View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12057_high_19 (Length: 263)

Name: NF12057_high_19
Description: NF12057
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12057_high_19
NF12057_high_19
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-128)||(29938058-29938185)
chr8 (1-123)||(39206588-39206710)
chr8 (1-123)||(14422705-14422827)
chr8 (1-123)||(18594539-18594661)
chr8 (1-123)||(34842448-34842570)
chr8 (1-128)||(35118114-35118241)
chr8 (1-123)||(13110406-13110528)
chr8 (1-121)||(26783816-26783936)
chr8 (1-127)||(8021717-8021843)
chr8 (1-123)||(40117935-40118057)
chr8 (1-121)||(2042607-2042727)
chr8 (1-121)||(10836838-10836958)
chr8 (1-120)||(34679540-34679659)
chr8 (1-123)||(33287108-33287230)
chr8 (1-123)||(39218779-39218901)
chr8 (1-120)||(38167238-38167357)
chr8 (1-123)||(4035849-4035971)
chr8 (1-123)||(6144356-6144478)
chr8 (1-123)||(22260713-22260835)
chr8 (1-123)||(24113249-24113371)
chr8 (1-122)||(144397-144518)
chr8 (1-126)||(34998979-34999104)
chr8 (1-122)||(41575516-41575637)
chr8 (1-121)||(42571598-42571717)
chr8 (1-123)||(7791413-7791535)
chr8 (1-121)||(7774768-7774888)
chr8 (1-119)||(44805027-44805145)
chr8 (1-126)||(28639277-28639406)
chr8 (6-128)||(5320561-5320683)
chr8 (1-123)||(33278402-33278524)
chr8 (1-122)||(66263-66384)
chr8 (1-123)||(7811997-7812119)
chr8 (1-119)||(36491163-36491281)
chr8 (29-126)||(5005165-5005262)
chr8 (7-123)||(2322101-2322217)
chr8 (38-124)||(9806874-9806960)
chr8 (29-125)||(39220256-39220352)
chr8 (1-42)||(9807343-9807384)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (1-128)||(29078511-29078638)
chr1 (1-123)||(26580353-26580475)
chr1 (1-123)||(1168503-1168625)
chr1 (1-123)||(16052096-16052218)
chr1 (1-123)||(39260429-39260551)
chr1 (1-123)||(52753230-52753352)
chr1 (1-126)||(8079792-8079917)
chr1 (1-123)||(20089471-20089593)
chr1 (1-123)||(25897374-25897496)
chr1 (1-123)||(26663258-26663380)
chr1 (1-123)||(29288149-29288271)
chr1 (1-122)||(43905655-43905776)
chr1 (1-123)||(5215385-5215507)
chr1 (1-126)||(2473719-2473844)
chr1 (1-122)||(46409436-46409557)
chr1 (1-120)||(12682823-12682942)
chr1 (1-120)||(38829072-38829191)
chr1 (1-123)||(1170527-1170649)
chr1 (1-123)||(1940830-1940952)
chr1 (1-123)||(32671579-32671701)
chr1 (1-123)||(41928578-41928700)
chr1 (1-123)||(52696791-52696913)
chr1 (1-123)||(970607-970731)
chr1 (1-124)||(19715244-19715367)
chr1 (1-123)||(33510484-33510606)
chr1 (1-122)||(8120870-8120991)
chr1 (1-122)||(49146173-49146294)
chr1 (1-120)||(40092494-40092613)
chr1 (9-128)||(42370886-42371005)
chr1 (1-123)||(2347656-2347778)
chr1 (1-126)||(46760963-46761088)
chr1 (1-120)||(13996806-13996925)
chr1 (1-128)||(51359300-51359426)
chr1 (1-123)||(15203112-15203234)
chr1 (1-126)||(15717782-15717906)
chr1 (1-123)||(17591691-17591810)
chr1 (1-120)||(52086270-52086389)
chr1 (1-107)||(17587588-17587694)
chr1 (1-120)||(29695678-29695798)
chr1 (128-246)||(30798283-30798404)
chr1 (1-126)||(7145204-7145329)
chr1 (33-123)||(15554259-15554349)
chr1 (7-120)||(23498463-23498576)
chr1 (1-110)||(23322923-23323032)
chr1 (1-89)||(40149497-40149585)
chr1 (1-123)||(6765459-6765581)
chr1 (6-122)||(38171833-38171949)
chr1 (53-123)||(5675105-5675175)
chr1 (29-121)||(5217895-5217986)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (1-123)||(9008140-9008262)
chr5 (1-126)||(16069353-16069478)
chr5 (1-123)||(27420861-27420983)
chr5 (1-123)||(27679252-27679374)
chr5 (1-122)||(24105754-24105875)
chr5 (1-123)||(1579039-1579161)
chr5 (1-123)||(1605654-1605776)
chr5 (1-123)||(35782727-35782849)
chr5 (1-120)||(3386569-3386688)
chr5 (1-123)||(33491279-33491401)
chr5 (1-126)||(16737530-16737655)
chr5 (1-123)||(4120940-4121062)
chr5 (1-123)||(8374421-8374543)
chr5 (1-123)||(19358529-19358651)
chr5 (1-120)||(38598533-38598652)
chr5 (1-120)||(20992364-20992487)
chr5 (1-126)||(3921581-3921706)
chr5 (1-119)||(1165684-1165802)
chr5 (1-123)||(5202975-5203097)
chr5 (1-123)||(20992229-20992351)
chr5 (1-123)||(33991143-33991265)
chr5 (1-122)||(31883148-31883269)
chr5 (1-118)||(33284658-33284775)
chr5 (1-130)||(31410472-31410601)
chr5 (1-128)||(26603025-26603142)
chr5 (2-79)||(27025003-27025080)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (1-123)||(23776530-23776652)
chr4 (1-123)||(1756835-1756957)
chr4 (1-126)||(20877044-20877169)
chr4 (1-126)||(30423635-30423760)
chr4 (1-122)||(19165042-19165164)
chr4 (1-123)||(50055172-50055294)
chr4 (1-123)||(54189545-54189667)
chr4 (1-123)||(54412628-54412750)
chr4 (1-123)||(8932249-8932371)
chr4 (1-123)||(14987792-14987914)
chr4 (1-123)||(19913701-19913823)
chr4 (1-123)||(27488719-27488841)
chr4 (1-123)||(37464721-37464843)
chr4 (1-115)||(37968828-37968942)
chr4 (1-123)||(38055157-38055279)
chr4 (1-123)||(50353801-50353923)
chr4 (1-127)||(52139199-52139325)
chr4 (1-122)||(16700782-16700903)
chr4 (1-126)||(35490844-35490969)
chr4 (1-122)||(43290031-43290152)
chr4 (1-120)||(28032783-28032902)
chr4 (1-120)||(48909849-48909968)
chr4 (4-123)||(53717538-53717657)
chr4 (1-123)||(2481479-2481601)
chr4 (1-123)||(6611431-6611553)
chr4 (1-123)||(11639649-11639771)
chr4 (1-123)||(40428791-40428913)
chr4 (1-123)||(44784988-44785110)
chr4 (1-123)||(50053443-50053565)
chr4 (9-123)||(1617084-1617198)
chr4 (1-123)||(15669183-15669305)
chr4 (2-120)||(28360433-28360551)
chr4 (1-123)||(45424605-45424727)
chr4 (1-122)||(30171581-30171702)
chr4 (1-122)||(53875658-53875779)
chr4 (1-121)||(15241099-15241219)
chr4 (1-127)||(8591163-8591289)
chr4 (1-119)||(27583703-27583821)
chr4 (5-127)||(31969677-31969799)
chr4 (1-114)||(38071391-38071504)
chr4 (1-123)||(53353055-53353181)
chr4 (20-123)||(6688711-6688814)
chr4 (5-120)||(23704284-23704399)
chr4 (1-123)||(47632034-47632157)
chr4 (1-123)||(44375845-44375967)
chr4 (1-119)||(40680109-40680227)
chr4 (1-123)||(27536175-27536293)
chr4 (1-101)||(16703843-16703943)
chr4 (38-126)||(23265865-23265953)
chr4 (1-120)||(44379258-44379377)
chr4 (1-114)||(33703850-33703963)
chr4 (26-123)||(55344921-55345018)
chr4 (27-123)||(44548238-44548335)
chr4 (69-123)||(9595974-9596027)
chr4 (5-42)||(23269121-23269158)
chr4 (1-42)||(51780789-51780830)
chr4 (2-116)||(17493340-17493454)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (1-123)||(38856090-38856212)
chr3 (1-123)||(15520211-15520333)
chr3 (1-123)||(25999385-25999507)
chr3 (1-123)||(37698212-37698334)
chr3 (1-123)||(42307974-42308096)
chr3 (1-123)||(54534396-54534517)
chr3 (1-126)||(32359253-32359378)
chr3 (1-123)||(25494354-25494476)
chr3 (1-125)||(21581037-21581161)
chr3 (1-123)||(8042604-8042726)
chr3 (1-123)||(22175059-22175181)
chr3 (1-123)||(50528926-50529048)
chr3 (1-123)||(54870243-54870365)
chr3 (1-126)||(32244114-32244239)
chr3 (1-125)||(50529842-50529966)
chr3 (1-120)||(26122814-26122933)
chr3 (1-120)||(35226447-35226566)
chr3 (1-123)||(12117727-12117849)
chr3 (1-123)||(20699146-20699268)
chr3 (4-123)||(29445485-29445604)
chr3 (1-123)||(15520633-15520755)
chr3 (1-123)||(34700338-34700460)
chr3 (1-123)||(38933943-38934064)
chr3 (1-123)||(46452231-46452353)
chr3 (7-123)||(20842423-20842539)
chr3 (1-120)||(44609402-44609521)
chr3 (1-123)||(35643214-35643336)
chr3 (1-116)||(42105040-42105155)
chr3 (1-119)||(2895186-2895304)
chr3 (1-123)||(24835768-24835890)
chr3 (5-99)||(44688782-44688876)
chr3 (5-123)||(49128046-49128164)
chr3 (1-120)||(48925072-48925189)
chr3 (1-120)||(53028225-53028336)
chr3 (2-68)||(16354398-16354464)
chr3 (1-97)||(12915930-12916025)
chr3 (70-119)||(24366093-24366142)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (1-121)||(30691855-30691975)
chr6 (1-123)||(6086682-6086804)
chr6 (1-123)||(2837547-2837669)
chr6 (1-123)||(26946959-26947081)
chr6 (1-123)||(52838-52960)
chr6 (5-123)||(3955853-3955971)
chr6 (1-123)||(9459565-9459687)
chr6 (1-123)||(26704422-26704544)
chr6 (5-126)||(17261160-17261281)
chr6 (1-123)||(3347606-3347728)
chr6 (1-123)||(11167242-11167364)
chr6 (1-127)||(34887375-34887501)
chr6 (1-123)||(35198286-35198407)
chr6 (1-115)||(1153603-1153717)
chr6 (1-123)||(21893457-21893579)
chr6 (1-123)||(20726793-20726911)
chr6 (1-123)||(16307091-16307213)
chr6 (1-123)||(18613540-18613662)
chr6 (2-132)||(28199591-28199723)
chr6 (1-121)||(30699012-30699132)
chr6 (47-126)||(33463700-33463779)
chr6 (1-51)||(33464403-33464453)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (1-123)||(42204155-42204278)
chr7 (1-123)||(7164185-7164307)
chr7 (1-123)||(30181097-30181219)
chr7 (1-123)||(6394752-6394874)
chr7 (1-119)||(12101251-12101369)
chr7 (1-123)||(20346489-20346611)
chr7 (1-123)||(33359163-33359285)
chr7 (1-123)||(33846597-33846719)
chr7 (1-119)||(42965069-42965187)
chr7 (1-126)||(3511321-3511446)
chr7 (1-122)||(4477394-4477515)
chr7 (1-126)||(5280858-5280983)
chr7 (6-119)||(43156718-43156831)
chr7 (1-123)||(4347274-4347396)
chr7 (1-123)||(22649767-22649889)
chr7 (1-123)||(24792405-24792527)
chr7 (7-121)||(1803029-1803143)
chr7 (1-123)||(36890903-36891024)
chr7 (1-123)||(43068046-43068168)
chr7 (1-126)||(9452588-9452713)
chr7 (1-123)||(15655913-15656035)
chr7 (1-123)||(32041543-32041665)
chr7 (1-120)||(933289-933408)
chr7 (1-123)||(19828271-19828393)
chr7 (1-121)||(38866547-38866667)
chr7 (1-128)||(25748483-25748610)
chr7 (1-123)||(8630667-8630789)
chr7 (1-122)||(42673467-42673584)
chr7 (1-124)||(46891412-46891536)
chr7 (1-119)||(12097663-12097781)
chr7 (1-123)||(17753601-17753723)
chr7 (29-123)||(37704981-37705075)
chr7 (5-122)||(37005888-37006005)
chr7 (1-89)||(16894580-16894668)
chr7 (1-119)||(43021649-43021767)
chr7 (1-123)||(46134377-46134499)
chr7 (1-89)||(48865665-48865756)
chr7 (15-123)||(43405021-43405129)
chr7 (35-119)||(27691433-27691517)
chr7 (1-123)||(36849610-36849732)
chr7 (94-123)||(16894663-16894692)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-123)||(36705-36827)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (1-123)||(30420250-30420372)
chr2 (1-123)||(31517298-31517420)
chr2 (1-121)||(3873327-3873447)
chr2 (1-125)||(28329920-28330044)
chr2 (1-120)||(33906130-33906249)
chr2 (1-122)||(42937720-42937841)
chr2 (1-123)||(1108280-1108401)
chr2 (1-123)||(4232225-4232347)
chr2 (5-123)||(18806971-18807089)
chr2 (1-123)||(39635452-39635574)
chr2 (1-122)||(1482986-1483106)
chr2 (1-123)||(4016039-4016161)
chr2 (1-123)||(6174911-6175033)
chr2 (1-123)||(19901221-19901342)
chr2 (1-123)||(26323269-26323391)
chr2 (1-123)||(2178852-2178974)
chr2 (1-128)||(16066377-16066504)
chr2 (1-115)||(5733407-5733521)
chr2 (1-122)||(16588859-16588980)
chr2 (1-125)||(850995-851119)
chr2 (1-119)||(44947625-44947743)
chr2 (1-123)||(30270762-30270884)
chr2 (1-109)||(19384018-19384126)
chr2 (5-122)||(429817-429934)
chr2 (1-123)||(42446652-42446774)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-123)||(23034-23156)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-126)||(145328-145453)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (1-123)||(3710-3832)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-123)||(89-211)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-123)||(378-500)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-132)||(89-221)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-123)||(10238-10360)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29938185 - 29938058
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29938185 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagct 29938086  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29938085 caaaataagccaatccaaacggggccaa 29938058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39206710 - 39206588
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39206710 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 39206611  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39206610 caaaataagccaatccaaacggg 39206588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14422827 - 14422705
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14422827 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 14422728  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  14422727 caaaataaaccaatccaaacggg 14422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18594661 - 18594539
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18594661 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 18594562  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18594561 caaaataagccaatccaaacggg 18594539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 34842448 - 34842570
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34842448 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 34842547  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  34842548 caaaataagccaatccaaacggg 34842570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 35118114 - 35118241
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35118114 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 35118213  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35118214 caaaataagccaatccaaacggggccaa 35118241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13110528 - 13110406
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13110528 tatggcataagcagcttattaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagct 13110429  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13110428 caaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 26783816 - 26783936
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26783816 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 26783915  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26783916 caaaataagccaatccaaacg 26783936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8021843 - 8021717
