View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12049_low_20 (Length: 326)

Name: NF12049_low_20
Description: NF12049
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12049_low_20
NF12049_low_20
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (1-311)||(22303934-22304251)
chr6 (1-311)||(6203853-6204170)
chr6 (1-311)||(11690820-11691137)
chr6 (1-311)||(27638452-27638769)
chr6 (1-311)||(30826654-30826971)
chr6 (1-311)||(31770778-31771088)
chr6 (1-231)||(26440145-26440375)
chr6 (1-311)||(2406947-2407257)
chr6 (1-295)||(26172614-26172922)
chr6 (5-231)||(24085937-24086165)
chr6 (5-121)||(32642600-32642716)
chr6 (155-311)||(2406059-2406222)
chr6 (8-121)||(3384140-3384253)
chr6 (39-311)||(18005475-18005754)
chr6 (226-284)||(21603320-21603378)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (1-311)||(1055230-1055547)
chr8 (1-311)||(23019323-23019640)
chr8 (1-311)||(26662151-26662468)
chr8 (1-311)||(22532-22849)
chr8 (1-311)||(15033801-15034118)
chr8 (1-311)||(42482542-42482859)
chr8 (1-311)||(486769-487086)
chr8 (1-311)||(34367646-34367963)
chr8 (1-311)||(43214107-43214405)
chr8 (1-311)||(39603992-39604308)
chr8 (3-311)||(41243120-41243416)
chr8 (1-311)||(39831787-39832096)
chr8 (1-294)||(20858717-20859017)
chr8 (5-311)||(35554303-35554609)
chr8 (3-311)||(40075736-40076044)
chr8 (1-311)||(34819646-34819963)
chr8 (1-295)||(5301359-5301660)
chr8 (1-311)||(21176349-21176666)
chr8 (1-311)||(45132443-45132760)
chr8 (22-224)||(51807-52009)
chr8 (1-295)||(5679563-5679866)
chr8 (220-309)||(30761310-30761399)
chr8 (155-231)||(30761409-30761485)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (1-311)||(41883244-41883561)
chr7 (1-311)||(48406062-48406379)
chr7 (1-311)||(9368438-9368755)
chr7 (1-311)||(35607427-35607744)
chr7 (1-311)||(17460298-17460615)
chr7 (1-311)||(17592599-17592916)
chr7 (1-311)||(42504970-42505287)
chr7 (41-311)||(15071319-15071596)
chr7 (1-311)||(17837664-17837974)
chr7 (1-311)||(10521535-10521851)
chr7 (13-311)||(34741444-34741742)
chr7 (1-311)||(5538587-5538904)
chr7 (1-311)||(13322738-13323055)
chr7 (1-311)||(16680163-16680480)
chr7 (1-311)||(17654399-17654716)
chr7 (1-311)||(27450723-27451040)
chr7 (1-311)||(11630317-11630614)
chr7 (39-311)||(37342992-37343271)
chr7 (1-121)||(11632735-11632855)
chr7 (5-225)||(47670332-47670552)
chr7 (159-311)||(47522013-47522172)
chr7 (38-225)||(9491989-9492176)
chr7 (38-225)||(36980301-36980488)
chr7 (155-225)||(41734630-41734700)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-311)||(6178840-6179157)
chr4 (1-311)||(49168215-49168532)
chr4 (1-311)||(1306170-1306489)
chr4 (1-311)||(31424444-31424761)
chr4 (1-311)||(49093125-49093443)
chr4 (1-311)||(41796075-41796392)
chr4 (1-311)||(21018628-21018945)
chr4 (1-311)||(40355453-40355770)
chr4 (1-231)||(30723886-30724116)
chr4 (1-291)||(44677040-44677337)
chr4 (1-311)||(37016633-37016938)
chr4 (1-311)||(50277858-50278175)
chr4 (1-311)||(8109855-8110172)
chr4 (20-295)||(50904086-50904361)
chr4 (1-229)||(51685839-51686067)
chr4 (1-311)||(10730030-10730347)
chr4 (1-311)||(10943799-10944116)
chr4 (1-311)||(50020734-50021039)
chr4 (5-231)||(13624656-13624882)
chr4 (8-311)||(71648-71958)
chr4 (1-114)||(50196105-50196218)
chr4 (1-214)||(41931116-41931329)
chr4 (5-183)||(46438776-46438954)
chr4 (1-121)||(14317313-14317433)
chr4 (50-295)||(30706657-30706909)
chr4 (241-311)||(30723777-30723847)
chr4 (249-311)||(50196289-50196351)
chr4 (40-121)||(21535449-21535530)
chr4 (220-295)||(55278836-55278911)
chr4 (241-295)||(14317560-14317614)
chr4 (226-308)||(46438956-46439038)
chr4 (241-284)||(40886693-40886736)
chr4 (220-294)||(12891842-12891916)
chr4 (241-299)||(21535276-21535334)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (1-311)||(42901192-42901509)
chr3 (1-311)||(46698347-46698664)
chr3 (1-311)||(46401409-46401726)
chr3 (1-311)||(49141550-49141867)
chr3 (1-311)||(50477809-50478126)
chr3 (1-311)||(54388829-54389146)
chr3 (1-311)||(34048129-34048446)
chr3 (1-311)||(2272088-2272405)
chr3 (1-311)||(47071219-47071529)
chr3 (1-311)||(36130189-36130506)
chr3 (2-311)||(4005443-4005758)
chr3 (13-311)||(599583-599888)
chr3 (1-311)||(41614973-41615282)
chr3 (7-311)||(17562375-17562686)
chr3 (1-311)||(44232422-44232732)
chr3 (52-311)||(9473034-9473300)
chr3 (3-299)||(20353247-20353550)
chr3 (4-311)||(42759369-42759676)
chr3 (5-311)||(16646216-16646516)
chr3 (1-311)||(48565580-48565890)
chr3 (1-295)||(49266417-49266718)
chr3 (5-230)||(50758807-50759032)
chr3 (5-291)||(48891225-48891518)
chr3 (82-311)||(50214199-50214428)
chr3 (1-97)||(51807880-51807976)
chr3 (221-311)||(2648608-2648698)
chr3 (128-311)||(52388630-52388820)
chr3 (5-311)||(42804993-42805306)
chr3 (1-95)||(52388827-52388921)
chr3 (155-311)||(6927989-6928146)
chr3 (8-188)||(30253256-30253436)
chr3 (1-41)||(3495550-3495590)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (1-311)||(15833960-15834277)
chr2 (1-311)||(30493997-30494314)
chr2 (1-311)||(17423170-17423487)
chr2 (1-311)||(43981225-43981542)
chr2 (1-311)||(5354675-5354992)
chr2 (1-311)||(43536740-43537057)
chr2 (1-311)||(28471232-28471549)
chr2 (1-311)||(45431209-45431526)
chr2 (1-311)||(39950198-39950515)
chr2 (1-311)||(10825954-10826264)
chr2 (1-295)||(7189517-7189818)
chr2 (1-311)||(29398641-29398958)
chr2 (1-130)||(22680223-22680351)
chr2 (1-295)||(36653548-36653849)
chr2 (5-224)||(7416490-7416709)
chr2 (8-222)||(40538250-40538464)
chr2 (220-295)||(20067509-20067584)
chr2 (253-288)||(22529914-22529949)
chr2 (253-311)||(40538488-40538546)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (1-311)||(26878420-26878730)
chr1 (1-311)||(3729379-3729697)
chr1 (1-311)||(13637036-13637353)
chr1 (1-311)||(95132-95442)
chr1 (3-311)||(31780697-31781005)
chr1 (1-311)||(22526706-22527016)
chr1 (1-311)||(19158724-19159041)
chr1 (1-294)||(19522331-19522624)
chr1 (1-311)||(52804571-52804888)
chr1 (1-294)||(47505045-47505344)
chr1 (5-311)||(47660580-47660893)
chr1 (1-311)||(11196566-11196883)
chr1 (1-311)||(45828280-45828596)
chr1 (131-311)||(21143770-21143950)
chr1 (1-90)||(50341407-50341496)
chr1 (5-231)||(49855140-49855365)
chr1 (1-81)||(21143683-21143763)
chr1 (38-225)||(38120288-38120475)
chr1 (5-95)||(35256520-35256610)
chr1 (195-311)||(50617929-50618052)
chr1 (220-292)||(23273427-23273499)
chr1 (168-311)||(16269827-16269977)
chr1 (1-63)||(23273541-23273603)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-311)||(19038199-19038516)
chr5 (1-311)||(28238769-28239086)
chr5 (3-311)||(28879304-28879619)
chr5 (1-309)||(30707751-30708066)
chr5 (1-311)||(8577575-8577892)
chr5 (1-311)||(7760041-7760351)
chr5 (1-261)||(8739-9006)
chr5 (1-295)||(38407903-38408197)
chr5 (1-311)||(511646-511956)
chr5 (1-311)||(5199471-5199781)
chr5 (1-311)||(42538497-42538814)
chr5 (1-295)||(42937708-42937990)
chr5 (5-225)||(8699555-8699775)
chr5 (8-295)||(38970752-38971046)
chr5 (3-311)||(15939351-15939666)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (5-231)||(12058-12284)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (195-291)||(56476-56579)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (226-294)||(22343-22411)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 22303934 - 22304251
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303934 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 22304033  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304034 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 22304133  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304134 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 22304233  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||    
T  22304234 tctgaggcctgcaaatga 22304251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 6203853 - 6204170
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203853 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 6203952  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6203953 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 6204052  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204053 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 6204152  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  6204153 tccgaggcctgcaaatga 6204170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 11690820 - 11691137
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690820 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 11690919  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11690920 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 11691019  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691020 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 11691119  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  11691120 tccgaggcctgcaaatga 11691137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 27638452 - 27638769
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638452 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 27638551  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27638552 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 27638651  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27638652 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaagagatct 27638751  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  27638752 tccgaggcctgcaaatga 27638769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30826971 - 30826654
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826971 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 30826872  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826871 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 30826772  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30826771 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 30826672  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  30826671 tccgaggcctgcaaatga 30826654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 31770778 - 31771088
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31770778 ggttttatggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 31770877  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  31770878 cccagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 31770977  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  31770978 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctctttcaggagatcttccgagg 31771077  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  31771078 ccagcaaatga 31771088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26440145 - 26440375
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26440145 ggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcaatacggatacgtccagaccatc 26440244  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||   ||||||||||||  ||||||||||||||||||||   | | ||||||    
T  26440245 cctagacatctgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaagcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgactgattggggtg 26440344  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  26440345 agccggcaggagagcagacatggcggatggc 26440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 2406947 - 2407257
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| ||    
T  2406947 ggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgtacgtagggtctactgtcacttgctcgagagggttttaaggcaatacggatacgtctagaccgtc 2407046  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || | ||||||||| ||||||   || || ||||  |||   ||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||    
T  2407047 cctaaacatccgacggatgttgtagagctgccactacctcaaattgtgcagacattcgtcgacttccgcacttacacgcttaaggcggccgatcgaggtg 2407146  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    | |||||||||||| | | ||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  2407147 aacaggcaggagagcagaaatggcagatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcggattttgccacctcttccaggagatcttccgagg 2407246  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  2407247 ccagcaaatga 2407257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 26172614 - 26172922
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  26172614 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagagttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 26172713  T
Q  101 cccagacatccg--------actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgc 192  Q
    ||||||||||||        || ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||     
T  26172714 cccagacatccgacggatgaacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccga 26172813  T
Q  193 tcggggtgagcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcca 285  Q
    | ||| | |||||||||||||| | ||       |||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||| |    
T  26172814 ttgggataagcaggcaggagagcagacattgcggatggcggatgtctatgtgttatggtacactagggtgtctca-cctcaaattttgccacctcttcga 26172912  T
Q  286 ggagatcttc 295  Q
    ||||||||||    
T  26172913 ggagatcttc 26172922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24086165 - 24085937
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttg-cccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc- 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||     
T  24086165 ttctggtattcaggatggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgccccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccct 24086066  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
     |||||| || | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || | ||||||||    
T  24086065 tagacattcgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatgttttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggccgattggggtgag 24085966  T
Q  203 caggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
    || ||||||||| |  ||||||| |||||    
T  24085965 catgcaggagagcaggcatggcgtatggc 24085937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Original strand, 32642600 - 32642716
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |    
T  32642600 ttctggtattcaggctgaattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcctgaccgtcccta 32642699  T
Q  105 gacatccgactgatgtt 121  Q
    |||||||| | ||||||    
T  32642700 gacatccgtcggatgtt 32642716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2406222 - 2406059
Alignment:
Q  155 ttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgga-------tggctatgtcctgtggtaca 247  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||       |||||||||  | |||||||    
T  2406222 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagagcagacatgacggacgacggatggctatgtgttatggtaca 2406123  T
Q  248 gtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  2406122 caagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaatga 2406059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Original strand, 3384140 - 3384253
Alignment:
Q  8 tggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagac 107  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  3384140 tggtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgcaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccatacgatccctagac 3384239  T
Q  108 atccgactgatgtt 121  Q
    |||| || ||||||    
T  3384240 atcctacggatgtt 3384253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18005754 - 18005475
Alignment:
Q  39 gtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcc 138  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |   | ||||   ||  |  ||||| |    
T  18005754 gtagggtgcaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccctagacatctgttagctgttgtagagatgtcaccgac 18005655  T
Q  139 ttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatac-------atggcggatggc 231  Q
    |   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||||| ||       ||||| ||||||    
T  18005654 tgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgcagcagaggaaacatggtgtatggcagatggc 18005555  T
Q  232 tatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||||| |   ||||||     ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  18005554 tatgtacgaaggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagattttccgaggcctccaaatga 18005475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 226 - 284
Target Start/End: Original strand, 21603320 - 21603378
Alignment:
Q  226 gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 284  Q
    ||||||||| | || ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21603320 gatggctatatactatggtacactacggtgtctcaccctcagatttttccacctattcc 21603378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 1055230 - 1055547
