View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12023_high_66 (Length: 277)

Name: NF12023_high_66
Description: NF12023
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12023_high_66
NF12023_high_66
[»] chr4 (82 HSPs)
chr4 (19-264)||(56178619-56178862)
chr4 (19-264)||(48142984-48143229)
chr4 (19-264)||(9927441-9927683)
chr4 (23-264)||(5370065-5370308)
chr4 (19-264)||(52095345-52095588)
chr4 (19-264)||(26175619-26175862)
chr4 (19-264)||(34570397-34570640)
chr4 (19-264)||(37740568-37740810)
chr4 (19-264)||(13992275-13992511)
chr4 (14-264)||(48893621-48893873)
chr4 (19-264)||(29999792-30000031)
chr4 (19-264)||(54199890-54200132)
chr4 (19-264)||(12739533-12739776)
chr4 (19-264)||(5429621-5429864)
chr4 (19-264)||(47038394-47038635)
chr4 (19-262)||(5871762-5872003)
chr4 (21-257)||(36463379-36463613)
chr4 (98-264)||(12743908-12744073)
chr4 (98-264)||(12745297-12745462)
chr4 (32-226)||(8665363-8665556)
chr4 (22-264)||(36994469-36994708)
chr4 (97-250)||(2209732-2209886)
chr4 (19-264)||(6542162-6542407)
chr4 (97-226)||(41639445-41639574)
chr4 (103-257)||(27416955-27417108)
chr4 (19-264)||(52082646-52082883)
chr4 (97-226)||(6655975-6656104)
chr4 (19-264)||(52467337-52467581)
chr4 (97-229)||(26364255-26364387)
chr4 (19-264)||(29254436-29254679)
chr4 (97-264)||(46147374-46147540)
chr4 (32-248)||(54882976-54883189)
chr4 (32-222)||(46703455-46703645)
chr4 (19-208)||(12747794-12747982)
chr4 (97-243)||(41964434-41964580)
chr4 (103-250)||(50262697-50262844)
chr4 (23-264)||(31474096-31474336)
chr4 (97-222)||(379399-379524)
chr4 (32-226)||(40632401-40632593)
chr4 (19-264)||(45687165-45687409)
chr4 (48-226)||(8648111-8648287)
chr4 (61-226)||(35662426-35662589)
chr4 (22-206)||(12745476-12745659)
chr4 (103-226)||(50673867-50673989)
chr4 (97-264)||(31495297-31495467)
chr4 (97-222)||(12073411-12073536)
chr4 (19-226)||(4587900-4588107)
chr4 (45-260)||(3913417-3913628)
chr4 (98-206)||(12744087-12744195)
chr4 (112-248)||(12119573-12119709)
chr4 (32-226)||(37229741-37229935)
chr4 (97-223)||(5207865-5207992)
chr4 (19-204)||(24969053-24969238)
chr4 (19-264)||(51337006-51337249)
chr4 (133-250)||(8393448-8393566)
chr4 (133-250)||(8395657-8395775)
chr4 (48-226)||(21688221-21688397)
chr4 (112-222)||(26699466-26699577)
chr4 (19-261)||(13009430-13009657)
chr4 (130-222)||(33989896-33989989)
chr4 (103-220)||(33089903-33090021)
chr4 (100-205)||(22882791-22882897)
chr4 (100-205)||(22934455-22934561)
chr4 (97-163)||(41639282-41639348)
chr4 (32-169)||(55085442-55085577)
chr4 (97-250)||(5136081-5136237)
chr4 (97-250)||(5138306-5138462)
chr4 (97-222)||(5349929-5350052)
chr4 (130-199)||(34112869-34112939)
chr4 (103-183)||(48142440-48142522)
chr4 (130-205)||(6677521-6677597)
chr4 (169-250)||(7124992-7125074)
chr4 (98-199)||(16422653-16422755)
chr4 (103-188)||(53345241-53345328)
chr4 (131-220)||(37754986-37755076)
chr4 (130-222)||(21703860-21703952)
chr4 (169-224)||(7122773-7122829)
chr4 (103-182)||(32091503-32091583)
chr4 (98-170)||(34788851-34788923)
chr4 (130-184)||(44570427-44570482)
chr4 (110-199)||(52065628-52065719)
chr4 (136-264)||(29056416-29056544)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (19-264)||(42498136-42498380)
chr8 (19-264)||(17982595-17982839)
chr8 (19-264)||(31218199-31218443)
chr8 (19-264)||(44303796-44304041)
chr8 (32-264)||(34254313-34254542)
chr8 (19-264)||(19945341-19945586)
chr8 (20-264)||(1746201-1746443)
chr8 (25-264)||(34256489-34256725)
chr8 (19-264)||(15212728-15212971)
chr8 (19-264)||(33352092-33352335)
chr8 (19-264)||(43036365-43036608)
chr8 (19-264)||(12702617-12702864)
chr8 (20-261)||(27811221-27811460)
chr8 (19-264)||(4731600-4731843)
chr8 (19-264)||(30143284-30143525)
chr8 (19-264)||(3303653-3303896)
chr8 (21-264)||(40321024-40321265)
chr8 (48-246)||(42434992-42435186)
chr8 (32-257)||(18655356-18655578)
chr8 (21-264)||(1345354-1345595)
chr8 (32-246)||(4283480-4283691)
chr8 (14-264)||(1292447-1292694)
chr8 (25-264)||(5689219-5689456)
chr8 (97-257)||(40221764-40221923)
chr8 (19-261)||(6598914-6599154)
chr8 (19-261)||(6674367-6674607)
chr8 (18-222)||(19491723-19491925)
chr8 (20-226)||(18141763-18141968)
chr8 (19-264)||(30291547-30291793)
chr8 (97-264)||(2627753-2627923)
chr8 (18-264)||(9765690-9765929)
chr8 (97-257)||(11384004-11384163)
chr8 (103-248)||(10930198-10930342)
chr8 (45-208)||(44353762-44353923)
chr8 (97-220)||(40328798-40328922)
chr8 (22-261)||(41366601-41366837)
chr8 (45-226)||(3772161-3772340)
chr8 (19-226)||(4162442-4162644)
chr8 (19-264)||(4743197-4743429)
chr8 (32-264)||(8965674-8965904)
chr8 (98-250)||(25689974-25690126)
chr8 (19-226)||(18106101-18106304)
chr8 (133-250)||(3439558-3439675)
chr8 (156-264)||(4733784-4733891)
chr8 (130-226)||(8153810-8153906)
chr8 (112-222)||(7597648-7597759)
chr8 (116-226)||(10015119-10015227)
chr8 (138-226)||(3073894-3073981)
chr8 (112-222)||(11712024-11712135)
chr8 (112-208)||(1822326-1822423)
chr8 (112-208)||(1856771-1856868)
chr8 (97-250)||(42575320-42575476)
chr8 (130-222)||(32902197-32902290)
chr8 (97-242)||(15290540-15290688)
chr8 (97-242)||(15470909-15471057)
chr8 (112-187)||(10240188-10240264)
chr8 (14-161)||(41364932-41365078)
chr8 (19-197)||(10929742-10929907)
chr8 (112-222)||(29796344-29796456)
chr8 (112-182)||(3231859-3231930)
chr8 (123-195)||(11137070-11137146)
chr8 (169-220)||(38863949-38864000)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (19-264)||(5406182-5406424)
chr6 (19-264)||(5410507-5410749)
chr6 (19-264)||(5413377-5413618)
chr6 (19-264)||(16452311-16452555)
chr6 (19-264)||(30834518-30834762)
chr6 (19-264)||(31404657-31404899)
chr6 (19-263)||(9183015-9183257)
chr6 (19-264)||(2171513-2171756)
chr6 (19-264)||(33160334-33160579)
chr6 (19-226)||(28137428-28137634)
chr6 (32-246)||(21593620-21593831)
chr6 (61-246)||(21588916-21589098)
chr6 (48-246)||(17757995-17758191)
chr6 (48-246)||(17762962-17763158)
chr6 (20-256)||(26954277-26954510)
chr6 (98-250)||(3808704-3808857)
chr6 (97-226)||(2972959-2973088)
chr6 (97-246)||(26830124-26830272)
chr6 (19-264)||(33211168-33211411)
chr6 (19-223)||(3038926-3039129)
chr6 (148-264)||(5409052-5409167)
chr6 (98-264)||(3072740-3072909)
chr6 (32-246)||(5043583-5043795)
chr6 (98-264)||(412120-412290)
chr6 (97-250)||(603085-603237)
chr6 (48-222)||(22424850-22425023)
chr6 (98-264)||(6097431-6097589)
chr6 (97-264)||(16653130-16653300)
chr6 (165-264)||(16569109-16569207)
chr6 (97-250)||(27647879-27648032)
chr6 (97-264)||(16554887-16555057)
chr6 (97-264)||(16578498-16578668)
chr6 (97-264)||(16616712-16616882)
chr6 (97-264)||(16631443-16631613)
chr6 (121-222)||(26800630-26800731)
chr6 (97-250)||(25421323-25421478)
chr6 (45-220)||(4045392-4045566)
chr6 (97-250)||(6027264-6027419)
chr6 (97-250)||(13153931-13154087)
chr6 (97-250)||(33342101-33342257)
chr6 (97-250)||(34164874-34165030)
chr6 (178-250)||(34167180-34167252)
chr6 (98-207)||(25073588-25073698)
chr6 (20-67)||(6097610-6097657)
chr6 (168-222)||(9572681-9572735)
chr6 (130-205)||(2908510-2908586)
chr6 (19-70)||(16567148-16567200)
[»] chr5 (65 HSPs)
chr5 (19-264)||(25412704-25412946)
chr5 (19-264)||(13239694-13239937)
chr5 (19-264)||(13343003-13343246)
chr5 (19-264)||(30182531-30182774)
chr5 (19-264)||(37439076-37439327)
chr5 (19-264)||(36074025-36074270)
chr5 (22-264)||(42426218-42426458)
chr5 (19-264)||(13488145-13488388)
chr5 (19-264)||(42428413-42428656)
chr5 (26-264)||(32636773-32637009)
chr5 (19-264)||(39468532-39468775)
chr5 (19-262)||(533711-533952)
chr5 (32-246)||(213421-213633)
chr5 (19-264)||(28750638-28750881)
chr5 (19-264)||(30682906-30683146)
chr5 (48-261)||(28278289-28278498)
chr5 (19-264)||(16409425-16409663)
chr5 (19-264)||(26177833-26178070)
chr5 (19-264)||(33831622-33831865)
chr5 (61-246)||(40147246-40147428)
chr5 (22-261)||(537970-538207)
chr5 (19-264)||(16452023-16452265)
chr5 (19-264)||(8565930-8566172)
chr5 (19-264)||(9789204-9789442)
chr5 (19-264)||(18441628-18441866)
chr5 (32-246)||(5058003-5058212)
chr5 (19-264)||(31182915-31183156)
chr5 (48-244)||(27637615-27637809)
chr5 (19-264)||(3075641-3075884)
chr5 (20-229)||(42309952-42310160)
chr5 (19-264)||(26170724-26170950)
chr5 (97-226)||(38747024-38747153)
chr5 (32-225)||(16640961-16641153)
chr5 (97-250)||(29751156-29751310)
chr5 (97-264)||(29720382-29720551)
chr5 (97-264)||(29722542-29722711)
chr5 (98-260)||(27015551-27015704)
chr5 (32-223)||(13695713-13695904)
chr5 (97-264)||(10593276-10593445)
chr5 (97-250)||(22536286-22536439)
chr5 (118-264)||(9049325-9049470)
chr5 (98-222)||(316782-316907)
chr5 (97-250)||(25078138-25078293)
chr5 (97-250)||(25136107-25136262)
chr5 (133-250)||(40382355-40382474)
chr5 (19-175)||(5887487-5887642)
chr5 (169-264)||(19806454-19806548)
chr5 (169-250)||(40380181-40380263)
chr5 (97-250)||(16546647-16546803)
chr5 (132-248)||(33906028-33906145)
chr5 (169-250)||(16544499-16544581)
chr5 (130-208)||(10054854-10054932)
chr5 (19-145)||(19806326-19806449)
chr5 (130-207)||(3325965-3326043)
chr5 (22-87)||(42926838-42926904)
chr5 (154-264)||(42926967-42927076)
chr5 (181-222)||(4160702-4160743)
chr5 (130-179)||(42926919-42926968)
chr5 (104-183)||(30802854-30802934)
chr5 (103-186)||(35616194-35616278)
chr5 (130-208)||(8445767-8445846)
chr5 (98-222)||(10700674-10700796)
chr5 (97-188)||(22097883-22097973)
chr5 (137-264)||(30793195-30793321)
chr5 (194-264)||(5887417-5887486)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (19-264)||(7762208-7762451)
chr3 (19-264)||(37408401-37408644)
chr3 (19-264)||(5258126-5258370)
chr3 (19-264)||(45095107-45095349)
chr3 (19-264)||(19683871-19684115)
chr3 (19-264)||(5260305-5260549)
chr3 (19-264)||(7764410-7764650)
chr3 (19-264)||(9636107-9636352)
chr3 (19-264)||(23200120-23200362)
chr3 (19-264)||(23197921-23198163)
chr3 (19-264)||(9581225-9581468)
chr3 (19-264)||(5236440-5236682)
chr3 (14-264)||(29810805-29811053)
chr3 (97-264)||(34491231-34491397)
chr3 (19-264)||(40734440-40734683)
chr3 (19-264)||(40735325-40735568)
chr3 (19-264)||(51398756-51398999)
chr3 (19-264)||(31314387-31314630)
chr3 (19-251)||(44331487-44331717)
chr3 (19-264)||(29196369-29196614)
chr3 (19-264)||(760789-761032)
chr3 (32-246)||(4569907-4570120)
chr3 (32-226)||(6095619-6095811)
chr3 (19-264)||(44700462-44700705)
chr3 (21-250)||(43401797-43402026)
chr3 (19-264)||(29682301-29682544)
chr3 (20-264)||(16498973-16499214)
chr3 (21-261)||(22834989-22835226)
chr3 (98-264)||(29813083-29813248)
chr3 (32-222)||(46860428-46860618)
chr3 (97-250)||(49199465-49199619)
chr3 (103-226)||(54593729-54593852)
chr3 (97-226)||(30236144-30236273)
chr3 (98-226)||(46173377-46173505)
chr3 (97-264)||(801109-801279)
chr3 (97-264)||(7779985-7780153)
chr3 (19-261)||(39153347-39153587)
chr3 (48-250)||(43403740-43403940)
chr3 (19-264)||(23391892-23392135)
chr3 (19-229)||(53921520-53921729)
chr3 (32-222)||(41819547-41819736)
chr3 (48-248)||(47304224-47304420)
chr3 (23-222)||(32891049-32891248)
chr3 (32-264)||(9666449-9666680)
chr3 (112-264)||(32744419-32744570)
chr3 (19-264)||(23410312-23410555)
chr3 (97-250)||(6716518-6716671)
chr3 (97-250)||(54635143-54635296)
chr3 (32-222)||(5433906-5434090)
chr3 (137-250)||(40913352-40913464)
chr3 (103-213)||(36018877-36018987)
chr3 (139-222)||(55301996-55302079)
chr3 (97-250)||(45283001-45283158)
chr3 (97-250)||(3617467-3617622)
chr3 (97-250)||(25637444-25637599)
chr3 (97-250)||(4598519-4598675)
chr3 (97-250)||(4600740-4600896)
chr3 (97-250)||(10056235-10056391)
chr3 (97-250)||(10058457-10058613)
chr3 (97-250)||(10060679-10060835)
chr3 (97-250)||(10062901-10063057)
chr3 (97-250)||(10065123-10065279)
chr3 (97-250)||(10211411-10211567)
chr3 (110-179)||(31340268-31340337)
chr3 (103-212)||(25491003-25491111)
chr3 (169-250)||(10209265-10209347)
chr3 (97-222)||(4055788-4055913)
chr3 (45-197)||(5373200-5373353)
chr3 (97-205)||(35138746-35138855)
chr3 (112-222)||(33191866-33191974)
chr3 (112-207)||(51352150-51352244)
chr3 (130-203)||(20937708-20937781)
chr3 (179-236)||(27305721-27305777)
chr3 (172-226)||(2075095-2075149)
chr3 (137-205)||(4075511-4075581)
chr3 (19-87)||(2075214-2075283)
chr3 (112-195)||(54739004-54739087)
chr3 (207-250)||(10067435-10067478)
chr3 (97-195)||(26323124-26323223)
chr3 (97-148)||(55302079-55302130)
chr3 (130-183)||(2020191-2020245)
chr3 (45-87)||(26386638-26386680)
chr3 (19-65)||(32744606-32744652)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (19-264)||(2334400-2334643)
chr2 (19-264)||(5723238-5723480)
chr2 (19-264)||(45099697-45099940)
chr2 (19-264)||(4503115-4503358)
chr2 (19-264)||(36988058-36988301)
chr2 (23-264)||(6594988-6595228)
chr2 (19-264)||(4484312-4484556)
chr2 (19-264)||(36205647-36205889)
chr2 (19-264)||(30833288-30833532)
chr2 (19-264)||(36773504-36773747)
chr2 (19-264)||(38312182-38312425)
chr2 (14-264)||(723727-723975)
chr2 (19-264)||(36317992-36318235)
chr2 (19-264)||(34139753-34139997)
chr2 (19-264)||(29867811-29868054)
chr2 (19-264)||(17057352-17057595)
chr2 (19-264)||(17085335-17085578)
chr2 (14-264)||(14633808-14634057)
chr2 (21-264)||(33162433-33162674)
chr2 (32-246)||(45726885-45727096)
chr2 (19-264)||(11151574-11151817)
chr2 (19-264)||(42362294-42362533)
chr2 (20-264)||(11067248-11067490)
chr2 (98-246)||(35446885-35447032)
chr2 (19-261)||(11690443-11690683)
chr2 (32-226)||(1631752-1631944)
chr2 (97-250)||(32289582-32289736)
chr2 (98-222)||(33648190-33648316)
chr2 (48-248)||(24398027-24398228)
chr2 (97-250)||(6266709-6266863)
chr2 (115-246)||(17490149-17490279)
chr2 (97-226)||(42288131-42288259)
chr2 (112-264)||(26353218-26353368)
chr2 (32-208)||(7815311-7815486)
chr2 (45-212)||(13121738-13121901)
chr2 (125-246)||(7451165-7451284)
chr2 (97-250)||(13656028-13656182)
chr2 (45-257)||(17450560-17450755)
chr2 (97-250)||(12647382-12647537)
chr2 (118-223)||(11049593-11049699)
chr2 (19-264)||(14202404-14202633)
chr2 (19-180)||(24885603-24885763)
chr2 (172-264)||(39284930-39285024)
chr2 (137-222)||(28671989-28672075)
chr2 (97-222)||(30218068-30218194)
chr2 (19-87)||(39284827-39284896)
chr2 (132-220)||(42019896-42019987)
chr2 (103-207)||(42261524-42261629)
chr2 (112-222)||(7597036-7597145)
chr2 (177-223)||(42412117-42412162)
chr2 (130-186)||(34811281-34811338)
chr2 (103-186)||(12123644-12123728)
chr2 (19-70)||(32289515-32289566)
chr2 (98-211)||(41454254-41454366)
chr2 (123-260)||(24197942-24198078)
chr2 (98-163)||(41446159-41446224)
chr2 (130-170)||(4561140-4561180)
[»] chr7 (78 HSPs)
chr7 (21-264)||(23554984-23555226)
chr7 (19-264)||(35853857-35854101)
chr7 (19-264)||(29990997-29991239)
chr7 (19-264)||(4178717-4178959)
chr7 (20-264)||(27347760-27348002)
chr7 (19-264)||(47676119-47676362)
chr7 (19-263)||(14069817-14070059)
chr7 (19-263)||(14379845-14380087)
chr7 (19-264)||(19502120-19502364)
chr7 (19-264)||(31732952-31733195)
chr7 (32-257)||(34310705-34310928)
chr7 (19-264)||(47673927-47674169)
chr7 (19-264)||(18126586-18126829)
chr7 (27-261)||(30024718-30024950)
chr7 (19-264)||(48491521-48491763)
chr7 (19-264)||(1113599-1113842)
chr7 (22-264)||(25766941-25767180)
chr7 (19-264)||(41317417-41317660)
chr7 (19-264)||(39731319-39731555)
chr7 (19-264)||(48489373-48489616)
chr7 (48-264)||(22269945-22270158)
chr7 (19-264)||(43864186-43864429)
chr7 (19-264)||(4586103-4586346)
chr7 (19-264)||(48408745-48408991)
chr7 (19-261)||(8153284-8153524)
chr7 (97-264)||(25615872-25616039)
chr7 (19-264)||(41648994-41649236)
chr7 (22-264)||(495966-496206)
chr7 (19-264)||(38671205-38671448)
chr7 (32-259)||(2360960-2361184)
chr7 (19-264)||(36146391-36146635)
chr7 (110-246)||(32358055-32358190)
chr7 (49-246)||(3258968-3259162)
chr7 (22-264)||(26417261-26417501)
chr7 (97-226)||(2390301-2390430)
chr7 (97-226)||(6431990-6432119)
chr7 (97-226)||(29608756-29608885)
chr7 (103-246)||(4508707-4508849)
chr7 (97-246)||(8359316-8359466)
chr7 (104-261)||(2759183-2759339)
chr7 (97-246)||(48599335-48599483)
chr7 (19-264)||(12097850-12098085)
chr7 (26-264)||(31105376-31105612)
chr7 (97-264)||(43504135-43504305)
chr7 (112-226)||(23565081-23565195)
chr7 (97-226)||(4510568-4510697)
chr7 (97-226)||(4512410-4512539)
chr7 (97-264)||(24789859-24790028)
chr7 (32-264)||(4253511-4253742)
chr7 (98-264)||(31518923-31519088)
chr7 (14-188)||(31518732-31518905)
chr7 (121-226)||(6359972-6360077)
chr7 (97-250)||(20343915-20344068)
chr7 (154-264)||(24525485-24525594)
chr7 (112-222)||(22328414-22328525)
chr7 (32-264)||(36574499-36574728)
chr7 (19-159)||(4538627-4538766)
chr7 (97-250)||(18388756-18388911)
chr7 (97-250)||(18392192-18392347)
chr7 (45-226)||(23343944-23344121)
chr7 (97-250)||(32060318-32060475)
chr7 (165-264)||(1560647-1560748)
chr7 (97-250)||(6592336-6592491)
chr7 (97-250)||(6594554-6594709)
chr7 (19-87)||(24514918-24514986)
chr7 (172-264)||(30814530-30814620)
chr7 (130-208)||(5116656-5116735)
chr7 (20-150)||(24525992-24526122)
chr7 (112-222)||(3904641-3904751)
chr7 (153-223)||(18396392-18396463)
chr7 (19-87)||(2761459-2761528)
chr7 (142-223)||(5513690-5513771)
chr7 (2-46)||(21983517-21983561)
chr7 (98-212)||(43363507-43363622)
chr7 (128-173)||(31048277-31048323)
chr7 (130-186)||(27073868-27073925)
chr7 (130-186)||(27204388-27204445)
chr7 (98-171)||(1360226-1360301)
[»] chr1 (82 HSPs)
chr1 (19-264)||(3189273-3189516)
chr1 (19-264)||(3198090-3198333)
chr1 (19-264)||(3206929-3207172)
chr1 (19-264)||(20762614-20762858)
chr1 (19-264)||(3156808-3157050)
chr1 (19-263)||(28220210-28220452)
chr1 (45-264)||(8550769-8550986)
chr1 (45-264)||(49918319-49918535)
chr1 (19-264)||(44455102-44455345)
chr1 (20-264)||(28265537-28265779)
chr1 (19-264)||(834150-834393)
chr1 (19-264)||(4552620-4552863)
chr1 (97-264)||(13316334-13316501)
chr1 (19-263)||(28223405-28223647)
chr1 (19-261)||(31659180-31659420)
chr1 (19-264)||(37503540-37503780)
chr1 (19-264)||(50167158-50167401)
chr1 (32-246)||(13547090-13547301)
chr1 (27-264)||(46064868-46065103)
chr1 (32-246)||(37168253-37168465)
chr1 (48-246)||(47255340-47255535)
chr1 (19-264)||(50169193-50169436)
chr1 (32-246)||(29136203-29136415)
chr1 (25-264)||(51765343-51765583)
chr1 (22-223)||(1833467-1833667)
chr1 (19-264)||(3847104-3847347)
chr1 (20-264)||(13659319-13659561)
chr1 (21-260)||(19754438-19754676)
chr1 (32-226)||(11348654-11348846)
chr1 (32-246)||(13549001-13549212)
chr1 (19-226)||(23555286-23555491)
chr1 (98-250)||(42297971-42298123)
chr1 (19-261)||(196893-197134)
chr1 (45-264)||(37559850-37560068)
chr1 (20-264)||(45644337-45644580)
chr1 (19-264)||(10925165-10925411)
chr1 (21-226)||(15820251-15820455)
chr1 (32-250)||(37033068-37033285)
chr1 (23-264)||(13137959-13138196)
chr1 (97-226)||(31925727-31925856)
chr1 (49-226)||(34603549-34603725)
chr1 (49-226)||(7482250-7482426)
chr1 (61-246)||(193596-193778)
chr1 (18-222)||(41360856-41361058)
chr1 (32-246)||(47115127-47115340)
chr1 (48-257)||(19752658-19752864)
chr1 (98-264)||(30476429-30476594)
chr1 (97-264)||(20622218-20622388)
chr1 (97-250)||(9987220-9987373)
chr1 (97-264)||(40282395-40282564)
chr1 (97-264)||(9036435-9036603)
chr1 (22-264)||(40122179-40122421)
chr1 (98-222)||(22079336-22079461)
chr1 (103-264)||(21053982-21054145)
chr1 (103-264)||(927959-928120)
chr1 (121-207)||(16455664-16455750)
chr1 (147-246)||(37876767-37876865)
chr1 (97-250)||(44203649-44203804)
chr1 (105-220)||(6808479-6808595)
chr1 (155-246)||(28242382-28242472)
chr1 (47-223)||(37282714-37282888)
chr1 (112-223)||(3460730-3460841)
chr1 (123-206)||(9109459-9109543)
chr1 (165-226)||(36683767-36683828)
chr1 (45-236)||(44650173-44650362)
chr1 (32-151)||(37879006-37879123)
chr1 (115-204)||(2263016-2263106)
chr1 (98-222)||(2926528-2926653)
chr1 (130-218)||(5459958-5460046)
chr1 (97-188)||(32471480-32471571)
chr1 (97-186)||(16914234-16914325)
chr1 (137-222)||(13938195-13938281)
chr1 (97-183)||(12318585-12318672)
chr1 (98-199)||(4535527-4535629)
chr1 (45-87)||(16455591-16455633)
chr1 (47-89)||(44646939-44646981)
chr1 (130-186)||(25652138-25652195)
chr1 (178-226)||(8871082-8871130)
chr1 (97-183)||(41135839-41135926)
chr1 (97-186)||(1050503-1050593)
chr1 (98-159)||(8871135-8871197)
chr1 (98-150)||(36683710-36683762)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (19-264)||(434475-434719)
scaffold0002 (103-207)||(490359-490464)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (19-264)||(114545-114788)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (19-261)||(859-1098)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (21-264)||(11502-11744)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (19-264)||(11143-11387)
scaffold0491 (19-264)||(8717-8961)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (19-264)||(20398-20641)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (20-264)||(149080-149322)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (32-246)||(7283-7494)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (98-246)||(18004-18151)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (103-226)||(10515-10637)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (97-252)||(2598-2755)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (97-186)||(80343-80432)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (133-250)||(3722-3841)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (130-222)||(27466-27559)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (169-250)||(6363-6445)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (112-199)||(25087-25175)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 82)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 56178862 - 56178619
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  56178862 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattagggttgttct 56178765  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  56178764 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 56178665  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  56178664 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 56178619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 48142984 - 48143229
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || |||||||||||||||    
T  48142984 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagg-tagaaattagggttgttc 48143082  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48143083 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 48143182  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48143183 ggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 48143229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9927683 - 9927441
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  9927683 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttct 9927586  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9927585 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 9927486  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  9927485 gtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 9927441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5370308 - 5370065
Alignment:
Q  23 tgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnng-ggtaaaaattagggttgttctttg 121  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         | |||| |||||||||||||||||||    
T  5370308 tgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattggaaaaaaaagaggtagaaattagggttgttctttg 5370209  T
Q  122 tgaacttcttgaa-gctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5370208 tgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggactagagagatcaatctctcctccagagtaggt 5370109  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  5370108 caagtttggaccgaactgagtgaacaatctttgatgtgtttgtt 5370065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52095588 - 52095345
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  52095588 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 52095491  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52095490 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 52095391  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52095390 gg-caagtttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgtttgtt 52095345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26175862 - 26175619
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||| | |||||||||||||||    
T  26175862 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--ggggagaaattagggttgttc 26175765  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26175764 tttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 26175665  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26175664 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 26175619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34570640 - 34570397
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||||||||    
T  34570640 gggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaata--ggtagaaattagggttgttc 34570543  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34570542 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 34570443  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34570442 ggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 34570397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 37740568 - 37740810
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| ||||||||||||||||    
T  37740568 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaa--gggtataaattagggttgttct 37740665  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  37740666 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttg 37740765  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| | || |||||| ||| |||||||||||    
T  37740766 gtcaag-ttggaccgaactgtgtcaacaattttttgtgtgtttgtt 37740810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13992511 - 13992275
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  13992511 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 13992420  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13992419 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctc-ttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 13992321  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13992320 gtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 13992275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 48893873 - 48893621
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||    
T  48893873 ctttagggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggt 48893776  T
Q  113 tgttc----tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    |||||    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48893775 tgttcattgtttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcc 48893676  T
Q  209 tccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48893675 cccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 48893621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30000031 - 29999792
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  30000031 gggtttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcgttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa---gggtagaaattagggttgttct 29999935  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||| | |  |||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999934 ttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 29999835  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||||||||||||||    
T  29999834 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaaca----ttggtgtgtttgtt 29999792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54200132 - 54199890
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  54200132 gggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 54200035  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  54200034 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattagagagatcattctctcccccagatta 54199935  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  54199934 ggtcaagttgga--cgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgtt 54199890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12739776 - 12739533
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || |||||||||||||||    
T  12739776 gggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--ggatagaaattagggttgttc 12739679  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12739678 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 12739579  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12739578 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 12739533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 5429621 - 5429864
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       | ||| ||||||||||| |||    
T  5429621 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gagtagaaattagggttattc 5429718  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5429719 ttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 5429818  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5429819 ggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 5429864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47038635 - 47038394
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  47038635 gggttgggaaacattataaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg---gaaaatgggtagaaattagggttgttc 47038539  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47038538 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattt-gtatctgtttgtaaggactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagta 47038440  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47038439 agtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 47038394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Original strand, 5871762 - 5872003
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||| ||||||    
T  5871762 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattaggtttgttc 5871859  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5871860 tttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaagaactctttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagatta 5871959  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttg 262  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5871960 ggtcaagtttg-accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttg 5872003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36463613 - 36463379
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || ||||||||| ||||| |    
T  36463613 gttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--ggatagaaattagggctgttcat 36463516  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36463515 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 36463416  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgt 257  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36463415 tcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgt 36463379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743908
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12743974  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12743973 tcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 12743908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745297
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12745363  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12745362 tcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 12745297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 8665363 - 8665556
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |       ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  8665363 ttgtaaacaccttggaagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgagagcttgt 8665460  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665461 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 36994469 - 36994708
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| |||||||||||    
T  36994469 ttggcaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattaaggttgttcttt 36994566  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  36994567 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagat 36994666  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||| ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  36994667 caag-ttggaccgaactgggtcaacaat-tttggcgtgtttgtt 36994708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 2209732 - 2209886
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2209732 gggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 2209831  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  2209832 gattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 2209886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6542407 - 6542162
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gtt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |       || || |||||||| || |||    
T  6542407 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggggagattgggaaaaaatgg-tagaaattaggatttgtt 6542309  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6542308 ctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgttagccttttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggt 6542209  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||    
T  6542208 aggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtt 6542162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 41639445 - 41639574
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  41639445 gggtagaaattagggttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtaagaactcatcgatagtggattggagag 41639544  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41639545 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 41639574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27417108 - 27416955
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27417108 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaat 27417009  T
Q  203 ctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgt 257  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| | || |||||||||||||||    
T  27417008 ctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgt 27416955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52082883 - 52082646
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||| |||||||||||    
T  52082883 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaactagggttgttc 52082786  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||       ||||||| ||||||||||||||||    
T  52082785 tttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaaatctttgatagtg-------gagatcattctctcctccagagta 52082693  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  52082692 ggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 52082646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656104
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 6656074  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6656075 atcaatctctcatccagagtaggtcaagtt 6656104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 52467581 - 52467337
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgtt-gtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgtt 116  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |       ||||| |||||||| |||||    
T  52467581 gggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaggttgggaaaat--gggtagaaattaggtttgtt 52467484  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |    
T  52467483 ctttgtgagcttgttgaagctaatatcttgtaacccatttgtatcactttgtaataactttttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagatt 52467384  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  52467383 aggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 52467337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 229
Target Start/End: Original strand, 26364255 - 26364387
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  26364255 gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattaatagtggattggagag 26364354  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26364355 atcaatctctcccccagattaggtcaagtttga 26364387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 29254436 - 29254679
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||| ||||||     
T  29254436 gggttgggaaacattgtaaacacattgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaatt--gggtagaaattagagttgttt 29254533  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | ||    
T  29254534 tttatgagcttgttgaagttaatttcttgcaacccatttgtgtctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaatta 29254633  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29254634 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 29254679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 46147540 - 46147374
