View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12048_low_3 (Length: 583)

Name: NF12048_low_3
Description: NF12048
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12048_low_3
NF12048_low_3
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (19-570)||(12227099-12227652)
chr4 (30-565)||(44100530-44101071)
chr4 (90-385)||(25144752-25145050)
chr4 (24-439)||(3510028-3510442)
chr4 (19-159)||(24075670-24075810)
chr4 (193-370)||(23124246-23124426)
chr4 (184-370)||(44101035-44101228)
chr4 (99-357)||(24075341-24075601)
chr4 (19-142)||(20758655-20758779)
chr4 (19-142)||(20765046-20765170)
chr4 (309-489)||(31931688-31931874)
chr4 (195-315)||(12227011-12227134)
chr4 (146-240)||(31293276-31293369)
chr4 (55-195)||(20758820-20758960)
chr4 (55-195)||(20765211-20765351)
chr4 (171-255)||(23620570-23620655)
chr4 (318-449)||(20759051-20759187)
chr4 (318-449)||(20765442-20765578)
chr4 (27-140)||(23620603-23620717)
chr4 (27-175)||(35049285-35049432)
chr4 (188-255)||(3393914-3393981)
chr4 (188-255)||(13851076-13851143)
chr4 (173-258)||(20758627-20758713)
chr4 (173-258)||(20765018-20765104)
chr4 (193-255)||(31324595-31324657)
chr4 (211-255)||(13866704-13866748)
chr4 (173-370)||(24075752-24075955)
chr4 (210-255)||(9718021-9718066)
chr4 (330-382)||(17292287-17292340)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (19-573)||(20409383-20409937)
chr3 (23-517)||(29787860-29788357)
chr3 (27-517)||(29634543-29635027)
chr3 (27-393)||(17266910-17267280)
chr3 (42-488)||(17370924-17371378)
chr3 (90-381)||(50342308-50342602)
chr3 (332-536)||(4812229-4812428)
chr3 (320-488)||(1638524-1638697)
chr3 (171-315)||(20409293-20409443)
chr3 (171-270)||(17266859-17266962)
chr3 (195-270)||(1886342-1886420)
chr3 (193-344)||(29634416-29634572)
chr3 (72-207)||(55390598-55390732)
chr3 (94-213)||(1638296-1638412)
chr3 (305-395)||(3162494-3162584)
chr3 (195-256)||(29787830-29787891)
chr3 (209-255)||(14265732-14265778)
chr3 (420-517)||(55390799-55390897)
chr3 (194-258)||(1886235-1886299)
chr3 (19-55)||(1886263-1886299)
chr3 (193-258)||(29516661-29516726)
chr3 (42-103)||(29516712-29516773)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (229-570)||(26793350-26793695)
chr1 (29-565)||(27799705-27800246)
chr1 (27-441)||(19262033-19262455)
chr1 (82-441)||(39899578-39899924)
chr1 (27-389)||(11788768-11789133)
chr1 (31-232)||(26798866-26799054)
chr1 (85-486)||(48706586-48706997)
chr1 (174-370)||(27800199-27800397)
chr1 (27-160)||(27574855-27574988)
chr1 (309-489)||(21760294-21760479)
chr1 (90-187)||(21760071-21760168)
chr1 (193-270)||(27259845-27259925)
chr1 (192-240)||(15471903-15471951)
chr1 (468-517)||(12026629-12026678)
chr1 (209-270)||(16279015-16279079)
chr1 (82-132)||(16279121-16279171)
chr1 (193-254)||(15471989-15472050)
chr1 (194-258)||(26089138-26089202)
chr1 (19-55)||(26089138-26089174)
chr1 (82-185)||(42460409-42460512)
chr1 (174-370)||(19261881-19262082)
chr1 (27-61)||(27259840-27259874)
chr1 (193-270)||(27574804-27574884)
chr1 (193-255)||(48706495-48706557)
chr1 (19-56)||(15471989-15472026)
chr1 (192-229)||(22923427-22923464)
chr1 (83-132)||(52076217-52076266)
chr1 (173-240)||(11788750-11788818)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (19-517)||(22842927-22843431)
chr8 (23-441)||(12784797-12785218)
chr8 (23-517)||(32108510-32109018)
chr8 (65-493)||(26140265-26140700)
chr8 (27-393)||(10204790-10205164)
chr8 (69-487)||(24629590-24630015)
chr8 (147-270)||(29370509-29370635)
chr8 (27-199)||(32123686-32123858)
chr8 (91-488)||(27783566-27783967)
chr8 (192-393)||(12504541-12504744)
chr8 (193-342)||(22842810-22842964)
chr8 (193-258)||(12504446-12504511)
chr8 (196-343)||(32108391-32108540)
chr8 (193-295)||(12784723-12784830)
chr8 (198-251)||(10205140-10205193)
chr8 (209-258)||(24629512-24629561)
chr8 (306-370)||(12504330-12504394)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (146-565)||(5306211-5306633)
chr2 (63-315)||(23282593-23282845)
chr2 (65-376)||(11718991-11719306)
chr2 (23-377)||(20529375-20529731)
chr2 (55-364)||(18878753-18879064)
chr2 (91-376)||(28276586-28276874)
chr2 (292-441)||(37059057-37059203)
chr2 (193-370)||(20529228-20529408)
chr2 (225-472)||(28746780-28747034)
chr2 (27-141)||(5305279-5305394)
chr2 (191-315)||(12763805-12763932)
chr2 (307-488)||(18332676-18332862)
chr2 (192-393)||(20988732-20988935)
chr2 (192-517)||(26617255-26617592)
chr2 (85-185)||(12763966-12764066)
chr2 (82-181)||(18332986-18333085)
chr2 (20-119)||(18038814-18038913)
chr2 (82-139)||(37059358-37059416)
chr2 (193-258)||(20988973-20989038)
chr2 (173-258)||(28276356-28276442)
chr2 (189-255)||(31991668-31991734)
chr2 (91-132)||(18879116-18879157)
chr2 (209-258)||(31991574-31991623)
chr2 (209-326)||(5305171-5305292)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (42-517)||(7575737-7576216)
chr5 (69-541)||(37396775-37397250)
chr5 (23-441)||(26604222-26604651)
chr5 (19-493)||(16417715-16418197)
chr5 (65-441)||(31488146-31488528)
chr5 (61-488)||(10975925-10976360)
chr5 (192-544)||(19748127-19748485)
chr5 (82-394)||(11477578-11477892)
chr5 (175-382)||(25360247-25360458)
chr5 (19-240)||(34595584-34595805)
chr5 (90-255)||(23228373-23228538)
chr5 (25-187)||(19575564-19575726)
chr5 (90-454)||(28718215-28718587)
chr5 (19-159)||(15797777-15797917)
chr5 (193-344)||(11477396-11477552)
chr5 (29-255)||(36311528-36311749)
chr5 (146-332)||(26604113-26604302)
chr5 (329-544)||(15798007-15798228)
chr5 (193-368)||(19748523-19748701)
chr5 (193-315)||(16417625-16417752)
chr5 (329-457)||(23228598-23228731)
chr5 (193-252)||(34595768-34595827)
chr5 (173-258)||(36311490-36311576)
chr5 (193-344)||(6998515-6998671)
chr5 (24-132)||(8531809-8531917)
chr5 (338-393)||(22858233-22858288)
chr5 (224-332)||(37397294-37397405)
chr5 (211-255)||(31238526-31238570)
chr5 (192-295)||(7575647-7575752)
chr5 (211-368)||(25360048-25360208)
chr5 (188-241)||(10398390-10398443)
chr5 (329-381)||(13130905-13130958)
chr5 (304-393)||(12067522-12067613)
chr5 (187-255)||(13130817-13130885)
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (27-393)||(24560030-24560400)
chr6 (42-477)||(19242924-19243364)
chr6 (19-255)||(20244538-20244775)
chr6 (19-255)||(22138522-22138759)
chr6 (23-438)||(22962057-22962483)
chr6 (23-438)||(23825910-23826336)
chr6 (146-393)||(2402414-2402663)
chr6 (89-488)||(8711002-8711407)
chr6 (329-515)||(23607878-23608066)
chr6 (165-376)||(21864657-21864869)
chr6 (307-488)||(5972935-5973120)
chr6 (42-159)||(33200822-33200939)
chr6 (56-381)||(33200341-33200669)
chr6 (307-515)||(14095729-14095942)
chr6 (175-453)||(3097284-3097568)
chr6 (305-393)||(18743878-18743967)
chr6 (19-132)||(21864382-21864495)
chr6 (19-159)||(30764573-30764713)
chr6 (253-364)||(20244410-20244521)
chr6 (253-364)||(22138394-22138505)
chr6 (191-252)||(23607794-23607855)
chr6 (201-255)||(14482544-14482598)
chr6 (117-213)||(5972743-5972839)
chr6 (188-255)||(30764866-30764933)
chr6 (307-381)||(30764987-30765062)
chr6 (307-382)||(17465145-17465221)
chr6 (119-230)||(18743691-18743802)
chr6 (89-132)||(14096110-14096153)
chr6 (188-255)||(17465024-17465091)
chr6 (189-255)||(14482635-14482701)
chr6 (201-239)||(23911477-23911515)
chr6 (42-126)||(3097169-3097253)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (148-413)||(16651087-16651354)
chr7 (148-413)||(17625447-17625714)
chr7 (148-439)||(44110051-44110344)
chr7 (175-393)||(28066472-28066694)
chr7 (62-393)||(29656147-29656481)
chr7 (68-240)||(26926724-26926896)
chr7 (96-393)||(31267293-31267593)
chr7 (70-395)||(1321311-1321634)
chr7 (61-488)||(16886155-16886592)
chr7 (191-515)||(13304052-13304364)
chr7 (61-213)||(27317475-27317627)
chr7 (42-240)||(23553755-23553953)
chr7 (89-493)||(12083044-12083456)
chr7 (90-255)||(7413897-7414062)
chr7 (61-517)||(7066746-7067210)
chr7 (85-270)||(10546007-10546193)
chr7 (338-515)||(28008860-28009038)
chr7 (173-370)||(12083596-12083797)
chr7 (56-240)||(5281989-5282173)
chr7 (318-453)||(7414115-7414255)
chr7 (165-270)||(41935116-41935224)
chr7 (281-488)||(12309482-12309694)
chr7 (193-270)||(41934913-41934995)
chr7 (27-124)||(5281826-5281923)
chr7 (27-132)||(12083541-12083646)
chr7 (290-393)||(3924961-3925065)
chr7 (65-240)||(3925096-3925271)
chr7 (173-258)||(5281790-5281876)
chr7 (69-132)||(41935008-41935071)
chr7 (447-510)||(41935406-41935469)
chr7 (210-270)||(3925297-3925359)
chr7 (23-128)||(36338062-36338167)
chr7 (419-478)||(26926629-26926689)
chr7 (318-364)||(5282464-5282510)
chr7 (189-255)||(11825055-11825121)
chr7 (27-255)||(150470-150693)
chr7 (209-258)||(150680-150729)
chr7 (209-258)||(3380343-3380392)
chr7 (90-142)||(7413768-7413821)
chr7 (193-258)||(23553939-23554004)
chr7 (329-393)||(27317745-27317810)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (67-517)||(5438-5896)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (23-307)||(22273-22559)
scaffold0015 (193-291)||(22203-22306)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (305-441)||(1191-1328)
[»] scaffold0591 (1 HSPs)
scaffold0591 (254-395)||(2828-2968)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (192-270)||(37009-37090)
scaffold0027 (21-53)||(37131-37163)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (195-332)||(45911-46051)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 570
Target Start/End: Original strand, 12227099 - 12227652
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || | ||||||||||    
T  12227099 ataagttctcacatcgaatctcttcatataggatgaatcatcacaaaatggaatgcatcccaatatattattttgaacttaatcatagtgccctgccaac 12227198  T
Q  119 tgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcga 217  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  || |||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12227199 tgacaagtttcaattgacacaggaacat-gatcaagcacaaaacaacatcttaaaaatgcatttccttttgtgacactcatcttatacgaaggaattcga 12227297  T
Q  218 tgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  12227298 tgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacaagttgtgtactctttattcttgtgagttttgaa--agacttgcaaacctttacgctaactataac 12227395  T
Q  315 aggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatct 414  Q
    |  |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  12227396 acacttcaatgtcaacatcttcagcaaattaacaagaattaaactaaaatcgagcaaaatattgacacaacataataatattacctaaacataatcatct 12227495  T
Q  415 tgccgaatcaaactcttgagaatat-ctcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagca 513  Q
     ||  |||||||||| ||| ||||| |||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  12227496 agcataatcaaactcatgaaaatatactcaagcaatctcagcaacatagcatccatctcgatcctcgagaacatgttgtgcaaaccaaatatcgagaaca 12227595  T
Q  514 tgctttgcacgtcgtcattgttcgttaattccggtcgactgaacgtcaatctaccct 570  Q
    ||||   ||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12227596 tgctcctcacgtcgtcgtcattcgttacctccggccgactgaacgtcaatctcccct 12227652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 30 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 44101071 - 44100530
Alignment:
Q  30 catcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttc 129  Q
    |||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||| | |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44101071 catcgaatccctttatataggatgagtagtcacataaaggagtacatctcaatatattctattgaacttaatcttactaccttgccaactgacaagtttc 44100972  T
Q  130 aat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacat 228  Q
    ||| || ||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44100971 aattgatagaggagcat-gatcaaacacaaaacaacatcttataaatgcatttccttttgtgacactcatcttatacgaaggaattcgatgtgagaactt 44100873  T
Q  229 atatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatg 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||   ||||||||||||   |||||||    
T  44100872 atatagttgattcggcataatacatattgttttctcttcattcttgtaagttttgaaatagacttgcaaacttttgaactaagtataagacaattcaatg 44100773  T
Q  326 ccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatcc-aacaaaataatgacacaa-cataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatc 423  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  44100772 ccaacatcttcaacaaactaacaagaattaaactaaaatccaaaaaaaacaatgacataataataataataatacctaaacatcttcctctgaccgaatc 44100673  T
Q  424 aaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgca 522  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||   ||    
T  44100672 aaattcttgagaatatcttcaggtgatctcagcaatgtagcatccatctcgatcctcggaaacatgttgtgctgaccaaatgtcgataacatgctcctca 44100573  T
Q  523 cgtcgtcattgttcgttaattccggtcgactgaacgtcaatct 565  Q
    | ||||| | ||| ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  44100572 catcgtcgtagtttgttaactctggctgactgaacgtcaatct 44100530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 25145050 - 25144752
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatg 188  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||    
T  25145050 tttgaagttaatcttactgccctgccaactaacaagtttcaattgacagaggagcat-gatcaagctcaaaagaacttcttagaggtgcattcccttctg 25144952  T
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaaga 285  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| || ||| ||| ||||||  |||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||| | |  ||| || ||    
T  25144951 tgacactcatcctatacaatggaattccatatgataacttatataactgattctgcagaatacatgttgtgttctcttca-tcttttgacttttcaatga 25144853  T
Q  286 gacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaa 384  Q
    | |||||||  |  |||  | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  25144852 ggcttgcaagtcactacattcagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacacaa 25144753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 439
Target Start/End: Original strand, 3510028 - 3510442
Alignment:
Q  24 ttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgaca 123  Q
    |||||||||| ||| | ||| |||| ||||||| || ||||||| |||||| | ||| ||||||| || |||||| ||| |||| || | |||| |||||    
T  3510028 ttctcacatcaaataccttcgtataagatgagtaatgacaaaaatgaatgctttccaatatattcattggaactttatcctactgccataccaattgaca 3510127  T
Q  124 agtttcaatg-acagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtga 222  Q
     ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  || || ||| || |||||||| || || |||||||    
T  3510128 tgtttcaatggacagaggagcat-gatcaagctcaaaaagacatcttggaaatgcattccctttcgtcaccctcttcttatacgaatgactttgatgtga 3510226  T
Q  223 aaacatatatagttgattcggcagaatacatg---tgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggct 319  Q
     ||  | || | || ||| || |||||| |     | ||||||||||| ||   || ||| ||||||||   |||||  |||| ||||||||||||  ||    
T  3510227 gaat-tgtacaattcattaggtagaataaaaaacattttctcttcattttttcgagttttcaaagagacaaacaaacatttacactaagtataagacact 3510325  T
Q  320 tcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccg 419  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||   |||||||||   |||    
T  3510326 tcaatgcaaacatcttcaacaaactaccatgaattaaacttaattccaacaaaataatgacactacataataaaacaactta---atcttcatcagaccg 3510422  T
Q  420 aatcaaactcttgagaatat 439  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  3510423 aatcaaacttttgagaatat 3510442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24075810 - 24075670
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24075810 ataaattctcacatcgaattccttcttatacgatgagtcatcacaaaaaggaatgcattccaacagattgctttgaacttaatcttactgctctgccaac 24075711  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  24075710 tgacaagtttcaattgacataggagca-tgatcaagctcaaa 24075670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23124426 - 23124246
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt---ctcttcattcttgtaagctttgaaagagact 289  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||   ||||||||| || |||| ||| ||| |||||    
T  23124426 actcatcttatatgagagaattcgatgtgaaaacctatatagatgattttgtagaatacatgtgttgttctcttcattattttaagttttcaaacagact 23124327  T
Q  290 tgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaaca 370  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||||  ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||    
T  23124326 tacaaacctttaccctaagcataagacacttcaataccaacatcttcagcaatctaacaagaatttaatttaaatccaaca 23124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 184 - 370
Target Start/End: Original strand, 44101035 - 44101228
Alignment:
Q  184 ttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca-----tgtgttctcttcattcttgtaagct 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| | ||||||     |||||||||||||||||| | || |    
T  44101035 ttatgtgactactcatcctatataaagggattcgatgcgataacctatatagttgattcggtataatacatgtgttgtgttctcttcattcttttgagtt 44101134  T
Q  278 ttgaaagagacttgcaaa-cccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaaca 370  Q
    ||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  |||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||| || | ||||||||||    
T  44101135 ttgaaagagacttgcaaattttttacactaagtataagacacttcaatgtcgacatattccgcaaactttcaagaatttaatttaaatccaaca 44101228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24075601 - 24075341
Alignment:
Q  99 aatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactca 197  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||| |  |||||  ||  |||||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  24075601 aatcttactgtcctgccaactgacaagtttcaattgatagaggagcac-gatccaattcaaaggaacctcttagatgtgcattcccttccgtgacactca 24075503  T
Q  198 tcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaa 294  Q
    || |||| |||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||   ||||||||||| | |||| | |  ||| |||||| |||||||    
T  24075502 tcatataagaaggaattttatgtgaaaatctatatagctgattctgtagaatacatgttgtgttctctt-aatcttttgacttttcaaagaggcttgcaa 24075404  T
Q  295 acccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa 357  Q
    | |  | |  | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24075403 atcactgcattcagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaa 24075341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 20758655 - 20758779
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20758655 ataagttatcacatcgaattccctcatataagatgagtcatcacataaaggaatgcattccaagaggttgctttgaattgaatcttactaccctgccaac 20758754  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggag 142  Q
    | |||||| |||| |||||||||||    
T  20758755 taacaagtctcaattgacagaggag 20758779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 20765046 - 20765170
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||  |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20765046 ataagttatcacatcgaattccctcatataagatgagtcatcacataaaggaatgcattccaagaggttgctttgaattgaatcttactaccctgccaac 20765145  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggag 142  Q
    | |||||| |||| |||||||||||    
T  20765146 taacaagtctcaattgacagaggag 20765170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 309 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 31931874 - 31931688
Alignment:
Q  309 tataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa--ctaaaatccaacaaaataatgacacaacataataa---tactacctaaa 403  Q
    |||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||   | | || ||||    
T  31931874 tataagacacttcaataccaacatcttccgcaaactaacaagaattaaaacttaaattccgacaaaataaagacactacataataatggtgccacataaa 31931775  T
Q  404 catcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgt 489  Q
    |||  |||| | || |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||   |||||||| ||||| ||||||||||    
T  31931774 cataatcatgtggcagaatcaaattcttcagaatatcttcaggcgatctcagcaacgtaacttccatctcaatcctcgggaacatgt 31931688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12227134 - 12227011
Alignment:
Q  195 tcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca-----tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagact 289  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||     |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  12227134 tcatcctatatgaagagattcgatgtgagaacttatatagttgatttggtagaatacaaatgttgtgttctcttcattcttg--agtttttaaagagact 12227037  T
Q  290 tgcaaacccttacgctaagtataaga 315  Q
    ||||||   |||| ||||||||||||    
T  12227036 tgcaaatttttacactaagtataaga 12227011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 240
Target Start/End: Original strand, 31293276 - 31293369
Alignment:
Q  146 tgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  31293276 tgatcaaactcaaaactacatcttagaaatgcattttgtt-tgtcacactcatcttatacgaaggaattcgatgtgagaatatgtatagttgatt 31293369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 20758820 - 20758960
Alignment:
Q  55 gtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaag 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | || |||||    
T  20758820 gtcatcacataaaggaatgcattccaaaaggttgttttgaacttaatcttactgtcctgccaactgacaaatttcaattgaaagaggagca-tggtcaag 20758918  T
Q  154 ctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacact 195  Q
    ||||||| ||  |||||||  || ||||||||  ||||||||    
T  20758919 ctcaaaagaacctcttagaggtggattcccttccgtgacact 20758960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Original strand, 20765211 - 20765351
Alignment:
Q  55 gtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaag 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||  |  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| | || |||||    
