View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12037_high_11 (Length: 383)

Name: NF12037_high_11
Description: NF12037
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12037_high_11
NF12037_high_11
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (20-383)||(25191358-25191721)
chr3 (29-324)||(22063-22357)
chr3 (29-321)||(35033136-35033428)
chr3 (29-324)||(5168822-5169117)
chr3 (29-321)||(47233596-47233888)
chr3 (29-323)||(52138790-52139084)
chr3 (29-323)||(28245427-28245721)
chr3 (50-324)||(53519603-53519865)
chr3 (29-324)||(54279010-54279304)
chr3 (40-324)||(51447714-51447991)
chr3 (72-324)||(48508268-48508520)
chr3 (42-321)||(38850123-38850403)
chr3 (38-324)||(43694768-43695048)
chr3 (156-324)||(12096702-12096870)
chr3 (39-322)||(54128378-54128662)
chr3 (193-324)||(53262295-53262426)
chr3 (29-222)||(33272122-33272318)
chr3 (29-321)||(45289091-45289385)
chr3 (29-187)||(38060421-38060579)
chr3 (46-286)||(48953454-48953697)
chr3 (177-324)||(52156081-52156228)
chr3 (39-323)||(19676079-19676362)
chr3 (49-321)||(54424959-54425244)
chr3 (208-324)||(311306-311422)
chr3 (193-321)||(49042090-49042219)
chr3 (29-213)||(45728137-45728324)
chr3 (183-321)||(38060858-38060996)
chr3 (41-244)||(3186771-3186973)
chr3 (55-286)||(39235154-39235384)
chr3 (217-324)||(47555329-47555436)
chr3 (214-324)||(2133609-2133719)
chr3 (43-324)||(42510013-42510292)
chr3 (194-324)||(49503565-49503695)
chr3 (39-322)||(50960636-50960915)
chr3 (200-321)||(48712075-48712196)
chr3 (193-321)||(15296061-15296189)
chr3 (222-321)||(40106620-40106719)
chr3 (29-321)||(54364976-54365268)
chr3 (239-321)||(31566161-31566243)
chr3 (29-319)||(39600683-39600973)
chr3 (239-324)||(40273202-40273287)
chr3 (39-321)||(48734147-48734417)
chr3 (232-324)||(7895877-7895969)
chr3 (41-257)||(38430850-38431066)
chr3 (41-320)||(26490317-26490596)
chr3 (240-322)||(31454224-31454306)
chr3 (37-311)||(19757898-19758158)
chr3 (207-324)||(29601060-29601177)
chr3 (237-322)||(45486848-45486933)
chr3 (233-324)||(48532151-48532243)
chr3 (233-324)||(52927845-52927936)
chr3 (236-318)||(32170602-32170684)
chr3 (222-324)||(39208791-39208893)
chr3 (198-321)||(54422837-54422966)
chr3 (39-108)||(27917570-27917639)
chr3 (41-109)||(49503766-49503834)
chr3 (207-321)||(36304134-36304248)
chr3 (37-311)||(19736995-19737255)
chr3 (231-324)||(45374474-45374567)
chr3 (28-147)||(21200539-21200656)
chr3 (256-324)||(45834597-45834665)
chr3 (29-108)||(3987037-3987116)
chr3 (250-321)||(7278675-7278746)
chr3 (222-321)||(14415260-14415358)
chr3 (237-324)||(20208196-20208283)
chr3 (42-319)||(30294125-30294403)
chr3 (226-321)||(30797822-30797917)
chr3 (232-323)||(33271908-33271999)
chr3 (29-116)||(36820166-36820253)
chr3 (43-242)||(52678929-52679124)
chr3 (123-244)||(19162664-19162785)
chr3 (253-318)||(41529975-41530040)
chr3 (209-282)||(41842562-41842635)
chr3 (193-318)||(49841770-49841895)
chr3 (244-324)||(27893294-27893374)
chr3 (64-108)||(38181042-38181086)
chr3 (246-321)||(24778609-24778684)
chr3 (222-321)||(40991614-40991713)
chr3 (243-322)||(46148232-46148311)
chr3 (266-320)||(21862742-21862796)
chr3 (232-310)||(24541343-24541421)
chr3 (223-321)||(31337560-31337658)
chr3 (209-311)||(40116348-40116450)
chr3 (40-146)||(41842686-41842792)
chr3 (208-321)||(11284157-11284270)
chr3 (193-286)||(17022707-17022800)
chr3 (273-322)||(39512777-39512826)
chr3 (268-324)||(344769-344825)
chr3 (240-324)||(3987535-3987619)
chr3 (268-324)||(31146928-31146984)
chr3 (238-298)||(37351606-37351666)
chr3 (207-263)||(37779045-37779101)
chr3 (39-107)||(44134044-44134112)
chr3 (248-319)||(659734-659805)
chr3 (248-323)||(31260965-31261039)
chr3 (222-321)||(42026536-42026635)
chr3 (269-324)||(50249607-50249662)
chr3 (39-108)||(31453151-31453221)
chr3 (268-322)||(37083291-37083345)
chr3 (248-318)||(46367390-46367460)
chr3 (245-323)||(50631879-50631957)
chr3 (43-80)||(31454467-31454504)
chr3 (268-321)||(52882662-52882715)
chr3 (29-81)||(344951-345003)
chr3 (40-108)||(11581445-11581513)
chr3 (248-324)||(30332557-30332633)
chr3 (240-324)||(31452958-31453042)
chr3 (193-257)||(40116532-40116596)
chr3 (242-322)||(40672366-40672446)
chr3 (211-255)||(44571599-44571643)
[»] chr7 (132 HSPs)
chr7 (20-324)||(43281655-43281959)
chr7 (29-324)||(29650374-29650669)
chr7 (29-324)||(12841272-12841567)
chr7 (29-324)||(45836479-45836772)
chr7 (29-324)||(11593950-11594245)
chr7 (29-323)||(37617934-37618229)
chr7 (29-321)||(34869410-34869702)
chr7 (29-324)||(39906369-39906662)
chr7 (30-324)||(2885719-2886013)
chr7 (29-319)||(46355858-46356148)
chr7 (29-323)||(49029266-49029559)
chr7 (29-314)||(35906208-35906493)
chr7 (40-324)||(31682599-31682883)
chr7 (29-324)||(44855171-44855464)
chr7 (29-324)||(33349803-33350098)
chr7 (29-324)||(6374858-6375153)
chr7 (29-324)||(38606994-38607277)
chr7 (51-324)||(36652004-36652277)
chr7 (29-320)||(35558994-35559286)
chr7 (42-324)||(22349623-22349905)
chr7 (30-324)||(43491299-43491593)
chr7 (29-262)||(13859067-13859300)
chr7 (78-324)||(32631615-32631849)
chr7 (29-244)||(31005213-31005428)
chr7 (38-324)||(36869234-36869527)
chr7 (97-324)||(24598185-24598411)
chr7 (49-324)||(15682184-15682459)
chr7 (20-187)||(33072933-33073100)
chr7 (156-321)||(40979928-40980093)
chr7 (156-324)||(38900074-38900241)
chr7 (93-322)||(7273154-7273383)
chr7 (196-322)||(27648937-27649063)
chr7 (112-319)||(31681022-31681226)
chr7 (182-321)||(48919255-48919394)
chr7 (184-322)||(21078062-21078200)
chr7 (30-262)||(23404409-23404640)
chr7 (29-321)||(36136754-36137046)
chr7 (161-324)||(9210701-9210864)
chr7 (226-324)||(28208325-28208423)
chr7 (29-143)||(46014359-46014472)
chr7 (211-320)||(34035155-34035264)
chr7 (42-318)||(28627936-28628212)
chr7 (215-322)||(33073105-33073212)
chr7 (207-324)||(36101774-36101891)
chr7 (30-146)||(7273030-7273146)
chr7 (162-318)||(45601599-45601755)
chr7 (207-324)||(27893560-27893677)
chr7 (222-321)||(33732017-33732114)
chr7 (193-329)||(44951309-44951445)
chr7 (193-320)||(14057632-14057759)
chr7 (193-320)||(14367660-14367787)
chr7 (248-319)||(24777170-24777241)
chr7 (243-322)||(31869101-31869180)
chr7 (211-324)||(42969870-42969983)
chr7 (193-324)||(42187595-42187726)
chr7 (214-322)||(47652722-47652830)
chr7 (159-322)||(1011167-1011329)
chr7 (42-324)||(12966025-12966301)
chr7 (161-278)||(35922376-35922492)
chr7 (19-104)||(36514424-36514509)
chr7 (29-81)||(32630584-32630636)
chr7 (202-321)||(8519046-8519165)
chr7 (233-320)||(24177628-24177714)
chr7 (40-324)||(26741891-26742177)
chr7 (201-321)||(40415169-40415295)
chr7 (266-324)||(31005432-31005490)
chr7 (30-116)||(40169640-40169726)
chr7 (183-320)||(34745891-34746028)
chr7 (29-278)||(47848664-47848912)
chr7 (196-323)||(28355322-28355450)
chr7 (268-324)||(29318792-29318848)
chr7 (202-281)||(8492276-8492355)
chr7 (193-284)||(36239833-36239924)
chr7 (193-324)||(38135210-38135341)
chr7 (257-324)||(40630652-40630719)
chr7 (29-108)||(43282398-43282477)
chr7 (248-322)||(7220965-7221039)
chr7 (237-323)||(25891086-25891172)
chr7 (29-107)||(27021906-27021984)
chr7 (207-321)||(37976403-37976517)
chr7 (29-146)||(19262609-19262725)
chr7 (236-321)||(20158671-20158756)
chr7 (207-324)||(33103094-33103211)
chr7 (217-318)||(47852265-47852366)
chr7 (259-319)||(6263479-6263539)
chr7 (29-105)||(7189442-7189518)
chr7 (240-324)||(14593953-14594037)
chr7 (240-324)||(16013476-16013560)
chr7 (268-324)||(28708610-28708666)
chr7 (268-324)||(29312218-29312274)
chr7 (251-323)||(31840442-31840514)
chr7 (159-262)||(1531420-1531523)
chr7 (46-109)||(14593772-14593835)
chr7 (207-321)||(28541943-28542058)
chr7 (226-321)||(30814125-30814220)
chr7 (210-281)||(31859046-31859117)
chr7 (240-322)||(19119423-19119505)
chr7 (266-324)||(30144982-30145040)
chr7 (268-325)||(5418303-5418360)
chr7 (239-324)||(33281087-33281171)
chr7 (39-116)||(42187470-42187547)
chr7 (29-82)||(45558352-45558405)
chr7 (240-321)||(45558531-45558611)
chr7 (29-146)||(48736074-48736191)
chr7 (252-324)||(1523856-1523928)
chr7 (268-324)||(20525049-20525105)
chr7 (193-284)||(44401164-44401253)
chr7 (46-109)||(16013295-16013358)
chr7 (91-150)||(33139206-33139265)
chr7 (222-321)||(34341395-34341494)
chr7 (225-296)||(34926547-34926618)
chr7 (29-107)||(5335910-5335988)
chr7 (276-322)||(21244282-21244328)
chr7 (193-275)||(21517426-21517508)
chr7 (29-146)||(25579252-25579370)
chr7 (236-286)||(26332908-26332958)
chr7 (250-328)||(28021146-28021224)
chr7 (238-324)||(48515370-48515456)
chr7 (243-324)||(4604751-4604832)
chr7 (40-109)||(30200175-30200244)
chr7 (247-320)||(34029677-34029750)
chr7 (39-104)||(38920794-38920859)
chr7 (248-321)||(40138948-40139021)
chr7 (221-318)||(40149016-40149112)
chr7 (266-323)||(41483714-41483771)
chr7 (40-108)||(18605359-18605427)
chr7 (40-108)||(18637563-18637631)
chr7 (40-108)||(18650997-18651065)
chr7 (41-109)||(36101977-36102045)
chr7 (240-321)||(38921086-38921169)
chr7 (268-324)||(47700053-47700108)
chr7 (252-324)||(48735898-48735970)
[»] chr1 (137 HSPs)
chr1 (29-324)||(4001452-4001747)
chr1 (29-323)||(696259-696554)
chr1 (29-324)||(1210735-1211030)
chr1 (29-324)||(30202127-30202422)
chr1 (29-323)||(34792347-34792641)
chr1 (29-324)||(22090086-22090381)
chr1 (29-321)||(49347393-49347685)
chr1 (20-324)||(8671899-8672203)
chr1 (29-324)||(38807668-38807963)
chr1 (29-324)||(15085924-15086207)
chr1 (29-323)||(9592724-9593018)
chr1 (20-324)||(51602037-51602341)
chr1 (29-324)||(4029112-4029407)
chr1 (57-324)||(25979228-25979495)
chr1 (29-324)||(32082753-32083037)
chr1 (29-297)||(8391762-8392030)
chr1 (29-322)||(51440764-51441057)
chr1 (121-324)||(37311752-37311955)
chr1 (29-320)||(43240380-43240671)
chr1 (29-278)||(32230997-32231246)
chr1 (154-321)||(52921195-52921362)
chr1 (102-324)||(39318193-39318413)
chr1 (159-323)||(4415469-4415633)
chr1 (40-323)||(32404525-32404807)
chr1 (28-318)||(39140509-39140794)
chr1 (69-320)||(52561590-52561841)
chr1 (203-321)||(46423216-46423331)
chr1 (193-322)||(32079176-32079303)
chr1 (20-319)||(37462878-37463174)
chr1 (203-324)||(4707218-4707338)
chr1 (29-286)||(9509308-9509565)
chr1 (29-321)||(2544589-2544875)
chr1 (201-324)||(10200303-10200426)
chr1 (193-324)||(41560383-41560514)
chr1 (211-324)||(24020264-24020377)
chr1 (207-323)||(43375596-43375712)
chr1 (39-324)||(48431396-48431688)
chr1 (232-323)||(44941774-44941865)
chr1 (253-323)||(3777258-3777328)
chr1 (231-321)||(21769711-21769801)
chr1 (193-282)||(16142019-16142108)
chr1 (231-324)||(28090691-28090784)
chr1 (232-321)||(42337749-42337838)
chr1 (196-324)||(19936617-19936745)
chr1 (232-324)||(44751677-44751769)
chr1 (41-324)||(27847797-27848085)
chr1 (248-323)||(29577461-29577536)
chr1 (193-323)||(52532614-52532744)
chr1 (206-323)||(6025772-6025889)
chr1 (248-321)||(28533676-28533749)
chr1 (220-321)||(40568410-40568511)
chr1 (29-321)||(18469082-18469374)
chr1 (193-320)||(29128937-29129065)
chr1 (236-322)||(8796406-8796492)
chr1 (29-283)||(9599432-9599686)
chr1 (222-324)||(34444539-34444641)
chr1 (243-324)||(51584948-51585029)
chr1 (29-321)||(36339804-36340095)
chr1 (193-324)||(3818853-3818984)
chr1 (236-323)||(50846759-50846846)
chr1 (222-324)||(6084158-6084260)
chr1 (235-320)||(22175341-22175426)
chr1 (236-321)||(25715326-25715411)
chr1 (223-324)||(31274398-31274499)
chr1 (193-322)||(36623884-36624012)
chr1 (238-323)||(38869081-38869166)
chr1 (29-109)||(1661420-1661500)
chr1 (248-324)||(5113952-5114028)
chr1 (208-318)||(15438800-15438906)
chr1 (249-321)||(38877343-38877415)
chr1 (268-324)||(43481795-43481851)
chr1 (236-324)||(50636278-50636366)
chr1 (269-324)||(37430417-37430472)
chr1 (194-273)||(44905404-44905483)
chr1 (233-319)||(1290033-1290119)
chr1 (266-324)||(4318842-4318900)
chr1 (96-282)||(27520246-27520428)
chr1 (266-324)||(41165509-41165567)
chr1 (207-324)||(5338881-5338998)
chr1 (193-262)||(7762496-7762565)
chr1 (207-284)||(48865744-48865821)
chr1 (236-321)||(50257767-50257852)
chr1 (248-324)||(1704836-1704912)
chr1 (248-324)||(10569068-10569144)
chr1 (212-316)||(19908040-19908144)
chr1 (236-304)||(29808053-29808121)
chr1 (42-146)||(35828725-35828829)
chr1 (164-324)||(52832170-52832330)
chr1 (269-324)||(2914120-2914175)
chr1 (201-324)||(11941577-11941700)
chr1 (29-116)||(40416361-40416448)
chr1 (29-108)||(43423709-43423788)
chr1 (159-257)||(8628150-8628248)
chr1 (239-325)||(16272818-16272903)
chr1 (274-324)||(38758017-38758067)
chr1 (237-323)||(45510831-45510917)
chr1 (39-108)||(18793201-18793270)
chr1 (236-317)||(27072491-27072572)
chr1 (252-321)||(33560858-33560927)
chr1 (268-320)||(4590533-4590585)
chr1 (268-324)||(7133299-7133355)
chr1 (224-324)||(12930308-12930408)
chr1 (29-109)||(13827929-13828009)
chr1 (243-319)||(15437130-15437206)
chr1 (268-324)||(26299297-26299353)
chr1 (248-324)||(32111986-32112062)
chr1 (269-321)||(43898439-43898491)
chr1 (234-310)||(48801625-48801700)
chr1 (240-323)||(14224286-14224368)
chr1 (41-108)||(27637846-27637913)
chr1 (238-309)||(30445304-30445375)
chr1 (222-321)||(35828562-35828661)
chr1 (236-327)||(52633166-52633257)
chr1 (269-324)||(52814291-52814346)
chr1 (193-286)||(8676897-8676993)
chr1 (248-318)||(16943364-16943434)
chr1 (240-298)||(28528556-28528614)
chr1 (207-317)||(29577147-29577256)
chr1 (39-105)||(37263331-37263397)
chr1 (39-108)||(52073675-52073745)
chr1 (40-109)||(10272260-10272329)
chr1 (193-278)||(11331247-11331332)
chr1 (193-278)||(11489268-11489353)
chr1 (291-324)||(22930645-22930678)
chr1 (239-304)||(26113456-26113521)
chr1 (268-325)||(42539208-42539265)
chr1 (267-320)||(44008806-44008859)
chr1 (236-321)||(50806864-50806949)
chr1 (39-107)||(4380013-4380081)
chr1 (42-146)||(5338727-5338831)
chr1 (270-322)||(8194721-8194773)
chr1 (273-321)||(12231592-12231640)
chr1 (37-145)||(13827746-13827854)
chr1 (29-105)||(51812515-51812591)
chr1 (207-255)||(51812677-51812725)
chr1 (268-320)||(52292268-52292320)
chr1 (209-281)||(52900682-52900754)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (29-324)||(38429874-38430168)
chr2 (20-324)||(12734680-12734985)
chr2 (29-324)||(25834671-25834963)
chr2 (29-324)||(3866062-3866357)
chr2 (40-324)||(41197224-41197509)
chr2 (38-324)||(45367622-45367908)
chr2 (20-321)||(11992108-11992409)
chr2 (29-325)||(2610578-2610874)
chr2 (39-321)||(41763043-41763324)
chr2 (29-321)||(38452686-38452977)
chr2 (20-320)||(3243654-3243954)
chr2 (29-328)||(36183441-36183740)
chr2 (29-319)||(8180770-8181060)
chr2 (29-324)||(4807586-4807880)
chr2 (60-324)||(451645-451909)
chr2 (29-321)||(18424378-18424669)
chr2 (93-324)||(7326157-7326388)
chr2 (96-324)||(39029638-39029872)
chr2 (110-322)||(28508749-28508961)
chr2 (46-322)||(24583630-24583907)
chr2 (55-295)||(23997630-23997858)
chr2 (156-324)||(35643065-35643233)
chr2 (153-321)||(31959635-31959803)
chr2 (197-324)||(30306190-30306317)
chr2 (219-324)||(3635320-3635425)
chr2 (210-324)||(227360-227474)
chr2 (159-320)||(45543074-45543234)
chr2 (60-324)||(6237750-6238014)
chr2 (39-324)||(12141544-12141829)
chr2 (207-324)||(9496034-9496151)
chr2 (193-321)||(9996623-9996754)
chr2 (37-115)||(16097192-16097270)
chr2 (200-324)||(38328367-38328489)
chr2 (29-321)||(38434941-38435234)
chr2 (193-324)||(12882042-12882173)
chr2 (29-324)||(43751944-43752239)
chr2 (243-324)||(15025698-15025779)
chr2 (163-324)||(43573127-43573287)
chr2 (207-318)||(19336896-19337007)
chr2 (196-322)||(30743686-30743812)
chr2 (39-320)||(18958907-18959192)
chr2 (37-109)||(43238305-43238377)
chr2 (233-324)||(9531597-9531688)
chr2 (37-324)||(44437718-44438005)
chr2 (237-323)||(12520060-12520146)
chr2 (248-321)||(12474927-12475000)
chr2 (251-324)||(17670680-17670753)
chr2 (237-322)||(19863432-19863517)
chr2 (237-322)||(19867764-19867849)
chr2 (237-322)||(19872665-19872750)
chr2 (167-324)||(33287549-33287706)
chr2 (194-324)||(35755242-35755376)
chr2 (167-319)||(13149460-13149612)
chr2 (224-320)||(39709202-39709298)
chr2 (193-305)||(41545559-41545671)
chr2 (193-324)||(8197538-8197669)
chr2 (193-324)||(8202298-8202429)
chr2 (250-324)||(43832309-43832383)
chr2 (183-324)||(12489799-12489940)
chr2 (248-321)||(17429259-17429332)
chr2 (251-324)||(17626284-17626357)
chr2 (207-318)||(45077895-45078008)
chr2 (200-324)||(6219126-6219250)
chr2 (196-321)||(11412865-11412992)
chr2 (240-286)||(19334187-19334233)
chr2 (39-324)||(9556366-9556650)
chr2 (243-324)||(15015149-15015230)
chr2 (236-317)||(33504421-33504502)
chr2 (238-319)||(34931631-34931712)
chr2 (236-324)||(3481351-3481439)
chr2 (234-322)||(13443907-13443995)
chr2 (207-283)||(36650610-36650686)
chr2 (244-324)||(42543440-42543520)
chr2 (29-76)||(227312-227359)
chr2 (29-108)||(4598775-4598854)
chr2 (241-324)||(42549834-42549917)
chr2 (250-324)||(25384680-25384754)
chr2 (259-321)||(36993755-36993816)
chr2 (243-320)||(624687-624764)
chr2 (245-314)||(4598569-4598638)
chr2 (240-321)||(5758995-5759076)
chr2 (275-324)||(8560803-8560852)
chr2 (268-321)||(10516749-10516802)
chr2 (268-321)||(16521007-16521060)
chr2 (223-328)||(17581643-17581748)
chr2 (240-324)||(12470894-12470978)
chr2 (268-324)||(15775842-15775898)
chr2 (40-108)||(23714474-23714542)
chr2 (40-108)||(24102146-24102214)
chr2 (238-322)||(28960210-28960294)
chr2 (206-322)||(32402667-32402783)
chr2 (248-324)||(33393319-33393394)
chr2 (165-326)||(37470124-37470289)
chr2 (223-318)||(186135-186230)
chr2 (29-146)||(3481134-3481248)
chr2 (269-324)||(14444899-14444954)
chr2 (247-320)||(887065-887139)
chr2 (207-245)||(4682253-4682291)
chr2 (249-323)||(14197205-14197279)
chr2 (240-321)||(33594272-33594354)
chr2 (207-261)||(36616856-36616910)
chr2 (31-109)||(38860165-38860243)
chr2 (29-82)||(11412711-11412764)
chr2 (291-324)||(14530532-14530565)
chr2 (248-297)||(19224990-19225039)
chr2 (268-321)||(32706472-32706525)
chr2 (268-317)||(45482989-45483038)
chr2 (255-319)||(522445-522509)
chr2 (42-82)||(786833-786873)
chr2 (226-298)||(3720438-3720510)
chr2 (39-103)||(6218967-6219031)
chr2 (254-298)||(9078792-9078836)
chr2 (29-109)||(9578915-9578995)
chr2 (52-108)||(41858744-41858800)
[»] chr4 (155 HSPs)
chr4 (20-321)||(27450180-27450480)
chr4 (29-324)||(436219-436514)
chr4 (29-324)||(52569512-52569807)
chr4 (29-321)||(31959814-31960106)
chr4 (29-324)||(48174090-48174385)
chr4 (20-321)||(48622543-48622844)
chr4 (29-323)||(33190846-33191140)
chr4 (58-322)||(32479057-32479321)
chr4 (29-322)||(56375280-56375573)
chr4 (29-324)||(4440843-4441138)
chr4 (29-324)||(33227199-33227494)
chr4 (43-322)||(1777016-1777295)
chr4 (29-324)||(43433914-43434209)
chr4 (31-324)||(53707786-53708079)
chr4 (29-324)||(37797842-37798136)
chr4 (20-324)||(39100533-39100836)
chr4 (29-322)||(27983190-27983476)
chr4 (29-321)||(23906297-23906587)
chr4 (63-324)||(8286455-8286724)
chr4 (29-320)||(26037506-26037797)
chr4 (29-324)||(46582823-46583116)
chr4 (30-314)||(39708424-39708708)
chr4 (20-326)||(28236164-28236469)
chr4 (31-318)||(20192025-20192311)
chr4 (39-286)||(37773486-37773733)
chr4 (29-323)||(47265193-47265494)
chr4 (167-324)||(21528416-21528573)
chr4 (47-295)||(50286970-50287217)
chr4 (134-324)||(21236953-21237143)
chr4 (167-324)||(6957726-6957883)
chr4 (38-318)||(1793459-1793741)
chr4 (167-324)||(12494791-12494948)
chr4 (157-321)||(51811280-51811442)
chr4 (30-274)||(20591353-20591591)
chr4 (39-322)||(51421730-51422013)
chr4 (167-316)||(7947065-7947214)
chr4 (123-271)||(50679588-50679736)
chr4 (50-304)||(20601669-20601917)
chr4 (30-257)||(41009414-41009641)
chr4 (157-320)||(4548140-4548303)
chr4 (37-324)||(45204837-45205131)
chr4 (73-324)||(20821001-20821255)
chr4 (211-324)||(19154860-19154973)
chr4 (216-324)||(19969358-19969466)
chr4 (45-278)||(16002933-16003165)
chr4 (159-324)||(35690391-35690556)
chr4 (207-324)||(55007914-55008031)
chr4 (193-321)||(28550455-28550583)
chr4 (193-324)||(31043226-31043357)
chr4 (97-322)||(28351617-28351842)
chr4 (233-324)||(883357-883448)
chr4 (30-324)||(1211389-1211683)
chr4 (193-324)||(31961263-31961394)
chr4 (239-324)||(19061932-19062017)
chr4 (246-322)||(49939733-49939809)
chr4 (160-246)||(50862764-50862851)
chr4 (161-320)||(53518325-53518483)
chr4 (222-324)||(2589255-2589357)
chr4 (29-83)||(12494740-12494794)
chr4 (207-324)||(25574992-25575109)
chr4 (207-324)||(56225236-56225353)
chr4 (236-324)||(13805262-13805350)
chr4 (196-324)||(31459151-31459279)
chr4 (212-324)||(34208266-34208378)
chr4 (236-323)||(12443292-12443379)
chr4 (245-324)||(32633403-32633482)
chr4 (29-116)||(41192826-41192913)
chr4 (257-324)||(50238612-50238679)
chr4 (257-324)||(50238698-50238765)
chr4 (240-318)||(13262413-13262491)
chr4 (183-325)||(26024846-26024988)
chr4 (40-109)||(35555859-35555928)
chr4 (193-318)||(37042667-37042792)
chr4 (240-325)||(50869876-50869961)
chr4 (236-324)||(6958236-6958323)
chr4 (244-324)||(7066496-7066575)
chr4 (268-324)||(30634103-30634159)
chr4 (236-324)||(51438642-51438730)
chr4 (207-319)||(55388213-55388325)
chr4 (193-324)||(37488245-37488376)
chr4 (29-116)||(44047553-44047640)
chr4 (269-324)||(45209202-45209257)
chr4 (250-321)||(47372915-47372986)
chr4 (29-108)||(54470197-54470276)
chr4 (222-324)||(5306479-5306581)
chr4 (41-107)||(31459032-31459098)
chr4 (39-321)||(46372024-46372306)
chr4 (162-324)||(53540413-53540575)
chr4 (271-324)||(46153940-46153993)
chr4 (268-324)||(1328611-1328667)
chr4 (236-324)||(29399001-29399089)
chr4 (240-324)||(35622673-35622757)
chr4 (269-321)||(38017319-38017371)
chr4 (240-324)||(42285700-42285784)
chr4 (242-322)||(44360289-44360369)
chr4 (273-325)||(56130404-56130456)
chr4 (207-322)||(41192229-41192344)
chr4 (269-324)||(44719358-44719413)
chr4 (163-250)||(55809061-55809148)
chr4 (39-105)||(2588991-2589056)
chr4 (268-322)||(15665330-15665384)
chr4 (46-108)||(26356626-26356688)
chr4 (220-262)||(41729509-41729551)
chr4 (49-139)||(42285882-42285972)
chr4 (170-324)||(42293262-42293416)
chr4 (238-324)||(54935348-54935434)
chr4 (243-320)||(3979124-3979201)
chr4 (222-319)||(22873601-22873698)
chr4 (240-321)||(31897428-31897509)
chr4 (268-324)||(4879106-4879162)
chr4 (268-324)||(15661869-15661925)
chr4 (236-324)||(20105515-20105603)
chr4 (39-107)||(30621418-30621486)
chr4 (248-324)||(32339768-32339844)
chr4 (222-314)||(34233031-34233123)
chr4 (193-257)||(41009283-41009347)
chr4 (40-108)||(42639233-42639301)
chr4 (269-321)||(49738550-49738602)
chr4 (268-316)||(50862860-50862908)
chr4 (236-319)||(1095642-1095725)
chr4 (269-320)||(4136744-4136795)
chr4 (248-319)||(34585691-34585762)
chr4 (238-321)||(36799657-36799740)
chr4 (29-108)||(44360077-44360155)
chr4 (29-108)||(51252674-51252753)
chr4 (39-109)||(10209034-10209104)
chr4 (39-109)||(17900480-17900550)
chr4 (29-107)||(33709914-33709992)
chr4 (201-283)||(36198977-36199059)
chr4 (46-143)||(50680746-50680844)
chr4 (268-322)||(50967027-50967081)
chr4 (39-105)||(55768717-55768783)
chr4 (39-105)||(55832973-55833039)
chr4 (291-324)||(3601416-3601449)
chr4 (248-321)||(8284348-8284421)
chr4 (240-324)||(10209237-10209319)
chr4 (240-324)||(10775468-10775550)
chr4 (209-262)||(26510558-26510611)
chr4 (29-146)||(28497480-28497596)
chr4 (29-82)||(36557268-36557321)
chr4 (39-116)||(49738809-49738886)
chr4 (268-324)||(7544528-7544584)
chr4 (269-321)||(28348287-28348339)
chr4 (207-283)||(28486089-28486165)
chr4 (193-281)||(30621241-30621329)
chr4 (258-322)||(30662042-30662106)
chr4 (240-324)||(35555647-35555731)
chr4 (240-324)||(36556757-36556841)
chr4 (248-324)||(40932921-40932997)
chr4 (240-324)||(45184130-45184214)
chr4 (41-105)||(45423617-45423681)
chr4 (269-321)||(46236719-46236771)
chr4 (269-321)||(50471757-50471809)
chr4 (236-324)||(54963648-54963735)
chr4 (207-303)||(55579200-55579295)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (29-324)||(42854001-42854296)
chr8 (29-324)||(36545139-36545434)
chr8 (29-324)||(11523720-11524016)
chr8 (29-324)||(40813314-40813609)
chr8 (29-323)||(36565239-36565533)
chr8 (41-318)||(12491141-12491418)
chr8 (20-318)||(8932683-8932982)
chr8 (113-324)||(42469724-42469935)
chr8 (29-320)||(36394949-36395242)
chr8 (20-322)||(18125154-18125454)
chr8 (37-273)||(39946855-39947091)
chr8 (70-324)||(21121177-21121430)
chr8 (29-304)||(2796547-2796818)
chr8 (166-324)||(14742079-14742234)
chr8 (59-278)||(26904950-26905168)
chr8 (140-324)||(2027631-2027815)
chr8 (54-324)||(37077768-37078034)
chr8 (29-321)||(8879446-8879732)
chr8 (97-317)||(12025847-12026058)
chr8 (20-321)||(45419218-45419517)
chr8 (200-324)||(15215409-15215533)
chr8 (193-322)||(25473402-25473531)
chr8 (209-321)||(44529395-44529507)
chr8 (20-201)||(18751996-18752176)
chr8 (212-324)||(44047529-44047641)
chr8 (193-320)||(25288918-25289045)
chr8 (193-320)||(25300253-25300380)
chr8 (207-324)||(490503-490620)
chr8 (193-321)||(29520803-29520931)
chr8 (162-324)||(35643605-35643765)
chr8 (193-322)||(45041315-45041443)
chr8 (193-324)||(30559847-30559983)
chr8 (48-324)||(32930970-32931245)
chr8 (41-127)||(12796894-12796980)
chr8 (162-321)||(2216411-2216568)
chr8 (42-132)||(6510617-6510707)
chr8 (269-323)||(39967497-39967551)
chr8 (29-322)||(39953263-39953556)
chr8 (207-324)||(42584527-42584643)
chr8 (42-286)||(43904700-43904947)
chr8 (248-324)||(27556299-27556375)
chr8 (243-327)||(30689939-30690023)
chr8 (193-321)||(35914601-35914729)
chr8 (236-324)||(41031417-41031505)
chr8 (236-324)||(41031523-41031611)
chr8 (232-324)||(8255528-8255622)
chr8 (161-324)||(28169514-28169676)
chr8 (249-323)||(1928585-1928659)
chr8 (249-323)||(10668495-10668569)
chr8 (207-324)||(21425214-21425331)
chr8 (222-323)||(23492217-23492318)
chr8 (242-327)||(36042401-36042486)
chr8 (193-320)||(14459049-14459177)
chr8 (211-324)||(31715992-31716107)
chr8 (29-324)||(32043580-32043872)
chr8 (248-324)||(32276894-32276970)
chr8 (248-324)||(32569707-32569783)
chr8 (236-320)||(36143538-36143622)
chr8 (240-323)||(30812814-30812897)
chr8 (238-320)||(18473973-18474055)
chr8 (240-324)||(7531641-7531725)
chr8 (269-321)||(12611727-12611779)
chr8 (20-80)||(25985500-25985560)
chr8 (269-317)||(26055651-26055699)
chr8 (259-323)||(35323993-35324057)
chr8 (168-320)||(35362651-35362803)
chr8 (204-324)||(41444336-41444456)
chr8 (243-323)||(43733410-43733490)
chr8 (222-318)||(44699649-44699745)
chr8 (37-116)||(2776434-2776513)
chr8 (236-323)||(10824187-10824274)
chr8 (240-315)||(16351578-16351653)
chr8 (206-321)||(26363655-26363768)
chr8 (222-325)||(30198262-30198365)
chr8 (274-324)||(1064955-1065005)
chr8 (39-81)||(25985839-25985881)
chr8 (239-317)||(39702154-39702232)
chr8 (242-325)||(41212064-41212149)
chr8 (226-319)||(2518400-2518493)
chr8 (39-116)||(9695631-9695708)
chr8 (271-324)||(16921451-16921504)
chr8 (248-321)||(35646930-35647003)
chr8 (41-146)||(36143367-36143472)
chr8 (240-325)||(38901815-38901900)
chr8 (43-95)||(7103274-7103326)
chr8 (280-324)||(32978115-32978159)
chr8 (208-319)||(16917352-16917462)
chr8 (193-244)||(25439479-25439530)
chr8 (168-295)||(38391919-38392046)
chr8 (268-323)||(39651026-39651081)
chr8 (248-318)||(1313773-1313843)
chr8 (269-323)||(11129951-11130004)
chr8 (207-286)||(12966347-12966428)
chr8 (39-81)||(13986494-13986536)
chr8 (222-324)||(14903744-14903846)
chr8 (226-304)||(16035744-16035822)
chr8 (211-320)||(36069774-36069883)
chr8 (39-100)||(41444547-41444608)
chr8 (270-322)||(4558207-4558259)
chr8 (193-321)||(4955345-4955473)
chr8 (268-324)||(12985919-12985975)
chr8 (269-321)||(16971772-16971824)
chr8 (238-286)||(30456329-30456377)
chr8 (45-81)||(30456452-30456488)
chr8 (162-286)||(30783077-30783201)
chr8 (272-324)||(35085134-35085186)
chr8 (268-324)||(40982893-40982949)
chr8 (237-325)||(42493426-42493514)
chr8 (41-109)||(44681251-44681319)
chr8 (162-257)||(45512558-45512654)
chr8 (39-107)||(45512709-45512777)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (29-324)||(5258145-5258440)
chr6 (29-324)||(28085366-28085661)
chr6 (37-318)||(30031254-30031535)
chr6 (29-324)||(32755911-32756206)
chr6 (29-286)||(21351872-21352129)
chr6 (40-321)||(35043441-35043722)
chr6 (20-320)||(608138-608442)
chr6 (29-281)||(5631812-5632064)
chr6 (29-321)||(9706766-9707052)
chr6 (29-324)||(20427633-20427928)
chr6 (30-324)||(12890575-12890860)
chr6 (37-324)||(14030805-14031080)
chr6 (50-323)||(30679417-30679680)
chr6 (20-187)||(10099993-10100160)
chr6 (162-324)||(34143762-34143924)
chr6 (162-324)||(34156378-34156540)
chr6 (41-278)||(33496963-33497198)
chr6 (202-324)||(3206456-3206578)
chr6 (39-322)||(9593709-9593988)
chr6 (212-324)||(31819004-31819116)
chr6 (210-321)||(34934830-34934941)
chr6 (104-282)||(5080905-5081083)
chr6 (93-216)||(7133800-7133923)
chr6 (93-216)||(7136723-7136846)
chr6 (45-321)||(2689646-2689915)
chr6 (161-321)||(5095956-5096116)
chr6 (240-324)||(30789071-30789155)
chr6 (39-252)||(28026896-28027108)
chr6 (193-324)||(10098893-10099022)
chr6 (162-324)||(34502-34664)
chr6 (236-324)||(4245869-4245957)
chr6 (201-323)||(5897619-5897741)
chr6 (193-321)||(31818685-31818813)
chr6 (193-286)||(24665965-24666058)
chr6 (159-286)||(6055806-6055933)
chr6 (200-319)||(7492550-7492669)
chr6 (235-321)||(12119642-12119729)
chr6 (248-321)||(1615223-1615296)
chr6 (47-116)||(24665818-24665887)
chr6 (236-324)||(579615-579703)
chr6 (29-109)||(33084048-33084128)
chr6 (250-322)||(12133901-12133973)
chr6 (248-323)||(9109507-9109582)
chr6 (222-324)||(6293389-6293491)
chr6 (207-280)||(14389202-14389275)
chr6 (249-318)||(21886314-21886383)
chr6 (268-321)||(33730194-33730247)
chr6 (244-324)||(38976-39056)
chr6 (162-322)||(8364679-8364839)
chr6 (40-107)||(2079341-2079408)
chr6 (37-72)||(5080853-5080888)
chr6 (270-329)||(6906819-6906878)
chr6 (248-318)||(21089606-21089676)
chr6 (291-324)||(3127273-3127306)
chr6 (291-324)||(4878294-4878327)
chr6 (39-80)||(6641650-6641691)
chr6 (42-102)||(8364575-8364635)
chr6 (224-324)||(9568884-9568983)
chr6 (41-109)||(14389380-14389447)
chr6 (268-324)||(30642998-30643054)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (29-314)||(38684957-38685242)
chr5 (29-321)||(3301834-3302126)
chr5 (29-324)||(4496374-4496669)
chr5 (29-321)||(16347380-16347670)
chr5 (29-324)||(12492381-12492679)
chr5 (20-324)||(28976856-28977160)
chr5 (29-322)||(1287578-1287871)
chr5 (29-322)||(24178500-24178793)
chr5 (29-324)||(14665704-14665997)
chr5 (42-320)||(20456776-20457054)
chr5 (49-324)||(10639314-10639587)
chr5 (29-319)||(2075475-2075766)
chr5 (39-324)||(1275264-1275549)
chr5 (128-323)||(13561384-13561579)
chr5 (97-324)||(2915493-2915719)
chr5 (29-323)||(34273017-34273297)
chr5 (134-324)||(14911267-14911457)
chr5 (170-324)||(29816513-29816667)
chr5 (31-324)||(26884686-26884979)
chr5 (183-321)||(16913882-16914021)
chr5 (212-322)||(5558314-5558424)
chr5 (200-324)||(2393038-2393161)
chr5 (29-274)||(14749297-14749542)
chr5 (219-324)||(30213755-30213860)
chr5 (159-322)||(28002-28165)
chr5 (79-317)||(38501422-38501660)
chr5 (30-281)||(36215489-36215730)
chr5 (193-324)||(28276392-28276523)
chr5 (231-322)||(18855799-18855890)
chr5 (201-324)||(39040918-39041041)
chr5 (202-324)||(418031-418153)
chr5 (222-324)||(32442123-32442224)
chr5 (20-290)||(32516537-32516806)
chr5 (39-112)||(31636129-31636202)
chr5 (39-109)||(33667216-33667286)
chr5 (207-321)||(43557833-43557947)
chr5 (250-323)||(408492-408565)
chr5 (207-324)||(14667939-14668056)
chr5 (193-309)||(9235201-9235316)
chr5 (240-319)||(3442873-3442952)
chr5 (193-323)||(11675683-11675814)
chr5 (202-321)||(31220546-31220664)
chr5 (236-318)||(7640510-7640592)
chr5 (222-324)||(20367076-20367178)
chr5 (29-146)||(79503-79620)
chr5 (201-322)||(2090575-2090696)
chr5 (213-322)||(36551320-36551429)
chr5 (210-275)||(42504293-42504358)
chr5 (46-321)||(1525651-1525923)
chr5 (236-324)||(6859578-6859666)
chr5 (162-322)||(7678601-7678760)
chr5 (248-324)||(28411885-28411961)
chr5 (28-147)||(42199277-42199394)
chr5 (268-324)||(42576239-42576295)
chr5 (249-316)||(2713146-2713213)
chr5 (222-317)||(8081967-8082059)
chr5 (243-318)||(11002424-11002499)
chr5 (236-322)||(2645187-2645273)
chr5 (30-108)||(10082952-10083030)
chr5 (38-116)||(15168791-15168869)
chr5 (248-322)||(38132545-38132619)
chr5 (244-321)||(9121078-9121155)
chr5 (29-82)||(14667753-14667806)
chr5 (40-109)||(28676596-28676665)
chr5 (207-304)||(30588615-30588712)
chr5 (236-324)||(21193649-21193737)
chr5 (43-107)||(37065533-37065597)
chr5 (240-323)||(5860035-5860118)
chr5 (41-323)||(7359259-7359539)
chr5 (248-323)||(32366187-32366262)
chr5 (193-259)||(2552936-2553002)
chr5 (39-109)||(2712944-2713014)
chr5 (259-321)||(9234106-9234168)
chr5 (207-257)||(17340500-17340550)
chr5 (39-116)||(18351112-18351190)
chr5 (196-324)||(14725675-14725803)
chr5 (222-327)||(23980127-23980232)
chr5 (268-321)||(27386569-27386622)
chr5 (247-324)||(27800036-27800113)
chr5 (249-322)||(42272687-42272760)
chr5 (222-286)||(18350937-18351001)
chr5 (46-106)||(21952364-21952424)
chr5 (248-324)||(41200343-41200419)
chr5 (236-323)||(9400708-9400795)
chr5 (241-316)||(28985285-28985360)
chr5 (207-322)||(38684648-38684763)
chr5 (222-297)||(41808105-41808180)
chr5 (202-324)||(41894229-41894358)
chr5 (193-283)||(6889147-6889237)
chr5 (268-321)||(3000968-3001021)
chr5 (263-324)||(4653476-4653537)
chr5 (273-322)||(5303681-5303730)
chr5 (39-108)||(6888993-6889062)
chr5 (248-323)||(9917458-9917530)
chr5 (207-320)||(12576861-12576974)
chr5 (248-321)||(28186782-28186855)
chr5 (196-245)||(36200886-36200935)
chr5 (273-321)||(7367172-7367220)
chr5 (208-312)||(15588399-15588503)
chr5 (269-325)||(36123178-36123234)
chr5 (240-323)||(37065677-37065761)
chr5 (268-304)||(39322096-39322132)
chr5 (162-262)||(43035104-43035204)
chr5 (42-146)||(43475243-43475347)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (20-324)||(945-1249)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (29-324)||(31458-31753)
scaffold0018 (39-109)||(44080-44150)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (29-321)||(82711-83000)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (153-321)||(16692-16860)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (53-324)||(86606-86877)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (109-324)||(4706-4921)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (39-324)||(4277-4553)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (167-324)||(25529-25686)
scaffold0157 (29-83)||(25683-25737)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (81-324)||(11546-11787)
scaffold0113 (37-107)||(11810-11880)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (193-322)||(485-614)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (193-324)||(14737-14868)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (231-324)||(28886-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (162-324)||(58223-58385)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (179-319)||(7580-7720)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (193-324)||(1519-1647)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (193-320)||(160325-160452)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (233-319)||(16438-16524)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (236-322)||(6771-6857)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (271-324)||(19149-19202)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (201-257)||(39481-39537)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 383
Target Start/End: Original strand, 25191358 - 25191721
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191358 gacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatacc 25191457  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191458 gttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 25191557  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25191558 tcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgtt 25191657  T