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  46147540 gggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagac 46147441  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46147440 atcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 46147374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 248
Target Start/End: Original strand, 54882976 - 54883189
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  54882976 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgt 54883072  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||| |    
T  54883073 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttgga 54883171  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaat 248  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  54883172 ccgaactgggtcaacaat 54883189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Original strand, 46703455 - 46703645
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |       | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  46703455 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gagtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 46703552  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703553 ttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 46703645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12747982 - 12747794
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || |||||||||||||||    
T  12747982 gggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtggaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--ggatagaaattagggttgttc 12747885  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12747884 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctatttgtatgaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc 12747794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 243
Target Start/End: Original strand, 41964434 - 41964580
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41964434 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 41964533  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  41964534 gatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 50262844 - 50262697
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaat 202  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  50262844 aaattacggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagatatcaat 50262745  T
Q  203 ctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    || |||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||    
T  50262744 ctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatct 50262697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Original strand, 31474096 - 31474336
Alignment:
Q  23 tgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattaggg-ttgttcttt 120  Q
    |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||  |||||||||    
T  31474096 tgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaggtcttgttcttt 31474193  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
     |||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  31474194 ttgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagat 31474293  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaaca-atctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||| ||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  31474294 caag-ttggaccgaactgggtaaacatatc-ttggtgtgtttgtt 31474336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Original strand, 379399 - 379524
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  379399 gggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgctttgtaagaactaattgatagtggattggagag 379498  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  379499 atcaatctctcctccagagtaggtca 379524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 40632401 - 40632593
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  40632401 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 40632497  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  40632498 tgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaagtt 40632593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45687409 - 45687165
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gtt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||| |       ||| | |||||||| || |||    
T  45687409 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaattttttgattgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggaagaaattaggttttgtt 45687312  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||| ||| |  ||||||||||||| |||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |    
T  45687311 ctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtatctatttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcctccatatt 45687212  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    | |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  45687211 atgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 45687165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 8648111 - 8648287
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |       || || ||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||| |    
T  8648111 gagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaat--ggatagaaattagggttgttcattgtgagtttgttgaagctaatttcttat 8648208  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648209 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8648287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 226
Target Start/End: Original strand, 35662426 - 35662589
Alignment:
Q  61 tgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  35662426 tgagtgtcttgttcattggtgagattga--aaaaatgggtagaaattagggttgttctttatgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 35662523  T
Q  161 ctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  35662524 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaagtt 35662589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12745659 - 12745476
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |       ||||| ||||||||||||||||||    
T  12745659 ttgggaaacaatgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattaggaaaat--gggtagaaattagggttgttcttt 12745562  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctct 206  Q
    |||||||| |  || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12745561 gtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctct 12745476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 50673989 - 50673867
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaat 202  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50673989 aaattaggattgt-ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaat 50673891  T
Q  203 ctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  50673890 ctctcctccagagtaggtcaagtt 50673867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31495467 - 31495297
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||    
T  31495467 gggtagaaattaggattgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagttgattggag 31495368  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31495367 agttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 31495297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Original strand, 12073411 - 12073536
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12073411 gggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 12073510  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12073511 atcaatctctcttccagagtaggtca 12073536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 4587900 - 4588107
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gtt 116  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |        |||| |||||| | || |||    
T  4587900 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcatgttcattggtgaaattgggaaaaaa--ggtagaaattaagatttgtt 4587997  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |    
T  4587998 ctttgtaagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccataat 4588097  T
Q  217 aggtcaagtt 226  Q
    |||| |||||    
T  4588098 aggtgaagtt 4588107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 260
Target Start/End: Original strand, 3913417 - 3913628
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttct 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       | ||| ||||||| | ||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  3913417 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gagtagaaattagagctgttctttgtgagtttgttgaagctaatttct 3913514  T
Q  145 tgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaa 244  Q
    | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| | ||||| |||| ||    
T  3913515 tttaacccatttgtatatctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagagtatgtaaag-ttgtatcgaactgggtcaa 3913612  T
Q  245 caatctttggtgtgtt 260  Q
    ||||||||||||||||    
T  3913613 caatctttggtgtgtt 3913628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744087
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 12744096  T
Q  198 tcaatctct 206  Q
    |||||||||    
T  12744095 tcaatctct 12744087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 248
Target Start/End: Original strand, 12119573 - 12119709
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12119573 ttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-c 12119671  T
Q  211 cagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaat 248  Q
     |||||||||||   ||| |||||||  ||||||||||    
T  12119672 aagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaat 12119709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37229935 - 37229741
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt-tgttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||| |||||||||||| |||     
T  37229935 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat---ggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttg 37229839  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttg-tatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    || |||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  37229838 ttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaagtt 37229741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5207992 - 5207865
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  5207992 gggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacccttgtatatctatttgtaagaactcattgatagtggattggaaa 5207893  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5207892 gatcaatctctctcccagagtaggtcaa 5207865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 204
Target Start/End: Original strand, 24969053 - 24969238
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgtt-gtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgtt 116  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||         ||||| |||||||  |||||    
T  24969053 gggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagagtcttgttctttggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagatttgtt 24969150  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatct 204  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24969151 ctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactaattgatagtggattggagagataaatct 24969238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 51337006 - 51337249
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattaggg--ttgt 115  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||       ||||| |||||| ||  ||||    
T  51337006 gggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcctgttcattggtgagattgagaaaaa--gggtagaaattacggatttgt 51337103  T
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagag 215  Q
    ||||||||| ||| |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  || |     
T  51337104 tctttgtgagctttt--aagataatttattataacccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtgtattagagagatcaatctctcccacacat 51337201  T
Q  216 taggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |   |||||||||||||    
T  51337202 taggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacatttcgtggtgtgtttgtt 51337249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Original strand, 8393448 - 8393566
Alignment:
Q  133 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8393448 aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 8393546  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  8393547 ccgaactgggtgaacaatct 8393566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Original strand, 8395657 - 8395775
Alignment:
Q  133 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8395657 aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 8395755  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  8395756 ccgaactgggtgaacaatct 8395775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 226
Target Start/End: Original strand, 21688221 - 21688397
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  21688221 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatcggtgagattgagaaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaattttttgt 21688318  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||| | |||||||||| | | ||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  21688319 aactcatttgtatctcttcggaagaactcattgataatgaattggagagatcaatccctcccctagattaggtcaagtt 21688397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26699577 - 26699466
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||   |    
T  26699577 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctatcc 26699478  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||||    
T  26699477 cagagtaggtca 26699466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13009657 - 13009430
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||    
T  13009657 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgtgaaaat--gggtagaaattaggtttgttc 13009560  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    || |||| |||             ||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||    
T  13009559 ttcgtgagctt-------------tcttgtaaaacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcctccaaatta 13009473  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||||||| | ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  13009472 ggtcaagttag-accgaactgtgtcaacaatctttggcgtgttt 13009430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Original strand, 33989896 - 33989989
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaag-aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33989896 ttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaataactcgttaatagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 33089903 - 33090021
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    |||||| | |||||||| | || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  33089903 aaattatgtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttattataaccattttgtatctctctgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaa 33090002  T
Q  202 tctctcctccagagtaggt 220  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  33090003 tctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22882897 - 22882791
Alignment:
Q  100 taaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  22882897 taaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaat 22882798  T
Q  199 caatctc 205  Q
    |||||||    
T  22882797 caatctc 22882791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22934561 - 22934455
Alignment:
Q  100 taaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagat 198  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  22934561 taaaaattaggtttgttcttggagagtttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaaagaactcattggtagtggattagagaaat 22934462  T
Q  199 caatctc 205  Q
    |||||||    
T  22934461 caatctc 22934455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 163
Target Start/End: Original strand, 41639282 - 41639348
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctc 163  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41639282 gggtagaaattagggttgttctttgtaaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctc 41639348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 55085577 - 55085442
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||          |||| |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  55085577 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgactgtcttgttcattggtgagattg---gaaaataggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 55085481  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgta 169  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  55085480 tgaagctaatttcttgtaaaccatttgtatctctttgta 55085442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 5136081 - 5136237
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  5136081 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 5136178  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  5136179 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 5136237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 5138306 - 5138462
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  5138306 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 5138403  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  5138404 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 5138462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Original strand, 5349929 - 5350052
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| | | |||||||||| |||| |||||||| |||||| || |  |||||    
T  5349929 gggtagaaattaggtttgttctttgtgaacttgtcgaagctaattccttgtagctcgtttgtatctctttgtaaagaactcgttgataatgaagcggaga 5350028  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  5350029 gatc--tctctcc-ccagagtaggtca 5350052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 199
Target Start/End: Original strand, 34112869 - 34112939
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatc 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  34112869 ttgaagctaatttcatgtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtggagagatc 34112939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 48142522 - 48142440
Alignment:
Q  103 aaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgata 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  48142522 aaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacccttgtatatctctttgtaaagaactcattgata 48142440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 6677521 - 6677597
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||    
T  6677521 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatatctttgtaaagaagtctttgataatggatttgagagatcaatctc 6677597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 7124992 - 7125074
Alignment:
Q  169 aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||||||||||    
T  7124992 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatct 7125074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16422755 - 16422653
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||| | ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  16422755 ggtagaaattatgtttgttttttgagagctttttgaagctaatttctagaaacccttttgtatatctttgtaatgaactcatggatagtgaagtggagag 16422656  T
Q  197 atc 199  Q
    |||    
T  16422655 atc 16422653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 53345241 - 53345328
Alignment:
Q  103 aaattagggttg-ttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtgga 188  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||| ||||    
T  53345241 aaattaaggttgattctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaactcattaatattgga 53345328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37755076 - 37754986
Alignment:
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaa-ctcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| || ||| || |||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37755076 tgaagataatttcttgtaacctttttttatctctttctaaaaaactcattgataatggtttgaagagatcaatctctcccccatagtaggt 37754986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21703952 - 21703860
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||| | |||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  21703952 ttgaagatgatttcttgtaccctttttgtatctttttgtaaagaactcattgacagtggattggagatatcaatctatcc-ccatagtaggtca 21703860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 224
Target Start/End: Original strand, 7122773 - 7122829
Alignment:
Q  169 aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 224  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  7122773 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaag 7122829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 182
Target Start/End: Original strand, 32091503 - 32091583
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgat 182  Q
    |||||||| |||||||| | ||  || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  32091503 aaattaggtttgttcttggagagtttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaacacattgat 32091583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 34788923 - 34788851
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa 170  Q
    |||| |||||||| ||| |||| | || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34788923 ggtagaaattaggattgctcttggagagcttgttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaa 34788851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 44570482 - 44570427
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatag 184  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44570482 ttgaaactaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatag 44570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 199
Target Start/End: Original strand, 52065628 - 52065719
Alignment:
Q  110 ggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaa-ctcattgatagtggactggagagatc 199  Q
    |||||||||| | || ||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  52065628 ggttgttcttagagagcttattgaagctatttttctgtaaccccttttgtatctctttgttagaaactcattgatagtgaagtggagagatc 52065719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Original strand, 29056416 - 29056544
Alignment:
Q  136 ctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaa-ctcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccga 234  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| || |||||||||| |||| | |||||| | |||||||  |||| ||||||| | |||| |||||    
T  29056416 ctaatttcttgcaatccttttatatctctttgtaacaacctcattgataatggattagagagacctatctctcacccagtgtaggtccattttg-accga 29056514  T
Q  235 accgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || | || |||| |  ||||||||||||||    
T  29056515 actgtgtaaacacttcttggtgtgtttgtt 29056544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 42498136 - 42498380
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || ||||||||||||||||    
T  42498136 gggttgggaaacgttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagg-tagaaattagggttgttct 42498234  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42498235 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 42498334  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42498335 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 42498380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 17982595 - 17982839
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  17982595 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 17982693  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17982694 ttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 17982793  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17982794 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 17982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 31218199 - 31218443
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || ||||||||||||||||    
T  31218199 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttct 31218297  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31218298 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattagagagttcaatctctcctccagagtag 31218397  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31218398 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 31218443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 44303796 - 44304041
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| |||||||||    
T  44303796 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaagggtagaaattaaggttgttct 44303895  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44303896 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttttaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 44303995  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  44303996 gtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 44304041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34254542 - 34254313
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttctt 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  34254542 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa---gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtc 34254446  T
Q  132 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaac 231  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  34254445 aaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggac 34254346  T
Q  232 cgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34254345 cgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 34254313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19945586 - 19945341
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| |||||||||    
T  19945586 gggtcgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattatggttgttct 19945488  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacc-cttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19945487 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagta 19945388  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19945387 ggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 19945341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1746443 - 1746201
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        || || |||||||||||||||||    
T  1746443 ggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgaaaaaaaaagg-tagaaattagggttgttctt 1746345  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  1746344 tgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccatagtagg 1746246  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1746245 tcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcgttggtgtgtttgtt 1746201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34256725 - 34256489
Alignment:
Q  25 ggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtga 124  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||          |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34256725 ggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg---gaaaaatggtagaaattagggttgttctttgtga 34256629  T
Q  125 acttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 224  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256628 acttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag 34256529  T
Q  225 tttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34256528 tttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 34256489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 15212728 - 15212971
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  15212728 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 15212825  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  15212826 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccagatta 15212925  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212926 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 15212971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 33352092 - 33352335
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||    
T  33352092 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtaaaaattagggttgttc 33352189  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33352190 tttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 33352289  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33352290 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 33352335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 43036365 - 43036608
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  43036365 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 43036462  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  43036463 tttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcctccagatta 43036562  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43036563 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 43036608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12702864 - 12702617
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnn---gggtaaaaattagggttgt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |          ||||| |||||||||||||    
T  12702864 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaaaagggtagaaattagggttgt 12702765  T
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagag 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||     
T  12702764 tctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtgtctctttgtaagaactcattgatattggattggagagatcaatctctcccctagat 12702665  T
Q  216 taggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12702664 taggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt 12702617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 261
Target Start/End: Original strand, 27811221 - 27811460
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  27811221 ggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttct 27811318  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||    
T  27811319 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacccattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattag 27811418  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27811419 gtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 27811460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 4731600 - 4731843
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||| ||    
T  4731600 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgctc 4731697  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |     
T  4731698 tttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattc 4731797  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4731798 ggtcaag-ttggaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 4731843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 30143284 - 30143525
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  |||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  30143284 gggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattg--tgtcttgttcattggccagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 30143379  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |    
T  30143380 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagataa 30143479  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  30143480 ggtcaag-ttgaactgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 30143525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3303896 - 3303653
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||| |       ||||| |||||| | ||||||    
T  3303896 gggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtatcttgtttattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattaagtttgttc 3303799  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||    
T  3303798 tttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagta 3303699  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3303698 ggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt 3303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 40321024 - 40321265
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |       ||||| ||||||||||||||| |    
T  40321024 gttgggaaacattgtaaacaccttgagtgactgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttcat 40321121  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  40321122 tgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctctttgtaaaaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagg 40321221  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40321222 tcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 40321265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42435186 - 42434992
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42435186 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 42435090  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  42435089 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 42434992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Original strand, 18655356 - 18655578
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||       ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  18655356 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgttttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 18655452  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  18655453 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttgga 18655551  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaatctttggtgt 257  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||    
T  18655552 ccgaactgggtgaacattttttggtgt 18655578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1345595 - 1345354
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |       | ||| |||||||||||||||||    
T  1345595 gttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gtgtagaaattagggttgttctt 1345498  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1345497 tgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatatgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtagg 1345398  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1345397 tcaagttag-accgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 1345354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 4283480 - 4283691
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  4283480 ttgtaaacaccttaggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgt 4283576  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |    
T  4283577 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttgga 4283675  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  4283676 ccgaactgggtgaaca 4283691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1292694 - 1292447
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||| ||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||       ||||| |||||| | |    
T  1292694 cttttgggttgggaaacactgtgaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttctttggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaagtt 1292597  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcca 212  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||| |||    
T  1292596 tgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagaaataaatctctcc-cca 1292498  T
Q  213 gagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||  |||| |  ||||||||||||||    
T  1292497 gagtaggtcaag-ttggaccgaactgggcaaacatttcttggtgtgtttgtt 1292447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Original strand, 5689219 - 5689456
Alignment:
Q  25 ggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||         ||||| |||||| ||| || |||||||    
T  5689219 ggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattaatgagattg--gaaaaatgggtagaaattaaggtggtgctttgtg 5689316  T
Q  124 aacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    | ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  5689317 agcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaa 5689416  T
Q  224 gtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    | ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5689417 g-ttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 5689456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Original strand, 40221764 - 40221923
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40221764 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagag 40221863  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgt 257  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  40221864 atcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatctttggtgt 40221923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 6598914 - 6599154
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||| | ||||||    
T  6598914 gggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaagtttgttc 6599011  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||| || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  6599012 tttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatatta 6599111  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6599112 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 6599154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 6674367 - 6674607
