View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12027_high_1 (Length: 800)

Name: NF12027_high_1
Description: NF12027
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12027_high_1
NF12027_high_1
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (6-800)||(44725525-44726304)
chr7 (66-485)||(24749494-24749912)
chr7 (121-482)||(28486475-28486835)
chr7 (17-485)||(21678966-21679432)
chr7 (8-485)||(9679565-9680038)
chr7 (66-528)||(24815991-24816448)
chr7 (572-800)||(1048399-1048627)
chr7 (572-800)||(7350761-7350989)
chr7 (572-800)||(22135753-22135981)
chr7 (572-800)||(40550780-40551008)
chr7 (572-800)||(38394934-38395162)
chr7 (189-482)||(4293803-4294095)
chr7 (572-800)||(31157395-31157623)
chr7 (8-303)||(38395374-38395667)
chr7 (327-532)||(7093348-7093553)
chr7 (572-800)||(36400-36628)
chr7 (572-800)||(7093571-7093799)
chr7 (327-532)||(1048176-1048381)
chr7 (327-532)||(7350538-7350743)
chr7 (327-532)||(31157172-31157377)
chr7 (327-532)||(22135999-22136205)
chr7 (327-532)||(40551026-40551232)
chr7 (327-532)||(38395180-38395385)
chr7 (68-389)||(44011476-44011797)
chr7 (121-329)||(1048006-1048213)
chr7 (9-329)||(20298343-20298642)
chr7 (121-329)||(22136168-22136374)
chr7 (121-329)||(40551195-40551401)
chr7 (121-303)||(7093178-7093359)
chr7 (123-299)||(43633-43808)
chr7 (327-482)||(7471204-7471359)
chr7 (121-329)||(7350370-7350575)
chr7 (121-329)||(7471034-7471241)
chr7 (327-485)||(20298222-20298380)
chr7 (121-329)||(31157003-31157209)
chr7 (572-795)||(24816470-24816703)
chr7 (406-532)||(36646-36772)
chr7 (572-798)||(26213671-26213900)
chr7 (626-794)||(48490284-48490455)
chr7 (605-798)||(6047436-6047632)
chr7 (90-456)||(47674742-47675104)
chr7 (631-794)||(6593656-6593822)
chr7 (114-487)||(48490578-48490945)
chr7 (92-520)||(6047689-6048110)
chr7 (634-794)||(18391297-18391460)
chr7 (200-394)||(18390883-18391074)
chr7 (573-798)||(13289611-13289835)
chr7 (200-394)||(6593245-6593436)
chr7 (626-794)||(47675255-47675426)
chr7 (327-411)||(43556-43640)
chr7 (68-249)||(26214193-26214373)
chr7 (287-394)||(1560762-1560869)
chr7 (9-105)||(43807-43902)
chr7 (6-102)||(7093083-7093178)
chr7 (686-785)||(18412835-18412934)
chr7 (470-530)||(26213920-26213980)
chr7 (698-785)||(7070644-7070731)
chr7 (686-785)||(9185968-9186067)
chr7 (686-767)||(21645202-21645283)
chr7 (686-779)||(21988097-21988190)
chr7 (9-102)||(28486835-28486927)
chr7 (698-785)||(3324032-3324119)
chr7 (6-102)||(7470939-7471034)
chr7 (690-785)||(16884108-16884203)
chr7 (690-785)||(24262134-24262229)
chr7 (698-785)||(25352201-25352288)
chr7 (698-785)||(25406263-25406350)
chr7 (686-731)||(5818051-5818096)
chr7 (9-56)||(1047914-1047961)
chr7 (478-532)||(13289539-13289593)
chr7 (68-153)||(6067995-6068080)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (6-532)||(34745-35270)
scaffold0011 (572-800)||(34491-34727)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (6-532)||(21519262-21519786)
chr2 (6-485)||(31733786-31734260)
chr2 (6-485)||(6263059-6263535)
chr2 (572-800)||(19503446-19503674)
chr2 (572-800)||(35217080-35217308)
chr2 (572-800)||(36560251-36560479)
chr2 (327-532)||(35216857-35217062)
chr2 (327-532)||(19503223-19503428)
chr2 (121-329)||(35216687-35216894)
chr2 (327-519)||(36560031-36560223)
chr2 (221-425)||(22402266-22402470)
chr2 (572-800)||(21519804-21520032)
chr2 (121-320)||(36559862-36560059)
chr2 (121-303)||(19503053-19503234)
chr2 (90-532)||(28569073-28569512)
chr2 (66-226)||(22404969-22405129)
chr2 (114-457)||(14634627-14634966)
chr2 (573-798)||(28569531-28569761)
chr2 (332-445)||(41304109-41304222)
chr2 (686-779)||(25402827-25402920)
chr2 (698-773)||(17932982-17933057)
chr2 (626-794)||(42019007-42019178)
chr2 (332-392)||(42018734-42018794)
chr2 (690-785)||(19348458-19348553)
chr2 (698-785)||(20054005-20054092)
chr2 (698-785)||(39680895-39680982)
chr2 (698-785)||(2737054-2737141)
chr2 (686-785)||(10446248-10446347)
chr2 (90-240)||(41303933-41304082)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (6-532)||(18097736-18098260)
chr3 (6-485)||(3315559-3316036)
chr3 (6-485)||(53916578-53917055)
chr3 (22-485)||(28100928-28101389)
chr3 (23-485)||(890827-891288)
chr3 (125-485)||(42991176-42991535)
chr3 (6-485)||(43422375-43422851)
chr3 (66-532)||(23634596-23635059)
chr3 (572-800)||(456827-457055)
chr3 (572-800)||(6064903-6065131)
chr3 (572-800)||(5192570-5192798)
chr3 (572-800)||(18098278-18098509)
chr3 (572-800)||(10957433-10957661)
chr3 (327-532)||(43227246-43227451)
chr3 (572-800)||(11169021-11169249)
chr3 (327-532)||(457073-457278)
chr3 (327-532)||(10957210-10957415)
chr3 (572-800)||(43226997-43227228)
chr3 (333-532)||(6064686-6064885)
chr3 (8-303)||(28138147-28138440)
chr3 (327-532)||(11169267-11169472)
chr3 (572-800)||(4309617-4309848)
chr3 (572-800)||(5898329-5898560)
chr3 (327-532)||(5898578-5898783)
chr3 (327-532)||(4309394-4309599)
chr3 (123-329)||(5898746-5898951)
chr3 (123-329)||(4309226-4309431)
chr3 (134-458)||(25634738-25635058)
chr3 (9-329)||(43227414-43227713)
chr3 (121-329)||(457241-457447)
chr3 (123-329)||(6064513-6064717)
chr3 (121-329)||(11169435-11169642)
chr3 (656-785)||(5192816-5192945)
chr3 (602-794)||(15830335-15830530)
chr3 (572-800)||(23634365-23634578)
chr3 (90-427)||(23198742-23199076)
chr3 (605-798)||(7769477-7769673)
chr3 (172-329)||(10957090-10957247)
chr3 (627-794)||(23199257-23199427)
chr3 (90-423)||(5258926-5259256)
chr3 (572-794)||(15821753-15821974)
chr3 (90-427)||(7763500-7763833)
chr3 (114-487)||(29812043-29812409)
chr3 (626-794)||(7763150-7763321)
chr3 (631-794)||(4599842-4600008)
chr3 (90-487)||(32892262-32892652)
chr3 (626-794)||(29811748-29811919)
chr3 (626-794)||(37407568-37407739)
chr3 (631-794)||(10057124-10057290)
chr3 (631-794)||(10059346-10059512)
chr3 (631-794)||(10061568-10061734)
chr3 (631-794)||(10063790-10063956)
chr3 (631-794)||(10066012-10066178)
chr3 (631-794)||(10210080-10210246)
chr3 (627-794)||(32891969-32892138)
chr3 (686-794)||(5259503-5259611)
chr3 (686-794)||(9635304-9635412)
chr3 (605-800)||(27421558-27421755)
chr3 (626-779)||(6717407-6717563)
chr3 (90-394)||(4599321-4599622)
chr3 (6-144)||(35918802-35918939)
chr3 (200-394)||(6717774-6717965)
chr3 (200-394)||(10210463-10210654)
chr3 (200-394)||(10057510-10057701)
chr3 (200-394)||(10059732-10059923)
chr3 (200-394)||(10061954-10062145)
chr3 (200-394)||(10064176-10064367)
chr3 (200-394)||(10066398-10066589)
chr3 (306-530)||(27421807-27422028)
chr3 (202-442)||(1619605-1619844)
chr3 (224-442)||(7769766-7769982)
chr3 (572-643)||(35918946-35919017)
chr3 (712-794)||(22834215-22834297)
chr3 (69-182)||(1619491-1619603)
chr3 (698-779)||(10612022-10612103)
chr3 (686-785)||(9602657-9602756)
chr3 (686-785)||(16263540-16263639)
chr3 (690-785)||(28489985-28490080)
chr3 (8-104)||(42991537-42991632)
chr3 (698-785)||(47882133-47882220)
chr3 (698-785)||(54189359-54189446)
chr3 (9-105)||(4309137-4309227)
chr3 (9-102)||(10956974-10957066)
chr3 (686-785)||(3324359-3324458)
chr3 (698-785)||(6304160-6304247)
chr3 (690-785)||(8516275-8516370)
chr3 (698-785)||(10204936-10205023)
chr3 (698-785)||(10897854-10897941)
chr3 (698-785)||(22625224-22625311)
chr3 (698-785)||(29913200-29913287)
chr3 (690-785)||(32479521-32479616)
chr3 (699-785)||(10098041-10098127)
chr3 (332-442)||(15824698-15824808)
chr3 (9-102)||(11169642-11169734)
chr3 (332-397)||(27900211-27900276)
chr3 (332-395)||(27882632-27882695)
[»] chr4 (65 HSPs)
chr4 (6-532)||(5099724-5100246)
chr4 (123-532)||(22133301-22133709)
chr4 (6-485)||(14788337-14788814)
chr4 (6-526)||(12401661-12402179)
chr4 (33-482)||(47563710-47564158)
chr4 (6-485)||(16454255-16454734)
chr4 (8-483)||(36379180-36379653)
chr4 (200-532)||(12399578-12399910)
chr4 (6-329)||(22801676-22801997)
chr4 (6-329)||(36920437-36920758)
chr4 (572-800)||(22781847-22782075)
chr4 (66-389)||(36770499-36770822)
chr4 (572-800)||(16933258-16933486)
chr4 (34-327)||(24879622-24879913)
chr4 (572-800)||(11007678-11007906)
chr4 (572-800)||(22133727-22133955)
chr4 (327-532)||(22781624-22781829)
chr4 (572-800)||(22045825-22046053)
chr4 (577-800)||(9175587-9175810)
chr4 (327-532)||(22045601-22045807)
chr4 (327-532)||(16933035-16933240)
chr4 (327-530)||(11007455-11007658)
chr4 (327-532)||(9175360-9175565)
chr4 (572-800)||(12399928-12400160)
chr4 (572-800)||(12402203-12402434)
chr4 (12-423)||(10113857-10114262)
chr4 (121-329)||(22045431-22045638)
chr4 (121-329)||(22781455-22781661)
chr4 (121-320)||(11007286-11007483)
chr4 (121-329)||(9175190-9175397)
chr4 (121-320)||(16932866-16933063)
chr4 (7-329)||(18535749-18536066)
chr4 (327-485)||(22801960-22802118)
chr4 (66-364)||(47565681-47565978)
chr4 (327-482)||(36920721-36920876)
chr4 (6-177)||(12396719-12396888)
chr4 (626-780)||(12740850-12741007)
chr4 (626-794)||(52094480-52094651)
chr4 (631-794)||(5136971-5137137)
chr4 (626-780)||(12749056-12749213)
chr4 (572-798)||(26558584-26558813)
chr4 (114-487)||(34571229-34571593)
chr4 (686-794)||(7123587-7123695)
chr4 (686-794)||(8394297-8394405)
chr4 (90-436)||(12740336-12740679)
chr4 (90-436)||(12748542-12748885)
chr4 (169-394)||(8394683-8394905)
chr4 (200-394)||(5137357-5137548)
chr4 (200-394)||(7123973-7124164)
chr4 (693-794)||(5872694-5872795)
chr4 (572-680)||(5099598-5099706)
chr4 (326-520)||(26558843-26559034)
chr4 (327-389)||(18536029-18536091)
chr4 (312-390)||(47565620-47565698)
chr4 (686-794)||(4588831-4588939)
chr4 (330-442)||(3577934-3578046)
chr4 (686-794)||(5206844-5206952)
chr4 (686-785)||(5147078-5147177)
chr4 (686-785)||(15313167-15313266)
chr4 (8-100)||(22133206-22133297)
chr4 (698-785)||(9225215-9225302)
chr4 (126-249)||(54881989-54882111)
chr4 (6-56)||(16932771-16932821)
chr4 (406-458)||(18536807-18536859)
chr4 (698-773)||(4559067-4559142)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (6-532)||(28202265-28202789)
chr1 (7-481)||(50077699-50078171)
chr1 (94-482)||(6996485-6996872)
chr1 (6-485)||(31423940-31424415)
chr1 (6-485)||(16429846-16430322)
chr1 (6-368)||(14098829-14099189)
chr1 (572-800)||(16227109-16227337)
chr1 (572-800)||(51750978-51751206)
chr1 (572-800)||(47178303-47178531)
chr1 (572-800)||(20301072-20301300)
chr1 (6-387)||(25249556-25249935)
chr1 (574-800)||(28841363-28841589)
chr1 (327-532)||(20301318-20301523)
chr1 (69-532)||(13126369-13126826)
chr1 (327-532)||(51751224-51751429)
chr1 (327-532)||(27338017-27338222)
chr1 (327-532)||(16227355-16227560)
chr1 (572-800)||(27338240-27338471)
chr1 (572-800)||(28202807-28203037)
chr1 (327-532)||(47178549-47178754)
chr1 (272-485)||(29003139-29003352)
chr1 (272-474)||(28997423-28997625)
chr1 (121-329)||(51751392-51751599)
chr1 (121-320)||(47178726-47178924)
chr1 (6-329)||(27337752-27338054)
chr1 (123-303)||(31736531-31736710)
chr1 (121-329)||(16227523-16227729)
chr1 (121-329)||(20301486-20301693)
chr1 (327-485)||(31736699-31736857)
chr1 (572-798)||(8348178-8348407)
chr1 (344-493)||(28841615-28841764)
chr1 (123-281)||(28841760-28841917)
chr1 (572-795)||(13126844-13127070)
chr1 (626-794)||(31658083-31658254)
chr1 (574-778)||(3805240-3805447)
chr1 (118-441)||(50167982-50168302)
chr1 (626-794)||(50168468-50168639)
chr1 (626-794)||(28222539-28222710)
chr1 (331-514)||(31658287-31658467)
chr1 (114-487)||(776246-776613)
chr1 (389-485)||(25250566-25250662)
chr1 (409-532)||(8348039-8348160)
chr1 (169-514)||(28222106-28222443)
chr1 (90-363)||(13548287-13548556)
chr1 (741-800)||(51758475-51758534)
chr1 (6-107)||(25127081-25127181)
chr1 (626-785)||(775961-776123)
chr1 (6-105)||(28841916-28842014)
chr1 (6-105)||(31736434-31736532)
chr1 (91-187)||(31928880-31928975)
chr1 (686-785)||(19359649-19359748)
chr1 (690-785)||(41397420-41397515)
chr1 (6-56)||(16227774-16227824)
chr1 (90-182)||(19753440-19753532)
chr1 (9-56)||(51751644-51751691)
chr1 (169-234)||(31658561-31658626)
chr1 (686-731)||(47099683-47099728)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (6-532)||(20504770-20505295)
chr5 (22-485)||(27911330-27911791)
chr5 (6-482)||(658919-659394)
chr5 (6-485)||(18510318-18510795)
chr5 (123-532)||(18467874-18468282)
chr5 (6-485)||(20043870-20044346)
chr5 (572-800)||(10750639-10750867)
chr5 (572-800)||(15355959-15356187)
chr5 (572-800)||(23665987-23666215)
chr5 (572-800)||(34478529-34478757)
chr5 (226-463)||(25806350-25806587)
chr5 (572-800)||(31543674-31543902)
chr5 (327-532)||(15355736-15355941)
chr5 (572-800)||(18467625-18467856)
chr5 (327-532)||(34478306-34478511)
chr5 (327-532)||(23666233-23666439)
chr5 (572-800)||(6746009-6746240)
chr5 (327-532)||(6746258-6746463)
chr5 (327-532)||(31543920-31544125)
chr5 (340-532)||(10750885-10751077)
chr5 (572-800)||(20505313-20505544)
chr5 (251-485)||(31467036-31467274)
chr5 (121-329)||(31544088-31544295)
chr5 (6-303)||(6746452-6746728)
chr5 (121-329)||(34478137-34478343)
chr5 (121-329)||(23666402-23666608)
chr5 (121-329)||(15355566-15355773)
chr5 (121-303)||(10756275-10756455)
chr5 (6-225)||(31466815-31467031)
chr5 (6-147)||(41586911-41587051)
chr5 (626-794)||(16408214-16408385)
chr5 (626-794)||(29721254-29721425)
chr5 (631-794)||(16545319-16545485)
chr5 (90-394)||(29721636-29721939)
chr5 (631-794)||(40380995-40381161)
chr5 (626-794)||(9788339-9788510)
chr5 (91-394)||(16545705-16546005)
chr5 (90-514)||(13487171-13487588)
chr5 (626-794)||(13486904-13487075)
chr5 (626-794)||(42427549-42427720)
chr5 (90-427)||(26174010-26174344)
chr5 (326-427)||(16408565-16408666)
chr5 (626-746)||(26173707-26173830)
chr5 (90-394)||(40381381-40381682)
chr5 (90-263)||(13295033-13295204)
chr5 (331-436)||(42427276-42427381)
chr5 (626-736)||(534675-534788)
chr5 (90-436)||(534956-535299)
chr5 (9-105)||(18468281-18468376)
chr5 (686-798)||(32584731-32584843)
chr5 (626-794)||(13694259-13694430)
chr5 (690-778)||(43596302-43596390)
chr5 (690-778)||(43629096-43629184)
chr5 (690-785)||(27449003-27449098)
chr5 (698-773)||(28788583-28788658)
chr5 (690-785)||(31397803-31397898)
chr5 (690-785)||(33790496-33790591)
chr5 (690-785)||(37557435-37557530)
chr5 (688-785)||(24556396-24556493)
chr5 (688-785)||(24597428-24597525)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (6-485)||(50916-51393)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (6-473)||(41383618-41384082)
chr8 (6-377)||(15071820-15072187)
chr8 (573-800)||(43080598-43080825)
chr8 (572-800)||(18811704-18811932)
chr8 (572-800)||(27827981-27828209)
chr8 (116-502)||(21481435-21481818)
chr8 (327-532)||(43080844-43081049)
chr8 (572-800)||(15069563-15069794)
chr8 (327-532)||(18811950-18812155)
chr8 (327-532)||(27828227-27828432)
chr8 (121-303)||(18812144-18812324)
chr8 (121-329)||(43081012-43081218)
chr8 (121-303)||(27828421-27828602)
chr8 (373-532)||(15069812-15069971)
chr8 (309-532)||(31577171-31577391)
chr8 (90-427)||(34255109-34255443)
chr8 (628-798)||(31577457-31577630)
chr8 (273-520)||(17848783-17849026)
chr8 (626-794)||(34255623-34255794)
chr8 (572-794)||(17848528-17848753)
chr8 (626-779)||(41366111-41366267)
chr8 (22-252)||(31574489-31574714)
chr8 (90-442)||(41365619-41365965)
chr8 (626-794)||(4732537-4732708)
chr8 (169-436)||(4732851-4733116)
chr8 (626-758)||(29542943-29543078)
chr8 (712-794)||(5591764-5591846)
chr8 (686-779)||(18853980-18854073)
chr8 (686-785)||(26300515-26300614)
chr8 (6-56)||(21481856-21481906)
chr8 (698-785)||(4819484-4819571)
chr8 (690-785)||(10685075-10685170)
chr8 (698-785)||(16756505-16756592)
chr8 (90-245)||(17849079-17849233)
chr8 (698-785)||(28328757-28328844)
chr8 (690-785)||(35744571-35744666)
chr8 (699-785)||(33033489-33033575)
chr8 (686-785)||(23800328-23800427)
chr8 (698-785)||(28891613-28891700)
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (66-485)||(3630906-3631324)
chr6 (6-435)||(3395260-3395687)
chr6 (572-800)||(26067505-26067733)
chr6 (8-329)||(15533541-15533862)
chr6 (572-800)||(33309830-33310058)
chr6 (327-532)||(26067282-26067487)
chr6 (327-532)||(33310076-33310281)
chr6 (121-329)||(33310244-33310450)
chr6 (121-329)||(26067115-26067319)
chr6 (327-485)||(15533825-15533983)
chr6 (607-796)||(25462608-25462800)
chr6 (115-442)||(11137349-11137673)
chr6 (90-394)||(16652203-16652504)
chr6 (139-427)||(16568196-16568480)
chr6 (68-520)||(30444489-30444936)
chr6 (90-394)||(16553941-16554242)
chr6 (90-394)||(16630497-16630798)
chr6 (605-798)||(30444236-30444432)
chr6 (572-767)||(12158225-12158423)
chr6 (631-794)||(16553555-16553721)
chr6 (631-794)||(16630111-16630277)
chr6 (631-794)||(16651816-16651982)
chr6 (631-794)||(34165763-34165929)
chr6 (312-427)||(5407899-5408014)
chr6 (312-427)||(5412224-5412339)
chr6 (345-442)||(26944465-26944562)
chr6 (686-794)||(5408250-5408358)
chr6 (686-794)||(5412575-5412683)
chr6 (686-794)||(16567865-16567973)
chr6 (90-187)||(26944599-26944696)
chr6 (200-394)||(34166149-34166340)
chr6 (66-161)||(28038629-28038724)
chr6 (6-57)||(3630828-3630879)
chr6 (698-785)||(17694096-17694183)
chr6 (698-785)||(5165088-5165175)
chr6 (698-785)||(13879588-13879675)
chr6 (690-785)||(14738383-14738478)
chr6 (698-785)||(25942518-25942605)
chr6 (690-785)||(33331257-33331352)
chr6 (332-397)||(10456494-10456559)
chr6 (326-397)||(11722602-11722673)
chr6 (229-264)||(17012969-17013004)
chr6 (698-785)||(22350216-22350303)
[»] scaffold1899 (3 HSPs)
scaffold1899 (572-800)||(565-793)
scaffold1899 (327-532)||(811-1016)
scaffold1899 (121-329)||(979-1186)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (572-800)||(23067-23295)
scaffold0140 (327-532)||(23313-23519)
scaffold0140 (121-329)||(23482-23689)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (572-800)||(72624-72855)
scaffold0025 (6-303)||(70150-70426)
scaffold0025 (394-532)||(72468-72606)
scaffold0025 (327-389)||(70415-70477)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (298-485)||(80764-80951)
[»] scaffold1674 (2 HSPs)
scaffold1674 (327-485)||(675-833)
scaffold1674 (127-329)||(511-712)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (6-198)||(3969-4157)
scaffold0133 (229-264)||(26228-26263)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (626-794)||(115482-115653)
scaffold0016 (337-427)||(115830-115920)
[»] scaffold1908 (2 HSPs)
scaffold1908 (292-501)||(525-728)
scaffold1908 (687-794)||(245-352)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (698-785)||(17174-17261)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (686-794)||(26597-26705)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (686-785)||(4005-4104)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (686-779)||(18756-18849)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (690-785)||(15120-15215)
[»] scaffold0355 (1 HSPs)
scaffold0355 (690-785)||(688-783)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 571; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 44726304 - 44725525
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44726304 aggacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttgaccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 44726206  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  44726205 cggaatgccttccatcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcataacacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 44726106  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  44726105 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtatca 44726006  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44726005 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcttctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccgctccact 44725906  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725905 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 44725806  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggacagttaaagcattctctacctccaccatcttgtgacagttaccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttga 605  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 |||||||||||||||||||||    
T  44725805 tgcggagttaccattaatctctagacagttaaagcattctctacctccaccatcttgtgaca-----------------gttaaagcattcagaccttga 44725723  T
Q  606 cttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatga---gtcaagtccttggacttg 702  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  44725722 cttgttaccactctttctccggttacctctacctccatcattccctcttaagacacttaggccttcaccgtgttcatgaactctcaagtccttggacttg 44725623  T
Q  703 gtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44725622 gtcaacttcttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 44725525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 66 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24749912 - 24749494
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  24749912 agggtaatcccgcaagtcatgctatacattcttcaacctccggaatgccttccgtctttatgaagaaatctcttgctcacca-tagagcatagcatccaa 24749814  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24749813 ggtcctccatagacgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagtgtactctaccttaactagaaaatgcatacatcccactatgtcttca 24749714  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatg 365  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24749713 accttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgcatccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatg 24749614  T
Q  366 ttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacacca 465  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  24749613 ttgagtgtttaatgtctctccagatgacaaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcttccaaacaacaccacacca 24749514  T
Q  466 tcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  24749513 tcagagcacccacatcctca 24749494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 121 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 28486835 - 28486475
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28486835 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 28486737  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  28486736 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtatttttgcctccgcctctc 28486637  T
Q  321 aagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaa 420  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||    
T  28486636 cagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccacaaggcatcaatctcaa 28486537  T
Q  421 ggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28486536 ggtgagacacatcaccttcttcattctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcc 28486475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 21679432 - 21678966
Alignment:
Q  17 cgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttctt 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  21679432 cgcttccttgaaggtcaccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaaccttcggaatatctt 21679334  T
Q  117 ccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21679333 ccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagccgtaccattactggtgtgttcaactccacctcacgctg 21679235  T
Q  217 agcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcc 316  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  21679234 agtgtactctacctcaactagaaaatgtgtatatcccattatgtcttcaaccttgaaactccatcttaacaagtagatcatgagtattggttcctccgcc 21679135  T
Q  317 tctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactc 416  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21679134 tctccgaactgatcatgagtattcttaccaccgcgtctcctggatgatgttgagtgtttagcgtctctccagatgaccaccgctccactaggcatcattc 21679035  T
Q  417 ccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  21679034 tcaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacactacgccatcagagtacccgcatcctca 21678966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 9680038 - 9679565
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccg 107  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||||||    
T  9680038 gacatctcccgcttccttgaaggtctccatgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcctgcaagtagtgttatacattcttcaacctccg 9679940  T
Q  108 aaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccac 207  Q
    ||||   ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  9679939 aaatgcattccgtcttcatgaaaaaatctctttctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagcagtaccattaccggtgt--tcaactccac 9679843  T
Q  208 ctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgtt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| || |||||||||||| |||    
T  9679842 ctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaagttgatcatgagtattgtt 9679743  T
Q  308 gcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactag 407  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9679742 gcctccacctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctcttcaggatgatgttgagtttttaacgtctctccagacaaccaccgctccactag 9679643  T
Q  408 gcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  9679642 gtatcactcctaaggtgagacacatcatcttcttcatcctccaaacaacaccacaccataagaacactcacatcctca 9679565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 66 - 528
Target Start/End: Original strand, 24815991 - 24816448
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  24815991 agggtaatcccgcaagctatgctatacattcttcaacctccgaaataccttccttcttcatgaagaa-tcccttgctcaccactagagcatagcacccga 24816089  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    ||||| || |||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24816090 ggtccaccgtagtcgtaccattctcggtgtgttcaactccacctcaagctgagcgtactctacttcaactagcaaatgcatacatcccactatgtcttcc 24816189  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatg 365  Q
    || || ||||| |||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  24816190 accttgaaactccacctcaa-atgtagatcatgggtattgttacctccgcctctccaaagtgaccatgagtattcttaccaccgtctcttcaggctgatg 24816288  T
Q  366 ttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacacca 465  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||   ||||    
T  24816289 ttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctctacaaggcatcactcccaaggtgagacacatcacattcttcatcctccaaacaacac---acca 24816385  T
Q  466 tcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccg 528  Q
     || ||||   | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816386 ccaaagcatttgaatcctcataaccctcagagactatttgtgcggagttaccattaatctccg 24816448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 1048399 - 1048627
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1048399 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 1048498  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1048499 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 1048598  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048599 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 1048627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 7350761 - 7350989
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7350761 ccatcttgtgacagttaaagcattcaagccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 7350860  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7350861 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 7350960  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350961 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 7350989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22135981 - 22135753
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22135981 ccatcttatgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 22135882  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22135881 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 22135782  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135781 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 22135753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 40551008 - 40550780
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40551008 ccatcttatgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 40550909  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40550908 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 40550809  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40550808 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 40550780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 38395162 - 38394934
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  38395162 ccatcttgtgacaattaaagcattcaaaccttgacttgttaccactctttctccggttacctatacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 38395063  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38395062 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 38394963  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394962 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 38394934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 189 - 482
Target Start/End: Original strand, 4293803 - 4294095
Alignment:
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  4293803 ccggtgtgttcaactccacctcaagcttagcgtactctacctaaactagcaaatgcgta-atcgtactatgtcttcaaccttgaaactccagctcaacag 4293901  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4293902 gtagatcatgagtattgttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttgtcaccacctctccaggctgatgttgagtgtttaatgtctctccag 4294001  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    | || |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294002 acgaccaccgctccactaggcatcattctcaagttgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 4294095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 31157395 - 31157623
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157395 ccatgttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 31157494  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31157495 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttagttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 31157594  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31157595 atgatatctttgaacgattcaaaagattt 31157623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38395667 - 38395374
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccg 107  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||        ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38395667 gacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcatgcttggccttttttt-agggtaatcccacaagccgtgctatacattcttcaacctccg 38395569  T
Q  108 aaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccac 207  Q
     |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  38395568 gaatgccttccgtcttcatgaagaaatcgcttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccac 38395470  T
Q  208 ctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38395469 ctcacgctgagcgtaccctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaaccccacctcaacaggtagatcatgagtat 38395374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 7093348 - 7093553
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093348 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 7093447  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093448 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 7093547  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  7093548 cggaca 7093553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36400
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  36628 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgttaccgctctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 36529  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36528 atcgtgttcatgagtcaagtccttggagttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 36429  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36428 atggtatttttgaacgattcaaaagattt 36400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 7093571 - 7093799
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  7093571 ccatcttgtgacagttaaagcattcaggttttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccgttccctcttgagacacttaggccttc 7093670  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7093671 accatgttcatgggtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 7093770  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7093771 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 7093799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 1048176 - 1048381
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1048176 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 1048275  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1048276 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 1048375  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  1048376 cggaca 1048381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 7350538 - 7350743
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7350538 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 7350637  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7350638 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 7350737  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  7350738 cggaca 7350743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 31157172 - 31157377
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31157172 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacatctctccagacgaccaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 31157271  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31157272 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagataatttgtgcggagttaccattaatctc 31157371  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  31157372 cggaca 31157377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 22136205 - 22135999
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac-accgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22136205 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgacccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtga 22136106  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatct 525  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22136105 gacacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatct 22136006  T
Q  526 ccggaca 532  Q
    |||||||    
T  22136005 ccggaca 22135999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40551232 - 40551026
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac-accgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40551232 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgacccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtga 40551133  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatct 525  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40551132 gacacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatct 40551033  T
Q  526 ccggaca 532  Q
    |||||||    
T  40551032 ccggaca 40551026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 38395385 - 38395180
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38395385 gatcatgagtattcttaccaccgtctctccaggctgatgttgagtgtttaacttctctctagacgaccaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 38395286  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38395285 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaacctc 38395186  T
Q  527 cggaca 532  Q
     |||||    
T  38395185 tggaca 38395180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 68 - 389
Target Start/End: Original strand, 44011476 - 44011797
Alignment:
Q  68 ggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaagg 167  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  44011476 ggtaatcccacaagccatgttatacattcttcaacctccggaataccttccatcttcatgaagaattcccttgctcacaactacagcatagcacccaagg 44011575  T
Q  168 tcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctc--aactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| || |||| |  ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||     
T  44011576 ttctccatagtcgtaccatttccggtgtgttcgactccacctcaagcagagctt--tctacctcttaactagcaaatacgtacatcacactatatcttcc 44011673  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatg 365  Q
    || || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44011674 accttgaaactccacttcaataggtagatcatgagtactgttacctccgcctctccagactgaccatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatg 44011773  T
Q  366 ttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44011774 ttgagtgtttaacgtctctccaga 44011797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 1048006 - 1048213
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1048006 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 1048104  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  1048105 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 1048204  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  1048205 caggctgat 1048213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20298642 - 20298343
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccga 108  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20298642 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcactcttggccttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc--- 20298547  T
Q  109 aatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacc 208  Q
                    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20298546 ----------------atgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggttctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacc 20298464  T
Q  209 tcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  20298463 tcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatctcactatgtcttccaccttgaaactccacatcaacaggtagatcatgagtattgtta 20298364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22136374 - 22136168