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8021843 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 8021744  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8021743 caaaataagccaatccaaacgggacca 8021717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 40117935 - 40118057
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40117935 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagct 40118034  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  40118035 caaaataagccaatccaaacggg 40118057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 2042607 - 2042727
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2042607 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 2042706  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2042707 caaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 10836838 - 10836958
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10836838 tatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagct 10836937  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10836938 caaaataagccaatccaaacg 10836958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 34679540 - 34679659
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34679540 tatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 34679639  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34679640 caaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 33287108 - 33287230
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33287108 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcatatgggagtagataaacccacataagct 33287207  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  33287208 caaaataagtcaatccaaacggg 33287230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39218901 - 39218779
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39218901 tatggcataagcagcttatgaagctatgataaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 39218802  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39218801 caaaataagccaatccaaacggg 39218779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 38167238 - 38167357
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38167238 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaact 38167337  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  38167338 caaaataggccaatccaaac 38167357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4035971 - 4035849
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4035971 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagct 4035872  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     ||||||| ||||||||||||||    
T  4035871 aaaaataaaccaatccaaacggg 4035849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 6144356 - 6144478
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  6144356 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagct 6144455  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  6144456 caaaataagtcaatccaaacggg 6144478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 22260713 - 22260835
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22260713 tatggcataagcagcttatgaaactaggataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagct 22260812  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22260813 caaaataagccaatccaaacggg 22260835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 24113249 - 24113371
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24113249 tatgacataagcagcttatgaaactatgataatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagct 24113348  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  24113349 caaaataagtcaatccaaacggg 24113371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 144518 - 144397
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  144518 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgct 144419  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  144418 caaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 34998979 - 34999104
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||  |||||||    
T  34998979 tatggcataagcagcttatgaaactaagataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagct 34999078  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34999079 caaaataagccaatccatacgggacc 34999104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 41575637 - 41575516
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  41575637 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagct 41575538  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  41575537 caaaataagccaatccaaacgg 41575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 42571717 - 42571598
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  42571717 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagct 42571619  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  42571618 caaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7791535 - 7791413
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||| ||    
T  7791535 tatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaact 7791436  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7791435 caaaataagccaatccaaacggg 7791413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 7774888 - 7774768
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  7774888 tatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagct 7774789  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  7774788 caaaataagccaatctaaacg 7774768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 44805027 - 44805145
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  44805027 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagct 44805126  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  44805127 caaaataagccaattcaaa 44805145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28639406 - 28639277
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagct----tatgggaatagataagcccacata 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28639406 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacata 28639307  T
Q  97 agctcaaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  28639306 agcttaaaataagccaattcaaacgggacc 28639277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 6 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 5320683 - 5320561
Alignment:
Q  6 cataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaa 105  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  5320683 cataagcaacttatgaaactatgataaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaa 5320584  T
Q  106 taagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  5320583 taagccaatccaaacggggccaa 5320561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33278524 - 33278402
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||  | |||||||| ||| |||| ||    
T  33278524 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaact 33278425  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33278424 caaaataagccaatccaaacggg 33278402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 66263 - 66384
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| ||| || ||    
T  66263 tatggcataagcagcttatgaaactattataagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaact 66362  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  66363 caaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7812119 - 7811997
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || |||| | ||||||| | ||||||| ||    
T  7812119 tatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaact 7812020  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  7812019 caaaataagccaatcaaaacggg 7811997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 36491281 - 36491163
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  36491281 tatggcataaacaagttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagct 36491182  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
     ||||||||||||||||||    
T  36491181 taaaataagccaatccaaa 36491163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5005262 - 5005165
Alignment:
Q  29 ataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  5005262 ataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataagcttaagataagccaatccaaacaggacc 5005165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 2322101 - 2322217
Alignment:
Q  7 ataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 106  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||||  |||    
T  2322101 ataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgttagtagataaatccatataagctccgaat 2322200  T
Q  107 aagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||    
T  2322201 aagccaatccaaacggg 2322217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806874
Alignment:
Q  38 ttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggga 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggga 9806874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 39220352 - 39220256
Alignment:
Q  29 ataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggac 125  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  | |||||   ||||||||  || |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39220352 ataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacatatggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacgggac 39220256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 9807384 - 9807343
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctattttta 42  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9807384 tatgacataagcagcttatgaagctatgataagctattttta 9807343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29078638 - 29078511
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29078638 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 29078539  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29078538 caaaataagccaatccaaacaggaccaa 29078511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26580353 - 26580475
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580353 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagct 26580452  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26580453 caaaataagccaatccaaacggg 26580475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1168625 - 1168503
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1168625 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagct 1168526  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1168525 caaaataagccaatccaaacggg 1168503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 16052218 - 16052096
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  16052218 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaact 16052119  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16052118 caaaataagccaatccaaacggg 16052096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 39260429 - 39260551
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39260429 tatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagct 39260528  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  39260529 caaaataagccaatccaaacggg 39260551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 52753230 - 52753352
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52753230 tatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagct 52753329  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52753330 caaaataagccaatccaaacggg 52753352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 8079792 - 8079917
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8079792 tatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 8079891  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  8079892 caaaataagccaatccaaacgggacc 8079917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20089593 - 20089471
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20089593 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagct 20089494  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20089493 caaaataagccaatccaaacggg 20089471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25897496 - 25897374
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25897496 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagct 25897397  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25897396 caaaataagtcaatccaaacggg 25897374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 26663380 - 26663258
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26663380 tatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 26663281  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26663280 caaaataagccaatccaaacggg 26663258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29288271 - 29288149
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29288271 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 29288172  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  29288171 caaaataagtcaatccaaacggg 29288149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 43905776 - 43905655
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  43905776 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagct 43905677  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43905676 caaaataagccaatccaaacgg 43905655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5215507 - 5215385
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  5215507 tatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagct 5215408  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5215407 caaaataagccaatccaaacggg 5215385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2473844 - 2473719