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||| | ||||||    
T  6674367 gggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaagtttgttc 6674464  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||| || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  6674465 tttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatacttttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatatta 6674564  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6674565 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 6674607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19491925 - 19491723
Alignment:
Q  18 agggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgtt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||| |||||    
T  19491925 agggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgtt 19491829  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||| |||    
T  19491828 ctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagt 19491729  T
Q  217 aggtca 222  Q
    ||||||    
T  19491728 aggtca 19491723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Original strand, 18141763 - 18141968
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgtt-gtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||    
T  18141763 ggttgggaaacatttgtaaacaccttgggcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaaaat--gggtagaaattagg-ttgttc 18141859  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  18141860 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagatta 18141959  T
Q  218 ggtcaagtt 226  Q
    |||||||||    
T  18141960 ggtcaagtt 18141968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 30291547 - 30291793
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgtt-gtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gt 115  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||| || ||    
T  30291547 gggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgattgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaggttttgt 30291644  T
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctct-cctccaga 214  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30291645 tctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaattctttgatagtggattggagagatcaatctctccctccaga 30291744  T
Q  215 gtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     || | |||| ||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  30291745 ttatgccaag-ttggaccgaactgaatcaacaatctttggtgtgtttgtt 30291793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 2627753 - 2627923
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcct-tgtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2627753 gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgtaagaactcattgatagtggattggag 2627852  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  2627853 agttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtctttgtt 2627923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 264
Target Start/End: Original strand, 9765690 - 9765929
Alignment:
Q  18 agggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgtt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||    
T  9765690 agggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa----ttgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgtt 9765783  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||| ||||| |    
T  9765784 ctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagct-gctctctcccccagatt 9765882  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9765883 aggtc-atattggaccgaactgggtcaacaatcattggtgtgtttgtt 9765929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 257
Target Start/End: Original strand, 11384004 - 11384163
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||     
T  11384004 gggtagaaattagggttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaacccattgatactggattggagac 11384103  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgt 257  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  11384104 atcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaacattttttggtgt 11384163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10930342 - 10930198
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaat 202  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10930342 aaattagggttgctctttgtgagctcgttgaagctaatttcttgtaacccatttatatctctttgtaagaacacattgatagtggattggagagatcaat 10930243  T
Q  203 ctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaat 248  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  10930242 ctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat 10930198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Original strand, 44353762 - 44353923
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttct 144  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44353762 ggtgagtaaaaatcattgagtatcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 44353859  T
Q  145 tgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  44353860 tgtaacacatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaaaagatcaatctctcc 44353923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 220
Target Start/End: Original strand, 40328798 - 40328922
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40328798 gggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 40328897  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40328898 gatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41366837 - 41366601
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    ||||||||||       ||||| |||||| | |||||||||    
T  41366837 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgagaaaat--gggtagaaattatgtttgttcttt 41366740  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    || | ||| || ||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  41366739 gtaagcttgtttaagctaatttcttttaacctatttgtatccctttgtaagaactcatttatagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggt 41366641  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    |||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  41366640 caag-ttggaccgaactgggacaacaatctttggtgtgttt 41366601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 226
Target Start/End: Original strand, 3772161 - 3772340
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttct 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||        | || |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  3772161 ggtgagtgaaaatgattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaatt--gatagaaattaggtttgttctttgtgagcttatttaagctaatttct 3772258  T
Q  145 tgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  3772259 tgtaactcatttgtatatctttgtaagaatttattgatagtggattggagagatcaatctatctctcagagtaggtcaagtt 3772340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Original strand, 4162442 - 4162644
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||   |        ||||| || ||||| ||||||    
T  4162442 gggttggaaaacattgtaaacaccttgagcgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagaggaa-----aatgggtagaagttaggtttgttc 4162536  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  4162537 tttgagaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatag-ggattggagatatcaatctctccccaagagta 4162635  T
Q  218 ggtcaagtt 226  Q
    |||||||||    
T  4162636 ggtcaagtt 4162644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4743429 - 4743197
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| || ||||| ||||||    
T  4743429 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaa-ttaggtttgttc 4743333  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||   || ||||||||||  ||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4743332 tttgtgtgtttgttgaagctaaaatcttgtaacccatttgta----------agaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagta 4743243  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4743242 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 4743197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8965904 - 8965674
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||| ||||||| |||  ||     
T  8965904 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa---ggtagaaattagggtttgttctttatgagtttg 8965808  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||     
T  8965807 ttgaagttaatttcttataacccttttatatctctttgtaagaactcattgatagtgcatcggagagataaatctctcccccatattaggtcaag-ttgg 8965709  T
Q  230 accgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| |||| |||| |  | ||||||||||||    
T  8965708 accgaactgggtaaacatttatcggtgtgtttgtt 8965674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Original strand, 25689974 - 25690126
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25689974 ggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggaga 25690071  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25690072 gtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25690126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18106304 - 18106101
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||         || || ||| ||  |||||||    
T  18106304 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattgttgagtgtcttgttcatcggtgagattg--gaaaaatggatagaaactatagttgttc 18106207  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18106206 tttgcgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatct-tttgtaagaactcattgatagt-gtttggagagatcaatctctcc-ccagaata 18106110  T
Q  218 ggtcaagtt 226  Q
    |||||||||    
T  18106109 ggtcaagtt 18106101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Original strand, 3439558 - 3439675
Alignment:
Q  133 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaac 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3439558 aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggac 3439656  T
Q  232 cgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  3439657 cgaactggatgaacaatct 3439675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 264
Target Start/End: Original strand, 4733784 - 4733891
Alignment:
Q  156 tgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggt 255  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4733784 tgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacagtctttggt 4733882  T
Q  256 gtgtttgtt 264  Q
    |||||||||    
T  4733883 gtgtttgtt 4733891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 8153810 - 8153906
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  8153810 ttgaagctaaattcgtgtaactcttttgtatatctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttcctcagagtaggtcaagtt 8153906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Original strand, 7597648 - 7597759
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    |||||||| | || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7597648 ttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttataatccttttgtatctctttgtaaagaatgcattgatagtggattggagagatcaatctctcccc 7597747  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
    || |||||||||    
T  7597748 catagtaggtca 7597759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 226
Target Start/End: Original strand, 10015119 - 10015227
Alignment:
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagag 215  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  10015119 tctttgtgtgcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-taggaactcattgatagtggattggagagataaatctct-ctccatag 10015216  T
Q  216 taggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||    
T  10015217 taggtcaagtt 10015227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3073981 - 3073894
Alignment:
Q  138 aatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3073981 aatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaagaactcattgataatggcttggagagatcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 3073894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11712135 - 11712024
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaag-aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||      
T  11712135 ttgttccttgagagcttgttgaagctaatttcttgaaacccttttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattgaagagatcaatctctccct 11712036  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
    || |||||||||    
T  11712035 caaagtaggtca 11712024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Original strand, 1822326 - 1822423
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  1822326 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttgtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1822423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 208
Target Start/End: Original strand, 1856771 - 1856868
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  1856771 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctatttgtaaataactcactaatagtgaattggagagatcaatctctcc 1856868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42575476 - 42575320
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattaggg-ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  42575476 gggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 42575379  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  42575378 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 42575320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32902290 - 32902197
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32902290 ttgaagctaatttcttgtaacttttttgtatctctttctaaagaattcattgatagtgaatttgagagatcaatctctccccctgagtaggtca 32902197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 242
Target Start/End: Original strand, 15290540 - 15290688
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  15290540 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 15290637  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtg 242  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15290638 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15290688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 242
Target Start/End: Original strand, 15470909 - 15471057
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  15470909 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 15471006  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtg 242  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15471007 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 15471057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 187
Target Start/End: Original strand, 10240188 - 10240264
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtgg 187  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10240188 ttgttctttgtgagcttgttgaatctaatttcttgtaaccatgttggatctctttgtaaagaactcattgatagtgg 10240264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41365078 - 41364932
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    |||||||| |        |||| |||||||| |    
T  41365078 cttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcaagactgagattgggaaaatt--ggtagaaattaggtt 41364981  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatc 161  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41364980 tgttctttgtgagtttgtttaagctaatttcttgtaacacatttgtatc 41364932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 10929742 - 10929907
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |        ||||| |||||| | ||||||    
T  10929742 gggttgggaa-cattgtaaacaccttggattagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagat--atggaaaatgggtagaaattatgtttgttc 10929838  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10929839 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttt-----------gtaagaactcattgatagtggattggagaga 10929907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29796456 - 29796344
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaa--ctcattgatagtggactggagagatcaatctctcct 209  Q
    |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||  |||||| ||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||     
T  29796456 ttgttcttggagaacttgttgaagctgatttcttgtaacatttttgtacctatttgtaaaaaaactcatttataatggattggagagatcaatctctccc 29796357  T
Q  210 ccagagtaggtca 222  Q
    |||  ||||||||    
T  29796356 ccaatgtaggtca 29796344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3231930 - 3231859
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgat 182  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  3231930 ttgttcttcgtgagcttgttgaagctaattttttttaaccattttgtatctctttgtaaagaacttattgat 3231859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 11137070 - 11137146
Alignment:
Q  123 gaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaa----ctcattgatagtggactggaga 195  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||    ||||||||||||| | ||||||    
T  11137070 gaacttgttgaagctaatttcttataaccgttttgtatctctttgtaaaaaaaaactcattgatagtgaattggaga 11137146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Original strand, 38863949 - 38864000
Alignment:
Q  169 aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  38863949 aagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctcccctgcatagtaggt 38864000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5406424 - 5406182
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  5406424 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat---ggtagaaattagggttgttct 5406328  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5406327 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 5406228  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5406227 gtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5406182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5410749 - 5410507
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  5410749 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat---ggtagaaattagggttgttct 5410653  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5410652 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 5410553  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5410552 gtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5410507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5413618 - 5413377
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  5413618 gggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa---ggtagaaattagggttgttct 5413522  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    ||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413521 ttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 5413422  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5413421 gtcaagtttggaccgaa-ctggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5413377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16452555 - 16452311
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  16452555 gggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 16452457  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16452456 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttcatatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 16452357  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16452356 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 16452311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30834762 - 30834518
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  30834762 gggttgagaaacattgtaaacacctcggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 30834664  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30834663 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 30834564  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  30834563 gtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctttggtgtgtttgtt 30834518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31404899 - 31404657
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  31404899 gggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgagattgggaaaat---ggtagaaattagggttgttct 31404803  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31404802 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 31404703  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31404702 gccaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 31404657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9183257 - 9183015
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  9183257 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 9183160  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9183159 tttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagatta 9183060  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgt 263  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9183059 tgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 9183015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2171756 - 2171513
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  2171756 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaat--ggtagaaattagggttgttct 2171659  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2171658 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttt-gtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 2171560  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2171559 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 2171513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33160579 - 33160334
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaatt-attgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || ||||||| |||||||    
T  33160579 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaaaaagg-tagaaattagagttgttc 33160481  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33160480 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagta 33160381  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
      ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33160380 tttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 33160334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28137634 - 28137428
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |       ||||| |||||||||||||||    
T  28137634 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagaatgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 28137537  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28137536 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagta 28137437  T
Q  218 ggtcaagtt 226  Q
    |||||||||    
T  28137436 ggtcaagtt 28137428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 21593620 - 21593831
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21593620 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 21593716  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21593717 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 21593815  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  21593816 ccgaactgggtgaaca 21593831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Original strand, 21588916 - 21589098
Alignment:
Q  61 tgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21588916 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat 21589013  T
Q  161 ctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  21589014 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 21589098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Original strand, 17757995 - 17758191
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17757995 gagtgaaaattcatgagtgtcttcttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 17758092  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17758093 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17758191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Original strand, 17762962 - 17763158
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17762962 gagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 17763059  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||    
T  17763060 aactcatttgtatctttttggaagaactcattgatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtgaaca 17763158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26954510 - 26954277
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  26954510 ggttgggaaacattgtaaacacctttggggagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatatgtgagattgggaaatt---ggtataaattagggttgttct 26954414  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26954413 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtag 26954314  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtg 256  Q
    |||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26954313 gtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtg 26954277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3808857 - 3808704
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3808857 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 3808758  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||    
T  3808757 atcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatct 3808704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2973088 - 2972959
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2973088 gggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 2972989  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2972988 atcaatctctcctcaagagtaggtcaagtt 2972959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26830272 - 26830124
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26830272 gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 26830173  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  26830172 atcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttg-actgaactgggtgaaca 26830124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33211411 - 33211168
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |        |||| |||||| ||||||||    
T  33211411 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtcactgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattgggaaaatt--ggtagaaattatggttgttc 33211314  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| |||  ||||| |||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33211313 tttgtgagcttgatgaagttaatttcttgtagctcatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattggagagatcaatctctcccccagagta 33211214  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33211213 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtatgtttgtt 33211168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3039129 - 3038926
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||||||||    
T  3039129 gggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt--ggtagaaattagggttgttc 3039032  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  3039031 attgtgagctttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttaatagtggattggagagattaatctctcccccagatta 3038932  T
Q  218 ggtcaa 223  Q
    ||||||    
T  3038931 ggtcaa 3038926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5409167 - 5409052
Alignment:
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  5409167 aacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa-ctggtgaacaa 5409069  T
Q  248 tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||    
T  5409068 tctttggtgtgtttgtt 5409052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3072909 - 3072740
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3072909 ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggaga 3072810  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3072809 gttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 3072740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 5043583 - 5043795
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||       | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  5043583 ttgtaaacaccttgtgagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattcgtgagattgagaaaat--gagtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgt 5043679  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |    
T  5043680 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttgga 5043779  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  5043780 ccgaactgggtgaaca 5043795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 412120 - 412290
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  412120 ggtagaaattagggttgttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattagaga 412219  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  412220 gttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 412290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 603237 - 603085
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  603237 gggtagaaatttgtgttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagaa 603138  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  603137 atcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 603085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22425023 - 22424850
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  22425023 gagtgaaaattcatgagtgtcttgttcgttggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgt 22424926  T
Q  148 aaccc--ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22424925 aacccatttttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtca 22424850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6097589 - 6097431
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||          ||||||||||||||||||| |||||||     
T  6097589 ggtagaaattaggattgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgta----------agaactcattgatagtggattggagagt 6097500  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6097499 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 6097431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 16653130 - 16653300
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16653130 gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 16653227  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16653228 gagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16653300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Original strand, 16569109 - 16569207
Alignment:
Q  165 ttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16569109 ttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 16569207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 27647879 - 27648032
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27647879 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 27647976  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27647977 agtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 27648032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 16554887 - 16555057
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16554887 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 16554984  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16554985 gagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16555057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16578668 - 16578498
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16578668 gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 16578571  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16578570 gagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16578498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 16616712 - 16616882
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| | || |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16616712 gggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 16616809  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16616810 gagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16616882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 16631443 - 16631613
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16631443 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 16631540  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16631541 gagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtatttgtt 16631613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 222
Target Start/End: Original strand, 26800630 - 26800731
Alignment:
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26800630 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactaattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg 26800728  T
Q  220 tca 222  Q
    |||    
T  26800729 tca 26800731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 25421323 - 25421478
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  25421323 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 25421420  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25421421 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25421478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Original strand, 4045392 - 4045566
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttc 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||| |        |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  4045392 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttattggagagattgggaaaat---ggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttc 4045488  T
Q  144 ttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||||| | |||| |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  4045489 ttgtaatcattttatatctctttgtaaataactcattgatagtggattggagagatcaatttctaccccaaagtaggt 4045566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 6027264 - 6027419
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  6027264 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 6027361  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6027362 agagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6027419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 13153931 - 13154087
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  13153931 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 13154028  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  13154029 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 13154087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33342257 - 33342101
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  33342257 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgta-ctccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 33342160  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  33342159 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 33342101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 34164874 - 34165030
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  34164874 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 34164971  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  34164972 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 34165030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 250
Target Start/End: Original strand, 34167180 - 34167252
Alignment:
Q  178 ttgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34167180 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34167252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 207
Target Start/End: Original strand, 25073588 - 25073698
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||||  || ||||| |||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||     
T  25073588 ggtagaaattagatttattcttcgtgagcttgttaaagctattttattgtaacccttttgtatctctatgtaaagaactcattgatagtggattagagaa 25073687  T
Q  197 atcaatctctc 207  Q
    |||||||||||    
T  25073688 atcaatctctc 25073698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6097657 - 6097610
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgt 67  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6097657 ggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgt 6097610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Original strand, 9572681 - 9572735
Alignment:
Q  168 taagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  9572681 taagaacccattgatagtggattgcagagatcaatctctactttagagtaggtca 9572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 2908510 - 2908586
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctc 205  Q
    |||||| |||||| ||  ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  2908510 ttgaagataattttttacaactcttttgtatcttattgtaaagaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctc 2908586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 16567148 - 16567200
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtctt 70  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16567148 gggtttggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 16567200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 25412704 - 25412946