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22136374 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 22136277  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  22136276 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 22136177  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  22136176 caggctgat 22136168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40551401 - 40551195
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40551401 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 40551304  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  40551303 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 40551204  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  40551203 caggctgat 40551195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Original strand, 7093178 - 7093359
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  7093178 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgttgagcg 7093276  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7093277 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatctcactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 7093359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43808 - 43633
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43808 tcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccatctcacgctgagcgta 43710  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  43709 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactcaacctcaacaggtagatcatga 43633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 327 - 482
Target Start/End: Original strand, 7471204 - 7471359
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7471204 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccgctccactaggcatcactctcaaggtgag 7471303  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471304 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 7471359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 7350370 - 7350575
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7350370 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccagtg-gttcaactccacctcacgctgagcg 7350466  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  7350467 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 7350566  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  7350567 caggctgat 7350575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 7471034 - 7471241
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7471034 cttcatgaagaaatcccttgctcccca-tagagcatagcacccaaggtcttccataatcgtatcattaccggtgtgttcaaccccacctcacgctgagcg 7471132  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  7471133 tactctgcctcaactagcaaatgcgtacatcccactttgtcttcaaccttgaaactccaccacaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 7471232  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  7471233 caggctgat 7471241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 327 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20298380 - 20298222
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20298380 gatcatgagtattgttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgttccactaggcatcactcccaaggtgag 20298281  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20298280 acatatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 20298222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 31157003 - 31157209
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31157003 cttcatgaagaaattccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattacaggtgtgttcaagtccacctcacgctgagcg 31157100  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||    
T  31157101 tactctacctcaactagaaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaagtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 31157200  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  31157201 caggctgat 31157209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 572 - 795
Target Start/End: Original strand, 24816470 - 24816703
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  24816470 ccatcttgttacagttaaatcatttaaaccttgacttgttaccactttttctacgattacctctacctccaccgttccctcttgaaacacttatgccttc 24816569  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttcctt------- 761  Q
     |||| ||||| ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||           
T  24816570 cccgttttcatcagctttcaagttcttggactgggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttcttttccatag 24816669  T
Q  762 gccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaa 795  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816670 tccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaa 24816703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 406 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36772 - 36646
Alignment:
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36772 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccattagagcacctacatcctcataaccctcatagacaatttg 36673  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36672 tgcggagttaccattaatctccggaca 36646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 572 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 26213900 - 26213671
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | |  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||    
T  26213900 ccatcttgtgacagttaaagcacttaaaatttaacttgttaccactctttccccgattacctctacctccaccattacctcttgaaacactaaggccttc 26213801  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    ||| | ||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||    
T  26213800 accattttcataagctctcaagtccttggacttggtcagctcattggttcttaaagccacttgaacttcttccatggtgacagtgccttctttgccatag 26213701  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
    | ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26213700 atcatggtattcttgaaggattcaaaagat 26213671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 48490455 - 48490284
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48490455 ggtttcctttacctccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 48490356  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  48490355 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 48490284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 605 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 6047632 - 6047436
Alignment:
Q  605 acttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgagt---caagtccttggactt 701  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||| | ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||| |||   ||||| |||||||||    
T  6047632 acttgttaccactctttccccgattacctttacctccactagtccctctcgagacacttaggcgttcaccgttttcatcagttctcaagttcttggactt 6047533  T
Q  702 ggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6047532 ggtaaactcgttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatatagaatggtatccttgaaggattcaaaagat 6047436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 456
Target Start/End: Original strand, 47674742 - 47675104
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    |||||||||||| | | | ||| ||||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||| ||| |||| |    
T  47674742 tacattcttcaaaccctggaatgtcttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcatatcactcaagg-ccaccatagttgtaccattcc 47674840  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacagg 289  Q
     |||||  | |||||||||| | | ||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||| || ||||| || |||    
T  47674841 aggtgtcatcaactccaccttaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtaca-cacactatgccttcaccttgcaa-ctccaccttaa-agg 47674937  T
Q  290 tagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    | ||||| |||||   ||  | |||||| || || || | ||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47674938 ttgatcacgagtactcttcacaccgcctatccaggctaaccatgagtattcttcccaccgcctctccatgatgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 47675037  T
Q  390 tgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaac 456  Q
     ||||||| ||| || ||| |||| | ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||| ||||||    
T  47675038 cgaacaccactctacaaggaatcaataccaagttgagagacctcaccttcttcatcctcccaacaac 47675104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Original strand, 6593656 - 6593822
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  6593656 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 6593755  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  6593756 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 6593822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 48490945 - 48490578
Alignment:
Q  114 cttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcac 212  Q
    |||||||| |||||||||| |  | ||||||| ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||  |  |||||||||||     
T  48490945 cttccgtcctcatgaagaatttacatgctcacaactagagcataaacacccaagg-cctccatagttgtaccattcccggtgtcatctactccacctcaa 48490847  T
Q  213 gctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctc 312  Q
    | ||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||| |||||  |||||  ||  |      
T  48490846 gttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtaca-cacactatgccttcaccttgcaa-ctccacctcaa-aggttgatcacaagtattattcacag 48490750  T
Q  313 cgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatc 412  Q
     ||||||| || || | ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||    
T  48490749 tgcctctccaggctaaccatgagtattcttcccaccgcctctccagactgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccactccacaaggcatc 48490650  T
Q  413 actcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcata 487  Q
    | | | ||||||||| || ||||   |||| ||||||   ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  48490649 aatactaaggtgagaaacctcac---cttcatcatcctgccaacaactcaccaccaaagcacccgcatcctcata 48490578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6048110 - 6047689
Alignment:
Q  92 cattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccg 191  Q
    |||||||||| | |||||||  ||| |||| || ||||||| | |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||||| ||| ||||  ||    
T  6048110 cattcttcaaaccccgaaatgcctttcgtcctcttgaagaatttccttgctcacaactagagcctagcacccaaggtcc--catagttgtaccattctcg 6048013  T
Q  192 gtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggta 291  Q
     |||  | |||||||||||| |||||   | |||||||||||||  |||||  ||||  | |||||||||||  || ||  |||| |||||||| ||||     
T  6048012 atgtcatcaactccacctcaagctgacatttctctacctcaacttccaaataagtacg-cacactatgtctttcaccttgcaactccacctcaa-aggtt 6047915  T
Q  292 gatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatg 391  Q
    ||| |  |||||  || |||||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  6047914 gattacaagtattcttacctccgcctcttcagactgaccttgagtattctttccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagacg 6047815  T
Q  392 aacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccc 491  Q
    | |||| ||| || || ||||| || ||||| |||| ||||||||  |||| ||  ||   |||    |||||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  6047814 accaccactctacaagacatcattcacaaggcgagaaacatcacctacttcatctccc---caatgagacaccaccaaagcaacttcatcctcataaccc 6047718  T
Q  492 tctgagacaatttgtgcggagttaccatt 520  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6047717 tcaaagacaatttgtgcggagttaccatt 6047689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 634 - 794
Target Start/End: Original strand, 18391297 - 18391460
Alignment:
Q  634 ctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgctt 730  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18391297 ctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgctt 18391396  T
Q  731 gaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  18391397 gaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 18391460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Original strand, 18390883 - 18391074
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18390883 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtacatcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcatga 18390979  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18390980 gtattgttcacaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 18391074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 573 - 798
Target Start/End: Original strand, 13289611 - 13289835
Alignment:
Q  573 catcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatca 672  Q
    ||||||||| ||||||||| | | | || || |||||||||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||||||  |||| | |||| |||    
T  13289611 catcttgtgacagttaaagaacttaaacttttacttgttaccactctttccccggttacctct----ccaccattccctcttgaaacacatgggccttca 13289706  T
Q  673 ccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccataga 769  Q
      || ||||| |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  13289707 aagttttcatcatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagttgtttgaacttcttccaatgtgacagtgccttctttgccataga 13289806  T
Q  770 gcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
     |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  13289807 acatggtatccatgaaagattaaaaagat 13289835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Original strand, 6593245 - 6593436
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  6593245 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtacatcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 6593341  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6593342 gtattgttcacaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 6593436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 47675255 - 47675426
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||  | |||| || ||||   |   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47675255 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacactaagaacttcactgttttcacccgctctcaagtccttagacttggtcaactccctggttcttaa 47675354  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47675355 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccacagagcatggtatccttgaaggattcaaa 47675426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 327 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43640 - 43556
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcat 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43640 gatcatgattattcttaccaccgcctctgcaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcat 43556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26214373 - 26214193
Alignment:
Q  68 ggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaagg 167  Q
    ||||||||| ||||||  ||  |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||||    
T  26214373 ggtaatcccacaagccaagccatacattcttcaaactacggaatgtcttccgtcttcttgaagaattcccttgctcacaactagagtctagcacccaagg 26214274  T
Q  168 tcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtaca 249  Q
    | ||||||||||||||| || |  ||||    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  26214273 t-ctccatagtcgtatcgttcctagtgtcaccaactccacctcaagctgagctttatctacctcaacttccaaatgcgtaca 26214193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 287 - 394
Target Start/End: Original strand, 1560762 - 1560869
Alignment:
Q  287 aggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcc 386  Q
    |||| ||||| |||||| |||  | ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1560762 aggttgatcacgagtattgttatcaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctcc 1560861  T
Q  387 agatgaac 394  Q
    ||| ||||    
T  1560862 agacgaac 1560869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43902 - 43807
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43902 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgatatacattcttcaacctc 43807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 102
Target Start/End: Original strand, 7093083 - 7093178
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaac 102  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7093083 aggacatctcccacttccttgaaggtcaccttgcatccaatcacccttggcc-tccttttagagtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaac 7093178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Original strand, 18412835 - 18412934
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  18412835 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 18412934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 26213980 - 26213920
Alignment:
Q  470 agcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccgga 530  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  26213980 agcacccacatcctcataaccctcagagacaatttgtgaggagttaccattgttctccgga 26213920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 7070731 - 7070644
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7070731 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 7070644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 9186067 - 9185968
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||    
T  9186067 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaccttctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatgatatccttgaa 9185968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 686 - 767
Target Start/End: Original strand, 21645202 - 21645283
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccata 767  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| |||||    
T  21645202 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccata 21645283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 686 - 779
Target Start/End: Original strand, 21988097 - 21988190
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  | ||| ||| ||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21988097 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacttccttcaaagtagtagtgccctctttaccataaaggatggtatc 21988190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 28486927 - 28486835
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaac 102  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28486927 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggcc-ttcttttagagtaatctcgcaagccgtgctatacattcttcaac 28486835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 3324032 - 3324119
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  3324032 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 3324119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 102
Target Start/End: Original strand, 7470939 - 7471034
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaac 102  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7470939 aggacatctcctgctcccttgaagatcactttgcatccaatcacccttggacttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaac 7471034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 16884108 - 16884203
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  16884108 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 16884203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 24262229 - 24262134
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  24262229 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 24262134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 25352288 - 25352201
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25352288 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 25352201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 25406350 - 25406263
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25406350 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 25406263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 686 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 5818096 - 5818051
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttg 731  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5818096 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttg 5818051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Original strand, 1047914 - 1047961
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggc 56  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1047914 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggc 1047961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 478 - 532
Target Start/End: Original strand, 13289539 - 13289593
Alignment:
Q  478 catcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  13289539 catcctcaaaaccctcaaagacaatttgcgcggagttaccattgttctccggaca 13289593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 153
Target Start/End: Original strand, 6067995 - 6068080
Alignment:
Q  68 ggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagag 153  Q
    ||||||||| |||||| |||  | |||||||||| ||||| |||  |||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6067995 ggtaatcccacaagccatgccatgcattcttcaaactccggaatgccttccgtctaattgaagaattcccttgctcacaactagag 6068080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 35270 - 34745
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35270 aggacatctcccgtttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccctttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 35172  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  35171 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcatagcactcaaggtcctccatagtcgtaccattaccgatgtgttcaactcc 35072  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  35071 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 34972  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  34971 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctttccagacgaccaccgctccact 34872  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34871 aggcatcactcccaacgtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacgccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttg 34772  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34771 tgcagagttaccattaatctctggaca 34745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 34727 - 34491
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34727 ccatcttgtgacagttaaagcattatgactttgacttgttaccactctttctccggttacttctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 34628  T
Q  672 accgtgttcatga---gtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattc-----caaggtaatagtgccttccttgc 763  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||     |||||||| ||||||||| ||||    
T  34627 accgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaaccccttggttctcaaagccacttgaacttcttccaatgcaaggtaacagtgccttctttgc 34528  T
Q  764 catagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34527 catagagcatggtatctttgaacaattcaaaagattt 34491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 532
Target Start/End: Original strand, 21519262 - 21519786
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21519262 aggacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggcctttttttaaga-taatcccgcaagccgtgctatatattcttcaacctc 21519360  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21519361 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 21519459  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||      
T  21519460 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaagcttcacctcaacaagtagatcatgagtattt 21519559  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21519560 ttgcctccggctctccagaatgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggatgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccgctctact 21519659  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21519660 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttg 21519759  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  21519760 tgcggagttaccaataatatccagaca 21519786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 31733786 - 31734260
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||         |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31733786 aggacatctcccgcttccttgaagatctccttgcatccaatcacctttggc----tttttagggtaatctagcaagtcgtgctatacattcttcaacctc 31733881  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  31733882 cggaatgtctttcgtcttcatgaagaaatcacttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttccatagtcgtaccattaccgatgtgttcaactcc 31733980  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31733981 acctcaagctgagtgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 31734080  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31734081 ttacctccgcctctccagactgatcatgagtattcttatcaccacatctccaggttgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 31734180  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31734181 aggcatcattcccaaggtgagaaacatcaccttctttatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcattctca 31734260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 6263059 - 6263535
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||| ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6263059 aggatatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacacttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 6263157  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6263158 cagaatgtcttctgtcttcatgaagaaatcccttgctcacc--tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 6263255  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6263256 acctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggcagatcatgagtattg 6263355  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||     
T  6263356 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccatcgtctcttcaggttgatgttgagtgtttaacgtttctccagacgaccaccactccacc 6263455  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263456 aggtatcaatcccaaggtgagggacatcaccttcttcatcctccaaacaacgccacaccatcagagcacccgcatcctca 6263535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 19503446 - 19503674
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19503446 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccctc 19503545  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19503546 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttacttgccatagagc 19503645  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19503646 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 19503674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 35217080 - 35217308
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35217080 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 35217179  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35217180 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaaatccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 35217279  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35217280 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 35217308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 36560251 - 36560479
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560251 ccatcttgtgatagttaaagcattcaaaccttgccttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 36560350  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36560351 accgtattcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 36560450  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36560451 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 36560479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 35216857 - 35217062
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35216857 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgcttcactaggcatcaatcccaaggtgag 35216956  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35216957 acacatcacctttttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatctt 35217056  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  35217057 cggaca 35217062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 19503223 - 19503428
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19503223 gatcatgagtattcttaccaccacctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccactgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 19503322  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19503323 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgtggagttaccattaatctc 19503422  T
Q  527 cggaca 532  Q
     |||||    
T  19503423 tggaca 19503428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 35216687 - 35216894
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35216687 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 35216785  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  35216786 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 35216885  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  35216886 caggctgat 35216894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 519
Target Start/End: Original strand, 36560031 - 36560223
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36560031 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaagctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggcgag 36560130  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccat 519  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  36560131 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatgctcataaccctcagagacaatttgtgcggagctaccat 36560223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 221 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 22402470 - 22402266
Alignment:
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  22402470 tactctacctcaactagaaaatgcgtacattccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattattgcctccacctctc 22402371  T
Q  321 aagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaa 420  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||    
T  22402370 cagactgatcatgaatattcttaccaccgcctctccaagctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcattctcaa 22402271  T
Q  421 ggtga 425  Q
    |||||    
T  22402270 ggtga 22402266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 21519804 - 21520032
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21519804 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttat---tctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 21519900  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    || ||||| || |    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21519901 actgtgttaataaactctcaagtccttggactgggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatag 21520000  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21520001 agcatgatatctttgaatgattcaaaagattt 21520032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 36559862 - 36560059
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36559862 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 36559959  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  36559960 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 36560059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Original strand, 19503053 - 19503234
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19503053 cttcatgaagaaatcccttggtcacca-tagcgcatagcacccaaggtccttaatagccgtaccattaccggtgtattcaactccacctcacgctgagcg 19503151  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19503152 tactctacctcagctagcaaatgcgtgcatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 19503234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 532
Target Start/End: Original strand, 28569073 - 28569512
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcatta- 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  ||||| || || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || ||     
T  28569073 tacattcttcaaaccccggaatgccttccatcctcttgaagaattaccttgctcacaactagagaatagcaccctaggtc-tccatagtcgtaccaatat 28569171  T
Q  189 --ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtctt-caactttcaaacttcacctcaa 285  Q
      | |||||  | |||||||||| | ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||| | ||||||||    
T  28569172 tccaggtgtcatcaactccaccttaagctgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtaca-cccactatggctttcaccttgcaaa-tccacctcaa 28569269  T
Q  286 caggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctc 385  Q
     |||| ||||| ||||||  || ||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  28569270 -aggttgatcacgagtattcttacctccacctcttcagactgatcatgagtatttttcccaccgcctctccagactgatgttgagtgtttaacatctctc 28569368  T
Q  386 cagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
     ||| || |||| ||| || || ||||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||   ||||   ||||||||| |||||| | |||||||    
T  28569369 tagacgaccaccactctacaagtcatcattcacaaggtgagaaacatcaccttcttcatcaccc---caacgagacaccatcaaagcacctgaatcctca 28569465  T
Q  486 taaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  28569466 taatcttcggagacgatttgtgcggagttaccattgttctccggaca 28569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22405129 - 22404969
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22405129 agggtaatcccgcaagccgtgttatacattcttcaacctccggaatgcctttcgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcataacactcaa 22405030  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactct 226  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22405029 ggtcctccatagccataccattaccggtgtgttcaattccacctcaagctgagcgtactct 22404969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 457
Target Start/End: Original strand, 14634627 - 14634966
Alignment:
Q  114 cttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacg 213  Q
    |||||||| || ||||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| |    
T  14634627 cttccgtcctcttgaagaattctcatgctcacaactagagcataacacccaaggccctccatagtcgtaccatttccggtgtcactaactccacctcaag 14634726  T
Q  214 ctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctcc 313  Q
     ||||  | ||||||| |||||  ||| ||||||||   |||||||  || ||| ||  |||| ||||| || |||| ||||| ||||||  ||  | ||    
T  14634727 ttgagatttctctaccccaacttccaattgcgtaca---cactatgcttttaaccttgtaactccaccttaa-aggttgatcacgagtattcttcacacc 14634822  T
Q  314 gcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatca 413  Q
    ||||||| || || | | ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  14634823 gcctctccaggctaaccgtgagtattcttcccaccgcctctctaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccgctctacaaggcatca 14634922  T
Q  414 ctcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaaca 457  Q
     | |||||||||||  | ||||| ||||| || ||| |||||||    
T  14634923 ataccaaggtgagaaccctcaccctcttcatcctcccaacaaca 14634966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 573 - 798
Target Start/End: Original strand, 28569531 - 28569761
Alignment:
Q  573 catcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatca 672  Q
    ||||||||| |||||||||||   | || || | ||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||| | |||    
T  28569531 catcttgtgacagttaaagcacctaaactttaatttggtactactctttccccggttacctctacctccacaattccctgttgaaacacttaggtcttca 28569630  T
Q  673 ccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaata--gtgccttccttgccata 767  Q
    |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||| | | |  |||||||| ||||||||    
T  28569631 ccgttttcatcagctctcaagtccttggacttggtcatctccttggttctcaaagtcacttgaacttcttctaagttgacaatgtgccttctttgccata 28569730  T
Q  768 gagcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| |||||||    
T  28569731 gagcatgatatccttgaaggatttaaaagat 28569761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 445
Target Start/End: Original strand, 41304109 - 41304222
Alignment:
Q  332 tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacaca 431  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||| |  ||    
T  41304109 tgagtattcttcccaccgcatctccaagctgattttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctctataaggcatcagtcacaaggtgaaaggca 41304208  T
Q  432 tcaccatcttcgtc 445  Q
    ||||| ||||||||    
T  41304209 tcaccttcttcgtc 41304222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 779
Target Start/End: Original strand, 25402827 - 25402920
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || | |||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  25402827 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttcttaaagccgcttggacctcttccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatc 25402920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 17933057 - 17932982
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcat 773  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  17933057 acttggtcaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcat 17932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 42019007 - 42019178
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |  | ||||| ||| ||||  | ||||| |    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  42019007 ggttacctctacctccatcattccctctggaaatacttatgccttcactattttcatcaactctcaagtccttggacttggttaacttcttggttctaaa 42019106  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || || ||| | ||  |||||||| | | ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  42019107 agtcgattggaattcctccaaggtgacaatgccttctttgaaatagagcatggtatccttgaagaattcaaa 42019178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 392
Target Start/End: Original strand, 42018734 - 42018794
Alignment:
Q  332 tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatga 392  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  42018734 tgagtattcttcccaccgcctctccaggatgatgttgagtgtttaatgtctttcaagatga 42018794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 19348458 - 19348553
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  19348458 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 19348553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 20054005 - 20054092
