignment:
Q  646 agttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 745  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  746 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    | || ||||| ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggt 26893679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27215157 - 27215001
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | | |  || ||||||||||| |  ||||||||||||||    | |||| |  ||||||| |||||||  || |    
T  27215157 tcaagaagcaattttacttgttgtatttgggtatgtaatccaacagggtgtttggcaacatgtaaaaaatcacgattcgtcttgtttgagatgtcttcaa 27215058  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagt 207  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27215057 ctatcttctcaataaacttgtattcatatctgttaatgtccaataagataagttagt 27215001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26056627 - 26056472
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||| || | |||      | || | |||||||||||||||   || |    
T  26056627 tcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgccttcga 26056528  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttag 206  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26056527 ctatcttctcaataaacttgcattcagatctattcatgtccaataaggtaagttag 26056472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 26076597 - 26076442
Alignment:
Q  51 tcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactcta 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||| || | |||      | || | |||||||||||||||   || |    
T  26076597 tcaagaagcaatttcacttgttctattcgggactgcaatccaacagggtatttggctacgtttaaaaaaacatgattgatcttgttggagatgccttcga 26076498  T
Q  151 ctatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttag 206  Q
    ||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26076497 ctatcttctcaataaacttgcattcagatctattcatgtccaataaggtaagttag 26076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26884776 - 26884621
Alignment:
Q  50 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactct 149  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||      |||| | || |||| |||||| |  ||     
T  26884776 atcaagaagcaattttaattgttgtactcggtactgtaatccaacagggtatttggctacatgtaaaacaacacgattgattttgtcggagatatcttcg 26884677  T
Q  150 actatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagtta 205  Q
    |||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26884676 actatcttcccgataaactcgtattcgtatctattcatgtccaataagataagtta 26884621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 114
Target Start/End: Original strand, 27337569 - 27337635
Alignment:
Q  48 tcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  27337569 tcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgta 27337635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 114
Target Start/End: Original strand, 27398309 - 27398375
Alignment:
Q  48 tcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgta 114  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  27398309 tcatcaagaagcaattttacttgttgtactcgggactgtaatccaacagggtatttggcaacgtgta 27398375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 482 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 25071938 - 25071741
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| |||||||| || ||| | ||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||||||  | ||  | | |||||| || ||||||||    
T  25071938 gcaaccgctccatgtgttccttgttattttgaaacccctcttcatgcttagcaaatgattcaccataactgtcattcagttttcgcacctgcgaaggttc 25071839  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
        ||| ||||||  || | ||| ||||||| ||||  |||| || | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25071838 ggtgccatagaaaattggtagaacaaggcgactcttttccttgaagtagtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 25071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Original strand, 25492793 - 25492860
Alignment:
Q  48 tcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 115  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25492793 tcatctagaagcaatttcacgtgttgtactcgggattgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaa 25492860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 26824541 - 26824460
Alignment:
Q  34 catcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 115  Q
    |||||||||||   | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  26824541 catcatcagattcgttatcaagaagagatttcacttgttgtactcgggactgtaatccaaccgggtatttggcaacatgtaa 26824460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 482 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26959445 - 26959250
Alignment:
Q  482 gcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttc 581  Q
    |||||| ||||||||||| |||   ||||||||||  || |||||||| ||| |  |||||||||||||| || ||  | | ||||||||||||||||||    
T  26959445 gcaaccgctccatgttttccttgctattttgaaactgctcttcatgcttagcaagcgcttcaccataactgccatttagttttcgcacatgagaaggttc 26959346  T
Q  582 cacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata 677  Q
        ||| |||||||||| | ||    || ||| |||   ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  26959345 tgtgccatagaaaacaggaataatcgtgctacctttttcattggagaaatgaatgatgtggacaagttcatccaaataaaacgaagaagaagcata 26959250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 487 - 553
Target Start/End: Original strand, 25506897 - 25506963
Alignment:
Q  487 ctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactac 553  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||   |||||||||||||||    
T  25506897 ctctccatgtttttcttattattttgaaacttctcttcatgcttagtcagatcttcaccataactac 25506963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 24715856 - 24715667
Alignment:
Q  490 tccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaa 589  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||  | |||||||| ||| |  ||||||||||||||  | ||  | | |||||||||||||||||||   |||     
