View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1204_low_59 (Length: 359)

Name: NF1204_low_59
Description: NF1204
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1204_low_59
NF1204_low_59
[»] chr3 (129 HSPs)
chr3 (5-341)||(50493877-50494213)
chr3 (5-341)||(6063489-6063827)
chr3 (22-341)||(6065839-6066159)
chr3 (23-293)||(35777317-35777587)
chr3 (50-341)||(455826-456121)
chr3 (50-341)||(458203-458498)
chr3 (23-341)||(3859424-3859741)
chr3 (5-341)||(38889917-38890254)
chr3 (24-341)||(38210265-38210584)
chr3 (23-340)||(5191549-5191865)
chr3 (5-341)||(25388776-25389119)
chr3 (50-341)||(746674-746971)
chr3 (50-341)||(4103939-4104233)
chr3 (50-341)||(4308324-4308615)
chr3 (50-341)||(10621573-10621876)
chr3 (23-341)||(18099213-18099531)
chr3 (23-341)||(11170300-11170618)
chr3 (23-303)||(22114387-22114666)
chr3 (117-341)||(28413075-28413299)
chr3 (23-341)||(45882835-45883153)
chr3 (57-303)||(6561740-6561985)
chr3 (23-299)||(18096986-18097262)
chr3 (50-341)||(43228214-43228505)
chr3 (23-341)||(5522670-5522976)
chr3 (50-341)||(43226009-43226299)
chr3 (23-303)||(10958405-10958684)
chr3 (51-303)||(43423545-43423796)
chr3 (23-341)||(10956070-10956388)
chr3 (23-303)||(32264121-32264404)
chr3 (23-341)||(10084432-10084754)
chr3 (50-303)||(1313333-1313584)
chr3 (23-288)||(24979603-24979867)
chr3 (50-303)||(53917746-53917998)
chr3 (51-303)||(1626765-1627016)
chr3 (51-303)||(28102084-28102335)
chr3 (23-296)||(18162560-18162831)
chr3 (23-329)||(26720444-26720749)
chr3 (50-303)||(51727089-51727340)
chr3 (51-303)||(3314608-3314859)
chr3 (50-341)||(25533357-25533656)
chr3 (51-293)||(5926856-5927097)
chr3 (50-303)||(53915578-53915830)
chr3 (23-295)||(48361761-48362031)
chr3 (27-288)||(12268061-12268323)
chr3 (50-303)||(27101263-27101519)
chr3 (51-283)||(28100143-28100374)
chr3 (91-341)||(30005805-30006055)
chr3 (52-303)||(43421497-43421747)
chr3 (50-303)||(39715393-39715644)
chr3 (50-295)||(51943294-51943537)
chr3 (91-303)||(42990268-42990479)
chr3 (27-341)||(10191353-10191670)
chr3 (23-296)||(15780756-15781039)
chr3 (51-303)||(880533-880785)
chr3 (50-303)||(35918025-35918283)
chr3 (50-341)||(9604650-9604946)
chr3 (51-303)||(53468538-53468788)
chr3 (51-303)||(36011751-36012002)
chr3 (91-341)||(29956650-29956900)
chr3 (51-288)||(28180948-28181182)
chr3 (50-303)||(28761511-28761762)
chr3 (51-303)||(47148977-47149233)
chr3 (131-341)||(1321483-1321693)
chr3 (51-303)||(54691656-54691906)
chr3 (52-303)||(51674848-51675087)
chr3 (23-296)||(32218991-32219252)
chr3 (52-303)||(23636952-23637198)
chr3 (51-303)||(889855-890104)
chr3 (51-290)||(31151271-31151507)
chr3 (50-260)||(42992205-42992417)
chr3 (23-195)||(11163046-11163218)
chr3 (149-341)||(7606631-7606822)
chr3 (51-276)||(28137415-28137628)
chr3 (50-308)||(23633383-23633634)
chr3 (50-303)||(13420268-13420506)
chr3 (51-301)||(53591119-53591357)
chr3 (50-296)||(53597164-53597404)
chr3 (50-219)||(41849065-41849244)
chr3 (51-303)||(54884081-54884329)
chr3 (140-296)||(6484372-6484528)
chr3 (51-181)||(47701798-47701928)
chr3 (5-105)||(53896475-53896575)
chr3 (188-341)||(5886261-5886412)
chr3 (188-341)||(5899734-5899885)
chr3 (178-303)||(25688243-25688367)
chr3 (52-181)||(27635830-27635959)
chr3 (52-180)||(6231374-6231502)
chr3 (175-303)||(6231849-6231975)
chr3 (134-303)||(17795269-17795433)
chr3 (134-303)||(19103709-19103873)
chr3 (134-296)||(25635391-25635549)
chr3 (50-296)||(1673898-1674140)
chr3 (134-296)||(561866-562024)
chr3 (23-232)||(24177175-24177380)
chr3 (148-303)||(4666535-4666691)
chr3 (191-303)||(11168165-11168276)
chr3 (52-170)||(3306724-3306842)
chr3 (5-99)||(6719396-6719490)
chr3 (57-308)||(36871378-36871624)
chr3 (23-123)||(1321337-1321437)
chr3 (50-268)||(4560401-4560599)
chr3 (5-79)||(5899638-5899712)
chr3 (5-79)||(5886163-5886237)
chr3 (205-303)||(3306839-3306936)
chr3 (236-296)||(24181488-24181548)
chr3 (189-267)||(1620580-1620657)
chr3 (255-303)||(47701753-47701801)
chr3 (50-115)||(6484308-6484373)
chr3 (126-264)||(13419883-13420015)
chr3 (189-303)||(14634524-14634638)
chr3 (134-232)||(25633930-25634024)
chr3 (50-123)||(1618916-1618992)
chr3 (189-267)||(11066652-11066731)
chr3 (251-295)||(27635748-27635792)
chr3 (207-267)||(27762107-27762165)
chr3 (52-99)||(31021431-31021479)
chr3 (204-267)||(10094195-10094256)
chr3 (204-267)||(10201075-10201136)
chr3 (204-267)||(16462203-16462264)
chr3 (204-267)||(22626105-22626166)
chr3 (204-267)||(47883003-47883064)
chr3 (221-267)||(11007633-11007679)
chr3 (23-81)||(13893289-13893347)
chr3 (171-216)||(7606828-7606873)
chr3 (50-79)||(42990205-42990234)
chr3 (51-87)||(4663843-4663879)
chr3 (207-267)||(29914074-29914132)
chr3 (207-267)||(47878292-47878350)
chr3 (207-267)||(54193229-54193287)
[»] chr1 (108 HSPs)
chr1 (5-341)||(16226065-16226401)
chr1 (5-341)||(47179607-47179947)
chr1 (5-341)||(47177256-47177596)
chr1 (23-341)||(51749955-51750273)
chr1 (50-336)||(20302402-20302687)
chr1 (23-341)||(28840594-28840913)
chr1 (23-341)||(6822931-6823248)
chr1 (23-296)||(13214997-13215269)
chr1 (27-339)||(28842413-28842726)
chr1 (50-341)||(9463291-9463588)
chr1 (23-341)||(51752281-51752597)
chr1 (23-341)||(10399875-10400193)
chr1 (23-302)||(15823462-15823740)
chr1 (50-341)||(9459464-9459761)
chr1 (23-339)||(13761753-13762068)
chr1 (23-303)||(38925564-38925843)
chr1 (50-337)||(20291400-20291686)
chr1 (50-341)||(31735568-31735863)
chr1 (51-341)||(2617460-2617750)
chr1 (99-341)||(46431755-46431996)
chr1 (53-341)||(21948235-21948526)
chr1 (23-303)||(39462435-39462714)
chr1 (23-303)||(41646836-41647115)
chr1 (50-341)||(27336987-27337280)
chr1 (23-303)||(6823800-6824087)
chr1 (53-341)||(39932017-39932307)
chr1 (50-341)||(47906207-47906504)
chr1 (50-340)||(27339179-27339472)
chr1 (50-303)||(24325599-24325858)
chr1 (52-303)||(18307054-18307304)
chr1 (50-295)||(12302599-12302848)
chr1 (50-303)||(17324722-17324974)
chr1 (52-296)||(25251368-25251611)
chr1 (51-303)||(50076758-50077009)
chr1 (51-303)||(50078907-50079158)
chr1 (29-303)||(14098056-14098329)
chr1 (51-295)||(50307640-50307884)
chr1 (51-303)||(18839531-18839782)
chr1 (50-295)||(6995794-6996038)
chr1 (50-303)||(16428596-16428848)
chr1 (50-295)||(28998347-28998591)
chr1 (50-295)||(29004063-29004307)
chr1 (51-303)||(17186214-17186465)
chr1 (50-302)||(2510412-2510666)
chr1 (27-303)||(3579702-3579979)
chr1 (91-341)||(15294881-15295131)
chr1 (50-303)||(48665114-48665373)
chr1 (51-303)||(11457561-11457812)
chr1 (23-295)||(28207160-28207431)
chr1 (50-303)||(9241172-9241424)
chr1 (50-295)||(31422967-31423212)
chr1 (51-295)||(50248666-50248909)
chr1 (50-303)||(6756470-6756721)
chr1 (51-303)||(31489859-31490108)
chr1 (72-303)||(31425101-31425335)
chr1 (51-303)||(17324009-17324258)
chr1 (23-295)||(47451564-47451829)
chr1 (52-303)||(17318838-17319082)
chr1 (91-303)||(25127856-25128067)
chr1 (50-295)||(2949325-2949569)
chr1 (174-341)||(16231630-16231797)
chr1 (91-296)||(4131473-4131676)
chr1 (50-303)||(42922177-42922425)
chr1 (5-147)||(16231499-16231641)
chr1 (51-303)||(14183678-14183923)
chr1 (50-303)||(8347359-8347607)
chr1 (51-303)||(40133879-40134139)
chr1 (50-302)||(15669481-15669729)
chr1 (50-303)||(18800659-18800907)
chr1 (203-341)||(23785935-23786073)
chr1 (50-303)||(49495297-49495537)
chr1 (98-303)||(16432396-16432589)
chr1 (199-341)||(51757623-51757764)
chr1 (52-303)||(8349138-8349385)
chr1 (57-303)||(13125544-13125787)
chr1 (57-296)||(26520206-26520449)
chr1 (174-303)||(25248638-25248766)
chr1 (199-303)||(16429049-16429152)
chr1 (52-146)||(25248756-25248850)
chr1 (23-303)||(30790487-30790759)
chr1 (5-89)||(23783449-23783533)
chr1 (187-303)||(6115189-6115304)
chr1 (189-303)||(30738716-30738830)
chr1 (249-303)||(23816027-23816081)
chr1 (50-267)||(27916440-27916653)
chr1 (189-267)||(155788-155865)
chr1 (185-303)||(16561544-16561662)
chr1 (189-303)||(26613326-26613440)
chr1 (130-267)||(28279292-28279424)
chr1 (57-182)||(13127837-13127959)
chr1 (83-123)||(6115344-6115384)
chr1 (189-265)||(26332613-26332688)
chr1 (204-267)||(4144804-4144865)
chr1 (51-122)||(26613503-26613577)
chr1 (53-94)||(15295142-15295183)
chr1 (50-87)||(43104102-43104139)
chr1 (50-99)||(46432017-46432066)
chr1 (189-267)||(14353047-14353126)
chr1 (204-267)||(2232597-2232658)
chr1 (204-267)||(14997040-14997101)
chr1 (107-232)||(26332719-26332836)
chr1 (51-123)||(30738890-30738963)
chr1 (189-296)||(49959129-49959237)
chr1 (207-267)||(2401342-2401400)
chr1 (207-267)||(9526469-9526527)
chr1 (50-102)||(16431044-16431096)
chr1 (207-267)||(21353467-21353525)
chr1 (207-267)||(25134074-25134132)
[»] chr4 (113 HSPs)
chr4 (6-341)||(16934188-16934523)
chr4 (6-341)||(16931834-16932169)
chr4 (5-341)||(18847105-18847441)
chr4 (50-341)||(44599883-44600174)
chr4 (5-341)||(9176519-9176855)
chr4 (6-341)||(22782783-22783126)
chr4 (6-341)||(22780418-22780761)
chr4 (23-340)||(9174192-9174509)
chr4 (5-341)||(11008613-11008951)
chr4 (23-341)||(51015216-51015533)
chr4 (23-341)||(11006282-11006604)
chr4 (23-341)||(5198390-5198708)
chr4 (23-341)||(11434925-11435242)
chr4 (23-341)||(22044436-22044753)
chr4 (23-341)||(22046731-22047048)
chr4 (23-341)||(38409169-38409492)
chr4 (23-303)||(22802818-22803097)
chr4 (23-295)||(48486289-48486560)
chr4 (50-341)||(8631464-8631759)
chr4 (50-341)||(18709209-18709507)
chr4 (23-341)||(9148221-9148540)
chr4 (50-303)||(40637071-40637323)
chr4 (50-341)||(2484918-2485209)
chr4 (23-303)||(24888766-24889045)
chr4 (23-341)||(31849644-31849962)
chr4 (23-341)||(37089417-37089737)
chr4 (27-303)||(24878963-24879238)
chr4 (23-303)||(24880421-24880700)
chr4 (27-303)||(40091499-40091774)
chr4 (23-303)||(47274697-47274975)
chr4 (50-341)||(24348211-24348506)
chr4 (50-341)||(22132437-22132735)
chr4 (23-303)||(22800946-22801225)
chr4 (50-341)||(6764836-6765132)
chr4 (23-341)||(7941289-7941611)
chr4 (50-303)||(14633317-14633567)
chr4 (23-303)||(5637549-5637832)
chr4 (23-303)||(3824654-3824936)
chr4 (50-341)||(22134662-22134966)
chr4 (23-303)||(36919668-36919950)
chr4 (50-329)||(47868398-47868677)
chr4 (51-303)||(12395929-12396180)
chr4 (23-303)||(36921577-36921858)
chr4 (50-303)||(619531-619783)
chr4 (51-295)||(38928269-38928513)
chr4 (51-303)||(12400891-12401142)
chr4 (50-302)||(36378289-36378540)
chr4 (52-303)||(33415572-33415821)
chr4 (52-303)||(37313150-37313400)
chr4 (50-295)||(14787523-14787769)
chr4 (50-341)||(47210797-47211082)
chr4 (50-303)||(16453306-16453558)
chr4 (51-303)||(19095880-19096132)
chr4 (52-295)||(56030443-56030685)
chr4 (119-341)||(26086022-26086243)
chr4 (50-341)||(17662290-17662574)
chr4 (52-303)||(13543953-13544208)
chr4 (57-303)||(19322701-19322942)
chr4 (51-303)||(18409431-18409681)
chr4 (55-303)||(41997494-41997741)
chr4 (23-303)||(52942543-52942810)
chr4 (51-282)||(3937314-3937543)
chr4 (51-303)||(18537559-18537806)
chr4 (51-272)||(6132871-6133090)
chr4 (50-303)||(53405124-53405384)
chr4 (51-303)||(18534917-18535164)
chr4 (50-303)||(8756336-8756586)
chr4 (129-296)||(36380425-36380591)
chr4 (51-214)||(38270158-38270321)
chr4 (51-214)||(24446756-24446914)
chr4 (166-303)||(16455354-16455490)
chr4 (50-189)||(5100994-5101133)
chr4 (133-303)||(38890310-38890476)
chr4 (50-303)||(15032633-15032872)
chr4 (136-289)||(27499128-27499280)
chr4 (51-170)||(2891314-2891434)
chr4 (199-303)||(2891437-2891540)
chr4 (201-296)||(13547302-13547396)
chr4 (51-303)||(12102088-12102336)
chr4 (248-341)||(11437557-11437650)
chr4 (52-287)||(28453686-28453915)
chr4 (141-303)||(30136640-30136798)
chr4 (249-341)||(5635521-5635614)
chr4 (57-265)||(9863712-9863917)
chr4 (50-256)||(25357634-25357838)
chr4 (52-267)||(40999071-40999281)
chr4 (58-266)||(10112876-10113080)
chr4 (188-296)||(31983619-31983727)
chr4 (231-303)||(4215483-4215555)
chr4 (189-303)||(47150978-47151092)
chr4 (50-123)||(16186099-16186173)
chr4 (204-296)||(16185926-16186018)
chr4 (133-232)||(10114412-10114505)
chr4 (107-267)||(9022362-9022516)
chr4 (203-265)||(3982300-3982362)
chr4 (204-267)||(5336903-5336964)
chr4 (239-277)||(38270120-38270158)
chr4 (255-296)||(5101130-5101171)
chr4 (50-122)||(16455284-16455356)
chr4 (207-267)||(16489352-16489410)
chr4 (207-267)||(25699752-25699810)
chr4 (204-267)||(4570094-4570155)
chr4 (204-267)||(7050378-7050439)
chr4 (204-267)||(11853549-11853610)
chr4 (225-267)||(23001523-23001566)
chr4 (50-96)||(36380371-36380417)
chr4 (51-99)||(52043716-52043765)
chr4 (207-267)||(4556180-4556238)
chr4 (207-267)||(4558314-4558372)
chr4 (207-267)||(8529270-8529328)
chr4 (207-267)||(15316961-15317019)
chr4 (207-267)||(18586969-18587027)
chr4 (207-267)||(31300427-31300485)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (5-341)||(31542633-31542968)
chr5 (5-341)||(31544978-31545314)
chr5 (5-341)||(31179416-31179752)
chr5 (23-341)||(38882021-38882339)
chr5 (23-341)||(2174835-2175152)
chr5 (50-341)||(15552178-15552479)
chr5 (23-341)||(4236545-4236863)
chr5 (23-303)||(25921557-25921836)
chr5 (23-341)||(21684497-21684824)
chr5 (23-303)||(21947943-21948221)
chr5 (91-341)||(34477098-34477349)
chr5 (25-341)||(16776075-16776391)
chr5 (50-303)||(10529183-10529435)
chr5 (50-341)||(39854427-39854717)
chr5 (91-341)||(34479463-34479714)
chr5 (53-303)||(18511296-18511547)
chr5 (50-303)||(18468950-18469206)
chr5 (23-295)||(2818427-2818699)
chr5 (50-303)||(40221465-40221717)
chr5 (51-303)||(17072827-17073078)
chr5 (51-302)||(25904047-25904297)
chr5 (52-303)||(18466625-18466879)
chr5 (51-303)||(1189693-1189949)
chr5 (91-341)||(6745053-6745302)
chr5 (91-341)||(25804009-25804259)
chr5 (50-288)||(6756437-6756674)
chr5 (23-296)||(31466070-31466341)
chr5 (53-288)||(18509417-18509652)
chr5 (51-303)||(34530750-34531001)
chr5 (50-329)||(27912473-27912758)
chr5 (50-341)||(6747247-6747538)
chr5 (54-303)||(10474407-10474655)
chr5 (50-303)||(26097676-26097927)
chr5 (53-295)||(16092292-16092537)
chr5 (50-303)||(27910388-27910645)
chr5 (51-303)||(31472697-31472948)
chr5 (50-303)||(18596590-18596840)
chr5 (23-303)||(36402412-36402690)
chr5 (51-270)||(20044954-20045172)
chr5 (50-303)||(37705864-37706116)
chr5 (51-303)||(39398077-39398327)
chr5 (24-295)||(12556016-12556285)
chr5 (51-266)||(20042994-20043208)
chr5 (51-303)||(24126800-24127051)
chr5 (58-303)||(17818574-17818817)
chr5 (59-308)||(2954368-2954617)
chr5 (51-303)||(695833-696072)
chr5 (50-341)||(10586782-10587065)
chr5 (129-303)||(658437-658610)
chr5 (50-259)||(26098379-26098587)
chr5 (56-303)||(6661270-6661512)
chr5 (174-341)||(4410090-4410256)
chr5 (58-288)||(21288715-21288949)
chr5 (203-337)||(3373186-3373320)
chr5 (203-341)||(10749796-10749934)
chr5 (50-183)||(20507665-20507798)
chr5 (183-303)||(39798123-39798242)
chr5 (203-341)||(10757273-10757410)
chr5 (203-341)||(23665140-23665277)
chr5 (203-341)||(23793310-23793447)
chr5 (203-341)||(15354620-15354757)
chr5 (203-341)||(15356896-15357033)
chr5 (203-341)||(38960177-38960314)
chr5 (186-303)||(20505925-20506041)
chr5 (52-303)||(9020167-9020413)
chr5 (51-303)||(36208524-36208771)
chr5 (210-341)||(23741904-23742034)
chr5 (174-303)||(41585828-41585956)
chr5 (94-290)||(20053834-20054020)
chr5 (5-94)||(23665036-23665125)
chr5 (5-94)||(23793462-23793551)
chr5 (5-91)||(15354777-15354863)
chr5 (5-91)||(15357053-15357139)
chr5 (5-94)||(38960334-38960423)
chr5 (50-147)||(4410000-4410101)
chr5 (5-88)||(10757162-10757245)
chr5 (5-94)||(23667311-23667400)
chr5 (107-303)||(17413251-17413441)
chr5 (169-303)||(2723964-2724088)
chr5 (50-146)||(41585946-41586042)
chr5 (5-94)||(23742057-23742147)
chr5 (5-79)||(34477379-34477453)
chr5 (50-276)||(42770717-42770934)
chr5 (5-79)||(34479740-34479814)
chr5 (24-87)||(10749704-10749767)
chr5 (236-303)||(42770938-42771005)
chr5 (189-303)||(15143547-15143661)
chr5 (203-341)||(23667415-23667552)
chr5 (23-89)||(39798004-39798070)
chr5 (50-95)||(3373332-3373377)
chr5 (107-267)||(2144684-2144840)
chr5 (207-302)||(4897828-4897923)
chr5 (51-101)||(2723911-2723961)
chr5 (107-267)||(4754159-4754312)
chr5 (107-262)||(29748352-29748502)
chr5 (204-267)||(1170811-1170872)
chr5 (204-267)||(31782578-31782639)
chr5 (204-267)||(35385573-35385634)
chr5 (50-99)||(2144878-2144928)
chr5 (51-100)||(29748285-29748335)
chr5 (50-79)||(25803959-25803988)
chr5 (207-267)||(25452498-25452556)
chr5 (189-267)||(35430259-35430338)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (5-341)||(6106-6442)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (5-341)||(44720797-44721133)
chr8 (5-341)||(18810662-18810997)
chr8 (23-341)||(27829269-27829586)
chr8 (23-341)||(27826958-27827275)
chr8 (99-341)||(43079650-43079892)
chr8 (23-341)||(14807723-14808041)
chr8 (50-341)||(24873226-24873523)
chr8 (91-341)||(43082013-43082263)
chr8 (5-341)||(18812847-18813171)
chr8 (23-341)||(4423990-4424308)
chr8 (23-341)||(28251612-28251930)
chr8 (50-341)||(32339304-32339599)
chr8 (51-303)||(27106981-27107232)
chr8 (27-303)||(15072686-15072962)
chr8 (23-303)||(15067953-15068232)
chr8 (50-341)||(28283265-28283561)
chr8 (50-302)||(27911014-27911264)
chr8 (50-302)||(27957433-27957683)
chr8 (91-341)||(608774-609024)
chr8 (50-341)||(3874005-3874300)
chr8 (50-293)||(14419285-14419527)
chr8 (50-341)||(15809214-15809508)
chr8 (50-295)||(1225165-1225409)
chr8 (51-296)||(14477276-14477520)
chr8 (51-303)||(30480587-30480838)
chr8 (50-293)||(13858578-13858820)
chr8 (51-268)||(33541507-33541723)
chr8 (52-303)||(36865538-36865786)
chr8 (51-296)||(5372269-5372512)
chr8 (50-341)||(22684698-22685002)
chr8 (50-295)||(41384744-41384987)
chr8 (50-341)||(43530123-43530405)
chr8 (51-303)||(25952521-25952771)
chr8 (50-295)||(41382672-41382905)
chr8 (51-303)||(21482322-21482561)
chr8 (51-248)||(5622877-5623073)
chr8 (50-250)||(26775200-26775400)
chr8 (50-303)||(15185799-15186046)
chr8 (50-303)||(31162212-31162460)
chr8 (51-214)||(35872555-35872713)
chr8 (82-303)||(3005716-3005931)
chr8 (141-303)||(15956051-15956208)
chr8 (81-303)||(21480544-21480753)
chr8 (27-151)||(3886153-3886277)
chr8 (27-162)||(12517248-12517385)
chr8 (82-270)||(37214317-37214514)
chr8 (23-232)||(2468261-2468461)
chr8 (174-308)||(181622-181758)
chr8 (6-79)||(43081913-43081986)
chr8 (50-146)||(181536-181632)
chr8 (10-79)||(43079545-43079614)
chr8 (52-220)||(31035068-31035235)
chr8 (189-303)||(31578362-31578476)
chr8 (133-267)||(31573847-31573975)
chr8 (186-308)||(31035252-31035374)
chr8 (204-290)||(13985176-13985262)
chr8 (50-94)||(6375988-6376032)
chr8 (203-267)||(17847677-17847740)
chr8 (258-303)||(2468214-2468259)
chr8 (207-267)||(3276347-3276405)
chr8 (189-267)||(3895957-3896035)
chr8 (204-267)||(9021228-9021289)
chr8 (204-267)||(16752643-16752704)
chr8 (204-267)||(16757388-16757449)
chr8 (204-267)||(28327908-28327969)
chr8 (204-267)||(28895502-28895563)
chr8 (204-267)||(30423212-30423274)
chr8 (50-99)||(14419784-14419833)
chr8 (50-79)||(17847527-17847556)
chr8 (207-267)||(590797-590855)
chr8 (207-267)||(33032657-33032715)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (8-341)||(20915401-20915736)
chr6 (50-341)||(12195560-12195851)
chr6 (25-341)||(14507221-14507536)
chr6 (5-341)||(4816276-4816627)
chr6 (23-341)||(11983074-11983392)
chr6 (56-341)||(19704612-19704905)
chr6 (23-303)||(9019877-9020156)
chr6 (50-341)||(28241366-28241657)
chr6 (50-337)||(26932611-26932906)
chr6 (51-303)||(13057173-13057424)
chr6 (50-303)||(1230333-1230585)
chr6 (23-303)||(15532765-15533044)
chr6 (23-303)||(15541224-15541503)
chr6 (58-341)||(14458812-14459093)
chr6 (50-341)||(2628931-2629226)
chr6 (51-303)||(25477253-25477504)
chr6 (23-341)||(15530168-15530485)
chr6 (50-303)||(3390357-3390609)
chr6 (51-303)||(3629948-3630199)
chr6 (23-303)||(32279948-32280226)
chr6 (50-341)||(30034648-30034943)
chr6 (23-296)||(30728919-30729191)
chr6 (50-341)||(30967176-30967470)
chr6 (53-303)||(3632022-3632271)
chr6 (23-281)||(19227514-19227771)
chr6 (51-303)||(13039733-13039984)
chr6 (50-341)||(26064959-26065251)
chr6 (50-341)||(26084928-26085220)
chr6 (51-295)||(3233822-3234065)
chr6 (171-341)||(5273261-5273431)
chr6 (51-303)||(24338531-24338783)
chr6 (51-303)||(12161641-12161889)
chr6 (51-303)||(22490618-22490870)
chr6 (50-303)||(3027938-3028186)
chr6 (23-196)||(1072067-1072240)
chr6 (72-303)||(15719654-15719872)
chr6 (51-197)||(32447504-32447651)
chr6 (23-171)||(8995430-8995578)
chr6 (203-341)||(26066169-26066307)
chr6 (203-341)||(33308988-33309125)
chr6 (203-341)||(33311257-33311394)
chr6 (203-341)||(29754754-29754892)
chr6 (57-303)||(17012029-17012270)
chr6 (51-303)||(14466312-14466553)
chr6 (50-180)||(17852520-17852650)
chr6 (203-341)||(26068440-26068578)
chr6 (53-303)||(16455510-16455757)
chr6 (192-303)||(1069803-1069913)
chr6 (58-197)||(13870611-13870749)
chr6 (5-95)||(26068590-26068680)
chr6 (5-95)||(26066319-26066409)
chr6 (5-99)||(29754983-29755077)
chr6 (5-82)||(33308887-33308964)
chr6 (5-82)||(33311156-33311233)
chr6 (50-303)||(12186156-12186405)
chr6 (138-302)||(15367101-15367260)
chr6 (51-163)||(10584105-10584212)
chr6 (50-217)||(15346369-15346524)
chr6 (51-303)||(19696420-19696670)
chr6 (187-303)||(26945258-26945374)
chr6 (189-308)||(7542461-7542581)
chr6 (189-265)||(11138423-11138499)
chr6 (189-308)||(20526922-20527041)
chr6 (133-267)||(22858075-22858203)
chr6 (248-302)||(15346522-15346576)
chr6 (190-303)||(28037814-28037927)
chr6 (212-267)||(5165936-5165989)
chr6 (204-267)||(13878727-13878788)
chr6 (204-267)||(13883475-13883536)
chr6 (204-267)||(16785919-16785980)
chr6 (204-267)||(26887345-26887406)
chr6 (204-267)||(31248835-31248896)
chr6 (204-267)||(35201447-35201508)
chr6 (50-123)||(25466433-25466506)
chr6 (50-87)||(28038004-28038041)
chr6 (204-267)||(3577636-3577696)
chr6 (207-267)||(17036058-17036116)
chr6 (207-267)||(17694972-17695030)
chr6 (50-94)||(18318004-18318048)
[»] chr7 (107 HSPs)
chr7 (6-341)||(1046970-1047312)
chr7 (23-341)||(1049341-1049658)
chr7 (50-341)||(31155956-31156247)
chr7 (50-341)||(7349318-7349615)
chr7 (50-341)||(7351697-7351994)
chr7 (23-341)||(40836788-40837105)
chr7 (50-341)||(38393935-38394230)
chr7 (23-341)||(27306275-27306592)
chr7 (23-303)||(35555-35834)
chr7 (50-341)||(3035670-3035968)
chr7 (53-341)||(7470067-7470359)
chr7 (53-341)||(7472025-7472317)
chr7 (25-341)||(25542459-25542772)
chr7 (50-303)||(13099560-13099812)
chr7 (23-303)||(44490-44769)
chr7 (51-341)||(44724533-44724823)
chr7 (29-303)||(31435131-31435404)
chr7 (23-341)||(3878497-3878821)
chr7 (51-303)||(20137193-20137444)
chr7 (50-303)||(42331081-42331335)
chr7 (50-341)||(20297311-20297606)
chr7 (50-341)||(48457602-48457897)
chr7 (50-303)||(443548-443800)
chr7 (51-296)||(11355212-11355456)
chr7 (51-296)||(21678020-21678264)
chr7 (53-341)||(20625990-20626282)
chr7 (53-341)||(20629881-20630173)
chr7 (53-341)||(20642300-20642592)
chr7 (51-303)||(21679981-21680232)
chr7 (50-340)||(18345490-18345784)
chr7 (50-337)||(20299407-20299700)
chr7 (51-303)||(24748548-24748799)
chr7 (23-291)||(26804499-26804765)
chr7 (52-303)||(37412211-37412462)
chr7 (50-341)||(40946277-40946572)
chr7 (51-295)||(4296026-4296271)
chr7 (50-303)||(11757177-11757435)
chr7 (51-303)||(25276095-25276346)
chr7 (50-303)||(28485515-28485771)
chr7 (50-303)||(28487502-28487758)
chr7 (91-341)||(1849975-1850225)
chr7 (51-303)||(39146071-39146322)
chr7 (50-303)||(22828717-22828969)
chr7 (51-296)||(9680768-9681018)
chr7 (57-303)||(24258423-24258668)
chr7 (52-303)||(9679009-9679264)
chr7 (72-295)||(21592235-21592457)
chr7 (52-303)||(21990106-21990355)
chr7 (50-296)||(22251641-22251878)
chr7 (51-303)||(27832717-27832969)
chr7 (51-303)||(42223110-42223363)
chr7 (50-341)||(43253562-43253860)
chr7 (29-215)||(18567545-18567731)
chr7 (50-296)||(7188496-7188737)
chr7 (53-303)||(24817438-24817682)
chr7 (50-303)||(20091629-20091877)
chr7 (167-303)||(7092296-7092431)
chr7 (203-341)||(2935374-2935512)
chr7 (52-296)||(24465503-24465735)
chr7 (126-293)||(24813593-24813755)
chr7 (175-339)||(38396713-38396876)
chr7 (203-341)||(1606486-1606623)
chr7 (167-303)||(7094544-7094678)
chr7 (23-245)||(22392399-22392608)
chr7 (203-341)||(9027239-9027376)
chr7 (203-341)||(22137184-22137321)
chr7 (203-341)||(40552211-40552348)
chr7 (203-341)||(22108173-22108310)
chr7 (203-341)||(40549933-40550070)
chr7 (5-94)||(22108069-22108158)
chr7 (5-94)||(22137080-22137169)
chr7 (5-94)||(40549829-40549918)
chr7 (5-94)||(40552107-40552196)
chr7 (6-93)||(2935262-2935349)
chr7 (5-94)||(9027396-9027485)
chr7 (50-303)||(6332179-6332425)
chr7 (107-267)||(11081522-11081675)
chr7 (97-158)||(38396316-38396377)
chr7 (53-146)||(7094662-7094759)
chr7 (236-303)||(6348920-6348987)
chr7 (237-303)||(26295586-26295652)
chr7 (53-146)||(7092414-7092512)
chr7 (189-266)||(16297146-16297222)
chr7 (252-303)||(22393876-22393927)
chr7 (50-99)||(1606423-1606472)
chr7 (51-267)||(26210500-26210710)
chr7 (52-119)||(3677235-3677301)
chr7 (50-174)||(30906264-30906386)
chr7 (107-267)||(6048885-6049039)
chr7 (57-182)||(6348778-6348903)
chr7 (192-298)||(40281466-40281572)
chr7 (189-267)||(11084467-11084544)
chr7 (204-267)||(21369642-21369703)
chr7 (50-94)||(1849918-1849962)
chr7 (204-267)||(2120899-2120960)
chr7 (204-267)||(3320171-3320232)
chr7 (204-267)||(3324919-3324980)
chr7 (204-267)||(7069780-7069841)
chr7 (204-267)||(7074787-7074848)
chr7 (204-267)||(25351353-25351414)
chr7 (204-267)||(25357047-25357108)
chr7 (204-267)||(25405393-25405454)
chr7 (204-267)||(25410130-25410191)
chr7 (204-267)||(42006663-42006724)
chr7 (50-79)||(38396239-38396268)
chr7 (207-267)||(30246973-30247031)
chr7 (207-267)||(44512646-44512704)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (23-341)||(2805-3122)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (23-341)||(42064407-42064724)
chr2 (23-341)||(27104691-27105007)
chr2 (23-330)||(13910101-13910407)
chr2 (50-341)||(35215631-35215932)
chr2 (23-341)||(19504391-19504708)
chr2 (91-341)||(35218008-35218258)
chr2 (52-341)||(19502056-19502345)
chr2 (23-296)||(40032149-40032421)
chr2 (23-341)||(24162268-24162575)
chr2 (50-341)||(23452282-23452577)
chr2 (50-341)||(45280029-45280321)
chr2 (51-303)||(19007560-19007811)
chr2 (50-341)||(42452702-42452991)
chr2 (50-303)||(42923593-42923847)
chr2 (27-341)||(22287381-22287695)
chr2 (51-327)||(28196557-28196833)
chr2 (23-303)||(21520777-21521058)
chr2 (23-303)||(6258901-6259178)
chr2 (52-296)||(15539566-15539809)
chr2 (51-303)||(11739644-11739895)
chr2 (23-303)||(6264233-6264508)
chr2 (23-341)||(43623625-43623931)
chr2 (51-303)||(17849037-17849288)
chr2 (59-303)||(34979663-34979906)
chr2 (54-303)||(3022086-3022334)
chr2 (51-303)||(31732861-31733100)
chr2 (51-303)||(17848365-17848611)
chr2 (51-303)||(14837193-14837438)
chr2 (51-303)||(44289152-44289403)
chr2 (51-303)||(11578193-11578439)
chr2 (23-204)||(22407591-22407772)
chr2 (23-303)||(18800398-18800665)
chr2 (91-303)||(45239061-45239271)
chr2 (51-216)||(22163117-22163282)
chr2 (91-289)||(38020162-38020349)
chr2 (203-341)||(36558909-36559047)
chr2 (203-341)||(36561186-36561324)
chr2 (50-296)||(17897337-17897578)
chr2 (203-341)||(45332226-45332364)
chr2 (52-303)||(20146693-20146941)
chr2 (50-303)||(22874061-22874301)
chr2 (141-303)||(28459274-28459435)
chr2 (181-341)||(5375391-5375550)
chr2 (50-184)||(5377631-5377769)
chr2 (23-266)||(35107192-35107427)
chr2 (5-94)||(36559067-36559156)
chr2 (5-94)||(36561344-36561433)
chr2 (50-298)||(37963028-37963263)
chr2 (5-94)||(45332384-45332474)
chr2 (52-145)||(38020064-38020157)
chr2 (187-303)||(40699429-40699545)
chr2 (141-303)||(27136209-27136368)
chr2 (204-303)||(20589763-20589862)
chr2 (174-274)||(38414194-38414291)
chr2 (50-122)||(12342673-12342746)
chr2 (245-303)||(22407538-22407596)
chr2 (107-308)||(43139356-43139551)
chr2 (258-303)||(7463032-7463077)
chr2 (203-267)||(17921769-17921833)
chr2 (204-267)||(28458949-28459011)
chr2 (52-94)||(20147040-20147082)
chr2 (204-267)||(2740941-2741002)
chr2 (188-265)||(26345661-26345738)
chr2 (190-247)||(27583479-27583535)
chr2 (50-99)||(40699229-40699278)
chr2 (189-267)||(34575230-34575308)
chr2 (207-267)||(37170873-37170931)
chr2 (204-267)||(2736205-2736266)
chr2 (203-265)||(7502990-7503052)
chr2 (203-265)||(10942634-10942696)
chr2 (203-265)||(10948503-10948565)
chr2 (204-267)||(17462436-17462497)
chr2 (204-267)||(20054886-20054947)
chr2 (268-303)||(22707837-22707872)
chr2 (204-267)||(22712637-22712698)
chr2 (204-267)||(22717346-22717407)
chr2 (50-265)||(35028498-35028707)
chr2 (204-267)||(39686983-39687044)
chr2 (204-267)||(45567409-45567470)
chr2 (203-303)||(15693974-15694075)
chr2 (207-267)||(12781342-12781400)
chr2 (207-267)||(17932637-17932695)
chr2 (207-267)||(17943540-17943598)
chr2 (51-79)||(20589581-20589609)
chr2 (207-267)||(27517760-27517818)
chr2 (23-79)||(28462593-28462649)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (91-341)||(34-284)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (23-341)||(69337-69658)
scaffold0025 (23-202)||(73207-73390)
scaffold0025 (165-213)||(73160-73208)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (50-341)||(41528-41819)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (23-341)||(29086-29413)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (23-303)||(3922-4200)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (50-303)||(183725-183975)
scaffold0005 (50-295)||(51961-52207)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (53-341)||(79140-79428)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (50-341)||(11518-11809)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (23-303)||(14944-15223)
scaffold0131 (63-341)||(14427-14707)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (50-303)||(1988-2245)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (51-295)||(79812-80055)
scaffold0004 (204-267)||(188363-188424)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (165-341)||(1498-1673)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (51-303)||(85184-85434)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (51-279)||(35593-35819)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (50-303)||(15906-16154)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (52-303)||(16735-16981)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (60-303)||(1727-1958)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (50-219)||(993-1167)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (203-341)||(22221-22358)
scaffold0140 (203-341)||(24496-24633)
scaffold0140 (5-94)||(22117-22206)
scaffold0140 (5-94)||(24392-24481)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (57-303)||(4773-5014)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (204-267)||(57550-57613)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (204-267)||(224819-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (207-267)||(16328-16386)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 129)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 50493877 - 50494213
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  50493877 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggc 50493976  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50493977 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 50494076  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50494077 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 50494176  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50494177 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 50494213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6063827 - 6063489
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6063827 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggg 6063728  T
Q  103 gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg 202  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6063727 gctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 6063628  T
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063627 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 6063528  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6063527 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 6063489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 6066159 - 6065839
Alignment:
Q  22 agcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6066159 agcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttag 6066060  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 220  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6066059 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6065960  T
Q  221 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcacca 320  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  6065959 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatca 6065860  T
Q  321 tatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6065859 tatagtggattggatggctgc 6065839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 293
Target Start/End: Original strand, 35777317 - 35777587
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777317 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 35777416  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35777417 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 35777516  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 293  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777517 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 455826 - 456121
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  455826 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 455925  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  455926 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 456025  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  456026 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 456121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 458203 - 458498
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  458203 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 458302  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458303 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 458402  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  458403 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 458498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 3859424 - 3859741
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859424 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 3859523  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  3859524 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 3859622  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  3859623 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaacaatactcatcata 3859722  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  3859723 tagtggatcgtagggctgc 3859741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 38889917 - 38890254
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||    ||||||||||    
T  38889917 atttgttacagattttaagcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagg 38890013  T
Q  101 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38890014 gggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 38890113  T
Q  201 gggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890114 gggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 38890212  T
Q  301 c-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38890213 cttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 38890254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 24 - 341
Target Start/End: Original strand, 38210265 - 38210584
Alignment:
Q  24 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttta 119  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||   |||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcaggctat--tttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 38210362  T
Q  120 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38210363 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 38210462  T
Q  220 ggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcacc 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  38210463 ggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatc 38210562  T
Q  320 atatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  38210563 atatagtggattggagagctgc 38210584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Original strand, 5191549 - 5191865
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191549 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5191648  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5191649 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 5191747  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  5191748 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 5191847  T
Q  323 tagtggattggagggctg 340  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  5191848 tagtggatcagagggctg 5191865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 25388776 - 25389119
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggggg- 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||   ||||||| |||| | |     
T  25388776 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctat--tttgagagagagagaga 25388873  T
Q  104 ---------ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgatt 194  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388874 gagagagagctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgatt 25388973  T
Q  195 cactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 294  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25388974 caccttgg-aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattg 25389072  T
Q  295 atttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25389073 atttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 25389119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 746674 - 746971
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746674 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 746773  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  746774 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 746873  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  746874 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggactgc 746971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4104233 - 4103939
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4104233 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4104134  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  4104133 gtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 4104035  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4104034 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 4103939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4308615 - 4308324
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4308615 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 4308516  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  4308515 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 4308324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10621876 - 10621573
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt------------gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||            ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621876 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaac 10621777  T
Q  138 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10621776 tagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgg 10621677  T
Q  238 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggaggg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  10621676 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggaggg 10621577  T
Q  338 ctgc 341  Q
    ||||    
T  10621576 ctgc 10621573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18099531 - 18099213
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099531 gcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagaccttgtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18099433  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18099432 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-g 18099334  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcacca 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||    
T  18099333 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatca 18099234  T
Q  321 tatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  18099233 tatagtggaacggagggctgc 18099213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11170300 - 11170618
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170300 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11170399  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11170400 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 11170498  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  11170499 gtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11170598  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  11170599 atagtggaacggagggctgc 11170618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22114666 - 22114387
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22114666 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 22114567  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22114566 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 22114468  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114467 gtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 22114387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 117 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413075
Alignment:
Q  117 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  217 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactc 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  317 accatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgc 28413075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 45882835 - 45883153
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    |||||||||||  | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882835 gcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 45882934  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  45882935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 45883033  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||   ||||| |||    
T  45883034 gtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 45883133  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  45883134 atagtggaacggagggctgc 45883153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 6561740 - 6561985
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561740 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6561839  T
Q  157 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgg 256  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6561840 gtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 6561938  T
Q  257 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6561939 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 6561985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18097262 - 18096986
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt-gagatagagggggctgaaacaagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18097262 gcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaacttgagagatagagggggctcaaacaagggtttaga 18097163  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18097162 atggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-g 18097064  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18097063 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttc 18096986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 43228214 - 43228505