Q  320 gttgtcgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatagcgagataatttaatattttatttta 383  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25191658 gtcgttgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatagcgagataatttaatatttgatttta 25191721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 22063 - 22357
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22063 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 22161  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22162 agagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 22261  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22262 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033428
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 5168822 - 5169117
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5168822 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 5168921  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5168922 agagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagt 5169021  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5169022 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 5169117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 47233888 - 47233596
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  47233888 agagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 47233789  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  47233788 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaat 47233689  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47233688 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 52138790 - 52139084
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  52138790 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaaga 52138889  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||  |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52138890 agaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 52138989  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52138990 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 28245427 - 28245721
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  28245427 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaaga 28245526  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28245527 agagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagt 28245626  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    | ||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28245627 tggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 324
Target Start/End: Original strand, 53519603 - 53519865
Alignment:
Q  50 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53519603 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggag 53519702  T
Q  150 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 249  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53519703 agtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccatt------------aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttg 53519790  T
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53519791 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 53519865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 54279010 - 54279304
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  54279010 agagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaa 54279109  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54279110 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 54279209  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54279210 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttgt 54279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 51447991 - 51447714
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  51447991 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatca 51447892  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||       |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51447891 aatggaggagagtcaagttaaaagag-------aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 51447799  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51447798 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 324
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508520
Alignment:
Q  72 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 171  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  172 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 271  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  272 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 321
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaata 240  Q
    ||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  || |||||     
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  241 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43695048 - 43694768
Alignment:
Q  38 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  ||||    
T  43695048 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagat 43694949  T
Q  138 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 237  Q
    |||||| ||  |||    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  43694948 caaatgaag--gaa----gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaa 43694855  T
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |   ||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43694854 actaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttgt 43694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12096870 - 12096702
Alignment:
Q  156 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  12096870 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12096771  T
Q  256 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12096770 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12096702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 54128378 - 54128662
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| |||||| ||||||   |  ||| | |||| |||||    
T  54128378 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatc 54128477  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt-gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 237  Q
    | ||||||   |  ||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  54128478 agatggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaa 54128577  T
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54128578 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262426
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 53262426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33272318 - 33272122
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctata----gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgt 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||    
T  33272318 agagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggt 33272220  T
Q  125 aagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 222  Q
    |||||| | | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272219 aagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289091
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaa 126  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| ||  ||||||   || ||||    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  127 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 226  Q
    |||||| |||||| |||||| | |   || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  227 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060579
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 187  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaac 38060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa-gacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||   || |||||||||| |||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  145 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    || |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52156228 - 52156081
Alignment:
Q  177 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 276  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52156228 actaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T
Q  277 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  52156128 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 52156081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 19676362 - 19676079
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  19676362 ggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | || ||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa 19676164  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||| | | ||||||| || |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19676163 tatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54425244 - 54424959
Alignment:
Q  49 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag-------agaagatcaaa 141  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||       || |||||| |    
T  54425244 ctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtagggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcaga 54425145  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54425144 tggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagagggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatat 54425045  T
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54425044 ggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311306
Alignment:
Q  208 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 307  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  308 ttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgttgt 311306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042219
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 291  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 49042189  T
Q  292 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49042190 cttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 213
Target Start/End: Original strand, 45728137 - 45728324
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag-aagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||    
T  45728137 agagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaag 45728236  T
Q  128 aagag--aagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 213  Q
    |||||   | ||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45728237 aagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 321
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  183 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  283 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 244
Target Start/End: Original strand, 3186771 - 3186973
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||| |  ||||||     
T  3186771 ggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggct-agatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcag 3186869  T
Q  141 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 240  Q
    || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| || | |||||||||| ||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3186870 attgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaata 3186969  T
Q  241 tggt 244  Q
    ||||    
T  3186970 tggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 286
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  55 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 154  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| | |  ||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  155 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 254  Q
    | | |||||||||||||||||| | || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  255 acactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555329
Alignment:
Q  217 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  317 gttgttgt 324  Q
    ||||||||    
T  47555336 gttgttgt 47555329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133609
Alignment:
Q  214 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 313  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  314 gttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||    
T  2133619 gttgttgttgt 2133609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510013
Alignment:
Q  43 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 142  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  |||||  |||||   || ||||| |||| |||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  143 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 242  Q
    |||| | |  ||| | |  ||||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgt 42510013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 49503695 - 49503565
Alignment:
Q  194 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaact 293  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| || | |||| | | ||||||||||||||||||| || |||    
T  49503695 agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctact 49503596  T
Q  294 tagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49503595 tagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 49503565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50960915 - 50960636
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||     ||   || | |||||||| |||||    
T  50960915 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | |||||| |||  | | |  ||||||| ||||||||| |||  ||||   |  ||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaa 50960720  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| | | ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  50960719 tatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48712196 - 48712075
Alignment:
Q  200 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 299  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48712196 cattaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgg 48712097  T
Q  300 gataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48712096 gataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296189
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364976
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga--agacccgtagataccgttgtaa 126  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||  | ||| |||||| |  || |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  127 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 226  Q
    | |||| |||||||||| || | |  |||   |  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  227 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga-ccacactagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566161
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 39600973 - 39600683
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||| | || |  ||     
T  39600973 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgagg 39600874  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| || ||| | |  ||| ||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  39600873 agagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagt 39600774  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||| || || | || |||| ||| |||||  ||||||| |||||    
T  39600773 tggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273202
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgt 40273202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48734417 - 48734147
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | |||||  | || ||| |||||| |||||    
T  48734417 ggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatc 48734318  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | |||||||  |   || | |||||||||||||||||  ||            ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  48734317 agatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaaggcct------------tgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaa 48734230  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
     ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48734229 catggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895877
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 7895877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 257
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   || | |||||||||||| |||| | ||||   || ||| |||||| ||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  141 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 240  Q
    |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||| |||    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  241 tggtttttgatagaaca 257  Q
    |||||| ||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 320
Target Start/End: Original strand, 26490317 - 26490596
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||  | |||   || ||| |||||| ||||||     
T  26490317 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcag 26490416  T
Q  141 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 240  Q
    || ||| |||| ||  ||| | |||| || ||||||  ||  ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||     
T  26490417 atagaggagaatcatattagatgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatg 26490516  T
Q  241 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    || |||   |||||| | |||| | | ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  26490517 tgatttcatatagaatattatggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31454306 - 31454224
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31454306 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 19757898 - 19758158
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||    
T  19757898 tgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtaga 19757997  T
Q  137 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 236  Q
    ||| |||||| |||   || | |||| ||||||||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||      
T  19757998 tcagatggaggagagttagatcaaaa-aggtagaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctc 19758084  T
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19758085 aatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601177
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29601160 cttggttcttgttgttgt 29601177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486848
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532243
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca-tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48532243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927845
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgt 52927845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Original strand, 32170602 - 32170684
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170602 aaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208893
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  39208891 tgt 39208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422837
Alignment:
Q  198 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaa 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccca 54422867  T
Q  292 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54422866 cttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Original strand, 27917570 - 27917639
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27917570 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagac 27917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 49503834 - 49503766
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  49503834 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 49503766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304248
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  307 cttggttgttgttgt 321  Q
    || ||||||||||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 19736995 - 19737255
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||    
T  19736995 tgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtaga 19737094  T
Q  137 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 236  Q
    ||| |||||| |||   || | |||| |||| |||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||      
T  19737095 tcagatggaggagagttagatcaaaa-aggttgaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctc 19737181  T
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19737182 aatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45374567 - 45374474
Alignment:
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45374567 gatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Original strand, 21200539 - 21200656
Alignment:
Q  28 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | |  |||||    
T  21200539 cagagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaag 21200636  T
Q  128 aagagaagatcaaatggaga 147  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  21200637 gagagtagatcacatggaga 21200656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834597
Alignment:
Q  256 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45834597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 321
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 324
Target Start/End: Original strand, 20208196 - 20208283
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  20208196 aatatggcatttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgt 20208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294125
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat---gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||   |||||||||||||  |||||| ||   |||||||||| | ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| || | |  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggca--atttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 36820253 - 36820166
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820253 agagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678929
Alignment:
Q  43 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgtt-gtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |  |||||  |    
T  52679124 tagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagat---gttggtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatat 52678930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162664
Alignment:
Q  123 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 222  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  223 atgagttagatccaaatatggt 244  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19162685 atgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 318
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  253 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41842635 - 41842562
Alignment:
Q  209 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  41842635 agatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 318
Target Start/End: Original strand, 49841770 - 49841895
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  49841770 gagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
     ||| | | ||| |||||||||||||    
T  49841870 atagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893374
Alignment:
Q  244 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttgt 27893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38181086 - 38181042
Alignment:
Q  64 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38181086 tggtagaaattagacttagatgatttagacatgttgagagaagac 38181042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778609
Alignment:
Q  246 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148311
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21862796 - 21862742
Alignment:
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21862796 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31337658 - 31337560
Alignment:
Q  223 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31337658 atgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116348
Alignment:
Q  209 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 308  Q
    |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  309 tgg 311  Q
    |||    
T  40116350 tgg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842686
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| |  |||||||||||||| | |||||| | || ||||  |||| ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  140 aatggag 146  Q
    |||||||    
T  41842692 aatggag 41842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 321
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284270
Alignment:
Q  208 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 307  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggc 11284256  T
Q  308 ttggttgttgttgt 321  Q
    ||| ||||||||||    
T  11284257 ttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022707
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | ||||   |||||| || |||||||||||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  273 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 344825 - 344769
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  344825 atttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 344769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987619
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 3987619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146984
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 31146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351666
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 298  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 37351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 263
Target Start/End: Original strand, 37779045 - 37779101
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 263  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37779045 aaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacattatga 37779101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 44134112 - 44134044
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  44134112 ggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 319
Target Start/End: Original strand, 659734 - 659805
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  659734 tgatagaacattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 31261039 - 31260965
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31261039 tgatagaacactgtgacatcatttgattcatg-cgccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 31260965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42026635 - 42026536
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42026635 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249662
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 50249662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31453221 - 31453151
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  31453221 ggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37083345 - 37083291
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37083345 atttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367390
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 50631957 - 50631879
Alignment:
Q  245 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  50631957 ttttgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 31454504 - 31454467
Alignment:
Q  43 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 80  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31454504 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 31454467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 52882715 - 52882662
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  52882715 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 345003 - 344951
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 81  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  345003 agagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggctta 344951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Original strand, 11581445 - 11581513
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  11581445 gggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagac 11581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332557
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| | || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 30332557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31453042 - 31452958
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| | || |||||| | || |||||| |||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  31453042 atggtttttgacataatactatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtttttgt 31452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40116596 - 40116532
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  40116596 gagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaaca 40116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 40672446 - 40672366
Alignment:
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  40672446 ggtttttgataggtcattatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 255
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 255  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 132)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 43281655 - 43281959
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43281655 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 43281754  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43281755 gttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagagg 43281854  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43281855 tcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 43281954  T
Q  320 gttgt 324  Q
    |||||    
T  43281955 gttgt 43281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 29650374 - 29650669
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650374 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 29650473  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650474 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 29650573  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29650574 ttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29650669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12841567 - 12841272
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12841567 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 12841468  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12841467 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 12841368  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12841367 tgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45836772 - 45836479
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45836772 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 45836673  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||   ||||||   |||||||||| ||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45836672 agagtagatcaaatggaggagagttaggttat--gaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 45836575  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45836574 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 45836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 11593950 - 11594245
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  11593950 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaaga 11594049  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11594050 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 11594149  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11594150 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11594245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 37617934 - 37618229
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37617934 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaag 37618033  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37618034 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataag 37618133  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37618134 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37618229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 34869410 - 34869702
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  34869410 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaaga 34869509  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||| ||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34869510 agagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 34869609  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34869610 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39906662 - 39906369
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||    
T  39906662 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaaga 39906563  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39906562 agagtagatcaaatggaggagt--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgact 39906465  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39906464 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885719
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2885719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 46356148 - 46355858
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   || ||||||    
T  46356148 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaaga 46356049  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46356048 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 46355949  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46355948 tggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 49029266 - 49029559
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49029266 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 49029365  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
     ||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49029366 cgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 49029465  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  49029466 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35906493 - 35906208
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35906493 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 35906394  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | |||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35906393 agagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagt 35906294  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 314  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  35906293 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682599
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
    ||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44855464 - 44855171
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  44855464 agagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataaga 44855365  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855364 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 44855265  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44855264 tggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44855171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33350098 - 33349803
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33350098 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 33349999  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33349998 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagt 33349899  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33349898 tggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 33349803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 6374858 - 6375153
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||    
