View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12055_high_24 (Length: 419)

Name: NF12055_high_24
Description: NF12055
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12055_high_24
NF12055_high_24
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (1-412)||(40418952-40419363)
chr1 (1-411)||(43240981-43241392)
chr1 (1-284)||(28527980-28528263)
chr1 (1-411)||(51441364-51441775)
chr1 (1-411)||(49347994-49348405)
chr1 (10-321)||(37463474-37463783)
chr1 (9-388)||(8671215-8671594)
chr1 (1-348)||(35828993-35829341)
chr1 (2-270)||(32083346-32083614)
chr1 (1-268)||(51601473-51601740)
chr1 (10-100)||(32066877-32066967)
chr1 (167-320)||(46227069-46227224)
chr1 (297-412)||(29173426-29173541)
chr1 (1-187)||(52420928-52421112)
chr1 (1-116)||(1210312-1210427)
chr1 (1-109)||(6640700-6640808)
chr1 (1-36)||(7921574-7921609)
chr1 (1-47)||(32405084-32405130)
chr1 (51-89)||(32405163-32405201)
chr1 (223-255)||(29173345-29173377)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (1-412)||(43793640-43794038)
chr7 (1-411)||(36651265-36651676)
chr7 (1-411)||(33350406-33350817)
chr7 (1-411)||(46356451-46356862)
chr7 (1-410)||(32629880-32630289)
chr7 (11-411)||(39906989-39907390)
chr7 (91-411)||(11593224-11593545)
chr7 (9-270)||(36869897-36870158)
chr7 (195-399)||(49028564-49028769)
chr7 (221-412)||(20499380-20499571)
chr7 (221-412)||(48055637-48055828)
chr7 (193-411)||(38606309-38606528)
chr7 (9-411)||(24177803-24178206)
chr7 (220-321)||(38896972-38897074)
chr7 (1-151)||(31004756-31004906)
chr7 (1-151)||(37616448-37616598)
chr7 (1-152)||(49028798-49028949)
chr7 (1-155)||(38606534-38606687)
chr7 (167-256)||(21520200-21520288)
chr7 (1-99)||(32484071-32484169)
chr7 (1-78)||(18608290-18608366)
chr7 (1-78)||(18626512-18626588)
chr7 (1-78)||(18637186-18637262)
chr7 (1-78)||(18650621-18650697)
chr7 (1-98)||(24436497-24436594)
chr7 (41-84)||(20499694-20499737)
chr7 (287-405)||(36870210-36870329)
chr7 (15-101)||(33737945-33738031)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (1-349)||(10776019-10776368)
chr4 (1-411)||(435503-435911)
chr4 (1-411)||(23906901-23907313)
chr4 (55-254)||(35555975-35556173)
chr4 (1-411)||(27450773-27451184)
chr4 (1-411)||(1777615-1778027)
chr4 (178-370)||(42037218-42037414)
chr4 (9-411)||(48623135-48623538)
chr4 (220-411)||(39707734-39707925)
chr4 (242-410)||(53703882-53704051)
chr4 (196-321)||(1212102-1212228)
chr4 (1-193)||(25867082-25867273)
chr4 (160-281)||(15183457-15183579)
chr4 (9-151)||(31960422-31960564)
chr4 (64-247)||(16002350-16002533)
chr4 (297-368)||(35556182-35556252)
chr4 (1-151)||(48174693-48174843)
chr4 (154-343)||(39755093-39755284)
chr4 (1-151)||(56374822-56374972)
chr4 (4-294)||(30852815-30853095)
chr4 (1-100)||(41427422-41427521)
chr4 (3-412)||(55768979-55769394)
chr4 (1-151)||(53707326-53707476)
chr4 (222-412)||(55833454-55833650)
chr4 (3-84)||(55833235-55833316)
chr4 (221-276)||(21060180-21060235)
chr4 (1-36)||(30807245-30807280)
chr4 (43-99)||(37677444-37677500)
chr4 (1-36)||(33226856-33226891)
chr4 (224-270)||(17666848-17666894)
chr4 (3-36)||(39754973-39755006)
chr4 (10-82)||(17666644-17666716)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (1-410)||(876429-876814)
chr2 (9-411)||(45368231-45368636)
chr2 (1-411)||(2609799-2610210)
chr2 (1-411)||(24584206-24584617)
chr2 (69-411)||(452284-452627)
chr2 (8-314)||(33594876-33595182)
chr2 (1-411)||(38453220-38453629)
chr2 (195-411)||(8180066-8180283)
chr2 (220-411)||(16291984-16292176)
chr2 (11-266)||(12475031-12475286)
chr2 (55-312)||(14769668-14769927)
chr2 (1-390)||(12904262-12904650)
chr2 (277-381)||(3308156-3308261)
chr2 (25-240)||(7292436-7292651)
chr2 (1-142)||(4807133-4807274)
chr2 (2-155)||(41763650-41763803)
chr2 (1-84)||(7135285-7135368)
chr2 (1-103)||(26433784-26433885)
chr2 (221-318)||(13148686-13148784)
chr2 (5-71)||(23866267-23866333)
chr2 (1-36)||(11992706-11992741)
chr2 (1-36)||(13148960-13148995)
chr2 (196-277)||(37281510-37281591)
chr2 (9-101)||(36038802-36038894)
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (5-400)||(3284774-3285167)
chr8 (1-411)||(36565841-36566252)
chr8 (1-390)||(36544444-36544834)
chr8 (56-410)||(42854668-42855023)
chr8 (1-319)||(12492442-12492761)
chr8 (257-412)||(25984818-25984974)
chr8 (1-315)||(41444904-41445219)
chr8 (220-411)||(15216091-15216283)
chr8 (1-97)||(25985128-25985222)
chr8 (10-100)||(38667142-38667232)
chr8 (10-193)||(28300714-28300895)
chr8 (59-154)||(33830888-33830983)
chr8 (57-349)||(13983966-13984256)
chr8 (3-37)||(43732246-43732280)
chr8 (1-33)||(4033094-4033126)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (68-410)||(17222285-17222628)
chr6 (1-321)||(5258750-5259072)
chr6 (195-411)||(6082671-6082888)
chr6 (154-412)||(9369152-9369406)
chr6 (1-411)||(20428236-20428648)
chr6 (1-270)||(5631230-5631499)
chr6 (1-410)||(9706047-9706458)
chr6 (15-390)||(30670180-30670556)
chr6 (209-315)||(2208210-2208317)
chr6 (222-321)||(3629591-3629691)
chr6 (223-390)||(2680872-2681037)
chr6 (1-142)||(10100457-10100598)
chr6 (220-263)||(26291201-26291244)
[»] chr5 (30 HSPs)
chr5 (12-412)||(31502657-31503059)
chr5 (1-411)||(20318262-20318673)
chr5 (1-404)||(2076074-2076478)
chr5 (1-408)||(3393985-3394392)
chr5 (1-388)||(1274559-1274947)
chr5 (1-390)||(1288189-1288579)
chr5 (9-411)||(24177795-24178198)
chr5 (1-411)||(3301120-3301531)
chr5 (1-252)||(3096625-3096864)
chr5 (1-265)||(43558414-43558670)
chr5 (195-371)||(12493156-12493333)
chr5 (5-246)||(16134643-16134881)
chr5 (1-293)||(10638688-10638979)
chr5 (3-269)||(28977459-28977725)
chr5 (1-99)||(6368525-6368623)
chr5 (138-297)||(35685241-35685398)
chr5 (11-315)||(27298-27602)
chr5 (1-79)||(38579101-38579178)
chr5 (1-97)||(37124155-37124252)
chr5 (8-84)||(14099919-14099995)
chr5 (11-100)||(23979815-23979904)
chr5 (355-411)||(3095404-3095459)
chr5 (298-362)||(14099646-14099710)
chr5 (1-36)||(16348002-16348037)
chr5 (1-84)||(21915485-21915568)
chr5 (9-84)||(27302555-27302630)
chr5 (241-354)||(17212593-17212707)
chr5 (12-89)||(25937665-25937743)
chr5 (297-380)||(30418700-30418781)
chr5 (57-97)||(35685437-35685477)
[»] chr3 (26 HSPs)
chr3 (1-411)||(52138099-52138510)
chr3 (1-411)||(51448309-51448720)
chr3 (51-238)||(19757429-19757616)
chr3 (1-238)||(19736611-19736848)
chr3 (9-410)||(38849366-38849768)
chr3 (220-388)||(9258180-9258349)
chr3 (139-412)||(50630059-50630333)
chr3 (1-100)||(19757651-19757750)
chr3 (1-154)||(48221310-48221466)
chr3 (41-389)||(805243-805584)
chr3 (1-297)||(29816891-29817187)
chr3 (16-99)||(44395014-44395097)
chr3 (1-151)||(47542311-47542461)
chr3 (2-329)||(1448214-1448539)
chr3 (1-235)||(25190827-25191061)
chr3 (1-123)||(30724400-30724522)
chr3 (1-89)||(32490324-32490412)
chr3 (2-89)||(1426124-1426211)
chr3 (2-89)||(1470698-1470785)
chr3 (3-89)||(7696668-7696754)
chr3 (15-101)||(15750820-15750906)
chr3 (1-79)||(26592036-26592114)
chr3 (228-285)||(11580963-11581020)
chr3 (221-285)||(1426341-1426405)
chr3 (1-37)||(27917218-27917254)
chr3 (1-61)||(46145775-46145835)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-410)||(30740-31150)
[»] scaffold0606 (2 HSPs)
scaffold0606 (118-369)||(8981-9233)
scaffold0606 (11-75)||(9265-9329)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (209-315)||(309-416)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (287-390)||(13142-13248)
scaffold0113 (1-151)||(12198-12348)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (356-411)||(88878-88933)
scaffold0045 (227-317)||(88760-88851)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (1-36)||(2870-2905)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-36)||(5839-5874)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40419363 - 40418952
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40419363 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcgtgcttctact 40419264  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaa 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40419263 cgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactacatcataacaaaa 40419164  T
Q  201 agcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatctat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419163 agcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatctat 40419064  T
Q  301 tgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaaca 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419063 tgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaaca 40418964  T
Q  401 cctttcttctct 412  Q
    ||||||||||||    
T  40418963 cctttcttctct 40418952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 43240981 - 43241392
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  43240981 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagatctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 43241080  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  43241081 caagtggaatccatacgcttctaaggcttacctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 43241179  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  43241180 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 43241279  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  43241280 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcgtgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 43241378  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  43241379 acccctttcttctc 43241392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28528263 - 28527980
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28528263 taacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctctaggctagaaacgcttcgcctcttgctaaaactatatcccatatactttgtcttgcttctact 28528164  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaa 199  Q
       || |||  |||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||| |  |||||||  |||||    
T  28528163 caggcaaaagtcatatgtttctaagacttgtctccaagtctccaacctccca-tttaattcttccctcatctctacaagtagaatgatatcatctgcaaa 28528065  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaa 284  Q
     ||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  28528064 cagcatgcatcttggtgctcaatcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactcaggcggaaaggtaagggcttagtgttgaa 28527980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 51441364 - 51441775
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  51441364 taacttggggtatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 51441463  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  51441464 caagcggaatccatactcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 51441562  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  51441563 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagaaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 51441662  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||| || |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||    
T  51441663 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcttgcgtcctcacactaatcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaattcta 51441761  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || | |||||||||    
T  51441762 acccatttcttctc 51441775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 49347994 - 49348405
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || |||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  49347994 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattcgatatactccgtcttgcttctact 49348093  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatag-caaa 199  Q
      |||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |    ||||| |||||   ||||    
T  49348094 caagcagaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccgagactacatcatctacaaa 49348192  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| | ||| | |||||||||| ||    
T  49348193 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggctgacccttggtgcaatcct 49348292  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  49348293 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcatgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 49348391  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || | |||||||||    
T  49348392 acccttttcttctc 49348405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 321
Target Start/End: Original strand, 37463474 - 37463783
Alignment:
Q  10 gtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| | |   | |||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||   |||  ||    
T  37463474 gtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaactcc---ggcttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgtttctacaaaagcagaa 37463570  T
Q  110 tccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacg 208  Q
     ||||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||  | |||  || ||||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||| ||     
T  37463571 gccatacacttctaaggcttgtctcaaagtctctaacctcccattc-atttccaccctcgactcttcaagcaggactacgtcatctgcaaaaagcataca 37463669  T
Q  209 tcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatg 307  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  37463670 tctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaagaacatccaaaactaaagtaaaaaggtaagggcttagggttgacccttggtgcaatcctattgttata 37463769  T
Q  308 ggaaaatcttcggt 321  Q
    |||||||| |||||    
T  37463770 ggaaaatcatcggt 37463783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 8671594 - 8671215
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  |||| |||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||| |    
T  8671594 ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcgga 8671495  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacac 207  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  8671494 atccatacgcttctaaggcttgcctccaagtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatac 8671396  T
Q  208 gtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa-tctattgttat 306  Q
     ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  8671395 atctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacat-caaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgaccctaggtgcaattctattgttat 8671297  T
Q  307 gggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatatag 388  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  8671296 gggaaaatcttcgatagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatatag 8671215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 35828993 - 35829341
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||  | | ||||| | || || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||    
T  35828993 taacttgtggtatgatatgatctctagctttcacctccaaggtagaactactatgtcttttgctaaaattacatttcatatactttgtcttgcttgtact 35829092  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      ||  ||  ||||| | ||||| | ||| |||| | |||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||| |||| ||||| | ||| |  ||| |    
T  35829093 caagaaaatgccatatgcttctaggacttgtctcaaagtctccaacctcccattc-aattcctctctcgactctccaagcaggacgacatcttgtgcaca 35829191  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || | | |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| ||| | |||||   |||| | |||||||||| ||    
T  35829192 aagcatacatatcggtgctagctcttggatgtgttctgtaagtacatccaaaactaagttagaaatatatgggcttaagtttgatccttggtgcaatcct 35829291  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagt 348  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||| |||||||||||    
T  35829292 attgttatgggaaaatcgtcggcgaccccatcttgtgtactcacactagt 35829341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 270
Target Start/End: Original strand, 32083346 - 32083614
Alignment:
Q  2 aacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctactt 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||     
T  32083346 aacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactc 32083445  T
Q  102 gagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaa 200  Q
      ||| || ||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||| || || ||| |||||||  |||| | || || |||||  ||||||    
T  32083446 aggcggaaaccatacgcttctgaggcttgcctccaggtctctagcctcccattt-aactcctccctcgactcaccaagcaagattacatcatttgcaaaa 32083544  T
Q  201 agcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataag 270  Q
    |||| || ||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  32083545 agcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataag 32083614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 51601740 - 51601473
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  51601740 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttttact 51601641  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  51601640 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 51601542  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagata 268  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||    
T  51601541 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagata 51601473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Original strand, 32066877 - 32066967
Alignment:
Q  10 gtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| | |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32066877 gtatgatatgatctccaattttcacctctaaggtagaactacttcaccttttgctaaaattacattacatatactatgtcatgcttctact 32066967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 320
Target Start/End: Original strand, 46227069 - 46227224
Alignment:
Q  167 tcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaag 265  Q
    |||||||| ||| |||| ||| |||||| |||||| ||| || |||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  46227069 tcgactctccaaatagggctacatcatatgcaaaaggcatacatcttggtgctaactcttggacgtgtttcgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaag 46227168  T