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055230 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 1055329  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055330 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 1055429  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055430 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 1055529  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  1055530 tccgaggcctgcaaatga 1055547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23019640 - 23019323
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019640 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 23019541  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019540 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 23019441  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019440 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 23019341  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  23019340 tccgaggcctgcaaatga 23019323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 26662151 - 26662468
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662151 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 26662250  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662251 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 26662350  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662351 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 26662450  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  26662451 tccgaggcctgcaaatga 26662468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22849 - 22532
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22849 ggttttctggtattctggatggattatgtgtggcatccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 22750  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22749 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 22650  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22649 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatgactatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatat 22550  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  22549 tccgaggcctgcaaatga 22532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15034118 - 15033801
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15034118 ggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 15034019  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15034018 cccagacatccgactgatgttaggaacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtg 15033919  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcgga-------tggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15033918 agcaggcaggagaggatacatggcggatggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 15033819  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  15033818 tccgaggcctgcaaatga 15033801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42482859 - 42482542
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482859 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 42482760  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42482759 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggcggacgctcggggtg 42482660  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||| ||||||||       |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42482659 agcaggcaggaaaggatacatggtgggtggcggatggctatatcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 42482560  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  42482559 tccgaggcctgcaaatga 42482542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 487086 - 486769
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  487086 ggtttcctggtattctggatggattatgtgcggcgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 486987  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486986 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgtttatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 486887  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  486886 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 486787  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |  ||| |||||||||||    
T  486786 ttcgaggcctgcaaatga 486769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34367963 - 34367646
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34367963 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtatggtgtaccttcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgaatacgtccagaccatc 34367864  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  34367863 ctcagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 34367764  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcgga-------tggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  34367763 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccctcagatcttgccacctctttcaggagatct 34367664  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||    
T  34367663 tctgaggcctgcaaatga 34367646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 43214107 - 43214405
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  43214107 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgaatacgtccagaccatc 43214206  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  43214207 cccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaacgattggggtg 43214306  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||            |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||     
T  43214307 agcag------------acatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatattatgagg 43214394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 39603992 - 39604308
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  39603992 ggttttctcgtattctggatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacgaatacgtccagaccat- 39604090  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  39604091 cccagacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtg 39604190  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||| ||||||||| | ||       |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39604191 agcatgcaggagagtagacatgacggatggcggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggaaatct 39604290  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||    
T  39604291 tctgaggcctgcaaatga 39604308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41243416 - 41243120
Alignment:
Q  3 ttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 102  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41243416 ttttatggtattctggctggattatgtgcgctgttcgtagggtgtaccgtcacttgccagagagtgttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccc 41243317  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
    |||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  41243316 cagacatccgacagatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactgacacgcttaaggcagacgattggggtgag 41243217  T
Q  203 caggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccc 302  Q
    ||||            |||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  || ||    
T  41243216 cagg------------catggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgtcacctcttccaggagatcttccaaggcc 41243129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39832096 - 39831787
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| || | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  39832096 ggttttgtggtattcaggctggattatgtgcggtgttcctaaggtgtaccgtcacttacccgagagggttttaaggcagtacggatacgtccagaccgtc 39831997  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
     ||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  39831996 tccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcgattggggtg 39831897  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  39831896 agcaggcaggagagcagacatggcggatgattatgtgttatggtacacta-ggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatcttccgagg 39831798  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  39831797 ccagcaaatga 39831787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20858717 - 20859017
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20858717 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 20858816  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||   ||  |  |||||||||  |||||||||   |||||| ||||   ||||||||| |||||||||| |  | || |||    
T  20858817 cccaaacatccgacggatgttgtagagttgtcaccgccttagattgtgcaggcattcgtcaacttccacactcacacccttaaggcggcctattggagtg 20858916  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  20858917 agcaggcaggagagcatacatggatgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttttccacctcttccaggagatct 20859016  T
Q  294 t 294  Q
    |    
T  20859017 t 20859017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Original strand, 35554303 - 35554609
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||| | || |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| |    
T  35554303 ttctggtatccaggctggattatttgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagagggtcccta 35554402  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||||| |||  |   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  35554403 gacatccgacggataatgtagagctgacaccgcctcagattgtgcaggaattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 35554502  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctg 304  Q
    ||||  | || | |||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || |    
T  35554503 ggcacaaaagcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccag 35554602  T
Q  305 caaatga 311  Q
    |||||||    
T  35554603 caaatga 35554609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40076044 - 40075736
Alignment:
Q  3 ttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 102  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||||    
T  40076044 ttttctagtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacatccagagaatccc 40075945  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
     ||||||| ||| ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||   || | ||||||||    
T  40075944 tagacatcagacggatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcaaccgattggggtgag 40075845  T
Q  203 caggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccc 302  Q
    ||||||  |||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  40075844 caggcacaagagcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggcc 40075745  T
Q  303 tgcaaatga 311  Q
     ||||||||    
T  40075744 agcaaatga 40075736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34819963 - 34819646
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  34819963 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtaggatgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagagcgtc 34819864  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||| | || | ||||||    
T  34819863 cctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtg 34819764  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||   ||| | ||       |||||||||||||||||  | ||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||    
T  34819763 agcaggcacaggagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccctcagatttttccacctcttccaggagatct 34819664  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  34819663 tccgaggccagcaaatga 34819646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 5301660 - 5301359
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||| || ||| ||    
T  5301660 ggttttctggtattcaagctggattatgtgcggtgtttgttgggtctaccgtcacttgtccaagtggattttgaggtagtacggatacgtccataccgtc 5301561  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || |||||||  |||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | | || |    
T  5301560 cctagacatccgacggatgttgtagagctcccactacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattgaggcg 5301461  T
Q  201 agcaggcaggagag-------gatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||       |||  |||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  5301460 agcaggcaggagagcagacatgatggatggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatct 5301361  T
Q  294 tc 295  Q
    ||    
T  5301360 tc 5301359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21176666 - 21176349
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21176666 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtaggatgtaccgtcactttcttgagagggttttgcggcagtaaggatacgtccagagcatc 21176567  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || || | | |||||   |||||| ||   ||| |||||||  |||||||||||||||||| | ||| | ||||||    
T  21176566 cctagacatccgacggatgttgtagagctgcgatcgcctcagattgtggaggcattcatcgacttccgcactcacacgcttaaggagcacgattggggtg 21176467  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | |||||||       ||||| |||||| || ||||||| |  |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  21176466 agcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatgactatgtgctatggtacactgcggtgtcacaccctcagattttgacacctcttccagaagatct 21176367  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| || ||||||||    
T  21176366 tctgaggccagcaaatga 21176349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 45132443 - 45132760
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||    
T  45132443 ggttttttggtattcaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgacatctgcccgagagggttttgaggtagtacggatacgtccagatggtc 45132542  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||  ||||||||| |||||||| || || | ||||||    
T  45132543 cctagacatccgacggatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcaagctttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggaggccgattggggtg 45132642  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||| || |||  | |||||||       ||| ||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45132643 agcaggtagcagatcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatct 45132742  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  45132743 tccgaggccagcaaatga 45132760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Original strand, 51807 - 52009
Alignment:
Q  22 gattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgtt 121  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| | ||||||    
T  51807 gattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagtccgtccctagacatccgtcagatgtt 51906  T
Q  122 agggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacat 221  Q
       || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||| ||||| | ||||    
T  51907 gtagagctgtcaccgactcagattgtgcaggatttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcgattggggtgagcatgcatgagagcagacat 52006  T
Q  222 ggc 224  Q
    |||    
T  52007 ggc 52009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 5679563 - 5679866
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgta--ccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagacca 98  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||  ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |     
T  5679563 ggttttctggtattcaggctggattatgtacggtgtttgtagggtgtataccgtcacttgcctgagagggttttgcggcagtacggatacgtccagagcg 5679662  T
Q  99 tccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcgggg 198  Q
    |||| ||||| |  || ||||||   || |  | |||||||   |||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||| |  || | ||||    
T  5679663 tccctagacaactaacggatgttgtagagcggcgaccgcctcagattgtgcagccattcatcgacttccgcactcacacgcttaaggagcccgattgggg 5679762  T
Q  199 tgagcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagat 291  Q
    |||||||||||||||| | |||||||       |||||||||||| || ||||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  5679763 tgagcaggcaggagagcagacatggcgtatgagggatggctatgtgctatggtatactacggtgtctcaccctcggattttgccacctcttccagtagat 5679862  T
Q  292 cttc 295  Q
    ||||    
T  5679863 cttc 5679866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30761399 - 30761310
Alignment:
Q  220 atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaat 309  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| ||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  30761399 atggcggatgactatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaatttttccacctcttccaagagatcttccgaggccagcaaat 30761310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30761485 - 30761409
Alignment:
Q  155 ttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || || | |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||    
T  30761485 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcatgcaggagagcagacatggtggatggc 30761409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 41883244 - 41883561
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883244 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 41883343  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883344 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 41883443  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41883444 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 41883543  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  41883544 tccgaggcctgcaaatga 41883561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 48406062 - 48406379
