View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12039_low_5 (Length: 653)

Name: NF12039_low_5
Description: NF12039
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12039_low_5
NF12039_low_5
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (1-634)||(8306064-8306698)
chr6 (11-327)||(18736010-18736331)
chr6 (1-327)||(23574394-23574724)
chr6 (47-328)||(15119589-15119870)
chr6 (3-328)||(29094884-29095214)
chr6 (1-327)||(4409196-4409528)
chr6 (1-327)||(14910605-14910936)
chr6 (24-321)||(18728948-18729246)
chr6 (1-327)||(29482591-29482922)
chr6 (1-258)||(12738495-12738757)
chr6 (24-200)||(7968491-7968667)
chr6 (1-286)||(24438470-24438760)
chr6 (119-327)||(21508507-21508716)
chr6 (53-327)||(3876374-3876649)
chr6 (25-327)||(15349496-15349800)
chr6 (1-192)||(19860056-19860251)
chr6 (2-190)||(18014464-18014656)
chr6 (85-327)||(17756886-17757129)
chr6 (24-298)||(18258492-18258767)
chr6 (3-186)||(15318989-15319175)
chr6 (237-325)||(18043519-18043607)
chr6 (1-129)||(18043340-18043472)
chr6 (331-458)||(8301524-8301652)
chr6 (61-180)||(23524128-23524247)
chr6 (26-327)||(15369492-15369795)
chr6 (224-327)||(23524248-23524351)
chr6 (237-325)||(19857705-19857793)
chr6 (240-327)||(27964968-27965055)
chr6 (330-415)||(8302714-8302800)
chr6 (329-496)||(8300139-8300309)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (1-327)||(19967288-19967618)
chr1 (1-325)||(19441982-19442310)
chr1 (24-327)||(8995308-8995610)
chr1 (1-327)||(24973756-24974085)
chr1 (26-327)||(9858996-9859302)
chr1 (23-325)||(38621829-38622132)
chr1 (1-323)||(21817605-21817937)
chr1 (1-191)||(8990767-8990961)
chr1 (1-138)||(22186045-22186185)
chr1 (144-327)||(21815425-21815609)
chr1 (144-325)||(49472350-49472531)
chr1 (13-101)||(21815619-21815709)
chr1 (130-327)||(33028926-33029124)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (1-327)||(12885280-12885610)
chr4 (1-327)||(10985583-10985912)
chr4 (1-327)||(3268334-3268665)
chr4 (24-327)||(12217588-12217885)
chr4 (24-327)||(21332413-21332717)
chr4 (76-327)||(16396135-16396387)
chr4 (24-327)||(25239721-25240025)
chr4 (1-217)||(3270546-3270766)
chr4 (24-328)||(13861340-13861645)
chr4 (27-327)||(9901571-9901871)
chr4 (24-327)||(26780684-26780988)
chr4 (24-327)||(45313174-45313476)
chr4 (27-271)||(17282415-17282660)
chr4 (3-327)||(8082047-8082375)
chr4 (26-324)||(49402721-49403013)
chr4 (1-327)||(28891910-28892243)
chr4 (240-327)||(18284484-18284571)
chr4 (24-190)||(15455467-15455633)
chr4 (1-62)||(18284661-18284724)
chr4 (277-327)||(3270777-3270827)
chr4 (22-140)||(34845514-34845632)
chr4 (248-328)||(8168007-8168087)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (1-328)||(29164849-29165179)
chr7 (3-327)||(30770057-30770384)
chr7 (27-329)||(20093566-20093868)
chr7 (1-325)||(21802450-21802779)
chr7 (45-327)||(22705647-22705929)
chr7 (3-327)||(18153131-18153459)
chr7 (1-327)||(9548828-9549168)
chr7 (1-314)||(47295564-47295880)
chr7 (1-327)||(21592744-21593076)
chr7 (51-327)||(7595403-7595684)
chr7 (24-327)||(2249860-2250164)
chr7 (60-327)||(38612620-38612888)
chr7 (1-200)||(18185625-18185827)
chr7 (131-325)||(21801716-21801911)
chr7 (63-327)||(30764849-30765114)
chr7 (1-102)||(22703896-22704001)
chr7 (24-146)||(28794078-28794200)
[»] chr2 (14 HSPs)
chr2 (1-327)||(23755687-23756018)
chr2 (1-327)||(3770260-3770591)
chr2 (24-327)||(41266065-41266368)
chr2 (1-332)||(3105204-3105540)
chr2 (1-328)||(25133792-25134133)
chr2 (24-286)||(42534032-42534295)
chr2 (1-328)||(27347171-27347500)
chr2 (48-328)||(26154850-26155131)
chr2 (11-327)||(19092731-19093051)
chr2 (1-191)||(23929797-23929991)
chr2 (1-190)||(29568315-29568507)
chr2 (1-74)||(26159156-26159233)
chr2 (237-328)||(23932920-23933011)
chr2 (277-327)||(26159096-26159146)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (1-327)||(391459-391791)
scaffold0002 (2-327)||(380763-381092)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-326)||(32008884-32009213)
chr8 (34-324)||(18573889-18574180)
chr8 (1-332)||(7999650-7999984)
chr8 (1-327)||(18040357-18040680)
chr8 (1-332)||(41280672-41281008)
chr8 (1-284)||(24033762-24034053)
chr8 (1-296)||(2085642-2085942)
chr8 (1-327)||(7454521-7454866)
chr8 (24-327)||(25820743-25821047)
chr8 (25-191)||(11709396-11709562)
chr8 (26-185)||(10532801-10532960)
chr8 (5-326)||(24060562-24060888)
chr8 (60-327)||(22609363-22609631)
chr8 (24-327)||(33273391-33273679)
chr8 (164-303)||(17775787-17775926)
chr8 (137-307)||(10532629-10532800)
chr8 (237-325)||(11709621-11709709)
chr8 (1-80)||(1788651-1788733)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (2-327)||(29926-30256)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (1-329)||(28067891-28068223)
chr5 (1-327)||(5931190-5931521)
chr5 (1-327)||(23495349-23495678)
chr5 (24-329)||(15620059-15620364)
chr5 (37-322)||(33622365-33622653)
chr5 (1-327)||(20899465-20899795)
chr5 (1-327)||(36712519-36712848)
chr5 (24-216)||(42792508-42792700)
chr5 (1-317)||(41037524-41037854)
chr5 (24-271)||(5590622-5590870)
chr5 (1-327)||(8244511-8244846)
chr5 (1-190)||(22922645-22922838)
chr5 (1-188)||(22922050-22922241)
chr5 (24-167)||(38608294-38608437)
chr5 (128-327)||(13537860-13538060)
chr5 (86-303)||(19329817-19330035)
chr5 (117-327)||(22510101-22510312)
chr5 (148-327)||(24095343-24095523)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (4-327)||(909-1237)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (36-327)||(16185-16476)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (2-249)||(1609-1861)
scaffold0058 (1-149)||(15365-15517)
scaffold0058 (225-300)||(15528-15603)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-216)||(47396-47615)
scaffold0034 (237-325)||(56229-56317)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (1-323)||(151164-151490)
[»] chr3 (10 HSPs)
chr3 (68-328)||(19790346-19790607)
chr3 (1-325)||(22915052-22915379)
chr3 (24-191)||(16853014-16853181)
chr3 (1-298)||(16914706-16915008)
chr3 (24-72)||(19773414-19773462)
chr3 (76-190)||(44635826-44635940)
chr3 (24-72)||(1998033-1998081)
chr3 (124-327)||(13016433-13016636)
chr3 (24-93)||(22006519-22006588)
chr3 (24-93)||(22014036-22014105)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (24-327)||(68700-69004)
scaffold0042 (1-197)||(74845-75045)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (1-327)||(4065-4396)
[»] scaffold0989 (1 HSPs)
scaffold0989 (1-271)||(1448-1721)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (24-327)||(7218-7522)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (13-327)||(10741-11058)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (1-325)||(242673-243002)
scaffold0008 (1-328)||(253313-253645)
[»] scaffold0265 (3 HSPs)
scaffold0265 (1-323)||(14872-15204)
scaffold0265 (144-327)||(17200-17384)
scaffold0265 (13-101)||(17100-17190)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (1-327)||(12323-12651)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (37-327)||(54473-54763)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (24-327)||(2697-3002)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (48-327)||(37095-37374)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (106-327)||(9243-9461)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (223-327)||(1970-2074)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (1-115)||(19150-19268)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (1-135)||(86424-86562)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (26-145)||(20336-20455)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (277-327)||(18257-18307)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (48-211)||(36765-36928)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 543; Significance: 0; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 543; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 634
Target Start/End: Original strand, 8306064 - 8306698
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  8306064 agagagtgagggtttagaggaagagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacacc 8306163  T
Q  101 tgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttt 200  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8306164 tgactctagcagttatgaaatcatggaaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacctacagagagacgttgtgactcgtttgaaccagtctcttt 8306263  T
Q  201 tgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggcc 300  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8306264 cgctctgtgcacctccttgtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgtcaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaagtatatgggcc 8306363  T
Q  301 aaatgtccttttggccggtccagaacacaaatgtccttgcaaattctttacttcaattaaacagccacaaccaagcatcgta-aaattggtggaaatgag 399  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8306364 aaatgtccttttgaccggtccagaacacaaatgtccttgcaaattctttacttcaattaaacagccacaaccaagcatcgtagaaattggtggaaatgag 8306463  T
Q  400 tatatagatcaatcaatgtggaggtattatatcaagaactaaaacttaataaatgaatagaagaaaccaaaatctatgcaggtagtctatttgatcagaa 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8306464 tatatagatcaatcaatgtggaggcattatatcaagaactaaaactcaataaatgaatagaagaaaccaaaatctatgcaggtagtctatttgatcagaa 8306563  T
Q  500 caaaataaacaaagtcttgccatatttggtgtaaaattcatgaatgttgataaaaatatgttccttacatgtcttcacgcactacaaaataacaggtgaa 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8306564 caaaataaacaaagtcttgccatatttggtgtaaaattcatgaatgttgataaaaatatgttccttacatgtcttcacgcactacaaaataacaggtgaa 8306663  T
Q  600 ttacgacggttttattacggcggcttccaataacc 634  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8306664 ttaggacggttttattacggcggcttccaataacc 8306698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 18736010 - 18736331
Alignment:
Q  11 ggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactc 106  Q
    |||||||||||||||||    ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||| |||    
T  18736010 ggtttagaggaagagataaattctagcttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgctgagccgttgtaatggcacacctggctc 18736109  T
Q  107 tggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctct 206  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||     
T  18736110 tggcggttacgaaattgtgggaagtctaatcgccagagagtttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggctcgtttgaaccaatctcgctcgctcc 18736209  T
Q  207 gtgcacccc-ctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatg 305  Q
    ||||||||| || |   |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||      
T  18736210 gtgcacccctcttgcgggaaaggggtatattgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttgggctttggatattattgggcctaagtaaatgggccaaaaa 18736309  T
Q  306 tccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18736310 tccttttggccggtccagaaca 18736331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 23574394 - 23574724
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  23574394 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgtggactgctttgagtcccctatttatagaggtagagggctgcagagccgttgtaatggca 23574493  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||| || ||||||| |||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23574494 cacttggctctggctgttacgaagtcgtggaaagtgtaaccaccagagagtttattgcgagaacatgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 23574593  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    | || |||| |||||| |||| ||  ||||||||  | |  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  23574594 cgttcgctccgtgcacgcccttgtgggaaaggggtgtatcacaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatg 23574693  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23574694 ggccaaaggtccttttgggcggtccagaaca 23574724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15119870 - 15119589
Alignment:
Q  47 tgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  15119870 tgagtcccctatttatagaggtggagagttgcagagccagtgtaatggcacacctggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtataaccgctagagag 15119771  T
Q  147 tttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaac 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||| | || || ||||||  |||   |||||||    
T  15119770 tttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacctgtctctttcactctgtgcaccccccttgtgtggaaggggtgtgtcataagtaac 15119671  T
Q  246 tttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    |||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15119670 tttgtcaaacgtggtgtttgggctctggattgtattgggcctaagtaaatgggcc-aaggtccttttggccggtccagaacac 15119589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29095214 - 29094884
Alignment:
Q  3 agagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacac 99  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||    
T  29095214 agagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacac 29095115  T
Q  100 ctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctctt 199  Q
    || |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||  ||||||    
T  29095114 ctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtctctt 29095015  T
Q  200 ttgctctgtgcaccccc--tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgg 297  Q
    | | || ||||||||||  | |  || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||    
T  29095014 tcgttccgtgcaccccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtgaatgg 29094915  T
Q  298 gccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    ||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  29094914 gccaaagatctttttggtcggtccagaacac 29094884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 4409196 - 4409528
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||  |||| ||    
T  4409196 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgcattgaatcctctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttacaatggca 4409295  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||  ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4409296 caccttgctctggcggttacaaaatcgtgagaagtgtaaccgctagggcgtttattgcgggaacgtgcatagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 4409395  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatg-tttgggctttagatcgtattgggcctaaataaa 294  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |  |||||||||  |||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||  ||  |||||||||||| ||||    
T  4409396 ctttcgctccgtgcaccccccttgcgtgaaaggggtgtgtcacaagtaactttgtcaaacgtggtgttttgggctttgaatgatattgggcctaagtaaa 4409495  T
Q  295 tgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4409496 tgggccaaatgtccttttggccgatcgagaaca 4409528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 14910605 - 14910936
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat-----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgac 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |     ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |    
T  14910605 agagagtgagggtttagaggaagagctagatttctaccttggggactgcagtgagtcccctatatatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggc 14910704  T
Q  96 acacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattc 195  Q
    |||| |  ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  14910705 acacatcgctctggcagttacgaaattgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccggtc 14910804  T
Q  196 tcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |   | |||| ||||||||||   |  | ||||||  ||| |||| |||  |||||||| ||| ||||||| |||| |||  ||||| |||||| |||||    
T  14910805 ttgctcgctccgtgcacccccatttggggaaggggtgtgtcgcaaataatgttgccaaatgtggtgtttggactttggattctattgtgcctaagtaaat 14910904  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14910905 gggcaaaaggtccttttggccggtccagaaca 14910936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 321
Target Start/End: Original strand, 18728948 - 18729246
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||     
T  18728948 agattctaccttgaggactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagacattgtaatggaacacctggctctggcgggtacaaaatcg 18729047  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccc-cctggtct 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||| || |||| |||||||| ||| |       
T  18729048 tgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcggaaacgtgcagagagacgttgtggctcctttgaaccggtctcgttcgctccgtgcaccctccttgcgg 18729147  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcc 321  Q
    ||||| ||  |||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  18729148 gaaagcggtgtgttacaagtaagtttgtcaaacgtggtgtttgggttttggatagtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggcctgtcc 18729246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 29482591 - 29482922
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||    
T  29482591 agagagtgggggtttagaggaagagatagattctaccttggggactactatgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagtcgttgtaatggca 29482690  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29482691 cacctggttctagcggttacgaaatcgtgggaagtataactgtgagagagtttattgcgggaacatgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtct 29482790  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctg-aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |  | |||| ||||| | | | ||  | |||||||  ||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||| || |||||||| | |||||    
T  29482791 cgctcgctccgtgcagcactttgtgggaaaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacgtggcgtttgggctttggattgtgttgggcctgagtaaat 29482890  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  29482891 gggccaaagatccttttggcctttccagaaca 29482922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 12738495 - 12738757
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||    ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  12738495 agagagtgggggtttagaggaagagatagattctacctaggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggca 12738594  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    || ||| || || || ||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  12738595 catctggctatgacgattacgaaatcgtgggaagtgtaacctctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtct 12738694  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtg 258  Q