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  25412704 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa---gggtagaaattagggttgttct 25412800  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25412801 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 25412900  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25412901 gtcaagtttggactgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 25412946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 13239694 - 13239937
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||          |||| ||||||||||| ||||    
T  13239694 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaaatggtagaaattagggtttttct 13239791  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13239792 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 13239891  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13239892 gtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatttttggtgtgtttgtt 13239937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 13343003 - 13343246
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  13343003 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 13343101  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13343102 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 13343200  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13343201 gtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtt 13343246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 30182531 - 30182774
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  30182531 gggttgggaaacattgcaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaat--ggtagaaattagggttgttct 30182628  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  30182629 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtat 30182728  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30182729 gtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgtttgtt 30182774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 37439076 - 37439327
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnng------ggtaaaaattagggt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |              |||| ||||||||||    
T  37439076 gggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaggaaaaataaaaggtagaaattagggt 37439175  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcca 212  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37439176 tgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctcca 37439275  T
Q  213 gagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37439276 gagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 37439327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36074270 - 36074025
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnn-gggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        ||||| |||||||||||||||    
T  36074270 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaaaagggtagaaattagggttgttc 36074171  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||| |||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36074170 tttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagta 36074072  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36074071 ggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctttggtgtgtttgtt 36074025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42426458 - 42426218
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||    
T  42426458 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttcttt 42426361  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||    
T  42426360 gtgaaattgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccctgattaggt 42426261  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||| ||| || ||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  42426260 caag-ttggactgaactaggtcaacaatcttttgtgtgtttgtt 42426218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 13488145 - 13488388
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  13488145 gggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtaagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 13488242  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  13488243 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccgagatta 13488342  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||    
T  13488343 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatcttttgtgtctttgtt 13488388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 42428656 - 42428413
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| |||| |||    
T  42428656 gggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattatggtttttc 42428559  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  42428558 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatatta 42428459  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  42428458 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgtt 42428413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Original strand, 32636773 - 32637009
Alignment:
Q  26 gaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtga 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32636773 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattatggttgttctttgtga 32636870  T
Q  125 acttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 224  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32636871 acttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag 32636970  T
Q  225 tttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32636971 -ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 32637009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39468775 - 39468532
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  39468775 gggttgggaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 39468678  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| | ||    
T  39468677 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccccatatta 39468578  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||  ||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  39468577 ggttaa-attggactgaactgggtcaacaatctttagtgtgtttgtt 39468532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 262
Target Start/End: Original strand, 533711 - 533952
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||| ||    
T  533711 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttggtc 533808  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  533809 tttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcccccatatta 533908  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttg 262  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  533909 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtctttg 533952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 213421 - 213633
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  213421 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 213517  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  213518 taaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttgga 213617  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  213618 ccgaactgggtgaaca 213633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28750881 - 28750638
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  28750881 gggttgggaaacattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 28750784  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28750783 tttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 28750684  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||||    
T  28750683 ggtcaag-ttggaccgaattgggtcaataatctttggtgtgtttgtt 28750638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30683146 - 30682906
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||   ||    
T  30683146 gggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaaa--gggtagaaattagggtt---ct 30683052  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaaga--actcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  30683051 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaagaatactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatt 30682952  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30682951 aggtcaag-ttggaccgaa-ctggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 30682906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 48 - 261
Target Start/End: Original strand, 28278289 - 28278498
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28278289 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 28278385  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa 247  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  28278386 aacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaa 28278484  T
Q  248 tctttggtgtgttt 261  Q
    |  |||||||||||    
T  28278485 ttcttggtgtgttt 28278498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 16409425 - 16409663
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||         ||||| ||||||||||||||||    
T  16409425 gggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattg---gaaaaagggtagaaattagggttgttct 16409514  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16409515 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 16409614  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  16409615 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 16409663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 26177833 - 26178070
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||         ||||| ||||||||||||||||    
T  26177833 gggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattg----gaaaagggtagaaattagggttgttct 26177921  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26177922 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 26178021  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26178022 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 26178070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 33831622 - 33831865
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||         ||||| |||||||| ||||||    
T  33831622 gggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcatttgtgagattg--gaaaaatgggtagaaattaggtttgttc 33831719  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| | ||    
T  33831720 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccccatatta 33831819  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33831820 ggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtttttgtt 33831865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Original strand, 40147246 - 40147428
Alignment:
Q  61 tgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 160  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  40147246 tgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 40147343  T
Q  161 ctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  40147344 ctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 40147428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 261
Target Start/End: Original strand, 537970 - 538207
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||| ||||| |||||    
T  537970 ttgggaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattagtgagattgggaaaat--gggtagaaattaaggttgctcttt 538067  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  538068 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatattaggt 538167  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    |||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  538168 caag-ttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgttt 538207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 16452023 - 16452265
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||         ||||| |||||| | |||||||    
T  16452023 gggttcggaaacattgtaaacaccttggtaagtgacaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattg--gaaaaatgggtagaaattaagtttgttct 16452120  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16452121 ttctgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagataaatctctcccccagagtag 16452220  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||    
T  16452221 gtcaag-ttggaccgaactgggtaaacatttcttggtgtgtttgtt 16452265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8566172 - 8565930
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||       ||||| || ||||| ||||||    
T  8566172 gggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaat--gggtagaacttaggtttgttc 8566075  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8566074 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctctgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcacccagatta 8565975  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8565974 ggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatc-ttggtgtgtttgtt 8565930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9789442 - 9789204
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||         ||||| |||||| ||||||||     
T  9789442 gggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc-------ttggtgagattg---gaaaaagggtagaaattaaggttgttcc 9789353  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctc-cttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9789352 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 9789253  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  9789252 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 9789204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18441866 - 18441628
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||         ||||| |||||||||||||||     
T  18441866 gggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtc-------ttggtgagattg---gaaaaagggtagaaattagggttgttcc 18441777  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctc-cttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18441776 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctctagagta 18441677  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  18441676 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 18441628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 5058003 - 5058212
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||  |||| ||| |    
T  5058003 ttgtaaacaccttggaagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttct--gtgagcttgt 5058097  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  5058098 tgaagctattttcttgtatcccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttgga 5058196  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  5058197 ccgaactgggtgaaca 5058212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 31182915 - 31183156
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||         ||||| |||||||| ||||||    
T  31182915 gggttgggaaacattgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattg---gaaaatgggtagaaattaggattgttc 31183011  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||  || || ||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  31183012 tttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccattt-gtatccctttgtaagaactcattgatactggattggagagatctatctctcccccatatta 31183110  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  31183111 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacattctttggtgtgtttgtt 31183156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27637809 - 27637615
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||    
T  27637809 gagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttctttatgagcttgtttaaactaatttcttgt 27637712  T
Q  148 aaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaa 244  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||| ||||||| |||||||    
T  27637711 aacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaa 27637615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3075884 - 3075641
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||        |||| |||||||| ||||||    
T  3075884 gggttgggaaacattgtaaacacctttgatgagtgaaaatcattgagtgtctcgttcatttgtgagattgagaaaata--ggtagaaattaggtttgttc 3075787  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||    
T  3075786 tttgtgagcttgctgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaattcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccctcatagta 3075687  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  3075686 ggtcaag-ttggaccaaattgggtgaacatttcttggtgtgtttgtt 3075641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 42310160 - 42309952
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||       ||||| |||| | | ||| |||    
T  42310160 ggttggaaaacattgtaaacattttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgctcattggtgagattgagaaatt--gggtagaaatcaagtttgatct 42310063  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  42310062 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattagcgagatcaatctctcccccatagtag 42309963  T
Q  219 gtcaagtttga 229  Q
     | ||||||||    
T  42309962 attaagtttga 42309952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 26170724 - 26170950
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||         ||||| |||||||| |||||||    
T  26170724 gggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattg----gaaaagggtagaaattaggattgttct 26170812  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||          |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26170813 ttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgt----------aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 26170902  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa--tctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  26170903 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtctttgtt 26170950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 38747024 - 38747153
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||    
T  38747024 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttggaaaaactcattgatagaggattggagag 38747123  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  38747124 atcaatctctccctcagatcaggtcaagtt 38747153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16641153 - 16640961
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||        |||| ||||||| ||| ||||||||||| |||     
T  16641153 ttgtaaacaccttgagtgagtgaaattcattaagtgtcttgttcattggcgagattgagaaaaaaatggtagaaattagtgtttgttctttgtgagcttg 16641054  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 225  Q
    |||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16641053 ttgaagctgatttctgataactcttttgtatctctttgtaagaact---tgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29751310 - 29751156
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29751310 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 29751212  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29751211 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29751156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 29720382 - 29720551
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29720382 gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 29720480  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29720481 agtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29720551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 29722542 - 29722711
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29722542 gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 29722640  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  29722641 agtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 29722711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 98 - 260
Target Start/End: Original strand, 27015551 - 27015704
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  27015551 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaat--------acccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgtacaga 27015642  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtt 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  27015643 tcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacattttttggtgtgtt 27015704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13695904 - 13695713
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||| |       ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  13695904 ttgtaaacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtatctttttctttggagagattgggaaaa---gggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttg 13695808  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  13695807 ttaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 10593276 - 10593445
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10593276 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 10593373  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10593374 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 10593445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22536439 - 22536286
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  22536439 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgggg 22536342  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22536341 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 22536286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9049470 - 9049325
Alignment:
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  9049470 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagagatcaatatctcccccaaagta 9049371  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||| ||| ||||||  || | |||| | |||||||||||||||    
T  9049370 ggtgaag-ttggaccgaaatggataaacattttttggtgtgtttgtt 9049325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Original strand, 316782 - 316907
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||| |    
T  316782 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggatcggaggg 316881  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  316882 atcaatctctcccctagagtaggtca 316907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 25078138 - 25078293
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  25078138 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 25078235  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25078236 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25078293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 25136107 - 25136262
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  25136107 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 25136204  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25136205 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 25136262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Original strand, 40382355 - 40382474
Alignment:
Q  133 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  40382355 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 40382453  T
Q  230 accgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  40382454 accgaactgggtgaacaatct 40382474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 5887642 - 5887487
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||       || || |||||||  ||||||    
T  5887642 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgag--aaaatggatagaaattagatttgttc 5887545  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaact 175  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  5887544 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgcaacccatttgtatcactttgtaagaact 5887487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 169 - 264
Target Start/End: Original strand, 19806454 - 19806548
Alignment:
Q  169 aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  19806454 aagaactccttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggggtgtttgtt 19806548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 40380181 - 40380263
Alignment:
Q  169 aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40380181 aagaactcatttgatagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 40380263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 16546647 - 16546803
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  16546647 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 16546745  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  16546746 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 16546803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33906145 - 33906028
Alignment:
Q  132 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | | ||||||||||||  ||| |    
T  33906145 gaagctaacttcttgtaatccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtagattggaaagatcaatctcttccctagagtaggtcaatgttgga 33906046  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaat 248  Q
    |||| | |||| ||||||    
T  33906045 ccgagctgggtaaacaat 33906028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 16544499 - 16544581
Alignment:
Q  169 aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  16544499 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 16544581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10054932 - 10054854
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||    
T  10054932 ttgaagctaatttcttataacc-ttttgtatctctttgtaatgaactcattgatagtgtattggagatatcaatatctcc 10054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 19806326 - 19806449
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| |||||| ||||||||    
T  19806326 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaa-tcattgagtgtcttgttcattggtgagatt--ggaaaaatgggtagaaatta-ggttgttc 19806421  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttctt 145  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||    
T  19806422 tttgtgagtttgttgaagctaatttctt 19806449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 207
Target Start/End: Original strand, 3325965 - 3326043
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctc 207  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  3325965 ttgaagctaatttcttgtaaccattgtgtatctctttgtaaagaactcaatgatggtggattagagagatcaatatctc 3326043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 87
Target Start/End: Original strand, 42926838 - 42926904
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42926838 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgagattg 42926904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 264
Target Start/End: Original strand, 42926967 - 42927076
Alignment:
Q  154 tttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttg 253  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||||||||   || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |  |||    
T  42926967 tttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattgaagaaataaatctctctctcatagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacatttcttg 42927065  T
Q  254 gtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||    
T  42927066 gtgtgtttgtt 42927076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 222
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160743
Alignment:
Q  181 atagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 4160743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 179
Target Start/End: Original strand, 42926919 - 42926968
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcatt 179  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  42926919 ttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 42926968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 183
Target Start/End: Original strand, 30802854 - 30802934
Alignment:
Q  104 aattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgata 183  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  30802854 aattaggtttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaatccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 30802934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Original strand, 35616194 - 35616278
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    |||||||| |||||||| | || ||  || ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  35616194 aaattaggtttgttcttggagagctcgtttaagttaatttcttgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagtg 35616278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Original strand, 8445767 - 8445846
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||| ||||||||| || | || |||| |||||||||    
T  8445767 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttctttataaagaactaattgatagtagattagaaagatgaatctctcc 8445846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10700796 - 10700674
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| ||  || |||||||||||||||| | |||||||    
T  10700796 ggtagaaattaggtttgttcttagagagcttgttgaagctaatt-cttataacatttttgtatctctttaaaaagaactcattgatagtgaagtggagag 10700698  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||  ||||||| ||| |||||||||    
T  10700697 atc--tctctcccccatagtaggtca 10700674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Original strand, 22097883 - 22097973
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtgga 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  22097883 gggtagaaattagggttgttcttggagaatttgttgaagttaatttcttataaccc--ttgtatctatttgtaaaaaactcattgatagtgga 22097973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 264
Target Start/End: Original strand, 30793195 - 30793321
Alignment:
Q  137 taatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaa 235  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||  ||||||| | |||||| ||||   ||| ||||||    
T  30793195 taatttattgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactaattgatagtgaagtggagagatc--tctctcccctagagtaagtcattgttggaccgaa 30793292  T
Q  236 ccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |  ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  30793293 caaggtaaacatttcttggtgtgtttgtt 30793321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5887486 - 5887417
Alignment:
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  5887486 gagatctatctctcccccagattaggtcaagttgga-ccgaattggatcaacaatctttggtgtgtttgtt 5887417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 7762208 - 7762451
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||    
T  7762208 gggttgggaaatattgtgaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattgagaaaaa--gggtagaaattagggttgttct 7762305  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7762306 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 7762405  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  7762406 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctatgatgtgtttgtt 7762451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 37408401 - 37408644
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  37408401 gggttgggaaacattgtaaacaccttagtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattagggttgttct 37408498  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37408499 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtag 37408598  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37408599 gtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 37408644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5258370 - 5258126
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  5258370 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 5258272  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5258271 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccagagtag 5258172  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5258171 gtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5258126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 45095107 - 45095349
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  45095107 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat---ggtagaaattagggttgttct 45095203  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45095204 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtag 45095303  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  45095304 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggcgtatttgtt 45095349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19684115 - 19683871
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  19684115 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 19684018  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19684017 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagta 19683918  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19683917 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 19683871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5260549 - 5260305
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  5260549 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 5260451  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  5260450 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtag 5260351  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5260350 gtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5260305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 7764410 - 7764650
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||        ||||| ||||||||||||||||    
T  7764410 gggttaggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagaggga-----aaagggtagaaattagggttgttct 7764504  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7764505 ttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatgaatctctcctccagagtag 7764604  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7764605 gtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 7764650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9636352 - 9636107
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  9636352 gggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgagattg-ggagaaaagggtagaaattagggttgttct 9636254  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9636253 ttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtag 9636154  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9636153 gtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtt 9636107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23200362 - 23200120
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |        |||| ||||||| ||||||||    
T  23200362 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaat--ggtagaaattagagttgttct 23200266  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23200265 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtag 23200166  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23200165 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 23200120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23198163 - 23197921
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |        |||| ||||||| |||||| |    
T  23198163 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattgggaaaaat--ggtagaaattagagttgtttt 23198067  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23198066 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtag 23197967  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  23197966 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 23197921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 9581225 - 9581468
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||  |       ||||| |||||||| ||||||    
T  9581225 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgggattcggaaat---gggtagaaattaggtttgttc 9581321  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9581322 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagta 9581421  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9581422 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtt 9581468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5236682 - 5236440
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  5236682 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 5236585  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  5236584 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgataatggattcgagagatcaatctttcc-ccagatta 5236486  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5236485 ggtcaa-tttggaccaaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 5236440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 29810805 - 29811053
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |       |  || ||||||| ||    
T  29810805 cttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgaatgtcttattcattggtgagattaggaaaatatg--tagaaattagagt 29810902  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcca 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  29810903 tgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 29811002  T
Q  213 gagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29811003 gattaggtcaag-ttaaaccgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 29811053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 34491231 - 34491397