Q  266 ataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa-tctattgttatgggaaaatcttcgg 320  Q
     |||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||    
T  46227169 gtaagggcttagggttgatccttggtgcaactctattattataagaaaatcgtcgg 46227224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 412
Target Start/End: Original strand, 29173426 - 29173541
Alignment:
Q  297 ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccct 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||| | || ||||||||||||||| | ||  || |||||||||| || ||||||||||||||||| | |||    
T  29173426 ctattgttatgggaaaatcttcggtagccccatcatgcgtcctcacactagtcgaaacttccccatgcatatcattgatagctctaatataggcaatcct 29173525  T
Q  397 aacacctttcttctct 412  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  29173526 aacccctctcttctct 29173541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 52421112 - 52420928
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||  ||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||||| |||    
T  52421112 taacttgtggcatgatatgatctctaactttcacctataaggtagagatacttcaccttttgctgaaattccatttcatatatcatgtcttgcttcaact 52421013  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggacta 187  Q
    | ||  | | ||||||  | |||| |||| |||| | || |||||||| ||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  52421012 t-aggcagagccatacactcctaaagcttgtctctaagtttccaaccttcca-ttcaattcctccatcgacttttcaagtaggacta 52420928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 1210427 - 1210312
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1210427 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 1210328  T
Q  101 tgagcgaaatccatac 116  Q
      |||| |||||||||    
T  1210327 caagcggaatccatac 1210312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 6640808 - 6640700
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||   || || ||||||| | |||| ||||||  | || ||||||||||    
T  6640808 taacttgtggtgtaatatgatctctaactttcacctctacactagaaacgtttcatctctttctaaaatcatattctatatacactctcttgcttctact 6640709  T
Q  101 tgagcgaaa 109  Q
    |||||||||    
T  6640708 tgagcgaaa 6640700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 7921609 - 7921574
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7921609 taacttgtggtaagatatgatctccaactttcacct 7921574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 32405084 - 32405130
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaa 47  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  32405084 taacttggggtatgatatgatctccaactttaacctctaagctagaa 32405130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 89
Target Start/End: Original strand, 32405163 - 32405201
Alignment:
Q  51 ctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtc 89  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  32405163 ctttgccttttgctgaaattacattccatatactctgtc 32405201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 255
Target Start/End: Original strand, 29173345 - 29173377
Alignment:
Q  223 cttggatgtgttccgtaagtacatccaaaacta 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29173345 cttggatgtgttccgtaagtacatcccaaacta 29173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 412
Target Start/End: Original strand, 43793640 - 43794038
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  43793640 taactagtggtatgatatgatctctaactttcacctctacactcgaaacgcttcgcctcttgctaaatttacattccgtatactctgtcttgcttctact 43793739  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      ||| ||| ||||| |||||| ||||||        |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  43793740 caagcaaaaaccatatgtttctgaggctt--------gtctccaacctcccattt-aattcttcctttgactctccaagtaggactatatcatttgcaaa 43793830  T
Q  200 aa-gcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc- 297  Q
    || ||| || |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||     
T  43793831 aaagcatacatcttggtgctcgctcttggatgtgttttgtaagtacatccaacactaaggtgaaaagataagggcttagtgttcaaccttggtgcaatct 43793930  T
Q  298 tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    |||||||||||     ||||  |||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43793931 tattgttatgg-----tcttatgtgtctcctccttgtgtcct--cactagttgagaccccttcatacatatccttgatagctcaaatataggccacccta 43794023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36651676 - 36651265
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||   |||  ||| || || |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  36651676 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttcttcttccgctgaagttccattccatatactccgtcttgcttctact 36651577  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  36651576 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 36651478  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  36651477 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatctaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 36651378  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  36651377 attgttatgggaaaaacttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaaactccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 36651279  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||| ||||||    
T  36651278 accccttacttctc 36651265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 33350406 - 33350817
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  33350406 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttcttcttccgctgaagttacattccatatacttcgtcttgcttctact 33350505  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  33350506 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 33350604  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||||| | |||||||||| ||    
T  33350605 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggagttagggttgacccttggtgcaatcct 33350704  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||| ||||||||||| |  | | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  33350705 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcttcacactagtcgaagctctctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 33350803  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || | |||||||||    
T  33350804 acccttttcttctc 33350817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 46356451 - 46356862
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  46356451 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 46356550  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      ||||  ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | | |||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | | ||| |||||  |||||    
T  46356551 caagcggtatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcttcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaaggctacatcatctgcaaa 46356649  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  46356650 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 46356749  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||    
T  46356750 attgttatgggaaaatctttggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaattcta 46356848  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  46356849 acccctttcttctc 46356862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32630289 - 32629880
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  32630289 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 32630190  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
       ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||   ||||| || ||| | |||||  | || | ||||| |||||  |||||    
T  32630189 caggcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcca--tttaactcctccctagactcacctagcaagactacatcatctgcaaa 32630092  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| | ||    
T  32630091 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgttagtacatccaaaactagagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcagtcct 32629992  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||| | || ||||||||||  ||| |  | ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| | ||| |    
T  32629991 attgttatgggaaaatctacggtatccccatcctgcgtcctcacacaggtcgaagctccctcatacatatcctggatagctttaatataggcaatcctca 32629892  T
Q  399 cacctttcttct 410  Q
    | ||||||||||    
T  32629891 cccctttcttct 32629880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 411
Target Start/End: Original strand, 39906989 - 39907390
Alignment:
Q  11 tatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||| |||    
T  39906989 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcggaat 39907088  T
Q  111 ccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgt 209  Q
    ||||| | |||||||  ||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||||||| || |    
T  39907089 ccatatgcttctaagatttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacat 39907187  T
Q  210 cttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgg 308  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  39907188 ctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtgaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgg 39907287  T
Q  309 gaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttct 407  Q
    |||||||||| || ||| ||| | ||  |||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  39907288 gaaaatcttccgtagtc-ccatcctgcatcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaacccctttct 39907386  T
Q  408 tctc 411  Q
    ||||    
T  39907387 tctc 39907390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11593545 - 11593224
Alignment:
Q  91 tgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatat 190  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| ||    
T  11593545 tgcttctactcaagcggaatccatacgcttctaagacttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacat 11593447  T
Q  191 cata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattg 289  Q
    |||  |||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||    
T  11593446 catctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttg 11593347  T
Q  290 gtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatata 387  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  11593346 gtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagtct-catcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatata 11593248  T
Q  388 ggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    ||| | |||||| |||||||||||    
T  11593247 ggcaatcctaacccctttcttctc 11593224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Original strand, 36869897 - 36870158
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||| || |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |    
T  36869897 ggtatgatatgctctccaactttcacctccagggtagacatactttcccttttcctgaagttacattccatatactatgtcttgcttctactcaagcgga 36869996  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaaaagcacac 207  Q
    | ||||||| |||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||  || ||||| ||| |||||||  |||| | ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  36869997 aaccatacgcttctaaagcttgcctccaggcctctagcctccc-gttcaattcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcatac 36870095  T
Q  208 gtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataag 270  Q
     ||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  36870096 atctcggtgctagctcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataag 36870158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 195 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 49028769 - 49028564
Alignment:
Q  195 gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgca 294  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||    
T  49028769 gcaaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgca 49028670  T
Q  295 at-ctattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggcca 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  49028669 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctacgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaa 49028571  T
Q  393 ccctaac 399  Q
     ||||||    
T  49028570 tcctaac 49028564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 20499571 - 20499380
Alignment:
Q  221 ctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcg 319  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| |  ||    
T  20499571 ctcttggatgtgttccgcaagtacatccaaaagtaaagtaaaaagataagggcttatggttcaaccttggtgcaatcctattgttatggaaaaaacgccg 20499472  T
Q  320 gtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctct 412  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||||| ||||||  |||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  20499471 atgtctccatcatgtgtcctcacactagttgagactcccttatagatatccttcatagcttgaatatagg-catcctaaccccttttttctct 20499380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 412
Target Start/End: Original strand, 48055637 - 48055828
Alignment:
Q  221 ctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcg 319  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || |||||||||| |||||  ||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||    
T  48055637 ctcttggatgtgctccgcaggtacatccaaaagtaaagtaaaaagataagggcttatggttcagccttggtgcaatcctattgttatggaaaaatcaccg 48055736  T
Q  320 gtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctct 412  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||  |||| |||| ||  |||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  48055737 atgtctccatcctgtgtcctcacactagttgagactcccttatagatatccttcatagctcgaatatagg-catcctaacccctttcttctct 48055828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38606528 - 38606309
Alignment:
Q  193 tagcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtg 292  Q
    |||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||  || || ||||| | ||||||    
T  38606528 tagcaaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactaaagcaaaaagataaggactaagggttgacccttggtg 38606429  T
Q  293 caat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggcc 391  Q
    || | |||||||||| | ||||||| |||| |  ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |  |||||||||||||||||     
T  38606428 cagtcctattgttatcgaaaaatctacggtattcccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcttggatagctctaatataggca 38606329  T
Q  392 accctaacacctttcttctc 411  Q
    | ||| |  |||||||||||    
T  38606328 atcctcatccctttcttctc 38606309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Original strand, 24177803 - 24178206
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||  | |||   |||||||| || ||||||||||||||||   || || | |||||   ||  |    
T  24177803 ggtatgatatgatctccaaccttcatctacaagctagacctacttcttcttttgctgaagttacattccatatactccatcttgatgctactcatgcaga 24177902  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacac 207  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||| ||| ||| || ||| ||||||  |||| | |||||  ||||  |||||||||| ||    
T  24177903 aaccatacgtttctaaggcttgcctccaggtctctagtctcccgtttaaatcctccct-cgactcaccaagcaagactacgtcatttgcaaaaagcatac 24178001  T
Q  208 gtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttat 306  Q
     ||| |||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||| ||||| | || ||||  | |||||||| |    
T  24178002 atctcggtgctaactcttgggcgtgttccgtcagtacatccaaaactaaaataaaaagataagaacttagggttgacccttagtgcggtcctattgttgt 24178101  T
Q  307 gggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttc 406  Q
    |||||| |||||||| || ||| |  | |||||||| |||||| |  | ||||||| || |||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||    
T  24178102 gggaaagtcttcggtatccccatccggcgtcctcaccctagtcgaagctccctcatacacatccttgatagctttaatttaggcaatcctaacccctttc 24178201  T
Q  407 ttctc 411  Q
    |||||    
T  24178202 ttctc 24178206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38897074 - 38896972
Alignment:
Q  220 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttc 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38897074 actcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagcaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttc 38896975  T
Q  319 ggt 321  Q
    |||    
T  38896974 ggt 38896972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 31004906 - 31004756
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || | |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31004906 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagtaacattccatatactctgtcttgcttctact 31004807  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  31004806 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 31004756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37616598 - 37616448
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  | | ||||  | |||  |||| |||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37616598 taacttggggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 37616499  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  37616498 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 37616448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 49028949 - 49028798
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||   || || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  49028949 taacttggggtatgatctgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttcccctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 49028850  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccca 152  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||    
T  49028849 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccca 49028798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 38606687 - 38606534
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  38606687 taacttgggatatgatatgatctccaactttcacctcaagg-tagacccacttctccttttgcaaaaattacattccatatactccgtcttgcttctact 38606589  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattt 155  Q