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43228214 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtat 43228313  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  43228314 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 43228505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5522976 - 5522670
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522976 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5522877  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  5522876 aggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattg-a 5522789  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  5522788 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 5522689  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  5522688 tagtggatcggagggctgc 5522670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 43226009 - 43226299
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  43226009 actttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtat 43226107  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  43226108 agagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 43226299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10958684 - 10958405
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958684 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10958585  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10958584 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 10958486  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10958485 gtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctt 10958405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423545
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggg 43423598  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43423597 ctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctctt 43423545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10956388 - 10956070
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956388 gcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10956289  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  10956288 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggatt-ga 10956190  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  10956189 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10956090  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  10956089 atagtggaacggagggctgc 10956070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 32264404 - 32264121
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaa----ctttgagatagagggggctgaaacaagggttt 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32264404 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggttt 32264305  T
Q  119 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32264304 agaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 32264205  T
Q  219 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32264204 t-gagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 32264121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10084754 - 10084432
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  10084754 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggttt 10084655  T
Q  119 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10084654 agaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga- 10084556  T
Q  219 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactca 317  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||   |||||    
T  10084555 tcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactca 10084456  T
Q  318 ccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  10084455 tcatatagtggatcggagggctgc 10084432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 1313333 - 1313584
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1313333 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 1313431  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1313432 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagagattggg 1313530  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1313531 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 1313584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 288
Target Start/End: Original strand, 24979603 - 24979867
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979603 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatataccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24979702  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  24979703 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-ga 24979801  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 288  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24979802 gtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 24979867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53917998 - 53917746
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  53917998 acttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53917899  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53917898 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 53917800  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53917799 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 53917746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626765
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggggagagattggga 1626818  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1626817 ctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 1626765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28102084
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggg 28102137  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28102136 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 28102084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 18162560 - 18162831
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaa-agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  18162560 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatgagtaaacttggagatagaggga--tgaaacaagggtttaga 18162657  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18162658 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-g 18162756  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162757 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgat 18162831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 329
Target Start/End: Original strand, 26720444 - 26720749
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720444 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaa 26720543  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||||||| ||    
T  26720544 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggatt-ga 26720641  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    || ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| | ||||| |||    
T  26720642 gtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcat 26720741  T
Q  322 atagtgga 329  Q
    ||||||||    
T  26720742 atagtgga 26720749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51727340 - 51727089
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51727340 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtat 51727241  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  || |    
T  51727240 agagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 51727089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314859
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgggg 3314806  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3314807 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3314859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 25533357 - 25533656
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25533357 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 25533456  T
Q  142 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  25533457 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaag 25533555  T
Q  242 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctg 340  Q
    ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25533556 aggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 25533655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 51 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926856
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 5926899  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926898 cttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 5926856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53915830 - 53915578
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||    
T  53915830 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtat 53915731  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53915730 agattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 53915632  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53915631 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 53915578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48362031 - 48361761
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  48362031 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaa 48361933  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  48361932 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-ga 48361834  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  48361833 gtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattga 48361761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 27 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 12268323 - 12268061
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 126  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |    
T  12268323 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttagaaagac 12268224  T
Q  127 aacaac-aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 224  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  12268223 aacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggatt-gagt 12268125  T
Q  225 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268124 ctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27101519 - 27101263
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaact----ttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |    | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27101519 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27101420  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  27101419 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27101263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattgggg 28100176  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100175 ctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006055
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 30006003  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  30006004 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 30006055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 43421747 - 43421497
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43421747 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 43421648  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
     ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||      
T  43421647 tgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaaaagattgggga 43421549  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43421548 tttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 43421497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 39715393 - 39715644
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  39715393 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtat 39715491  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39715492 agagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 39715590  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39715591 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctctt 39715644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 51943294 - 51943537
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51943294 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 51943393  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  51943394 agagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggg 51943492  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51943493 gctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattga 51943537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990479
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 42990466  T
Q  291 attgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||    
T  42990467 attgatttctctt 42990479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10191670 - 10191353
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||    |||||||| |||||||||||||||    
T  10191670 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaa 10191571  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  10191570 aggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcga 10191472  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    ||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||   ||||| |||    
T  10191471 gtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcat 10191373  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  10191372 atagtggatcggagggctgc 10191353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 15780756 - 15781039
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780756 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15780855  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacacta 211  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15780856 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 15780955  T
Q  212 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||| |||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15780956 ttacgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 15781039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880533
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcatt-gagtctcttggttacggaaagagattggg 880587  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  880586 gctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctctt 880533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 35918283 - 35918025
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35918283 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 35918184  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaa------acactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||| |||||||      ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||    
T  35918183 agagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 35918025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9604946 - 9604650
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||      |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9604946 actttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactaggat 9604848  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  9604847 ttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 9604650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468538
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggttacggggagagattggga 53468591  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53468590 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 53468538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012002
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggatt-gaatatcttggttacgggaagagattgtga 36011949  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36011950 ctttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 36012002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956900
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactc 29956848  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  29956849 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 29956900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 288
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggatt-gagtctattggttacgggaagagattggga 28181144  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181145 ctttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28761762 - 28761511
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28761762 acttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtat 28761663  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    | |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| |    
T  28761662 atagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagatattgag 28761565  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28761564 actttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctctt 28761511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148977
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgag----atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | |||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacactattatgattg-agtctcttggttacgggaagaga 47149036  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47149035 ttgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 47148977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 131 - 341
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321693
Alignment:
Q  131 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttg 1321581  T
Q  231 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtgga 329  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  330 ttggagggctgc 341  Q
    | ||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgc 1321693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691656
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggg-taaaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| ||     
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaattttttggttatgggaagagattaggg 54691709  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  54691708 ctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctctt 54691656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 51675087 - 51674848
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||        
T  51675087 ttttactataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt---- 51674992  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
           | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||     
T  51674991 -------ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattgggat 51674900  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51674899 tttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 51674848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 32218991 - 32219252
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32218991 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagaccttgtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 32219090  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||           |||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  32219091 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattg-a 32219178  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32219179 gtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgat 32219252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 23636952 - 23637198
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  23636952 ttttaatataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtatag 23637050  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||    
T  23637051 agtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttgttcatgggaagatattaggac 23637146  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23637147 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 23637198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889855
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaaca--aaacctagggtttgtata 890007  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag-ttggg 889909  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  889908 gctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctctt 889855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 290
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151507
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgg 31151465  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31151466 gactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc 31151507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 260
Target Start/End: Original strand, 42992205 - 42992417
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42992205 acttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggttt 42992304  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  42992305 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagag 42992403  T
Q  246 tgggactttgggtag 260  Q
    | |||||||||||||    
T  42992404 t-ggactttgggtag 42992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 23 - 195
Target Start/End: Original strand, 11163046 - 11163218
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163046 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11163145  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 195  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163146 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 149 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606631
Alignment:
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||   ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgc 7606631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattagga-tgaagtctcttggttacgggaagagattgggg 28137441  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagact 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137440 ctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 308
Target Start/End: Original strand, 23633383 - 23633634
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  23633383 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtat 23633481  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    || ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |    
T  23633482 agtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgag 23633575  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  23633576 actttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaa 23633634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13420506 - 13420268
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||          ||  ||||||||||||||||    
T  13420506 acttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgtat 13420417  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |    
T  13420416 agagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgag 13420322  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13420321 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 13420268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 51 - 301
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591357
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||       
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt--- 53591215  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
            |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  53591216 --------ctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattg-agtctcttggttacgagaatagatttgga 53591306  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 301  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  53591307 ttttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctc 53591357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Original strand, 53597164 - 53597404
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  53597164 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagataga-ggggatgaaacaagggttta-taagtcaacaagaaaactaggggttgtat 53597261  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |    
T  53597262 agagttt-tctcttggcaacaaacactagggtt--gaagttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcatgagaatagattgag 53597357  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  53597358 attttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgat 53597404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Original strand, 41849065 - 41849244
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41849065 acttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgagagagagatagatagagggggctgaaacaagggtttagaataacaacaacaaaacta 41849164  T
Q  140 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41849165 gggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 54884081 - 54884329
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||    
T  54884081 cttttaccataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttg--ta 54884178  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |    
T  54884179 gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattgaaa 54884277  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  54884278 ctttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctctt 54884329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 140 - 296
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484528
Alignment:
Q  140 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggg 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttg-agtctcttggttacggg 6484470  T
Q  239 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgat 6484528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 181  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 53896575 - 53896475
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53896575 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 53896476  T
Q  105 t 105  Q
    |    
T  53896475 t 53896475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 188 - 341
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886412
Alignment:
Q  188 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  288 cccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| |||| | |||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5886359 cccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 5886412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 188 - 341
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899885
Alignment:
Q  188 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 287  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  288 cccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5899832 cccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 5899885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 178 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688243
Alignment:
Q  178 gggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 277  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  278 attcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctctt 25688243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27635959 - 27635830
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  27635959 ttttactacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatag 27635860  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggt 181  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635859 agtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 180
Target Start/End: Original strand, 6231374 - 6231502
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6231374 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6231473  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactaggg 180  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231474 agtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 175 - 303
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231975
Alignment:
Q  175 ctagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 274  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttg-agtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  275 cttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctctt 6231975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795433
Alignment:
Q  134 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 233  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 17795363  T
Q  234 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 17795433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 303
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103873
Alignment:
Q  134 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 233  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 19103803  T
Q  234 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 19103873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635549
Alignment:
Q  134 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 25635486  T
Q  234 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 25635549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Original strand, 1673898 - 1674140
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||| |  ||||||  ||||||||||||    ||||| |||||||| ||||||    
T  1673898 acttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagagagt-ctgaaaataagggtttagaagtt-aacaagaaaactagtgtttgt 1673995  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||    
T  1673996 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtctcttgatcacgggaagagattg 1674091  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674092 ggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 134 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561866
Alignment:
Q  134 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 561929  T
Q  234 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  561928 acgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgat 561866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Original strand, 24177175 - 24177380
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24177175 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagaccttgtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttaga 24177274  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
        |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |    
T  24177275 tgt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-g 24177369  T
Q  222 agtctcttggt 232  Q
    |||||||||||    
T  24177370 agtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 303
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666691
Alignment:
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattg-agtctctaggttacgggaagagattg 4666633  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4666634 agactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctctt 4666691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 191 - 303
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168276
Alignment:
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  291 attgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||    
T  11168264 attgatttctctt 11168276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 170
Target Start/End: Original strand, 3306724 - 3306842
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  3306724 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatag 3306823  T
Q  152 agtttgtctcttcggaaca 170  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  3306824 agtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 6719490 - 6719396
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  6719490 atttgatacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36871624 - 36871378
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | |  || ||||||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  36871624 ctataaatataaaccttgtatcatagtaaacctagggggag-gggggctgaaacaagggtttacaagc-caacaagaaaactagggcttgtatagagttt 36871527  T
Q  157 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgg 256  Q
    | ||||| | ||||||||| |||||| |  | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  36871526 g-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgg 36871431  T
Q  257 gtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaa 308  Q
    |||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||    
T  36871430 gtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaa 36871378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 123
Target Start/End: Original strand, 1321337 - 1321437
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321337 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1321436  T
Q  123 a 123  Q
    |    
T  1321437 a 1321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 50 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 4560599 - 4560401
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||             
T  4560599 actttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag--------- 4560509  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
      |||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||     
T  4560508 --agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagcctgttggttaccggaagagattgga 4560420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 5899638 - 5899712
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5899638 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatca 5899712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 5886163 - 5886237
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5886163 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatca 5886237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 205 - 303
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306936
Alignment:
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3306839 aacactattaggattg-agtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctt 3306936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 296
Target Start/End: Original strand, 24181488 - 24181548
Alignment:
Q  236 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181488 gggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgat 24181548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620580
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattag-gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701753
Alignment:
Q  255 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 47701753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 115
Target Start/End: Original strand, 6484308 - 6484373
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg 115  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484308 acttttgctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 264
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420015
Alignment:
Q  126 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattagga-tcaagtc 13419976  T
Q  226 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatt 264  Q
    ||||||| | || ||||||||   | |||||||||||||    
T  13419977 tcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634524
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || | | |||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  288 cccattgatttctctt 303  Q
     || ||||| ||||||    
T  14634539 acctttgatatctctt 14634524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  134 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |   || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggatt-gagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1618992 - 1618916
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 123  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1618992 actttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgagagacagagggggctgaaaacaagggtttagaaa 1618916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaa-tcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635748
Alignment:
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 27635748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31021479 - 31021431
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  31021479 ttttactataaatatagaccttgtatcaaatgtaaaccttgagagagag 31021431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11007679 - 11007633
Alignment:
Q  221 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11007679 gagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Original strand, 13893289 - 13893347
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaa 81  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13893289 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatcaaa 13893347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  171 aacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 216  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 79
Target Start/End: Original strand, 42990205 - 42990234
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990205 acttttactataaatatagaccttgtatca 42990234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 87
Target Start/End: Original strand, 4663843 - 4663879
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaac 87  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4663843 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaac 4663879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914074
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  29914132 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878292
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47878350 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 108)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 16226065 - 16226401
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16226065 atttgttacagattttaagtagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtc 16226164  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16226165 taaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 16226264  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16226265 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 16226364  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16226365 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 16226401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 47179607 - 47179947
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||    
T  47179607 atttgttacagattttaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagg 47179706  T
Q  101 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47179707 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt 47179806  T
Q  201 gggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179807 gggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 47179906  T
Q  301 cttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47179907 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 47179947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 47177256 - 47177596
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||    
T  47177256 atttgttacagattttaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagg 47177355  T
Q  101 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacttt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47177356 gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcacctt 47177455  T
Q  201 gggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177456 gggaaacactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttct 47177555  T
Q  301 cttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47177556 ctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 47177596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 51749955 - 51750273
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51749955 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51750054  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  51750055 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 51750153  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  51750154 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 51750253  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  51750254 atagtggatcggagggctgc 51750273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 50 - 336
Target Start/End: Original strand, 20302402 - 20302687
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20302402 acttttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20302501  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  20302502 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagactagg 20302600  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||| |||||    
T  20302601 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcagatagtggatcggagg 20302687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 28840594 - 28840913
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  28840594 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttag 28840693  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 220  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28840694 aaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt- 28840792  T
Q  221 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcacca 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||    
T  28840793 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 28840892  T
Q  321 tatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  28840893 tatagtggatcggagggctgc 28840913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 6822931 - 6823248
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6822931 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6823030  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  6823031 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggatt-ga 6823128  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||| |||    
T  6823129 gtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 6823228  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  6823229 atagtggatcggagggctgc 6823248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Original strand, 13214997 - 13215269
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13214997 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13215096  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  13215097 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-ga 13215195  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215196 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 13215269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Original strand, 28842413 - 28842726
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 124  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28842413 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 28842512  T
Q  125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28842513 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagt 28842611  T
Q  225 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatata 324  Q
    || ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||    
T  28842612 ctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 28842711  T
Q  325 gtggattggagggct 339  Q
    |||||  ||||||||    
T  28842712 gtggaacggagggct 28842726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9463588 - 9463291
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9463588 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 9463489  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9463488 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9463389  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9463388 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 9463291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 51752281 - 51752597
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51752281 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaa 51752380  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||    
T  51752381 aggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gatt-ga 51752478  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||    