T  24715856 tccatgtgttccttgttattttgaaacccgtcttcatgcttagcaagagcttcaccataactgtcatttagttttcgcacatgagaaggttccgtgccat 24715757  T
Q  590 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    |||||||||| | ||| | || ||||||  | ||| ||||||| ||||||||   ||||||  | ||||||||||||||||| |||||||    
T  24715756 agaaaacaggaataaccatgccacccttgttattgaagcaatggatgatgtgggaaagttcgcctaaacaaaatgaagaagaagcatagt 24715667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26862286 - 26862230
Alignment:
Q  50 atcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26862286 atcaagaagcaatttcacttgttctactcgggactttaatccaacagggtatttggc 26862230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 714 - 761
Target Start/End: Original strand, 28491660 - 28491707
Alignment:
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  28491660 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttcttcacctttttgaag 28491707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 714 - 761
Target Start/End: Original strand, 29804070 - 29804117
Alignment:
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  29804070 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttcttcacctttttgaag 29804117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 736 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617305
Alignment:
Q  736 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggt 26617305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 736 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723233
Alignment:
Q  736 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggt 26723233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 712 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 29467876 - 29467806
Alignment:
Q  712 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |  ||||| ||||||||    
T  29467876 tcttcaatagctttgatgagtgatggtgtgatttcttcgcctttttgaagttcttcatcatccatgaaggt 29467806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 4)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 414 - 785
Target Start/End: Original strand, 3260 - 3633
Alignment:
Q  414 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttttt-cttatcattttg 512  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  3260 gtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgttttttcggatcattttg 3359  T
Q  513 aaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcga 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3360 aaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttacgatgtcgcacaatagtaggttccacaccaaataaaacaggcagaacgaggcga 3459  T
Q  613 ccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcata-gttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 711  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3460 ccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagat 3559  T
Q  712 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3560 tcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 3633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 414 - 785
Target Start/End: Original strand, 14196 - 14566
Alignment:
Q  414 gtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttga 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14196 gtacccaggaggactatcatggtagccggacaagttagcagcctggctcagagcctctttccatccctgcaacctctccatgtttttcggatcattttga 14295  T
Q  514 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14296 aacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttctgatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgac 14395  T
Q  614 cctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 713  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14396 cctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattc 14494  T
Q  714 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 785  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14495 atcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatg 14566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 231
Target Start/End: Original strand, 2984 - 3196
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2984 ctaccatgtggactccatcatcagatctttcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagacttcattccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 3083  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||     
T  3084 ttgacgactggtcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaactcgtattcatatctattcatgtccagtaagataagttagtatgtgacaaca 3183  T
Q  219 tcacaatcacatc 231  Q
    |||||||||||||    
T  3184 tcacaatcacatc 3196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 236
Target Start/End: Original strand, 14082 - 14135
Alignment:
Q  183 ttcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatcacatccatgt 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14082 ttcatgtccaataagataagttagtatgtgacaacatcacaatcacatccatgt 14135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 28 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 60297 - 59612
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  60297 ggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgact 60198  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcaca--at 225  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  60197 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataatataagttagtatgtaacaacatcacacaat 60098  T
Q  226 cacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgat 324  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||  |     
T  60097 cacatccatgta--ctcataatatattatacatttttaactattttgacatataaataactaacaattgtttaaaaacataaataaaaaaggtgttaca- 60001  T
Q  325 ctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggag 424  Q
      ||||||  ||| || |||    ||||| | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| | ||||  |||| ||||||||    | ||||| | ||     
T  60000 --catttaggctttaagatgg---tattgaggaatagaaattaaataaattaaatgcaaaaagcaaaac-aggaattaagtaaataggcgtacccatgac 59907  T
Q  425 gactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttc 524  Q