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2473844 tatgacataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagct 2473745  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    |||||||| || ||||||||||||||    
T  2473744 caaaataaaccgatccaaacgggacc 2473719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 46409557 - 46409436
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  46409557 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagct 46409458  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  46409457 caaaataagtcaatccaaacgg 46409436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 12682942 - 12682823
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12682942 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaact 12682843  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  12682842 caaaataagtcaatccaaac 12682823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38829191 - 38829072
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  38829191 tatggcacaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagct 38829092  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38829091 caaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 1170527 - 1170649
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  1170527 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagct 1170626  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1170627 caaaataagccaatccaaacggg 1170649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 1940830 - 1940952
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1940830 tatgacataaacaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 1940929  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1940930 caaaataagccaatccaaacggg 1940952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32671701 - 32671579
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  32671701 tatggcataagtagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagct 32671602  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32671601 caaaataagccaatccaaacggg 32671579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 41928578 - 41928700
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |    
T  41928578 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagtt 41928677  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  41928678 caaaataagccaatccaaacggg 41928700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 52696913 - 52696791
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  52696913 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 52696814  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52696813 caaaataagccaatccaaacggg 52696791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 970607 - 970731
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgat--gataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataag 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  970607 tatggcataagcagcttatgaaactatatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataag 970706  T
Q  99 ctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  970707 ctcaaaataagtcaatccaaacggg 970731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 19715244 - 19715367
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  19715244 tatgacataagcagcttatgaaacaatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagct 19715343  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggga 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  19715344 caaaataaaccaatccaaacggga 19715367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33510606 - 33510484
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  33510606 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagct 33510507  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33510506 caaaataagccaatccaaacggg 33510484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 8120991 - 8120870
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  8120991 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagct 8120892  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8120891 caaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 49146294 - 49146173
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  49146294 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagct 49146195  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  49146194 caaaataaaccaatccaaacgg 49146173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 40092613 - 40092494
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  40092613 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagct 40092514  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  40092513 caaaataagtcaatccaaac 40092494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Original strand, 42370886 - 42371005
Alignment:
Q  9 aagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42370886 aagcagcttatgaaactatgataagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataa 42370985  T
Q  109 gccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  42370986 gtcaatccaaacggggccaa 42371005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2347778 - 2347656
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  2347778 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaact 2347679  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  2347678 caaaataaacaaatccaaacggg 2347656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 46761088 - 46760963
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| || ||||| |    
T  46761088 tatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagtt 46760989  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  46760988 caaaataagtcaatccaaacgggacc 46760963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 13996806 - 13996925
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |    
T  13996806 tatggcataagcagcttatgaaaccattataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataattt 13996905  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  13996906 caaaataagccaatccaaac 13996925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 51359300 - 51359426
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  51359300 tatggcataagcaccttatgaaactatgataagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagct 51359398  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51359399 caaaataagccaatccaaacggggccaa 51359426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15203234 - 15203112
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  15203234 tatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagct 15203135  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     |||||||| |||| ||||||||    
T  15203134 taaaataagtcaattcaaacggg 15203112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15717906 - 15717782
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| ||| |||||| ||    
T  15717906 tatggcataagcagcttatgaaactatga-aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaact 15717808  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15717807 caaaataagtcaatccaaacgagacc 15717782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17591810 - 17591691
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17591810 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagct 17591712  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  17591711 c--aataagccaatccaaacggg 17591691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 52086389 - 52086270
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  52086389 tatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccacataagct 52086290  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
     |||||||| ||||||||||    
T  52086289 taaaataagtcaatccaaac 52086270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 17587588 - 17587694
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17587588 tatggcataagcagcttatgaaaatatgataagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagct 17587687  T
Q  101 caaaata 107  Q
    |||||||    
T  17587688 caaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 29695798 - 29695678
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagc-ttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  29695798 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagc 29695699  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaac 120  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  29695698 tcaaaataagccaatccaaac 29695678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 128 - 246
Target Start/End: Original strand, 30798283 - 30798404
Alignment:
Q  128 atatactaaagtttaattacatatatcatccattaacttatttataatttctctttattac---nnnnnnnnncctatgttttggtcccctaagtttatt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||              |||||||||||||||||||||||||    
T  30798283 atatactaaagtttaattacatatatcatccattaacttatttataatttcactttattactttttttttttttttatgttttggtcccctaagtttatt 30798382  T
Q  225 ctcgttaatcaagttacttgtg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30798383 ctcgttaatcaagttacttgtg 30798404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7145329 - 7145204
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| | ||||| |||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  7145329 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttgtttatttac-ccaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagct 7145231  T
Q  101 c-aaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||    
T  7145230 caaaaataagtcaatccaaacgggacc 7145204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 123
Target Start/End: Original strand, 15554259 - 15554349
Alignment:
Q  33 gctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15554259 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggg 15554349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23498576 - 23498463
Alignment:
Q  7 ataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 106  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  23498576 ataagcaacttatgaaactatgatgaactatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaat 23498477  T
Q  107 aagccaatccaaac 120  Q
    |||||||| |||||    
T  23498476 aagccaattcaaac 23498463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 23322923 - 23323032
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23322923 tatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagtttatgggagtagataagcctatataagct 23323022  T
Q  101 caaaataagc 110  Q
    ||||||||||    
T  23323023 caaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40149585 - 40149497
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagc 89  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40149585 tatgacataagcagcttataaaactatgataaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6765581 - 6765459
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||   | |||||||   ||||||| ||    
T  6765581 tatgacataagcagctcatgaaaatatgataaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaact 6765482  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6765481 caaaataagccaatccaaacggg 6765459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38171949 - 38171833
Alignment:
Q  6 cataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||  |||||||  ||||||    
T  38171949 cataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaa 38171850  T
Q  106 taagccaatccaaacgg 122  Q
    |||| |||| |||||||    
T  38171849 taagtcaatgcaaacgg 38171833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5675175 - 5675105
Alignment:
Q  53 caaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5675175 caaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggg 5675105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 121
Target Start/End: Original strand, 5217895 - 5217986
Alignment:
Q  29 ataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||    ||| ||| ||||||||  | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5217895 ataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagcttatgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacg 5217986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 9008140 - 9008262
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9008140 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 9008239  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9008240 caaaataagccaatccaaacggg 9008262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16069478 - 16069353
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16069478 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagct 16069379  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16069378 caaaataagtcaatccaaacgggacc 16069353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 27420983 - 27420861
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27420983 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 27420884  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27420883 caaaataagccaatccaaacggg 27420861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 27679252 - 27679374
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27679252 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 27679351  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27679352 caaaataagccaatccaaacggg 27679374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 24105754 - 24105875
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24105754 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 24105853  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24105854 caaaataagccaatccaaacgg 24105875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1579161 - 1579039