T  51752479 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcaccata 51752578  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  51752579 tagtggattggagggctgc 51752597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10400193 - 10399875
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400193 gcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagaccttgtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 10400094  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10400093 tgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 10399995  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  10399994 gtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10399895  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  10399894 atagtggatcggagggctgc 10399875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 302
Target Start/End: Original strand, 15823462 - 15823740
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15823462 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 15823561  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||    
T  15823562 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatatt-ga 15823660  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15823661 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 15823740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9459761 - 9459464
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9459761 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggt 9459662  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9459661 ttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagag 9459562  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9459561 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 9459464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 339
Target Start/End: Original strand, 13761753 - 13762068
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13761753 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaa 13761852  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||    
T  13761853 aggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggatt-ga 13761951  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||    
T  13761952 gtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 13762051  T
Q  323 tagtggattggagggct 339  Q
    |||||||  ||||||||    
T  13762052 tagtggaccggagggct 13762068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38925843 - 38925564
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    |||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38925843 gcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaa 38925744  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  38925743 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 38925645  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38925644 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 38925564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 337
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291686
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 20291499  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||    
T  20291500 agagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagactagg 20291598  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggaggg 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||||    
T  20291599 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgattctcatcatatagtggatcggaggg 20291686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31735863 - 31735568
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttga----gatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31735863 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 31735764  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||      
T  31735763 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggtt-gagtctcttggttacgggaagaggc 31735665  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31735664 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 31735568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 51 - 341
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617750
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggga 2617658  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2617659 ctttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 2617750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 99 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 46431996 - 46431755
Alignment:
Q  99 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46431996 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 46431897  T
Q  199 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431896 ttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 46431798  T
Q  299 ctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46431797 ctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 46431755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21948526 - 21948235
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21948526 tttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 21948427  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||    
T  21948426 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagacgctgg 21948329  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  21948328 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 21948235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 39462435 - 39462714
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  39462435 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaa 39462534  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39462535 atgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 39462633  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39462634 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctctt 39462714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 41646836 - 41647115
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41646836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaa 41646935  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  41646936 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 41647034  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41647035 gtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 41647115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27337280 - 27336987
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27337280 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 27337181  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||      
T  27337180 ttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg-gtctcttggttacgggaagaggc 27337083  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27337082 tgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 27336987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 6823800 - 6824087
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6823800 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 6823899  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  6823900 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-g 6823998  T
Q  222 agtctctt-------ggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||       ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823999 aatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctctt 6824087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Original strand, 39932017 - 39932307
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39932017 tttactataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39932116  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || ||    
T  39932117 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagactgaga 39932215  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  39932216 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgc 39932307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 47906207 - 47906504
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  47906207 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggt 47906306  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47906307 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagag 47906405  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  47906406 attggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 47906504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27339472 - 27339179
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27339472 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggttt 27339373  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||      
T  27339372 gtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgatt-gagtctcttagttacgggaagaggc 27339274  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctg 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27339273 tgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 27339179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 24325599 - 24325858
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24325599 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagg 24325697  T
Q  142 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24325698 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaag 24325796  T
Q  242 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325797 aggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 24325858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 18307054 - 18307304
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  18307054 ttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataa 18307153  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  18307154 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggc 18307252  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  18307253 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctctt 18307304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12302848 - 12302599
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatca-aagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12302848 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtt 12302749  T
Q  145 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  12302748 tgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattga 12302599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17324974 - 17324722
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17324974 acttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtat 17324875  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17324874 agagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 17324776  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17324775 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 17324722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25251611 - 25251368
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  25251611 ttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataa 25251512  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25251511 cgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctctcggttacgggaagagattgggac 25251413  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25251412 tttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgat 25251368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076758
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 50076811  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50076810 atttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctctt 50076758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078907
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagatttgga 50078960  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50078959 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 50078907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14098329 - 14098056
Alignment:
Q  29 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 128  Q
    ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  14098329 ttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaa 14098230  T
Q  129 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctct 228  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14098229 ctacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctct 14098131  T
Q  229 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14098130 tggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 14098056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307640
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 50307686  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50307685 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 50307640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839782
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || ||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagaatgaga 18839729  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18839730 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18839782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 6996038 - 6995794
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6996038 acttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6995939  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6995938 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 6995840  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  6995839 gctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattga 6995794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 16428596 - 16428848
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||| || ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16428596 acttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 16428695  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16428696 agagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 16428794  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16428795 actttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 16428848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28998591 - 28998347
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  28998591 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 28998492  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28998491 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggg 28998393  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28998392 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 28998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29004307 - 29004063
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  29004307 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 29004208  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29004207 agagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggg 29004109  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29004108 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 29004063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17186465 - 17186214
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17186465 cttttaatataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 17186366  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  17186365 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttgaa 17186267  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17186266 ctttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 17186214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 50 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 2510666 - 2510412
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  2510666 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggttt 2510567  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  2510566 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtcttttggttacgggaagagat 2510468  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510467 ttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctct 2510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3579979 - 3579702
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggggg--ctgaaacaagggtttagaaaa 124  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||     
T  3579979 atttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagaccttgtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaag 3579880  T
Q  125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||    
T  3579879 gcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggatt-gagt 3579781  T
Q  225 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579780 ctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3579702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15295131 - 15294881
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  15295131 gagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggtt 15295032  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15295031 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaaccc 15294933  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  15294932 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 15294881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 48665114 - 48665373
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc------tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48665114 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 48665213  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta-tgggaaga 242  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  48665214 ttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccgggaaga 48665312  T
Q  243 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48665313 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 48665373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457561
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||  |||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||||     
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgcgaagagattgggg 11457614  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11457613 gtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 11457561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28207431 - 28207160
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28207431 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 28207332  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  28207331 agacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggatt-gt 28207233  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28207232 gtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattga 28207160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 9241424 - 9241172
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggggg-ctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241424 acttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 9241326  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9241325 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 9241172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31423212 - 31422967
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31423212 acttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatat 31423113  T
Q  150 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  31423112 agagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattga 31423014  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423013 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 31422967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248666
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagatcgaga 50248711  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50248710 ctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattga 50248666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 6756470 - 6756721
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||   |||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6756470 acttttgctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6756569  T
Q  150 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||||    
T  6756570 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gag--tcttgattacgagaagagattgg 6756666  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6756667 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctt 6756721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490108
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtat- 31489957  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||    
T  31489958 -agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatttcttggttacgggaagagattgaga 31490055  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31490056 ctttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 31490108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31425101
Alignment:
Q  72 ttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aaca 170  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  171 aacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg-gag-tctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 268  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  269 gggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctctt 31425101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 17324009 - 17324258
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||    
T  17324009 cttttattataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttata 17324106  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  17324107 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgaatatgggaagagattggaa 17324205  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17324206 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 17324258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 47451564 - 47451829
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  47451564 gcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaa 47451663  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |         |||||||| ||    
T  47451664 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggatt-ga 47451756  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47451757 gtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattga 47451829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 17318838 - 17319082
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17318838 ttttactataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttag 17318937  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||      |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17318938 agtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------aggatt-gagtctcttggttacgggaacagattgggac 17319030  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  17319031 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctctt 17319082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128067
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattc 25128054  T
Q  291 attgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||    
T  25128055 attgatatctctt 25128067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2949569 - 2949325
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  2949569 acttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 2949470  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||||||    
T  2949469 agagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgtttacgagaatagattggg 2949371  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2949370 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 2949325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231797
Alignment:
Q  174 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  274 acttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 16231797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 91 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 4131676 - 4131473
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4131676 gagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 4131577  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4131576 gatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaaccc 4131479  T
Q  291 attgat 296  Q
    ||||||    
T  4131478 attgat 4131473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 42922177 - 42922425
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  42922177 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 42922275  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42922276 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggg 42922371  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42922372 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 42922425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 147
Target Start/End: Original strand, 16231499 - 16231641
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16231499 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 16231598  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231599 tgaaacaagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183678
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttag-aatgcaaca--caaactagggtttgtata 14183827  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattataatt-gagtctcttggttacgggaagagattagaa 14183731  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14183730 ttttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctctt 14183678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8347607 - 8347359
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  8347607 acttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgta 8347510  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||     
T  8347509 tagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgggaagagattga 8347414  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8347413 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 8347359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 40133879 - 40134139
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggg---------gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 141  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||| |||||         ||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |    
T  40133879 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaatcttgagatataggggctgaaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaag 40133978  T
Q  142 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  40133979 gtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggatt-gagtctcttggtcacgggaag 40134077  T
Q  242 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40134078 agattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 40134139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 15669729 - 15669481
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||| | |  ||| || ||||| ||||||||||    
T  15669729 acttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggctgaaaactagggtttgggag-gcagca-caaaagtagggtttgt 15669632  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  15669631 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattg 15669536  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15669535 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 15669481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18800907 - 18800659
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  18800907 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttag-aagtcaacaagaaaactacggtttgtat 18800809  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||   ||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||||||| |     
T  18800808 agagtttg-ctcttggccacaaatactagggtt--ggggttgattcaccctgagaaacactattaggatt-gagtctctaggtcacgggtagagatttga 18800713  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18800712 actttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctctt 18800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786073
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 23786073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 49495537 - 49495297
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||| ||    
T  49495537 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgcat 49495446  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    | |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| | || |||||||||||    
T  49495445 atagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattg-agtcttttggtcacggtaagagattggg 49495351  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  49495350 gctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctctt 49495297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 98 - 303
Target Start/End: Original strand, 16432396 - 16432589
Alignment:
Q  98 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16432396 agggggcagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcac 16432484  T
Q  198 tttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 297  Q
     |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||     
T  16432485 cttgggaaacattattaggattgaa-tctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgata 16432583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 199 - 341
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757764
Alignment:
Q  199 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  299 ctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757722 ctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgc 51757764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8349385 - 8349138
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||||||||||    
T  8349385 ttttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaaggtttgtata 8349287  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  |||| | ||||||||||| |||    
T  8349286 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattg-agtttgatggtcacgggaagagattagga 8349191  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  8349190 ctttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctctt 8349138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13125787 - 13125544
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg-tatagagtt 155  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| ||||   ||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  13125787 ctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaagc-caacaaggaaactagggtttggtatagagtt 13125689  T
Q  156 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttg 255  Q
    || ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13125688 tg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattg-aggctcttggtcaagggaagagattgggactttg 13125593  T
Q  256 ggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13125592 ggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctt 13125544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26520449 - 26520206
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag-ggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 154  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26520449 ctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttctatagagt 26520351  T
Q  155 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg------gttatgggaagagattgg 248  Q
    ||| ||||| | ||||||||||| | ||    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||      || | |||||||||||||    
T  26520350 ttg-ctcttggcaacaaacactaagatt--gaggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgg 26520255  T
Q  249 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520254 gactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248638
Alignment:
Q  174 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  274 acttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctctt 25248638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Original strand, 16429049 - 16429152
Alignment:
Q  199 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16429049 ttgggaaacactattaggattg-agtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatat 16429147  T
Q  299 ctctt 303  Q
    |||||    
T  16429148 ctctt 16429152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25248850 - 25248756
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248850 tttttctagaaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30790759 - 30790487
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  30790759 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttaga 30790660  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    ||  |||  |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | ||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||| |||||||  |    
T  30790659 aa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggagacactaggg-ttgt-ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--g 30790570  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30790569 agtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 30790487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Original strand, 23783449 - 23783533
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactt 89  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23783449 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115189
Alignment:
Q  187 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 286  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgta 6115206  T
Q  287 acccattgatttctctt 303  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  6115205 accaattgatatctctt 6115189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738716
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 30738732  T
Q  288 cccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  30738731 ccctttgatgtctctt 30738716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 249 - 303
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816081
Alignment:
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 23816081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 267
Target Start/End: Original strand, 27916440 - 27916653
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | || | ||    ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||    
T  27916440 acttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttagaagc-cagcaagaaaactagggtttg 27916538  T
Q  147 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt 246  Q
    ||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |   |||||||||    
T  27916539 ta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattg-agtctcttggtcacatgaagagatt 27916632  T
Q  247 gggactttgggtagaattagg 267  Q
    | |||||||||| ||||||||    
T  27916633 gtgactttgggtggaattagg 27916653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 303
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561662
Alignment:
Q  185 tgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || || |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  284 gtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  16561643 gtaaccctttgatatctctt 16561662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613326
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattg-agtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  288 cccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  26613341 ccctttgatatctctt 26613326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279424
Alignment:
Q  130 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctct 228  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattg-agcttct 28279385  T
Q  229 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28279386 tggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 28279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13127959 - 13127837
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  13127959 ctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagaga-ggggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatagagttt 13127862  T
Q  157 gtctcttcggaacaaacactagggtt 182  Q
      || || | ||||||||||||||||    
T  13127861 -ccttttggcaacaaacactagggtt 13127837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 83 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6115384 - 6115344
Alignment:
Q  83 taaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 123  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115384 taaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 6115344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatta 265  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26613577 - 26613503
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt--gagatagagggggctg-aaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26613577 cttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttagaa 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15295183 - 15295142
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15295183 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgaga 15295142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Original strand, 43104102 - 43104139
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaac 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43104102 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaac 43104139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46432066 - 46432017
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  46432066 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 46432017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332719
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaa 206  Q
    ||||||||||||||||  || |  |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa--gccaacacaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaa 26332744  T
Q  207 cactattaggattggagtctcttggt 232  Q
    |||||||||||||  |||||||||||    
T  26332743 cactattaggatt-tagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30738963 - 30738890
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 123  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |  |||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30738963 cttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaa 30738890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 296
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959237
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 286  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||   || ||| |||||| ||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatg-agtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattctttta 49959227  T
Q  287 acccattgat 296  Q
    |||| |||||    
T  49959228 accctttgat 49959237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 102
Target Start/End: Original strand, 16431044 - 16431096
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggg 102  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  16431044 acttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg 16431096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353467
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  21353525 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 21353467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 113)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16934523 - 16934188
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16934523 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 16934424  T
Q  106 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaa 205  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16934423 gatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaa 16934324  T
Q  206 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16934323 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 16934224  T
Q  306 taacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16934223 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 16934188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16932169 - 16931834
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16932169 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggct 16932070  T
Q  106 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  16932069 gatacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaa 16931970  T
Q  206 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16931969 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 16931870  T
Q  306 taacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16931869 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 16931834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 18847105 - 18847441
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  18847105 atttgttacaaatttaaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggt 18847204  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18847205 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttggga 18847304  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18847305 aacactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18847404  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18847405 gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 18847441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 44600174 - 44599883
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600174 acttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 44600075  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44600074 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 44599975  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44599974 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 44599883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9176855 - 9176519
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9176855 atttgttataaatttaaagcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggc 9176756  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9176755 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttggga 9176656  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9176655 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 9176556  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9176555 gtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 9176519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22783126 - 22782783
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  ||||        |||    
T  22783126 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatag 22783027  T
Q  98 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22783026 agggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcac 22782927  T
Q  198 tttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 297  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782926 cttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 22782827  T
Q  298 tctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782826 tctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 22782783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22780761 - 22780418
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  ||||        |||    
T  22780761 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatag 22780662  T
Q  98 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780661 agggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcac 22780562  T
Q  198 tttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 297  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780561 cttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 22780462  T
Q  298 tctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22780461 tctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 22780418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9174509 - 9174192
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174509 gcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9174410  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  9174409 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 9174310  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||| ||||    