T  20765211 gtcatcacataaaggaatgcattccaaaaggttgttttgaacttaatcttactgtcctgccaactgacaaatttcaattgaaagaggagca-tggtcaag 20765309  T
Q  154 ctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacact 195  Q
    ||||||| ||  |||||||  || ||||||||  ||||||||    
T  20765310 ctcaaaagaacctcttagaggtggattcccttccgtgacact 20765351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23620655 - 23620570
Alignment:
Q  171 gaaatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| || |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23620655 gaaatgcattcctttatgtgacgactcgtcttatatgagagaattcgatgtgataacatatatagttgattctgcataatacatgt 23620570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 318 - 449
Target Start/End: Original strand, 20759051 - 20759187
Alignment:
Q  318 cttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacac---aacataataatactacctaaacatcttcatc 413  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   |  ||||| ||||||||||| |||  || ||    
T  20759051 cttcaataccaacattttcagcaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactagattataatgatactacctaatcataatcttc 20759150  T
Q  414 ttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgat 449  Q
    | |  |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  20759151 tggtggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgat 20759187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 318 - 449
Target Start/End: Original strand, 20765442 - 20765578
Alignment:
Q  318 cttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacac---aacataataatactacctaaacatcttcatc 413  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||   |  ||||| ||||||||||| |||  || ||    
T  20765442 cttcaataccaacattttcagcaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactagattataatgatactacctaatcataatcttc 20765541  T
Q  414 ttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgat 449  Q
    | |  |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  20765542 tggtggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgat 20765578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 140
Target Start/End: Original strand, 23620603 - 23620717
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  ||  |  ||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |    
T  23620603 tcacatcgaattctctcatataagacgagtcgtcacataaaggaatgcatttcaagaggttcttttgagcttaatcttactgctctgtcaactgacaaat 23620702  T
Q  127 ttcaa-tgacagagg 140  Q
    ||||| |||||||||    
T  23620703 ttcaattgacagagg 23620717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 175
Target Start/End: Original strand, 35049285 - 35049432
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||| ||| | |||||||| ||||||| || |||||| ||  |||||  ||| |||||||||||| ||| | | |||| | ||||||||||||| ||    
T  35049285 tcacatcaaattcattcatataagatgagtaatgacaaaatggtgtgcattacag-atattcttttgagcttcaccctactgctctgccaactgacatgt 35049383  T
Q  127 ttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaat 175  Q
    ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35049384 ttcaattgacataggagca-tgatcaagctcaaaacaacatcttggaaat 35049432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3393981 - 3393914
Alignment:
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  3393981 gtgacactcatcttatatgaaggaattcgatatcataacttacatagttgattcggcataatacatgt 3393914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13851143 - 13851076
Alignment:
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13851143 gtgacactcatcttatatgaaggaattcgatatcataacttatatagttgattctgcataatacatgt 13851076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20758713 - 20758627
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  20758713 aatgcattcctttatgtgatgactcatcttatatgagggaattcgatgtgataacttatagagttgattttgtagaatacatgtgtt 20758627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20765104 - 20765018
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  20765104 aatgcattcctttatgtgatgactcatcttatatgagggaattcgatgtgataacttatagagttgattttgtagaatacatgtgtt 20765018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 31324595 - 31324657
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31324595 actcatcttatacgagagaattcgatatgataacatatatagttgattctgcataatacatgt 31324657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 255
Target Start/End: Original strand, 13866704 - 13866748
Alignment:
Q  211 aattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13866704 aattcgatgtgataacatatatagttgattctgcataatacatgt 13866748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 370
Target Start/End: Original strand, 24075752 - 24075955
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca-----tgtgttctcttcat 266  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    ||||||||     |||||| |||||||    
T  24075752 aatgcattcctttttgtgatgactcatcgtataagaaggaattcgatgtgagaatttatatagttgattttttagaatacatgtgttgtgttttcttcat 24075851  T
Q  267 tcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatcc 366  Q
    |||| | |  ||| | ||||   |||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||  | |||||  ||||||||||| | ||||||    
T  24075852 tcttttgacttttcagagagcgctgcaaatcactacgctaagtataagacacttcaatgccaacatttttggaaaactttcaagaattaaatttaaatcc 24075951  T
Q  367 aaca 370  Q
    ||||    
T  24075952 aaca 24075955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 9718021 - 9718066
Alignment:
Q  210 gaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9718021 gaatttgatgtgataacatatatagttgattctgcataatacatgt 9718066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 17292340 - 17292287
Alignment:
Q  330 catcttcagcaaactaacaagaa-ttaaactaaaatccaacaaaataatgacac 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  17292340 catcttcagcaaactaacaagaatttaatttaaattccaacaaaataaagacac 17292287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 19 - 573
Target Start/End: Original strand, 20409383 - 20409937
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||||||| |||| | ||| ||||    
T  20409383 ataagttatcacattgaatcccttcatataggatgagtcgtcacaaaaaggattgcatttcaatatattattttgaacttaatcctactgctctgtcaac 20409482  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcga 217  Q
    | |||||||| || ||||| ||| | | ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20409483 taacaagttttaattgacaaaggggca-tgatcaaacac-aaacaacatcttagaaatgcattcccttttcttacactcatcctatacgaaggaattcga 20409580  T
Q  218 tgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataag 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |     
T  20409581 tgtgaaaacttatatagttgattcggcagaatacatgttgtgttctcttcattcttgtgagttttgaaagagacttgcaaacctttacgctaactatcac 20409680  T
Q  315 aggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatct 414  Q
    |  |||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  20409681 acacttcaatgccaacatcttcaaaaagctaacaagagttaaactaaaatccaacaaaataatggcacaacataataatactacctaaacttaatcatct 20409780  T
Q  415 tgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagca 513  Q
     ||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20409781 ggcataatcaaactcttgaaaatatcttaaggcgatctcaacaatgtagcatcgatctcaatcctcgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagaaca 20409880  T
Q  514 tgctttgcacgtcgtcattgttcgttaattccggtcgactgaacgtcaatctaccctatg 573  Q
    ||||   ||| |||||   ||||||||| | | | ||| ||||||||||||| |||||||    
T  20409881 tgctcctcacatcgtc---gttcgttaactgctgccgattgaacgtcaatctcccctatg 20409937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 517
Target Start/End: Original strand, 29787860 - 29788357
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |  | ||||  | |||||||| | | | |||| ||||||||||||||| | | |||| |||||||||    
T  29787860 gttctcacatcaaattccttcatataagatgaatagtgacaagcatgaatgcattctaatctatttttttgaacttaatctcatttccctaccaactgac 29787959  T
Q  123 aagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||   |  || |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  29787960 aagtttcaattgacataggagcat-gatcaaactcaaaacaacatcttataaatgcattcttgttcgtcacactcaaattatacgaaggaattcgatgtg 29788058  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaatacat--gtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggct 319  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||  ||    
T  29788059 aaaacttatatagttgattcggtagaatacaaacgtgttctcttcattcttttgagttttcaaagagacttgcaaatttttacgctaagtataagacact 29788158  T
Q  320 tcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccg 419  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  29788159 tcaatgtcaacatcttcagcaaactaccatgaattaaactaaaatcaaacaaaataaagacactacataataatactacctaaacatcttcatctgaccg 29788258  T
Q  420 aatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
    |||||||||||||||||| || ||| | ||||||| ||| | || ||||||||||||| |    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  29788259 aatcaaactcttgagaatttcttcaagtgatctcagcaacgaagtatccatctcgatcgtcacaaacatgttgtgctgaccaaatatcaagaacatgct 29788357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 27 - 517
Target Start/End: Original strand, 29634543 - 29635027
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||| ||||  | | |||||||||||||    
T  29634543 tcacatcgaatattttcatataggatgagtagtgacaaaaaggagtgcatttcaatatattcttttgaacttaatcctactgtcataccaactgacaagt 29634642  T
Q  127 ttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaa 225  Q
    |||||| |||| ||||  || |||||| | |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||  |||||||| |||          | ||||||| ||    
T  29634643 ttcaattgacaaaggaacat-gatcaaacacaaaacaacatcttagaagtgcaatcccttttgtcccactcatcttat----------ttgatgtgagaa 29634731  T
Q  226 catatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttca 322  Q
    | |||||||||||||||| ||| |||||||   ||||| ||||| |||  ||  ||| ||||||||   |||||| ||| |||| ||| ||||  |||||    
T  29634732 cttatatagttgattcggtagattacatgttgtgttctattcatgctttcaaaatttaaaagagaccaccaaacctttatgctatgtaaaagacacttca 29634831  T
Q  323 atgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaat 422  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| |    
T  29634832 atgtcaacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaattcaacaaaataaggacacaacataataatactacctacacaccttcatctgaccgatt 29634931  T
Q  423 caaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||  | ||||||| |||||| | | |||||||| ||| ||||||    
T  29634932 caaactcttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacggagcatctatctcgattgtcgggaacaagttgtgctaatcaaatatcaagaacatgct 29635027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 393
Target Start/End: Original strand, 17266910 - 17267280
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17266910 tcacatcgaatccttttatataggatgagtaacgacataaaggaatgcatttcaatatattctattgaacttaatcttactgcacttccaactgacaagt 17267009  T
Q  127 ttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaa 225  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17267010 ttcaattgacagaggagcat-gatcaagcacaaaacaatatcttagaggtgctttcccttacgtcacactcatcctatacaaaggaatacgatgtgaaaa 17267108  T
Q  226 catatatagttgattcgg-cagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttc 321  Q
    ||||||||||||||||||  | || ||||||   ||||||||||||||| |    ||| |||||  |||||||| |  ||| ||||||||||||  ||||    
T  17267109 catatatagttgattcggtaaaaaaacatgttgagttctcttcattctt-tgtcttttcaaagaatcttgcaaatctgtacactaagtataagacacttc 17267207  T
Q  322 aatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    | | || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  17267208 attaccaacatattcagcaaactaacaagaattaaacttaaattacaacaaaataaagacattacataataat 17267280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17371378 - 17370924
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagagg 140  Q
    ||||||| ||||||| |  ||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  17371378 tcatataagatgagtaacgacaaacatgaatgcattccaatatattcttttgagcttaatcctactgcactgccaactaacaagtttcaattgacaaagg 17371279  T
Q  141 agaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  17371278 agcat-gatcaagcacaaaacaacatcttagaattgcattctcgttcgtcacactcatcctatatgaaggaattcaatgtg-aaacctataaagttgatt 17371181  T
Q  241 cggcagaatacat-----gtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatctt 335  Q
        |||||||||     |||||||||| |||||| | || ||| ||| || | |||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| || || |  |    
T  17371180 -tttagaatacatgtgccgtgttctctttattcttttgagttttcaaatagccgtgcaaacctttaccctaagtataagacactttaataccaactttct 17371082  T
Q  336 cagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactctt 431  Q
    || ||||||  ||  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||| ||||  || | | |  |||||||||||||    
T  17371081 catcaaacttccattaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacataataattatgctacctatacataatcttgtggaagaatcaaactctt 17370982  T
Q  432 gagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg 488  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || | | ||||||| ||| | |||||||||    
T  17370981 gagaatatcttcaggcgacctcaacaacgttgcaaccatctcaatcatcgggaacatg 17370924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 381
Target Start/End: Original strand, 50342308 - 50342602
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatg 188  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||    
T  50342308 tttgaacttaatcttacttcgctaccaactgacaagtttcaaatgacaaaggagcat-gatcaagctcaaaagaacctcttagaggtgcattcccttctg 50342406  T
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaaga 285  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||| || ||| | |  ||| |||||    
T  50342407 gaacactcattctatacgaaggaattcgatgtggtaacctatatagttgattctgcagaatacatgttgtgttttcttaat-cttttgacttttcaaaga 50342505  T
Q  286 gacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaatt-aaactaaaatccaacaaaataatgaca 381  Q
    |  ||| ||| |  |||  | |||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  50342506 ggtttgtaaatcactacattcagtataagacacttcaataccaacaacttcagcaaactaacaagaattaaaattaatttccaacaaaataaagaca 50342602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 332 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 4812428 - 4812229
Alignment:
Q  332 tcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactctt 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |    |||||| ||||||||||| || |    
T  4812428 tcttcaccaaactaacaagaattaaactaaaatccaaccaaataatgacacaatataataatacaacctaatc----tcatctggccgaatcaaagtcat 4812333  T
Q  432 gagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgcacgtcgtca 530  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||   |  ||||| || |||| | | |||||||||||| ||||||||||||  || ||||||   ||||||||||    
T  4812332 gagaatatcttcagaagatctcaccaacaaaacatccaacttgatcgtcgagaacatgttgtgctgaccaaatatc--gaacatgctcctcacgtcgtca 4812235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 488
Target Start/End: Original strand, 1638524 - 1638697
Alignment:
Q  320 tcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaac---ataataatactacctaaacatcttcatctt 415  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||   |||||||| ||||||||||||  |  | |     
T  1638524 tcaataccaacatcttcagcaaaataacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacgtaataataatgctacctaaacataattttatg 1638623  T
Q  416 gccgaatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg 488  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| | |||||||   |||||||| ||||| |||||||||    
T  1638624 gcagaaacaaactcttaagaatatctccaggtgatctgagcaatgtatcttccatctcaatcctcgggaacatg 1638697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 20409443 - 20409293
Alignment:
Q  171 gaaatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg-----tgttctcttc 264  Q
    |||||||| ||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||     ||||||||||    
T  20409443 gaaatgcaatcctttttgtgacgactcatcctatatgaagggattcaatgtgataacttatatagttgattcagtagaatacatgtgttgtgttctcttc 20409344  T
Q  265 attcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataaga 315  Q
    |||||| |  | ||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||    
T  20409343 attcttttgtgttttgaaagagactagcaaatttttacactaagtataaga 20409293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17266962 - 17266859
Alignment:
Q  171 gaaatgcattcccttatgt-gacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg---tgttctcttcat 266  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||   ||||||||||||    
T  17266962 gaaatgcattcctttatgtcgttactcatcctatataaaaggattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggtggaatacatgtgttgttctcttcat 17266863  T
Q  267 tctt 270  Q
    ||||    
T  17266862 tctt 17266859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 270
Target Start/End: Original strand, 1886342 - 1886420
Alignment:
Q  195 tcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattctt 270  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||    
T  1886342 tcatcttatacaacggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggtaaaatacatgttgtgttctcttcattctt 1886420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 29634572 - 29634416
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtg-----ttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||     |||||||||||||| | || ||| |||||||    
T  29634572 actcatcctatatgaaaatattcgatgtgataacatataaagttgatttggtagaatacatgtgttgcattctcttcattcttttgagtttttaaagaga 29634473  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaact 344  Q
    ||  ||||   |||| ||||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||||||    
T  29634472 ctaccaaatttttacactaagtataagacatttcaatgctgacattttcaacaaact 29634416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 207
Target Start/End: Original strand, 55390598 - 55390732
Alignment:
Q  72 tgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatctta 170  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||  | |||| | ||| ||    
T  55390598 tgcattccaatacattattttgaacttaatcctactgccttgccaactgacaagtttcaattgacagatgagca-tgatcaagtacgaaactacatc-ta 55390695  T
Q  171 gaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacga 207  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  55390696 gaagtgcattctcttttgtgacactcatcttatacga 55390732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 213
Target Start/End: Original strand, 1638296 - 1638412
Alignment:
Q  94 aacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgac 192  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  ||||||   ||||||||  |||||||||||||||  |    
T  1638296 aacttaatcatactgccctgccaactaacaagtttcaattgacagaggagca-tgatgaagtacaaaac---atcttagaggtgcattcccttatgtccc 1638391  T
Q  193 actcatcctatacgaaggaat 213  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  1638392 actcatcttatatgaaggaat 1638412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 395
Target Start/End: Original strand, 3162494 - 3162584
Alignment:
Q  305 taagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatac 395  Q
    |||||||||||  |||||| |   ||||||||| ||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3162494 taagtataagacacttcaaagaaaacatcttcaacaaactaccatgaattaaacttaattccaataaaataatgacactacataataatac 3162584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29787891 - 29787830
Alignment:
Q  195 tcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtg 256  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29787891 tcatcttatatgaaggaatttgatgtgagaacctatatagttgattcggtagaatacatgtg 29787830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 255
Target Start/End: Original strand, 14265732 - 14265778
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14265732 ggaattcgatgtgataacatatatagttgattctgcataatacatgt 14265778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 517
Target Start/End: Original strand, 55390799 - 55390897
Alignment:
Q  420 aatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||   |||||||| |||||  |||| ||||||    
T  55390799 aatcaaacttttgagaatatcttcaggtgatatcaacaatgtagcatccatctcaatcctcgcgaacatacggtgttgacgaaatactgagaacatgct 55390897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 1886299 - 1886235
Alignment:
Q  194 ctcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  1886299 ctcatcctatatgaagggattcgatgtgagaacttatacagttgatttgctagaatacatgtgtt 1886235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Original strand, 1886263 - 1886299
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgag 55  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1886263 ataagttctcacatcgaatcccttcatataggatgag 1886299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29516726 - 29516661
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    ||||||| |||| || | ||||| |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  29516726 actcatcttatatgaggaaattcaatgtgaaaacctataaagttgatttggtagaatacatgtgtt 29516661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Original strand, 29516712 - 29516773
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatct 103  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||    
T  29516712 tcatataagatgagtcacaacaaaaaagaatgcattccaatacattctttagaacttaatct 29516773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 229 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 26793695 - 26793350
Alignment:
Q  229 atatagttgattcggcagaatacatgtgtt---ctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||     
T  26793695 atatagttgattcggcagaatacatgttttattctcttcattcttgtgaactttgaaagagacttgcaaacctttacgttaagtataagacactgcaata 26793596  T