      || |||| || || |||||| ||  ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12738695 tgttcgctccgtacaccccccttgtgggaaaggggtgtgtcgcaggtaactttgccaaacgtg 12738757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7968667 - 7968491
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||      
T  7968667 agattctgccttggggactgcattgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacctgactctggcggttacgaaattg 7968568  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttt 200  Q
    ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7968567 tggaaagtgtaaccgccagggggtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctcttt 7968491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 24438760 - 24438470
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  24438760 agagagtgagggtttagaggaagagatagattataccttggg-actgctgtgagtcccctatttatagaggtagaggattgcagagtcgttgtaatgaca 24438662  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  24438661 cacctggctcttgcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagttgattgcaggaacgtgcaaagagacgatgtggttcgtttgaaccaatct 24438562  T
Q  197 cttttgctctgtg--caccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcc 286  Q
    ||||  | | |||  |||||||| |  || ||||||  ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||  |||| ||| ||||||||||    
T  24438561 ctttctccccgtgcacacccccttgcgtggaaggggtgtgttgcaagtaacatagccaaatgtggtgtttgaactttggattgtattgggcc 24438470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 119 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21508716 - 21508507
Alignment:
Q  119 aatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-t 217  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  21508716 aatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgctgtggttcgattgaaccagtctctttcgctccgtgcacccccct 21508617  T
Q  218 ggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccg 317  Q
     |  || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21508616 tgcatggaaggggtgtgttgcaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccctttggccg 21508517  T
Q  318 gtccagaaca 327  Q
     |||||||||    
T  21508516 atccagaaca 21508507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 327
Target Start/End: Original strand, 3876374 - 3876649
Alignment:
Q  53 ccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttatt 152  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||| |||||    
T  3876374 ccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgaagacacacctaagtctggcggttacgaaatcgtaggaagtgtaatcgtcagagagattatt 3876473  T
Q  153 gcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctga-aagggggatgttgcaagtaactttgcc 251  Q
    |||||||  | || ||||||||||| |||| ||||||||  |||   |||||| |||||||||||   | || |||||| ||||  ||||||| ||||||    
T  3876474 gcgggaatatgcaaagagacgttgtagctcatttgaaccgatcttgcttgctccgtgcacccccttcgcggagaaggggtatgtcacaagtaagtttgcc 3876573  T
Q  252 aaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| ||||||||||  ||  || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  3876574 aaacgtgaagtttgggcttgggactgtgttgggcctaaataaatggacctaaagtccttttggccggtccagaaca 3876649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15349800 - 15349496
Alignment:
Q  25 gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcat 124  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||||||  ||||||||||| |||||| |    
T  15349800 gattctacgttggggactgctaagagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatagcacacctgggtctggcggttacgaaatcgt 15349701  T
Q  125 gggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcg-tttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccct--ggtc 221  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||  |||    |||||||||||||||||  |       
T  15349700 gggaagtgtaaccgcgagagagattattgtgggaacgtgcaaagagatgttgtggttcgttttgaaccggtcttgcatgctctgtgcaccccctccgcga 15349601  T
Q  222 tgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcc 321  Q
    || ||||| | ||||||||||||  ||||||||| || ||||||  |||| ||| |||| |||||||| |||| ||||| ||  |||||||| |||||||    
T  15349600 tggaagggtg-tgttgcaagtaatattgccaaacatggtgtttgatctttggattgtatcgggcctaagtaaacgggcctaagatccttttgaccggtcc 15349502  T
Q  322 agaaca 327  Q
    ||||||    
T  15349501 agaaca 15349496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19860251 - 19860056
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||  |    
T  19860251 agagagtgacggtttagaggaatagataaattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcggagccgttgtaatggga 19860152  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaacca 192  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |   ||||||||||| || ||||||||||||    
T  19860151 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccaccagagagattattgtgggaacatgttgagagacgttgcggttcgtttgaacca 19860056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18014656 - 18014464
Alignment:
Q  2 gagagtgaaggtttagaggaagagatt----ctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||    |||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||    
T  18014656 gagagtgagggttaagaggaagagattgattctaccttggggactgctatgagtcccctacatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 18014557  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaac 190  Q
    ||||  |||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||    
T  18014556 acctagctctggcggttacgaaatcgtgggaagtctaaccaccagagagattattgcgggaacgtacagtcaaacattgtggttcgtttgaac 18014464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 85 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17757129 - 17756886
Alignment:
Q  85 gttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgt 184  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  | |||||||||| || ||||    
T  17757129 gttgtaatggcacaccttactctgacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgtgggaacgtggaaagagacgttggggttcgt 17757030  T
Q  185 ttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgg 283  Q
    |||||||| ||| ||| | || |||||||||| | |  || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |    
T  17757029 ttgaaccaatctttttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttcgattgtattag 17756930  T
Q  284 gcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  17756929 gcctaagtaaatgtgtcaaagatccttttggccggtcccgaaca 17756886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18258767 - 18258492
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||| || |||||||| |||||  ||||| |||||      
T  18258767 agattctaccttggagactgttgtgagtcccctatttatagaggtagagggctgtagagccgttgtagtggcacacctggctctgatggttacgaaattg 18258668  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtct 222  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||||||||  ||||  | |||  |||||||||| | ||      
T  18258667 tgggaagtgtaactgctaaagagtttattgcgggaatgtgcggagagacgttgtggttcctttgaaccggtctcactcgcttcgtgcaccccctttgtgg 18258568  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatggg 298  Q
      || ||| ||| ||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18258567 agaaagggtatgctgcaagtaagtttgcaaaacatggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatggg 18258492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15319175 - 15318989
Alignment:
Q  3 agagtgaaggtttagaggaagag---attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacac 99  Q
    ||||||| ||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||  ||||    
T  15319175 agagtgagggtttagagaaagagtcgattctaccttggggactgctaagagttccctatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtgatggtacac 15319076  T
Q  100 ctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgttt 186  Q
    ||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||||    
T  15319075 ctaggtctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagattattgcaggaacgtgcaaagagaagttgtggttcgttt 15318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Original strand, 18043519 - 18043607
Alignment:
Q  237 gcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18043519 gcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttgaatggtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtccttttggccggtccagaa 18043607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 18043340 - 18043472
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  18043340 agagagtgagggtttagaggaagagataaattctaccttggggactgcatttagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatgaca 18043439  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaa 129  Q
    | | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18043440 cgcatgactctggcgggtacgaaatcatgggaa 18043472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 331 - 458
Target Start/End: Original strand, 8301524 - 8301652
Alignment:
Q  331 atgtccttgcaaattctttacttcaattaaacagccacaaccaagcatcgtaaaa-ttggtggaaatgagtatatagatcaatcaatgtggaggtattat 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | |||    
T  8301524 atgtccttgcaaattctttacttcaattaaaaagcctcaacaaaatatcatccaacttggtggaaatgagtatatagatcaatcaatgtgagtgaactat 8301623  T
Q  430 atcaagaactaaaacttaataaatgaata 458  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8301624 atcaagtactaaaactcaataaatgaata 8301652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Original strand, 23524128 - 23524247
Alignment:
Q  61 atagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaac 160  Q
    ||||| |||||||| |||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  23524128 atagacgtggagggctgcagagccattgtaatggcacacctggctctggcggttaagaaatcgtggaaagtgtaaccatcaaagagtttattgcgggaac 23524227  T
Q  161 gtacagagagacgttgtggc 180  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  23524228 gtgcagagagaagttgtggc 23524247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15369795 - 15369492
Alignment:
Q  26 attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || | ||  ||| | |||  ||||||   ||||||||||| |||||  |     
T  15369795 attctaccttggggactgctaagagtcctctatatatagaggtggagggctgtagagtcgttatgatggtacacctaggtctggcggttacgaaattgta 15369696  T
Q  126 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcg-tttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctga 224  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||  |||  | |||||  |||||| |||   | ||    
T  15369695 ggaagtgtaaccgccagacagattattgcgggaacgtgcaaagagaagttgtggttcgttttgaaccggtcttgtatgctccttgcaccgccttcgc-ga 15369597  T
Q  225 a--agggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    |  | |||  ||||||||| ||  |||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  15369596 aggaagggtgtgttgcaaggaatattgccaaacgtggtgtttgagctttggattatattgggcttaagtaaatgcgcctaagatccttttggccggtcca 15369497  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  15369496 gaaca 15369492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Original strand, 23524248 - 23524351
Alignment:
Q  224 aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23524248 aaaggggtgtgtcgcaagtaactttgcaaaacgtggtgtttgggctttgggttgtattgtacctaagtaaatgggccaaaggtccctttggccggtccag 23524347  T
Q  324 aaca 327  Q
    ||||    
T  23524348 aaca 23524351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19857793 - 19857705
Alignment:
Q  237 gcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19857793 gcaactaactttgccaaacgtggtgtttgagctttggattgtattgagcctaagtaaatgcgccaaaggtccttttggtcggtccagaa 19857705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 327
Target Start/End: Original strand, 27964968 - 27965055
Alignment:
Q  240 agtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  27964968 agtaattttaccaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggctggtccaaaaca 27965055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 8302800 - 8302714
Alignment:
Q  330 aatgtccttgcaaattctttacttcaattaaacagccacaaccaagcatcgt-aaaattggtggaaatgagtatatagatcaatcaa 415  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8302800 aatgtcctttcaaattcttcacttcaattaaacaaccataagcaagcatcgtccaacttggtagaaatgaatatatagatcaatcaa 8302714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 8300309 - 8300139
Alignment:
Q  329 aaatgtccttgcaaattctttacttcaattaaacagccacaaccaagcatcgt-aaaattggtggaa---atgagtatatagatcaatcaatgtggaggt 424  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |  || ||||||| |   ||||||||||  ||||||||||||          
T  8300309 aaatgtcctttcaaattctttaattcaattaaacaaccacaatcaagcatcatccaacttggtgggaattatgagtatat--atcaatcaatgtcagcaa 8300212  T
Q  425 attatatcaagaactaaaact-taataaatgaatagaagaaaccaaaatctatgcaggtagtctatttgatca 496  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  8300211 actatatcaagaactaaaactgtagtaaataaataaaagaaagcaagatctatgtagatactctatttgatca 8300139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 5e-98; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19967618 - 19967288
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19967618 agagagtgagggtttagaggaagagatggattctaccttagggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggttgcataaccgttgtaatgaca 19967519  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19967518 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggtggtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 19967419  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    |||| |||| |||||||||||  | || ||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19967418 ctttcgctccgtgcacccccttatgtggaaggggtgtgtcgcaggtaactttgtcaaacgtggtgtttggactttggatcgtattgggcctaagtaaatg 19967319  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19967318 gatcaaaggtccttttgaccggtccagaaca 19967288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19442310 - 19441982
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    
T  19442310 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagtgctgcaaagccgttgtaatgaca 19442211  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    || |||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  19442210 catctgactctggcggttacgaaatcgggggaagtataaccgccagagagtttattgtgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgattgaaccagtct 19442111  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    |||| |||| |  |||||||| || || ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  19442110 ctttcgctccgcacacccccttgtgtggaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgagttttggattgtattgggcctaagtaaatg 19442011  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19442010 ggccaaaggtccttttggccggtccagaa 19441982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8995610 - 8995308
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||||||  |||| ||||||| ||||||     
T  8995610 agattctaccttggggaatgcagtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttg-attgacacacctagctctagcggttacgaaatcg 8995512  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||  ||||  | |||| ||||||||||| ||  |    
T  8995511 tgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgctgagagacgttgtggcttgcttgaaccggtctcgctcgctccgtgcaccccctcgtggg 8995412  T
Q  224 aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
    ||||||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  8995411 aaaggggtatgtcgcaagtaatgttgtcaaacgtggtgtttaggctttagatagtattgggtctaagtaaatgggccaaaggtccttttggtcggtccaa 8995312  T
Q  324 aaca 327  Q
    ||||    
T  8995311 aaca 8995308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24974085 - 24973756
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaagaga--ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| ||||||||| |||    
T  24974085 agagagtgagggttttagaggaagagagattctaccttggtgactgcattgagtcccctatttatagagttagagggctgcagagccgttgtaatggcac 24973986  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||  ||||    
T  24973985 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgtgggaatgttgaaagagacgttgaggttcgtttgaaccggtctc 24973886  T
Q  198 ttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgg 297  Q
    ||| | |||||||||||||| |  || |||||   ||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  24973885 tttcgttctgtgcacccccttgcttggaagggatgtgtcgcaagtaattttgcaaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgggcctaagtaaatgg 24973786  T
Q  298 gccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
     |||||   |||||||||||||||| ||||    
T  24973785 accaaagaaccttttggccggtccataaca 24973756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 26 - 327
Target Start/End: Original strand, 9858996 - 9859302
Alignment:
Q  26 attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatg----acacacctgactctggcggttatgaaat 121  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  |     |||||| || ||||| |||||| |||||    
T  9858996 attctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtggttgcacacacacttggctctgacggttacgaaat 9859095  T
Q  122 catgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggt 220  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||  | ||||||||||||||| | |     
T  9859096 cgtgggaagtgtaaccgccaaagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacgagtctcactcgctctgtgcaccccccttgc 9859195  T
Q  221 ctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtc 320  Q
      ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||||| || |||| | |||  | ||||  |||||||||||||||    
T  9859196 aggaaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttggattttggattgtattaggtctaagtcaataagtcaaagatccttttggccggtc 9859295  T
Q  321 cagaaca 327  Q
    |||||||    
T  9859296 cagaaca 9859302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 325
Target Start/End: Original strand, 38621829 - 38622132
Alignment:
Q  23 gagattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||  || |||||| ||||| ||||||    
T  38621829 gagattctaccttggggactgcagtgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacatttggctctggtggttacgaaatc 38621928  T
