View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12076_high_3 (Length: 349)

Name: NF12076_high_3
Description: NF12076
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12076_high_3
NF12076_high_3
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (7-349)||(25191358-25191700)
chr3 (16-311)||(22063-22357)
chr3 (16-308)||(35033136-35033428)
chr3 (16-311)||(5168822-5169117)
chr3 (16-308)||(47233596-47233888)
chr3 (16-310)||(52138790-52139084)
chr3 (16-310)||(28245427-28245721)
chr3 (37-311)||(53519603-53519865)
chr3 (16-311)||(54279010-54279304)
chr3 (27-311)||(51447714-51447991)
chr3 (59-311)||(48508268-48508520)
chr3 (29-308)||(38850123-38850403)
chr3 (25-311)||(43694768-43695048)
chr3 (143-311)||(12096702-12096870)
chr3 (26-309)||(54128378-54128662)
chr3 (180-311)||(53262295-53262426)
chr3 (16-209)||(33272122-33272318)
chr3 (16-308)||(45289091-45289385)
chr3 (16-174)||(38060421-38060579)
chr3 (33-273)||(48953454-48953697)
chr3 (164-311)||(52156081-52156228)
chr3 (26-310)||(19676079-19676362)
chr3 (36-308)||(54424959-54425244)
chr3 (195-311)||(311306-311422)
chr3 (180-308)||(49042090-49042219)
chr3 (16-200)||(45728137-45728324)
chr3 (170-308)||(38060858-38060996)
chr3 (28-231)||(3186771-3186973)
chr3 (42-273)||(39235154-39235384)
chr3 (204-311)||(47555329-47555436)
chr3 (201-311)||(2133609-2133719)
chr3 (30-311)||(42510013-42510292)
chr3 (181-311)||(49503565-49503695)
chr3 (26-309)||(50960636-50960915)
chr3 (187-308)||(48712075-48712196)
chr3 (180-308)||(15296061-15296189)
chr3 (209-308)||(40106620-40106719)
chr3 (16-308)||(54364976-54365268)
chr3 (226-308)||(31566161-31566243)
chr3 (16-306)||(39600683-39600973)
chr3 (226-311)||(40273202-40273287)
chr3 (26-308)||(48734147-48734417)
chr3 (219-311)||(7895877-7895969)
chr3 (28-244)||(38430850-38431066)
chr3 (28-307)||(26490317-26490596)
chr3 (227-309)||(31454224-31454306)
chr3 (24-298)||(19757898-19758158)
chr3 (194-311)||(29601060-29601177)
chr3 (224-309)||(45486848-45486933)
chr3 (220-311)||(48532151-48532243)
chr3 (220-311)||(52927845-52927936)
chr3 (223-305)||(32170602-32170684)
chr3 (209-311)||(39208791-39208893)
chr3 (185-308)||(54422837-54422966)
chr3 (26-95)||(27917570-27917639)
chr3 (28-96)||(49503766-49503834)
chr3 (194-308)||(36304134-36304248)
chr3 (24-298)||(19736995-19737255)
chr3 (218-311)||(45374474-45374567)
chr3 (15-134)||(21200539-21200656)
chr3 (243-311)||(45834597-45834665)
chr3 (16-95)||(3987037-3987116)
chr3 (237-308)||(7278675-7278746)
chr3 (209-308)||(14415260-14415358)
chr3 (224-311)||(20208196-20208283)
chr3 (29-306)||(30294125-30294403)
chr3 (213-308)||(30797822-30797917)
chr3 (219-310)||(33271908-33271999)
chr3 (16-103)||(36820166-36820253)
chr3 (30-229)||(52678929-52679124)
chr3 (110-231)||(19162664-19162785)
chr3 (240-305)||(41529975-41530040)
chr3 (196-269)||(41842562-41842635)
chr3 (180-305)||(49841770-49841895)
chr3 (231-311)||(27893294-27893374)
chr3 (51-95)||(38181042-38181086)
chr3 (233-308)||(24778609-24778684)
chr3 (209-308)||(40991614-40991713)
chr3 (230-309)||(46148232-46148311)
chr3 (253-307)||(21862742-21862796)
chr3 (219-297)||(24541343-24541421)
chr3 (210-308)||(31337560-31337658)
chr3 (196-298)||(40116348-40116450)
chr3 (27-133)||(41842686-41842792)
chr3 (195-308)||(11284157-11284270)
chr3 (180-273)||(17022707-17022800)
chr3 (260-309)||(39512777-39512826)
chr3 (255-311)||(344769-344825)
chr3 (227-311)||(3987535-3987619)
chr3 (255-311)||(31146928-31146984)
chr3 (225-285)||(37351606-37351666)
chr3 (194-250)||(37779045-37779101)
chr3 (26-94)||(44134044-44134112)
chr3 (235-306)||(659734-659805)
chr3 (235-310)||(31260965-31261039)
chr3 (209-308)||(42026536-42026635)
chr3 (256-311)||(50249607-50249662)
chr3 (26-95)||(31453151-31453221)
chr3 (255-309)||(37083291-37083345)
chr3 (235-305)||(46367390-46367460)
chr3 (232-310)||(50631879-50631957)
chr3 (30-67)||(31454467-31454504)
chr3 (255-308)||(52882662-52882715)
chr3 (16-68)||(344951-345003)
chr3 (27-95)||(11581445-11581513)
chr3 (235-311)||(30332557-30332633)
chr3 (227-311)||(31452958-31453042)
chr3 (180-244)||(40116532-40116596)
chr3 (229-309)||(40672366-40672446)
chr3 (198-242)||(44571599-44571643)
[»] chr7 (132 HSPs)
chr7 (7-311)||(43281655-43281959)
chr7 (16-311)||(29650374-29650669)
chr7 (16-311)||(12841272-12841567)
chr7 (16-311)||(45836479-45836772)
chr7 (16-311)||(11593950-11594245)
chr7 (16-310)||(37617934-37618229)
chr7 (16-308)||(34869410-34869702)
chr7 (16-311)||(39906369-39906662)
chr7 (17-311)||(2885719-2886013)
chr7 (16-306)||(46355858-46356148)
chr7 (16-310)||(49029266-49029559)
chr7 (16-301)||(35906208-35906493)
chr7 (27-311)||(31682599-31682883)
chr7 (16-311)||(44855171-44855464)
chr7 (16-311)||(33349803-33350098)
chr7 (16-311)||(6374858-6375153)
chr7 (16-311)||(38606994-38607277)
chr7 (38-311)||(36652004-36652277)
chr7 (16-307)||(35558994-35559286)
chr7 (29-311)||(22349623-22349905)
chr7 (17-311)||(43491299-43491593)
chr7 (16-249)||(13859067-13859300)
chr7 (65-311)||(32631615-32631849)
chr7 (16-231)||(31005213-31005428)
chr7 (25-311)||(36869234-36869527)
chr7 (84-311)||(24598185-24598411)
chr7 (36-311)||(15682184-15682459)
chr7 (7-174)||(33072933-33073100)
chr7 (143-308)||(40979928-40980093)
chr7 (143-311)||(38900074-38900241)
chr7 (80-309)||(7273154-7273383)
chr7 (183-309)||(27648937-27649063)
chr7 (99-306)||(31681022-31681226)
chr7 (169-308)||(48919255-48919394)
chr7 (171-309)||(21078062-21078200)
chr7 (17-249)||(23404409-23404640)
chr7 (16-308)||(36136754-36137046)
chr7 (148-311)||(9210701-9210864)
chr7 (213-311)||(28208325-28208423)
chr7 (16-130)||(46014359-46014472)
chr7 (198-307)||(34035155-34035264)
chr7 (29-305)||(28627936-28628212)
chr7 (202-309)||(33073105-33073212)
chr7 (194-311)||(36101774-36101891)
chr7 (17-133)||(7273030-7273146)
chr7 (149-305)||(45601599-45601755)
chr7 (194-311)||(27893560-27893677)
chr7 (209-308)||(33732017-33732114)
chr7 (180-316)||(44951309-44951445)
chr7 (180-307)||(14057632-14057759)
chr7 (180-307)||(14367660-14367787)
chr7 (235-306)||(24777170-24777241)
chr7 (230-309)||(31869101-31869180)
chr7 (198-311)||(42969870-42969983)
chr7 (180-311)||(42187595-42187726)
chr7 (201-309)||(47652722-47652830)
chr7 (146-309)||(1011167-1011329)
chr7 (29-311)||(12966025-12966301)
chr7 (148-265)||(35922376-35922492)
chr7 (6-91)||(36514424-36514509)
chr7 (16-68)||(32630584-32630636)
chr7 (189-308)||(8519046-8519165)
chr7 (220-307)||(24177628-24177714)
chr7 (27-311)||(26741891-26742177)
chr7 (188-308)||(40415169-40415295)
chr7 (253-311)||(31005432-31005490)
chr7 (17-103)||(40169640-40169726)
chr7 (170-307)||(34745891-34746028)
chr7 (16-265)||(47848664-47848912)
chr7 (183-310)||(28355322-28355450)
chr7 (255-311)||(29318792-29318848)
chr7 (189-268)||(8492276-8492355)
chr7 (180-271)||(36239833-36239924)
chr7 (180-311)||(38135210-38135341)
chr7 (244-311)||(40630652-40630719)
chr7 (16-95)||(43282398-43282477)
chr7 (235-309)||(7220965-7221039)
chr7 (224-310)||(25891086-25891172)
chr7 (16-94)||(27021906-27021984)
chr7 (194-308)||(37976403-37976517)
chr7 (16-133)||(19262609-19262725)
chr7 (223-308)||(20158671-20158756)
chr7 (194-311)||(33103094-33103211)
chr7 (204-305)||(47852265-47852366)
chr7 (246-306)||(6263479-6263539)
chr7 (16-92)||(7189442-7189518)
chr7 (227-311)||(14593953-14594037)
chr7 (227-311)||(16013476-16013560)
chr7 (255-311)||(28708610-28708666)
chr7 (255-311)||(29312218-29312274)
chr7 (238-310)||(31840442-31840514)
chr7 (146-249)||(1531420-1531523)
chr7 (33-96)||(14593772-14593835)
chr7 (194-308)||(28541943-28542058)
chr7 (213-308)||(30814125-30814220)
chr7 (197-268)||(31859046-31859117)
chr7 (227-309)||(19119423-19119505)
chr7 (253-311)||(30144982-30145040)
chr7 (255-312)||(5418303-5418360)
chr7 (226-311)||(33281087-33281171)
chr7 (26-103)||(42187470-42187547)
chr7 (16-69)||(45558352-45558405)
chr7 (227-308)||(45558531-45558611)
chr7 (16-133)||(48736074-48736191)
chr7 (239-311)||(1523856-1523928)
chr7 (255-311)||(20525049-20525105)
chr7 (180-271)||(44401164-44401253)
chr7 (33-96)||(16013295-16013358)
chr7 (78-137)||(33139206-33139265)
chr7 (209-308)||(34341395-34341494)
chr7 (212-283)||(34926547-34926618)
chr7 (16-94)||(5335910-5335988)
chr7 (263-309)||(21244282-21244328)
chr7 (180-262)||(21517426-21517508)
chr7 (16-133)||(25579252-25579370)
chr7 (223-273)||(26332908-26332958)
chr7 (237-315)||(28021146-28021224)
chr7 (225-311)||(48515370-48515456)
chr7 (230-311)||(4604751-4604832)
chr7 (27-96)||(30200175-30200244)
chr7 (234-307)||(34029677-34029750)
chr7 (26-91)||(38920794-38920859)
chr7 (235-308)||(40138948-40139021)
chr7 (208-305)||(40149016-40149112)
chr7 (253-310)||(41483714-41483771)
chr7 (27-95)||(18605359-18605427)
chr7 (27-95)||(18637563-18637631)
chr7 (27-95)||(18650997-18651065)
chr7 (28-96)||(36101977-36102045)
chr7 (227-308)||(38921086-38921169)
chr7 (255-311)||(47700053-47700108)
chr7 (239-311)||(48735898-48735970)
[»] chr1 (137 HSPs)
chr1 (16-311)||(4001452-4001747)
chr1 (16-310)||(696259-696554)
chr1 (16-311)||(1210735-1211030)
chr1 (16-311)||(30202127-30202422)
chr1 (16-310)||(34792347-34792641)
chr1 (16-311)||(22090086-22090381)
chr1 (16-308)||(49347393-49347685)
chr1 (7-311)||(8671899-8672203)
chr1 (16-311)||(38807668-38807963)
chr1 (16-311)||(15085924-15086207)
chr1 (16-310)||(9592724-9593018)
chr1 (7-311)||(51602037-51602341)
chr1 (16-311)||(4029112-4029407)
chr1 (44-311)||(25979228-25979495)
chr1 (16-311)||(32082753-32083037)
chr1 (16-284)||(8391762-8392030)
chr1 (16-309)||(51440764-51441057)
chr1 (108-311)||(37311752-37311955)
chr1 (16-307)||(43240380-43240671)
chr1 (16-265)||(32230997-32231246)
chr1 (141-308)||(52921195-52921362)
chr1 (89-311)||(39318193-39318413)
chr1 (146-310)||(4415469-4415633)
chr1 (27-310)||(32404525-32404807)
chr1 (15-305)||(39140509-39140794)
chr1 (56-307)||(52561590-52561841)
chr1 (190-308)||(46423216-46423331)
chr1 (180-309)||(32079176-32079303)
chr1 (7-306)||(37462878-37463174)
chr1 (190-311)||(4707218-4707338)
chr1 (16-273)||(9509308-9509565)
chr1 (16-308)||(2544589-2544875)
chr1 (188-311)||(10200303-10200426)
chr1 (180-311)||(41560383-41560514)
chr1 (198-311)||(24020264-24020377)
chr1 (194-310)||(43375596-43375712)
chr1 (26-311)||(48431396-48431688)
chr1 (219-310)||(44941774-44941865)
chr1 (240-310)||(3777258-3777328)
chr1 (218-308)||(21769711-21769801)
chr1 (180-269)||(16142019-16142108)
chr1 (218-311)||(28090691-28090784)
chr1 (219-308)||(42337749-42337838)
chr1 (183-311)||(19936617-19936745)
chr1 (219-311)||(44751677-44751769)
chr1 (28-311)||(27847797-27848085)
chr1 (235-310)||(29577461-29577536)
chr1 (180-310)||(52532614-52532744)
chr1 (193-310)||(6025772-6025889)
chr1 (235-308)||(28533676-28533749)
chr1 (207-308)||(40568410-40568511)
chr1 (16-308)||(18469082-18469374)
chr1 (180-307)||(29128937-29129065)
chr1 (223-309)||(8796406-8796492)
chr1 (16-270)||(9599432-9599686)
chr1 (209-311)||(34444539-34444641)
chr1 (230-311)||(51584948-51585029)
chr1 (16-308)||(36339804-36340095)
chr1 (180-311)||(3818853-3818984)
chr1 (223-310)||(50846759-50846846)
chr1 (209-311)||(6084158-6084260)
chr1 (222-307)||(22175341-22175426)
chr1 (223-308)||(25715326-25715411)
chr1 (210-311)||(31274398-31274499)
chr1 (180-309)||(36623884-36624012)
chr1 (225-310)||(38869081-38869166)
chr1 (16-96)||(1661420-1661500)
chr1 (235-311)||(5113952-5114028)
chr1 (195-305)||(15438800-15438906)
chr1 (236-308)||(38877343-38877415)
chr1 (255-311)||(43481795-43481851)
chr1 (223-311)||(50636278-50636366)
chr1 (256-311)||(37430417-37430472)
chr1 (181-260)||(44905404-44905483)
chr1 (220-306)||(1290033-1290119)
chr1 (253-311)||(4318842-4318900)
chr1 (83-269)||(27520246-27520428)
chr1 (253-311)||(41165509-41165567)
chr1 (194-311)||(5338881-5338998)
chr1 (180-249)||(7762496-7762565)
chr1 (194-271)||(48865744-48865821)
chr1 (223-308)||(50257767-50257852)
chr1 (235-311)||(1704836-1704912)
chr1 (235-311)||(10569068-10569144)
chr1 (199-303)||(19908040-19908144)
chr1 (223-291)||(29808053-29808121)
chr1 (29-133)||(35828725-35828829)
chr1 (151-311)||(52832170-52832330)
chr1 (256-311)||(2914120-2914175)
chr1 (188-311)||(11941577-11941700)
chr1 (16-103)||(40416361-40416448)
chr1 (16-95)||(43423709-43423788)
chr1 (146-244)||(8628150-8628248)
chr1 (226-312)||(16272818-16272903)
chr1 (261-311)||(38758017-38758067)
chr1 (224-310)||(45510831-45510917)
chr1 (26-95)||(18793201-18793270)
chr1 (223-304)||(27072491-27072572)
chr1 (239-308)||(33560858-33560927)
chr1 (255-307)||(4590533-4590585)
chr1 (255-311)||(7133299-7133355)
chr1 (211-311)||(12930308-12930408)
chr1 (16-96)||(13827929-13828009)
chr1 (230-306)||(15437130-15437206)
chr1 (255-311)||(26299297-26299353)
chr1 (235-311)||(32111986-32112062)
chr1 (256-308)||(43898439-43898491)
chr1 (221-297)||(48801625-48801700)
chr1 (227-310)||(14224286-14224368)
chr1 (28-95)||(27637846-27637913)
chr1 (225-296)||(30445304-30445375)
chr1 (209-308)||(35828562-35828661)
chr1 (223-314)||(52633166-52633257)
chr1 (256-311)||(52814291-52814346)
chr1 (180-273)||(8676897-8676993)
chr1 (235-305)||(16943364-16943434)
chr1 (227-285)||(28528556-28528614)
chr1 (194-304)||(29577147-29577256)
chr1 (26-92)||(37263331-37263397)
chr1 (26-95)||(52073675-52073745)
chr1 (27-96)||(10272260-10272329)
chr1 (180-265)||(11331247-11331332)
chr1 (180-265)||(11489268-11489353)
chr1 (278-311)||(22930645-22930678)
chr1 (226-291)||(26113456-26113521)
chr1 (255-312)||(42539208-42539265)
chr1 (254-307)||(44008806-44008859)
chr1 (223-308)||(50806864-50806949)
chr1 (26-94)||(4380013-4380081)
chr1 (29-133)||(5338727-5338831)
chr1 (257-309)||(8194721-8194773)
chr1 (260-308)||(12231592-12231640)
chr1 (24-132)||(13827746-13827854)
chr1 (16-92)||(51812515-51812591)
chr1 (194-242)||(51812677-51812725)
chr1 (255-307)||(52292268-52292320)
chr1 (196-268)||(52900682-52900754)
[»] chr2 (114 HSPs)
chr2 (16-311)||(38429874-38430168)
chr2 (7-311)||(12734680-12734985)
chr2 (16-311)||(25834671-25834963)
chr2 (16-311)||(3866062-3866357)
chr2 (27-311)||(41197224-41197509)
chr2 (25-311)||(45367622-45367908)
chr2 (7-308)||(11992108-11992409)
chr2 (16-312)||(2610578-2610874)
chr2 (26-308)||(41763043-41763324)
chr2 (16-308)||(38452686-38452977)
chr2 (7-307)||(3243654-3243954)
chr2 (16-315)||(36183441-36183740)
chr2 (16-306)||(8180770-8181060)
chr2 (16-311)||(4807586-4807880)
chr2 (47-311)||(451645-451909)
chr2 (16-308)||(18424378-18424669)
chr2 (80-311)||(7326157-7326388)
chr2 (83-311)||(39029638-39029872)
chr2 (97-309)||(28508749-28508961)
chr2 (33-309)||(24583630-24583907)
chr2 (42-282)||(23997630-23997858)
chr2 (143-311)||(35643065-35643233)
chr2 (140-308)||(31959635-31959803)
chr2 (184-311)||(30306190-30306317)
chr2 (206-311)||(3635320-3635425)
chr2 (197-311)||(227360-227474)
chr2 (146-307)||(45543074-45543234)
chr2 (47-311)||(6237750-6238014)
chr2 (26-311)||(12141544-12141829)
chr2 (194-311)||(9496034-9496151)
chr2 (180-308)||(9996623-9996754)
chr2 (24-102)||(16097192-16097270)
chr2 (187-311)||(38328367-38328489)
chr2 (16-308)||(38434941-38435234)
chr2 (180-311)||(12882042-12882173)
chr2 (16-311)||(43751944-43752239)
chr2 (230-311)||(15025698-15025779)
chr2 (150-311)||(43573127-43573287)
chr2 (194-305)||(19336896-19337007)
chr2 (183-309)||(30743686-30743812)
chr2 (26-307)||(18958907-18959192)
chr2 (24-96)||(43238305-43238377)
chr2 (220-311)||(9531597-9531688)
chr2 (24-311)||(44437718-44438005)
chr2 (224-310)||(12520060-12520146)
chr2 (235-308)||(12474927-12475000)
chr2 (238-311)||(17670680-17670753)
chr2 (224-309)||(19863432-19863517)
chr2 (224-309)||(19867764-19867849)
chr2 (224-309)||(19872665-19872750)
chr2 (154-311)||(33287549-33287706)
chr2 (181-311)||(35755242-35755376)
chr2 (154-306)||(13149460-13149612)
chr2 (211-307)||(39709202-39709298)
chr2 (180-292)||(41545559-41545671)
chr2 (180-311)||(8197538-8197669)
chr2 (180-311)||(8202298-8202429)
chr2 (237-311)||(43832309-43832383)
chr2 (170-311)||(12489799-12489940)
chr2 (235-308)||(17429259-17429332)
chr2 (238-311)||(17626284-17626357)
chr2 (194-305)||(45077895-45078008)
chr2 (187-311)||(6219126-6219250)
chr2 (183-308)||(11412865-11412992)
chr2 (227-273)||(19334187-19334233)
chr2 (26-311)||(9556366-9556650)
chr2 (230-311)||(15015149-15015230)
chr2 (223-304)||(33504421-33504502)
chr2 (225-306)||(34931631-34931712)
chr2 (223-311)||(3481351-3481439)
chr2 (221-309)||(13443907-13443995)
chr2 (194-270)||(36650610-36650686)
chr2 (231-311)||(42543440-42543520)
chr2 (16-63)||(227312-227359)
chr2 (16-95)||(4598775-4598854)
chr2 (228-311)||(42549834-42549917)
chr2 (237-311)||(25384680-25384754)
chr2 (246-308)||(36993755-36993816)
chr2 (230-307)||(624687-624764)
chr2 (232-301)||(4598569-4598638)
chr2 (227-308)||(5758995-5759076)
chr2 (262-311)||(8560803-8560852)
chr2 (255-308)||(10516749-10516802)
chr2 (255-308)||(16521007-16521060)
chr2 (210-315)||(17581643-17581748)
chr2 (227-311)||(12470894-12470978)
chr2 (255-311)||(15775842-15775898)
chr2 (27-95)||(23714474-23714542)
chr2 (27-95)||(24102146-24102214)
chr2 (225-309)||(28960210-28960294)
chr2 (193-309)||(32402667-32402783)
chr2 (235-311)||(33393319-33393394)
chr2 (152-313)||(37470124-37470289)
chr2 (210-305)||(186135-186230)
chr2 (16-133)||(3481134-3481248)
chr2 (256-311)||(14444899-14444954)
chr2 (234-307)||(887065-887139)
chr2 (194-232)||(4682253-4682291)
chr2 (236-310)||(14197205-14197279)
chr2 (227-308)||(33594272-33594354)
chr2 (194-248)||(36616856-36616910)
chr2 (18-96)||(38860165-38860243)
chr2 (16-69)||(11412711-11412764)
chr2 (278-311)||(14530532-14530565)
chr2 (235-284)||(19224990-19225039)
chr2 (255-308)||(32706472-32706525)
chr2 (255-304)||(45482989-45483038)
chr2 (242-306)||(522445-522509)
chr2 (29-69)||(786833-786873)
chr2 (213-285)||(3720438-3720510)
chr2 (26-90)||(6218967-6219031)
chr2 (241-285)||(9078792-9078836)
chr2 (16-96)||(9578915-9578995)
chr2 (39-95)||(41858744-41858800)
[»] chr4 (155 HSPs)
chr4 (7-308)||(27450180-27450480)
chr4 (16-311)||(436219-436514)
chr4 (16-311)||(52569512-52569807)
chr4 (16-308)||(31959814-31960106)
chr4 (16-311)||(48174090-48174385)
chr4 (7-308)||(48622543-48622844)
chr4 (16-310)||(33190846-33191140)
chr4 (45-309)||(32479057-32479321)
chr4 (16-309)||(56375280-56375573)
chr4 (16-311)||(4440843-4441138)
chr4 (16-311)||(33227199-33227494)
chr4 (30-309)||(1777016-1777295)
chr4 (16-311)||(43433914-43434209)
chr4 (18-311)||(53707786-53708079)
chr4 (16-311)||(37797842-37798136)
chr4 (7-311)||(39100533-39100836)
chr4 (16-309)||(27983190-27983476)
chr4 (16-308)||(23906297-23906587)
chr4 (50-311)||(8286455-8286724)
chr4 (16-307)||(26037506-26037797)
chr4 (16-311)||(46582823-46583116)
chr4 (17-301)||(39708424-39708708)
chr4 (7-313)||(28236164-28236469)
chr4 (18-305)||(20192025-20192311)
chr4 (26-273)||(37773486-37773733)
chr4 (16-310)||(47265193-47265494)
chr4 (154-311)||(21528416-21528573)
chr4 (34-282)||(50286970-50287217)
chr4 (121-311)||(21236953-21237143)
chr4 (154-311)||(6957726-6957883)
chr4 (25-305)||(1793459-1793741)
chr4 (154-311)||(12494791-12494948)
chr4 (144-308)||(51811280-51811442)
chr4 (17-261)||(20591353-20591591)
chr4 (26-309)||(51421730-51422013)
chr4 (154-303)||(7947065-7947214)
chr4 (110-258)||(50679588-50679736)
chr4 (37-291)||(20601669-20601917)
chr4 (17-244)||(41009414-41009641)
chr4 (144-307)||(4548140-4548303)
chr4 (24-311)||(45204837-45205131)
chr4 (60-311)||(20821001-20821255)
chr4 (198-311)||(19154860-19154973)
chr4 (203-311)||(19969358-19969466)
chr4 (32-265)||(16002933-16003165)
chr4 (146-311)||(35690391-35690556)
chr4 (194-311)||(55007914-55008031)
chr4 (180-308)||(28550455-28550583)
chr4 (180-311)||(31043226-31043357)
chr4 (84-309)||(28351617-28351842)
chr4 (220-311)||(883357-883448)
chr4 (17-311)||(1211389-1211683)
chr4 (180-311)||(31961263-31961394)
chr4 (226-311)||(19061932-19062017)
chr4 (233-309)||(49939733-49939809)
chr4 (147-233)||(50862764-50862851)
chr4 (148-307)||(53518325-53518483)
chr4 (209-311)||(2589255-2589357)
chr4 (16-70)||(12494740-12494794)
chr4 (194-311)||(25574992-25575109)
chr4 (194-311)||(56225236-56225353)
chr4 (223-311)||(13805262-13805350)
chr4 (183-311)||(31459151-31459279)
chr4 (199-311)||(34208266-34208378)
chr4 (223-310)||(12443292-12443379)
chr4 (232-311)||(32633403-32633482)
chr4 (16-103)||(41192826-41192913)
chr4 (244-311)||(50238612-50238679)
chr4 (244-311)||(50238698-50238765)
chr4 (227-305)||(13262413-13262491)
chr4 (170-312)||(26024846-26024988)
chr4 (27-96)||(35555859-35555928)
chr4 (180-305)||(37042667-37042792)
chr4 (227-312)||(50869876-50869961)
chr4 (223-311)||(6958236-6958323)
chr4 (231-311)||(7066496-7066575)
chr4 (255-311)||(30634103-30634159)
chr4 (223-311)||(51438642-51438730)
chr4 (194-306)||(55388213-55388325)
chr4 (180-311)||(37488245-37488376)
chr4 (16-103)||(44047553-44047640)
chr4 (256-311)||(45209202-45209257)
chr4 (237-308)||(47372915-47372986)
chr4 (16-95)||(54470197-54470276)
chr4 (209-311)||(5306479-5306581)
chr4 (28-94)||(31459032-31459098)
chr4 (26-308)||(46372024-46372306)
chr4 (149-311)||(53540413-53540575)
chr4 (258-311)||(46153940-46153993)
chr4 (255-311)||(1328611-1328667)
chr4 (223-311)||(29399001-29399089)
chr4 (227-311)||(35622673-35622757)
chr4 (256-308)||(38017319-38017371)
chr4 (227-311)||(42285700-42285784)
chr4 (229-309)||(44360289-44360369)
chr4 (260-312)||(56130404-56130456)
chr4 (194-309)||(41192229-41192344)
chr4 (256-311)||(44719358-44719413)
chr4 (150-237)||(55809061-55809148)
chr4 (26-92)||(2588991-2589056)
chr4 (255-309)||(15665330-15665384)
chr4 (33-95)||(26356626-26356688)
chr4 (207-249)||(41729509-41729551)
chr4 (36-126)||(42285882-42285972)
chr4 (157-311)||(42293262-42293416)
chr4 (225-311)||(54935348-54935434)
chr4 (230-307)||(3979124-3979201)
chr4 (209-306)||(22873601-22873698)
chr4 (227-308)||(31897428-31897509)
chr4 (255-311)||(4879106-4879162)
chr4 (255-311)||(15661869-15661925)
chr4 (223-311)||(20105515-20105603)
chr4 (26-94)||(30621418-30621486)
chr4 (235-311)||(32339768-32339844)
chr4 (209-301)||(34233031-34233123)
chr4 (180-244)||(41009283-41009347)
chr4 (27-95)||(42639233-42639301)
chr4 (256-308)||(49738550-49738602)
chr4 (255-303)||(50862860-50862908)
chr4 (223-306)||(1095642-1095725)
chr4 (256-307)||(4136744-4136795)
chr4 (235-306)||(34585691-34585762)
chr4 (225-308)||(36799657-36799740)
chr4 (16-95)||(44360077-44360155)
chr4 (16-95)||(51252674-51252753)
chr4 (26-96)||(10209034-10209104)
chr4 (26-96)||(17900480-17900550)
chr4 (16-94)||(33709914-33709992)
chr4 (188-270)||(36198977-36199059)
chr4 (33-130)||(50680746-50680844)
chr4 (255-309)||(50967027-50967081)
chr4 (26-92)||(55768717-55768783)
chr4 (26-92)||(55832973-55833039)
chr4 (278-311)||(3601416-3601449)
chr4 (235-308)||(8284348-8284421)
chr4 (227-311)||(10209237-10209319)
chr4 (227-311)||(10775468-10775550)
chr4 (196-249)||(26510558-26510611)
chr4 (16-133)||(28497480-28497596)
chr4 (16-69)||(36557268-36557321)
chr4 (26-103)||(49738809-49738886)
chr4 (255-311)||(7544528-7544584)
chr4 (256-308)||(28348287-28348339)
chr4 (194-270)||(28486089-28486165)
chr4 (180-268)||(30621241-30621329)
chr4 (245-309)||(30662042-30662106)
chr4 (227-311)||(35555647-35555731)
chr4 (227-311)||(36556757-36556841)
chr4 (235-311)||(40932921-40932997)
chr4 (227-311)||(45184130-45184214)
chr4 (28-92)||(45423617-45423681)
chr4 (256-308)||(46236719-46236771)
chr4 (256-308)||(50471757-50471809)
chr4 (223-311)||(54963648-54963735)
chr4 (194-290)||(55579200-55579295)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (16-311)||(42854001-42854296)
chr8 (16-311)||(36545139-36545434)
chr8 (16-311)||(11523720-11524016)
chr8 (16-311)||(40813314-40813609)
chr8 (16-310)||(36565239-36565533)
chr8 (28-305)||(12491141-12491418)
chr8 (7-305)||(8932683-8932982)
chr8 (100-311)||(42469724-42469935)
chr8 (16-307)||(36394949-36395242)
chr8 (7-309)||(18125154-18125454)
chr8 (24-260)||(39946855-39947091)
chr8 (57-311)||(21121177-21121430)
chr8 (16-291)||(2796547-2796818)
chr8 (153-311)||(14742079-14742234)
chr8 (46-265)||(26904950-26905168)
chr8 (127-311)||(2027631-2027815)
chr8 (41-311)||(37077768-37078034)
chr8 (16-308)||(8879446-8879732)
chr8 (84-304)||(12025847-12026058)
chr8 (7-308)||(45419218-45419517)
chr8 (187-311)||(15215409-15215533)
chr8 (180-309)||(25473402-25473531)
chr8 (196-308)||(44529395-44529507)
chr8 (7-188)||(18751996-18752176)
chr8 (199-311)||(44047529-44047641)
chr8 (180-307)||(25288918-25289045)
chr8 (180-307)||(25300253-25300380)
chr8 (194-311)||(490503-490620)
chr8 (180-308)||(29520803-29520931)
chr8 (149-311)||(35643605-35643765)
chr8 (180-309)||(45041315-45041443)
chr8 (180-311)||(30559847-30559983)
chr8 (35-311)||(32930970-32931245)
chr8 (28-114)||(12796894-12796980)
chr8 (149-308)||(2216411-2216568)
chr8 (29-119)||(6510617-6510707)
chr8 (256-310)||(39967497-39967551)
chr8 (16-309)||(39953263-39953556)
chr8 (194-311)||(42584527-42584643)
chr8 (29-273)||(43904700-43904947)
chr8 (235-311)||(27556299-27556375)
chr8 (230-314)||(30689939-30690023)
chr8 (180-308)||(35914601-35914729)
chr8 (223-311)||(41031417-41031505)
chr8 (223-311)||(41031523-41031611)
chr8 (219-311)||(8255528-8255622)
chr8 (148-311)||(28169514-28169676)
chr8 (236-310)||(1928585-1928659)
chr8 (236-310)||(10668495-10668569)
chr8 (194-311)||(21425214-21425331)
chr8 (209-310)||(23492217-23492318)
chr8 (229-314)||(36042401-36042486)
chr8 (180-307)||(14459049-14459177)
chr8 (198-311)||(31715992-31716107)
chr8 (16-311)||(32043580-32043872)
chr8 (235-311)||(32276894-32276970)
chr8 (235-311)||(32569707-32569783)
chr8 (223-307)||(36143538-36143622)
chr8 (227-310)||(30812814-30812897)
chr8 (225-307)||(18473973-18474055)
chr8 (227-311)||(7531641-7531725)
chr8 (256-308)||(12611727-12611779)
chr8 (7-67)||(25985500-25985560)
chr8 (256-304)||(26055651-26055699)
chr8 (246-310)||(35323993-35324057)
chr8 (155-307)||(35362651-35362803)
chr8 (191-311)||(41444336-41444456)
chr8 (230-310)||(43733410-43733490)
chr8 (209-305)||(44699649-44699745)
chr8 (24-103)||(2776434-2776513)
chr8 (223-310)||(10824187-10824274)
chr8 (227-302)||(16351578-16351653)
chr8 (193-308)||(26363655-26363768)
chr8 (209-312)||(30198262-30198365)
chr8 (261-311)||(1064955-1065005)
chr8 (26-68)||(25985839-25985881)
chr8 (226-304)||(39702154-39702232)
chr8 (229-312)||(41212064-41212149)
chr8 (213-306)||(2518400-2518493)
chr8 (26-103)||(9695631-9695708)
chr8 (258-311)||(16921451-16921504)
chr8 (235-308)||(35646930-35647003)
chr8 (28-133)||(36143367-36143472)
chr8 (227-312)||(38901815-38901900)
chr8 (30-82)||(7103274-7103326)
chr8 (267-311)||(32978115-32978159)
chr8 (195-306)||(16917352-16917462)
chr8 (180-231)||(25439479-25439530)
chr8 (155-282)||(38391919-38392046)
chr8 (255-310)||(39651026-39651081)
chr8 (235-305)||(1313773-1313843)
chr8 (256-310)||(11129951-11130004)
chr8 (194-273)||(12966347-12966428)
chr8 (26-68)||(13986494-13986536)
chr8 (209-311)||(14903744-14903846)
chr8 (213-291)||(16035744-16035822)
chr8 (198-307)||(36069774-36069883)
chr8 (26-87)||(41444547-41444608)
chr8 (257-309)||(4558207-4558259)
chr8 (180-308)||(4955345-4955473)
chr8 (255-311)||(12985919-12985975)
chr8 (256-308)||(16971772-16971824)
chr8 (225-273)||(30456329-30456377)
chr8 (32-68)||(30456452-30456488)
chr8 (149-273)||(30783077-30783201)
chr8 (259-311)||(35085134-35085186)
chr8 (255-311)||(40982893-40982949)
chr8 (224-312)||(42493426-42493514)
chr8 (28-96)||(44681251-44681319)
chr8 (149-244)||(45512558-45512654)
chr8 (26-94)||(45512709-45512777)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (16-311)||(5258145-5258440)
chr6 (16-311)||(28085366-28085661)
chr6 (24-305)||(30031254-30031535)
chr6 (16-311)||(32755911-32756206)
chr6 (16-273)||(21351872-21352129)
