View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12040_low_17 (Length: 410)

Name: NF12040_low_17
Description: NF12040
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12040_low_17
NF12040_low_17
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (11-364)||(4501191-4501543)
chr7 (6-382)||(45613659-45614035)
chr7 (11-382)||(19277205-19277578)
chr7 (5-384)||(28517103-28517482)
chr7 (64-382)||(21326713-21327031)
chr7 (11-382)||(982863-983234)
chr7 (21-382)||(43856788-43857149)
chr7 (88-382)||(22197901-22198194)
chr7 (88-382)||(22239627-22239920)
chr7 (43-382)||(27521385-27521722)
chr7 (22-382)||(5825187-5825545)
chr7 (11-382)||(24527503-24527875)
chr7 (87-382)||(32584514-32584810)
chr7 (5-258)||(3676677-3676931)
chr7 (185-382)||(40726476-40726673)
chr7 (219-382)||(48539095-48539258)
chr7 (126-382)||(25186873-25187124)
chr7 (171-382)||(30216040-30216251)
chr7 (171-382)||(42295166-42295377)
chr7 (26-382)||(10905032-10905373)
chr7 (11-292)||(47679129-47679410)
chr7 (156-382)||(9281099-9281329)
chr7 (156-382)||(9292070-9292300)
chr7 (98-384)||(34772694-34772977)
chr7 (252-384)||(41117833-41117965)
chr7 (234-382)||(5972261-5972409)
chr7 (217-356)||(6634991-6635130)
chr7 (300-382)||(43333941-43334023)
chr7 (272-382)||(23037459-23037569)
chr7 (81-313)||(2904348-2904580)
chr7 (311-382)||(45003019-45003090)
chr7 (182-282)||(34067855-34067954)
chr7 (218-382)||(36558897-36559060)
chr7 (304-383)||(5714953-5715032)
chr7 (319-382)||(27027760-27027823)
chr7 (201-367)||(23792941-23793107)
chr7 (324-382)||(41071736-41071794)
chr7 (280-354)||(44525927-44526001)
chr7 (309-382)||(38839240-38839313)
chr7 (321-382)||(45974731-45974792)
chr7 (210-317)||(10032192-10032299)
chr7 (91-217)||(33202368-33202493)
chr7 (7-116)||(38596635-38596744)
chr7 (59-231)||(38839393-38839563)
chr7 (341-382)||(2904294-2904335)
chr7 (147-215)||(1249667-1249735)
chr7 (298-370)||(26770047-26770119)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (5-382)||(4412882-4413259)
chr2 (5-391)||(41867724-41868110)
chr2 (5-382)||(17344552-17344929)
chr2 (5-382)||(28224914-28225291)
chr2 (1-382)||(9685227-9685608)
chr2 (6-382)||(19161600-19161976)
chr2 (5-382)||(27502276-27502652)
chr2 (5-382)||(18744770-18745147)
chr2 (6-384)||(23484755-23485131)
chr2 (28-364)||(44686348-44686686)
chr2 (11-336)||(20142562-20142872)
chr2 (15-381)||(5532336-5532700)
chr2 (6-382)||(3825640-3826017)
chr2 (76-383)||(16351726-16352038)
chr2 (241-382)||(13413265-13413406)
chr2 (161-349)||(2888463-2888651)
chr2 (173-332)||(34814803-34814961)
chr2 (80-382)||(7760737-7761038)
chr2 (73-383)||(29807988-29808295)
chr2 (201-382)||(32029098-32029279)
chr2 (179-382)||(13147087-13147293)
chr2 (206-382)||(2886632-2886808)
chr2 (21-129)||(10579611-10579719)
chr2 (59-193)||(9674947-9675081)
chr2 (6-136)||(13146951-13147081)
chr2 (164-239)||(1296025-1296100)
chr2 (197-355)||(33612555-33612711)
chr2 (302-379)||(24765178-24765255)
chr2 (338-382)||(26407843-26407887)
chr2 (107-239)||(44720380-44720512)
chr2 (241-385)||(8036534-8036680)
chr2 (306-359)||(20142871-20142923)
chr2 (302-379)||(24762900-24762977)
chr2 (81-119)||(3661843-3661881)
chr2 (182-324)||(3968402-3968544)
chr2 (197-382)||(11921218-11921397)
chr2 (267-336)||(9200212-9200281)
chr2 (344-384)||(15515302-15515342)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (14-385)||(32269622-32269993)
chr5 (5-380)||(35310364-35310739)
chr5 (5-386)||(15291842-15292222)
chr5 (5-382)||(13166726-13167103)
chr5 (2-382)||(27336609-27336987)
chr5 (11-382)||(33691878-33692245)
chr5 (87-382)||(14423601-14423887)
chr5 (147-382)||(37873596-37873831)
chr5 (5-382)||(26212398-26212776)
chr5 (20-371)||(34335262-34335613)
chr5 (165-365)||(38875570-38875769)
chr5 (221-384)||(22188687-22188850)
chr5 (6-305)||(43129525-43129823)
chr5 (168-382)||(25663011-25663225)
chr5 (196-382)||(42921612-42921797)
chr5 (11-218)||(433370-433577)
chr5 (212-382)||(430516-430686)
chr5 (25-267)||(3114000-3114241)
chr5 (289-382)||(2566195-2566288)
chr5 (112-385)||(8100465-8100736)
chr5 (64-287)||(35455965-35456188)
chr5 (20-193)||(38446267-38446442)
chr5 (214-327)||(14723269-14723382)
chr5 (300-382)||(23023509-23023591)
chr5 (11-136)||(9841148-9841274)
chr5 (263-373)||(15832985-15833092)
chr5 (171-239)||(32230489-32230557)
chr5 (90-257)||(43115359-43115525)
chr5 (88-238)||(8858974-8859124)
chr5 (262-373)||(15809972-15810081)
chr5 (224-331)||(41343473-41343581)
chr5 (195-382)||(16017087-16017275)
chr5 (298-382)||(15506724-15506808)
chr5 (276-364)||(19260236-19260324)
chr5 (302-364)||(9829465-9829527)
chr5 (247-371)||(7716109-7716230)
chr5 (344-381)||(12033346-12033383)
chr5 (241-382)||(23423923-23424064)
chr5 (300-357)||(24113514-24113571)
chr5 (266-347)||(27294387-27294468)
chr5 (79-136)||(27355606-27355663)
chr5 (312-385)||(43349971-43350044)
chr5 (168-258)||(9829333-9829421)
chr5 (211-249)||(16598953-16598991)
chr5 (196-258)||(26577407-26577469)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (11-384)||(34644478-34644851)
chr1 (5-336)||(29169610-29169940)
chr1 (6-382)||(28040944-28041320)
chr1 (29-359)||(45659487-45659816)
chr1 (5-382)||(22346809-22347168)
chr1 (33-370)||(4861833-4862170)
chr1 (5-278)||(19035465-19035738)
chr1 (104-382)||(2898616-2898889)
chr1 (122-382)||(31737256-31737515)
chr1 (89-382)||(2764393-2764686)
chr1 (58-382)||(20259667-20259990)
chr1 (178-382)||(21472917-21473121)
chr1 (204-382)||(24177526-24177704)
chr1 (23-332)||(37932052-37932360)
chr1 (64-315)||(50161292-50161546)
chr1 (201-359)||(38731546-38731704)
chr1 (26-324)||(42919832-42920129)
chr1 (30-268)||(25375674-25375912)
chr1 (142-292)||(16500038-16500188)
chr1 (232-359)||(7213187-7213314)
chr1 (158-381)||(50314593-50314815)
chr1 (298-383)||(6670214-6670299)
chr1 (182-335)||(35387653-35387802)
chr1 (11-169)||(38731707-38731865)
chr1 (76-267)||(37200012-37200201)
chr1 (158-244)||(23043929-23044015)
chr1 (304-382)||(45835301-45835379)
chr1 (225-382)||(47459596-47459753)
chr1 (299-382)||(868513-868594)
chr1 (307-382)||(40515993-40516067)
chr1 (324-382)||(4611103-4611161)
chr1 (311-384)||(48841204-48841277)
chr1 (232-322)||(18616196-18616286)
chr1 (318-382)||(30688471-30688535)
chr1 (298-381)||(11128363-11128446)
chr1 (344-382)||(1114023-1114061)
chr1 (340-382)||(28493482-28493524)
chr1 (204-370)||(35550090-35550256)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (11-379)||(53785626-53785994)
chr3 (22-382)||(39583062-39583422)
chr3 (11-382)||(49017881-49018248)
chr3 (10-382)||(13582424-13582797)
chr3 (5-382)||(44198681-44199058)
chr3 (11-382)||(52741333-52741705)
chr3 (88-382)||(37132898-37133192)
chr3 (75-383)||(7900771-7901079)
chr3 (168-382)||(26772672-26772886)
chr3 (133-378)||(3443256-3443501)
chr3 (190-382)||(32546709-32546901)
chr3 (87-382)||(38145970-38146265)
chr3 (146-382)||(38978756-38978992)
chr3 (88-381)||(5338561-5338855)
chr3 (50-382)||(7501872-7502203)
chr3 (96-335)||(51234577-51234803)
chr3 (116-384)||(4472974-4473241)
chr3 (88-382)||(46940669-46940966)
chr3 (57-379)||(54508253-54508574)
chr3 (201-382)||(52411903-52412084)
chr3 (196-384)||(38670887-38671075)
chr3 (196-382)||(26856769-26856955)
chr3 (170-383)||(25324942-25325157)
chr3 (11-382)||(37992247-37992617)
chr3 (197-382)||(21552578-21552766)
chr3 (25-129)||(29861964-29862068)
chr3 (98-245)||(35484601-35484748)
chr3 (289-382)||(464981-465074)
chr3 (314-382)||(4669788-4669856)
chr3 (273-351)||(44781-44859)
chr3 (21-317)||(43123124-43123419)
chr3 (89-200)||(35236302-35236413)
chr3 (284-382)||(4763888-4763985)
chr3 (298-382)||(3643067-3643149)
chr3 (289-370)||(42205993-42206074)
chr3 (18-138)||(52411731-52411851)
chr3 (340-382)||(26276529-26276571)
chr3 (282-382)||(25094665-25094765)
chr3 (252-382)||(7257620-7257749)
chr3 (308-382)||(35484799-35484873)
chr3 (180-230)||(45676778-45676828)
chr3 (341-382)||(3376890-3376931)
chr3 (168-245)||(13772500-13772577)
chr3 (334-374)||(2601751-2601791)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (5-382)||(50000741-50001119)
chr4 (5-382)||(30940555-30940925)
chr4 (40-382)||(53619500-53619842)
chr4 (20-382)||(26521403-26521764)
chr4 (30-384)||(55933303-55933655)
chr4 (26-357)||(132324-132657)
chr4 (21-374)||(56461939-56462291)
chr4 (23-382)||(25504209-25504566)
chr4 (156-382)||(600659-600885)
chr4 (5-292)||(12918188-12918475)
chr4 (6-382)||(53170426-53170791)
chr4 (164-384)||(34107669-34107891)
chr4 (5-305)||(31847078-31847378)
chr4 (219-382)||(3329910-3330073)
chr4 (252-391)||(4419168-4419307)
chr4 (5-269)||(16957569-16957827)
chr4 (172-384)||(23255625-23255828)
chr4 (5-162)||(3330084-3330241)
chr4 (124-382)||(50462881-50463136)
chr4 (219-382)||(7536601-7536764)
chr4 (11-277)||(12053432-12053696)
chr4 (96-382)||(46440795-46441082)
chr4 (265-382)||(16955374-16955491)
chr4 (159-382)||(48656880-48657108)
chr4 (11-122)||(25706683-25706794)
chr4 (94-367)||(46391220-46391490)
chr4 (204-313)||(50483211-50483320)
chr4 (11-354)||(6865635-6865984)
chr4 (247-382)||(39001311-39001446)
chr4 (280-382)||(50464387-50464489)
chr4 (297-384)||(8738117-8738204)
chr4 (12-110)||(18534586-18534683)
chr4 (227-381)||(38535607-38535760)
chr4 (195-324)||(43849354-43849483)
chr4 (307-382)||(23233232-23233307)
chr4 (298-382)||(23242814-23242898)
chr4 (74-222)||(1041386-1041533)
chr4 (316-382)||(50442606-50442672)
chr4 (240-382)||(54190902-54191044)
chr4 (77-131)||(54927621-54927675)
chr4 (301-381)||(18981651-18981729)
chr4 (279-383)||(34213533-34213636)
chr4 (274-382)||(42455692-42455800)
chr4 (214-382)||(53098335-53098503)
chr4 (338-383)||(1041338-1041383)
chr4 (188-356)||(28739845-28740014)
chr4 (79-324)||(45385951-45386196)
chr4 (298-354)||(32312820-32312876)
chr4 (307-382)||(49354184-49354263)
chr4 (321-382)||(9601123-9601184)
chr4 (289-382)||(45661605-45661698)
chr4 (34-138)||(9815706-9815809)
chr4 (320-376)||(40005289-40005345)
chr4 (59-126)||(53098575-53098643)
chr4 (319-382)||(22449816-22449878)
chr4 (271-317)||(747851-747897)
chr4 (338-384)||(3698689-3698735)
chr4 (188-246)||(34536931-34536989)
chr4 (252-371)||(49344202-49344325)
chr4 (274-371)||(52403868-52403963)
chr4 (232-332)||(1208422-1208522)
chr4 (196-244)||(41440089-41440137)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (6-386)||(24124938-24125318)
chr8 (5-382)||(39434581-39434958)
chr8 (11-325)||(500199-500512)
chr8 (5-336)||(35739803-35740133)
chr8 (21-383)||(25021646-25022008)
chr8 (64-382)||(38815208-38815516)
chr8 (57-382)||(3187884-3188208)
chr8 (112-378)||(6592494-6592758)
chr8 (169-382)||(28196106-28196319)
chr8 (24-227)||(37517163-37517366)
chr8 (100-382)||(4699785-4700064)
chr8 (219-382)||(37514135-37514298)
chr8 (73-382)||(8540262-8540573)
chr8 (197-382)||(6618199-6618383)
chr8 (97-382)||(8619736-8620013)
chr8 (246-382)||(22589394-22589529)
chr8 (262-382)||(18804527-18804646)
chr8 (171-285)||(8882339-8882452)
chr8 (188-349)||(39671170-39671332)
chr8 (264-372)||(3821148-3821256)
chr8 (147-386)||(4073444-4073684)
chr8 (73-271)||(10189568-10189766)
chr8 (232-358)||(43823927-43824053)
chr8 (311-391)||(24451026-24451105)
chr8 (274-383)||(9259377-9259486)
chr8 (262-327)||(40223476-40223541)
chr8 (169-371)||(121703-121903)
chr8 (320-382)||(8882258-8882320)
chr8 (226-391)||(3825540-3825705)
chr8 (311-382)||(42659141-42659212)
chr8 (212-370)||(8115738-8115895)
chr8 (278-370)||(10950739-10950831)
chr8 (278-370)||(10958744-10958836)
chr8 (312-382)||(4066759-4066829)
chr8 (77-131)||(40839717-40839770)
chr8 (26-383)||(36004035-36004391)
chr8 (17-110)||(39671015-39671108)
chr8 (298-382)||(5329711-5329795)
chr8 (338-382)||(24320251-24320295)
chr8 (307-382)||(8714721-8714795)
chr8 (308-383)||(10556412-10556486)
chr8 (340-382)||(500156-500198)
chr8 (226-367)||(3863243-3863387)
chr8 (289-383)||(14545733-14545827)
chr8 (171-229)||(22589336-22589394)
chr8 (59-121)||(42921997-42922059)
chr8 (334-383)||(8227980-8228029)
chr8 (87-136)||(11611146-11611195)
chr8 (311-383)||(42922225-42922297)
[»] scaffold1768 (1 HSPs)
scaffold1768 (11-382)||(6-377)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (43-382)||(959495-959833)
chr6 (11-382)||(34304410-34304781)
chr6 (22-381)||(4206429-4206788)
chr6 (30-382)||(33220552-33220904)
chr6 (87-382)||(17249203-17249498)
chr6 (11-331)||(45491-45819)
chr6 (22-381)||(29337916-29338271)
chr6 (20-382)||(357548-357909)
chr6 (11-212)||(32115773-32115974)
chr6 (65-328)||(34415404-34415667)
chr6 (81-382)||(34554169-34554469)
chr6 (186-381)||(4165919-4166114)
chr6 (88-382)||(28008886-28009180)
chr6 (168-382)||(28625845-28626059)
chr6 (5-239)||(12401388-12401622)
chr6 (43-277)||(28543394-28543628)
chr6 (81-372)||(24016261-24016551)
chr6 (280-382)||(32115632-32115734)
chr6 (219-382)||(13398212-13398375)
chr6 (307-382)||(3137365-3137440)
chr6 (147-375)||(3714838-3715066)
chr6 (142-250)||(34168914-34169022)
chr6 (22-137)||(20693434-20693548)
chr6 (220-344)||(22985873-22985997)
chr6 (220-344)||(23802397-23802521)
chr6 (319-382)||(34168835-34168897)
chr6 (340-382)||(7749395-7749437)
chr6 (212-282)||(32291258-32291328)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (28-382)||(33164-33519)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (87-351)||(6279-6542)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (127-382)||(103020-103274)
[»] scaffold0110 (2 HSPs)
scaffold0110 (26-268)||(47376-47618)
scaffold0110 (310-382)||(47641-47713)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (197-382)||(7517-7701)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (114-328)||(10329-10546)
scaffold0186 (11-101)||(19916-20006)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (26-324)||(18202-18499)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (88-381)||(49330-49622)
[»] scaffold0119 (2 HSPs)
scaffold0119 (156-251)||(16179-16274)
scaffold0119 (246-334)||(16068-16155)
[»] scaffold0493 (1 HSPs)
scaffold0493 (80-282)||(8407-8609)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (300-380)||(17390-17468)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4501543 - 4501191
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4501543 aacttcctgaatgacccactagatagaagataaacactcaggccagcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga 4501444  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  4501443 ctggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagc 4501344  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||    
T  4501343 gtgttctgacaatcaacatgcttttatataatttgcttttgacacttt-ggttttctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaagttc 4501245  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgatt 364  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4501244 atgcatagcaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgaggatt 4501191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Original strand, 45613659 - 45614035
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  45613659 ctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgatgtacgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtaga 45613758  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| | |    
T  45613759 cttgactggggtttcaccacttgtaggattaggtgtcgggcctttttccgtaggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaggtgaccaaacacggg 45613858  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||  || |||| ||| ||||||||    
T  45613859 aaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgattttgacactttcggtttccaagcaccagaggctgttagccttctacatagagttcaaa 45613958  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  45613959 agttcatgcataacaatgtcaaatctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccgaaaa 45614035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 19277578 - 19277205
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  19277578 aacttcctgactgacgcactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtctacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 19277479  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     |||||||||||||||||| | ||||||| || | |||||| |  |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  19277478 ctggggtttcaccacttgtcggattaggtttcagaccttttgccgtaggacaggcagtcctaaaagctgcgtcaagcaaagtagccaaacatgagaaagc 19277379  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  19277378 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtc 19277279  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtt--tacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||   ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19277278 atgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacacgaaaattggttttgccatccaaaaa 19277205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 384
Target Start/End: Original strand, 28517103 - 28517482
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  28517103 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgtatgtgtgg 28517202  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28517203 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacagacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 28517302  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| |||||   |||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |  |||||||||||||||   ||||||| |||| ||| ||| |||    
T  28517303 gaaagcgtgtttagacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttttgacttcctagcatcagagacagttgaccttctacatagagtccaa 28517402  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    | ||| |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28517403 agggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaaag 28517482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 64 - 382
Target Start/End: Original strand, 21326713 - 21327031
Alignment:
Q  64 tatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaa 163  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21326713 tatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatacttgtgtagatttgattggagtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaa 21326812  T
Q  164 acaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtt 263  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  21326813 acagccctaaaagccgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgatt 21326912  T
Q  264 tcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgat 363  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  21326913 tcctagcaccagaggctgttgaccttttacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggat 21327012  T
Q  364 tgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21327013 tgattttgccatccaaaaa 21327031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 983234 - 982863
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||| || ||| |||||   ||||||||| ||||| |||||||    
T  983234 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatccggaagttatgatgtacgaatgagtaggtgaaaaacatgcttgtgtagacttga 983135  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     | |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||   |||||||  || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  983134 ctagggtttaaccacttgtgggattaggtgtgggaccttttattgtaggacaggcagccataaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatc 983035  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  983034 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgatactttcggttttctagcaccagaggttgttggccttctacatagagttcaaaaggtc 982935  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  982934 atgcatatcaatgtcatgtcttctatgtccatgaatgttgtgttcacgaggattggtattgccatccaaaaa 982863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 43857149 - 43856788
Alignment:
Q  21 ctgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttc 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||  ||||||||    
T  43857149 ctgacccactagatagaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatacatgcgtggacttgacgggggtttc 43857050  T
Q  121 accacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaac 220  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||    
T  43857049 accacttgtgggattaggggtcggggcttttacagtaggacagacaacattaaaagatgcgtcaatcaaagtggctagacatgagaaagcgtgttttgac 43856950  T
Q  221 aatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataaca 320  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  43856949 aatcaacatgcgtttatacaatttgcttttgacatttttggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcacaaca 43856850  T
Q  321 atgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  43856849 atgtcatgactcctaggtccatgaatgttatgtttacgagaattgattttgctatccaaaaa 43856788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22198194 - 22197901
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagc 187  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||| |||||||||    
T  22198194 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22198095  T
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22198094 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22197995  T
Q  288 gtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     |||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22197994 ttctacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacgataattgattttgtcatccaaaaa 22197901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 88 - 382
Target Start/End: Original strand, 22239627 - 22239920
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagc 187  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||   || |||||||||| |||||||||    
T  22239627 aaaacatgcatgtgtagatttgattggggtttcgccacttgtgcgattaggtgtcgggccttttatggtaggacgcgcagccctaaaagcggcgtcaagc 22239726  T
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22239727 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttccaacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgtcactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 22239826  T
Q  288 gtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     |||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22239827 ttctacatagagttcaaaaggttatg-atagcaacgtcatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttacgataattgattttgtcatccaaaaa 22239920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27521722 - 27521385
Alignment:
Q  43 aacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtc 142  Q
    |||||||||| || |||||| ||| || | |||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||    
T  27521722 aacactcaggtctgcggatgttattgtctacggatgggtaggagaaaaacat--atgtgtagacttgactgagatttcaccatttgtgggattaggtgtc 27521625  T
Q  143 gggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactat 242  Q
    |||||||||||| |||||||  || || |||||| ||||| || |||||||  |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  27521624 gggccttttacggtaggacatgcacccttaaaagttgcgttaaacaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcatttatacaat 27521525  T
Q  243 ttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcat 342  Q
    ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  27521524 ttacttttgacacttttggtttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtctat 27521425  T
Q  343 gaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27521424 gaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatcgaaaaa 27521385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 5825545 - 5825187
Alignment:
Q  22 tgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttca 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5825545 tgacccactagatagaagatcgacacataggcctgcggatgttatggtgtacgaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttca 5825446  T
Q  122 ccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaaca 221  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||||  ||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || | ||||| | |||    
T  5825445 ccacttgtgggtttaggggtcgaggcttttacggcaggacaggaagccctaaaagctgcatcaagcaaagtg--caaacatgacaatgcgtgttatgaca 5825348  T
Q  222 atcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaa 321  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||  ||| ||| ||||||| |||    
T  5825347 atcaacatgtttttataccatttacttttgacactttcggcatcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagtcgaaagggttatgcatagcaa 5825248  T
Q  322 tgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  5825247 tgttatgtctcctaggtctatggatgttgtgtttacgaggattggttttgccatcgaaaaa 5825187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24527875 - 24527503
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatggg-taggacgaaaacatgcatgtgtggacttg 109  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| || || |||  ||||||| |||||||| ||||  |||||||||  ||||| ||||||    
T  24527875 aacttcctaactggcccactaggtcgaagatcaacactcaggtctgcgaatgtcatggtgtacggatgggataggtggaaaacatgtttgtgtagacttg 24527776  T
Q  110 attggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaag 209  Q
    | | |||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||  || |||||||||| | |||||| ||||||   ||||||||||||     
T  24527775 actagggtctcatcatttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagccctaaaagcagtgtcaagtaaagtgggaaaacatgagaaaa 24527676  T
Q  210 tgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggt 309  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  24527675 cgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcacgagaggcggttgaccttctacatagagttcaaaaggt 24527576  T
Q  310 catgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||||| || |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  24527575 catgcatagcaatgtcatttctccttggtccatgaatgttgtattcacgaggattggttttgtcatccaaaaa 24527503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 87 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32584810 - 32584514
Alignment:
Q  87 gaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaag 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||  |||||||||||  ||| ||||     
T  32584810 gaaaacatgcatgtgtggacttgactcgggtttcacctcttgtgggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcaaccctaaaaattgcatcaaa 32584711  T
Q  187 caaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32584710 caaagtggtcaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaagatgcttttacaccatttgcttttgacactttatgtttcctagcaccagaggttgttgac 32584611  T
Q  287 cgtctatatatagtt-caaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | |||| ||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  32584610 cttctagatagagttccaaaagatcatgcatatcaatgttatgtctcatagatcgatgaatgttgtgtttacaaagattgattttaccatccaaaaa 32584514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3676931 - 3676677
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |   |||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  3676931 cctgtgaacttcctgactgacccaatagatagaaaatcaacactcaggcttgtagatgttatggtgtagggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 3676832  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggaca-aacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatg 203  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  3676831 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggtccttttaccgtaggacaggccagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatc 3676732  T
Q  204 agaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacacttt 258  Q
    |||||| ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  3676731 agaaagcgtgttcttactatcaatatgcttttataccatttgcttttgacacttt 3676677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 382
Target Start/End: Original strand, 40726476 - 40726673
Alignment:
Q  185 agcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttg 284  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40726476 agcaaagtggccaaacataataaaatgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcggcttcatagcatcagaggttgttg 40726575  T
Q  285 accgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40726576 accttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgctatgtctcctagatccatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaa 40726673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48539258 - 48539095
Alignment:
Q  219 acaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataa 318  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||     
T  48539258 acaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggttttctagcaccagaggctgttgatcgtctacatagagtccaaaaggtcatgcatag 48539159  T
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48539158 caatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaa 48539095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 382
Target Start/End: Original strand, 25186873 - 25187124
Alignment:
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatca 225  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||  | |||||    
T  25186873 ttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacataaaaccctaaaagttgtgtcaagtaaagtggtctaacatgagaaagcgtgttccgataatca 25186972  T
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtc 325  Q
    ||||| |||| ||| ||||| |||| |     ||||||||| | ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25186973 acatgtttttctaccatttgcttttga-----tcggtttccgaacactagaggttgttgaccttctatatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtc 25187067  T
Q  326 atgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||    
T  25187068 atgtctcctagatccatgaatgttgtgttcccaatgattgattttaccatctaaaaa 25187124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 171 - 382
Target Start/End: Original strand, 30216040 - 30216251
Alignment:
Q  171 taaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagc 270  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30216040 taaaagctgcgtcaagcaaaatggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagc 30216139  T
Q  271 atcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    ||||||| ||||||| | || | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  30216140 atcagagtttgttgatcttccacataaagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtctatgaatgttgtgttcacgaggatcgatttt 30216239  T
Q  371 gccatccaaaaa 382  Q
    | ||| ||||||    
T  30216240 gtcattcaaaaa 30216251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 171 - 382
Target Start/End: Original strand, 42295166 - 42295377
Alignment:
Q  171 taaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagc 270  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  42295166 taaaagcggcgtcaagcaaaatggccaaacataagaaagcttcttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttatactttcggtttcctaac 42295265  T
Q  271 atcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    | ||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  42295266 accaggggttgttgaccttctacatagcgttcaaaatatcatgcataacattgtcatgtctcctaggtccatgaatcttgtgtttacgatgattagtttt 42295365  T
Q  371 gccatccaaaaa 382  Q
    |  |||||||||    
T  42295366 gttatccaaaaa 42295377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 10905373 - 10905032
Alignment:
Q  26 ccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattg-gggtttcacca 124  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||| | |||| |  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  10905373 ccactagatataagatcgacacttaggcctgcagatgtt--ggtgtacggatggataggaggaaaacatgcatgtgtgaacttgactgaggttttcacca 10905276  T
Q  125 cttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatc 224  Q
    ||||| | |||| | ||  || |||||| |             |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||    
T  10905275 cttgttggattaagagttaggacttttatg-------------ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaatatgagaaaaagtgttctgacactc 10905189  T
Q  225 aacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||  |||||||| |||| ||| ||||||||  | |||||||||||||||    
T  10905188 aacatgc-tttataccatttgcttttgacacttttggttgcctagcaccagagtatgttgaccttctacatagagttcaaagagccatgcataacaatgt 10905090  T
Q  325 catgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||||||||||    
T  10905089 catgtctcctaggtccatgaatgtcgtgtttacaaggattgatctgaccatccaaaaa 10905032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47679410 - 47679129
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||  | | |||| |||  |||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  47679410 aactttctgactgacgcactagatagaagatcgacactttgacttacgaatgtaatggcgtgcgaatgggtaggaggaaaacatacatgtctagacttga 47679311  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaa-ttaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaag 209  Q