     |  ||||||||||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  59906 tatcatcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttc 59807  T
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  59806 atgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttg 59707  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaat 719  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  59706 tagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 59612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 28 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 18074489 - 18073804
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18074489 ggaccccatcatcaggtccctcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaagtggcaacatgtaaggactgtcgact 18074390  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcaca--at 225  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  18074389 gatcttgttggagatgtatttgactatctttccaataagctcgtattcatatctattcatgtccaataatataagttagtatgtaacaacatcacacaat 18074290  T
Q  226 cacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgat 324  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||  |     
T  18074289 cacatccatgta--ctcataatatattatacatttttaactattttgacatataaataactaacaattgtttaaaaacataaataaaaaaggtgttaca- 18074193  T
Q  325 ctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggag 424  Q
      ||||||  ||| || |||    ||||| | ||| |||||| ||||||  |||| ||||| | ||||  |||| ||||||||    | ||||| | ||     
T  18074192 --catttaggctttaagatgg---tattgaggaatagaaattaaataaattaaatgcaaaaagcaaaac-aggaattaagtaaataggcgtacccatgac 18074099  T
Q  425 gactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttc 524  Q
     |  ||||||||||| ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18074098 tatcatcatggtagctgggcaagttagcagccagactcagagccactttccattgctgcaacctctccatgtttttcgtatcattttgaaacctattttc 18073999  T
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  18073998 atgctcagccaatgctttaccatacctacctgtatgatgtcgcacatcagtaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttg 18073899  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaat 719  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18073898 tagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 18073804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 27 - 782
Target Start/End: Original strand, 18698849 - 18699595
Alignment:
Q  27 cggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgac 126  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18698849 cggactccatcatcagatcctttatcaagaagcgctttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgacgac 18698948  T
Q  127 taatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatc 226  Q
    | ||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||| ||    
T  18698949 tgatcttgttggagacgtatttgactatatctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataaatcagtgtgtaacaacatcacagtc 18699048  T
Q  227 acatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatc 325  Q
    ||||||||||   |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||   ||    
T  18699049 acatccatgt--cctcatagtatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaacgt-aattaaaaaggtgtt---tc 18699142  T
Q  326 tcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggagg 425  Q
      |||||  ||| || |||  || |||| | |||  ||||| |||||| ||||| ||||| || |||| | || |||||||| |  |||||||    ||     
T  18699143 caatttaggctttaagatggtatcattgaggaataaaaattaaataaataaaatgcaaaaagg-aaaacaagaattaagtaaagaggagtacc---caga 18699238  T
Q  426 actatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttca 525  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||| |     
T  18699239 actaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttccg 18699338  T
Q  526 tgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18699339 tgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatctacgccatagaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttg 18699437  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  18699438 tagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcat 18699537  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  18699538 tgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggt 18699595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 27 - 782
Target Start/End: Original strand, 18730953 - 18731699
Alignment:
Q  27 cggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgac 126  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18730953 cggactccaccataagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaaatggcaacatgtaagggctgacgac 18731052  T
Q  127 taatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatc 226  Q
    | |||||||||||||  || |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  18731053 tgatcttgttggagacatatttgactatcttttcaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagtcagtatgtaacaacatcacagtc 18731152  T
Q  227 acatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatc 325  Q
    ||||||||||   |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||   ||    
T  18731153 acatccatgt--cctcataatatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaatgtaaa-aaaaaaggtgtt---tc 18731246  T
Q  326 tcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggagg 425  Q
      |||||  ||| || |||  ||||||| | |||  ||||| |||||| ||||| ||||| || |||| | || |||||||| |  |||||||    | |    
T  18731247 caatttaggctttaagatggtattattgaggaataaaaattaaataaataaaatgcaaaatgg-aaaacaagaattaagtaaagaggagtacc---catg 18731342  T
Q  426 actatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttca 525  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| || |||||||      
T  18731343 actaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactctttttg 18731442  T