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1579161 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 1579062  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1579061 caaaataagccaatccaaacggg 1579039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 1605654 - 1605776
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1605654 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 1605753  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1605754 caaaataagccaatccaaacggg 1605776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 35782727 - 35782849
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35782727 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 35782826  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  35782827 caaaataaggcaatccaaacggg 35782849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 3386569 - 3386688
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  3386569 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagct 3386668  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3386669 caaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 33491279 - 33491401
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  33491279 tatggcaaaagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagct 33491378  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33491379 caaaataagccaatccaaacggg 33491401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 16737530 - 16737655
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16737530 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagct 16737629  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  16737630 caaaataagccaattcaaacgagacc 16737655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4121062 - 4120940
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4121062 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagct 4120963  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||    
T  4120962 caaaataagccattccaaacggg 4120940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 8374421 - 8374543
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8374421 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagct 8374520  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  8374521 taaaataaggcaatccaaacggg 8374543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19358651 - 19358529
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  19358651 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagct 19358552  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  19358551 caaaataaggcaatccaaacggg 19358529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 38598533 - 38598652
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||| |    
T  38598533 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagtt 38598632  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  38598633 caaagtaagccaatccaaac 38598652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 20992364 - 20992487
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagccc----acata 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    |||||    
T  20992364 tatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatgtacata 20992463  T
Q  97 agctcaaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20992464 agctcaaaataagccaatccaaac 20992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3921706 - 3921581
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  3921706 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaact 3921607  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    
T  3921606 caaaataaatcaatccaaacgggacc 3921581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 1165684 - 1165802
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1165684 tatgacataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagct 1165783  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  1165784 caaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5203097 - 5202975
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||| ||    
T  5203097 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaact 5202998  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  5202997 caaaataagtcaatccaaacggg 5202975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 20992229 - 20992351
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  20992229 tatggcataatcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagct 20992328  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20992329 caaaataagccaattcaaacggg 20992351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 33991265 - 33991143
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||    
T  33991265 tatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaact 33991166  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||| ||||||||    
T  33991165 caaaataagtcaattcaaacggg 33991143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31883269 - 31883148
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||||||||||    
T  31883269 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagct 31883170  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  31883169 caaaataagtcaatccaaacgg 31883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 33284658 - 33284775
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  33284658 tatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 33284757  T
Q  101 caaaataagccaatccaa 118  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  33284758 caaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 31410601 - 31410472
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| |||| |||| ||    
T  31410601 tatggcataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaact 31410502  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaata 130  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  31410501 caaaataaatcaatccaaacgcggccaata 31410472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 26603025 - 26603142
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||          |||    
T  26603025 tatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataa----------gct 26603114  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26603115 caaaataagccaatccaaacggggccaa 26603142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 27025080 - 27025003
Alignment:
Q  2 atggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatggga 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||  |||||||||    
T  27025080 atggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatggga 27025003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 23776530 - 23776652
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23776530 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 23776629  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23776630 caaaataagccaatccaaacggg 23776652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 1756835 - 1756957
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1756835 tatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagct 1756934  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  1756935 caaaataagccaatccaaacggg 1756957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20877169 - 20877044
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20877169 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 20877070  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20877069 caaaataagccaatccaaacgggacc 20877044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 30423635 - 30423760
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  30423635 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaact 30423734  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  30423735 caaaataagccaatccaaacgggacc 30423760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 19165042 - 19165164
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaag-cttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19165042 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagc 19165141  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19165142 tcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 50055172 - 50055294
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50055172 tatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 50055271  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50055272 caaaataagccaatccaaacggg 50055294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 54189667 - 54189545
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  54189667 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagct 54189568  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  54189567 caaaataagccaatccaaacggg 54189545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 54412750 - 54412628
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54412750 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 54412651  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  54412650 caaaataagccaatccaaacggg 54412628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 8932249 - 8932371
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8932249 tatggcataagcagcttatgaaactacgttaagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagct 8932348  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8932349 caaaataagccaatccaaacggg 8932371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14987914 - 14987792
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14987914 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagct 14987815  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14987814 caaaataagccaatccaaacggg 14987792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 19913701 - 19913823
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19913701 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 19913800  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19913801 caaaataagccaatccaaacggg 19913823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 27488719 - 27488841
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27488719 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagct 27488818  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  27488819 caacttaagccaatccaaacggg 27488841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37464843 - 37464721
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37464843 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagct 37464744  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  37464743 caaaataagccaattcaaacggg 37464721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 37968828 - 37968942
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37968828 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagct 37968927  T
Q  101 caaaataagccaatc 115  Q
    |||||||| ||||||    
T  37968928 caaaataaaccaatc 37968942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38055279 - 38055157
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38055279 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 38055180  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  38055179 caaaataagtcaatccaaacggg 38055157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 50353923 - 50353801
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  50353923 tatggcataagcagcttatgaaactatcataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagct 50353824  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50353823 caaaataagccaatccaaacggg 50353801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 52139325 - 52139199
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  52139325 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagtt 52139226  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  52139225 caaaataagccaatccaaacgggacca 52139199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16700903 - 16700782
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16700903 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagct 16700804  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16700803 caaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 35490844 - 35490969
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||    
T  35490844 tatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagct 35490943  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  35490944 caaaataagccaatccaaacgggacc 35490969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 43290031 - 43290152
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || | |||||    
T  43290031 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagct 43290130  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43290131 caaaataagccaatccaaacgg 43290152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 28032783 - 28032902
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28032783 tatggcataagcagcttatgatactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 28032882  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||| ||||| ||||    
T  28032883 caaaataagtcaatctaaac 28032902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 48909968 - 48909849
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  48909968 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagct 48909869  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48909868 caaaataagccaatccaaac 48909849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 53717538 - 53717657