T  9174309 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacggtactcatcata 9174210  T
Q  323 tagtggattggagggctg 340  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9174209 tagtggattggagggctg 9174192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11008951 - 11008613
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------taga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||   |||||||      ||||    
T  11008951 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctat--tttgagagagagataga 11008854  T
Q  99 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11008853 gggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 11008754  T
Q  199 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11008753 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt- 11008655  T
Q  299 ctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||| ||||    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11008654 -tctttgtaatggtactcatcatatagtggattggagggctgc 11008613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 51015216 - 51015533
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015216 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 51015315  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  51015316 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 51015414  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  51015415 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 51015514  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  51015515 tagtggatcggaggtctgc 51015533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11006604 - 11006282
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||      ||||||||||||||||||||||    
T  11006604 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagactat--tttgagagagagatagagggggctgaaacaagggt 11006507  T
Q  117 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 216  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11006506 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 11006407  T
Q  217 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactc 316  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||    
T  11006406 attggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatggtactc 11006307  T
Q  317 accatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  11006306 atcatatagtggatcggagggctgc 11006282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 5198390 - 5198708
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198390 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 5198489  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5198490 aggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggatt-ga 5198588  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||    
T  5198589 gtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 5198688  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5198689 atagtggattggagggctgc 5198708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 11434925 - 11435242
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11434925 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 11435024  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11435025 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 11435123  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    ||||| ||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||    
T  11435124 gtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 11435223  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  11435224 tagtggatcggagggctgc 11435242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22044753 - 22044436
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044753 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22044654  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  22044653 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggatt-ga 22044555  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||    
T  22044554 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 22044455  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22044454 tagtggatcggagggctgc 22044436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22047048 - 22046731
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047048 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22046949  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22046948 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 22046850  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||    
T  22046849 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcata 22046750  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22046749 tagtggatcggagggctgc 22046731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 38409169 - 38409492
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggt 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||      |||||||||||||||||| |||    
T  38409169 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggt 38409268  T
Q  117 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 216  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38409269 ttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 38409368  T
Q  217 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactc 316  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  38409369 att-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactc 38409467  T
Q  317 accatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  38409468 atcatatagtggatcggagggctgc 38409492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22803097 - 22802818
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803097 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22802998  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22802997 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 22802899  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22802898 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22802818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Original strand, 48486289 - 48486560
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48486289 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 48486388  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  48486389 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 48486487  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48486488 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattga 48486560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8631759 - 8631464
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8631759 actttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 8631660  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  8631659 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 8631464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18709507 - 18709209
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18709507 acttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 18709408  T
Q  142 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  18709407 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggtt-gagtctcttggttacgggaag 18709309  T
Q  242 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18709308 agattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggactgc 18709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 9148221 - 9148540
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  9148221 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaagcaagggtttag 9148320  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 220  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  9148321 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt- 9148419  T
Q  221 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcacca 320  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||    
T  9148420 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatca 9148519  T
Q  321 tatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||  ||||||||||    
T  9148520 tatagtggaacggagggctgc 9148540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 40637071 - 40637323
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40637071 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 40637170  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  40637171 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 40637323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2485209 - 2484918
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga-gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2485209 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 2485110  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  2485109 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 2484918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 24888766 - 24889045
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888766 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24888865  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24888866 aggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 24888964  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24888965 gtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctctt 24889045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31849962 - 31849644
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31849962 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtcttgtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31849863  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacact-agggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  31849862 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-g 31849764  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||    
T  31849763 agtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcat 31849664  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  31849663 atagtggatcggagggctgc 31849644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37089737 - 37089417
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggttta 119  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089737 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 37089638  T
Q  120 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37089637 gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 37089538  T
Q  220 ggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcacc 319  Q
     |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |    
T  37089537 -gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatc 37089439  T
Q  320 atatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  37089438 atatagtggaacggagggctgc 37089417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Original strand, 24878963 - 24879238
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 126  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  24878963 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagac 24879062  T
Q  127 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtct 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24879063 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtct 24879161  T
Q  227 cttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24879162 cttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24879238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 24880421 - 24880700
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  24880421 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaa 24880520  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24880521 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggatt-ga 24880619  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24880620 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24880700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 40091774 - 40091499
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 126  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40091774 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagac 40091675  T
Q  127 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtct 226  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40091674 aacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtct 40091576  T
Q  227 cttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40091575 cttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 40091499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 47274697 - 47274975
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274697 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 47274796  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  47274797 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-ga 47274894  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47274895 gtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 47274975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 24348211 - 24348506
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24348211 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 24348310  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  24348311 gtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 24348409  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24348410 tgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 24348506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22132735 - 22132437
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag---------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22132735 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttg 22132636  T
Q  141 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22132635 ggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 22132538  T
Q  241 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctg 340  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22132537 gaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctg 22132438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22801225 - 22800946
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801225 gcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 22801126  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  22801125 tgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 22801027  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22801026 gtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22800946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 6764836 - 6765132
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6764836 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 6764935  T
Q  150 agagtttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6764936 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgc 6765132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 7941289 - 7941611
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaac--tttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941289 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgttgtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttag 7941388  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7941389 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 7941488  T
Q  219 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactca 317  Q
    | ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||    
T  7941489 t-gagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactca 7941587  T
Q  318 ccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  7941588 tcatatagtggattggagggctgc 7941611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 14633317 - 14633567
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14633317 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 14633415  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14633416 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtta-cggaagagattggg 14633513  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 14633567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 5637832 - 5637549
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  5637832 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagttt 5637733  T
Q  119 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5637732 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 5637633  T
Q  219 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637632 t-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 5637549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3824936 - 3824654
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaa-ctttgaga----tagagggggctgaaacaagggtt 117  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||    |||||||||||||||||  ||||    
T  3824936 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtt 3824839  T
Q  118 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3824838 tagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 3824739  T
Q  218 ttggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824738 tt-gagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 3824654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22134966 - 22134662
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag---------------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||               |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22134966 acttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagagagagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaa 22134867  T
Q  135 aactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22134866 aactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtta 22134769  T
Q  235 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattgga 334  Q
    |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  22134768 tgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggattgga 22134669  T
Q  335 gggctgc 341  Q
    |||||||    
T  22134668 gggctgc 22134662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36919950 - 36919668
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttga--gatagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36919950 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttag 36919851  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36919850 aaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36919751  T
Q  220 ggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36919750 g-agtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 36919668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 329
Target Start/End: Original strand, 47868398 - 47868677
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47868398 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 47868497  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |    
T  47868498 agagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtgga 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtgga 47868677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395929
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtga 12395982  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12395981 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctctt 12395929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36921858 - 36921577
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36921858 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagagatagaggggg-tgaaacaagggcttag 36921760  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36921759 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 36921660  T
Q  220 ggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  36921659 g-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 36921577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 619783 - 619531
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  619783 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcat 619684  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  619683 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gactgtcttggttaagggaagagattggg 619585  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  619584 tctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctctt 619531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928269
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaagattggg 38928315  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38928314 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 38928269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400891
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtga 12400944  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12400943 ctttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctctt 12400891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 302
Target Start/End: Original strand, 36378289 - 36378540
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36378289 acttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 36378388  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  36378389 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 36378540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 33415821 - 33415572
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  33415821 ttttactacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag 33415722  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  33415721 agtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaaga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgaggc 33415624  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33415623 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 33415572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37313400 - 37313150
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37313400 ttttactataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatag 37313301  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||     
T  37313300 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgggat 37313202  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37313201 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 37313150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14787769 - 14787523
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14787769 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 14787670  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14787669 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 14787571  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14787570 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattga 14787523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 47211082 - 47210797
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47211082 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 47210983  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  47210982 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggattg-agtctcttagttacgggaagag 47210896  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47210895 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 47210797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 16453306 - 16453558
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||     
T  16453306 acttttgctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtac 16453405  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  16453406 aaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggg 16453504  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16453505 actttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 16453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096132
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |     
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattaga 19096078  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19096079 gctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctctt 19096132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 52 - 295
Target Start/End: Original strand, 56030443 - 56030685
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030443 ttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatag 56030542  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  56030543 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggagc 56030641  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  56030642 tttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 56030685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 119 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26086022
Alignment:
Q  119 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  219 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcac 318  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||     
T  26086143 t-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcat 26086045  T
Q  319 catatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  26086044 catatagtggatcggaaggctgc 26086022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17662574 - 17662290
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17662574 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 17662475  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    ||           ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  17662474 gt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagac 17662387  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17662386 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 17662290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 13543953 - 13544208
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  13543953 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 13544052  T
Q  147 tatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  13544053 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagat 13544150  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13544151 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 13544208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19322942
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 156  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  157 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgg 256  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgg 19322895  T
Q  257 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19322896 gtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 19322942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409431
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagagagg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggatt-gagtctcttagttataggaagagattgaga 18409484  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18409483 cttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 18409431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 55 - 303
Target Start/End: Original strand, 41997494 - 41997741
Alignment:
Q  55 tactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  41997494 tactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagt 41997593  T
Q  155 ttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggacttt 254  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| || |||    
T  41997594 ttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaaaagattgagatttt 41997692  T
Q  255 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  41997693 gggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctctt 41997741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 52942810 - 52942543
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtat--caaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52942810 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatatcagactaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttag 52942712  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  52942711 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt- 52942613  T
Q  221 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52942612 gagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 52942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt-ggaattgagtctcttggttacaggaagagattgagg 3937346  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattct 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937345 ctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18537806 - 18537559
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||    
T  18537806 cttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtat 18537709  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |    
T  18537708 agagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgag 18537613  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18537612 acttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18537559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 272
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 6133068  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcggga 272  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6133069 ctttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 53405124 - 53405384
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53405124 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 53405223  T
Q  147 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||  |    
T  53405224 tatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggaaagaggct 53405321  T
Q  247 gggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||||| |||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405322 gagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctctt 53405384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18535164 - 18534917
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  18535164 cttttacaataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgttta-aaaacaaacaacaaa-ctagggtttgtat 18535067  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||| |    
T  18535066 agagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgag 18534971  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18534970 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18534917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8756586 - 8756336
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| |||| |||| ||||||    
T  8756586 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattaggatttgta 8756488  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctctt-ggttatgggaagagattg 247  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    
T  8756487 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattg-agtctctttggtcacgggaagagattg 8756392  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8756391 agactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 8756336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 129 - 296
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380591
Alignment:
Q  129 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatct 36380523  T
Q  229 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 36380591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 214  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 24446820  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 214  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 303
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455490
Alignment:
Q  166 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatta 265  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 16455452  T
Q  266 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16455453 ggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 16455490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 189
Target Start/End: Original strand, 5100994 - 5101133
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  5100994 acttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 5101093  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 189  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101094 agagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 133 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890310
Alignment:
Q  133 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattg-agtctcttgat 38890381  T
Q  233 tatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 38890310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15032872 - 15032633
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  15032872 acttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtat 15032774  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||||| | ||||||          ||  ||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||| ||||| ||    
T  15032773 agagtttg-ctctttgcaacaaa----------tg-aggttgattcatatttggaaacactattaggatt-gagtctcttggacacgagaaaagatttgg 15032687  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15032686 acttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 15032633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 289
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499280
Alignment:
Q  136 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggatt-gagtctattggttac 27499226  T
Q  236 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 289  Q
    |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27499227 gataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc 27499280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 170
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgta-tcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaaca 170  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Original strand, 2891437 - 2891540
Alignment:
Q  199 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2891437 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatat 2891535  T
Q  299 ctctt 303  Q
    |||||    
T  2891536 ctctt 2891540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 201 - 296
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547396
Alignment:
Q  201 gggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  13547302 gggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgat 13547396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 12102088 - 12102336
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggggg-ctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| ||    
T  12102088 cttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggttt-ta 12102184  T
Q  149 tagag-tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
     |||| ||| |||   ||| | ||||  |||||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  12102185 gagagatttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtatcttggtcatgggaaaagattg 12102279  T
Q  248 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12102280 gaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccactgatatctctt 12102336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 341
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437650
Alignment:
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 11437650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Original strand, 28453686 - 28453915
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||   |||||  |||||||||||||| |     
T  28453686 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgca- 28453782  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
     ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28453783 -gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggttacgggaagagatttgg 28453877  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 287  Q
    || |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  28453878 accttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaa 28453915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136798
Alignment:
Q  141 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 240  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | | |||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgg-gtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  241 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctctt 30136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 249 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635521
Alignment:
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 5635521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 265
Target Start/End: Original strand, 9863712 - 9863917
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatag-agggggctg--aaacaagggtttagaaaagcaacaac-aaaactagggtttgtataga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| || | ||||  |||||||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||  ||||    
T  9863712 ctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttag-aagccaaaaacaaaaactagggtttg--taga 9863808  T
Q  153 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggact 252  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| ||||   || ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| ||||    
T  9863809 gtttgt-tcttggcaacaaacactaaggtt--gggtttgattcaccttgggaaaccctattaggatt-gagtcttttggtcacgggaagagattgagact 9863904  T
Q  253 ttgggtagaatta 265  Q
    |||||||||||||    
T  9863905 ttgggtagaatta 9863917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 25357634 - 25357838
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag-----ggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  25357634 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagagagtgagaggggctgaaaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggt 25357731  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    ||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25357732 tt--agagagatt-tctctaagtgggagacactagggtt-gtga-ttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagag 25357825  T
Q  244 attgggactttgg 256  Q
    |||||||||||||    
T  25357826 attgggactttgg 25357838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40999281 - 40999071
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||    |||||| |||||||||| |||||||    
T  40999281 ttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagacgt-caacaagaaaactaggggttgtata 40999184  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||    
T  40999183 gagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaacattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatcgaga 40999088  T
Q  251 ctttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||||    
T  40999087 ctttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 266
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113080
Alignment:
Q  58 tataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 155  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||| |||||| | ||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagc-caacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  156 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggg-aagagattgggacttt 254  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttggtcacggggaagagattaggacttt 10113068  T
Q  255 gggtagaattag 266  Q
    ||||||||||||    
T  10113069 gggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983619
Alignment:
Q  188 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 286  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagatta-agtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  287 acccattgat 296  Q
    |||| |||||    
T  31983628 accctttgat 31983619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 303
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215555
Alignment:
Q  231 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 4215555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150978
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T
Q  288 cccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  47150993 ccctttgatatctctt 47150978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16186173 - 16186099
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggct-gaaacaagggtttagaaa 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16186173 acttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185926
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  16186018 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgat 16185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 232
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  133 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 232  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022516
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaa 205  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||| |||    
T  9022362 aaacaagggtttagaagt-caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  206 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||| ||||||||| | | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9022456 acagtattaggatagaatt-tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattagg 9022516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982300
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 265  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3982362 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaatta 3982300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  239 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 277  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 296
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101171
Alignment:
Q  255 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 5101171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Original strand, 16455284 - 16455356
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| || ||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16455284 acttttgctattaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 16455356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23001566 - 23001523
Alignment:
Q  225 ctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23001566 ctcttggttatgggaagagattcgggactttaggtagaattagg 23001523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 96
Target Start/End: Original strand, 36380371 - 36380417
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagata 96  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  36380371 acttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagata 36380417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 52043765 - 52043716
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagtaaactttgagatagag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  52043765 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 52043716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300485
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 31542633 - 31542968
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31542633 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 31542732  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31542733 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 31542832  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  31542833 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctcttt 31542931  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31542932 gtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgc 31542968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 31544978 - 31545314
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31544978 atttattacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggc 31545077  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31545078 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 31545177  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31545178 aacactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 31545277  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31545278 gtaacagtactcatcatatagtggattggagggctgc 31545314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31179752 - 31179416