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20054005 acttggttaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 20054092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 39680982 - 39680895
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  39680982 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 39680895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 2737141 - 2737054
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  2737141 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttaaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 2737054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 10446347 - 10446248
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |  | ||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  10446347 tcaagtccttgaacttggtcaattccttgattctcaaagccgcttggacctccttcaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 10446248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 90 - 240
Target Start/End: Original strand, 41303933 - 41304082
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||  ||| || ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||| |||| | ||||||||| ||| |||| |    
T  41303933 tacattattcaaaccccggaatttcttttgtcctcttgaagaattcccttgctcacaactagagcctagcacccaagat-ctccatagttgtaccattcc 41304031  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaa 240  Q
    || |||  | || ||||||||| |||  ||   ||||||||||||||||||    
T  41304032 cgatgtcatcaattccacctcaagctatgctatctctacctcaactagcaa 41304082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 532
Target Start/End: Original strand, 18097736 - 18098260
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18097736 aggacatctcccgctcccttgaagatcgccttgcatccaatcacccttggccttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 18097834  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||    
T  18097835 cagaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatggcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttaaattcc 18097933  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  18097934 acctcatgctgagcgtactctacctcaactagaaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttcaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattt 18098033  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  18098034 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttactaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccgctccact 18098133  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18098134 agacatcaatctcaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttg 18098233  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  18098234 tgcggagttaccattaatctccggaca 18098260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3316036 - 3315559
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||        |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  3316036 aggacatctcccacttccttgaaggtcttcttgcattcaatcacccttgaccttttttt-agggtaatcccgcaagtcgtgctatatattcttcaacctc 3315938  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||    
T  3315937 cggaatgtcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcataccattaccggtgttttaaactcc 3315839  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||      
T  3315838 agctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggaagatcatgagtattc 3315739  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  3315738 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccacctctccact 3315639  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315638 aagcatcattcccaaggtgagatacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 3315559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 53916578 - 53917055
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||        ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  53916578 aggacatctcccgcttccttgaagattaccttgcatccaatcaccgttggccttttttt-aggataatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaacctc 53916676  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  53916677 cggaatgtcttccatcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagccgtaccattaccgatgtgttcaactcc 53916775  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  53916776 acctcacgctgagcgtactctaactcaactagcaaatgcgtacatctcactatgtcttccaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattt 53916875  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  53916876 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgtagagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 53916975  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53916976 aggcatcaatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctacaaacaacaccacaccatcagagcactcgcatcctca 53917055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 28100928 - 28101389
Alignment:
Q  22 ccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtc 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28100928 ccttgaaagtctccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaacctccgaaatgccttccgtc 28101026  T
Q  122 ttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28101027 ttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcataacacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcaagctgagcgt 28101125  T
Q  222 actctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctca 321  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||     
T  28101126 actctaccttaactagaaaatgcgtacatcccaccatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgaatattattgcatccgcctctcc 28101225  T
Q  322 agactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||    
T  28101226 agactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggatgatgttgagtgtttaacttccctctagatgaccaccgctccactaggcatcattttcaag 28101325  T
Q  422 gtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28101326 gtgagacatatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagaacccgcatcctca 28101389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 485
Target Start/End: Original strand, 890827 - 891288
Alignment:
Q  23 cttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtct 122  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||        ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  890827 cttgaaggtcttcttgcatccaatcactcttggccttttttt-agggtaatcccgcaagctgtgctatacattcttcaacctccggaatgtcttccgtct 890925  T
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||     
T  890926 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcatagcacccaaggtactccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcaagctgagagtg 891025  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    |||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  891026 ctctacatcaacgagaaaatgtgtacatcccattatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgtctccgcctctcca 891125  T
Q  323 gactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaagg 422  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  891126 gactaatcatgagtattcttaccaccgcctctccaagatgatgtcgagtgtttaacgtctctccaaacgaccaccgctccactaggcatcactccaaagg 891225  T
Q  423 tgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
     ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  891226 cgagacacatcaccttcttcatcttccaaacaacaccacaccaccagagcaccctcatcctca 891288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 125 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 42991535 - 42991176
Alignment:
Q  125 atgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtact 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42991535 atgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacctaaggtccttcatagttgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcgtact 42991437  T
Q  225 ctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaaga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  42991436 ctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtctttaaccttgaaactccacctcaataggtagatcatgagtattgttgcctccgcctctccaga 42991337  T
Q  325 ctgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtg 424  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42991336 ctgatcatgagtattcttaccactgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagatgatcaccgctccattaggcatcacttccaaggtg 42991237  T
Q  425 agacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42991236 agacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 42991176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 43422375 - 43422851
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43422375 aggacatctcccgcttccttgaagatcacctagcatccaatcacccttggc-atttttttagggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 43422473  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||    
T  43422474 cggaatgccttccgtcttaatgaa-aaatccctttctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcttaccattactagtgtgttcaactcc 43422571  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  43422572 acctcaagttgagcgtactctacctcaattagcaaatacgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagataatgagtattg 43422671  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || ||||| ||||||    
T  43422672 ttacctccgcatctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctctaggctgatgttgagtgtttatcgtctctccatacgaccaccgttccact 43422771  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43422772 aggcatcactctcaaggtgagacagatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctca 43422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 66 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23635059 - 23634596
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  ||    
T  23635059 agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaaccttcggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccagtagagcataacaccgaa 23634960  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |     ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||    
T  23634959 ggtcctccatagccgtaccattactggtgtgttcaactccacctcaagctgagcttccaacctctcaactagaaaatgtgtacacctcactatgtcttca 23634860  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatg 365  Q
    || || ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  23634859 accttaaaactccccctcaacaggtagatcatgagtattgttacctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccacctcttctccatgctgatg 23634760  T
Q  366 ttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacacca 465  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||   |||||||    
T  23634759 ttgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccgctctaccatacatcaatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaaaaa---cacacca 23634663  T
Q  466 tcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23634662 ccagagcacatgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgtggagttgccattaatctccggaca 23634596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 457055 - 456827
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  457055 ccatcttgtgacagttaaagcattcaagccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 456956  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  456955 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactcattggttctcaaagccgctcgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 456856  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456855 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 456827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 6064903 - 6065131
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6064903 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccagttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 6065002  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6065003 aacgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 6065102  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6065103 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 6065131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5192798 - 5192570
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5192798 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttatccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccctc 5192699  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5192698 accgtgttcgtgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 5192599  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5192598 atggtatctttgaacgatttaaaagattt 5192570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 18098278 - 18098509
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18098278 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 18098377  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  18098378 accgtgttcatgatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatag 18098477  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18098478 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 18098509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 10957433 - 10957661
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  10957433 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaacctttacttgttaccactctttctccgattacctctaccgccaccattccctcttgagacacttagaccttc 10957532  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10957533 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacaatgccttccttgccatagagc 10957632  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957633 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 10957661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 43227451 - 43227246
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43227451 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtccctccagacgatcaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 43227352  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43227351 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 43227252  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  43227251 cggaca 43227246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 11169249 - 11169021
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  11169249 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacttccaccattccctattgagacacttaggccttc 11169150  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11169149 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaaaccggttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccacagagc 11169050  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11169049 atggtatctttgaatgattcaaaagattt 11169021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 457278 - 457073
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  457278 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 457179  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  457178 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagctaccattaatctc 457079  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  457078 cggaca 457073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 10957210 - 10957415
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10957210 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccactccactaggcatcactcccaaggtgag 10957309  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10957310 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaacctc 10957409  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  10957410 cggaca 10957415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 43227228 - 43226997
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43227228 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 43227129  T
Q  672 accgtgttcatga---gtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  43227128 accgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttctttgccatag 43227029  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43227028 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 43226997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 333 - 532
Target Start/End: Original strand, 6064686 - 6064885
Alignment:
Q  333 gagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacat 432  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6064686 gagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgagacacat 6064785  T
Q  433 caccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6064786 caccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctctggaca 6064885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 303
Target Start/End: Original strand, 28138147 - 28138440
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccg 107  Q
    |||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  28138147 gacatcttccgcttccttgaaagtctccttgcttccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagttgcgctatacattcttcaacctccg 28138245  T
Q  108 aaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccac 207  Q
     |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  28138246 gaatgcctttcgtcttcatgaagaaatcccttgctcgcca-tagagcatagcacccaaggtcatccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccac 28138344  T
Q  208 ctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28138345 ctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 28138440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 11169472 - 11169267
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11169472 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 11169373  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11169372 acatatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagctcccgcatcctcataaccctctaagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 11169273  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  11169272 cggaca 11169267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 4309617 - 4309848
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  4309617 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaactttgacttgttactactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgaaacacttaggccttc 4309716  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||     
T  4309717 accgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatat 4309816  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309817 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 4309848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5898560 - 5898329
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  5898560 ccatcttgtgacagttaaagcattcaggctttgacctgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacactaaggccttc 5898461  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5898460 accgtgttcatgatctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatag 5898361  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898360 agaatggtatctttgaacgattcaaaagattt 5898329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5898783 - 5898578
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5898783 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgactaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 5898684  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5898683 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacttgcatcctcataactctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 5898584  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  5898583 cggaca 5898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 4309394 - 4309599
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  4309394 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctcttcagacgaccactactccactaggcatcactcccaaagtgag 4309493  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  4309494 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatccttttaaccctcagagacaatttgtgcggagttatcattaatctt 4309593  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  4309594 cggaca 4309599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5898951 - 5898746
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5898951 tcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacacaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagtgta 5898853  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |    
T  5898852 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctcca 5898753  T
Q  323 gactgat 329  Q
    | |||||    
T  5898752 ggctgat 5898746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 123 - 329
Target Start/End: Original strand, 4309226 - 4309431
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4309226 tcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagttgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgttgagcgta 4309324  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| |    
T  4309325 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctcca 4309424  T
Q  323 gactgat 329  Q
    | |||||    
T  4309425 ggctgat 4309431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 134 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 25635058 - 25634738
Alignment:
Q  134 tcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaa 233  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||  |||| | | ||    |||||    
T  25635058 tcccttgcttcccactagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccatttccgctgtgttcaactccacctcaaactgaactttctacctctcaa 25634959  T
Q  234 ctagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  25634958 ctagcaaatgcgtacatcccactatgtcttccaccttgaaactccacgtcaa-aggtagatcatgagtattgttacctccgtctctccagactgaccatg 25634860  T
Q  334 agtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatc 433  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| || |||||   |||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  25634859 agtattcttagcaccgcctctctaggctgatgttgagtatttaacaactctctagacgaccaccg---cactaggcatcattcacaaggtgagaaacatc 25634763  T
Q  434 accatcttcgtcatccaaacaacac 458  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||    
T  25634762 accttcttcatcctccaaacaacac 25634738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43227713 - 43227414
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccga 108  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  43227713 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc--- 43227618  T
Q  109 aatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacc 208  Q
                    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  43227617 ----------------atgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtctttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactctacc 43227535  T
Q  209 tcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  43227534 tcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcatacatccaactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattctta 43227435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 457447 - 457241
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  457447 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 457350  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  457349 tactctacctcaactggcaaatgcatacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 457250  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  457249 caggctgat 457241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 123 - 329
Target Start/End: Original strand, 6064513 - 6064717
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6064513 tcatgaagaaatcccttgctcatca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccagtgtgttcaactccacctcacgctgagcgta 6064611  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||||||| |    
T  6064612 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatca-gagtattcttaccaccgcctctcca 6064710  T
Q  323 gactgat 329  Q
    | |||||    
T  6064711 ggctgat 6064717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11169642 - 11169435
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  11169642 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaagctccttcatagccgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgttgagtg 11169544  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  11169543 tactctacctcaactagaaaatgcgtacatcccaccatgtcttcaaccttgaaactccaccgcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 11169444  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  11169443 caggctgat 11169435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 656 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 5192945 - 5192816
Alignment:
Q  656 tgacacttaggccatcaccgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgcc 755  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5192945 tgacacttaggccctcaccgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgcc 5192846  T
Q  756 ttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5192845 ttccttgccatagagcatggtatctttgaa 5192816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 602 - 794
Target Start/End: Original strand, 15830335 - 15830530
Alignment:
Q  602 ttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttgga 698  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
T  15830335 ttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgaagcacttagaccttcaccgttttcatcagctctcaagtccttgga 15830434  T
Q  699 cttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  15830435 ctgtgttaactccttggttctcaaagccgcttgaactttttccaaggtggcagttccttctttgccatagaccatggtatctttgaaggattcaaa 15830530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23634578 - 23634365
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  23634578 ccatcttgtgacagttaaagcatttagactttgacttgttaccactctttctctagttacctctacctccaccattacctcttgaaacacttaggccttc 23634479  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| ||||| |||    ||           |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||    
T  23634478 accgttttcatcagt----tc-----------tcaagtcattggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagttccttcttttccatatagc 23634394  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23634393 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 23634365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 427
Target Start/End: Original strand, 23198742 - 23199076
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  ||| ||| | ||||||||||| || ||||     
T  23198742 tacattcttcaaaccccggaatgccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataaacacccaaag-cctccatagtcataccattc 23198840  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    ||| |||  | |||||||||| | | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| || ||   ||| |||||||| ||    
T  23198841 ccgatgtcatcaactccaccttaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccaccttaccactccacctcaa-ag 23198937  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || |||||||||||| ||| || || |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23198938 gttgatcatgagtattgttaccaccacctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 23199037  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgaga 427  Q
    | ||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  23199038 acgaacaccactctacaaggcatcaataccaaggtgaga 23199076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 605 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 7769673 - 7769477
Alignment:
Q  605 acttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggactt 701  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||| |    |||||||||| |||||    
T  7769673 acttgttaccactctttccccggttacctctacctccaccattccctcttaaaacacttaggccttcaccgttttcatcatctctcaagtccttagactt 7769574  T
Q  702 ggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
     | | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  7769573 tgcctactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctagataacattgccttctttgccatagagcatggtaactttgaaagatttaaaagat 7769477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 329
Target Start/End: Original strand, 10957090 - 10957247
Alignment:
Q  172 ccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttc 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  10957090 ccatagtcgtaccattaccggtgtgttcattttcacctcacgctgagtgtactctacctcaactagaaaatgcatacatcccactatgtcttcaaccttg 10957189  T
Q  272 aaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgat 329  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  || || ||||||||| || |||||    
T  10957190 aaactccacctcaactggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgat 10957247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 627 - 794
Target Start/End: Original strand, 23199257 - 23199427
Alignment:
Q  627 gttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaa 723  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23199257 gttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaa 23199356  T
Q  724 gacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    | ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23199357 gccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatctttaaaggattcaaa 23199427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 423
Target Start/End: Original strand, 5258926 - 5259256
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  ||| ||| | |||||||||||||| ||||     
T  5258926 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataaacacccaaag-cctccatagtcgtaccattc 5259024  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||  | |||||||||| | | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||  ||| |||||| |||| || ||  |||| ||||||||  |    
T  5259025 ccggtgtcatcaactccaccttaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtatttcc-actatg-cttccaccttgtaactccacctcaag-g 5259121  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5259122 gttgatcacgagtattgttcacaccgcctctctaggctaaccatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaatgtctctccag 5259221  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggt 423  Q
    |||||||||  || || |||||||| | |||||||    
T  5259222 atgaacaccattctacaaggcatcaataccaaggt 5259256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 572 - 794
Target Start/End: Original strand, 15821753 - 15821974
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||  || |||||||| | | || ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||    
T  15821753 ccatcttgtcacaattaaagcacttaaactttgacttgttaccacttattccctggttacctctacctccaccattccctcttgaagcacttagaccatc 15821852  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||  |  |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||||  |||||||| ||    
T  15821853 act-taatcaactctcaagtccttggactcggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttctatgccatagggc 15821951  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    |||||||| ||||| ||||||||    
T  15821952 atggtatcattgaaagattcaaa 15821974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 7763833 - 7763500
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||  ||| ||||||||| |||||||||| ||   |||||||  |||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  7763833 tacattcttcaaaccccagaatgtcttccgtcctcatgaagaattcatatgctcacacctagagcataaacacccaagg-cctccatagtcgtaccattc 7763735  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
     ||||||    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||| ||| ||  || ||||||||  |    
T  7763734 tcggtgtcacaaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatgccttcaccttgcag-ctccacctcaa--g 7763639  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| ||||||  ||  | ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763638 gttgatcacgagtattattcacaccgcctctccagactaaccatgagtattgttaccaccgcctctcctggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 7763539  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgaga 427  Q
    | ||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||    
T  7763538 acgaacaccactctacaaggcatcaataccaaggtgaga 7763500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 29812409 - 29812043
Alignment:
Q  114 cttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacg 213  Q
    |||||||  |||||||||| || |  |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| |||| |||||||  | |||||||||| | |    
T  29812409 cttccgttctcatgaagaattcacaagctcacaactagagcatagcactcaagg-catccatagttgtaccattcccggtgtcatcaactccaccttaag 29812311  T
Q  214 ctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctcc 313  Q
     ||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||   ||  | ||    
T  29812310 ttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtaca-cacactatgccttcaccttgcaa-ctccacctcaa-aggttgatcacgagtactcttcacacc 29812214  T
Q  314 gcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatca 413  Q
    ||||||| || || | ||||||||||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||    
T  29812213 gcctctccaggctaaccatgagtattcttccgaccgcctctccaaactgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccactgtacaaggcatca 29812114  T
Q  414 ctcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcata 487  Q
     | ||||||||||| || ||||   |||| ||| ||   ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29812113 ataccaaggtgagagacctcac---cttcctcagcctcccaacaactcaccaccaaagcacccgcatcctcata 29812043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7763321 - 7763150
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||   |||| ||||| ||||||| |||||  |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  7763321 ggttacctctacctccatcatttcctcttgaagcactaaggccttcaccgttttcatccgctctcaagtccttggacttggttaactccttggttcttaa 7763222  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7763221 agccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 7763150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Original strand, 4599842 - 4600008
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  4599842 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 4599941  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4599942 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 4600008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32892652 - 32892262
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    |||||||||||| || |||||   |||||||| || ||||||| | | |||||||  |||||||  || ||| |||| || |||||||| ||| ||||      
T  32892652 tacattcttcaaacttcgaaaggccttccgtcctcttgaagaatttctttgctcaaaactagagcctaacacccaagatc-tccatagttgtaccatttt 32892554  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacagg 289  Q
    ||||||   ||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||  |||||||||||| | ||| |||  |||| ||| ||| || |||||||| |||    
T  32892553 cggtgtcactaactccacctcaagttgagctttctctgcctcaactttcaaatgcgtaca-cacaccatgctttcaccttgcaa-ctccacctcaa-agg 32892457  T
Q  290 tagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    | |||||  |||||  ||  | ||||||||| |  |||| | ||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32892456 ttgatcacaagtattattcacaccgcctctccatgctgaccttgagtattcttcccaccgcttctcctgactgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 32892357  T
Q  390 tgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcata 487  Q
    ||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||    ||||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  32892356 tgagcaccgctctacaaggcatcagtaccaaggtgagaaacctcaccttcttcatcatc---tcaacaacaaaccaccaaagcacccgcatcctcata 32892262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 29811919 - 29811748
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  29811919 ggttacctctacctccaccattttctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactctttggttcttaa 29811820  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29811819 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgtcttatttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 29811748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 37407739 - 37407568
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | ||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37407739 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaagccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 37407640  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || || |||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  37407639 agccggttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaaa 37407568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10057290 - 10057124
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10057290 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccg 10057191  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10057190 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 10057124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10059512 - 10059346
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10059512 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccg 10059413  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10059412 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 10059346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10061734 - 10061568
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10061734 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccg 10061635  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10061634 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 10061568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10063956 - 10063790
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10063956 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccg 10063857  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10063856 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 10063790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10066178 - 10066012