Q  326 ccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaa 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  26793595 ccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacataaacatcttcatttggccgaatcaa 26793496  T
Q  426 actcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgcacg 524  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26793495 actcttgagaatatcttctggcgatctcagcaatgtagaatccatctcgatcctcgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgcacg 26793396  T
Q  525 tcgtcattgttcgttaattccggtcgactgaacgtcaatctaccct 570  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26793395 tcgtcatcgttcgttaactccggccgactgaacgtcaatctcccct 26793350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 29 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27800246 - 27799705
Alignment:
Q  29 acatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagttt 128  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27800246 acatccaatcccttcatataggatcagtagtcacagaaaggaatgcatcccaatatattcttttgaactcaatcatacttccctgccaactgacaagttt 27800147  T
Q  129 caat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaaca 227  Q
    |||| |||||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||     
T  27800146 caattgacagaggaacat-gatcaagctcgaaacaacatcttagaaatgcattcccttttgtgacactcatccaatataaaggaattcgatgtgaaaact 27800048  T
Q  228 tatatagttgattcggcagaatacat---gtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaat 324  Q
    ||||||||| ||||  || |||||||   || |||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||    
T  27800047 tatatagttcattcaacataatacattatgtattctcttcattcttgtgagttttgcaatagacttgcaaacctttacaataagtataagacacttcaat 27799948  T
Q  325 gccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaac-aaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatc 423  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||    
T  27799947 gccgacatcttcaacaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaaataatgagacaaaataataatactacccaaacttcttcatctaaccgaatc 27799848  T
Q  424 aaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgca 522  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  || ||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||   ||    
T  27799847 aaactcttgagaatatcttcaggagattccagcaacgtagcatccatctcgatccacggaaacatgttgtgctggccaaatattgagaacatgctcatca 27799748  T
Q  523 cgtcgtcattgttcgttaattccggtcgactgaacgtcaatct 565  Q
    |||| || | ||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||    
T  27799747 cgtcatcgtcgttcgttaactccggccgattaaacatcaatct 27799705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 441
Target Start/End: Original strand, 19262033 - 19262455
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||  | |||||||||||    
T  19262033 tcacatctaatcccttcatataggatgagtcatcacataaaggaatgcatcccaatatattctttagaacttaatcctactgcccgacaaactgacaagt 19262132  T
Q  127 ttcaatga-cagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttat-gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaa 224  Q
    |||||| | |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |     ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  19262133 ttcaattaacagaggagcat-gctcaagctcaaaacaacatcttagaagtgcattcgcaccccgtgacactcatcctaaacgaatgaatttgatgtgaaa 19262231  T
Q  225 acatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttc 321  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | || ||| ||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||    
T  19262232 acctatatagttgattctgcagaatacatgttgtgttctcttcattcttttgagttttcaaacaaacttgcaaacctttaccctaagtataagacacttc 19262331  T
Q  322 aatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgc 417  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||| |||  || ||  ||    
T  19262332 aataccaacatctttagcaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacataataatgatgctacctaatcataatcttcaggc 19262431  T
Q  418 cgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  19262432 ggaatcaaactgttgagaatatct 19262455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 441
Target Start/End: Original strand, 39899578 - 39899924
Alignment:
Q  82 tatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcatt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||  |||||| | ||||||   ||||||| |||||||    
T  39899578 tatattcttttgaacttaatcatattgtcatgccaactaacaagtttcaattgacagagaagcatc-atcaagttaaaaaca---tcttagagatgcatt 39899673  T
Q  181 cccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatac---atgtgttctcttcattcttgtaagct 277  Q
    |   | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||  | | |||||   ||||||||||||||||||| | || |    
T  39899674 cttgtttgtcacactcatcttatacgaaggaattcgatgtgagaatcaatatagttgattttgtataatacaaaatgtgttctcttcattcttttgagtt 39899773  T
Q  278 ttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataat 377  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39899774 ttcaaagagacttgcaaacctttacactaagtataaaacacttcaatatcaacatcttcaataaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataag 39899873  T
Q  378 gacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
    ||||||             |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39899874 gacaca-------------acctaaacatcttcatctagccgaatcaaacttttgagaatatct 39899924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 389
Target Start/End: Original strand, 11788768 - 11789133
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  || ||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||    
T  11788768 tcacatcgaatcccttcatataagatgagtcatcacagaaaggaatgcattccaagaggttgttttgaacttaattttactgccttgccaaatgataagt 11788867  T
Q  127 ttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaa 225  Q
    |||||| ||| |||||| ||  ||||||||||||| ||  |||||||  ||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||  ||    
T  11788868 ttcaattgacggaggagcata-atcaagctcaaaagaacctcttagaggtgcattctcttctgttacactcatcctatatgaaggaattcaatgtggtaa 11788966  T
Q  226 catatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttca 322  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||   ||||| ||||| | |||| | |  ||| |||||| |||||||| |  |||  | |||||||||  |||||    
T  11788967 cctatatagatgatttggcagaatacatgttgtgtgctctt-aatcttttgacttttcaaagaggcttgcaaatcactacattcagtataagacacttca 11789065  T
Q  323 atgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataa 389  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  11789066 ataccaacatcttcagtaaactaacaagaattaaactttaattccaacaaaataaagactctacataa 11789133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26799054 - 26798866
Alignment:
Q  31 atcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttca 130  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||             ||||| |||||    
T  26799054 atcgaatccctttatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcattccaatatattattttgaacttaattttacg------------gacaaatttca 26798967  T
Q  131 atgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatat 230  Q
    |||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26798966 atgaccaaggagcat-gatcaagctcaaaacaacatcttagaaatgcattcctttgtttgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacctat 26798868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 486
Target Start/End: Original strand, 48706586 - 48706997
Alignment:
Q  85 attcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattccc 183  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  48706586 attcttttgaacttactcctactgcactgccaactaacaagtttcaattgatagaggagca-tgattaagcacaaaacaacatcttagatgtgcattccc 48706684  T
Q  184 ttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttg 280  Q
    ||| ||  |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||  ||| | | ||||||   ||||||||||||||| || | |  |||     
T  48706685 ttacgtctcactcatcttatac-aagggattcaatgtgaaaatatatatactt--ttcagtaaaatacatgttgtgttctcttcattatt-tgacttttc 48706780  T
Q  281 aaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaac-aaaataatg 378  Q
    |||||  |||| ||| |  ||| ||||||||||||  ||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
T  48706781 aaagaatcttggaaatctctacactaagtataagacacttcattgccaacatattcaacaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaaataaag 48706880  T
Q  379 acacaacataataat--actacctaaac---atcttc---atcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccat 469  Q
    |||  ||||||||||  |  ||||||||   ||||||    ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||  || |||    
T  48706881 acattacataataatgaaaaacctaaacataatcttctggttctagcagaatcaaactcttgagaatatcttcagacgatctcagcaacgtaacatacat 48706980  T
Q  470 ctcgatccttgggaaca 486  Q
     ||||||| ||||||||    
T  48706981 atcgatccatgggaaca 48706997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 27800199 - 27800397
Alignment:
Q  174 atgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtg-----ttctcttcatt 267  Q
    ||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||    
T  27800199 atgcattcctttctgtgactactgatcctatatgaagggattggatgtaataacatatatagttgattcggtagaatacatgtgttgtattctcttcatt 27800298  T
Q  268 cttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatcca 367  Q
    ||| | |  |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| || | |||||||    
T  27800299 cttttgaattttgaaagagacttgcaaa---ttatactaagtataagacacttcaatgccgacat-ttccgcaaactttcaagaatttaatttaaatcca 27800394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 160
Target Start/End: Original strand, 27574855 - 27574988
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| |||| || |||  |  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  27574855 tcacatcgaattctctcatataagatgagtcatcacataaagaaatgtattccaagaggttgctttgaacttaatcttactcccctgccaactgacaact 27574954  T
Q  127 ttc-aatgacagaggagaattgatcaagctcaaaa 160  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  27574955 ttcaaatgacagaggagca-tgatcaaactcaaaa 27574988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 309 - 489
Target Start/End: Original strand, 21760294 - 21760479
Alignment:
Q  309 tataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaac 404  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||    
T  21760294 tataagacacttcaataccaacatcttcaacaaactaataagaattaaacttaaattccaataaaataaagacactacataataatgatgctacctaaac 21760393  T
Q  405 atcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgt 489  Q
    ||  | || | |  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21760394 ataattatatggtagaatcaaactgttgagaatatcttcagacgatctcatcaacgtggtttccatctcaatcctcgggaacatgt 21760479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 187
Target Start/End: Original strand, 21760071 - 21760168
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttat 187  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  21760071 tttgaacttaatcttattgccctgccaactgacaagtttcaattgacagaggggca-tgatcaagtacaaaacaacatcttagaggtgcattcccttat 21760168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 270
Target Start/End: Original strand, 27259845 - 27259925
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacat---gtgttctcttcattctt 270  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    ||||||||||||||||    
T  27259845 actcatcctatatgaagggattcgatgtgaaaacatatatagttgattatgtagaatacatttgttgttctcttcattctt 27259925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15471951 - 15471903
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15471951 cactcatcctatacaaaggaattcgatgtgaaaatatatatagttgatt 15471903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 468 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12026678 - 12026629
Alignment:
Q  468 atctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12026678 atctcgatccttaggaacatgttgtgctgaccaaatatcgagaacatgct 12026629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16279079 - 16279015
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgttctcttcattctt 270  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||   | |||||||||||||||||||    
T  16279079 ggaattcgatgtgaaaacctatatagttgatttggtagaatataaaatgtgttctcttcattctt 16279015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 132
Target Start/End: Original strand, 16279121 - 16279171
Alignment:
Q  82 tatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16279121 tatattcttttgaacttaattctactgccctgtcaactgacaagtttcaat 16279171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Original strand, 15471989 - 15472050
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg 254  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||||    
T  15471989 actcatcctatatgaagggattcgatgtgaaaacttatatagttaatttgctagaatacatg 15472050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 258
Target Start/End: Original strand, 26089138 - 26089202
Alignment:
Q  194 ctcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||    
T  26089138 ctcatcctatatgaagggattcgatgtgagaacttatatagttgatttgctagaatacctgtgtt 26089202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 26089174 - 26089138
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgag 55  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26089174 ataagttctcacatcgaatcccttcatataggatgag 26089138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Original strand, 42460409 - 42460512
Alignment:
Q  82 tatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcatt 180  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |  || |||||||||| |||||| || || ||||||||||    
T  42460409 tatattcttttgaacttcatcatgttgccctgccaactgacatgttttaattgacagagaaacat-gatcaagctcgaaacaacatattggaaatgcatt 42460507  T
Q  181 ccctt 185  Q
    |||||    
T  42460508 ccctt 42460512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19262082 - 19261881
Alignment:
Q  174 atgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtg-aaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtg---ttctcttcattc 268  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||   ||||||| |||     
T  19262082 atgcattcctttatgtgatgactcatcctatatgaagggattagatgtgaaaaacctatatagatgattttgtagaatacatgtgtttttctctttatta 19261983  T
Q  269 ttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaa 368  Q
    || | || ||| ||| |||||||||||    |||  |||||||| ||  ||||||| ||||||| ||| |||||||  | |||| |||| | ||||||||    
T  19261982 ttttgagttttcaaacagacttgcaaatttctacattaagtatacgacacttcaattccgacattttcggcaaactttccagaaataaatttaaatccaa 19261883  T
Q  369 ca 370  Q
    ||    
T  19261882 ca 19261881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27259874 - 27259840
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatca 61  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27259874 tcacatcgaatcccttcatataggatgagtcatca 27259840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27574884 - 27574804
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg---tgttctcttcattctt 270  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  27574884 actcatcttatatgagagaattcgatgtgaaaacctataaagttgatttgctagaatacatgtgttgttctcttcattctt 27574804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 48706557 - 48706495
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48706557 actcatcttatatgagggaattcgatgttataacctatatatttgattcggtagaatacatgt 48706495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 15472026 - 15471989
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagt 56  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15472026 ataagttttcacatcgaatcccttcatataggatgagt 15471989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 22923427 - 22923464
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacata 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22923427 cactcatcctatacaaaggaattcaatgtgaaaacata 22923464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 132
Target Start/End: Original strand, 52076217 - 52076266
Alignment:
Q  83 atattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat 132  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  52076217 atattcttttgaactttatcatactaccatgtcaactgacacgtttcaat 52076266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 173 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11788818 - 11788750
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11788818 aatgcattcctttctgtgatgactcatcttatatgaagggattcgatgtgataacatacatagttgatt 11788750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 517
Target Start/End: Original strand, 22842927 - 22843431
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  22842927 ataagttctcacatcgaatcccttcatataagatgagtcatcacaaaaaagaatgtatcccaatatattcttttgaacataaccctactgccctgccaac 22843026  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatc----ctatacgaaggaat 213  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    ||||| ||||||||    
T  22843027 taacaagtttcaattgacagaggagca-tgagcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcacttttgtgacgctcatcctagctataggaaggaat 22843125  T
Q  214 tcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagta 310  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||| || |||||| |     
T  22843126 ttgatgtgaaaacttatatagttgattcggtagaatacaagttgtgttatcttctttcttgtgagttatgaaagagacttgcaaacctttgcgctaactg 22843225  T
Q  311 taagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttc 410  Q
    ||  |   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22843226 tagaacaattcaatgccaacatcttcagcaaactaagaagaattaaact-aaatccaacaaaataatgacacaacat-ataatactacctaaacatcttc 22843323  T
Q  411 atcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgag 509  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||   || ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22843324 gtctggccgaatcaaactcttgagaataacttcaggcgatctcaaaaacaaagcatccatctcgatcgtcggaaacatgttgtgctgaccaaacatcgag 22843423  T
Q  510 agcatgct 517  Q
    | ||||||    
T  22843424 aacatgct 22843431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Original strand, 12784797 - 12785218
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  | ||  | | | |||||| ||| ||| || ||||| |||||||| ||||   ||||||||||||    
T  12784797 gttctcacatcgaattccttcatataagatgagtagtaacgtacacgtatgcattccaatatttt-ttttggacttaatcatactggtctgccaactgac 12784895  T
Q  123 aagtttcaatga-cagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    |||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  12784896 aagtttcaattaacaaaggagcat-gatcaagctcaaaacaacatcttagaaatgcattcccgtttgtcacactcatcttatacgaagaaatttgatgtg 12784994  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtg---ttctcttcattc-ttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagagg 317  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |      
T  12784995 aaaacgtatatagttgattcggtagaatacatgttgtattctcttcattccttttgagttttgaaagagacttgcaaacctttacactaagtataacaca 12785094  T
Q  318 cttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgc 417  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  12785095 cttcaatgccaacattttcatcaaactatcatgaattaaacttaattccaacaaaataaacacactacataataatattacctaaacatcttcatctagt 12785194  T
Q  418 cgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  12785195 cgaatcaaactcttgttaatatct 12785218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 23 - 517
Target Start/End: Original strand, 32108510 - 32109018
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||| |||| || || |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  32108510 gttctctcatcgaattccctcatataagatgggtaatgacaaaaaggaatgcattctaatatgttcttttgaacttaatcctactgccctggcaactgac 32108609  T
Q  123 aagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32108610 aagtttcaattgacagaggagcat-gatcaagctcaaaacaacgtcttagaaatgcattctcgtttgtcacactcatcttatacgaatgaattcgatgtg 32108708  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggc 318  Q
    | ||| ||||||||||| |||| |||||   ||||||||| | | |||||||   || ||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||  |    
T  32108709 agaacctatatagttgactcggtagaatacaacatgtgttttatccattctttcgagttttcaaagagacttgtaaaactttacactaagtataagacac 32108808  T
Q  319 ttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataa----------taatactacctaaacatct 408  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |          |||||| |||||||||| |    
T  32108809 ttcaatgcaaacaacttcaacaaactaccataaattaaacttaattccaacaaaataatgacactacattataatacaatttaatacaacctaaacattt 32108908  T
Q  409 tcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcg 507  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| | |  ||||| ||||||| | | |||||||  ||| |||||||||||||    
T  32108909 tcatctgtccgaatcaaactcttgcgaatatcttcagaagatctcagcaacgaaacatccaactcgatcgtcgagaacatgccgtgctgaccaaatatcg 32109008  T
Q  508 agagcatgct 517  Q
    ||| ||||||    
T  32109009 agaacatgct 32109018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 26140700 - 26140265
Alignment:
Q  65 aaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaatgac-agaggagaattgatcaagctcaaaacaa 163  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||||||| || | | |||| |||||||| |||||||| |  ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  26140700 aaaggaatgcattacaatacattcttttgaacttaatcatattgcactgcaaactgacatgtttcaattaatagaggagcatt-atcaagcacaaaacaa 26140602  T
Q  164 tatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttct 260  Q
     ||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| | ||||||   ||||||||    
T  26140601 catcttagaggtgtattcccttacgtcacactcatcttatacaaaggaattcgatgtgaaaacaaatatagctaattcggtaaaatacatgttgtgttct 26140502  T