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34491231 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 34491330  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34491331 atcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 34491397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 40734440 - 40734683
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  40734440 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 40734537  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  40734538 tttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaatta 40734637  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  40734638 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggagtgtttgtt 40734683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 40735325 - 40735568
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtga-gtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  40735325 gggttaggaaacattgtaaacaccttggaaaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 40735422  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  40735423 tttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 40735522  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  40735523 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatctttggtgtatttgtt 40735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 51398756 - 51398999
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  51398756 gggttgggaaatattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgatgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttc 51398853  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  51398854 ttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctcccccagatta 51398953  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51398954 ggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 51398999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 31314387 - 31314630
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  31314387 gggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcataggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 31314484  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||    
T  31314485 attgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatatta 31314584  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  31314585 ggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 31314630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Original strand, 44331487 - 44331717
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| |||||||||||||||    
T  44331487 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 44331584  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44331585 attgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 44331684  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctt 251  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  44331685 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctt 44331717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 29196614 - 29196369
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgtt-gtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gt 115  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||| ||    
T  29196614 gggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggtttgt 29196517  T
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagag 215  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |     
T  29196516 tctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaat 29196417  T
Q  216 taggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29196416 taggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 29196369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 760789 - 761032
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| ||||||||  |||||    
T  760789 gggttgggaaacattataaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtctgttc 760886  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  760887 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 760986  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  760987 ggtcaag-ttggactgaaatgggttaacaatctttggtgtgtttgtt 761032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 4569907 - 4570120
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  4569907 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttctttggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttcattgtgagcttat 4570004  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  4570005 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttgga 4570104  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||| ||||    
T  4570105 ccgaactgggtcaaca 4570120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6095811 - 6095619
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       | ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6095811 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaat--gagtagaaattagggttgttctttgtaaacttct 6095715  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6095714 tgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 6095619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 44700705 - 44700462
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgtt-gtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgtt 116  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||    
T  44700705 gggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgtt 44700608  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |    
T  44700607 ctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccacatt 44700509  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  44700508 aggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttcgtgtgtttgtt 44700462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43402026 - 43401797
Alignment:
Q  21 gttgggaaacg-ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  43402026 gttgggaaacgattgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttct 43401930  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  43401929 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaattaatctctcctccagagta 43401830  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  43401829 ggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 43401797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 29682301 - 29682544
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||| |       ||||| |||||| | ||||||    
T  29682301 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgtttatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattatgtttgttc 29682398  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  29682399 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagatta 29682498  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    | ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29682499 gatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtatgtt 29682544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Original strand, 16498973 - 16499214
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttggtg-agtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       || || |||||||||||||| |    
T  16498973 ggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaac--ggatagaaattagggttgtt-t 16499069  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16499070 ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtag 16499169  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16499170 gttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt 16499214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22835226 - 22834989
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||||    
T  22835226 gttgggaaacattgtaatcaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgttctt 22835129  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  22835128 tgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccgccatattagg 22835029  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||| ||| |||||| | ||| |||||| ||||||||||||    
T  22835028 tcaag-ttggaccgaa-ctggtcaacaatatttggtgtgttt 22834989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 29813083 - 29813248
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29813083 ggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagaga 29813182  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| | ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29813183 tcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 29813248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Original strand, 46860428 - 46860618
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaatt-attgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||| ||||||||||||| |||     
T  46860428 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaattcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttg 46860525  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46860526 ttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtca 46860618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 49199619 - 49199465
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49199619 gggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 49199520  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  49199519 gattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 49199465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Original strand, 54593729 - 54593852
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54593729 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaat 54593828  T
Q  203 ctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  54593829 ctctcctccagagtatgtcaagtt 54593852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 30236144 - 30236273
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30236144 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 30236243  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30236244 atcaatctctcccccagattaggtcaagtt 30236273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Original strand, 46173377 - 46173505
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46173377 ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagaga 46173476  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  46173477 tcaatctctcccccagattaggtcaagtt 46173505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 801109 - 801279
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  801109 gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggag 801208  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  801209 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 801279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7780153 - 7779985
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7780153 gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggaga 7780055  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7780054 gttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 7779985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39153587 - 39153347
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||    
T  39153587 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaatcattgagtgtcttgttcatgtgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgttc 39153490  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
     |||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  39153489 attgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttataagaactcattgatagtggattggagagaacaatctctcccccagatta 39153390  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||||| ||| || |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  39153389 ggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatctttgttgtgttt 39153347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43403940 - 43403740
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  43403940 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctcatttcttgt 43403844  T
Q  148 aaccctt-ttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||| | | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  43403843 aactcatgttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaaca 43403744  T
Q  247 atct 250  Q
    ||||    
T  43403743 atct 43403740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23392135 - 23391892
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |       | ||| |||||| | ||||||    
T  23392135 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgtctttttcattggtgagtttgggaaaat--gagtagaaattaagtttgttc 23392038  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| | ||    
T  23392037 tttgtgagcttgtttaagataatttcttgtaacccatttgtatcactttgcaagaactctttgatagtggattgtagagataaatctctcccccaaatta 23391938  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23391937 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23391892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 53921729 - 53921520
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||| |||||     
T  53921729 gggttggaaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattaggtttgttg 53921632  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  53921631 tttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagta 53921532  T
Q  218 ggtcaagtttga 229  Q
    | ||||||||||    
T  53921531 gatcaagtttga 53921520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41819736 - 41819547
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |    
T  41819736 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgt 41819639  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41819638 ctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtca 41819547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 47304224 - 47304420
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||       ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||    
T  47304224 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaat--gggtagaaattatggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatatcttgt 47304320  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa 247  Q
    ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  47304321 aacccatctgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagtttg-accgaactgggtcaacaa 47304419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 222
Target Start/End: Original strand, 32891049 - 32891248
Alignment:
Q  23 tgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttcttt 120  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||       ||||| |||||| | || |||||||    
T  32891049 tgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgagtgtcttgttcttcggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaagttttgttcttt 32891146  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  32891147 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagataaatctctcccccggagtaggt 32891246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 9666680 - 9666449
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||         ||||| |||||||  || ||||||||||| |||     
T  9666680 ttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagattttgttctttgtgagcttg 9666583  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||| |||     
T  9666582 ttgaagctaatttcttgtaactcatttatacctctttgtaagaattctttgatagtggattggagagattgatctctcccccagattaggtaaag-ttgg 9666484  T
Q  230 accgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9666483 accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 9666449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 112 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32744570 - 32744419
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcc 211  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||    
T  32744570 ttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatagtggattgaagagataaatctatccccc 32744471  T
Q  212 agagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32744470 agattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 32744419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23410555 - 23410312
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||  |       ||||| |||||| | || |||    
T  23410555 gggttggaaaacattgtaaacaccttgagtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattagtgaaatttggaaaat--gggtagaaattatgtttattc 23410458  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||| | |||||| |||||||| | |||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||    
T  23410457 tttgtgagcttgtttaagctaatttcgtataacccatttgtatcactttgtaagaactcttagataatggattggagagataaatctctcccccaaatta 23410358  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23410357 ggtcaagttggaa-cgaattgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 23410312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 6716518 - 6716671
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6716518 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 6716615  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6716616 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6716671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 54635143 - 54635296
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  54635143 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 54635240  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54635241 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 54635296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5434090 - 5433906
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattaggg-ttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  5434090 ttgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgt 5433992  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||         ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5433991 taaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaac-------cggtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtca 5433906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 250
Target Start/End: Original strand, 40913352 - 40913464
Alignment:
Q  137 taatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaac 236  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  40913352 taatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatcgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaac 40913450  T
Q  237 cgggtgaacaatct 250  Q
     |||| ||||||||    
T  40913451 tgggtcaacaatct 40913464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 213
Target Start/End: Original strand, 36018877 - 36018987
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaac-ccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  36018877 aaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaactcattttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagaggtcaa 36018975  T
Q  202 tctctcctccag 213  Q
    ||||||| ||||    
T  36018976 tctctcccccag 36018987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55302079 - 55301996
Alignment:
Q  139 atttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55302079 atttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaattcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtca 55301996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 45283001 - 45283158
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt----gtaagaactcatt-gatagtggact 190  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||    ||||||||||||| ||||||||| |    
T  45283001 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtggatt 45283098  T
Q  191 ggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  45283099 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 45283158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 3617467 - 3617622
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  3617467 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 3617564  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3617565 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3617622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 25637444 - 25637599
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  25637444 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 25637541  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  25637542 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 25637599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4598675 - 4598519
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  4598675 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 4598578  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  4598577 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 4598519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4600896 - 4600740
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  4600896 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-ttttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 4600799  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  4600798 gagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 4600740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 10056235 - 10056391
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10056235 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10056332  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10056333 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10056391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 10058457 - 10058613
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10058457 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10058554  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10058555 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10058613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 10060679 - 10060835
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10060679 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10060776  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10060777 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10060835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 10062901 - 10063057
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10062901 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10062998  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10062999 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10063057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 10065123 - 10065279
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10065123 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10065220  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10065221 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10065279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 10211411 - 10211567
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactg 191  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||| |  | ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||    
T  10211411 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattg 10211508  T
Q  192 gagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10211509 gagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10211567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31340337 - 31340268
Alignment:
Q  110 ggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcatt 179  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  31340337 ggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcatt 31340268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25491111 - 25491003
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||      
T  25491111 aaattaggtttgttctttgagagcttgttgaagctgatttcttatactccttttgtatctctttgtaaagaaatcattgatagtgaagtggagagatc-- 25491014  T
Q  202 tctctcctcca 212  Q
    |||||||||||    
T  25491013 tctctcctcca 25491003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 10209265 - 10209347
Alignment:
Q  169 aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||    
T  10209265 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatct 10209347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4055913 - 4055788
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacc-cttttgtatctccttgtaagaa-ctcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  4055913 gggtagaaattagg-ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattgaag 4055815  T
Q  195 agatcaatctctcctccaga-gtaggtca 222  Q
    |||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  4055814 agatc--tctctcccccagatgtaggtca 4055788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 45 - 197
Target Start/End: Original strand, 5373200 - 5373353
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttc 143  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |       ||||| |||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||||     
T  5373200 ggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattgaagagattg-ggaaaaaagggtagaaattaggctttgttctttttgagcttgttgaagctaattta 5373298  T
Q  144 ttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||  | |||| ||||||||    
T  5373299 ttgtaacccttttatatctctttgtaaggaactcattgccaatggattggagaga 5373353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35138855 - 35138746
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||||  || |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||    
T  35138855 gggtagaaattatgtttgttcttggtgagtttgttgaagttaatttcttgcaactcttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtggatggaaga 35138756  T
Q  196 gatcaatctc 205  Q
    || |||||||    
T  35138755 gaacaatctc 35138746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Original strand, 33191866 - 33191974
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    |||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||||| |||| | |||  |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  33191866 ttgttcttagagagcttgttgaagctaagttcttgtaaccattttatgtct--ttgtaaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctct-ctc 33191962  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
    ||||| ||||||    
T  33191963 cagaggaggtca 33191974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51352244 - 51352150
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctc 207  Q
    |||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  51352244 ttgttcattgtgagctttttaaagttaatttcttgtaaccattt-gtatttctttgtaataactcattgagagtggatttgagagatcaatctctc 51352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 203
Target Start/End: Original strand, 20937708 - 20937781
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttg-taagaactcattgatagtggactggagagatcaatc 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20937708 ttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgaaaagaactcattgata-tagattggagagatcaatc 20937781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305721
Alignment:
Q  179 tgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaac 236  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaac 27305721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2075149 - 2075095
Alignment:
Q  172 aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  2075149 aactaattgatagtggatttgagagatcaatctctccccgagagtaggtcaagtt 2075095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4075581 - 4075511
Alignment:
Q  137 taatttcttgtaacc-cttttgtatctccttgtaagaa-ctcattgatagtggactggagagatcaatctc 205  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4075581 taatttcttgtaacctcttttgtatcactttgtaagaaactctttgatagtggattggagagatcactctc 4075511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2075283 - 2075214
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttg-taaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2075283 gggttgggaaacatttataaacaccttgctgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgatattg 2075214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 54739087 - 54739004
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  54739087 ttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttat-gtaactcttttatatctctctgtaaagaactcattgatagtggattggaga 54739004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 250
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067478
Alignment:
Q  207 cctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 10067478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26323223 - 26323124
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    |||||||||||||| ||||| ||   ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || ||||||||||||||| | ||||||    
T  26323223 gggtaaaaattaggtttgtttttgaagagtttgttgaagctaatttcttgtaacctttttgtatatcttggtaaaaaactcattgatagtgaagtggaga 26323124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 55302130 - 55302079
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgta 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  55302130 gggtagaaattagggttgttctttgtaagtttgttgaagctaatttcttgta 55302079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 183
Target Start/End: Original strand, 2020191 - 2020245
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgata 183  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  2020191 ttgaagctaatttcttataaccgttttgtatttctttgtaaagaactcattgata 2020245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26386680 - 26386638
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  26386680 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattg 26386638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 32744652 - 32744606
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagt 65  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  32744652 gggttgggaaacattgtaaacacattggtgagtgaaaatcattgagt 32744606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2334643 - 2334400
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||| |||||||||||    
T  2334643 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaataagggttgttct 2334546  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2334545 ttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 2334446  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2334445 gtcaagtttggaccgaactgggggaacaatctttggtgtgtttgtt 2334400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5723480 - 5723238
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||| |||||||    
T  5723480 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaa---gggtagaaattaggcttgttct 5723384  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5723383 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtag 5723284  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5723283 gttaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 5723238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 45099697 - 45099940
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  45099697 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 45099795  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45099796 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 45099894  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45099895 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 45099940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4503358 - 4503115
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |       || || ||||||||||||||||    
T  4503358 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggagagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttct 4503260  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4503259 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 4503161  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4503160 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 4503115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36988301 - 36988058
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||         ||||| ||||||||||||||||    
T  36988301 gggttgggaaacatagtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgggattg--gaaaaaagggtagaaattagggttgttct 36988204  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
     ||||| ||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36988203 atgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 36988104  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36988103 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 36988058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6595228 - 6594988
Alignment:
Q  23 tgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgt 122  Q
    |||||||  |||||||||  |||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||        |||| ||||||||||||||||||||    
T  6595228 tgggaaaaattgtaaacactttggagagtgagaatcattgggtgtcttgttcattggtgagatt-aggaaaaaatggtagaaattagggttgttctttgt 6595130  T
Q  123 gaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6595129 gaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 6595030  T
Q  223 agtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6595029 agtttggaccgaactgagtgaacaatctttggtgtgtttgtt 6594988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4484556 - 4484312
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  4484556 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgaaattg-ggagaaaagggtagaaattagggttgttct 4484459  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4484458 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 4484359  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4484358 ggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 4484312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36205889 - 36205647
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  36205889 gggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaat--ggtagaaattagggttgttct 36205792  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36205791 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg-aagaactcattgacagcggattggagagttcaatctatcctccagagtag 36205693  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36205692 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 36205647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 30833288 - 30833532
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  30833288 gggttgggaaacattgtaaacactttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattg-ggagaaaagggtagaaattagggttgttct 30833385  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30833386 ttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 30833485  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  30833486 ggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 30833532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 36773504 - 36773747
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||| | |||||||||||||||    
T  36773504 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggaataaattagggttgttc 36773601  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  36773602 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 36773701  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36773702 tgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 36773747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 38312182 - 38312425
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  38312182 gggttgggaaacattgtatacaccttgtgtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 38312279  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  38312280 tttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagatctcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 38312379  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38312380 tgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 38312425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 723975 - 723727
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||         ||||| |||||||| |    
T  723975 cttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattg--gaaaactgggtagaaattaggtt 723878  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcca 212  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  723877 tgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccca 723778  T
Q  213 gagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  723777 gattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36318235 - 36317992
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  36318235 gggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttc 36318138  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  36318137 tttgtgagcttgttgaaactaatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccttagagta 36318038  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36318037 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 36317992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 34139997 - 34139753