Q  526 tgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18731443 tgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttg 18731541  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  18731542 tagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcat 18731641  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  18731642 tgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggt 18731699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 19 - 782
Target Start/End: Original strand, 18679001 - 18679762
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18679001 ctaccatgcggactccatcataagatcattcatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 18679100  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  18679101 ctgccgactgatcttgttagagacgtatttgactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagtcagtatgtaacaaca 18679200  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttct-------aactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataa 310  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||       ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18679201 tcacagtcacacccatgt--actcataatatatcatacatttctaaattcaaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaacgtaaat-a 18679297  T
Q  311 aaaaggtatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgt 410  Q
    ||||||| ||   ||  |||||  |||     ||  ||||||| | |||  | ||| |||||| ||||| ||||| || |||| | || |||||||| |     
T  18679298 aaaaggtgtt---tccaatttaggctttcggttggtattattgaggaataaatattaaataaataaaatgcaaaaagg-aaaacaagaattaagtaaaga 18679393  T
Q  411 tgagtacctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattt 510  Q
     |||||||    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |  |||||| | ||||||| |||||||||||| || | ||||    
T  18679394 ggagtacc---caggactaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagctaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttattgttattt 18679490  T
Q  511 tgaaacctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgagg 609  Q
    || || ||||||   || | ||  | ||| |||||||||||||||  | |||||||  |  |||| ||| |||||  || |||||||||||||||| ||     
T  18679491 tggaaactctttcagtgattagtgagatg-ttcaccataactaccactttgatgtcatatgtgagtaggatccacgacatagaaaacaggcaaaacaaga 18679589  T
Q  610 cgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctag 709  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18679590 cgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctag 18679689  T
Q  710 attcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    | ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  18679690 actcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggt 18679762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 27 - 782
Target Start/End: Original strand, 18654926 - 18655672
Alignment:
Q  27 cggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgac 126  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18654926 cggactccaccatcagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaactggcagcatgtaagggctgacgac 18655025  T
Q  127 taatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatc 226  Q
    | |||||||||||||  || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| ||||| ||    
T  18655026 tgatcttgttggagacatatttgactatctttccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataaatcagtgtgtaacaacatcacagtc 18655125  T
Q  227 acatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatc 325  Q
    |||||||| |  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||   ||    
T  18655126 acatccattt--actcataatatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaatgtaaat-aaaaaggtgtt---tc 18655219  T
Q  326 tcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggagg 425  Q
      |||||  ||| || |||  || |||| | |||  ||||| |||||| ||||| ||||| || |||| | || |||||| | |  |||||||    |||    
T  18655220 gaatttaggctttaagatggtatcattgaggaataaaaattaaataaataaaatgcaaaaagg-aaaacatgaattaagtgaagaggagtacc---cagg 18655315  T
Q  426 actatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttca 525  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||  |||||       
T  18655316 actagaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaattctttctg 18655415  T
Q  526 tgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18655416 tgcttagtgagatg-ttcaccataacttccagtttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttg 18655514  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |    
T  18655515 tagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaagatcctagactcttgaatggcat 18655614  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  |||||||||||||||    
T  18655615 tgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggt 18655672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 27 - 782
Target Start/End: Original strand, 18723534 - 18724280
Alignment:
Q  27 cggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgac 126  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18723534 cggactccaccattagatcctttatcaagaagcgatttcacttgttgtactcgagactgcaacccaacagggtaagtggcaacatgtaagggctgacgac 18723633  T
Q  127 taatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatc 226  Q
    | |||||||||  ||  || |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  18723634 tgatcttgttgttgacatatttgactatctttccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataagataagtcagtatgtaacaacatcacagtc 18723733  T
Q  227 acatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggtatttgatc 325  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||   |    
T  18723734 acatccattta--ctcataatatatcatacatttctaactattttgacttataaataactaatacttgtttaaaaatgtaaataaaaa-ggtgttt---c 18723827  T
Q  326 tcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagtacctaggagg 425  Q
      |||||  ||| || |||  |||| || |   |  || || |||||| ||||| ||||| ||||||  || ||| |||||| |  ||||||| ||||      
T  18723828 caatttaggctttaagatggtattactgaggtttaaaatttaaataaataaaatgcaaaaaggaaaacaagaatt-aagtaaagaggagtacccagga-- 18723924  T