Q  123 atgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtc 221  Q
     ||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||  | |||| ||| | |||||| |      
T  38621929 gtggaaagtgtaactgccaaacaatttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgttttaaccgatctcgctcgctccgtggacccccctcgcg 38622028  T
Q  222 tgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcc 321  Q
     | |||||| |||| ||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||    
T  38622029 gggaaggggtatgtcgcaagtaatgtcgctaaacgtgatgtttgagctttggattgtattgggcctaagtaaataggtcaaaagtccttttgtccggtcc 38622128  T
Q  322 agaa 325  Q
    ||||    
T  38622129 agaa 38622132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 21817937 - 21817605
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||| |||    
T  21817937 agagagtgagggttttagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggatggccgcagagccgttgtaatggcac 21817838  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| || || |||||||||||  ||||    
T  21817837 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaacagcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgctggggttcgtttgaaccgatctc 21817738  T
Q  198 ttttgctctgtgca-------ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaa 290  Q
    ||| | || |||||       ||||||    || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  21817737 tttcgttccgtgcacccccccccccctcacgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtactgggcctaag 21817638  T
Q  291 taaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21817637 tgaatgggccaaagatccttttggccggtccag 21817605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8990961 - 8990767
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||| ||    
T  8990961 agagagtgagggtttagaggaagagttagattctaccgtggggactgcagtgagtcccctatttacagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggca 8990862  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaacc 191  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  8990861 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaactgtcagagagtttattgtgagaacgtgcagagagacgttgtggcttgcttgaacc 8990767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22186185 - 22186045
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| |||    
T  22186185 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgctttaagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcac 22186086  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccg 138  Q
    |||| |||| | ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22186085 accttactcggacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccg 22186045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21815609 - 21815425
Alignment:
Q  144 gagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagt 242  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||| | || |||||||||| | |  || ||||||  |||  | |||    
T  21815609 gagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcacgagt 21815510  T
Q  243 aactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  21815509 aattttgccaaacgtggtgtttgggatttggatggtactgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccagaaca 21815425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 144 - 325
Target Start/End: Original strand, 49472350 - 49472531
Alignment:
Q  144 gagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagta 243  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||| || || ||||||||  ||||||| | || ||||||||||| |  ||  |||||  | | || ||||    
T  49472350 gagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcatttgaaccggtctctttcgttccgtgcaccccctcgcgtgggaggggtgtttcgcgagta 49472449  T
Q  244 actttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    | |||| |||||| | ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  49472450 attttgtcaaacgcggtgtttggactttggatggtattgggcctaagtaaatgggtcaaagatccttttgcccggtccagaa 49472531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21815709 - 21815619
Alignment:
Q  13 tttagaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacct 101  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  21815709 tttagaggaagaaagattctaccttggagactgcattgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacct 21815619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 327
Target Start/End: Original strand, 33028926 - 33029124
Alignment:
Q  130 gtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgttt-gaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagg 228  Q
    |||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||  || |  |||||| || ||||||||     | ||||    
T  33028926 gtgtaaccgttagagagattattgcgagaacgtacatagagacgttgtggtttgttttgaaccggtcccgcttgctccgttcaccccctcacggggaagg 33029025  T
Q  229 gggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||  ||| ||||||||  | | |||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| || ||||||  || |||||||||||||||||||    
T  33029026 ggtgtgtcgcaagtaatatagtcaaacgtggtgtttgggctttggattatattgtgcctaagtaattgagccaaaactcattttggccggtccagaaca 33029124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 12885280 - 12885610
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||  |||||||| ||    
T  12885280 agagggtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgagtcccctatttataaaggtggagggctgcagagccattgtaatggca 12885379  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12885380 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 12885479  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    |||| ||||  |||||||||| |   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  12885480 ctttcgctccatgcacccccttgcggggaaggggtatgttgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggttttggattgtattgggcctaagtaaatg 12885579  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    || |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12885580 ggtcaaaagtccttttggccggtccaaaaca 12885610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 10985912 - 10985583
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||    
T  10985912 agagagtgagggtttggaggaagaggtagattctaccttggg-actgccgtgagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggca 10985814  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10985813 cacctggctctcgcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 10985714  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    | || |||||||||||||||| ||  | || |||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  10985713 cgttcgctctgtgcacccccttgtggggaaagggtgtgtcacaagtaactttgccaaacgtggtgtttgacctttggattgtattgggcctaagtaaatg 10985614  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10985613 ggccaaaggtccttttgcccggtccagaaca 10985583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 3268334 - 3268665
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  3268334 agagagtgagggtttagagggagagatagattctaccttggagacttccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaatgaca 3268433  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3268434 cacctggctctggcggttacgtaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 3268533  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    || | |||| ||||| |||||| || || ||||||  |||  ||||||| |||||||||   | |||||||||| | ||| || ||| |||||| |||||    
T  3268534 ctgtcgctccgtgcaccccccttgtgtggaaggggtgtgtcacaagtaattttgccaaaatcggtgtttgggctgtggattgttttgagcctaagtaaat 3268633  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3268634 gggccaaaggtccttttggccggtcccgaaca 3268665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Original strand, 12217588 - 12217885
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||      ||||| |||||||||||| ||||||     
T  12217588 agattctaccttggggactgtcgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaa------acctggctctggcggttacgaaatcg 12217681  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||  || ||    
T  12217682 taggaagtgtaaccgccagagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctgtcgctccgtgcacccccatgtgtg 12217781  T
Q  224 aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||| ||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12217782 gaaggggtgtgttgcaagtaattttgctaaacgcggtgtttgggctgtggattgtattaggactaagtaaatgggccaaaggtccttttggccagtccag 12217881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21332717 - 21332413
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  21332717 agattctaccttggaaactgctttgagtcccctatttacagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggcacacctggctctggcgcttacgaaatca 21332618  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtct- 222  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || |     
T  21332617 tgggaagtataaccgccagaaagtttattgtgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcacccccttgtgtg 21332518  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||| || |    
T  21332517 gaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtagtgtttggactttgaattgtattggacctaagtaaatgggccaaagatcattttggccgatcta 21332418  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  21332417 gaaca 21332413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 76 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16396387 - 16396135
Alignment:
Q  76 tgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgtt 175  Q
    |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16396387 tgcagagccgttgtagtggcacacctgactctggcgattaggaaatcatgggaagtgtaaccgccagagtgtttattgcgggaacgtgtagagagacgtt 16396288  T
Q  176 gtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttaga 274  Q
    |||| ||| |||||||| ||||  |||||| ||||| |||||| ||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  16396287 gtggttcgcttgaaccagtctcgcttgctccgtgcaccccccttgtgggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgttttggctttgga 16396188  T
Q  275 tcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16396187 ttgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaaca 16396135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Original strand, 25239721 - 25240025
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||      
T  25239721 agattctaccttggggactgcatttagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaattg 25239820  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtct 222  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||||||||||| ||||||| | || |||||||||| | |  |    
T  25239821 tgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagactttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgt 25239920  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    ||||| ||  ||| || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25239921 gaaagaggtgtgtcgcgagtaattttgtcaaacgtggtgtttaggctttggagtgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtcca 25240020  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  25240021 gaaca 25240025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 3270546 - 3270766
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagatt----ctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  3270546 agagagtgagggtttagagggagagatagatcctaccttggggactgccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 3270645  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3270646 cacctggctctggtggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgtagtgagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 3270745  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccct 217  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  3270746 ctgttgctccgtgcaccccct 3270766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 328
Target Start/End: Original strand, 13861340 - 13861645
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||  | |||| ||||||     
T  13861340 agattctaccttggggactgcattgagttccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacaccttactctaacagttacgaaatcg 13861439  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtct 222  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||  | ||||| | || |||||||||| | |  |    
T  13861440 tgggaagtgtaactgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtatctttcgttccgtgcacccccctcgcgt 13861539  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    | ||||||  ||| || ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  13861540 ggaaggggtgtgtcgcgagtaattttaccagacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtaaatgagtcaaagatccttttggccggtcca 13861639  T
Q  323 gaacac 328  Q
    ||||||    
T  13861640 gaacac 13861645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9901871 - 9901571
Alignment:
Q  27 ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgg 126  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  9901871 ttctaccttgaggactgctaagagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacacctggctctgacggttacgaaatcgtgg 9901772  T
Q  127 gaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaa 226  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||  |||   | |||| ||||||||||| |   | ||    
T  9901771 gacgtgtaaccgctagagagattattgcgggaatgtccagagagacgttgtggttcatttgaaccgatctagctcgctccgtgcacccccttgcagggaa 9901672  T
Q  227 gggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaac 326  Q
    | ||  ||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||  ||  |||||||| ||| ||||||||    
T  9901671 gaggtgtgtcgcaagtaatattgccaaacgtgatatttgcgcttttgattgtattgagcctaagtaaatgggcataagctccttttgaccgatccagaac 9901572  T
Q  327 a 327  Q
    |    
T  9901571 a 9901571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26780988 - 26780684
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||  | |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |     
T  26780988 agattctaccttggggactgttatgactcccctatacagagaggtggagggctgcagagccgttgtaatgacacaccagactctggtggttacgaaaacg 26780889  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||   ||  ||  |||  | |||||||    | |    
T  26780888 tgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacgtgcagagaaacgttgtggttcgtttgagccggccttgttctctccctacacccccctcacag 26780789  T
Q  224 a-aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    | ||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26780788 agaaggggtgtgtagcaagtaatgttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattgggcctatgtaaatgggccaaaactccttttggccggtcca 26780689  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  26780688 gaaca 26780684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Original strand, 45313174 - 45313476
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||| |||| | ||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||     
T  45313174 agattctaccttggggactgttatgagttccct-tatatagaggtagagggttgcaaatccgttgtaatggcacaccaggctctggcggttacgaaatcg 45313272  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctct-tttgctctgtgcaccccctggtct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||| |  | |||| |||||||| || | |     
T  45313273 tgggaagtgtaaccgccagagagattattg-gggaacgtgcagagagacgttgtagttcgtttgaaccagtctttgctcgctccgtgcaccctctcg-cg 45313370  T
Q  223 ga-aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcc 321  Q
    || ||||||  ||| ||||||||  ||||||||| || || |||||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  45313371 gagaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacatggtgcttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggtcaaagttccttttggccggtcc 45313470  T
Q  322 agaaca 327  Q
    ||||||    
T  45313471 agaaca 45313476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17282660 - 17282415
Alignment:
Q  27 ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgg 126  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| || |||    
T  17282660 ttctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaattcgtgg 17282561  T
Q  127 gaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaa 225  Q
    |||||||||||||  | | |||||||||||||||||  | |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| | || |||||||||| | |  || |    
T  17282560 gaagtgtaaccgcttgtgggtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgttagaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtgga 17282461  T
Q  226 agggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggcttt 271  Q
    |||||  ||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17282460 aggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtctgggcttt 17282415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 8082047 - 8082375
Alignment:
Q  3 agagtgaaggtttagaggaagag---attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacac 99  Q
    ||||||| ||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||  |||||||| |||||    
T  8082047 agagtgagggtttagagaaagagtagattctacattggggactgctaagagtcccctatatatagaggtggaggactgcagagccattgtaatggcacac 8082146  T
Q  100 ctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctctt 199  Q
    |||  ||   | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||  ||        
T  8082147 ctgggtccaacagttacgaaatcgtggaaagtgtaaccgccagagaaataattgcgggaacgtgcaaatagatgttatggctcgtttgaaccggtcctgc 8082246  T
Q  200 ttgctctgtgcaccccctggtctg-aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatggg 298  Q
    |||||| |||||||||||   | | ||||||| | || ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  8082247 ttgctccgtgcacccccttcgcggaaaaggggtaagtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtgaatggg 8082346  T
Q  299 ccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    || ||  ||||||||| ||||||||||||    
T  8082347 cctaagatccttttggacggtccagaaca 8082375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 49402721 - 49403013
Alignment:
Q  26 attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatg 125  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| || ||| ||    
T  49402721 attctactttggggactgctatgagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacaccaggctctggcggttacgagatcgtg 49402820  T