Alignment:
Q  4 ggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  53717538 ggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaa 53717637  T
Q  104 aataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  53717638 aataagccaatccaaacggg 53717657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 2481479 - 2481601
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2481479 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 2481578  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2481579 caaaataagccaatccaaacggg 2481601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 6611431 - 6611553
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6611431 tatgacataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagct 6611530  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  6611531 caaaataaaccaatccaaacggg 6611553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 11639649 - 11639771
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  11639649 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagtt 11639748  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  11639749 caaaataaaccaatccaaacggg 11639771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 40428791 - 40428913
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40428791 tatggtataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagct 40428890  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  40428891 caaaataagccaattcaaacggg 40428913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 44784988 - 44785110
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44784988 tatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 44785087  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  44785088 caaaataagccaatccaaacggg 44785110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 50053565 - 50053443
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  50053565 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataagtccatataagct 50053466  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50053465 caaaataagccaatccaaacggg 50053443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1617198 - 1617084
Alignment:
Q  9 aagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1617198 aagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataa 1617099  T
Q  109 gccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||    
T  1617098 gccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15669305 - 15669183
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  15669305 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagct 15669206  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15669205 caaaataagccaatccaaacggg 15669183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28360551 - 28360433
Alignment:
Q  2 atggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctc 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28360551 atggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctc 28360452  T
Q  102 aaaataagccaatccaaac 120  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  28360451 aaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 45424605 - 45424727
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  45424605 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagct 45424704  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  45424705 caaaataagtcaatccaaacggg 45424727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 30171702 - 30171581
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  30171702 tatggtataagcagcttatgaaactatgataagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagct 30171603  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  30171602 caaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 53875779 - 53875658
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  53875779 tatgacataagcagcttataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagct 53875680  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  53875679 taaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 15241099 - 15241219
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  15241099 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagct 15241198  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15241199 caaaataagccaatccaaacg 15241219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 8591163 - 8591289
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||| | | ||||||| ||||||||| ||    
T  8591163 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaact 8591262  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacca 127  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  8591263 caaaataagccaagtcaaacgggacca 8591289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 27583703 - 27583821
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27583703 tatggcataagcagcttatgcaactatgataagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagct 27583802  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  27583803 caaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31969799 - 31969677
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31969799 gcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaa 31969700  T
Q  105 ataagccaatccaaacgggacca 127  Q
    ||||  |||| ||||||||||||    
T  31969699 ataaatcaattcaaacgggacca 31969677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 38071391 - 38071504
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38071391 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagct 38071490  T
Q  101 caaaataagccaat 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  38071491 caaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 53353181 - 53353055
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccaca----ta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |    ||    
T  53353181 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataatta 53353082  T
Q  97 agctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  53353081 agctcaaaataagccaatccaaacggg 53353055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 123
Target Start/End: Original strand, 6688711 - 6688814
Alignment:
Q  20 gaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6688711 gaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaa 6688810  T
Q  120 cggg 123  Q
    ||||    
T  6688811 cggg 6688814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 23704284 - 23704399
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  23704284 gcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaa 23704383  T
Q  105 ataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||    
T  23704384 ataagccaatccaaac 23704399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 47632157 - 47632034
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacc-tttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||| || |||||||| |||||||| |    
T  47632157 tatggcataagcagcttatgaaactatgagaagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaac 47632058  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  47632057 tcaaaataagccaatccaaacggg 47632034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 44375967 - 44375845
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44375967 tatgacataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagct 44375868  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  44375867 taaaataagccaatccaaacggg 44375845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 40680109 - 40680227
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||||||  |    
T  40680109 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaatt 40680208  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  40680209 caaaataagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 27536175 - 27536293
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||     |||||||  |||||||    
T  27536175 tatggcataagcagtttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatggga----gtaagcccgtataagct 27536270  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  27536271 caaaataagccaatccaaacggg 27536293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 16703943 - 16703843
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  16703943 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataagttcacataagct 16703844  T
Q  101 c 101  Q
    |    
T  16703843 c 16703843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 126
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265953
Alignment:
Q  38 ttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacc 23265953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 44379258 - 44379377
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| | |||||||||| | |||| ||    
T  44379258 tatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaact 44379357  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  44379358 caaaataagtcaatccaaac 44379377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 33703963 - 33703850
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| | ||||||||||    
T  33703963 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagct 33703864  T
Q  101 caaaataagccaat 114  Q
    ||||||||| ||||    
T  33703863 caaaataagtcaat 33703850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 123
Target Start/End: Original strand, 55344921 - 55345018
Alignment:
Q  26 atgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  55344921 atgataagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 55345018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 123
Target Start/End: Original strand, 44548238 - 44548335
Alignment:
Q  27 tgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataa-gccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||| | |||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  44548238 tgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggg 44548335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 123
Target Start/End: Original strand, 9595974 - 9596027
Alignment:
Q  69 agcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9595974 agcttatgagagtagataagcccacataaactc-aaataagccaatccaaacggg 9596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 42
Target Start/End: Original strand, 23269121 - 23269158
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctattttta 42  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23269121 gcataagcagcttatgaaactatgataagctattttta 23269158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 51780789 - 51780830
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctattttta 42  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51780789 tatggcataagcagcttatgaaattatgataagctattttta 51780830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 17493454 - 17493340
Alignment:
Q  2 atggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctc 101  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |  ||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||||| ||| |||||| |  || ||||  ||    
T  17493454 atggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgcttataggagtagatatgttcatataaattc 17493355  T
Q  102 aaaataagccaatcc 116  Q
    |||||||| ||||||    
T  17493354 aaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38856212 - 38856090
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38856212 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagct 38856113  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38856112 caaaataagccaatccaaacggg 38856090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 15520211 - 15520333
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15520211 tatggcataagcagtttatgaaacgatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 15520310  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15520311 caaaataagccaatccaaacggg 15520333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25999507 - 25999385
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25999507 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagct 25999408  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25999407 caaaataagccaatccaaacggg 25999385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 37698212 - 37698334
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37698212 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 37698311  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37698312 caaaataagccaatccaaacggg 37698334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 42307974 - 42308096
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42307974 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 42308073  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  42308074 caaaataagccaatccaaacggg 42308096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 54534396 - 54534517
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54534396 tatggcataagcagcttat-aaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagct 54534494  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  54534495 caaaataagccaatccaaacggg 54534517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32359378 - 32359253
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  32359378 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagct 32359279  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32359278 caaaataagccaatccaaacgggacc 32359253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 25494354 - 25494476