Q  426 actatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttca 525  Q
     |||  |||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||| || ||| |||      
T  18723925 -ctaaaatggtagccggacaagttagcagcttcggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgttattttggaaactcattttg 18724023  T
Q  526 tgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | || ||||| |  |||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18724024 tgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttggtgtcgtatgtgactaggatccacgccatagaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttg 18724122  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  18724123 tagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcat 18724222  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  18724223 tgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggt 18724280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 522 - 782
Target Start/End: Original strand, 5090902 - 5091162
Alignment:
Q  522 ttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtc 621  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||  |    
T  5090902 ttcatgctcagcaagtgcttcaccataacttccagtctgatatcgcacatgagaaggttccacaccatagaaaataggcaaaaccaggcaaccattttcc 5091001  T
Q  622 ttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatgg 721  Q
    ||| |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |||| || ||   ||| | |||| ||||||||| |||||    
T  5091002 ttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaaaacgataatgacaatcttagattcttgaatgg 5091101  T
Q  722 ccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||  ||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||    
T  5091102 ccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggt 5091162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 544 - 719
Target Start/End: Original strand, 17989013 - 17989185
Alignment:
Q  544 ccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaaca-ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtga 642  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||  |  |||||||| |||||||||||     
T  17989013 ccatacctacctgtatgatgtcgcacatcaga-ggttccacaccaaagaaaacaaggcaaaacgagga-accct--ggtttgtagcagtgaatgatgtgg 17989108  T
Q  643 acaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaat 719  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17989109 acaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaat 17989185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 432 - 782
Target Start/End: Original strand, 4529 - 4879
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4529 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaacctctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 4628  T
Q  532 gccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaat 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4629 gccaatgcttcaccataactacctttcagatgtcgcacgttagtaggttccacgccgaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagt 4728  T
Q  632 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgag 731  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  4729 gaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggag 4828  T
Q  732 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4829 ggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 4879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 432 - 782
Target Start/End: Original strand, 13490 - 13840
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13490 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 13589  T
Q  532 gccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaat 631  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13590 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaat 13689  T
Q  632 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgag 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13690 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 13789  T
Q  732 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13790 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Original strand, 13120 - 13415
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13120 ctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 13219  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  13220 ctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaaca 13319  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaa 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13320 tcacaatcacatccatgt--actcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaagtaattaaatacttgtttaaaaacgtaaatagaaaa 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 31 - 317
Target Start/End: Original strand, 4169 - 4457
Alignment:
Q  31 ctccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaat 130  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4169 ctccatgatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctgatgactgat 4268  T
Q  131 cttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacgtcacaatcacat 230  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4269 cttgttggagatgttcttgactatctctccaataaacttgtattcatatctattaatgtccgataagataagttagtatgtaacaacatcacaatcacat 4368  T
Q  231 ccatgtagactcagaatatat--tatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaaggt 317  Q
    ||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4369 ccatgt--actcataatatatggtatacatttctaactattgtgacataaaagtaattaaatacttgtttaaaaacgtaaatataaaaggt 4457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 2)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 432 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 7854 - 7504
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7854 atggtagccggacaagttagcagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaatcgctccatgttattcttatcattttgaaacctcttttcatgtcca 7755  T