       ||| || ||||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||    
T  38606588 caggcggaaaccatacacttctaaggcttgcctccaggtctctagcctctcattt 38606534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 256
Target Start/End: Original strand, 21520200 - 21520288
Alignment:
Q  167 tcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaa 256  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||  |||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21520200 tcgactctccaagcagaactacatcatat-aaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaaatacatccaaaactaa 21520288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32484169 - 32484071
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctac 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| |||| | || | |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  32484169 taacttgtggtatgatatgatatttaactctcacatctaagatagaaatgtttctcctcttgataaaattacattccacatactttgtcttgcttctac 32484071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 18608290 - 18608366
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattcca 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18608290 taacttgtgatatgatatgatctccaac-ttcaccttcacactagagactctatgcctcttgctaaaattacaatcca 18608366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18626588 - 18626512
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattcca 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18626588 taacttgtgatatgatatgatctccaac-ttcaccttcacactagagactctatgcctcttgctaaaattacaatcca 18626512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18637262 - 18637186
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattcca 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18637262 taacttgtgatatgatatgatctccaac-ttcaccttcacactagagactctatgcctcttgctaaaattacaatcca 18637186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18650697 - 18650621
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattcca 78  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |  || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18650697 taacttgtgatatgatatgatctccaac-ttcaccttcacactagagactctatgcctcttgctaaaattacaatcca 18650621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 24436497 - 24436594
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttcta 98  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||  ||  || ||||  || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24436497 taacttgcggtatggtctgatctcaaactttcacctcaacaataaaaatatttcgccttttgttaaaattacatttcatatactttgtcttgcttcta 24436594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 41 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 20499737 - 20499694
Alignment:
Q  41 gctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact 84  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20499737 gctagaaacgcttcgccttttgctaaaattacactccatatact 20499694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 287 - 405
Target Start/End: Original strand, 36870210 - 36870329
Alignment:
Q  287 ttggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaata 385  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| || ||| | ||  |||||||||||||  |  | ||||||| ||||||||| ||  ||||||||    
T  36870210 ttggtgcaatcctattgttatgggaaaatttgcggtatccccatcctgcatcctcacactagttgaagctccctcatacatatccttgatgactctaata 36870309  T
Q  386 taggccaccctaacaccttt 405  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  36870310 taggcaatcctaaccccttt 36870329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 33737945 - 33738031
Alignment:
Q  15 atatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctactt 101  Q
    ||||| |||| ||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  33737945 atatgttctcaaactttcacctctaagttagaaatgatttgcattttgttggaattacattccatattttatgtattgcttctactt 33738031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 10776019 - 10776368
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  10776019 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcccctctaaactagaaacatttcgccttttgctaaaattacattccatatagtatgtcgtgcttctgct 10776118  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaa 199  Q
       ||| || |||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| |||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||  |||||    
T  10776119 caggcggaagccatacatttctaaggcttgtctccaagtgtcctacctccca-tttaattcctctctcgactctccatgtaggactatatcatctgcaaa 10776217  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  10776218 aagcatacatcttggtgtccgctcttgaatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaaatgaaaagataagggcttggtgttgaaccttggtgcaatcct 10776317  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtc 349  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10776318 attgtcatgggaaaatcgtcagtgtctccaccttgtgttctcacactagtc 10776368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 435911 - 435503
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  435911 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcgtgcttctact 435812  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaa 200  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||   ||||||    
T  435811 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatct--gcaaaa 435715  T
Q  201 agcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-cta 299  Q
    |||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| | |||    
T  435714 agcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcactccta 435615  T
Q  300 ttgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||    
T  435614 ttgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaa 435516  T
Q  399 cacctttcttctc 411  Q
    | |||||||||||    
T  435515 cccctttcttctc 435503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 23906901 - 23907313
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  | | || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  23906901 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 23907000  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata--gcaa 198  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||    | |||||| ||||||  | |  | ||||| |||||   ||||    
T  23907001 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcacttccttcct-cgactcacccaccaagactacatcatcttgcaa 23907099  T
Q  199 aaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-c 297  Q
    |||||| || ||| |||| | |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| |    
T  23907100 aaagcatacatctcggtgctaactcttggttgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcc 23907199  T
Q  298 tattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccct 396  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | |||    
T  23907200 tattgttatgggaaaatcttcggtagtct-catcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctaatatagacaatcct 23907298  T
Q  397 aacacctttcttctc 411  Q
    ||| |||||||||||    
T  23907299 aacccctttcttctc 23907313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 254
Target Start/End: Original strand, 35555975 - 35556173
Alignment:
Q  55 gccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccatt 154  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  || |||| ||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |    
T  35555975 gcctcttgctaaaattacattccatatgctctgtcttgcttctactcaagtgaaaaccatatgtttctaaggcttgtctccaagactccaacctccca-t 35556073  T
Q  155 ttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaac 253  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35556074 ttaatccttccttcgactctccaagtaggactatatcatctacaaaaagcatacat-ttggtgctcgctcttggaggtgttctgtaagtacatccaaaac 35556172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 27450773 - 27451184
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | || |    |||  ||||||||| || |||||||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  27450773 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtatacccacttctccttttgctgaagttacattccaaatactccgtcttgcttctact 27450872  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatag-caaa 199  Q
      |||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| | |||||||||| | | || ||| ||||||  |||| | ||||| ||||| | ||||    
T  27450873 caagcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctcgaggtctctagcctcccatttgactcctccct-cgactcaccaagcaagactacatcatcggcaaa 27450971  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgca-atct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||| ||||| | ||||||||  |||    
T  27450972 aagcatacatctcggtgttaactcttggatgtgtttcgttagtacatccaaaactaaagtaaaaagagaaggacttagggttgacccttggtgcagttct 27451071  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||| | || ||| ||||||||||  |  | ||||||| |||||||   ||||||||||||||||| | ||| |    
T  27451072 attgttatgggaaaatctacgctatccccatcatgcgtcttcacactagtggaagctccctcatacatatcccagatagctctaatataggcaatcctca 27451171  T
Q  399 cacctttcttctc 411  Q
      |||||||||||    
T  27451172 tccctttcttctc 27451184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 1777615 - 1778027
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  1777615 taacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtattgcttctact 1777714  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  ||| |    
T  1777715 caagcggaatccatacgcttctaaggtttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcata 1777813  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||||| | |||||||||| ||    
T  1777814 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagttaaaagataaggatttagggttgacccttggtgcaatcct 1777913  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctaga-ccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccct 396  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |  ||||||||||||||  | | | ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||| |  ||    
T  1777914 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctacgtcctcacactagttgaaagctccctcatacatatcattgatagccctaatataggcaattct 1778012  T
Q  397 aacacctttcttctc 411  Q
    ||| |||||||||||    
T  1778013 aacccctttcttctc 1778027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42037414 - 42037218
Alignment:
Q  178 agtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgctta 276  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  | || ||| |||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  42037414 agtaggactatatcatctgcaaaaaaaatacatctcggtgctcgctcttggatgtgttttctaagtacatccaaaactaaggtgaaaatgtaagggatta 42037315  T
Q  277 gtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtc--tagaccccctcatgcatatcc 370  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||    
T  42037314 gtgttgaaccttggtacaatcttattattttgggagaatcttagatgtctccaccttgtgtcctcacactagtcgagagaccccctcatacatatcc 42037218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Original strand, 48623135 - 48623538
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||| |    
T  48623135 ggtatgatatgctctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcgga 48623234  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacac 207  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| |||  | |||||| ||  | ||| ||| ||||||| || |  | ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  48623235 atccatacgcttctaaggcttgcctccagatctatagcctcccgttc-acttcctccctcgactcatccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatac 48623333  T
Q  208 gtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttat 306  Q
     ||| |||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||     
T  48623334 atctcggtgctaactcttggatgtgttacgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttagggttgaaccttggtgcaatcctattgataa 48623433  T
Q  307 gggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacaccttt 405  Q
    | ||||||||||||| |||   | | ||  |||||||||||||| |  | ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||| | |||||| |||||    
T  48623434 gagaaaatcttcggtagtc-aaatcatgcatcctcacactagtcgaagctccctcgtacatatctttgatagccctaatataggcaatcctaaccccttt 48623532  T
Q  406 cttctc 411  Q
    ||||||    
T  48623533 cttctc 48623538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39707925 - 39707734
Alignment:
Q  220 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttc 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||| | | || ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  39707925 actcttggatgtgttctgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttaacccttagtgcaatcctattgttatgggaaaatcttt 39707826  T
Q  319 ggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    |||  | ||| | || |||||||| |||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  39707825 ggtagc-ccatcatgcgtcctcacgctagtcaaaactccctcatacatttccttgatagctctaatataggcaatccaaacccctttcttctc 39707734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 242 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 53704051 - 53703882
Alignment:
Q  242 tacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcct 339  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||    
T  53704051 tacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttacgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgtgtcct 53703953  T
Q  340 cacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttct 410  Q
    |||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  53703952 cacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaacccctttcttct 53703882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 321
Target Start/End: Original strand, 1212102 - 1212228
Alignment:
Q  196 caaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa 295  Q
    ||||||||| || ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  1212102 caaaaagcatacatctcggtgctaactcttagatgtgttatgtaagtacatccaaaactaaagtgaaaagataaggacttagggttgaaccttggtgcaa 1212201  T
Q  296 t-ctattgttatgggaaaatcttcggt 321  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||    
T  1212202 tcctattgttatgggaaaatattcggt 1212228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25867273 - 25867082
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||  |||| || |||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||    
T  25867273 taacttgtggtgtgatatgatcttgaactttcacctctaaactagtaacgcttcgccttttcctaaaattacatttcatatgttatgtcttgcttctgct 25867174  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat 193  Q
    |  ||| ||  | ||||||| |||| ||| ||| || ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25867173 taggcggaagtcgtacgtttataagacttgtcttcaagtctccaacctccca-tgtaattcctccctcgactctccaagtagaactatatcat 25867082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15183579 - 15183457
Alignment:
Q  160 tcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaagg 258  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |  | |||||| || ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| |    
T  15183579 tcttccttagactctccaagttggactatatcatatgcaaaaaacatatatattggtgctcgctcttggatgtattatgtaaatacatccaaaactaaag 15183480  T
Q  259 tgaaaagataagtgcttagtgtt 281  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  15183479 tgaaaagataagggcttagtgtt 15183457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Original strand, 31960422 - 31960564
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |    
T  31960422 ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttctactcaagcgga 31960521  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  31960522 atccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 31960564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16002533 - 16002350
Alignment:
Q  64 taaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattctt 163  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||  || ||||| |    
T  16002533 taaagttatattccatatactttgtcttgcttctactcaagcgcaaaccatacgcttctaaggcttgtctctaggtctctagcctccc-gttcaattcct 16002435  T
Q  164 ccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatc 247  Q
    || || ||||  |||| | |||||  ||||| ||||||| || || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16002434 ccctcaactcaccaagcaagactacgtcatatgcaaaaaacatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatc 16002350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 297 - 368
Target Start/End: Original strand, 35556182 - 35556252
Alignment:
Q  297 ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatat 368  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  35556182 ctatttttatgggaaaatcttcagtgtctccaccttgtgt-ctcacactagttgagaccccctcatgcatat 35556252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 48174693 - 48174843
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  48174693 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 48174792  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  48174793 caagcggaattcatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 48174843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 154 - 343
Target Start/End: Original strand, 39755093 - 39755284
Alignment:
Q  154 tttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaa 252  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||  || | |||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||| || |    
T  39755093 tttaattctttcctcgactctccaagtatgacgatatcgtatgcaaaaaatacgcatcttggtgctcgctcttagatgtgttctgtaagcacatctaaca 39755192  T
Q  253 ctaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcaca 343  Q
    | ||| | |||||| ||| | |  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||| || |||||||||||    
T  39755193 caaagattaaaagacaagagttcggtgttgaaccttgatgcaattctattgttatggaaaaatctttggtgtacccagctcgtgtcctcaca 39755284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 56374972 - 56374822