T  6374858 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagaccagtagatgctgtggtaaga 6374957  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    || | |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  6374958 agggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcagtgagt 6375057  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  6375058 tggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 6375153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 38606994 - 38607277
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38606994 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 38607093  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38607094 agagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38607181  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  38607182 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgt 38607277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 324
Target Start/End: Original strand, 36652004 - 36652277
Alignment:
Q  51 atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |    
T  36652004 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggata 36652103  T
Q  151 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 250  Q
      || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||    
T  36652104 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatga 36652203  T
Q  251 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36652204 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgt 36652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35559286 - 35558994
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacct-atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||    
T  35559286 agagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaag 35559187  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35559186 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 35559087  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    || ||||||||| | |||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |  | |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  35559086 ttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 42 - 324
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349905
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||| ||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 22349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Original strand, 43491299 - 43491593
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43491299 gagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaa 43491398  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    |||  ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  43491399 gagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagtt 43491498  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43491499 ggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43491593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 13859300 - 13859067
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  13859300 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaaga 13859201  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13859200 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagt 13859101  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 262  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13859100 tggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 78 - 324
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631849
Alignment:
Q  78 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 177  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||     
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  178 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 277  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  278 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Original strand, 31005213 - 31005428
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31005213 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 31005312  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  31005313 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagt 31005412  T
Q  229 tagatccaaatatggt 244  Q
    | ||||||||| ||||    
T  31005413 tggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869234
Alignment:
Q  38 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  138 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 237  Q
    ||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc-------catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 36869234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598185
Alignment:
Q  97 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 196  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  197 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |  | |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  297 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgt 24598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 324
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682459
Alignment:
Q  49 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 148  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  149 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 248  Q
     |  || || ||||||||| ||| || | ||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgt 15682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Original strand, 33072933 - 33073100
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  33072933 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtc 33073032  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 187  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33073033 gtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 33073100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  156 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  256 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 324
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900241
Alignment:
Q  156 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  256 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38900241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 322
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273383
Alignment:
Q  93 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| ||||   |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  296 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  112 tagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga 211  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||   || |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  212 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  312 ttgttgtt 319  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 321
Target Start/End: Original strand, 48919255 - 48919394
Alignment:
Q  182 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48919255 gaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgta 48919354  T
Q  282 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  48919355 gtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Original strand, 21078062 - 21078200
Alignment:
Q  184 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 283  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  21078062 aaaccgttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 21078161  T
Q  284 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||    | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21078162 cgacttcatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 23404409 - 23404640
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || | ||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||||    
T  23404409 gagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggcttaga-cagtttggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaa 23404507  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||  ||   ||||||||||| ||   ||||| || ||||||||||    
T  23404508 gagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtt 23404607  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatg 262  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404608 tgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 36136754 - 36137046
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| | ||| ||||||||| |||  |||||   || ||| ||    
T  36136754 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacga 36136853  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||| ||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| |    
T  36136854 agagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaat 36136953  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||    | |||||||  || || ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36136954 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210701
Alignment:
Q  161 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 260  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||  |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  261 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttgt 9210701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208325
Alignment:
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28208325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 46014472 - 46014359
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  46014472 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg-gttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcctaaga 46014374  T
Q  129 agagaagatcaaatg 143  Q
    |||| ||||||||||    
T  46014373 agagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  311 gttgttgttg 320  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28628212 - 28627936
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| || ||| | |||||| |||||| ||| ||||||   || ||||| |||| |||||  |    
T  28628212 gtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccga 28628113  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    ||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  28628112 tggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgt 28628013  T
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28628012 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 322
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  215 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  315 ttgttgtt 322  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101774
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36101791 cttggttgttgttgttgt 36101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 146
Target Start/End: Original strand, 7273030 - 7273146
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||    
T  7273030 gagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaa 7273129  T
Q  130 gagaagatcaaatggag 146  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  7273130 gagtagatcagatggag 7273146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 318
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |   | |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893560
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| | |||||| | || | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgttgt 27893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 329
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951445
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatac 44951408  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 329  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44951409 ttagtggtataaggtttggttgttgttgttgtagtct 44951445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 319
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869101
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 324
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969983
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  311 gttgttgttgttgt 324  Q
    ||| ||| ||||||    
T  42969970 gttattgatgttgt 42969983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 42187595 - 42187726
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 291  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  42187595 gagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 42187693  T
Q  292 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  42187694 cttagtgggataaggctttgttgttgttgttgt 42187726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 322
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  214 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 313  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  314 gttgttgtt 322  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 1011167 - 1011329
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1011167 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacat 1011265  T
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1011266 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 324
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966301
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    || |||  |     || |||  |  |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| || |||  ||||||    
T  12966125 tgaagacta-----gtcaaatcac-tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| | ||||| | || |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12966301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 278
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922492
Alignment:
Q  161 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 260  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaac-tttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  261 tgacatcatttgatccat 278  Q
    |||| | |||||||||||    
T  35922475 tgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36514509 - 36514424
Alignment:
Q  19 ggacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 104  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  36514509 ggacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 81
Target Start/End: Original strand, 32630584 - 32630636
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 81  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32630584 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519046
Alignment:
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 301  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  | || |||||||| ||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  302 taatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741891
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||  ||||||||||| | ||||  |||||   || ||||| |||| ||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga--aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 237  Q
     || ||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||  ||  ||||| ||   |||  ||| ||||| ||| |||| ||  | |||||||| || | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgcaaaaatgcttggttgttgttgttgt 26741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc------aactt 294  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||       ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  295 agtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 324
Target Start/End: Original strand, 31005432 - 31005490
Alignment:
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31005432 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31005490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169726
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 320
Target Start/End: Original strand, 34745891 - 34746028
Alignment:
Q  183 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||| || || | |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||    
T  34745891 aaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtag 34745990  T
Q  283 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34745991 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 278
Target Start/End: Original strand, 47848664 - 47848912
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||  ||| || | ||  ||||     
T  47848664 agagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaagg 47848763  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| | |  | | | |  ||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | | | ||||||     
T  47848764 agagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagc 47848862  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  47848863 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 323
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag-ccgatccaactt 294  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |   |||||||||| |||| | || || ||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  295 agtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29318848 - 29318792
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29318848 atttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29318792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 8492355 - 8492276
Alignment:
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||    
T  8492355 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 284  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38135341 - 38135210
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| || |||||||| | |||| | | ||||||||||| |||| || || ||    
T  38135341 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccac 38135242  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38135241 ttggtgggacaaggcttggttgttattgttgt 38135210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 324
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630719
Alignment:
Q  257 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40630719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 43282398 - 43282477
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  43282398 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 322
Target Start/End: Original strand, 7220965 - 7221039
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7220965 tgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 237 - 323
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891172
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976517
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||| ||||||||||||| | ||  |||||   ||||| |    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataagg 37976502  T
Q  307 cttggttgttgttgt 321  Q
     ||||||||||||||    
T  37976503 tttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19262725 - 19262609
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||    
T  19262725 agagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaaga 19262627  T
Q  129 agagaagatcaaatggag 146  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  19262626 agagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158671
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103211
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| || |||||||||    
T  33103194 cttggctgatgttgttgt 33103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  217 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 316  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  317 gt 318  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 319
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189442
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594037
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013560
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 16013560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 28708610 - 28708666
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28708610 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttgt 28708666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 29312218 - 29312274
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29312218 atttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 323
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840514
Alignment:
Q  251 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 159 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 1531523 - 1531420
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||     
T  1531523 aaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacat 1531424  T
Q  259 tatg 262  Q
    ||||    
T  1531423 tatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Original strand, 14593772 - 14593835
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  14593772 cacctatagtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541943
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataat 305  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||  || |||||||  |||||     
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  306 gcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 281
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  210 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19119505 - 19119423
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  19119505 atggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 324
Target Start/End: Original strand, 30144982 - 30145040
Alignment:
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30144982 tcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtttttgt 30145040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 325
Target Start/End: Original strand, 5418303 - 5418360
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5418303 atttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 5418360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281171
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacca-cttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 33281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Original strand, 42187470 - 42187547
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187470 ggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558405
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 82  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttag 45558405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558611
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagtg-gataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 48736191 - 48736074
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||   ||||||||| ||||||| || |||   || || ||     
T  48736191 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttagg 48736092  T
Q  129 agagaagatcaaatggag 146  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48736091 agagtagatcaaatggag 48736074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523928
Alignment:
Q  252 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttgt 1523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525049
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttgt 20525049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44401253 - 44401164
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 284  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44401253 gagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtta--tcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 109
Target Start/End: Original strand, 16013295 - 16013358
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  16013295 cacctatagtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139265
Alignment:
Q  91 gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaaga 33139265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| | |||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926547
Alignment:
Q  225 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 296  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Original strand, 5335910 - 5335988
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  5335910 agagagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  276 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517426
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 275  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25579370 - 25579252
Alignment:
Q  29 agagagaatgggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||  |||||| | || |||||    
T  25579370 agagagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaag 25579271  T
Q  128 aagagaagatcaaatggag 146  Q
    ||||| |||| | ||||||    
T  25579270 aagagtagattagatggag 25579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 328
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021224
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 328  Q
    |||||||| |||||  || ||||| |||||||||| |  | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttgtcgtc 28021224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 324
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515456
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttgt 48515456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 324
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604832
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgt 4604832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 30200244 - 30200175
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||| | ||||||||    
T  30200244 gggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  247 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 104
Target Start/End: Original strand, 38920794 - 38920859
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||| | ||||||||||||    
T  38920794 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138948
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40149112 - 40149016
Alignment:
Q  221 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40149112 caatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 323
Target Start/End: Original strand, 41483714 - 41483771
Alignment:
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  41483714 tcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 36102045 - 36101977
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  36102045 ggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38921169 - 38921086
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag--ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||  |||| || |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  38921169 atggtttttgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47700108 - 47700053
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  47700108 atttgatccatgtagccgaccca-cttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 47700053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48735970 - 48735898
Alignment:
Q  252 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  48735970 agaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttgt 48735898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 137)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4001747 - 4001452
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4001747 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 4001648  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4001647 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagt 4001548  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4001547 tggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4001452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 696259 - 696554
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  696259 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 696358  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696359 agagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 696458  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacacta-tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  696459 ttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 696554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 1210735 - 1211030
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1210735 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 1210834  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1210835 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1210934  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1210935 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30202422 - 30202127
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30202422 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 30202323  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30202322 agagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 30202223  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30202222 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34792641 - 34792347
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34792641 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 34792542  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34792541 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 34792442  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34792441 tggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 34792347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 22090086 - 22090381
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22090086 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaaga 22090185  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    | || ||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22090186 aaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 22090285  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22090286 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 22090381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 49347685 - 49347393
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49347685 agagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 49347586  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49347585 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 49347486  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49347485 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 8671899 - 8672203
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8671899 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgcc 8671998  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8671999 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagg 8672098  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8672099 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgtt 8672198  T
Q  320 gttgt 324  Q
    |||||    
T  8672199 gttgt 8672203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38807963 - 38807668
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38807963 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaaga 38807864  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||| || |||||| |||  ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38807863 agagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagt 38807764  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38807763 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38807668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 15085924 - 15086207
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15085924 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 15086023  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15086024 agagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagt 15086111  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15086112 tggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 9592724 - 9593018
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9592724 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 9592823  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9592824 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagt 9592923  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||  |||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9592924 tagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 9593018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 51602037 - 51602341
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  51602037 gacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtc 51602136  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  51602137 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagagg 51602236  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51602237 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 51602336  T
Q  320 gttgt 324  Q
    |||||    
T  51602337 gttgt 51602341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029407
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 4029407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 57 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979228
Alignment:
Q  57 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 156  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  157 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 256  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  257 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25979228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32083037 - 32082753
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32083037 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 32082938  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32082937 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagt 32082850  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca-tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  32082849 tggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttgt 32082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 297
Target Start/End: Original strand, 8391762 - 8392030
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8391762 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 8391861  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||||||| || |||  || |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8391862 agagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagt 8391961  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 297  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8391962 tggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 51441057 - 51440764
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  51441057 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaaga 51440958  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||| ||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51440957 agagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagt 51440858  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51440857 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 121 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311752
Alignment:
Q  121 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 220  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  221 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  321 ttgt 324  Q
    ||||    
T  37311755 ttgt 37311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43240671 - 43240380
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  43240671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaaga 43240572  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43240571 agagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagt 43240472  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43240471 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 29 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 32231246 - 32230997
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||    
T  32231246 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataaga 32231147  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32231146 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 32231047  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    | ||||||||  |||| | |||||||||||||||   | |||||||||||    