chr6 (27-308)||(35043441-35043722)
chr6 (7-307)||(608138-608442)
chr6 (16-268)||(5631812-5632064)
chr6 (16-308)||(9706766-9707052)
chr6 (16-311)||(20427633-20427928)
chr6 (17-311)||(12890575-12890860)
chr6 (24-311)||(14030805-14031080)
chr6 (37-310)||(30679417-30679680)
chr6 (7-174)||(10099993-10100160)
chr6 (149-311)||(34143762-34143924)
chr6 (149-311)||(34156378-34156540)
chr6 (28-265)||(33496963-33497198)
chr6 (189-311)||(3206456-3206578)
chr6 (26-309)||(9593709-9593988)
chr6 (199-311)||(31819004-31819116)
chr6 (197-308)||(34934830-34934941)
chr6 (91-269)||(5080905-5081083)
chr6 (80-203)||(7133800-7133923)
chr6 (80-203)||(7136723-7136846)
chr6 (32-308)||(2689646-2689915)
chr6 (148-308)||(5095956-5096116)
chr6 (227-311)||(30789071-30789155)
chr6 (26-239)||(28026896-28027108)
chr6 (180-311)||(10098893-10099022)
chr6 (149-311)||(34502-34664)
chr6 (223-311)||(4245869-4245957)
chr6 (188-310)||(5897619-5897741)
chr6 (180-308)||(31818685-31818813)
chr6 (180-273)||(24665965-24666058)
chr6 (146-273)||(6055806-6055933)
chr6 (187-306)||(7492550-7492669)
chr6 (222-308)||(12119642-12119729)
chr6 (235-308)||(1615223-1615296)
chr6 (34-103)||(24665818-24665887)
chr6 (223-311)||(579615-579703)
chr6 (16-96)||(33084048-33084128)
chr6 (237-309)||(12133901-12133973)
chr6 (235-310)||(9109507-9109582)
chr6 (209-311)||(6293389-6293491)
chr6 (194-267)||(14389202-14389275)
chr6 (236-305)||(21886314-21886383)
chr6 (255-308)||(33730194-33730247)
chr6 (231-311)||(38976-39056)
chr6 (149-309)||(8364679-8364839)
chr6 (27-94)||(2079341-2079408)
chr6 (24-59)||(5080853-5080888)
chr6 (257-316)||(6906819-6906878)
chr6 (235-305)||(21089606-21089676)
chr6 (278-311)||(3127273-3127306)
chr6 (278-311)||(4878294-4878327)
chr6 (26-67)||(6641650-6641691)
chr6 (29-89)||(8364575-8364635)
chr6 (211-311)||(9568884-9568983)
chr6 (28-96)||(14389380-14389447)
chr6 (255-311)||(30642998-30643054)
[»] chr5 (104 HSPs)
chr5 (16-301)||(38684957-38685242)
chr5 (16-308)||(3301834-3302126)
chr5 (16-311)||(4496374-4496669)
chr5 (16-308)||(16347380-16347670)
chr5 (16-311)||(12492381-12492679)
chr5 (7-311)||(28976856-28977160)
chr5 (16-309)||(1287578-1287871)
chr5 (16-309)||(24178500-24178793)
chr5 (16-311)||(14665704-14665997)
chr5 (29-307)||(20456776-20457054)
chr5 (36-311)||(10639314-10639587)
chr5 (16-306)||(2075475-2075766)
chr5 (26-311)||(1275264-1275549)
chr5 (115-310)||(13561384-13561579)
chr5 (84-311)||(2915493-2915719)
chr5 (16-310)||(34273017-34273297)
chr5 (121-311)||(14911267-14911457)
chr5 (157-311)||(29816513-29816667)
chr5 (18-311)||(26884686-26884979)
chr5 (170-308)||(16913882-16914021)
chr5 (199-309)||(5558314-5558424)
chr5 (187-311)||(2393038-2393161)
chr5 (16-261)||(14749297-14749542)
chr5 (206-311)||(30213755-30213860)
chr5 (146-309)||(28002-28165)
chr5 (66-304)||(38501422-38501660)
chr5 (17-268)||(36215489-36215730)
chr5 (180-311)||(28276392-28276523)
chr5 (218-309)||(18855799-18855890)
chr5 (188-311)||(39040918-39041041)
chr5 (189-311)||(418031-418153)
chr5 (209-311)||(32442123-32442224)
chr5 (7-277)||(32516537-32516806)
chr5 (26-99)||(31636129-31636202)
chr5 (26-96)||(33667216-33667286)
chr5 (194-308)||(43557833-43557947)
chr5 (237-310)||(408492-408565)
chr5 (194-311)||(14667939-14668056)
chr5 (180-296)||(9235201-9235316)
chr5 (227-306)||(3442873-3442952)
chr5 (180-310)||(11675683-11675814)
chr5 (189-308)||(31220546-31220664)
chr5 (223-305)||(7640510-7640592)
chr5 (209-311)||(20367076-20367178)
chr5 (16-133)||(79503-79620)
chr5 (188-309)||(2090575-2090696)
chr5 (200-309)||(36551320-36551429)
chr5 (197-262)||(42504293-42504358)
chr5 (33-308)||(1525651-1525923)
chr5 (223-311)||(6859578-6859666)
chr5 (149-309)||(7678601-7678760)
chr5 (235-311)||(28411885-28411961)
chr5 (15-134)||(42199277-42199394)
chr5 (255-311)||(42576239-42576295)
chr5 (236-303)||(2713146-2713213)
chr5 (209-304)||(8081967-8082059)
chr5 (230-305)||(11002424-11002499)
chr5 (223-309)||(2645187-2645273)
chr5 (17-95)||(10082952-10083030)
chr5 (25-103)||(15168791-15168869)
chr5 (235-309)||(38132545-38132619)
chr5 (231-308)||(9121078-9121155)
chr5 (16-69)||(14667753-14667806)
chr5 (27-96)||(28676596-28676665)
chr5 (194-291)||(30588615-30588712)
chr5 (223-311)||(21193649-21193737)
chr5 (30-94)||(37065533-37065597)
chr5 (227-310)||(5860035-5860118)
chr5 (28-310)||(7359259-7359539)
chr5 (235-310)||(32366187-32366262)
chr5 (180-246)||(2552936-2553002)
chr5 (26-96)||(2712944-2713014)
chr5 (246-308)||(9234106-9234168)
chr5 (194-244)||(17340500-17340550)
chr5 (26-103)||(18351112-18351190)
chr5 (183-311)||(14725675-14725803)
chr5 (209-314)||(23980127-23980232)
chr5 (255-308)||(27386569-27386622)
chr5 (234-311)||(27800036-27800113)
chr5 (236-309)||(42272687-42272760)
chr5 (209-273)||(18350937-18351001)
chr5 (33-93)||(21952364-21952424)
chr5 (235-311)||(41200343-41200419)
chr5 (223-310)||(9400708-9400795)
chr5 (228-303)||(28985285-28985360)
chr5 (194-309)||(38684648-38684763)
chr5 (209-284)||(41808105-41808180)
chr5 (189-311)||(41894229-41894358)
chr5 (180-270)||(6889147-6889237)
chr5 (255-308)||(3000968-3001021)
chr5 (250-311)||(4653476-4653537)
chr5 (260-309)||(5303681-5303730)
chr5 (26-95)||(6888993-6889062)
chr5 (235-310)||(9917458-9917530)
chr5 (194-307)||(12576861-12576974)
chr5 (235-308)||(28186782-28186855)
chr5 (183-232)||(36200886-36200935)
chr5 (260-308)||(7367172-7367220)
chr5 (195-299)||(15588399-15588503)
chr5 (256-312)||(36123178-36123234)
chr5 (227-310)||(37065677-37065761)
chr5 (255-291)||(39322096-39322132)
chr5 (149-249)||(43035104-43035204)
chr5 (29-133)||(43475243-43475347)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (7-311)||(945-1249)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (16-311)||(31458-31753)
scaffold0018 (26-96)||(44080-44150)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (16-308)||(82711-83000)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (140-308)||(16692-16860)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (40-311)||(86606-86877)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (96-311)||(4706-4921)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (26-311)||(4277-4553)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (154-311)||(25529-25686)
scaffold0157 (16-70)||(25683-25737)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (68-311)||(11546-11787)
scaffold0113 (24-94)||(11810-11880)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (180-309)||(485-614)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (180-311)||(14737-14868)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (218-311)||(28886-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (149-311)||(58223-58385)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (166-306)||(7580-7720)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (180-311)||(1519-1647)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (180-307)||(160325-160452)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (220-306)||(16438-16524)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (223-309)||(6771-6857)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (258-311)||(19149-19202)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (188-244)||(39481-39537)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 349
Target Start/End: Original strand, 25191358 - 25191700
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191358 gacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatacc 25191457  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191458 gttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 25191557  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25191558 tcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgtt 25191657  T
Q  307 gttgtcgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatagcgag 349  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191658 gtcgttgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatagcgag 25191700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 22063 - 22357
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22063 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 22161  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22162 agagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 22261  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22262 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033428
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 5168822 - 5169117
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5168822 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 5168921  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5168922 agagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagt 5169021  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5169022 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 5169117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 47233888 - 47233596
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  47233888 agagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 47233789  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  47233788 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaat 47233689  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47233688 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 52138790 - 52139084
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  52138790 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaaga 52138889  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||  |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52138890 agaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 52138989  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52138990 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 28245427 - 28245721
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  28245427 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaaga 28245526  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28245527 agagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagt 28245626  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    | ||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28245627 tggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 37 - 311
Target Start/End: Original strand, 53519603 - 53519865
Alignment:
Q  37 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53519603 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggag 53519702  T
Q  137 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 236  Q
    |  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53519703 agtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccatt------------aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttg 53519790  T
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53519791 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 53519865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 54279010 - 54279304
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  54279010 agagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaa 54279109  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54279110 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 54279209  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54279210 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttgt 54279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 51447991 - 51447714
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  51447991 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatca 51447892  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||       |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51447891 aatggaggagagtcaagttaaaagag-------aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 51447799  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51447798 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 311
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508520
Alignment:
Q  59 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 158  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  159 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 258  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  259 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 308
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaata 227  Q
    ||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  || |||||     
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  228 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43695048 - 43694768
Alignment:
Q  25 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  ||||    
T  43695048 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagat 43694949  T
Q  125 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 224  Q
    |||||| ||  |||    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||    
T  43694948 caaatgaag--gaa----gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaa 43694855  T
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |   ||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43694854 actaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttgt 43694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12096870 - 12096702
Alignment:
Q  143 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  12096870 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12096771  T
Q  243 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12096770 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12096702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Original strand, 54128378 - 54128662
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||| |||||| ||||||   |  ||| | |||| |||||    
T  54128378 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatc 54128477  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt-gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 224  Q
    | ||||||   |  ||| |  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  54128478 agatggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaa 54128577  T
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54128578 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262426
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 53262426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33272318 - 33272122
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctata----gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| ||    
T  33272318 agagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggt 33272220  T
Q  112 aagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 209  Q
    |||||| | | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272219 aagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289091
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaa 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| ||  ||||||   || ||||    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  114 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 213  Q
    |||||| |||||| |||||| | |   || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  214 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 174
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060579
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 174  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaac 38060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa-gacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||   || |||||||||| |||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  132 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    || |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 164 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52156228 - 52156081
Alignment:
Q  164 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 263  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52156228 actaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T
Q  264 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  52156128 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 52156081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19676362 - 19676079
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  19676362 ggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | || ||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa 19676164  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||| | | ||||||| || |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19676163 tatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54425244 - 54424959
Alignment:
Q  36 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag-------agaagatcaaa 128  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||       || |||||| |    
T  54425244 ctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtagggagaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcaga 54425145  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54425144 tggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagagggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatat 54425045  T
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54425044 ggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 195 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311306
Alignment:
Q  195 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 294  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  295 ttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgttgt 311306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042219
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 49042189  T
Q  279 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49042190 cttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 45728137 - 45728324
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag-aagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||  |||||||||    
T  45728137 agagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaag 45728236  T
Q  115 aagag--aagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 200  Q
    |||||   | ||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45728237 aagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  170 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  270 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 3186771 - 3186973
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||| |  ||||||     
T  3186771 ggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggct-agatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcag 3186869  T
Q  128 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 227  Q
    || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| || | |||||||||| ||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3186870 attgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaata 3186969  T
Q  228 tggt 231  Q
    ||||    
T  3186970 tggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  42 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 141  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| | |  ||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  142 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 241  Q
    | | |||||||||||||||||| | || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  242 acactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555329
Alignment:
Q  204 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  304 gttgttgt 311  Q
    ||||||||    
T  47555336 gttgttgt 47555329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133609
Alignment:
Q  201 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  301 gttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||    
T  2133619 gttgttgttgt 2133609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510013
Alignment:
Q  30 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 129  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  |||||  |||||   || ||||| |||| |||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  130 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 229  Q
    |||| | |  ||| | |  ||||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgt 42510013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 49503695 - 49503565
Alignment:
Q  181 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaact 280  Q
    |||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| || | |||| | | ||||||||||||||||||| || |||    
T  49503695 agaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccctact 49503596  T
Q  281 tagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49503595 tagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 49503565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50960915 - 50960636
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||     ||   || | |||||||| |||||    
T  50960915 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | |||||| |||  | | |  ||||||| ||||||||| |||  ||||   |  ||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaa 50960720  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| | | ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  50960719 tatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48712196 - 48712075
Alignment:
Q  187 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 286  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48712196 cattaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgg 48712097  T
Q  287 gataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48712096 gataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296189
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364976
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga--agacccgtagataccgttgtaa 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||  | ||| |||||| |  || |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  114 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 213  Q
    | |||| |||||||||| || | |  |||   |  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  214 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga-ccacactagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566161
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39600973 - 39600683
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||| | || |  ||     
T  39600973 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgagg 39600874  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| || ||| | |  ||| ||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  39600873 agagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagt 39600774  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||| || || | || |||| ||| |||||  ||||||| |||||    
T  39600773 tggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273202
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgt 40273202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48734417 - 48734147
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | |||||  | || ||| |||||| |||||    
T  48734417 ggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatc 48734318  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | |||||||  |   || | |||||||||||||||||  ||            ||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | ||||||    
T  48734317 agatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaaggcct------------tgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaa 48734230  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
     ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48734229 catggtttatgatagaacattatggcgtaagttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895877
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 7895877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 244
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   || | |||||||||||| |||| | ||||   || ||| |||||| ||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  128 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 227  Q
    |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||| |||    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  228 tggtttttgatagaaca 244  Q
    |||||| ||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 307
Target Start/End: Original strand, 26490317 - 26490596
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | ||||||  | |||   || ||| |||||| ||||||     
T  26490317 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcag 26490416  T
Q  128 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 227  Q
    || ||| |||| ||  ||| | |||| || ||||||  ||  ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||     
T  26490417 atagaggagaatcatattagatgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatg 26490516  T
Q  228 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    || |||   |||||| | |||| | | ||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  26490517 tgatttcatatagaatattatggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31454306 - 31454224
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31454306 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Original strand, 19757898 - 19758158
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||    
T  19757898 tgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtaga 19757997  T
Q  124 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 223  Q
    ||| |||||| |||   || | |||| ||||||||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||      
T  19757998 tcagatggaggagagttagatcaaaa-aggtagaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctc 19758084  T
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19758085 aatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601177
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29601160 cttggttcttgttgttgt 29601177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486848
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532243
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca-tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48532243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927845
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgt 52927845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Original strand, 32170602 - 32170684
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170602 aaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208893
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  39208891 tgt 39208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422837
Alignment:
Q  185 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaa 278  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccca 54422867  T
Q  279 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54422866 cttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Original strand, 27917570 - 27917639
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27917570 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagac 27917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 49503834 - 49503766
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  49503834 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 49503766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304248
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  294 cttggttgttgttgt 308  Q
    || ||||||||||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 298
Target Start/End: Original strand, 19736995 - 19737255
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||    
T  19736995 tgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtaga 19737094  T
Q  124 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 223  Q