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  56374972 taacttggggtatgatatgctctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 56374873  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  56374872 caagcggaatccatacacttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 56374822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30853095 - 30852815
Alignment:
Q  4 cttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttga 103  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||||||| | | |   ||||||||||| ||||||||||||||  || || ||||||||||       
T  30853095 cttgtggtatgacatgttctccaaatttcaactctaagctagaattccgtcaacttttgctaaagttacattccatata--atctcttgcttctactcag 30852998  T
Q  104 gcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaag 202  Q
    ||| || ||||| | |||||||||||        |||| ||||||| ||||| || || ||| |||||||| | ||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  30852997 gcggaagccatatgcttctaaggctt--------gtcttcaacctcacattt-aactcctccctcgactctccgagtaggactgtataatccgcaaaaag 30852907  T
Q  203 cacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgca 294  Q
     |  | ||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  30852906 tatgcatctcggtgatggctcttggatgtattccgtaagtgcgttcaaaactaaagtaaaaagataagggcttagagttgacccttggtgca 30852815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41427521 - 41427422
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| | ||||| | ||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  41427521 taacttggggtatgatatgatcttcaattttcacttttaaggtagaactacttcgttttttgctgaaattacatttcatataccatgtcttgcttctact 41427422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 412
Target Start/End: Original strand, 55768979 - 55769394
Alignment:
Q  3 acttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttg 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||  ||||||| | |  || ||||||||     
T  55768979 acttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtagaacttcttagctttttgctaaaattacattttatatactctttattgtttctactta 55769078  T
Q  103 agcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agc-aaaa 200  Q
     ||| || ||||||   |||||||||| |||  | |||||||| |||||| || ||||| ||  |||| ||| |||  ||||||| || ||  || ||||    
T  55769079 ggcggaagccatacacctctaaggcttgtct-taagtctccaatctccca-ttcaattcctctctcgaatctccaaacaggactacattatctgcaaaaa 55769176  T
Q  201 agcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttg------aacattggtgca 294  Q
    |||| |   || || | |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||| | | || ||||      | | ||||||||    
T  55769177 agcatagaactcggagttaggtcttggatgtgttccataaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagggttcagggttgacaccaacccttggtgca 55769276  T
Q  295 at-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccac 393  Q
    || ||||||||||||||||||  || ||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |  | |||| || |||||| || |||||||||||||| || |     
T  55769277 atcctattgttatgggaaaattgtctgtggctccatcttgcgtcctcaaactagtcgaagctccct-atacatatcattgatagctctaatataagcaat 55769375  T
Q  394 cctaacacctttcttctct 412  Q
    |||||  ||||||||||||    
T  55769376 cctaatccctttcttctct 55769394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 53707476 - 53707326
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||   || || |||||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  53707476 taacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaagttacattcgatatactccgtcttgcttctact 53707377  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  53707376 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 53707326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 412
Target Start/End: Original strand, 55833454 - 55833650
Alignment:
Q  222 tcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaa------cattggtgcaatc-tattgttatgggaaaat 314  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || |||||||||| | | || |||||       | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55833454 tcttggatgtgttccataaacacatccaaaactaaagtaaaaagataagggttcagggttgacaccaacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaat 55833553  T
Q  315 cttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctct 412  Q
      || ||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |  | |||| || |||||| || |||||||||||||| || | |||||  ||||||||||||    
T  55833554 tgtctgtggctccatcttgcgtcctcaaactagtcgaagctccct-atacatatcattgatagctctaatataagcaatcctaatccctttcttctct 55833650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 84
Target Start/End: Original strand, 55833235 - 55833316
Alignment:
Q  3 acttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact 84  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || | ||||| | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||    
T  55833235 acttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtagaacttcttagctttttgctaaaattacattttatatact 55833316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21060235 - 21060180
Alignment:
Q  221 ctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgctta 276  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  21060235 ctcttggatgtgttatgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaggataagtgctta 21060180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 30807280 - 30807245
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30807280 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 30807245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 99
Target Start/End: Original strand, 37677444 - 37677500
Alignment:
Q  43 tagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctac 99  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  37677444 tagaaatgcttcaccttttgctaaaattgcattccatatatgttgtcatgcttctac 37677500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 33226891 - 33226856
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33226891 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 33226856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 270
Target Start/End: Original strand, 17666848 - 17666894
Alignment:
Q  224 ttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataag 270  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17666848 ttggatgtgttatgtaagtacatccaaaactaatgtaaaaagataag 17666894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 36
Target Start/End: Original strand, 39754973 - 39755006
Alignment:
Q  3 acttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39754973 acttgtggtatgatatgatcttcaactttcacct 39755006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 82
Target Start/End: Original strand, 17666644 - 17666716
Alignment:
Q  10 gtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatata 82  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || | ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  17666644 gtatgatatgatctctaacgttcacctctaagatagaaatacttcgccttttgatgaaattgcattacatata 17666716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 876814 - 876429
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||  ||| | ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||      
T  876814 taacttgtggtaggatatgatctccaactttcacctctatgctaggaacgcttctcctctggctaaaattacattccataaactcggtcttgcttctaac 876715  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaa 200  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||                 
T  876714 taagcgaaagccatatgtttctaaggctt--------gtctccaacctcccattt-aattcttccttcaactctcctagtaggacta------------- 876637  T
Q  201 agcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-cta 299  Q
    |||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     
T  876636 agcatacatcttggtgctcgctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaacgaaggtgaaaagataagggcttagtgttgaaccttggtgcaatcctg 876537  T
Q  300 ttgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaac 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  876536 ttgttatgggaaaatcttcagtgtctcca--ttgtgtcctcacactagtcgaga-cccctcatacatatccttgatagctcgaatatagggcaccctaac 876440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Original strand, 45368231 - 45368636
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaa--atgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||   |  |||  ||||||| | || |||||||||||||||   ||| ||||||||||   |||    
T  45368231 ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttctactcaggcg 45368330  T
Q  107 aaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcac 205  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || || ||| |||||||  |||| | ||||| |||||  ||||||||||     
T  45368331 aaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccattt-aactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcat 45368429  T
Q  206 acgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgtt 304  Q
    || ||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| | ||||||||    
T  45368430 acatctcggtgctaattcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcagtcctattgtt 45368529  T
Q  305 atgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctt 404  Q
    |||||||||||| |||| || ||| | ||  |||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || || |    
T  45368530 atgggaaaatctacggtatccccatcctgcatcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcctggatagctctaatataggcaatcctcaccccat 45368629  T
Q  405 tcttctc 411  Q
    |||||||    
T  45368630 tcttctc 45368636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2610210 - 2609799
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  |||| |||| || ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  2610210 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttctact 2610111  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  |||||||| || | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  2610110 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtttctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 2610012  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  2610011 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 2609912  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | || |||||||||||| || |  | | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||     
T  2609911 attgttatgggaaaatctttggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactaatcgaagctctctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctt 2609813  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  2609812 acccctttcttctc 2609799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 24584206 - 24584617
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | | |||| ||  ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| || |||||||    
T  24584206 taacttgcggtctgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacataattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgtttctact 24584305  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| ||  |||||| ||||||| ||   ||   |||||| | |||||| ||  ||||| ||| | |||||  |||| | ||||| |||||  |||||    
T  24584306 caagcggaaatcatacgcttctaagactggcctttgggtctctagcctcccgttc-aattcctcccttgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaa 24584404  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    || || || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  24584405 aaacatacatctcggtgataactcttggatgtgttccgttagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 24584504  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||| | || ||| ||||| ||||| |  | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  24584505 attgttatgggaaaatcttcggtagccccatcctgcgtcttcacagtagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctgatataggcaatcctaa 24584604  T
Q  399 cacctttcttctc 411  Q
    | |||||||||||    
T  24584605 cccctttcttctc 24584617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 411
Target Start/End: Original strand, 452284 - 452627
Alignment:
Q  69 ttacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttc 168  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| ||    
T  452284 ttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagtggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctc 452382  T
Q  169 gactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagat 267  Q
     ||||  | |  | ||||| |||||  | |||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||    
T  452383 aactcacccaccaagactacatcatctgtaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagat 452482  T
Q  268 aagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgca 365  Q
    |||  ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||    
T  452483 aaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagtct-catcctgcgtcctcacactagtcgaacctccctcataca 452581  T
Q  366 tatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  452582 tattcttgatagccctaatataggcaatcctaacccctttcttctc 452627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 314
Target Start/End: Original strand, 33594876 - 33595182
Alignment:
Q  8 tggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcga 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||||||| |  |||||||| | || |||||||| |  |||||    
T  33594876 tggtatgatatgaactccaactttcacctttacgctaaaaacactccgcctcttgctaaaattacctgtcatatactctatcttgcttctagtcaagcga 33594975  T
Q  108 aatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcaca 206  Q
    || |||||  | |||||||||| ||||||  | || ||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||| |    
T  33594976 aaaccatatttctctaaggcttgtctccaattgtctaacttccca-tttaattattccttcgactctccaactaggactatatcttatgcaaaatgcata 33595074  T
Q  207 cgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa-tctattgtta 305  Q
    | |||  ||  ||  | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  33595075 catctcagt-ttcgtttttggatgtgttttataagtacatccaaaactaaggtgaaacaataagggcttggtgttgaacattggagtaaccctattgtta 33595173  T
Q  306 tgggaaaat 314  Q
    ||| |||||    
T  33595174 tggaaaaat 33595182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 38453220 - 38453629
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| |  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  38453220 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagac-tacttctccttccgctgatgttacattccatatactccgtcttgcttctact 38453318  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
    | |||| |||||||||| ||||| || ||  |||||| |||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  38453319 taagcggaatccatacgcttctatggtttgcctccag-tctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 38453416  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-t 298  Q
    |  || || ||| |||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||| || || |||| ||  ||||| ||||| | ||||||||||| |    
T  38453417 atacatacatctcggtgctaactcttggatgtgttttgtcaatacatccaaaactaaagtaaagagatgaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 38453516  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||| | || ||||||||||||||| | || | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||    
T  38453517 attgttatgggaaaatcttcggtaatcccatcctgcgtcctcacactagtcgaaactctctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatcctaa 38453616  T
Q  399 cacctttcttctc 411  Q
    | |||||||||||    
T  38453617 cccctttcttctc 38453629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8180283 - 8180066
Alignment:
Q  195 gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgca 294  Q
    |||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||  ||||| | |||| |||    
T  8180283 gcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgtttcgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttatggttgacccttggcgca 8180184  T
Q  295 at-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccac 393  Q
    || |||||||||||||||||||||||||   |||| | || | ||||||||||||| |  | ||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||| |     
T  8180183 atcctattgttatgggaaaatcttcggtagttccatcctgcgacctcacactagtcgaagctccctcgtacatatccttgatagccctaatattggcaat 8180084  T
Q  394 cctaacacctttcttctc 411  Q
    |||||| |||||||||||    
T  8180083 cctaacccctttcttctc 8180066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 220 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16292176 - 16291984
Alignment:
Q  220 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttc 318  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16292176 actcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttgatgcaatcctaatgttatgggaaaattttc 16292077  T
Q  319 ggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    ||| ||| ||| | |||||||||||||||||| |  | | ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  16292076 ggtagtc-ccatcctgtgtcctcacactagtcgaagctctctcatacatatccttgatagtcctaatataggcaatcctaacccctttcttctc 16291984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 12475031 - 12475286
Alignment:
Q  11 tatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||  || | |||    
T  12475031 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttatactcaagaggaat 12475130  T
Q  111 ccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgt 209  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||||||| || |    
T  12475131 ccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaaaagcatacat 12475229  T
Q  210 cttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaaga 266  Q
    || |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  12475230 ctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaaga 12475286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14769927 - 14769668
Alignment:
Q  55 gccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccatt 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |   || ||| ||  ||  ||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  14769927 gcctttagctaaaattacattccatatactctgtcttgcttctattcacgcaaaagccggacacttctaaggcttgtcttcaagtctccaacctctcatt 14769828  T