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406062 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 48406161  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406162 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 48406261  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48406262 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 48406361  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  48406362 tccgaggcctgcaaatga 48406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9368755 - 9368438
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368755 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 9368656  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368655 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 9368556  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
     |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368555 tgcaggcaggagaggatacacggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 9368456  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  9368455 tccgaggcctgcaaatga 9368438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35607744 - 35607427
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35607744 ggttttctggtattctagatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatc 35607645  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607644 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 35607545  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35607544 agcaggcaggagaggatacatggcaggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 35607445  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  35607444 tccgaggcctgcaaatga 35607427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17460615 - 17460298
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460615 ggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 17460516  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460515 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 17460416  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17460415 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcaccctcatatcttgccacctattccaggagatct 17460316  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  17460315 tccgaggcctgcaaatga 17460298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17592599 - 17592916
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592599 ggttttctggtattcttgatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 17592698  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17592699 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 17592798  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17592799 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtttcaccctcatatcttgccacctattccaggagatct 17592898  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  17592899 tccgaggcctgcaaatga 17592916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42505287 - 42504970
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42505287 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 42505188  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42505187 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtg 42505088  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  42505087 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcatatcttgctgcctattccaggagatct 42504988  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  42504987 tccgaggcctgcaaatga 42504970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15071596 - 15071319
Alignment:
Q  41 agggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctt 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15071596 agggtgtaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctt 15071497  T
Q  141 ccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggcta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  15071496 ccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgatcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggcta 15071397  T
Q  234 tgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15071396 tgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 15071319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17837664 - 17837974
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17837664 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtatggtgtaccgtcacttgcccgagatggttttgaggcagtatggatacgtccagaccatc 17837763  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  17837764 cccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcacttacacgcttaaggcagacgattggggtg 17837863  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  17837864 agcaagcaggagagcagacatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgagg 17837963  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  17837964 cctgcaaatga 17837974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 10521535 - 10521851
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10521535 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagg-ttttgaggcagtacggatacgtccagaccatc 10521633  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||  |||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10521634 cccagacatccgactgatgttgcagacctccgaccgcctgacattgtacaggcgttcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtg 10521733  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10521734 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcatatcttgccacctcttccaggagatct 10521833  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  10521834 tccgagacctgcaaatga 10521851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 34741444 - 34741742
Alignment:
Q  13 ttctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccg 112  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  34741444 ttctggctggattatgtgcggtgttcgtagaatgtactgtcacttgcccgatagggttttgaagcagtacggatacgtccagaccgtccccagacatctg 34741543  T
Q  113 actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggag 212  Q
    || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||    
T  34741544 acggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtgagcaggcaggag 34741643  T
Q  213 aggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    || | |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  34741644 agcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactaggctgtctcaacctcagattttgccacctcttccaggagatcttctgagaccagcaaatga 34741742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5538904 - 5538587
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |  |||||| |    
T  5538904 ggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgttcgtacggtgtaccgtcacttgcccgagtgggttttgaggcagtacaaatacatctagaccaac 5538805  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||  ||||||   || || ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || | ||||||    
T  5538804 cctagacatccgatggatgttgtagagctgccatcgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggcggccgattggggtg 5538705  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5538704 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 5538605  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |  ||| || ||||||||    
T  5538604 ttcgaggccagcaaatga 5538587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 13322738 - 13323055
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13322738 ggttttatggtattctggctggataatgtgtggtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 13322837  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||  ||||||   || || ||||| |||  ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  13322838 cccagacatccgaaagatgttgtagagctgccaccacctcacattgtgcaggcgttcatcgactttagcactcacacgcttaagggggccgattggggtg 13322937  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       |||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  13322938 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggcgatgttctatggtacactatggtgtctcaccctcagatattgccacctcttccaggagatct 13323037  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  13323038 tccgaggccagcaaatga 13323055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 16680163 - 16680480
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||    
T  16680163 ggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttttgaggcagtacgaatacgtccagcctgtc 16680262  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |  |||||    
T  16680263 cccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattagggtg 16680362  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  16680363 agcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccctcagattttgccacctgttccatgagatct 16680462  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  16680463 tccgaggccagcaaatga 16680480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17654399 - 17654716
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||    
T  17654399 ggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccaatagggttttgaggcagtacgaatacgtccagcctgtc 17654498  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |  |||||    
T  17654499 cccagacatccgacggatgttgtcgagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattagggtg 17654598  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  17654599 agcaggcaggagagcagacttggcggatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtgtcaccctcagattttgccacctgttccatgagatct 17654698  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  17654699 tccgaggccagcaaatga 17654716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27451040 - 27450723
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||    
T  27451040 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgtttatagggtgtaccgtcactttcccaagagggttttgaggtagtacggatacgtccaaaccgtc 27450941  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
     ||||| ||||||  ||||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  27450940 tccagatatccgaacgatgttgtagagctgtcaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 27450841  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       ||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27450840 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaagagatct 27450741  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  27450740 tccgaggccagcaaatga 27450723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11630614 - 11630317
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  11630614 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttttgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtc 11630515  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || |  |||||    
T  11630514 cctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgttgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgat-tgggtg 11630416  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||            ||||||| ||||| |||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  11630415 agcag------------acatggcagatggttatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgagg 11630328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 311
Target Start/End: Original strand, 37342992 - 37343271
Alignment:
Q  39 gtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcc 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| | ||||||   || ||  |||||||    
T  37342992 gtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttaaggcaatacggatacgtccagacaaaccctagacatccggcggatgttgtagagctgacaccgcc 37343091  T
Q  139 ttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggc 231  Q
    |   ||||||||||  |||||  ||||  |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| |||| | |||||||       ||| |||    
T  37343092 tcagattgtgcagacattcgtatacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcatatgagggagggc 37343191  T
Q  232 tatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  37343192 tatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagatttttccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 37343271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11632855 - 11632735
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  11632855 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtctaccatcactttcccgagagggttttgaggcagtacgtatacgtcaagaccgtc 11632756  T
Q  101 cccagacatccgactgatgtt 121  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  11632755 cctagacatccgacggatgtt 11632735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47670552 - 47670332
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  47670552 ttctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgcaccgtcacttgcccgaaagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtaccta 47670453  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | || |||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||| ||||  |||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||    
T  47670452 gacatccgtcggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcaacttccgcactcacgcgcttaagtcggccgattggggtgagca 47670353  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcg 225  Q
      |||||||||| ||||||||    
T  47670352 tccaggagaggagacatggcg 47670332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47522172 - 47522013
Alignment:
Q  159 tcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggc-------tatgtcctgtggtacagtag 251  Q
    |||||||  ||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||       |||||  | ||||||| |||    
T  47522172 tcgacttccgcacttacacgtttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggaaagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactag 47522073  T
Q  252 ggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  47522072 ggtgtctcaccctcagattttgccacctattccaggagatcttccgaggccagcaaatga 47522013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9492176 - 9491989
Alignment:
Q  38 cgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgc 137  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||| | ||||||   || ||  |||||     
T  9492176 cgtagagtgtaccgtcactttcccgagagggttttaaggcagtacggatacacccagaccatccctagacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgg 9492077  T
Q  138 cttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcg 225  Q
    ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||  |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  9492076 ctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccaattggggtgagcatgtaggagaggagacatggcg 9491989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 36980301 - 36980488
Alignment:
Q  38 cgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgc 137  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| | | ||||||   || ||  |||||     
T  36980301 cgtagggtgtaccgtcactttcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtccagactgtccctagacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccga 36980400  T
Q  138 cttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcg 225  Q
    ||   |||||||||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || |  ||||| |||  |||||||| | ||||||||    
T  36980401 ctgagattgtgcaggctttcgtcgactttcacactcacacacttaaggcggccgatttgggtgtgcatacaggagagcagacatggcg 36980488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Original strand, 41734630 - 41734700
Alignment:
Q  155 ttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcg 225  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  41734630 ttcgtagacttccgcactcacacgcttaaggaggccgattggggtgagcaggcagcagagcagacatggcg 41734700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6179157 - 6178840
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179157 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 6179058  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6179057 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 6178958  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178957 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 6178858  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  6178857 tccgaggcctgcaaatga 6178840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 49168215 - 49168532
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168215 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 49168314  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168315 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 49168414  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49168415 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 49168514  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  49168515 tccgaggcctgcaaatga 49168532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1306489 - 1306170
