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Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12026_low_2 (Length: 672)

Name: NF12026_low_2
Description: NF12026
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12026_low_2
NF12026_low_2
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (17-672)||(37560750-37561405)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 628; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 628; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 672
Target Start/End: Original strand, 37560750 - 37561405
Alignment:
Q  17 caggtataacatcattctctccacgtctgtgtttccaacaatattcaacttcttcaacaacaaaattcatctattaatttattgttatatccaaacaata 116  Q
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T  37560750 caggtataacatcattctctccacgtctgtgtttccaacaatattcaacttcttcaacaacaaaattcatctattaatttattgttatatccaaacaata 37560849  T
Q  117 atacctgcattactgaaccaaaaccttacatcacacattcaacaaattcaaccacattcgtttcattggtttttcgcctttaattgcactttttcatcac 216  Q
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T  37560850 atacctgcattactgaaccaaaaccttacataacacattcaacaaattcaaccacattcgtttcattggtttttcgcctttaattgcactttttcatcac 37560949  T
Q  217 acaataatttattggcagttacaacattttccacaagttcaacgaatatttgttacaataactttaaacctaaaggtgcatgcatttgttattgatagag 316  Q
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T  37560950 acaataatttataggcagttacaacattttccacaagttcaacgaattattgttacactaactttaaacctaaaggtgcatgcatttgttattgatagag 37561049  T
Q  317 ttattaaaaggaaaattaaagttcaatgtgatgaaaattagattatgcaattttattgatgaatttcaaaggaagaagggaaatgaaaaaaccttgttat 416  Q
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T  37561050 ttattaaaaggaaaattaaagttcaatgtgatgaaaattagattatgcaattttattgatgaatttcaaaggaagaagggaaatgaaaaaaccttgttat 37561149  T
Q  417 atcgttgtttatgttattcttctttgtgctttagaaaaaggatgctcagagggcaagaggtggaaacatgatgagttttttagagatcatattggagaaa 516  Q
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T  37561150 atcgttgtttatgttattcttctttgtgctttagaaaaaggatgctcagagggcaagaggtggaaacatgatgagttttttagagatcatattggagaaa 37561249  T
Q  517 aggtatcttataagttatttatttgtaattttgattagtattctcaatgtatattgaaatagacttatatgaatttagcaaaattgttgttatgagtttg 616  Q
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T  37561250 aggtatcttataagttatttatttgtaattttgattagtattctcaatgtatattgaaatagacttatatgaattcaacaaaattgttgttatgagtttg 37561349  T
Q  617 attatgttattttgtctagtctactataatttaccatgtaactattgtgaaatgta 672  Q
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T  37561350 attatgttattttgtctagtctactataatttaccatgtaactattgtgaaatgta 37561405  T

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