Q  155 ttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaaag-cacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaac 253  Q
      ||||| ||| |||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||  || || | |||||| |  |||||| ||||||   ||||||||||||||||     
T  14769827 g-aattcgtccctcgactctccaagcatgactacatcatcgcaaaaaaacatacatattggtgctagctcttgaatgtgtgatgtaagtacatccaaaat 14769729  T
Q  254 taaggtgaaaagata-agtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaa 312  Q
    ||| || |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14769728 taaagtaaaaagatacagggcttagggttgacccttggtgcaatcatattgttttgggaaa 14769668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12904650 - 12904262
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||  ||||||| | || ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| |  |||||||    
T  12904650 taacttgtgatatgatatgatctccaatttgtacctctaaactagaaacgtttcgccttttgctaaa-ttacattctatatactccgtcttatttctact 12904552  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
       | | || ||| ||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||| ||||| |||  | ||||| |||||||||  |||| ||  | |||    
T  12904551 catgtggaagccaaacgtttctaaggcttgtctcaaagcctcaaacctcccattt-aattcctccgacaactctccaagtaggataatattatctgaaaa 12904453  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-t 298  Q
    |||||  | | ||  |  || |||||  ||||||||| ||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  12904452 aagcaaccatttttatactcgctcttatatgtgttccatacatacatccaaaa-taaagtgaaaacgtaagggcttattgttgaactttggtgcaatcct 12904354  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggc 390  Q
    ||||||||| ||||||| ||| | || ||||||| ||||||||  |||||| || ||  ||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  12904353 attgttatgtgaaaatcgtcgttatcaccaccttatgtcctcattctagtcgaggcctactcatacatatccttcatatctaaaatataggc 12904262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3308261 - 3308156
Alignment:
Q  277 gtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaat 375  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || ||    
T  3308261 gtgttgaaccttggtgcaatcctattattatgaaaaaatctttggtgtctctaccttgtatcctcacactagtcgagaccacctcatacatgtcattgat 3308162  T
Q  376 agctct 381  Q
    ||||||    
T  3308161 agctct 3308156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7292651 - 7292436
Alignment:
Q  25 caactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact-atgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttcta 123  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| ||||| | | ||||||||||| ||||||||||| | || |  ||||| ||||| || |||| |||||  ||| ||    
T  7292651 caactttcacctctacactataaaagcttttcatcttgctaaaattgcattccatatattcatctt-tgcttttacttaagggaaaaccatatatttata 7292553  T
Q  124 aggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcact 222  Q
    | | || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||  |||||| | ||||| ||||||| || || ||||| || || ||    
T  7292552 atgattgtctccaagtcttcaacctcccattt-aattcttccctcgactctccaaacaggactctgtcatatgcaaaaatcatacatcttgatgctcgct 7292454  T
Q  223 cttggatgtgttccgtaa 240  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7292453 cttggatgtgttccgtaa 7292436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 4807274 - 4807133
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||   || || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  4807274 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 4807175  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctc 142  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  4807174 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaagtctc 4807133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 41763650 - 41763803
Alignment:
Q  2 aacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctactt 101  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||     
T  41763650 aacttggggtatgatataatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactc 41763749  T
Q  102 gagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattt 155  Q
      ||| || ||||||| | |||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  41763750 aggcggaaaccatacgctactaaggcttgcctccaggtctctagcctcccattt 41763803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 7135285 - 7135368
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact 84  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | |||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7135285 taacttgtggtatgatatgatatctaaatttcacctcaaagctataaatgttttttcttttgctaaaattacattccatgtact 7135368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26433885 - 26433784
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||  |   |||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26433885 taacttgtggtatgacatgatctccaactttcatctctaagttagaaatattaaacctttttctacaatttcattccatatactttgtc-tgcttctact 26433787  T
Q  101 tga 103  Q
    |||    
T  26433786 tga 26433784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 13148784 - 13148686
Alignment:
Q  221 ctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa-tctattgttatgggaaaatcttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  |||| | |||  || || | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13148784 ctcttggatgtgttctgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaaagtaagggtttacggtagacctttggtgcaattctattgttatcgaaaaatcttc 13148686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23866333 - 23866267
Alignment:
Q  5 ttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaatta 71  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  23866333 ttgtggtatgatatgatctctaactttcacatctaagttagaactactttgccttttgttaaaatta 23866267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 11992706 - 11992741
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992706 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 11992741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 13148995 - 13148960
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13148995 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 13148960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37281591 - 37281510
Alignment:
Q  196 caaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttag 277  Q
    ||||||||| ||  ||||||| | || | |||||||||| |||||||||||| ||| |||| || |||||||||| ||||||    
T  37281591 caaaaagcatacaccttggtgctaacccatggatgtgtttcgtaagtacatctaaacctaaagtaaaaagataagggcttag 37281510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 36038894 - 36038802
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctactt 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  | || | ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||| ||| | || | |||||||||    
T  36038894 ggtatgatatgatcttcaactttcagttataaggtagaactacttcgccttttgctgaaatcacattccatacactctatcttccttctactt 36038802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 3285167 - 3284774
Alignment:
Q  5 ttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgag 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||  || | || ||||||||||  ||    
T  3285167 ttgtggtatgatatgatctccaactttcacctctacgctagaaacgctttggctcttgctaaatttacattccatactctctttcttgcttctactaaag 3285068  T
Q  105 cgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagc 203  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||  |||||||||    
T  3285067 caaaagccatatgtttctaaggcttgtctccag--------cctcccattt-aattcttccttcgactctccgaataggactatgtcatctgcaaaaagc 3284977  T
Q  204 acacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaa----gtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    | |  ||||| || ||  ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3284976 ataaatcttgatgctctttcttgtatgtgttccgtaattaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagggcttagtgttgaaccttggtgcaatact 3284877  T
Q  299 attgttatgggaaaa-tcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |    
T  3284876 attgttatgagaaaattctttagtgtctccatcttgtgtcctcacactagtcgagactccctcatacatatccttgatagctctaaaataggtcacccga 3284777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 36565841 - 36566252
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  | | || ||||||| |||||||| | || ||||||||||    
T  36565841 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgttgaagttacatttcatatactctatcttgcttctact 36565940  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  36565941 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 36566039  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  36566040 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 36566139  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  36566140 attgttatgggaaaatcttcagtagtct-catcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 36566238  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  36566239 acccctttcttctc 36566252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 36544834 - 36544444
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36544834 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttctact 36544735  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      || | |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  | |||    
T  36544734 caagtggaatccatacggttctaaggcttgcctctaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgaaaa 36544636  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || |||  ||| | ||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  36544635 aagcatacatctcagtgctaactcttggatgtgttgcatcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttagggttgacccttggtgcaatcct 36544536  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | |||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  36544535 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatatatatccttgatagccctaatataggc 36544444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 56 - 410
Target Start/End: Original strand, 42854668 - 42855023
Alignment:
Q  56 ccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattt 155  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||   ||| || ||||||| || ||||||||  ||||||||||| | ||||||| ||    
T  42854668 ccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaggcggaaaccatacgcttttaaggcttgcctccaggtctctagcctccca-tt 42854766  T
Q  156 taattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaact 254  Q
    ||| || ||| |||||||  |||| | ||||| |||||  |||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  42854767 taactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctatcaggacatccaaaact 42854866  T
Q  255 aaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctaga 353  Q
    || || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||| || | || ||||||||||||||| |      
T  42854867 aaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcagtcctattgttataggaaaatctacggtatcttcatcctgcgtcctcacactagtcgaag 42854966  T
Q  354 ccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttct 410  Q
    | ||||||| |||||||   ||||||||||| ||||| | ||| || ||||||||||    
T  42854967 ctccctcatacatatcccggatagctctaatttaggcaatcctcacccctttcttct 42855023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 319
Target Start/End: Original strand, 12492442 - 12492761
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  12492442 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttatccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 12492541  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||| | || | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  12492542 caagcggaatccatacgcttctaaggcttacctccaggtctctagcctcc-agttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 12492640  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||   |||| | |||||||||| ||    
T  12492641 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttaagattgacccttggtgcaatcct 12492740  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcg 319  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  12492741 attgttatggaaaaatcttcg 12492761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 257 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25984974 - 25984818
Alignment:
Q  257 ggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagacc 355  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||     
T  25984974 ggtgaaaagataagggattaatgttaaaccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccactttgtgccctcacacttgtcttgact 25984875  T
Q  356 ccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctct 412  Q
    || |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  25984874 ccgtcatacatatccttgatagcttgaatattggcaaccctaacacttctcttctct 25984818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 41444904 - 41445219
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  41444904 taacttgtggtatgatatgatctccacctttcacctctaagttagaaatgcttcgccttttgctaaaattacattccatatactttatcttgcttttact 41445003  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaa 199  Q
       ||| || | |||   || |||||||  |||||| | ||  |||| |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||   ||||    
T  41445004 catgcggaagcaatatccttataaggctcgtctccaagccttaaacc-ccca-tttaattcctccctcgactctccaagtaggactacatcatctacaaa 41445101  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaa-aagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc- 297  Q
    ||  | || ||| |||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| || || || ||||| |||||| ||| | | ||||| |||||     
T  41445102 aaatagacatctcggtgctagcttttggatgtgtttcgtaattacatccaaaattaaagtaaacaaaataagggcttagggttaacccttggtacaatca 41445201  T
Q  298 tattgttatgggaaaatc 315  Q
    ||||||||||||||||||    
T  41445202 tattgttatgggaaaatc 41445219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 411
Target Start/End: Original strand, 15216091 - 15216283
Alignment:
Q  220 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttc 318  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  15216091 actcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgatccttggtgcagtcctattgttatgggaaaatctac 15216190  T
Q  319 ggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    ||| ||  || | || ||||||||||||||| |  | |||||||  ||||| |  ||||||||||||||||| | |||  | |||||||||||    
T  15216191 ggtatcctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatatatatcatagatagctctaatataggcaatcctcgcccctttcttctc 15216283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 25985222 - 25985128
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttct 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25985222 taacttgtggtatgatatgatc--caactttcacctctaagctagaaatgcttcgcctcttgctaaacttacattccatatactctgtcttgcttct 25985128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 38667232 - 38667142
Alignment:
Q  10 gtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  38667232 gtatgatatgatctccaagtttcacctctaggatagaactacttcgccttttgctaaaactacattacatataccatgtcttgcttctact 38667142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 28300714 - 28300895
Alignment:
Q  10 gtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaa 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||| | ||| | |||||| | |||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |  |||||    
T  28300714 gtatgatatgatctccagctttcacctctaaggtcgaactacttcgtcttttgatgaaatcacattaaatatactatgtc-tgcttctactcggacgaaa 28300812  T
Q  110 tccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat 193  Q
      |||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||| || || || ||||| ||| |||||||| ||| || ||||| |||||    
T  28300813 gtcatacccttctaagacttgtctccaagtctccaacatctca-ttcaattcctccatcgactctccaattaagactacatcat 28300895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 59 - 154
Target Start/End: Original strand, 33830888 - 33830983
Alignment:
Q  59 tttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccatt 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    |||||  |||||  ||||||| ||| |||||| |||||| || |||||||    
T  33830888 tttgctaaaattacattacatatactatgttttgcttctactcagccgaaagtcatacacttctaagacttgtctccaagtctccgacatcccatt 33830983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13984256 - 13983966
Alignment:
Q  57 cttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccatttt 156  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||| ||  |||||  ||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||| ||     
T  13984256 cttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttctactcatgcggaagtcatacacttctaaggcttgtctccaagtctctaactttcca-ttc 13984158  T
Q  157 aattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaacta 255  Q
    ||||  ||| ||||||||  ||| |||||||  ||||  ||||||| || || |||||||  | | |||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  13984157 aatttctccctcgactctcaaagcaggactacttcatctgcaaaaa-catacatcttggttctaaatcttggatatgtttcgtaagtacattcaaaatta 13984059  T
Q  256 aggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtc 349  Q
    |  | ||| | ||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||| |||||| ||||||| || ||  | ||| |||  |||||||||||||||    
T  13984058 a-ttaaaagggtaagtgcttagggtt-atccttggtgcaatcatatagttatgagaaaatcgtcagtagccccatcttacgtcctcacactagtc 13983966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 37
Target Start/End: Original strand, 43732246 - 43732280
Alignment:
Q  3 acttgtggtatgatatgatctccaactttcacctt 37  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43732246 acttgtgctatgatatgatctccaactttcacctt 43732280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 4033094 - 4033126
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttca 33  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4033094 taacttggggtatgatatgatctccaactttca 4033126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 68 - 410