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31179752 atttgttacaaatttaaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagc 31179653  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31179652 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 31179553  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  31179552 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctcttt 31179453  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31179452 gtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 31179416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 38882021 - 38882339
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38882021 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttaga 38882120  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  38882121 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-g 38882219  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||    
T  38882220 agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcat 38882319  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  38882320 atagtggatcggagggctgc 38882339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 2174835 - 2175152
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2174835 gcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2174934  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  2174935 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-ga 2175033  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| | ||||    
T  2175034 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttacttatcata 2175133  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  2175134 tagtggatcggagggctgc 2175152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 15552178 - 15552479
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552178 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 15552277  T
Q  140 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggga 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15552278 gggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgattacggga 15552377  T
Q  240 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggct 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15552378 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 15552477  T
Q  340 gc 341  Q
    ||    
T  15552478 gc 15552479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 4236545 - 4236863
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4236545 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaa 4236644  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  4236645 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 4236743  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  4236744 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 4236843  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  4236844 atagtggatcggagggctgc 4236863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 25921836 - 25921557
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921836 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 25921737  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  25921736 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-ga 25921638  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921637 gtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctt 25921557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21684824 - 21684497
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  21684824 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 21684725  T
Q  113 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 212  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21684724 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 21684625  T
Q  213 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  21684624 taggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaat 21684526  T
Q  313 actcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21684525 actcatcatatagtggatcggagggctgc 21684497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 21947943 - 21948221
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21947943 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaattttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaa 21948041  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21948042 agacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 21948140  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21948141 gtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctctt 21948221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477098
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  290 cattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34477149 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 34477098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 16776075 - 16776391
Alignment:
Q  25 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaa-tatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 123  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776075 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagaccttgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaa 16776174  T
Q  124 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggag 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16776175 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-ag 16776273  T
Q  224 tctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg-gtaacaaaactcaccata 322  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||   ||| | ||||    
T  16776274 tctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc-attgatttctcttttgtaacgttacttatcata 16776372  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  16776373 tagtggatcggagggctgc 16776391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10529435 - 10529183
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||    
T  10529435 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttat 10529336  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10529335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 10529183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 39854427 - 39854717
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39854427 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 39854525  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||     
T  39854526 agagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgc 39854717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479463
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 289  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  290 cattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34479514 cattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 34479463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18511547 - 18511296
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  18511547 tttaatataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 18511448  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18511447 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggga 18511349  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18511348 ctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctctt 18511296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 18468950 - 18469206
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18468950 acttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18469049  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  18469050 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 18469148  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18469149 tgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctctt 18469206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 23 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 2818699 - 2818427
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818699 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2818600  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg-ttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |    
T  2818599 aggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgatt-g 2818501  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2818500 agtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 2818427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 40221465 - 40221717
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40221465 acttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 40221564  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40221565 agagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggg 40221663  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40221664 acttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 40221717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073078
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttaggggaagagattgggg 17073025  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17073026 ctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 17073078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 51 - 302
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904297
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattaggg 25904245  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25904246 ctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 25904297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 18466625 - 18466879
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18466625 ttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgg 18466724  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  ||    
T  18466725 atagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagaggctg 18466823  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466824 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 18466879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189693
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttacaggaagagat 1189751  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1189750 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 1189693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 6745053 - 6745302
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  6745053 gagataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggtt 6745151  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745152 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 6745250  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6745251 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 6745302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 25804009 - 25804259
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25804009 gagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggtt 25804108  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804109 gattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 25804207  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  25804208 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 25804259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 288
Target Start/End: Original strand, 6756437 - 6756674
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756437 acttttactattaatatagatcttgtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 6756536  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  6756537 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgag 6756635  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756636 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6756674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31466341 - 31466070
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||    
T  31466341 gcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaa 31466242  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||    
T  31466241 aagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggatt-ga 31466143  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31466142 gtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgat 31466070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 53 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18509652 - 18509417
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag-ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18509652 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatag 18509553  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18509552 agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagaatgggac 18509454  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18509453 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaac 18509417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530750
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggctacgggaagagattagga 34530803  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34530802 ctttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctctt 34530750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 329
Target Start/End: Original strand, 27912473 - 27912758
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27912473 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 27912572  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  27912573 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagag 27912671  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtgga 329  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||    
T  27912672 gctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtgga 27912758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 6747247 - 6747538
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt--gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6747247 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgt 6747346  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    ||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  6747347 ataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||   ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgc 6747538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 54 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 10474655 - 10474407
Alignment:
Q  54 ttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10474655 ttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagag 10474556  T
Q  154 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactt 253  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10474555 tttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagatt-gaatctcttggttacaggaagagattgggactt 10474457  T
Q  254 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10474456 tgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 10474407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 26097676 - 26097927
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  26097676 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggat 26097775  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |   ||||    
T  26097776 agagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactattaggaat-gagtctcttggttacgggaaaatgctggg 26097873  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26097874 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 26097927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 53 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16092537 - 16092292
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaacttt---gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16092537 tttactagaaatatagactttgtatcagatgtaaacttgtgagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgta 16092438  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  16092437 tagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattga 16092339  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092338 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 16092292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 27910388 - 27910645
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||      ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27910388 acttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-tttaaaaaggcaacaacaaaactagggt 27910486  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  27910487 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagag 27910585  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910586 gctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 27910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472697
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattggga 31472750  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  31472749 cttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctctt 31472697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 18596590 - 18596840
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18596590 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtataaaga--caacaacaaaactagggtttgtat 18596687  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18596688 agagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 18596786  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  18596787 actttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctctt 18596840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36402690 - 36402412
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402690 gcagatttgtt-caaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttatatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 36402592  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
       |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||    
T  36402591 tgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggatt-ga 36402493  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  36402492 atctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctctt 36402412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 270
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggttccgggaagagattggga 20045152  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgg 270  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20045153 ctttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37706116 - 37705864
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  37706116 acttttgctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtat 37706017  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  37706016 agactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagg 37705918  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
      ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37705917 gttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 37705864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39398077
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||     
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgga 39398131  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39398130 actttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctctt 39398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 24 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 12556285 - 12556016
Alignment:
Q  24 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaa 123  Q
    |||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12556285 cagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaat 12556186  T
Q  124 agcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggag 223  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  12556185 gacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtg 12556087  T
Q  224 tctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  12556086 tctcttggctacgggaagagatt-ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattga 12556016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 51 - 266
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 20043192  T
Q  251 ctttgggtagaattag 266  Q
    |||||| |||||||||    
T  20043193 ctttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127051
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggga 24126998  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24126999 ctttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctctt 24127051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 58 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818574
Alignment:
Q  58 tataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 157  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagagggg-ctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  158 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttggg 257  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagact-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttggg 17818620  T
Q  258 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17818619 tagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 17818574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 308
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954617
Alignment:
Q  59 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 158  Q
    |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  159 ctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttggg 257  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattg-agtctcttagttacgagaagagattgagactttggg 2954566  T
Q  258 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaa 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2954567 tagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaa 2954617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696072
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
              ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgaga 696019  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  696020 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 696072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 10586782 - 10587065
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag---ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          
T  10586782 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag------ 10586875  T
Q  147 tatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
         |||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||    
T  10586876 -----agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc-agtctcttgcttacggaaagagat 10586969  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10586970 tgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 10587065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 129 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658437
Alignment:
Q  129 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctct 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga-tcgagtctct 658512  T
Q  229 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 658437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 50 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26098587 - 26098379
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  26098587 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtat 26098488  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  26098487 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgatt-gagtctcttggttacggaaagagattggg 26098389  T
Q  250 actttgggta 259  Q
      ||||||||    
T  26098388 gttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 56 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6661512 - 6661270
Alignment:
Q  56 actataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  6661512 actataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaattagggtatgtatagagtt 6661414  T
Q  156 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttg 255  Q
    ||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| || ||||    
T  6661413 tgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaaattgagattttg 6661318  T
Q  256 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6661317 ggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 6661270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 341
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410256
Alignment:
Q  174 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  274 acttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgc 4410256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 58 - 288
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21288949
Alignment:
Q  58 tataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 157  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  158 tctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||| |||||||||||      ||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattaggac 21288912  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 288  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21288913 tttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaac 21288949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 203 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373186
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggaggg 337  Q
    | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 3373186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749934
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 10749934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20507798 - 20507665
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  20507798 acttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtat 20507699  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 183  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507698 agagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 183 - 303
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798242
Alignment:
Q  183 tgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 282  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  283 tgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  39798222 tgtaacccattgatttctctt 39798242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757410
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 10757410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665277
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 23665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793310
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 23793310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354620
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   |||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgc 15354620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356896
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   |||||  | ||||||||| ||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgc 15356896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960177
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 38960177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505925
Alignment:
Q  186 gggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 285  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  286 aacccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  20505942 aacacattgatatctctt 20505925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 9020167 - 9020413
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||| | |  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  9020167 ttttactataaatacataccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggag-gcaaca-caaaagtagggtttgtat 9020264  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||   ||||| | ||||||||||||||||   |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||     
T  9020265 agagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattg-agtttcttggtcacgggaagagattgga 9020359  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9020360 gctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 9020413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208771
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttag-aaacaaacaac-aaactagggttt-tag 36208620  T
Q  150 agag-tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||| ||| |||   ||| | ||  |||||||||  |  |||||||||| |||||||||| || || |||| |||||||||||| | ||||||||||||     
T  36208621 agagatttctctaagcgggagaa--actagggttgtt--gttgattcaccttgggaaacattactaagatt-gagtctcttggtaacgggaagagattga 36208715  T
Q  249 gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36208716 gactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctctt 36208771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741904
Alignment:
Q  210 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  310 aaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
       ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 23741904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 174 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585828
Alignment:
Q  174 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 273  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattg-agtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  274 acttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctctt 41585828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 290
Target Start/End: Original strand, 20053834 - 20054020
Alignment:
Q  94 atagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgat 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||    
T  20053834 atagagggcgctgaaacaagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgat 20053929  T
Q  194 tcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20053930 tcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtt-tg----gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 20054020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 23665036 - 23665125
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23665036 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23793551 - 23793462
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23793551 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15354863 - 15354777
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttg 91  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15354863 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15357139 - 15357053
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttg 91  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15357139 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38960423 - 38960334
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38960423 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 4410000 - 4410101
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4410000 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 4410099  T
Q  146 gt 147  Q
    ||    
T  4410100 gt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 88
Target Start/End: Original strand, 10757162 - 10757245
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaact 88  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10757162 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 23667311 - 23667400
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23667311 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 17413441 - 17413251
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaa 206  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||    
T  17413441 aaacaagggtttagaag-gcagcactaaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 17413348  T
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17413347 cactattaggattg-agtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctt 17413251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 303
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724088
Alignment:
Q  169 caaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 268  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatt---------ggtagaattaggc 2724053  T
Q  269 gggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2724054 gggtgatttattcttgtaacccattgatatctctt 2724088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 41586042 - 41585946
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  41586042 acttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23742147 - 23742057
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaa-gcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23742147 atttgttacaaattttaggcagatttgttataggttttaaagcaggacttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34477453 - 34477379
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477453 atttgttacagattttgagcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatca 34477379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 276
Target Start/End: Original strand, 42770717 - 42770934
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||| ||| ||    
T  42770717 acttttactataaatataaactttgtatcga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaattagg-tttata 42770812  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||  ||||||||  |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||     
T  42770813 tagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactg-agtctcttggtcacgggaagagattga 42770906  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagact 276  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770907 gactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 34479814 - 34479740
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479814 atttgttacagattttgagcagatttgttacagattttaagcgagacctttactataaaaatagaccttgtatca 34479740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 87
Target Start/End: Original strand, 10749704 - 10749767
Alignment:
Q  24 cagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaac 87  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10749704 cagatttgttatagattttaagcaggacttttagtataaatatagaccttgtatcaaagcaaac 10749767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Original strand, 42770938 - 42771005
Alignment:
Q  236 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42770938 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctctt 42771005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143661
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 15143645  T
Q  288 cccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  15143646 ccctttgatatctctt 15143661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667552
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaac-tatgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||| ||||| ||||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgc 23667552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 89
Target Start/End: Original strand, 39798004 - 39798070
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactt 89  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  39798004 gcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtattagagtaaactt 39798070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3373377 - 3373332
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagat 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3373377 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144684
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa-acactagggtttgtgggttgattcactttgg-ga 204  Q
    ||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | ||||||||| |||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaagc-caacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg-ggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  2144746 aacactattaggat-ggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattagg 2144684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 302
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897923
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  4897828 cactgttaggattg-agtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctct 4897923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 101
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723961
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggg 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg 2723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754312
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaa 206  Q
    ||||||||||||| |||  |||||  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||  |||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754253 cactattagaattg-agcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 262
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaa 205  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| ||||||| |  | |||||||   |||| |||    
T  29748352 aaacaagggtttagaagc-caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggttag--gattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  206 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaa 262  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748446 acactaataggattg-agtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 2144928 - 2144878
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatca-aagtaaactttgagatagag 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||    
T  2144928 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 2144878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 100
Target Start/End: Original strand, 29748285 - 29748335
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagtaaactttgagatagagg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  29748285 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaacttttagagagagg 29748335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 79
Target Start/End: Original strand, 25803959 - 25803988
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803959 acttttactataaatatagaccttgtatca 25803988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattg-agtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 6106 - 6442
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6106 atttgttacaaatttaaagcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggc 6205  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6206 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 6305  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  6306 aacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttt 6405  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  6406 gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 6442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 44720797 - 44721133
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44720797 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggc 44720896  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggg- 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  44720897 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 44720996  T
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44720997 aaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 44721095  T
Q  304 ggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44721096 tgtaacggtactcatcatatagtggattggagagctgc 44721133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 18810662 - 18810997
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  18810662 atttgttacagattttgagcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggc 18810761  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18810762 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 18810861  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18810862 aacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18810960  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810961 gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgc 18810997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 27829269 - 27829586
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829269 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27829368  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27829369 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 27829467  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27829468 gtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 27829567  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27829568 tagtggatcggagggctgc 27829586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 27826958 - 27827275
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27826958 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27827057  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27827058 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 27827156  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  27827157 gtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 27827256  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27827257 tagtggatcggagggctgc 27827275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 99 - 341
Target Start/End: Original strand, 43079650 - 43079892
Alignment:
Q  99 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcact 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43079650 gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacc 43079749  T
Q  199 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079750 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 43079849  T
Q  299 ctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43079850 ctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 43079892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 14807723 - 14808041
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807723 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 14807822  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  14807823 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 14807921  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  14807922 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 14808021  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  14808022 atagtggaacggagggctgc 14808041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24873523 - 24873226
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24873523 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 24873424  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24873423 ttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagag 24873324  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24873323 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 24873226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082263
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  291 attgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43082213 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 43082263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Original strand, 18812847 - 18813171
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggc 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||    
T  18812847 atttgttacagattttgagcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggc 18812946  T
Q  105 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18812947 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 18813035  T
Q  205 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg 304  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18813036 aacactattaggattg-agtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 18813134  T
Q  305 gtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18813135 gtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgc 18813171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 4423990 - 4424308