Q  126 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgt--acagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||| |  ||||||||||  |||   |||||||||||||||||| |   |    
T  49402821 gaaagtgtaaccgccatagagattattgcggaaacgtgcagagagagacgttgtagtccgtttgaaccggtcttgcttgctctgtgcaccccctcgcagg 49402920  T
Q  224 aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
     ||||||  ||| | ||||||   ||||||| ||| | ||||||||||||     ||| ||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  49402921 gaaggggtgtgtcgtaagtaatgctgccaaaagtggtatttgggctttag-----attaggcctaagtaaatgggtcaaat---cttttggccggtccag 49403012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 28891910 - 28892243
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaaga---gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  28891910 agagagtga-ggtttagaggaagaatagattctaccttggggactcttaagagtcccctatatatagaggtggagagctgcatagccgttgtaatggcac 28892008  T
Q  98 acctgactc----tggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccat 193  Q
    | |||  ||    |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| || ||||| || ||||||||||||| ||||||||||       
T  28892009 atctgggtccggttggcagttgcgaaatcgtgggaagtgtaaccaccagagaaataattgtggaaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaacagg 28892108  T
Q  194 tctcttttgctctgtgcaccccctggtctga-aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaata 292  Q
    |||   |||||| |||||| ||||   | || |||||| |||| ||||||||  ||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  28892109 tcttgcttgctccgtgcactcccttcgcggagaaggggtatgtcgcaagtaatgttggcaaacgtggtgtttgaactttagattgtattgggcctaaata 28892208  T
Q  293 aatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||| || ||  |||||||| |||||||||||||    
T  28892209 aatggacctaagatccttttgaccggtccagaaca 28892243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18284571 - 18284484
Alignment:
Q  240 agtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18284571 agtaattttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcctaattaaatgggccaaagatccttttggccggtccataaca 18284484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 190
Target Start/End: Original strand, 15455467 - 15455633
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||   ||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||| | | ||||||||  | ||||||||||||||| |    
T  15455467 agattctaccttggggactgctaagagtcttatatatatagaggtggagggatgcaaagtcgttgtgaaggcacacctgtgtttggcggttatgaaataa 15455566  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaac 190  Q
    |||||||||||| ||| |||||  | ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15455567 tgggaagtgtaaacgcaagagaaataattgcagaaacgtgcaaagagacgttgtggctcgtttgaac 15455633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 18284724 - 18284661
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagaga--ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttat 62  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18284724 agagagtgagggtttagaggaagagagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttat 18284661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 327
Target Start/End: Original strand, 3270777 - 3270827
Alignment:
Q  277 gtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  3270777 gtattgggcctaagtaaatgggccaaaagtccttttgaccggtccaaaaca 3270827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 34845632 - 34845514
Alignment:
Q  22 agagattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaat 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||| ||||| | |||||||||||  |  |||| ||  ||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||    
T  34845632 agagattctaccttggggactgcgaggagccccctttatatagaggtgggtgaatgcagagtcgttgtaatggcacacatgtgtctgacggttacgaaat 34845533  T
Q  122 catgggaagtgtaaccgcc 140  Q
    | |||||||||||||||||    
T  34845532 cgtgggaagtgtaaccgcc 34845514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 328
Target Start/End: Original strand, 8168007 - 8168087
Alignment:
Q  248 tgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||| | ||||||||    
T  8168007 tgccaaacatggtgtttgggctttggattgtattggacctaagtaaatgggtcaaaactccttttgcccgattcagaacac 8168087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29164849 - 29165179
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  29164849 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggacggctgcagagccgttgtaatgaca 29164948  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29164949 cacctgactctagaagttacgaaatcgtgggaagtgtaactgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 29165048  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    | || |||| ||||||||||| ||  ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  29165049 cgttcgctccgtgcacccccttgtgggaaaggggtgtgtcacaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgggttgtattgggcctaaataaatg 29165148  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    || ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  29165149 ggtcaaatgt-cgtttggccggtccagaacac 29165179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30770384 - 30770057
Alignment:
Q  3 agagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacaca 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||||    
T  30770384 agagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagtgctgcagagccgttgtaatggcaca 30770285  T
Q  99 cctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctct 198  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| || ||    
T  30770284 cctggctctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaactgccaaagagtttattgcgggaacgtgtagagagacgttgt-gttcgtttgaaccagtccct 30770186  T
Q  199 tttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatggg 298  Q
    || |||| ||||||||||| || || ||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||     
T  30770185 ttcgctccgtgcacccccttgtgtggaaggggtgtgtcgcaagtaacttcgtcaaacgtgatgtttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatggt 30770086  T
Q  299 ccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30770085 tcaaaggtccttttggccggtccagaaca 30770057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 329
Target Start/End: Original strand, 20093566 - 20093868
Alignment:
Q  27 ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgg 126  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| | || ||||||| |||||| |||    
T  20093566 ttctaccttggggactgccgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggccctagcggttacgaaatcgtgg 20093665  T
Q  127 gaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaa 226  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||||||| || || || ||    
T  20093666 gaagtgtaaccaccaaagagcttattgcgggaatgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctgtcgctccgtgcaccctcttgtgtggaa 20093765  T
Q  227 gggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaac 326  Q
    ||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||    
T  20093766 ggggtttgttgcaagtaactttgacaaacgtggtgtttggactttggattgtattggacctaagtaaatgggtcaaagatccttttggccgattcagaac 20093865  T
Q  327 aca 329  Q
    |||    
T  20093866 aca 20093868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 21802450 - 21802779
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| ||||||||| ||    
T  21802450 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggttgagggctacagagccgttgtaatggca 21802549  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  21802550 cacctggctctggtggttacgaaatcgtaggaagtgtaacagcgagagagtttattgcgagaacctgcagagagacgttgtggttcgtctgaaccagtct 21802649  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    | || |||| |||||||||| | |  || |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  21802650 ccttcgctccgtgcaccccccttgcgtggaaggcgtgtgttgaaagtaactttgacaaacgtggtgtttgagctttagattgtattcggcctaagtaaat 21802749  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    | |||||||||| |||| | |||| |||||    
T  21802750 gagccaaatgtcattttagacggttcagaa 21802779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 327
Target Start/End: Original strand, 22705647 - 22705929
Alignment:
Q  45 tgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagag 144  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  22705647 tgtgagtcccgtatttatagaggtggaggactgcagagccattgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcatgggaagtgtaaccggtagag 22705746  T
Q  145 agtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccc-cctggtctgaaagggggatgttgcaagta 243  Q
    | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||| |  || ||||||  |||||||||||    
T  22705747 aatttattgcaggaacgtgcagagaaacgttgtggttcgtttgaactagtctctttcgctccgtgcacccgccttgcatggaaggggtgtgttgcaagta 22705846  T
Q  244 actttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||| |||||||| || |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22705847 actttgtcaaacgtggtg-ttggactttggattgtattgggcctaagtaaatgggtcaaatgtccttttgaccggtctagaaca 22705929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 327
Target Start/End: Original strand, 18153131 - 18153459
Alignment:
Q  3 agagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacac 99  Q
    ||||||| ||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| ||||     
T  18153131 agagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggaatgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgccgagtcgttgtaatggcacag 18153230  T
Q  100 ctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctctt 199  Q
    || |||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  18153231 cttactctgacggttacgaaatggtgggaagtgtaaccgcctgcgagtttattgtgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctt 18153330  T
Q  200 ttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatggg 298  Q
    ||| || |||||||||| | |  || ||||||  ||| || ||||| |||||||||| || ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||    
T  18153331 ttgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacatggtgtttgggctttgtagtgtattgggcctaagtaaatggg 18153430  T
Q  299 ccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18153431 ccaaagatccttttggccggtccagaaca 18153459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9549168 - 9548828
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | ||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||  | ||    
T  9549168 agagagtgagggtttagaggaagagatagattttaccttggggactactttgagtcccctttttataaaggtggagggctgcagagccgttgtagaggca 9549069  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  9549068 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtgtttcgtttgaaccagtct 9548969  T
Q  197 cttttgctctgtg---------caccccctggtctg-aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcc 286  Q
    |  ||||||  ||         | |||||| ||  | |||||||  ||| |||||||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |    
T  9548968 cgcttgctccatgccccccccccccccccttgtgggtaaaggggtgtgtcgcaagtaactataccaaacgtggcgtttgggctttggattgtattgggac 9548869  T
Q  287 taaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9548868 tacgtaaatgggccaaacatccttttggccggtccagaaca 9548828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47295880 - 47295564
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||    
T  47295880 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 47295781  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  47295780 accttactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaacgcttgtgagtttattgcgggaaggtggagagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 47295681  T
Q  198 ttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgg 297  Q
     || | || ||||||||||| |  || || |||  ||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |  ||||||| ||||| |||||||    
T  47295680 cttcgttccgtgcaccccctcgcgtggaatgggtgtgtcgcgagtaatttttccaaacgtggtgtttgggctttgtagtgtattggacctaagtaaatgg 47295581  T
Q  298 gccaaatgtccttttgg 314  Q
    | ||||  |||||||||    
T  47295580 gtcaaagatccttttgg 47295564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21593076 - 21592744
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaagaga--ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||    
T  21593076 agagagtgagggttttagaggaagaaagcttctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgctgagccgttgtaatggcac 21592977  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| | |  || ||||| |||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  21592976 accttactctgacggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgtctgttagcttattacgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 21592877  T
Q  198 ttttgctctgtgca---ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaa 294  Q
    ||| | || |||||   |||||| |  || ||||||  ||| || ||||| || ||||||| || ||||||| |||| ||| ||||||||||||| | ||    
T  21592876 tttcgttccgtgcacccccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaatttagccaaacatggtgtttggactttggatggtattgggcctaagtgaa 21592777  T
Q  295 tgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  21592776 tgggccaaagattcttttggccggtccagaaca 21592744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 51 - 327
Target Start/End: Original strand, 7595403 - 7595684
Alignment:
Q  51 tcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagttta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||||||| | ||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7595403 tcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatagcacacctggcgctggatgttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagttta 7595502  T
Q  151 ttgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcacccc-----ctggtctgaaagggggatgttgcaagtaac 245  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||  | |||| |||||||||     |  ||  | ||||||  ||||||||||||     
T  7595503 ttgcgggaacgtgcagagagacattgtggttcgtttgaaccggtctcgctcgctccgtgcacccccccctcctgtggggaaggggtgtgttgcaagtaag 7595602  T
Q  246 tttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| |||| |||||  |||||  || ||||||||||| | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  7595603 tttgccaagcgtggtgtttaagctttgaattgtattgggcctgagtaaatgggccaaagatccttttgaccggtccaaaaca 7595684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2250164 - 2249860
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | || |||||||||  |||||     
T  2250164 agattctacattggggtttgctatgagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacaccaggctttggcggttacaaaatcg 2250065  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtct 222  Q
    |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||| |||||||||| | |       
T  2250064 tgggaattgtaaccgctagagatattattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtcttgcttgctccgtgcaccccccttgcgg 2249965  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    | ||||||  ||| ||||||||  |||||||||||| | |||| |||||  || ||||||||  ||| ||||| || ||||  |||||||||  ||||||    
T  2249964 ggaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacgtggtatttgagctttgaattgtattgggaataagtaaataggtcaaagctccttttggttggtcca 2249865  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  2249864 gaaca 2249860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 327
Target Start/End: Original strand, 38612620 - 38612888
Alignment:
Q  60 tatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaa 159  Q
    |||||||||||||   |||| ||| |||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  38612620 tatagaggtggagatctgcagagccgttgtaatggtacaccaggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtgtaactgccagagagattattgtgggaa 38612719  T
Q  160 cgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgc-accccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtg 258  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||   |    |||||| |||| ||||||| |   | ||||||  | ||||||||||  ||||||||||||    
T  38612720 cgtgcagagggacgttgtggttcgtttgaaccggccctgcttgctccgtgcaaccccctcgcgaggaaggggtgttttgcaagtaatgttgccaaacgtg 38612819  T
Q  259 atgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
     ||||||||||||  || |||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||    
T  38612820 gtgtttgggctttgaatagtattgagcctaagtaaatgggtcaaagctccttttgaccagtccagaaca 38612888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 18185625 - 18185827
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||| ||| | |||    
T  18185625 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctacgctggggactgcattgagtcccctattaataaatgtggagggctgcagagccgttttaacggcac 18185724  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |  | |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  18185725 accttactctgacggttacgaaatcgcgggaagtgtaaccgcttgcgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 18185824  T
Q  198 ttt 200  Q
    |||    
T  18185825 ttt 18185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21801911 - 21801716
Alignment:
Q  131 tgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaaggg 229  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |  |||   | ||||  | ||||||| | |   || |||     
T  21801911 tgtaaccgccagagaacttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaatcggtcttgctcgctccttacaccccccttgcaggagagga 21801812  T
Q  230 ggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    |  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21801811 gtgtgttgcaagtaagttttccaaacgtggtgtttgggttttagatagtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaa 21801716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30765114 - 30764849
Alignment:
Q  63 agaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgt 162  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||   || | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||    
T  30765114 agaggtggagggctgcagagctgttgtagtggcacacctaggtccgacgggtacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagaaataattgcgggaatgt 30765015  T
Q  163 acagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcac-cccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatg 261  Q
     || |||||| |||||| ||| |||||||| ||    ||||||||||||| ||||| |     |||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |    