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10066178 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccg 10066079  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10066078 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 10066012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10210246 - 10210080
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10210246 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 10210147  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  10210146 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 10210080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 627 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 32892138 - 32891969
Alignment:
Q  627 gttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaa 723  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||  | |||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32892138 gttacctctacctccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcacttt-ttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaa 32892040  T
Q  724 gacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    | || |||||||| |||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32892039 gccggttgaacttcttccaaggtggcagtgccttctttcccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 32891969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 5259503 - 5259611
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  5259503 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttaaa 5259602  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  5259603 ggattcaaa 5259611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 9635304 - 9635412
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  9635304 tcaagtccttggacttggtcaactcattggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaa 9635403  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  9635404 ggattcaaa 9635412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 605 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27421755 - 27421558
Alignment:
Q  605 acttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggactt 701  Q
    ||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| || | ||| | || || ||   |||| ||| | |||||    
T  27421755 acttgttaccaatttttcccgg-ttacctctatctccaccattccctcttgaaacgcttagacctttaccatttttatcagctctcaattcccttgactt 27421657  T
Q  702 ggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| || | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27421656 ggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttctttcaaagtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaaagattt 27421558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 626 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 6717563 - 6717407
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6717563 ggttgcctctacctccaccattcccctttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaa 6717464  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    || | ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6717463 agccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatc 6717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Original strand, 4599321 - 4599622
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  | |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||  | | ||| | ||||||||| |||| ||||     
T  4599321 tacattcttcaaaccccggaataccatccgtcctcatgaagaattcacatgctcaccactagagcataaactcccaaag-cctccatagccgtaccattc 4599419  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||| ||    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| ||    
T  4599420 ccggagtcaccaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-ag 4599516  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4599517 gttgatcacgagtattgttaccaccgcctctccagactgaccatgagtattatcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccag 4599616  T
Q  389 atgaac 394  Q
    | ||||    
T  4599617 acgaac 4599622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Original strand, 35918802 - 35918939
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| | || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35918802 aggacatctcccacttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttctttt-agagtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaacctc 35918900  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctca 144  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918901 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctca 35918939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6717965 - 6717774
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||| | | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||  |||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  6717965 aactccacctcaagttgaactttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccactttgcaactccacctcaa-aggttgatcacga 6717869  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6717868 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccataagtattctcaccactgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 6717774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10210654 - 10210463
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  10210654 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgggtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 10210558  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10210557 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 10210463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10057701 - 10057510
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  10057701 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 10057605  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10057604 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 10057510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10059923 - 10059732
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  10059923 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 10059827  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10059826 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 10059732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10062145 - 10061954
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  10062145 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 10062049  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10062048 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 10061954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10064367 - 10064176
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  10064367 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 10064271  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10064270 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 10064176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 10066589 - 10066398
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  10066589 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 10066493  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10066492 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 10066398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 27422028 - 27421807
Alignment:
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||| ||||||  ||||| | |||||||||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||     
T  27422028 ttgcctctgcctcttcagactaaccatgagtattcttctcaccgccttttcatgctgatgttgagtgtttaaagtctctccagacgaccgccgctctaca 27421929  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| |||| ||||| ||  ||   |||||    |||| || |||||   ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27421928 aggcatcattcacaaggtgagaaacaacaccttcttcatctccc---caacaagctaccaccaaagcacttacatcctcataaacctcggagacaatttg 27421832  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccgga 530  Q
    |||||||||||||||  ||||||||    
T  27421831 tgcggagttaccattgttctccgga 27421807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 202 - 442
Target Start/End: Original strand, 1619605 - 1619844
Alignment:
Q  202 ctccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagt 301  Q
    |||||||||| ||||| | | |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  || || ||||| ||||| || |||  |||||  |||    
T  1619605 ctccacctcaagctgaactttctctacctcaacttccaaatgcgtacatcccaccatgtctttcaccttgaaactccacctaaa-aggctgatcacaagt 1619703  T
Q  302 atcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctc 401  Q
    ||  || |||||||||||  ||||| | || |||||||||||| || || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||| ||     
T  1619704 attcttacctccgcctcttcagactaaccacgagtattcttacaactgcctctctgggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagaaaactaccactt 1619803  T
Q  402 cactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttc 442  Q
     || ||| |||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  1619804 tacaaggaatcattcacaaggtgagaaacatcaccttcttc 1619844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 7769982 - 7769766
Alignment:
Q  224 tctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatg-tcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||| || |||||||| || | | ||| ||||| | || | ||| |||||  |    
T  7769982 tctacctcaactaggaaatgcgtacatcc-actatgattttcaccttgcaa-ctccacctcaa-agtttgttcacgagtaaccttacatcctcctcttca 7769886  T
Q  323 gactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaagg 422  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |  |||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| || |||||    
T  7769885 gactgaccatgagtattcttcccacagactctctaggatgatcttgactgtttaacgtctctccagatagacaccgctctacaaggcatcattcacaagg 7769786  T
Q  423 tgagacacatcaccatcttc 442  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  7769785 tgagaaacatcaccttcttc 7769766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 643
Target Start/End: Original strand, 35918946 - 35919017
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccac 643  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35918946 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttccccggttacctctacctccac 35919017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 712 - 794
Target Start/End: Original strand, 22834215 - 22834297
Alignment:
Q  712 ttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  22834215 ttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 22834297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 182
Target Start/End: Original strand, 1619491 - 1619603
Alignment:
Q  69 gtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggt 168  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||| |||| | |   |||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  1619491 gtaatcccacaagccatgctatacattcctcaaacactagaatgccttctgtcttcatgaagaattcccttggtcaccactagagcatagcacccaaggt 1619590  T
Q  169 cctccatagtcgta 182  Q
     |||||||||||||    
T  1619591 -ctccatagtcgta 1619603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 779
Target Start/End: Original strand, 10612022 - 10612103
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10612022 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccgtctttgccatagagcatagtatc 10612103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 9602756 - 9602657
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  9602756 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 9602657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Original strand, 16263540 - 16263639
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  16263540 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgctctccttaccataaaggatggtatccttgaa 16263639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 28490080 - 28489985
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  28490080 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 28489985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 42991632 - 42991537
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacct 104  Q
    |||||||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||        || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42991632 gacatctcccgcttccttgaagatcaccttgtatccaatcacccttggcc-tttttttagagtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacct 42991537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 47882133 - 47882220
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  47882133 acttggtcaactctttggttctcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 47882220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 54189446 - 54189359
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  54189446 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 54189359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 4309137 - 4309227
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4309137 acatctcccgcttccttgaatatcaccttgcatccaatcacccttggccttc------gagtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 4309227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Original strand, 10956974 - 10957066
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaac 102  Q
    ||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  10956974 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggcc-ttcttttagagtaatcccgtaagccgtgctatacattcttcaac 10957066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 3324458 - 3324359
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||| || |  ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  3324458 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaacgcctcttggacctcctccaaagtagtggtgccttccttaccataaaggatggtatccttgaa 3324359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 6304247 - 6304160
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  6304247 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 6304160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 8516275 - 8516370
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  8516275 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 8516370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 10204936 - 10205023
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10204936 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 10205023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 10897941 - 10897854
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10897941 acttggtcaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 10897854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 22625224 - 22625311
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22625224 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 22625311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 29913200 - 29913287
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| |  |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  29913200 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctatttgccataaagcatagtatccttgaa 29913287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 32479521 - 32479616
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  32479521 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 32479616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 785
Target Start/End: Original strand, 10098041 - 10098127
Alignment:
Q  699 cttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  10098041 cttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 10098127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 442
Target Start/End: Original strand, 15824698 - 15824808
Alignment:
Q  332 tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacaca 431  Q
    ||||||||||| ||| |||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | | ||| || |||||||||||| ||||||||| | |    
T  15824698 tgagtattcttcccatcgcccctccaagatgatgttgagtgtttaatgtctctctagacgactatctctctacaaggcatcactccaaaggtgagaaata 15824797  T
Q  432 tcaccatcttc 442  Q
    ||||| |||||    
T  15824798 tcaccttcttc 15824808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 11169734 - 11169642
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaac 102  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |        || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11169734 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttgg-cattcttttagagtaatctcgcaagccgtgctatacattcttcaac 11169642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 27900276 - 27900211
Alignment:
Q  332 tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacacc 397  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  27900276 tgagtattctttgcaccgcctctccagactgatgttgggtgtttaacgtctcttaaaatgaacacc 27900211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 395
Target Start/End: Original strand, 27882632 - 27882695
Alignment:
Q  332 tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaaca 395  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27882632 tgagtattctttgcaccgcctctccaaactgatgctgagtgtttaacgtctcttaagatgaaca 27882695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5100246 - 5099724
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||         ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  5100246 aggacatctcccgcttccttgaagatctccttgcatccaatcactcttggc-tattttttagggtaatcccgcaagctgtgttatacattcttcaacctc 5100148  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  5100147 cggaatgtcttctgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtactattaccggtgt--ttaactcc 5100051  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  5100050 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagaaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattt 5099951  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  5099950 ttgcctccacctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctaatgttgagtgtttaatgtctctccagacgaccaccgctccact 5099851  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5099850 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcatagccctcagagacaatttg 5099751  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  5099750 tgcggagttaccattaatctccggaca 5099724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 123 - 532
Target Start/End: Original strand, 22133301 - 22133709
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22133301 tcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcgta 22133399  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22133400 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgcctccgcctctcca 22133499  T
Q  323 gactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaagg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22133500 gactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccgctccactaggcatcaatcccaagg 22133599  T
Q  423 tgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaa 522  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133600 tgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccccttgagacaatttgtgcggagttaccattaa 22133699  T
Q  523 tctccggaca 532  Q
     | |||||||    
T  22133700 cccccggaca 22133709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 14788337 - 14788814
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14788337 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 14788435  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14788436 cggaacgccttccgtcttcgtgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaacgtcctccatagccgtaccattaccggtgtgttcaactcc 14788534  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14788535 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 14788634  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14788635 ttgtctccgcctctctagactaatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 14788734  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788735 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctcgaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 14788814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 6 - 526
Target Start/End: Original strand, 12401661 - 12402179
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12401661 aggacatctcatgcttccttgaagatcaccttacatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaacctc 12401759  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  12401760 cggaattccttctgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagctgtaccattaccggtgagttcaactcc 12401858  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12401859 acctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccattatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaagtagatcatgagtattg 12401958  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||    
T  12401959 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcttttccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccgcttcact 12402058  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12402059 aggcatcaatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatccagcaaaaaacactacaccatcagtgcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttg 12402158  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctc 526  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  12402159 tgcggagttaccatttatctc 12402179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 33 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 47564158 - 47563710
Alignment:
Q  33 tccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  47564158 tccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaattcgtgctatacattcttcaacctccataatgccttccgtcttcatgaagaa 47564060  T
Q  133 atcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctca 232  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47564059 atccattgctcaccactagagcatagcacccaaggtcgtccatagtcgtaccattatcggtgtgttcaactccacctcaagctgagcgtactctacctca 47563960  T
Q  233 actagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcat 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  47563959 actagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaaccggtagatcatgagtattgttgcctccgcctctccagactgatcat 47563860  T
Q  333 gagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  47563859 gagtattcttaccaccgcatctctagactgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctctactatgtatcaatcccaaggtgagacacat 47563760  T
Q  433 caccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    |||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47563759 cacattcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcc 47563710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16454734 - 16454255
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16454734 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 16454636  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16454635 cagaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagcgtatagcacccaaggtactccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 16454537  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16454536 acctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcatacatcccactatgtcttcaaccttgaaacaccacctcaacaggtagatcatgagtattg 16454437  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctga--tgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctcca 403  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||| |    
T  16454436 ttgcttccacctctccagtctgatcatgagtattcttgccaccgcctctccaggctgatctgttgagtgtctaacgtctctctagacaaccaccgctcta 16454337  T
Q  404 ctaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454336 acaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 16454255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 36379653 - 36379180
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccg 107  Q
    |||||||| |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  36379653 gacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcattcaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaatctctg 36379555  T
Q  108 aaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccac 207  Q
     |||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  36379554 gaatgccttccgttttcatgaagaaattcattgctcaccactagagcatagcatccaaggtcctccatagtcgtaccattcccggtgtgtttaactccac 36379455  T
Q  208 ctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgtt 307  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  36379454 ctcaaactgagcgtactctacctcaactagcaaatg-gtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagataatgagtattgtt 36379356  T
Q  308 gcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactag 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  36379355 gcctccgcctctccagactgatcatgagtattattaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactag 36379256  T
Q  408 gcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcct 483  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||  | ||||| || |||||||||||  ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  36379255 gcatcattcccaaggtgagaaaaatcgtcttcttcatcctccaaacaacattacaccgtcagaccacccacatcct 36379180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 200 - 532
Target Start/End: Original strand, 12399578 - 12399910
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  12399578 aactccacctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccaccttaacatgtagatcatga 12399677  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgc 399  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  12399678 gtattgttccctccgcctctccagactaatcatgagtattcttaccaccgcctttccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccgc 12399777  T
Q  400 tccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagac 499  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  12399778 tccactaggcatcaatcccaaggtgagacgcatcaccttcttcatccagcaaaaaacaccacaccatcagtgcacctgcatcctcataacccttagagac 12399877  T
Q  500 aatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12399878 aatttgtgcggagttaccatttatctccagaca 12399910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Original strand, 22801676 - 22801997
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22801676 aggacatctcccgcttccttgaaggtttccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 22801774  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22801775 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 22801873  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22801874 acctcacgctgagcgtattctacctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 22801973  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgat 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  22801974 ttgcctccgcctctccagactgat 22801997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Original strand, 36920437 - 36920758
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36920437 aggacatctcctgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagctgtgctatacattcttcaacctc 36920535  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |    
T  36920536 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcattgcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaaatgc 36920634  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  36920635 acctcacgctgaacgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgaatattg 36920734  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgat 329  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  36920735 ttgcctccgcctctccagactgat 36920758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 22781847 - 22782075
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22781847 ccatcttgtgacagttaaagcattcaagccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 22781946  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22781947 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 22782046  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782047 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 22782075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 66 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 36770822 - 36770499
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  36770822 agggtaatcccacaagccatgttatacattcttcaacctccggaatgccttccgtcttcatgaagaattcccttgctcacaactagagcatagcacccaa 36770723  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    ||| |||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36770722 ggttctccatagccgtaccattatcggtctgttcaactccacctcaagctaagcttactctacctcaactagcaaatgcgcacatcccactatgtcttca 36770623  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatg 365  Q
    || || ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36770622 accttgaaactccaactcaacaaatagatcatgagtattgttgcctctgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctttccaggctgatg 36770523  T
Q  366 ttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36770522 ttgagtgtttaacgtctctccaga 36770499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 16933258 - 16933486
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933258 ccatcttgtgaaagttaaagcattcaagccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 16933357  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16933358 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 16933457  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16933458 atgatatctttgaacgattcaaaagattt 16933486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24879913 - 24879622
Alignment:
Q  34 ccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  24879913 ccttgcatccaatcacccttggccttttttt-acggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctccggaatgcattccgtcttcatgaagaaa 24879815  T
Q  134 tcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaa 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24879814 tcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctctcgctgagcgtactctaccttaa 24879716  T
Q  234 ctagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  24879715 ctagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgcctccacctctccagactg 24879622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 11007678 - 11007906
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11007678 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctaccttcaccattccctcttgagacacttaggccctc 11007777  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11007778 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttagtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 11007877  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007878 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 11007906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 22133727 - 22133955
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22133727 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctaccaacaccattccctcttgagacacttaggccctc 22133826  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22133827 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactgcttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 22133926  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133927 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 22133955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 22781624 - 22781829
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22781624 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 22781723  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22781724 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 22781823  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  22781824 cggaca 22781829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 22045825 - 22046053
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22045825 ccatcttatgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccctc 22045924  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  22045925 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacaatgccttccttgccaaagagc 22046024  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22046025 atggtatctttaaacgattcaatagattt 22046053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 577 - 800
Target Start/End: Original strand, 9175587 - 9175810
Alignment:
Q  577 ttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgt 676  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9175587 ttgtgacaattaaagcattcaagccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctcacctt 9175686  T
Q  677 gttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggt 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9175687 gttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtagcagtgccttccttgccattgagcatggt 9175786  T
Q  777 atctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9175787 atctttgaacgattcaaaagattt 9175810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 22045601 - 22045807
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac-accgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22045601 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtgtctccagacgaaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtga 22045700  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatct 525  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22045701 gatacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagataatttgtgcggagttaccattaatct 22045800  T
Q  526 ccggaca 532  Q
    |||||||    
T  22045801 ccggaca 22045807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 16933035 - 16933240
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16933035 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaagctaatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 16933134  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16933135 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagctaccattaatctc 16933234  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  16933235 cggaca 16933240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 327 - 530
Target Start/End: Original strand, 11007455 - 11007658
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11007455 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 11007554  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007555 acacatcaccttcttcatccttcaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 11007654  T
Q  527 cgga 530  Q
    ||||    
T  11007655 cgga 11007658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 9175360 - 9175565
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9175360 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 9175459  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9175460 acacatcaccttcttcatcctccaagcaacaccacaccattagagaacccgcatcctcataacccttagagataatttgtgcggagtttccattaatctc 9175559  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  9175560 cggaca 9175565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 12399928 - 12400160
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  12399928 ccatcttatgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacatttaggccttc 12400027  T
Q  672 accgtgttcatga---gtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaa-tagtgccttccttgccata 767  Q
    ||||| ||||| |    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  12400028 accgttttcataaattctcaagtccttggacttggtcaacttcctggttctcaaagccgcttgaactttttccaaggtaacaagtgccttctttgccata 12400127  T
Q  768 gagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12400128 gagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 12400160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 12402203 - 12402434
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  12402203 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacatttaggccttc 12402302  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    ||| | ||||| |    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12402303 accattttcataaaatatgaaatccttggacttggtcaacttcttggttctcaaatccgcttgaacttcttcaaaggtaatagtgccttctttgccgtag 12402402  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12402403 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 12402434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 10114262 - 10113857
Alignment:
Q  12 tctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaat 111  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||          |||| |||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| |||    
T  10114262 tctcccgcttccttgaagatctccttccatccaatcacccttgg----tattttagggcaatcccacaagccatgccatacattcttcaaactccggaat 10114167  T
Q  112 ttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctca 211  Q
     ||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10114166 gtcttatgtcttcatgaagaattccattgctcacaactaaagaataacacccaaggtc-tccatagtcgtaccattcccggtgtgtttaactccacctca 10114068  T
Q  212 cgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcct 311  Q
     |||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  ||  | ||||  |||||||| |||| |||||  |||||  || |      
T  10114067 agctgagcgttgtcaacctcaactagaaaatgcgtacatcacactttgtctttcaccctaaaacaccacctcaa-aggttgatcacaagtattcttactc 10113969  T
Q  312 ccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcat 411  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10113968 ccgcctcttcagactgaccataagtattcttcccaccacctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgatcaccgctctactaggcat 10113869  T
Q  412 cactcccaaggt 423  Q
    || || ||||||    
T  10113868 cattcacaaggt 10113857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 22045431 - 22045638
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22045431 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagccgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 22045529  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  22045530 tactctatctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 22045629  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  22045630 caggctgat 22045638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 22781455 - 22781661