    ||| |||||| |||   || | |||| |||| |||||||| |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||      
T  19737095 tcagatggaggagagttagatcaaaa-aggttgaggaagaccta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctc 19737181  T
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19737182 aatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45374567 - 45374474
Alignment:
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45374567 gatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 21200539 - 21200656
Alignment:
Q  15 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | |  |||||    
T  21200539 cagagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaag 21200636  T
Q  115 aagagaagatcaaatggaga 134  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  21200637 gagagtagatcacatggaga 21200656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834597
Alignment:
Q  243 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45834597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 311
Target Start/End: Original strand, 20208196 - 20208283
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  20208196 aatatggcatttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgt 20208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294125
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat---gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||   |||||||||||||  |||||| ||   |||||||||| | ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| || | |  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggca--atttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36820253 - 36820166
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820253 agagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678929
Alignment:
Q  30 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgtt-gtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |  |||||  |    
T  52679124 tagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagat---gttggtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatat 52678930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162664
Alignment:
Q  110 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 209  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  210 atgagttagatccaaatatggt 231  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19162685 atgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 305
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  240 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41842635 - 41842562
Alignment:
Q  196 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  41842635 agatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 305
Target Start/End: Original strand, 49841770 - 49841895
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  49841770 gagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
     ||| | | ||| |||||||||||||    
T  49841870 atagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893374
Alignment:
Q  231 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttgt 27893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38181086 - 38181042
Alignment:
Q  51 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38181086 tggtagaaattagacttagatgatttagacatgttgagagaagac 38181042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778609
Alignment:
Q  233 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 230 - 309
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148311
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21862796 - 21862742
Alignment:
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21862796 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31337658 - 31337560
Alignment:
Q  210 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31337658 atgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116348
Alignment:
Q  196 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 295  Q
    |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  296 tgg 298  Q
    |||    
T  40116350 tgg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842686
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| |  |||||||||||||| | |||||| | || ||||  |||| ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  127 aatggag 133  Q
    |||||||    
T  41842692 aatggag 41842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 308
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284270
Alignment:
Q  195 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 294  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggc 11284256  T
Q  295 ttggttgttgttgt 308  Q
    ||| ||||||||||    
T  11284257 ttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022707
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | ||||   |||||| || |||||||||||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  260 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 344825 - 344769
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  344825 atttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 344769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987619
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 3987619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146984
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 31146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 285
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351666
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 285  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 37351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 37779045 - 37779101
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 250  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37779045 aaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacattatga 37779101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44134112 - 44134044
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  44134112 ggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 306
Target Start/End: Original strand, 659734 - 659805
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  659734 tgatagaacattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31261039 - 31260965
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31261039 tgatagaacactgtgacatcatttgattcatg-cgccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 31260965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 42026635 - 42026536
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42026635 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249662
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 50249662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 31453221 - 31453151
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  31453221 ggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37083345 - 37083291
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37083345 atttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367390
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50631957 - 50631879
Alignment:
Q  232 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  50631957 ttttgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 31454504 - 31454467
Alignment:
Q  30 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 67  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31454504 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 31454467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52882715 - 52882662
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  52882715 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 345003 - 344951
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 68  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  345003 agagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggctta 344951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 11581445 - 11581513
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  11581445 gggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagac 11581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332557
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| | || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 30332557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31453042 - 31452958
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| | || |||||| | || |||||| |||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  31453042 atggtttttgacataatactatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtttttgt 31452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40116596 - 40116532
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  40116596 gagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaaca 40116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 229 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40672446 - 40672366
Alignment:
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  40672446 ggtttttgataggtcattatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 198 - 242
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 242  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 132)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 43281655 - 43281959
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43281655 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcc 43281754  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43281755 gttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagagg 43281854  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43281855 tcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 43281954  T
Q  307 gttgt 311  Q
    |||||    
T  43281955 gttgt 43281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 29650374 - 29650669
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650374 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 29650473  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29650474 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 29650573  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29650574 ttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29650669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12841567 - 12841272
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12841567 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 12841468  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12841467 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 12841368  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12841367 tgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45836772 - 45836479
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45836772 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 45836673  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||   ||||||   |||||||||| ||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45836672 agagtagatcaaatggaggagagttaggttat--gaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 45836575  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45836574 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 45836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 11593950 - 11594245
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  11593950 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaaga 11594049  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11594050 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 11594149  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11594150 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11594245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 37617934 - 37618229
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37617934 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaag 37618033  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37618034 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataag 37618133  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37618134 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37618229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 34869410 - 34869702
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  34869410 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaaga 34869509  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||| ||||| | |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34869510 agagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 34869609  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34869610 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39906662 - 39906369
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||    
T  39906662 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaaga 39906563  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  39906562 agagtagatcaaatggaggagt--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgact 39906465  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39906464 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885719
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2885719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46356148 - 46355858
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   || ||||||    
T  46356148 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaaga 46356049  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46356048 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 46355949  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46355948 tggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 49029266 - 49029559
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49029266 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 49029365  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
     ||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49029366 cgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 49029465  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  49029466 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 35906493 - 35906208
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35906493 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 35906394  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | |||| |||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35906393 agagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagt 35906294  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 301  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  35906293 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682599
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
    ||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44855464 - 44855171
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  44855464 agagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataaga 44855365  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855364 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 44855265  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44855264 tggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44855171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 33350098 - 33349803
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33350098 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 33349999  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33349998 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagt 33349899  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | |  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33349898 tggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 33349803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 6374858 - 6375153
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||    
T  6374858 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagaccagtagatgctgtggtaaga 6374957  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    || | |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  6374958 agggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcagtgagt 6375057  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  6375058 tggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 6375153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 38606994 - 38607277
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38606994 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 38607093  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38607094 agagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38607181  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  38607182 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgt 38607277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Original strand, 36652004 - 36652277
Alignment:
Q  38 atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |    
T  36652004 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggata 36652103  T
Q  138 accaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 237  Q
      || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | |||    
T  36652104 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatga 36652203  T
Q  238 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36652204 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgt 36652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35559286 - 35558994
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacct-atagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||    
T  35559286 agagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaag 35559187  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35559186 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 35559087  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    || ||||||||| | |||| || ||||||| |||  |||||||||||||||||||| || |  | |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  35559086 ttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349905
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||| ||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 22349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 43491299 - 43491593
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43491299 gagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaa 43491398  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    |||  ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  43491399 gagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagtt 43491498  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43491499 ggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43491593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13859300 - 13859067
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  13859300 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaaga 13859201  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13859200 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagt 13859101  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 249  Q
    | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13859100 tggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 311
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631849
Alignment:
Q  65 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 164  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||     
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  165 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 264  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  265 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Original strand, 31005213 - 31005428
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31005213 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 31005312  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||    
T  31005313 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagt 31005412  T
Q  216 tagatccaaatatggt 231  Q
    | ||||||||| ||||    
T  31005413 tggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869234
Alignment:
Q  25 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  125 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 224  Q
    ||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc-------catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 36869234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598185
Alignment:
Q  84 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 183  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  184 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |  | |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  284 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgt 24598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682459
Alignment:
Q  36 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 135  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  136 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 235  Q
     |  || || ||||||||| ||| || | ||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgt 15682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 33072933 - 33073100
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  33072933 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtc 33073032  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 174  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  33073033 gtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 33073100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 143 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  143 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  243 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 311
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900241
Alignment:
Q  143 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  243 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38900241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 309
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273383
Alignment:
Q  80 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 179  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| ||||   |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 183 - 309
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  283 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  99 tagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga 198  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||   || |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  199 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  299 ttgttgtt 306  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 169 - 308
Target Start/End: Original strand, 48919255 - 48919394
Alignment:
Q  169 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48919255 gaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgta 48919354  T
Q  269 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  48919355 gtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 171 - 309
Target Start/End: Original strand, 21078062 - 21078200
Alignment:
Q  171 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 270  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  21078062 aaaccgttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 21078161  T
Q  271 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||    | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21078162 cgacttcatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Original strand, 23404409 - 23404640
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | || | ||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||||    
T  23404409 gagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaaataggcttaga-cagtttggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaa 23404507  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||  ||   ||||||||||| ||   ||||| || ||||||||||    
T  23404508 gagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtt 23404607  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatg 249  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404608 tgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 36136754 - 36137046
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||| | ||| ||||||||| |||  |||||   || ||| ||    
T  36136754 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacga 36136853  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||| ||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| |    
T  36136854 agagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaat 36136953  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||    | |||||||  || || ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36136954 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210701
Alignment:
Q  148 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 247  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||  |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  248 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttgt 9210701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 213 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208325
Alignment:
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28208325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 46014472 - 46014359
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  46014472 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg-gttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcctaaga 46014374  T
Q  116 agagaagatcaaatg 130  Q
    |||| ||||||||||    
T  46014373 agagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  298 gttgttgttg 307  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28628212 - 28627936
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| || ||| | |||||| |||||| ||| ||||||   || ||||| |||| |||||  |    
T  28628212 gtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccga 28628113  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    ||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  28628112 tggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgt 28628013  T
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28628012 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 309
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  202 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  302 ttgttgtt 309  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101774
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36101791 cttggttgttgttgttgt 36101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Original strand, 7273030 - 7273146
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||    
T  7273030 gagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaa 7273129  T
Q  117 gagaagatcaaatggag 133  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  7273130 gagtagatcagatggag 7273146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 149 - 305
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |   | |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893560
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| | |||||| | || | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgttgt 27893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 316
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951445
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatac 44951408  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 316  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44951409 ttagtggtataaggtttggttgttgttgttgtagtct 44951445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 306
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 230 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869101
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969983