Q  261 cttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-t 359  Q
    |||||||| | | |  ||| |||||  ||| |||| |  ||| ||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26140501 cttcattcat-tgacttttcaaagaatcttacaaaactctacactaagtataagacatttcaatgccaacatattcagtaaactaacaagaattaaacat 26140403  T
Q  360 aaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaac 455  Q
    ||| |||||||||||||  |||  ||||||||   || ||||||||||||  |  | |    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26140402 aaattccaacaaaataaatacaatacataataatgatgctacctaaacataattttttgaaagaatcaaactcttaagaatatcttcaggcgatctcaac 26140303  T
Q  456 aatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtg 493  Q
    || |||  || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26140302 aacgtaacatacatatcgatccatgggaacatgttgtg 26140265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 10205164 - 10204790
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||  || || |||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  10205164 tcacatcgaatctcttcatataggacgagccatcacagaaaggaatgcattccaagatgttgttttgaacttaattgtactgctctgccaactgacaagt 10205065  T
Q  127 ttcaat------gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgt 220  Q
    ||||||      |||| || || || ||||||||| |||| ||  |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10205064 ttcaatataattgacaaagtaggat-gatcaagcttaaaataacctcttagaggtgcattcccttccgtgacactcatcctatacaatggaattcgatgt 10204966  T
Q  221 gaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg-tgttctct-tcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggc 318  Q
       ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | | |||| | |  ||| |||||| |||||||| |  |||  | |||||||||       
T  10204965 tgtaacctatatagttgattcggcagaatacatgttgtgctctcttaatcttttgacttttcaaagaggcttgcaaatcactacatttagtataagacaa 10204866  T
Q  319 ttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  10204865 ttcaatgccaacatcttcagcaaactaactagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacatcataat 10204790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 487
Target Start/End: Original strand, 24629590 - 24630015
Alignment:
Q  69 gaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatc 167  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||| |||    
T  24629590 gaatgcataccaatacattcttttgaacttaatcttactgcactactaactgacaagtttcaattgacagaggagcat-gatcaaacacaaaacaacatc 24629688  T
Q  168 ttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttc 264  Q
    || |   |||||| ||||   | ||||||||| ||||| |   |||||||||| |||| |||||||||  ||| || | ||||||   ||| || ||||     
T  24629689 tttggggtgcattgcctttcatcacactcatcttatacaagaaaattcgatgtaaaaatatatatagtatatttggtaaaatacaagttgttttttctt- 24629787  T
Q  265 attcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat 364  Q
    |||||| | |  ||| |||||| |||||||| | |||||||||| ||||||  ||| ||| || ||||||||| |||| |  || ||||| |||| ||||    
T  24629788 attcttttgacttttcaaagagtcttgcaaatctttacgctaagcataagacactttaataccaacatcttcaacaaaatttcatgaattcaacttaaat 24629887  T
Q  365 -ccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatg 459  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||  || | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||      
T  24629888 tccaacaaaataaagacactacataataatgatgctacctaaacataatcttgtggcagaatcaaactcttgagaatatcttcaggcgatctcagcaaca 24629987  T
Q  460 tagaatccatctcgatccttgggaacat 487  Q
    |||  ||| |||| ||||| ||||||||    
T  24629988 tagcttccgtctcaatcctcgggaacat 24630015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 270
Target Start/End: Original strand, 29370509 - 29370635
Alignment:
Q  147 gatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcag 246  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  29370509 gatcaagctcaaaacaacatcttagaaatgcattcatgtttgtcacactcatcttatacgaagcaattcgatgtgaaaacctatatagttgatttggtag 29370608  T
Q  247 aatac---atgtgttctcttcattctt 270  Q
    |||||   |||||||||||||||||||    
T  29370609 aatacaaaatgtgttctcttcattctt 29370635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 27 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32123858 - 32123686
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||| | || | | ||| |||||    
T  32123858 tcacatcgaatcccttcatacaggatgattcatgacaaaaaagaatgcattctaatatattcttttgaacttaatcctactgctctactatctgtcaagt 32123759  T
Q  127 ttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatc 199  Q
    || || ||| | ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||    
T  32123758 ttgaattgataaaggagca-tgatcaagctcaaaacaacatcttaaaaatgcattcccctttgtcacactcatc 32123686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 27783967 - 27783566
Alignment:
Q  91 ttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgt 189  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  ||||||   ||||||||  |||||||||||||||    
T  27783967 ttgaacttaatcttactgacctgccaactgacaagtttcaattgacagaggatta-tgatcaagtacaaaac---atcttagaggtgcattcccttatgt 27783872  T
Q  190 gacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagag 286  Q
      |||||||| |||||||||||||  ||||  ||||    || |   | || || |||||   |||| |||| | | ||||||| | |  ||| |||  |    
T  27783871 cccactcatcatatacgaaggaatctgatgaaaaaattggtacaaccg-ttaggtagaatacaacatatgttttatccattcttttgactttttaaattg 27783773  T
Q  287 acttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaac 385  Q
     |||||||| | ||||  | |||||||||   |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  27783772 gcttgcaaatctttacattcagtataagacatttcaataccaacatcttccgcaaactaacaagaattgaacttaaattccaacaaaataaagacactac 27783673  T
Q  386 ataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactctt-gagaatatctcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgg 481  Q
    ||||||   || ||||||||||||  || | |  | |||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  27783672 ataataatgatgctacctaaacataatcttgtgacagaatcaaactcttaaagaatatcttcagcgatctcagcaacgtagattccatctcaatccttgg 27783573  T
Q  482 gaacatg 488  Q
    |||||||    
T  27783572 gaacatg 27783566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Original strand, 12504541 - 12504744
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagac 288  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||   | ||||||||||||| | |  |||||| || |     
T  12504541 cactcatcctatacaaaagaagtcgatgtgaaaacttatatagttgattcgcaagaatacatgttgtgctctcttcattctt-tgacttttgaagga-at 12504638  T
Q  289 ttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacat 387  Q
     | |||| |  |||  ||||||  |||  |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  12504639 atacaaatctctaccttaagtaccagacacttcaatgcctacatagtcggcaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacat 12504738  T
Q  388 aataat 393  Q
    ||||||    
T  12504739 aataat 12504744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22842964 - 22842810
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacat-----gtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||      |||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  22842964 actcatcttatatgaagggattcgatgtgagaacttatatagttgatttggtagaatacaattgtcgtgttcacttcattcttttgagttttgaaagaga 22842865  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaa 342  Q
    ||||||||   |||  ||||||||||||  |||||||||| |||| ||| |||||    
T  22842864 cttgcaaatttttatactaagtataagatacttcaatgccaacattttcggcaaa 22842810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12504511 - 12504446
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||    
T  12504511 actcatcctatgtgaaggaattcgatgtgaaaacttatatagttgatttaatagaatacatgtgtt 12504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32108540 - 32108391
Alignment:
Q  196 catcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatac---atgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgc 292  Q
    |||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||  | | |||||   |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  32108540 catcttatatgagggaattcgatgagagaacatatatagttgatttagtataatacaaaatgtgttcacttcattcttttaag-tttcaaagagacttgc 32108442  T
Q  293 aaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaac 343  Q
    |||   |||| |||||||||| |  ||| |||||| |||| || |||||||    
T  32108441 aaatttttacactaagtataaaacactttaatgccaacattttgagcaaac 32108391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12784830 - 12784723
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg-----tgttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | || ||||||||||     |||||||||||||||| | || ||||||| |||    
T  12784830 actcatcttatatgaaggaattcgatgtgagaacatgtataactgacttggtagaatacatgtgtcatgttctcttcattcttttgagttttgaaaaaga 12784731  T
Q  288 cttgcaaa 295  Q
    ||||||||    
T  12784730 cttgcaaa 12784723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 251
Target Start/End: Original strand, 10205140 - 10205193
Alignment:
Q  198 tcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatac 251  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10205140 tcctatatgaagagattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggtagaatac 10205193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24629561 - 24629512
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24629561 ggaattccatgtgaaaatatatatagttgatttggtagaatacaagtgtt 24629512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12504394 - 12504330
Alignment:
Q  306 aagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaaca 370  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  12504394 aagtataagagacttcaatgacaacattttctgcaaacttccaataattaaacttaaatccaaca 12504330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 146 - 565
Target Start/End: Original strand, 5306211 - 5306633
Alignment:
Q  146 tgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggca 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5306211 tgatcaagctcaaaacaacatcttggaaatgcactctcttttgtggcattcatcctatacgaagaaattcgatgtgaaaac-tatatagttgattcggca 5306309  T
Q  246 gaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaaccctt-acgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaa 341  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| | || |||  ||||||||| |||||| || ||| ||| |||||||  ||||||| || |||||||||||||    
T  5306310 gaatacatgttgtgttctcttcattcttttgag-tttccaagagacttacaaaccttttacgttaattataagacacttcaataccaacatcttcagcaa 5306408  T
Q  342 actaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc- 440  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  5306409 acttacaagaattaaactaaaatccaataaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcgtctggccgagtcaaactcttgagaatatct 5306508  T
Q  441 tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgcacgtcgtcattgttcgtta 540  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | |  |||||||||||||||| ||||||   ||| |||   | ||||||||    
T  5306509 tcaggaggtctcaacaatgtagcatccatctcgatcgtcgggaagatgatatcctgaccaaatatcgagaacatgctcctcacatcgatgtcgttcgtta 5306608  T
Q  541 attccggtcgactgaacgtcaatct 565  Q
    | ||| || ||||||||||||||||    
T  5306609 actccagttgactgaacgtcaatct 5306633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 63 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23282845 - 23282593
Alignment:
Q  63 aaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaac 161  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||| | ||||||    
T  23282845 aaaaaggaatgcattccaatatatttttttgaacttaaccttactaccctgccaactgacaagtttcaattgacaggggagcat-gatcaatcacaaaac 23282747  T
Q  162 aatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgtt 258  Q
    |   |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||   ||||||    
T  23282746 a---tcttagaagtgcattccctttagtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagatgattcgacaaaatacatgttgtgtt 23282650  T
Q  259 ctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataaga 315  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23282649 ctcttcattcttgtgagttttcaaagagacttgcaaacctttacgctaagtataaga 23282593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 65 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 11719306 - 11718991
Alignment:
Q  65 aaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaa 163  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||  |||| ||    
T  11719306 aaaggaatgcattccaatacattcttttgaacttaatactactgcactgccaactgacaagtttcaattgacagagaagcat-gatcaagcataaaataa 11719208  T
Q  164 tatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttct 260  Q
     ||||||||  |||||||| ||| ||  |||||||| | ||| | |||||||||| ||| ||   ||||||||||||  |||||||||||||   |||||    
T  11719207 catcttagaggtgcattcctttacgtcccactcatcttgtacaatggaattcgatttgagaattcatatagttgattttgcagaatacatgttgtgttct 11719108  T
Q  261 cttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-t 359  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11719107 cttcattcttttgagttttgaaacagacttgcaaacctttaccctaagtataagacacttcaatcccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaactt 11719008  T
Q  360 aaaatccaacaaaataa 376  Q
    ||| |||||||||||||    
T  11719007 aaattccaacaaaataa 11718991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 377
Target Start/End: Original strand, 20529375 - 20529731
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||     
T  20529375 gttctcacatcgaattccttcatataagatgagtaggaacaaaaaggaatgcattccaatatattcttttgaacttaattgtactggcatgccaactgaa 20529474  T
Q  123 aagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    |||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   | ||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||     
T  20529475 aagtttcaattgacagagaagtat-gatcaagctcaaaacaacatcttagaaatacattcttgtttgtcacactcatcttatacaaagaaattcgatgta 20529573  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaa---tacatgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggc 318  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||    |||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||||| ||| |||   |||   |||||| ||||  |    
T  20529574 aaaatctatatagttgattcggtagaaaacaacatgtgttctctcaattctttcaagttttcaaagagatttgaaaatgttta-attaagtacaagacac 20529672  T
Q  319 ttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataat 377  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  20529673 ttcaatgcaaacatcttcagcaaactaacaagaatgaaaccaaaatccaacataataat 20529731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18879064 - 18878753
Alignment:
Q  55 gtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaag 153  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  |  ||  |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||    
T  18879064 gtcatcacaaaaaagaatgcattccaagaggttgctttgaacttaatcttacggccttgccaactgacaagtttcaattgacagaggagcac-gatcaag 18878966  T
Q  154 ctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca- 252  Q
    ||||||| ||  || || |  ||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||     
T  18878965 ctcaaaaaaacctcctataggtgcattcccatccgtgacactcatcatatatgaaggaattcgatgtgaaaacctatatagcagattctgcagaatacat 18878866  T
Q  253 --tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaag 350  Q
      ||||||||||| | | || | |  ||| |||||| |||||||| |  |||  | |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18878865 gttgtgttctctt-aatattttgactttttaaagaggcttgcaaatcactacattcagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaag 18878767  T
Q  351 aattaaactaaaat 364  Q
    ||||||||| ||||    
T  18878766 aattaaacttaaat 18878753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 91 - 376
Target Start/End: Original strand, 28276586 - 28276874
Alignment:
Q  91 ttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgt 189  Q
    ||||||| |||| |||| | |||| |||||| |||||||||| || ||||||  || |||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||| |||    
T  28276586 ttgaactaaatcgtactgcgctgctaactgataagtttcaattgagagaggatcat-gatcaagctcaaaataacctcttagaggtgcattcccttctgt 28276684  T
Q  190 gacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagag 286  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||   ||||||||||| | |||| | |  ||  ||||||    
T  28276685 gacactcatcctatacgaatcaattcgatgtggtaacctatatagctaattcggcagaatacatgttgtgttctctt-aatcttttgactttccaaagag 28276783  T
Q  287 acttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataa 376  Q
     |||||||| |  |||  | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28276784 gcttgcaaatcactacattcagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataa 28276874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 37059203 - 37059057
Alignment:
Q  292 caaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataata 391  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||   |||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37059203 caaaccgttacactaagtataagacactttaatggtaacattttcaccaaacaaacaagaattaaattaaaatccaacaaaataatgacacaacataatg 37059104  T
Q  392 atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
    |||| |||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37059103 atacaaccta---atctttatctggccgaatcaaactcttgagaatatct 37059057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 193 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20529408 - 20529228
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatac---atgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagact 289  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||| || | || ||| |||||||||    
T  20529408 actcatcttatatgaaggaattcgatgtgagaacctatatagttgattcggtagaatacaaaatgtgttctctacattattttgagttttcaaagagact 20529309  T
Q  290 tgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaaca 370  Q
    || |||   |||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||  || ||||| || | ||||||||||    
T  20529308 tgtaaatttttacactaagtataagacacttcaatgccaacattttcaacaaactttcatgaatttaatttaaatccaaca 20529228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 472
Target Start/End: Original strand, 28746780 - 28747034
Alignment:
Q  225 acatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttc 321  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||   ||||||||||||||| | |  ||| |||||  || ||||| | |||| ||||||||| ||  ||||    
T  28746780 acatatatagttgatttgctagaatacatgttgtgttctcttcattctt-tgacttttcaaagaatct-gcaaatctttaccctaagtatatgacacttc 28746877  T
Q  322 aatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac--taaaatccaacaaaataatgacacaacataataata---ctacctaaacatcttcatcttg 416  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||| ||||||  |  ||| |    
T  28746878 aataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaaacttaaaatccaacaaaataaagacaccacataataatgatgctaccgaaacataattttctgg 28746977  T
Q  417 ccgaatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctc 472  Q
    | |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  28746978 cagaatcaaactgttgagaatattttcaggcgatctcagcaacgtagcttccatctc 28747034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Original strand, 5305279 - 5305394
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||| |  ||||||| || || |  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  5305279 tcacatcgaattccctcatataagacgactactcacaaaaaagaatgcatcccaatatattctttttaacttaatcttactgccttgccaactgacaagt 5305378  T
Q  127 ttcaa-tgacagagga 141  Q
    ||||| ||||||||||    
T  5305379 ttcaattgacagagga 5305394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 191 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 12763932 - 12763805
Alignment:
Q  191 acactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||   |||||||||||||||||| | |  ||| ||||||     
T  12763932 acactcatcttatacaagggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattttgtaaaatacatgttgtgttctcttcattcttttgacttttcaaagagt 12763833  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataaga 315  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||    
T  12763832 cttgcaaatctttacgctatgtataaga 12763805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 18332862 - 18332676
Alignment:
Q  307 agtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat-ccaacaaaataatgacacaacataataata---ctacctaa 402  Q
    |||||||||  |||||||  | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||    |||| |||    
T  18332862 agtataagacacttcaatatcaacatcttccgcaaactaataagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacatagtaatgatgctacataa 18332763  T
Q  403 acatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg 488  Q
    ||||  |||| | ||  |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || ||||||    
T  18332762 acataatcatgtggcataatcaaactcttcataatatcttcaggcgatctcaacaacgtagcttccatctcaatcctcggaaacatg 18332676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20988935 - 20988732
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagac 288  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| | ||||| |||   |||||||| |||||| | |  ||| |||||  |    
T  20988935 cactcatcctatacaaaggaatttgatgtgaaaacattca-agttgattcggtaaaatacttgttatgttctctttattctt-tgacttttcaaagaagc 20988838  T
Q  289 ttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacat 387  Q
    ||||||| |  ||| ||||||||||||  | ||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  20988837 ttgcaaatctataccctaagtataagacacgtcaatgcggatatagtcaacaaactaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacattacat 20988738  T
Q  388 aataat 393  Q
    ||||||    