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306489 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 1306390  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306389 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 1306290  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat---------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagat 291  Q
    |||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306289 agcaggtaggagaggatacatggcgcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagat 1306190  T
Q  292 cttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  1306189 cttccgaggcctgcaaatga 1306170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 31424444 - 31424761
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424444 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 31424543  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424544 cccagacatccgactgatgttaaggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 31424643  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31424644 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggcacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 31424743  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  31424744 tccgaggcctgcaaatga 31424761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 49093125 - 49093443
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093125 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 49093224  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49093225 cctagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgctcggggtg 49093324  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca--------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 292  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49093325 agcaggcaggagaggatacatgggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 49093424  T
Q  293 ttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  49093425 ttccgaggcctgcaaatga 49093443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41796392 - 41796075
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41796392 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtactgtcacttgcccgagagggttttgaggcaatacggatacgtgcagaccatc 41796293  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41796292 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcctggggtg 41796193  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||| ||||||||| |||||||       ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41796192 agcaggtaggagaggagacatggcgggcgggggatggctatgtcttgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 41796093  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  41796092 tccgaggcctgcaaatga 41796075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21018945 - 21018628
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21018945 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagcgtgtaccgtcactttcccgagaaggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 21018846  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21018845 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgcctttcattatgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtg 21018746  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcgga-------tggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21018745 agcaggcaggagaggagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctaagatcttgccacctcttccaggagatct 21018646  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  21018645 tccgaggcctgcaaatga 21018628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40355770 - 40355453
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40355770 ggttttatggtattctgggtggattatgtgtagtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatc 40355671  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  40355670 cctagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtg 40355571  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcgg-------atggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40355570 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcgaatggcaatgtcatatggtacactagggtgtctaaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 40355471  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  40355470 tccgagacctgcaaatga 40355453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30724116 - 30723886
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30724116 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 30724017  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30724016 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttcaattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtg 30723917  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30723916 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggc 30723886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 44677337 - 44677040
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44677337 ggttttttggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacatccagaccatc 44677238  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||| |||| ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  44677237 cccaggcatctgactgatgttgtaaacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 44677138  T
Q  201 agcaggcaggag-------aggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagat 291  Q
    ||||||||||||       | |  ||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44677137 agcaggcaggagaacagacatggcacatggcggatggctgtgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagat 44677040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37016938 - 37016633
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37016938 ggttttctggtattctggttggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcaatacggatacgtcaagaccatc 37016839  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||| ||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  37016838 cccagacatctgacggatgttgtagacctcccatcgccttacattgtgcagacgttcgttgacttccgcactcacacacttaaggcggacgattggggtg 37016739  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||| || | | ||    ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| |||     
T  37016738 agcagacatg-gcgg----atggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctaagatcttgccacctctttcagtagatcttccgagg 37016644  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  37016643 cctgcaaatga 37016633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 50277858 - 50278175
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  50277858 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 50277957  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||  | |||||||||   |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | || | ||||||    
T  50277958 cccagacatccgacggatgttgtagagttgccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattggggtg 50278057  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       |||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  50278058 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtgttatggcacactagggtgtctcaccctcatattttgtcacctcttccaggagatct 50278157  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  50278158 tccgaggccagcaaatga 50278175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 8109855 - 8110172
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8109855 ggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 8109954  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||  |||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || | ||||||    
T  8109955 cccagacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgtctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcatacgcttaaggcagccgattggggtg 8110054  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||| ||||| | ||       |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||    
T  8110055 agcaggcaagagagcagacatggttgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttttccacatcttccaggagatct 8110154  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  8110155 tccgaggccagcaaatga 8110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 295
Target Start/End: Original strand, 50904086 - 50904361
Alignment:
Q  20 tggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatg 119  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  50904086 tggatcatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccaggcatccgacggatg 50904185  T
Q  120 ttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatac 219  Q
    ||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||| || || | | |||||||||| ||||||| | ||    
T  50904186 ttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgatttccgcactcacacgcttaaggtggccgattgaggtgagcaggtaggagagcagac 50904285  T
Q  220 atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| || ||| ||||||||    
T  50904286 atggcggacggctatgtgctatggtacactagggtatctcaccctcagattttgtcacctctttcagaagatcttc 50904361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 51685839 - 51686067
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  51685839 ggttttctggtattcaggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtc 51685938  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  51685939 cctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcaacttctgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 51686038  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatg 229  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  51686039 agcaggcaggagaacagacatggcggatg 51686067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10730347 - 10730030
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10730347 ggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccatc 10730248  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| |||| || || | ||||||    
T  10730247 cctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattggggtg 10730148  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |       ||| ||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10730147 agcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatct 10730048  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  10730047 tccgaggccagcaaatga 10730030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10944116 - 10943799
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||  || |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10944116 ggttttctggtatttaggctggattttgtgcggtgttcgtagagtgtaccgtcacttgcctgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccatc 10944017  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||| ||||||| ||||||   || || | |||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||| |||| || || | ||||||    
T  10944016 cctagaaatccgacggatgttgttgagctgctaccgcctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgctgaaggaggccgattggggtg 10943917  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |       ||| ||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10943916 agcaggcacgagagcagacatgacgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatct 10943817  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  10943816 tccgaggccagcaaatga 10943799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50021039 - 50020734
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  50021039 ggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgggtacgtccataccgtc 50020940  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||||| ||   |||||||||   |||||| ||| | ||||||||| ||| |||| || || | ||||||    
T  50020939 cccagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgactcagattgtgcaggcattcgtcaactctcgcactcacatgctcaaggaggccgattggggtg 50020840  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||| || |   |     ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| |||     
T  50020839 agcagacatggctg-----atggcggatggctatatgttatggtacactagggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccaagagatcttccgagg 50020745  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  50020744 ccagcaaatga 50020734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13624882 - 13624656
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  13624882 ttctggtattcaggttggattatgtgcggtgatcgtagggcgtaccgtcacttgcccaagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtcccta 13624783  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  13624782 gacatccgtcggatgttgtagatctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 13624683  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
     ||| ||||| | |||||||| |||||    
T  13624682 tgcaagagagcagacatggcgtatggc 13624656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 8 - 311
Target Start/End: Original strand, 71648 - 71958
Alignment:
Q  8 tggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagac 107  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  71648 tggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgttccgtcacttggccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagac 71747  T
Q  108 atccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggc 207  Q
    ||| | | ||||||   || ||  || || ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||    
T  71748 atctgtcggatgttgtagagctgtcatcggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgc 71847  T
Q  208 aggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||||| | ||       ||||||||||||||||| |  |||||||     ||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||||     
T  71848 aggagagcagacatggcgtatggcggatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgtcacttcttctaggagatattctgagg 71947  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    ||| |||||||    
T  71948 cctccaaatga 71958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 50196105 - 50196218
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  50196105 ggttttctggtattcaggttggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgttcaggccgtc 50196204  T
Q  101 cccagacatccgac 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  50196205 cccagacattcgac 50196218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 41931329 - 41931116
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||    
T  41931329 ggttttctggtattaaggatggattatgtgcggtgttcgtagagtgtaccgttatctacccaagagggttttgaggcagcacggatacgtccaaacagtc 41931230  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||||||||||   || || |||||||||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||| || || | ||||||    
T  41931229 cctagacatccgactgatgttgttgagctgccaccgcctcagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacatgattaaggaggccgattggggtg 41931130  T
Q  201 agcaggcaggagag 214  Q
    ||||||||| ||||    
T  41931129 agcaggcagcagag 41931116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Original strand, 46438776 - 46438954
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   |||| |    
T  46438776 ttctagtattcaggctggattatttgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagagggtcccta 46438875  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaa 183  Q
    |||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  46438876 gacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgcagacattcgtcgacttccgcactcacacgcttaa 46438954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 14317313 - 14317433
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||  ||    
T  14317313 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtataccatcacttgcccgagagggttttgaggcggtacagatacgtccaaactgtc 14317412  T
Q  101 cccagacatccgactgatgtt 121  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  14317413 cctagtcatccgacggatgtt 14317433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 30706657 - 30706909
Alignment:
Q  50 cgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgc 149  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||    
T  30706657 cgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacgaatacgtctagacgatccctagacatccgacggatgttgtagagctgacaccgcctcagattgtgc 30706756  T
Q  150 agatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatg-------gctatgtcctgtg 242  Q
    ||   ||||| |||||  ||||||||||| |||||| || || | ||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||       | | |||  | ||    
T  30706757 aggcattcgtagacttctgcactcacacgtttaaggaggccgattggggtgagctggcagcagagcagacatggcgtatgagggaatgttgtgtgttatg 30706856  T
Q  243 gtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
     |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30706857 atacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttc 30706909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30723847 - 30723777