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  34139997 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 34139900  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  34139899 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatt 34139800  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34139799 aggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 34139753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 29867811 - 29868054
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  29867811 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 29867908  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  29867909 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaatta 29868008  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||    
T  29868009 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaataatctttgatgtgtttgtt 29868054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17057595 - 17057352
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  17057595 gggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttc 17057498  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17057497 tttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagacta 17057398  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17057397 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 17057352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17085578 - 17085335
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  17085578 gggttgggaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttc 17085481  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||  | ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17085480 tttgcaagcttgttgaagctaattttttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagacta 17085381  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17085380 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 17085335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14634057 - 14633808
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||         ||||| |||||||| |    
T  14634057 cttttgggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattg--gtaaaatgggtagaaattaggat 14633960  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcc 211  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14633959 tgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaagaactcatagatagtggattggagagatcaatctctccccc 14633860  T
Q  212 agagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  14633859 agattaggtcaag-ttggaccgaactgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 14633808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33162674 - 33162433
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||  |       ||||| |||||||||||||||||    
T  33162674 gttgggaaacattgtaaacaccttgggtgattgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgaaattaggaaaat--gggtagaaattagggttgttctt 33162577  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  33162576 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctctgtaagaactcattgatagtggattagagagatcaatctctcccctagattagg 33162477  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  33162476 tcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 33162433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 45726885 - 45727096
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |    
T  45726885 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttattcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagagttgttctttgtgagcttgt 45726981  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  45726982 tgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 45727080  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  45727081 ccgaactgggtgaaca 45727096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11151817 - 11151574
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| |       ||||| |||||||  ||||||    
T  11151817 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgaaattgggaaaat--gggtagaaattagatttgttc 11151720  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  11151719 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcactttgtaagaactcttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagatta 11151620  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11151619 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 11151574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 42362294 - 42362533
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||    
T  42362294 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgttc 42362391  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  42362392 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagatta 42362491  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||      || | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  42362492 ggtcaagtt-----ggacctgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 42362533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Original strand, 11067248 - 11067490
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||         ||||| ||||||| ||||| ||    
T  11067248 ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgaaattg--gaaaaatgggtagaaattagtgttgtact 11067345  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||| |||    
T  11067346 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcatttataatggattgaagagatcaatctctcccccagattag 11067445  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11067446 gtcaag-ttggaccgaactcggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 11067490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 35447032 - 35446885
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35447032 ggtagaaattagggttgttctttgtgatcttgttgaatctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaga 35446933  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  35446932 tcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 35446885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 11690443 - 11690683
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||    
T  11690443 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgttc 11690540  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| | ||    
T  11690541 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaaatcgttgatagtggattggagagatcaacctctcccccatatta 11690640  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
     |||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  11690641 cgtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgttt 11690683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1631944 - 1631752
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |    
T  1631944 ttgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgt 1631848  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1631847 tgaagctaatatcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 1631752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 32289582 - 32289736
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||  | | ||||    
T  32289582 gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtaaattagaga 32289681  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32289682 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 32289736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Original strand, 33648190 - 33648316
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  33648190 ggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttctttgtaaagaactcattgatagcggattggaga 33648289  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  33648290 gatcaatctctcctccagagtaggtca 33648316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 48 - 248
Target Start/End: Original strand, 24398027 - 24398228
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttg 146  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| || ||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24398027 gagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgtgaagaaa-gggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttg 24398125  T
Q  147 taacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaac 245  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||| ||||||| || |||||    
T  24398126 taacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaac 24398225  T
Q  246 aat 248  Q
    |||    
T  24398226 aat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 6266709 - 6266863
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6266709 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 6266807  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6266808 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6266863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17490279 - 17490149
Alignment:
Q  115 ttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccaga 214  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||    
T  17490279 ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtaactctttgtaagaactcattgatagtggattgtagagatcaatctctcccctaga 17490180  T
Q  215 gtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  17490179 gtaggtcaa-tttggaccgaactgggtaaaca 17490149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42288259 - 42288131
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  42288259 gggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccatttgtatttctttgtaagagctcattgataatggattggagag 42288160  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  42288159 atcaatctctcc-ccagattaggtcaagtt 42288131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 264
Target Start/End: Original strand, 26353218 - 26353368
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcc 211  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||       
T  26353218 ttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtatctttttgtaagtactcattgatagtggattggagagatcactctctccctt 26353317  T
Q  212 agagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||    
T  26353318 agagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggtaaac-attttttgtgtgtttgtt 26353368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7815486 - 7815311
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||        |||  ||||||||||| |||||||   | |||     
T  7815486 ttgtaaacaccttaggtgggtgaaaatcattgcgtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaa---ggttgaaattagggtttgttctttagaagcttg 7815390  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7815389 ttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcatttatagtggattggagagattaatctctcc 7815311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 212
Target Start/End: Original strand, 13121738 - 13121901
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttc 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |        |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  13121738 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgggaaaat---ggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttc 13121834  T
Q  144 ttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcca 212  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  13121835 ttgtaacc--tttgtatctctttgtagaaactcattgatagtggattgaagaaatcaatctctcctcca 13121901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Original strand, 7451165 - 7451284
Alignment:
Q  125 acttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  7451165 acttgttgaagctaatttcttgtaattcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctctacagtaggtcaag 7451264  T
Q  225 tttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    || ||  ||||| |||||||||    
T  7451265 ttgga--cgaactgggtgaaca 7451284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13656182 - 13656028
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13656182 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 13656085  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  13656084 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 13656028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 257
Target Start/End: Original strand, 17450560 - 17450755
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttct 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||          ||||| | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  17450560 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattt--gaaaaatgggtagagattaggcttgttctttgtgagcttgttgaagctaattt-t 17450656  T
Q  145 tgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaa 244  Q
    |||||||| |||||            |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  17450657 tgtaacccatttgt------------gaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaa 17450742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12647537 - 12647382
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  12647537 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 12647440  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12647439 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 12647382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 223
Target Start/End: Original strand, 11049593 - 11049699
Alignment:
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| || | |    
T  11049593 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccttttagtatctctttgtaagaactcattgatagtagattgaaaagatcaatctctccttcataat 11049692  T
Q  217 aggtcaa 223  Q
    |||||||    
T  11049693 aggtcaa 11049699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14202633 - 14202404
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgt--cttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgt 115  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||| |       ||||| |||||| | ||||    
T  14202633 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaattattgagtgtgtctttttcatttctgagattgggaaaat--gggtagaaattatgtttgt 14202536  T
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagag 215  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |      ||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||     
T  14202535 tctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactc------atc-ctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctccccaagat 14202443  T
Q  216 taggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||          ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14202442 tagg----------accgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 14202404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 24885603 - 24885763
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || | |||| |       | ||| |||||||| ||||||    
T  24885603 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtaaaattgggaaaat--gagtagaaattaggtttgttc 24885700  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattg 180  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||||||||    
T  24885701 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtacccctctgtaagaactcattg 24885763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Original strand, 39284930 - 39285024
Alignment:
Q  172 aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctt---tggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||   |||||||||||||    
T  39284930 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttaatggtgtgtttgtt 39285024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Original strand, 28671989 - 28672075
Alignment:
Q  137 taatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||  || ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28671989 taatttcttgttaccgttttgtatctctttacaaagaactcactgacagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 28672075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30218194 - 30218068
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || |||||||||||||  || | |    
T  30218194 gggtagaagttaggtttgttcttggagagcttattgaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaataattcattgatagtgggttgaaaa 30218095  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  30218094 gatcaatcactcccccagagtaagtca 30218068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Original strand, 39284827 - 39284896
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39284827 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattg 39284896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42019987 - 42019896
Alignment:
Q  132 gaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  42019987 gaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaaaaaaactcattgatagtgaatttgagagatcaatctcttccccatagtaggt 42019896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42261629 - 42261524
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    |||||| | |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||     
T  42261629 aaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagagatcat 42261530  T
Q  202 tctctc 207  Q
    ||||||    
T  42261529 tctctc 42261524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 7597145 - 7597036
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    |||||| || ||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||  |||||||||  ||||||||     
T  7597145 ttgttccttatgaacttgtcgaaactaatttcttgtaagtcttttgtatctttttgtaaagaactcattgattgtagaacggagagatc--tctctcctt 7597048  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||||    
T  7597047 cagagtaggtca 7597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 223
Target Start/End: Original strand, 42412117 - 42412162
Alignment:
Q  177 attgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42412117 attgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccagagtaggtcaa 42412162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 34811338 - 34811281
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaag-aactcattgatagtg 186  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34811338 ttgaagctaatttattgtaactcttttatatctctttgtaagaaactcattgatagtg 34811281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12123728 - 12123644
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    ||||||| |||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||    
T  12123728 aaattagagttgttctttatgattttgttgaagcttatttcttgtaactcttttgtatcattttgtaaagaactcaatgatagtg 12123644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 32289515 - 32289566
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtctt 70  Q
    ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32289515 gggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt 32289566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 211
Target Start/End: Original strand, 41454254 - 41454366
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| || ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||| ||    
T  41454254 ggtagaaattagatttgttttttgagagcttgttgaagctaatttctagcaactcttttgtatatatttgtaaagaactcattgatagtgaagtggacag 41454353  T
Q  197 atcaatctctcctcc 211  Q
    |||  ||||||||||    
T  41454354 atc--tctctcctcc 41454366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 260
Target Start/End: Original strand, 24197942 - 24198078
Alignment:
Q  123 gaacttcttgaag-ctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaag-aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccaga-gtagg 219  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||| ||||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  24197942 gaacttgttgaaggctaatttcttgtaaccc--ttgtatctctttgcaagaaactctttgataatggattggagagatc--tatcttctccagacgtagg 24198037  T
Q  220 tcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtt 260  Q
    ||| |||||  |||||| |||| |||||   ||||||||||    
T  24198038 tcacgtttgggccgaactgggtaaacaaatattggtgtgtt 24198078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 163
Target Start/End: Original strand, 41446159 - 41446224
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctc 163  Q
    |||| |||||| | |||||||||| || ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  41446159 ggtagaaattatgtttgttctttgagagcttgttgaagctaattttaagtaacccttttgtatctc 41446224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 170
Target Start/End: Original strand, 4561140 - 4561180
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  4561140 ttgaagctaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaa 4561180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 78)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 23554984 - 23555226
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || ||||||||||||||||||    
T  23554984 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaatgg-tagaaattagggttgttcttt 23555082  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23555083 gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgtacctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 23555182  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23555183 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctttgatgtgtttgtt 23555226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 35853857 - 35854101
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  35853857 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattagggttgttct 35853954  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35853955 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 35854054  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35854055 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtt 35854101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 29990997 - 29991239
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       || || |||||||||||||| |    
T  29990997 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaa---ggatagaaattagggttgttat 29991093  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29991094 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttctaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 29991193  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29991194 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 29991239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 4178717 - 4178959
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||    
T  4178717 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaaa--ggtagaaattagggttgttct 4178814  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||| ||    
T  4178815 ttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aagaactcattgatagtggattgaacagttcaatctctcctccagagcag 4178913  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4178914 gtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 4178959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Original strand, 27347760 - 27348002
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||| |||||||    
T  27347760 ggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggattgttct 27347857  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||    
T  27347858 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattag 27347957  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27347958 gtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 27348002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47676362 - 47676119
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  47676362 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcaatgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 47676265  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  47676264 tttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcaatgatagtggaatggagagatcaatctctcccccatatta 47676165  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  47676164 ggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgtt 47676119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14070059 - 14069817
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  14070059 gggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattagggttgttc 14069962  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  14069961 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagatta 14069862  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14069861 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 14069817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14380087 - 14379845
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  14380087 gggttgggtaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattagggttgttc 14379990  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||    
T  14379989 tttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctagatta 14379890  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14379889 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 14379845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 19502120 - 19502364
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |       || || |||||| ||||||| |    
T  19502120 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgagaatcattgagtgtcttgttcagtggtgagattgcgaaaaaa-ggttagaaattaaggttgtttt 19502218  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19502219 ttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaa 19502318  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19502319 gtcaagtttggaacgaagtgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 19502364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31733195 - 31732952
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||    
T  31733195 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagactgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 31733098  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  31733097 tttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggagagatcaatctctcccccaaatta 31732998  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||    
T  31732997 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgagtttgtt 31732952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34310928 - 34310705
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||| || |    
T  34310928 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgaaattgt 34310832  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34310831 tgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 34310732  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaatctttggtgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34310731 ccgaactgggtgaacaatctttggtgt 34310705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 47674169 - 47673927
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  47674169 gggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttc 47674072  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  47674071 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccatatta 47673973  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||| ||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  47673972 agtcaag-ttggaccgaactgaatcaacaatctttggtgtgtttgtt 47673927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 18126586 - 18126829
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||         | ||| |||||||||||||||    
T  18126586 gggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgttttgttcattggtgagattg--gaaaaatgtgtagaaattagggttgttc 18126683  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  18126684 tttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagacta 18126783  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18126784 ggtcaagtttg-accgacctgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 18126829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 27 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30024950 - 30024718
Alignment:
Q  27 aaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaa 125  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  30024950 aaacgttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttcattgtgag 30024853  T
Q  126 cttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 225  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  30024852 cttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag- 30024754  T
Q  226 ttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||| ||||||||    
T  30024753 ttggaccgaactggatcaacaatctttagtgtgttt 30024718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 48491521 - 48491763
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  48491521 gggttgggaaacattgtaaacactttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 48491618  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48491619 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgaaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 48491718  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| |  || |||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  48491719 ggtcaagttgg--ccaaacttggtaaacaatctttgatgtgtttgtt 48491763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 1113599 - 1113842
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||       || || |||||||||||||||    
T  1113599 gggttgggaaacattgtaaacaacttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaat--ggatagaaattagggttgttc 1113696  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  1113697 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttataacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcccccatatta 1113796  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||    
T  1113797 ggtcaagtttg-accgaattgagtcaacaatctttggtgtgtttgtt 1113842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25767180 - 25766941
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttg 121  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||         ||||| |||||||||||||||||||    
T  25767180 ttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg---agattg--gaaaaaagggtagaaattagggttgttctttg 25767086  T
Q  122 tgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25767085 tgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 25766986  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25766985 caagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtgtttgtt 25766941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41317660 - 41317417
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||||||||    
T  41317660 gggttgggaaacattgtaaacaccttggatgagtgaaaatcattgagtctcttgttcattggtgagattgggaaaatt--ggtagaaattagggttgttc 41317563  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  41317562 tttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 41317463  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41317462 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 41317417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 39731319 - 39731555
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||         ||||| ||||||||||||||||    
T  39731319 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtctt-------ggtgagattg---gaaaaagggtagaaattagggttgttct 39731408  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |   | ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39731409 ttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 39731508  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39731509 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 39731555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 48489373 - 48489616
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  48489373 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattaaatgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 48489470  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  48489471 tttgaaaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgcaataactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 48489570  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48489571 ggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt 48489616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 48 - 264
Target Start/End: Original strand, 22269945 - 22270158
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22269945 gagtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 22270042  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa 247  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |    
T  22270043 aacccatttgtatctctttgtaagaactgattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaac-a 22270140  T
Q  248 tct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  22270141 tctcttggtgtgtttgtt 22270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 43864186 - 43864429
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  43864186 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaagtgggtagaaattagggttgttc 43864283  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  43864284 tttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactaattgatagtggattggagagatcaatctctctcccagatta 43864383  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||   |||||||||||||    
T  43864384 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatagatggtgtgtttgtt 43864429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 4586103 - 4586346
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  4586103 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 4586200  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  4586201 tttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatatta 4586300  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||  ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  4586301 tgtcaa-cttggaccgaactgggtcgacaatctttcgtgtgtttgtt 4586346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 48408745 - 48408991
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||  ||||||||    
T  48408745 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattaatgttgttct 48408842  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  48408843 ttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaaataactcattgatagtggattggagagtttaatctctcctccagagt 48408942  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    | |||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  48408943 atgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgtgtttgtt 48408991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 8153284 - 8153524
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       | ||| |||||||||||||||    
T  8153284 gggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gagtagaaattagggttgttc 8153381  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||  || |  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  8153382 tttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 8153481  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||||| ||| || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8153482 ggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 8153524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 25615872 - 25616039
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  25615872 gggtagaaattaggtttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcattttgtaagaactcattgatagtggattagagag 25615971  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25615972 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatctttggtgtgtttgtt 25616039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 41649236 - 41648994
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||          |||| |||||||| ||||||    
T  41649236 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattg--gaaaaattggtagaaattaggtttgttc 41649139  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  41649138 tttgtgagcttgttta-gctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaatta 41649040  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41649039 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 41648994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 496206 - 495966
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || || ||| ||||||||| |       ||||| |||||||||| |||||||    
T  496206 ttgggaaacattgtaaaaaccttgggtgagtgaaaatcatttagtgttttgttaatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggtagttcttt 496109  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  496108 gtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccctatagtaggt 496009  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  496008 caag-ttggacagaaccgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 495966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38671448 - 38671205
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  38671448 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagcgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 38671351  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||| | ||    