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22781455 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccagtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 22781552  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  22781553 tactctacctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 22781652  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  22781653 caggctgat 22781661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 11007286 - 11007483
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11007286 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggttttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 11007383  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  11007384 tactctacctcaactagaaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 11007483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 9175190 - 9175397
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9175190 cttcatgaataaatcccttgctcacca-tagagcatagtacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgttgagcg 9175288  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  9175289 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatctcactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaataggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 9175388  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  9175389 caggctgat 9175397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Original strand, 16932866 - 16933063
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  || ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16932866 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggttttc-atagtcgtaccattaccagtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 16932963  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  16932964 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcagccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 16933063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 329
Target Start/End: Original strand, 18535749 - 18536066
Alignment:
Q  7 ggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctcc 106  Q
    ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||         | |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||    
T  18535749 ggacatctcccacttccttgaagatctccttgcatccaatcacccttggc----tttttaaggtaatcccgcaagtcgtgatatacattctttaacctcc 18535844  T
Q  107 gaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcca 206  Q
      ||| |  | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  18535845 agaatgttgttcgtctttatgaagaaatccattgctcaccactagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattcctggtgtgttaaactcca 18535944  T
Q  207 cctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgt 306  Q
    ||||| ||||||| |  |    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  18535945 cctcaagctgagctttttacctctcaactagaaaatgcgtacatcgcactatgtcttcaaccttaaaactccacctcaa-aggtagatcatgaatattct 18536043  T
Q  307 tgcctccgcctctcaagactgat 329  Q
    | || ||||||||| || |||||    
T  18536044 taccaccgcctctccaggctgat 18536066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 327 - 485
Target Start/End: Original strand, 22801960 - 22802118
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    ||||||||||||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801960 gatcatgagtattgttgcctccgcctctccagactgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccactccactaggcatcactcccaaggtgag 22802059  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22802060 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccattagagcacccgcatcctca 22802118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47565978 - 47565681
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  47565978 agggtaatcccacaagccatgctatacatccttcaacctccagaatgccttccgtcttcatgaagaattcccttgctcacaa-tagagcatatcactcaa 47565880  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    ||| |||||||||| || |||| |||||| ||| |||| |||||||  || ||| | ||    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  47565879 ggttctccatagtcataccattcccggtgagttcaacttcacctcaaactaagctttctacctctcaactagcaaatatgtacatcccattatgtcttcc 47565780  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgat 364  Q
    || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47565779 accttgaaactccacctcaataggtagatcatgagtattgttaccttcgcctttccaaactgaccatgaatattcttaccaccgcctctccaggctgat 47565681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 327 - 482
Target Start/End: Original strand, 36920721 - 36920876
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||| |||| || || |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  36920721 gatcatgaatattgttgcctccgcctctccagactgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccgctccactaggcatcaatctcaaggtgag 36920820  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    |||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36920821 acacatcacattcttcatcctccaaacatcaccacaccatcagagcacccgcatcc 36920876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 12396719 - 12396888
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||||||  ||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12396719 aggacatctcatgcttccttgaagatcaccttacatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaacctc 12396817  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatag 177  Q
    || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12396818 cggaattccttctgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatag 12396888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 626 - 780
Target Start/End: Original strand, 12740850 - 12741007
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12740850 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 12740949  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatct 780  Q
    || ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12740950 agccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatct 12741007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 52094480 - 52094651
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52094480 ggttacctctacctccaccattttctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtcattggacttggtcaactccttggttcttaa 52094579  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52094580 agccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatctttgaagaattcaaa 52094651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5137137 - 5136971
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5137137 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 5137038  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  5137037 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 5136971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 626 - 780
Target Start/End: Original strand, 12749056 - 12749213
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| || |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12749056 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 12749155  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatct 780  Q
    || ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12749156 agccgcttgaacttcttcaaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatct 12749213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 572 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 26558813 - 26558584
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||||||  |||||||| | | | || |||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  26558813 ccatcttgtgatagttaaagtacttaaactttgacttgttaccattatttccacggttacctctacctccatcattccctcttgaaacacttaggtcttc 26558714  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    || || ||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||   ||||||||  ||||| |||    
T  26558713 actgttttcatcaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagtcgtttgaacttcttcctgggtggcagtgccttttttgccttag 26558614  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26558613 agcatggtatccttgaaagattcgaaagat 26558584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 487
Target Start/End: Original strand, 34571229 - 34571593
Alignment:
Q  114 cttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacg 213  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||    |||||||||||| |    
T  34571229 cttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcatagcacccaagg-ccttcatagttgtatcattctcggtgtcaccaactccacctcaag 34571327  T
Q  214 ctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctcc 313  Q
     ||||| ||   ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||   ||  | ||    
T  34571328 ttgagctta---tacctcaacttccaaatgcgtacatac-actatgtcttcaccttgcaa-ctccacctcaa-aggttgatcacgagtactcttcacacc 34571421  T
Q  314 gcctctcaagactgatca-tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatc 412  Q
     |||||| ||||| | || |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  34571422 acctctccagactaaccaatgagtattcttcacaccacctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagacgaacaccactctacaaggcatc 34571521  T
Q  413 actcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcata 487  Q
    | | |||||||||||   | | ||| |||| ||||||   ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  34571522 aataccaaggtgaga---aaccccaccttcatcatcctcccaacaactcaccaccaaagcacccgcatcctcata 34571593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7123695 - 7123587
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  7123695 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaa 7123596  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  7123595 ggattcaaa 7123587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 8394405 - 8394297
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  8394405 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaa 8394306  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  8394305 ggattcaaa 8394297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 436
Target Start/End: Original strand, 12740336 - 12740679
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||| || | |||| || ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  12740336 tacattcttcaaaccccggaatgtcttccgtcctcatgaagaattcacgtgcttacaactagagcataaacacccaagg-cctccatagttgtaccattt 12740434  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    ||||| |  | ||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| |||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  12740435 ccggtatcatcaactctacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtaca-cacactatg-cttccaccttgcaactccacctcaa-ag 12740531  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| || || | |||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12740532 gttgatcacgagtattgttcacaccgcctctccaggctaaccatgagtattcttctcaccgcctatccaggatgatgttgagtgtttaacgtctctccag 12740631  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcacc 436  Q
    | || |||| ||  || |||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  12740632 acgatcaccactttacaaggcatcaataccaaggtgagaaacctcacc 12740679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 436
Target Start/End: Original strand, 12748542 - 12748885
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||| || | |||| || ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  12748542 tacattcttcaaaccccggaatgtcttccgtcctcatgaagaattcacgtgcttacaactagagcataaacacccaagg-cctccatagttgtaccattt 12748640  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    ||||| |  | ||||| |||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| |||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  12748641 ccggtatcatcaactctacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtaca-cacactatg-cttccaccttgcaactccacctcaa-ag 12748737  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| || || | |||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12748738 gttgatcacgagtattgttcacaccgcctctccaggctaaccatgagtattcttctcaccgcctatccaggatgatgttgagtgtttaacgtctctccag 12748837  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcacc 436  Q
    | || |||| ||  || |||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  12748838 acgatcaccactttacaaggcatcaataccaaggtgagaaacctcacc 12748885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8394905 - 8394683
Alignment:
Q  169 cctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaact 268  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||    |||||||||||| | ||||| | | |||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  |     
T  8394905 cctccatagtcgtaccattcccggagtcaccaactccacctcaagttgagctttcgctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgcc 8394808  T
Q  269 ttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttg 368  Q
    ||   ||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8394807 ttgccactccacctcaa-aggttgatcatgagtattattcacaccgcctctccagactgatcatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttg 8394709  T
Q  369 agtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8394708 agtgtttaacgtctctccagacgaac 8394683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5137548 - 5137357
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  5137548 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcatga 5137452  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5137451 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 5137357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 7124164 - 7123973
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  7124164 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtacatcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 7124068  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| |||  | ||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7124067 gtattgttcacaccgcctctccagactaactatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 7123973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 693 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5872795 - 5872694
Alignment:
Q  693 cttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattca 792  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  5872795 cttggacttgttcaactccttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattca 5872696  T
Q  793 aa 794  Q
    ||    
T  5872695 aa 5872694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 572 - 680
Target Start/End: Complemental strand, 5099706 - 5099598
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||    
T  5099706 ccatcttatgacagttaaagctttcaaacgttgactttttaccactctttctccggttacctgtacctccatcattccctcttgagacacttagaccttc 5099607  T
Q  672 accgtgttc 680  Q
    |||||||||    
T  5099606 accgtgttc 5099598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 26559034 - 26558843
Alignment:
Q  326 tgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    ||||||||||||||||||||  |   ||| |||||||||||||||||||||| |||| | || | || | |||||| |  |||||||| ||| |||||||    
T  26559034 tgatcatgagtattcttaccgtcaactcttcaggctgatgttgagtgtttaatgtctgtacaaacgaccgccgctctataaggcatcagtccaaaggtga 26558935  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccatt 520  Q
    || |||||||| ||||| ||| || ||||| ||   || | || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26558934 gagacatcaccttcttcatcaccccaacaagac---acaaccaaagcacccacatcctcataaccctcgaagacaatttgtgcggagttaccatt 26558843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 389
Target Start/End: Original strand, 18536029 - 18536091
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18536029 gatcatgaatattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 18536091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 47565698 - 47565620
Alignment:
Q  312 ccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagat 390  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47565698 ccgcctctccaggctgatcatgagtattcttaccactgcctcttcaggttgatgttgagtgtttaacgtctctccagat 47565620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4588939 - 4588831
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||| | |||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  4588939 tcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcgttcatggtgacagtgtcttatttgcaatagagcatggtatccttgaa 4588840  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  4588839 ggattcaaa 4588831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 330 - 442
Target Start/End: Original strand, 3577934 - 3578046
Alignment:
Q  330 catgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagaca 429  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||      |||||| | ||||||||||||| |    
T  3577934 catgagtattcttactaccgcctctccatgctgatgttgagtgtttaacgtctcttcagacgatcaccgcgttgtaaggcattattcccaaggtgagaaa 3578033  T
Q  430 catcaccatcttc 442  Q
    ||||||| |||||    
T  3578034 catcaccttcttc 3578046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 5206844 - 5206952
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||||| | |||    
T  5206844 tcaagtccttggacttggtcaacttcttggttcttaaagctgcttggacttcctccaaggtgatagtgtcttcttttccatagaggatggtatcctggaa 5206943  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  5206944 ggattcaaa 5206952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Original strand, 5147078 - 5147177
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  5147078 tcaagtccttgaacttggtcaattgtttggttctcaaagccgcttggacttcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 5147177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 15313266 - 15313167
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  15313266 tcaagtctttgaacttggtcaactctttggttatcaaagttgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 15313167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Original strand, 22133206 - 22133297
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttca 100  Q
    |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22133206 gacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggcc-ttcttttaggataatcccgcaagccgtgctatacattcttca 22133297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 9225302 - 9225215
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  9225302 acttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 9225215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54882111 - 54881989
Alignment:
Q  126 tgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactc 225  Q
    ||||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||   ||||||||||||| | ||||| | |||    
T  54882111 tgaagaattcacatgctcacaactagagcataacacccaagg-cctccatagtcgtaccattctcggtgtcactaactccacctcaagttgagctttctc 54882013  T
Q  226 tacctcaactagcaaatgcgtaca 249  Q
    ||||||||||  |||||| |||||    
T  54882012 tacctcaacttccaaatgtgtaca 54881989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Original strand, 16932771 - 16932821
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggc 56  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16932771 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggc 16932821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 406 - 458
Target Start/End: Original strand, 18536807 - 18536859
Alignment:
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacac 458  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  18536807 aggcatcactcacaaggtgagaaacatcaccttcttcatcctccaaacaacac 18536859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 4559142 - 4559067
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcat 773  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || |||||||| || || ||||| |||||    
T  4559142 acttggttaactctttggttctcaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctcttttccataaagcat 4559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 532
Target Start/End: Original strand, 28202265 - 28202789
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||    
T  28202265 aggacatctcccgcttccttgaaggtcttcttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgagcgccgtgatatacattcttcaacctc 28202363  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  28202364 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaaacccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtgccattaccgatgtgttcaactcc 28202462  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28202463 acctcaagctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgaacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaataggtagatcatgagtattg 28202562  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  28202563 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgtcgagtgtttaacgtctctccagaagatcaccgctctact 28202662  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28202663 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaacttattcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataacccttagagacaatttg 28202762  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28202763 tgcggagttaccattaatctccggaca 28202789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 7 - 481
Target Start/End: Original strand, 50077699 - 50078171
Alignment:
Q  7 ggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctcc 106  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||        |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  50077699 ggacatctcccgcttccttgaaggccaccttgcatccaatcacccttgaccttttttt-agggtaatcccgcaagtcgtgctatacattctttaacctcc 50077797  T
Q  107 gaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcca 206  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  50077798 aaaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcatccaaggttctccatagtcgtaccattatcggtgtgttcaactcca 50077896  T
Q  207 cctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgt 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50077897 cctcacgctgagtgtactctacctcaactagcaaatgcatacatcctattatgtcttcaaccttgaagctccacctcaacaggtagatcatgagtattgt 50077996  T
Q  307 tgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccacta 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||    
T  50077997 tgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagaagacaaccactccaata 50078096  T
Q  407 ggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatc 481  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50078097 ggaatcaatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatc 50078171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 94 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 6996872 - 6996485
Alignment:
Q  94 ttcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggt 193  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  6996872 ttcttcaacctccggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagccgtaccattaccgat 6996774  T
Q  194 gtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtaga 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| | |||||    
T  6996773 gtgttcaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaaaatgtaga 6996674  T
Q  294 tcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaa 393  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6996673 tcatgagtactgttgcctccgcctctctagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgac 6996574  T
Q  394 caccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996573 caccgctccactaggcatcaatccaaatgtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 6996485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 31423940 - 31424415
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  31423940 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggcctttttt--agggtaatcccgcaagccgtgcaatacattcttcaacctc 31424037  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  31424038 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacc--tagagcatagcacccaaggtcccccatagtcgtactattaccggtgtgttcaactcc 31424135  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| ||||||| | |     |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||| |    
T  31424136 acctcaagctgagcttccaacctctcaactagcaaatgcgtacatcccattatgtgttcaaccttgaaactctacctcaacaggtagataatgagtattg 31424235  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31424236 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttaagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 31424335  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424336 aggaatcactcccaagatgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaataccacaccatcagagcacccgcatcctca 31424415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16430322 - 16429846
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  16430322 aggacatctcccgcttccttgaagatctccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattctccaacctt 16430224  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||    
T  16430223 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcataacatccaaggtcctccatagccgtaccattactggtgtgttcaactcc 16430124  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||| | ||||||| | |     ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16430123 accttaagctgagcttccatcctctcaactagaaaa-gcgtacataccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 16430025  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  16430024 ttacatccgcctctccagactgaccatgagtattcttaccaccgcctctccaagctgatgttgagtgtttaacttctctccagaagaccaccgttccact 16429925  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16429924 aggcatcactcccaaggtgagacacatcacctttttcatcctccaaacaacaccacaccaccagagca-ccgcatcctca 16429846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 6 - 368
Target Start/End: Original strand, 14098829 - 14099189
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14098829 aggacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccatgctatacattcttcaacctc 14098927  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  14098928 cagaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcataacacccaaggtcctccatagacataccattaccggtgtgttcaactcc 14099026  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14099027 acctcacgctgagcgtactctgcctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 14099126  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttg 368  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14099127 ttgcctccgcctcttcagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttg 14099189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16227337 - 16227109
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16227337 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 16227238  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16227237 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 16227138  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16227137 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 16227109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 51751206 - 51750978
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51751206 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 51751107  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51751106 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 51751007  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751006 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 51750978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 47178531 - 47178303
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47178531 ccatcttgtgacagttaaagcattcaagccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 47178432  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47178431 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaatgtaacagtgccttccttgccatagagc 47178332  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47178331 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 47178303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20301300 - 20301072
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20301300 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 20301201  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20301200 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 20301101  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20301100 atggtatctttgaacgattgaaaagattt 20301072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 387
Target Start/End: Original strand, 25249556 - 25249935
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  25249556 aggacatctcccgcttctttgaagatcatcttgcatccaatcacccttggcctttttt--agggtaatcccgcaagtcatgctatacattattcaacctc 25249653  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    |  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||    
T  25249654 cagaatgccttctgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagatcatagcacccaaggtcctccatagtcatacgatttccggtgtgttcaactcc 25249753  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  25249754 acctcaagtagagtgtactctacctcaattagcaaatgtgtacatcccactatgtcttccaccttaaaactccaactcaacaggtagatcatgagtattg 25249853  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcca 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25249854 ttgcctccgcctctccagactgatcattagtattcttaccaccacctctccagaatgatgtttagtatttaacgtctctcca 25249935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 574 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28841589 - 28841363
Alignment:
Q  574 atcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcac 673  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28841589 atcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttcttcggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttcac 28841490  T
Q  674 cgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcat 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28841489 cgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagcctcttgaacttcttccaaggtaacagtgtcttccttgccatagagcat 28841390  T
Q  774 ggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28841389 ggtatctttgaacgattcaaaagattt 28841363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 20301523 - 20301318
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301523 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 20301424  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20301423 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacatcatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 20301324  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  20301323 cggaca 20301318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 69 - 532
Target Start/End: Original strand, 13126369 - 13126826
Alignment:
Q  69 gtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggt 168  Q
    |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| || || |||  |||  |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| |||  |||||    
T  13126369 gtaatcccacaagccatgctatactttcttcaaacttcggaatgccttttgtcttcatgaagaatttccttgctcacaactagagcataacac--aaggt 13126466  T
Q  169 cctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaact 268  Q
    |||| ||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  13126467 cctctatagtcgtaccattttcagtgtgttcaactccacctctagctgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtacatcccactatgtcttccacc 13126566  T
Q  269 ttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttg 368  Q
    || ||||| ||||| || |||||||| |  |||||  || |||||||||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  13126567 ttgaaactccaccttaa-aggtagattacaagtattcttacctccgcctcttcagactaaccataagtattcttaccaccgcctctccaagttgatgttg 13126665  T
Q  369 agtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatca 468  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||   ||||| ||||||| ||    
T  13126666 agtgtttatcatctctccagacgaccaccgctctacaaggcatcactcccaaggtgagaaacatcgccttcttcatcctcc---caacaacacaccacca 13126762  T
Q  469 gagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13126763 aagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattgatctctggaca 13126826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 51751429 - 51751224
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51751429 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 51751330  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51751329 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 51751230  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  51751229 cggaca 51751224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 27338017 - 27338222
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27338017 gatcatgagtattcttaccaccgcctctctaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggaatcaatcccaaggtgag 27338116  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338117 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 27338216  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  27338217 cggaca 27338222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 16227560 - 16227355
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16227560 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttaagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 16227461  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16227460 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttttgcggagttatcattaatctc 16227361  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  16227360 cggaca 16227355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 27338240 - 27338471
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27338240 ccatcttgtgacagttaaagcattcaggctttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 27338339  T
Q  672 accgtgttcatgagt---caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    ||||||||| ||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  27338340 accgtgttcttgaattctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatag 27338439  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27338440 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 27338471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 28202807 - 28203037
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28202807 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 28202906  T
Q  672 accgtgttcatga---gtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  28202907 accgtgttcatgaattctcaagttcttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaatttcatccaaggt-acagtgccttctttgccatag 28203005  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28203006 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 28203037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 47178754 - 47178549
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47178754 gatcatgagtattcttaccaccgcctctctaggttgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 47178655  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47178654 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagataatttgtgcggagttaccattaatctc 47178555  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  47178554 cggaca 47178549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 272 - 485
Target Start/End: Original strand, 29003139 - 29003352
Alignment:
Q  272 aaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagt 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29003139 aaactccacctcaacaggtagatcatgcgtattgttgcctccgcctctccagactgatcatgagtatttttaccaccgcctctccaggctgatgttgagt 29003238  T
Q  372 gtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagag 471  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29003239 gtttaacgtctctccagacgaccgccgctccactaggcatcactgccaaggtgtgacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagag 29003338  T
Q  472 cacccgcatcctca 485  Q
    ||| | ||||||||    
T  29003339 cactcacatcctca 29003352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 272 - 474
Target Start/End: Original strand, 28997423 - 28997625
Alignment:
Q  272 aaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagt 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28997423 aaactccacctcaacaggtagatcatgcgtattgttgcctccgcctctccagactgatcatgagtatttttaccaccgcctctccaggctgatgttgagt 28997522  T
Q  372 gtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagag 471  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  28997523 gtttaacgtctctccagacgaccgccgctccactaggcatcactgccaaggtgtgacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagag 28997622  T
Q  472 cac 474  Q
    |||    
T  28997623 cac 28997625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51751599 - 51751392
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51751599 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 51751501  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  51751500 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 51751401  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  51751400 caggctgat 51751392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 47178924 - 47178726
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47178924 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 47178826  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  47178825 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 47178726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 329
Target Start/End: Original strand, 27337752 - 27338054
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  27337752 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaac--- 27337847  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