T  20988737 aataat 20988732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 517
Target Start/End: Original strand, 26617255 - 26617592
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagac 288  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||| | |  ||| |||||  |    
T  26617255 cactcatcctataaaaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggtaaaatacatgttgtgttctcttcattctt-tgatttttcaaagaatc 26617353  T
Q  289 ttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac--taaaatccaacaaaataatgacacaaca 386  Q
    | ||||| |  ||| ||||||||||||  ||||||| || ||||  | ||||||| |||||||| ||||   |||| | ||||||||||| ||||| |||    
T  26617354 t-gcaaatctctaccctaagtataagacacttcaatcccaacataattagcaaacaaacaagaaataaaacttaaattgcaacaaaataaagacactaca 26617452  T
Q  387 taataat--actacctaaacat---cttca---tcttgccgaatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatcc 477  Q
    || ||||  |  |||||| |||   ||||    ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||   |  ||| |||||||    
T  26617453 tagtaatgaaaaacctaatcataatcttctggttctagcggaatcaaactcttaagaatatcttcaggcgatctcagcaacgtgacaaacatatcgatcc 26617552  T
Q  478 ttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
      ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  26617553 acggggacatgttgtgttgacaaaaaatcgagaacatgct 26617592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12764066 - 12763966
Alignment:
Q  85 attcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattccc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  12764066 attcttttgaacttaatcttactgctctcccaactgacaagtttcaattgacaaaggagca-tgatcaaacacaaaacaacatcttagaggtgcattccc 12763968  T
Q  184 tt 185  Q
    ||    
T  12763967 tt 12763966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 18333085 - 18332986
Alignment:
Q  82 tatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcatt 180  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||    
T  18333085 tatatttttttgaactcaatattactgccctgccaactgacaagtttcaattgacagaggagca-taatcaagcacaaaacaacatcatagaggtgcatt 18332987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18038913 - 18038814
Alignment:
Q  20 taagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaact 119  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| || |||||||  |||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  18038913 taagttctcacatcaaatttcttcatataagatgagtaataacaaaaataaatgaatttcagtatattcttttgaacataatcctactgccctgccaact 18038814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 82 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37059416 - 37059358
Alignment:
Q  82 tatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttc-aatgacagag 139  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37059416 tatattcttttgaatttaatcctactaccctgtcaactgacaagtttcaaatgacagag 37059358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Original strand, 20988973 - 20989038
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20988973 actcatcctatatgaagggatttgatgtgataacctataaagttgattcggtagaatacatgtgtt 20989038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 28276442 - 28276356
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgaca-ctcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| |||| || ||||||| |||||||||| || | |||| |||||| ||||||||||||||    
T  28276442 aatgcattcctttatgtgataactcatcttatatgagggaattcaatgtgaaaacctaaagagttaattcggtagaatacatgtgtt 28276356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 255
Target Start/End: Original strand, 31991668 - 31991734
Alignment:
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31991668 tgacactcatcttatatgaaggaattcgatatcataacttatatagttgattctgcataatacatgt 31991734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18879157 - 18879116
Alignment:
Q  91 ttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18879157 ttgaacttaatcttactgccctgccaactgacatgtttcaat 18879116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31991623 - 31991574
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  31991623 ggaattcgatgtgataacatatatagttgattttgtagaatacatgtgtt 31991574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 5305292 - 5305171
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca-----tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacg 303  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||| | | ||||||     |||||| ||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||   |||||    
T  5305292 ggaattcgatgtgataacctatatagt-gattcagtataatacaagtgttgtgttttcttcattcttttgagttttcaaagagagttgcaaatttttacg 5305194  T
Q  304 ctaagtataagaggcttcaatgc 326  Q
    ||||||||||||  |||||||||    
T  5305193 ctaagtataagacacttcaatgc 5305171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 42 - 517
Target Start/End: Original strand, 7575737 - 7576216
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagagg 140  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7575737 tcatataagatgagtggtgacaaaaaggagtgtataccaatatattcttttgaacttaatcatactgccctgccaactgacaagtttcaattgacagagg 7575836  T
Q  141 agaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    || || |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |     || |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7575837 agcat-gatcaagcacaaaacaacatcttaaaaatgcattcccgttcaacacgctcatcttatgcgaaggaattcgatgtgagaacctatatagttgatt 7575935  T
Q  241 cggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttca 337  Q
     | || |||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||||||| | | ||  |||    
T  7575936 tgacaaaatacatgttgtgttctcttcattcttgtgagttttgaaagagacttgcaaacctttacactaagtataacacacttcaatgtcaatattgtca 7576035  T
Q  338 gcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaat 437  Q
     ||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  7576036 acaaactaccacaaattaaacttaattccaacaaaataaagacgctgcataataatactacctaaacatcttcatatggccgaattaaactcttgagaat 7576135  T
Q  438 atc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
    ||| | ||| ||||| |  || | || || |||||||||| | | ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||    
T  7576136 atctttaggtgatctaagtaacgaagtatacatctcgatcgtcgagaacatgttatgctaaccaaatatcgagaacatgct 7576216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 69 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 37397250 - 37396775
Alignment:
Q  69 gaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaatga-cagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatc 167  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||| || || |||||||||||||||||| | |||| ||| ||  |||||||||||||||| |||    
T  37397250 gaatgcattccaatatattcttttaaaattaatcatactgccatgtcaactgacaagtttcaattaacagatgagcat--atcaagctcaaaacaacatc 37397153  T
Q  168 ttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttc 264  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||| ||||   |||||||||    
T  37397152 ttataaatgcattcctgtttgtgacactcatcttataccaaagagttcgatgtgagaacctatatagttgattcaacaaaataaatgttatgttctcttc 37397053  T
Q  265 attcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat 364  Q
    |||||||| |  ||||||| | |  |||| ||| |||  ||||||||||||  ||| ||| || |||   ||| || |||| || |||||||||| || |    
T  37397052 attcttgtgaattttgaaacatatatgcacacctttatactaagtataagacactttaatcccaacactctcaacagactaccatgaattaaacttaatt 37396953  T
Q  365 ccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtaga 463  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||     
T  37396952 ccaaccaaataaagacactacataataatactacctaaacatctttatctagccgaatcaaactcttgagaatatcttcaggtgatctcagcaacgtagc 37396853  T
Q  464 atccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgcacgtcgtcattgttcgttaa 541  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | | ||||||||| | |||||||||    
T  37396852 atccatctcgatcgttgggaacatgttgtgctgaccaaatatcgagaacatgatattcacgtcgtcctcgttcgttaa 37396775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 23 - 441
Target Start/End: Original strand, 26604222 - 26604651
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  ||||||    ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||    
T  26604222 gttctcacatcgaattccttcatataatatgagtatgaacataaaggaatgcattctaatatattcttttgaacttaatcatattgctctgccaactgac 26604321  T
Q  123 aagtttcaat-gacaga----ggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcga 217  Q
    |||||||||| ||||||    |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||    
T  26604322 aagtttcaattgacagatctaggagcat-gatccagctcaaaacaacatcttagaaatgcattgccttatgtcccactctttttatacgaatgaattcga 26604420  T
Q  218 tgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataag 314  Q
    | ||| ||||| |||||||||||| | | ||||||   |||||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  26604421 tttgagaacatgtatagttgattcagtataatacaaaatgtgttctcttcattcttttgagttttcaaagagacttacaaaccattacactaagtataag 26604520  T
Q  315 aggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaa-----acatctt 409  Q
    |  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||     |||||||    
T  26604521 acacttcattgcaaacatcttcagcaaactaacaagaactaaactaaaattcaaaaaaataatgacacaacataat-atacaacctaaacatcacatctt 26604619  T
Q  410 catcttgccgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  26604620 catctggacgaatcaaactcttgaaaatatct 26604651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 493
Target Start/End: Original strand, 16417715 - 16418197
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||||| | |||| | ||||||||    
T  16417715 ataagttctcacatcgaattccctcatataagatgagtcatgacaaaaaggaatgcgttccaatacattcttttaaacttaagcctactgctctgccaac 16417814  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |  || ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16417815 tgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagcacaaaacaacatcttagaaatgcattcacgttcgtcacactcatcttatacgaaggaattcaa 16417913  T
Q  218 tgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataag 314  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||| || | ||||||   |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||    
T  16417914 tgtaaaaacctatatagttaatttggtaaaatacatgttgtgttctcttcattcttttgagttttcaaagagacttgcaaacttttacactaactataag 16418013  T
Q  315 aggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa-ctaaaatccaacaaaataatgaca---caacataataatactacctaaacatcttc 410  Q
    |  ||| ||| || ||||  ||| ||||||  || ||||||||  |||| || |||||||||||||||   ||  ||||| || || |||||||||  ||    
T  16418014 acactttaataccaacattgtcaacaaacttccatgaattaaatttaaattcaaacaaaataatgacattgcataataatgatgctccctaaacataatc 16418113  T
Q  411 atcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtg 493  Q
     ||| || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16418114 ttctggcagagtcaaactcttgagaatatcttcaggtgatctcagcaatgtaacatccatctcaatcctcgggaacatgttgtg 16418197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 31488528 - 31488146
Alignment:
Q  65 aaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaa 163  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  31488528 aaaggaatgcattccaacacattcttttgaacttaatcctactgcactgccaactaacaagtttcaattgacagagaagcat-gatcaagcacaaaacaa 31488430  T
Q  164 tatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttct 260  Q
     ||||||||  |||| |||||||||| |||| | || ||||| | | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||||| |    
T  31488429 catcttagaggtgcactcccttatgtcacacacttcttatacaaggaaattcaacgtgaaaacatatatagttgtttcggtaaaatacatgttgtgttat 31488330  T
Q  261 cttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-t 359  Q
    ||||||| || | |  ||| ||| |  |||| ||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31488329 cttcattatt-tgacttttcaaaaattcttgtaaatctttacactaagtataagacactttaatgccgacatattcagcaaactaacaagaattaaactt 31488231  T
Q  360 aaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
    ||| | ||||||||||| ||||  | ||||||   || ||||||||||||  || ||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  31488230 aaatttcaacaaaataaagacattaaataataatcatgctacctaaacataatcttctggtagaatcaaactcttaagaatatct 31488146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 10976360 - 10975925
Alignment:
Q  61 acaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaa 159  Q
    ||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||| |||| | ||| || |||||||| ||||    
T  10976360 acaaaaaggaatgtatttcaatatattcttttgaacttaattctactgcactgccaactaacaagtttcaattgacatatgagcat-gatcaagcacaaa 10976262  T
Q  160 acaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtg 256  Q
    | || ||||||||  | |||| ||||  || ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||   ||||    
T  10976261 ataacatcttagaggtacatttcctttcgtcacactcatcttatacaagggaattcgatgcgaaaacatatatagttgatttggtaaaatacaagttgtg 10976162  T
Q  257 ttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaa 356  Q
    |||||||||||||| | |  ||| ||||     |||||| | |||||||||||||||||   || |||  | ||||||||||||||||  || |||||||    
T  10976161 ttctcttcattcttttgacttttcaaaggatgctgcaaatctttacgctaagtataagacattttaataacaacatcttcagcaaactttcatgaattaa 10976062  T
Q  357 ac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatat-ctcaggcgatct 451  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   ||  ||| |||||||  || | | || |||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  10976061 acttaaattccaacaaaataaagacactacataataatgatgttacataaacataatcttgtggcagaatcaaactcttgagaatatattcagacgatct 10975962  T
Q  452 caacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg 488  Q
    || |||  |||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  10975961 cagcaacatagcttccatctcaatcctcgggaacatg 10975925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 192 - 544
Target Start/End: Complemental strand, 19748485 - 19748127
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagac 288  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||   |||| |||||||||| | || |||  || ||||    
T  19748485 cactcatcttatacaagggaattcgatgtgaaaacctatatagctgattttgcagaatacatgttgtgttc-cttcattcttttgagtttttgaacagac 19748387  T
Q  289 ttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa-ctaaaatccaacaaaataatgacacaacat 387  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||||    
T  19748386 ttgcaaacctttaccctaagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaagttaaattccaacaaaataaagacaatacat 19748287  T
Q  388 aataat---actacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttggga 483  Q
    ||||||    |||||||| |||  || | | || |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||  || |    
T  19748286 aataatgacgctacctaatcataatcttatggcggaatcaaattgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaacgtacaa-acatatcgatccacggaa 19748188  T
Q  484 acatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgcacgtcgtcattgttcgttaattc 544  Q
    |||||||||| || | ||| || |||| |||| | | ||||||||| | ||||||||||||    
T  19748187 acatgttgtgctgccaaaaaatggagaacatgttcttcacgtcgtcgtcgttcgttaattc 19748127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 82 - 394
Target Start/End: Original strand, 11477578 - 11477892
Alignment:
Q  82 tatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcatt 180  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  11477578 tatattcttttgaacttaattctactgctctgccaactaacaagtttcaattgacagaggagcat-gataaaactcaaaacaacatcttagaaatgcatt 11477676  T
Q  181 cccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagct 277  Q
    |   | ||| ||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||| |||||||| |  |||||||   ||||||||||  ||||||   || |    
T  11477677 catgtttgtcacacttatcttatacgaatgaattcaatgtgagaatctatatcgttgattcagtggaatacaacatgtgttctctcaattctttcgagtt 11477776  T
Q  278 ttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataat 377  Q
    || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||   ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||| || |||||||||||||     
T  11477777 ttcaaggagacttgcaaacctttacactaagtatatgacaattcaatgccaacattctcagcaaactaccatgaattcaacttaattccaacaaaataa- 11477875  T
Q  378 gacacaacataataata 394  Q
     ||||||||||||||||    
T  11477876 aacacaacataataata 11477892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 175 - 382
Target Start/End: Original strand, 25360247 - 25360458
Alignment:
Q  175 tgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattcttg 271  Q
    ||||||||||||  |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||   |||||||||||||||     
T  25360247 tgcattcccttacatcccactcatcttatacaagggaattcgatgtgaaaacctatatagatgattttgcagaatacatgttgtgttctcttcattcttt 25360346  T
Q  272 taagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaa-ttaaactaaaatccaaca 370  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  25360347 tgagttttcaaacagacttgcaaacttttaccctatgtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaatttaatttaaattccaaca 25360446  T
Q  371 aaataatgacac 382  Q
     ||||| |||||    
T  25360447 gaataaggacac 25360458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34595805 - 34595584
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccct-gccaa 117  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| || | |||| | |||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||  | | |||||    
T  34595805 ataagttttcacatcgaattccttcatataagatgagtaatgataaaa-gtaatgtattccaatatattattttgaacttaatcatacttgcattgccaa 34595707  T
Q  118 ctgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcg 216  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  34595706 ctgacaagtttcaattgacaaaggagcat-gatcaagcacaaaacaacatcttagaggtgcattccctttcgtcacactcatcttatacaaaggaatttg 34595608  T
Q  217 atgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  34595607 ttgtgaaaacctatatagttgatt 34595584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 23228373 - 23228538
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatg 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||  |    
T  23228373 tttgaacttaatcttactgccctaccaactcacaagtttcaattgacagaggagcat-gatcaagctcaaaagaacctcttagaggtgcattcccttccg 23228471  T
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23228472 ggacactcattctatacgaaggaattcgatatgagaatttatatagttgatttgatagaatacatgt 23228538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19575726 - 19575564
Alignment:
Q  25 tctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaa 124  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||    
T  19575726 tctcacatcaaattcattcatataagatgagtaaggacataaaggaatgcattcaaatatattcttttgaacttaatcctattactctgtcaactgataa 19575627  T
Q  125 gtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttat 187  Q
    ||||||| |||||  ||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  19575626 gtttcaattgacaatgga-atatgatcaagctcaaaacaacatctaagaaatgcattcccttat 19575564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 28718587 - 28718215
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatg 188  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  28718587 tttgaattgaatcttactgccctgccaactgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagtataaaacaacatcttagaggtgcattcccttatg 28718489  T
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaaga 285  Q
    |  |||||||  |||||||||||||  ||||  ||||  | || |    ||| || |||||   |||| |||| | | ||||||| | |  ||| ||| |    
T  28718488 tcccactcattttatacgaaggaatctgatgaaaaaatttgtaca-accattaggtagaatacaacatatgttttatccattcttttgacttttcaaata 28718390  T
Q  286 gacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa--ctaaaatccaacaaaataatgacaca 383  Q
    | |||||||| | | ||  | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||     
T  28718389 ggcttgcaaatcttcacattcagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaaacttaaattccaacaaaataaaaacact 28718290  T
Q  384 acataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaa 454  Q
    ||||||||   || ||||||||||||  |  ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28718289 acataataatgatgctacctaaacataattttctggcataatcaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcaa 28718215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 15797777 - 15797917
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||||  ||||| |||||||||||| |||  |  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15797777 ataaattctcacatcgaattccctcatataaaatgagtattcacacaaaggaatgcattccaagaggttgctttgaacttaatcttactgccctgccaac 15797876  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaa 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  15797877 tgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagttcaaa 15797917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11477552 - 11477396
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca-----tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||     |||||||||||||||||| | || ||| |||||||    
T  11477552 actcatcttatacgaatgaattcaatgtgagaacctatattgttgattcggtagaatacatgtgatgtgttctcttcattcttttgagttttcaaagaga 11477453  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaact 344  Q
    || |||||   |||| |||||||||| |  |||||||||| |||| ||| |||||||    
T  11477452 ctggcaaatttttacactaagtataacacacttcaatgccaacattttcggcaaact 11477396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 255
Target Start/End: Original strand, 36311528 - 36311749
Alignment:
Q  29 acatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagttt 128  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||  |  ||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36311528 acatcgaattccttcatataagatgagtcatcacataaaggaaagcattccaagaggttgctttgagtttaatcttactgccctgccaactgacaagttt 36311627  T