T  38671350 tttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacacatttgtatcactttgtaagaactcattgatagtggattgaagagataaatctatcccccaaaata 38671251  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38671250 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 38671205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2361184 - 2360960
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  2361184 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 2361088  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  2361087 tgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaa 2360989  T
Q  231 ccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgt 259  Q
    |||||| |||| || || |||||||||||    
T  2360988 ccgaactgggtcaataacctttggtgtgt 2360960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36146635 - 36146391
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgtt-gtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gt 115  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||| ||| ||    
T  36146635 gggttgggaaacatttgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagagtttgt 36146538  T
Q  116 tctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagag 215  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |     
T  36146537 tatttgtgagcttgttgaagctaatttct-gtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggatttgagagatcaatctctcccccatat 36146439  T
Q  216 taggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36146438 taggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 36146391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 110 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 32358190 - 32358055
Alignment:
Q  110 ggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcct 209  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32358190 ggttgtgctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcct 32358091  T
Q  210 ccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  32358090 ccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 32358055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 246
Target Start/End: Original strand, 3258968 - 3259162
Alignment:
Q  49 agtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgta 148  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  3258968 agtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaactagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgta 3259065  T
Q  149 acccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    || | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3259066 actcatttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 3259162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Original strand, 26417261 - 26417501
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||    
T  26417261 ttgggaaacattgtaaacaccttgagcgggtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttcttt 26417358  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  26417359 gtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccaggttaggt 26417457  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  ||| ||| ||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  26417458 caa-attggaccaaactgggtcaacaatttcttggtgtgtttgtt 26417501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 2390301 - 2390430
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  2390301 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaataactcatatatagtggattggagag 2390400  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2390401 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 2390430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 6431990 - 6432119
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6431990 gggtagaaattaggattgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattggagag 6432089  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6432090 atcaatctctccttcagagtaggtcaagtt 6432119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 29608756 - 29608885
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29608756 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagat 29608855  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29608856 atcaatcactcctccagagtaggtcaagtt 29608885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 103 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 4508849 - 4508707
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaat 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4508849 aaattagggttgttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgagagtggattggagagatcaat 4508750  T
Q  203 ctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||| || |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  4508749 ctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtgaaca 4508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8359466 - 8359316
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8359466 gggtagaaattagggtttttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaga 8359367  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  8359366 gatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 8359316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 104 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2759339 - 2759183
Alignment:
Q  104 aattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2759339 aattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagatatcaatc 2759240  T
Q  204 tctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  2759239 tcttccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatcattggtgtgttt 2759183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 48599483 - 48599335
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  48599483 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttggaagagctcattgatagtggattggagag 48599384  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  48599383 atcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 48599335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12098085 - 12097850
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  12098085 gggttgggaaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggttagattggg--aaaatgggtagaaattagggttgttc 12097988  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
     |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||        ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  12097987 attgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccatttgtatctc-------taactctttg-tagtggattggagagatgaatctctcccccagatta 12097896  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097895 ggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 12097850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31105612 - 31105376
Alignment:
Q  26 gaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtga 124  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||  || ||||||||||    
T  31105612 gaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagattttttctttgtga 31105515  T
Q  125 acttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag 224  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  31105514 gcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctttttgtaagaactcattgatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag 31105415  T
Q  225 tttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     ||| ||||||| |||| |||| |  ||||| ||||||||    
T  31105414 -ttggaccgaactgggtaaacatttcttggtctgtttgtt 31105376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 43504305 - 43504135
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccctttt-gtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  43504305 gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtgaattggag 43504206  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43504205 agttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 43504135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23565195 - 23565081
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcc 211  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |     
T  23565195 ttgttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctctcct 23565096  T
Q  212 agagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||||    
T  23565095 agagtaggtcaagtt 23565081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4510697 - 4510568
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||     
T  4510697 gggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaa 4510598  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4510597 atcaatctctcctgtagagtaggtcaagtt 4510568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4512539 - 4512410
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||     
T  4512539 gggtagaaattaaggttgttctttgtgagtttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttataagaactcattgatagtggattgaagaa 4512440  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4512439 atcaatctctcctgtagagtaggtcaagtt 4512410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 24789859 - 24790028
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||  ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  24789859 gggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaca-ttttgtatcccttttgtaaaaactctttgatagtggattggag 24789957  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24789958 agtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 24790028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4253742 - 4253511
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||          |||| ||||||||||| ||||||||||| |||     
T  4253742 ttgtaaacaccttaggtgagtgaaaatcattgagtttcttgttcattggtgaaattg---gtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttg 4253646  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  4253645 ttgaagctaatttcatgtaacccttttatatctctttggaaagaactcattgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttg 4253547  T
Q  229 aaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||||  ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  4253546 gaccgaactaggtaaacatttcttggtgtgtttgtt 4253511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 31518923 - 31519088
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31518923 ggtagaaattaggtttgttctctgtgagcttattgaagctagtt-cttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtggattggagaga 31519021  T
Q  198 tcaatctctc-ctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| || | |||| |  ||||||||||||||    
T  31519022 tcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactggataaacatttcttggtgtgtttgtt 31519088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Original strand, 31518732 - 31518905
Alignment:
Q  14 ctttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggt 112  Q
    |||| ||||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||| |    
T  31518732 cttttgggttggaaaacatcgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaata--ggtagaaattaggtt 31518829  T
Q  113 tgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtgga 188  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31518830 tgttctttgtgagcttattgaagctagtttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgacagtgga 31518905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6360077 - 6359972
Alignment:
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  6360077 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagttgattggagagatcaatctcttccccatattaggt 6359978  T
Q  221 caagtt 226  Q
    ||||||    
T  6359977 caagtt 6359972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 20343915 - 20344068
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcatt-gatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20343915 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactcatttgatagtggattgga 20344012  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20344013 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 20344068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 154 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24525594 - 24525485
Alignment:
Q  154 tttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttg 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| || |||| |||| || ||||||||    
T  24525594 tttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggtcaataatctttg 24525496  T
Q  254 gtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||||    
T  24525495 gtgtgtttgtt 24525485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22328525 - 22328414
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  22328525 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttgcaaggaagtcattaatagtggatttgagagatcaatctctcccc 22328426  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
     |||||||||||    
T  22328425 tagagtaggtca 22328414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36574728 - 36574499
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatctt-ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttc 129  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||| |        |||| |||||| | || |||||||||||  ||     
T  36574728 ttgtaaacaccttaggtgagtgaaaattatcgagtgtcttgtttattggagagattggggaaa----ggtagaaattaagatttgttctttgtgagtttg 36574633  T
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||    
T  36574632 ttgaagctaatttcttgtaacccttttatatctctttgtaaagaactcattgatagtggtttggagagatcaatccatcc-ctagagtaggtcaa-tttg 36574535  T
Q  229 aaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     ||| ||| |||| |||| |  ||| ||||||||||    
T  36574534 gaccaaactgggtaaacatttcttgatgtgtttgtt 36574499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4538766 - 4538627
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| |||||||||||||||    
T  4538766 gggttgggaaaaattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagatt--ggaaaaatgggtagaaattagggttgttc 4538669  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgta 159  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4538668 tttatgaaattttttaagctaatttcttgtaacccatttgta 4538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18388911 - 18388756
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  18388911 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 18388814  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18388813 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 18388756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18392347 - 18392192
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  18392347 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 18392250  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18392249 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 18392192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 226
Target Start/End: Original strand, 23343944 - 23344121
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttg-ttctttgtgaacttcttgaagctaatttc 143  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||  |       ||||| |||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23343944 ggtgagtgaaaatcattgaatgtctagttcattggtgagatttggaaaa---gggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttc 23344040  T
Q  144 ttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| | || |||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  23344041 ttgtaaccctttagtatatctttgtgagaactcattgataatagattggagaaattaatctctc--ccagagtaggtcaagtt 23344121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32060475 - 32060318
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt----aagaactcatt-gatagtggact 190  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |    ||||||||||| ||||||||| |    
T  32060475 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccctttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 32060378  T
Q  191 ggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  32060377 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 32060318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1560748 - 1560647
Alignment:
Q  165 ttgtaagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttg 262  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| ||||    
T  1560748 ttgtaagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctcttggtgtatttg 1560649  T
Q  263 tt 264  Q
    ||    
T  1560648 tt 1560647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6592491 - 6592336
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  6592491 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 6592394  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6592393 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6592336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6594709 - 6594554
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  6594709 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 6594612  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6594611 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 6594554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24514986 - 24514918
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24514986 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg 24514918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Original strand, 30814530 - 30814620
Alignment:
Q  172 aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  30814530 aactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaat-tttggtgtgtttgtt 30814620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Original strand, 5116656 - 5116735
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcc 208  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  5116656 ttgaagataatttattgtaaaccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaattggagagataaatctctcc 5116735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24526122 - 24525992
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagg-gttgttc 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |       ||||| ||||||||  ||||||    
T  24526122 ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaaattggg--aaaatgggtagaaattaggttttgttc 24526025  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaac 150  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  24526024 tttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3904751 - 3904641
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    |||||||||| || | | |||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||      
T  3904751 ttgttctttgagagcctattgaatgtaatttcttgtaacacttttgcatctctttgtaaagaactcattgatagtgatcag-agagatcaatctctccct 3904653  T
Q  211 cagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||||    
T  3904652 cagagtaggtca 3904641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 223
Target Start/End: Original strand, 18396392 - 18396463
Alignment:
Q  153 ttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18396392 ttttgtatctctttataaagaattcattgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaa 18396463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2761528 - 2761459
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2761528 gggttgggaaacattgtaaacacattgggtgagtgaaaatcatcgagtgtcttgttcattggtgagattg 2761459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5513771 - 5513690
Alignment:
Q  142 tcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5513771 tcttataacccttttatatctctttgtaaagaactcattgacactgaattggaga-atcaatctcacctccagagtaggtcaa 5513690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21983561 - 21983517
Alignment:
Q  2 caaaggaggtaactttagggttgggaaacgttgtaaacatcttgg 46  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  21983561 caaaggaggtaactttagggtggggaaacattgtaaacaccttgg 21983517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 98 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43363622 - 43363507
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctc--cttgt-aagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    |||| |||||||| |||||||| | || ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||| | ||||     
T  43363622 ggtagaaattaggtttgttcttggagagcttgttgaaactaatttattgtaactcttttgtatctctatttgtaaataactcattgatagtgaagtggat 43363523  T
Q  195 agatcaatctctcctcca 212  Q
    |||||  |||||||||||    
T  43363522 agatc--tctctcctcca 43363507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 173
Target Start/End: Original strand, 31048277 - 31048323
Alignment:
Q  128 tcttgaagctaatttcttgtaacc-cttttgtatctccttgtaagaa 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31048277 tcttgaagttaatttcttgtaacctcttttgtatctccttgcaagaa 31048323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 27073868 - 27073925
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  27073868 ttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27204445 - 27204388
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  27204445 ttgaagttaatttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcgttgacagtg 27204388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 1360301 - 1360226
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaaccc--ttttgtatctccttgtaag 171  Q
    |||| |||||||| ||  |||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  1360301 ggtagaaattaggttttgtcttggagaacttgttgaagcgaatttcttgtaacccttttttgtatctctttgtaag 1360226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 82)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 3189273 - 3189516
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| ||||||||||||||||    
T  3189273 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaa--gggtataaattagggttgttct 3189370  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3189371 ttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtag 3189470  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3189471 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 3189516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 3198090 - 3198333
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| ||||||||||||||||    
T  3198090 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaa--gggtataaattagggttgttct 3198187  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3198188 ttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtag 3198287  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3198288 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 3198333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 3206929 - 3207172
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| ||||||||||||||||    
T  3206929 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcactgagtgtcttgttcattggtgagatttggaaaaa--gggtataaattagggttgttct 3207026  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3207027 ttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtag 3207126  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3207127 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 3207172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 20762614 - 20762858
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||    
T  20762614 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtatcttgttcattggtgagattgagaaaaaa-gggtagaaattagggttgttct 20762712  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20762713 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttcgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtag 20762812  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20762813 gtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatctttggtgtgtttgtt 20762858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 3156808 - 3157050
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||    
T  3156808 gggtttggaaacattgtaaacaccctggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttct 3156905  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  3156906 ttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattag 3157005  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3157006 gtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 3157050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28220452 - 28220210
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| |||||||||||||||    
T  28220452 gggttgggaagcattgaaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttattcattggtgagattcggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 28220355  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28220354 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 28220255  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28220254 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 28220210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8550986 - 8550769
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttct 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  8550986 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttct 8550889  T
Q  145 tgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaa 244  Q
    |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8550888 tgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaa 8550789  T
Q  245 caatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8550788 caatctttggtgtgtttgtt 8550769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Original strand, 49918319 - 49918535
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttct 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49918319 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttct 49918416  T
Q  145 tgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaa 244  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||| ||    
T  49918417 tgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaa 49918515  T
Q  245 caatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  49918516 caatctttggtgtgtttgtt 49918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 44455102 - 44455345
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  44455102 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 44455199  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  44455200 tttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgtatctttttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 44455299  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44455300 ggtcaagtttg-accgaactgggtcaacgatctttggtgtgtttgtt 44455345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28265779 - 28265537
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |        |||| |||||||||||||||     
T  28265779 ggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggcgagattgggaaaata--ggtagaaattagggttgttca 28265682  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28265681 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattag 28265582  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28265581 gtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 28265537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 834393 - 834150
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       || || |||||||||||||||    
T  834393 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgcgtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--ggatagaaattagggttgttc 834296  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  834295 tttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatctatctctcccccagagta 834196  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  834195 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 834150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4552863 - 4552620
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||| |||| |    
T  4552863 gggttgagaaacattgtaaacaccttgggtgagggaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattaggtttgtcc 4552766  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  4552765 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatccctttgtaagaactcattgataatggattggagagatcaatctctccctcagagta 4552666  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4552665 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 4552620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13316501 - 13316334
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13316501 gggtagaaattagggttgttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttggaagaactcattgatagtggattggagag 13316402  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13316401 ttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttagtgagtttgtt 13316334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28223647 - 28223405
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| ||||| ||    
T  28223647 gggttgggaaacattgaagacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattatggttgatc 28223550  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  28223549 tttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatatta 28223450  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgt 263  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28223449 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgt 28223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 31659180 - 31659420
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| ||||||||| |||||    
T  31659180 gggttcggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggctgttc 31659277  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  31659278 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaacttattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagatta 31659377  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31659378 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgttt 31659420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37503780 - 37503540
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||    
T  37503780 gggttggaaaatattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtaaaaattagggttgttc 37503683  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37503682 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc---ttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 37503586  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||||| ||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37503585 tgtcaag-ttggatcgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 37503540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 50167401 - 50167158
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       |  || ||||||||||||||     
T  50167401 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaattag--tagaaattagggttgtta 50167304  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  50167303 tttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaaaaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagatta 50167204  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    | ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  50167203 gctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 50167158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13547301 - 13547090
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13547301 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 13547205  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13547204 tgaagctattttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 13547106  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  13547105 ccgaactgggtgaaca 13547090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 264
Target Start/End: Original strand, 46064868 - 46065103
Alignment:
Q  27 aaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaa 125  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       || ||||||||||| |||||||||||||     
T  46064868 aaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--ggataaaaattaggtttgttctttgtgag 46064965  T
Q  126 cttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 225  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  46064966 ctcgttgaagctaatttcttgtaactcatgtgtatctctttgtaagaactcattcatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag- 46065064  T
Q  226 ttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46065065 ttggatcgaactgggtaaacaatctttggtgtgtttgtt 46065103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 37168253 - 37168465
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37168253 ttgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 37168349  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37168350 ttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgg 37168448  T
Q  230 accgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37168449 accgaactgggtgaaca 37168465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 48 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 47255535 - 47255340
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47255535 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgt 47255439  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  47255438 aacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 47255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 50169436 - 50169193
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  50169436 gggttgggaaacattgtaaataccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttc 50169339  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| ||    
T  50169338 tttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagtactcattgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagatta 50169239  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  50169238 ggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgtttgtt 50169193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 29136203 - 29136415
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29136203 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 29136299  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29136300 tgaagctaatttcttggaacccatttgtatttctttgtaagaactcattgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgga 29136399  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||  ||||||||    
T  29136400 ccgaactaggtgaaca 29136415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Original strand, 51765343 - 51765583
Alignment:
Q  25 ggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc-tttgtg 123  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||  ||||| |       ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  51765343 ggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtttgattg-ggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtg 51765440  T
Q  124 aacttcttgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 221  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  51765441 aacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggac 51765540  T
Q  222 aagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  51765541 aagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 51765583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Original strand, 1833467 - 1833667
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||    
T  1833467 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttcttt 1833564  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||||  | |||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1833565 gtgaatctattgaagctaaattcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccaccagattaggt 1833664  T
Q  221 caa 223  Q
    |||    
T  1833665 caa 1833667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3847347 - 3847104
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       ||||| |||||||||||||||    
T  3847347 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttc 3847250  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||  || || ||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  3847249 tttgtgagtttgtttaagctaaatttttgtaacccatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatccatctcttccccagatta 3847150  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3847149 ggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 3847104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13659561 - 13659319
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttggtg-agtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       || || |||||||||||||| |    
T  13659561 ggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaac--ggatagaaattagggttgtttt 13659464  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13659463 ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtag 13659364  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13659363 gttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt 13659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 260
Target Start/End: Original strand, 19754438 - 19754676