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25494354 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagct 25494453  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  25494454 caaaataagtcaatccaaacggg 25494476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21581161 - 21581037
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21581161 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 21581062  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggac 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21581061 caaaataagtcaatccaaacaggac 21581037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8042726 - 8042604
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  8042726 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagct 8042627  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  8042626 caaaataagcccatccaaacggg 8042604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 22175059 - 22175181
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22175059 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 22175158  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22175159 caaaataagccaatccaaacggg 22175181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 50529048 - 50528926
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  50529048 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 50528949  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  50528948 caaaataagccaatccaaacggg 50528926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 54870243 - 54870365
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||    
T  54870243 tatgacataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaact 54870342  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  54870343 caaaataagccaatccaaacggg 54870365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32244239 - 32244114
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  32244239 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagct 32244140  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  32244139 caaaataagccaatccaaacgggacc 32244114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 50529842 - 50529966
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  50529842 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataaact 50529941  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggac 125  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||    
T  50529942 caaaataagtcaatccaaacaggac 50529966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 26122933 - 26122814
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26122933 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagct 26122834  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26122833 caaaataagccaatccaaac 26122814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 35226566 - 35226447
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35226566 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagct 35226467  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  35226466 caaaataggccaatccaaac 35226447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 12117727 - 12117849
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117727 tatgacataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagct 12117826  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  12117827 caaaataagccaattcaaacggg 12117849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20699268 - 20699146
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20699268 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 20699169  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20699168 caaaataagccaatccaaacggg 20699146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 29445604 - 29445485
Alignment:
Q  4 ggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaa 103  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  29445604 ggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaa 29445505  T
Q  104 aataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29445504 aataagccaatccaaacggg 29445485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15520755 - 15520633
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  15520755 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagct 15520656  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15520655 caaaataagccaatccaaacggg 15520633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 34700460 - 34700338
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||||||||    
T  34700460 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagct 34700361  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| |||||| |||||||    
T  34700360 caaaataaaccaatctaaacggg 34700338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38934064 - 38933943
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  38934064 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagct 38933966  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38933965 caaaataagccaatccaaacggg 38933943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 46452231 - 46452353
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46452231 tatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 46452330  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  46452331 caacttaagccaatccaaacggg 46452353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Original strand, 20842423 - 20842539
Alignment:
Q  7 ataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20842423 ataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaat 20842522  T
Q  107 aagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||    
T  20842523 aagccaatccaaacggg 20842539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 44609402 - 44609521
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  44609402 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagct 44609501  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44609502 caaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35643336 - 35643214
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  35643336 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaaaggcttatggaagtagataagttcacataagct 35643237  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  35643236 caaaataagtcaatccaaacggg 35643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 42105040 - 42105155
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||  |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42105040 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagct 42105139  T
Q  101 caaaataagccaatcc 116  Q
    ||||||||| ||||||    
T  42105140 caaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 2895304 - 2895186
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  2895304 tatggcataagcagcttatgaaactatgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagct 2895205  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  2895204 caaaataagtcaattcaaa 2895186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 24835768 - 24835890
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| | | |||||||    
T  24835768 tatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagct 24835867  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||  |||||||||||||    
T  24835868 caaaataaatcaatccaaacggg 24835890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44688876 - 44688782
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  44688876 gcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagc 44688782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 49128164 - 49128046
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||| | |||    
T  49128164 gcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagcccacataagtttaaa 49128065  T
Q  105 ataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  49128064 ataagtcaatccaaacggg 49128046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 48925072 - 48925189
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| ||    
T  48925072 tatgacataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaact--tttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaact 48925169  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  48925170 ctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 53028336 - 53028225
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||        || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028336 tatgacataagcagtttatgaaaatatgataagctatttttatttatttac--------ctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagct 53028245  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  53028244 caaaataagtcaatccaaac 53028225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 16354464 - 16354398
Alignment:
Q  2 atggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaa 68  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16354464 atggcattagcagcttatgaaactatgataagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 16354398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 12916025 - 12915930
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataa 97  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||   |||| ||| || ||||||||||||||    
T  12916025 tatgacataagcagtttatgaaattatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24366142 - 24366093
Alignment:
Q  70 gcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 119  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24366142 gcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaa 24366093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 30691975 - 30691855
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30691975 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 30691876  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30691875 caaaataagccaatccaaacg 30691855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 6086682 - 6086804
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6086682 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagct 6086781  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6086782 caaaataagccaatccaaacggg 6086804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 2837669 - 2837547
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2837669 tatggcatgagcagctcatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 2837570  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2837569 caaaataagccaatccaaacggg 2837547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26946959 - 26947081
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26946959 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 26947058  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  26947059 caaaataagccaatccaaacggg 26947081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 52960 - 52838
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  52960 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagct 52861  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  52860 caaaataagccaatccaaacggg 52838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 3955853 - 3955971
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3955853 gcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaa 3955952  T
Q  105 ataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3955953 ataagccaatccaaacggg 3955971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 9459687 - 9459565
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  9459687 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaact 9459588  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9459587 caaaataagccaatccaaacggg 9459565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26704422 - 26704544
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  26704422 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagct 26704521  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  26704522 caaaataaaccaatccaaacggg 26704544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 17261160 - 17261281
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17261160 gcataagcagcttatgaaaatattataagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaa 17261259  T
Q  105 ataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17261260 ataagccaatccaaacgggacc 17261281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 3347606 - 3347728
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3347606 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagct 3347705  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3347706 caaaataagccaatccaaacggg 3347728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 11167364 - 11167242
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||    
T  11167364 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagct 11167265  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11167264 caaaataagccaatccaaacggg 11167242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 34887375 - 34887501
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  34887375 tatggcataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagct 34887474  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacca 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34887475 caaaataagtcaatccaaacggaacca 34887501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 35198407 - 35198286
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  35198407 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaagcttatggaagtagataagcccacataagtt 35198309  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  35198308 caaaataagccaattcaaacggg 35198286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1153717 - 1153603