T  30765014 gcaaagagacattgtggttcgcttgaaccagtcctgcttgctctgtgcactcccctcgcggtgaaggggtatgtcgcaagtaaatttgccaaacgtggag 30764915  T
Q  262 tttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||  ||||  ||| ||||||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||| |||||||||    
T  30764914 tttaagcttgggattgtattggacctaagtaaatggacctaaagcccttttggccgatccagaaca 30764849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22703896 - 22704001
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  22703896 agagagtgagggtttagaggacgagatagattctaccttggggactgctgtgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 22703995  T
Q  97 cacctg 102  Q
    ||||||    
T  22703996 cacctg 22704001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28794200 - 28794078
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||   || |||||||| ||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||     
T  28794200 agattctaccttggggactgttaagagtcccctatatataaaggtgagtggctgcatagccgttgtaatggcacacgtgtgtctgacggttacgaaatcg 28794101  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagag 146  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28794100 tgggaagtgtaaccgccagagag 28794078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 14)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23756018 - 23755687
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | ||| ||||||||| ||    
T  23756018 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgagtcccctatttatagaggtggaaggctgtagagccgttgtaatggca 23755919  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||     
T  23755918 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcttttgaaccagtca 23755819  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |||| |||| ||||| |||||| |  || ||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||    
T  23755818 ctttcgctccgtgcaccccccttgcttggaaggggtgtgttgcaagtaactttaccaaacatggtgtttgggctttggattgtattgggcctaggtaaat 23755719  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23755718 gggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 23755687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 3770260 - 3770591
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  3770260 agagagtgagggtttaaaggaagagatagattctaccttggggactgttgtgaatcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 3770359  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  3770360 cacctggctctggcggttacaaaatcgtggaaagtgtaaccgctagagagtttattgcggaaacgtgcagagagacgttgaggttcgtttgaaccagtct 3770459  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    || | ||||  |||| |||||| |  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  3770460 ctctcgctccatgcaccccccttgagtggaaggggtgtgttgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgaattgtattgggcctaagtaaat 3770559  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3770560 gggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 3770591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41266368 - 41266065
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||     
T  41266368 agattctaccttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgatatcg 41266269  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | || |||| ||||||||| | | |||    
T  41266268 tgagaagtgtaaccgcccgagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtcac-ttcgctccgtgcaccccattgcctg 41266170  T
Q  224 aaa-gggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||| ||||||||    
T  41266169 aaagggggggtgttgcaagtaactttgccaaacatggtgtttggattttggatcgtattgggcctaagtaaatgggtctaaaatccttttgaccggtcca 41266070  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  41266069 gaaca 41266065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 3105204 - 3105540
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  3105204 agagagtgaggttttagaggaagagttagattctaccttggggactgctatgagtcccatatttatagaggtggaggattgtagagccgttgtaatgaca 3105303  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3105304 cacctaactctcatggttatgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtct 3105403  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaaggggg-atgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |  | ||||||||||| |||| ||  |||||||||  ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||    
T  3105404 cgctcgctctgtgcactcccttgtgggaaagggggtgtgtcgcaagtaatgttgtcaaacgtggtgtttgggctttggattgtgttgggcctaagtaaat 3105503  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaacacaaat 332  Q
    || | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  3105504 ggactaaaggtccttttggccagtccagaacaaaaat 3105540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25134133 - 25133792
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||    
T  25134133 agagaatgatggtttagaggaagagatagattctaccttagggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggca 25134034  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25134033 cacctggctctggcggttacgaaatcgtggtaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 25133934  T
Q  197 cttttgctctgtgca----------ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcc 286  Q
    |  |||||| |||||          ||||||  |  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  25133933 cgcttgctccgtgcaccccccaccccccccttttaggaaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttggattgtaatgggcc 25133834  T
Q  287 taaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    ||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||    
T  25133833 taagtaaatgggtcaaagatctttttggcccgtccagaacac 25133792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42534295 - 42534032
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  42534295 agattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacatctggctctggcggttacgaaatcg 42534196  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtct 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||  | |||  ||||| |||||| ||      
T  42534195 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaacaggtctcgctcgctacgtgcaccccccttgtgg 42534096  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcc 286  Q
    ||||||||  ||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  42534095 gaaaggggagtgtcgcaagtaaggttgacaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcc 42534032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27347171 - 27347500
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag--attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacaca 98  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||||||| | || ||| ||||||||| ||||    
T  27347171 agagagtgatggttttgaggaagagagattctaccttggggactgcattgaatcccctatgtatagacgtggagggctacaaagccgttgtaatggcaca 27347270  T
Q  99 cctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctct 198  Q
    ||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  27347271 cctaacactgacggttacgaaatcatgggaagtgtaactgcctatgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctct 27347370  T
Q  199 tttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatggg 298  Q
    || | | ||||||||||||    || ||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  27347371 ttcgttatgtgcaccccctctcatggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcttaagtaaatggg 27347470  T
Q  299 ccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  27347471 ccaaagatccttttgaccggtccagaacac 27347500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26155131 - 26154850
Alignment:
Q  48 gagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26155131 gagtcccctatttatagaggtggagggctgcatagccgttataatggcacacctggctatggtggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagcgt 26155032  T
Q  148 ttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaact 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||||| |||||| || || |||||   ||| ||||||||||    
T  26155031 ttattgcgggaacgtacaaagagatgttgtggttcgtttgaactaatctctttcgctccgtgcaccccccttgtgtggaagggatgtgtcgcaagtaact 26154932  T
Q  247 ttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||    
T  26154931 ttgccaaacgtggtgtttgaactttaaattatattggacctaagtaaatgggtcaaaagtccttttgactgatccagaacac 26154850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 19092731 - 19093051
Alignment:
Q  11 ggtttagaggaagagatt----ctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactc 106  Q
    |||||||||||||||||     |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  19092731 ggtttagaggaagagataaatcctaccttggggactgctatgagtcccctatatatagaggtggggggctgcagagccgttgtaatgacacaccagactc 19092830  T
Q  107 tggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctct 206  Q
    | ||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||  || ||||     
T  19092831 tcgcggtttcgaacttgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtcttgttcgctcc 19092930  T
Q  207 gtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgt 306  Q
    ||||||||||| ||    |||||   ||| ||||||||  || |||||| || ||||||||||||  ||  |||||||||||| |||||||  ||||| |    
T  19092931 gtgcaccccctcgtggagaagggatgtgtcgcaagtaatgttaccaaacatggtgtttgggctttgaataatattgggcctaagtaaatggatcaaatct 19093030  T
Q  307 ccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||| ||| |||||||||    
T  19093031 ccttttgtccgatccagaaca 19093051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 23929797 - 23929991
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  23929797 agagagtgagggtttagaggaagagttagattttaccttggggactgcagtgagtcccctatataaagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 23929896  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaacc 191  Q
    |||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||    
T  23929897 cacctggctctggcggttacggaatcgtgggaagtgtaaccgccggagagtttattgtgggaacgtgcagagagacattgtggttcatttgaacc 23929991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 29568315 - 29568507
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaaga----gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    |||||||  |||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||  |    
T  29568315 agagagtgagggtttagaggaagacatagattctaacttggcggttgctatgagtccccaatttatagaggtggagggctacagagccgttgtaatggta 29568414  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaac 190  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29568415 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgctagagagtttattgc-ggaacgtgtagagagacgttgtggctcgtttgaac 29568507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26159233 - 26159156
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggaggg 74  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26159233 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgggaactgctttgagtcccctatttatagaggtggaggg 26159156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 328
Target Start/End: Original strand, 23932920 - 23933011
Alignment:
Q  237 gcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    ||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23932920 gcaagtaatgttgtcagacgtggtgtttgggctttggattgtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtctagaacac 23933011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26159146 - 26159096
Alignment:
Q  277 gtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26159146 gtattgggcctaagtaaatgagccaaaagtccttttggccggtccagaaca 26159096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 391459 - 391791
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  391459 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggca 391558  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  391559 cacctggctctggcggttacgaaattatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacctgcagagagacgttgtggttcgtttgaactagtct 391658  T
Q  197 cttttgctctgtgca--ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaa 294  Q
    |  | |||| |||||  |||||| |   ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  391659 cgctcgctccgtgcacccccccttgcgggaaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaccgtggtgtttggggtttggattgtattggacctaagtaaa 391758  T
Q  295 tgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  391759 tggaccacaggtccttttggtcggtccagaaca 391791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Original strand, 380763 - 381092
Alignment:
Q  2 gagagtgaaggtttagaggaagagat---tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacaca 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||    
T  380763 gagagtgagggtttagaggaagagatagatttaccatggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcaca 380862  T
Q  99 cctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctct 198  Q
    |||| |||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  380863 cctggctctggaggttacgaaattgtgagaagtgtaaccgccagagactttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctcg 380962  T
Q  199 tttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgg 297  Q
     | |||| |||||||||| | |   ||||||||  || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  380963 ctcgctccgtgcaccccccttgcaggaaaggggtgtggtgcaagtaagtttgccaaccatggtgtttgggctttggattgtattgggcgtaagtaaatgg 381062  T
Q  298 gccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  381063 gccacatgtccttttggccggtccataaca 381092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32009213 - 32008884
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    | ||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||    
T  32009213 agagagtgagggtttagaggaagagatagattttaccttggggagtactttgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggca 32009114  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  32009113 cacctgactctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaatcgctagagagattattgcgggaacgtgcagagagacgctgtggttcgtttgaaccagtct 32009014  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||  | ||||||  |||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||    
T  32009013 ctttcgctccgtgcacccccttgtgaggaaggggtgtgtcacaagtaactttgtcaaacgtggtgtttgggctttcgattgtattgggcctaagtatatg 32008914  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaac 326  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32008913 ggtcaaaggtccttttggccggtccagaac 32008884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18574180 - 18573889
Alignment:
Q  34 ttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgt 133  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18574180 ttggggaatgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgt 18574081  T
Q  134 aaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaaggggga 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||| || || |||||       
T  18574080 aaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccactctcttttgctccatgcaccccccttgtgtggaagggatg 18573981  T
Q  233 tgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccaga 324  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  18573980 tgtcgcaagtaactttgccaaacgtggtgtttgggctttgcattgtattaggcctaagtaaatggaccaaaaatccttttggccggtccaga 18573889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 7999650 - 7999984
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||    
T  7999650 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgccgtgagtctcctgtttatagaggtggaggactgca--gccgttgtaatgaca 7999747  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  7999748 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacatgcagagagacgttgtggttcgttggaaccagtct 7999847  T
Q  197 cttttgctctgtgcac-cccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    || | |||| |||||| | ||| || || ||||||  ||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||| | | ||| ||||||||||||| |||||    
T  7999848 ctgtcgctccgtgcactcgccttgtgtggaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgcggtgttcgggttgtggattgtattgggcctaagtaaat 7999947  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaacacaaat 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7999948 gggccaaatgtccttttggccggtccagaacaaaaat 7999984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18040680 - 18040357
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagatt----ctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||| ||    
T  18040680 agagagtgaaggtttagaggaagagattgattctaccttggggactgct-tgagtcccctatttatagaggtggagagctgcagagccgttgtaatggca 18040582  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18040581 cacctggctctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 18040482  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccc-cctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |||| |||| |||||||| ||| || || ||||||  |||  |||||||||||||      || |||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||    
T  18040481 ctttcgctccgtgcacccaccttgtgtggaaggggtgtgtcacaagtaactttgc------tggtgtttgggctttggattatatt-ggcctaagtaaat 18040389  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18040388 gggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 18040357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41281008 - 41280672
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaag---agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| |||    
T  41281008 agagagtgaaggtttcgaggaaggttagattctaccttggggactgttatgagtcccctatttatagaggtggaggactgcagagccgttgtaatggcac 41280909  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||     
T  41280908 acctgactctgggggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagag-cgttgtggctcgtttgaaccggtctt 41280810  T
Q  198 ttttgctctgtgca--ccccctggtctgaaaggggg-atgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaa 294  Q
      | |||| |||||  |||||| ||  |||||||||  ||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  41280809 gctcgctccgtgcacccccccttgtgcgaaagggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacatggtgtttgggctttggattgtgttgggcctaagtaaa 41280710  T
Q  295 tgggccaaatgtccttttggccggtccagaacacaaat 332  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41280709 tgggtcaaaggtccttttgtccggtccagaacaaaaat 41280672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 24033762 - 24034053