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgtt-gtaaacatcttg-gtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| | |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||    
T  19754438 gttgggaaacattcgtaaacaccttgagagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaaat-gggtagaaattagggttgttct 19754535  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||    
T  19754536 ttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattag 19754635  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtt 260  Q
    |||||| ||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  19754636 gtcaag-ttggaccgaagtgggtcaacaatttttggtgtgtt 19754676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 226
Target Start/End: Original strand, 11348654 - 11348846
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11348654 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt--ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 11348750  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348751 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttctaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 11348846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 13549212 - 13549001
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13549212 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 13549116  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13549115 taaacctaatttcatgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgga 13549017  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  13549016 ccgaactgggtgaaca 13549001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23555491 - 23555286
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||| |||||||||||||||    
T  23555491 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgaatgaaaattattgagtgtcttattctttggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattagggttgttc 23555394  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  23555393 tttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagta 23555295  T
Q  218 ggtcaagtt 226  Q
    |||||||||    
T  23555294 ggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42298123 - 42297971
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42298123 ggtagaaattagggttgttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattgaagaga 42298024  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||    
T  42298023 tcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatct 42297971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 197134 - 196893
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||        |||| |||||||||||||||    
T  197134 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgagaaaatt--ggtagaaattagggttgttc 197037  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctct-cctccagagt 216  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||| |    
T  197036 tttgtgagcttgtttaagttaatttcttgtaactcatttgtatccctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatttatctctccccccagatt 196937  T
Q  217 aggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    |||||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  196936 aggtcaag-ttggaccgaactggatcaacaatctttggtgtgttt 196893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 37560068 - 37559850
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaa-gctaatttc 143  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |       ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37560068 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattaggaaaat--gggtagaaattagagttgttctttgtgaacttgttgaaagctaatttc 37559971  T
Q  144 ttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctcc-agagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtg 242  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||| |||||||  |||     
T  37559970 ttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtgaattggagagatcaatctctccccctagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtc 37559872  T
Q  243 aacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  37559871 aacaatctttggtgtgtttgtt 37559850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 45644580 - 45644337
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttc 117  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||       || || |||||| | || ||||    
T  45644580 ggttggaaaacattgtaaacatcttgggtgagtgaaaatcattaagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--ggatagaaattaagttttgttc 45644483  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  45644482 tttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatatctcccccagatta 45644383  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  45644382 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgcttgtt 45644337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 10925165 - 10925411
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        || || |||||| ||||||||    
T  10925165 gggttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattga--aaaaatggatagaaattatggttgttc 10925262  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccaga 214  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||    
T  10925263 tttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaagaattcattgatagtggattggagaaatcaatctctcccctaga 10925362  T
Q  215 gtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10925363 ttaggtaaag-ttggatcgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 10925411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 15820251 - 15820455
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||         |||||||||||||| ||||||||    
T  15820251 gttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttctttggtgatattg--gaaagatgggtaaaaattaggtttgttctt 15820348  T
Q  120 tgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtagg 219  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  15820349 tgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacacatttgtatctctttttaagaactcattgatagtgcattgaagagataaatctctcatccagagtagg 15820448  T
Q  220 tcaagtt 226  Q
    |||||||    
T  15820449 tcaagtt 15820455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37033285 - 37033068
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37033285 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 37033189  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||     
T  37033188 tgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttgg 37033089  T
Q  230 accgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  37033088 accgaactgggtgaacaatct 37033068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13138196 - 13137959
Alignment:
Q  23 tgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttg 121  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||        || || |||||||| | ||||||||    
T  13138196 tgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattga---aaaatggatagaaattagg-tcgttctttg 13138101  T
Q  122 tgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtc 221  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  13138100 tgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaagaacacattgatagtggattgaagagagcaatctctcccctagagtaggtc 13138001  T
Q  222 aagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |  ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13138000 -atattggaccgaactgggtcaacaatctttgatgtgtttgtt 13137959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31925856 - 31925727
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31925856 gggtagaaattagggatgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagag 31925757  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31925756 atcaatctctcctctagagtaggtcaagtt 31925727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Original strand, 34603549 - 34603725
Alignment:
Q  49 agtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgta 148  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  34603549 agtgaaaattcatgagtgtcttgttcattggtgagattga--aaaaatgggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgta 34603646  T
Q  149 accc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34603647 acccattttttatctctttgtaagaactcattgatggtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 34603725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7482426 - 7482250
Alignment:
Q  49 agtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgta 148  Q
    ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |       ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  7482426 agtgaaaattcatgagtgtattgttcattggtgagattgggtaaat--gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgta 7482329  T
Q  149 accc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7482328 acccattttgtatctctttgtaagaactcattgatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaagtt 7482250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 246
Target Start/End: Original strand, 193596 - 193778
Alignment:
Q  61 tgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  193596 tgagtgtcttgttcattggtgagattgagaaaat--gggtagaaattagggttgttctttattagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat 193693  T
Q  161 ctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  193694 ctctttgtaataactcattgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtgaaca 193778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Original strand, 41360856 - 41361058
Alignment:
Q  18 agggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgtt 116  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||||| |||||    
T  41360856 agggttgggaaacatcgtaaacatcttgggtgagtgaaaat-attgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaat--gggtagaaattaggtttgtt 41360952  T
Q  117 ctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagt 216  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||||| ||| |||    
T  41360953 ctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattaaagagatcaatatctcccccatagt 41361052  T
Q  217 aggtca 222  Q
    ||||||    
T  41361053 aggtca 41361058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 47115127 - 47115340
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  47115127 ttgtaaacatcttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaatt--ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 47115223  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaaccc-ttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttga 229  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||     
T  47115224 ttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctctttgtaaaaacccattgatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttgg 47115323  T
Q  230 accgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||| |||||||||    
T  47115324 accgaactgggtgaaca 47115340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 48 - 257
Target Start/End: Original strand, 19752658 - 19752864
Alignment:
Q  48 gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgt 147  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19752658 gagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgagtaaaat-gggtagaaattagggttgttctttgcgagcttgttgaagctaatttcttgt 19752755  T
Q  148 aacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaa 247  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||  ||| |||||    
T  19752756 aaccgatttgtatctctttgtaagaactcattgatagaggattggagagatcaatctctctcccatattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaa 19752854  T
Q  248 tctttggtgt 257  Q
    ||||| ||||    
T  19752855 tcttttgtgt 19752864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30476594 - 30476429
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  30476594 ggtagaaattagggttgttctttatgaacttgttgaagataatttattgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatactggattggacaga 30476495  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||| | ||| |  |||| ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30476494 tcaatctctaccccatatgaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 30476429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20622388 - 20622218
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatc---tccttgtaagaactcattgatagtggactgga 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||| |||||||||||   |  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20622388 gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaa-ccttttgtatcccttttttgtaagaactctttgatagtggattgga 20622290  T
Q  194 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20622289 gagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 20622218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 9987220 - 9987373
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggaga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| |||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9987220 gggtagaaattagggttgttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaacc-ttttgtatcccttttgcaagaactcattgatagtggattggaga 9987318  T
Q  196 gatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9987319 gtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9987373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 40282395 - 40282564
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  40282395 gggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggag 40282493  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40282494 agtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtt 40282564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 264
Target Start/End: Original strand, 9036435 - 9036603
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggag 194  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| || ||    
T  9036435 gggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattgaag 9036532  T
Q  195 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9036533 agtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 9036603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 40122421 - 40122179
Alignment:
Q  22 ttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||         ||||  |||||||  |||||||||    
T  40122421 ttgggaaacattgtaaacaccttgggtgagtaaaaatcattgaatgtcttgttcatttgtgagattg--gaaaaatgggtcgaaattagatttgttcttt 40122324  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattg--atagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||| ||| || ||||||||||||| |||| | |||||||| | |||||||||||| |||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||    
T  40122323 gtgagcttgtttaagctaatttcttataactcatttgtatcactttgtaagaactctttgatatagtggattagagagatcaatctctcccccatattag 40122224  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40122223 gtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatctttggtgtgtttgtt 40122179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Original strand, 22079336 - 22079461
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22079336 ggtagaaattatgtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctctttgtaaagaactcattgatattggattggagag 22079435  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||    
T  22079436 atcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 264
Target Start/End: Original strand, 21053982 - 21054145
Alignment:
Q  103 aaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatca 200  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| |  || ||||||||||| |||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  21053982 aaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaacc-ttttgtatcccttttgtaagaactctttgatagtggattggagagtaca 21054080  T
Q  201 atctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  21054081 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtatttgtt 21054145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 928120 - 927959
Alignment:
Q  103 aaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||    
T  928120 aaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttggatctctttgtaaaaactcattaatagtggattagagagaccaa 928021  T
Q  202 tctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
     |||| | |||  |||||||||||| | ||||||| |||| |||| |  || |||||||||||    
T  928020 cctcttccccaaggtaggtcaagttag-accgaactgggtaaacatttctttgtgtgtttgtt 927959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 207
Target Start/End: Original strand, 16455664 - 16455750
Alignment:
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctc 207  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455664 gtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctgtgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctc 16455750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 147 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37876865 - 37876767
Alignment:
Q  147 taacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37876865 taacccatttgtatctctttgtaataactcattgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtgaaca 37876767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 250
Target Start/End: Original strand, 44203649 - 44203804
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  44203649 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 44203746  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44203747 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 44203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Original strand, 6808479 - 6808595
Alignment:
Q  105 attagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatc 203  Q
    |||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6808479 attaggtttgttcttggagagcttgttgaagctaacttcttgtaactcttttgtatctctttgtaaagaactcatttatagtggattggagagatcaatc 6808578  T
Q  204 tctcctccagagtaggt 220  Q
    ||| |  ||||||||||    
T  6808579 tcttcctcagagtaggt 6808595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 246
Target Start/End: Original strand, 28242382 - 28242472
Alignment:
Q  155 ttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||    
T  28242382 ttgtatctctttgtaagaactcatt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaaca 28242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37282888 - 37282714
Alignment:
Q  47 tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttctt 145  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||         |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| |     
T  37282888 tgagtgaaaaccattgagtgtcttgttcattggagagattgaaaaat----ggtataaattagggtttgttccttgtgagcttgttgaagctaatttatg 37282793  T
Q  146 gtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaa 223  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  37282792 gtaacccttttgcatctctttgtaaagaactcattagtagtggattggagagataaatctctcctttggagtaggtcaa 37282714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 3460730 - 3460841
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctc 210  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||| | |    
T  3460730 ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaacccttttgtatatctttgtaaagaacatattgatagtcgattggagagatcaatatcttc-c 3460828  T
Q  211 cagagtaggtcaa 223  Q
     ||||||||||||    
T  3460829 tagagtaggtcaa 3460841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9109543 - 9109459
Alignment:
Q  123 gaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctct 206  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9109543 gaacttgttgaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaaagaacacgttgatagtgtattggagagatcaatctct 9109459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 36683767 - 36683828
Alignment:
Q  165 ttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36683767 ttgtaagaactcattgatagtggattgtagaaatcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 36683828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44650362 - 44650173
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaatta-gggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||         |||||||||| || |||||||||||||  || || | ||||||||     
T  44650362 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgagaaaaat---gtaaaaattatggtttgttctttgtgagtttgttaacgctaattta 44650266  T
Q  144 ttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaac 236  Q
    ||||||  ||||| |||||| |||| || || ||||| |||||||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| |||| |||||||    
T  44650265 ttgtaaatcttttatatctctttgtaaataattcattaatagtggattgaagagatcaatctcttcccaaaagtaggtcaa-tttggaccgaac 44650173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37879123 - 37879006
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |        |||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37879123 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaata--ggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgt 37879027  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacc 151  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37879026 tgaagctaatttcttgtaacc 37879006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2263106 - 2263016
Alignment:
Q  115 ttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaatct 204  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  2263106 ttcttggtgagcttgttgaagataatttcttgtaacccttttatatctttttgtaaagaacttattgatagtggattgaagagatcaatct 2263016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 222
Target Start/End: Original strand, 2926528 - 2926653
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||||| |||| |||   |||||| || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || ||| |||||| ||||||| |||||||    
T  2926528 ggtagaaattaggtttgtgcttgaagaacttgttaaagttaatttattgtaacctttttgcatctctttgaaacgaattcattggtagtggattggagag 2926627  T
Q  197 atcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  2926628 atcaatctcttctgcagagtaggtca 2926653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 130 - 218
Target Start/End: Original strand, 5459958 - 5460046
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaa-gaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  5459958 ttgaagctaatttcttgtaaca-ttttatatttctttgtaaagaactcattgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 188
Target Start/End: Original strand, 32471480 - 32471571
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaag-aactcattgatagtgga 188  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  32471480 gggtataaattaggtttgttctttgagaactg-ttgaagttaatttattgcaactcttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtgga 32471571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16914325 - 16914234
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaa-tttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    |||||||||||| | |||||||| | || | | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16914325 gggtaaaaattatgtttgttcttggagagcctgttgaagctaagtttcttctaacccttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtg 16914234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 222
Target Start/End: Original strand, 13938195 - 13938281
Alignment:
Q  137 taatttcttgtaaccctttt-gtatctccttgtaagaa-ctcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccaga-gtaggtca 222  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  13938195 taatttcttgtaaccttttttgtatctctttgtaagaaactcattgatagtggattggagagatc--tctctcccccagatgtaggtca 13938281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 12318672 - 12318585
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcct-tgtaagaactcattgata 183  Q
    ||||| |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || | | ||||||||||||||||    
T  12318672 gggtagaaattaggtttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaaccattttgtatgtcttctttaagaactcattgata 12318585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4535629 - 4535527
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagag 196  Q
    |||| |||||| | |||||||| | || ||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  | |||||||    
T  4535629 ggtagaaattaagtttgttcttggagagcttattgaagtcaatttcttgtaacatttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagttaagtggagag 4535530  T
Q  197 atc 199  Q
    |||    
T  4535529 atc 4535527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 87
Target Start/End: Original strand, 16455591 - 16455633
Alignment:
Q  45 ggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattg 87  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16455591 ggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg 16455633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 44646981 - 44646939
Alignment:
Q  47 tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgag 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44646981 tgagtgaaaattattgagtgtcttgttcattggagagattgag 44646939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 186
Target Start/End: Original strand, 25652138 - 25652195
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  25652138 ttgaagctaatttcttgtaactctcttgtatctctttgtaaagaactctttgatagtg 25652195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8871130 - 8871082
Alignment:
Q  178 ttgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  8871130 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggccaagtt 8871082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Original strand, 41135839 - 41135926
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgata 183  Q
    ||||| |||||||  ||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  41135839 gggtagaaattagatttgttcttgaagaactttttgaagttaatttcttgtaaaccttttgtatctatttgtaaagaactcgttgata 41135926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1050593 - 1050503
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtg 186  Q
    |||| |||||||||  ||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| || ||||| |||||||||    
T  1050593 gggtgaaaattaggtgtgttcttcgagagcttattgaagctaatttcttgtaacatttttgtgtctctttgtaaataactcgttgatagtg 1050503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8871197 - 8871135
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgta 159  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8871197 ggtagaaattagggtttgttctttgtgagttcgttgaagctaatttcttgtaaccattttgta 8871135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 150
Target Start/End: Original strand, 36683710 - 36683762
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaac 150  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  36683710 ggtagaaattaggtttattctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaac 36683762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 434475 - 434719
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||||| |||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  434475 gggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattg-gggaaaaagggtagaaattagggttgttct 434573  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  434574 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 434673  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  434674 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatatttggtgtgtttgtt 434719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 490464 - 490359
Alignment:
Q  103 aaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    |||||| | |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |  ||||||||||     
T  490464 aaattaagtttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatatctttgtaaagtactcattgatagtgaagcggagagatcat 490365  T
Q  202 tctctc 207  Q
    ||||||    
T  490364 tctctc 490359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 144; Significance: 9e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 114545 - 114788
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |       ||||| |||||| |||||||||    
T  114545 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaa--gggtagaaattaaggttgttct 114642  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  114643 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtag 114742  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  114743 gttaagtttagaccgaactggatgaacaatctttggtgtgcttgtt 114788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 261
Target Start/End: Original strand, 859 - 1098
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  859 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattg-ggaaaaaagggtagaaattagggttgttct 956  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  957 ttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg-aacaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtag 1055  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgttt 261  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1056 gtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtgttt 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 11502 - 11744
Alignment:
Q  21 gttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttcttt 120  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |        |||| ||||||||||||||||||    
T  11502 gttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgggaaaaat--ggtagaaattagggttgttcttt 11599  T
Q  121 gtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggt 220  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11600 gtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggt 11699  T
Q  221 caagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct-ttggtgtgtttgtt 264  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11700 caagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtatttgtt 11744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11387 - 11143
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  11387 gggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttc-ttggtgagattg-ggagaaaagggtagaaattagggttgttct 11290  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11289 ttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 11190  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  11189 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 11143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8961 - 8717
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttggtgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||    
T  8961 gggttgggaaacattgtaaagaccttggtgagtgtaaaccattgagtgtcttgttc-ttggtgagattg-ggagaaaagggtagaaattagggttgttct 8864  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8863 ttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaagaactcgttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagta 8764  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8763 ggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttggtgtctttgtt 8717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20641 - 20398
Alignment:
Q  19 gggttgggaaacgttgtaaacatcttgg-tgagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttc 117  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||| |       | | | |||||||| |||||     
T  20641 gggttgggagacattgtaaacaccttgggtgagtgaaaatcattgagtttattattcattggtgagattgggaaaat--gagcagaaattaggtttgttt 20544  T
Q  118 tttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagta 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20543 tttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactctttgatattggattggagagatcaatctctcccccagatta 20444  T
Q  218 ggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20443 ggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttttggtgtgtttgtt 20398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 149322 - 149080
Alignment:
Q  20 ggttgggaaacgttgtaaacatcttggtg-agtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttct 118  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |       || || |||||||||||||| |    
T  149322 ggttgagaaacattgtaaacaccttggggtagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgagattgggaaaac--ggatagaaattagggttgtttt 149225  T
Q  119 ttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtag 218  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  149224 ttgtaagcttgttgaagctaatttcttgttacccatttatatctctttgtaagaactcattgatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtag 149125  T
Q  219 gtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatctttggtgtgtttgtt 264  Q
    || ||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  149124 gttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctttggtgtatttgtt 149080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 246
Target Start/End: Original strand, 7283 - 7494
Alignment:
Q  32 ttgtaaacatcttggt-gagtgaaaattattgagtgtcttcttcattggtgagattgagnnnnnnngggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttct 130  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||         ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  7283 ttgtaaacaccttgggagagtgaaaatcat-gagtgtcttgttcattggtgagattg--gaaaaatgggtagaaattaaggttgttctttgtgagcttgt 7379  T
Q  131 tgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |    
T  7380 tgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttgtaagaactcattgatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttgga 7478  T
Q  231 ccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||| |||||||||    
T  7479 ccgaactgggtgaaca 7494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18004
Alignment:
Q  98 ggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagaga 197  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18151 ggtagaaattagggttgttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaa-aactcattgatagtggattggagaga 18053  T
Q  198 tcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaaca 246  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  18052 tcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaaca 18004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 226
Target Start/End: Original strand, 10515 - 10637
Alignment:
Q  103 aaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtggactggagagatcaa 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10515 aaattagggtttgttctttgtgagct-cttgt-gctaatttattgtaaccattttgtatctctttgtaagaactcgttgatagtggattgaagagatcaa 10612  T
Q  202 tctctcctccagagtaggtcaagtt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10613 tctctcctccagagtaggtcaagtt 10637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 2755 - 2598
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcctt-gtaa-gaactcatt-gatagtggactgg 192  Q
    ||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  2755 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtatcccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 2658  T
Q  193 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatcttt 252  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2657 agagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatcttt 2598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 80432 - 80343
Alignment:
Q  97 gggtaaaaattagggttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaagaactcattgatagtg 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  80432 gggtagaaattagggttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgcaacccatttgtatctttttgtaagaactcatagatagtg 80343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 3841 - 3722
Alignment:
Q  133 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt---aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 228  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3841 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttg 3744  T
Q  229 aaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
     ||||||| |||||| ||||||    
T  3743 gaccgaactgggtgaccaatct 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27559 - 27466
Alignment:
Q  130 ttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgtaag-aactcattgatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtca 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27559 ttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgtaaataacttattgatagtggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtca 27466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 250
Target Start/End: Original strand, 6363 - 6445
Alignment:
Q  169 aagaactcatt-gatagtggactggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaaccgggtgaacaatct 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  6363 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 6445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 199
Target Start/End: Original strand, 25087 - 25175
Alignment:
Q  112 ttgttctttgtgaacttcttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctccttgt-aagaactcattgatagtggactggagagatc 199  Q
    |||||||||| ||  || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  25087 ttgttctttgagagtttgttgaaggtaatttcttgtaacctttttgtatctctttgtaaagaactcattgatagtgaagtagagagatc 25175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University