Alignment:
Q  241 tggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  30723847 tggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgtaaatga 30723777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 311
Target Start/End: Original strand, 50196289 - 50196351
Alignment:
Q  249 tagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  50196289 tagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgaggccagcaaatga 50196351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21535530 - 21535449
Alignment:
Q  40 tagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgtt 121  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  21535530 tagggtgtatcgtcacttgcctgagagagttttgcggctgtacggatatgtcgagaccgtccctagacatccgacggatgtt 21535449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 55278911 - 55278836
Alignment:
Q  220 atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  55278911 atggaggatggctatgtactatggtacactagggtgactcaccctctgattttgccacttcttccaggatatcttc 55278836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 295
Target Start/End: Original strand, 14317560 - 14317614
Alignment:
Q  241 tggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  14317560 tggtacactaaggtgtctcaccctcatattttgccacctcttccaggagatcttc 14317614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Original strand, 46438956 - 46439038
Alignment:
Q  226 gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaa 308  Q
    |||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  46438956 gatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttccatgagatcttccgaggccagcaaa 46439038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 40886736 - 40886693
Alignment:
Q  241 tggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattcc 284  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40886736 tggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacttattcc 40886693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 294
Target Start/End: Original strand, 12891842 - 12891916
Alignment:
Q  220 atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 294  Q
    |||| |||||||||| | | |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | || | |||||||||    
T  12891842 atggaggatggctatatacggtggtacactagggtgtatcaccctcagattttgccacttctttcgggagatctt 12891916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21535334 - 21535276
Alignment:
Q  241 tggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgag 299  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  21535334 tggtacactacgatgtctcaccttcagatttttccacctcttccaggagatcttctgag 21535276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42901509 - 42901192
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901509 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 42901410  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901409 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 42901310  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42901309 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 42901210  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  42901209 tccgaggcctgcaaatga 42901192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46698664 - 46698347
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698664 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 46698565  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46698564 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaagacggacgctcggggtg 46698465  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46698464 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 46698365  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  46698364 tccgaggcctgcaaatga 46698347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 46401409 - 46401726
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401409 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 46401508  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  46401509 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgtccggggtg 46401608  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat-------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46401609 agcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 46401708  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  46401709 tccgaggcctgcaaatga 46401726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49141867 - 49141550
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141867 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 49141768  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141767 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgatttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 49141668  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49141667 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 49141568  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  49141567 tccgaggcctgcaaatga 49141550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50478126 - 50477809
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478126 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 50478027  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50478026 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgttgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 50477927  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50477926 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagtagatct 50477827  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  50477826 tccgaggcctgcaaatga 50477809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 54388829 - 54389146
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54388829 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggcgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 54388928  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54388929 cccagacatccgactgattttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 54389028  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389029 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 54389128  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  54389129 tccgaggcctgcaaatga 54389146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 34048129 - 34048446
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048129 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 34048228  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  34048229 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgattttcgcactcacacgcttaaggcggtagcttggggtg 34048328  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34048329 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 34048428  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  34048429 tccgaggcctgcaaatga 34048446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2272405 - 2272088
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2272405 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 2272306  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2272305 cccagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgctttccattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgatcggggtg 2272206  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcgga-------tggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||       |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2272205 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 2272106  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    | |||| |||||||||||    
T  2272105 tttgaggcctgcaaatga 2272088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47071529 - 47071219
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47071529 ggttttctggtattctgactggattatatgcggcgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagaggattttgaggcagtacggatacgtccagaccatc 47071430  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  | | | ||||    
T  47071429 cccagacatccgacggatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgtaggcgttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggctgattgaggtg 47071330  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||||||||||||| |||     
T  47071329 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcactcttggatcttgccacctttaccaggagatcttccgagg 47071230  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  47071229 cctgcaaatga 47071219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 36130189 - 36130506
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36130189 ggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatc 36130288  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36130289 cccagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtg 36130388  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| ||||||||||       ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  36130389 agcaggcaggagagcatacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctccctggagatct 36130488  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  36130489 tccgaggcctgcaaatga 36130506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4005758 - 4005443
Alignment:
Q  2 gttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcc 101  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4005758 gttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacatgcagaccatcc 4005659  T
Q  102 ccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtga 201  Q
    | |||||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||| |||| || | |||||||    
T  4005658 ctagacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaagcgg-cgattggggtga 4005560  T
Q  202 gcaggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 294  Q
    | ||||||||||| | ||||||||       ||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||  ||||||||    
T  4005559 gtaggcaggagagcagacatggcggatggctgatggctatatgctatggtacactagggtgtctcaccctcatactttgccacctctccctagagatctt 4005460  T
Q  295 ctgagccctgcaaatga 311  Q
    | ||| |||||||||||    
T  4005459 ccgaggcctgcaaatga 4005443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 599583 - 599888
Alignment:
Q  13 ttctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccg 112  Q
    |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  599583 ttctggctggattatgtgtggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatcctcagacatctc 599682  T
Q  113 actgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggag 212  Q
    || ||||||   || || |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  599683 acggatgttgtagagctgccattgccttacattgtgcaggtgttcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggtggacgattggggtgagcaggcaggag 599782  T
Q  213 aggatacatggcggatggct-atgtc------ctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgc 305  Q
    || |  |||||||||||||| ||| |      || ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||| ||| |||||    
T  599783 agcagtcatggcggatggctgatggctattagctatggtacactaggatgtctcaccctcagatttcgccacctcttcctggagatcttccgaggcctgc 599882  T
Q  306 aaatga 311  Q
    ||||||    
T  599883 aaatga 599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 41614973 - 41615282
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  41614973 ggttttatggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagagggtc 41615072  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||| | | ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| || | ||||||    
T  41615073 cctagacatctggcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttagggcggccgat-ggggtg 41615171  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||     
T  41615172 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttacaggagatcttccgagg 41615271  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  41615272 ccagcaaatga 41615282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17562686 - 17562375
Alignment:
Q  7 ctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccaga 106  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||    
T  17562686 ctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtccctaga 17562587  T
Q  107 catccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcagg 206  Q
    |||| | | ||||||   || ||  || || |||  |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  17562586 catctgtcggatgttgtagagctgtcatcgtcttagattgtgcagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcagg 17562487  T
Q  207 caggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgag 299  Q
    |||||||| | ||||||||       ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||    
T  17562486 caggagagcagacatggcgtatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatctcgccatctcttccaggagatcttccgag 17562387  T
Q  300 ccctgcaaatga 311  Q
     || ||||||||    
T  17562386 gccagcaaatga 17562375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 44232422 - 44232732
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  44232422 ggttttctggtattcaggctggattatgtgtggtgttcatagggtgtactgtcactttttcgagagggttttgaggcagtgcggatacgtccagaccgtc 44232521  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||| ||| ||||||   || || |||||||||   ||| ||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  44232522 cccagacatctgacagatgttgtagagctgccaccgcctcagattatgcagatattcgtcggcttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 44232621  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||     
T  44232622 agcaggcaagagagcatacatggctgatgacaatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctttcaggagatcttccgagg 44232721  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  44232722 ccagcaaatga 44232732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 311
Target Start/End: Original strand, 9473034 - 9473300
Alignment:
Q  52 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||    | || |||||| ||  |||||| |||    
T  9473034 tcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtccccagacatccgatcgatgttgtacagctgccaccgtctcacattgtccag 9473133  T
Q  152 atgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggt 244  Q
      ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||||    
T  9473134 gcgttcgtcgacttccgcactcagacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcaggagaggagacatgacggatggcggatggctatgtcctatggt 9473233  T
Q  245 acagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9473234 acactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 9473300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 299
Target Start/End: Original strand, 20353247 - 20353550
Alignment:
Q  3 ttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 102  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20353247 ttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagaggggtttgaggcagtacggatacgtccagacgatccc 20353346  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
     ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   | |||||||   |||||||||||   |||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  20353347 tagacatccgacggatgttgtagagctaccaccgcctcagactgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttaaggcggccgattggggtgag 20353446  T
Q  203 caggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    |||||||||||| | ||       |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || || |||||||||    
T  20353447 caggcaggagagcagacatggctgatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagatttttccacctctttcacgagatcttc 20353546  T
Q  296 tgag 299  Q
    ||||    
T  20353547 tgag 20353550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 311
Target Start/End: Original strand, 42759369 - 42759676
Alignment:
Q  4 tttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccc 103  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||     
T  42759369 tttctggtattcaggctgaattatgtgcggtgttcgtagggtgtagcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacatccagagcgtccct 42759468  T
Q  104 agacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagc 203  Q
    |||||||||||  |||||   || || |||||||||   ||||||||    |||||||||||  |||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  42759469 agacatccgacgaatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcatgcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggtggtcgattggggtgagc 42759568  T
Q  204 aggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccct 303  Q
    || ||  |||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||     
T  42759569 agacacaagagcagacatggcggatggctatgttttatggtacactaaggtgtctcaccctcaaattttgccacctcttctaagagatcttccgaggcca 42759668  T
Q  304 gcaaatga 311  Q
    ||||||||    
T  42759669 gcaaatga 42759676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Original strand, 16646216 - 16646516