                    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  27337848 ----------------ttcatgaagaaatccattgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgaaacattaccggtgtgttcaactcc 27337930  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  27337931 acctcgcgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattc 27338030  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgat 329  Q
    || || ||||||||| || |||||    
T  27338031 ttaccaccgcctctctaggctgat 27338054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 123 - 303
Target Start/End: Original strand, 31736531 - 31736710
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31736531 tcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggttctccatagccgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcgta 31736629  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31736630 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 31736710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16227729 - 16227523
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16227729 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 16227632  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  16227631 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatatcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 16227532  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  16227531 caggctgat 16227523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20301693 - 20301486
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20301693 cttcatgaagaaatcctttgctcacga-tagagcatagcactcaaggtccttcatagccgtaccattactggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 20301595  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  20301594 tactctacctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcgacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 20301495  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  20301494 caggctgat 20301486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 327 - 485
Target Start/End: Original strand, 31736699 - 31736857
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31736699 gatcatgagtattcttacaaccgcctctccaggctaatgttgagtgtttaacgtctctccaaacgaccaccgcttcactaggcatcactcccaaggtgag 31736798  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736799 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 31736857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 572 - 798
Target Start/End: Original strand, 8348178 - 8348407
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||  || |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||    
T  8348178 ccatcttgttacaattaaagcatttaaactttgacttgttaccactctttctctggttacctctacctccaccatttccttttgaaacacttaggccttc 8348277  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    || || ||||  |    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  8348278 actgttttcaccaactatcaagttcttggacttggttaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaagataatagtgccttatttgccatag 8348377  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8348378 agcatgatatctttgaacgattcaaaagat 8348407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 344 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28841764 - 28841615
Alignment:
Q  344 ccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcg 443  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28841764 ccaccgcctctccaggctgatgttgggtgtttaacgtctcgccagacgaccatcgctccactacgcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttca 28841665  T
Q  444 tcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctc 493  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28841664 tcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctc 28841615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 123 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28841917 - 28841760
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28841917 tcatgaagaaattccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtttttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcgta 28841819  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  28841818 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacc 28841760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 572 - 795
Target Start/End: Original strand, 13126844 - 13127070
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||    
T  13126844 ccatcttgttacagttaaagcatttaaactttgacttgttatcagtctttccccggttacatctacctccaccattccctcttgaaacacttacgccttc 13126943  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    ||| | ||||| ||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  13126944 accattttcatcagctctcaagtccttggatttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtaccttctttgccatag 13127043  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaa 795  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  13127044 agcatggtatcttcgatagattcaaaa 13127070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 31658254 - 31658083
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  31658254 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaattccttggttcttaa 31658155  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31658154 agccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 31658083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 574 - 778
Target Start/End: Original strand, 3805240 - 3805447
Alignment:
Q  574 atcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcac 673  Q
    ||||| || ||||||||||| | | || || |||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||    
T  3805240 atcttatgacagttaaagcacttaaactttaacttgttatcactattttcccggttacctctacctccaccattccctcttgaaacactcaagccttcac 3805339  T
Q  674 cgtgttcatgagt---caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagag 770  Q
    | | ||||| |||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||| |||| |||||||||||    
T  3805340 cattttcatcagttctcaagtcataggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttctaaggtgacagtgtcttctttgccatagag 3805439  T
Q  771 catggtat 778  Q
    ||||||||    
T  3805440 catggtat 3805447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 441
Target Start/End: Original strand, 50167982 - 50168302
Alignment:
Q  118 cgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctg 216  Q
    |||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| | ||    
T  50167982 cgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataaacacccaagg-cctccatagtcgtaccatttccggtgtcatcaactccacctcaagttg 50168080  T
Q  217 agcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcc 316  Q
    ||  | |||||||||||||  |||||| ||||| | ||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||| ||||||  ||  | |||||    
T  50168081 agttttctctacctcaacttccaaatgtgtaca-cacactatgccttcaccttgcaa-ctccacctcaa-aggttgatcacgagtattattcacaccgcc 50168177  T
Q  317 tctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactc 416  Q
    |||| || ||   | ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||| |     
T  50168178 tctccaggctatccttgagtattcttcctaccgcctttccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccgctctacaaggcatcaata 50168277  T
Q  417 ccaaggtgagacacatcaccatctt 441  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  50168278 ccaaggtgagaaacctcaccttctt 50168302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 50168468 - 50168639
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||| || |||||  |   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50168468 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacacaaaggccttcactgttttcatttgctctcaagtcattggacttgatcaactccttggttctcaa 50168567  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || || |||||||| ||||||||| | | ||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  50168568 agccgtttgaacttcttccaaggtgacaatgccttcttttccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 50168639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 28222539 - 28222710
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28222539 ggttatctctacgtccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttcttaa 28222638  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28222639 agccgcctgaacttcttccaaggtgacagtgccttcttttccatatagcatggtatccttgaaggattcaaa 28222710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 331 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 31658467 - 31658287
Alignment:
Q  331 atgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacac 430  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||| ||    
T  31658467 atgagtattctttccactgcatctccagaatgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccactctacaaggcatcaataccaaggtgagaaac 31658368  T
Q  431 atcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagtt 514  Q
     ||||   |||| ||||||   ||||| | ||| | || ||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| ||||||||    
T  31658367 ctcac---cttcatcatcctcccaacaactcacaaccaaagcacccgcatcctcatactcctcagacacaacttgcgcggagtt 31658287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 776613 - 776246
Alignment:
Q  114 cttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcac 212  Q
    |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||  | ||||||||||||     
T  776613 cttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataaacacccaagg-cctccatagtggtaccatttccggtgttatcaactccacctcaa 776515  T
Q  213 gctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctc 312  Q
    | ||||| |  ||||||||||||  |||||||||| | | ||||||| ||||| ||| ||| || |||||||| |||| ||||| ||||||  ||  | |    
T  776514 gttgagctttatctacctcaacttccaaatgcgtata-cacactatgccttcaccttgcaa-ctccacctcaa-aggttgatcacgagtattattcacac 776418  T
Q  313 cgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatc 412  Q
    |||||||| || ||   | | ||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  776417 cgcctctccaggctatccttcagtattcttcccaccgcctccccaagctgatgttgagtgtttaatgtctctcaagacgaacaccactctacaaggcatc 776318  T
Q  413 actcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcata 487  Q
    | |  |||||||||| || ||||   |||| ||||||   ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  776317 aatatcaaggtgagaaacctcac---cttcatcatcctcccaacaactcaccaccaaagcacccgcatcctcata 776246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 389 - 485
Target Start/End: Original strand, 25250566 - 25250662
Alignment:
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25250566 atgaccaccgctccactaggcatcattctcaaggtgagacacatcacattcttcaccctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 25250662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 409 - 532
Target Start/End: Original strand, 8348039 - 8348160
Alignment:
Q  409 catcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgc 508  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||   ||||  | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  8348039 catcactcccaaggtgagaaacatcaccttcttcatcctccaaacaacac---accacaaaagcacccgcgtcctcataaccctcagaaacaatttgtgc 8348135  T
Q  509 ggagttacc-attaatctccggaca 532  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  8348136 ggagttaccaattaatctccggaca 8348160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 169 - 514
Target Start/End: Original strand, 28222106 - 28222443
Alignment:
Q  169 cctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaact 268  Q
    ||||||||||  || |||| |||||||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  28222106 cctccatagttataccattcccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtaca-cacactatgccttcacct 28222204  T
Q  269 ttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatca-tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgtt 367  Q
    | ||| || |||||||| |||| ||||| |||||   ||  | |||||| || || || | || |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||    
T  28222205 tgcaa-ctccacctcaa-aggttgatcacgagtactcttcacaccgcctatccaggctaaccaatgagtattcttcacactgcctctctaggctgatgtt 28222302  T
Q  368 gagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatc 467  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| ||| || |||||||| | ||||||||||| || ||||   |||| || |||   ||||| ||||||| |    
T  28222303 gagtgtttaacgtctctccaaacgaccaccactctacaaggcatcagtaccaaggtgagaaacctcac---cttcatcctcc---caacaacacaccacc 28222396  T
Q  468 agagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagtt 514  Q
    | ||||||| ||||||||||  |||| || |||| ||| ||||||||    
T  28222397 aaagcacccacatcctcatactcctcggacacaacttgcgcggagtt 28222443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 363
Target Start/End: Original strand, 13548287 - 13548556
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |    
T  13548287 tacattcttcaaaccccggaatgccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagaacatagcactcaagg-cctccatagttgtaccattcc 13548385  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacagg 289  Q
    ||||||  | |||||||||| | | ||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| | |||| |||||||| |||    
T  13548386 cggtgtcatcaactccaccttaagttgagctttctctaccttaacttccaaatgcgtaca-cacactatgccttcaccttgc-aactccacctcaa-agg 13548482  T
Q  290 tagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctga 363  Q
    | ||||| |||||   ||  | ||| ||||| ||  | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13548483 ttgatcacgagtactcttcacaccgtctctccaggataaccatgagtattcttcccaccgcctctccaggctga 13548556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 51758534 - 51758475
Alignment:
Q  741 caaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51758534 caaggtaacagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaaagattcaaaagattt 51758475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25127181 - 25127081
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||        ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25127181 aggacatctcccgcttccttgaaggtctccttccatccaattacccttggcc-tttttttagggtaatcccacaagccgtgctatacattcttcaacctc 25127083  T
Q  106 cg 107  Q
    ||    
T  25127082 cg 25127081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 626 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 776123 - 775961
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  776123 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacacaaaggccttcactgttttcattcgctctcaagtccttggacttggtcaacttcttggttctcaa 776024  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    || || ||| |  |  ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  776023 agccgattggatctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 775961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28842014 - 28841916
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28842014 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggcc-ttcttttagtgtaatcccgcaagctgtgctttacattcttcaacctc 28841916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 105
Target Start/End: Original strand, 31736434 - 31736532
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||        || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31736434 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatcctatcacccttggccttctttt-agagtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 31736532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 187
Target Start/End: Original strand, 31928880 - 31928975
Alignment:
Q  91 acattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcatt 187  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  31928880 acattcttcaacccccgaaatgtctttcgtcctcttgaagaattctcttgctcacaactagagcatatcacccaaggt-ctccatagtcgtaccatt 31928975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 19359748 - 19359649
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  19359748 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggaactcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 19359649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 41397420 - 41397515
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  41397420 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 41397515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16227824 - 16227774
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggc 56  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16227824 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggc 16227774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 19753532 - 19753440
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaat-agcactcaaggtcctccatagtcgta 182  Q
    |||||||||||| | |||||||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19753532 tacattcttcaaaccccgaaatgccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataagcacccaagg-cctccatagtcgta 19753440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 51751691 - 51751644
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggc 56  Q
    ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  51751691 acatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggc 51751644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31658626 - 31658561
Alignment:
Q  169 cctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaac 234  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  | |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  31658626 cctccatagtcgtaccattcccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaac 31658561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 47099728 - 47099683
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttg 731  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  47099728 tcaagtccttgaacttggttaattccttggttctcaaagtcgcttg 47099683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 532
Target Start/End: Original strand, 20504770 - 20505295
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20504770 aggacatctcccgcttccttaaaggtctccttgcatccaatcccccttggcatttttttaagggtaatcccgtaagccgtgctatacattcttcaacctc 20504869  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  20504870 cgtaatgccttccgtcttcatgaacaaatcccttgctcacca-tagagcataacatccaaggtcctccatagccgtaccattaccggtgtgttccactcc 20504968  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20504969 acctcacgctgagtgtactctaactcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 20505068  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  20505069 ttgcctccgcctctcgagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgtcgagtgtttaacgtctctctagacgaccaccactccact 20505168  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttg 505  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20505169 aggcatcaacctcaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttg 20505268  T
Q  506 tgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20505269 tgcagagttaccattaatctccggaca 20505295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27911791 - 27911330
Alignment:
Q  22 ccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtc 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  27911791 ccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctccagaatgccttccgtc 27911693  T
Q  122 ttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27911692 ttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcgt 27911594  T
Q  222 actctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctca 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  27911593 actctaccttaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgtctccgcctctct 27911494  T
Q  322 agactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaag 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27911493 agactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgtcgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaag 27911394  T
Q  422 gtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911393 gtgagacacgtcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 27911330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 6 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 659394 - 658919
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  659394 aggacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccttttttttagggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 659295  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  659294 cgaaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcatca-tagagcaaagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccagtgtgttcaactcc 659196  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  659195 acctcacgctgagcgtactctacctaaactagaaaatgcgtacatcccactatgtcttcaatcttgaaactccatctcaacaggtagatcatgagtattg 659096  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  659095 ttgcctccgcctctccagactgatcatgattattcttacgaccgcctctctaggctgatggtgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 658996  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658995 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcc 658919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 18510318 - 18510795
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18510318 aggacatctcccgcttccttgaagatctccttgcctccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattctttaacctc 18510416  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18510417 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 18510515  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||      
T  18510516 acctcacactgagagtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagattatgagtattt 18510615  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18510616 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtgttcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctcttcagacgaacaccgctccact 18510715  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18510716 aggcatcactcccaaggtgagacacatcatcttattcatcgtccaaacaacaccacaccatcagagcacccacatcctca 18510795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 123 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18468282 - 18467874
Alignment:
Q  123 tcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgta 222  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18468282 tcatgaagaaatccattgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagccgtgccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcgta 18468184  T
Q  223 ctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaa 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |    
T  18468183 ctctacctcagctagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgattgttgttgcctccgcctctcca 18468084  T
Q  323 gactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaagg 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468083 gactgatcatgggtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtttttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcactcccaagg 18467984  T
Q  423 tgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaa 522  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467983 tgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcatagcacctgtgtcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaa 18467884  T
Q  523 tctccggaca 532  Q
    ||||||||||    
T  18467883 tctccggaca 18467874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20044346 - 20043870
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20044346 aggacatctcccgcttccttgaaggtttccttgcatccaatcacccttgaccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 20044248  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| |  | ||||||    
T  20044247 cggaatgtcttccgtcttcatgaagaaatctcttgctcaccactagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgcaacattactggtct--tcaactcc 20044150  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| ||||||| | |     ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20044149 acctcaagctgagcttccaacctctcaactagcaaatgtgtacatcccgctatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 20044050  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20044049 ttgtcttcgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccacctctccaagatgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 20043950  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20043949 aggaatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctca 20043870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10750867 - 10750639
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750867 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 10750768  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10750767 accgtattcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 10750668  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10750667 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 10750639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 15355959 - 15356187
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355959 ccatcttatgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 15356058  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356059 accgtattcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 15356158  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356159 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 15356187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23666215 - 23665987
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666215 ccatcttatgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 23666116  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23666115 accgtattcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 23666016  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23666015 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 23665987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 34478529 - 34478757
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34478529 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccctc 34478628  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34478629 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacaatgccttccttgccatagagc 34478728  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34478729 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 34478757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 226 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 25806587 - 25806350
Alignment:
Q  226 tacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25806587 tacctcaactagcaaatgcgtacttcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgcctccgcctctctagac 25806488  T
Q  326 tgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25806487 tgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtga 25806388  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacac 463  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  25806387 gacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacac 25806350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 31543902 - 31543674
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31543902 ccatcttgcgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccctc 31543803  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31543802 actgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagctgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 31543703  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543702 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 31543674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 15355736 - 15355941
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15355736 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 15355835  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15355836 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcaaagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatctc 15355935  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  15355936 cggaca 15355941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18467856 - 18467625
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  18467856 ccatcttgtgacagttaaagcattcaggctttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgaaacacttaggccttc 18467757  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  18467756 accgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttgattctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtcccttctttgccatag 18467657  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18467656 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 18467625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 34478306 - 34478511
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34478306 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 34478405  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34478406 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcaccagcatcctcataacccttagagacaatttgtgtggagttaccattaatctc 34478505  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  34478506 cggaca 34478511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23666439 - 23666233
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac-accgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23666439 gatcctgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgacccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtga 23666340  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatct 525  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23666339 gacacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatct 23666240  T
Q  526 ccggaca 532  Q
    |||||||    
T  23666239 ccggaca 23666233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 6746240 - 6746009
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  6746240 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccgattacctctacctccaccatttcctcttgagacacttaggccttc 6746141  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    | |||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6746140 atcgtgttcacgaactctcaagtcattggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatag 6746041  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746040 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 6746009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 6746463 - 6746258
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6746463 gatcatgagtattcttaccaccacctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcaagacgaacaccgctccactaggcatcaatcctaaggtgag 6746364  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6746363 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccattagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccatcaatctc 6746264  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  6746263 cggaca 6746258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 31544125 - 31543920
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31544125 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctatagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 31544026  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31544025 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcacaaccctctgagataatttgtgcggaattaccattaatctc 31543926  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  31543925 cggaca 31543920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 340 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 10751077 - 10750885
Alignment:
Q  340 cttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatc 439  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  10751077 cttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgagacacatcaccttc 10750978  T
Q  440 ttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10750977 ttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgctgagttaccattaacctccggaca 10750885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 20505313 - 20505544
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||    
T  20505313 ccatcttgtgacagttaaaacattcagattttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaagacttc 20505412  T
Q  672 accgtgttcatgagt---caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  20505413 accgtgttcatgaattctcaagtccttggacttggtcaactccttagttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttcccatag 20505512  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20505513 agcatagtatctttgaacgattcaaaagattt 20505544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 251 - 485
Target Start/End: Original strand, 31467036 - 31467274
Alignment:
Q  251 cccactatgtcttcaactttcaaacttcacctca----acaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttacca 346  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  31467036 cccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcatgcaacaggtagattatgagtattgttgcctccgcctgtccagacttatcatgagtattcttacca 31467135  T
Q  347 ccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtca 446  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||     
T  31467136 ccgcctctccaggatgatgttgagtgtttaacgtctctccaaacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaagtgagacacatcaccttcttcatcc 31467235  T
Q  447 tccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31467236 tccaaacaacaccacaccatcagagcacccacatcctca 31467274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31544295 - 31544088
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31544295 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 31544197  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  31544196 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 31544097  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  31544096 caggctgat 31544088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6746728 - 6746452
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6746728 aggacatctcctgcttctttgaaggtcaccttgcatccaatcacccttggtcttctttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 6746630  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    |                   |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6746629 c-------------------tgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 6746550  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6746549 acctcacggtgagcatactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 6746452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 34478137 - 34478343
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34478137 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 34478234  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  34478235 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 34478334  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  34478335 caggctgat 34478343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23666608 - 23666402
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23666608 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 23666511  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||    
T  23666510 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcctgagtattcttaccaccgcctctc 23666411  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  23666410 caggctgat 23666402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 15355566 - 15355773
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatccc-ttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagc 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15355566 cttcatgaagaaatccccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagc 15355663  T
Q  220 gtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctct 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||    
T  15355664 gtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctct 15355763  T
Q  320 caagactgat 329  Q
    | || |||||    
T  15355764 ccaggctgat 15355773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10756455 - 10756275
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  10756455 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgagttcaactccacctcacgctgagca 10756358  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10756357 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 10756275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 225
Target Start/End: Original strand, 31466815 - 31467031
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31466815 aggacatctcccactttcttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggcctttttt--agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 31466912  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31466913 tgaaatgtcttccgtcttcatgaagaaatctcttgctcacca-tagagcatagcaaccaaggtcctccatagtcgtaccattatcggtgtgtttaactcc 31467011  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactc 225  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  31467012 acctcaagctaagcgtactc 31467031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 6 - 147
Target Start/End: Original strand, 41586911 - 41587051
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41586911 aggacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggcctcttttt-agagtaatcccacaagccgtgctgtacattcttcaacctc 41587009  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca 147  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41587010 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca 41587051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16408385 - 16408214
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||  || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16408385 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccttcattgtcttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 16408286  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16408285 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 16408214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 29721425 - 29721254