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  298 gttgttgttgttgt 311  Q
    ||| ||| ||||||    
T  42969970 gttattgatgttgt 42969983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 42187595 - 42187726
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 278  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  42187595 gagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 42187693  T
Q  279 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  42187694 cttagtgggataaggctttgttgttgttgttgt 42187726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 201 - 309
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  201 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 300  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  301 gttgttgtt 309  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 1011167 - 1011329
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1011167 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacat 1011265  T
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1011266 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 311
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966301
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    || |||  |     || |||  |  |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| || |||  ||||||    
T  12966125 tgaagacta-----gtcaaatcac-tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| | ||||| | || |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12966301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 265
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922492
Alignment:
Q  148 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 247  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaac-tttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  248 tgacatcatttgatccat 265  Q
    |||| | |||||||||||    
T  35922475 tgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 36514509 - 36514424
Alignment:
Q  6 ggacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 91  Q
    ||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  36514509 ggacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 68
Target Start/End: Original strand, 32630584 - 32630636
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 68  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32630584 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519046
Alignment:
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 288  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  | || |||||||| ||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  289 taatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741891
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||  ||||||||||| | ||||  |||||   || ||||| |||| ||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga--aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 224  Q
     || ||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||  ||  ||||| ||   |||  ||| ||||| ||| |||| ||  | |||||||| || | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgcaaaaatgcttggttgttgttgttgt 26741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 308
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc------aactt 281  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||       ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  282 agtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 31005432 - 31005490
Alignment:
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31005432 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31005490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169726
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 307
Target Start/End: Original strand, 34745891 - 34746028
Alignment:
Q  170 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||| || || | |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||    
T  34745891 aaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtag 34745990  T
Q  270 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34745991 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Original strand, 47848664 - 47848912
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||  ||| || | ||  ||||     
T  47848664 agagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaagg 47848763  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| | |  | | | |  ||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | | | ||||||     
T  47848764 agagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagc 47848862  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  47848863 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag-ccgatccaactt 281  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |   |||||||||| |||| | || || ||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  282 agtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 29318848 - 29318792
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29318848 atttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29318792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8492355 - 8492276
Alignment:
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||    
T  8492355 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 271  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38135341 - 38135210
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| || |||||||| | |||| | | ||||||||||| |||| || || ||    
T  38135341 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccac 38135242  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38135241 ttggtgggacaaggcttggttgttattgttgt 38135210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 311
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630719
Alignment:
Q  244 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40630719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Original strand, 43282398 - 43282477
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  43282398 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Original strand, 7220965 - 7221039
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7220965 tgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891172
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976517
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||| ||||||||||||| | ||  |||||   ||||| |    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataagg 37976502  T
Q  294 cttggttgttgttgt 308  Q
     ||||||||||||||    
T  37976503 tttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19262725 - 19262609
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||    
T  19262725 agagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaaga 19262627  T
Q  116 agagaagatcaaatggag 133  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  19262626 agagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158671
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103211
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| || |||||||||    
T  33103194 cttggctgatgttgttgt 33103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 305
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  204 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 303  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  304 gt 305  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 306
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189442
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594037
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013560
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 16013560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 28708610 - 28708666
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28708610 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttgt 28708666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 29312218 - 29312274
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29312218 atttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 310
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840514
Alignment:
Q  238 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1531523 - 1531420
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||     
T  1531523 aaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacat 1531424  T
Q  246 tatg 249  Q
    ||||    
T  1531423 tatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 14593772 - 14593835
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  14593772 cacctatagtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541943
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataat 292  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||  || |||||||  |||||     
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  293 gcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  197 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 19119505 - 19119423
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  19119505 atggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 30144982 - 30145040
Alignment:
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30144982 tcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtttttgt 30145040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 312
Target Start/End: Original strand, 5418303 - 5418360
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5418303 atttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 5418360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281171
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacca-cttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 33281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 42187470 - 42187547
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187470 ggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558405
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 69  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttag 45558405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558611
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagtg-gataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48736191 - 48736074
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||   ||||||||| ||||||| || |||   || || ||     
T  48736191 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttagg 48736092  T
Q  116 agagaagatcaaatggag 133  Q
    |||| |||||||||||||    
T  48736091 agagtagatcaaatggag 48736074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523928
Alignment:
Q  239 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttgt 1523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525049
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttgt 20525049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44401253 - 44401164
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 271  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44401253 gagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtta--tcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 96
Target Start/End: Original strand, 16013295 - 16013358
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  16013295 cacctatagtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 137
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139265
Alignment:
Q  78 gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 137  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaaga 33139265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| | |||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926547
Alignment:
Q  212 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 283  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Original strand, 5335910 - 5335988
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  5335910 agagagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  263 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517426
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 262  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25579370 - 25579252
Alignment:
Q  16 agagagaatgggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||  |||||| | || |||||    
T  25579370 agagagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaag 25579271  T
Q  115 aagagaagatcaaatggag 133  Q
    ||||| |||| | ||||||    
T  25579270 aagagtagattagatggag 25579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 315
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021224
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 315  Q
    |||||||| |||||  || ||||| |||||||||| |  | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttgtcgtc 28021224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515456
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttgt 48515456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604832
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgt 4604832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 30200244 - 30200175
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||| | ||||||||    
T  30200244 gggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  234 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 91
Target Start/End: Original strand, 38920794 - 38920859
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||| | ||||||||||||    
T  38920794 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138948
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40149112 - 40149016
Alignment:
Q  208 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40149112 caatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Original strand, 41483714 - 41483771
Alignment:
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  41483714 tcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36102045 - 36101977
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  36102045 ggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38921169 - 38921086
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag--ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||  |||| || |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  38921169 atggtttttgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47700108 - 47700053
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  47700108 atttgatccatgtagccgaccca-cttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 47700053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48735970 - 48735898
Alignment:
Q  239 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  48735970 agaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttgt 48735898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 137)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4001747 - 4001452
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4001747 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 4001648  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4001647 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagt 4001548  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4001547 tggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4001452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 696259 - 696554
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  696259 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 696358  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696359 agagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 696458  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacacta-tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  696459 ttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 696554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 1210735 - 1211030
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1210735 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 1210834  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1210835 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1210934  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1210935 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30202422 - 30202127
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  30202422 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 30202323  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30202322 agagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 30202223  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30202222 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 34792641 - 34792347
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  34792641 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 34792542  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  34792541 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 34792442  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34792441 tggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 34792347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 22090086 - 22090381
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22090086 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaaga 22090185  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    | || ||||||||||||| |||  || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22090186 aaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 22090285  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22090286 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 22090381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49347685 - 49347393
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  49347685 agagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 49347586  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49347585 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 49347486  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49347485 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 8671899 - 8672203
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  8671899 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgcc 8671998  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8671999 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagg 8672098  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| | || |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  8672099 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgtt 8672198  T
Q  307 gttgt 311  Q
    |||||    
T  8672199 gttgt 8672203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38807963 - 38807668
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38807963 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaaga 38807864  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||| || |||||| |||  ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38807863 agagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagt 38807764  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38807763 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38807668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 15085924 - 15086207
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15085924 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 15086023  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||            ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15086024 agagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagt 15086111  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15086112 tggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 9592724 - 9593018
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9592724 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 9592823  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9592824 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagt 9592923  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||  |||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9592924 tagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 9593018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 51602037 - 51602341
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  51602037 gacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtc 51602136  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  51602137 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagagg 51602236  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51602237 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 51602336  T
Q  307 gttgt 311  Q
    |||||    
T  51602337 gttgt 51602341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029407
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 4029407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979228
Alignment:
Q  44 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 143  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  144 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 243  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  244 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25979228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32083037 - 32082753
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  32083037 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 32082938  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32082937 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagt 32082850  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca-tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  32082849 tggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttgt 32082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Original strand, 8391762 - 8392030
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8391762 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaaga 8391861  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||||||| || |||  || |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8391862 agagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagt 8391961  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 284  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8391962 tggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 51441057 - 51440764
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  51441057 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaaga 51440958  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||| ||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51440957 agagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagt 51440858  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51440857 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 108 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311752
Alignment:
Q  108 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  208 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  308 ttgt 311  Q
    ||||    
T  37311755 ttgt 37311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43240671 - 43240380
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||   || ||||||    
T  43240671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaaga 43240572  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  43240571 agagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagt 43240472  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43240471 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32231246 - 32230997
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||    
T  32231246 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataaga 32231147  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32231146 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 32231047  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    | ||||||||  |||| | |||||||||||||||   | |||||||||||    
T  32231046 tggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 308
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921362
Alignment:
Q  141 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  241 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 311
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318413
Alignment:
Q  89 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 188  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 288  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  289 taatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttgt 39318413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 310
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415633
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | ||  |||||||||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttg 4415633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404525
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
     |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 305
Target Start/End: Original strand, 39140509 - 39140794
Alignment:
Q  15 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| || ||| | |||||||||||||||||  || ||   || ||| |    
T  39140509 cagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacg 39140608  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| |||   ||  ||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  39140609 aagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattag 39140703  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  39140704 ttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  56 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 155  Q
    |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||| |||||| |||||| |||   || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  156 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 255  Q
    ||||||||  ||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |   |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  190 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  290 aatgcttggttgttgttgt 308  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079176
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37463174 - 37462878
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||| | |   || |||| ||||  |||||| ||    
T  37463174 gacaccattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgcc 37463078  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa-gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 205  Q
    || ||| |||||| |||||| |||||| |||  | | | |||| |||||||||||  | |||  ||||| ||  ||||||| || || || |||||||||    
T  37463077 gtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagag 37462978  T
Q  206 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37462977 gttaatgagtttgatc-aaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 37462879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707218
Alignment:
Q  190 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 289  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  290 aatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttgt 4707218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Original strand, 9509308 - 9509565
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| || |  | |||       
T  9509308 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtactt 9509407  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||| ||   |||||||    
T  9509408 agagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagt 9509507  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||| |||||||||||||||    
T  9509508 tagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544875
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||    |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||     ||||||| ||  |||||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagt 2544782  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | || | ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  2544783 tggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200303