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4423990 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaa 4424089  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  4424090 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggatt-ga 4424188  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||    
T  4424189 gtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcat 4424288  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||  |||||||||    
T  4424289 atagtggatcagagggctgc 4424308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28251930 - 28251612
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28251930 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaa 28251831  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  28251830 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 28251732  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    ||||| |||    
T  28251731 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 28251632  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  28251631 atagtggatcggagggctgc 28251612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 32339304 - 32339599
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32339304 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 32339403  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32339404 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagat 32339502  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32339503 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 32339599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106981
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtga 27107034  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27107033 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctctt 27106981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 303
Target Start/End: Original strand, 15072686 - 15072962
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 126  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15072686 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 15072785  T
Q  127 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtct 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15072786 aacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtct 15072884  T
Q  227 cttggttatgggaaga-gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15072885 cttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 15072962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 15067953 - 15068232
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15067953 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaa 15068052  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  15068053 aggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggatt-ga 15068151  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15068152 gtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15068232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28283561 - 28283265
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28283561 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggt 28283462  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  28283461 ttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagag 28283363  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28283362 attggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 28283265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 302
Target Start/End: Original strand, 27911014 - 27911264
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27911014 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27911112  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911113 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 27911211  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27911212 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctct 27911264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 302
Target Start/End: Original strand, 27957433 - 27957683
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27957433 acttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtat 27957531  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27957532 agagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 27957630  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27957631 actttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctct 27957683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 608774 - 609024
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  608774 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 608873  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608874 gattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 608972  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  608973 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 609024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 3874005 - 3874300
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  3874005 acttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagttt 3874104  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||      
T  3874105 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggc 3874203  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3874204 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 3874300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14419527 - 14419285
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14419527 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtat 14419428  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14419427 agagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 14419329  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419328 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 14419285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 15809214 - 15809508
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15809214 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 15809313  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |     
T  15809314 gtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaaac 15809411  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  15809412 taggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgc 15809508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 1225165 - 1225409
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  1225165 acttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaa 1225264  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1225265 agagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattga 1225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 296
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477520
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 14477474  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477475 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480587
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |     
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgagg 30480640  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30480639 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 30480587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13858820 - 13858578
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13858820 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 13858721  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13858720 agagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggg 13858622  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 293  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  13858621 gctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt 13858578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541507
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattggga 33541525  T
Q  251 ctttgggtagaattaggc 268  Q
    |||| |||||||||||||    
T  33541524 cttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 36865538 - 36865786
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36865538 ttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 36865637  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    | ||||||||||||| |    
T  36865638 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttc---acgggaagagattggaa 36865733  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36865734 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 36865786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 51 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372269
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattggga 5372315  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5372314 ctttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgat 5372269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22685002 - 22684698
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22685002 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaacta 22684903  T
Q  140 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggga 239  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22684902 gggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  240 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-tggtaacaaaactcaccatatagtggattggag 335  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||||  ||||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  336 ggctgc 341  Q
    ||||||    
T  22684703 ggctgc 22684698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 41384744 - 41384987
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41384744 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41384842  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  41384843 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgga 41384941  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  41384942 gctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattga 41384987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 43530123 - 43530405
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  43530123 acttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaac------------- 43530209  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||      
T  43530210 gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctctcggttacgggaagaggc 43530308  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43530309 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgc 43530405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952771
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattaggg-ttgtata 25952619  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaaattgaga 25952718  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  25952719 cattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 25952771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 41382672 - 41382905
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41382672 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtat 41382771  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||           |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41382772 agaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac-----------ctattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 41382859  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  41382860 gctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 41382905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482561
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggttatgggaagagattgggg 21482508  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21482509 ctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctctt 21482561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5623073 - 5622877
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5623073 cttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 5622974  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5622973 gagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggatt-gagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 50 - 250
Target Start/End: Original strand, 26775200 - 26775400
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26775200 acttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtat 26775299  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctc-ttggttatgggaagagattgg 248  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||| |||    
T  26775300 atagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaatt-gagtctctttggttatgcgatgagactgg 26775398  T
Q  249 ga 250  Q
    ||    
T  26775399 ga 26775400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15186046 - 15185799
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||    
T  15186046 acttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatat 15185947  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg-gagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||        
T  15185946 aaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga---- 15185851  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15185850 ---tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctctt 15185799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 31162212 - 31162460
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaa-caacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31162212 acttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaat-tagtgtttgt 31162308  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    ||| |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  31162309 ataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaccggaagagattg 31162404  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31162405 ggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 31162460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtata 35872619  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 214  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005716
Alignment:
Q  82 gtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaataggg 3005835  T
Q  181 tttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 280  Q
    ||   || |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3005834 tt---ggattgattcactttggaaaacactattagcattg-agtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 3005739  T
Q  281 cttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||| |||||||| ||||||    
T  3005738 cttgtaatccattgatatctctt 3005716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956208
Alignment:
Q  141 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| | |||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaa-tcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  241 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15956208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 303
Target Start/End: Original strand, 21480544 - 21480753
Alignment:
Q  81 agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 180  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  21480544 agtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggt 21480634  T
Q  181 tttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 280  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21480635 tt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggttacgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttatt 21480730  T
Q  281 cttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  21480731 cttgtaacccattgatatctctt 21480753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 27 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3886277 - 3886153
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 126  Q
    ||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3886277 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 3886178  T
Q  127 aacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3886177 aacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517248
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 124  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12517385 atttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatataccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 12517286  T
Q  125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517285 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214317
Alignment:
Q  82 gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaact-------------------agggtttgtatagagtttgtctct 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttggttacgggaagagattgagggtttgtatagagtttgtctct 37214415  T
Q  163 tcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaa 262  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||          | |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  37214414 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca----------ttgagtctcttggttacgggaagcgattggaactttgggtagaa 37214325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2468461 - 2468261
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  2468461 gcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttaga- 2468363  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttg----tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
           ||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  2468362 -------aatcaaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattagaat 2468274  T
Q  219 tggagtctcttggt 232  Q
    | ||||||||||||    
T  2468273 t-gagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 308
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181758
Alignment:
Q  174 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt-aggattggagtctcttggttatg--ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 270  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggatta-agtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  271 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaa 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaa 181758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 79
Target Start/End: Original strand, 43081913 - 43081986
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081913 tttgttacagattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43081986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 146
Target Start/End: Original strand, 181536 - 181632
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  181536 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaacaataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Original strand, 43079545 - 43079614
Alignment:
Q  10 ttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079545 ttacagattttaagcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Original strand, 31035068 - 31035235
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |  |||||| ||| |||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  31035068 ttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagagagt-ctgaaaacaatggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgt 31035165  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 220  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31035166 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattg 31035235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578362
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  288 cccattgatttctctt 303  Q
    ||  ||||| ||||||    
T  31578377 ccttttgatatctctt 31578362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573847
Alignment:
Q  133 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 232  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggt 31573882  T
Q  233 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31573881 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 308
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035374
Alignment:
Q  186 gggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 284  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  285 taacccattgatttctcttggtaa 308  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||    
T  31035351 taaccctttgatatctctttgtaa 31035374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 6375988 - 6376032
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6375988 acttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847740
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaa-tctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468214
Alignment:
Q  258 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctctt 2468214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896035
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattg-agtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14419833 - 14419784
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag 99  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  14419833 acttttgctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 79
Target Start/End: Original strand, 17847527 - 17847556
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17847527 acttttactataaatatagaccttgtatca 17847556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20915736 - 20915401
Alignment:
Q  8 tgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggct 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  ||||  |||||||||||    
T  20915736 tgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattgagagagatagagggggct 20915637  T
Q  106 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaa 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20915636 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 20915537  T
Q  206 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20915536 acactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 20915437  T
Q  306 taacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20915436 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 20915401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12195851 - 12195560
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195851 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 12195752  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12195751 agagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 12195652  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12195651 actttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 12195560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14507536 - 14507221
Alignment:
Q  25 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 124  Q
    ||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  14507536 agatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaag 14507437  T
Q  125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14507436 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 14507338  T
Q  225 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatata 324  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | ||||||    
T  14507337 ctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatacttatcatata 14507238  T
Q  325 gtggattggagggctgc 341  Q
    ||| || ||||||||||    
T  14507237 gtgaatcggagggctgc 14507221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4816627 - 4816276
Alignment:
Q  5 atttgttacagatttt-aagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------- 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||             
T  4816627 atttgttacagatttttaagcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagag 4816528  T
Q  95 -----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 189  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816527 agagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 4816428  T
Q  190 tgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 289  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816427 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 4816329  T
Q  290 cattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816328 cattgatttctcttttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 4816276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11983392 - 11983074
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11983392 gcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaa 11983293  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  11983292 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 11983194  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||    
T  11983193 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11983094  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  11983093 atagtggatcggagggctgc 11983074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 56 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19704905 - 19704612
Alignment:
Q  56 actataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag------ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19704905 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 19704806  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19704805 agagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattggg 19704706  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt--ctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19704705 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgc 19704612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 9019877 - 9020156
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9019877 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 9019976  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  9019977 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 9020075  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9020076 gtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 9020156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 28241657 - 28241366
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28241657 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 28241558  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  28241557 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 28241366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 50 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26932906 - 26932611
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26932906 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagg 26932807  T
Q  142 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26932806 gtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaag 26932707  T
Q  242 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggaggg 337  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  26932706 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggaggg 26932611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057424
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggga 13057371  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13057372 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 13057424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1230585 - 1230333
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1230585 actttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1230486  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||  ||||    
T  1230485 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 1230333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15533044 - 15532765
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15533044 gcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15532945  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  15532944 aggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 15532846  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15532845 gtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15532765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 15541503 - 15541224
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541503 gcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 15541404  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||    
T  15541403 aggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-ga 15541305  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15541304 gtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctt 15541224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 58 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458812
Alignment:
Q  58 tataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  158 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttggg 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgatt--ccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggg 14458897  T
Q  258 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  14458896 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgc 14458812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2629226 - 2628931
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag-----ggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2629226 acttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 2629127  T
Q  145 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2629126 tgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 2629028  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2629027 ttgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcatatagtggatcggagggctgc 2628931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477504
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||     
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattgggg 25477451  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25477452 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 25477504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15530485 - 15530168
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    |||| |||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15530485 gcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaa 15530386  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15530385 tggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 15530287  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||   ||||| |||    
T  15530286 gtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 15530188  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  15530187 atagtggaacggagggctgc 15530168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 3390357 - 3390609
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3390357 acttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 3390456  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||    
T  3390457 agagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattggg 3390555  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3390556 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3390609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629948
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||     
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gaatctcttggttacgggaagagattgggg 3630001  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3630000 ctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 32279948 - 32280226
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32279948 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagaccttgtatcatagtaaacttggagatagagggg-ctgaaacaagggtttaaaa 32280046  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  32280047 aggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 32280145  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32280146 gtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 32280226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30034943 - 30034648
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  30034943 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagttt 30034844  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||      
T  30034843 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcaattggttaagggaagaggc 30034745  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  30034744 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagcggatcggagggctgc 30034648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30729191 - 30728919
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  30729191 gcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaa 30729092  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30729091 agacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 30728993  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30728992 ctctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgat 30728919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 30967176 - 30967470
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  30967176 acttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggttt 30967274  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  30967275 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 30967373  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  30967374 tgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgc 30967470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3632271 - 3632022
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 152  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3632271 tttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 3632172  T
Q  153 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggact 252  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  3632171 gtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctctttgttacggaaagagattgggact 3632073  T
Q  253 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3632072 ttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3632022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 19227771 - 19227514
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  19227771 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaa 19227672  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19227671 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 19227573  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 281  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227572 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13039984
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgaga 13039931  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13039932 ctttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 13039984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 26064959 - 26065251
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttg-----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    |||     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  26064959 actttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtt 26065058  T
Q  145 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  26065059 tgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagg 26065154  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  26065155 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgc 26065251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 26084928 - 26085220
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttg-----agatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 144  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    |||     |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  26084928 actttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtt 26085027  T
Q  145 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  26085028 tgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagg 26085123  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  26085124 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgc 26085220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233822
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 3233868  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3233867 gctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattga 3233822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 171 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273261
Alignment:
Q  171 aacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  271 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgc 5273261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338531
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacacta-gggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
     ||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||  |    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagatt-gagtcttttggttatggaaagagattaag 24338585  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24338584 actttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24338531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161641
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaagggg-ctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaaga-tcgagtctattggttacgggaagagattgaga 12161694  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12161693 ctttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 12161641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 22490618 - 22490870
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta-gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22490618 cttttaccataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 22490717  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  22490718 atagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattggg 22490816  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22490817 actttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22490870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 3028186 - 3027938
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||| ||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3028186 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaag-gcaaca-caaaactagggtttgta 3028089  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||     
T  3028088 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgtgaagagattga 3027993  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3027992 gactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctctt 3027938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1072240 - 1072067
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1072240 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacattgtatcagagtaaactttgagatagaaggagctgaaacaagggtttagaa 1072141  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 196  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072140 aggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 303
Target Start/End: Original strand, 15719654 - 15719872
Alignment:
Q  72 ttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 171  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||| || || | |||||    
T  15719654 ttgtatcaatataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaa 15719744  T
Q  172 acactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 271  Q
    |||||||||||   | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15719745 acactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 15719840  T
Q  272 agacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15719841 agacttattcttgtaacccattgatatctctt 15719872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447504
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcac 197  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcac 32447504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 23 - 171
Target Start/End: Original strand, 8995430 - 8995578
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8995430 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaa 8995529  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 171  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995530 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066169
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||| | || ||||||||| ||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgc 26066169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309125
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 33309125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311394
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 33311394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754754
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 29754754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 17012029 - 17012270
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaa-acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17012029 ctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttagaagta-aacaacaaa-ctagggtttgtataaagtt 17012126  T
Q  156 tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttg 255  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||   ||||     
T  17012127 tg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgatgctttt 17012222  T
Q  256 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17012223 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 17012270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466553
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
     ||||||||| || | ||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattggg 14466499  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14466500 agtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctctt 14466553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Original strand, 17852520 - 17852650
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||    
T  17852520 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtat 17852619  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 180  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852620 agagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068440
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||    |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgc 26068440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16455757 - 16455510
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||||| ||||||  ||||| |  |||||| |||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||     
T  16455757 tttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaagt-caacacaaaaactagggtttgtac 16455660  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | || |||||||||||    
T  16455659 agagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggatta-agtctcttgctcacggaaagagattggg 16455564  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16455563 actttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctctt 16455510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069803
Alignment:
Q  192 attcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1069815  T
Q  292 ttgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||    
T  1069814 ttgatatctctt 1069803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 58 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870611
Alignment:
Q  58 tataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 157  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggg-ctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  158 tctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 197  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcac 13870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26068680 - 26068590
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagat 95  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26068680 atttgttacaaatttaaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 26066409 - 26066319
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagat 95  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26066409 atttgttacaaatttaaagtagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29755077 - 29754983