T  32231046 tggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 154 - 321
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921362
Alignment:
Q  154 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  254 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 324
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318413
Alignment:
Q  102 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 201  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  302 taatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttgt 39318413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 159 - 323
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415633
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | ||  |||||||||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttg 4415633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404525
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
     |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 39140509 - 39140794
Alignment:
Q  28 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| || ||| | |||||||||||||||||  || ||   || ||| |    
T  39140509 cagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacg 39140608  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| |||   ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  39140609 aagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattag 39140703  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39140704 ttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  69 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 168  Q
    |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||| |||||| |||||| |||   || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  169 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 268  Q
    ||||||||  ||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |   |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  203 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  303 aatgcttggttgttgttgt 321  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079176
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 37463174 - 37462878
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||| | |   || |||| ||||  |||||| ||    
T  37463174 gacaccattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgcc 37463078  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa-gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 218  Q
    || ||| |||||| |||||| |||||| |||  | | | |||| |||||||||||  | |||  ||||| ||  ||||||| || || || |||||||||    
T  37463077 gtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagag 37462978  T
Q  219 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37462977 gttaatgagtttgatc-aaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 37462879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707218
Alignment:
Q  203 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 302  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  303 aatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttgt 4707218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 286
Target Start/End: Original strand, 9509308 - 9509565
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| || |  | |||       
T  9509308 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtactt 9509407  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||| ||   |||||||    
T  9509408 agagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagt 9509507  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||||    
T  9509508 tagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544875
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||    |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||     ||||||| ||  |||||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagt 2544782  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | || | ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  2544783 tggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200303
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 300  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  301 ataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgttgt 10200303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 41560383 - 41560514
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  41560383 gagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 41560482  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41560483 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 211 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020264
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  311 gttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttgt 24020264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375596
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  307 cttggttgttgttgttg 323  Q
     ||||||||||||||||    
T  43375612 attggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431396
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || ||||  ||||  ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc-------aatgagttag 231  Q
    | |||||| | |  | | ||| |||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||| |        |||||||| |    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 48431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941774
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44941774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  253 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090691
Alignment:
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 28090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 232 - 321
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936745
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  |  ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  296 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgttgt 19936745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751769
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27848085 - 27847797
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||| | ||||     
T  27848085 ggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcag 27847986  T
Q  141 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaacc-atttgagaaaccattagaaaagat----ttagaggtcaatgagttagatcc 235  Q
    |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| ||  |||||   ||  ||||||| | ||  ||||||    |||||||| |||||||| | |      
T  27847985 atggaggagagtcagctcagaagaggtagaggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttg 27847886  T
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  27847885 aaatatggtttatgatggaacattatgccgtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgt 27847797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577536
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29577536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532614
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 206 - 323
Target Start/End: Original strand, 6025772 - 6025889
Alignment:
Q  206 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 305  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6025772 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataat 6025871  T
Q  306 gcttggttgttgttgttg 323  Q
     |||||||||| ||||||    
T  6025872 acttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533749
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  320 gt 321  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18469374 - 18469082
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||| ||    
T  18469374 agagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacga 18469275  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | |||| ||||||||||  | | | |||||||||||| |||||  ||  ||||  ||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18469274 agagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagt 18469175  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||   | ||||| | ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18469174 tggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129065
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat-ccatgtagccgatccaa 291  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | || |||| |||||||||||| || |    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccca 29129036  T
Q  292 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29129037 cttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796492
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 9599686 - 9599432
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||  | ||| || | ||| |||| | ||||    | |||  |    
T  9599686 agagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaa 9599587  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  9599586 agagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagt 9599487  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 283  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||  |||| | | ||||||||||||||||    
T  9599486 ttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444641
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  34444639 tgt 34444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 324
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585029
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 51585029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36340095 - 36339804
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||   || |||||     
T  36340095 agagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaagg 36339996  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
     | |  ||||| |||||| | | | || | |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  36339995 cgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagt 36339897  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||   ||| ||||||  ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36339896 tggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818853
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcac 3818885  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3818884 ttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 3818853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846846
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084260
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  6084258 tgt 6084260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 320
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  235 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715326
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274398
Alignment:
Q  223 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||| | | ||||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  323 gt 324  Q
    ||    
T  31274399 gt 31274398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36624012 - 36623884
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |    |||||||||||| ||| || ||    
T  36624012 gagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc-tgtaatgatccatgtagtcgaccctac 36623914  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36623913 ttagtgggataaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 323
Target Start/End: Original strand, 38869081 - 38869166
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  38869081 atatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661500
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114028
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgt 5114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438800
Alignment:
Q  208 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 307  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  308 ttggttgttgt 318  Q
    |||||||||||    
T  15438810 ttggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481795
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 50636278 - 50636366
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50636278 aaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttgt 50636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430417
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 37430417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  194 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 273  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4318900 - 4318842
Alignment:
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4318900 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4318842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520246
Alignment:
Q  96 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta--agaaaaccatttg 193  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||      ||| || || || |||||||||| |||||||  ||  | ||||| ||  |    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatca------gaaaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  194 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtag 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 324
Target Start/End: Original strand, 41165509 - 41165567
Alignment:
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41165509 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 41165567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 5338881 - 5338998
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||| || ||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |    
T  5338881 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataagg 5338980  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    || |||||||||||||||    
T  5338981 ctcggttgttgttgttgt 5338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762496
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 284  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||   | |||||||||||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 1704836 - 1704912
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1704836 tgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttgt 1704912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569068
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttgt 10569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 212 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  212 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  312 ttgtt 316  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 304
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 35828829 - 35828725
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||||||||| |    
T  35828829 gtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcata 35828730  T
Q  142 tggag 146  Q
    |||||    
T  35828729 tggag 35828725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 324
Target Start/End: Original strand, 52832170 - 52832330
Alignment:
Q  164 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 263  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  52832170 aggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatga 52832269  T
Q  264 catcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | | ||||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  52832270 cgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgttgttgt 52832330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2914175 - 2914120
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2914175 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2914120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11941700 - 11941577
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 300  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  | |||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||| ||  |  |||||||| |    
T  11941700 attagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtggg 11941601  T
Q  301 ataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  11941600 atacggcttggttgttgttgttgt 11941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416448
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 43423709 - 43423788
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  43423709 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16272903 - 16272818
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16272903 tatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgtaatcaatcc-acttagtgggataatgtctggatgttgttgttgtc 16272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758017
Alignment:
Q  274 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38758017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510831
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgttg 45510831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18793270 - 18793201
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  18793270 ggggtaggacttattgtagaaaagatggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   ||||||| || || ||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 252 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33560927 - 33560858
Alignment:
Q  252 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33560927 agaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4590585 - 4590533
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4590585 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7133355 - 7133299
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7133355 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 7133299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930308
Alignment:
Q  224 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||    |||| | ||||||||||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T
Q  324 t 324  Q
    |    
T  12930308 t 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13828009 - 13827929
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  13828009 agagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 26299297 - 26299353
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  26299297 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgt 26299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111986
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32111986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48801700 - 48801625
Alignment:
Q  234 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  48801700 ccaaatatggtttatgatagaacattac-acataatttgatccatgtagctgatcccacttagcgggaaaatgcttg 48801625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Original strand, 14224286 - 14224368
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  14224286 atggtttttgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637846
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagac 27637846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 309
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828562
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52633257 - 52633166
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 327  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | | |   ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  52633257 aaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgcttagtgggatggtgtttggttgttgttgttgtcgt 52633166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814291
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttgt 52814291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8676993 - 8676897
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt---tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  |   |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8676993 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 298
Target Start/End: Original strand, 28528556 - 28528614
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 298  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28528556 atggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 29577256 - 29577147
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  29577256 aaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggttat-gatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtg 29577158  T
Q  307 cttggttgttg 317  Q
    |||||||||||    
T  29577157 cttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Original strand, 37263331 - 37263397
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||   || ||| | |||||||||||||    
T  37263331 ggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 52073745 - 52073675
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52073745 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 10272260 - 10272329
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||    
T  10272260 gggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacc 10272329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11331332 - 11331247
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11331332 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11489353 - 11489268
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11489353 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 324
Target Start/End: Original strand, 22930645 - 22930678
Alignment:
Q  291 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22930645 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 22930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113456
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42539265 - 42539208
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42539265 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgttgttgtc 42539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 320
Target Start/End: Original strand, 44008806 - 44008859
Alignment:
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  44008806 catttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 321
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806949
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Original strand, 4380013 - 4380081
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||   |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4380013 ggggtagcaactatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338831
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  142 tggag 146  Q
    |||||    
T  5338827 tggag 5338831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8194773 - 8194721
Alignment:
Q  270 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8194773 ttgatctatgtagccggtcctactttgtatgataatgtttggttgttgttgtt 8194721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  273 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827746
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||  | || || ||| |||||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| |||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtaga 13827755  T
Q  137 tcaaatgga 145  Q
    ||| |||||    
T  13827754 tcatatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 105
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812591
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 255
Target Start/End: Original strand, 51812677 - 51812725
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 255  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51812677 aaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaa 51812725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 52292268 - 52292320
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||||| || | || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52292268 atttgatccatgtaaccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  209 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 38429874 - 38430168
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38429874 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaaga 38429973  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429974 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 38430073  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430074 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttgt 38430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 12734680 - 12734985
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12734680 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgcc 12734779  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg-tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 218  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12734780 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagag 12734879  T
Q  219 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12734880 gtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12734979  T
Q  319 tgttgt 324  Q
    ||||||    
T  12734980 tgttgt 12734985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834963
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggaggagtt--aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25834963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 3866062 - 3866357
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  3866062 agagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaaga 3866161  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3866162 agagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 3866261  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3866262 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 3866357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 40 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41197509 - 41197224
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41197509 gggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatca 41197410  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaaga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    ||||||| |||  |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  41197409 aatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaa 41197310  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41197309 tatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgt 41197224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45367908 - 45367622
Alignment:
Q  38 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  45367908 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagat 45367809  T
Q  138 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 237  Q
    ||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45367808 caaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaa 45367709  T
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  45367708 atatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgt 45367622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11992409 - 11992108
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11992409 gacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgcc 11992310  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  11992309 gttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagagg 11992210  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  11992209 tcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtt 11992110  T
Q  320 gt 321  Q
    ||    
T  11992109 gt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 29 - 325
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610874
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgtc 2610874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 39 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41763324 - 41763043
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  41763324 ggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatc 41763225  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41763224 aaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaa 41763126  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| |||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41763125 tatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38452977 - 38452686
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38452977 agagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 38452878  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    ||| | |||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38452877 agata-gatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38452779  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38452778 tggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3243954 - 3243654
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3243954 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgcc 3243855  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3243854 gtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagg 3243755  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3243754 tcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 3243655  T
Q  320 g 320  Q
    |    
T  3243654 g 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 328
Target Start/End: Original strand, 36183441 - 36183740
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36183441 agagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 36183540  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36183541 agagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagt 36183640  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 328  Q
    | ||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36183641 tggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgtcgtc 36183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Original strand, 8180770 - 8181060
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  8180770 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaaga 8180869  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8180870 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 8180969  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8180970 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 4807586 - 4807880
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  4807586 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaaga 4807684  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||||||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4807685 agagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagt 4807784  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||  ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4807785 tggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451645
Alignment:
Q  60 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 159  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  160 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 259  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  260 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 451645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18424669 - 18424378
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  18424669 agagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaaga 18424570  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||  ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||    
T  18424569 agattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagt 18424470  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18424469 ttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 93 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7326388 - 7326157
Alignment:
Q  93 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||  || |||||| |||     
T  7326388 catgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactatta 7326289  T
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  7326288 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccac 7326189  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7326188 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 324
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029872
Alignment:
Q  96 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 195  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca------tgtagccgatcc 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  290 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 39029872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 110 - 322
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508961
Alignment:
Q  110 cgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa 209  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  210 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  310 ggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 46 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  146 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg-gt 244  Q
    | |||  || |||||||||| |||| |||||   || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  245 ttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 55 - 295
Target Start/End: Original strand, 23997630 - 23997858
Alignment:
Q  55 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 154  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23997630 tagaaaatttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 23997729  T
Q  155 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 254  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23997730 ggttaaaagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaa 23997817  T
Q  255 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23997818 acactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 156 - 324
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643233
Alignment:
Q  156 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 255  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  256 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 35643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Original strand, 31959635 - 31959803
Alignment:
Q  153 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 252  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31959635 caggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  253 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306317
Alignment:
Q  197 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  297 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgttgt 30306317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635320
Alignment:
Q  219 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  319 tgttgt 324  Q
    ||||||    
T  3635325 tgttgt 3635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 324
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227474
Alignment:
Q  210 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  310 ggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||    
T  227460 ggttgttgttgttgt 227474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 159 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||| | |  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6238014 - 6237750
Alignment:
Q  60 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 159  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || || |    
T  6238014 aagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtca 6237915  T
Q  160 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 259  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6237914 aaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacact 6237815  T
Q  260 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||  || |||||||| || ||| ||| || ||||| ||  | || ||||  |||||||||||||    
T  6237814 atgggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttgt 6237750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 324
Target Start/End: Original strand, 12141544 - 12141829