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 287  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  288 ataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgttgt 10200303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 41560383 - 41560514
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  41560383 gagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 41560482  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41560483 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020264
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  298 gttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttgt 24020264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375596
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  294 cttggttgttgttgttg 310  Q
     ||||||||||||||||    
T  43375612 attggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431396
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || ||||  ||||  ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc-------aatgagttag 218  Q
    | |||||| | |  | | ||| |||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||| |        |||||||| |    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 48431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941774
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44941774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  240 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090691
Alignment:
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 28090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 219 - 308
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936745
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  |  ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  283 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgttgt 19936745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 311
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751769
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27848085 - 27847797
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||| | ||||     
T  27848085 ggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcag 27847986  T
Q  128 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaacc-atttgagaaaccattagaaaagat----ttagaggtcaatgagttagatcc 222  Q
    |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| ||  |||||   ||  ||||||| | ||  ||||||    |||||||| |||||||| | |      
T  27847985 atggaggagagtcagctcagaagaggtagaggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttg 27847886  T
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  27847885 aaatatggtttatgatggaacattatgccgtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgt 27847797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577536
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29577536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532614
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 310
Target Start/End: Original strand, 6025772 - 6025889
Alignment:
Q  193 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 292  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6025772 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataat 6025871  T
Q  293 gcttggttgttgttgttg 310  Q
     |||||||||| ||||||    
T  6025872 acttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533749
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  307 gt 308  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18469374 - 18469082
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||  |||| |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||| ||    
T  18469374 agagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacga 18469275  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | |||| ||||||||||  | | | |||||||||||| |||||  ||  ||||  ||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  18469274 agagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagt 18469175  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||   | ||||| | ||||||| ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18469174 tggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129065
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat-ccatgtagccgatccaa 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | || |||| |||||||||||| || |    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccca 29129036  T
Q  279 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29129037 cttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 309
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796492
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 9599686 - 9599432
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||  | ||| || | ||| |||| | ||||    | |||  |    
T  9599686 agagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaa 9599587  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  9599586 agagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagt 9599487  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 270  Q
    | |||||| ||||||||| |||||||||  |||| | | ||||||||||||||||    
T  9599486 ttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccatgtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444641
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  34444639 tgt 34444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585029
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 51585029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36340095 - 36339804
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||   || |||||     
T  36340095 agagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaagg 36339996  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
     | |  ||||| |||||| | | | || | |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  36339995 cgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagt 36339897  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||   ||| ||||||  ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36339896 tggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818853
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcac 3818885  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3818884 ttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 3818853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846846
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084260
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  6084258 tgt 6084260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 307
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  222 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715326
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274398
Alignment:
Q  210 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||| | | ||||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  310 gt 311  Q
    ||    
T  31274399 gt 31274398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36624012 - 36623884
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |    |||||||||||| ||| || ||    
T  36624012 gagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc-tgtaatgatccatgtagtcgaccctac 36623914  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36623913 ttagtgggataaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 38869081 - 38869166
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  38869081 atatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661500
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114028
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgt 5114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438800
Alignment:
Q  195 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 294  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  295 ttggttgttgt 305  Q
    |||||||||||    
T  15438810 ttggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481795
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 50636278 - 50636366
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50636278 aaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttgt 50636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430417
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 37430417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  181 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 260  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4318900 - 4318842
Alignment:
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4318900 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4318842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520246
Alignment:
Q  83 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta--agaaaaccatttg 180  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||      ||| || || || |||||||||| |||||||  ||  | ||||| ||  |    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatca------gaaaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  181 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtag 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 311
Target Start/End: Original strand, 41165509 - 41165567
Alignment:
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41165509 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 41165567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 5338881 - 5338998
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||| || ||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |    
T  5338881 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataagg 5338980  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    || |||||||||||||||    
T  5338981 ctcggttgttgttgttgt 5338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762496
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 249  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 271  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||   | |||||||||||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 1704836 - 1704912
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1704836 tgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttgt 1704912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569068
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttgt 10569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  199 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  299 ttgtt 303  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 291
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 35828829 - 35828725
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||||||||| |    
T  35828829 gtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcata 35828730  T
Q  129 tggag 133  Q
    |||||    
T  35828729 tggag 35828725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 311
Target Start/End: Original strand, 52832170 - 52832330
Alignment:
Q  151 aggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 250  Q
    ||||||||||| | |||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  52832170 aggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatga 52832269  T
Q  251 catcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | | ||||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  52832270 cgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgttgttgt 52832330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2914175 - 2914120
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2914175 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2914120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11941700 - 11941577
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 287  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  | |||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||| ||  |  |||||||| |    
T  11941700 attagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtggg 11941601  T
Q  288 ataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  11941600 atacggcttggttgttgttgttgt 11941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416448
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Original strand, 43423709 - 43423788
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  43423709 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16272903 - 16272818
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16272903 tatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgtaatcaatcc-acttagtgggataatgtctggatgttgttgttgtc 16272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758017
Alignment:
Q  261 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38758017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510831
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgttg 45510831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 18793270 - 18793201
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| || ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  18793270 ggggtaggacttattgtagaaaagatggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   ||||||| || || ||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 239 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33560927 - 33560858
Alignment:
Q  239 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33560927 agaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4590585 - 4590533
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4590585 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7133355 - 7133299
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7133355 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 7133299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930308
Alignment:
Q  211 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||    |||| | ||||||||||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  12930308 t 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13828009 - 13827929
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  13828009 agagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 26299297 - 26299353
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  26299297 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgt 26299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111986
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32111986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 48801700 - 48801625
Alignment:
Q  221 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  48801700 ccaaatatggtttatgatagaacattac-acataatttgatccatgtagctgatcccacttagcgggaaaatgcttg 48801625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 310
Target Start/End: Original strand, 14224286 - 14224368
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  14224286 atggtttttgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637846
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagac 27637846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 296
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828562
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52633257 - 52633166
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 314  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | | |   ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  52633257 aaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgcttagtgggatggtgtttggttgttgttgttgtcgt 52633166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814291
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttgt 52814291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8676993 - 8676897
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt---tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  |   |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8676993 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 285
Target Start/End: Original strand, 28528556 - 28528614
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28528556 atggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 29577256 - 29577147
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  29577256 aaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggttat-gatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtg 29577158  T
Q  294 cttggttgttg 304  Q
    |||||||||||    
T  29577157 cttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Original strand, 37263331 - 37263397
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||   || ||| | |||||||||||||    
T  37263331 ggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52073745 - 52073675
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52073745 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 10272260 - 10272329
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||    
T  10272260 gggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacc 10272329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11331332 - 11331247
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11331332 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11489353 - 11489268
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11489353 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Original strand, 22930645 - 22930678
Alignment:
Q  278 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22930645 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 22930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113456
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42539265 - 42539208
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42539265 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgttgttgtc 42539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 307
Target Start/End: Original strand, 44008806 - 44008859
Alignment:
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  44008806 catttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 308
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806949
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Original strand, 4380013 - 4380081
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||   |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4380013 ggggtagcaactatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338831
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  129 tggag 133  Q
    |||||    
T  5338827 tggag 5338831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8194773 - 8194721
Alignment:
Q  257 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8194773 ttgatctatgtagccggtcctactttgtatgataatgtttggttgttgttgtt 8194721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  260 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827746
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||  | || || ||| |||||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| |||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtaga 13827755  T
Q  124 tcaaatgga 132  Q
    ||| |||||    
T  13827754 tcatatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 92
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812591
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 51812677 - 51812725
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 242  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51812677 aaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaa 51812725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 307
Target Start/End: Original strand, 52292268 - 52292320
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||| || | || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52292268 atttgatccatgtaaccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  196 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 114)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 38429874 - 38430168
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38429874 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaaga 38429973  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429974 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 38430073  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430074 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttgt 38430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 12734680 - 12734985
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12734680 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgcc 12734779  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg-tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 205  Q
    || |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  12734780 gtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagag 12734879  T
Q  206 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12734880 gtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 12734979  T
Q  306 tgttgt 311  Q
    ||||||    
T  12734980 tgttgt 12734985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834963
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggaggagtt--aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25834963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 3866062 - 3866357
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  3866062 agagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaaga 3866161  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3866162 agagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 3866261  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3866262 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 3866357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 27 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41197509 - 41197224
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  41197509 gggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatca 41197410  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaaga-ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    ||||||| |||  |||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  41197409 aatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaa 41197310  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41197309 tatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgt 41197224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 25 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45367908 - 45367622
Alignment:
Q  25 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||    
T  45367908 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagat 45367809  T
Q  125 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 224  Q
    ||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  45367808 caaatggaggagagtctagttaaaagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaa 45367709  T
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  45367708 atatgatttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgt 45367622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11992409 - 11992108
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  11992409 gacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgcc 11992310  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||    
T  11992309 gttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagagg 11992210  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  11992209 tcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtt 11992110  T
Q  307 gt 308  Q
    ||    
T  11992109 gt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 312
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610874
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgtc 2610874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41763324 - 41763043
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||    
T  41763324 ggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatc 41763225  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41763224 aaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaa 41763126  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| |||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41763125 tatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38452977 - 38452686
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38452977 agagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 38452878  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    ||| | |||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38452877 agata-gatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38452779  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38452778 tggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3243954 - 3243654
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3243954 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgcc 3243855  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || |||||||||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3243854 gtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagg 3243755  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3243754 tcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 3243655  T
Q  307 g 307  Q
    |    
T  3243654 g 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 315
Target Start/End: Original strand, 36183441 - 36183740
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36183441 agagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 36183540  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  36183541 agagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagt 36183640  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 315  Q
    | ||||||||| || | | |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36183641 tggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgtcgtc 36183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 8180770 - 8181060
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  8180770 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaaga 8180869  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||||||  || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8180870 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 8180969  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8180970 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 4807586 - 4807880
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  4807586 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaaga 4807684  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||||||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4807685 agagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagt 4807784  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||  ||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4807785 tggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451645
Alignment:
Q  47 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 146  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  147 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 246  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  247 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 451645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18424669 - 18424378
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  18424669 agagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaaga 18424570  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||  ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||    
T  18424569 agattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagt 18424470  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18424469 ttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7326388 - 7326157
Alignment:
Q  80 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||  || |||||| |||     
T  7326388 catgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactatta 7326289  T
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  7326288 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccac 7326189  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7326188 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 83 - 311
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029872
Alignment:
Q  83 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 182  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca------tgtagccgatcc 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  277 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 39029872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 309
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508961
Alignment:
Q  97 cgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa 196  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  197 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  297 ggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  133 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg-gt 231  Q
    | |||  || |||||||||| |||| |||||   || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  232 ttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 282
Target Start/End: Original strand, 23997630 - 23997858
Alignment:
Q  42 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||    
T  23997630 tagaaaatttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 23997729  T
Q  142 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 241  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  23997730 ggttaaaagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaa 23997817  T
Q  242 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||| |||| || |||||    
T  23997818 acactatggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 311
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643233
Alignment:
Q  143 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 242  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  243 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 35643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 308
Target Start/End: Original strand, 31959635 - 31959803
Alignment:
Q  140 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 239  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31959635 caggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  240 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 184 - 311
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306317
Alignment:
Q  184 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  284 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgttgt 30306317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 206 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635320
Alignment:
Q  206 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  306 tgttgt 311  Q
    ||||||    
T  3635325 tgttgt 3635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 311
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227474
Alignment:
Q  197 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  297 ggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||    
T  227460 ggttgttgttgttgt 227474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||| | |  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6238014 - 6237750
Alignment:
Q  47 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 146  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || || |    
T  6238014 aagttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtca 6237915  T
Q  147 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 246  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  6237914 aaagaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacact 6237815  T
Q  247 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||  || |||||||| || ||| ||| || ||||| ||  | || ||||  |||||||||||||    
T  6237814 atgggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttgt 6237750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 12141544 - 12141829
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||| | || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  12141544 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | || ||| | |  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaa 12141743  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | || | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  12141744 tatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttgt 12141829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496151
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| || || |    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgttgt 9496151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996623
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccac 9996655  T
Q  280 ttagt---gtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9996654 ttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16097270 - 16097192
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtaga 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16097270 tgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328367
Alignment:
Q  187 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaag--gatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  287 gataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgttgt 38328367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 38434941 - 38435234
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga-tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  || ||| | |||||| |||||||||  |||||| |  | |||||    
T  38434941 agagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaag 38435040  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
     |||| |||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||| ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||| |    
T  38435041 gagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtg 38435140  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    || |||| |||| |||||| |||| ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38435141 ttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12882173 - 12882042
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | ||||||||||||||||| | |  ||    
T  12882173 gagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcac 12882074  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12882073 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751944
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   || ||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||| | |   |||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | || | ||| ||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |  |||||||  || || |||  ||||||||||||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgt 43751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025779
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15025779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573127
Alignment:
Q  150 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 249  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  250 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43573127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 194 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  294 cttggttgttgt 305  Q
    ||||||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 309
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||| |  |||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  283 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttaga----catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| |     |||| |||||||||||| | || |   || ||||| |||| |    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  122 gatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatc 221  Q
    ||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||||||| |||  ||||| |   ||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  222 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 43238377 - 43238305
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  43238377 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531597
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 9531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437718
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||  |||| ||   |||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  124 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 223  Q
    | | ||||||  ||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| || |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||||| ||   |    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaa 44437806  T
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44437805 aacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44437718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 224 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520060
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474927
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670753
Alignment:
Q  238 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17670753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863517
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867849
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 224 - 309
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872750
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287706
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
      |||||||| ||||||| |  | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttgt 33287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35755376 - 35755242
Alignment:
Q  181 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga----gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc 276  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||||||| |||||| ||    
T  35755376 agaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccc 35755277  T
Q  277 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35755276 tacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 35755242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Original strand, 13149460 - 13149612
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    ||||||||||  || |||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  13149460 tagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacat 13149559  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  13149560 aatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  211 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 292
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545671
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  ||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcac 41545658  T
Q  280 ttagtgtgataat 292  Q
    ||| || ||||||    
T  41545659 ttaatgagataat 41545671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8197669 - 8197538
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8197669 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8197570  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8197569 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8197538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8202429 - 8202298
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8202429 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8202330  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8202329 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8202298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832383
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgt 43832383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12489940 - 12489799
Alignment:
Q  170 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||||||| |||||| || | || |||||| |||||||    
T  12489940 aaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtag 12489841  T
Q  270 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12489840 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12489799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429332
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 311
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626357
Alignment:
Q  238 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 305
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078008
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgag--ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |||||||||||| | ||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  292 tgcttggttgttgt 305  Q
     |||||||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 311
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219250
Alignment:
Q  187 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 286  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || || ||||      
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttg 6219225  T
Q  287 gataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6219226 gataaggcttggttgttattgttgt 6219250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 308
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag---aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334187
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9556650 - 9556366
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||    
T  9556650 ggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatc 9556552  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | |||||| | |  ||   ||  ||||| | ||||||| ||   ||||| ||  || |||| ||||  |||||| ||| | | |||||||| |||| | |    
T  9556551 agatggaggatagtcaaactactagaggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaaga 9556452  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| |||||||||| || |   | ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9556451 tatggtttatgatagaacattagggtgtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttgt 9556366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 311
Target Start/End: Original strand, 15015149 - 15015230
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  15015149 gtttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgt 15015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 304
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504502
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481439
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 3481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443907
Alignment:
Q  221 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 270
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 270  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 42543440 - 42543520
Alignment:
Q  231 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42543440 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42543520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 63
Target Start/End: Original strand, 227312 - 227359
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 63  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  227312 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatag 227359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 4598854 - 4598775
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | || ||| ||||| |||| |||||||    
T  4598854 agagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549834
Alignment:
Q  228 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 42549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 311
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384754
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 25384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 624764 - 624687
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  624764 gtttttgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598569
Alignment:
Q  232 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 301  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5759076 - 5758995
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5759076 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560803
Alignment:
Q  262 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 8560803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10516802 - 10516749
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10516802 atttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 315
Target Start/End: Original strand, 17581643 - 17581748
Alignment:
Q  210 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  310 gtcgtc 315  Q
    ||||||    
T  17581743 gtcgtc 17581748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12470978 - 12470894
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || |||| | ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12470978 atggtttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 12470894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775842
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgt 15775842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23714542 - 23714474
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23714542 gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24102214 - 24102146
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  24102214 gggtagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960210
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||| |||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 309
Target Start/End: Original strand, 32402667 - 32402783
Alignment:
Q  193 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 292  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||     
T  32402667 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T
Q  293 gcttggttgttgttgtt 309  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32402767 acttggctgttgttgtt 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 33393319 - 33393394
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33393319 tgatagaaca-tatgtcatagtttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttgt 33393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470124
Alignment:
Q  152 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 251  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  252 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg----cttggttgttgttgttgtcg 313  Q
     |  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggctctctcggttgttgttgttgtcg 37470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 210 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  210 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 3481134 - 3481248
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | |||     
T  3481134 agagggaattggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaagg 3481230  T
Q  116 agagaagatcaaatggag 133  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3481231 agagtagatcagatggag 3481248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Original strand, 14444899 - 14444954
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14444899 tttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14444954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887065
Alignment:
Q  234 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat-gcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4682291 - 4682253
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4682291 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 14197279 - 14197205
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14197279 gatagagcattatgacatcgtttgattcatgtacccgacctcacttactggggtaatgcttggttgttgttgttg 14197205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33594354 - 33594272
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgat-ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33594354 atggttttggatagaacactatgatgtcgtttgactcatgtagtcgatccccacttaatgtgataaagctttgttgttgttgt 33594272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616910
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactat 36616910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860243
Alignment:
Q  18 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412764
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 69  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttag 11412764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Original strand, 14530532 - 14530565
Alignment:
Q  278 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14530532 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 14530565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 284
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225039
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 284  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 306
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  242 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 69
Target Start/End: Original strand, 786833 - 786873
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  786833 gtagcacctatagtagaaaagatggcagaaactagacttag 786873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720438
Alignment:
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 285  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 3720438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 6218967 - 6219031
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 90  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||    
T  6218967 ggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 285
Target Start/End: Original strand, 9078792 - 9078836
Alignment:
Q  241 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 285  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9078792 aacattatgacatcatatgatccatgtagccgagcccacttagtg 9078836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9578995 - 9578915
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||| | |||||  ||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  9578995 agagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  39 tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 155)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27450480 - 27450180
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27450480 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgcc 27450381  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27450380 gttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagagg 27450281  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  27450280 tcaatgagttggatccaaatat-gattttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgtt 27450182  T
Q  307 gt 308  Q
    ||    
T  27450181 gt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 436219 - 436514
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  436219 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaaga 436318  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  436319 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagt 436418  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  436419 tgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 436514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 52569807 - 52569512
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  52569807 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 52569708  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52569707 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 52569608  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52569607 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 52569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31960106 - 31959814
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31960106 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 31960007  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31960006 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagt 31959907  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31959906 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48174385 - 48174090
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48174385 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 48174286  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48174285 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 48174186  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48174185 tggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 48622844 - 48622543
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  48622844 gacaccattagagagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgcc 48622745  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || ||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48622744 gtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagagg 48622645  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48622644 tcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 48622545  T
Q  307 gt 308  Q
    ||    
T  48622544 gt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33191140 - 33190846
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33191140 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaaga 33191041  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    || | |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33191040 agggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 33190941  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33190940 tgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttg 33190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 309
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  45 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 144  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  145 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  245 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 56375280 - 56375573
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  56375280 agagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 56375379  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  56375380 agagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagt 56375479  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  56375480 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 4440843 - 4441138
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  4440843 agagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaaga 4440942  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4440943 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 4441042  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| || || ||||||||    
T  4441043 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgt 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 33227199 - 33227494
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  33227199 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaaga 33227298  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33227299 agagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 33227398  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  33227399 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgt 33227494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1777295 - 1777016
Alignment:
Q  30 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  1777295 tagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaat 1777196  T
Q  130 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 229  Q
    |||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1777195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 1777096  T