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  16646216 ttctggtattctggctg-attatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcactttcccgatagggttttgaggcagtacggatacatccagaccatcccaa 16646314  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||| ||   |||||   ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16646315 gacatctgaagtatgttgtagacctgccaccgccttacattatgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagacgattggggtgagca 16646414  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctg 304  Q
      || | | ||    |||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||    
T  16646415 cacatg-gcgg----atggcggatgactatgtgctatggtaaactagggtgtctcaccctttgattttgccacctcttccaggagatcttccgagacttg 16646509  T
Q  305 caaatga 311  Q
    |||||||    
T  16646510 caaatga 16646516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 48565580 - 48565890
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||||||| || || |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||    
T  48565580 ggttttctggtgttcaggctagattatgtgtggtgttcgtagggtgtactgtcacttacccgagcgggttttgaggcagtacagatacgtccagagcgtc 48565679  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
       ||||||||||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||   ||||||    
T  48565680 tttagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggtcgaatggggtg 48565779  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||||||  |||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||     
T  48565780 agcaggcacaagagcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactgaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccagaagatcttccgagg 48565879  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  48565880 ccagcaaatga 48565890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 49266718 - 49266417
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  49266718 ggttttctggtatttaggctggattatgtgaggtggtcgtagggtctaccgtcatttgcccgagagggttttgaggcagtacggagacgtccagaccgtc 49266619  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||| ||||| ||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |  |||||    
T  49266618 cccaaacatctgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgactttcgcactcacacgcttaaggtggccgattagggtg 49266519  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatgg-------ctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||       || |||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49266518 agcaggcaggaaagcagacatggcggatggcagatgactgtgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatct 49266419  T
Q  294 tc 295  Q
    ||    
T  49266418 tc 49266417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 230
Target Start/End: Original strand, 50758807 - 50759032
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  50758807 ttctggtattcaggctggattatgtgcggtgattgtagggtgtaccgtcacttgaccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtcccta 50758906  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  50758907 gacatccgccggatgttgtagagctgtcaccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagca 50759006  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatgg 230  Q
     ||||||||| | |||||||| ||||    
T  50759007 tgcaggagagcagacatggcgtatgg 50759032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 291
Target Start/End: Original strand, 48891225 - 48891518
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  48891225 ttctggtattcaggctggattatatgcagtgttcgtaaggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtcccta 48891324  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||  || || ||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | || |||||||    
T  48891325 gacatccgtcggatgttgtagagctgtcatcggctgagattgtgcagactttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggagtgagca 48891424  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagat 291  Q
     ||| ||||| |  |||||||       ||||||||||| |  |||||||     ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48891425 tgcatgagagcaggcatggcgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccgttgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagat 48891518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50214428 - 50214199
Alignment:
Q  82 cggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgctt 181  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||    | ||  ||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||   |||||||||||||    
T  50214428 cggatacgtccagaccgtccccagacatccgacggatattgtaaagctgtcaccgcctcacattgtgtaggcgttcgtcgacttcctcactcacacgctt 50214329  T
Q  182 aaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctat 281  Q
    ||| ||  || | |||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  50214328 aagacgaccgattggggtgagcagctaagagagcagacatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgccacctct 50214229  T
Q  282 tccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  50214228 tccaggagatattccgaggccagcaaatga 50214199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 51807880 - 51807976
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagacc 97  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51807880 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagacc 51807976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2648698 - 2648608
Alignment:
Q  221 tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2648698 tggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgaggcctgcaaatga 2648608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52388820 - 52388630
Alignment:
Q  128 ctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcgga 227  Q
    |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  52388820 ctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtgagcaggcaggagagtagacatggcgga 52388721  T
Q  228 t-------ggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |       |||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    |||||||||| ||| |||||||||||    
T  52388720 tggctgatggctatatgctatggtagactagggtgtctcaccctcagattttgccacctctcaatggagatcttccgaggcctgcaaatga 52388630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42805306 - 42804993
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  | || |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |    
T  42805306 ttctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcatacggtgcaccgtcactagcccgagaggattttgaggcagtacagatacgttcggaccgtcccta 42805207  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||   |||| ||   |||||||||   |||||||||||  ||||||  ||||||||||||| || | ||||||||||    
T  42805206 gacatccgtcggatgttgtagagctgttaccggctcagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcgtacgcttaaggcgggcgattggggtgagca 42805107  T
Q  205 ggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctg 297  Q
     ||| ||||||| ||       ||||| ||||||||||| |  |||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  42805106 tgcatgagaggagacatggtgtatggcagatggctatgtacgatggtacaccattgtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaggagatattctg 42805007  T
Q  298 agccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||    
T  42805006 aggcctccaaatga 42804993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52388921 - 52388827
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 95  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  52388921 ggttttctggtattctggctggataatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggtagtatagatacgtgcaga 52388827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 6927989 - 6928146
Alignment:
Q  155 ttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgt-cctgtggtacagtaggg 253  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||   |||| | |||||||||||||||||||   | ||||||| || ||    
T  6927989 ttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcaggcgcaagagcagacatggcggatggctatgtgtttatggtacactaagg 6928088  T
Q  254 tgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||    
T  6928089 tgtgtcaccctcaaattttgccacctctttcaggagatcttccgaggccagcaaatga 6928146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30253436 - 30253256
Alignment:
Q  8 tggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagac 107  Q
    |||||||| || ||||||||||| || |  |  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||| |||| ||||    
T  30253436 tggtattcaggctggattatgtgtggtgatcagagggtataccgtcacttgctcgagagggttttgaggcagtacagatacatccaaaccgtccctagac 30253337  T
Q  108 atccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcgg 188  Q
    ||||| | ||||||   || ||  ||| ||||   ||||||||| | ||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30253336 atccgtcggatgttgtagagctgtcactgcctgagattgtgcaggttttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcgg 30253256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 3495590 - 3495550
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgta 41  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3495590 ggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgta 3495550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 15833960 - 15834277
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15833960 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 15834059  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834060 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 15834159  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15834160 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 15834259  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||    
T  15834260 tctgaggcctgcaaatga 15834277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30494314 - 30493997
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494314 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 30494215  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494214 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 30494115  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30494114 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 30494015  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  30494014 tccgaggcctgcaaatga 30493997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 17423170 - 17423487
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423170 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 17423269  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17423270 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtg 17423369  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat-------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17423370 agcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 17423469  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  17423470 tccgaggcctgcaaatga 17423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 43981225 - 43981542
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981225 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 43981324  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981325 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 43981424  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat-------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43981425 agcaggcaggagaggatacatggcgggaggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 43981524  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  43981525 tccgaggcctgcaaatga 43981542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 5354675 - 5354992
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5354675 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgtagaccatc 5354774  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354775 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcatcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 5354874  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5354875 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 5354974  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  5354975 tccgaggcctgcaaatga 5354992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43537057 - 43536740
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43537057 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacatgcagactatc 43536958  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536957 cccagacatctgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 43536858  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43536857 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcagatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagtagatct 43536758  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  43536757 tccgaggcctgcaaatga 43536740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 28471232 - 28471549
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28471232 ggttttttggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggtagtacagatacgtgcagaccatc 28471331  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28471332 cccagacatccgactgatgttagggatctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtg 28471431  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat-------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28471432 agcaggtaggagaggatacatggcgggcggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 28471531  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  28471532 tccgagacctgcaaatga 28471549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 45431209 - 45431526
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45431209 ggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtatggatacgtgcagaccatc 45431308  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45431309 cccagacatcctactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcaggtgttcgtcaacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtg 45431408  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45431409 agcaggcaggaaaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccaccttttctaggagatct 45431508  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  45431509 tccgaggcctgcaaatga 45431526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 39950198 - 39950515
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39950198 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatc 39950297  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    | |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39950298 cgcagacatccgactgatgttgcagacctcccaccgccttacattgtacaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtg 39950397  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||       |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39950398 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 39950497  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  39950498 tccgaggcctgcaaatga 39950515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10826264 - 10825954
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10826264 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatc 10826165  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    | |||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  10826164 cgcagacatccgacggatgttgtagacctgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacatgcttaaggcggacgattggggtg 10826065  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||     
T  10826064 agcaggcagaatagcagacatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatattccgagg 10825965  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  10825964 cctgcaaatga 10825954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 7189517 - 7189818
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7189517 ggttttctggtattctgactggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatc 7189616  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  7189617 cccagacatccgactgatgttgtagacctcccactgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgtactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 7189716  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatgg-------cggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||||||       ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7189717 agcaggcaggagagcagacatggctgatgacggatggctatatgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctctttcaggagatct 7189816  T
Q  294 tc 295  Q
    ||    
T  7189817 tc 7189818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29398958 - 29398641
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29398958 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgttacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtcctgaccatc 29398859  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29398858 cccagacatccgacggatgttgtagacttgccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgattggggtg 29398759  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatgg-------ctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||       |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||| ||||    