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29721425 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccttcactgttttcatctgctcttaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 29721326  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  29721325 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 29721254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16545485 - 16545319
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16545485 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 16545386  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16545385 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 16545319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 29721939 - 29721636
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactc--aaggtcctccatagtcgtatcatt 187  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  ||||  || | ||||||||||| || ||||    
T  29721939 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcgcatgctcacaactagagcataaaactcccaaag-cctccatagtcataccatt 29721841  T
Q  188 a-ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaac 286  Q
      |||||||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||   ||| ||||||||     
T  29721840 ttccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccactttgccactccacctcaa- 29721744  T
Q  287 aggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcc 386  Q
    |||| ||||| |||||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29721743 aggttgatcacgagtattgttatcaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcc 29721644  T
Q  387 agatgaac 394  Q
    ||| ||||    
T  29721643 agacgaac 29721636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 40381161 - 40380995
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  40381161 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 40381062  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  40381061 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 40380995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 9788339 - 9788510
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9788339 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccgtcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 9788438  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| || |||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  9788439 agccgcttgaacttctttcaaggtgacagtgcattatttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 9788510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16546005 - 16545705
Alignment:
Q  91 acattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    ||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||| |||  | | ||| | || |||||| |||| |||| |    
T  16546005 acattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcaccactagagcataaactcccaaagccc-ccatagccgtaccattcc 16545907  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacagg 289  Q
    ||||||  | |||||||||||| | ||||| | | |||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||    
T  16545906 cggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttcgctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-agg 16545810  T
Q  290 tagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    | ||||| |||||| ||| || ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16545809 ttgatcacgagtattgttaccaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccaga 16545710  T
Q  390 tgaac 394  Q
     ||||    
T  16545709 cgaac 16545705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 13487588 - 13487171
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||  || ||||      
T  13487588 tacattcttcaaaccccggaatgccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataacacccaagg-cctccatagttataccattct 13487490  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacagg 289  Q
    ||||||  | |||||||||| | | ||| | | |||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||| ||| | | || |||||||| |||    
T  13487489 cggtgtcctcaactccaccttaagttgatctttctctacctcaacttccgaatgcgtaca-cacactatgtcttcaccttgcta-ctccacctcaa-agg 13487393  T
Q  290 tagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    | ||||| |||||   ||  | ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| || |||||| || ||||||||||||||||| | |    
T  13487392 ttgatcacgagtactcttcacaccgcctctccagactaaccatgagtattcttcccaccgcttctgcaagctgatattaagtgtttaacgtctctctata 13487293  T
Q  390 tgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataac 489  Q
     ||||||| ||| || ||||||||    |||||||||| || ||||   |||| ||||||   ||||| | |||||||| || |||||||||||||||      
T  13487292 cgaacaccactctacaaggcatcaaaagcaaggtgagaaacctcac---cttcatcatcctcccaacaactcaccatcaaagtacccgcatcctcatact 13487196  T
Q  490 cctctgagacaatttgtgcggagtt 514  Q
    |||| || |||| ||| ||||||||    
T  13487195 cctcggacacaacttgcgcggagtt 13487171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13487075 - 13486904
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |||  || |||||  |   | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  13487075 ggttacctctaccttcaccattccctcttgaaacactaatgccttcattgttttcatccgctcttaagtccttagacttggtcaactccttggtttttaa 13486976  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13486975 agccgcttgaacatattccaaggtgacagtgccttctttaccatagagcatggtatccttgaatgattcaaa 13486904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 42427549 - 42427720
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42427549 ggttacctctacctccaccatttcttcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctgaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 42427648  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||    
T  42427649 agtcgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttttttgccatagagtgtggtatagttgaaggattcaaa 42427720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26174344 - 26174010
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  | | ||| | ||||||||||| || ||||     
T  26174344 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataaactcccaaag-cctccatagtcataccattc 26174246  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||  | |||||||||| | | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| | | |||||| |||| || ||   ||| |||||||| ||    
T  26174245 ccggtgtcatcaactccaccttaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttgc-actatg-cttccaccttgccactccacctcaa-ag 26174149  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | || |||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26174148 gttgatcacgagtattgttcacacctcctctccagactaaccatgagtattctcaccatcgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 26174049  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgaga 427  Q
    | ||||  | ||| || ||| |||| | |||||||||||    
T  26174048 acgaaccacactctacaaggaatcaataccaaggtgaga 26174010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 326 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16408666 - 16408565
Alignment:
Q  326 tgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| || ||| |||| | |||||||||    
T  16408666 tgatcatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaaccacactctacaaggaatcaataccaaggtga 16408567  T
Q  426 ga 427  Q
    ||    
T  16408566 ga 16408565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 626 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 26173830 - 26173707
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26173830 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 26173731  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggt 746  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  26173730 agccgcttgaacttcttccaaggt 26173707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 40381682 - 40381381
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||||||||  | | ||||||||||||||| |||  | | ||| | ||||||||| |||| ||||     
T  40381682 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaatccacatgctcaccactagagcataaactcccaaag-cctccatagccgtaacattc 40381584  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||| ||    |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| ||    
T  40381583 ccggagttaccaactccacctcaagttgagctttctctgcctcaacttccaaatgcgtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-ag 40381487  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40381486 gttgatcacgagtattgttatcaccgcctctccaaactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccag 40381387  T
Q  389 atgaac 394  Q
    | ||||    
T  40381386 acgaac 40381381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 13295204 - 13295033
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    |||||| ||||| ||||||||| || | |||| || | ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||      
T  13295204 tacatttttcaaactccgaaatgtcgttcgtcctcttaaagagctcccttgctcacaactagagcatagcacccaaggt-ctccatagtcgtaccatttt 13295106  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtctt 263  Q
     |||||  | | |||||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||    
T  13295105 tggtgtcatcatctccacctcaagctgagctttctctacctcaacttccaaatgagtac-ttccactatgtctt 13295033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 436
Target Start/End: Original strand, 42427276 - 42427381
Alignment:
Q  331 atgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacac 430  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| || |||||||| | ||||||||||| ||    
T  42427276 atgaatattcttcccatcgcctctccaggatgatgttgagtgtttaacgtctctccagacaaccaccactctacaaggcatcaataccaaggtgagaaac 42427375  T
Q  431 atcacc 436  Q
     |||||    
T  42427376 ctcacc 42427381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 626 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 534788 - 534675
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||  |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  534788 ggttacctctacctccaccatttcttcttgaaacactaaggcattcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 534689  T
Q  723 agacgcttgaactt 736  Q
    |  |||||||||||    
T  534688 atccgcttgaactt 534675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 535299 - 534956
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  ||||||||  ||||||||| || | ||||||  ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||| ||| ||||     
T  535299 tacattcttcaaaccccggaatgccttccgtccccatgaagaattcacatgctcataactagagcataaacacccaagg-cctccatagttgtaccattc 535201  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    ||| | |  | |||||||||| | | ||||| | |||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||  || |||||||| ||    
T  535200 ccgatatcctcaactccaccttaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgcgtaca-catactatgccttcaccttgcac-ctccacctcaa-ag 535104  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||   ||  | |||||| || || || | |||||||||| || ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  535103 gttgatcacgagtactcttcacaccgcctatccaggctaaccatgagtattattcccagcgcctctcgaggctgatgttgagtgtttaacgtctctctag 535004  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcacc 436  Q
    | || |||| ||| || |||||||| | ||||||| ||| || |||||    
T  535003 acgatcaccactctacaaggcatcattaccaaggtaagaaacctcacc 534956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 18468376 - 18468281
Alignment:
Q  9 acatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18468376 acatctctcgcttccttgaagatcaccttgcatctaatcacccttggccttctttt-agggtaatcctgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 18468281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 686 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 32584843 - 32584731
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||   |||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||    
T  32584843 tcaagtccatggacttggttaactctttggttctcaattccgcttggacttcctcaaaggtgatagttccttccttgccataaatcatggtatccatgaa 32584744  T
Q  786 cgattcaaaagat 798  Q
     || |||||||||    
T  32584743 ggactcaaaagat 32584731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 13694259 - 13694430
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||    ||||||||| |||  || ||||| ||   |||| |||||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13694259 ggttatctctacctccaccattccctcatgaagtacttaggccttcattgttttcattagctctcaactccttgaacttggttaactcattggtcctcaa 13694358  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || |||||| ||||  | ||| || | | || |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  13694359 agccgcttggacttccttcaaagtgacaatgtcttctttgccatagagcatggcatccttgaaggattcaaa 13694430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 778
Target Start/End: Original strand, 43596302 - 43596390
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtat 778  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  43596302 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 43596390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 778
Target Start/End: Original strand, 43629096 - 43629184
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtat 778  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  43629096 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtat 43629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 27449003 - 27449098
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||| | ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  27449003 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgtcctccttaccataaaggatggtatccttgaa 27449098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 28788658 - 28788583
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcat 773  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||| |||| |||||||| |||||    
T  28788658 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgtcttctttgccataaagcat 28788583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 31397898 - 31397803
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  31397898 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 31397803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 33790496 - 33790591
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  33790496 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 33790591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 37557530 - 37557435
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  37557530 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 37557435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 24556493 - 24556396
Alignment:
Q  688 aagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  24556493 aagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 24556396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 688 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 24597525 - 24597428
Alignment:
Q  688 aagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||  ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  24597525 aagtccttgaacttggtcaattatttggttctcaaagccgattggacttcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 24597428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 51393 - 50916
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51393 aggacatctcccgcttccttgaagatcaccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 51295  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || ||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  51294 cggaacgccttccgtcttcgtgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaacgtcctccatagccgtaccattaccggtgtgttcaactcc 51196  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  51195 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 51096  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51095 ttgtctccgcctctctagactaatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 50996  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50995 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctcgaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 50916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 287; Significance: 1e-160; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41384082 - 41383618
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41384082 aggacatctcccgcttccttgaaggtcaccttgcatcaaataacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctc 41383984  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41383983 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcatccaaggtcctccatagccgtaccattaccggtgtgttcaactcc 41383885  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41383884 acctcaagatgagcgtactctacctcaactagcaaatgtgcacatctcactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattg 41383785  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41383784 ttgcctccgcctctccaaactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgatcaccgctccact 41383685  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagca 473  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  41383684 aggcatcactctcaaggtgagacacatcaccttcatcatcctccaaacaa-accacaccatcagagca 41383618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15072187 - 15071820
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||      
T  15072187 aggacatctcctgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccttttttt-agggtaatcctgcttgccgtgctatacattcttcaacc-- 15072091  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  15072090 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcactcaaggtcttccattgtcgtaccattaccagtgtgttcaactcc 15071992  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  15071991 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaataggtagatcatgagtattg 15071892  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaa 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15071891 ttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaa 15071820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 573 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 43080825 - 43080598
Alignment:
Q  573 catcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatca 672  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080825 catcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgccttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatca 43080726  T
Q  673 ccgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagca 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43080725 ccgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagca 43080626  T
Q  773 tggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080625 tggtatctttgaacgattcaaaagattt 43080598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 18811932 - 18811704
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  18811932 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggctctc 18811833  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18811832 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagacc 18811733  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18811732 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 18811704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 27828209 - 27827981
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27828209 ccatcttgtgatagttaaagcattcaaactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctgcaccattccctcttgagacacttaggccctc 27828110  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27828109 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatatagc 27828010  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828009 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 27827981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 21481818 - 21481435
Alignment:
Q  116 tccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| || ||||||||| | |    
T  21481818 tccgtcttcatgaagaaatccattgctcaccactagagcatagctcccaaggtcttccatagtcgtaccatttccgatgtgttcaaatccacctcaagtt 21481719  T
Q  216 gagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgc 315  Q
    |||| | |     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21481718 gagcttccaacctctcaactagcaaatgtgtaaatcccactatgtcttccaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattgttacctccgc 21481619  T
Q  316 ctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcact 415  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||| |  ||||| ||||    
T  21481618 ctctccagactgatcatgagtattcttaccatcgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcttgacgaccaccgctctatcaggcaacact 21481519  T
Q  416 cccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaat 502  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||   | ||||| || | |||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21481518 cccaaggtgagaaacatcaccttcttcatcctccatacaa---cgcaccaccaaaacacatgcatcctcataaccctcagagacaat 21481435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 43081049 - 43080844
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43081049 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 43080950  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43080949 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagctaccattaatctc 43080850  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  43080849 cggaca 43080844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 15069794 - 15069563
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  15069794 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttattaccactctttctctggttacctctatctccaccgttccctcttgagacacttaggccttc 15069695  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15069694 accgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatag 15069595  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15069594 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 15069563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 18812155 - 18811950
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18812155 gatcatgagtattcttaccaccgcctttccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgcttcactaggcatcaatcccaaggtgag 18812056  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18812055 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 18811956  T
Q  527 cggaca 532  Q
     |||||    
T  18811955 tggaca 18811950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 27828432 - 27828227
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27828432 gatcatgagtattcttactaccacctctccaggttgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 27828333  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  27828332 acacatcatcttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacctgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaacctt 27828233  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  27828232 cggaca 27828227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18812324 - 18812144
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18812324 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 18812227  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18812226 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 18812144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43081218 - 43081012
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43081218 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 43081121  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  43081120 tactctacctcaactagtaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 43081021  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  43081020 caggctgat 43081012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 121 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27828602 - 27828421
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27828602 cttcatgaagaaatcccttactcacca-tagagcatagcacccaaggttcttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 27828504  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27828503 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatccaactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 27828421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 373 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 15069971 - 15069812
Alignment:
Q  373 tttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagc 472  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||    
T  15069971 tttaacgtctcttcagatgaccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgagatccatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcaaagc 15069872  T
Q  473 acccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15069871 acctgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaatctccagaca 15069812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 309 - 532
Target Start/End: Original strand, 31577171 - 31577391
Alignment:
Q  309 cctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactagg 408  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  31577171 cctccgcctctccagactgaccatgagtattcttacaaccgcctctccaggctgaggttgagtgtttaacgtctctccagaagaacaccgctctacaagg 31577270  T
Q  409 catcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgc 508  Q
    ||| | || |||||||||| |||||||  ||||| || |||   |||||  ||||||    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31577271 cataattcacaaggtgagaaacatcacattcttcatcctcc---caacaagacaccactgaagcacccgcatcctcataaccctcagagaaaatttgtgc 31577367  T
Q  509 ggagttaccattaatctccggaca 532  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  31577368 ggagttaccattattcttcggaca 31577391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 427
Target Start/End: Original strand, 34255109 - 34255443
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||| ||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  34255109 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcacaactagagcataaacacccaagg-cctccatagtcgtaccattc 34255207  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| || ||  |||| |||||||| ||    
T  34255208 ccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccaccttgtaactccacctcaa-ag 34255304  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| ||||||  ||    |||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34255305 gttgatcacgagtattattcataccgcctctccggactaaccatgagtattcttaccaccacctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 34255404  T
Q  389 atgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgaga 427  Q
    | ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||    
T  34255405 acgaacaccactccacaaggcatcaataccaaggtgaga 34255443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 628 - 798
Target Start/End: Original strand, 31577457 - 31577630
Alignment:
Q  628 ttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgagt---caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaag 724  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||| | || || | |   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31577457 ttacctctacctccaccattcactcttgaaacacttaggccttcaccattttaatcaattctcaagtccttggacttggttaactcattggttctcaaag 31577556  T
Q  725 acgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  31577557 ccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttctttgccatatagcatagtatctttgaaagattcaaaagat 31577630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 273 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 17849026 - 17848783
Alignment:
Q  273 aacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtg 372  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  17849026 aactccacctcaa-aggttgatcatgagtattcttacctccgcctcttcagactgaccatgactattctttcgaccgcctctccagggtgatgttgaatg 17848928  T
Q  373 tttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagc 472  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||  ||| ||   ||||   ||||||||| |||    
T  17848927 tttaatgtctctccagacgaccaccgctctacaaggcataattcccaaggtgagaaacatcactttctttatcaccc---caacgagacaccatcaaagc 17848831  T
Q  473 acccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccatt 520  Q
    |||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17848830 acccgtgttctcatcaccctcggagacaatttgtgcggagttaccatt 17848783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Original strand, 34255623 - 34255794
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34255623 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 34255722  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || | ||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  34255723 agccacttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatgatatccttgaaggattcaaa 34255794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 572 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17848753 - 17848528
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | || |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||  |||  || ||| ||    
T  17848753 ccatcttgtgataattaaagcaattaaactttgacttgttaccactctttccttggttacctatacctccaccattccctcttgaaacagatatgccttc 17848654  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    ||||| ||||| ||   |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||  | ||||||     
T  17848653 accgttttcatcagctctcaagtccttggacttggtttgctccttggttctcaaagcagcttgaacttcttccaaggtgacagtgcctttttagccataa 17848554  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||    
T  17848553 agcatgatatccttgaaagattcaaa 17848528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 626 - 779
Target Start/End: Original strand, 41366111 - 41366267
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41366111 ggttacctctacctccaccatttcctcttgaaacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtctttggacttggtcaactccttggttctcaa 41366210  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41366211 agccgcttgaacttcttccaaggtgacggtgccttttttgccatagagcatggtatc 41366267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 252
Target Start/End: Original strand, 31574489 - 31574714
Alignment:
Q  22 ccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtc 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |        | ||||||||| || ||| || | |||||||||||| || || |||  |||| |||    
T  31574489 ccttgaagatctccttgcatccaatcacccttgttcttta----aaggtaatcccacatgccatgttatacattcttcaaacttcggaatgccttctgtc 31574584  T
Q  122 ttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgt 221  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||| | ||||| |    
T  31574585 ttcatgaagaattccctttctcataactagagcatagcacccaaggtc-tccatagtcgtatcattcccgatgtcataaactccacctcaagttgagctt 31574683  T
Q  222 actctacctcaactagcaaatgcgtacatcc 252  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31574684 tctctacctcaactagcaaatgcgtacatcc 31574714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 442
Target Start/End: Original strand, 41365619 - 41365965
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttc---atgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcat 186  Q
    |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||   |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  41365619 tacattcttcaaactctggaatgtcttccgtcttcttcatgaagaattcccatgctcacaactagagcatagcacccaagg-cctccatagtcataccat 41365717  T
Q  187 taccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaac 286  Q
    | |||||||  | |||||||||||| | ||||| | ||| || ||      ||||||| |||| | ||||||| |||   | ||  |||| ||||||||     
T  41365718 tcccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctcaacttc------caaatgcataca-cacactatgccttttgccttgcaactccacctcaa- 41365809  T
Q  287 aggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcc 386  Q
    |||| ||||| ||||||  ||  | ||||||||| || || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41365810 aggttgatcacgagtattcttcacaccgcctctccaggctaaccatgagtattcttcccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctcc 41365909  T
Q  387 agatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttc 442  Q
    |||  | |||| ||| || |||| ||| | ||||||||||| || ||||| |||||    
T  41365910 agacaatcaccactctacaaggcctcaataccaaggtgagagacttcaccttcttc 41365965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4732708 - 4732537
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||| | |||| || |||||  |   ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4732708 ggttacctccacctccaccatttcctcttgaaacactaaggtcttcactgttttcatccgctctcatgtccttggacttggtcaactccttggtttttaa 4732609  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4732608 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgctatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 4732537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 4733116 - 4732851
Alignment:
Q  169 cctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaact 268  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||  | |||||||||||| | ||||  | ||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||  |||  |     
T  4733116 cctccatagtcgtaccattttcggtgtcatcaactccacctcaagttgagatttctctacctcaatttccaaatgcgtaca-cacactatgctttctccc 4733018  T
Q  269 ttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttg 368  Q
    ||  |||| |||||||| |||| |||||||||||   ||  | | ||||||| || || | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  4733017 ttgcaactccacctcaa-aggttgatcatgagtactcttcacactgcctctccaggctaaccatgagtattcttcccaccgcctctccaggctgatgatg 4732919  T
Q  369 agtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcacc 436  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| ||| || |||||||| | ||||||||||| || |||||    
T  4732918 agtgtttaacgtctctctaaacgaacaccactctacaaggcatcaataccaaggtgagaaacctcacc 4732851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 626 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 29543078 - 29542943
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| |||| || |||||  |   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  29543078 ggttacctctaccaccaccatttcctcttgaaacacttaggccttcactgttttcatccgctctcaagttcttggacttggtcaactccttgggtcttaa 29542979  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttc 758  Q
    || |||||||||||  |||| ||| | |||||||||    
T  29542978 agccgcttgaacttcctccatggtgacagtgccttc 29542943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 712 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5591846 - 5591764
Alignment:
Q  712 ttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  5591846 ttggttctcaaagccgcttgaatttcttccaaggtgacggtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 5591764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 18854073 - 18853980
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  18854073 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatc 18853980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Original strand, 26300515 - 26300614
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  26300515 tcaagtccttgaacttggtcaattcattggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 26300614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 21481906 - 21481856
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggc 56  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21481906 aggacatctcccgcttccttgaagatctccttgcatccaatcacccttggc 21481856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 4819484 - 4819571
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  4819484 acttggttaactctttggttcttaaagccgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 4819571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 10685170 - 10685075
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  10685170 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 10685075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 16756505 - 16756592
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16756505 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 16756592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17849233 - 17849079
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattac 189  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||||||| || |||||| || |||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||   |  |    
T  17849233 tacattcttcaaaatccgaaatgccttccgtctttttgaagaattctcttgctaacaactagagcctagcacccaaggtc-tccatagtcatactttgtc 17849135  T
Q  190 cggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcg 245  Q
    |  |||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  17849134 caatgtcatcaactccacctcaaggtgagctttctctacctcaactagcaaatgcg 17849079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 28328844 - 28328757
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28328844 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 28328757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Original strand, 35744571 - 35744666
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  35744571 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 35744666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 699 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 33033575 - 33033489
Alignment:
Q  699 cttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  33033575 cttggttaactctttggttctcaaaactgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccttctttgccataaagcattgtatccttgaa 33033489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 23800427 - 23800328
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| || ||| || |  ||||| ||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  23800427 tcaagtccttgaacttggtcaatttcttggttctcaaagccgtttggacctcctccaaagtagtggtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 23800328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 28891700 - 28891613