Target Start/End: Original strand, 17222285 - 17222628
Alignment:
Q  68 attacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttcctt 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| | || ||||||  || ||||||||||| |||||| ||||| |    
T  17222285 attacattccatatactatgtcttgcttctacttaagcgaaagccatatgtttctaaagtttgtctccaaatcaccaacctccca-tttaatccttccct 17222383  T
Q  168 cgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaaga 266  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| |  |||||||| | |||| |||||  ||||||| ||| ||| |||||||||   ||||||||| |||||||     
T  17222384 cgactctccaaatatgactatatcatatgtgaaaagcacgcatcttagtgatttctcttggttgtcttctgtaagtacaattaaaactaagatgaaaagt 17222483  T
Q  267 taagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgca 365  Q
    | || |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||    
T  17222484 ttagggcttagtgttgaaccttgttgcaatcatattgttatgagaaaatcttcgacgtctccatcttgtgtccgcacactattcgagactctctcataca 17222583  T
Q  366 tatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttct 410  Q
    |||| || ||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  17222584 tatctttgataactcaaatatagacaaccctaacacctttattct 17222628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 5258750 - 5259072
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||    |||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5258750 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttctact 5258849  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
       ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || || ||| |||||||  |||| | ||||  |||||  |||||    
T  5258850 caggcggaagccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccattt-aactcctccctcgactcaccaagcaagacttcatcatctgcaaa 5258948  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggt-gaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-c 297  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||| ||| | | |||||||||| |    
T  5258949 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaaagataaggacttagggtttacccttggtgcaatcc 5259048  T
Q  298 tattgttatgggaaaatcttcggt 321  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5259049 tattgttatgggaaagtctacggt 5259072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 195 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6082888 - 6082671
Alignment:
Q  195 gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgca 294  Q
    |||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||    
T  6082888 gcaaaaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataagaacttagggttgacccttggtgca 6082789  T
Q  295 at-ctattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggcca 392  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  6082788 atcctattgttacgagaaaatcttcggtagtct-catcttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagttctaatataggcaa 6082690  T
Q  393 ccctaacacctttcttctc 411  Q
     |||||| |||||||||||    
T  6082689 tcctaacccctttcttctc 6082671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 154 - 412
Target Start/End: Original strand, 9369152 - 9369406
Alignment:
Q  154 tttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaag-cacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaa 251  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||||  || || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9369152 tttaattcttccttcgacactccaagtaagactatatcatttgcaaaaaaacatacatcttggtgctcgcttttggatgtgtttcgtaagtacatccaaa 9369251  T
Q  252 actaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtcta 351  Q
    |||||||||||||||||||  || | | |||||| |||||||||||   | |||| | |||| |||| |||| ||||||||||||      ||||||| |    
T  9369252 actaaggtgaaaagataaggactcaatattgaactttggtgcaatcctatattatagaaaaaccttctgtgtatccaccttgtgt------actagtcaa 9369345  T
Q  352 gaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctct 412  Q
    ||  || |||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9369346 gaatccttcatacatatccttgatatctcgaatataggtcaccctaacacctttcttctct 9369406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 20428236 - 20428648
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||  |  ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| |||||| |||    
T  20428236 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctcctaggtagacctaattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttccact 20428335  T
Q  101 --tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gca 197  Q
      || |||||| ||||||| |||||||||||  ||| || | || | |||||||||| | | || |||| |||||  |||| | ||||| |||||  |||    
T  20428336 catg-gcgaaaaccatacgcttctaaggcttgcctctagatatctagcctcccatttaactcctccctt-gactcaccaagcaagactacatcatctgca 20428433  T
Q  198 aaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat- 296  Q
    ||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||   ||||| ||||| | |||||||| |     
T  20428434 aaaagcatacatctcggtgctaactcttgaatgtgttccgtaagtacatccaaagctaaagtaataagataaaaacttagggttgacccttggtgcagtc 20428533  T
Q  297 ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccct 396  Q
    |||||||||||||||||| | |||| || ||| | |   |||||||||||||| |  | ||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||| | |||    
T  20428534 ctattgttatgggaaaatatacggtatccccatcctacttcctcacactagtcgaagctcccacatacatatcctggatagctctaatataggcaatcct 20428633  T
Q  397 aacacctttcttctc 411  Q
     || |||||||||||    
T  20428634 cacccctttcttctc 20428648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5631499 - 5631230
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5631499 taacttggggtatgatatgatctctaactttcacctgcaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttctact 5631400  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
       ||| || ||||||  |||||||||||  || |||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||  |||| | ||||| |||||| |||||    
T  5631399 catgcggaaaccatactcttctaaggcttgcctacaggtctccagcctccca-tttaactcctccctcgactcaccaagaaagactagatcatatgcaaa 5631301  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataag 270  Q
    || ||  | ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5631300 aaacatgcatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataag 5631230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9706458 - 9706047
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | | || |    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  9706458 taacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtatacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccatcttgcttctact 9706359  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata--gcaa 198  Q
       |||  | ||||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| | |||| ||| ||||||  |||| | ||||| |||||   | ||    
T  9706358 caggcgggaaccatactcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccatttaacttctccct-cgactcaccaagcaagactacatcatttgggaa 9706260  T
Q  199 aaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc- 297  Q
    |||||| ||  || |||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||  ||||| | |||||||| ||     
T  9706259 aaagcatacaactcggtgctaactcttggatgtgtttcgtcagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttaaggttgacccttggtgcagtca 9706160  T
Q  298 tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  || | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||| | |||     
T  9706159 tattgttatgggaaaatctacggtatcctcatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcctggaaagctctaatttaggcaatcctc 9706060  T
Q  398 acacctttcttct 410  Q
    || ||||||||||    
T  9706059 acccctttcttct 9706047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30670556 - 30670180
Alignment:
Q  15 atatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  | | || |  | |||  ||||||||||||  ||||||| |||||||  ||| ||||||| ||  ||||||| ||||    
T  30670556 atatgatctccaactttcacctccaaggtatacctacttctccttttgctaaagatacattctatatactccgtcttgcttcttctcaagcgaaaaccat 30670457  T
Q  115 acgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaaaagcacacgtcttg 213  Q
    ||| || ||||||||  ||| ||||||| ||||||||  || ||||| ||| |||||||  |||| | ||||| |||||  |||||||||| || |||      
T  30670456 acgcttataaggcttgcctctaggtctctaacctccc-gttcaattcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaaaagcatacatctca 30670358  T
Q  214 gtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaa 312  Q
     || | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||   |||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30670357 atgctaactcttggatgtattccgtcagtacacccaaaactaaagtaaaaagacaaggatttatggttgacccttggtgcaatcttattgttatgggaaa 30670258  T
Q  313 atcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggc 390  Q
    ||||| |||  |  || | ||  |||||||||||||| | || |||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  30670257 atcttaggtaacctcatcatgcatcctcacactagtcaaaactcccttatacatatcctggatagctctaatataggc 30670180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 315
Target Start/End: Original strand, 2208210 - 2208317
Alignment:
Q  209 tcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatg 307  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  2208210 tcttggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaaggtaagggcttaggattgacccttggtgcaatcatattgatatg 2208309  T
Q  308 ggaaaatc 315  Q
    | ||||||    
T  2208310 gaaaaatc 2208317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 3629691 - 3629591
Alignment:
Q  222 tcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcgg 320  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||  ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3629691 tcttgaatgtgttccataagtacatccaaaactaaagtaaaaagataagggcttaaggttgacccttagtgcaatcctattgttatgggaaaatcgtcgg 3629592  T
Q  321 t 321  Q
    |    
T  3629591 t 3629591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 390
Target Start/End: Original strand, 2680872 - 2681037
Alignment:
Q  223 cttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaa-gataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatctattgttatgggaaaatcttcggt 321  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||  ||||| | | ||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  2680872 cttggatgtgttatgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaaagataaggacttacggttgaccct-ggtgcaat--attgttatggaaaaattttcggt 2680968  T
Q  322 gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggc 390  Q
      | ||| | ||||| |||||||||||| |  | || |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2680969 agccccatcctgtgttctcacactagtcgaagctccttcatgcatatccttgatagctctaaaataggc 2681037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 10100457 - 10100598
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  | |||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  10100457 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctcattttgctaaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 10100556  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctc 142  Q
       ||| || ||||| | |||||||||| | |||| ||||||    
T  10100557 caggcggaaaccatatgcttctaaggctcacctcctggtctc 10100598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26291244 - 26291201
Alignment:
Q  220 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  26291244 actcttggatgtgttccgtaaatacatccaaaattaaagtgaaa 26291201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 412
Target Start/End: Original strand, 31502657 - 31503059
Alignment:
Q  12 atgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||  | ||||  ||||| ||||| | | |||||||| |  | ||||| ||||  || |||| |    
T  31502657 atgatatgatctccaactttcagatctacgttaggaatgtgtcgcctcatgctataattatagttcatatactcttacttgcttatactcaagagaaaac 31502756  T
Q  112 catacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtc 210  Q
    | ||  |||||||  ||| ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||  | ||    
T  31502757 cttatatttctaaaacttgtcttcaagtctccaacctcgcattc-aattcttctttcgactctccaagtaagactatctcatctgcaaaaagcatgcatc 31502855  T
Q  211 ttggtgatcact-cttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgg 308  Q
    |||||| ||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||    
T  31502856 ttggtgctcgtttcttggatttgttttgtaagtacatccaaaattaaggtgaaaagataaggacgtagtgttgaaccttggtacaatcctattgttaagg 31502955  T
Q  309 gaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttctt 408  Q
    | |||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31502956 ggaaatcttcggtgtctccttctggtgtcctcacagtagtcgagaccccatcatacatatcctttataactcgaatataggccaccctaacacctttctt 31503055  T
Q  409 ctct 412  Q
    ||||    
T  31503056 ctct 31503059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20318673 - 20318262
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  20318673 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaactacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 20318574  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  20318573 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccatgaagactacatcatctgcaaa 20318475  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  20318474 aagcatacatctcggtgctaactcttgaatgtgtttcgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 20318375  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||| | ||||    
T  20318374 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaaactccctcatacatatccttgatagccataatataggcaatccta 20318276  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  20318275 acccctttcttctc 20318262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 404
Target Start/End: Original strand, 2076074 - 2076478
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |||||  ||||  ||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  2076074 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaactgcttctccttccgctgaagttacattccatgtactctgtcttgcttctact 2076173  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  |||||| |||| | |||||| ||  | ||| ||| | |||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  2076174 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccagctctctagcctcccgttc-acttcctcccttgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 2076272  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  2076273 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 2076372  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| |||||  | |||||||| | ||||    
T  2076373 attgttgtgggaaaatcttcggtagtct-catcatgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccatgatataggcaatccta 2076471  T
Q  398 acacctt 404  Q
    || ||||    
T  2076472 acccctt 2076478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3394392 - 3393985
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  3394392 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaa-ttacattccatatactctgtcttgcttctact 3394294  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
       ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| || || ||| |||||||  |||| | ||||  |||||  |||||    
T  3394293 caggcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccattt-aactcctccctcgactcaccaagcaagactgcatcatctgcaaa 3394195  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||  ||||| ||| | | |||||||||| ||    
T  3394194 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcagtacatccaaaactagagtaaagagataaggacttagggtttacccttggtgcaatcct 3394095  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
    |||||||||||||||||| || | || ||| |  | ||||||||| ||||| |  |  |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||| | ||| |    
T  3394094 attgttatgggaaaatctacgatatccccatcccgcgtcctcacattagtcgaagcttcctcatacatatcctggataactctaatataggcaatcctca 3393995  T
Q  399 cacctttctt 408  Q
    | ||||||||    
T  3393994 cccctttctt 3393985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1274947 - 1274559
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  | | ||||  | |||  ||||| ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1274947 taacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtagacctacttctcctttcgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 1274848  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaa-ttcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaa 198  Q
      | || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||  || || | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  ||||    
T  1274847 caaccggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctc--atgttcacttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaa 1274750  T
Q  199 aaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa-tc 297  Q
    |||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  1274749 aaagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaattc 1274650  T
Q  298 tattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatatag 388  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  1274649 tattgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatctttgatagccctaatatag 1274559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 1288189 - 1288579
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  1288189 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacttacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 1288288  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||  | ||| ||| |||| ||  | |  | ||| | |||||  |||||    
T  1288289 caagcagaatccatacgcttctaaggcttgtctccaggtctctagtctcccgttc-acttcctccctcgaatcacccaccaagaccacatcatctgcaaa 1288387  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  1288388 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaatataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 1288487  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggc 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1288488 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggc 1288579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24178198 - 24177795