T  29398758 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgtcatctcttccaggaaatct 29398659  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||  || |||||||||||    
T  29398658 tcctaggcctgcaaatga 29398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 22680223 - 22680351
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22680223 ggttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccat- 22680321  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22680322 cccagacatccgactgatgttagggacctc 22680351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36653849 - 36653548
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  36653849 ggttttttggtattcaggttggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgtccgagagggttttgaggcagtacagatacgtccagaccgtc 36653750  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||    ||||| ||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  36653749 cccagacatccgaccgatgttgtagagctgtcaccgcctcagtttgtgaaggcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 36653650  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatgg-------cggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||| |||||||| | ||||||       |||||||||||||  | ||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36653649 agcagacaggagagcagacatggtggatgacggatggctatgtgttatggtatactcgggtgtctcgccctcagattttgccacctcttccaggagatct 36653550  T
Q  294 tc 295  Q
    ||    
T  36653549 tc 36653548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 7416490 - 7416709
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||   |  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |    
T  7416490 ttctggtattcaggctggattatgtgcaatgatcgtaaggtgcaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatatgtccagaccgtcccta 7416589  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||  ||||| ||   |||||||| |  ||| |||||||  ||||||||||||||||||| | || | | ||||||||    
T  7416590 gacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgactgagattgtgcatactttcttcgacttccgcactcacacgcttaaggcagccgattgcggtgagca 7416689  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggc 224  Q
     ||||||||||| |||||||    
T  7416690 tgcaggagaggagacatggc 7416709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Original strand, 40538250 - 40538464
Alignment:
Q  8 tggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagac 107  Q
    |||||||| || |||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  40538250 tggtattcaggctggattatgtgcgatgatcgtagggtgcaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccatccctagac 40538349  T
Q  108 atccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggc 207  Q
    ||| |   || |||   || ||  ||||| ||   |||||| ||   || ||||||||   |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||    
T  40538350 atctgttggaggttgtagagctgtcaccggctgagattgtgtaggcttttgtcgacttccacactcacacgcttaaggcggccgattggggtgagcatgc 40538449  T
Q  208 aggagaggatacatg 222  Q
    ||||||||| |||||    
T  40538450 aggagaggagacatg 40538464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20067584 - 20067509
Alignment:
Q  220 atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  20067584 atggaggatggctatgtaatatggtacattagggtgtctcaccctctgattttgccacttcttctaggagatcttc 20067509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22529949 - 22529914
Alignment:
Q  253 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagga 288  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22529949 gtgtctcaccctcagattttgccacctattccagga 22529914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 40538488 - 40538546
Alignment:
Q  253 gtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||    
T  40538488 gtgtctcaccctcagattttgccacttcttccaagagatattctgaggcctccaaatga 40538546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 26878420 - 26878730
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26878420 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgagacagtacggatacgtgcagaccatc 26878519  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26878520 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggaagctcggggtg 26878619  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  26878620 agcaagcaggagaggatacatggcgaatggctatgtcctgtggtacactggggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagtagatcttctgagg 26878719  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  26878720 cctgcaaatga 26878730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3729697 - 3729379
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729697 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 3729598  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccg-ccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729597 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgcccttccattgtgcagatgttcgttgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggt 3729498  T
Q  200 gagcaggcaggagaggatacatgg-------cggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 292  Q
    ||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3729497 gagtaggcaggagaggatacatggcgggtgacggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 3729398  T
Q  293 ttctgagccctgcaaatga 311  Q
    ||| ||| |||||||||||    
T  3729397 ttccgaggcctgcaaatga 3729379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13637353 - 13637036
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13637353 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccatcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatc 13637254  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637253 cccagacatccgactgatgttagggagctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 13637154  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13637153 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 13637054  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||    
T  13637053 tctgaggcctgcaaatga 13637036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 95442 - 95132
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  95442 ggttttctggtattctggctggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgatagggttttgaggcagtacggatatttccagaccatc 95343  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  95342 cccagacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggatgattggggtg 95243  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  95242 agcagacaggagagtagacatggcggatggctatgtcctatagtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatcttctgagg 95143  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  95142 cctgcaaatga 95132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31781005 - 31780697
Alignment:
Q  3 ttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 102  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31781005 ttttctggtattctggttggattatgtgcggtgtctgtagggtgtaccatcacttgcccgagagggttatgaggcagtacggatacgtccagaccatccc 31780906  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
    || ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  31780905 caaacatccgactgatgttgtagacctcccaccgccttacattgtgcagacgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtgag 31780806  T
Q  203 caggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccc 302  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||    
T  31780805 taggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccagcagatcttccgaggcc 31780706  T
Q  303 tgcaaatga 311  Q
    |||||||||    
T  31780705 tgcaaatga 31780697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 22526706 - 22527016
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22526706 ggttttctagtactctggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 22526805  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||| || | ||||||    
T  22526806 cccagacatccgaccgatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgccctcacacgcttaaggcggccgattggggtg 22526905  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22526906 agcaggcaggagagcaaacatggcggatggctatgtcctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttccgagg 22527005  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  22527006 cctgcaaatga 22527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 19158724 - 19159041
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19158724 ggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcactttcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 19158823  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||| |||||| || ||||||   || |||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  19158824 cccaaacatcccacggatgttgtagagctcccactcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtc 19158923  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat-------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19158924 agcaggcaggagaggagacatggcggacggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 19159023  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  19159024 tccgaggcctgcaaatga 19159041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19522624 - 19522331
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19522624 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtatcgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 19522525  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||| |||| ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||  || |||||||||||||||| | || | ||||||    
T  19522524 cccagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcaacttccgccctcacacgcttaaggcagccgattggggtg 19522425  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 294  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19522424 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatctt 19522331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 52804571 - 52804888
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  52804571 ggttttctggtattatgcttggattatgtgaggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 52804670  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || || |||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||  | | ||||||    
T  52804671 cccagacatccgacggatgttgtagagctgccactgcctcacattgtgcagacgttcgtcgacttccacactcacacacttaaggcggctgattggggtg 52804770  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatgg-------cggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||||||       ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| |    
T  52804771 agcaggcaggagagcagacatggaggatgacggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccagctcttccagtagatat 52804870  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  52804871 tccgaggccagcaaatga 52804888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 47505045 - 47505344
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||    
T  47505045 ggttttctggtaatcaggctggattatgtgcggtgttcgt-gggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacaaatacgtccagactgtc 47505143  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||| ||||||   || |   ||||||||   |||||||||   |||||||||||  || |||||||||||||||||| || | ||||||    
T  47505144 cccagacatccgacggatgttgtagagcgatcaccgcctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccgcgctcacacgcttaaggcggccgattggggtg 47505243  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||| | ||||||||       ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47505244 agcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 47505343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Original strand, 47660580 - 47660893
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   |||| |    
T  47660580 ttctggtattcaggctggattatctgcggtgtttgtagggtgtaccgtcacttacccgagagggttttgaggaagtacggatacgtccagagggtcccta 47660679  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||| |||  |||||   || ||  |||| |||   |||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||| || || | |||||||||     
T  47660680 gacatcggacgaatgttgtagagctgacaccacctcagattgtgcaggcattcgtcgacttctgcactcacacgcttaaggtggccgattggggtgagcc 47660779  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatgg-------ctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctg 297  Q
    | || ||||| | |||||||||||||       ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  47660780 gacacgagagcagacatggcggatggcggatgactatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttctg 47660879  T
Q  298 agccctgcaaatga 311  Q
    || || ||||||||    
T  47660880 aggccagcaaatga 47660893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 11196566 - 11196883
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  11196566 ggttttttggtattcaggctggattatgtgcggtattcgtagggtgtaccgtcacttgtctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccagatgatc 11196665  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || |||||||||||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||||  |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||| || |  |||||    
T  11196666 cctagacatccgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcagacattcgtcgatttccgcactcacatgcttaaggcggccgattagggtg 11196765  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||| |||| | ||||| |       ||| ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||    
T  11196766 agcaggcagcagagcagacatgtcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcgtattttgccacctctttcaggagatct 11196865  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  11196866 tccgaggccagcaaatga 11196883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 45828280 - 45828596
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| || | | ||    
T  45828280 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtataccgtcacttgcccaagagggttttgaggtagtacaaatacgttcatagcgtc 45828379  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || |||||||| || ||||||   || || |||| ||||   |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  45828380 cctagacatcctacagatgttgtagagctgccactgcctcagattgtgcag-cattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 45828478  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||  |||| | |||||||       ||||||||||||  | ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  45828479 agcaggcacaagagcagacatggcgaatggaggatggctatgtgttatggtacactaaggtgtttcaccctcagattttgccacctctttcatgagatct 45828578  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    | |||| || ||||||||    
T  45828579 tatgaggccagcaaatga 45828596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 131 - 311
Target Start/End: Original strand, 21143770 - 21143950
Alignment:
Q  131 ccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatgg 230  Q
    |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||||| || || | |||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||    
T  21143770 ccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacacttaaggtggccgattggggtgagcaagcagaagagcagacaaggcggatgg 21143869  T
Q  231 ctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||    
T  21143870 ctatgtgctatggtacacttgggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagttcttccgaggccagcaaatga 21143950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 50341496 - 50341407
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgt 90  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50341496 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgt 50341407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 49855365 - 49855140
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |    
T  49855365 ttctggtattcaagttggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtgacttgcccgagaggg-tttgaggcactacagatacgtccagaccgtcccta 49855267  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||| | | ||||||   || ||  ||||| ||   ||||||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||    
T  49855266 gacatctgtcggatgttgtagagctgtcaccggctcaaattgtgcagactttcgtcgacttgcgcactcacacacttaaggcggccgattggggtgagca 49855167  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||    
T  49855166 tgcaggagagcagacatggcgtatggc 49855140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 21143683 - 21143763
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagta 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143683 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagta 21143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38120475 - 38120288
Alignment:
Q  38 cgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| ||||||   || ||  ||| ||    
T  38120475 cgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacggatacgtccagacgatccctaaacatctgacggatgttgtagagctgacactgc 38120376  T