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatag---aggtggagggttgcatagctgttgtaatg 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24033762 agagagtgaaggtttagaggaagagatagattctacattggggactgctatgagtcccctagttataatataggtggagggttgcagagccgttgtaatg 24033861  T
Q  94 acacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccat 193  Q
     ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  24033862 gcacacttgactttggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacattgtggttcgtttgaaccag 24033961  T
Q  194 tctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattggg 284  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||| ||  ||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||| ||||||||    
T  24033962 tctcgttttctccgtgcaccccccttgtgggaaaggggtgtgacgcaagtaactttgccgaacgtggtgtttaggatttggattgtattggg 24034053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 2085942 - 2085642
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| ||    
T  2085942 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagaaccgttgtaatggca 2085843  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| | |||    
T  2085842 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaattgccaggtcgtttattgcgggaacatgcagagagacattgtggttcgtttgaactagtct 2085743  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |||| |||| ||| | |||||| |  || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  || | ||||||||||| |||||    
T  2085742 ctttcgctccgtgtaccccccttgcttggaaggggtgtgttgcaagtaacttttccaaacgtggtgtttaggctttgaattgcattgggcctaagtaaat 2085643  T
Q  296 g 296  Q
    |    
T  2085642 g 2085642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7454866 - 7454521
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||    
T  7454866 agagagtgagggtttacaggaagagatagattctaacttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtggaaggctgcagagccgttgtaatggca 7454767  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  7454766 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtcatagagtttattgtgggaacgtgcatagagacgttgtggctcgtatgaaccggtct 7454667  T
Q  197 cttttgctctgtgca--------------ccccctggtctga-aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtatt 281  Q
    |  | |||| |||||              |||||  | | || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| || ||    
T  7454666 cgctcgctccgtgcacccccccccccccccccccccggcggagaaggggtgtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggagtttgggctttggattgtgtt 7454567  T
Q  282 gggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7454566 gggcctaagtaaataggccaaagatccttttggccggtccagaaca 7454521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Original strand, 25820743 - 25821047
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||     
T  25820743 agattctaccatggggactgcattgagtcccctatttttagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaatcg 25820842  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtct 222  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||||||| |  |  |||| | |  ||||| ||||||         
T  25820843 tgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgctggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaatcggttcctttcgtttcgtgcacccccctcacac 25820942  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    | |||| |  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  25820943 ggaaggtgtttgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattcggcccaaataaattggccaaagatccttttggccggtcca 25821042  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  25821043 gaaca 25821047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Original strand, 11709396 - 11709562
Alignment:
Q  25 gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcat 124  Q
    |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||  ||| |||||| |    
T  11709396 gattctacctttcggactgctgagagtcccctatatatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacaccaggctctggcatttacgaaatcgt 11709495  T
Q  125 gggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaacc 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11709496 gggaagtgtaaccgccagagagattattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaacc 11709562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10532960 - 10532801
Alignment:
Q  26 attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatg 125  Q
    ||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10532960 attctaccttggggactccattaagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctgactctggcggttacgaaatcgtg 10532861  T
Q  126 ggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtt 185  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  10532860 gaaagtgtaaccgccagggtgtttattgcaggaacgtggagagagacgttgtggttcgtt 10532801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Original strand, 24060562 - 24060888
Alignment:
Q  5 agtgaaggtttagaggaag----agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacc 100  Q
    ||||| |||||||||||||    ||||||||| |||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  24060562 agtgagggtttagaggaagcgatagattctaccttggagactgctaagagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatggcacacc 24060661  T
Q  101 tgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttt 200  Q
     | ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||| ||||| |||||  |||   |    
T  24060662 aggctctggcggttacaaaatcgtaggaagtgtaactgccagagagattattgcaggaacatgcagagagatgttgtggttcgttagaaccggtcttgct 24060761  T
Q  201 tgctctgtgcacc-ccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggc 299  Q
    ||||| ||||||| |||| |   | ||||||  ||| ||||||||  || || |||||| | ||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24060762 tgctccgtgcacctccctcgcggggaaggggtgtgtcgcaagtaatgtttcctaacgtggtatttcgactttggattgtattgggcctaagtaaatgggc 24060861  T
Q  300 caaatgtccttttggccggtccagaac 326  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  24060862 caaagctccttttgaccggtccagaac 24060888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22609631 - 22609363
Alignment:
Q  60 tatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatg--acacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcggg 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||| |||  ||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  22609631 tatagaggtggagggttgcagagtcgttgtgatggtacacacctggctctggcggttacgaaatcgtgagatgtgtaaccgacagagagtttattgcgtg 22609532  T
Q  158 aacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgt 257  Q
    ||| | ||||||||  | |||| |||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||| |   | |||||   |||||||| |||  ||| ||||| |    
T  22609531 aacatgcagagagatatcgtggttcgtttgaaccaatctcgctcgctccgtgcaccccctcgcagggaagggatgtgttgcaaataatgttgtcaaacat 22609432  T
Q  258 gatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  22609431 ggtgtttgggctttggat-gtattgggcctaagtaaatggatcaaagatccttttggtcggtccagaaca 22609363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33273679 - 33273391
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||         |||       |     
T  33273679 agattctaccttggggactcctatgagtcccctatttatagaggtggagggttgcagagccgttgtaatggcacacttg---------gtt-------cg 33273596  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtct 222  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||   | ||||   |||||||| | |       
T  33273595 tgggaagtgtaaccgccatagaacttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaaccggtcttgctcgctcctcgcaccccccttgcgg 33273496  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    || | | |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  33273495 gagaagagtgtgttgcaagtaaatttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtattaggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggtcggtcca 33273396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 164 - 303
Target Start/End: Original strand, 17775787 - 17775926
Alignment:
Q  164 cagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtt 263  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| || |||||||| || || ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17775787 cagagagacgttgtggttcgattgaaccagtctctttcgctccgtacacccccttgtgtggaaggggtgtgtcgcaagtaactttgccaaacgtgatgtt 17775886  T
Q  264 tgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaa 303  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||    
T  17775887 tgggctttggattgtattggacctaggtaaatgggccaaa 17775926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 10532800 - 10532629
Alignment:
Q  137 cgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgt 235  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||| | |||||| |  || ||||||  ||     
T  10532800 cgccagggtgtttattgcaggaacgtggagagagacgttgtggttcgtttgaaccaatctctttcgcttcgtgtaccccccttgcatgtaaggggtgtgc 10532701  T
Q  236 tgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtc 307  Q
     ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10532700 cgcaagtatctttgccaaacgtggcgtttgagctttgaatggtattgggcctaagtaaatgggtcaaatgtc 10532629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Original strand, 11709621 - 11709709
Alignment:
Q  237 gcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    ||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  11709621 gcaagtaatattgtcaaacgtggtatttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaa 11709709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 1788651 - 1788733
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcat 80  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1788651 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggtgactgcattgagtctcctatttatagaggtggagggctgcat 1788733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 2 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30256 - 29926
Alignment:
Q  2 gagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| |  ||    
T  30256 gagagtgaggatttagaggaagagatagattctaccttagggactgctgtgagtcccgtatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaacggaac 30157  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  30156 acctggctctggtggttacgaaattgtgggaagtgtaacctccagagattttattgcgggaacgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctc 30057  T
Q  198 ttttgctctgtgcacc-ccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    ||| |||| ||||||| |||| |  || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||    
T  30056 tttcgctccgtgcacctcccttgcatggaaggggtgtgttgcatgtaactttgccaaacgtgctgtttgggctttggattgtgttgggcctaattaaatg 29957  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29956 ggccaaaggtccttttggccggtccagaaca 29926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 9e-81; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28068223 - 28067891
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagaga----ttctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  28068223 agagagtgagggtttagaggaagagagagattctaccttagggactgctatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 28068124  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  28068123 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccggagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgaggctcgtttgaaccagtct 28068024  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggc-tttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |  | |||| ||||||||||| | | |||| || | |||||||||||| ||||||||||||| || ||| || ||| ||| ||||||||| ||| ||| |    
T  28068023 cgctcgctccgtgcacccccttg-cggaaaaggaggtgttgcaagtaagtttgccaaacgtggtgcttgtgcttttggattgtattgggcgtaagtaagt 28067925  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaacaca 329  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28067924 gggtcaaagatccttttggccggtccagaacaca 28067891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 5931190 - 5931521
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||    ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  5931190 agagagtgagggtttagagggagagatagattctatcttggggactgtcgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatgaca 5931289  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  5931290 cacctggttctggcggttatgaaatcgtgggaagtgcaaccgccagagagtttattgcgggaatgtgtagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 5931389  T
Q  197 cttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    || | |||| ||||| |||||| || || ||||||  |||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||    
T  5931390 ctatcgctccgtgcaccccccttgtgtggaaggggtgtgtcacaagtaattttgccaaacgcgatgtttgggttgtggattgtattgggcctaagtaaat 5931489  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  5931490 gggccaaaggtacttttggccagtccataaca 5931521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 23495349 - 23495678
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaagag--attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||    
T  23495349 agagagtgaaggttttagaggaagagagattctacattggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 23495448  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||  ||||    
T  23495449 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccggtctc 23495548  T
Q  198 ttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgg 297  Q
    ||| | || ||||||||||| |  || ||||||  ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||    
T  23495549 tttcgttccgtgcacccccttgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgcaaaacgtggtgtttgggctttggatgatattgagcctaagtaaatgg 23495648  T
Q  298 gccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    | ||||  |||||||| |||||||| ||||    
T  23495649 gtcaaagatccttttgcccggtccaaaaca 23495678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15620364 - 15620059
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||      
T  15620364 agattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaggtgaagggctgtagagctgttgtaatggcacacttggctctgacggttacgaaattg 15620265  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  | |||| || |||||||| |   |    
T  15620264 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgtgggaacgtgcagagagacgttgtggctcgtttgaacccgtctcgctcgctccgtacacccccttgcaag 15620165  T
Q  224 aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
     ||||||   ||||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||     
T  15620164 gaaggggtgcgttgcaagtaagtttgtcaaacgtggcgtttggactttggattgtattaggcctgaataaataggccaaatatccttttgcccgatccat 15620065  T
Q  324 aacaca 329  Q
    ||||||    
T  15620064 aacaca 15620059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 37 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33622653 - 33622365
Alignment:
Q  37 gggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggt---tatgaaatcatgggaagtgt 133  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| ||||   || |||||| ||||||||||    
T  33622653 gggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaattacacaccttactctgacggtggttacgaaatcctgggaagtgt 33622554  T
Q  134 aaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggat 233  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    || ||||||  |    
T  33622553 aaccgcctgtgagtttattgctggaacgtagaaagagacgttggggttcgtttaaaccagtctctttcgttctgtgcaccccctcacgtggaaggggtgt 33622454  T
Q  234 gttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    || || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  33622453 gtcgcgagtaattttgccaaacatgatgtttgggctttggattgtattgggcttaagtaaatgggtcaaagatccttttggccggtcca 33622365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20899795 - 20899465
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||| |||    
T  20899795 agagagtgagggttttagaggaagaaagattcaaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggagggctgcagattcgttgtaatggcac 20899696  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  20899695 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctc 20899596  T
Q  198 ttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatg 296  Q
    ||| | || |||||||||| | |  || ||||||  ||| || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||| | ||||    
T  20899595 tttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgagtaatttttccaaacgtggtgtttgggctttggatggtactgggcttaagtgaatg 20899496  T
Q  297 ggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  20899495 ggccaaagatccttttggctggtccagaaca 20899465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 36712848 - 36712519
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||    
T  36712848 agagagtgagggtttgagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggcac 36712749  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| || | || ||||||||| ||||||  | |||||||||| || |||||||||| | ||||    
T  36712748 acctaactctgacggttacgaaatcgtggaaagtgtaaccacctgcgattttattgcgagaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaactagtctc 36712649  T
Q  198 ttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgg 297  Q
    ||| | || ||||||||||| |  || ||||||  ||| ||  |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  36712648 tttcgttccgtgcaccccctagcgtggaaggggtgtgtcgcgggtaattttgccaaacgtggtgtttaggctttggagtgtattgggcctaagtaaatgg 36712549  T
Q  298 gccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    | ||||  ||||||| ||| ||| ||||||    
T  36712548 gtcaaagatccttttagccagtctagaaca 36712519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 42792508 - 42792700
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  42792508 agattctaccttggggattgttatgagtcccctagttatagaggtggagggctgcagagcagttgtagtggcacacctggctctggcggttacgaaatcg 42792607  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  42792608 tgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgcagagatacgttgtgactcgtttgaaccggtctcgcttgctctgtgcaccccc 42792700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41037854 - 41037524
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttataga---------ggtggagggttgcatagctgtt 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||         ||||||||| |||  ||| |||    