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    || | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1777095 gtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 43433914 - 43434209
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43433914 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 43434013  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  43434014 agagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagt 43434113  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
      ||||||||| || | |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43434114 cggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 53707786 - 53708079
Alignment:
Q  18 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 117  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53707786 agagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaag 53707885  T
Q  118 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 217  Q
    || | ||||||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  53707886 agtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 53707985  T
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  53707986 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 53708079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 37797842 - 37798136
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||    
T  37797842 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaaga 37797941  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  37797942 agagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagaggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagt 37798040  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37798041 tgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgt 37798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39100836 - 39100533
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| |     
T  39100836 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc- 39100738  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39100737 gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggagg 39100638  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| | | || | |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39100637 tcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39100538  T
Q  307 gttgt 311  Q
    |||||    
T  39100537 gttgt 39100533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 27983190 - 27983476
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27983190 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagg-------cttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaaga 27983282  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  27983283 agagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaat 27983382  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    | |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27983383 tggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23906587 - 23906297
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||    
T  23906587 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaaga 23906490  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||| |||||||| |||  || ||||||| ||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23906489 agagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 23906390  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23906389 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 311
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286724
Alignment:
Q  50 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 149  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  150 ga--------ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 241  Q
    ||        |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  242 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 8286724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037506
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatg-tagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaag 26037699  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26037698 aagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgag 26037599  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  26037598 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 46583116 - 46582823
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagaccc-gtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||    
T  46583116 agagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaag 46583019  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  46583018 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgag 46582919  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  46582918 ttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 46582823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Original strand, 39708424 - 39708708
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  39708424 gagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaa 39708523  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39708524 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 39708623  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 301  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  39708624 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 28236164 - 28236469
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||  |    
T  28236164 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtc 28236263  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || ||||||||||  |||||||||| | |||| || |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| | ||| ||| ||||||||||    
T  28236264 gtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagagg 28236362  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  28236363 tcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 28236462  T
Q  307 gttgtcg 313  Q
    |||||||    
T  28236463 gttgtcg 28236469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 305
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  18 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  118 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 217  Q
    || | ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37773733 - 37773486
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||| |||||    
T  37773733 ggggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatc 37773634  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    |||||||  |||  ||  |||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  37773633 aaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaga 37773534  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  37773533 tttggtttatgatagaacactatgacataatttgatctatatagccga 37773486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47265494 - 47265193
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac-------ccgtagataccgt 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||       |||||||| ||||    
T  47265494 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgt 47265395  T
Q  109 tgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 208  Q
     |||||||||| |||  |||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47265394 cgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtc 47265295  T
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||    | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  47265294 aatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T
Q  309 tg 310  Q
    ||    
T  47265194 tg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528573
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 21528573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 34 - 282
Target Start/End: Original strand, 50286970 - 50287217
Alignment:
Q  34 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  50286970 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggag 50287069  T
Q  134 aagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 233  Q
     |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || | |    
T  50287070 gagagtcaagttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgt 50287169  T
Q  234 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
     |||||||||||||||    |||||||||||||||| ||| || |||||    
T  50287170 atgatagaacactatg-ggccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 311
Target Start/End: Original strand, 21236953 - 21237143
Alignment:
Q  121 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 220  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21236953 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 21237052  T
Q  221 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21237053 ccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgt 21237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957883
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 6957883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 305
Target Start/End: Original strand, 1793459 - 1793741
Alignment:
Q  25 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 124  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||  || |||  ||| ||||||| || ||||    
T  1793459 gggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagat 1793558  T
Q  125 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatta----gaaaagatttagaggtcaatgagttagat 220  Q
    || |||||| ||    |  | ||||||||||||| |||| ||   ||||| ||  ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1793559 cagatggaggagtcgta--tcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggat 1793656  T
Q  221 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1793657 ccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494948
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12494948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  144 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 243  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  244 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20591591 - 20591353
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||| | |||||  ||| |||||||    
T  20591591 gagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaa 20591493  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| | |||| |||||| |||  || ||    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20591492 gagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 20591397  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 261  Q
     ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20591396 ggattcaaatatgg-ttatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Original strand, 51421730 - 51422013
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||| |||||||||  || || |||||||||| ||||| || ||| | ||| || |||||||||| ||||||   ||  || |||||| |||||    
T  51421730 ggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatc 51421829  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    ||||||||      ||| | ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  51421830 aaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaa 51421929  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51421930 aatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 303
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 303  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 258
Target Start/End: Original strand, 50679588 - 50679736
Alignment:
Q  110 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 209  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50679588 gtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 50679687  T
Q  210 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 258  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  50679688 atgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20601917 - 20601669
Alignment:
Q  37 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| ||    
T  20601917 tatagtagaaaagttggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggag 20601818  T
Q  137 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 236  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||    
T  20601817 agtcaggtcaaaagaggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatg 20601724  T
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| |||||| | || || |||||||| |||||    
T  20601723 atagaacattatgacgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41009641 - 41009414
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggt-agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  || ||| | || ||||||    
T  41009641 gagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaaga 41009542  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    | |  |||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||     
T  41009541 aaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgaga 41009443  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009442 tggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 307
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  144 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 243  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  244 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45205131 - 45204837
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt--agatgatttagacatgtagagagaagacccgtag-------ataccgttgtaag 114  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||   || |||||||||||||| ||||       ||   |||||| |    
T  45205131 tgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacg 45205032  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| | || | ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| ||    
T  45205031 aagagtagatcagatggaggagagc-agatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataag 45204933  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||| || | | | |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45204932 ttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45204837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821001
Alignment:
Q  60 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 159  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || || |||| | |||||| |||| ||| | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  160 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata----gaacactatgacatca 255  Q
    |||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    |||||||||  ||| |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttgt 20821001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154860
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  298 gttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttgt 19154860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 311
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969466
Alignment:
Q  203 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  303 tgttgttgt 311  Q
    |||||||||    
T  19969458 tgttgttgt 19969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 265
Target Start/End: Original strand, 16002933 - 16003165
Alignment:
Q  32 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 131  Q
    |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||| ||||    
T  16002933 gcacctatggtataaaagttgatagaaaatagtcttagatggttga-acatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatgg 16003031  T
Q  132 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 231  Q
    |  | |   | || ||||||  |||||||| | |  | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  16003032 atgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 16003131  T
Q  232 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    || ||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  16003132 ttatgataaaacactatgacgtaatttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 311
Target Start/End: Original strand, 35690391 - 35690556
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  35690391 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacat 35690490  T
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35690491 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgt 35690556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008031
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgttgt 55008031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550455
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||| || || ||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccac 28550484  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28550483 ttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043357
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||| || || ||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccac 31043325  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  31043326 ttagtgcaataaagcttagttattgttgttgt 31043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 309
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  84 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 183  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||  ||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  184 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 283  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  284 tgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 220 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883357
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttgt 883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1211683 - 1211389
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga--cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||| |  |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||  || |||||    
T  1211683 gagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaag 1211584  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||||||  || || ||| ||  || |||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1211583 aagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaaaaatt-agaggtcaatgag 1211485  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat-catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || |||||  || |||||| | ||||||||||| | | |  ||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  1211484 ttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgt 1211389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31961394 - 31961263
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||    
T  31961394 gagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcac 31961295  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961294 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31961263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061932
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 19061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939733
Alignment:
Q  233 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 233
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  147 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 233  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 53518483 - 53518325
Alignment:
Q  148 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 247  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||| ||  || |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  53518483 aagaggtagaggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacacta 53518384  T
Q  248 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    || | | |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||   || |||||||||||    
T  53518383 tggcgtaatttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589357
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||  | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  2589355 tgt 2589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 12494740 - 12494794
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 70  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12494740 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575109
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||   | |||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25575092 cttggttgttgttgttgt 25575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 56225236 - 56225353
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  56225236 aaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataagg 56225335  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
     | |||||||||||||||    
T  56225336 atcggttgttgttgttgt 56225353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805262
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgt 13805262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459279
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |   | |||||||||||| |||| || |||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  283 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 31459279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 199 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208266
Alignment:
Q  199 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||| ||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  299 ttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttgt 34208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633403
Alignment:
Q  232 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 41192826 - 41192913
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192826 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238612
Alignment:
Q  244 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238698
Alignment:
Q  244 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 305
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024846
Alignment:
Q  170 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| ||||   | |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  270 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgctgtc 26024846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 35555928 - 35555859
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  35555928 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 37042792 - 37042667
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| || ||    
T  37042792 gagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgac 37042693  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37042692 ttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869876
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 50869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958236
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttgt 6958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066496
Alignment:
Q  231 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7066496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634103
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30634103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438730
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51438730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388213
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||   | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  294 cttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||    
T  55388225 cttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 37488245 - 37488376
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||   || ||    
T  37488245 gagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccac 37488344  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37488345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 37488376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047553
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  44047640 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45209257 - 45209202
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45209257 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 308
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Original strand, 54470197 - 54470276
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  54470197 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306581
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||| ||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  5306579 tgt 5306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Original strand, 31459032 - 31459098
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  31459032 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 308
Target Start/End: Original strand, 46372024 - 46372306
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| || |||   ||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||| |||||    
T  46372024 ggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatc 46372123  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | || |||  || |||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |    
T  46372124 agatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaaga 46372223  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
     |||||||||||||||||||  |  | || |||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  46372224 catggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540575
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttgt 53540575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 311
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153993
Alignment:
Q  258 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 46153993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328611
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 29399001 - 29399089
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29399001 aaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 29399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35622757 - 35622673
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35622757 atggtttttgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 35622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42285784 - 42285700
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| | || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  42285784 atggtttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttgt 42285700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 309
Target Start/End: Original strand, 44360289 - 44360369
Alignment:
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  44360289 ggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 260 - 312
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130456
Alignment:
Q  260 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 56130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 309
Target Start/End: Original strand, 41192229 - 41192344
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||| |||| | || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||| |    
T  41192229 aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataagg 41192328  T
Q  294 cttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||    
T  41192329 cttggttgttgttgtt 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44719413 - 44719358
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44719413 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 44719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  150 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 237  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Original strand, 2588991 - 2589056
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2588991 ggggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 309