     | ||||||||||||||||||   ||||| || | | |||||||   ||||| |  | | ||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  47679310 ctagggtttcaccacttgtgggggttaggggtagcggcttttacaaaaggacgagtatctctaaaagttgcgtca-gcaaagtgacaaaatatgagaaag 47679212  T
Q  210 tgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtcta 292  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47679211 tgtgttctcacaatcaatatacttttatactatttgcgtttgacattttcggtttcctagcatcacaggttgttgaccttcta 47679129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 382
Target Start/End: Original strand, 9281099 - 9281329
Alignment:
Q  156 taggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacac 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  9281099 taggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaact-agcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgacat 9281197  T
Q  256 tttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatg-----cataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttg 350  Q
    |||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||     || |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||    
T  9281198 tttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgtacagcacaacaatgtcatgactcttaagtccattaatgttg 9281297  T
Q  351 tgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| ||  |||| |||||| |||||||||    
T  9281298 tgtttaggagaattggttttgcaatccaaaaa 9281329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 382
Target Start/End: Original strand, 9292070 - 9292300
Alignment:
Q  156 taggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacac 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||     
T  9292070 taggacagacaaccctaaaagctgcatcaagcaaact-agcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttggatttgacat 9292168  T
Q  256 tttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatg-----cataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttg 350  Q
    |||  | ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||     || |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||    
T  9292169 tttttgcttcctagcaccagatgttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgtacagcacaacaatgtcatgactcttaagtccattaatgttg 9292268  T
Q  351 tgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| ||  |||| |||||| |||||||||    
T  9292269 tgtttaggagaattggttttgcaatccaaaaa 9292300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34772977 - 34772694
Alignment:
Q  98 tgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgacca 197  Q
    ||||| |||||||||| ||||| | || |||||| |||| |||| |||| ||||||| || || |  || | ||||||| ||  |||| ||||||  |||    
T  34772977 tgtgtagacttgattgaggttttatcatttgtgggattatgtgttgggctttttacggtatgataggcagctctaaaagttg--tcaatcaaagtagcca 34772880  T
Q  198 aacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatat 297  Q
    || ||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||| ||||| |||| | ||||||  |||| ||| || |||||||||||||| |||| |||     
T  34772879 aatatgagaaagtgtgttcggacaattaatatgtttttataccatttgcttttgaaactttcaatttcttag-attagaggttgttgaccttctacataa 34772781  T
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  34772780 acttcaaaaagtcatgcatatcaatgtcatgttttctaggtccatgaatattgtgtttacgataattggttttgccattcaaaaaag 34772694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 384
Target Start/End: Original strand, 41117833 - 41117965
Alignment:
Q  252 acactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgt 351  Q
    ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  41117833 acactttcggtttcctaacaccagatgttgttaaccttctacatagagtttaaaagatcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgt 41117932  T
Q  352 gtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41117933 gttcacgatgattgattttgctatccaaaaaag 41117965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 234 - 382
Target Start/End: Original strand, 5972261 - 5972409
Alignment:
Q  234 ttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcc 333  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||    
T  5972261 ttataccatttgtttttgacattttcatttttctagtatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaatgtcatgcatagtaatgtcatttctcc 5972360  T
Q  334 tagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     ||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  5972361 cagatctatgaatgttgtgtttacgaggattagttttgccatccaaaaa 5972409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 217 - 356
Target Start/End: Original strand, 6634991 - 6635130
Alignment:
Q  217 taacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcat 316  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||| |||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||  || | || |||   || |||||    
T  6634991 taacaatcaacatatttttatatcatttgcttttgacagtttcgattttttagcatcagaggttgttgaccttctacgtaaaattaaaataatcttgcat 6635090  T
Q  317 aacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgttta 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  6635091 aacaatgtcatgtctcctagatccataaatgttgtgttta 6635130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 382
Target Start/End: Original strand, 43333941 - 43334023
Alignment:
Q  300 ttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43333941 ttcaaaaggtcatgcatatcaatgacatgtctcctagatctatgaatgttgagtttatgatgattggttttgccattcaaaaa 43334023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23037569 - 23037459
Alignment:
Q  272 tcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttg 371  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23037569 tcagaggttgttgaccatctacgtagggttcaaagggttatgcatagcaatgtcatttctcttaggtctatgaattttgtgtttacgaggattgattttg 23037470  T
Q  372 ccatccaaaaa 382  Q
    ||||| |||||    
T  23037469 ccatctaaaaa 23037459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2904580 - 2904348
Alignment:
Q  81 taggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgc 180  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||   ||||| |  | | | |||||| ||||| | |||  |||||||| | |    
T  2904580 taggaggaaaatatgtatgtgtggatttcatcggggtttcaccacttgtgaggttaggggatgaggcatttacggtaggatagacagtcctaaaagttac 2904481  T
Q  181 gtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggtt 280  Q
    |||||||||| |   ||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||  |||||||| | |||  || || |||||||||  |||||||    
T  2904480 gtcaagcaaaatagtcaaacatgagaaagcatgttccgacaatcaacatgattttatatcatttgtttgtgacatgtttggcttcctagcactagaggtt 2904381  T
Q  281 gttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatg 313  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||| |||||||    
T  2904380 gttgaccttctacgtaaagtttaaagggtcatg 2904348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 382
Target Start/End: Original strand, 45003019 - 45003090
Alignment:
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45003019 atgcatagcaatgttatgtctcataggaccatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgccatccaaaaa 45003090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 282
Target Start/End: Original strand, 34067855 - 34067954
Alignment:
Q  182 tcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttg 281  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || ||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||| | || ||||||    
T  34067855 tcaagccaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttttgacaatcaacat-tttctatgccatttgtatttgacacttttggtttcctagtaccaaaggttg 34067953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 382
Target Start/End: Original strand, 36558897 - 36559060
Alignment:
Q  218 aacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcata 317  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||  ||| ||| ||| ||||| |||||| || | || ||||||  |||  ||| |||| ||| |||||||||||    
T  36558897 aacaatcaacatgtttttatataatttgcatttgacatttttggttttctagcaccaaaagtcgttgactttctccatagagtt-aaatggtcatgcata 36558995  T
Q  318 acaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
      ||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  36558996 taaatatcatgtcttataggtccatgaatgttgtgtttacgatgaatgattttgctatctaaaaa 36559060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 5715032 - 5714953
Alignment:
Q  304 aaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||    
T  5715032 aaaggtcatacataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgtttatgaagattggttttgtcatctaaaaaa 5714953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 382
Target Start/End: Original strand, 27027760 - 27027823
Alignment:
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||    
T  27027760 caatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgctatccaaaaa 27027823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23793107 - 23792941
Alignment:
Q  201 atgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagt 300  Q
    |||||||| | |||| | ||||||||||||||| ||||  | || | ||| ||||||| | |||| ||||| || |||||||||||| |||| ||| |||    
T  23793107 atgagaaaatatgttttgacaatcaacatgcttctatatcaattatgtttgacacttttgttttcttagcaccacaggttgttgaccttctaaatacagt 23793008  T
Q  301 tcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgat 367  Q
    ||||| | |||| ||||  ||||| ||||||||||| |  || ||| |||||||||| | |||||||    
T  23793007 tcaaaggatcatacatagtaatgtaatgtctcctaggtctataaatcttgtgtttacaaggattgat 23792941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 382
Target Start/End: Original strand, 41071736 - 41071794
Alignment:
Q  324 tcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41071736 tcatgtcttctagatttatgaatgttatgtttacgaagattgattttgtcatccaaaaa 41071794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 44526001 - 44525927
Alignment:
Q  280 tgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtt 354  Q
    |||||||| |||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44526001 tgttgaccttctacatggagttcaaaagaatatgcataacaatgtcatgtctcctatatccatgaatgttgtgtt 44525927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38839313 - 38839240
Alignment:
Q  309 tcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  38839313 tcatgcataacaatgtcatgtttatcaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattggttttaccatccaaaaa 38839240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Original strand, 45974731 - 45974792
Alignment:
Q  321 atgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||    
T  45974731 atgtcatgtctcctaggttcatgaatgttgtgtttacaaggataaattttgtcatccaaaaa 45974792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 317
Target Start/End: Original strand, 10032192 - 10032299
Alignment:
Q  210 tgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggt 309  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||| | | |||| | ||| |||||| ||| |||||| ||| |||| ||| |||||||| | |    
T  10032192 tgtgttctgacaatcaatatgtttttatactatttgcttttgatattttcagcttcttagcattagatgttgttaaccttctacatagagttcaaaggat 10032291  T
Q  310 catgcata 317  Q
    ||||||||    
T  10032292 catgcata 10032299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 217
Target Start/End: Original strand, 33202368 - 33202493
Alignment:
Q  91 acatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaa 190  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||| | | | ||||  ||| |||||| | | ||    
T  33202368 acatgcatgtgtggacttgact-gggtttcaccgcttgtgggattaggggttggggcttttacagtaggatagaaagccctggaagttgcgtccaactaa 33202466  T
Q  191 gtgaccaaacatgagaaagtgtgttct 217  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||    
T  33202467 gtggccaaacatgagaacgcgtgttct 33202493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 38596744 - 38596635
Alignment:
Q  7 tgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggac 106  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||| | || |  ||||| |||||||| |||||| |||| |  |||| |||||||| |||||    
T  38596744 tgttaacttcctgaccgacccactaaataaaagatcgacacttaagcatgtggatgttatggtgtacggatgtgtagaagaaaaatatgcatgtatggac 38596645  T
Q  107 ttgattgggg 116  Q
    |||| |||||    
T  38596644 ttgactgggg 38596635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38839563 - 38839393
Alignment:
Q  59 gatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttag 158  Q
    |||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| || | ||||| || |||||| ||| || |||| | ||||||||  ||    
T  38839563 gatgttatggtgtacggatgtgtaaga-gaaaacatgcatgtgtggacttgactgagatttcatca-ttgtgggatttggggtcgtgtcttttacggaag 38839466  T
Q  159 gacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgc 231  Q
     ||| ||||| ||||||| ||||| ||  ||| |   ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||    
T  38839465 aacagacaactctaaaagttgcgtaaaataaaatcgtcaaacatgagaaagcatgttatgtcaatcaacatgc 38839393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2904335 - 2904294
Alignment:
Q  341 atgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  2904335 atgaatgttgtgtttacgataattggttttgctatccaaaaa 2904294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1249735 - 1249667
Alignment:
Q  147 cttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgtt 215  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1249735 cttttacggtaggatagacagccctaaaacctgcgtcaaataaagtggtcaaacatgagaaagcgtgtt 1249667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26770119 - 26770047
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||| | ||| ||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  26770119 agttcaaaagatcatgcacaacaatatcatgactcttaggtccataaatattgggtttacgatgattcatttt 26770047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Original strand, 4412882 - 4413259
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  4412882 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 4412981  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4412982 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcagaccttttaccgtaggacaggcaaccctaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatga 4413081  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||  ||||||    
T  4413082 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagagattgttgaccttctacatagggttcaa 4413181  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  4413182 aaggtcatgcatagcaaagtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcatgaggattgattttgccatccaaaaa 4413259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 391
Target Start/End: Original strand, 41867724 - 41868110
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  41867724 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 41867823  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| || | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||  || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41867824 acttgactgagatttcacgacttgtgggattaggtgtcggaccttttatcgtaggacaggcagccttaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 41867923  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  41867924 gaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaa 41868023  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagctagcgg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| | |||||||    
T  41868024 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcccaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccaccaaaaagatctagcgg 41868110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17344929 - 17344552
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17344929 cctgtgaactttctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 17344830  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||| |  ||  ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  17344829 acttgactggggtttcacaacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggaaagccagtccttaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacga 17344730  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  17344729 gaaaacgtgttttcacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccataggctgttgaccttctacatagagttcaa 17344630  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  17344629 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgatttttcgatccaaaaa 17344552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28225291 - 28224914
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28225291 cctgtgaactttctgacttacccactagatagaatatcgacacttaggcctacggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 28225192  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||  || |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28225191 acttgaatggggtttcactacttgtgggcttaggagttagggcttttacggtaggacaaacaactttaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaatatga 28225092  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||    
T  28225091 gaaagcgtattctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcttcagaggttgttgaccttctacatagagtccaa 28224992  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | | | |||||| ||||| | ||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  28224991 aggattatgcatgacaatattatgtctcctaggtcaatgaatgttgtgtttatgaagatttgttttgccatccaaaaa 28224914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 382
Target Start/End: Original strand, 9685227 - 9685608
Alignment:
Q  1 ggctcctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgt 100  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |   ||||||||||  |||||||||  |||||||||  |||    
T  9685227 ggcttctgtgaacttcctgactgacccactagatagaaggtcaacactcaggcctgcaaacattatggtgtgcatatgggtaggtggaaaacatgattgt 9685326  T
Q  101 gtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaac 200  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||| |  || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9685327 gtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgtaggataggcagccctaaaatccgcgtcaagcaaagtggccaaac 9685426  T
Q  201 atgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagt 300  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||| ||||||  ||||| ||| |||| |||||||| |||    
T  9685427 atgaaaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgattttctagcactagaggctgtggaccttctatatagagt 9685526  T
Q  301 tcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  9685527 tcaaaaggtcatggatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacaaagattgtttttgccatccaaaaa 9685608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Original strand, 19161600 - 19161976
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19161600 ctgtgaacgtcctaactgacccattagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatgatgtaaggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtaga 19161699  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    ||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||     
T  19161700 cttgaatagggtttcaccacttgtgagattagatgtcaggccttttatggtaggacatacatccctaaaatctgcgtcaagaaaagtgggcaaacatgaa 19161799  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||  || ||  ||||| || | ||| | || ||| ||||||||    
T  19161800 aaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcggttttgtaacactagaggctgcttaccttttacatagagttcaaa 19161899  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19161900 aggtcatgcatatcaatgtcatgtctcctaggtcaatgaatagtgtgttttcgaggattgattttgtcatccaaaaa 19161976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27502652 - 27502276
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27502652 cctgtgaactttctgactgacccactagatgcaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 27502553  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| |  |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27502552 acctgaatggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcagagcttttacgataggacaat-aaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 27502454  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  |||||||||||| |   |||||||| |||| ||| | | |||    
T  27502453 gaaaacgtgttccgacaaacaacatgcttttatacaattgctttttgacactttcgacttcctagcatcatatactgttgaccttctacatagaatccaa 27502354  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | ||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27502353 agggttatgcatagcaatatcatgtctcctagatctatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgcaatccaaaaa 27502276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Original strand, 18744770 - 18745147
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18744770 cctgtgaatttcctgactgacccgctagaaagaatatcaacactcaggcctgcgggtgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 18744869  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||  |||   | |||| ||||| ||||||||  | ||| ||||||| ||    
T  18744870 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcaggccatttaccgtaacacaggaagcccttaaagcagcgtcaagttaggtggccaaacacga 18744969  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| ||||| ||| |||||| || ||| ||||| || |||| ||| |||||||    
T  18744970 gaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacattttcgattttctagcaccataggctgttggccttctacatagagttcaa 18745069  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| ||||||||| ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  18745070 aagatcatgcatagcaatgtcatatttcctaggtctatgaatgttgtgtttataaggattggttttgccatccaaaaa 18745147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 6 - 384
Target Start/End: Original strand, 23484755 - 23485131
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| || | |  ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23484755 ctgtgaacttcctgattgacctactatatagaagatcaacactcaagcatgcatatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtaga 23484854  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| | ||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  23484855 cttgattggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggcctttaacggtgggacaactagccctaaaagctacgtcaaacaaagtggccaaatatgag 23484954  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |    ||||    || ||| ||||||||    
T  23484955 aaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacac-ttctgtttcctagcaccaga-gacaatgacttcttacatagagttcaaa 23485052  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||||    
T  23485053 agatcatgcataacaatgctatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacaaaaattggttttgccaaccaaaaaag 23485131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 44686686 - 44686348
Alignment:
Q  28 actagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccactt 127  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||| |  |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44686686 actagatagaagattgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacaaatgttt-ggacgaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccactt 44686588  T
Q  128 gtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaa- 226  Q
    ||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  44686587 gtgggtttaggggtcggggcttttacgataggacagacagtcctaaaagctg-gtcaagcaatgtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaat 44686489  T
Q  227 ---catgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatg 323  Q
       |||||||||||| | || | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| | | |||| ||| ||||||| |||||    
T  44686488 caacatgcttttatattgttcgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagtttgttgaccttctacatagattccaaagggttatgcatagcaatg 44686389  T
Q  324 tcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgatt 364  Q
    | ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||    
T  44686388 ttatgtctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacgaggatt 44686348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 11 - 336
Target Start/End: Original strand, 20142562 - 20142872
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| | ||   |||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  20142562 aacttcctgactgacccagtagatagaagatcaacactcaaacctgcagacattatggtgtacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 20142661  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||||  || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||           
T  20142662 ttggggcttcaccacttgtgggattaggtgtcgtaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatg------- 20142754  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
            ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||||    
T  20142755 --------acaatcaacatgcttttataccattttcttttgacacttttggttttctagcatcaaaggttgttgaccttatacatagagttcaaaaggtc 20142846  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctag 336  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  20142847 atacataacaatgtcatgtctcctag 20142872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5532700 - 5532336
Alignment:
Q  15 tcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattgg 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||   | | || | |||| ||| ||||  |||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |  ||    
T  5532700 tcctgactgacccactagatagaagatcgacatcgaagtctgcagatgttatagtgtatggactggtaggagaaaaacatgcatgtgtgaacttaaccgg 5532601  T
Q  115 ggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgt 214  Q
     |||||||||||  | | |||||| ||||||  ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||    
T  5532600 agtttcaccactcataggattaggggtcggggattttacggtaggacatgcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaacgtgt 5532501  T
Q  215 tctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgc 314  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  | ||||||||| || |||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5532500 tgtgacaatcaacatgcttttatactatttacttttgacacttt-agcttcctagcaccataggttgttgagcttctacatagagttcaaagggtcatgc 5532402  T
Q  315 ataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    | ||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||  |||||||||    
T  5532401 acaacaatgccatgactcctaagttcatgaatg-tgtgtttacaaggattgattttctcatccaaaa 5532336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3826017 - 3825640
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | | || |  ||||| || ||||| |  ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3826017 ctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacctttatgcttgtggatgttaaggtgtacaaatgagtaggagaaaaacatgcatgtgtgga 3825918  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||| || |||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||     
T  3825917 cttgattgaggtttcaccccttgtgggattaggggtcaggacttttacggtatgacagagagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgaa 3825818  T
Q  206 aaagtgtgtt-ctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| | || || |||||| ||||| ||||||   ||||| ||   ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| || | ||  |||||||    
T  3825817 aaagttttttcctgacaatctacatgtttttatttcatttgcttcagacactttcaatttcctagcatcaaaggttgttgaccttcaacatcgagttcaa 3825718  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |   ||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  3825717 agaatcatgcatagcaatgtcatgtcttctaggaccataaatgttgtgtttatgaagatcgattttgtcatccaaaaa 3825640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 76 - 383
Target Start/End: Original strand, 16351726 - 16352038
Alignment:
Q  76 atgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttagg---acaaacaacccta 172  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||  | | |||||||| ||||||||||| |||||||    |||||| ||||   ||| |||| ||||    
T  16351726 atgggttggaagacaacatgcatgtgtagacttgacagag-tttcaccatttgtggaattatgtgtcggagtatttacgataggtagacagacaatccta 16351824  T
Q  173 aaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttc---ggtttcctag 269  Q
    |||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| | |||| |||| ||| |||    || |   ||     
T  16351825 aaagttgtgtcaagcaaagtggtcaaacatgagaaaatgtgttctcacaatcaacataattttatattgtttgcttttgacattttgtttggctctttat 16351924  T
Q  270 catcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattt 369  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  16351925 catcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatggtcatgcacaacaatgtcatgtctcttaggtacatgaatattatgtttacgatgattgtttt 16352024  T
Q  370 tgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||||| ||||||    
T  16352025 tgccatctaaaaaa 16352038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 241 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13413406 - 13413265
Alignment:
Q  241 atttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattc 340  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  13413406 atttgtttttgacactttcggttttcaagcagcagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtcc 13413307  T
Q  341 atgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  13413306 atgaatgttgtgtttatgagaattggttttgccatccaaaaa 13413265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 161 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2888651 - 2888463
Alignment:
Q  161 caaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcg 260  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||| | ||||||| |    
T  2888651 caaacaaccctaaaagttgcgtctagcaaagtggacaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttataccattcgtttatgacacttttg 2888552  T
Q  261 gtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgtt 349  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||| |||| | |  |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || || ||| ||||||    
T  2888551 gcttcctaacacaagaggttgttgaccttctacacaaggttcaaaatgtcatgcacaacaatgtcatatctcttaaatccataaatgtt 2888463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Original strand, 34814803 - 34814961
Alignment:
Q  173 aaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcat 272  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||| ||     
T  34814803 aaagcttcgtcaaataaagtgatcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttataccatttgctttcgacactttcgg-ttcctaacac 34814901  T
Q  273 cagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctc 332  Q
    |||||  |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34814902 cagagactgttgaccttctacatagagttcaaatggtcatgcataacaatgttatgtctc 34814961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 382
Target Start/End: Original strand, 7760737 - 7761038
Alignment:
Q  80 gtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctg 179  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||| |   |  | |||||| | | |||||| ||||||| ||||  |    
T  7760737 gtaggaggaaaacatacatgtgtgaacttgactagggtttcaccacttgtgggattatgaaccaagacttttatggtgggacaagcaaccctcaaagtcg 7760836  T
Q  180 cgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggt 279  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||||| |||  |||  ||| |||||  ||  |||| || ||||| ||| || |||||||    
T  7760837 cgtcaagtaaagtggccaatcatgagaaaacgtgatctaacaatca-catattttcttacgatttgcattagacacctttggttttctatcaccagaggt 7760935  T
Q  280 tgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||| | |||||| || |||||| ||||||| ||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  7760936 tgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcgtagcaatgtgatgtctcataagttcaagaatgatgtgcttacgaaaattgattttgacatccaa 7761035  T
Q  380 aaa 382  Q
    |||    
T  7761036 aaa 7761038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 29808295 - 29807988
Alignment:
Q  73 cggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaacccta 172  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||| || | |  |||||   ||||| |  ||||  ||    
T  29808295 cggatgagtacgaggaaaacatgcatttgtgaatttgattggggtttcaccacttattggattagg-gttgaga-ttttattgtaggatagtcaacttta 29808198  T
Q  173 aaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcat 272  Q
    |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| | |   |||||||||||    
T  29808197 aaagttgcctcaagtaaagtcaccaaacatgagacagcgtgttataacaatcaacatg-ttttataccatttgcttttcacattatttatttcctagcat 29808099  T
Q  273 cagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgc 372  Q
    | ||||||||||||| | || ||| |||| ||  ||||||||| |||||  |||||  |||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||||| |    
T  29808098 cggaggttgttgaccttttacatagagtttaagtggtcatgcacaacaacatcatgaatcctaggtccatgaatgtcgtatttacaaggattgattttac 29807999  T
Q  373 catccaaaaaa 383  Q
     ||||||||||    
T  29807998 tatccaaaaaa 29807988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 382
Target Start/End: Original strand, 32029098 - 32029279
Alignment:
Q  201 atgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagt 300  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  32029098 atgagaatgtgtgttcagacaatcaacatgctttcatatcatttgtttttgacactttcagcttcccaacttcagaggctgttgaccttctacatagagt 32029197  T