T  41037854 agagagtgagggtttagaggaagagatatattctaccttggggactgctatgagtcccctatttatagaatttatagaggtggagggctgcggagccgtt 41037755  T
Q  88 gtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttg 187  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| | | || ||||    
T  41037754 gtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgtgaacgtgcagacagatgttatcgttcatttg 41037655  T
Q  188 aaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcc 286  Q
    ||||| ||||  |||||  ||||| |||||| | | ||||| ||  |||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||| | |    
T  41037654 aaccagtctcgcttgcttcgtgcaccccccttgccggaaagtggtgtgttgcaagtaagtttgccaaccgtagtgtttgggctttggattgtattgagtc 41037555  T
Q  287 taaataaatgggccaaatgtccttttggccg 317  Q
    ||| |||||||| || | |||||||||||||    
T  41037554 taagtaaatgggtcataggtccttttggccg 41037524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5590870 - 5590622
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||      
T  5590870 agattctaccttggggactgcattgaatcccctatttatagaggtggagggcagcagagccgttgtaatggcacaccttactctgacggttacgaaattg 5590771  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccc-cctggtct 222  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |  |    
T  5590770 tgggaagtgtaaccgcctgcgagtttattgcgggaatgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttctgtgcaccctcctcgcgt 5590671  T
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggcttt 271  Q
    ||||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5590670 gaaaggggtctgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggcttt 5590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 8244511 - 8244846
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    ||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  || || ||| ||    
T  8244511 agagagtgagggttttgaggaagagatagattctaccttgaggactgatgtgagtcccttatttatagaggtggagggctgcagagtcgt-gtgatggca 8244609  T
Q  97 cacc------tgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaac 190  Q
    || |      || |||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  8244610 catcattacatggctctggcggttacgaaatcgtggaaagtgtaatcgctagagagtttattgggggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaac 8244709  T
Q  191 cattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaa 290  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||| |  || ||||||  ||||||||||||||  |||||| | | ||||| | |||| ||| |||||  ||||||     
T  8244710 cagtctctttcgctccgtgcacccccttgcgtggaaggggtgtgttgcaagtaactcagccaaatgcggtgtttagactttggattgtattaagcctaag 8244809  T
Q  291 taaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  8244810 taaatgggctaaaattccttttggccggtccagaaca 8244846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22922838 - 22922645
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||    
T  22922838 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggattgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctacagagccgttgtagtgaca 22922739  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaac 190  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22922738 cacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgctgaaacatacagagagaggttgtggttcgtttgaac 22922645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22922241 - 22922050
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||| |||||    
T  22922241 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttgggaactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctacagagccgttgtagtgaca 22922142  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttga 188  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22922141 cacctggctctggtggttacaaaatcgtgggaagtgtaaccgccagaaagtttattcctgaaacgtacagagagacgttgtggttcgtttga 22922050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Original strand, 38608294 - 38608437
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  | || ||| |||||   | |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  38608294 agattctaccttagggactgcattgagtcccctatttatagaggtggaggtctacagagccgttgtggaggcacacctggctctggcggttacgaaatcg 38608393  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacaga 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38608394 tgggaagtgtaaccgccaaagagtttattgcgggaacgtgcaga 38608437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 128 - 327
Target Start/End: Original strand, 13537860 - 13538060
Alignment:
Q  128 aagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaa 226  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||||| || || ||||||||| ||||||| | || || ||||||| | |  || ||    
T  13537860 aagtgtaaccggctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcatttgaaccagtctctttcgttccgtacacccccctcgcgtggaa 13537959  T
Q  227 gggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaac 326  Q
    ||||  ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||  |||||||||||    
T  13537960 ggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtgatgtttgggctttggatggtattgggcctaagtaaatggaccaaatattcttttgatcggtccagaac 13538059  T
Q  327 a 327  Q
    |    
T  13538060 a 13538060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19330035 - 19329817
Alignment:
Q  86 ttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtt 185  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||    
T  19330035 ttgtaatggcacaccaagctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagattattgcgggaacatgcagagtaacgttgtggctcgtt 19329936  T
Q  186 tgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattggg 284  Q
    ||||||  |||   || ||| ||||| |||||| |   | |||||   | | ||||||||  |||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||    
T  19329935 tgaaccggtcttgctttctccgtgcacccccctcgcagggaagggatgtctcgcaagtaatgttgccaaacgtggtatttgggctttgaattgtattggg 19329836  T
Q  285 cctaaataaatgggccaaa 303  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  19329835 cctaagtaaatgggccaaa 19329817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 327
Target Start/End: Original strand, 22510101 - 22510312
Alignment:
Q  117 gaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccc-c 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  | ||||||||||  | |||||| ||||| ||||||| | || |||||||| |    
T  22510101 gaaatcgtgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttggagttcgttttaaccagtctctttcgttccgtgcacccac 22510200  T
Q  216 ctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggc 315  Q
    || |  || ||||||  ||| ||  |||| |||  |||||||| ||||||  ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  22510201 ctcgcgtggaaggggtgtgtcgcgggtaattttatcaaacgtggtgtttgaactttatagtgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggc 22510300  T
Q  316 cggtccagaaca 327  Q
    ||||||||||||    
T  22510301 cggtccagaaca 22510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 327
Target Start/End: Original strand, 24095343 - 24095523
Alignment:
Q  148 ttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaact 246  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| || | |||||||||  ||||  |||||| ||||| |||||| |   | | ||||  ||  |||||||||     
T  24095343 ttattgcgggaacgtgcaaagagacgttggggtttgtttgaaccggtctcgcttgctccgtgcatccccctcgcgcggacggggtgtgccgcaagtaacg 24095442  T
Q  247 ttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24095443 ttgccaaacgtggtatttgggctttggattgtattgggcctaagtagatgggccaaaactccttttggccggtccagaaca 24095523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1237 - 909
Alignment:
Q  4 gagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacac 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  ||||    
T  1237 gagtgagggtttagaggaagagatagattctacgttggagactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctacatagccgttgtaatggaacac 1138  T
Q  100 ctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctctt 199  Q
    ||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||      
T  1137 ctggctctagcgattacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccatagagtttattgcaggaacatgcagagaaacgttgtggttcgtttgaaccagtctcgc 1038  T
Q  200 ttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatggg 298  Q
    | |||| |||||||||| | ||    |||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  1037 tcgctccgtgcacccccttcgtggagaaggggtatgctgcaagtaagtttgctaaacgtggtgtttgggctttggattgtattggacctaagtaaatggg 938  T
Q  299 ccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  937 ccaaaggtccttttgaccggtccagaaca 909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16476 - 16185
Alignment:
Q  36 ggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaa 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  16476 ggggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaatggtacacctggctctggcggttacaaaatcgtgggaagtgtaa 16377  T
Q  136 ccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgt 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| ||  ||||||||  |||    
T  16376 ccaccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagatgttgtggttcgtttgaaccagtctcattcgctccgtgcacccccttgtgggaaaggggtgtgt 16277  T
Q  236 tgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
     ||| |||||||| |||||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16276 cgcatgtaacttttccaaacatagtgtttgggctttgggttgtattgggcctaagtaaatggaccaaaggtccttttggccagtccagaaca 16185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 2 - 249
Target Start/End: Original strand, 1609 - 1861
Alignment:
Q  2 gagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||| ||     
T  1609 gagagtgagggtttagaggaagagatagattctacattggggactgttgtgagtcccctatttatagaggtggatggctgcagagccgttgtaatggcat 1708  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagag-tttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    || || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  1709 acttggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagttttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccaatct 1808  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttg 249  Q
    |||| |||| | ||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  1809 ctttcgctccgggcacccccttgtgtggaaggggtatgttgcaagtaactttg 1861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 15365 - 15517
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    |||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||    
T  15365 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccgcggggactgttatgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgcaatggca 15464  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagttt 149  Q
      |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15465 tgcctgactctggcggttactaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagttt 15517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 225 - 300
Target Start/End: Original strand, 15528 - 15603
Alignment:
Q  225 aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggcc 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||   || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  15528 aaggggtatgttgcaagtaactttgccaaacgcgttgtttgagcttggtattgtattgggcataagtaaatgggcc 15603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 47615 - 47396
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  47615 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctttgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggca 47516  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||| || ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47515 cacttggctctggcggttacaaaattgtgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtct 47416  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccc 216  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  47415 ctttcgctccgtgcaccccc 47396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 56317 - 56229
Alignment:
Q  237 gcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | | ||||||||    
T  56317 gcaagtaacttcgccaaacgtggtgtttgggctttggattgtattgggcctaagtaaatgggccaaaggtcctttttgtcagtccagaa 56229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 151490 - 151164
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||  |    
T  151490 agagagtgagggtttaaaggaagagatagattctaccttagggaatgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggaa 151391  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
     ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  151390 gacctggctctagcggttacgaaatcgtgggaagtg-aaacgccagagagtttattgcaggaacgtacagagagacgttgtggttcgtttgaatcggtct 151292  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |  | |||| |||||||||| | ||  | |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||    
T  151291 cgctcgctccgtgcaccccctttgtggggaaggggtatgctgcaagtaagtttgccaaacgtagtgtttgggctttggattgtattaggcctaagtaaat 151192  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  151191 gggccaaagatccttttggccggtccag 151164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 5e-67; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 328
Target Start/End: Original strand, 19790346 - 19790607
Alignment:
Q  68 tggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacaga 167  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19790346 tggagggctgcagagccgttgtaatggcacacctgactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgtcagagagtttattgtgggaacgtgcaga 19790445  T
Q  168 gagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca-ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgg 266  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||  | |||||||    
T  19790446 gagacgttgtggttcgtttgaaccagtctctttcgctctgtgcaccccccttgtctggaaggggcgtgtcgcaagtaactttaccaaacacggtgtttgg 19790545  T
Q  267 gctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    | ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||    
T  19790546 gttttggatggtattgggcctaagtaaatgggccaatgatccttttggccagtccataacac 19790607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 22915052 - 22915379
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||  |    
T  22915052 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctatgagtcccctatttataaaggtggagagctgcagagccgttgtaatggta 22915151  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  22915152 cacttggctccggcggttatgaaatcgtgggaagtgtaacagctagagagtttattgcgggaacgtgaagagagacgttgtgattcgtttgaactagtct 22915251  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaaggggg-atgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |  | |||| ||||||||| ||  | | |||||||  ||||||||||||  ||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  22915252 cgctcgctccgtgcaccccttg--cgggaagggggtgtgttgcaagtaaacttgtcaaacgtggtgtttgcgcttcagattgtattgggcctaagtaaat 22915349  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22915350 gagccaaatgtccttttgaccggtcaagaa 22915379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16853181 - 16853014
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||     
T  16853181 agattctcccttggggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaatatgttgtaatggcacacctggctctggcggttacgaaatcg 16853082  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaacc 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16853081 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcggtaacgtgcagagagacgttgtggcttgtttgaacc 16853014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 16914706 - 16915008
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||    ||| | |||||||||| |  ||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| ||    
T  16914706 agagagtgagggttttgaggaagagatagattctgctttggggactgttaagagccctctatatatagaggtggagggctgcagagccattgtaatggca 16914805  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    ||  |   ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   |||||  | ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||     
T  16914806 cagatcggtctggcggttacgaaatcgtgggaggtgtaaccagtagagaaataattgcgggaacgtgcaaagagacgttgcggctcgtttgaaccggtcc 16914905  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaaggggg-atgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
     | |||||| || |||||||    | || |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||    
T  16914906 ttcttgctccgttcacccccctcacggagagggggtatgtcgcaagtaagttttccaaacgtggtgtttgggtatgggattgtattgggcctaagtaaat 16915005  T
Q  296 ggg 298  Q
    |||    
T  16915006 ggg 16915008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 19773414 - 19773462
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggag 72  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19773414 agattctaccttggggactgctgtgagtctcctatttatagaggtggag 19773462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 190
Target Start/End: Original strand, 44635826 - 44635940
Alignment:
Q  76 tgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgtt 175  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||| || | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |  |||||||||    
T  44635826 tgcagagccgttgtaatggcacacgtgagtccgtcggttacgaaatcgtgggaagtgtaaccgccagagagagattcgcgggaacgtgcgaagagacgtt 44635925  T
Q  176 gtggctcgtttgaac 190  Q
    || | ||||||||||    
T  44635926 gtagttcgtttgaac 44635940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 72
Target Start/End: Original strand, 1998033 - 1998081
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggag 72  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1998033 agattctaccttggggactgctttgagtaccctatttatagaggtggag 1998081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13016636 - 13016433
Alignment:
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||    | |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||   ||||  ||||| |||||||||| | ||  |    
T  13016636 tgggaagtgtaaccgccagagagagattcgcgggaacgtgcgaagagacgttgtagttcgtttgaactgatctcgcttgctatgtgcacccctttgtggg 13016537  T
Q  224 aaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