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||| | || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  12141544 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | || ||| | |  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaa 12141743  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | || | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  12141744 tatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttgt 12141829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496151
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| || || |    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgttgt 9496151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996623
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccac 9996655  T
Q  293 ttagt---gtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9996654 ttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16097270 - 16097192
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtaga 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16097270 tgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328367
Alignment:
Q  200 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaag--gatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  300 gataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgttgt 38328367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 38434941 - 38435234
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga-tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  || ||| | |||||| |||||||||  |||||| |  | |||||    
T  38434941 agagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaag 38435040  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
     |||| |||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||| ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||| |    
T  38435041 gagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtg 38435140  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    || |||| |||| |||||| |||| ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38435141 ttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12882173 - 12882042
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | ||||||||||||||||| | |  ||    
T  12882173 gagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcac 12882074  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12882073 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751944
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   || ||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||| | |   |||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | || | ||| ||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |  |||||||  || || |||  ||||||||||||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgt 43751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 324
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025779
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15025779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573127
Alignment:
Q  163 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 262  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  263 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43573127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  307 cttggttgttgt 318  Q
    ||||||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 322
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||| |  |||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  296 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 320
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttaga----catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| |     |||| |||||||||||| | || |   || ||||| |||| |    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  135 gatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatc 234  Q
    ||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||||||| |||  ||||| |   ||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  235 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43238377 - 43238305
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  43238377 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531597
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 9531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437718
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||  |||| ||   |||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  137 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 236  Q
    | | ||||||  ||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| || |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||||| ||   |    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaa 44437806  T
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44437805 aacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44437718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520060
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474927
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670753
Alignment:
Q  251 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17670753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 322
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863517
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 322
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867849
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 322
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872750
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287706
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
      |||||||| ||||||| |  | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttgt 33287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35755376 - 35755242
Alignment:
Q  194 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga----gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc 289  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||||||| |||||| ||    
T  35755376 agaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccc 35755277  T
Q  290 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35755276 tacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 35755242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 319
Target Start/End: Original strand, 13149460 - 13149612
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    ||||||||||  || |||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  13149460 tagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacat 13149559  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  13149560 aatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  224 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 305
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545671
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  ||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcac 41545658  T
Q  293 ttagtgtgataat 305  Q
    ||| || ||||||    
T  41545659 ttaatgagataat 41545671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8197669 - 8197538
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8197669 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8197570  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8197569 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8197538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8202429 - 8202298
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8202429 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8202330  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8202329 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8202298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832383
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgt 43832383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12489940 - 12489799
Alignment:
Q  183 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||||||| |||||| || | || |||||| |||||||    
T  12489940 aaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtag 12489841  T
Q  283 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12489840 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12489799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429332
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 251 - 324
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626357
Alignment:
Q  251 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 318
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078008
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgag--ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |||||||||||| | ||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  305 tgcttggttgttgt 318  Q
     |||||||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 200 - 324
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219250
Alignment:
Q  200 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 299  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || || ||||      
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttg 6219225  T
Q  300 gataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6219226 gataaggcttggttgttattgttgt 6219250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 321
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag---aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334187
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9556650 - 9556366
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||    
T  9556650 ggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatc 9556552  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | |||||| | |  ||   ||  ||||| | ||||||| ||   ||||| ||  || |||| ||||  |||||| ||| | | |||||||| |||| | |    
T  9556551 agatggaggatagtcaaactactagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaaga 9556452  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| |||||||||| || |   | ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9556451 tatggtttatgatagaacattagggtgtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttgt 9556366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 324
Target Start/End: Original strand, 15015149 - 15015230
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  15015149 gtttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgt 15015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 317
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504502
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 319
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481439
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 3481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443907
Alignment:
Q  234 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 283  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 42543440 - 42543520
Alignment:
Q  244 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42543440 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42543520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 76
Target Start/End: Original strand, 227312 - 227359
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 76  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  227312 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatag 227359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4598854 - 4598775
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||| |||||||    
T  4598854 agagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549834
Alignment:
Q  241 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 42549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 324
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384754
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 25384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 321
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 624764 - 624687
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  624764 gtttttgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598569
Alignment:
Q  245 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 314  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 5759076 - 5758995
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5759076 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560803
Alignment:
Q  275 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 8560803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10516802 - 10516749
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10516802 atttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 328
Target Start/End: Original strand, 17581643 - 17581748
Alignment:
Q  223 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  323 gtcgtc 328  Q
    ||||||    
T  17581743 gtcgtc 17581748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12470978 - 12470894
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || |||| | ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12470978 atggtttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 12470894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775842
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgt 15775842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 23714542 - 23714474
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23714542 gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24102214 - 24102146
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  24102214 gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960210
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||| |||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 322
Target Start/End: Original strand, 32402667 - 32402783
Alignment:
Q  206 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 305  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||     
T  32402667 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T
Q  306 gcttggttgttgttgtt 322  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32402767 acttggctgttgttgtt 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 33393319 - 33393394
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33393319 tgatagaaca-tatgtcatagtttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttgt 33393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470124
Alignment:
Q  165 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 264  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  265 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg----cttggttgttgttgttgtcg 326  Q
     |  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggctctctcggttgttgttgttgtcg 37470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  223 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 3481134 - 3481248
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | |||     
T  3481134 agagggaattggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaagg 3481230  T
Q  129 agagaagatcaaatggag 146  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3481231 agagtagatcagatggag 3481248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Original strand, 14444899 - 14444954
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14444899 tttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14444954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887065
Alignment:
Q  247 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat-gcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4682291 - 4682253
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 245  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4682291 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14197279 - 14197205
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14197279 gatagagcattatgacatcgtttgattcatgtacccgacctcacttactggggtaatgcttggttgttgttgttg 14197205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33594354 - 33594272
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgat-ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33594354 atggttttggatagaacactatgatgtcgtttgactcatgtagtcgatccccacttaatgtgataaagctttgttgttgttgt 33594272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616910
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactat 36616910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 109
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860243
Alignment:
Q  31 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412764
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 82  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttag 11412764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 324
Target Start/End: Original strand, 14530532 - 14530565
Alignment:
Q  291 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14530532 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 14530565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 297
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225039
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 297  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 319
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  255 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 82
Target Start/End: Original strand, 786833 - 786873
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 82  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  786833 gtagcacctatagtagaaaagatggcagaaactagacttag 786873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720438
Alignment:
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 298  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 3720438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Original strand, 6218967 - 6219031
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||    
T  6218967 ggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 9078792 - 9078836
Alignment:
Q  254 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 298  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9078792 aacattatgacatcatatgatccatgtagccgagcccacttagtg 9078836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 9578995 - 9578915
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||| | |||||  ||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  9578995 agagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  52 tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 155)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 27450480 - 27450180
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27450480 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgcc 27450381  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27450380 gttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagagg 27450281  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27450280 tcaatgagttggatccaaatat-gattttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgtt 27450182  T
Q  320 gt 321  Q
    ||    
T  27450181 gt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 436219 - 436514
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  436219 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaaga 436318  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  436319 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagt 436418  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  436419 tgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 436514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 52569807 - 52569512
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52569807 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 52569708  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52569707 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 52569608  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52569607 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 52569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31960106 - 31959814
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31960106 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 31960007  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31960006 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 31959907  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31959906 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 48174385 - 48174090
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48174385 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 48174286  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48174285 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 48174186  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48174185 tggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 48622844 - 48622543
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  48622844 gacaccattagagagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgcc 48622745  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48622744 gtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagagg 48622645  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48622644 tcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 48622545  T
Q  320 gt 321  Q
    ||    
T  48622544 gt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 33191140 - 33190846
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33191140 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaaga 33191041  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    || | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33191040 agggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 33190941  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33190940 tgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttg 33190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 322
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  58 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 157  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  158 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  258 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Original strand, 56375280 - 56375573
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  56375280 agagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 56375379  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  56375380 agagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagt 56375479  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  56375480 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 4440843 - 4441138
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  4440843 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaaga 4440942  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4440943 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 4441042  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| || || ||||||||    
T  4441043 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgt 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 33227199 - 33227494
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33227199 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaaga 33227298  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33227299 agagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 33227398  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  33227399 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgt 33227494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1777295 - 1777016
Alignment:
Q  43 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  1777295 tagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 1777196  T
Q  143 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 242  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1777195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 1777096  T
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1777095 gtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 43433914 - 43434209
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43433914 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 43434013  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  43434014 agagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagt 43434113  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
      ||||||||| || | |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43434114 cggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Original strand, 53707786 - 53708079
Alignment:
Q  31 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 130  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53707786 agagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaag 53707885  T
Q  131 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 230  Q
    || | ||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  53707886 agtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 53707985  T
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  53707986 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 53708079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 37797842 - 37798136
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  37797842 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaaga 37797941  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37797942 agagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagaggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagt 37798040  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37798041 tgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgt 37798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39100836 - 39100533
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |     
T  39100836 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc- 39100738  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39100737 gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggagg 39100638  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| | | || | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39100637 tcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39100538  T
Q  320 gttgt 324  Q
    |||||    
T  39100537 gttgt 39100533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Original strand, 27983190 - 27983476
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27983190 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagg-------cttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaaga 27983282  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27983283 agagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaat 27983382  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27983383 tggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 23906587 - 23906297
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  23906587 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaaga 23906490  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||| ||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23906489 agagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 23906390  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23906389 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 324
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286724
Alignment:
Q  63 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 162  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  163 ga--------ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 254  Q
    ||        |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  255 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 8286724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037506
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatg-tagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaag 26037699  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26037698 aagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgag 26037599  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  26037598 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 46583116 - 46582823
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagaccc-gtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||    
T  46583116 agagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaag 46583019  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  46583018 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgag 46582919  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  46582918 ttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 46582823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 39708424 - 39708708
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  39708424 gagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaa 39708523  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39708524 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 39708623  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 314  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  39708624 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Original strand, 28236164 - 28236469
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |    
T  28236164 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtc 28236263  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || ||||||||||  |||||||||| | |||| || |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  28236264 gtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagagg 28236362  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28236363 tcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 28236462  T
Q  320 gttgtcg 326  Q
    |||||||    
T  28236463 gttgtcg 28236469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 318
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  31 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 130  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  131 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 230  Q
    || | ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 37773733 - 37773486
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  37773733 ggggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatc 37773634  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    |||||||  |||  ||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  37773633 aaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaga 37773534  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37773533 tttggtttatgatagaacactatgacataatttgatctatatagccga 37773486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 47265494 - 47265193
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac-------ccgtagataccgt 121  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||       |||||||| ||||    
T  47265494 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgt 47265395  T
Q  122 tgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 221  Q
     |||||||||| |||  |||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47265394 cgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtc 47265295  T
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  47265294 aatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T
Q  322 tg 323  Q
    ||    
T  47265194 tg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528573
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 21528573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 295
Target Start/End: Original strand, 50286970 - 50287217
Alignment:
Q  47 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  50286970 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggag 50287069  T
Q  147 aagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 246  Q
     |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || | |    
T  50287070 gagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgt 50287169  T
Q  247 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
     |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50287170 atgatagaacactatg-ggccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 134 - 324
Target Start/End: Original strand, 21236953 - 21237143
Alignment:
Q  134 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 233  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21236953 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 21237052  T
Q  234 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21237053 ccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgt 21237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957883
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 6957883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 318
Target Start/End: Original strand, 1793459 - 1793741
Alignment:
Q  38 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||  ||| ||||||| || ||||    
T  1793459 gggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagat 1793558  T
Q  138 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatta----gaaaagatttagaggtcaatgagttagat 233  Q
    || |||||| ||    |  | ||||||||||||| |||| ||   ||||| ||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1793559 cagatggaggagtcgta--tcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat 1793656  T
Q  234 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1793657 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494948
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12494948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 157 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  157 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 256  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  257 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20591591 - 20591353
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  20591591 gagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaa 20591493  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| | |||| |||||| |||  || ||    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20591492 gagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 20591397  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 274  Q
     ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20591396 ggattcaaatatgg-ttatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Original strand, 51421730 - 51422013
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||| |||||||||  || || |||||||||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||| ||||||   ||  || |||||| |||||    
T  51421730 ggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatc 51421829  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    ||||||||      ||| | ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51421830 aaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaa 51421929  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51421930 aatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 316
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 316  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 271
Target Start/End: Original strand, 50679588 - 50679736
Alignment:
Q  123 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 222  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50679588 gtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 50679687  T
Q  223 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 271  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  50679688 atgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20601917 - 20601669
Alignment:
Q  50 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||    
T  20601917 tatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggag 20601818  T
Q  150 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 249  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  20601817 agtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatg 20601724  T