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  1153717 tatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagct 1153618  T
Q  101 caaaataagccaatc 115  Q
     ||||||||||||||    
T  1153617 taaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 21893579 - 21893457
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21893579 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagct 21893480  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||  | |||||||||||    
T  21893479 caaaataaatcgatccaaacggg 21893457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20726911 - 20726793
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20726911 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 20726816  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20726815 caaaataagccaatccaaacggg 20726793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 16307091 - 16307213
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  16307091 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagct 16307190  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  16307191 caaaataagtcaatccaaacggg 16307213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 18613662 - 18613540
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  18613662 tatgacataagcagcttatggaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagct 18613563  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18613562 caaaataagtcaatccaaacggg 18613540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Original strand, 28199591 - 28199723
Alignment:
Q  2 atggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgg-gaata-gataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||||||||||    
T  28199591 atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagc 28199690  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacgggaccaatata 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  28199691 tcaaaataagtcaatccaaacgggacctatata 28199723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 30699012 - 30699132
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||| |||||| ||||||| ||    
T  30699012 tatggcataagcagctaataaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaact 30699111  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  30699112 cataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463700
Alignment:
Q  47 tttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggacc 33463700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 33464453 - 33464403
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttac 51  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33464453 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttac 33464403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 42204278 - 42204155
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaag-cttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  42204278 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagc 42204179  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42204178 tcaaaataagccaatccaaacggg 42204155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7164307 - 7164185
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7164307 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagct 7164208  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  7164207 caaaataagccaatccaaacggg 7164185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 30181097 - 30181219
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30181097 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagct 30181196  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30181197 caaaataagccaatccaaacggg 30181219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6394874 - 6394752
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6394874 tatggcataagcagcttatgaaaccatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagct 6394775  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  6394774 caaaataagccaatctaaacggg 6394752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 12101251 - 12101369
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12101251 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagct 12101350  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12101351 caaaataagccaatccaaa 12101369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 20346611 - 20346489
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20346611 tatggcataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 20346512  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20346511 caaaataagccaatccaaacggg 20346489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 33359163 - 33359285
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33359163 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagct 33359262  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33359263 caaaataagccaatccaaacggg 33359285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 33846597 - 33846719
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33846597 tatgacataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 33846696  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  33846697 caaaataagccaatccaaacggg 33846719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 42965069 - 42965187
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42965069 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagct 42965168  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  42965169 caaaataagccaatccaaa 42965187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3511446 - 3511321
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3511446 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagct 3511347  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  3511346 caaaataagacaatccaaacgggacc 3511321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 4477394 - 4477515
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4477394 tatggcataagcagcttatgaaaccatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagct 4477493  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4477494 caaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5280983 - 5280858
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5280983 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagct 5280884  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  5280883 caaaataagccaatccaaacgggacc 5280858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 43156831 - 43156718
Alignment:
Q  6 cataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaa 105  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156831 cataaacagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaa 43156732  T
Q  106 taagccaatccaaa 119  Q
    ||||||||||||||    
T  43156731 taagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4347396 - 4347274
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4347396 tatggcataagcagcttatgaaactatggtaagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagct 4347297  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     |||||||| |||||||||||||    
T  4347296 taaaataagtcaatccaaacggg 4347274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 22649767 - 22649889
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22649767 tatggcataagcagcttatgaaattatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 22649866  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  22649867 caaaataagccaattcaaacggg 22649889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 24792405 - 24792527
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24792405 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagct 24792504  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||  ||||||||||||||||||    
T  24792505 caacttaagccaatccaaacggg 24792527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 1803143 - 1803029
Alignment:
Q  7 ataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaat 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1803143 ataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaat 1803044  T
Q  107 aagccaatccaaacg 121  Q
    ||| |||||||||||    
T  1803043 aagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 36890903 - 36891024
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36890903 tatggcataagcaacttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagct 36891002  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  36891003 c-aaataagtcaatccaaacggg 36891024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 43068046 - 43068168
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43068046 tatgacataagaagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagct 43068145  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  43068146 caaaataagtcaatccaaacggg 43068168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9452713 - 9452588
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9452713 tatggcatagacagcttatgaaactatgataaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagct 9452614  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9452613 caaaataagtcaatccaaacgggacc 9452588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15656035 - 15655913
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15656035 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagct 15655936  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15655935 caaaataagccaatccaaacggg 15655913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 32041665 - 32041543
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  32041665 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagca 32041566  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  32041565 caaaataagccaatccaaacggg 32041543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 933408 - 933289
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  933408 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagct 933309  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  933308 caaaataagccaattcaaac 933289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19828393 - 19828271
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  19828393 tatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccaacataaact 19828294  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  19828293 caaaataagccaattcaaacggg 19828271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 38866667 - 38866547
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38866667 tatggcataaacagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagct 38866568  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  38866567 caaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25748610 - 25748483
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |  | |||||||    
T  25748610 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagct 25748511  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  25748510 caacttaagccaatccaaacggggccaa 25748483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8630789 - 8630667
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||    
T  8630789 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacct 8630690  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||    
T  8630689 caaaataaacaaatccaaacggg 8630667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42673584 - 42673467
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  42673584 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgttttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagct 42673489  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    | ||||||| ||||||||||||    
T  42673488 ccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 46891412 - 46891536
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaa-gcttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  46891412 tatgacataagcagcttataaaactatgacaaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagc 46891511  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacggga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  46891512 tcaaaataagccaatccaaacggga 46891536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 12097663 - 12097781
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||    
T  12097663 tatgacataagtagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagct 12097762  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    |||  ||||||||||||||    
T  12097763 caacttaagccaatccaaa 12097781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 17753723 - 17753601
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||||    |||||||    
T  17753723 tatggcataagcagcttatgaaactatgttaagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagct 17753624  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  17753623 caaaataagctaatccaaacggg 17753601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704981
Alignment:
Q  29 ataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggg 37704981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Original strand, 37005888 - 37006005
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| | |||||||||| |||    
T  37005888 gcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaacttatagaagtagataaactcacataagcttaaa 37005987  T
Q  105 ataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37005988 ataagccaatccaaacgg 37006005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 16894580 - 16894668
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16894580 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 16894668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 43021649 - 43021767