Q  301 tcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||| | |||||||||| |||| ||| || ||| ||||||    
T  32029198 tcaaagagtcatccataacaatgtcatgtcttataggatcatgaatatcgtgtttacgaagattaattctgtcattcaaaaa 32029279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 382
Target Start/End: Original strand, 13147087 - 13147293
Alignment:
Q  179 gcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacat---gcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcag 275  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||     |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||| || |||    
T  13147087 gcgtcaagaaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcagcatatactttttataccatttgattttgacacttttggttttctaacaccag 13147186  T
Q  276 aggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccat 375  Q
    || ||||||||| |||  ||||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||  ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||    
T  13147187 agattgttgaccttcttcatatagtacaaagggtcgtgcacaacaatgtcttgtcttctaagttcatgaatattgtatttacgaaaattgattttgtcat 13147286  T
Q  376 ccaaaaa 382  Q
    | |||||    
T  13147287 ctaaaaa 13147293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 206 - 382
Target Start/End: Original strand, 2886632 - 2886808
Alignment:
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | | || ||| ||||||||    
T  2886632 aaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgtttttgatattttcggtttccaagcatcagaggctgttgatcttttacatagagttcaaa 2886731  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattga-ttttgccatccaaaaa 382  Q
    ||  |||||||| |||| |||| |||| | | | ||| ||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  2886732 agagcatgcatagcaatatcatatctcgt-ggtccataaatgttgtgtttatgaggattgatttttgtcatccaaaaa 2886808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 10579611 - 10579719
Alignment:
Q  21 ctgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttc 120  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||| ||||| ||  ||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10579611 ctgacctaccagatggaagatcgacacttaggccaacaaatgttatggtgtacgagtgggtaggaggaaaacatgcatttgtggacttgactggggtttc 10579710  T
Q  121 accacttgt 129  Q
    |||||||||    
T  10579711 accacttgt 10579719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9675081 - 9674947
Alignment:
Q  59 gatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttag 158  Q
    |||| |||| ||| || ||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||  || | ||||||| | |||    
T  9675081 gatgttatgatgtacgaatgagtaggaggaaaacatgcatgtatgaacttgattggggtttcaccactcatgggattagggatcagaccttttatggtag 9674982  T
Q  159 gacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtg 193  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||| |||||||    
T  9674981 gacaaatagccctaaaatatgcgtcaaacaaagtg 9674947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 136
Target Start/End: Original strand, 13146951 - 13147081
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| | |||| |   |||| |||||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||| |    
T  13146951 ctgtgaacttcctgattaacccactagatagaagatcgacatttaggcatgtagatgttatggtgtacgcatgggtaggaagaaaacacggatgtgtgaa 13147050  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaatta 136  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||    
T  13147051 cttgactgtggtttcaccacttatgggatta 13147081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 239
Target Start/End: Original strand, 1296025 - 1296100
Alignment:
Q  164 acaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatac 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  1296025 acaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaatatgttctgacaataaacatgtttttatac 1296100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 355
Target Start/End: Original strand, 33612555 - 33612711
Alignment:
Q  197 aaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatata 296  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| || | ||||||||||||  ||  || |    
T  33612555 aaacatgagaaaacgtgttttgacaatcaacatgattttatacaatttgtatttgacacttttggcttcctaacaccggaggttgttgacattc--taca 33612652  T
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgttt 355  Q
     |||||| | ||||   |||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  33612653 gagttcagagggtcgctcatagcaatgtcttgtcccctaggtccatgaatgttgtgttt 33612711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24765255 - 24765178
Alignment:
Q  302 caaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| || ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  24765255 caaagggtcatccataacaatgtcatgtctcttaggtccatgaatgttctggttatgatgattaattttggcatccaa 24765178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 382
Target Start/End: Original strand, 26407843 - 26407887
Alignment:
Q  338 ttcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26407843 ttcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgctatcctaaaa 26407887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 44720512 - 44720380
Alignment:
Q  107 ttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgaga 206  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| |||||| ||| |   ||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||||| ||  || |||||||||| |    
T  44720512 ttgattgaggtttcaccgtttgtgggattaggggtcagcaattttacgttagaacatgcaacgctaaaagccgcgtcaagtaagatggccaaacatgaaa 44720413  T
Q  207 aagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatac 239  Q
    ||  ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  44720412 aaacgtgttatgacaatcaacatgtttttatac 44720380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 385
Target Start/End: Original strand, 8036534 - 8036680
Alignment:
Q  241 atttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataa--caatgtcatgtctcctagat 338  Q
    |||||||||| | | ||| || ||| || |||||||||||||||||| | || ||| |||||||| | | |||||||   |||||||||||||||||| |    
T  8036534 atttgtttttgatatttttggcttcgtaacatcagaggttgttgaccttttacatagagttcaaaggtttatgcatatatcaatgtcatgtctcctaggt 8036633  T
Q  339 tcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagc 385  Q
     | |  || |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8036634 ccgtagatattgtctttacaatgattgattttgtcattcaaaaaagc 8036680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 359
Target Start/End: Original strand, 20142871 - 20142923
Alignment:
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacga 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  20142871 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctag-gtcatggatgttgtgttgacga 20142923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 379
Target Start/End: Original strand, 24762900 - 24762977
Alignment:
Q  302 caaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| || ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  24762900 caaagggtcatccataacaatgtcatgtctcttaggtccatgagtgttctggttatgatgattaattttggcatccaa 24762977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 119
Target Start/End: Original strand, 3661843 - 3661881
Alignment:
Q  81 taggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggttt 119  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3661843 taggatgaaaacatacatgtgtggacttgattggggttt 3661881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 324
Target Start/End: Original strand, 3968402 - 3968544
Alignment:
Q  182 tcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttg 281  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||   |||| | |||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||| ||| |  ||| ||| ||| ||| |||    
T  3968402 tcaagcaaagtggtcaaatatgagaaaacatgttttgacaatcaatatgcttttatacaatttgcgtttgacatttttgacttcatagtatctgagtttg 3968501  T
Q  282 ttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
    || ||| |||||| | |||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3968502 ttaaccttctataaaaagttcaaaggatcacgcataacaatgt 3968544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 382
Target Start/End: Original strand, 11921218 - 11921397
Alignment:
Q  197 aaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatata 296  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||||||  ||| || | |||| ||  |||||||| |||| |||    
T  11921218 aaacattagaaaacgtgttctgacaatcaacatatttttataccgtttgttttttatactttcaattttctggtatcatagactgttgaccttctacata 11921317  T
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     |||||||| |||      || |||| | || ||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||||||||    
T  11921318 gagttcaaagggt------tatcaattttatatcttctaggtccatgaatgttgtgtttactaggattagtttcgccatccaaaaa 11921397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9200281 - 9200212
Alignment:
Q  267 tagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctag 336  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| |  |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  9200281 tagcaccaaaggttgttgaccttctaaaactagttcaaagcgtcatgcataacaatattatgtctcctag 9200212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 384
Target Start/End: Original strand, 15515302 - 15515342
Alignment:
Q  344 aatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15515302 aatgttgtgttcacgaggattggttttgccatccaaaaaag 15515342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 32269622 - 32269993
Alignment:
Q  14 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32269622 ttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaaatctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactg 32269721  T
Q  114 gggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtg 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  32269722 gggtttcaccacttctggaattaggtgtcgggccttttatggtaggacatgcaaccctaaaagctgcatcaaccaaagtggtcaaacatgagaaagtgtg 32269821  T
Q  214 ttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatg 313  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||    
T  32269822 ttctgacaatcaacacgcttttataccatttgcttttgatactttcgatttcctagcactagaggttgttgaccttctgcatgaagttcaaaaggtcatg 32269921  T
Q  314 cataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagc 385  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32269922 catagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgatttcgccatccaaaaaagc 32269993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35310739 - 35310364
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  35310739 cctgtgaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacacttaggcttgcggatgttatgatgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 35310640  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35310639 acttgattggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacaaccctaaaagatgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 35310540  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||| ||| |||    
T  35310539 gaaagcatgttctgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacactttcggcttcctggcatcagaggctgttaaccttctacatagagtccaa 35310440  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaa 380  Q
    | |||  |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  35310439 agggttttgcatatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgccatccaaa 35310364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 386
Target Start/End: Original strand, 15291842 - 15292222
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  15291842 cctgtgaacttcccaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcgaatgttatggtgtacggctgggtaggaggaaaacatgtttgtgtag 15291941  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || || |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15291942 acttgaatgaggtttcaccacttgttggattaagtgtcgggccttttgcggtatgacagacaaccctaaaagtggcgtcaaacaaagtggccaaacatga 15292041  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||| |||| | |||| | | |||||||    
T  15292042 gaaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttatacaatttgttttttacacttttagttttctagcactagaggttattgatcttctaca-aaagttcaa 15292140  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagct 386  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15292141 aaggtcatgcatagcaatgtcacatctcctaggtccatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaaagct 15292222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Original strand, 13166726 - 13167103
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13166726 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcatgcggatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 13166825  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaatt-aggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatg 203  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || | | ||  || |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  13166826 acttgactggg-tttcaccacttgtggattttatgggttagggcttttacggtgggacagacaaccctaaaatctgcgtcaagcaaagtggctaaacatg 13166924  T
Q  204 agaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttca 303  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||| ||    
T  13166925 agaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagagactgttgaccttctacatagagtcca 13167024  T
Q  304 aaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  13167025 aagggttatgcatagcaatggtatgtctcctaggtccatgaatgttgggtttacgatgattgattctgttatccaaaaa 13167103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27336987 - 27336609
Alignment:
Q  2 gctcctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtg 101  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27336987 gctcctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtg 27336888  T
Q  102 tggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaaca 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  27336887 tggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacaataggacagacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggtcaaaca 27336788  T
Q  202 tgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagtt 301  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||  || ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||      
T  27336787 tgagaaatcgtgttctgacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagag-- 27336690  T
Q  302 caaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     ||| ||| ||| ||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  27336689 aaaatggttatgtatagcaatgttatgtctcctaagtccatgaatgttgtttttacaaggattgattttgccatcaaaaaa 27336609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Original strand, 33691878 - 33692245
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| |  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33691878 aactttctgactgaccc-ctagatagaagatcgacacttaagcctgcaaatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 33691976  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     || |||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  33691977 ctgaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaggcaggcctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgacaaaac 33692076  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| |||  || |||| |||     
T  33692077 gtgttatgacaatcaacatgcttttgtaccatttgcttttgacactttcggcttcttagcatcagagactgttgaccttctacatagtgtccaaagggt- 33692175  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  33692176 atgcataacaatgttatgtctcataggttcatgaatgttctgtttacgat--ttggtttttccatccaaaaa 33692245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 14423887 - 14423601
Alignment:
Q  87 gaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaag 186  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  14423887 gaaaatatgcttgtgaagacttgattggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggacctttaaccgtaggacaggcaaccctaaaaaatgcgtcaag 14423788  T
Q  187 caaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  14423787 caaagtgaccgaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttc----tcctagcatcagaggctgttgac 14423692  T
Q  287 cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | |||| ||| ||||   ||||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||  ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  14423691 cttctacatagagtt---aaggtaattcataacaatgtcatgtctcttaggtccataaa--ttgtgttcacaaggattggttttgccatccaaaaa 14423601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 147 - 382
Target Start/End: Original strand, 37873596 - 37873831
Alignment:
Q  147 cttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgt 246  Q
    |||||||| ||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||     
T  37873596 cttttacggtaggacagacagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgc 37873695  T
Q  247 tttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaat 346  Q
    |||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| |  ||||||    
T  37873696 ttttgacacttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcagaacaatgtcatgacttctaggtctatgaat 37873795  T
Q  347 gttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  37873796 gttgtgtttaagaggattgattttgctatcaaaaaa 37873831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Original strand, 26212398 - 26212776
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaaca-tgcatgtgtg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||||||| ||| ||| ||||  ||||| | |||||||||     
T  26212398 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcatgcagatgtgatggtgtacgggtggctaggtggaaaaaaatgcatgtgta 26212497  T
Q  104 gacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggcctttta-cgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacat 202  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||| |||| |||    ||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  26212498 gatttgactggggtttcatcacttgtgagattaggtgttggaccttttatcgtt-ggaatggcagttctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacat 26212596  T
Q  203 gagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttc 302  Q
    ||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | || ||| |||| ||| |||||    
T  26212597 gagaaagcgtattctgacgatcaacatgcttttataccatttgttttttaccctttcagtttcttagcaccagaggctattaaccttctacatagagttc 26212696  T
Q  303 aaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| |||||| ||  |||| | ||||||||||  | |||||||||||| || | || ||||| ||||||| ||| ||||    
T  26212697 aaaatgtcatgtatggcaatattatgtctcctaagtccatgaatgttgttttcatgaggattggttttgccttccgaaaa 26212776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34335613 - 34335262
Alignment:
Q  20 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggttt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |  ||| |||||||| |  ||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||     
T  34335613 actgacccactagatagaagatcgacacttaggcttgcatatgttatggtgtacaaatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtggaattcactggggttc 34335514  T
Q  120 caccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaa 219  Q
     | ||||||| | |||| | |||    |||||||  ||||| | ||||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||||||| |||| || |    
T  34335513 tatcacttgtaggattaagggtcaaagcttttactgtaggatagacaaccctaaaagccatgtcaagcaaaagggccaaacatgagaaagcgtgtcctga 34335414  T
Q  220 caatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataac 319  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||  || |||||| |||||||| |||| ||| |||||||  | |||||| ||||    
T  34335413 caatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgactttctgacaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaacggatcatgcgtaac 34335314  T
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttg 371  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34335313 aatctcatgtctcctagacccataaatattgtgtttacgatgattgattttg 34335262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 165 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38875769 - 38875570
Alignment:
Q  165 caaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggttt 264  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||    
T  38875769 caaccctaaaaactgcatcaaacaaagcgaccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgtttttgtaccatttgtttttgacactttcagctt 38875670  T
Q  265 cctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgatt 364  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  38875669 cctagcaccagaggctgctgaccttctacgtagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcttgtctcctaggtcaatg-atgttgtgtttacgatgatt 38875571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 221 - 384
Target Start/End: Original strand, 22188687 - 22188850
Alignment:
Q  221 aatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataaca 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22188687 aatcaacatgattttatactatttgtttttgacactttcgattttttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataaca 22188786  T
Q  321 atgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  22188787 atatcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgagaattggttttgtcatccaaaaaag 22188850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43129823 - 43129525
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |    
T  43129823 ctgtgaactttcttactgatctactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatgatgtacggatggataggaggaaaa-atgcatgtgtgaa 43129725  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
     |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||  |||||||| | |||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43129724 attgactggggtttcaccacttgttggattaggggtcggaacttttacggttggacattcagtcctaaaagatgcgtcaagcaaagtggtcaaacatgag 43129625  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||| |||| | | ||||||||    
T  43129624 aaaacgtgttctgacaatcaacatgtttttctaccatttgcttttgacattttcggtttcctaacaccagatgtttttgaccttctacagagagttcaaa 43129525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 168 - 382
Target Start/End: Original strand, 25663011 - 25663225
Alignment:
Q  168 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcct 267  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||| | |||||    
T  25663011 ccctaaaagctgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaacatgtttttataccatttgcttttgacactttcagcttcct 25663110  T
Q  268 agcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgat 367  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| ||| ||| |||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| |||||      
T  25663111 agcatcagaagttgttgatcttctacatagagtccaaagggttatgcatatcaatgttatgtcccctaggtccatgaatgttgagtttacgaggattggc 25663210  T
Q  368 tttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||||||||||    
T  25663211 tttgtcatccaaaaa 25663225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42921797 - 42921612
Alignment:
Q  196 caaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatat 295  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||    
T  42921797 caaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttatgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttggccttctacat 42921698  T
Q  296 atagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  42921697 agagttcagaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaagtccat-aatattgtgtttacaaggattggttttgccatccaaaaa 42921612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 433577 - 433370
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||| | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  433577 aactttctgactggcccactaaatagaagatccacacttaggcatgcggatgttatggtgtacagatgggttggaggaaaatatgcatgtgtggacttga 433478  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
      ||||||||||||| |||||  ||| | || ||| |||||||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  433477 ccggggtttcaccacctgtgggtttaagggtaggggcttttacggtaggatagacaaccttaaaagctgtgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagc 433378  T
Q  211 gtgttcta 218  Q
    ||||||||    
T  433377 gtgttcta 433370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 212 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 430686 - 430516
Alignment:
Q  212 tgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtca 311  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |  ||| ||||||||||||  ||||||| |||| ||| | | |||| ||| |    
T  430686 tgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttgtcttcatagcatcagaggcagttgaccttctacatagattccaaagggtta 430587  T
Q  312 tgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  430586 tgcatagtaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgattatgccatccaaaaa 430516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 267
Target Start/End: Original strand, 3114000 - 3114241
Alignment:
Q  25 cccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcacca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | | | |||| |||||||| |  ||||||| || |||| ||  ||| ||| |||||||   |  ||||||||    
T  3114000 cccactagatagaagatcaacacttagtcatgcagatgttatggtgtacaaatgggtaagaggaaa-cactcatttgtagacttgaccagtatttcacca 3114098  T
Q  125 cttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatc 224  Q
    ||  ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||  || ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||    
T  3114099 ctcatgggattaggggtcggggcttttacggtaggacaggcagccctaaaagttgcatcaaacaaagtggccaaacatgagaaagcatgttctgacagtc 3114198  T
Q  225 aacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcct 267  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3114199 aacatgtttttataccatttgtttttgacacttttggtttcct 3114241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 289 - 382
Target Start/End: Original strand, 2566195 - 2566288
Alignment:
Q  289 tctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2566195 tctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatcaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaa 2566288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8100736 - 8100465
Alignment:
Q  112 tggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtg 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| |   |||||||  || ||||||| ||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||  |    
T  8100736 tggggtttcaccacttgtgggattaagagtcgggactttaatagtaggacatgcatccctaaacgctgcatcaagtaaaatggtcaaacatgagaaaacg 8100637  T
Q  212 tgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtca 311  Q
    |||| | |||||  |||||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||  ||  |||||||||||||| ||||  || |||| |||   |||    
T  8100636 tgttgtgacaatttacatgcttttataccatttgtttgtgacactttcaacttccttccactagaggttgttgaccttctacgtagagtttaaagattca 8100537  T
Q  312 tgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagc 385  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100536 tgcatatcaatgtcatgtcttctag-gtcgtaaatgttgt-tttgcgatgattgattttgccatccaaaaaagc 8100465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35456188 - 35455965
Alignment:
Q  64 tatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaa 163  Q
    |||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||| ||| ||||||||||| ||||  |     
T  35456188 tatggtgtacagatgggtaggaggtaaatatgcatgtgtggacttgaccggggttttgccactcgtaggattaggggtccggccttttacggtagggtag 35456089  T
Q  164 acaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtt 263  Q
      | ||| ||||| || || ||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||| || |    
T  35456088 gtagcccaaaaagttgtgttaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtgttctaacaatcaacatgcttttataccttttgcttttgacaattttggct 35455989  T
Q  264 tcctagcatcagaggttgttgacc 287  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  35455988 tcctagcaccagaggatgttgacc 35455965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38446442 - 38446267
Alignment:
Q  20 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggttt 119  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||| |||| | |  ||| |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38446442 actgaccctctagatagaatatcgacacttaggcatgcaaatgttatggtgtacggatgggttggagtaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggttt 38446343  T
Q  120 caccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccct--aaaagctgcgtcaagcaaagtg 193  Q
    ||||||||||||  ||||| || ||| |||||||| || ||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  38446342 caccacttgtgggtttaggagttggggcttttacggtatgacatgcatccctaaaaaagctgcgtcaagcaaagtg 38446267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 327
Target Start/End: Original strand, 14723269 - 14723382
Alignment:
Q  214 ttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatg 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||||    
T  14723269 ttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgttttttacacttttggttttttagcatcagaggttgttgaccttatacttaaagttcaaaatgtcatg 14723368  T
Q  314 cataacaatgtcat 327  Q
    ||||||||| ||||    
T  14723369 cataacaatatcat 14723382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23023591 - 23023509
Alignment:
Q  300 ttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23023591 ttcaaaaggtcatgcatatcaatgtcatgtctcctaggtcgatgaatgttgtgtttacgaagattgattttgtcatccaaaaa 23023509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Original strand, 9841148 - 9841274
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgc-ggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttg 109  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||  |||||    
T  9841148 aacttcctgacttacctactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtgcgggatgggtagaagaaaaacatgcgtgtgtaaacttg 9841247  T
Q  110 attggggtttcaccacttgtggaatta 136  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||    
T  9841248 agtagggtttcaccacttgtgggatta 9841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 263 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15833092 - 15832985
Alignment:
Q  263 ttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatga 362  Q
    ||||||||| |||| ||||||||   |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  15833092 ttcctagcaccagatgttgttga---tctatatagagttcaaatggtcatgtataacaatgtcacgtctcctagattcatgaatgtcgtgttcacgagga 15832996  T
Q  363 ttgattttgcc 373  Q
    ||  |||||||    
T  15832995 ttagttttgcc 15832985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 239
Target Start/End: Original strand, 32230489 - 32230557
Alignment:
Q  171 taaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatac 239  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32230489 taaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaatgtgttctgacaatcaacaagcttttatac 32230557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 90 - 257
Target Start/End: Original strand, 43115359 - 43115525
Alignment:
Q  90 aacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaa 189  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||  |||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||| ||  ||    
T  43115359 aacatgcatgtatggatttgatcggggtttcaccactcatgggattagaggtcggggcttttacggtaggatagacagccctaaaagttgcgt-aaataa 43115457  T
Q  190 agtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactt 257  Q
    || |  |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||    
T  43115458 agcggtcaaatatgagaaagcgtgttttgacaatcaacatgctttcatagcatttgcttttgacactt 43115525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8859124 - 8858974
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||  ||||||   |    |||||||| | |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  8859124 aaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttcattacttctgagattagggaccatagcttttacggtgggacaagcaacccacaaaactgcgtcaagc 8859025  T
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttata 238  Q
    |||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8859024 aaagtagtcaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttata 8858974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15810081 - 15809972
Alignment:
Q  262 tttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaa-ggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgat 360  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||     
T  15810081 tttcctagcacgagaggttgttgacc---tatatagagttcaaaatggtcatgtatagcaatgtcatgtctcctaggcccatgaatgtcgtgttcacgag 15809985  T
Q  361 gattgattttgcc 373  Q
    |||||||||||||    
T  15809984 gattgattttgcc 15809972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 224 - 331
Target Start/End: Original strand, 41343473 - 41343581
Alignment:
Q  224 caacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatat-atagttcaaaaggtcatgcataacaat 322  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||  |||||||| |||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||| | ||||||||||||||    
T  41343473 caacgtgcttttataccatttgttttcgacatattcggttttctagcaccagaggttgttggccttctacataatagttcaaaggatcatgcataacaat 41343572  T
Q  323 gtcatgtct 331  Q
     ||||||||    
T  41343573 atcatgtct 41343581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16017275 - 16017087
Alignment:
Q  195 ccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctat- 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||| | ||||| || ||||||||| ||  |||| | |  |   |||     
T  16017275 ccaaatatgagaaagtgtgttctaataatcaacatgatttaatactatttgcgtttgatacttttggcttcctagca-cattggttttggttcccttatg 16017177  T
Q  294 -atatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     | | |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||  ||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16017176 caaagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgttgtgtctcctaggtttatgggtgtggtttttaagatgattgattttgccatctaaaaa 16017087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 382
Target Start/End: Original strand, 15506724 - 15506808
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  15506724 agtttaaaaggttatgtatagcaatgtcatgtctcctagacctacgaatgttgtgtttacgaggattgattttaccatcaaaaaa 15506808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19260324 - 19260236
Alignment:
Q  276 aggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgatt 364  Q
    ||||| |||||| ||||  || |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19260324 aggttattgaccttctacttagagttcaaagggtcatacataacaatgtaatgtcttatatattcatgaatgttatgtttacgatgatt 19260236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 364
Target Start/End: Original strand, 9829465 - 9829527
Alignment:
Q  302 caaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgatt 364  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  9829465 caaaagatcatgtataacaatgtcatatctcctagattaatgaatattgtgtttaagatgatt 9829527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7716230 - 7716109
Alignment:
Q  247 tttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaat 346  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  | | || ||| |||||||| | | |||||||||||| ||||||||  | | |  ||||||    
T  7716230 ttttgacacttttggttttctagcaccagaggttgttggtcttttacataaagttcaaaggattatgcataacaatatcatgtct--ttg-taaatgaat 7716134  T
Q  347 gttgtgtttacgatgattgattttg 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  7716133 gttctgtttacgatgattgattttg 7716109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12033383 - 12033346
Alignment:
Q  344 aatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12033383 aatgttgtgtttacgatgattggttttgccatccaaaa 12033346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 382
Target Start/End: Original strand, 23423923 - 23424064
Alignment:
Q  241 atttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattc 340  Q
    ||||| |||| ||||||||   |||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| | |||||| | |||| |||  ||||||||||| |||||  |      
T  23423923 atttgcttttgacactttcaacttcctaacatcaaatgttgttgaccttctacatagatttcaaaggatcattcattgcaatgtcatgtatcctacttct 23424022  T
Q  341 atgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23424023 atcaatattgtgtttatgaagattgattttgtcatccaaaaa 23424064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24113571 - 24113514
Alignment:
Q  300 ttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttac 357  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||    
T  24113571 ttcaaatgatcatgcataacaatgtcatgtcttctaggtccatgaatgttgtttttac 24113514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27294468 - 27294387
Alignment:
Q  266 ctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatg 347  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||| |||| | ||||||||    
T  27294468 ctagcaccagaggttgttgaccttctacatatagttcaaatggtcacgtataacaacattatgtcttctaggtccatgaatg 27294387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 136
Target Start/End: Original strand, 27355606 - 27355663
Alignment:
Q  79 ggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaatta 136  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27355606 ggtaggaggaaaacatggatgtgttgaattgaatggggtttcaccacttgtgggatta 27355663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 43350044 - 43349971
Alignment:
Q  312 tgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagc 385  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43350044 tgcacaacaatgtcatgactcttaagtcaatgaatgttgtgtttacaatgattgattttgctatctaaaaaagc 43349971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 258
Target Start/End: Original strand, 9829333 - 9829421
Alignment:
Q  168 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacacttt 258  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||    
T  9829333 ccctaaaagttgcgt-aagcaaagtggctaa-catgataaaatgtgttttgacaatcaacatgcttttataccatttatatttgacacttt 9829421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16598991 - 16598953
Alignment:
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgtttt 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16598991 gtgttctaacaatcaacatgtttttatactttttgtttt 16598953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 258
Target Start/End: Original strand, 26577407 - 26577469
Alignment:
Q  196 caaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacacttt 258  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||    
T  26577407 caaacataagaaagtgtgttccgactatcaacatgtttttatacaatttgtgtttcacacttt 26577469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 34644851 - 34644478
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| ||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34644851 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtatgcggatgttatggtgtatggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 34644752  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  34644751 ctggggtttcaccacttgtgggtttaggggtcggggcttttacggtaggacaagcaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagc 34644652  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||     
T  34644651 gtgttctgacaacctacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatcagaggttgttgaccttctacatagagtccaaagggtt 34644552  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34644551 atgcatatcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 34644478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 29169610 - 29169940
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    
T  29169610 cctgtgaacttcctgactgacccgctagaaagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 29169709  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||| |||| || |||||| || ||| ||||||| ||    
T  29169710 acttgactggggtttcaccactt-tgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggacagacagcccttaaagttgtgtcaagtaaggtggccaaacacga 29169808  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  29169809 gaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttaaccttctacatagagttcaa 29169908  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctag 336  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29169909 aaggtcatgcacagcaatgtcatgtctcctag 29169940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Original strand, 28040944 - 28041320
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||| ||    
T  28040944 ctgtgaacttcctgactaacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgttatggtgtacagatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 28041043  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| |  || | |||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28041044 cttgactggggtttcactacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggataggcagctctaaaatccgcgtcaaacaaagtggccaaacatgag 28041143  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  28041144 aaagtgtgttctgacaatcaacaggtttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggcggttgaccttctacatagagttcaaa 28041243  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||  | ||||||||||||| | | || |||||||||| |||||||||||    
T  28041244 aggtcatgcatagcaatgtcatgtcctctaagtccatgaatgttgtgctcatgaggattgatttttccatccaaaaa 28041320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 29 - 359
Target Start/End: Original strand, 45659487 - 45659816
Alignment:
Q  29 ctagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttg 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |  ||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  45659487 ctagaaagaagatcaacactcaggcatgcacatgttatagtgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtagacttgactggggtttcaccacttg 45659586  T
Q  129 tggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccct-aaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaac 227  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||  || |||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  45659587 tgggattaggtatcgggccttttaccgtaggacatgcagcccttaaaagctgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagcgtgttctgacaatcaac 45659686  T
Q  228 atgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcat 327  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45659687 atgcttttataccatttgcttttgacactttcgatttcctatcaccagaggctgttgaccttc--tatagagttcaaaagatcatgcatagcaatgtcat 45659784  T
Q  328 gtctcctagattcatgaatgttgtgtttacga 359  Q
    ||||||||| |  || ||||| ||||||||||    
T  45659785 gtctcctaggtcaataaatgtcgtgtttacga 45659816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 22347168 - 22346809
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||                |||||||||| | ||| |    
T  22347168 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagacgttatggtg----------------gaaaacatgcttctgtag 22347085  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| | ||||||  |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  22347084 acttgattggtgtttcaccacttgtgga-ttagatttcggactttttaccgtaggacaaacaacc-taaaagttatgtcaagcaaagtggccaaatatga 22346987  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  22346986 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcgtttataccttttgcttttgacactttcggtttcctagtagcagaggttgttgaccttctacacagagttcaa 22346887  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22346886 aaggtcatgcatagaaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgttcacgaggattagttttgccatccaaaaa 22346809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 370
Target Start/End: Original strand, 4861833 - 4862170
Alignment:
Q  33 atagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgga 132  Q
    |||||||||| |||||   |||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |     
T  4861833 atagaagatcgacacttcagcctacagatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggatttgactggtgtttcaccacttgttgg 4861932  T
Q  133 attaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgct 232  Q
    |||||| |||  | | |||| | ||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| || |||| |||| |||||| ||    
T  4861933 attaggggtcttgacatttatggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagtaaaatggtcaaacatgagaaagcgtcttctgacaagcaacatact 4862032  T
Q  233 tttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctc 332  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| || || | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  4862033 tttatacaatttgcttttgacactttcgatttcctaacaccaaaagttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcacgtccc 4862132  T
Q  333 ctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4862133 ttagatccatgaatgttgtgattacgaggattgatttt 4862170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19035738 - 19035465
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| | | |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| |    
T  19035738 cctgtgaacttcctgaccgacccactagataaaagatcaacactcaggtatgtggacgttttggtgtacggatgggtaggtggaacacatgcttgtgtag 19035639  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19035638 acttgactgggatttcaccagttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtagggcaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 19035539  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagagg 278  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19035538 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacacttacggtttcctagcaccagagg 19035465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 104 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2898889 - 2898616
Alignment:
Q  104 gacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatg 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |         |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  2898889 gacttgatttgggtttcaccacttgtgtgattaggtgtcgggccttttacatg--------caaccctaaaagatgcatcaagcaaagtggccaaacatg 2898798  T
Q  204 agaaagtg----tgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatag 299  Q
    ||||||||    |||||| |||||||| | | |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  2898797 agaaagtgagcgtgttctgacaatcaata-gtttttataccatttgcttttgatactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagag 2898699  T
Q  300 ttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2898698 ttcaaaagatcatgcataacaatatcatgtctcatacgatcatgaatgttgtgtttaagaggattgattttgccatccaaaaa 2898616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 382
Target Start/End: Original strand, 31737256 - 31737515
Alignment:
Q  122 ccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaaca 221  Q
    |||||||||  |||||||||| | ||||||||| || || ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||| |||    
T  31737256 ccacttgtgagattaggtgtcagaccttttacggtaagataaacggccctaaaagcggcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacatattctgaca 31737355  T
Q  222 atcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaa 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  31737356 atcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcgattttctagcattagaggctattgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcatatcaa 31737455  T
Q  322 tgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| |||| |||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31737456 tgttatgtttcctagatccatgaat-tagtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaa 31737515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 89 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 2764686 - 2764393
Alignment:
Q  89 aaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagca 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || ||  |||||| | ||||| |  ||  |||||||| || ||||  ||    
T  2764686 aaacatgcatgtgtgaacttgattgaggtttcaccacttgtgggtttaggggttggtgcttttatggtaggataggcagtcctaaaagttgtgtcagaca 2764587  T
Q  189 aagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccg 288  Q
    |||||  |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||     
T  2764586 aagtggtcaaacatgagaaaacgtgttccgacaatcaacatgcttttatgccattttcttttgacactttcagcttcctagcatcagaggttgttgacct 2764487  T
Q  289 tctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||| ||| |||| ||| ||||| | |||||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2764486 tctacataaagtccaaagggttatgcaaatcaatgttatgtctcttaggtccataaatgttgtgtttacgatgattgattttaccatccaaaaa 2764393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 58 - 382
Target Start/End: Original strand, 20259667 - 20259990
Alignment:
Q  58 ggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgtta 157  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||| | |||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||   |    
T  20259667 ggatgttatggtgtacagatgggtaggga-aaaacatgcatgtgtagacatgactagggttttaccgcttgtgggattaggtgtcagaccttttaccgga 20259765  T
Q  158 ggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactt 257  Q
      |||   | ||||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||| || || ||||||    
T  20259766 aaacaggtagccctaaaagctacgtcaagcaaagtggttaaaaatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttattgttgacactt 20259865  T
Q  258 tcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttac 357  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  || || |||||||||||||     
T  20259866 tcggtttcttagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagtaatgtcatgtctcataagttaataaatgttgtgtttat 20259965  T
Q  358 gatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
       ||||| ||||||||||||||||    
T  20259966 atggattggttttgccatccaaaaa 20259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21473121 - 21472917
Alignment:
Q  178 tgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagag 277  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  21473121 tgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcttttgacacttgcagtttcctagcaccagag 21473022  T
Q  278 gttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatcc 377  Q
    | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | || || || |||||||||||    
T  21473021 gctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgcgttcaggaggactggttttgccatcc 21472922  T
Q  378 aaaaa 382  Q
    |||||    
T  21472921 aaaaa 21472917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 382
Target Start/End: Original strand, 24177526 - 24177704
Alignment:
Q  204 agaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttca 303  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||    
T  24177526 agaaagtgtgtaccgacaatcaacatatttttataccatttgtttttgacagtttcggtttcctagcatcagaggctgtttaccttctacatagagttca 24177625  T
Q  304 aaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||    
T  24177626 aaaagtcatgcatagcaatgtcatatctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgccaaccaaaaa 24177704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 332
Target Start/End: Original strand, 37932052 - 37932360
Alignment:
Q  23 gacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcac 122  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||| ||| |  ||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37932052 gacccattagatagaaaatcgacacttaggcctgcggatgttatgatgtacatatggacaggaggaaaacatgcatgcgtggacttgattgaggtttcac 37932151  T
Q  123 cacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaa 222  Q
    ||||||||| |||||| | |  | |||||||  || |||| ||| ||||||||| || |||||||||| ||  |||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  37932152 cacttgtgggattaggggccaaggcttttacagtaagacagacagccctaaaagttgtgtcaagcaaaatggtcaaatacgagaaag-gtgttctgacaa 37932250  T
Q  223 tcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaat 322  Q
    ||||| || ||||| | ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||| |||   || ||||||  |||    
T  37932251 tcaacgtgtttttacattattatttttttacactttcggcttcctagcaccagaggatgttgacattctatattgagtttaaacattcgtgcatagtaat 37932350  T
Q  323 gtcatgtctc 332  Q
    ||||||||||    
T  37932351 gtcatgtctc 37932360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 64 - 315
Target Start/End: Original strand, 50161292 - 50161546
Alignment:
Q  64 tatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaa 163  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |  |   |||||||||| ||||||||||| |  | | |||||||| |||||||     
T  50161292 tatggtgtacggttgggtaagagaaaaacatgcatgtgtggacttaaccgatatttcaccactcgtggaattaggggctgagacttttacggtaggacag 50161391  T
Q  164 acaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttt---tacactttcg 260  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||   || ||||| |    
T  50161392 acaaccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggacaaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgcttttatatcatttttttttttatatacttttg 50161491  T
Q  261 gtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgca 315  Q
    | | ||||||| || |||||| ||||  |||| ||| |||||||| | |||||||    
T  50161492 gctccctagcaccaaaggttgatgacattctacatagagttcaaaggatcatgca 50161546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38731704 - 38731546
Alignment:
Q  201 atgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagt 300  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |||    
T  38731704 atgagaaagcgtgttctgacaatcaacatacttttatacaatttgcttttgaaacttttggcttcttagcaccagaggttgttaaccttctacatagagt 38731605  T
Q  301 tcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacga 359  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  38731604 tcaaagggtcatgcacaataatgtcatgactcctaggtccatgaatattgtgtttacga 38731546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 42920129 - 42919832
Alignment:
Q  26 ccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccac 125  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||| | | |||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  42920129 ccactaaataaaagatcaacatttaggcttgcagatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactac 42920030  T
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatca 225  Q
    | |||| |||| | |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  42920029 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 42919931  T
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||   || || |||| ||||||| | ||||| ||||  |||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  42919930 acatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 42919832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 268
Target Start/End: Original strand, 25375674 - 25375912
Alignment:
Q  30 tagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgt 129  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || | |||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||   ||||||||| ||| ||    
T  25375674 tagatagaagattgacacttaggtctgcagatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcaagcgtggatttgaccagggtttcactactcgt 25375773  T
Q  130 ggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacat 229  Q
     | |||||| ||| |  |||||||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| || ||||||||    
T  25375774 cggattaggggtcagagcttttacggtaggacagacaactccaaaagttgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgacaaaacatgttcttaccatcaacat 25375873  T
Q  230 gcttttatactatttgttttttacactttcggtttccta 268  Q
    | |||||||| ||||| | || ||||||| || ||||||    
T  25375874 gtttttataccatttgctattgacacttttggcttccta 25375912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16500188 - 16500038
Alignment:
Q  142 cgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatacta 241  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||| || |||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16500188 cggggcttttacggtaggacagacaatcctaaaagttgcgtcacgtaaagtggccaaatataagaaaacatgttctaacaattaacatgcctttatacta 16500089  T
Q  242 tttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtcta 292  Q
    |||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16500088 tttgcttttgacacttttgacttcctagcattagaggctgttgaccttcta 16500038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7213314 - 7213187
Alignment:
Q  232 ttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtct 331  Q
    |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7213314 ttttatatcatttatttttgacactttcggtttcctagcattagagactgttgagcttctgcataaagttcaaaatgtcatgcataataatgtcatgtct 7213215  T
Q  332 cctagattcatgaatgttgtgtttacga 359  Q
     |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  7213214 tctaggtccatgaatgttgtgttcacga 7213187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 381
Target Start/End: Original strand, 50314593 - 50314815
Alignment:
Q  158 ggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactt 257  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||  ||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||    
T  50314593 ggacaaacaactctaagagctgcataaagcaaagtggtcaaacatgacaaaacttgttctcacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattt 50314692  T
Q  258 tcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttac 357  Q
    |   ||||||| ||  ||| |||||||||  |||| ||| |||||||| ||| || |  |||||||||||| ||||||| | |||||||  |||||||||    
T  50314693 tttatttcctaacacaagatgttgttgactttctacatagagttcaaagggttatacgcaacaatgtcatgactcctag-tccatgaataatgtgtttac 50314791  T
Q  358 gatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
     || | ||||||||| ||||||||    
T  50314792 cattactgattttgctatccaaaa 50314815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 298 - 383
Target Start/End: Original strand, 6670214 - 6670299
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6670214 agttcaaagagtcatgcattacaatgtcatatctcctagattcatgaatgttatatttacgataattaattttgccatccaaaaaa 6670299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Original strand, 35387653 - 35387802
Alignment:
Q  182 tcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttg 281  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||  |||||  | |   ||    
T  35387653 tcaagcaaagtggccaaacatgaaaaagtgtgttctgacgatcaacaagcttttatact-ttctttttttacacttttggctttttagcactaca---tg 35387748  T
Q  282 ttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctccta 335  Q
    |||| | |||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  35387749 ttgatcttctacatagagttcaaagggacatgcatatcaatgtcatgtctccta 35387802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 38731865 - 38731707
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | | |  | | | |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||| ||||    
T  38731865 aacttccttactgacccactagatagaagatcgatagttaaacttgcagatattatggtgtgcggatgggtaggaggaaaatatgcaaatgtggatttga 38731766  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaacc 169  Q
     | ||||||||||||| || || ||||| |||||| |||||| | || |||| ||||||    
T  38731765 ctagggtttcaccactcgttgatttaggggtcgggtcttttatggtatgacagacaacc 38731707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37200201 - 37200012
Alignment:
Q  76 atgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaa 175  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| |||| |   |||  |||||||  |||||||  || || |||||    
T  37200201 atgggtaagaggaaaacatgcatgtgtg-acttgactgatgtttcaccactcgtgggattaaggaccggagcttttacaataggacatgcagccataaaa 37200103  T
Q  176 gctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcct 267  Q
    | | ||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||    
T  37200102 gttacgtcaagtaaagtggtcaaacataagaaagcatgtgctaacaatcaatatgtttttataccatttg-tttttacacttttggcttcct 37200012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23044015 - 23043929
Alignment:
Q  158 ggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactattt 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    || || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23044015 ggacaaacaaccctcaaagctgcatcaagcaaagtggccaaatatgagaaaacaagtactcacaatcaacatgcttttataccattt 23043929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 382
Target Start/End: Original strand, 45835301 - 45835379
Alignment:
Q  304 aaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| || ||| |||||| ||| |||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45835301 aaaggtcatgtattacattgtcatctcttctaggtctatgaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaa 45835379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 47459753 - 47459596
Alignment:
Q  225 aacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| | ||||| || ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| |||| |   ||||||| ||||||    
T  47459753 aacatgtttttataccatttgcttttgatacttttggcttcctagtatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggaatatgcatagcaatgt 47459654  T
Q  325 catgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     ||||||||||  |  || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  47459653 tatgtctcctaagtctataaatgttgtgtttacgagaattgatttagccattcaaaaa 47459596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 382
Target Start/End: Original strand, 868513 - 868594
Alignment:
Q  299 gttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||    
T  868513 gttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaagtccatgaa--ttgtgttcacaaggattggttttgccatccaaaaa 868594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Original strand, 40515993 - 40516067
Alignment:
Q  307 ggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  40515993 ggtcatgcatggcaatataatgtctc-tagattcatgaatgttgtgtttacgattattgattttgcaatccgaaaa 40516067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4611161 - 4611103
Alignment:
Q  324 tcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4611161 tcatgtctcctaggtccatgaatattgtgttcacgatgattgattttgtcatccaaaaa 4611103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 384
Target Start/End: Original strand, 48841204 - 48841277
Alignment:
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||  |||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  48841204 atgcataataatgttatgtctcctaaatctatgaatattatgtttacgaggattgattttgcaatccaaaaaag 48841277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 322
Target Start/End: Original strand, 18616196 - 18616286
Alignment:
Q  232 ttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaat 322  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||  || |||||| | |||| |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  18616196 ttttataccatttgtttttaacactttcgactttctagcacccgaggctgttgacattctacatataattcaaagggtcatgcatagcaat 18616286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 30688535 - 30688471
Alignment:
Q  318 acaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  30688535 acaatgtcatgactcctgggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgttatccaaaaa 30688471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 381
Target Start/End: Original strand, 11128363 - 11128446
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |  || |||| ||||||||| ||||||  |||| | ||||||||    
T  11128363 agtttaaaaggtcatgcatatcaatgttatgtctcctaggtctataaatgatgtgtttacaatgatttgtttttctatccaaaa 11128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 382
Target Start/End: Original strand, 1114023 - 1114061
Alignment:
Q  344 aatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1114023 aatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaa 1114061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Original strand, 28493482 - 28493524
Alignment:
Q  340 catgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28493482 catgaatgttatgttcacgaggattgattttgccatccaaaaa 28493524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 370
Target Start/End: Original strand, 35550090 - 35550256
Alignment:
Q  204 agaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttca 303  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  || |||| |||||   ||| ||||| | || |||||||||  | ||||||||| || |||| | | |||| |    
T  35550090 agaaagtgttttctgacaatcaacataattctatattatttacgtttgacactcttggcttcctagcactataggttgttggccttctaaaaagagttta 35550189  T
Q  304 aaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    || | ||||| |||||||||| ||||| | ||  || || ||||||||||||| || ||||||||||    
T  35550190 aaggatcatgtataacaatgttatgtcccttatgtttattaatgttgtgtttaagaggattgatttt 35550256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 53785994 - 53785626
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  53785994 aacttcctaactgacccgctagaaataagatcaacactcaggcatgcggatgttttggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga 53785895  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||| |  || |||| ||||| |||||||| || ||| ||||||| |||||||     
T  53785894 ctggggtttcaccactagtgggattaggtgtcgggccttttaccgtaggataggcagcccttaaagccgcgtcaagtaaggtggccaaacacgagaaagc 53785795  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  53785794 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtc 53785695  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  53785694 atgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttatgtttacgaggattggttttgccatccaa 53785626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 382
Target Start/End: Original strand, 39583062 - 39583422
Alignment:
Q  22 tgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttca 121  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||| |    
T  39583062 tgacccactagatagaagatcgacacttaggcatgcggatgttatagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgcgtggacttgacttaggtttta 39583161  T
Q  122 ccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaaca 221  Q