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||| | || || |||||||| |||||    
T  20601723 atagaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41009641 - 41009414
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggt-agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  || ||| | || ||||||    
T  41009641 gagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaaga 41009542  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    | |  |||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||     
T  41009541 aaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgaga 41009443  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009442 tggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 320
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  157 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 256  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  257 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45205131 - 45204837
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt--agatgatttagacatgtagagagaagacccgtag-------ataccgttgtaag 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||   || |||||||||||||| ||||       ||   |||||| |    
T  45205131 tgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacg 45205032  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | || | ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  45205031 aagagtagatcagatggaggagagc-agatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataag 45204933  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| || | | | |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45204932 ttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45204837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821001
Alignment:
Q  73 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 172  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || || |||| | |||||| |||| ||| | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  173 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata----gaacactatgacatca 268  Q
    |||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    |||||||||  ||| |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttgt 20821001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 211 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154860
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  311 gttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttgt 19154860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 216 - 324
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969466
Alignment:
Q  216 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  316 tgttgttgt 324  Q
    |||||||||    
T  19969458 tgttgttgt 19969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 16002933 - 16003165
Alignment:
Q  45 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 144  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||| ||||    
T  16002933 gcacctatggtataaaagttgatagaaaatagtcttagatggttga-acatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatgg 16003031  T
Q  145 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 244  Q
    |  | |   | || ||||||  |||||||| | |  | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  16003032 atgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 16003131  T
Q  245 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  16003132 ttatgataaaacactatgacgtaatttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 324
Target Start/End: Original strand, 35690391 - 35690556
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  35690391 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacat 35690490  T
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35690491 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgt 35690556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008031
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgttgt 55008031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550455
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||| || || ||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccac 28550484  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28550483 ttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043357
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||| || || ||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccac 31043325  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  31043326 ttagtgcaataaagcttagttattgttgttgt 31043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 322
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  97 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 196  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||  ||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  197 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 296  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  297 tgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883357
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttgt 883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1211683 - 1211389
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga--cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |  |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||  || |||||    
T  1211683 gagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaag 1211584  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||  || || ||| ||  || |||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1211583 aagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaaaaatt-agaggtcaatgag 1211485  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat-catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || |||||  || |||||| | ||||||||||| | | |  ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  1211484 ttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgt 1211389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31961394 - 31961263
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||    
T  31961394 gagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcac 31961295  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961294 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31961263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061932
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 19061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939733
Alignment:
Q  246 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  160 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 246  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 53518483 - 53518325
Alignment:
Q  161 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 260  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||| ||  || |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  53518483 aagaggtagaggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacacta 53518384  T
Q  261 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    || | | |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||   || |||||||||||    
T  53518383 tggcgtaatttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589357
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||  | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  2589355 tgt 2589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Original strand, 12494740 - 12494794
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12494740 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575109
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||   | |||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25575092 cttggttgttgttgttgt 25575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 56225236 - 56225353
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  56225236 aaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataagg 56225335  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
     | |||||||||||||||    
T  56225336 atcggttgttgttgttgt 56225353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805262
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgt 13805262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459279
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |   | |||||||||||| |||| || |||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  296 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 31459279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208266
Alignment:
Q  212 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||| ||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  312 ttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttgt 34208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633403
Alignment:
Q  245 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Original strand, 41192826 - 41192913
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192826 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238612
Alignment:
Q  257 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238698
Alignment:
Q  257 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 318
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024846
Alignment:
Q  183 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| ||||   | |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  283 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgctgtc 26024846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 35555928 - 35555859
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  35555928 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37042792 - 37042667
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| || ||    
T  37042792 gagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgac 37042693  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37042692 ttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869876
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 50869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958236
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttgt 6958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066496
Alignment:
Q  244 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7066496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634103
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30634103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438730
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51438730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388213
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||   | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  307 cttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||||||    
T  55388225 cttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 37488245 - 37488376
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||   || ||    
T  37488245 gagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccac 37488344  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37488345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 37488376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047553
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  44047640 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45209257 - 45209202
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45209257 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 321
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 54470197 - 54470276
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  54470197 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306581
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||| ||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  5306579 tgt 5306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 107
Target Start/End: Original strand, 31459032 - 31459098
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  31459032 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 321
Target Start/End: Original strand, 46372024 - 46372306
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| || |||   ||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||| |||||    
T  46372024 ggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatc 46372123  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | || |||  || |||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |    
T  46372124 agatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaaga 46372223  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
     |||||||||||||||||||  |  | || |||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  46372224 catggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 162 - 324
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540575
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttgt 53540575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153993
Alignment:
Q  271 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 46153993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328611
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 29399001 - 29399089
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29399001 aaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 29399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35622757 - 35622673
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35622757 atggtttttgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 35622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42285784 - 42285700
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| | || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  42285784 atggtttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttgt 42285700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 322
Target Start/End: Original strand, 44360289 - 44360369
Alignment:
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  44360289 ggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 325
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130456
Alignment:
Q  273 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 56130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 41192229 - 41192344
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||| |||| | || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||| |    
T  41192229 aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataagg 41192328  T
Q  307 cttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  41192329 cttggttgttgttgtt 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44719413 - 44719358
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44719413 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 44719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  163 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 250  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Original strand, 2588991 - 2589056
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2588991 ggggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Original strand, 15665330 - 15665384
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15665330 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 108
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729509
Alignment:
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 262  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 41729509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285882
Alignment:
Q  49 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| || ||| | || || ||||||| ||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatca 42285882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42293416 - 42293262
Alignment:
Q  170 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 269  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||  | ||||||| | ||||||| || || || |||||    
T  42293416 aggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcat 42293317  T
Q  270 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||| |||||||||  || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  42293316 ttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgt 42293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 324
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935434
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttgt 54935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 320
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 31897509 - 31897428
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31897509 atggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879106
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttgt 4879106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15661925 - 15661869
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  15661925 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgt 15661869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105515
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  20105603 aaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgt 20105515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30621486 - 30621418
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  30621486 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339844
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32339844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34233123 - 34233031
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 314  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||    
T  34233123 aatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009283
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 42639301 - 42639233
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  42639301 gggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 316
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 316  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 319
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 319
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 238 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799657
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Original strand, 44360077 - 44360155
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  44360077 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 51252753 - 51252674
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || | | | ||||||||||||||||    
T  51252753 agagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 10209034 - 10209104
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| || ||| | ||||||| |||||||||    
T  10209034 ggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaacttagttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 17900480 - 17900550
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  || ||| | || ||||||||||||||    
T  17900480 ggggtagcacctatagtagaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 107
Target Start/End: Original strand, 33709914 - 33709992
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  33709914 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 283
Target Start/End: Original strand, 36198977 - 36199059
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 283  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  36198977 attagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 143
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680844
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta-gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 143  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatg 50680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 50967081 - 50967027
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  50967081 atttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 55768783 - 55768717
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55768783 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 55833039 - 55832973
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55833039 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3601449 - 3601416
Alignment:
Q  291 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3601449 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284421
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Original strand, 10209237 - 10209319
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10209237 atggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttgt 10209319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10775550 - 10775468
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10775550 atggtttttgatagaacact--gacattgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 10775468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 262
Target Start/End: Original strand, 26510558 - 26510611
Alignment:
Q  209 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 262  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510558 agatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497596
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || |||||     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  129 agagaagatcaaatggag 146  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  28497579 agagtagatcagatggag 28497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36557321 - 36557268
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 82  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557321 agagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag 36557268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7544584 - 7544528
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  7544584 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgtcgttattgt 7544528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 283
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486165
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 283  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30621329 - 30621241
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||    
T  30621329 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 30662106 - 30662042
Alignment:
Q  258 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30662106 ctatgacatcatttaatccaagtggctgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 30662042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35555731 - 35555647
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  35555731 atggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttgt 35555647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 36556841 - 36556757
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  36556841 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 36556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40932997 - 40932921
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40932997 tgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttgt 40932921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45184214 - 45184130
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  45184214 atggtttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgttattgt 45184130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 105
Target Start/End: Original strand, 45423617 - 45423681
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 105  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  || ||| |||||||||| ||||    
T  45423617 ggtagcacctataatagaaaagatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 46236719 - 46236771
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  46236719 tttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963735
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttgt 54963735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 303
Target Start/End: Original strand, 55579200 - 55579295
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 303  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||  ||| | ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  55579200 aaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42854296 - 42854001
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42854296 agagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 42854197  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854196 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 42854097  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  42854096 tggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgt 42854001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 36545139 - 36545434
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36545139 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 36545238  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| | |  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36545239 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 36545338  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36545339 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 36545434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11524016 - 11523720
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11524016 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaag 11523917  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11523916 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 11523817  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11523816 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11523720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 40813314 - 40813609
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  40813314 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaaga 40813413  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40813414 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagt 40813513  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40813514 tggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgt 40813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36565533 - 36565239
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  36565533 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaaga 36565434  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    || | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36565433 agggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 36565334  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36565333 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 36565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 41 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  141 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 240  Q
    ||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  241 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 20 - 318
Target Start/End: Original strand, 8932683 - 8932982
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt-agatac 118  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | || |    
T  8932683 gacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaaatgc 8932782  T
Q  119 cgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 218  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8932783 cattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttaaag 8932882  T
Q  219 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    || |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  8932883 gttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagcttggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 113 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469724
Alignment:
Q  113 agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagat 212  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  213 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  313 tgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttgt 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36395242 - 36394949
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  36395242 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaag 36395143  T
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36395142 aagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgag 36395043  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacacta---tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||   || |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36395042 ttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcat--tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Original strand, 18125154 - 18125454
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18125154 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgcc 18125253  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || ||||||| || ||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  18125254 gtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaag 18125352  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||   | |||||||| |||||| | | || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18125353 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgtt 18125451  T
Q  320 gtt 322  Q
    |||    
T  18125452 gtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 273
Target Start/End: Original strand, 39946855 - 39947091
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  39946855 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtaga 39946954  T
Q  137 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 236  Q
    |||||||||| |||  || |||| ||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39946955 tcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatcca 39947054  T
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 273  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  39947055 aatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 70 - 324
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121430
Alignment:
Q  70 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 169  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  170 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 269  Q
    ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  270 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21121377 ttgat-catgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 21121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 304
Target Start/End: Original strand, 2796547 - 2796818
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    | |||||| || ||||||||    
T  2796547 agagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaaga 2796642  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2796643 agagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagt 2796742  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  2796743 tgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742079
Alignment:
Q  166 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 265  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |     
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  266 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14742079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  59 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  259 tatgacatcatttgatccat 278  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 324
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027815
Alignment:
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2027815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 324
Target Start/End: Original strand, 37077768 - 37078034
Alignment:
Q  54 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  37077768 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 37077865  T
Q  154 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 253  Q
     ||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    |||||    
T  37077866 gggtcaaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatag 37077965  T
Q  254 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||  |||| | |||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  37077966 aacac--tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttgt 37078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 8879732 - 8879446
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    | |||| ||||||    
T  8879732 agagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaaga 8879637  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    ||||  ||||| |||||| ||   | |||  |||||| | |||| |||  || |||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  8879636 agagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagt 8879537  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  8879536 tgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 97 - 317
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  97 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 196  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||             
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaac--------- 12025937  T
Q  197 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga---catcatttgatccatgtagccgatccaact 293  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025938 ---cattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  294 tagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    |||||  |||| | ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 321
Target Start/End: Original strand, 45419218 - 45419517
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||  |     
T  45419218 gacaccattagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc- 45419316  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
     | ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| |   |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |      
T  45419317 -tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatc 45419415  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
      |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45419416 ataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 45419515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215409
Alignment:
Q  200 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||      
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  300 gataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgttgt 15215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473402
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 321
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529507
Alignment:
Q  209 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 308  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  309 tggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||    
T  44529495 tggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18752176 - 18751996
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||    
T  18752176 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag-cttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgcc 18752078  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 201  Q
    ||||| | |||||  ||||||||||| || |   || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||    
T  18752077 gttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047529
Alignment:
Q  212 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  312 ttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgt 44047529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25289045
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||    
T  25289018 ctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300380
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
     |||||  | || ||||||| |||||||    
T  25300353 ctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490620