Q  138 cttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcg 225  Q
    ||   |||||||||   |||||||||||   ||||||||||||| |||| | || | |||||||||||| || |||| | ||||||||    
T  38120375 ctcagattgtgcaggcattcgtcgacttccacactcacacgcttcaggccgccgattggggtgagcaggtagcagagcagacatggcg 38120288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 35256610 - 35256520
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcaga 95  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  35256610 ttctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcctgagagagttttgagacagtacggatacgttcaga 35256520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 195 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50618052 - 50617929
Alignment:
Q  195 ggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggc-------tatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 287  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  50618052 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 50617953  T
Q  288 agatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||||| ||| || ||||||||    
T  50617952 agatcttccgaggccagcaaatga 50617929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23273499 - 23273427
Alignment:
Q  220 atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatc 292  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  23273499 atggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatc 23273427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16269977 - 16269827
Alignment:
Q  168 gcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatg-------gctatgtcctgtggtacagtagggtgtctca 260  Q
    |||||||||||||||||| |  |  | ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||       |||||||  | ||||||| || | |||||||    
T  16269977 gcactcacacgcttaaggagcccaattggggtgagccggcaggagagcagacatggcggatgagggatcgctatgtgttatggtacactacgatgtctca 16269878  T
Q  261 ccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  16269877 cccttagattgtgccacctcttccaggagatcttgtgaggccagcaaatga 16269827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23273603 - 23273541
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccga 63  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  23273603 ggttttttggtattccggctggattatatgcggtgttcgtagggtctaccgtcacttgcccga 23273541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19038516 - 19038199
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038516 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 19038417  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19038416 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttcggcactcacacgcttaaggcggacgcccggggtg 19038317  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacat-------ggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19038316 agcaggcaggagaggagacatggcgggcggcggatggctatgtcctgtggtacgctagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 19038217  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  19038216 tccgaggcctgcaaatga 19038199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28239086 - 28238769
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28239086 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgcccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 28238987  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28238986 cccagacatccgactgatgttagggacctccccccgccttccattgtgcagatgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggacgctcgaggtg 28238887  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatg-------gcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238886 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctggggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 28238787  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| |||||||||||    
T  28238786 tccgaggcctgcaaatga 28238769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Original strand, 28879304 - 28879619
Alignment:
Q  3 ttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 102  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28879304 ttttctggtattcaggctggatcatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 28879403  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  28879404 cagacatccgattgatgttagggacctcccaccgtcttccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcgggatgag 28879503  T
Q  203 caggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  28879504 caggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcctgtggtacactagggtgtctcaccctcagatctttccacctctttcaggagatcttc 28879603  T
Q  296 tgagccctgcaaatga 311  Q
     ||| |||||||||||    
T  28879604 cgaggcctgcaaatga 28879619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 30707751 - 30708066
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707751 ggttttctggtattatgggtggattatgtgtggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 30707850  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30707851 cccagacatccgactgctgttagggacctcccaccgtcttccattatgcaggtgttcgttgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtg 30707950  T
Q  201 agcaggcaggagaggataca-------tggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30707951 agcaggcaggagaggatacatggcgggtggcggatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 30708050  T
Q  294 tctgagccctgcaaat 309  Q
    || ||| |||||||||    
T  30708051 tccgaggcctgcaaat 30708066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8577892 - 8577575
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577892 ggttttctggtattctgggtggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 8577793  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||| || ||||||   ||  |||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  8577792 cccagacatcccacggatgttgtagagatcccattcccttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgattaaggcggacgatcggggtc 8577693  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcg-------gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||       |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8577692 agcaggcaggagaggagacatggcggacggcagatggctatgtcatatggtacactagggtgtctcaccctcagatcttgccacctcttccaggagatct 8577593  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    |||||| |||||||||||    
T  8577592 tctgaggcctgcaaatga 8577575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 7760041 - 7760351
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  7760041 ggttttctggtattcttgatggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtgcgaatacgtccagaccatc 7760140  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    ||||||||||  || ||||||   ||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  7760141 cccagacatctaacggatgttgtagacctgccaccgctttacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 7760240  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  7760241 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcaccctcaaatcttgtcacctcttccaggagatcttctgagg 7760340  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    |||||||||||    
T  7760341 cctgcaaatga 7760351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9006 - 8739
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9006 ggttttctggtattttggctggattatgtgcggtgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacagatacgtgcagaccatc 8907  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8906 cccagacatccgactgatgttagggacctcccgccgcctcccattgtgcaggtgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcagacgatcggggtg 8807  T
Q  201 agcaggcaggagaggatac-------atggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcac 261  Q
    |||||||||||||||| ||       ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8806 agcaggcaggagaggagacatgacggatgacggatgactatgtcctatggtacactagggtgtctcac 8739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38408197 - 38407903
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  38408197 ggttttctggtattctggctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagaccgtc 38408098  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    |||| |||||  || ||||||   || || |||||||||  ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  38408097 cccatacatctaacggatgttgtagagctgccaccgcctcacattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcggccgattggggtg 38407998  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38407997 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgctatggtacactagggtgtctcacccttagatcttgccacctcttccaggagatcttc 38407903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 511956 - 511646
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  511956 ggttttctggtattcatgctggattatgtgcggtgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagagcgtc 511857  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || |||||| |||| ||||||   || || |||||||||   ||||| |||   ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| || | ||||||    
T  511856 cctagacattcgacggatgttgtagagctgccaccgcctcagattgtacaggcattcatcgacttccgcactcacacgtttaaggcggccgattggggtg 511757  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  511756 agcaggcacaagagaatacatggcagatggctatgtgttatggtacactaaggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttccgagg 511657  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  511656 ccagcaaatga 511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 5199471 - 5199781
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||    
T  5199471 ggttttctggtattcaggctgaattatgtgcgatgttcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtccagagggtc 5199570  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || | | ||||    
T  5199571 cctagacatccgacggatgttgtagagctgtcaccgcctcaaattgtgtaggcattcgtcgacttccgcactcacacgtttaaggcggccgattgaggtg 5199670  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttctgagc 300  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||     
T  5199671 agcaggcaggagagcagacatggcggatggctatgtgttatggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccatctcttctaggagatcttccgagg 5199770  T
Q  301 cctgcaaatga 311  Q
    || ||||||||    
T  5199771 ccagcaaatga 5199781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 311
Target Start/End: Original strand, 42538497 - 42538814
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||    
T  42538497 ggttttctggtattcaggctggattatgtgcggtgttcatagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacgaatatgtccagagcgtc 42538596  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || ||||||||||| ||||||   || || ||||| |||   |||||||||   || ||||||||  |||||||||||||||  |||  || | ||||||    
T  42538597 cctagacatccgacggatgttgtagagctgccaccacctcagattgtgcaggcatttgtcgacttccgcactcacacgcttacagcgaccgattggggtg 42538696  T
Q  201 agcaggcaggagag-------gatacatggcggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatct 293  Q
    ||||||||  ||||       |||| |||| ||||||||||||  | ||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  42538697 agcaggcacaagagcagatatgatagatggtggatggctatgtgttatggtacactaaagtgtttcaccctcagattttgccacctcttccaggagatct 42538796  T
Q  294 tctgagccctgcaaatga 311  Q
    || ||| || ||||||||    
T  42538797 tccgagaccagcaaatga 42538814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 42937990 - 42937708
Alignment:
Q  1 ggttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatc 100  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||    
T  42937990 ggttttctggttttcaggctggatcatgtgcggtgttcgtagggtgttc-gtcacttgcccgagggggttttgaggcagtacagatacgtccagactgtc 42937892  T
Q  101 cccagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtg 200  Q
    || || |||| ||| ||||||   || || |||||||||   |||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||    
T  42937891 cctaggcatctgacggatgttgtagagcttccaccgcctcatattgtgcaggcgttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccgattggggtg 42937792  T
Q  201 agcaggcaggagaggatacatggcggatggctatgtcctgt-ggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    |||||            ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42937791 agcag------------acatggcggatggctatgtgctatgggtacactagggtgtctcaccctcagattttgccacctcttccaggagatcttc 42937708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8699775 - 8699555
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||| |    
T  8699775 ttctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtctagaccgccccta 8699676  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||  | ||| ||   |||||||||   |||||||||||  |||||||||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  8699675 gacatccgtcggatgttgtagagctgtcgccggctgagattgtgcaggctttcgtcgacttccgcactcacacgcttgaggaggccgattggggtgagca 8699576  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcg 225  Q
     ||||||||| | ||||||||    
T  8699575 tgcaggagagcagacatggcg 8699555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 295
Target Start/End: Original strand, 38970752 - 38971046
Alignment:
Q  8 tggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccccagac 107  Q
    |||||||| || |||||||| ||| | || | || |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||  |||||  |||    
T  38970752 tggtattcaggctggattatttgcagtgttcataaggtgtaccgtcacttgcctgagagggtgttgaggcagtacagatacgtacagaagatccctggac 38970851  T
Q  108 atccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagcaggc 207  Q
    ||| |||  |||||   || ||  |||||||||  ||||||||    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| |    
T  38970852 atctgacgaatgttgtagagctgacaccgccttagattgtgcaagcattcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggcgaccgattggggtgagcagac 38970951  T
Q  208 aggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    || |||| | |||||||       ||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  38970952 agcagagcagacatggcgtatgagggagggctatgtgttgtggtacactaaggtgtctcaccctcagatttttccacctcttccaggagatcttc 38971046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 311
Target Start/End: Original strand, 15939351 - 15939666
Alignment:
Q  3 ttttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatccc 102  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  15939351 ttttctagtattcaggatgaattatgtgtggtgttcgtagagtgtactgtcatctgctcaagaggattttgaggcagtacggatatgtccagacggtccc 15939450  T
Q  103 cagacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgag 202  Q
     |||||||||| |||||||   || || |||||||||   |||||||||   || ||||||||  |||||||||||||||||| |  || | ||| ||||    
T  15939451 tagacatccgattgatgttgttgagctgccaccgcctcatattgtgcaggcttttgtcgacttccgcactcacacgcttaaggagaccgattgggatgag 15939550  T
Q  203 caggcaggagaggatacatggc-------ggatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatcttc 295  Q
    ||||||| |||| | ||| |||       ||| ||||||||  | ||||||| || | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||     
T  15939551 caggcagtagagcagacaaggcgtatgagggagggctatgtgttatggtacactaagttgtctcacccttagattttgccacctcttccaggatatcttt 15939650  T
Q  296 tgagccctgcaaatga 311  Q
     ||| || ||||||||    
T  15939651 cgaggccagcaaatga 15939666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 12058 - 12284
Alignment:
Q  5 ttctggtattctggatggattatgtgcggcgtccgtagggtgtaccgtcacttgcccgagagggttttgaggcagtacggatacgtgcagaccatcccca 104  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |    
T  12058 ttctggtattcaggctggattatgtgcggtgatcgtagggtgtaccgtcatttgctcgagagggttttgaggcagtacgaatacgtcctgaccatcccta 12157  T
Q  105 gacatccgactgatgttagggacctcccaccgccttccattgtgcagatgttcgtcgactttggcactcacacgcttaaggcggacgctcggggtgagca 204  Q
    |||||||| | ||||||   || ||  ||||||||   |||||| ||   |||||||||||  |||||||||||||||||| || || | ||||||||||    
T  12158 gacatccgtcggatgttgtagagctgtcaccgcctcagattgtgtagtctttcgtcgacttccgcactcacacgcttaaggaggtcgattggggtgagca 12257  T
Q  205 ggcaggagaggatacatggcggatggc 231  Q
     ||||||||| | |||||||| |||||    
T  12258 tgcaggagagcagacatggcgtatggc 12284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Original strand, 56476 - 56579
Alignment:
Q  195 ggggtgagcaggcaggagaggatacatggcggatggc-------tatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccagg 287  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||       ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  56476 ggggtgagcaggcaggagagcagacatggcggatggcagatgactatgtgctatggtacaccagggtgtctcaccctcagatcttgcaacctcttccagg 56575  T
Q  288 agat 291  Q
    ||||    
T  56576 agat 56579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22411 - 22343
Alignment:
Q  226 gatggctatgtcctgtggtacagtagggtgtctcaccctcagatcttgccacctattccaggagatctt 294  Q
    ||||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| ||||||||||    
T  22411 gatggctatatactatggtacactagggtgtctcaacctctgattttgccacttcttctaggagatctt 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University