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag 99  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29755077 atttgttacaaatttaaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 33308887 - 33308964
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 82  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33308887 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 33308964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Original strand, 33311156 - 33311233
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 82  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33311156 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaag 33311233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12186405 - 12186156
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagca-acaacaaaactagggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| | ||| |||     
T  12186405 acttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaaa--cagacaacaaaccaaggtttta 12186308  T
Q  147 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt 246  Q
     | ||| ||| |||   ||| | ||||  |||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||    
T  12186307 gagaga-tttctctaagcgggagaaac--tagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgttcacgggaagagatt 12186214  T
Q  247 gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12186213 gagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 12186156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 302
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367260
Alignment:
Q  138 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgg 237  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||   ||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattg-agtctcttcgtcgcgg 15367195  T
Q  238 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15367196 gaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctct 15367260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 163
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||     |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggg-----aaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  151 gagtttgtctctt 163  Q
    |||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 15346369 - 15346524
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |   ||||||||||||||||    
T  15346369 acttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttaga--------attcaaactagggtttgtat 15346460  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagga 217  Q
    | | |||| ||||| | |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15346461 aaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 19696420 - 19696670
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagg--gggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |  |||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||||||    
T  19696420 cttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttag-aaacaaacaac-aaattagggtttgt 19696517  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |  | |||||||||    
T  19696518 atagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggtt--caaattgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctctttgtcactgaaagagattg 19696613  T
Q  248 ggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  19696614 agactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctctt 19696670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 303
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945374
Alignment:
Q  187 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 285  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgt 26945356  T
Q  286 aacccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  26945357 aactcattgatatctctt 26945374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542461
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 286  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| |||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgta 7542483  T
Q  287 acccattgatttctcttggtaa 308  Q
    |||| ||||| |||||| ||||    
T  7542482 accctttgatatctctttgtaa 7542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 265
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatta 265  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527041
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 287  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 20527020  T
Q  288 cccattgatttctcttggtaa 308  Q
    ||  ||||| |||||| ||||    
T  20527021 ccttttgatatctctttgtaa 20527041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22858075
Alignment:
Q  133 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 232  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggt 22858110  T
Q  233 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
     |   |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22858109 cacaagaagagattgagactttaggtagatttagg 22858075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 302
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346576
Alignment:
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctct 15346576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037814
Alignment:
Q  190 tgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaac 288  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| | | || || |||||| |||||||||||||||||||    | | ||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaac 28037829  T
Q  289 ccattgatttctctt 303  Q
    || ||||| ||||||    
T  28037828 cctttgatatctctt 28037814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  212 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25466506 - 25466433
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaa 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  25466506 acttttactataaatatagatcttttgtcagagtaaaccttgaggtaga-gaggctgaaaacaagggtttagaaa 25466433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28038041 - 28038004
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaac 87  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28038041 acttttactataaatatagacattgtatcaacgtaaac 28038004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 18318004 - 18318048
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18318004 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 107)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1047312 - 1046970
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--------tag 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||  ||||        |||    
T  1047312 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaagctaatctaagagagagagagatag 1047213  T
Q  98 agggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047212 agggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 1047113  T
Q  198 tttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 297  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047112 cttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt 1047014  T
Q  298 tctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1047013 tctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 1046970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1049658 - 1049341
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049658 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 1049559  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  1049558 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggatt-ga 1049460  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  1049459 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 1049360  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1049359 tagtggattggagggctgc 1049341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 31156247 - 31155956
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31156247 acttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 31156148  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  31156147 agagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattggg 31156048  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31156047 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacggtactcatcctatagtggattggagggctgc 31155956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7349615 - 7349318
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7349615 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 7349516  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7349515 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7349416  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7349415 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 7349318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7351994 - 7351697
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7351994 acttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggct 7351895  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7351894 ttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagag 7351795  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7351794 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 7351697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40837105 - 40836788
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837105 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaa 40837006  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  40837005 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 40836907  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  40836906 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcata 40836807  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  40836806 tagtggatcggagggctgc 40836788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 38393935 - 38394230
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38393935 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38394034  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  38394035 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 38394133  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38394134 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 38394230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27306592 - 27306275
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306592 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 27306493  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27306492 aggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 27306395  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||   ||||| |||    
T  27306394 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 27306295  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  27306294 atagtggaacggagggctgc 27306275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 35555 - 35834
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35555 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 35654  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  35655 agacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgatt-ga 35753  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35754 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 35834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 3035670 - 3035968
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3035670 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 3035769  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaaga--- 242  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||       
T  3035770 ttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaaga 3035868  T
Q  243 gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3035869 ggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 3035968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7470359 - 7470067
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7470359 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 7470260  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||     
T  7470259 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctga 7470161  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7470160 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 7470067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 7472317 - 7472025
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472317 tttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 7472218  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  7472217 tagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 7472119  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  7472118 aactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggatggctgc 7472025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 25 - 341
Target Start/End: Original strand, 25542459 - 25542772
Alignment:
Q  25 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa 124  Q
    |||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||     
T  25542459 agatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggg-ctgaaacaaaggtttagaaag 25542557  T
Q  125 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 224  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||    
T  25542558 gtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaagactattaggatt-gagt 25542655  T
Q  225 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatata 324  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||||    
T  25542656 ctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatata 25542755  T
Q  325 gtggattggagggctgc 341  Q
    |||||| |||| |||||    
T  25542756 gtggatcggagagctgc 25542772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13099812 - 13099560
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13099812 acttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 13099713  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13099712 agagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 13099614  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13099613 gctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 13099560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 44490 - 44769
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||  || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44490 gcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44589  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||    
T  44590 aggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgatt-ga 44688  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44689 gtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 44769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 51 - 341
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724823
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagaggctggga 44724731  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  44724732 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 44724823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 29 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31435404 - 31435131
Alignment:
Q  29 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 128  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31435404 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 31435305  T
Q  129 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctct 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31435304 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctct 31435206  T
Q  229 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31435205 tggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 31435131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 3878497 - 3878821
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaat----atagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggt 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||    ||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3878497 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggt 3878596  T
Q  117 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 216  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3878597 ttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattagg 3878696  T
Q  217 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaact 315  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||    
T  3878697 att-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 3878795  T
Q  316 caccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    || |||||||||||| ||||||||||    
T  3878796 catcatatagtggatcggagggctgc 3878821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137193
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttgattacgggaagagattggga 20137246  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20137245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 20137193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42331335 - 42331081
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  42331335 acttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtat 42331236  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt--atgggaagagattg 247  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  42331235 agagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacacgggaagagattg 42331137  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42331136 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 42331081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 20297311 - 20297606
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  20297311 acttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggttt 20297410  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20297411 gtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagat 20297509  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20297510 tggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 20297606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 48457602 - 48457897
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48457602 actttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 48457701  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  48457702 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 48457897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 443548 - 443800
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  443548 acttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 443647  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  443648 agagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacgggaagagattggg 443746  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  443747 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctctt 443800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 51 - 296
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355456
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgaga 11355410  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11355411 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 11355456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 51 - 296
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678264
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagatattggga 21678218  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21678219 ctttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgat 21678264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Original strand, 20625990 - 20626282
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20625990 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20626089  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  20626090 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 20626188  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20626189 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 20626282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Original strand, 20629881 - 20630173
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20629881 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20629980  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  20629981 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 20630079  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20630080 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 20630173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Original strand, 20642300 - 20642592
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20642300 tttattataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20642399  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  20642400 tagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 20642498  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20642499 gactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 20642592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680232
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattggga 21680179  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21680180 ctttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctctt 21680232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 50 - 340
Target Start/End: Original strand, 18345490 - 18345784
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18345490 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 18345589  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||      
T  18345590 gtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaggc 18345688  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctg 340  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18345689 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctg 18345784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 50 - 337
Target Start/End: Original strand, 20299407 - 20299700
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  20299407 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 20299506  T
Q  145 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20299507 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 20299605  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggaggg 337  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||    
T  20299606 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggaggg 20299700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 24748548 - 24748799
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  24748548 cttttattataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 24748647  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  24748648 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttccgggaagagattggga 24748746  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24748747 ctttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24748799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 23 - 291
Target Start/End: Original strand, 26804499 - 26804765
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804499 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtg----agtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 26804594  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac---tagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26804595 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 26804694  T
Q  220 ggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 291  Q
      ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804695 -tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 37412462 - 37412211
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  37412462 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatag 37412363  T
Q  152 agtttgtctc-ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  37412362 agtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagactggga 37412264  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37412263 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 37412211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 40946277 - 40946572
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagat----agagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40946277 actttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 40946376  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||      
T  40946377 gtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggatt-gagtctcttagttacgggaagaggc 40946475  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  40946476 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgc 40946572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4296026
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagacctt-gtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  150 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 4296073  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4296072 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattga 4296026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 11757177 - 11757435
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaaggg-tttagaaaagcaacaacaaaactagggtt 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  11757177 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttagaatgacaacaacaaaactagggtt 11757276  T
Q  145 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11757277 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagag 11757375  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757376 gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 11757435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276346
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaga 25276293  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25276294 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctctt 25276346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 28485515 - 28485771
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28485515 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 28485614  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  28485615 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagat 28485713  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28485714 tggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctctt 28485771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 28487502 - 28487758
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  28487502 acttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagttt 28487601  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28487602 gtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacaggaagagat 28487700  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487701 tggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 28487758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850225
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 1850173  T
Q  291 attgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1850174 attgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 1850225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39146071
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggaa 39146124  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39146123 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 39146071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22828969 - 22828717
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22828969 acttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtat 22828870  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22828869 agagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgag 22828771  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22828770 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 51 - 296
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681018
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatca-aagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga 244  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaga 9680966  T
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9680967 ttgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgat 9681018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 24258423 - 24258668
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 156  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24258423 ctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagttt 24258522  T
Q  157 gtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgg 256  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  24258523 gtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttgg 24258621  T
Q  257 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24258622 atagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctctt 24258668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 9679009 - 9679264
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||    |||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||    
T  9679009 ttttactataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttg 9679108  T
Q  147 tatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  9679109 tatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgtgaagagat 9679206  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9679207 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 9679264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 72 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21592457 - 21592235
Alignment:
Q  72 ttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 171  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21592457 ttgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaa 21592358  T
Q  172 acactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggg 271  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21592357 acactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatt-tagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtggg 21592259  T
Q  272 agacttattcttgtaacccattga 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  21592258 agacttattcttgtaactcattga 21592235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Original strand, 21990106 - 21990355
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||    
T  21990106 ttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatag 21990204  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  21990205 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggc 21990303  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  21990304 tttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctctt 21990355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22251878 - 22251641
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22251878 acttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 22251779  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||        ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22251778 agagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 22251688  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251687 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832717
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggg-gctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||| || |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 27832771  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27832770 actttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223363
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagg-gggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  150 agagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgg 42223308  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
      |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  42223309 agctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctctt 42223363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43253860 - 43253562
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagaggg--------ggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |        ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  43253860 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagg 43253761  T
Q  142 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||    
T  43253760 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta-ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgattacggaaag 43253663  T
Q  242 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctg 340  Q
    ||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  43253662 aggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctg 43253563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 215
Target Start/End: Original strand, 18567545 - 18567731
Alignment:
Q  29 ttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaa 128  Q
    ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18567545 ttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaa 18567644  T
Q  129 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattag 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18567645 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Original strand, 7188496 - 7188737
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  7188496 acttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttag-aagtcaacaataaaaatagggtttgtat 7188594  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    || ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  7188595 agggtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaatagattgag 7188690  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7188691 actttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgat 7188737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 53 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 24817682 - 24817438
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||    
T  24817682 tttaatataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg-ctgaaacaagggtttagaagt-caacaagagaactagggtttgtatag 24817585  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  24817584 agtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagac 24817490  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24817489 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctctt 24817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20091877 - 20091629
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20091877 acttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcg-gaggcaac-acaaaactagggtttgta 20091780  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||| || || | |||||| | |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||||||     
T  20091779 tagagtttg-ctattggcaacaaagattagggtt--ggggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aaatctcttggtcacgggaagagattga 20091684  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20091683 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 20091629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092296
Alignment:
Q  167 aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  267 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 7092296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935512
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 2935512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Original strand, 24465503 - 24465735
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  24465503 ttttactatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 24465594  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24465595 gcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattggga 24465689  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  24465690 ctttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgat 24465735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 126 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813593
Alignment:
Q  126 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 225  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattg-agtc 24813661  T
Q  226 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 293  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 24813593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 339
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396876
Alignment:
Q  175 ctagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 274  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  275 cttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggct 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggct 38396876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606623
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 1606623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094544
Alignment:
Q  167 aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 266  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  267 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 7094544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 23 - 245
Target Start/End: Original strand, 22392399 - 22392608
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22392399 gcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttata- 22392497  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
           ||  ||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  22392498 -------aatcaaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggt---tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 22392585  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||| | ||||||||||    
T  22392586 gtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027239
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgc 9027239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137321
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 22137321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552348
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 40552348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108310
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 22108310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550070
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 40550070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 22108069 - 22108158
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22108069 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 22137080 - 22137169
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22137080 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 40549829 - 40549918
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40549829 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 40552107 - 40552196
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40552107 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Original strand, 2935262 - 2935349
Alignment:
Q  6 tttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgag 93  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2935262 tttgttacagattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9027485 - 9027396
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  9027485 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 6332179 - 6332425
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagca-acaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||| | |||||||||      
T  6332179 acttttactataaatataaaacttgtatcagagtaacctt-gagagagagggggctggaaacaagggtttataaa--catacaacaga-ctagggttt-- 6332272  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||||||    
T  6332273 atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggattga--gattgattcagtttggaaaacactattaagattg-agtctcttggtcacaagaagagattg 6332368  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  6332369 agactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctctt 6332425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081675
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaa 206  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||    
T  11081522 aaacaagggtttagaagc-caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  11081616 cactattaggatt-gagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattagg 11081675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 158
Target Start/End: Original strand, 38396316 - 38396377
Alignment:
Q  97 gagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396316 gagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7094759 - 7094662
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  7094759 tttattataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Original strand, 6348920 - 6348987
Alignment:
Q  236 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6348920 gggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctctt 6348987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 303
Target Start/End: Original strand, 26295586 - 26295652
Alignment:
Q  237 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26295586 ggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 26295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7092512 - 7092414
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaacttt----gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaa-actagggtttg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  7092512 tttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 266  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 252 - 303
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393927
Alignment:
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22393927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Original strand, 1606423 - 1606472
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1606423 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 267
Target Start/End: Original strand, 26210500 - 26210710
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || |||||  ||||||||| |||||||   ||||  |||||||||||||||||     
T  26210500 cttttagtataaatatagaacttgtatcaaatgtaaaccttgagagag-gggggaggaaacaaggttttagaatc-caacctcaaaactagggtttgtag 26210597  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-g 247  Q
    ||| ||   ||||| | ||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |    
T  26210598 agaatt---ctcttggcaacaa-cactagggtt-gtga-ttgattcaccttggagaaatactattaggattg-agtctcttggtaacggaaagagattcg 26210690  T
Q  248 ggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  26210691 ggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 119
Target Start/End: Original strand, 3677235 - 3677301
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttta 119  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3677235 ttttactataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagataga-ggggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30906386 - 30906264
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  |  ||||||| |||||||    
T  30906386 acttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaaa--caaataacaaactagagtttgta 30906289  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaaca 174  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30906288 tagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 267
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049039
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttg-ggaa 205  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||  |||    
T  6048885 aaacaagggtttagaagc-caacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  206 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| | | ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  6048979 acactattaggatt-gaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattagg 6049039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 182
Target Start/End: Original strand, 6348778 - 6348903
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatca-aagtaaactttgagatagagggggctg-aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||   || || ||||||||||||||||| ||||    