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||||||||||||    
T  490603 cttgtttgttgttgttgt 490620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 29520803 - 29520931
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |     
T  29520803 gagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccat 29520902  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520903 ttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35643765 - 35643605
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  35643765 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacact-- 35643668  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643667 gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 35643605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041315
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 30559847 - 30559983
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta-----gccgat 287  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     |||||     
T  30559847 gagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgac 30559946  T
Q  288 ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30559947 cccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 324
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931245
Alignment:
Q  48 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||| |||| | |  ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||     
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  148 agaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt 247  Q
    | |  ||  | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | ||||||||| |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgt 32931245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 12796980 - 12796894
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  12796980 ggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagactcgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 321
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
        | ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6510707 - 6510617
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagag 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  6510707 gtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagag 6510617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39967551 - 39967497
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39967551 tttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 39953556 - 39953263
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||  | |||   || |||||     
T  39953556 agagagagttgggatagcacctatatgagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaagg 39953457  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||| ||| ||  ||| ||| | |  |||||||| || ||| ||| |||||| |   ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||    
T  39953456 agagtagatcagatgaaggcgaatcagatcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagt 39953357  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||   ||| |||||||||||| | ||||||||   |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39953356 tagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584643
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||      
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42584626 cttgattgttgttgttgt 42584643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga---cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||     ||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||  |||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | |||||| | |  ||  ||| |||||||| ||||||| |||  || || ||  |||||||  |||  | |||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556299
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgt 27556299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 327
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690023
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 327  Q
    |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttgtcgt 30690023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914601
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  || | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031417
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031523
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255528
Alignment:
Q  232 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 8255528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 324
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169676
Alignment:
Q  161 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 260  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  261 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||   | |||| |||||| || || | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtg-gataaggcttggttgatgttgttgt 28169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928585
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668495
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10668495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425331
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||  |    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatgg 21425313  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21425314 cttggttattgttgttgt 21425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 323
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492318
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T
Q  322 tg 323  Q
    ||    
T  23492317 tg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 242 - 327
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042486
Alignment:
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgt 36042486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459177
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaa 291  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||  || |    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccca 14459148  T
Q  292 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  14459149 ctttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 324
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716107
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgct 308  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||| |||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  309 tggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgt 31716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 32043580 - 32043872
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| || |||   || |||||     
T  32043580 agagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaaactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaagg 32043679  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||  |||||| ||||||  |   ||  | |  |||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |  || ||| || || |||||||||    
T  32043680 agaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagt 32043779  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||   | | ||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32043780 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtttgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 32043872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276970
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 32276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569707
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 32569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 320
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812814
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7531725 - 7531641
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7531725 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttcttgt 7531641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611779
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Original strand, 25985500 - 25985560
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 80  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25985500 gacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 25985560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 259 - 323
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324057
Alignment:
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35324057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362651
Alignment:
Q  168 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 267  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||| | |     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  35362703 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41444456 - 41444336
Alignment:
Q  204 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 303  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || | |||||| |||||||||| | || ||||| ||  |||    
T  41444456 agaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaata 41444357  T
Q  304 atgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41444356 atgcttggtcgttgttgttgt 41444336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 323
Target Start/End: Original strand, 43733410 - 43733490
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  43733410 gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776434
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824187
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgttg 10824187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 315
Target Start/End: Original strand, 16351578 - 16351653
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 315  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  16351578 atggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 321
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363768
Alignment:
Q  206 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 305  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    | ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||     
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  306 gcttggttgttgttgt 321  Q
     |||||||||||||||    
T  26363753 acttggttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30198365 - 30198262
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | ||||   |  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30198365 aatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T
Q  322 tgtc 325  Q
    ||||    
T  30198265 tgtc 30198262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 324
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065005
Alignment:
Q  274 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985839
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta 25985839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 317
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 242 - 325
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212149
Alignment:
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta--gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttgtc 41212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518400
Alignment:
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Original strand, 9695631 - 9695708
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  9695631 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921504
Alignment:
Q  271 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 16921504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646930
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 146
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143472
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||  ||||| | || ||| | |||| |||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaa 36143466  T
Q  141 atggag 146  Q
    ||||||    
T  36143467 atggag 36143472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901815
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttgtc 38901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 95
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103326
Alignment:
Q  43 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttaggtgttttagacat 7103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 324
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978159
Alignment:
Q  280 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 208 - 319
Target Start/End: Original strand, 16917352 - 16917462
Alignment:
Q  208 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 307  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||  |    
T  16917352 aagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagac 16917450  T
Q  308 ttggttgttgtt 319  Q
    |||||| |||||    
T  16917451 ttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 244
Target Start/End: Original strand, 25439479 - 25439530
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 244  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25439479 gagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  168 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 267  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |||||| || || | |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||| | |     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaactta 295  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39651081 - 39651026
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39651081 atttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 1313773 - 1313843
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| |||| | | |||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313773 tgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11130004 - 11129951
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11130004 tttgatccatgtagccta-ccaacttaatgagataatacttggttgttgttgttg 11129951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgat--agaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 81
Target Start/End: Original strand, 13986494 - 13986536
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13986494 ggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 14903744 - 14903846
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  | || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14903744 aatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  14903844 tgt 14903846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  211 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 310  Q
    |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| | || ||||| ||  ||||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  311 gttgttgttg 320  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||| ||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 270 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  270 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 4955345 - 4955473
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||| ||| | ||| |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||  ||    
T  4955345 gagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtagtcgatctcac 4955444  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4955445 ttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985975
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 12985975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30456377 - 30456329
Alignment:
Q  238 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  30456377 atattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 30456488 - 30456452
Alignment:
Q  45 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 81  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30456488 gcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactta 30456452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783077
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattat 30783102  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||    
T  30783101 gaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085134
Alignment:
Q  272 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttgt 35085134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982893
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40982893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42493514 - 42493426
Alignment:
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| | || | |||||  || || |||||||||||| |||||||    
T  42493514 aatatggtatttaatagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttgtc 42493426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44681319 - 44681251
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  44681319 ggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 45512654 - 45512558
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaaca 257  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45512654 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 45512777 - 45512709
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||| ||| | ||| || ||||||||    
T  45512777 ggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 5258440 - 5258145
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258440 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaaga 5258341  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5258340 agagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagc 5258241  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5258240 tagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgt 5258145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 28085366 - 28085661
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  28085366 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaaga 28085465  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28085466 agagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 28085565  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28085566 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 318
Target Start/End: Original strand, 30031254 - 30031535
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  30031254 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtaga 30031353  T
Q  137 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 236  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  30031354 tcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattta 30031453  T
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30031454 aatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 32755911 - 32756206
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||  |||  |||||    
T  32755911 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataaga 32756010  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756011 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 32756110  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    
T  32756111 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttgt 32756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 29 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21352129 - 21351872
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||    
T  21352129 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttaga 21352030  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21352029 agaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 21351930  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  21351929 tggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 40 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 35043722 - 35043441
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  35043722 gggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatca 35043623  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
    ||||||  |||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35043622 aatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaat 35043523  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  35043522 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Original strand, 608138 - 608442
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  608138 gacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcc 608237  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaa----gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagattta 215  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  608238 tttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagattta 608337  T
Q  216 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 315  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||    
T  608338 gagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgt 608437  T
Q  316 tgttg 320  Q
    |||||    
T  608438 tgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 281
Target Start/End: Original strand, 5631812 - 5632064
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  5631812 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaaga 5631911  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    | || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||  | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631912 atagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 5632011  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5632012 tggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 9706766 - 9707052
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||      ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  9706766 agagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt------gtagagagaagacccatagaagccgttgttaga 9706859  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  9706860 agagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagt 9706959  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9706960 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 20427928 - 20427633
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20427928 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 20427829  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| | ||||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20427828 agagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagt 20427730  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg-cttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20427729 tggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgt 20427633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 324
Target Start/End: Original strand, 12890575 - 12890860
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||         ||| ||||| |||| |||||||    
T  12890575 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------cccatagatgccgtcgtaagaa 12890665  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| |||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12890666 gagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagtt 12890765  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12890766 agatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12890860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 37 - 324
Target Start/End: Original strand, 14030805 - 14031080
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||    
T  14030805 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtaga 14030904  T
Q  137 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 236  Q
    |||||| | | |||  | | |||||||||||||||||||| ||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14030905 tcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatcca 14030992  T
Q  237 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14030993 aatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 14031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 323
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  50 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  150 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 249  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||          || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 20 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10100160 - 10099993
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10100160 gacaccattagagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgcc 10100061  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100060 gttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 10099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143762
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 162 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156378
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 41 - 278
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  140 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33497062 aatgaaggagt--caagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206456
Alignment:
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  302 taatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgt 3206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9593988 - 9593709
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||    
T  9593988 ggggtagcaccattagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatc 9593889  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | |||||| |||  ||  |   |||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||    
T  9593888 agatggaggagagtcaaat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaa 9593791  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9593790 tatggtttatgatagaacattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 324
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819116
Alignment:
Q  212 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  312 ttgttgttgttgt 324  Q
    |||| ||||||||    
T  31819104 ttgtggttgttgt 31819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934830
Alignment:
Q  210 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 309  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  310 ggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||    
T  34934841 ggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  104 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 203  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  204 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
      |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Original strand, 7133800 - 7133923
Alignment:
Q  93 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7133800 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7133899  T
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7133900 gagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 216
Target Start/End: Original strand, 7136723 - 7136846
Alignment:
Q  93 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7136723 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7136822  T
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttag 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7136823 gagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 321
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  45 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 144  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  145 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 244  Q
    || |||  || || |||||||||      ||| |||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  245 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    || | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 321
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  161 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 260  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |   |||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  261 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 240 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789071
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 30789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28027108 - 28026896
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| || ||| |||||| | || ||| |||||| | |||    
T  28027108 ggggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatc 28027010  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    | |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  || ||||    
T  28027009 agatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaa 28026910  T
Q  239 tatggtttttgata 252  Q
    |||||||| |||||    
T  28026909 tatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098893
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| || ||    
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgttgt 10098893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34502
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | | | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 34502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245869
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgt 4245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 323
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 300  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  301 ataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 321
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818813
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 31818784  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||    
T  31818785 ttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 286
Target Start/End: Original strand, 24665965 - 24666058
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24665965 gagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6055933 - 6055806
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||     
T  6055933 aaaaaaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 6055834  T
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||    
T  6055833 tacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 319
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  200 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 299  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  | | |||||  ||| |||||||| || ||||||||     
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  300 gataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119642
Alignment:
Q  235 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615223
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 116
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  47 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 579615 - 579703
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| |||  ||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  579615 aaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 109
Target Start/End: Original strand, 33084048 - 33084128
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  33084048 agagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12133973 - 12133901
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12133973 atagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgtt 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9109582 - 9109507
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9109582 tgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttg 9109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6293491 - 6293389
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||| || | |||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  6293491 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgt 6293392  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  6293391 tgt 6293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 280  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 318
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 324
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39056
Alignment:
Q  244 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 39056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 322
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||  | ||| |||| ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 40 - 107
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Original strand, 5080853 - 5080888
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 72  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5080853 tgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 270 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6906878 - 6906819
Alignment:
Q  270 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  6906878 ttgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataagactttgatgttgttgtcgtcgtct 6906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 318
Target Start/End: Original strand, 21089606 - 21089676
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21089606 tgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3127306 - 3127273
Alignment:
Q  291 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3127306 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4878327 - 4878294
Alignment:
Q  291 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4878327 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 4878294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 6641691 - 6641650
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 80  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6641691 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 6641650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 102  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 324
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568983
Alignment:
Q  224 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| | | ||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 14389447 - 14389380
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14389447 ggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaa-acttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 30642998 - 30643054
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  30642998 atttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttgt 30643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 29 - 314
Target Start/End: Original strand, 38684957 - 38685242
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38684957 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 38685056  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38685057 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38685156  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 314  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  38685157 tggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 3301834 - 3302126
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3301834 agagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 3301933  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3301934 agaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagt 3302033  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3302034 tggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 4496374 - 4496669
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4496374 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4496473  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4496474 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 4496573  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4496574 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4496669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16347670 - 16347380