Q  129 caa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaaca 227  Q
    ||| ||||||||||| |  |||||| ||||||  ||  |||||||  || ||||     ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||     
T  36311628 caattgacagaggagca-cgatcaaactcaaaggaacctcttagaggtgaattc-----tgtgacactaatcttatacgaaggaatttgatatcataact 36311721  T
Q  228 tatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||  |||||  |||||||||||||    
T  36311722 tatataactgattatgcagaatacatgt 36311749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26604302 - 26604113
Alignment:
Q  146 tgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtg-acactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggc 244  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||  | ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||     
T  26604302 tgattaagttcaaaagaatatattagaa-tgcattcctttatgttcatactcatattatatgaaggaattcgatgtgagaacatttataattgatttggt 26604204  T
Q  245 agaatac---atgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacat 332  Q
    |||||||   |||||||||||| ||| || | || ||| |||||||||||||||   ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26604203 agaatacaaaatgtgttctcttaattgttttgagttttcaaagagacttgcaaatttttacattaagtataagacacttcaatgccaacat 26604113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 544
Target Start/End: Original strand, 15798007 - 15798228
Alignment:
Q  329 acatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaa--tccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatc 423  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||  ||||||||   || |||||||| |||  || | | || |||||    
T  15798007 acatcttcaacaaactaacaagaattaaacttaaatttctaacaaaataaagacaatacataataacgatgctacctaatcataatcttttggcggaatc 15798106  T
Q  424 aaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgctttgca 522  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| ||   |  ||| || ||||  || ||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||   ||    
T  15798107 aaactgttgagaatatcttcaggcaatctcatcaacgtgacaaacatatcaatccacggaaacatgttgtgctgccaaaaaatcgagaacatgctcctca 15798206  T
Q  523 cgtcgtcattgttcgttaattc 544  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  15798207 cgtcgtcatcgttcgttaattc 15798228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 368
Target Start/End: Original strand, 19748523 - 19748701
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt---ctcttcattcttgtaagctttgaaagagact 289  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||| ||||  ||||||| |||||  | ||||||||||||||   |||||||||||| | || ||| ||| |||||    
T  19748523 actcatcttatatgagggaatttgatgtaaaaatctatatagatgattttgtagaatacatgtgttgttctcttcattcttttgagttttcaaacagact 19748622  T
Q  290 tgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaa 368  Q
    ||||||   |||| ||||||||| ||  |||||||||| |||| ||| | |||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  19748623 tgcaaatttttacactaagtatacgacacttcaatgccaacattttcggaaaactttcaagaattaaatttaaatccaa 19748701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16417752 - 16417625
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg-----tgttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||     |||||||||||||||| | || ||| ||||||     
T  16417752 actcatcttatatgagggaattcgatgtgagaacttatattgttgatttggtagaatacatgtgttgtgttctcttcattcttttgagtttttaaagagg 16417653  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataaga 315  Q
    ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  16417652 cttgcaaatttttacactaagtataaga 16417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 457
Target Start/End: Original strand, 23228598 - 23228731
Alignment:
Q  329 acatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaaca---taataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatca 424  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||   ||||||| |||||||| |||  |  ||| || ||||||    
T  23228598 acatcttcagcaaacaaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacactacatattaataatgctacctaatcataattttctagcggaatca 23228697  T
Q  425 aactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaa 457  Q
    |||| || |||||||| ||| | |||||||||||    
T  23228698 aactgttcagaatatcttcaagtgatctcaacaa 23228731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 252
Target Start/End: Original strand, 34595768 - 34595827
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca 252  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  34595768 actcatcttatatgaaggaattcgatgtgaaaacttatatagttgatttggtagaataca 34595827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 36311576 - 36311490
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    ||||| |||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  36311576 aatgctttcctttatgtgatgactcatcttatatgaaggaattcgatgtcataacatatatagttgattttgtagaatacatgtgtt 36311490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6998671 - 6998515
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt-----ctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||     |||||||||||| | || ||| ||| ||     
T  6998671 actcatcttatatgatggagttcgatgtgaaaacctataaagttgatttggtagaatacatgtgttatgtgctcttcattcttttgagttttcaaatagt 6998572  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaact 344  Q
    ||||||||   ||||  |||||||||||  ||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  6998571 cttgcaaatttttactataagtataagacacttcaatgccagcattttcggcaaact 6998515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Original strand, 8531809 - 8531917
Alignment:
Q  24 ttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgaca 123  Q
    |||||||||||||| |  || ||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||  |||| || ||||||    
T  8531809 ttctcacatcgaattccctcgtatacaatgagtaatcacacaaagaaatgcatcccaacatattgctttgaacttaattttactgtcctgtcacctgaca 8531908  T
Q  124 agtttcaat 132  Q
    |||||||||    
T  8531909 agtttcaat 8531917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 393
Target Start/End: Original strand, 22858233 - 22858288
Alignment:
Q  338 gcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  22858233 gcaaactaacaagaattaaacttaaattcaacaaaataaagacaatacataataat 22858288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 224 - 332
Target Start/End: Original strand, 37397294 - 37397405
Alignment:
Q  224 aacatatatagttgattcggcagaatacatgtg---ttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggctt 320  Q
    ||||| |||| |||||| || ||||||||||||   ||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||  |||    
T  37397294 aacatgtataattgatttggtagaatacatgtggtgttctctttattcttttgagttttgaaagagacttgcaaatttttaaactaagtataagacactt 37397393  T
Q  321 caatgccgacat 332  Q
    ||||||| ||||    
T  37397394 caatgccaacat 37397405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 255
Target Start/End: Original strand, 31238526 - 31238570
Alignment:
Q  211 aattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31238526 aattcgatgtgaaaacctataaagttgattcggtagaatacatgt 31238570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 7575752 - 7575647
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgttctct--tcattcttgtaagctttgaaagagact 289  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||  | || || |||||||| || || |||||||||||||| | |  |||||||| | || |||||||||||||    
T  7575752 cactcatcttatatgagggaattcgatgctagaaaatgtatagttggtttggtagaatacatgtgttgtgttctcattcttttgagttttgaaagagact 7575653  T
Q  290 tgcaaa 295  Q
    ||||||    
T  7575652 tgcaaa 7575647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25360208 - 25360048
Alignment:
Q  211 aattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt---ctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaa 307  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||  | | ||||||||||||   ||||||||| || | |  ||| ||| |||||||||||   |||| ||||    
T  25360208 aattcgttgtgaaaacctatatagatgattttgtataatacatgtgttgttctcttcattgttttgaattttcaaacagacttgcaaatttttacactaa 25360109  T
Q  308 gtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaa 368  Q
     |||| ||  |||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  25360108 atatacgacacttcaatgccaacattttcggcaaactttcaagaattaaatttaaatccaa 25360048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10398443 - 10398390
Alignment:
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattc 241  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  10398443 gtgacactcatcttatatgaaggaattcgatatcataacttatatagttgattc 10398390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 381
Target Start/End: Original strand, 13130905 - 13130958
Alignment:
Q  329 acatcttcagcaaactaacaagaa-ttaaactaaaatccaacaaaataatgaca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  13130905 acatcttcagcaaactaacaagaatttaatttaaactccaacaaaataaagaca 13130958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 393
Target Start/End: Original strand, 12067522 - 12067613
Alignment:
Q  304 ctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa--ctaaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    ||||||||||||  ||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  12067522 ctaagtataagacacttcaatactgacactgtcaacaaactaacaagaattaaaacgtaaattccaacaaaataaagacactacatattaat 12067613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 255
Target Start/End: Original strand, 13130817 - 13130885
Alignment:
Q  187 tgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13130817 tgtgacactaatcttatatgaaggaatttgatatcataacttatatagttgattctgcataatacatgt 13130885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 4e-86; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24560400 - 24560030
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  24560400 tcacattgaaccccttcatataggatgagtcaccacataaaggaatgtatcccaatatattcttttgtacttaatcttactgccctaccaactaacaagt 24560301  T
Q  127 ttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaa 225  Q
    ||||| |||||| |||| | ||||||| | |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24560300 ttcaattgacagcggagca-tgatcaaacacaaaacaacaccttagaagtgcattcccttctgtgacgctcatcctataaaaaggaattcgatgtgaaaa 24560202  T
Q  226 catatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttca 322  Q
    | ||||||||||||| || | ||||||   |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||    
T  24560201 cctatatagttgatttggtaaaatacatgttgtgttctcttcattcttttgagttttgaaaaagacttgcaaacctttatcctaagtataagacacttca 24560102  T
Q  323 atgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa-ctaaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  24560101 ataccaacatattcagcaaactaacaagaattaaatttaaattccaacaaaataaagacactgcataataat 24560030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 19243364 - 19242924
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagagg 140  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  19243364 tcatataagatgagtcatgacaaaaaggaatgcattccaatacattcttttgaccttaatcctactgccctgccaattgacaagtttcaattgacagatg 19243265  T
Q  141 agaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    || | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | | ||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  19243264 agca-tgatcaagcacaaaacaacatcttagaaatgcattttcgtttgtcacattcatcttatacgaaggaattgaatgtgaaaacctatataattgatt 19243166  T
Q  241 cggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttca 337  Q
     || | ||||||   ||||||||||| |||||| | || ||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||| ||| ||  |||  | |    
T  19243165 tggtaaaatacatgttgtgttctctttattcttttgagttttcaaatagtcttgcaaacctttacactaagtatatgacactttaataccatcattctta 19243066  T
Q  338 gcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaa 436  Q
    |||||||  || | ||||||| |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||  |||||| ||  ||| ||| | |||||||    
T  19243065 gcaaacttccatggattaaacttaaattccaacaaaataaagacaatacataataatgatacctaaacataatcatctggcataattaaagttttgagaa 19242966  T
Q  437 tatctca-ggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatcc 477  Q
    ||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19242965 tatcttatggtaatctcaacaatgtagcatccatctcaatcc 19242924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20244775 - 20244538
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||   |||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  20244775 ataagttcttacatcgaattccctcatataaattgagtcacgacaaaaaggaatgcatttcaatacattcttttgaacttaatcctacaaccctgccaat 20244676  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattccc-ttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcg 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  20244675 tgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagcacaaaacaaaatcttagagttgcattccctttttgtgacactcatcttatacgaaggactttg 20244577  T
Q  217 atgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20244576 gtgtgaaaacatatacagttgattcggcagaatacatgt 20244538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22138759 - 22138522
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    ||||||||| ||||||||| |  |||||||   |||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  22138759 ataagttcttacatcgaattccctcatataaattgagtcacgacaaaaaggaatgcatttcaatacattcttttgaacttaatcctacaaccctgccaat 22138660  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattccc-ttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcg 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  22138659 tgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagcacaaaacaaaatcttagagttgcattccctttttgtgacactcatcttatacgaaggactttg 22138561  T
Q  217 atgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22138560 gtgtgaaaacatatacagttgattcggcagaatacatgt 22138522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Original strand, 22962057 - 22962483
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||  | ||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  22962057 gttctcacatcgaattctctcatataagatgagtagtgacaaacacgaatgctttccaatatatttttttgaacttaatcctactgccctgccaactaac 22962156  T
Q  123 aagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    ||||||||| | | ||||||| | ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |  || | ||||||| ||||  || |||||||||||     
T  22962157 aagtttcaattaatagaggagta-tgagcatgctcaaaacaacagattagaaatgcattcccgttagtcaaactcatcttatataaaagaattcgatgtt 22962255  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggc 318  Q
    | |||||||||| |||| |  | |||||   ||||||||||| | |||||||   || ||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  22962256 agaacatatataattgactttgtagaatacaacatgtgttctttccattctttcgagttttcaaaacgacttgcaaacctttacactaagtataagacac 22962355  T
Q  319 ttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataa----------taatactacctaaacatct 408  Q
    || |||||  ||||||||| |||| || || |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||          |||||| ||||||||||||    
T  22962356 tttaatgcaaacatcttcaacaaaataccatgaattaaacttaattccaacaaaata--gacacaacataataatacaatttaatacaacctaaacatct 22962453  T
Q  409 tcatcttgccgaatcaaactcttgagaata 438  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22962454 tcatctagccgaatcaaaatcttgagaata 22962483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23826336 - 23825910
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||  | ||||| | |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  23826336 gttctcacatcgaattctctcatataagatgagtagtgacaaacacgaatgctttccaatatatttttttgaacttaatcctactgccctgccaactaac 23826237  T
Q  123 aagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    ||||||||| | | ||||||| | ||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |  || | ||||||| ||||  || |||||||||||     
T  23826236 aagtttcaattaatagaggagta-tgagcatgctcaaaacaacagattagaaatgcattcccgttagtcaaactcatcttatataaaagaattcgatgtt 23826138  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggc 318  Q
    | |||||||||| |||| |  | |||||   ||||||||||| | |||||||   || ||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  23826137 agaacatatataattgactttgtagaatacaacatgtgttctttccattctttcgagttttcaaaacgacttgcaaacctttacactaagtataagacac 23826038  T
Q  319 ttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataa----------taatactacctaaacatct 408  Q
    || |||||  ||||||||| |||| || || |||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||          |||||| ||||||||||||    
T  23826037 tttaatgcaaacatcttcaacaaaataccatgaattaaacttaattccaacaaaata--gacacaacataataatacaatttaatacaacctaaacatct 23825940  T
Q  409 tcatcttgccgaatcaaactcttgagaata 438  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23825939 tcatctagccgaatcaaaatcttgagaata 23825910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 2402663 - 2402414
Alignment:
Q  146 tgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggca 245  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||  |||||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||    
T  2402663 tgatcaagcacaaaacaacatcttagaggtgcattcccttacgtctcactcatcttatacaaggaaattcgatgtgaaaacctatatagctgattttgca 2402564  T
Q  246 gaatacatgt---gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaa 342  Q
     ||| |||||   ||||||||||||||||  || ||| ||| ||||||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  2402563 taatgcatgttgtgttctcttcattcttg--agttttcaaacagacttgcagacttttaccctaagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaa 2402466  T
Q  343 ctaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||  ||||||||||    
T  2402465 ctaacaagaattaaacttaaattccaacaaagcaaagacaatacataataat 2402414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8711407 - 8711002
Alignment:
Q  89 ttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttat 187  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8711407 ttttgaacttaatcttactgccctgtcaactgacaaatttcaattgacagaggagcat-gatcaagtacaaaacaatatcttagaggtacattcccttat 8711309  T
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatac---atgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaag 284  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||   |||  ||||  | || |    ||| || |||||||   || |||| | |  |||||| | |  ||| |||     
T  8711308 gtcacactcatcttatatgaaggaatctaatgaaaaaatttgtaca-accattaggtagaatacaatatatgttttatctattcttttgacttttcaaat 8711210  T
Q  285 agacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacaca 383  Q
    || |||||||| ||||||  | |||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||     
T  8711209 aggcttgcaaatccttacattcagtataagacacttcaataccaacatcttccgcaaattaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataa-gacact 8711111  T
Q  384 acataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatcctt 479  Q
    ||||||||   || ||||||||||||  || | | |  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||  |||||||| |||||     
T  8711110 acataataatgatgctacctaaacataatcttatggtagaatcaaactcttgagaatatctttaggcaatctcagcaatgtagcttccatctcaatcctc 8711011  T
Q  480 gggaacatg 488  Q
    |||||||||    
T  8711010 gggaacatg 8711002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 329 - 515
Target Start/End: Original strand, 23607878 - 23608066
Alignment:
Q  329 acatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaact 428  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  23607878 acatctttagcaaactaataagaattaaactaaaatccaataaaagaacgacattacataataatactatctaaacttcttcatctggctaaatcaaact 23607977  T
Q  429 cttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg-ttgtgttgaccaaatatcgagagcatg 515  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||| | || |||||||| |||  |  |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  23607978 cttgagaatatcttcaggtgatctctgcaacgaagcatccatctagattgtcaggaacatgtttgttttgaccaaatgtcgagaacatg 23608066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 165 - 376
Target Start/End: Original strand, 21864657 - 21864869
Alignment:
Q  165 atcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatg--tgttctct 262  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |  ||||||||||  ||||||||    
T  21864657 atcttagaggtgctttcccttatgtgacatttatcttatacgaaggaattcgatgtgaaaacctataaacttgatttgctagaatacatgtttgttctct 21864756  T
Q  263 tcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taa 361  Q
    |||||||| | |  ||| ||||| |  |||||| |  ||| ||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21864757 tcattctt-tgacttttcaaaga-atctgcaaatctctaccctaagtatacgacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaacttaa 21864854  T
Q  362 aatccaacaaaataa 376  Q
    | |||||||||||||    
T  21864855 attccaacaaaataa 21864869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 488
Target Start/End: Original strand, 5972935 - 5973120
Alignment:
Q  307 agtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat-ccaacaaaataatgacacaacataataata---ctacctaa 402  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||    
T  5972935 agtataagacacttcaataccaacatcttccgcaaattaacaagaattaaacttaaattccaacaaaataa-gacactacataataatgatgctacctaa 5973033  T
Q  403 acatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg 488  Q
    ||||  || | | |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  5973034 acataatcttatggtagaatcaaactcttgagaatatcttcaggcgatctcagcaatgtagcttccatctcaatcctcgggaacatg 5973120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33200939 - 33200822