    |||||||||| |||| | |||||||| |||| | ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39583162 ccacttgtgggattaagggtcgggccatttatggtaggataggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgaca 39583261  T
Q  222 atcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaa 321  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  39583262 atcaacatgcttttatatcatttgttttcgacactttcggtttcctagcatcataggttgttgaccttctgcatagagttcaaagggtcatgcatagcaa 39583361  T
Q  322 tgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39583362 tgtcatgtctcctaggttcatgaatgtcgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaa 39583422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 49018248 - 49017881
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  49018248 aacttcctgactgacccactagatagaagattaacactcaggcatgcagatgttatggtgtacggattggtacgaggaaaacatgcatgtgtaaacttga 49018149  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  49018148 ctggagtttcaccacttgtggaattaggtgtcgagccttttacggtaggacaagcaaccctgaaagttacgtaaaacaaagtgaccaaacatgagaaagt 49018049  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||  || |||||||||||||    
T  49018048 gtgttctaacaatcaacatgtttttataccattttttttttacactttcggtttcctagcacccgaggttgttgatcttctacgtaaagttcaaaaggtc 49017949  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||  ||||||||||    ||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49017948 atgcatataaatgtcatgt----taggtcaatgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaa 49017881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 13582797 - 13582424
Alignment:
Q  10 taacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctat--ggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggact 107  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13582797 taacttcctgactgatccattagatagaagatcaacactctggcttacggatgctatatggtgtatggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagact 13582698  T
Q  108 tgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaa 207  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  13582697 tgaccgaggtttcaacacttgtgggattaggtgtcaggccttttaccgtaggacaagcagccctaaaagctgcgtcaatcaaagtgatcaaacataagaa 13582598  T
Q  208 agtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaag 307  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||    ||||||||| |||| | | ||||||||||    
T  13582597 agtgtgttctgacaatcaacgtgtttttataccatttg-tttttacacttttgatttcctagcaccaacaattgttgaccttctacagagagttcaaaag 13582499  T
Q  308 gtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13582498 gtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggaccatgaatgttgtgtttacgaagattgatttagccatccaaaaa 13582424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 44199058 - 44198681
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||   ||||||||  ||||| |||||  |||||||||   |||| |    
T  44199058 cctgtgaacttcgtgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcttgtggacattatggtgtatggatgagtaggtggaaaacatgttagtgtag 44198959  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||| ||  || | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44198958 acttgactggggtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggtcaggcagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 44198859  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| || || | |||| |||||||| |||| ||| ||||||     
T  44198858 gaaagcgtgttctgagaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcttaacacccgaggctgttgaccttctacatagagttcag 44198759  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44198758 aaggttatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttgcgataattgattttgccatccaaaaa 44198681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Original strand, 52741333 - 52741705
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| | |||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  52741333 aacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcagacttgcagatgttgtggtatacggatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtagacttga 52741432  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaa-gctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaag 209  Q
     || ||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||   |||||||  || |||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  52741433 ctgaggtttcaccacttgtgggattagatgtaggaccttttattgtaggacaggcagccctaaaaagctgagtcaaacaaattgaccaaacatgagaaag 52741532  T
Q  210 tgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggt 309  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  52741533 cgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggt 52741632  T
Q  310 catgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  || |||| || |||| ||||  ||||||||||||||||    
T  52741633 catgcatagcaatgtcatgtctcctagatccatttatcttgtattcacgaagatttgttttgccatccaaaaa 52741705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 382
Target Start/End: Original strand, 37132898 - 37133192
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagc 187  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||| | |||||||    || ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  37132898 aaaacatgcatgtgtagacatgattgaggttttaccacctgtgggattaagtgtcagaccttttatcggagaacagacagccctaaaagctacgtcaagc 37132997  T
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgacc 287  Q
    ||||||   ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37132998 aaagtggttaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgttttttacactttcggtttcttagcaccagaggttgttgacc 37133097  T
Q  288 gtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||    
T  37133098 ttctacatagagttctaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaagttaatgaatgttgtgtttataaggattggttttgcgatccaaaaa 37133192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 7901079 - 7900771
Alignment:
Q  75 gatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaa 174  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||  | | |||||||    
T  7901079 gatgtgtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggattaggggttgggtcttttacggtaggacggatatccctaaa 7900980  T
Q  175 agctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatca 274  Q
    | |||||||||||||| |  || |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7900979 aactgcgtcaagcaaaatagccgaacatgagaaagcgttttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacactttcggcttcctagcatca 7900880  T
Q  275 gaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgcca 374  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||  || | | || |||| |||||| |||| |||||| | ||| ||| || ||||||| ||||||  |||| |||    
T  7900879 gaggttgttgaccttctacatagagtttgaaggattatacatagcaatgttatgtttcctaggtccatcaatattttgtttacaatgattagttttacca 7900780  T
Q  375 tccaaaaaa 383  Q
    |||||||||    
T  7900779 tccaaaaaa 7900771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 168 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26772886 - 26772672
Alignment:
Q  168 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcct 267  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||    
T  26772886 ccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaacatcagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcct 26772787  T
Q  268 agcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgat 367  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26772786 agcatcagaggcagttgaccttctatatagagtacaaaggattatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattgat 26772687  T
Q  368 tttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||    
T  26772686 tttgccatccaaaaa 26772672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 133 - 378
Target Start/End: Original strand, 3443256 - 3443501
Alignment:
Q  133 attaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgct 232  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3443256 attaggtgtcaggacttttacgataggacagagagtcctaaaagttgcgtcaagcaaaatggccaaacatgaaaaagtgtattctaacaatcaacatgct 3443355  T
Q  233 tttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctc 332  Q
    ||||||| ||||  | || |||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||    
T  3443356 tttataccattttctgttgacactttcagtttcctagcactagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcgtaggaatgtcttgtctc 3443455  T
Q  333 ctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatcca 378  Q
    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3443456 ctaaatctatgaatgttgtgtttacgatgattggttttgccatcca 3443501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 190 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32546901 - 32546709
Alignment:
Q  190 agtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgt 289  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  32546901 agtggccaaacatgagaaagcgtgttcggacaatcaacatacttttataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccaaaggctgttgacctt 32546802  T
Q  290 ctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32546801 ctacatagagttcaaaaagtcatgcatagtaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgaggattggttttgccatccaaaaa 32546709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38146265 - 38145970
Alignment:
Q  87 gaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaag 186  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||| | | |||||||  || |||||||||| || ||||     
T  38146265 gaaaatatgcatgtgaggacttgcatggggtttcacgacttgtgggattaggggtcggagctttgagggtaggacatgcagccctaaaagcggcatcaat 38146166  T
Q  187 caaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
    |||||||  |||||  |||| |  ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||   ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||    
T  38146165 caaagtggtcaaacgcgagacaacgtgttttgacaatcaacatgtttttataccatttacatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgtttac 38146066  T
Q  287 cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
      ||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  38146065 attctacttagagttcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaacgttgtgtttacgatgattgattttgtcatctaaaaa 38145970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 382
Target Start/End: Original strand, 38978756 - 38978992
Alignment:
Q  146 ccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttg 245  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||| ||   | ||||| ||||  || || | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  38978756 ccttttacggtaggaaatacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaattggttagacatgtgaaaacgtattttgacaatcaatatgtttttatactatttg 38978855  T
Q  246 ttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaa 345  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || || ||    
T  38978856 tttttgacacttttggtttcctagcacctgaggccgttgaccttctacatatagttcaaaaggtgatgcataacaatgtcatgtctcataggtttatcaa 38978955  T
Q  346 tgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  38978956 tgttgtgtttacgaaaattagttttgccatccaaaaa 38978992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 88 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5338855 - 5338561
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattagg--tgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaa 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  | | | || ||||||| ||||||| | | |||||| || ||||||||    
T  5338855 aaaacatgcatctgtggacttgatttgggttacaccacttgtgggattagggatttagagc-ttttacggtaggacagaaagccctaagagttgcgtcaa 5338757  T
Q  186 gcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttc---taacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgt 282  Q
     |||| |  ||||||||||||||||| |||    | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||    
T  5338756 acaaaattgccaaacatgagaaagtgcgttgcgttgacagtcaacatgcttttatacaatttgcttttgacactttcggcttcctagcactagagattgt 5338657  T
Q  283 tgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    ||||  |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5338656 tgacattctacatagagttcaaaaggtcatgcgtagcaatgtcttgtctcataggt---cgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaa 5338561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 382
Target Start/End: Original strand, 7501872 - 7502203
Alignment:
Q  50 aggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggcctt 149  Q
    |||||| | |||| |||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||| ||||   |||| ||||||| |     
T  7501872 aggcctgcagatgttatggtatacggattggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttaaccagggtttcaccactcgtgggtctaggggtcgggc-tg 7501970  T
Q  150 ttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgc-gtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgctttt-atactatttgtt 247  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||| |   |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||  |    
T  7501971 ttacgataggacaagctaccgtaaaagtttttgtcaagtaaagtggtcaaacatgagaaagcgtgttcgaacaatcaacatgttttttataccattttct 7502070  T
Q  248 ttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatg 347  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |  ||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  7502071 tttgacatttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacaga--gtttaaagggtcatgcacaacaatgtcatgactcatagatccatgaata 7502168  T
Q  348 ttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7502169 ttatgtttacgataattgattttgctatccaaaaa 7502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51234803 - 51234577
Alignment:
Q  96 catgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgac 195  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||              
T  51234803 catgtgtggacttgattaaggtttcaccacttgtgggtttaggggtcgagacttttacgataggacaaacaaccctaaaaactgcgtcaa---------- 51234714  T
Q  196 caaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatat 295  Q
       |||||| ||||  |||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  51234713 ---acatgaaaaagcatgttatgacaaccaacatgcttttataccatttatttttgacactttcgactttctagcatcagaggttgttgaccttctacat 51234617  T
Q  296 atagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctccta 335  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51234616 agagttcaaaaggttatgcataacaatgttatgtctccta 51234577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 116 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4473241 - 4472974
Alignment:
Q  116 gtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgtt 215  Q
    |||||| || ||||||||||||  || |||  ||||||| ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||    
T  4473241 gtttcatcatttgtggaattagtggttggggtttttacggtaggacagagagccttaaaaattgcgtcaagcaaagtgtcaaaacatgaaaaagcgtgtt 4473142  T
Q  216 ctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgca 315  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  || || ||| |||| ||| ||||||||   |||||||    
T  4473141 ctaaccatcaatatgtttttatactatttgtttttgacactttcggcttcctagcaccaga-attcttaaccttctacataaagttcaaagaatcatgca 4473043  T
Q  316 taacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    || |||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  4473042 tagcaatttcatgtctcctaggtctatgaatattgtgtttacgagaattggttttgtcatccaaaaaag 4472974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 382
Target Start/End: Original strand, 46940669 - 46940966
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagc 187  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || |||||||  ||| |||| |||||| |||| |  ||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  46940669 aaaacatgtatgtgtgaacttgactgaggtttcattactcgtgggattaggggtcgaggattttatggtaggacagacaactctaaaagatgcgtcaagc 46940768  T
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac- 286  Q
    |||||| |||||||| |||||   |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||||||| || ||  | |||||     
T  46940769 aaagtggccaaacattagaaaacatgttccgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacgtcctagcaccatagactattgacc 46940868  T
Q  287 --cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
      | |||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||    
T  46940869 agcttctacatagagttcaaaggatcatgcacgacaatgtcatgactcataggttcatgaatgttgtgtttacgaaaattgattttgttatccaaaaa 46940966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 379
Target Start/End: Original strand, 54508253 - 54508574
Alignment:
Q  57 cggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgtt 156  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  ||||||  |    
T  54508253 cggatgttatggtgtacggatgggtagaa-gaaaacatgcatgtgtgtacttgattggggtttcaccacttgttggattaggtgtcaggatttttacaat 54508351  T
Q  157 aggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgt-gttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacac 255  Q
    | ||||| || || |||| | |||||||| |||| || | ||||||||||||   | ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||| |||| |||     
T  54508352 aagacaagcagccataaa-gttgcgtcaaacaaaatggctaaacatgagaaaaacttgttctgacaattaacatgtttttatatcatttgcttttgacat 54508450  T
Q  256 tttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgttt 355  Q
    ||| | ||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||  || |||| | |||||| ||||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  54508451 ttttgattttctagcaccagaggttgttgaccttctgcataaggtacaaaggatcatgcgtaacaatatcatatctgctaggtccatgaatgttgtgttt 54508550  T
Q  356 acgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    | ||| |||| ||||| |||||||    
T  54508551 aagataattggttttgtcatccaa 54508574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 201 - 382
Target Start/End: Original strand, 52411903 - 52412084
Alignment:
Q  201 atgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagt 300  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||| | || ||| ||  ||| || ||||||| |||| ||| |||    
T  52411903 atgagagagcgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgcttttgacactttcagctttctaacactagatgtcgttgaccttctacatagagt 52412002  T
Q  301 tcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52412003 tcaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagacccataaatattgtgtttacaatgattgattttgccatccaaaaa 52412084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 384
Target Start/End: Original strand, 38670887 - 38671075
Alignment:
Q  196 caaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatat 295  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |||||||||||||  | ||||| |||| ||    
T  38670887 caaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacaatttgtttttgacacttttggctttctagcatcagaggcggatgaccttctacat 38670986  T
Q  296 atagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    | |||  |||  || ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  38670987 agagtctaaagagttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtgtacgaggattggttttgccatctaaaaaag 38671075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 196 - 382
Target Start/End: Original strand, 26856769 - 26856955
Alignment:
Q  196 caaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatat 295  Q
    |||| |||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||| || |||||| ||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||    
T  26856769 caaatatgataaagcgtgttgtgacaatcaacatgcttttataccatctgcttttgacgctttcgatttcctagcactagagactgttgaccttctacat 26856868  T
Q  296 atagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  26856869 agagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtttatgaatgttgtgcttgcgaggattggttttaccatccaaaaa 26856955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 25325157 - 25324942
Alignment:
Q  170 ctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacat--gcttttatactatttgttttttacactttcggtttcct 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  || || |  ||||||||||  | |||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||    
T  25325157 ctaaaagttgcgtcaagcaaagtgacaaaacattataaaacgtattttggcaatcaacatatgtttttataccatttgctttcaacactttcgatttcct 25325058  T
Q  268 agcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgat 367  Q
    |||| || || ||||||||| |||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  25325057 agcaccatagattgttgaccttctacatagagttcaaatgatcatgcatagcaatgtcaagtttcctaaatccatgaatattgtgcttacgatgattgct 25324958  T
Q  368 tttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||||||||||||||    
T  25324957 tttgccatccaaaaaa 25324942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37992617 - 37992247
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||   |||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  37992617 aactttctcactgacccacttgatagaagatggacacttaggtctgtagatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgtgtgtgtggacttga 37992518  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
    | ||||||||| ||||  ||  |||||  |||| |  ||||||| ||||||| | | ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  37992517 tcggggtttcatcactcatgagattagaggtcgagatttttacggtaggacatatagccctgcaagttgtgtcaaacaaagtgaccaaacatgaggaagc 37992418  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||| |   ||| || ||| |||||  |||||||||||||| |||| | | ||||| || ||||    
T  37992417 atgttctgacaatcaacatgattttatatcatttacttttgatggttttggcttcatagcactagaggttgttgaccttctacaaagagttc-aagggtc 37992319  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||| |  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  37992318 atgcacagtaatgtcatgactcgtacgtgcatgaatgttgtgttttcgaagattggttttatcatccaaaaa 37992247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 21552766 - 21552578
Alignment:
Q  197 aaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatata 296  Q
    ||||||| |||| ||| || | |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| |||    
T  21552766 aaacatgggaaaatgtattatgacaatcaacatgcttt-ataccatttatttttgacattttcagtttcctagcatcagagactgttgaccttctacata 21552668  T
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcata--ac--aatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     ||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||    
T  21552667 gagttcaaaaggtcatgcatagtacgtaatatcatatctcctaggtccatgaatgttgtgtttacaagaattggttttgacatccaaaaa 21552578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 29862068 - 29861964
Alignment:
Q  25 cccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcacca 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||    
T  29862068 cccactagatagaagatcgacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgaacttgactggggtttaaaca 29861969  T
Q  125 cttgt 129  Q
    |||||    
T  29861968 cttgt 29861964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 98 - 245
Target Start/End: Original strand, 35484601 - 35484748
Alignment:
Q  98 tgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgacca 197  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |  | | | |||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||||  ||    
T  35484601 tgtgtagacttgactggggtttcacaacttgtgaaattaaggattgagacttttacggtaggacaaacaactttaaaaactatgtcaagtaaagtggtca 35484700  T
Q  198 aacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttg 245  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  35484701 aacatgagaaaatatgttccaacaatcaacatgtttttgtactatttg 35484748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 289 - 382
Target Start/End: Original strand, 464981 - 465074
Alignment:
Q  289 tctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  464981 tctacatatagttcataaagtcatgcataacaatattatgtttcatagattcatgaatgttgtgtttacaaatattgattttgccattcaaaaa 465074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 314 - 382
Target Start/End: Original strand, 4669788 - 4669856
Alignment:
Q  314 cataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  4669788 cataacaatgtcatgtctccttggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgttatccaaaaa 4669856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 273 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44859 - 44781
Alignment:
Q  273 cagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgt 351  Q
    |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  44859 cagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtttcctaggtccatgaatgttgt 44781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43123419 - 43123124
Alignment:
Q  21 ctgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttc 120  Q
    ||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| ||  ||| |||||||| ||| |||| || || ||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  43123419 ctgacccacaagatggaagaccgacacttaggccaacaaatgttatggtgtacgggtgggcagaacaaaaacaaacatgtgtggacttaattggggtttc 43123320  T
Q  121 accacttgtggaatt-aggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaa 219  Q
    ||| ||||||| ||| |||  | | ||  |||||| | |||||  ||||| | ||||  || |||||||||||| | |||||||| ||||  |||||| |    
T  43123319 acctcttgtgggattgaggattagagc--tttacggtgggacatgcaaccatcaaagtcgcatcaagcaaagtgtctaaacatgataaaggatgttctga 43123222  T
Q  220 caatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcata 317  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    || ||||||| | ||| |||||| || || ||||||||  |||| | | |||||||| |||| ||||||    
T  43123221 caatcaacatgttgttatactatttacgattgacacttttgattttctagcaccatagtttgttgactttctacaaaaagttcaaagggtcgtgcata 43123124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35236413 - 35236302
Alignment:
Q  89 aaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||| | ||||| |   | | ||||||| ||||||||| |    
T  35236413 aaacatgcatgtgtggacttgattgaggtttcaccacctgtgggattagggatcgagccttttatggtaggataggtagctctaaaagttgcgtcaagta 35236314  T
Q  189 aagtgaccaaac 200  Q
    || |||||||||    
T  35236313 aaatgaccaaac 35236302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 382
Target Start/End: Original strand, 4763888 - 4763985
Alignment:
Q  284 gaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||    
T  4763888 gaccttctacatagagttcaaaaggttatgcatagcaatgtcatgtctcct-ggtccatgaatgttgtgtttacgaggattagaattgccatccaaaaa 4763985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3643149 - 3643067
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3643149 agttcaaaggatcatgcataacaatgtcatgttttttaggtccatgaatgttgtgttt--gatgattgattttgtcatccgaaaa 3643067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42206074 - 42205993
Alignment:
Q  289 tctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  42206074 tctacatagagtttaaatggtcatgcatagaaatgtaatgtatcctagatccataaacgttgtgtttacgatgattgatttt 42205993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 138
Target Start/End: Original strand, 52411731 - 52411851
Alignment:
Q  18 taactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || || |||||| | |||| |||| ||| || ||||  |||| |||||| | ||| |||||||| || || |||    
T  52411731 taactgacccactagatagaagattgacgcttaggcctgcagatgttatgatgtccgaatggacaggaggaaaacttacatatgtggactcgactgaggt 52411830  T
Q  118 ttcaccacttgtggaattagg 138  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  52411831 tttaccacttgtgggattagg 52411851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26276571 - 26276529
Alignment:
Q  340 catgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  26276571 catgaatgttgtgtttatgaggattgattttgccatccaaaaa 26276529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 382
Target Start/End: Original strand, 25094665 - 25094765
Alignment:
Q  282 ttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||  ||  | ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||| ||||    
T  25094665 ttgaccttctacatatagttcaaatggtcatgcatagcaatgtaatatcttttaagtccatgaatgttgtgttcacgaagattagttttgcaatctaaaa 25094764  T
Q  382 a 382  Q
    |    
T  25094765 a 25094765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 382
Target Start/End: Original strand, 7257620 - 7257749
Alignment:
Q  252 acactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgt 351  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||  | |  |||| |||||||||||| ||  || |||| |||| |||||| | |||| | ||||||||||||    
T  7257620 acacttttggcttcctagcatcagatgttgc-gtcattctacatatagttcaaagggctatccatagcaatatcatgtattctaggtccatgaatgttgt 7257718  T
Q  352 gtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| ||||  ||||| ||| ||||||    
T  7257719 gtttacgaagattagttttgtcattcaaaaa 7257749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 382
Target Start/End: Original strand, 35484799 - 35484873
Alignment:
Q  308 gtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||    
T  35484799 gtcatgtataacaatgtcaagtcttctaggtatatgaatgttgtgtctacaaggaataattttgccatccaaaaa 35484873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 45676778 - 45676828
Alignment:
Q  180 cgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatg 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  45676778 cgtcaagcaaagtgaccaagcataagaaaacgtgttctgacaatcaacatg 45676828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 382
Target Start/End: Original strand, 3376890 - 3376931
Alignment:
Q  341 atgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  3376890 atgaatgttgtgtttatgatgattgattttgtcatctaaaaa 3376931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13772577 - 13772500
Alignment:
Q  168 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttg 245  Q
    |||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||  |||||| | |||||||||  ||||||||| |||||    
T  13772577 ccctcaaagctgcttcaagcaaagccatcaaacatgagaaaacgtgttccatcaatcaacacacttttataccatttg 13772500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2601791 - 2601751
Alignment:
Q  334 tagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgcca 374  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2601791 tagatccatgaacgttgtgtttacgaggattgattttgcca 2601751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Original strand, 50000741 - 50001119
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50000741 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgg 50000840  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  | ||| || ||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50000841 acttgactggggtttcaccacttgtgggttaaggggtgggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 50000940  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgctttt-atactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttca 303  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| || || |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||    
T  50000941 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttaatacaatttgcttttgacacttttggctttctagcatcagaggcagttgaccttctacatatagtcca 50001040  T
Q  304 aaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50001041 aagggttatgcatagcaatgttatgtctcctagatccataaatgttgtgtttacgaagattgattttgccatccaaaaa 50001119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Original strand, 30940555 - 30940925
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||  |||||||||| ||||| |    
T  30940555 cctgtgaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactaaggcctacgaatgttatggtgtacgaatgggtaggtggaaaacatgcttgtgtag 30940654  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| |||| |||||   ||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  30940655 acttgactgaggtttcgccacttgtgggattaagtgtcaaaccttttaccataggacagacaaccctaaaagttgcgtcaagtaaagtggtcaaacatga 30940754  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||      |||| ||| |||||||    
T  30940755 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatacca-ttgcttttgacactttcgatttcctagcacctgaggctgt------tctacatagagttcaa 30940847  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||    
T  30940848 aaggtcatgcataacaatgtcatatatcctaggtctatgaatgttgtgttcatgaggattgattttgccatccaaaaa 30940925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 40 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53619842 - 53619500
Alignment:
Q  40 atcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggt 139  Q
    ||||||||| |||||| |  ||| |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||      
T  53619842 atcaacacttaggcctgcatatgttatggtgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccacttgtgggtttagag 53619743  T
Q  140 gtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatac 239  Q
    || ||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53619742 gtgggggcttttacagtaggacaggcaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttatac 53619643  T
Q  240 tatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagatt 339  Q
     |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |     