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||| |    
T  24178198 ggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactcaagcgga 24178099  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacac 207  Q
    ||||||||  |||||||||||  || |||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||    |  | ||||| |||||  |||||||||| ||    
T  24178098 atccatacacttctaaggcttgccttcaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcactcaccaagactacatcatctgcaaaaagcatac 24178000  T
Q  208 gtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttat 306  Q
     ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  24177999 atctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatcccaaactaaagtaaaaagattaggacttagggttgacccttggtgcaatcctattgttat 24177900  T
Q  307 gggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacaccttt 405  Q
     |||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||    
T  24177899 cggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctaatataggcaatgctaaccccttt 24177801  T
Q  406 cttctc 411  Q
    ||||||    
T  24177800 cttctc 24177795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3301531 - 3301120
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  3301531 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 3301432  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
       ||| || ||||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| || ||||  |||| | || |  |||||  |||||    
T  3301431 caggcggaaaccatactcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccattt-aattcctccctcaactcaccaagcaagattgcatcatctgcaaa 3301333  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||  ||||| ||| | | |||||| | | ||    
T  3301332 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttctgtcagtacatccaaaactagagtaaagagataaggacttagggtttacccttggtggagtcct 3301233  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaa 398  Q
     |||||| |||||||||| | || || ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||| | ||| |    
T  3301232 tttgttaagggaaaatctacagtatccccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcatggataactctaatataggcaatcctca 3301133  T
Q  399 cacctttcttctc 411  Q
    | |||||||||||    
T  3301132 cccctttcttctc 3301120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3096864 - 3096625
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||  ||| ||||||    ||||||  ||||||| | || ||||||||||    
T  3096864 taacttgtgctgagatatgatctctaactttcacctctacgatagaaacgcttctcctcttgcta----tacattatatatactttatcttgcttctact 3096769  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||||||  |||| ||||||||| |||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  3096768 caagcgaaagtcatatgtttctaagactt--------gtctccaacctcccattt-aattcttccttcgactctttaagtatgactatatcatatgcaaa 3096678  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaa 252  Q
    | ||| || |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3096677 acgcatacatcttggtgctcgcttttggatgtgttctgtaagtacatccaaaa 3096625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 43558414 - 43558670
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  43558414 taacttgtggtatgctatgatctccaactttcacctctgagctagaaacactttgccttttgctaaatctacattccatatactttatcttgcttgtact 43558513  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaa 199  Q
        |||||  |||||| |||||||| ||        ||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||| |||| ||||||| |||||   ||||    
T  43558514 ccgacgaaagtcatacgcttctaaggttt--------gtctccaacatccca-ttaaattcctccctcaactctccaagaaggactacatcatctacaaa 43558604  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaag 265  Q
    | ||| |  ||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43558605 acgcatatatctcggtgttagctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtgaaaag 43558670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 12493156 - 12493333
Alignment:
Q  195 gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgca 294  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||   |||| ||||| | ||||||||    
T  12493156 gcaaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggagttagggttgacccttggtgca 12493255  T
Q  295 at-ctattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatcct 371  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||    
T  12493256 atcctattgttatgggaaaatattcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatcct 12493333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 246
Target Start/End: Original strand, 16134643 - 16134881
Alignment:
Q  5 ttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgag 104  Q
    ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||  |  ||||||||||||||| | |  ||||||| || |||    
T  16134643 ttgtgttatgaaatgatcttca-ctttcacctttacgctagaaacgcttcgcctcttgct--aggtacattccatatactctttattgcttctgctcgag 16134739  T
Q  105 cgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagc 203  Q
     ||||  |||| |||||||||| || || ||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||  || ||||||||||| |  ||||||    
T  16134740 tgaaactcatatgtttctaaggtttgtcaccaagtcttcaacctccca-tttaattcttccctcgactctcaaatcagcactatatcatatgtgaaaagc 16134838  T
Q  204 acacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacat 246  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16134839 aaacatcttgatgctcactcttggatgtgttctataagtacat 16134881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10638979 - 10638688
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||   || || ||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  10638979 taacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtctttcttctact 10638880  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  10638879 caagcgaa-tccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctaccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 10638782  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgc 293  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||    
T  10638781 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgc 10638688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 28977459 - 28977725
Alignment:
Q  3 acttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttg 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  | |||  ||||  | | || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||      
T  28977459 acttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacctacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttctactca 28977558  T
Q  103 agcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaa 201  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||  | |||||| ||  | ||| ||| | ||| |  | |  | ||||| |||||  |||||||    
T  28977559 agcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggcctatagcctcccgttc-acttcctcccttgacccacccaccaagactacatcatctgcaaaaa 28977657  T
Q  202 gcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataa 269  Q
    ||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  28977658 gcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataa 28977725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 6368525 - 6368623
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  6368525 taacttgtggtatgttatgatctccatctttcacctctacattagaaatgtttcacctcttgctaaaattacaatccatataccttgtcttgcttctac 6368623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35685398 - 35685241
Alignment:
Q  138 gtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccg 237  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||| || || |||||||| |  |||||| |||||||||     
T  35685398 gtctccaaccacccattc-aattcctcctccgactcttcaagtaggactatatcaactaaaaaaacatacatcttggtgctacctcttgaatgtgttcca 35685300  T
Q  238 taagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc 297  Q
    ||| ||| ||||||||||| |  |||||||||| | |||  ||||| |||| ||||||||    
T  35685299 taaatac-tccaaaactaaagcaaaaagataagagtttaaggttgatcattagtgcaatc 35685241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27602 - 27298
Alignment:
Q  11 tatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |  | || | ||| |||| ||| | || ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||  |||| ||     
T  27602 tatgatatgatctccaactttcacctccaaggcataactacttcgcctattgttgaagttacattccctatactctgtcttgcttttactcaagcggaag 27503  T
Q  111 ccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatag-caaaaagcacacgt 209  Q
     | |||| |||||| |||| | || | ||||||||| |||||||  ||||| ||| ||| |||| |||  ||||||| ||||| | |||||| || || |    
T  27502 tcctacgcttctaacgcttgtatctaagtctccaacttcccattc-aattcctccctcgtctctccaaacaggactacatcatcgacaaaaaacatacat 27404  T
Q  210 cttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgg 308  Q
    || | || | |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||| |||||| ||||| | || ||||||| ||||||||| ||    
T  27403 ctcgttgctaactcttggatatggtccgcaagtacatccaaaacaaaaataaaaaggtaagagcttag-gttgatccttcgtgcaatcctattgttacgg 27305  T
Q  309 gaaaatc 315  Q
    |||||||    
T  27304 gaaaatc 27298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 38579101 - 38579178
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccat 79  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38579101 taacttgtgctataatatgatctccaactt-caccttcacgctagagactctatgcctcttgctaaaattacattccat 38579178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 37124252 - 37124155
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgc-cttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttct 97  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||| |||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  37124252 taacttgttgtatgatttgatctccaactttcacctctaaggtagaaatacttcacatttttgctgaaattacattccatatactctatcttgcttct 37124155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 14099995 - 14099919
Alignment:
Q  8 tggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact 84  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | | ||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14099995 tggtatgatatgatctctaactttcgcctttaagttggaaattcttcaccttttgctaaagttatattccatatact 14099919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23979904 - 23979815
Alignment:
Q  11 tatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | | ||| | ||||| |||||| | || ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  23979904 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggttgaactactttgtcttttgttgaagttacattacatataccatgtcttgcttttact 23979815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3095459 - 3095404
Alignment:
Q  355 cccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3095459 cccctcatacatatccttgattgctc-aatataggccaccctaacatctttcttctc 3095404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14099710 - 14099646
Alignment:
Q  298 tattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcat 362  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14099710 tattgttatgggaaaatcgttagtgtctccatcaagtgtcctcacactagtctatactccctcat 14099646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 16348002 - 16348037
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348002 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 16348037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 21915568 - 21915485
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact 84  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| | | ||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21915568 taacttgtattatgatataatctcgaactttcacctctgcactagaaatgcttcacctcttgttaaaatttcattcaatatact 21915485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Original strand, 27302555 - 27302630
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatact 84  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||| | |||| ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  27302555 ggtatgatatgatctccaacactcaccttcaaggtagaactactttaccttttgttgaagttacattccatatact 27302630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17212707 - 17212593
Alignment:
Q  241 gtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcct 339  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||  |||||| |||  |||||||||||  |||||    
T  17212707 gtacatccaaaactatgatgaaaagatcatggcttagtgttgaagcttgatgcaatcctatttttatgaaaaaatcatcgtggtctccaccttacgtcct 17212608  T
Q  340 cacactagtctagac 354  Q
    || | ||||| ||||    
T  17212607 catagtagtcgagac 17212593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 25937743 - 25937665
Alignment:
Q  12 atgatatgatctccaactttcacc-tttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||  ||||||||| |||||||  | |||||||| ||||    
T  25937743 atgatatgatctccaactttcaccttttaaggtagaaatacttctccttttgctgaaattactcttcatatactttgtc 25937665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 297 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 30418781 - 30418700
Alignment:
Q  297 ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctc 380  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | ||||  |||||||||||||||||| ||| || | ||  ||||||||| |||||||    
T  30418781 ctattgttatgggaaaatctt--gtgaccccactctgtgtcctcacactagtcgagaacctcccacacatatccttgatagctc 30418700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 35685477 - 35685437
Alignment:
Q  57 cttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttct 97  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  35685477 cttttgctaaaattacattacatatactttgtcttgcttct 35685437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 26)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52138510 - 52138099
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  52138510 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 52138411  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      | |  |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||    | || |||| |||||  | |  | ||||| |||||  | |||    
T  52138410 caaacagaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttcccttcctccctt-gactcacccaccaagactacatcatgtgtaaa 52138312  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaa-tct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||| |||    
T  52138311 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgatccttggtgcaattct 52138212  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  52138211 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 52138113  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  52138112 acccctttcttctc 52138099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 51448309 - 51448720
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  51448309 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttctact 51448408  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||| | | |||| ||  | ||| ||| || ||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  51448409 caagcggaatccatacgcttctaagacttgcctctaggtctctagcgtcccgttc-acttcctccctcaactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 51448507  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| | || | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||| ||    
T  51448508 aagcatacatctcgatgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttagggttgacccttggtgcaatcct 51448607  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | || |||||||||| |||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  51448608 attgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacaccagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaaaccta 51448706  T
Q  398 acacctttcttctc 411  Q
    || |||||||||||    
T  51448707 acccctttcttctc 51448720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19757616 - 19757429
Alignment:
Q  51 ctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcc 150  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||| |  ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  19757616 ctttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttctactaaggcggatgccatacgcttctaaggcttgtctccaagtctctaacctcc 19757517  T
Q  151 cattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgt 238  Q
    || || ||||| ||| || ||||| |||| ||||||  |||||  |||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19757516 ca-ttcaattcctccctcaactctccaagcaggactgcatcatctgcaaaaagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgt 19757429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19736848 - 19736611
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| | | || ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19736848 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaggactactctgccttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttctact 19736749  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaa 199  Q
       ||| |  ||||||  ||||||||||| |||| | ||||| || |||||| || ||||| ||| || ||||| |||| ||||||  |||||  |||||    
T  19736748 aaggcggatgccatacacttctaaggcttgtctctaagtctctaatctccca-ttcaattcctccctcaactctccaagcaggactgcatcatctgcaaa 19736650  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgt 238  Q
    ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19736649 aagcatacatcttggtgctaactcttggatgtgttccgt 19736611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 38849768 - 38849366
Alignment:
Q  9 ggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  ||||||| |  | ||||||||||||||||  ||| | ||| ||||  |||| |    
T  38849768 ggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttttgatgtagttacattccatatactccgtcttacttttactcaagcgga 38849669  T
Q  109 atccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatag-caaaaagcacac 207  Q
    | ||||||| || || |||||  |||||| |||| | ||||| |||  ||||| |||||||||||  |||| | ||||| |||||   ||||||||| ||    