T  6348778 ctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttag-aagtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagt 6348876  T
Q  155 ttgtctcttcggaacaaacactagggtt 182  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348877 ttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  192 attcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccc 290  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattg-agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccc 40281474  T
Q  291 attgattt 298  Q
     |||||||    
T  40281473 tttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 94
Target Start/End: Original strand, 1849918 - 1849962
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  1849918 acttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 1849962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120960
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069841
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351414
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25351353 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357108
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410191
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 79
Target Start/End: Original strand, 38396239 - 38396268
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396239 acttttactataaatatagaccttgtatca 38396268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 2805 - 3122
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaacttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 2904  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||    
T  2905 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 3003  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  3004 gtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcata 3103  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3104 tagtggattggagggctgc 3122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 42064407 - 42064724
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064407 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 42064506  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42064507 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 42064605  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  42064606 gtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 42064705  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  42064706 tagtggatcggagggctgc 42064724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 27104691 - 27105007
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27104691 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaa 27104790  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27104791 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 27104888  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  27104889 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacattactcatcata 27104988  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27104989 tagtggatcggagggctgc 27105007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 23 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13910407 - 13910101
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13910407 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 13910308  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  13910307 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggatt-ga 13910209  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  13910208 gtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcata 13910109  T
Q  323 tagtggat 330  Q
    ||||||||    
T  13910108 tagtggat 13910101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35215932 - 35215631
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215932 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaacta 35215833  T
Q  140 gggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggga 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35215832 gggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacggga 35215733  T
Q  240 agagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggct 339  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35215732 agagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggct 35215633  T
Q  340 gc 341  Q
    ||    
T  35215632 gc 35215631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19504708 - 19504391
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504708 gcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 19504609  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19504608 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 19504510  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    ||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||    
T  19504509 gtctcttggtta-cggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 19504411  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  19504410 atagtggatcggagggctgc 19504391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35218008
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  291 attgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35218058 gttgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 35218008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 52 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19502345 - 19502056
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19502345 ttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtag 19502246  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||    
T  19502245 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagac 19502147  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  19502146 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgc 19502056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 23 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40032421 - 40032149
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032421 gcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 40032322  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  40032321 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 40032223  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40032222 gtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgat 40032149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 24162575 - 24162268
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24162575 gcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 24162476  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  24162475 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-ga 24162377  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccata 322  Q
    |||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||| ||||    
T  24162376 gtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatgctactcatcata 24162287  T
Q  323 tagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  24162286 tagtggattggatggctgc 24162268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23452577 - 23452282
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagataga----gggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23452577 acttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 23452478  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagat 245  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  23452477 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggc 23452379  T
Q  246 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23452378 tgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgc 23452282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45280321 - 45280029
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaa-gcaacaacaaaactagggtttgta 148  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45280321 actttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgta 45280222  T
Q  149 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  45280221 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  249 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 45280029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007811
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtttcttggttatgggaagagattgggg 19007758  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19007759 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 19007811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Original strand, 42452702 - 42452991
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  42452702 acttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 42452801  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    | |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |    
T  42452802 aaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgag 42452898  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42452899 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgc 42452991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 42923847 - 42923593
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  42923847 acttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgt 42923748  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42923747 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattg 42923649  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42923648 gggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 42923593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 27 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 22287695 - 22287381
Alignment:
Q  27 atttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagc 126  Q
    ||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22287695 atttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggc 22287596  T
Q  127 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtct 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22287595 aacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggatt-gagtct 22287497  T
Q  227 cttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatag 325  Q
    ||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||   ||||| |||||||    
T  22287496 cttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatag 22287397  T
Q  326 tggattggagggctgc 341  Q
    || | |||||||||||    
T  22287396 tgaaatggagggctgc 22287381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 327
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196833
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgagg 28196755  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtg 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||| |||||||||    
T  28196756 ctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg 28196833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 21521058 - 21520777
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttag 120  Q
    ||||||||||| || | |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  21521058 gcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaaccttgtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttag 21520959  T
Q  121 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 220  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  21520958 aaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt- 21520860  T
Q  221 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21520859 gagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctctt 21520777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6259178 - 6258901
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||| ||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  6259178 gcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtattagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaa 6259079  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6259078 aggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 6258980  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6258979 gtctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 6258901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 52 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15539809 - 15539566
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 151  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15539809 ttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatag 15539710  T
Q  152 agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggac 251  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15539709 agtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttacgggaagagattgagac 15539611  T
Q  252 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539610 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739644
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gattctcttggttataggaagagattggga 11739697  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  11739696 ctttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctctt 11739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 6264508 - 6264233
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6264508 gcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaa 6264409  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  6264408 aggcaacaacaa----agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aa 6264314  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| |  || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6264313 gtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 6264233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 43623931 - 43623625
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43623931 gcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagaccttgtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaa 43623832  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  43623831 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct------------cactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggatt-ga 43623745  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccat 321  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   ||||| |||    
T  43623744 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 43623645  T
Q  322 atagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  43623644 atagtggaacggagggctgc 43623625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849288
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagatt-gagtctcttggttacggtaagagattgaga 17849235  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17849236 ctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 17849288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 59 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979663
Alignment:
Q  59 ataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 158  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  159 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggt 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggt 34979708  T
Q  259 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  34979707 agaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctctt 34979663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 54 - 303
Target Start/End: Original strand, 3022086 - 3022334
Alignment:
Q  54 ttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3022086 ttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagag 3022185  T
Q  154 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactt 253  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||    
T  3022186 tttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgaggttt 3022284  T
Q  254 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3022285 taggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 3022334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732861
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||            ||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggatt-gagtctcttggt------------ttggga 31732914  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732913 ctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 31732861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848611
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||  |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatca--gtaatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgag 17848561  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  17848562 gctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctctt 17848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837438
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      ||||||||||||| ||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctct------tgggaagagattgaga 14837385  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14837386 ctttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctctt 14837438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289152
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtcacttggttacgggaagagattggga 44289205  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44289204 cttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctctt 44289152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11578439 - 11578193
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||    
T  11578439 cttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggctgaaacaagggtttagaagt-caacaaaaaaactagggtttgtata 11578341  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    || ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11578340 gaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga 11578246  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11578245 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 11578193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22407772 - 22407591
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    |||||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22407772 gcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaa 22407673  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22407672 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18800665 - 18800398
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18800665 gcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaa 18800566  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    |          || ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18800565 atc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-a 18800479  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18800478 gtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18800398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 91 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 45239271 - 45239061
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  45239271 gagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggtt 45239173  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45239172 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaaccc 45239074  T
Q  291 attgatttctctt 303  Q
    |||||| ||||||    
T  45239073 attgatatctctt 45239061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163117
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 216  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 91 - 289
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020349
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 289  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||          ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggatt-gagtctcttggtattg----------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558909
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 36558909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561186
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 36561186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17897578 - 17897337
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctga-aacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  17897578 acttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaagt-caacaataaaactagggtttgt 17897481  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  17897480 atagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaaaagattg 17897386  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 296  Q
     || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17897385 agattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgat 17897337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332226
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | ||||    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgc 45332226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 20146941 - 20146693
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||| |     ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  20146941 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtagagagtttgaaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 20146843  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||| |||||| |    
T  20146842 agagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgag 20146747  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  20146746 attttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctctt 20146693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 22874061 - 22874301
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    |||||| ||||||||| || | |||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||    
T  22874061 acttttgctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtat 22874152  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| |    
T  22874153 agagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattg-agtctcttagtcacgggaagagattgag 22874247  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22874248 gctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 22874301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459274
Alignment:
Q  141 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  241 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 28459274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 181 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375391
Alignment:
Q  181 tttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 280  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttatt 5375453  T
Q  281 cttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgc 5375391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5377769 - 5377631
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5377769 actttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggttt 5377670  T
Q  146 gtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377669 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 266
Target Start/End: Original strand, 35107192 - 35107427
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttaga 121  Q
    ||||||||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |  || |||| ||| |||||||    
T  35107192 gcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagagagt-ctaaaaccaagagtttaga 35107290  T
Q  122 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgg 221  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||     
T  35107291 agt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg- 35107382  T
Q  222 agtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 266  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35107383 agtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattag 35107427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36559156 - 36559067
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36559156 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36561433 - 36561344
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36561433 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37963263 - 37963028
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  |||||||||||||| |    
T  37963263 acttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttaga--------aatcaaactagggtttgtgt 37963172  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    | |||||| |||||   ||||||||| | |||   || |||||||| | || | ||||| ||||  |||| |||||||||||| |   |||||||||| |    
T  37963171 atagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggt---tgtgttgattccccttagaaaacattattgagatt-gagtctcttggtcacctgaagagattgag 37963077  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 298  Q
     |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37963076 gctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt 37963028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45332474 - 45332384
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagatttt-aagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45332474 atttgttacagattttaggcagatttgttatagatttttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 145
Target Start/End: Original strand, 38020064 - 38020157
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020064 ttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 303
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699545
Alignment:
Q  187 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 285  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  286 aacccattgatttctctt 303  Q
    || || ||||| ||||||    
T  40699528 aatcctttgatatctctt 40699545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136209
Alignment:
Q  141 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 240  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  241 gagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    || |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 27136209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 204 - 303
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589862
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20589763 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  174 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 273  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaa-agattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 12342746 - 12342673
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaac-aagggtttagaa 122  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12342746 acttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaagggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407538
Alignment:
Q  245 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 107 - 308
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139551
Alignment:
Q  107 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaa 206  Q
    ||||||||||||||||   |||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||  ||||||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaagc-caacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 305  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  43139450 cattattaggattg-agtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttg 43139548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 258 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463032
Alignment:
Q  258 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctt 7463032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921833
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17921769 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20147082 - 20147040
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20147082 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgaga 20147040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  188 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 265  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  190 tgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 99
Target Start/End: Original strand, 40699229 - 40699278
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||    
T  40699229 acttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagagag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  189 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503052
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga-ttgggactttgggtagaatta 265  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502990 gaaacactattaggatt-gagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707837
Alignment:
Q  268 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22707837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 265
Target Start/End: Original strand, 35028498 - 35028707
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaaca-agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||  ||||| |  | |||| | |||||||||||   |||||| |||| | ||||||||    
T  35028498 acttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagagagc-cggaaaaacagggtttagaatc-caacaataaaatttgggtttgt 35028595  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    |  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | | | ||||||||||    
T  35028596 a--gagtttg-ctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcgcattggaaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgagaagagattg 35028689  T
Q  248 ggactttgggtagaatta 265  Q
      ||||||||||||||||    
T  35028690 acactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 303
Target Start/End: Original strand, 15693974 - 15694075
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttct 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||  ||||| |||    
T  15693974 gaaacactattaggataa-agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatct 15694072  T
Q  301 ctt 303  Q
    |||    
T  15694073 ctt 15694075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943598
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17943540 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 51 - 79
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589609
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatca 20589609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517760
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 28462649 - 28462593
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 79  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28462649 gcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatca 28462593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 341
Target Start/End: Original strand, 34 - 284
Alignment:
Q  91 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  191 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 290  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  291 attgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  234 attgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgc 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 69658 - 69337
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 118  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  69658 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttatatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 69559  T
Q  119 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  69558 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 69459  T
Q  219 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcac 318  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||     
T  69458 t-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcat 69360  T
Q  319 catatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||| |||| |||||    
T  69359 catatagtggatcggagagctgc 69337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 73390 - 73207
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----tagagggggctgaaacaagggttt 118  Q
    ||||||||||| || ||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  73390 gcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgtgtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 73291  T
Q  119 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  73290 agaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  165 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 213  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 41819 - 41528
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41819 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 41720  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  41719 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 41528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 23 - 341
Target Start/End: Original strand, 29086 - 29413
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga----------tagagggggctgaaacaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  29086 gcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaa 29185  T
Q  113 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 212  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  29186 gggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactat 29285  T
Q  213 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaa 312  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  29286 taggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacaat 29384  T
Q  313 actcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29385 actcatcatatagtggatcggagggctgc 29413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 3922 - 4200
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3922 gcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 4021  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  4022 aggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggatt-ga 4119  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4120 gtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 4200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 183975 - 183725
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  183975 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaaggg-ctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtat 183877  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  183876 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtta-cggaagagattggg 183779  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 183725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 50 - 295
Target Start/End: Original strand, 51961 - 52207
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  51961 acttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgt 52060  T
Q  148 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 247  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52061 atagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattg 52159  T
Q  248 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  52160 tgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattga 52207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 53 - 341
Target Start/End: Original strand, 79140 - 79428
Alignment:
Q  53 tttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataga 152  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79140 tttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataga 79239  T
Q  153 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggact 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || |    
T  79240 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagaat 79338  T
Q  253 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  79339 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 79428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 50 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11518
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  11809 acttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 11710  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11709 agagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggg 11611  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11610 actttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagagctgc 11518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 23 - 303
Target Start/End: Original strand, 14944 - 15223
Alignment:
Q  23 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 122  Q
    ||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14944 gcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaa 15043  T
Q  123 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattgga 222  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15044 aggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-ga 15142  T
Q  223 gtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15143 gtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14427
Alignment:
Q  63 atatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga--tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 160  Q
    ||||||||||||| | | || |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  161 cttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtag 260  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtag 14509  T
Q  261 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  14508 aattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgc 14427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2245
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga------tagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggt 143  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1988 actttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt 2087  T
Q  144 ttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagag 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  2088 ttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaaaag 2185  T
Q  244 attgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2186 gctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctctt 2245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 295
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80055
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  151 gagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggg 80010  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 295  Q
     |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  80011 gctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattga 80055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 165 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1498
Alignment:
Q  165 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  265 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgc 1498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 303
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85434
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||||||| ||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggatt-gagtcttttggttacgagaagagattgtga 85381  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85382 ctttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 85434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 279
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  51 cttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    ||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcg-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggatt-aagtctcttggttacgggaagaggctggga 35790  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791 ctttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16154 - 15906
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  16154 acttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtat 16056  T
Q  150 agagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggg 249  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16055 agagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggg 15960  T
Q  250 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15959 actttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 16981 - 16735
Alignment:
Q  52 ttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 150  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  16981 ttttaatataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtata 16884  T
Q  151 gagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattggga 250  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||    
T  16883 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtcacttggtgacgggaagagattgaga 16788  T
Q  251 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16787 ctttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 16735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1727
Alignment:
Q  60 taaatatagaccttgtatcaaa-gtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 158  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaagt-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttc- 1861  T
Q  159 ctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggt 258  Q
            |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1860 --------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggt 1772  T
Q  259 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1771 agaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctt 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 50 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1167 - 993
Alignment:
Q  50 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtat 149  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1167 actttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 1068  T
Q  150 agagtttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 219  Q
    ||||||||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||    
T  1067 agagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22358
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 22358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 203 - 341
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24633
Alignment:
Q  203 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  303 tggtaacaaaactcaccatatagtggattggagggctgc 341  Q
    | |||||   ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgc 24633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 22117 - 22206
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22117 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 24392 - 24481
Alignment:
Q  5 atttgttacagattttaagcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgaga 94  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24392 atttgttacaaattttaggcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 303
Target Start/End: Original strand, 4773 - 5014
Alignment:
Q  57 ctataaatatagaccttgtatcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggg-tttagaa--aagcaacaacaaaactagggtttgtatagag 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||  |||||||||    |||||||||| ||||| |    
T  4773 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagtaagcaacaa----actagggtttatatagcg 4868  T
Q  154 tttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactt 253  Q
    ||| |||||  | |||||||||||| |||    | ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   |||    
T  4869 ttt-tctctcagcaacaaacactagagttga--gtttgattcatgttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaagagattgaagctt 4964  T
Q  254 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 303  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  4965 ttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 5014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57550
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 267  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  57613 aaacactattaggattgaa-tctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattagg 57550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 204 - 267
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  204 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  207 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 267  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University