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  16347670 agagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaaga 16347571  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16347570 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatt 16347471  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16347470 tggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12492679 - 12492381
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcaccta---tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgta 125  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  12492679 agagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgtta 12492580  T
Q  126 agaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatg 225  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12492579 agaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatg 12492480  T
Q  226 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12492479 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28977160 - 28976856
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||    
T  28977160 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgcc 28977061  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || |||||||| | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28977060 gtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagg 28976961  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28976960 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 28976861  T
Q  320 gttgt 324  Q
    |||||    
T  28976860 gttgt 28976856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 1287871 - 1287578
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  1287871 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaaga 1287772  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1287771 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1287672  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    | ||||||||| |||| | |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  1287671 tggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 29 - 322
Target Start/End: Original strand, 24178500 - 24178793
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24178500 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 24178599  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24178600 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagt 24178699  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    | ||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24178700 tggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 14665704 - 14665997
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14665704 agagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 14665803  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  14665804 agagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagt 14665903  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665904 tggatccaaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14665997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 42 - 320
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  142 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 241  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  242 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    | | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 49 - 324
Target Start/End: Original strand, 10639314 - 10639587
Alignment:
Q  49 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  10639314 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggagga 10639413  T
Q  149 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 248  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  10639414 gt--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 10639511  T
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10639512 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 10639587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 2075766 - 2075475
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2075766 agagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 2075667  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgag 227  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2075666 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgag 2075567  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2075566 ttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 324
Target Start/End: Original strand, 1275264 - 1275549
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||    
T  1275264 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatc 1275363  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    |||||||| |||  || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  1275364 aaatggaggagagtcaagttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaa 1275463  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  1275464 tttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttgt 1275549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561384
Alignment:
Q  128 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 13561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915493
Alignment:
Q  97 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 196  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  197 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  297 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgt 2915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 323
Target Start/End: Original strand, 34273017 - 34273297
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||    
T  34273017 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaaga 34273116  T
Q  129 agagaaga-tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 227  Q
    |||| ||| ||||               ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34273117 agaggagagtcaa---------------gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 34273201  T
Q  228 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  34273202 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 134 - 324
Target Start/End: Original strand, 14911267 - 14911457
Alignment:
Q  134 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 233  Q
    |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14911267 agatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggat 14911366  T
Q  234 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  14911367 ccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgttcttgt 14911457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 324
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816667
Alignment:
Q  170 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 269  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  270 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29816667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26884979 - 26884686
Alignment:
Q  31 agagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||   || |||||||    
T  26884979 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaa 26884880  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| |||||| |||||| |||  | ||| ||||||||||||||| || ||| |||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  26884879 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggatgagctaggaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtc 26884782  T
Q  230 agatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  26884781 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgt 26884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 183 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  183 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 282  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  283 ccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 322
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  212 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  312 ttgttgttgtt 322  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 324
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393161
Alignment:
Q  200 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  300 gataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgttgt 2393161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 274
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749542
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||     
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaagg 14749396  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||  ||  | |  | ||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| || |  || ||| ||||| | || ||||    
T  14749397 agagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagt 14749496  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 274  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14749497 tggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 324
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213860
Alignment:
Q  219 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  319 tgttgt 324  Q
    ||||||    
T  30213855 tgttgt 30213860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 28002 - 28165
Alignment:
Q  159 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 258  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28002 aaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacac 28101  T
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || || | |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  28102 tatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  79 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 178  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| | || ||||| |    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  179 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    || || ||| ||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    | || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  279 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 281
Target Start/End: Original strand, 36215489 - 36215730
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 129  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| | || ||||| |||| || |||| ||  ||||| |||||    
T  36215489 gagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaa 36215588  T
Q  130 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 229  Q
    ||| |||||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||          |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  36215589 gagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag----------gaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaatt 36215678  T
Q  230 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 281  Q
      ||||||| |||  || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  36215679 gaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276523
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 28276523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 18855799 - 18855890
Alignment:
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18855799 gatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 324
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041041
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  301 ataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgtagttgt 39041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418031
Alignment:
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 301  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  302 taatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||  |||||  ||||||||||||    
T  418053 tatggcttgaatgttgttgttgt 418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442123
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  32442125 tgt 32442123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 20 - 290
Target Start/End: Original strand, 32516537 - 32516806
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| | || ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| ||| || ||  |||||| |     
T  32516537 gacaacattagagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattct 32516636  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || ||| | |||| |||||  ||| || | || ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||  ||||||||||     
T  32516637 gtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagaga 32516735  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca 290  Q
    | ||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  32516736 ttaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatcgatataaccgatcca 32516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 31636202 - 31636129
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31636202 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 31636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 33667216 - 33667286
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  33667216 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 43557947 - 43557833
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  43557947 aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagg 43557848  T
Q  307 cttggttgttgttgt 321  Q
    | |||||||||||||    
T  43557847 cctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 250 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408492
Alignment:
Q  250 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 14667939 - 14668056
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||      
T  14667939 aaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaga 14668038  T
Q  307 cttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14668039 cttggttgtagttgttgt 14668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 309
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235316
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccac 9235299  T
Q  293 ttagtgtgataatgctt 309  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9235300 ttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 323
Target Start/End: Original strand, 11675683 - 11675814
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 291  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| || |    
T  11675683 gagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccca 11675782  T
Q  292 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11675783 cttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 321
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 301  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  302 taatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 324
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367178
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T
Q  322 tgt 324  Q
    |||    
T  20367176 tgt 20367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79620
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || |||||     
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagg 79602  T
Q  129 agagaagatcaaatggag 146  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  79603 agagtcgatcaaatggag 79620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090696
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 300  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | | |||||||||||||| |||| || | | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  301 ataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 322
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551429
Alignment:
Q  213 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 312  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || || |  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  313 tgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||    
T  36551420 tgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504293
Alignment:
Q  210 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 275  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 321
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 145  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  || | |  || || |||| |||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  146 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 245  Q
    | |||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| || |||  |||| | |||||||| ||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  246 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga-cca--ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Original strand, 6859578 - 6859666
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6859578 aaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgttgt 6859666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 322
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678760
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattat 7678699  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||  |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7678700 gaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411961
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 147
Target Start/End: Original strand, 42199277 - 42199394
Alignment:
Q  28 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 127  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||    
T  42199277 cagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaag 42199374  T
Q  128 aagagaagatcaaatggaga 147  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  42199375 gagagtagatcacatggaga 42199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 324
Target Start/End: Original strand, 42576239 - 42576295
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42576239 atttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 316
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 316  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 8082059 - 8081967
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8082059 aatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11002499 - 11002424
Alignment:
Q  243 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11002499 gtttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 2645187 - 2645273
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2645187 aaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 10083030 - 10082952
Alignment:
Q  30 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  10083030 gagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 116
Target Start/End: Original strand, 15168791 - 15168869
Alignment:
Q  38 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||||    
T  15168791 gggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgagaaatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 322
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132619
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9121155 - 9121078
Alignment:
Q  244 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9121155 tttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 82
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667806
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 82  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttag 14667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 109
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  40 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 304
Target Start/End: Original strand, 30588615 - 30588712
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30588615 aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21193737 - 21193649
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21193737 aaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttgt 21193649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 43 - 107
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  43 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860118
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359259
Alignment:
Q  41 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 140  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  141 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt-agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 239  Q
    |||||| | |  ||  | |  ||||| |||||||   |||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 7359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366262
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 2552936 - 2553002
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 259  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552936 gagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Original strand, 2712944 - 2713014
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  2712944 ggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 321
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234168
Alignment:
Q  259 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17340550 - 17340500
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340550 aaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagaca-tgtagagagaagacccgtagat 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 324
Target Start/End: Original strand, 14725675 - 14725803
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca-actt 294  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||||    
T  14725675 aaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgacataattcgatctatgcagtc-atccacactt 14725773  T
Q  295 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14725774 aatatgataagactttgttgttgttgttgt 14725803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 327
Target Start/End: Original strand, 23980127 - 23980232
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||  | | || |||||||| ||||||  ||| || |||||||    
T  23980127 aatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgt 23980226  T
Q  322 tgtcgt 327  Q
    ||||||    
T  23980227 tgtcgt 23980232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 27386569 - 27386622
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27386569 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 324
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800113
Alignment:
Q  247 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 27800113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 322
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  249 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 286  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 106
Target Start/End: Original strand, 21952364 - 21952424
Alignment:
Q  46 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaag 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  21952364 cacctatagtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41200419 - 41200343
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || | | ||||||||||||    
T  41200419 tgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttgt 41200343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 323
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400795
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttg 9400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 241 - 316
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985360
Alignment:
Q  241 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 316  Q
    |||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 38684648 - 38684763
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||  || || ||||||||  |||| |    
T  38684648 aaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaag 38684747  T
Q  307 cttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||    
T  38684748 cttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 297
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  222 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 297  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 324
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894358
Alignment:
Q  202 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt-------ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactt 294  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||       || ||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  295 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  41894329 agtgggataagactttgttgttgttgttgt 41894358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 283
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 283  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 321
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 324
Target Start/End: Original strand, 4653476 - 4653537
Alignment:
Q  263 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4653476 acataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttgt 4653537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 5303681 - 5303730
Alignment:
Q  273 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5303681 atccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 108
Target Start/End: Original strand, 6888993 - 6889062
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 108  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  6888993 ggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9917530 - 9917458
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9917530 tgatagaacagtataacatcgtttga---atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12576974 - 12576861
Alignment:
Q  207 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 306  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||  ||||||||| | ||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| |    
T  12576974 aaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaag 12576875  T
Q  307 cttggttgttgttg 320  Q
    ||||||||||||||    
T  12576874 cttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186782
Alignment:
Q  248 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 245
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200935
Alignment:
Q  196 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 245  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 36200935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  273 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15588503 - 15588399
Alignment:
Q  208 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 307  Q
    |||||||||||   |||||||| |||  ||| ||||| | ||| |||||| |||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15588503 aagatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggc 15588404  T
Q  308 ttggt 312  Q
    |||||    
T  15588403 ttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36123234 - 36123178
Alignment:
Q  269 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 325  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36123234 tttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtc 36123178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 323
Target Start/End: Original strand, 37065677 - 37065761
Alignment:
Q  240 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 323  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  37065677 atggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagcttagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 39322132 - 39322096
Alignment:
Q  268 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 304  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39322132 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 39322096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 262
Target Start/End: Original strand, 43035104 - 43035204
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  |  ||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||    
T  43035104 agaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattat 43035203  T
Q  262 g 262  Q
    |    
T  43035204 g 43035204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475347
Alignment:
Q  42 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 141  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| |  ||  |||||||||||| ||||||   || ||||| |||| |||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  142 tggag 146  Q
    |||||    
T  43475343 tggag 43475347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1249 - 945
Alignment:
Q  20 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 119  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1249 gacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtagatgcc 1150  T
Q  120 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 219  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1149 gtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagagg 1050  T
Q  220 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1049 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgtt 950  T
Q  320 gttgt 324  Q
    |||||    
T  949 gttgt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 324
Target Start/End: Original strand, 31458 - 31753
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  31458 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaaga 31557  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31558 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 31657  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31658 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44150 - 44080
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  44150 ggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 29 - 321
Target Start/End: Original strand, 82711 - 83000
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||    
T  82711 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaaga 82810  T
Q  129 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 228  Q
    || | | ||||||||||| |||    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82811 agggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 82907  T
Q  229 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  82908 tggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 153 - 321
Target Start/End: Original strand, 16692 - 16860
Alignment:
Q  153 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16692 caggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 16791  T
Q  253 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 321  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16792 gaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 53 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 86877 - 86606
Alignment:
Q  53 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||      
T  86877 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagt 86778  T
Q  153 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 252  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||| | | |||||    
T  86777 caggttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgata 86678  T
Q  253 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  86677 gaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttgt 86606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 324
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4921
Alignment:
Q  109 ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaa 208  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   || |||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  209 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 308  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  309 tggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgttgt 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4553 - 4277
Alignment:
Q  39 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||| ||||||| ||||||  | || |||||||||| |||||    
T  4553 ggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatc 4454  T
Q  139 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 238  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||          ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4453 aaatggaggagaatcaagttaaaagaggtataggaa----------aactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaa 4364  T
Q  239 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  || | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4363 tttggtttataatagaacactatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 167 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25529
Alignment:
Q  167 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 266  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  267 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 25737 - 25683
Alignment:
Q  29 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25737 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11546
Alignment:
Q  81 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 180  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||| |||||||||| ||| | |||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  181 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 280  Q
     |||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  281 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttgt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11880 - 11810
Alignment:
Q  37 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11880 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 322
Target Start/End: Original strand, 485 - 614
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14868
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgttgt 14868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28886
Alignment:
Q  231 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58223
Alignment:
Q  162 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 261  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | || ||| |||||||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  262 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttgt 58223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 319
Target Start/End: Original strand, 7580 - 7720
Alignment:
Q  179 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 278  Q
    ||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7580 taagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccat 7679  T
Q  279 gtagccgatc-caacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    | |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7680 gcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1519
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |   |||| |  ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || ||    
T  1647 gagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccac 1551  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1550 ttattaagataaagcttggttgttgttgttgt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 160452 - 160325
Alignment:
Q  193 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 292  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||| | || ||    
T  160452 gagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccac 160353  T
Q  293 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 320  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  160352 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  233 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  236 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 322  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 324
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19202
Alignment:
Q  271 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 324  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttgt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39537
Alignment:
Q  201 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 257  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaaca 39537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University