Q  532 gccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaat 631  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7754 gccaatgcttcaccataacgacctgtatgatgtcgcacattagtaggatccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaat 7655  T
Q  632 gaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgag 731  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  7654 gaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggag 7555  T
Q  732 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 7504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8224 - 7929
Alignment:
Q  19 ctaccatccggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaaggg 118  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8224 ctaccatgtggactccatcatcagatccttcatcaagaagcgatttcacatgttgtactcgagactgtaatccaacagggtaattggcaacatgtaaggg 8125  T
Q  119 ctgacgactaatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagtatgtaacaacg 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||     
T  8124 ctgacgactgatcttgttggagatgtatttgactatatcgccaataaacttgtattcatatctattcatgtcatataagataagttagtatgtaacaaca 8025  T
Q  219 tcacaatcacatccatgtagactcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataact-aatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaa 314  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8024 tcacaatcacatccatgt--actcagaatatagtatacatttctaactattttgacataaaagtaattaaatacttgtttaaaaacgtaaatagaaaa 7929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 782
Target Start/End: Original strand, 267794 - 268552
Alignment:
Q  28 ggactccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgact 127  Q
    |||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  267794 ggaccccatcatcagatccattatcaagaagcaatttcacttgttgtacttgagaccataatccaacagggtaattggcaacatgtaagggctcacgact 267893  T
Q  128 aatcttgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagta------tgtaacaacgtca 221  Q
     ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||      ||||||||| |||    
T  267894 gatcttgttggagatgtatttgactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtcaaataatgcaagttagtaatagtatgtaacaacatca 267993  T
Q  222 ca--atcacatccatgtag--actcagaatatattatacatttctaactattgtgacatataaataactaatactt-tttaaaaacgtaaataaaaaagg 316  Q
    ||  |||||||||||| |   ||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  267994 cacaatcacatccatgcatgtactcaaaatatattatacgtttctaactatttcgtcatataaacaactaatacttatttagaaacgtaaataaaaaagg 268093  T
Q  317 tatttgatctcatttaaccttgaatatgagattattgggcaattgaaattgaataaagaaaatacaaaagggaaaaataggatttaagtaatgttgagta 416  Q
    | || |    ||||||   || || |||  ||||| | | ||| |||||| |||||| |||||  |||| ||||||  || ||| |||||| |   ||||    
T  268094 ttttagc---catttatggtttaagatggtattatcgaggaatagaaattaaataaataaaatgaaaaaaggaaaacaagaatt-aagtaaagagcagta 268189  T
Q  417 cctaggaggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaac 516  Q
    || | ||   |||  ||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||||||   |||||| ||     
T  268190 cccacga---ctagaatggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgctccatgtttttcttgctattttggaaa 268286  T
Q  517 ctcttttcatgctcagcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccc 615  Q
    |||| ||| |||| ||  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||||    
T  268287 ctctcttcgtgcttagtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacgggcaaaatgagacgaccc 268385  T
Q  616 tttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattctt 715  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  268386 tttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagactctt 268485  T
Q  716 caatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  268486 caatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggt 268552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 424 - 745
Target Start/End: Original strand, 28127516 - 28127837
Alignment:
Q  424 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 523  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||| |     
T  28127516 ggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctctc 28127615  T
Q  524 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 623  Q
    |||||| ||| |   ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28127616 catgcttagcaagctcttcaccataactccctgtatgatatcgcacatcagtaggatccacgccaaagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtctt 28127715  T
Q  624 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 723  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28127716 gtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaaatacaggaataaaaattctagattcttcaatggcc 28127815  T
Q  724 ttgatgagtgatggtgtgattt 745  Q
    || |  ||||| ||||||||||    
T  28127816 tttaaaagtgacggtgtgattt 28127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 424 - 779
Target Start/End: Original strand, 28164200 - 28164554
Alignment:
Q  424 ggactatcatggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctctttt 523  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |  |||||| | ||||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||       
T  28164200 ggactataatggtagccggacaagttagcagcttgggttagagctatcttccattggtgcaatcgctccatgtttttcttgttattttggaacctctcac 28164299  T
Q  524 catgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctt 623  Q
    |||||| ||  |   |||  |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28164300 catgcttagtaagatctttgccataactccctgtatgatgtcgcacatcagtaggatccacgccaa-gaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtctt 28164398  T
Q  624 gtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcc 723  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  28164399 gtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagataacacaggaataaaaattcaagatttttcaatggcc 28164498  T
Q  724 ttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 779  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||   |||||||||||    
T  28164499 ttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaa 28164554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 115