     ||||||  |||||||  |||  |||||||||||  | |||||||||    | ||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||| ||||||||     
T  13016536 gaaggggtgtgttgcacataatgttgccaaacgttgtatttgggcttggatttgtactgggcctaagtaaatgggctgaatgtcattttgaccggtccat 13016437  T
Q  324 aaca 327  Q
    ||||    
T  13016436 aaca 13016433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Original strand, 22006519 - 22006588
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatg 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  22006519 agattctaccttggggactgctacgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtaatg 22006588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 93
Target Start/End: Original strand, 22014036 - 22014105
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatg 93  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  22014036 agattctaccttggggactgctacgagtcccttatatatagaggtggagggctgcagagtcgttgtaatg 22014105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 129; Significance: 2e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Original strand, 68700 - 69004
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||     
T  68700 agattctaccttgggcactgcggtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatgacacaccttgctttggcggttacgaaatcg 68799  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||    | |    
T  68800 tgggaagtgtaaccgctagagagtttattgcgggaacgtgggaagagacgttgtggctcgtttgaactagtctcggttgctccgtgcacccccctcgcag 68899  T
Q  224 a-aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    | ||||||  ||| ||||||||  |||| |||||||  || ||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  68900 agaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggagtctgggctttgaattgtattgggcctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggttca 68999  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  69000 gaaca 69004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 74845 - 75045
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| ||    
T  74845 agagagtgatggtatagaggaagagatagattctaccttggggaatgcggtgagtcccctatttatagaggtggagggctgtagagccgttgtaatggca 74944  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  74945 cacctggctctggcagttatgaaatcgtcggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgcggagacacgttgtggctcgtttgaaccagtct 75044  T
Q  197 c 197  Q
    |    
T  75045 c 75045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4396 - 4065
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || ||    
T  4396 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctctcttggggactgatgtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccgttgtagtggca 4297  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||  ||     
T  4296 cacctggctctggtggttacgaaatcgtgggatgtgtaactgcgagagagtttattgcgagaacgtgcagatagacgttgtggttcgtttgaaccggtcc 4197  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
    |  | |||| ||| |||||| | ||    |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| | ||||| |||||    
T  4196 cgctcgctccgtgaacccccttcgtggagaaggggtatgctgcaagtaagtttgccaaacgtggtgtttggactttggattgtatttgacctaagtaaat 4097  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4096 gagccaaatatccttttggccggtccagaaca 4065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0989 (Bit Score: 122; Significance: 3e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0989
Description:

Target: scaffold0989; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1721 - 1448
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||    
T  1721 agagagtgagggtttagaggaagagatagattctaccttggggactgctttgagtgccctatttatagaggtggacggctgtagagctgttgtaatggca 1622  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  1621 cacctggctctagcagttataaaatcgtgagaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtgtagagagatgttgtggttcgtttgaaccagtct 1522  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggcttt 271  Q
    |||| |||| ||||||||| || |  | |||||   ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1521 ctttcgctccgtgcaccccttg-tggggaagggatgtgtcgcaagtaacttcgccaaacgtggtgtttgggcttt 1448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7218
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||||     
T  7522 agattctaccttggggattgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcaaagccgttgtaatggcacaccttactctgacg-ttacgaaatcg 7424  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc--tggtc 221  Q
    | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||| | || ||||||||||  | ||     
T  7423 ttggaagtgtaactgcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcaccccccctcgtg 7324  T
Q  222 tgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcc 321  Q
    || | ||||  ||| || ||||| |||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  7323 tggagggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacttggtgtttgggctttggatgatattggacataaataaatgggccaaagatccttttagccggtcc 7224  T
Q  322 agaaca 327  Q
    | ||||    
T  7223 aaaaca 7218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11058 - 10741
Alignment:
Q  13 tttagaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggc 110  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  11058 tttagaggaagaaagattctcccttggggactccattgagtccactatttataaaggtggagggctgtagagccgttgtaatggcacacctaactctgac 10959  T
Q  111 ggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgc 210  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  | |||||||||| |  || ||||||||  ||||||| | ||  |||    
T  10958 ggttacgaaatcatgggaagtgtaaccgcctgtgagtttattgcgggaacatggaaagagacgttgggtttcttttgaaccggtctctttcgttccttgc 10859  T
Q  211 ac-cccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtcct 309  Q
    || ||||| |  || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  10858 actcccctcgcatggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatggtattgggcctaagtgaatgggccaaagatcct 10759  T
Q  310 tttggccggtccagaaca 327  Q
    |||||||| |||||||||    
T  10758 tttggccgatccagaaca 10741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Original strand, 242673 - 243002
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    ||||||   |||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| ||    
T  242673 agagagtgaggatttagaggaagagttagattctatcctggggactgaagtgagtactctatatatagaggtggagggcggcagagccgttgtaatggca 242772  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  242773 cacctggctcttgcggttacgtaatcgtgggaagtgtaactgccaaagagtttattgcgggaacgtgcaaagagacgttgtggttcgtttgaaccggtct 242872  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccc-cctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
       | |||| |||||||| |||     | ||||||  ||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  242873 tgctcgctccgtgcacccgcctatcggggaaggggtgtgtcgcaagtaatgttgccaaacttggtgtttgggctttagattgtattgggcctaagtaaat 242972  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaa 325  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  242973 gggacaaaggtccttttggccggtacagaa 243002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 253313 - 253645
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| || |||| ||  ||||||||| ||    
T  253313 agagagtgacggtttagaggaagagttagattctaccttggggactgtagtgagtcccctatatataaaggtggacggctgcaaagtcgttgtaatggca 253412  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||  |||    
T  253413 cacctggctctggcggttacgaaatcgtgggaagtgtaactgccagagagtttattgcgggaacgtgcagagagatgttgtggttcatttgaaccggtct 253512  T
Q  197 cttttgctctgtgcac-cccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
          ||| |||||| |||||     | ||||||  ||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  253513 tgcactctccgtgcactcccctctcggggaaggggtgtgtcgcacgtaatgttgccaaacgtggtgtttgggatttggattgtattgggcctaagaaaat 253612  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaacac 328  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| |||||    
T  253613 gggccaaaggttcttttggcctgtccaaaacac 253645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 14872 - 15204
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggttt-agaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacac 97  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||| |||    
T  14872 agagagtgagggttttagaggaagaaagattctaccttggggactgcattgagtcccctatttataaaggtggatggccgcagagccgttgtaatggcac 14971  T
Q  98 acctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctc 197  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| || || |||||||||||  ||||    
T  14972 acctaactctgacggttacgaaatcgtgggaagtgtaacagcctgtgagtttattgcgggaacgtggaaagagacgctggggttcgtttgaaccgatctc 15071  T
Q  198 ttttgctctgtgca-------ccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaa 290  Q
    ||| | || |||||       ||||||    || ||||||  ||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  15072 tttcgttccgtgcacccccccccccctcacgtggaaggggtgtgtcgcgagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttggatagtactgggcctaag 15171  T
Q  291 taaatgggccaaatgtccttttggccggtccag 323  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15172 tgaatgggccaaagatccttttggccggtccag 15204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 327
Target Start/End: Original strand, 17200 - 17384
Alignment:
Q  144 gagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccc-tggtctgaaagggggatgttgcaagt 242  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||| || |||||||||||| ||||||| | || |||||||||| | |  || ||||||  |||  | |||    
T  17200 gagtttattgcgggaacgtggaaagagacgttggggttcgtttgaaccagtctctttcgttccgtgcacccccctcgcgtggaaggggtgtgtcacgagt 17299  T
Q  243 aactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    || ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  17300 aattttgccaaacgtggtgtttgggatttggatggtactgggcctaagtgaatgggccaaagattcttttggccggtccagaaca 17384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 17100 - 17190
Alignment:
Q  13 tttagaggaaga--gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacct 101  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  17100 tttagaggaagaaagattctaccttggagactgcattgagtcccatatttatagaggtggagggctgcagagctgttgtaatggcacacct 17190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 12323 - 12651
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagag----attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||    ||| ||| ||||||  || | |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||    
T  12323 agagagtgagggtttagaggaatagttagattataccttggggtttgttatgagtcccctatatatagaggtgaagggctgcagagccgttgtaatggca 12422  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattct 196  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||| ||||  |||    
T  12423 caccaggctctggcggttacaaaatcatgggaagtgtaaccgctagagagattattgcgggaacgtgc--acagacgttgtggctcatttaaaccggtct 12520  T
Q  197 cttttgctctgtgcaccccctggtctga-aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaat 295  Q
      || |||||||||| ||||| | | || || |||  ||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||    
T  12521 tgttcgctctgtgcatcccctcg-cggagaatgggtgtgtcgcaagtaatgttgcaaaacgtggtgtttgggctttgaattgtattaggcctaagtaaat 12619  T
Q  296 gggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12620 gggccaaagctccttttggccggtccagaaca 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 54763 - 54473
Alignment:
Q  37 gggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaac 136  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54763 gggactgcattgagtcccctatttatagaggtggagggctgcatagccgttgtaatggtacaccttactctgacggttacgaaatcatgggaagtgtaac 54664  T
Q  137 cgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgc-accccctggtctgaaagggggatgt 235  Q
    | || | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||| |||| || | || ||||  |||||| |  ||  |||||  |||    
T  54663 cacctgtgagtttattgcgggaacgtggagagagacgttgggtttcgtttgaaccagtctccttcgttccgtgcgcccccctcgcgtg-gaggggtgtgt 54565  T
Q  236 tgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
      | ||||| |||||||||||||   ||||||||||  |  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54564 ctcgagtaattttgccaaacgtggattttgggctttgtagtgtattgggtctaagtaaatgggccaaagatccttttggccggtccagaaca 54473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3002 - 2697
Alignment:
Q  24 agattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatca 123  Q
    ||||||||| || ||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||     
T  3002 agattctaccttcgggactgttatgagtccc-tatatatagaggtggagagctgcagagctgttgtaatggcacaccaggctctggcggttacgaaatcg 2904  T
Q  124 tgggaagtgtaaccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctg 223  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||  |||  || |||| ||||||||||   ||      
T  2903 tgggaagtgtaaccgctagagagattattactggaacgtgcagagagacattgtgtttcgtttgaaccggtcttgttcgctccgtgcacccccccctcgc 2804  T
Q  224 a---aagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtc 320  Q
    |   |||||   ||| ||||||||  ||||||||  || ||||||||||||  || ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  2803 agagaagggttgtgtagcaagtaatgttgccaaagatggtgtttgggctttgaattgtattaggcctatgtaaatgggccaaagctccttttggtcggtc 2704  T
Q  321 cagaaca 327  Q
    || ||||    
T  2703 caaaaca 2697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37374 - 37095
Alignment:
Q  48 gagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagt 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||     
T  37374 gagtcccctatatatagaggtggagggctgcagagccgttgtgatggcacgccaggctctggcggttatgaaatcgtgggaagtgtaaccg-cagagaga 37276  T
Q  148 ttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgcaccccctggtctga-aagggggatgttgcaagtaact 246  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| || | ||||||| |  |||   ||||||||||||||||     | || ||||||  ||| |||||||||     
T  37275 ttattgcaggaacatgcagagagacgttgcggtttgtttgaatcggtcttgcttgctctgtgcacccctgtcgcggagaaggggtgtgtcgcaagtaaca 37176  T
Q  247 ttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
     ||||||||||| | |||  | ||| ||| |||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  37175 ctgccaaacgtggtattttagatttggattgtattgagcctaagtaaatgggtcaaagctccttttgaccggtccagaaca 37095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 327
Target Start/End: Original strand, 9243 - 9461
Alignment:
Q  106 ctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaa-ccgccagagagtttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgct 204  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    |||    
T  9243 ctggcggttacgaaattgtgggaagtgtaaaccgctagagagtttattgcaggaacgtgcagagagacgttgtggttcgtttgaaccagtctc----gct 9338  T
Q  205 ctgtgcaccccctggtctgaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaat 304  Q
    | |||||||  || |   ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| || || |||||||||||||     
T  9339 ccgtgcacctgctcgcgggaaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattggacccaagtaaatgggccaaaa 9438  T
Q  305 gtccttttggccggtccagaaca 327  Q
     |||| | |||||||||| ||||    
T  9439 ctcctctaggccggtccataaca 9461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Original strand, 1970 - 2074
Alignment:
Q  223 gaaagggggatgttgcaagtaactttgccaaacgtgatgtttgggctttagatcgtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtcca 322  Q
    ||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1970 gaaaggggtgtgtcgcaagtaattttgccaaacgtggtgtttgggctttgaatagtattggacccaagtaaatgggccaaaactccttttggccggtcca 2069  T
Q  323 gaaca 327  Q
    |||||    
T  2070 gaaca 2074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 19150 - 19268
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaagagat----tctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| | ||    
T  19150 agagagtgaggatttagaggaagagatagattctaccttggggactgcagtgagtcccctatttatagaggtggagggctgcagagccattgtaacggca 19249  T
Q  97 cacctgactctggcggtta 115  Q
    |||||  |||||| |||||    
T  19250 cacctagctctggtggtta 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 86562 - 86424
Alignment:
Q  1 agagagtgaaggtttagaggaaga----gattctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgaca 96  Q
    |||||||||  |||||||||||||    |||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||    
T  86562 agagagtgagagtttagaggaagaaatagattctatcttcgggactgctatgagtcccctatatatagaggtggagggttgcaaagtcgttgtaatggca 86463  T
Q  97 cacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaa 135  Q
    |||  | |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||    
T  86462 cactaggctctggcgattacgaaatcgtggaaagtgtaa 86424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20455 - 20336
Alignment:
Q  26 attctacgttggggactgctgtgagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatg 125  Q
    ||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||  ||  |||||||  ||||  ||    
T  20455 attctaccttggggactgttaagagtcccctatttttagaggtggagggctgcagagccgttgtaatggtacacttgggtcaagcggttacaaaattgtg 20356  T
Q  126 ggaagtgtaaccgccagaga 145  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  20355 ggaagtgtaaccgctagaga 20336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 327
Target Start/End: Original strand, 18257 - 18307
Alignment:
Q  277 gtattgggcctaaataaatgggccaaatgtccttttggccggtccagaaca 327  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18257 gtatttggcctaagtaaatgggccaaaggtccttttggccggtccaaaaca 18307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36928 - 36765
Alignment:
Q  48 gagtcccctatttatagaggtggagggttgcatagctgttgtaatgacacacctgactctggcggttatgaaatcatgggaagtgtaaccgccagagagt 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||  || || | ||| ||||||||| ||||| ||  || | |||||| |||||  |||||||||||||| ||| ||||     
T  36928 gagtcccctatatatagaggtgggtggctgtagagccgttgtaatggcacacgtgtgtccgacggttacgaaattgtgggaagtgtaacctccaaagaga 36829  T
Q  148 ttattgcgggaacgtacagagagacgttgtggctcgtttgaaccattctcttttgctctgtgca 211  Q
       |||||||||| | |  ||||||||||  | ||||||||||  |||||  ||||||||||||    
T  36828 gatttgcgggaacttgcgaagagacgttgcagttcgtttgaactgttctcgcttgctctgtgca 36765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University