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||  || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  28891700 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgctctctttgccataaagcatagtatccttgaa 28891613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 66 - 485
Target Start/End: Original strand, 3630906 - 3631324
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  3630906 agggtaatcccgcaagccgtgctatacattcttcaacctccggaatgtcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaa 3631004  T
Q  166 ggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 265  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631005 ggtcctccaaagtcataccattaccggtgtgttcaactccacctcaagttgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttca 3631104  T
Q  266 actttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatg 365  Q
    || || ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3631105 accttgaaagtccacctcaacaggtagatcatgagtattgttgtctccacctcttgagactgatcatgactattcttaccaccgcctctccaggttgatg 3631204  T
Q  366 ttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacacca 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  3631205 ttgagtgtttaacgtctctccagacaaccaccgctccactaggcatcacccccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacacca 3631304  T
Q  466 tcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  3631305 tcagagcatccacatcctca 3631324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 6 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 3395687 - 3395260
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||        |||||||||| | ||| |||| | || |||||||||||||    
T  3395687 aggacatctcccgcttccttgaaggtcttcttgcatccaatcacccttgaccttttttt-agggtaatccagaaagacgtgatataaattcttcaacctc 3395589  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3395588 cggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctaacca-tagagcatagcacccaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcc 3395490  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcg 305  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  3395489 acctcaagctgagggtactctagctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtctacaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattc 3395390  T
Q  306 ttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccact 405  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3395389 ttgtctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccact 3395290  T
Q  406 aggcatcactcccaaggtgagacacatcac 435  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3395289 aggcatcattcccaaggtgagacacatcac 3395260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 26067505 - 26067733
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26067505 ccatcttgtgacagttgaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 26067604  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26067605 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 26067704  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26067705 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 26067733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 329
Target Start/End: Original strand, 15533541 - 15533862
Alignment:
Q  8 gacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaa-tcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctcc 106  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||      
T  15533541 gacatctcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaaatcacccttggccttttttt-agggtaatcccgcaagttgtgctatacattcttcaaccttt 15533639  T
Q  107 gaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcca 206  Q
    | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15533640 ggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccgtgctcaccactagagcataacactcaaggtcctccatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactcca 15533739  T
Q  207 cctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgt 306  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15533740 cctcaagctgagcgtactctacctcaactagaaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactctaccttaacaggtagatcatgagtattgt 15533839  T
Q  307 tgcctccgcctctcaagactgat 329  Q
    |||||||||||||| || |||||    
T  15533840 tgcctccgcctctctaggctgat 15533862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 33310058 - 33309830
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  33310058 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaacattgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtaacacttaggccctc 33309959  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33309958 accgtattcacgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 33309859  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33309858 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 33309830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Original strand, 26067282 - 26067487
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26067282 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccagtaggcatcaatcccaaggtgag 26067381  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26067382 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagataatttgtgcggagttaccattaatctc 26067481  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  26067482 cggaca 26067487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 33310281 - 33310076
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33310281 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccactccactaggcatcaatcccaaggtgag 33310182  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33310181 acacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgtatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatctc 33310082  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  33310081 cggaca 33310076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33310450 - 33310244
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33310450 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcctagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 33310353  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  33310352 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 33310253  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  33310252 caggctgat 33310244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Original strand, 26067115 - 26067319
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26067115 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttc-atagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 26067212  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  26067213 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccac--tgtcttcaaccttgaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 26067310  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  26067311 caggctgat 26067319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 327 - 485
Target Start/End: Original strand, 15533825 - 15533983
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    ||||||||||||| || || |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15533825 gatcatgagtattgttgcctccgcctctctaggctgatgttgagtgtataacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcactctcatggtgag 15533924  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533925 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 15533983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 607 - 796
Target Start/End: Original strand, 25462608 - 25462800
Alignment:
Q  607 ttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatga---gtcaagtccttggacttgg 703  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||| |    ||||||||||| ||| ||    
T  25462608 ttgttaccactctttccccgattacctctaccttcaccattccctcttgaaacacttaggccttcactgttttcatcaattctcaagtccttgaactcgg 25462707  T
Q  704 tcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaag 796  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25462708 tcaactccttggttctcaaagtcgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttaccataaagcatgatatctttgaaagattcaaaag 25462800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11137673 - 11137349
Alignment:
Q  115 ttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgc 214  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| |||| ||| |||  | ||||||||| || ||    
T  11137673 ttccttcttcttgaagaattctcttgctcacaactagagcctagcacccaaggtc-tccatcgtcgtaccattcccgatgtcatcaactccaccacaagc 11137575  T
Q  215 tgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccg 314  Q
    ||||  | |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||  || || ||||| |||||||| |||| || |||||||||  || | ||||    
T  11137574 tgagttttctctacctgaactagcaaacgcgtacatcc-actatgactttcaccttgaaactccacctcaa-aggttgaacatgagtattcttacatccg 11137477  T
Q  315 cctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcac 414  Q
    |||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| |  ||||||||     
T  11137476 cctcttcagactaaccatgagtattcttcccaccgcctttccagaatgatgttgagtgtttaacgtctctatagacgatcaccgctctataaggcatcat 11137377  T
Q  415 tcccaaggtgagacacatcaccatcttc 442  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11137376 tcccaaggtgagaaacatcaccttcttc 11137349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16652504 - 16652203
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||  |||  | | ||| | |||||||||||||| ||||     
T  16652504 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcaccactagaacataaactcccaaag-cctccatagtcgtaccattc 16652406  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||    
T  16652405 ccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccactttgcaactccacctcaa-ag 16652309  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16652308 gttgatcacgagtattgttcacaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccag 16652209  T
Q  389 atgaac 394  Q
    | ||||    
T  16652208 acgaac 16652203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 139 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16568480 - 16568196
Alignment:
Q  139 tgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagc 238  Q
    ||||||| ||||||| ||| | | ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    |||||||||||| | ||||  | |||||||||||||  |    
T  16568480 tgctcacaactagagcataactcccaaggtc-tccatagttgtaccattcccggtgtcaccaactccacctcaagttgagatttctctacctcaacttcc 16568382  T
Q  239 aaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtat 338  Q
    ||||  ||||| | ||||||| |||| || ||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  16568381 aaattagtaca-cacactatg-cttccaccttgtaactccacctcaa-aggttgatcacgagtattgttcacaccgcctctccagactaaccatgagtat 16568285  T
Q  339 tcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgaga 427  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  16568284 tgttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctttccagatgaacaccgctctacaaggcatcaataccaaggtgaga 16568196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 30444936 - 30444489
Alignment:
Q  68 ggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaagg 167  Q
    ||||||||| |||| | |||  |||||||||||| | ||  |||  |||| ||| || ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||| ||| |    
T  30444936 ggtaatcccacaagtcatgccatacattcttcaaacccctgaatgccttctgtcctcttgaagaattctcttgctcacaactagagactagcacccaatg 30444837  T
Q  168 tcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaac 267  Q
    || |||||||||||| || || | | ||  | |||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |  |||||  ||| |||| |||||| |||  ||    
T  30444836 tc-tccatagtcgtaccactatcagcgtcatcaactccacctcaagctgacctttctctacctcaagttccaaatatgtatatcc-actatgactttcac 30444739  T
Q  268 tttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgtt 367  Q
     || ||||| |||||||| || | ||||||||||||  || |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  30444738 cttgaaactccacctcaa-agattgatcatgagtattcttacctccgcctcttcagactgaccatgaatattcttcccaccgcctctccatgctgatgtt 30444640  T
Q  368 gagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatc 467  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || | |||||||||||||||  |||  ||||||| ||||| ||  ||   ||||   ||||||      
T  30444639 gagtgtttaatgtctctccagacgaccaccgctctacaaagcatcactcccaaggcaagaatcatcaccttcttcatctccc---caacgagacaccact 30444543  T
Q  468 agagcacccgcatcctcataa-ccctctgagacaatttgtgcggagttaccatt 520  Q
    | | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30444542 aaaacactcgcatcctcataacccctcagagacaatttgcacggagttaccatt 30444489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16554242 - 16553941
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||  |||  | | ||| | ||||||||||| || ||||     
T  16554242 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcaccactagaacataaactcccaaag-cctccatagtcataccattc 16554144  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||    
T  16554143 ccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccactttgcaactccacctcaa-ag 16554047  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16554046 gttgatcacgagtattgttcacaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccag 16553947  T
Q  389 atgaac 394  Q
    | ||||    
T  16553946 acgaac 16553941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 90 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16630798 - 16630497
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatag-cactcaaggtcctccatagtcgtatcatta 188  Q
    |||||||||||| | ||| |||  |||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||  |||  | | ||| | ||||||||||| || ||||     
T  16630798 tacattcttcaaaccccggaataccttccgtcctcatgaagaattcacatgctcaccactagaacataaactcccaaag-cctccatagtcataccattc 16630700  T
Q  189 ccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacag 288  Q
    |||||||  | |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||    
T  16630699 ccggtgtcatcaactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccactttgcaactccacctcaa-ag 16630603  T
Q  289 gtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccag 388  Q
    || ||||| |||||| |||  | ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16630602 gttgatcacgagtattgttcacaccgcctctccagactaaccatgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccag 16630503  T
Q  389 atgaac 394  Q
    | ||||    
T  16630502 acgaac 16630497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 605 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 30444432 - 30444236
Alignment:
Q  605 acttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggactt 701  Q
    |||||||||| |||||||    |||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||| |||||  |   ||||| ||||||||||    
T  30444432 acttgttaccgctctttcctcagttacctctacctctaccattccctcataaaacacttaggccttcaccgttttcatcggctctcaagcccttggactt 30444333  T
Q  702 ggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaaagat 798  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||    
T  30444332 ggtcaactccttggttctcaaagccacttgaacttcttcctaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatcgttgacaaattcaaaagat 30444236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 12158423 - 12158225
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||| |||| ||||||||||| | | |  ||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| || ||    
T  12158423 ccatcatgtgacagttaaagcacttaaattttgactttttaccgccctttctctgattacctctacctccaccatgccctcttgaaacacttagaccttc 12158324  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccata 767  Q
    ||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  12158323 accgttttcatcagctatcaaatccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgtttgaacatcttctaaggtgacagtgccttctttgccata 12158225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16553721 - 16553555
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16553721 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccctggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 16553622  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16553621 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 16553555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16630277 - 16630111
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16630277 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccctggacttggtcaactccttggttcttaaagccg 16630178  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16630177 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 16630111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16651982 - 16651816
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16651982 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaaagcca 16651883  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  16651882 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 16651816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 631 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 34165929 - 34165763
Alignment:
Q  631 cctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacg 727  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||| || |||||  |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34165929 cctctacctccaccatttccttttgacacactaaggccttcactgttttcatccgctctcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaagccg 34165830  T
Q  728 cttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  34165829 cttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttaaaggattcaaa 34165763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 312 - 427
Target Start/End: Original strand, 5407899 - 5408014
Alignment:
Q  312 ccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcat 411  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  5407899 ccgcctccccagactaaccatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccactctacaaggcat 5407998  T
Q  412 cactcccaaggtgaga 427  Q
    || | |||||||||||    
T  5407999 caataccaaggtgaga 5408014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 312 - 427
Target Start/End: Original strand, 5412224 - 5412339
Alignment:
Q  312 ccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcat 411  Q
    ||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  5412224 ccgcctccccagactaaccatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccactctacaaggcat 5412323  T
Q  412 cactcccaaggtgaga 427  Q
    || | |||||||||||    
T  5412324 caataccaaggtgaga 5412339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26944562 - 26944465
Alignment:
Q  345 caccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttc 442  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  26944562 caccgcctctctaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccgctctactaggcatcactcccaaggtgaaaaacatcaccttcttc 26944465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 5408250 - 5408358
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  5408250 tcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5408349  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  5408350 ggattcaaa 5408358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 5412575 - 5412683
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  5412575 tcaagtccttagacttggtcaactccttggttcttaaatccgcttgaacttcttccaaggtgatagtgccttcttttccatagagcatggtatccttgaa 5412674  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  5412675 ggattcaaa 5412683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16567973 - 16567865
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  16567973 tcaagtccttggacttggtcaacttcttggttcttaaagccgcttgaacttcttccaaggtgacaatgccttctttgccatagagcatggtatccttaaa 16567874  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  16567873 ggattcaaa 16567865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 90 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26944696 - 26944599
Alignment:
Q  90 tacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcatt 187  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| ||||    
T  26944696 tacattcttcaacctccggaatgcattccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcatagcccccaaggtcctccacagtcgtaccatt 26944599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 34166340 - 34166149
Alignment:
Q  200 aactccacctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatga 299  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||||| |||| ||| |||||| ||||  | ||   ||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  34166340 aactccacctcaagttgagctttctctacctcaacttccaaatgagtacttcc-actatg-cttccgccttgccactccacctcaa-aggttgatcacga 34166244  T
Q  300 gtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac 394  Q
    |||| ||| || ||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34166243 gtattgttaccaccgcctctccagactaaccacgagtattctcaccaccgcctctccaggctgacgttgagtgtttaacgtctctccagacgaac 34166149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 161
Target Start/End: Original strand, 28038629 - 28038724
Alignment:
Q  66 agggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctccgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcac 161  Q
    ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||||    
T  28038629 agggtaatcccacaagtcatgctatacattcttcaacctccggaatgccttccgtcttcatgaagaatccccttcctcaccactagaccatagcac 28038724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 57
Target Start/End: Original strand, 3630828 - 3630879
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggcc 57  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3630828 aggacatatcccgcttccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggcc 3630879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 17694096 - 17694183
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  17694096 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 17694183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 5165088 - 5165175
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||| | || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  5165088 acttggttaactctttggttctcaaagatgcttgaactttctccaaagtgatagtgtcctctttgccataaagcattgtatccttgaa 5165175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 13879675 - 13879588
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  13879675 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 13879588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 14738478 - 14738383
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| |||  |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  14738478 gtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagcagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 14738383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 25942605 - 25942518
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25942605 acttggttaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgatagtgccctctttgccataaagcatagtatccttgaa 25942518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 33331352 - 33331257
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  33331352 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaagaatggtatccttgaa 33331257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 397
Target Start/End: Original strand, 10456494 - 10456559
Alignment:
Q  332 tgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacacc 397  Q
    |||||||||||  |||| | |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10456494 tgagtattcttcgcaccacttctctaggatgatgttgagtgtttaatgtctctccagacgaacacc 10456559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 397
Target Start/End: Original strand, 11722602 - 11722673
Alignment:
Q  326 tgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacacc 397  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  11722602 tgattatgagtattattagcaccgtctctccagactgatgttgaatgtttaatgtttctccagatgatcacc 11722673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17013004 - 17012969
Alignment:
Q  229 ctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttc 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17013004 ctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttc 17012969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 22350216 - 22350303
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || ||| |||| || |||||||| | ||| ||||| |||||    
T  22350216 acttggtcaactctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtgataatgccatctttgccataaatcatagtatccttgaa 22350303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 793 - 565
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  793 ccatcttgtgacagttaaagcattcaaactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccttc 694  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  693 accgtgttcatgagtcaagtcctttgacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 594  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  593 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 1016 - 811
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1016 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccgctccactaggcatcaatctcaaggtgag 917  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatctc 526  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  916 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggagttaccattaacctc 817  T
Q  527 cggaca 532  Q
    ||||||    
T  816 cggaca 811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1186 - 979
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1186 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 1088  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||    
T  1087 tactctacctcaattagcaaatgtgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctc 988  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  987 caggctgat 979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23295 - 23067
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23295 ccatcttatgacagttaaagcattcaaaccttgacttgtttccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 23196  T
Q  672 accgtgttcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagc 771  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23195 accgtattcatgagtcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttccttgccatagagc 23096  T
Q  772 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23095 atggtatctttgaacgattcaaaagattt 23067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 327 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23519 - 23313
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaac-accgctccactaggcatcactcccaaggtga 425  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23519 gatcctgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgacccaccgctccactaggcatcaatcccaaggtga 23420  T
Q  426 gacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctctgagacaatttgtgcggagttaccattaatct 525  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23419 gacacatcaccttcttcttcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctcagagacaatttgtgcggaattaccattaatct 23320  T
Q  526 ccggaca 532  Q
    |||||||    
T  23319 ccggaca 23313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23689 - 23482
Alignment:
Q  121 cttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcg 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23689 cttcatgaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagtcgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgctgagcg 23591  T
Q  221 tactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctc 320  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  || || |||||||||    
T  23590 tgctctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcctgagtattcttaccaccgcctctc 23491  T
Q  321 aagactgat 329  Q
     || |||||    
T  23490 caggctgat 23482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 572 - 800
Target Start/End: Original strand, 72624 - 72855
Alignment:
Q  572 ccatcttgtggcagttaaagcattcagaccttgacttgttaccactctttctcgggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatc 671  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  72624 ccatcttgtgacagttaaagcattcagactttgacttgttaccactctttctccggttacctctacctccaccattccctcttgagacacttaggccttc 72723  T
Q  672 accgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatag 768  Q
    |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  72724 accgtgttcatgaactctcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagccgcttgaacttcttccaaggtaacagtgccttctttgccatag 72823  T
Q  769 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 800  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72824 agcatggtatctttgaacgattcaaaagattt 72855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 303
Target Start/End: Original strand, 70150 - 70426
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  70150 aggacatctcccgcttccttgaaggtcaccttgcatccaatcacccttggccttctttt-agagtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaacctc 70248  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactcc 205  Q
                       ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  70249 -------------------atgaagaaatcccttcctcacca-tagagcatagcacccaaggtcttccatagtcgtaccattaccagtgtgttcaactcc 70328  T
Q  206 acctcacgctgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtat 303  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  70329 acctcacgatgagcgtactctacctcaactagcaaatgcgtacatctcactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtat 70426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 394 - 532
Target Start/End: Original strand, 72468 - 72606
Alignment:
Q  394 caccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccctc 493  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||    
T  72468 caccgctccactaggcatccatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcaaagcacaagaatcctcataaccctc 72567  T
Q  494 tgagacaatttgtgcggagttaccattaatctccggaca 532  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  72568 agagacaatttgtgcggagttaccaataatatccagaca 72606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 327 - 389
Target Start/End: Original strand, 70415 - 70477
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 389  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70415 gatcatgagtattattaccaccgcaactccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccaga 70477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 298 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 80951 - 80764
Alignment:
Q  298 gagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacacc 397  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  80951 gagtattgttgcctccgcctctccagactgatcatgagtattcttaccctcgcctctctaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccacc 80852  T
Q  398 gctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  80851 gctccactaggcatcaatcccaaggtgagacacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagaacacccgcatcctca 80764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 327 - 485
Target Start/End: Original strand, 675 - 833
Alignment:
Q  327 gatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgag 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  675 gatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaacaccgctccactaggcatcaatcccaaggtgag 774  T
Q  427 acacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 485  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  775 acacatcaccttcttcatcctccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctca 833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 127 - 329
Target Start/End: Original strand, 511 - 712
Alignment:
Q  127 gaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtttaactccacctcacgctgagcgtactct 226  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  511 gaagaaatcccttgctcacca-tagagcatagcacccaaggtccttcatagttgtaccattaccggtgtgttcaactccacctcacgttgagcgtactct 609  T
Q  227 acctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaactttcaaacttcacctcaacaggtagatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagact 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||||| || ||    
T  610 acctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttcaaccttgaaactccacctcaacaggtagatcatgagtattcttaccaccgcctctccaggct 709  T
Q  327 gat 329  Q
    |||    
T  710 gat 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4157 - 3969
Alignment:
Q  6 aggacatctctcgctgccttgaaggtctccttgcatccaatcacccttggccnnnnnnnnagggtaatcccgcaagccgtgctgtacattcttcaacctc 105  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||     
T  4157 aggacatctcccgcttccttgaagatctccttacatccaatcacccttggc----tttttagggtaatcccgcaagtcgtgctatacattcttcaaactt 4062  T
Q  106 cgaaatttcttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagaatagcactcaaggtcctccatagtcgtatcattaccggtgtgtt 198  Q
     | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  4061 tggaatgccttccgtcttcatgaagaaatcccttgctcaccactagagcatatcacccaaggtcctccatagtcgtaccatttctggtgtgtt 3969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 264
Target Start/End: Original strand, 26228 - 26263
Alignment:
Q  229 ctcaactagcaaatgcgtacatcccactatgtcttc 264  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26228 ctcaactagcaaatgtgtacatcccactatgtcttc 26263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 626 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 115653 - 115482
Alignment:
Q  626 ggttacctctacctccaccattccctcttgtgacacttaggccatcaccgtgttcatgag---tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaa 722  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||||| |||  || |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  115653 ggttacctctacctccaccatttccttttgaaacactaaggccttcattgttttcatcctctctcaagtccttggacttggtcaactccttggttcttaa 115554  T
Q  723 agacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaacgattcaaa 794  Q
    || ||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  115553 agccgcttgaacttcttccaaggtgacagtgccttctttgccatagagcatggtatccttgaaggattcaaa 115482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 115920 - 115830
Alignment:
Q  337 attcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatgaacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgaga 427  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  || |||||||| | |||||||||||    
T  115920 attcttcccactgcctctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagacgaccaccactttacaaggcatcaataccaaggtgaga 115830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 525
Alignment:
Q  292 gatcatgagtatcgttgcctccgcctctcaagactgatcatgagtattcttaccaccgcatctccaggctgatgttgagtgtttaacgtctctccagatg 391  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||| |  || | ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  728 gatcacgagtattgttaccaccgcctctccaagctaaccatgagtattcttcccaccgcctctccaagctgatgttgagtgtttaatgtctctccagacg 629  T
Q  392 aacaccgctccactaggcatcactcccaaggtgagacacatcaccatcttcgtcatccaaacaacaccacaccatcagagcacccgcatcctcataaccc 491  Q
    | |||||||| || |||||||| | ||||||||||| || ||||   |||| || |||   ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||    
T  628 atcaccgctctacaaggcatcaataccaaggtgagagacctcac---cttcatcctcc---caacaacacaccatcaaagcacccacatcctcatactcc 535  T
Q  492 tctgagacaa 501  Q
    ||||| ||||    
T  534 tctgacacaa 525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 687 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 352 - 245
Alignment:
Q  687 caagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaac 786  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| | | ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||     
T  352 caagtccttggacctggtcaactctttggttctcaaagttgattgaacttcttccaaggtgacactgcgttctttgccatagagcatggtatccttgaag 253  T
Q  787 gattcaaa 794  Q
    ||||||||    
T  252 gattcaaa 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 17261 - 17174
Alignment:
Q  698 acttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  17261 acttggtcaattctttggttctcaaagctgcttgaacttcctccaaagtaatagtgccctctttgccatagagcatagtatccttgaa 17174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 26597 - 26705
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| || |  | ||||||   ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||    
T  26597 tcaagtccttggacttagttaactccttggttctcaaatccgcttggacgtccttcaaggtggcagtgccttctttaccatagagcatggtacccttgaa 26696  T
Q  786 cgattcaaa 794  Q
     ||||||||    
T  26697 ggattcaaa 26705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 686 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 4104 - 4005
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||    
T  4104 tcaagtccttgaacttggtcaattccttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaagatggtatccttgaa 4005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 686 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18756
Alignment:
Q  686 tcaagtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatc 779  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  18849 tcaagtccttgaacttggtcaattcgttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatc 18756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 15215 - 15120
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  15215 gtccttgaacttggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 15120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 783 - 688
Alignment:
Q  690 gtccttggacttggtcaactccttggttctcaaagacgcttgaacttattccaaggtaatagtgccttccttgccatagagcatggtatctttgaa 785  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||| || |  ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  783 gtccttgaactgggtcaattctttggttctcaaagccgcttggacctcctccaaagtagtagtgccctccttaccataaaggatggtatccttgaa 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University