T  53619642 catttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtctaaagggttatgcataacaatgttatgtctcttaggtc 53619543  T
Q  340 catgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  53619542 catgaatgttgtgtttacgagaattggttttgccatccaaaaa 53619500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 26521764 - 26521403
Alignment:
Q  20 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggttt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||| | | |||||||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  26521764 actgacccactagatagaagatcgacatttaagcctacgaaggttatggtgtacagacgggtaggaggaaaacatgcatgtatggacttgactggagttt 26521665  T
Q  120 caccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaa 219  Q
    || ||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||  ||||| | |    
T  26521664 catcacttgtgggattaggggtcagaccttttatggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggctaaacatgaaaaaacgtgttatga 26521565  T
Q  220 caatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataac 319  Q
    |||||||||||||||||||  || || |||  ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| || |    
T  26521564 caatcaacatgcttttatatcatatgctttcaacacttttggtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatacagttcaaagggtcatgcgtagc 26521465  T
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  26521464 aatgtcatgtatcctaggcccatg-atgttgtgtttacgaggattggttttgtcatccaaaaa 26521403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 384
Target Start/End: Original strand, 55933303 - 55933655
Alignment:
Q  30 tagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgt 129  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |  | |||| |||||| | ||||||||| ||| ||||||||| |||| || | || |  ||||||||||| |||||    
T  55933303 tagatagaagatcgacacttaggtccgcagatgttatggtctacggatgggttggaggaaaacatgaatgtctgaatttaaccggggtttcaccccttgt 55933402  T
Q  130 ggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacat 229  Q
    ||  ||| | ||| || |||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55933403 gggtttaagggtcagggcttttacggtaggacagtcagccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagtttgttctaacaatcaacat 55933502  T
Q  230 gcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgt 329  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||| || ||||||||| | ||||    
T  55933503 gcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcctagcatc--aggttgttgaccttctacatagagtccaaagggttatacataacaatattatgt 55933600  T
Q  330 ctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933601 ctcctaggtccgtgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 55933655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 132657 - 132324
Alignment:
Q  26 ccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccac 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||| | | |||| |||||||| | |||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  132657 ccactagatagaagatcgacacttcggcatgcagatgttatggtgtacagatacgtaggaggaaaatatgcatgtgtgaacttgactggggtttcaccac 132558  T
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgtt--aggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaat 223  Q
    |||| | |||||| |||||| |||||||| |  ||||||  || ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  132557 ttgttggattaggggtcgggacttttacggtgtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaaatggcaaaacatgagaaatcgtgttctgacaat 132458  T
Q  224 caacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatg 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| | | |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  132457 caacatgcttttataccatttgttttttacactttcggtttcctaatatcagagattgttgacattctacacagagtttaaagggtcaagcataacaatg 132358  T
Q  324 tcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttac 357  Q
    ||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  132357 tcatgtcttttaggttcatgattgttgtgtttac 132324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 374
Target Start/End: Original strand, 56461939 - 56462291
Alignment:
Q  21 ctgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttc 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| | || | || ||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  56461939 ctgatccactagatagaagatcgacacttaagcatgcgaatgttatggtgtacggatgagtaggtggaaaacatgcatgtgtggacttgactgaggtttc 56462038  T
Q  121 accacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaac 220  Q
    |||| |||| | |||||| |||| | |||||||| | | | | || |||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||| ||    
T  56462039 accatttgttggattaggggtcgagacttttacggttgtatagaccaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggc-aaacatgataaagcgtgttctgac 56462137  T
Q  221 aatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataaca 320  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||||||| |||    
T  56462138 aatcaacatgtttttataccatttgttttagacacttttggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaggatcatgcatgaca 56462237  T
Q  321 atgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgcca 374  Q
    |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  56462238 atgtcatgtctcctaagtccataaatgttgtgtttacgagaattggttttgcca 56462291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 23 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 25504566 - 25504209
Alignment:
Q  23 gacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcac 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  25504566 gacccactagatagaagtttaacactcagacatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggagaaaaacatgcatgtatagacttgactgaggtttcac 25504467  T
Q  123 cacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaa 222  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||  ||||||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  25504466 cacttgtgggattaggcgtcaggccttttacggtatgacaggcaaccct-aaagttgcatcaagcaaa-tggtcaaacatgagaaaacgtgttctaacaa 25504369  T
Q  223 tcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaat 322  Q
    || ||||| ||||||||  |||| |||| ||| ||| ||||||||||||  ||||  |||||||| | || ||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  25504368 tcgacatgtttttataccgtttgcttttgacatttttggtttcctagcactagagactgttgaccttttaaatagagtttaaaaggtcatgcatagtaat 25504269  T
Q  323 gtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||    
T  25504268 gtcatgtctcataggtccatgaatattgtgtttatgaggattgcttttgccattcaaaaa 25504209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 382
Target Start/End: Original strand, 600659 - 600885
Alignment:
Q  156 taggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacac 255  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  |||    
T  600659 taggacagacaaccctaaaagttatgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaaacgtgttctaacaattaacatgcttttataccatttgcttttgtcac 600758  T
Q  256 tttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgttt 355  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||    
T  600759 tttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgtataactatgtcatgtctcctaggtccattaatgctgtgttt 600858  T
Q  356 acgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||    
T  600859 acgatgattagttttgccatccaaaaa 600885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 292
Target Start/End: Original strand, 12918188 - 12918475
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||     
T  12918188 cctgtgaactttctaactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgtggatgtcatggtgtatggatgggtaagaggaaaacatgcatgtgtgt 12918287  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    | |||| ||| |||||| ||||||||| |||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| |    
T  12918288 agttgactggagtttcatcacttgtgggattaagattcggggcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaacaaagtggtcaaacataa 12918387  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtcta 292  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12918388 gaaatcgtgttctgacaatcaacacacttttatactatttacttttgacactttcgacttcctagcatcagagattgttgaccttcta 12918475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 6 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53170791 - 53170426
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | | || | ||||||      |||||||||  |||||||||| ||||| ||    
T  53170791 ctgtgaacttcctgactgacctactagatagaagatcaacacttaggcatgcagacgttatggt------atgggtaggtggaaaacatgcttgtgtaga 53170698  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  || ||||  || |||||||||  | || | | |||||  |||||||||||    
T  53170697 cttgactggggtttcaccactcgtgggattaggtgtcggaccttttacagtatgacaggcagccctaaaagtcgtgttaggtaaagtagccaaacatgag 53170598  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||       ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||    
T  53170597 aaagcgtgttctgacagtcaacatgcttg------atttgcttttgacactttcggtttgctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaa 53170504  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaga-ttcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||    
T  53170503 aggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctataggtcatgaatgttgtgttcacgaggattgattttgctatctaaaaa 53170426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 384
Target Start/End: Original strand, 34107669 - 34107891
Alignment:
Q  164 acaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaa--gtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcgg 261  Q
    |||| |||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||     
T  34107669 acaatcctaaaaattgcgtcaaacgaagtggccaaacatgagaaaacgtgtgttcagataatcaacatgtttttataccatttgtttttgacactttcga 34107768  T
Q  262 tttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatg 361  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  34107769 tttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaagtcatgcataacaatgttatgtctcctagatccatgaatgttgtgttcacgagg 34107868  T
Q  362 attgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  34107869 attggttttgtcatccaaaaaag 34107891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 31847378 - 31847078
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  ||||| |||||| | |||  |||||||| | ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  31847378 cctgtgaactttctgactgacccactagataaaagattgacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatggattggaggaaaacatgcatgtgtgg 31847279  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31847278 acttgactagggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacagtaggacaggcagccctaaaagctgcgtcaagcaaagtggtcaaacatga 31847179  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||   |||||| ||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||| ||| ||| |||    
T  31847178 gaaaccatgttctgacagtcaacatgtttttttaccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaagcggttgaccttctacatagagtccaa 31847079  T
Q  305 a 305  Q
    |    
T  31847078 a 31847078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 219 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3330073 - 3329910
Alignment:
Q  219 acaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||     
T  3330073 acaatcaacatgcttttatactatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcatag 3329974  T
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3329973 caatgttatgtctcctaggtccatgaatgctgtgtttacgatgattggttttgccatccaaaaa 3329910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4419307 - 4419168
Alignment:
Q  252 acactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgt 351  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  4419307 acactttcggcttcgtagcatcagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgt 4419208  T
Q  352 gtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagctagcgg 391  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4419207 gtttacgatgattggttttgccatccaaaaaatctagcgg 4419168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16957827 - 16957569
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16957827 cctgtgaacttcctgactgacccgctagataaaagatcaacacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggtgtaaaacatgcatgtgtgg 16957728  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    ||||||  ||      ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||  ||||| |  ||  |||||||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  16957727 acttgacggg------accacttgttggattaggggtcgggcctcttacagtaggataggcagtcctaaaagttgcgtagagcaaaatgaccaaacatga 16957634  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctag 269  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||    
T  16957633 gaaagtgtgctctgataatcaacatgcttatataccatttgcttttgacactttcagttttctag 16957569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23255828 - 23255625
Alignment:
Q  172 aaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagca 271  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||         ||| |||||    
T  23255828 aaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaattaacatgcttttataccatttgtttttgac---------ttcttagca 23255738  T
Q  272 tcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttg 371  Q
    ||| |||  ||||||| |||| ||| ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23255737 tcataggcagttgaccttctacatagagtccaaagggttatgcataacaatgttatgtctcctaagtccatgaatattgtgtttacgaggattgattttg 23255638  T
Q  372 ccatccaaaaaag 384  Q
    ||||||| |||||    
T  23255637 ccatccagaaaag 23255625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3330241 - 3330084
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||    
T  3330241 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacgtgcatgtgtgg 3330142  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggaca 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||| |||||||| |||||||    
T  3330141 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtgggggcttttacggtaggaca 3330084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 382
Target Start/End: Original strand, 50462881 - 50463136
Alignment:
Q  124 acttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaat 223  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||| || |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  50462881 acttgttggattaggtgtcggtacttctacggtaggacagacagccttaaaagttgcgtcaagcaagatgaccaaacatgagaaagtgtcttccgacaat 50462980  T
Q  224 caacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatg 323  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||| | ||||||  || |||||  |||||||| ||||  || |||| ||| || ||||||||||||||    
T  50462981 caacatgctttcataccatttgcttttgacacttttgatttccttacaccagagactgttgaccttctacgtagagtttaaagggccatgcataacaatg 50463080  T
Q  324 tcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     ||||||||| |  |  ||||   |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  50463081 ccatgtctcccaagtatatga---ttgtgtttacgaggatttgttttgccatccaaaaa 50463136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 382
Target Start/End: Original strand, 7536601 - 7536764
Alignment:
Q  219 acaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataa 318  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| | || ||||||     
T  7536601 acaatcaacatgtttttatacaatttgtttttgacaatttcagtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaatgatcgtgcatag 7536700  T
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  7536701 caattttatgtctcgtagatccatgaatgttatgtttacaatgattggttttgtgatccaaaaa 7536764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12053696 - 12053432
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||  || || | |||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  12053696 aacttcctgactgatccactagatagaagatcgagactttggtctgcagatgttatgttgtacagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacatta 12053597  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
    |||||||||||||| | || | ||| || |||  | |||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||      
T  12053596 ttggggtttcaccattagttggattgggggtc--gacttttacagtaggacaaacagctctaaaagctgcgtcaaacaaagttgtcaaacatgagaaatc 12053499  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagag 277  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||  ||||| |||  || |||||  |||||||||| |||||    
T  12053498 gtgttctaacaatcaaaacgtttttatatcatttgctttcgactctttcaatttcctagcaccagag 12053432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 382
Target Start/End: Original strand, 46440795 - 46441082
Alignment:
Q  96 catgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggcctttt-acgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtga 194  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| ||||||||| |  ||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||| |  ||||||||   |||||| |||||||     
T  46440795 catgtgtggatttgattgagattttaccacttgtaggtttaggggtcggggctttttacagtaggataaatagtcctaaaagtaacgtcaaacaaagtgg 46440894  T
Q  195 ccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctata 294  Q
     ||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||| |    
T  46440895 tcaaacataaaaaagtgtgttctaacaattaacacgtttttatatcatttgcttttgacactttcggcttcctagcatcagaagctgctgaccttctaca 46440994  T
Q  295 tatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || ||| |||| |||  |||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46440995 tagagtccaaagggttgtgcatagcaatgctatgtctcataggttcatgaaaattatatttacgatgattgattttgtcatctaaaaa 46441082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16955491 - 16955374
Alignment:
Q  265 cctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgatt 364  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  16955491 cctagcaccagaggttgctgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggcccatgaatgttgtgtttacgaggatt 16955392  T
Q  365 gattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||| |||||| |||||    
T  16955391 gatttggccatcaaaaaa 16955374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 382
Target Start/End: Original strand, 48656880 - 48657108
Alignment:
Q  159 gacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacacttt 258  Q
    |||| ||| ||||||||| | | ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  48656880 gacagacagccctaaaagtttcatcaagtaaaatggacaaacatgagaaagtgtgttatgtcaatcaaaatgtttttataccatttgtttttgacacttt 48656979  T
Q  259 cggtttcctagc-atcagaggttgttgaccgtc----tatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgt 353  Q
    ||  ||| |||| || |||||||||||||| ||    || ||| ||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  48656980 cgacttcttagcgattagaggttgttgaccttccttctacatagagtccaaatgattatgcatagcaatgttatgtctcataggtctatgaatgttgtgt 48657079  T
Q  354 ttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48657080 ttacgatgattgattttgccgtccaaaaa 48657108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 25706794 - 25706683
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25706794 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaagcctacgtatgttatggtgtacagatgggtaggagaaaaacatgcatgtgtggacttga 25706695  T
Q  111 ttggggtttcac 122  Q
    || |||||||||    
T  25706694 tttgggtttcac 25706683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 367
Target Start/End: Original strand, 46391220 - 46391490
Alignment:
Q  94 tgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtg 193  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||  |||||||| ||||| |      |||||||||| |||| | ||||| |    
T  46391220 tgcatgtgtgaatttgattggggtttcaccacttgtaggattagaggtcggatcttttacggtaggatatgttgacctaaaagctacgtcgaacaaagcg 46391319  T
Q  194 accaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctat 293  Q
       ||||| ||||||   |||||| |||  ||||||| |||||||| ||| | || | ||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||| ||||     
T  46391320 gttaaacacgagaaaacatgttctcacagccaacatgtttttataccatt-gcttgtaacattttcgatttcctatcagtagaggttgttgaccttctac 46391418  T
Q  294 atatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgat 367  Q
    ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  46391419 ataaagttcaaaagatcatgca--acaatgtcatgtctcctaaatccatgaatgttgtatttacgaagattgat 46391490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 313
Target Start/End: Original strand, 50483211 - 50483320
Alignment:
Q  204 agaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttca 303  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  50483211 agaaagcgtcttctgacaatcaacatgattttataccatttgctttcgacactttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttca 50483310  T
Q  304 aaaggtcatg 313  Q
    ||||||||||    
T  50483311 aaaggtcatg 50483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 354
Target Start/End: Original strand, 6865635 - 6865984
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| |||||||| | | ||||||||||||  ||||| |||  | |||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | || |    
T  6865635 aactttctaactgatctattagatagaagattgacacttaggtatgcggatgttatgatgtacgtatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgtattt-a 6865733  T
Q  111 ttggg-gtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga----- 204  Q
    | ||| ||||||||| |||||  | ||   |||| | |||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||   | ||||||| ||||||||||         
T  6865734 tcgggagtttcaccatttgtgagactaaaggtcgtggcttttacggtagaacaaacagccataaaagctacgattaacaaagtgtccaaacatgaaacac 6865833  T
Q  205 --gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttc 302  Q
      ||||  ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  | ||| |||||  ||| |||||| ||| | || ||| |||||    
T  6865834 gagaaaacgtgttctgactatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttgagcttcatagcactagatgttgttaaccttttacatagagttc 6865933  T
Q  303 aaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtt 354  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6865934 aaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctaga-tcatgaatgttctgtt 6865984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39001446 - 39001311
Alignment:
Q  247 tttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaat 346  Q
    |||| ||||||| || ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| |||| | | ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||    
T  39001446 ttttgacacttttggcttcctaggatcagaggcagttgaccttctacatagagtccaaaggattatgcataacaatgttgtgtctcctaggtccatgaat 39001347  T
Q  347 gttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  39001346 gttgtgtttacgaggattggttttgtcatccaaaaa 39001311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 382
Target Start/End: Original strand, 50464387 - 50464489
Alignment:
Q  280 tgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    |||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50464387 tgttgaccttctacgtagagtttaaagggtcatgcataacaatgtcatgtctcccaaatatatgaatgttgtgtttacgaggatttattttgccatccaa 50464486  T
Q  380 aaa 382  Q
    |||    
T  50464487 aaa 50464489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 297 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8738204 - 8738117
Alignment:
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  8738204 tagttcaaaggctcatgcataaaaatgtcatgtctcttaggttcatgaatgttgtgtatacaaagattgattttgtcatccaaaaaag 8738117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18534683 - 18534586
Alignment:
Q  12 acttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18534683 acttcctaac-gacccactagattgaagatcgacacttaggcctacaaatgttatggtatacggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtggacttga 18534586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 381
Target Start/End: Original strand, 38535607 - 38535760
Alignment:
Q  227 catgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtca 326  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  38535607 catgctcttataccatttgcatttgacacttttgacttcctagcaccagaggttgttcaccctctacatagagttcaaagagtcatgcatagcaatgtca 38535706  T
Q  327 tgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    |||||  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  38535707 tgtcttataggtccatggatgttgtgtttacgaggattagttttg-catccaaaa 38535760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 324
Target Start/End: Original strand, 43849354 - 43849483
Alignment:
Q  195 ccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctata 294  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| | || ||||||| || | |||| |    
T  43849354 ccaaacacgagaaagcgtgttcagataaccaacatgcttttatactatttgtgtttgacacttttggcttcctagaaccaaaggttgtggatcttctaca 43849453  T
Q  295 tatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43849454 aagagttcaaatggtcatgcataacaatgt 43849483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Original strand, 23233232 - 23233307
Alignment:
Q  307 ggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||||||    
T  23233232 ggtcatgcataataatgtcatgtttcctagattcatgaatgttgtctttatgaggattgatttggctatccaaaaa 23233307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23242898 - 23242814
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23242898 agtttaaagggtcatgcataacaatgtcatttctcttaggtccataaatattgtgtttacgatgattgattttgttatccaaaaa 23242814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1041533 - 1041386
Alignment:
Q  74 ggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggcctttt-acgttaggacaaacaacccta 172  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || |   |||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| | | |||||||| |||| |||    
T  1041533 ggatgggtaggaggaaaacatgcatatgtggac--gacttaagtttcaccacttatgggattaggtgtcagacctttttatggtaggacaagcaactcta 1041436  T
Q  173 aaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaa 222  Q
    |||| || ||||| || ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1041435 aaagttgtgtcaaacatagtggtcaaacataagaaagtgtgttctgacaa 1041386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 382
Target Start/End: Original strand, 50442606 - 50442672
Alignment:
Q  316 taacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  50442606 taacaatgttatgtctcctaggttcatggatgttgtgtttaagaggattggttttgccatccaaaaa 50442672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 382
Target Start/End: Original strand, 54190902 - 54191044
Alignment:
Q  240 tatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagatt 339  Q
    |||||| |||| ||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  |     
T  54190902 tatttgcttttgacacttttgactttctagtatcagaggttgttgaccttccacatagagttcaaagggccatgcataacaatgtcatgactcttaagtc 54191001  T
Q  340 catgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| ||| |||| ||||| | ||||| |||||| |||||||||    
T  54191002 cataaatattgtatttacaaagattggttttgctatccaaaaa 54191044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 54927675 - 54927621
Alignment:
Q  77 tgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgg 131  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54927675 tgggtaggagggaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttccccacttgtgg 54927621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 301 - 381
Target Start/End: Original strand, 18981651 - 18981729
Alignment:
Q  301 tcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18981651 tcaaagggtcatgcatagtaatgtcatgtctc-taggtccatgaatgttgtgtttacgatgattg-gtttgccatccaaaa 18981729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 34213636 - 34213533
Alignment:
Q  279 ttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatcca 378  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||     
T  34213636 ttgttgaccttctagatagagttcaaagggtcatgcctaacaatgtg-tctctcctagttccatgaatgttgtgtttacaaggatcggttttgccatccg 34213538  T
Q  379 aaaaa 383  Q
    |||||    
T  34213537 aaaaa 34213533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 382
Target Start/End: Original strand, 42455692 - 42455800
Alignment:
Q  274 agaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgcc 373  Q
    |||||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||| | |||||||||||| |||||||  ||||| |||| |    
T  42455692 agaggttgttaaccttctacatagagttcaaatgatcatggataacaatgtcatgttttctaggtccatgaatgttgtttttacgagaattgactttgtc 42455791  T
Q  374 atccaaaaa 382  Q
    || ||||||    
T  42455792 attcaaaaa 42455800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 53098503 - 53098335
Alignment:
Q  214 ttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatg 313  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||  |||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||    
T  53098503 ttctgacaatcaacatgtttttgaaccgtttccttttgacatttttggtttcctagcatcagaggttgttaaccttctacatagagttcaaatggtcatg 53098404  T
Q  314 cataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |  | ||||||| || ||  ||  | || ||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  53098403 cccatcaatgtcgtgacttttatgtccaagaatactgtgtttacgaggattgattttacaatccaaaaa 53098335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 1041383 - 1041338
Alignment:
Q  338 ttcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1041383 ttcatgaatgttgtgttttcgatgattgattttaccatccaaaaaa 1041338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28740014 - 28739845
Alignment:
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgc-ttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | ||| | ||||||  |||||||| |||| | ||| |||||||||  |||||| || || | |||||||||    
T  28740014 aaagtggccaaacacgagaaattgtgttgtgacagttaacatgtgttttataccatttatgtttgacactttcgacttcctaacaccacaagttgttgac 28739915  T
Q  287 cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgttta 356  Q
    | | || ||| |||||||   |  |||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  28739914 cttttacatagagttcaacgtgcaatgcataacaatgttatgtctcctaggtccataaatgttgtgttta 28739845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 324
Target Start/End: Original strand, 45385951 - 45386196
Alignment:
Q  79 ggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagct 178  Q
    ||||||| |||| |||||||   |||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||   ||   ||||| || |||||||  ||||||||||||||    
T  45385951 ggtaggaggaaagcatgcataaatggacttggttgatgcttcaccacttgtgggattagggcccgaaacttttgcggtaggacatgcaaccctaaaagct 45386050  T
Q  179 gcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagagg 278  Q
      |||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||  |  |||||||| ||||   ||| | ||||| || || ||||||  |||||    
T  45386051 aagtcaaggaaagtggtcaaacataagaaagcgtgttctgacaatcaatttctttttataccatttacatttgaaacttttggctttctagcacaagagg 45386150  T
Q  279 ttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
    |  || ||| ||||  || | |||||| ||||||||||||||||||    
T  45386151 tcattaaccttctacctaaaattcaaagggtcatgcataacaatgt 45386196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 354
Target Start/End: Original strand, 32312820 - 32312876
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  32312820 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtagtgtcttctagatctatgaatgttgtgtt 32312876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Original strand, 49354184 - 49354263
Alignment:
Q  307 ggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaat----gttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49354184 ggtcattcatagcaatgtaatgtctcctaaatccatgaattaatgttgtgtttacgatgattgattttgtcgtccaaaaa 49354263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9601184 - 9601123
Alignment:
Q  321 atgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9601184 atgtcatgactcctaggttcataagtggtgtgtttacgaggattgattttgtcatccaaaaa 9601123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 45661698 - 45661605
Alignment:
Q  289 tctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| || |||||||||||  ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||||||||    
T  45661698 tctacataaagttcaaagggtcatacacaacaatgtcataactcgtaggtccatgaatattgtgtttacgaggattggttttactatccaaaaa 45661605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 138
Target Start/End: Original strand, 9815706 - 9815809
Alignment:
Q  34 tagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaa 133  Q
    ||||||||||||| | ||  || | ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |||| |    
T  9815706 tagaagatcaacatttagatctgcagatgctatggtgtacagataggtaggaggaaaacaagcatgtgt-aacttgatcggggtttcgccactagtggga 9815804  T
Q  134 ttagg 138  Q
    |||||    
T  9815805 ttagg 9815809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 376
Target Start/End: Original strand, 40005289 - 40005345
Alignment:
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatc 376  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  40005289 aatgtcatgtctcctagatatatcaatgttgtgtttacaaggattggttttgccatc 40005345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 53098643 - 53098575