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagagg 140  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33200939 tcatataagatgagtcatcacataaaggaatgcatgccaagaggttgctttgaacttaatcttactgccctgccaactgacaagtttcaattgacagagg 33200840  T
Q  141 agaattgatcaagctcaaa 159  Q
    || | ||||||||||||||    
T  33200839 agta-tgatcaagctcaaa 33200822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33200669 - 33200341
Alignment:
Q  56 tcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagc 154  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||  |  ||| |||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| |    
T  33200669 tcatcacataaagtaatgcattccaagaggttcatttgagtttaatcttattgccatgccaactgacaagtttcaattgacagaggagcac-gatcaaac 33200571  T
Q  155 tcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg-aaaacatatatagttgattcggcagaataca- 252  Q
    |||||| ||  |||||||  ||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||     
T  33200570 tcaaaaaaacctcttagaggtgctttcccttcggtgacactcctcttatacgaaggaattcgaagtgaaaaacttataaagttgatatggtagaatacat 33200471  T
Q  253 --tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaag 350  Q
      |||||||| || | |||| | |  ||| | |||| |||||||| |  |||  | |||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||| |||    
T  33200470 gttgtgttctatt-aatcttttgactttttagagaggcttgcaaatcgctacattcagtataagacacttcaatagcaacatcttcagcaaactaataag 33200372  T
Q  351 aattaaactaaaatccaacaaaataatgaca 381  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  33200371 aattaacttaaactccaacaaaataaagaca 33200341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 14095942 - 14095729
Alignment:
Q  307 agtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaa-caaaataatgacacaacataataata---ctacctaa 402  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||    ||||||||    
T  14095942 agtataagacacttcaataccaacatcttccacaaactaacaagaattaaacttaaattcaaacaaaataaagacattacataataatgatgctacctaa 14095843  T
Q  403 acatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatct-caggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaa 501  Q
    ||||  || | | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||  |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |     
T  14095842 acataatcttgtggcataatcaaactcttgagaatatctacaggcgatctcagcaacgaagcttccatctcaatcctcgggaacatgtggtgctgacgat 14095743  T
Q  502 atatcgagagcatg 515  Q
    |||| |||| ||||    
T  14095742 atatggagaacatg 14095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 453
Target Start/End: Original strand, 3097284 - 3097568
Alignment:
Q  175 tgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttg 271  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |  ||||| ||   ||| ||||||||||||||     
T  3097284 tgcattcccatatgtaacagtcattctatacgaaggaattcgatgtgaaaccctataaagttgatttgctagaatgcatgttgtattctcttcattctt- 3097382  T
Q  272 taagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa-ctaaaatccaaca 370  Q
    | |  ||| ||||| |  |||||| |  ||| ||||||||| ||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  3097383 tgacttttcaaaga-atctgcaaatctctaccctaagtatacgacacttcaatatcaacatcttcagcaaactaacaagaattaaatttaaattccaaca 3097481  T
Q  371 aaataatgac---acaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctca 453  Q
    |||||| |||   |||   |||| || ||||||||||||  |  ||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3097482 aaataaagactgtacatattaatgatgctacctaaacataattttctagcagaatcaaactgttgagaatatcttcaggcgatctca 3097568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 305 - 393
Target Start/End: Original strand, 18743878 - 18743967
Alignment:
Q  305 taagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    ||||||||| |  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  18743878 taagtataaaacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaacttaaattccaagaaaataaagacactacataataat 18743967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 132
Target Start/End: Original strand, 21864382 - 21864495
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    |||| ||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||   ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21864382 ataaattctcacatcgaattacctcatataagatgagtcatcacataaaggaatgcattccaagaggttgcgttgaacttaatcttactgccctaccaac 21864481  T
Q  119 tgacaagtttcaat 132  Q
    ||||||||||||||    
T  21864482 tgacaagtttcaat 21864495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 30764573 - 30764713
Alignment:
Q  19 ataagttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaac 118  Q
    |||| ||||||||| |||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||  ||||||| |||||||  | |||| |||||    
T  30764573 ataaattctcacatagaattccctcatatacggtgagtcatcacaaaaaggaatgcattccaacaagttgctttgaacctaatcttgtttccctaccaac 30764672  T
Q  119 tgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaa 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30764673 tgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagctcaaa 30764713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20244521 - 20244410
Alignment:
Q  253 tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaa 352  Q
    ||||||||||||||||||   || ||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||| ||||||||||| ||    
T  20244521 tgtgttctcttcattcttacgagtttccaaagagacgtgaaaacctttacgctaagtataagagactttaataccaacattttcaacaaactaacaataa 20244422  T
Q  353 ttaaactaaaat 364  Q
    ||||||| ||||    
T  20244421 ttaaacttaaat 20244410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22138505 - 22138394
Alignment:
Q  253 tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaa 352  Q
    ||||||||||||||||||   || ||  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||| ||||||||||| ||    
T  22138505 tgtgttctcttcattcttacgagtttccaaagagacgtgaaaacctttacgctaagtataagagactttaataccaacattttcaacaaactaacaataa 22138406  T
Q  353 ttaaactaaaat 364  Q
    ||||||| ||||    
T  22138405 ttaaacttaaat 22138394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 252
Target Start/End: Original strand, 23607794 - 23607855
Alignment:
Q  191 acactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca 252  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23607794 acactcatcttatatgaaggaattcgatgtgaaaacctatatagttgattcagtagaataca 23607855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14482598 - 14482544
Alignment:
Q  201 tatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14482598 tatatgaagaaattcgatgtgaaaacatatatagttgattctgcataatacatgt 14482544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 5972743 - 5972839
Alignment:
Q  117 actgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaat 213  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  5972743 actgacaaatttcaattgacagaagagcat-gatcaagtacaaaacaatatcttagaggtgcattcccttatgtcacactcatcttatataaaggaat 5972839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Original strand, 30764866 - 30764933
Alignment:
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||  | |||||||||||    
T  30764866 gtgacactcatcctatacaaaggaattagatgtgaaaacctatatagctaattatggagaatacatgt 30764933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 381
Target Start/End: Original strand, 30764987 - 30765062
Alignment:
Q  307 agtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaa-ttaaactaaaatccaacaaaataatgaca 381  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  30764987 agtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaatttaatttaaattccaacaaaataaagaca 30765062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 382
Target Start/End: Original strand, 17465145 - 17465221
Alignment:
Q  307 agtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaatt-aaactaaaatccaacaaaataatgacac 382  Q
    |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  17465145 agtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactaataagaattgaatttaaattccaacaaaataaagacac 17465221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 230
Target Start/End: Original strand, 18743691 - 18743802
Alignment:
Q  119 tgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcga 217  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||  ||||||||| | |||||||||  || ||||||||  ||||| | |||||||||    
T  18743691 tgacaattttcaattgacagaggagcat-gatcaaacacaaaacagcatcttagaagtacattccctttcgtcacactcattttatacaagggaattcga 18743789  T
Q  218 tgtgaaaacatat 230  Q
    ||||||| |||||    
T  18743790 tgtgaaatcatat 18743802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 14096153 - 14096110
Alignment:
Q  89 ttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat 132  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14096153 ttttgaatttaatcttactgcccagccaactgacaagtttcaat 14096110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Original strand, 17465024 - 17465091
Alignment:
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  17465024 gtgacactcatcttatatgaaggaattcgatatcataacttatataggtgattctgcataatacatgt 17465091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 255
Target Start/End: Original strand, 14482635 - 14482701
Alignment:
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  14482635 tgacactcatcttatatgaaggaattcgatatcataacttatatagctgatttggcataatacatgt 14482701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 239
Target Start/End: Original strand, 23911477 - 23911515
Alignment:
Q  201 tatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgat 239  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23911477 tatacgaaggaatttgatgtgataacatatatagttgat 23911515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 126
Target Start/End: Original strand, 3097169 - 3097253
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    |||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||  || ||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  3097169 tcatataaaatgagtaatcacacaaagaaatgcattccaagatgttgctttgaacttaatcttactgccctatcaactgacaagt 3097253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 413
Target Start/End: Original strand, 16651087 - 16651354
Alignment:
Q  148 atcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcaga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |    
T  16651087 atcaagctcaaaacaacatcttagaaatgcattctcgtttgtcacactcgtcttatatgaaggaattcgatgtgagaacttatatagttgatttggtata 16651186  T
Q  248 atac---atgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaact 344  Q
     |||   ||||||| | ||||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16651187 ctacaaaatgtgttatattcattcttttgagttatcaaagagacttgcaaacctttacactaagtataagacagttcaatgccaacatcttcagcaaact 16651286  T
Q  345 aacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatc 413  Q
    ||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16651287 aac-ataattaaactaagttacaacaaaataatgacacaacataataatacaacctaaacatcttcatc 16651354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 148 - 413
Target Start/End: Original strand, 17625447 - 17625714
Alignment:
Q  148 atcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcaga 247  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | |    
T  17625447 atcaagctcaaaacaacatcttagaaatgcattctcgtttgtcacactcgtcttatatgaaggaattcgatgtgagaacttatatagttgatttggtata 17625546  T
Q  248 atac---atgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaact 344  Q
     |||   ||||||| | ||||||||| | || | | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17625547 ctacaaaatgtgttatattcattcttttgagttatcaaagagacttgcaaacctttacactaagtataagacagttcaatgccaacatcttcagcaaact 17625646  T
Q  345 aacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatc 413  Q
    ||| | |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17625647 aac-ataattaaactaagttacaacaaaataatgacacaacataataatacaacctaaacatcttcatc 17625714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 148 - 439
Target Start/End: Original strand, 44110051 - 44110344
Alignment:
Q  148 atcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcaga 247  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||  ||| | || ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||    
T  44110051 atcaagctcaaaacaacatcgtagaagtatattcccttatgtcccacacttcttatgcgaaggaattcgatctgagaacatttatagttgatttggtaga 44110150  T
Q  248 atacat---gtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaact 344  Q
    ||||||   ||||| |||||||||| |  || | | ||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||| ||  |||||||||||| | |    
T  44110151 atacataatgtgttttcttcattctcg--agttatcaaagatacttgcaaacctttacactaagtgtaagacacttcaacgcatacatcttcagcagagt 44110248  T
Q  345 aacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatctt-gccgaatcaaactcttgagaatat 439  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  44110249 aacaacaattaaactaagatccaacaaaacaacgacacaacataataatacggcctaaacattttcatcttggccgaatcaaactcgtgagaatat 44110344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 28066694 - 28066472
Alignment:
Q  175 tgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttg 271  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||||||     
T  28066694 tgcattcccttccgtgacactcatcctatatgaaggaattcaatgtgaaaacctatatagttgattttgcagaatacatgttgtgttctctttattcttt 28066595  T
Q  272 taagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaaca 370  Q
    | || ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28066594 tgagttttcaaatagacttgcaaacctttaccctaagtatactacactttaattccgacatcttcagtaaactaacaagaattaaacttaaattccaaca 28066495  T
Q  371 aaataatgacacaacataataat 393  Q
    |||||| ||||| ||||||||||    
T  28066494 aaataaagacactacataataat 28066472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 62 - 393
Target Start/End: Original strand, 29656147 - 29656481
Alignment:
Q  62 caaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaa 160  Q
    |||||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  29656147 caaaaaagaatgcatttcaatatattattttgaacttaatcttatttccctgccaactgacaagtttcaattgacaggggagc-ttgatcaagctcaaaa 29656245  T
Q  161 caatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaat---acatgtgt 257  Q
     || |||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||   |||||||     
T  29656246 gaacatcttagaaatgcattcatgtttgtcacactcatcttatatgaaggaattcgatgtgagaacctatatagttgattaggtagaatacaacatgtgc 29656345  T
Q  258 tctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaa 357  Q
    ||| |  ||||||   || ||| |||||||||  |||||| || | ||||||||||||  ||| |||||  || ||||||| |||||| ||  |||||||    
T  29656346 tctatcaattctttcgagttttcaaagagactgacaaaccgttgcactaagtataagacacttaaatgcaaacctcttcagaaaactaccataaattaaa 29656445  T
Q  358 ctaaaatccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    || || ||||| ||||||| ||||| |||| |||||    
T  29656446 cttaattccaaaaaaataaggacactacatgataat 29656481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 240
Target Start/End: Original strand, 26926724 - 26926896
Alignment:
Q  68 ggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatat 166  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  26926724 ggaatgcatcccaatatattattttaaacttaatcctactgtcatgccaactgacaagtttcaattgacagaggagcat-gagcaagctcaaaacaacat 26926822  T
Q  167 cttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26926823 cttagaagtgcattcccatatgtgacactcatcatatacgaaagaattcgatgtgaaaacctatgtagttgatt 26926896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31267593 - 31267293
Alignment:
Q  96 cttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacac 194  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||  |||||||    
T  31267593 cttaatcttactgtcctgccaactaacaagtttcaattgacagaggagcat-gatcaagctcaaaagaacctcttagaggtgcattccctttcgtgacac 31267495  T
Q  195 tcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttg 291  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||   ||||||||||| | |||| | |  ||| |||||| ||||    
T  31267494 tcgtcttatacgaaggaattcgatgtgataacatatatagatgattatgcataatacatgttgtgttctctt-aatcttttgacttttcaaagaggcttg 31267396  T
Q  292 caaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataat 390  Q
    |||| |  |||  | |||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  31267395 caaatcactacaatcagtataagaaacttcaataccatcatcttcagcaaactatcaagaattaaacttaaattcccacaaaataaagacactacataat 31267296  T
Q  391 aat 393  Q
    |||    
T  31267295 aat 31267293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 70 - 395
Target Start/End: Original strand, 1321311 - 1321634
Alignment:
Q  70 aatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatct 168  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  1321311 aatgcattccaatatattcttttgaacttaatcctactgccctaccaactgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcaagctcaaaacaacatct 1321409  T
Q  169 tagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgttctcttcattc 268  Q
    |||||||||||||   | ||| ||| ||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||  |     | |  ||| ||||| |   |||||    
T  1321410 tagaaatgcattcatgtttgtcacattcatcttatacgaagaaattcattgtgagaacatatatagttagt--ataatacaacacgtgttatacccattc 1321507  T
Q  269 ttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaa 368  Q
    ||   || ||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||| |  ||| |||||  ||| ||||||||||||| || |||||||||| || |||||    
T  1321508 tttcgagttttcaaagagacttcaaaacctttacactaagtataaaacactttaatgcaaacaccttcagcaaactaccatgaattaaacttaattccaa 1321607  T
Q  369 caaaataatgacacaacataataatac 395  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1321608 caaaataacgacacaacataataatac 1321634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 488
Target Start/End: Original strand, 16886155 - 16886592
Alignment:
Q  61 acaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaactt-aatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaag-ctca 157  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||||| |||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||  | ||    
T  16886155 acaaaaaggagtgcattccaatacattctttggaactttaatcatattgtcctaccaactgacaagtttcaattgacagaggagcata-atcaattcaca 16886253  T
Q  158 aaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt-- 255  Q
     ||||| |||||| |  |||||||| ||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||      
T  16886254 taacaagatcttaaaggtgcattccgtttcgtcacactcatcttatacaaaggaattcgatgtgaaaacctatatagttgatttggtaaaatacatgttg 16886353  T
Q  256 -gttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaatt 354  Q
     |||||||| |||||| | || ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  16886354 tgttctctttattcttttgagttttcaaacagacttgcaaacctttaccctaagtataagacacttcaataccaacatcttcagcaaactgacaataatt 16886453  T
Q  355 aaa-ctaaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgat 449  Q
    |||  |||| || || ||||||| ||||  ||||||||   || ||||||||||||  || | | ||   ||||||||||| | |||||| ||||||||     
T  16886454 aaatttaaattcaaagaaaataaagacagtacataataatgatgctacctaaacataatcttgtggcatgatcaaactctttataatatcttcaggcgaa 16886553  T
Q  450 ctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatg 488  Q
    || |||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||    
T  16886554 cttaacaatgtagcatccagctcaatcctcaggaacatg 16886592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 191 - 515
Target Start/End: Original strand, 13304052 - 13304364
Alignment:
Q  191 acactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||| ||||||||   | | || ||||||||||| | |  ||| |||||||    
T  13304052 acactcatcttattcgaatgaatt-gattggaaaacctatatagttgatacggtagaatacaaaatatcttttcttcattcttttgacttttcaaagaga 13304150  T
Q  288 cttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacat 387  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||   |||||| || ||||||||       |||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13304151 ctaccaaacctttacgctaagtataagacatttcaataccaacatcttc-------taacaagaa-----ctaaaatccaacaaaataatgatacaacat 13304238  T
Q  388 aataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaaca 486  Q
    ||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | || |||||| |||||| | |||||||    
T  13304239 aa---tactacctaaacatcttcatctggccgaatcaaactcttgataatatcttcaggcgatctcatcaacgaagcatccatttcgatcgtcgggaaca 13304335  T
Q  487 tgttgtgttgaccaaatatcgagagcatg 515  Q
    |  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  13304336 ttctgtgctgaccaaatatcgagaacatg 13304364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Original strand, 27317475 - 27317627
Alignment:
Q  61 acaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaa 159  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||| ||||    
T  27317475 acaaaaaggaatgcattacaatatattcttttgaacttaatcctactaccctgccaactgacaagtttcaattgacagaggagca-tgttcaagcacaaa 27317573  T
Q  160 acaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaat 213  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  27317574 acaacatcttagaggtgcattcccttatgtcccactcatcttatacgaaggaat 27317627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23553953 - 23553755
Alignment:
Q  42 tcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttc-aatgacagagg 140  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23553953 tcatataagatgagtcgtgactaaaaggaatgcattccaatacattcttttgaacttaatcatattgcactgccaactgacaagtttctattgacagagg 23553854  T
Q  141 agaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  | |  || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23553853 agta-tgatcaagcacaaaacaacatcttagaaatacattttcgttcgtcacactcatcttatacgaaagaattcgatgtgaaaacatatttagttgatt 23553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 12083456 - 12083044