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||| | | |||||||| |||||||| ||    
T  43021649 tatgccataagcagcttatgaaactataataagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaact 43021748  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
     ||||||||||||||||||    
T  43021749 taaaataagccaatccaaa 43021767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 46134377 - 46134499
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||   |||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  46134377 tatggcgtaaacagcttatgaaactataataaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagct 46134476  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  46134477 caaaataagtcaatccaaacggg 46134499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 48865756 - 48865665
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaa---gcttatgggaatagataagc 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||    
T  48865756 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 43405129 - 43405021
Alignment:
Q  15 cttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaat 114  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  43405129 cttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaat 43405030  T
Q  115 ccaaacggg 123  Q
     ||||||||    
T  43405029 tcaaacggg 43405021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 119
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  35 tatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 119  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 36849610 - 36849732
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||   |||||||||  ||||| | |||||  ||||||||||||||||| | ||||  | |||| || ||||||||||||    
T  36849610 tatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttagtagacaaacccacataagct 36849709  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
       |||||| |||||||||||||    
T  36849710 tcgaataagtcaatccaaacggg 36849732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 123
Target Start/End: Original strand, 16894663 - 16894692
Alignment:
Q  94 ataagctcaaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894663 ataagctcaaaataagccaatccaaacggg 16894692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 36827 - 36705
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36827 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagct 36728  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36727 caaaataagccaatccaaacggg 36705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 30420250 - 30420372
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30420250 tatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 30420349  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30420350 caaaataagccaatccaaacggg 30420372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 31517298 - 31517420
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31517298 tatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagct 31517397  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31517398 caaaataagccaatccaaacggg 31517420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 3873327 - 3873447
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3873327 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagct 3873426  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacg 121  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3873427 caaaataagccaatccaaacg 3873447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 28329920 - 28330044
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28329920 tatggcataagcagtttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagct 28330019  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggac 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  28330020 caaaataagtcaatccaaacgggac 28330044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 33906130 - 33906249
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  33906130 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagtt 33906229  T
Q  101 caaaataagccaatccaaac 120  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  33906230 caaaataagtcaatccaaac 33906249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42937841 - 42937720
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  42937841 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagct 42937742  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  42937741 caaaataagccaatccaaacgg 42937720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 1108401 - 1108280
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1108401 tatggcataagcaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagct 1108302  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  1108301 caaaataagcc-atccaaacggg 1108280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 4232225 - 4232347
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  4232225 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagca 4232324  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4232325 caaaataagccaatccaaacggg 4232347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 123
Target Start/End: Original strand, 18806971 - 18807089
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| || |||||||||||    
T  18806971 gcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaa 18807070  T
Q  105 ataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18807071 ataagccaatccaaacggg 18807089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 39635574 - 39635452
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  39635574 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagct 39635475  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  39635474 caaaataagctaatccaaacggg 39635452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 1482986 - 1483106
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1482986 tatggcataagcagcttatgaaacaataataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagct 1483084  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  1483085 caaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4016161 - 4016039
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  4016161 tatggcataagcagcttatgaaactatgatacgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagct 4016062  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4016061 caaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 6174911 - 6175033
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  6174911 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagct 6175010  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  6175011 caaaataagccaatccaaacggg 6175033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 19901221 - 19901342
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  19901221 tatggcataagcagtttatgaaactatgataagctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagct 19901319  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  19901320 caaaataagccaatccaaacggg 19901342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 26323269 - 26323391
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26323269 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagct 26323368  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  26323369 caaaataaaccaatccaaacggg 26323391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 2178852 - 2178974
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  2178852 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaact 2178951  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     |||||||  |||||||||||||    
T  2178952 taaaataaatcaatccaaacggg 2178974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 16066377 - 16066504
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaag-cttatgggaatagataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  16066377 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaaca-ctttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagc 16066475  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacgggaccaa 128  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  16066476 tcaaaataagccaattcaaatggaaccaa 16066504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5733521 - 5733407
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5733521 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagct 5733422  T
Q  101 caaaataagccaatc 115  Q
    |||||||| ||||||    
T  5733421 caaaataaaccaatc 5733407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 16588859 - 16588980
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |     
T  16588859 tatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaaca 16588958  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16588959 caaaataagccaatccaaacgg 16588980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 851119 - 850995
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  851119 tatggcataagcagcttataaaattatgataagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagct 851020  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggac 125  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
T  851019 taaaataagcaaatccaaacgggac 850995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 44947625 - 44947743
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||| |    
T  44947625 tatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagat 44947724  T
Q  101 caaaataagccaatccaaa 119  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  44947725 caaaataagccaatacaaa 44947743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 30270762 - 30270884
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||    
T  30270762 tatgacataagcagcttatgaaactatgataaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagct 30270861  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  30270862 taaaataagccaatccaaacggg 30270884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 19384018 - 19384126
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| || |||| ||    
T  19384018 tatggcataaacaacttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaact 19384117  T
Q  101 caaaataag 109  Q
    |||||||||    
T  19384118 caaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 429934 - 429817
Alignment:
Q  5 gcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagctcaaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||  |||||    
T  429934 gcataagcaacttatgaaattatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaa 429835  T
Q  105 ataagccaatccaaacgg 122  Q
    |||||  ||| |||||||    
T  429834 ataagggaattcaaacgg 429817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 42446652 - 42446774
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||| | ||||||  ||||||||||||||| |||||||  | ||||||||  | ||||| ||    
T  42446652 tatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagttcgcataaact 42446751  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  42446752 ccgaataagccaatccaaacggg 42446774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 23034 - 23156
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  23034 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagct 23133  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23134 caaaataagccaatccaaacggg 23156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 145328 - 145453
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  145328 tatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaact 145427  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacgggacc 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  145428 caaaataagtcaatccaaacgggacc 145453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3832 - 3710
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  3832 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagtt 3733  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  3732 caaaataaaccaatccaaacggg 3710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 89 - 211
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  89 tatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaact 188  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||  ||||||||| ||||||||    
T  189 caacttaagccaatacaaacggg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 378 - 500
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||| ||    
T  378 tatgacataagcagcttatgaaactatgataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaact 477  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  478 caaaataagccaatccaaacggg 500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 132
Target Start/End: Original strand, 89 - 221
Alignment:
Q  2 atggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgg-gaata-gataagcccacataagc 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||||||||||    
T  89 atggcataagcagcatatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggagtagatgataagtccacataagc 188  T
Q  100 tcaaaataagccaatccaaacgggaccaatata 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  189 tcaaaataagtcaatccaaacgggacctatata 221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 10360 - 10238
Alignment:
Q  1 tatggcataagcagcttatgaaacgatgataagctatttttacttatttactcaaacacctttaaaaaagcttatgggaatagataagcccacataagct 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  10360 tatggtataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagct 10261  T
Q  101 caaaataagccaatccaaacggg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  10260 caaaataagtcaatccaaacggg 10238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University