Target Start/End: Original strand, 28163855 - 28163916
Alignment:
Q  54 agaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  28163855 agaagcaatttcacttgttgtacttgagattgtaatccaacaggatattttgcaacatgtaa 28163916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 28127155 - 28127308
Alignment:
Q  54 agaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatcttgttggagatgtactctacta 153  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |   ||| |||||||||||||| |||||||||||||||     |||| | ||| ||| ||| ||||  |  | ||    
T  28127155 agaagcaaattcacttgttgtacttggtcctgtaatccaacaggatatttggcaacatgtaagaaaacacgattgatcctgtcggatatgtctttgatta 28127254  T
Q  154 tctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagt 207  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  28127255 tcttctgaataaacttgtattcatatctattaatctccaataagataagttagt 28127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 432 - 782
Target Start/End: Original strand, 29273628 - 29273978
Alignment:
Q  432 atggtagccggaaaagttagcagcatggctcagagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctca 531  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||  |||||| | |||||||  ||||||||||||||   |||||| || |||| ||| | || |    
T  29273628 atggtagccagacaagttagaagcttgggtcagagccaacttccattgatgcaaccgatccatgtttttcttgctattttggaaactctcttcgtactta 29273727  T
Q  532 gcca-atgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaa 630  Q
    |  | ||| |||||||||||| ||  | |||||||| |  |||| ||| ||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  29273728 gtgagatg-ttcaccataactcccactttgatgtcgtatgtgagtaggatccacgccatagaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcag 29273826  T
Q  631 tgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatga 730  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  ||    
T  29273827 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcga 29273926  T
Q  731 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||    
T  29273927 gtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggt 29273978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Original strand, 29273297 - 29273472
Alignment:
Q  33 ccatcatcagatctttcatcaagaagcaatttcacttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaagggctgacgactaatct 132  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||   || || ||||    
T  29273297 ccatcatcagatccattatcaagaagcgatttgacttgttgtacttgagactgtaatccaacagggtatttggcaacatgtaagggcacgcggctgatct 29273396  T
Q  133 tgttggagatgtactctactatctctccaataaacttgtattcatatctattcatgtccaataaaataagttagta 208  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  29273397 tgttggagatgtatttgactatctctccgataaacttgtattcatatctattcatgtcaaataatacaagttagta 29273472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 643 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 31903969 - 31903851
Alignment:
Q  643 acaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtga 742  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||  |||   ||||||||| |||||||| ||||  |  |||||||||||||    
T  31903969 acaagttcatgtaagcaaaatgaagaagaagcatagtttttagagagcacaataatggcaatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtga 31903870  T
Q  743 tttcatctcctctttgaag 761  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  31903869 tttcatgtcctctttgaag 31903851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16440743 - 16440694
Alignment:
Q  66 acttgttgtactcgagactgcaatccaacaggataattggcaacatgtaa 115  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16440743 acttggtgcactcgagactccaatccaacagggtaattagcaacatgtaa 16440694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 463 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 35023 - 34704
Alignment:
Q  463 agagccactttccatcgctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgat 562  Q
    |||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| |||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || ||||    
T  35023 agagccatcttccatttctgcaacctctccatgttatccttgttattttggaacttctttatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgat 34924  T
Q  563 gtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaa 662  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| || || ||  ||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  34923 gtcgcacgtgagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactagacgcccgctttccttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaa 34824  T
Q  663 tgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaaga 762  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  34823 tgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagc 34724  T
Q  763 tcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  34723 tccctgtcatcaatgaaggt 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 480 - 761
Target Start/End: Complemental strand, 27729 - 27448
Alignment:
Q  480 ctgcaacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggt 579  Q
    ||||||||| |||||| | | ||| | |||||| ||||||| |  ||| ||| ||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27729 ctgcaacctatccatgctatgcttgttattttggaacctctctatatgatcatccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacatgagaaggt 27630  T
Q  580 tccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagt 679  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| ||||| |  |||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  27629 tccacatcatagaaaattggcaaaacaaggcgccgattttccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataat 27530  T
Q  680 tgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaag 761  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||    
T  27529 tgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatgaccttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaag 27448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 525 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 43202 - 42945