T  38849668 aaccatacgattatagggcttgcctccagatctctagcctcctattc-aattcctccttcgactcaccaagcaagactacatcatctacaaaaagcatac 38849570  T
Q  208 gtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttat 306  Q
     ||| |||| | ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    ||||||||||  ||||   |||| | ||||||||||| || ||||||    
T  38849569 atctcggtgcttactcttggacgtgttccgcccgtacatccaaaactaaataaaaaagataaggacttacaattgacccttggtgcaatcctactgttat 38849470  T
Q  307 gggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttc 406  Q
    || |||||||| |||  | |||  ||| ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| ||||||    
T  38849469 ggaaaaatctttggtagccccattttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagctctaatataggcaatcataacccctttc 38849370  T
Q  407 ttct 410  Q
    ||||    
T  38849369 ttct 38849366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 220 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 9258349 - 9258180
Alignment:
Q  220 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttc 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||| |||    
T  9258349 actcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttggggttgtccattggtgccatcctattgttgtgggaaaatattc 9258250  T
Q  319 ggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatatag 388  Q
    |||  | ||| | |||||||||||| ||||| |  | | ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  9258249 ggtaaccccatcatgtgtcctcacaatagtcgaagctctctcatacatatcgtttatagctctaatatag 9258180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 412
Target Start/End: Original strand, 50630059 - 50630333
Alignment:
Q  139 tctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccg 237  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| |  ||||||| ||  |  ||||||| |  | |||||||||||||||    
T  50630059 tctccaacctcctattt-aattcctccttcaactctccaagtagaactatatcgtttgcaaaaatcatgcaccttggtgctagcacttggatgtgttccg 50630157  T
Q  238 taagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgt 336  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||| |||| | ||| ||||| || |||||||||  | ||| || ||| | |||||    
T  50630158 taagtaaatccaaaactaaagtaaaaagataagggcttagggttgaaccttggggtaatcctattattgtgggaaaattattggtttcaccatcatgtgt 50630257  T
Q  337 cctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctct 412  Q
    |||||||| |||  ||||||||| ||  |||| | | ||||||  ||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  50630258 cctcacacaagttgagaccccctaatttatattcctgatagcttaaatataggcaatcgtaacacttttcttctct 50630333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19757750 - 19757651
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19757750 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaggactactttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttctact 19757651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 48221466 - 48221310
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| | ||   ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  48221466 taacttgtggtatgatatgatcttcaactttcacctctaagatagaactactacaccttttgctgaaattacattacatatactatgtcttacttctact 48221367  T
Q  101 tgagcgaaatccata---cgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccatt 154  Q
    | || | || |||||    | ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  48221366 taagtggaaaccataatgtgcttctaaggcttgtctccaagtcttcaacctcccatt 48221310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 805584 - 805243
Alignment:
Q  41 gctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctacttgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtc 140  Q
    |||||||| | || |||| ||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| |    | | |||||||||||| |||||| |||    
T  805584 gctagaaacgtttcgcctcttgttaaaatttcattccatatactccgtcttgcttctactcaagcgagagaagtgcatttctaaggcttgtctccaagtc 805485  T
Q  141 tccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgta 239  Q
    || ||||||||          |||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||| | || |||||| | |  |||||||||||||||||||    
T  805484 tctaacctccc----------ttcctttgactctccaagtaggaccgtatcatatgcaaaaagtatacatcttggcgcttgctcttggatgtgttccgta 805395  T
Q  240 agtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagt-gttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatcttcggtgtctccaccttgtgtc 337  Q
    || |||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||||||  || |||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||    
T  805394 agcacatcccaaactaa-gtgtaaaaataaggacttagtattttaaccatggtgcaatcctattgttatgagataatctccgatgtctccaccttgtgtc 805296  T
Q  338 ctcacactagtctagac-cccctcatgcatatccttaatagctctaatatagg 389  Q
    || ||||| ||  |||| ||| |||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  805295 ctaacactggttgagactcccatcatacatttcctttatagcttgaatatagg 805243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29817187 - 29816891
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |||||   |||  ||||||| | || |||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  29817187 taacttatggtatgatatgatctccaactttcacctccaagatagaacaacttcaccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttgattctatt 29817088  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatag-caaa 199  Q
       ||  || ||| ||  ||||||||||| |||| | ||||  || ||| | ||  ||||| ||| | |||||| ||||||||||| ||||||   ||||    
T  29817087 caggcagaagccacacacttctaaggcttgtctctaagtctataagctcgcgttc-aattcatcccttgactctccaagtaggactgtatcatcttcaaa 29816989  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc 297  Q
    || || || ||| |||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  29816988 aaacatacatctcggtgctaactctaggatgtgttttgtaagtacatccaaacctaaggtaaaaaggtaagggcttagggttgagccttggtgcaatc 29816891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44395097 - 44395014
Alignment:
Q  16 tatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctac 99  Q
    |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | || |||||||||    
T  44395097 tatgatctccaactttcatctctaaactagaaatgctttgccttttgctaaagttgcattccatatactctatcttgcttctac 44395014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 47542311 - 47542461
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | | ||||  | |||  |||| |||| || |||||||||||| |||  ||| ||||||||||    
T  47542311 taacttggggtatgaaatgatctccaactttcacctccaaggtagacctacttctccttctgctgaagttacattccatacactccgtcttgcttctact 47542410  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  47542411 caagcggaatccatacgcttctaaggcttgcctccaggtctctagcctccc 47542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Original strand, 1448214 - 1448539
Alignment:
Q  2 aacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctactt 101  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||  ||| ||| |||||||  ||| |||||| | |||| | ||||||||     
T  1448214 aacttttgatatgatatgatctccaacttttacctctaagctagaaatgtttcacctcttgttaaaattttatttcatatattttgtctttcttctactc 1448313  T
Q  102 gagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcatagcaaaaa 201  Q
      | |||| ||| |||||| | | | || |||| | || || ||||||  |  | ||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |  |||||     
T  1448314 atgtgaaagccaaacgttttttaagattttctcaaagtatctaacctcaaaagt-aattcttctctctactctccaagtaggactatatctt--caaaac 1448410  T
Q  202 gcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctat 300  Q
    ||| || |||| ||| ||  ||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||| ||  |||| |||||||| || |||| || ||||    
T  1448411 gcatacatctttgtgctcgttcttggatgtgtttcgtaagttattccaaaactaagatgaaaagatgaggtcttaatgttgaaccttagtgctatcctat 1448510  T
Q  301 tgttatgggaaaatcttcggtgtctccac 329  Q
    | |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1448511 tattatgaaaaaatcttcggggtctccac 1448539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25191061 - 25190827
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | | ||||    |||  ||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  25191061 taacttgggctatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacccacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttctact 25190962  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcat-agcaaa 199  Q
    | | || ||  || ||  ||||||||| |  ||| ||||||| | ||||||| ||||| || ||| |||||||  |||| | ||||| |||||  |||||    
T  25190961 taatcggaaatcacacacttctaaggcgtgcctctaggtctctagcctccca-tttaactcctccctcgactcaccaagcaagactacatcatctgcaaa 25190863  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttc 235  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||    
T  25190862 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttc 25190827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 30724400 - 30724522
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  ||||||| ||    
T  30724400 taacttatagtatgatatgatctccaacgttcacctataaacgagaaacactttgccttttgctaataatacatttcatatactttgttttgcttcttct 30724499  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttcta 123  Q
    |  ||| || ||||| |||||||    
T  30724500 taggcggaaaccatatgtttcta 30724522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 32490324 - 32490412
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtc 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || | ||||||  |||  |||||||||||| || |||| |||||||| ||||    
T  32490324 taacttgtggtatgatatgatcttcaactttcatctataagttagaaacacttcaccttttgctaaacttgcatttcatatactctgtc 32490412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 1426124 - 1426211
Alignment:
Q  2 aacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtc 89  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||| ||| |||||||  ||| |||||||| ||||    
T  1426124 aacttttggtataatatgatctccaactttcacctttaagttagaaatgtttcacctcttgttaaaattttatttcatatactttgtc 1426211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 1470698 - 1470785
Alignment:
Q  2 aacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtc 89  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||  ||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||    
T  1470698 aacttttggtatgatatgatctccaactttcacctctaagcaataaatgattcacctcttgctaaaattttatttcatatactctgtc 1470785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 7696754 - 7696668
Alignment:
Q  3 acttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtc 89  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| | ||  |||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7696754 acttgtggaatgatgtgctctccaactttcacttctagcctaggagtgttttgcattttgctaaacttacattccatatactttgtc 7696668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15750906 - 15750820
Alignment:
Q  15 atatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctactt 101  Q
    |||||||||||||||||||  | || | || || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  15750906 atatgatctccaactttcaaatgtaagataaaactactttgccttttgctgaaattacattccatatactttatcttacttctactt 15750820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 26592036 - 26592114
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccat 79  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||  | || |||||||||||||| ||||||||    
T  26592036 taacatgtggtatgatatgttatccaactttcacctctaagatagaaatattctgtcttttgctaaaattgcattccat 26592114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 11581020 - 11580963
Alignment:
Q  228 atgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaac 285  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11581020 atgtgtttcgtaaacacattcaaaactaaagtgaaaagataagggcttactgttgaac 11580963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Original strand, 1426341 - 1426405
Alignment:
Q  221 ctcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaac 285  Q
    |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||| ||  |||| ||||||||    
T  1426341 ctcttggatgtgtttcataagtaattccaaaactaagatgaaaagatgaggtcttaatgttgaac 1426405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 27917254 - 27917218
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctt 37  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27917254 taacttgggatatgatatgatctccaactttcacctt 27917218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 46145835 - 46145775
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgcctttt 61  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || | || |||||||| |||||||    
T  46145835 taacttgtggtatgacataatctccaactttaacctctaagttaaaaatgcttcgcctttt 46145775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 4e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31150 - 30740
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | | ||||  | |||  ||||  ||| || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  31150 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacctacttctccttccgctgaagttacattccatatactcagtcttgcttctact 31051  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaa 199  Q
      |||| |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||  | ||| ||| |||||||  | |  | ||||| |||||  |||||    
T  31050 caagcggaatccatacacttctaaggcttgcctccaggtctctagcctcccgttc-acttcctccctcgactcacccaccaagactacatcatctgcaaa 30952  T
Q  200 aagcacacgtcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ct 298  Q
    ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||  |||| | |||||||| | ||    
T  30951 aagcatacatctcggtgctaactcttggatgtgttccgtcaatacatccaaaactaaagtaaaaagataaggacttaggattgacccttggtgcagtcct 30852  T
Q  299 attgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccacccta 397  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||    
T  30851 attgttttgggaaaatcttcggtagtc-ccatcctgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatacatatccttgatagccctaatataggcaatccta 30753  T
Q  398 acacctttcttct 410  Q
    || ||||||||||    
T  30752 acccctttcttct 30740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9233 - 8981
Alignment:
Q  118 tttctaaggcttatctccaggtctccaacctcccattttaattcttccttcgactcttcaagtaggactatatcata-gcaaaaagcacacgtcttggtg 216  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| ||||  |||||||||| | ||||||| || |||||||  ||||||  ||  | ||||| ||    
T  9233 tttctaaggcttgtctccaagtcttcaacctctcattt-aatttatccttcgactttccaagtagaacaatatcatctgcaaaacacattcatcttgttg 9135  T
Q  217 atcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatgggaaaatc 315  Q
        ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9134 tgtgctcttggatgtgttttgtaagtacatccaaaactaaaatgaaaagataatggtttagtgttgtaccttggtgcaatcctattgttatgggaaaatc 9035  T
Q  316 ttcggtgtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctcatgcatatc 369  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  9034 gtcggtgtctccaccatgtgtcctcacactagtcgagatccattcatgcatatc 8981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9329 - 9265
Alignment:
Q  11 tatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacatt 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||   ||  ||||||||||||||||||||    
T  9329 tatgatatgatctccaacttttacctctaaactagaaacaattcaccttttgctaaaattacatt 9265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 315
Target Start/End: Original strand, 309 - 416
Alignment:
Q  209 tcttggtgatcactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaatc-tattgttatg 307  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  309 tcttggtgctaactcttggatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaagtaaaaaggtaagggcttaggattgacccttggtgcaatcatattgatatg 408  T
Q  308 ggaaaatc 315  Q
    | ||||||    
T  409 gaaaaatc 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 390
Target Start/End: Original strand, 13142 - 13248
Alignment:
Q  287 ttggtgcaatc-tattgttatgggaaaatcttcggt-gtctccaccttgtgtcctcacactagtctagaccccctc--atgcatatccttaatagctcta 382  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |  | |||||  || ||||||||| |||||||||    
T  13142 ttggtgcaatcctattgttatgggaaaatcttcggtagtc-ccatcttgcgtcctcacactagtcgaagctccctcatatacatatccttgatagctcta 13240  T
Q  383 atataggc 390  Q
    ||||||||    
T  13241 atataggc 13248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 12198 - 12348
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctttacgctagaaatgctttgccttttgctaaaattacattccatatactatgtcatgcttctact 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | | ||||  | |||  ||||||||| || |||||||| ||||| |  ||| | ||||||||    
T  12198 taacttggggtatgatatgatctccaactttcaccgcgaaggtagacctacttctccttttgctgaagttacattctatataatccgtcttacttctact 12297  T
Q  101 tgagcgaaatccatacgtttctaaggcttatctccaggtctccaacctccc 151  Q
      |||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||||||| | ||||||    
T  12298 caagcggaaaccatacgcttctaaggcttgcctctaggtctctagcctccc 12348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Original strand, 88878 - 88933
Alignment:
Q  356 ccctcatgcatatccttaatagctctaatataggccaccctaacacctttcttctc 411  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  88878 ccctcatacatatccttgatagctctaatataggcaatcctaactcctttcttctc 88933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 317
Target Start/End: Original strand, 88760 - 88851
Alignment:
Q  227 gatgtgttccgtaagtacatccaaaactaaggtgaaaagataagtgcttagtgttgaacattggtgcaat-ctattgttatgggaaaatctt 317  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||| ||||  ||||| ||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  88760 gatgtgttcctttagtacatccaaaagtaatgtaaaaagttaaggacttagggttgacccttggtgcaatcctatggttacgggaaaatctt 88851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 2870 - 2905
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 2905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 5874 - 5839
Alignment:
Q  1 taacttgtggtatgatatgatctccaactttcacct 36  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5874 taacttggggtatgatatgatctccaactttcacct 5839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University