Alignment:
Q  59 gatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgat-tggggtttcaccact 126  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||    
T  53098643 gatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcaaatgtggacttgatcgggggtttcactact 53098575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 319 - 382
Target Start/End: Original strand, 22449816 - 22449878
Alignment:
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  22449816 caatgtcatatcttatagatccatgaatgttgtgtttacga-gattgattttgtcatctaaaaa 22449878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 317
Target Start/End: Original strand, 747851 - 747897
Alignment:
Q  271 atcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcata 317  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  747851 atcagaggttgttgaccttctacatagagtttaaaaggtcatgcata 747897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 384
Target Start/End: Original strand, 3698689 - 3698735
Alignment:
Q  338 ttcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaag 384  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3698689 ttcatgaacgttgtgtttatgaagattgattttgccatctaaaaaag 3698735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 246
Target Start/End: Original strand, 34536931 - 34536989
Alignment:
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgt 246  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  34536931 aaagtgaccaaacatgaaaaaacgtgttatgacaatcaacatatttttatactatttgt 34536989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 252 - 371
Target Start/End: Original strand, 49344202 - 49344325
Alignment:
Q  252 acactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaat----g 347  Q
    ||||||| | |||||||| | || ||||  ||||||  ||| |||||||| ||| |||||  ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    |    
T  49344202 acacttttgttttcctaggaccaaaggtaattgacctcctacatatagtttaaagggtcactcatagaaatgtaatgtctcctagatccatgaattaatg 49344301  T
Q  348 ttgtgtttacgatgattgattttg 371  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  49344302 ttgtgtttatgatgattgattttg 49344325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52403963 - 52403868
Alignment:
Q  274 agaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttg 371  Q
    |||||||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||  |||| ||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  52403963 agaggttaatgaccttctacatatagttcaaagggtcatgtacaacaatatca--tctcttaggtttataaatgttgtgtttacgaagattggttttg 52403868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1208522 - 1208422
Alignment:
Q  232 ttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtct 331  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||| || || |||| |||  ||||| | | | |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  1208522 ttttataccatttattttttacattttcggctttcttgcataagaaattgtttatcttatatagagagttcaaaggatcgtgcataacaatgtcatgtct 1208423  T
Q  332 c 332  Q
    |    
T  1208422 c 1208422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Original strand, 41440089 - 41440137
Alignment:
Q  196 caaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactattt 244  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  41440089 caaacataagaaaatgtgttctaacattcaacgtgtttttatactattt 41440137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24125318 - 24124938
Alignment:
Q  6 ctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgga 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||| | | || |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24125318 ctgtcaacttcctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcatatgttatggtctactgacgggtaggaagaaaacatgcatgtgtaga 24125219  T
Q  106 cttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgag 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||||| | |||||| || ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  24125218 cttgactggggtttcaccacttgtgggattatgcgtcgtgccttttacggtgggacaagcagccctaaaagctgcatcaagcaaaatggccaaacatgag 24125119  T
Q  206 aaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaa 305  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||||||||    
T  24125118 aaagcgtgctctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacaattttgatttcctagcaccagaggttgttggccttctacataaagttcaaa 24125019  T
Q  306 aggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagct 386  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||  |||||||    
T  24125018 aggtcatgcatagcaatgtcatgtctcataggtccatgaatgttgtgtttacaaggattagttttgccatccgtaaaagct 24124938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 39434958 - 39434581
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||   |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||     
T  39434958 cctgtgaactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggtctgtcgatgttatggtgtacggatgggttggaggaaaacatgcatgtgtgt 39434859  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || | | |||||||  |||||||   | | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  39434858 acttgactggggtttcaccacttgtgggtttaggggtggaggcttttacagtaggacaggaagctctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatga 39434759  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||   |||| | |||| ||| ||| |||    
T  39434758 gaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgtttttgacacttttgacttcctagcatcagaggcatttgatcttctacatagagtccaa 39434659  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39434658 agggttatgcatatcaatgtaatgtctcttagatccatgaatgttgtgtttacgaggattgattttgccatccaaaaa 39434581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 500512 - 500199
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  500512 aacttcctgatttacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatgttgtatggatgggtagaaggaaaacatgcatgtgtagacttga 500413  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  500412 gtgaggtttcaccacttgtgggattaggtgtcgggccttttacggtaggaccgacagccctaaaagttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaaac 500313  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||||    
T  500312 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttacttttgacattttcggtttcctagtatgagagg-tgttggccttctacatagagttcaaaaggtc 500214  T
Q  311 atgcataacaatgtc 325  Q
    ||||||| |||||||    
T  500213 atgcatatcaatgtc 500199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 336
Target Start/End: Original strand, 35739803 - 35740133
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | | ||||||||||||||| |||| | | |||| ||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35739803 cctgtgaactttctgactgacccatttggtagaagatcaacacttaggcatgcagatgttatggtgtatgaatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgg 35739902  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  35739903 acttgactggggtttcaccactagtgggattaag-gtcgggccttttacggtaggacagacatccctaaaagttgtgttaagcaaagtggccaaacatga 35740001  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaa 304  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  35740002 gaaagcgggttctgacaatcaacatgtttttatacaattagcttttgacactttcagtttcctagcaccagagattgttgaccttctacatagagttcaa 35740101  T
Q  305 aaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctag 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35740102 aaagtcatgcataacaatgtcatgtcccctag 35740133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 383
Target Start/End: Original strand, 25021646 - 25022008
Alignment:
Q  21 ctgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttc 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  25021646 ctgacccactagatagaagatcgtcacttaggcctgcagatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgaccggagtttc 25021745  T
Q  121 accacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaac 220  Q
    ||||||||||| |||||| ||||    ||||||  || |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||    
T  25021746 accacttgtgggattaggggtcgatgtttttacagtatgacatacagccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggtgaaatatgagaaagtgtgttctcac 25021845  T
Q  221 aatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataaca 320  Q
    |||||||||| |||||||| ||||  |||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||| || | | | |||||||| ||||||||| ||||    
T  25021846 aatcaacatgtttttataccattttcttttgacatttttggcttcctagcaccagaggttgttgaccatccacacaaagttcaaagggtcatgcacaaca 25021945  T
Q  321 atgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  25021946 atgtcatatctcctaggtccaggaatgttgtgtttacaatgattgattttatcatccaaaaaa 25022008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 64 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 38815516 - 38815208
Alignment:
Q  64 tatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaa 163  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | |||||||     
T  38815516 tatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtgg----------ggtatcaccacttgtgggattaggggtcggggcttttatggtaggacag 38815427  T
Q  164 acaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtt 263  Q
    ||| ||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| | |    
T  38815426 acagccctaaaagccacgccaaacaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttccgct 38815327  T
Q  264 tcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgat 363  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  38815326 tcctagcaccagagggtgttgaccttctacatagagttcaaagggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggat 38815227  T
Q  364 tgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || |||| |||||||||||    
T  38815226 tggtttttccatccaaaaa 38815208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 57 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 3188208 - 3187884
Alignment:
Q  57 cggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgtt 156  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| |    
T  3188208 cggatgttatggtgtacggatggattggaggaaaacatgcatgtgtggccttgtgtggggtttcaccacttgtgggtttagg-gtcggggcttttacggt 3188110  T
Q  157 aggacaaacaacc-ctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacac 255  Q
    ||||||   | || ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||    
T  3188109 aggacaggaagcctctaaaagttgcatcaagcaaagtggcaaaacatgaggaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgaaac 3188010  T
Q  256 tttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgttt 355  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3188009 tttcggcttcctagcatcagaggttgttaaccttctacatagag-tcaaagggttatgcatagcaatgttatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttt 3187911  T
Q  356 acgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  3187910 acgagaattggttttgccatccaaaaa 3187884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6592758 - 6592494
Alignment:
Q  112 tggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtg 211  Q
    |||| |||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6592758 tgggttttcaccgtttgtgggattaggtgtcgg-ccttttacgataggatagacagtcgtaaaagctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcg 6592660  T
Q  212 tgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtca 311  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  6592659 tgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagaggttgttgaccttctgcatagagttcaaaaggtca 6592560  T
Q  312 tgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatcca 378  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  6592559 tgcat-ataatgtcatgtctcataggttcatgaatgttgtgtttacgagtattggttttgtcatcca 6592494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28196319 - 28196106
Alignment:
Q  169 cctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttccta 268  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  28196319 cctaaaaactgcatcaagtaaagcggctaaacatgagaaagtgtgttatgataataaacatgtttttataccatttgtttttgacacttttgtcttccta 28196220  T
Q  269 gcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatt 368  Q
    ||| || |||||||||||| ||||  || |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||   |||||||    
T  28196219 gcaccataggttgttgaccatctacgtagagttcaaaggatcatgcacaacaatgtcatgtctcctagatccacggatgttgtgtttacgggaattgatt 28196120  T
Q  369 ttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| ||||||||||    
T  28196119 ttgtcatccaaaaa 28196106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37517366 - 37517163
Alignment:
Q  24 acccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcacc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||  ||||||| ||||||||||||  ||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  37517366 acccactagatagaagatcaacactcatgcctgcaaatgtgatggtgtacggatgggtaggtggaaaatatgtttgtgtagacttgactggggtttcgcc 37517267  T
Q  124 acttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaat 223  Q
    |||||| | |||||| || || ||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  37517266 acttgttggattaggcgtaggaccttttaccgtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagggtgttccgacaat 37517167  T
Q  224 caac 227  Q
    ||||    
T  37517166 caac 37517163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4700064 - 4699785
Alignment:
Q  100 tgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaa 199  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| |  ||| | |||||||  | ||| | |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||    
T  4700064 tgtggatttgactggggtttcaccacttgtgggtttaaggatcgcggcttttacaatcggatagacaaccctcaaagttgtgtcaagcaaagtggccaaa 4699965  T
Q  200 catgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatag 299  Q
    ||||| || | ||||||| ||||| |||||| ||||| || |||||| ||  ||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||| ||    
T  4699964 catgataa-gcgtgttctcacaattaacatgtttttacaccatttgtgtta-acacttttggcttcatagcaccagaggctgttgaccttctatataaag 4699867  T
Q  300 ttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||    
T  4699866 ttcaaa-ggtcatgaatagcaatattatgtcacctaggtccatgaatgttgtgtttacaaggattagttttgccatccaaaaa 4699785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 219 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 37514298 - 37514135
Alignment:
Q  219 acaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataa 318  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  37514298 acaatcaacatgcgtttatactatttgcttttgacactttcaatttcctagcgccagaggctgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatat 37514199  T
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| | ||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  37514198 caatgttacgtctcttaggtccatgaatgttgtattcacgaggattgatcttgccacccaaaaa 37514135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 382
Target Start/End: Original strand, 8540262 - 8540573
Alignment:
Q  73 cggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaacccta 172  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||| || |||| | |||||  ||||| | ||||| | || ||||||||| | ||    
T  8540262 cggatgggtagaaagaaaacatgtatgcgtggactttattgatgtttcatcatttgttggattagaggtcggac-ttttatggtaagacaaacaatctta 8540360  T
Q  173 aaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcat 272  Q
    |||| |||||||| |||| |   ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||   || ||  ||| ||||||||   || ||| |||    
T  8540361 aaagttgcgtcaaacaaaatagtcaaacattagaaaatgtgttctaacaatcgacatgtttttatgtcatctgcatttgacactttcaactttctaacat 8540460  T
Q  273 cagaggttgttgaccgtctatatat---agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattt 369  Q
    ||||||||||||||  |||| |||    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8540461 cagaggttgttgactttctacataataaagttcaaagggtcatgcttaacaatgtcatgttttctattttcataaatgttgtgtttacgatgattgattt 8540560  T
Q  370 tgccatccaaaaa 382  Q
    |  ||||||||||    
T  8540561 tatcatccaaaaa 8540573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6618383 - 6618199
Alignment:
Q  197 aaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatata 296  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| | |  |||    
T  6618383 aaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagagattgttgaccttttgcata 6618284  T
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  6618283 gcgttcaaaaggtcatgcat-ataatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgagtattggttttgtcatccaaaaa 6618199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8620013 - 8619736
Alignment:
Q  97 atgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgacc 196  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||| | |||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| ||  |    
T  8620013 atgtgtgaacttgactggggtttcaccacttgtgggattagagatcgtgacttttacgatagaacagacagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggtc 8619914  T
Q  197 aaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatata 296  Q
    |||||||| |||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| || || ||| || ||||||||||||||  || | |||    
T  8619913 aaacatgaaaaagcgtattttgacaatcaacgtgcttttataccatttgtttttaacatttttggctttctaacaccagaggttgttgactttcgacata 8619814  T
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
     || ||||| |     ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  8619813 gagctcaaatg-----gcacaacaatgtcatgtct-cta-attcat-aatgttgtgtttacgacgattgattttgcctttcaaaaa 8619736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 382
Target Start/End: Original strand, 22589394 - 22589529
Alignment:
Q  246 ttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaa 345  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||    
T  22589394 tttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgacttt-tacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcataggtctatgaa 22589492  T
Q  346 tgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22589493 tgttgtgttcacgaggattggttttgccatccaaaaa 22589529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 18804646 - 18804527
Alignment:
Q  262 tttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatg 361  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| |    
T  18804646 tttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatagatttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgactcctaggttca-gagtgttttgtttacgagg 18804548  T
Q  362 attgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  18804547 attggttttgccatccaaaaa 18804527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8882452 - 8882339
Alignment:
Q  171 taaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagc 270  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  8882452 taaaacctgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaatatgcttttaaaccatttgtttttga-actttcagttttctagc 8882354  T
Q  271 atcagaggttgttga 285  Q
    | |||||||||||||    
T  8882353 accagaggttgttga 8882339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 39671170 - 39671332
Alignment:
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgtttttt-acactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||| |||||||| |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  39671170 aaagtggccaaaccagagaaagcgtgttttgacaattaacatgtttttatacaatttatttttttacattttcggcttcctagcaccagaggttgttaac 39671269  T
Q  287 cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgtt 349  Q
    | | ||  || |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39671270 cttttacgtagagttaaaagggtcatgaataaaaatgtcatgtctcctagatccatgaatgtt 39671332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 264 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3821256 - 3821148
Alignment:
Q  264 tcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgat 363  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||    
T  3821256 tcctagaaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaagggtaatgcatagcaatgtcatgtctcctaggttcataaatgttatgtttacgaggat 3821157  T
Q  364 tgattttgc 372  Q
    |||| ||||    
T  3821156 tgatattgc 3821148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 147 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4073684 - 4073444
Alignment:
Q  147 cttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgt 246  Q
    |||||||| | | ||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||| ||||||  ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||     
T  4073684 cttttacggtggaacagacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagtggtcaaacaagagaaaacgtgttttaccaatcaacatgattttatacaatttgc 4073585  T
Q  247 tttttacactttcggt-ttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaa 345  Q
     ||| ||||||| |   ||  ||| | ||||||||||||||| |||| | | |  ||||   |||||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||    
T  4073584 atttgacacttttgccatttttagtaccagaggttgttgaccttctacagagaaatcaatgagtcatgcatagcaatgtcatgtttccaagatccgtgaa 4073485  T
Q  346 tgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagct 386  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  4073484 tgttgtgtttacgagaattgattttatcatccaaaaaagct 4073444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10189766 - 10189568
Alignment:
Q  73 cggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaacccta 172  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||   | |||||| | ||||||| |||  ||||    
T  10189766 cggattggtaggaggaaaacatgtatgtgtggacttgattgggatttcaccgcttgtgagattaggggttaaggcttttatggtaggacatacattccta 10189667  T
Q  173 aaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagca 271  Q
    |||| |||| |||  |||||   |||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||  |||||  ||| ||| ||| || |||||||||    
T  10189666 aaagttgcgccaattaaagtagtcaaacaagagaaagcatgttctgacaatcaacatgtttttatatcatttgcatttgacatttttggcttcctagca 10189568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 43824053 - 43823927
Alignment:
Q  232 ttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtct 331  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||| |||| ||||| | |||||| |  | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43824053 ttttataccatttgcttttgacacttttggcttccttgcattagaggctattgacctttcacatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatgtct 43823954  T
Q  332 cctagattcatgaatgttgtgtttacg 358  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||    
T  43823953 ccgagatccattaatgttgtgtttacg 43823927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24451105 - 24451026
Alignment:
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagctagcgg 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  24451105 atgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgttcacgatgattg-ttttgccatccaaaatatctagcgg 24451026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 383
Target Start/End: Original strand, 9259377 - 9259486
Alignment:
Q  274 agaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgcc 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| |   ||||||||| ||||||||| | |||||  | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  9259377 agaggttgttgaccttctacatagagttcacagactcatgcatagcaatgtcatatatcctaagtccatgaatgttgtatttacgaagattgattttgtc 9259476  T
Q  374 atccaaaaaa 383  Q
    ||||||||||    
T  9259477 atccaaaaaa 9259486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 327
Target Start/End: Original strand, 40223476 - 40223541
Alignment:
Q  262 tttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcat 327  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40223476 tttcctagcaccggaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcat 40223541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 371
Target Start/End: Original strand, 121703 - 121903
Alignment:
Q  169 cctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttccta 268  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||   |||| |||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||| | |||||    ||||||    
T  121703 cctagaagctgcatcaagtaaagttgtcaaatatgataaaatgtgttcgcacagtcaacatgcttatat--tatttgcttttgaaacttttaacttccta 121800  T
Q  269 gcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatt 368  Q
    || |||||| ||||||||  |||| | | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||  | |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  121801 gcctcagagattgttgacattctacacaaagtttaaaagatcatgcatatcaatgtcatgtcatctaagtccatggatgttgtgtttacgaggattgatt 121900  T
Q  369 ttg 371  Q
    |||    
T  121901 ttg 121903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8882320 - 8882258
Alignment:
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  8882320 aatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattaattttgccatcaaaaaa 8882258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3825705 - 3825540
Alignment:
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtc 325  Q
    |||||||||||| | |||||  | | |||| || || ||||||| | || |||||||||||| |||| | | | ||||||  || ||||||| ||| |||    
T  3825705 acatgcttttattccatttgcatgtgacacctttggcttcctagaaccataggttgttgaccttctacacagaattcaaagagtaatgcatagcaacgtc 3825606  T
Q  326 atgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaagctagcgg 391  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||    
T  3825605 atgtttcatagatccatgaatattgtgtttacgatgattaatattgccattaaaaaaacctagcgg 3825540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 42659212 - 42659141
Alignment:
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  42659212 atgcatagcaatattatgtcttctaggttcatgaatgttgtgtttacgaggattaattttgtcatccaaaaa 42659141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8115895 - 8115738
Alignment:
Q  212 tgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtca 311  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||  ||  || |||||||||||||| |||| ||| |||||||| | |||    
T  8115895 tgttctaataatcaatatacttttataccatttgcatttgacacttttggttttttaa-atgagaggttgttgaccttctacataaagttcaaaggatca 8115797  T
Q  312 tgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    |||||  ||||||||||| |   |  | |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8115796 tgcattgcaatgtcatgtttataaagtccatgaatgttatgtttatgatgattgatttt 8115738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 10950739 - 10950831
Alignment:
Q  278 gttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  10950739 gttgttgaccttctacataaagttcaaagggtcacatataacaatgtcatgtttcttaatttcatgaatgatttatttacgatgattgatttt 10950831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 10958744 - 10958836
Alignment:
Q  278 gttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgatttt 370  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  10958744 gttgttgaccttctacataaagttcaaagggtcacatataacaatgtcatgtttcttaatttcatgaatgatttatttacgatgattgatttt 10958836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 4066829 - 4066759
Alignment:
Q  312 tgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  4066829 tgcatagcaatgtaatgtgtcctaggtccatgactgttgtgttcacgatgattggttttaccatccaaaaa 4066759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 40839770 - 40839717
Alignment:
Q  77 tgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtgg 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  40839770 tgggtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttgattggagtttc-ccacttgtgg 40839717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36004391 - 36004035
Alignment:
Q  26 ccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccac 125  Q
    |||| |||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||  | ||||||| | | | ||||| |||||||||||| || |||||  ||||    
T  36004391 ccacaagatagaagatcgacacataggccaacgaatgttatggtgtacgactaggtaggagggacatatgcacgtgtggacttgactgaggtttttccac 36004292  T
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatca 225  Q
    ||||||| | | |  || || |||||||| | || ||| ||  ||  |||| || || ||| |||||| | ||| |||| |||||| ||| | |||||||    
T  36004291 ttgtggattgaaga-tcagggcttttacggtggggcaagcagtccctaaagttgggtaaagtaaagtggctaaatatgacaaagtgcgttatgacaatca 36004193  T
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtc 325  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||| ||| ||| |  |||||| || ||||||||||||||| |||| | | ||||  || ||||||| |||||||  |     
T  36004192 acatgtttttataccatttacatttgacatttttgacttcctatcaccagaggttgttgaccatctaaaaagagtttcaagggtcatggataacaacatt 36004093  T
Q  326 atgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| | || | || |||||||||| | || |||||||    
T  36004092 atgtctcataggtccatgaatgttatcttcaagaggattgatttttctattcaaaaaa 36004035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 39671015 - 39671108
Alignment:
Q  17 ctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||| || |||||| || |||||   |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  39671015 ctaactgacccactagatattagatcgacatttaggtctgcggatgttacggtgtctagatgggtaggagaaaaatatgcatgtgtggacttga 39671108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 382
Target Start/End: Original strand, 5329711 - 5329795
Alignment:
Q  298 agttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||  |  || ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  5329711 agttcaaagggtcatggacaacaatatcatgtctcctatgtctatcaatgttgtgtttatgaggattaattttgacatccaaaaa 5329795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 338 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24320295 - 24320251
Alignment:
Q  338 ttcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  24320295 ttcatgaatgttgtgtttacgaggattgattttgatatccaaaaa 24320251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Original strand, 8714721 - 8714795
Alignment:
Q  307 ggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||    
T  8714721 ggtcatgcatatcaatgttatggctcatagat-catgaatgttgtgtttaagaaaattgattttaccatctaaaaa 8714795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 308 - 383
Target Start/End: Original strand, 10556412 - 10556486
Alignment:
Q  308 gtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    |||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  10556412 gtcatgcaaaacaatgtcgtggctcatag-ttcatgaatgttgtgtctacaaaaattgattttgctatccaaaaaa 10556486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 500198 - 500156
Alignment:
Q  340 catgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  500198 catgaatgttgtgtttacgaggattgattttaccattcaaaaa 500156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3863387 - 3863243
Alignment:
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtc 325  Q
    |||||||||||| | |||||  | | ||||||| || ||||||| | |||||||| |||||| |||| ||| |||||||| |||  |||||| |||||||    
T  3863387 acatgcttttattccatttgcatgtgacacttttggcttcctaggaccagaggttattgaccttctacatagagttcaaagggtagtgcatagcaatgtc 3863288  T
Q  326 atgtctcctagattcatgaa---tgttgtgtttacgatgattgat 367  Q
    || | |||||  |  |||||   |||||||||||||| |||||||    
T  3863287 atctttcctaagtctatgaatattgttgtgtttacgaggattgat 3863243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 383
Target Start/End: Original strand, 14545733 - 14545827
Alignment:
Q  289 tctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||||||| | || |||||||    
T  14545733 tctatataaagttcaaaaagtcatgcacgacaatgtcataactccttaattagtgaatgttgtgtcaacgaagattgattttacaattcaaaaaa 14545827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 229
Target Start/End: Original strand, 22589336 - 22589394
Alignment:
Q  171 taaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacat 229  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  22589336 taaaagctgcgtcaagcaaaatggctgaacatgagaaagcgtgttctgacaaccaacat 22589394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 121
Target Start/End: Original strand, 42921997 - 42922059
Alignment:
Q  59 gatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttca 121  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42921997 gatgttatggtgtacagatgggtaggaggaaaacaaacatgtgtggacttgactggagtttca 42922059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 383
Target Start/End: Original strand, 8227980 - 8228029
Alignment:
Q  334 tagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||    
T  8227980 tagatccatgaatgttgtgtttacgaggaatggttttgctatccaaaaaa 8228029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 136
Target Start/End: Original strand, 11611146 - 11611195
Alignment:
Q  87 gaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaatta 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||    
T  11611146 gaaaacatgcatgtgtggacttcacaggggtttcaccactcgtgggatta 11611195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 383
Target Start/End: Original strand, 42922225 - 42922297
Alignment:
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaaa 383  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| | | ||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  42922225 atgcacaacaatgtcataactcctcggtccatgaatattgtgtttacgataaattatttttccatccaaaaaa 42922297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1768 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1768
Description:

Target: scaffold1768; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Original strand, 6 - 377
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  6 aacttcctgactgacccactagatagatgatcaacacgcaggcccgcggatgttatgatgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtatagacttga 105  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  106 ctggggtttcaccacttgtgggattaagtgtcgggccttttactgtaggacaggcagccctaaaaactgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagacagt 205  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    | ||| | || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||| | || |||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||    
T  206 gggttatgaccatcaacatgcttttataccatttgtgtttgacacttttggttttctagtaccaaaggttgttgaccttctgcataaagttcaaaaagtc 305  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  306 atacatagcaatgtcatgtctcctagatcgatgaacgttgtgtttacgaggattagttttgccatccaaaaa 377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 959833 - 959495
Alignment:
Q  43 aacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtc 142  Q
    ||||||||||| | |||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  959833 aacactcaggcatgcggatgttacagtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgattgaagtttcaccacttatgggattaggtgtc 959734  T
Q  143 gggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactat 242  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||    
T  959733 gggccttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgtgtcaagcaaagtggctaaccatgagaaaacgtgttctgacaatcaacatgtctttataccat 959634  T
Q  243 ttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcat 342  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||    
T  959633 ttgtttttgacattttcggtttcctagcaccagaggttgttgaccttctacgta-agttcaaaaggtcatgcatagcaatgttgtgtctcctaggtccat 959535  T
Q  343 gaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  959534 gaatgttgtgtttacgaggattgattttgtcatctaaaaa 959495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34304781 - 34304410
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34304781 aactttctgactgacccactagatagaagatcgacacttaggcctgcggatgttatggtgtacggatgggctggaggaaaacatgcatgtgtggacttga 34304682  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||| | |||||   | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  34304681 ttggggtttcaccacttgtgggtttaggagtcggggcttttacggttggacagctagccctaaaagctgcgtcaagcaaaataaccaaacatgagaaagc 34304582  T
Q  211 gtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtc 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||| ||||  ||     
T  34304581 gtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacactttgggcttcctagcatcagatgatgttgaccttctacatagagtccaaagagtt 34304482  T
Q  311 atgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  34304481 atgcatagcaatatcatgtctcataggtctatgaatgttgtatttacgaggattgattttgcaatccaaaaa 34304410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Original strand, 4206429 - 4206788
Alignment:
Q  22 tgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttca 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4206429 tgacccactagataaaagatcaacactcaagcctgcggatgttatggtgtacaaatgggttggaggaaaacatgcatgtgtagacttgactggggtttca 4206528  T
Q  122 ccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaaca 221  Q
    |||||||||| ||||||  || | ||||||||| |||||||  || || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||    
T  4206529 ccacttgtgggattaggcatcagaccttttacggtaggacatgcagccttaaaagtggcgtcaagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgaca 4206628  T
Q  222 atcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaa 321  Q
    || ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4206629 atgaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatgacaa 4206728  T
Q  322 tgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    ||||||||| ||||| |  |||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4206729 tgtcatgtcacctaggtcaatgaatatagtgtttacgaggattggttttgccatccaaaa 4206788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 382
Target Start/End: Original strand, 33220552 - 33220904
Alignment:
Q  30 tagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgt 129  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||| ||| |||||| || ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  33220552 tagatagaagattgacactcaggcctgcagatgttatgatgtacggatgagttggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgactggggtttcaccacttgt 33220651  T
Q  130 ggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacat 229  Q
    ||  ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  33220652 gggtttaggggtcggggcttttacggtaggacagacagctctaaaagctgcatcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgtgttgacaatcaacat 33220751  T
Q  230 gcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgt 329  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||||||  |||    
T  33220752 gcttttataccatttgcttttgacactttcggcttcctagcatccgaggttgttgaccttctacatatagtccaaagggttatgcatagcaatgttgtgt 33220851  T
Q  330 ctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    || |||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  33220852 cttctaggtccatgaatgttgcgtttacgataattggttttgccatcctaaaa 33220904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 382
Target Start/End: Original strand, 17249203 - 17249498
Alignment:
Q  87 gaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaag 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || || || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17249203 gaaaatatgcatgtgtggacttgactggggtttcaccatttgtgggtttcggagtgggcgcttttacggtaggacaaacaaccctaaaagttgcgtcaaa 17249302  T
Q  187 caaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||    
T  17249303 caaagtggccaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttttggcttcctagcatcagaggcagttgac 17249402  T
Q  287 cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    | |||| ||| ||| |||| | | ||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17249403 cttctacatagagtccaaaggattatgtatagcaatgttatgtctcctaagttcatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaa 17249498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 331
Target Start/End: Original strand, 45491 - 45819
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||    
T  45491 aactttctgactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctgcagatgtgatggtgtacggatgggtagatggaaaacatgcttgtgtagacttga 45590  T
Q  111 ----ttg----gggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacat 202  Q
        |||    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45591 cagcttgacaggtgtttcaccacttgtgggattaggtgtcggaccttttaccgtaggacaggcagctctaaaagctgcatcaagcaaagtgatcaaacat 45690  T
Q  203 gagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttc 302  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  45691 gagaaaacgtgttctgacaatcaacatgcttttattccatttgtttttgacactttcggtttcttagcaccagaggctgttgaccttctacatagagttc 45790  T
Q  303 aaaaggtcatgcataacaatgtcatgtct 331  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  45791 aaaaggtcatgcatagcaatgttatgtct 45819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Original strand, 29337916 - 29338271
Alignment:
Q  22 tgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttca 121  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  29337916 tgacccactagatagaagttcgacacttaggcctgcagatgttatggtgtgcagatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtggacttgatcgaggtttta 29338015  T
Q  122 ccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaaca 221  Q
    ||||| |    |||||  |||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  29338016 ccactcg----attagtggtcggggcttttacggtaggacaaacaatcataaaagatgtgtcaagcaaagctgccaaacatgagaaaacgtgttctaaca 29338111  T
Q  222 atcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaa 321  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||  |  ||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| | |||    
T  29338112 atcaacatgctcttataccatttgcttttgacacttctgacttcctagcaccagagatcgttgaccttctacatatggttcaaagggtcatgcacatcaa 29338211  T
Q  322 tgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  29338212 tgtcatgactcctaggtccatgaatgttgtgtttacaaggattgatttttctatccaaaa 29338271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 20 - 382
Target Start/End: Original strand, 357548 - 357909
Alignment:
Q  20 actgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggttt 119  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | | |||| ||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  357548 actgacacactagatagaagatcgacacttaggtatgcagatgttatggtgtatggatgggttggagcaaaacatgcatgtgtggacttgactggagttt 357647  T
Q  120 caccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaa 219  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||  |||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |    
T  357648 caccacttgtgggtttaggggtcggtgcttttacggtaggacaggcagccctaaaagcttcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctga 357747  T
Q  220 caatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataac 319  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||| ||| |||| | | | ||||| |    
T  357748 caatgaacatgcttttataacctttgtttttaacacttt-tgtttcctaacattagaggttgatgaccttctacatagagtccaaatgattaagcatagc 357846  T
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  357847 aatgttatctctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaagattaattttgccatctaaaaa 357909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32115974 - 32115773
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttga 110  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32115974 aacttcctgactgacctactagatagaagatcaacactcaggcctgcggatgttatggtgtacagatgagtaggaggaaaacatgcatgtgtagacttga 32115875  T
Q  111 ttggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagt 210  Q
      ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32115874 ccggggtttcatcacttatgggattaggtgtcgggcattttacgttaggacatgcagccttaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacatgagaaagt 32115775  T
Q  211 gt 212  Q
    ||    
T  32115774 gt 32115773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34415667 - 34415404
Alignment:
Q  65 atggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaa 164  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  || | |||||| ||| || |||||||| ||||| |      
T  34415667 atggtgtatggatgggtaggaggaaaacatacatttgtgaacttgattggggtttcaccacacgttggattaggggtcaggacttttacggtaggatagg 34415568  T
Q  165 caaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggttt 264  Q
    || || || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  34415567 catccttacaagctgcgtcaagcaaaatggcgaaacatgagaaagtgtgttctgacaatcaacatgcttttatgccatttgtttttgacactttaggttt 34415468  T
Q  265 cctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatg 328  Q
    |||| || || | |  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34415467 cctaacaccaaatgcagttgaccttctatatagagttcaaatggtcatgcatagcaatgtcatg 34415404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 382
Target Start/End: Original strand, 34554169 - 34554469
Alignment:
Q  81 taggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgc 180  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||  || || ||||||   |||| || ||||| ||||||| |||    
T  34554169 taggaggaaaacaagcatatgtggatttgattggggtttcaccaattgtgggattagggatcagggcttttaaagtaggtcagacaacactaaaagttgc 34554268  T
Q  181 gtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggtt 280  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||| ||||||||| |||| | |    
T  34554269 gtcaagcaaaacgaccaaacatgagaaagcgtgttctgataatcaagatgtttttataccatttacttttgacacattcggcttcctagcaccagatgct 34554368  T
Q  281 gttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaa 380  Q
     |||||  |||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34554369 attgactttctacatagagtttaaaaggtcatgtatagcaatatcatgtctcgta-agtcatgaattttgtgtttacgaggattgattttgtcatccaaa 34554467  T
Q  381 aa 382  Q
    ||    
T  34554468 aa 34554469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 186 - 381
Target Start/End: Original strand, 4165919 - 4166114
Alignment:
Q  186 gcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttga 285  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4165919 gcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttttatatcatttgcttttgacactttcgggttcctagcaccagaggttgttga 4166018  T
Q  286 ccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
    || |||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  || ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4166019 ccttctacatagagtttaaaaggtcatgcatgacaatgtcatgtcacctaggtcaataaatatagtgtttacgaggattggttttgccatccaaaa 4166114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 382
Target Start/End: Original strand, 28008886 - 28009180
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagc 187  Q
    ||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  28008886 aaaacatgcacaggtgaacttgactggagtttcaccactcgtgggattaggggtcggggcttttacggtaggacatgcaaccctaaaagctacgtcaagc 28008985  T
Q  188 aaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatc---aacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttg 284  Q
    |||| |  ||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||   | || || || | |||||||    
T  28008986 aaagcggtcaaacatgagaaagcttgttctaacaatcaagaatatggttttataccatttgcttttgacacttttgg---cttaacaccaaaagttgttg 28009082  T
Q  285 accgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||    
T  28009083 accttctgtatatagttcaaagggtcatacacaacaatgtcatgactcctaggtccatgaacgttgtctttaccagaattgattttgcaatccaaaaa 28009180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28626059 - 28625845
Alignment:
Q  168 ccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgctttt-atactatttgttttttacactttcggtttcc 266  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  28626059 cccttaaagctgcgtcaagtaaggtggctaaacacgagaaaacgtgttctgacaatcaacattttttttataccatttgttttttacactttcaatttcc 28625960  T
Q  267 tagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattga 366  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  28625959 tagcaccagaggttgttgagcttctacataaagttcaaaaggtcatgcataac-atgtcatatctcataggtctatgaatgttgtgtttacggagattga 28625861  T
Q  367 ttttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28625860 ttttgccattcaaaaa 28625845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12401622 - 12401388
Alignment:
Q  5 cctgttaacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtgg 104  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | | || |  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12401622 cctgtgaacttcctgactgacctactagatagcagatcaagacttaagtctgcaaatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatgcatgtgtag 12401523  T
Q  105 acttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  || || |||||| | |||||||| || | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |    
T  12401522 acttgattggggtttcaccacttatgggattatggttcagggcttttatggtaggacaagcagcactaaaagttgcgtcaaacaaagtggccaaacataa 12401423  T
Q  205 gaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatac 239  Q
    || || ||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  12401422 gatagcgtgttttgctaatcaacatgcttatatac 12401388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 28543628 - 28543394
Alignment:
Q  43 aacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtc 142  Q
    ||||||||||| | | |||| |||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||  |||    
T  28543628 aacactcaggcatgcagatgttatgatgtacagatggataggaggaaaacatgcatgtgtggatttgactgaggtttcaccacttgtgggattagaggtc 28543529  T
Q  143 gggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactat 242  Q
     || |||||||| || ||||  || || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | | |||||  ||||| |||||||||    
T  28543528 aggacttttacggtaagacaggcagccttaaaagtcgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaatcgtgttttgaaaatcactatgctcttatactat 28543429  T
Q  243 ttgttttttacactttcggtttcctagcatcagag 277  Q
    ||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  28543428 ttgattttgacactttcagcttcctagcattagag 28543394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 81 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24016551 - 24016261
Alignment:
Q  81 taggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgc 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||  |  || ||| |||||| |||||| |||    
T  24016551 taggaggaaaacatgcatgtgtgaatttgaccggagtttccccacttgtgggattaggagtcggggctttttgggaag-acagacaaccgtaaaagttgc 24016453  T
Q  181 gtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggtt 280  Q
     ||||| ||| |   ||||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| | || | | ||| |||||||||||| |||| |||    
T  24016452 atcaagtaaaatagtcaaacatgagaaagcttgttctcacaatcaacatgtttttataccatttgctattgatagttttggtttcctagcaccagatgtt 24016353  T
Q  281 gttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgc 372  Q
    |||||   | || ||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||| || |||||||||| |||| ||||||    
T  24016352 gttgattttttacatagagttcaaagggtcatgcacaagaatgtcatgtctcctaagtacataaatattatgtttacgataattggttttgc 24016261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 32115734 - 32115632
Alignment:
Q  280 tgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaa 379  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  32115734 tgttgaccttctacaaagagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgctatctaa 32115635  T
Q  380 aaa 382  Q
    |||    
T  32115634 aaa 32115632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 382
Target Start/End: Original strand, 13398212 - 13398375
Alignment:
Q  219 acaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataa 318  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||| | | ||| |  |||||| ||||||| |||||||||  |||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  13398212 acaatcaacatatttttatactatttacttttgatatttttgacttcctaacatcagaagttgttgacattctacatagagttcaaaagatgatgcataa 13398311  T
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13398312 caatgtcacgacttctagatgcataaatgttgtgtttacgatggttgattttgtcatccaaaaa 13398375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Original strand, 3137365 - 3137440
Alignment:
Q  307 ggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3137365 ggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaa 3137440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3715066 - 3714838
Alignment:
Q  147 cttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgt 246  Q
    |||||||| || |||| |||| | |||||| || ||||| |||| ||   ||||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||  || |||    
T  3715066 cttttacgataagacatacaatcataaaagttgtgtcaaacaaaatggttaaacatgagaaaacgtgttctcacaattaacatgtttttatatcatctgt 3714967  T
Q  247 tttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaat 346  Q
    |||| ||||||| |  ||| ||||| || ||  | |||| | |||| ||| |||| |||   ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||    
T  3714966 ttttgacacttttgacttcttagcaccaaagactcttgatcttctacatagagtttaaagaatcatgcacaacaatgtcatgtctcataaatccatgaat 3714867  T
Q  347 gttgtgtttacgatgattgattttgccat 375  Q
    ||||||||| | | |||||||||| ||||    
T  3714866 gttgtgtttgcaaggattgattttaccat 3714838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34169022 - 34168914
Alignment:
Q  142 cgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatacta 241  Q
    |||| |||||||  |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||| |||||||||||||||| |    
T  34169022 cggggcttttaccgtaggacatgcaaccctaaaatttgcgtcaagcaaagtggccaaacatgagaaagcatgtttggacaagcaacatgcttttatacca 34168923  T
Q  242 tttgttttt 250  Q
    |||| ||||    
T  34168922 tttgctttt 34168914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 20693434 - 20693548
Alignment:
Q  22 tgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttca 121  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| | |||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||  ||||||||    
T  20693434 tgaccaactagataaaagatccacacttaggcctgcagatattatggtgtacagatgggtaggaggaaaacatgc-tatgtgaacttgatcagggtttca 20693532  T
Q  122 ccacttgtggaattag 137  Q
    ||||| |||| |||||    
T  20693533 ccactcgtgggattag 20693548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22985997 - 22985873
Alignment:
Q  220 caatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataac 319  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| ||| || | |||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  22985997 caatcaacgtacttttatactacttgtgtttgacatttttggctacctaacatcataggttgtttaccttctatatagagtccaaaaggtcatacatagc 22985898  T
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatga 344  Q
     |||| || |||| ||| |||||||    
T  22985897 catgttatatctcttaggttcatga 22985873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 344
Target Start/End: Original strand, 23802397 - 23802521
Alignment:
Q  220 caatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataac 319  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| ||| || | |||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |    
T  23802397 caatcaacgtacttttatactacttgtgtttgacatttttggctacctaacatcataggttgtttaccttctatatagagtccaaaaggtcatacatagc 23802496  T
Q  320 aatgtcatgtctcctagattcatga 344  Q
     |||| || |||| ||| |||||||    
T  23802497 catgttatatctcttaggttcatga 23802521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 319 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 34168897 - 34168835
Alignment:
Q  319 caatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  34168897 caatgtcatgactcctagatccatgaatgttgtg-ttacgaggattggttttgctatccaaaaa 34168835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7749437 - 7749395
Alignment:
Q  340 catgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7749437 catgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatcctaaaa 7749395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 282
Target Start/End: Original strand, 32291258 - 32291328
Alignment:
Q  212 tgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  32291258 tgttctaacaatcaacatgcatttatattatttgtgtttgacagttttggctacctagcactagaggttgt 32291328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 33519 - 33164
Alignment:
Q  28 actagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacat--gcatgtgtggacttgattggggtttcaccac 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  33519 actagatagaagatcaacactcaggcatgcggatgttatggtgtacggatgggtaggaggaaaacatatgcatgtgcaaacttgattggggtttcaccac 33420  T
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatca 225  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |  || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33419 ttatgggattaggtgtcgggccttttacggtaggacaggcaaccttaaa-gtggcatcaagcaaagtggctaaacatgagaaagcgtgttctgacaatca 33321  T
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtc 325  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |     
T  33320 acatgtttttataccatttacttttgacattttcggtttcctaacaccagaggttgttgaccttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatttt 33221  T
Q  326 atgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33220 atgtctcctaggtccatgaacgtcgtgtttacgaggattgattttgtcatccaaaaa 33164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6542 - 6279
Alignment:
Q  87 gaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaag 186  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  6542 gaaaacatgcttgtgtagacttgactggggtttcaccacttgtgggattagg-gtcggaccttttaccgtaggacagacagccctaaaagttgcgtcaag 6444  T
Q  187 caaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgac 286  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  6443 taaagtggccaaacatgagaaagcgtgttctgacaatcaacatgcttctataccatttgcttttgacactttcagtttcctagcaccagaggctgttgac 6344  T
Q  287 cgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgt 351  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6343 cttctacatagagttcaaaaggtcatgcatagcaatgtcatgtctcctaggtccatgaatgttgt 6279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 127 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 103274 - 103020
Alignment:
Q  127 tgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaa 226  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||  || |||| |||||||||||||| ||  || ||||||| ||||||| |||| || ||||||||    
T  103274 tgtgggataaggtgtcgggccttttaccgtaggacaggcagccctcaaagctgcgtcaagtaagatggccaaacacgagaaagcgtgt-ctgacaatcaa 103176  T
Q  227 catgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtca 326  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  103175 catgcttttataccatttgcttttgacactttcggtttcctagcaccagaggctgttgaccttctacatcgagctcaaaaggtcatgcataacaatgtcg 103076  T
Q  327 tgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  103075 tgtctcctaggtccatgaatgttgtgtttacgaggattggttttgccatccaaaaa 103020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 268
Target Start/End: Original strand, 47376 - 47618
Alignment:
Q  26 ccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccac 125  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  | |  ||| |||||||| |  ||| ||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47376 ccactaaatagaagatcaacacttagggatgcaaatgttatggtgtacaaatgagtatgagaaaaaaatgcaagtgtggacttgattggggtttcaccac 47475  T
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatca 225  Q
    |||||| ||||||  | | | |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  47476 ttgtgggattagggattgagacttttacggtaggacaaataaacctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgagaaaatgtgttctgacagtta 47575  T
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttccta 268  Q
    ||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  47576 acatatttttataccatttgcttttaacactttcgatttccta 47618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 382
Target Start/End: Original strand, 47641 - 47713
Alignment:
Q  310 catgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
    ||||||||||||||||| || || |||   |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  47641 catgcataacaatgtcacgtttcataggcccatgaatgttatgtttacaaagattgattttaccatcgaaaaa 47713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 7701 - 7517
Alignment:
Q  197 aaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatata 296  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| | |  |||    
T  7701 aaacatgagaaagcgtgttctcacaatcaacatgattttaaaccatttgcttttgacactttcagtttcctagctccagagattgttgaccttttgcata 7602  T
Q  297 tagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaaa 382  Q
      |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  7601 gcgttcaaaaggtcatgcat-ataatgtcatgtctcataggtccatgaatgttatgtttacgagtattggttttgtcatccaaaaa 7517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10546 - 10329
Alignment:
Q  114 gggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtg 213  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||  | |||||| || ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| || | |||    
T  10546 gggtttcaccactcgtgggattaggggttggggcttttacagttggacaagcagccctaaaagttgcgtcaagtaaaatggccaaacatgataatgcgtg 10447  T
Q  214 ttctaacaatcaa----catgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggt 309  Q
    |||| ||||||||    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| ||     
T  10446 ttctgacaatcaatcaacatgcttttataccatttgcttttgacacttgtggcttcctagcaccagaggttgttgaccttcta-atagagttgaaagggc 10348  T
Q  310 catgcataacaatgtcatg 328  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10347 catgcataacaatgtcatg 10329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 20006 - 19916
Alignment:
Q  11 aacttcctaactgacccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtg 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||   |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20006 aacttcttaactgacccactagatagaagatgaacacttagacctgtagatgttatggtgtacggataggtaggaggaaaacatgcatgtg 19916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Original strand, 18202 - 18499
Alignment:
Q  26 ccactagatagaagatcaacactcaggcctacggatgctatggtgtgcggatgggtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccac 125  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||| | | |||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| | |||||| ||    
T  18202 ccactaaataaaagatcaacatttaggcttgcagatgttaaggtgtacagatgggtaggaggaaaacatatttgtgtgggcttgattgagatttcactac 18301  T
Q  126 ttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatca 225  Q
    | |||| |||| | |||||  |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  18302 tcgtgggattacgggtcggagcttttatgataggacaaacaaccctaaaagttgcatcaaacaaagcggccaaacatgagaaa-cgtgttctcacaatca 18400  T
Q  226 acatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgt 324  Q
    ||||| ||||||   || || |||| ||||||| | ||||| ||||  |||| ||||| ||| |||| ||| |||| ||| ||||||||| | ||||||    
T  18401 acatgtttttatgtcatctgcttttgacacttttgatttccaagcagtagagattgttaaccttctacatagagtttaaagggtcatgcagagcaatgt 18499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 49622 - 49330
Alignment:
Q  88 aaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggc----cttttac-gttaggacaaacaaccctaaaagctgcgt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||| |    ||||| | | ||| |||| || ||||||||| ||| |    
T  49622 aaaacatgcatgtgtggacttgattgag-tttcactacttgtgggattaggggtcggtcagagcttttgcagctag-acaagcagccctaaaagttgcat 49525  T
Q  183 caagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgt 282  Q
    ||| |||||||  ||||  |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| || || || ||||||     
T  49524 caaacaaagtggtcaaatgtgagaaatcgtgttctgacaatcaacgtgcttttataccatttgcttttgacactttcgacttcttaacaccaaaggttg- 49426  T
Q  283 tgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaaa 381  Q
         ||| | ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  49425 ---aggtcaacatagagttcaaaggatcatgcataacaatgtcatgtctcttatgtccatgaatgtagtatttacgagaattgatttttccatctaaaa 49330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16274 - 16179
Alignment:
Q  156 taggacaaacaaccctaaaagctgcgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgtttttt 251  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  16274 taggacagacaacgctaaaagctgcgtcaaacaaaatggccaaacatgagaaaacatgttctgacaataaacatgtttttatactttttttttttt 16179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16155 - 16068
Alignment:
Q  246 ttttttacactttcggtttcctagcatcagaggttgttgaccgtctatatatagttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcct 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  16155 ttttttacacttttggtttcctagcacca-aggttattgactttctacatagagttcaaagggtcatgcatagtaatatcatgtttcct 16068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0493 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0493
Description:

Target: scaffold0493; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 282
Target Start/End: Original strand, 8407 - 8609
Alignment:
Q  80 gtaggacgaaaacatgcatgtgtggacttgattggggtttcaccacttgtggaattaggtgtcgggccttttacgttaggacaaacaaccctaaaagctg 179  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| | |||  | | |||| |||| ||  | |||||| ||||| | |||||||    
T  8407 gtaggagggaaacatgcatgtttggactggactggggtttccccacttgtaggattgagagacggggctttcactgtgggacaagcaaccttcaaagctg 8506  T
Q  180 cgtcaagcaaagtgaccaaacatgagaaagtgtgttctaacaatcaacatgcttttatactatttgttttttacactttcggtttcctagcatcagaggt 279  Q
    | |||| |||  ||    |||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  8507 cttcaaacaatttggttgaacatgagaaaacatgttctgacaatcaacatgtttttataccatttgcgtttaacacttttggtttcctagcactagaggt 8606  T
Q  280 tgt 282  Q
    |||    
T  8607 tgt 8609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 17390 - 17468
Alignment:
Q  300 ttcaaaaggtcatgcataacaatgtcatgtctcctagattcatgaatgttgtgtttacgatgattgattttgccatccaaa 380  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  17390 ttcaaatggtcatgcataataatgt--tgtctcttaggtccatgaatgttgtgtttaagatgattgcttttgctatccaaa 17468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University