Alignment:
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||| || ||| |||||    
T  43202 atgctcagccagtgctttaccataactgccaatctgatgtctcacgttagaaggttccacatcatagaaaattggcaaaactaggcgtccatttttcttg 43103  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
     |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43102 cagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 43003  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||    
T  43002 tgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggt 42945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 525 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 117032 - 116774
Alignment:
Q  525 atgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttg 624  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||| ||||| || |||   |||    
T  117032 atgctcggccagtgctttaccataactgcccttgtgatgtcgcacgtgagaaggttccacatcgtagaaaactggctaaactaggcgcccattttctttg 116933  T
Q  625 tagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcct 724  Q
     |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  116932 aagcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcct 116833  T
Q  725 tgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggta 783  Q
    |||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  116832 tgaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggta 116774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 667 - 782
Target Start/End: Original strand, 10 - 125
Alignment:
Q  667 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 766  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  767 tgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||||||||||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggt 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 537 - 782
Target Start/End: Original strand, 58245 - 58490
Alignment:
Q  537 tgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatg 636  Q
    ||||| ||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||  |||||||| ||||| || | |  || | |||| ||||||    
T  58245 tgctttaccataacttccatcttgatgtcgcacgtgagaaggttccacgtcatagaaaattggcaaaactaggcgcccatattcctcgaagcagtgaatg 58344  T
Q  637 atgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 736  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||    
T  58345 atgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggccttgaaaagtgatg 58444  T
Q  737 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    |||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  58445 gtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggt 58490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 538 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 16689234 - 16688992
Alignment:
Q  538 gcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttccacaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatga 637  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| ||||| |||||  || |||||||||||||||| || ||||| ||||   || ||| || |||||    
T  16689234 gcttcaccataacttccaatctgatgtctcacatgcgaaggatccacgtcatagaaaacaggcaaaactagccgaccttttgcactgaagccatcaatga 16689135  T
Q  638 tgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatgg 737  Q
    |||  |||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| || ||   |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  16689134 tgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaacacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatgg 16689035  T
Q  738 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaag 780  Q
    ||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16689034 tgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaag 16688992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 626 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279667
Alignment:
Q  626 agcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 725  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  726 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 782  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggt 3279667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 483 - 782
Target Start/End: Original strand, 17993593 - 17993892
Alignment:
Q  483 caacctctccatgtttttcttatcattttgaaacctcttttcatgctcagccaatgcttcaccataactacctttatgatgtcgcacatgagaaggttcc 582  Q
    ||||| ||||||||||| |||   ||||||||| | || |||||||| ||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||     
T  17993593 caaccgctccatgttttccttgctattttgaaaaccctcttcatgcttagcaagtgcttcaccataactatcattctgatgtcgcacctgagaaggttct 17993692  T
Q  583 acaccaaagaaaacaggcaaaacgaggcg-accctttgtcttgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttg 681  Q
       ||| |||||||||| |  ||  | || |||||||   ||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||      
T  17993693 gtgccatagaaaacaggaattac-cgtcgtacccttttcattggagcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtcc 17993791  T
Q  682 atagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaagg 781  Q
     | || || ||   |||   ||| || || |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  17993792 tttgagaagacgataatcgcaattcttgagtcttcaatgctcttgaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaagg 17993891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 643 - 760
Target Start/End: Complemental strand, 17712084 - 17711967
Alignment:
Q  643 acaagttcatccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatg-agtgatggtgtg 741  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||||||| |||| || |||  ||| ||||||||||||| || ||| | ||||| | ||||||||||||    
T  17712084 acaagttcattcaaacaaaaagtagaggaagcatagttgttagagaaaacaacaatgaaaatcctagattgttgaatag-cttgaagaagtgatggtgtg 17711986  T
Q  742 atttcatctcctctttgaa 760  Q
    || || |||||| ||||||    
T  17711985 atctcttctcctttttgaa 17711967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University