Alignment:
Q  89 ttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttat 187  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| |  | |||| ||   ||||||  |||||| || |      
T  12083456 ttttgaaatgaatcttactgccctgccaactgactagtttcaattgacagaggagcac-gatccaattaaaaagaaccccttagaggtgcatttccatcc 12083358  T
Q  188 gtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaag 284  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||| || |||   |||||||||||||||||| |  | ||| |||     
T  12083357 gtgacactcatcttatacgaagaaattcgatgtgaaaacctatataactgattttgcaaaacacatgttgtgttctcttcattcttttgggttttcaaac 12083258  T
Q  285 agacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacaca 383  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||||| ||  ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||     
T  12083257 agacttgaaaacatttaccctaagtatacgacacttcaataccaacatcttcagaaaacaaacaagaattaaacttaaattcgaacaaaataaagacact 12083158  T
Q  384 acataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatcctt 479  Q
    ||||||||   || |||||||| |||  || ||  || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||   |  ||| || |||| |    
T  12083157 acataataatgatgctacctaatcataatcttcaggcggaaccaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcagcaatgtgacaaacatatccatccat 12083058  T
Q  480 gggaacatgttgtg 493  Q
    ||||||||||||||    
T  12083057 gggaacatgttgtg 12083044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 7413897 - 7414062
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatg 188  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||   |    
T  7413897 tttgaacttaatcttattgccctgccaacttacaagtttcaattgacagaggagcat-gatcaagctcaaaataacatcttagaggtgcattccctgtcg 7413995  T
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||| | |||||||||||    
T  7413996 tgacactcatcatatacgaaggaatttgatgtgataacttatatagctaattctgtagaatacatgt 7414062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7067210 - 7066746
Alignment:
Q  61 acaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaa 159  Q
    |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| || || |    
T  7067210 acaaaagggaatgtattccaatatattcttttgaacttaattctattgcactgccaactgacaagtttcaattgacagaggagca-tgatcacgcacata 7067112  T
Q  160 acaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtg 256  Q
    |||| ||||||    | |||||||||  || ||||||||  ||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||   ||||    
T  7067111 acaacatcttaatggtacattccctttcgtcacactcatattatacaagggaatactatgtgaaaacatatatagttgatttggtaaaatacaagttgtg 7067012  T
Q  257 ttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaa 356  Q
    |||||||||||||| | |  ||| ||||     |||||| | ||||||  ||||||| |  ||| ||| || ||||||  ||||||||  || |||||||    
T  7067011 ttctcttcattcttttgacttttcaaaggatgctgcaaatctttacgcctagtataacacactttaataccaacatctgtagcaaactttcatgaattaa 7066912  T
Q  357 ac-taaaatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatat-ctcaggcgatct 451  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||   || ||||||||||||  || | | || ||||||| ||||| |||||||  |||||||||||    
T  7066911 acttaaattccaacaaaataaagacactacataataatgatgctacctaaacataatcttgtggcagaatcaagctcttaagaatatattcaggcgatct 7066812  T
Q  452 caacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
    || ||| ||||  |||||||| |||||  ||||||||  ||| |||| | |||| |||| ||||||    
T  7066811 cagcaacgtagcttccatctcaatcctcaggaacatgcggtgctgacgatatatggagaacatgct 7066746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10546193 - 10546007
Alignment:
Q  85 attcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattccc 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  10546193 attcttttgaacttaattttactgcaatgccaactgacaagtttcaattgacagaggagcat-gatcatgcacaaaacaacatcttagaggtgcattccc 10546095  T
Q  184 ttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctcttcattctt 270  Q
    ||| || | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||| |||||   |||||||||||||||    
T  10546094 ttaagtcatactcatcatatacaaaggaattcgatgtgaaaaca--tatagttgattcgctaaaatgcatgttgcgttctcttcattctt 10546007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 338 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 28009038 - 28008860
Alignment:
Q  338 gcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaat 437  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |    
T  28009038 gcaaactaacaagaattaagctaaaatccaataaaataatgacacaacattttaatacaacctaaacatcttcatctggccaaagcaaactcttgagagt 28008939  T
Q  438 atc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatg 515  Q
    ||| ||||  ||||||| |||   |  ||| | ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  28008938 atcttcagaagatctcagcaacaaaacatcaaactcgatcgtcgagaacatgatgtgctgaccaaatatcgagaacatg 28008860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 370
Target Start/End: Original strand, 12083596 - 12083797
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt---ctcttcattc 268  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||   ||||||||||    
T  12083596 aatgcattcctttctgtgatgactcatcttatatgagggaattcgatgtgaaaacgtatatagatgattttgaagaatacatgtgttgttctcttcattc 12083695  T
Q  269 ttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaa 368  Q
    || | || ||| ||| |||||||||||   |||| | ||||||| ||  ||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  12083696 ttttgagttttcaaacagacttgcaaatttttacacaaagtatacgacacttcaattccgacattttcggcaaactttcaagaattaaatttaaatccaa 12083795  T
Q  369 ca 370  Q
    ||    
T  12083796 ca 12083797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 240
Target Start/End: Original strand, 5281989 - 5282173
Alignment:
Q  56 tcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagc 154  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||  |  || ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||| |      
T  5281989 tcatcacataaaggaatacattccaagaggttgttttgaattgaatcttactgccctgccaactgactagtttcaattgacagaggagcac-gatctaat 5282087  T
Q  155 tcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
    |||||| ||    |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  5282088 tcaaaataacccattagaggtgcattcctttatgtgacactcatcttatacgaaggaattcgatgtgataacctatatagctgatt 5282173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 453
Target Start/End: Original strand, 7414115 - 7414255
Alignment:
Q  318 cttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatcca-acaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatc 413  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||||||   || |||||||| |||  || ||    
T  7414115 cttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattaaacttaaattcacacaaaataaagacactacataataatgatgctacctaatcataatcttc 7414214  T
Q  414 ttgccgaatcaaactcttgagaata-tctcaggcgatctca 453  Q
    | ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  7414215 tggcgaaatcaaactgttgagaatattttcaggcgatctca 7414255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 270
Target Start/End: Original strand, 41935116 - 41935224
Alignment:
Q  165 atcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatac---atgtgttctc 261  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |  |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||   ||||||||||    
T  41935116 atcttagaggtgcattcccttacatctcactcatcttatacaagggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggttgaatacaagatgtgttctc 41935215  T
Q  262 ttcattctt 270  Q
    |||||||||    
T  41935216 ttcattctt 41935224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 488
Target Start/End: Original strand, 12309482 - 12309694
Alignment:
Q  281 aaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat-ccaacaaaataatga 379  Q
    |||||| |||||||| |  ||| | ||||||||||  ||||||| || ||||  ||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  12309482 aaagagtcttgcaaatctctacaccaagtataagacacttcaataccaacattctcagcaaacttccatgaattaaacttaaattccaacaaaataaaga 12309581  T
Q  380 cacaacataataata---ctacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgat 475  Q
    ||  ||||||||||    ||||||||||||  || | | || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  | |  |||||||| ||    
T  12309582 caatacataataatgatgctacctaaacataatcttgtggcagaatcaaactcttgagaatatcttcatgcgatctcagcaacctggcttccatctcaat 12309681  T
Q  476 ccttgggaacatg 488  Q
    ||| |||||||||    
T  12309682 cctcgggaacatg 12309694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 41934995 - 41934913
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca-----tgtgttctcttcattctt 270  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||     ||||||||||||||||||    
T  41934995 actcatcttatacgagggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggtagaatgcaactgttgtgttctcttcattctt 41934913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 5281826 - 5281923
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaa 124  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||  |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  5281826 tcacatcgaattccttcatataaaatgagtcatcacaaaaaggaatgcattccaagaggttgctttgaactcaatcttacgaccctgccaattgacaa 5281923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12083646 - 12083541
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  |  ||  |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12083646 tcacatcgaattccctcatataagatgagtcatcacagaaaggaatgcattccaagaggttgctttgagttgaatcttactaccctgtcaactgacaagt 12083547  T
Q  127 ttcaat 132  Q
    ||||||    
T  12083546 ttcaat 12083541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3925065 - 3924961
Alignment:
Q  290 tgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taaaatccaacaaaataatgacacaacata 388  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  ||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||    
T  3925065 tgcaaatctttacgctaagtatatgacactttaataccaacatcttcagcgaactaataagaattaaacttaaattccaacaaaataaagacaatacata 3924966  T
Q  389 ataat 393  Q
    |||||    
T  3924965 ataat 3924961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3925271 - 3925096
Alignment:
Q  65 aaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaa 163  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||  |  |||||||| |||||||||||| |||| | ||  || |||||||| ||||| ||    
T  3925271 aaaggaatacattccaatacattcttttgaacttaatcctaccgcattgccaactaacaagtttcaattgacataagaacat-gatcaagcacaaaataa 3925173  T
Q  164 tatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatt 240  Q
     ||||||||  |||| ||||||| ||  |||||||| ||||  |  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3925172 catcttagaggtgcaatcccttacgtcccactcatcttatatcagagagatcgatgtgaaaacatatatagttgatt 3925096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5281876 - 5281790
Alignment:
Q  173 aatgcattcccttatgtgac-actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||| || |||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  5281876 aatgcattcctttttgtgatgactcattttatatgaaggaattcgatgtgataacatatatagttgattttgtagaatacatgtgtt 5281790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 132
Target Start/End: Original strand, 41935008 - 41935071
Alignment:
Q  69 gaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaat 132  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41935008 gaatgcattccagtacattctttttaacttaattctactgcactgccaactgacaagtttcaat 41935071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 447 - 510
Target Start/End: Original strand, 41935406 - 41935469
Alignment:
Q  447 gatctcaacaatgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgaga 510  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  41935406 gatctcaacaacgtagcatccatctcgacccatgggagcatgttgtgctgacaaaatatcgaga 41935469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 270
Target Start/End: Original strand, 3925297 - 3925359
Alignment:
Q  210 gaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattctt 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3925297 gaattcgatgtgaaa-catatatagttgatttggtagaatacaaattgtgttctcttcattctt 3925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 128
Target Start/End: Original strand, 36338062 - 36338167
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||| |||| ||  | ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || | |||||| ||    
T  36338062 gttctcacattgaattccctcatataagatgcgtattgacaaaaatgaatgcattccaatatattattttgaacttaatcttattgccttaccaactaac 36338161  T
Q  123 aagttt 128  Q
    ||||||    
T  36338162 aagttt 36338167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 26926689 - 26926629
Alignment:
Q  419 gaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaatgtagaatccatctcgatcct 478  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||    
T  26926689 gaatcaaactcttgagaatatcttcaggcgatctcatcaatgcagcttccatctcaatcct 26926629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 364
Target Start/End: Original strand, 5282464 - 5282510
Alignment:
Q  318 cttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat 364  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5282464 cttcaataccaacatcttcagcaaactaacaagaattagacttaaat 5282510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11825121 - 11825055
Alignment:
Q  189 tgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| | | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11825121 tgacactcatcttatatgaagaaattcgatatcataacttatatagttgattctgcataatacatgt 11825055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 150693 - 150470
Alignment:
Q  27 tcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagt 126  Q
    ||||||||||| |  ||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||  |  ||| |||||  |||||||||||  | ||| || ||||||||    
T  150693 tcacatcgaattccctcatataagacaagtcatcacaaaaatgaatgcattccaagaggttcctttgagtttaatcttactgtcttgcaaattgacaagt 150594  T
Q  127 ttcaa-tgacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaa 225  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||| || |||  ||  |||||||  ||||||||     |||||||||||| ||||  |||||||||||| | | ||    
T  150593 ttcaattgacagaggagca-cgatcaaactaaaaggaacctcttagaggtgcattcc-----gtgacactcatcttatattaaggaattcgatatcataa 150500  T
Q  226 catatatagttgattcggcagaatacatgt 255  Q
    | ||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  150499 cttatattgttgattatgcataatacatgt 150470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 258
Target Start/End: Original strand, 150680 - 150729
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||    
T  150680 ggaattcgatgtgataacatatataattgattttgtagaatacatgtgtt 150729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3380392 - 3380343
Alignment:
Q  209 ggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||    
T  3380392 ggaattcgatgtgataacatatatagtttattttgtagaatacatgtgtt 3380343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 142
Target Start/End: Original strand, 7413768 - 7413821
Alignment:
Q  90 tttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaa-tgacagaggag 142  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7413768 tttgaattgaatattactgccctgccaactgacaagtttcaattgacagaggag 7413821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Original strand, 23553939 - 23554004
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgtgtt 258  Q
    ||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23553939 actcatcttatatgagggaatttgatgtgataacctatatagttgatttgctagaatacatgtgtt 23554004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 393
Target Start/End: Original strand, 27317745 - 27317810
Alignment:
Q  329 acatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaat-ccaacaaaataatgacacaacataataat 393  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  27317745 acatattccgcaaactaacaagatttaaatttaaattccaacaaaataaagacactacataataat 27317810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 5896 - 5438
Alignment:
Q  67 aggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgacaagtttcaatg-acagaggagaattgatcaagctcaaaacaata 165  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||  ||||||||| || |||||||| | |||||| |    
T  5896 aggaatgcattccaatatattcttttgaacttaatcctactgcactgccaacagacaagtttcaatttacagaggagcat-gatcaagcacgaaacaaca 5798  T
Q  166 tcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt---gttctct 262  Q
    |||||||  ||||||| |||  || ||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||  ||| |||||||||   | |||||    
T  5797 tcttagaggtgcattctctttcgtcacactcatcttatacaaggtaattcgatgtgagaatttatatagttgattttgcaaaatacatgttgtgctctct 5698  T
Q  263 tcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaac-taa 361  Q
    |||||||| | || ||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||    
T  5697 tcattcttttgagttttcaaacagacttgcaaacctttaccctaagtatacgacacttcaattccaacatctttagcaaactaacaacaattaaacttaa 5598  T
Q  362 aatccaacaaaataatgacacaacataata---atactacctaaacatcttcatcttgccgaatcaaactcttgagaatatc-tcaggcgatctcaacaa 457  Q
    | ||  |||| | || ||||| ||||||||   || |||||||| |    || ||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5597 attcgcacaagacaaagacactacataataatgatgctacctaatctcgatcttctggcgaaatcaaactgttgagaatatcttcaggcgatctcaacaa 5498  T
Q  458 tgtagaatccatctcgatccttgggaacatgttgtgttgaccaaatatcgagagcatgct 517  Q
     ||   |  ||| | ||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||| ||||||    
T  5497 cgtgacaaacatattgatccatgggaacatgttgtgctgccaaaaaatcgagaacatgct 5438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 307
Target Start/End: Original strand, 22273 - 22559
Alignment:
Q  23 gttctcacatcgaatcctttcatataggatgagtcatcacaaaaaggaatgcatcccagtatattcttttgaacttaatcttactaccctgccaactgac 122  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||  |  | || | ||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  22273 gttctcacatcgaattccttcatataagatgagtagtgtcgaacacgaatgtattccaacatattcttttgaacttaatcatactgccttcccaactgac 22372  T
Q  123 aagtttcaat-gacagaggagaattgatcaagctcaaaacaatatcttagaaatgcattcccttatgtgacactcatcctatacgaaggaattcgatgtg 221  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22373 aagtttcaattgacagaagagcat-gatcaagtttaaaacaacatcttagaagtgcattctcgtttgtcacactcatcttatacgaaggaattcgatgtg 22471  T
Q  222 aaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaa 307  Q
    | ||| ||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  22472 agaacttatatagttgattcgacataatacatgttgtgttctcttca-tcttgtgatttttgaaagatacttgcaaacctttacactaa 22559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 22306 - 22203
Alignment:
Q  193 actcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaatacatgt-----gttctcttcattcttgtaagctttgaaagaga 287  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||||     ||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  22306 actcatcttatatgaaggaattcgatgtgagaacatgtagagtagatttggtagaatacatgtgttgcgttctcttcattcttttgagttttgaaagaga 22207  T
Q  288 cttg 291  Q
    ||||    
T  22206 cttg 22203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 305 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 1328 - 1191
Alignment:
Q  305 taagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactacctaaac 404  Q
    |||||||||||  |||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  1328 taagtataagacacttcaatgctagcaacttcaacaaactaacaagaattaaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatactttctaaac 1229  T
Q  405 atcttcatcttg-ccgaatcaaactcttgagaatatct 441  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1228 atcttcatctagcccgaatcaaactcttgagaatatct 1191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2968 - 2828
Alignment:
Q  254 gtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttgcaaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacatcttcagcaaactaacaagaat 353  Q
    |||||||||||||||||   || ||| ||||||||  ||||||  | || ||||||||||||   | ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2968 gtgttctcttcattctttcgagttttaaaagagaccggcaaactttaacactaagtataagaca-tgcaatgcaaacatcttcagcaaactaacaagaat 2870  T
Q  354 taaactaaaatccaacaaaataatgacacaacataataatac 395  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2869 taaattaaaatccaacaaaataatgacataacataataatac 2828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37090 - 37009
Alignment:
Q  192 cactcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattctt 270  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||   ||||||||||||||||||    
T  37090 cactcatcctatataaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgatttggtaaaatacatgttgtgttctcttcattctt 37009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 21 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 37163 - 37131
Alignment:
Q  21 aagttctcacatcgaatcctttcatataggatg 53  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37163 aagttctcacatcgaatcccttcatataggatg 37131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 46051 - 45911
Alignment:
Q  195 tcatcctatacgaaggaattcgatgtgaaaacatatatagttgattcggcagaataca---tgtgttctcttcattcttgtaagctttgaaagagacttg 291  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  | ||||||||   |||||||||||||||||| | || ||| ||||||| |||    
T  46051 tcatcttatatgaaggaattcgatgtgagaacatgtgtagttgattttgtagaatacaaaatgtgttctcttcattcttttgagttttcaaagagatttg 45952  T
Q  292 caaacccttacgctaagtataagaggcttcaatgccgacat 332  Q
     |||   |||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  45951 taaatttttacactaagtataagacacttcaatgccaacat 45911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University