Target Start/End: Original strand, 15665330 - 15665384
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15665330 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729509
Alignment:
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 41729509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285882
Alignment:
Q  36 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| || ||| | || || ||||||| ||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatca 42285882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42293416 - 42293262
Alignment:
Q  157 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 256  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||  | ||||||| | ||||||| || || || |||||    
T  42293416 aggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcat 42293317  T
Q  257 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||| |||||||||  || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  42293316 ttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgt 42293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 225 - 311
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935434
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttgt 54935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 230 - 307
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31897509 - 31897428
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31897509 atggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879106
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttgt 4879106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15661925 - 15661869
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  15661925 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgt 15661869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105515
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  20105603 aaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgt 20105515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30621486 - 30621418
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  30621486 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339844
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32339844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34233123 - 34233031
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 301  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||    
T  34233123 aatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009283
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 42639301 - 42639233
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  42639301 gggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 303  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 306
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 306
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799657
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Original strand, 44360077 - 44360155
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  44360077 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 51252753 - 51252674
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || | | | ||||||||||||||||    
T  51252753 agagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 10209034 - 10209104
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||| || ||| | ||||||| |||||||||    
T  10209034 ggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaacttagttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 17900480 - 17900550
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  || ||| | || ||||||||||||||    
T  17900480 ggggtagcacctatagtagaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 94
Target Start/End: Original strand, 33709914 - 33709992
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  33709914 agagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 270
Target Start/End: Original strand, 36198977 - 36199059
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 270  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  36198977 attagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 130
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680844
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta-gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 130  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatg 50680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 50967081 - 50967027
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  50967081 atttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 55768783 - 55768717
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55768783 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 55833039 - 55832973
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55833039 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3601449 - 3601416
Alignment:
Q  278 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3601449 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284421
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 10209237 - 10209319
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10209237 atggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttgt 10209319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10775550 - 10775468
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10775550 atggtttttgatagaacact--gacattgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 10775468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 249
Target Start/End: Original strand, 26510558 - 26510611
Alignment:
Q  196 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 249  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510558 agatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497596
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || |||||     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  116 agagaagatcaaatggag 133  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  28497579 agagtagatcagatggag 28497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 36557321 - 36557268
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 69  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557321 agagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag 36557268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7544584 - 7544528
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  7544584 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgtcgttattgt 7544528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 270
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486165
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 270  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30621329 - 30621241
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||    
T  30621329 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 30662106 - 30662042
Alignment:
Q  245 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30662106 ctatgacatcatttaatccaagtggctgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 30662042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35555731 - 35555647
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  35555731 atggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttgt 35555647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36556841 - 36556757
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  36556841 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 36556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40932997 - 40932921
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40932997 tgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttgt 40932921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45184214 - 45184130
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  45184214 atggtttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgttattgt 45184130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 92
Target Start/End: Original strand, 45423617 - 45423681
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 92  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  || ||| |||||||||| ||||    
T  45423617 ggtagcacctataatagaaaagatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 46236719 - 46236771
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  46236719 tttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963735
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttgt 54963735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 290
Target Start/End: Original strand, 55579200 - 55579295
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 290  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||  ||| | ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  55579200 aaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42854296 - 42854001
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42854296 agagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 42854197  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854196 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 42854097  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  42854096 tggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgt 42854001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 36545139 - 36545434
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  36545139 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 36545238  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| | |  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36545239 agagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 36545338  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36545339 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 36545434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11524016 - 11523720
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11524016 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaag 11523917  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11523916 aagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 11523817  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11523816 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11523720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 40813314 - 40813609
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  40813314 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaaga 40813413  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40813414 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagt 40813513  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40813514 tggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgt 40813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36565533 - 36565239
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  36565533 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaaga 36565434  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    || | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36565433 agggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 36565334  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36565333 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 36565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  128 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 227  Q
    ||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  228 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 305
Target Start/End: Original strand, 8932683 - 8932982
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt-agatac 105  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| | || |    
T  8932683 gacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaaatgc 8932782  T
Q  106 cgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagag 205  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8932783 cattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttaaag 8932882  T
Q  206 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    || |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  8932883 gttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagcttggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469724
Alignment:
Q  100 agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagat 199  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  200 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  300 tgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttgt 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36395242 - 36394949
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  36395242 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaag 36395143  T
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36395142 aagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgag 36395043  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacacta---tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||   || |||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36395042 ttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcat--tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Original strand, 18125154 - 18125454
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18125154 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgcc 18125253  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || ||||||| || ||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |    
T  18125254 gtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaag 18125352  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||   | |||||||| |||||| | | || |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18125353 tcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgtt 18125451  T
Q  307 gtt 309  Q
    |||    
T  18125452 gtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 260
Target Start/End: Original strand, 39946855 - 39947091
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  39946855 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtaga 39946954  T
Q  124 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 223  Q
    |||||||||| |||  || |||| ||||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  39946955 tcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatcca 39947054  T
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 260  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||    
T  39947055 aatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 57 - 311
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121430
Alignment:
Q  57 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 156  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  157 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 256  Q
    ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  257 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21121377 ttgat-catgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 21121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 291
Target Start/End: Original strand, 2796547 - 2796818
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    | |||||| || ||||||||    
T  2796547 agagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaaga 2796642  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2796643 agagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagt 2796742  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  2796743 tgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742079
Alignment:
Q  153 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 252  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |     
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  253 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14742079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  46 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 145  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  246 tatgacatcatttgatccat 265  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 127 - 311
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027815
Alignment:
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2027815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 37077768 - 37078034
Alignment:
Q  41 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  37077768 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 37077865  T
Q  141 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 240  Q
     ||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    |||||    
T  37077866 gggtcaaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatag 37077965  T
Q  241 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||  |||| | |||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  37077966 aacac--tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttgt 37078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8879732 - 8879446
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    | |||| ||||||    
T  8879732 agagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaaga 8879637  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    ||||  ||||| |||||| ||   | |||  |||||| | |||| |||  || |||||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||    
T  8879636 agagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagt 8879537  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | |||| ||||||||||||||  | ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  8879536 tgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 84 - 304
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  84 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 183  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||             
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaac--------- 12025937  T
Q  184 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga---catcatttgatccatgtagccgatccaact 280  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025938 ---cattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  281 tagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    |||||  |||| | ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 308
Target Start/End: Original strand, 45419218 - 45419517
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||  |     
T  45419218 gacaccattagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc- 45419316  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
     | ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| |   |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |      
T  45419317 -tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatc 45419415  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
      |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45419416 ataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 45419515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 187 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215409
Alignment:
Q  187 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 286  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||      
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  287 gataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgttgt 15215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473402
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 196 - 308
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529507
Alignment:
Q  196 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  296 tggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||    
T  44529495 tggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 7 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 18752176 - 18751996
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||    
T  18752176 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag-cttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgcc 18752078  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 188  Q
    ||||| | |||||  ||||||||||| || |   || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||    
T  18752077 gttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 199 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047529
Alignment:
Q  199 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  299 ttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgt 44047529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25289045
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||    
T  25289018 ctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300380
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
     |||||  | || ||||||| |||||||    
T  25300353 ctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490620
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||||||||||||    
T  490603 cttgtttgttgttgttgt 490620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Original strand, 29520803 - 29520931
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |     
T  29520803 gagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccat 29520902  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520903 ttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35643765 - 35643605
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  35643765 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacact-- 35643668  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643667 gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 35643605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041315
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 30559847 - 30559983
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta-----gccgat 274  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     |||||     
T  30559847 gagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgac 30559946  T
Q  275 ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30559947 cccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 311
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931245
Alignment:
Q  35 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 134  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||| |||| | |  ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||     
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  135 agaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt 234  Q
    | |  ||  | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | ||||||||| |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgt 32931245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 12796980 - 12796894
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  12796980 ggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagactcgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 308
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
        | ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6510707 - 6510617
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagag 119  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  6510707 gtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagag 6510617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39967551 - 39967497
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39967551 tttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39953556 - 39953263
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||  | |||   || |||||     
T  39953556 agagagagttgggatagcacctatatgagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaagg 39953457  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||| ||| ||  ||| ||| | |  |||||||| || ||| ||| |||||| |   ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||    
T  39953456 agagtagatcagatgaaggcgaatcagatcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagt 39953357  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||   ||| |||||||||||| | ||||||||   |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39953356 tagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584643
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||      
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42584626 cttgattgttgttgttgt 42584643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga---cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||     ||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||   || |||||||||  |||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | |||||| | |  ||  ||| |||||||| ||||||| |||  || || ||  |||||||  |||  | |||||||||| | |||||||| |||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556299
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgt 27556299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 314
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690023
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 314  Q
    |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttgtcgt 30690023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914601
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  || | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031417
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031523
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255528
Alignment:
Q  219 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 8255528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169676
Alignment:
Q  148 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 247  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  248 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||   | |||| |||||| || || | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtg-gataaggcttggttgatgttgttgt 28169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928585
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668495
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10668495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425331
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||  |    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatgg 21425313  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21425314 cttggttattgttgttgt 21425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 310
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492318
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T
Q  309 tg 310  Q
    ||    
T  23492317 tg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042486
Alignment:
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgt 36042486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459177
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaa 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||  || |    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccca 14459148  T
Q  279 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  14459149 ctttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716107
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgct 295  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||| |||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  296 tggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgt 31716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 32043580 - 32043872
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| || |||   || |||||     
T  32043580 agagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaaactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaagg 32043679  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||  |||||| ||||||  |   ||  | |  |||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| || |  || ||| || || |||||||||    
T  32043680 agaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagt 32043779  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||   | | ||||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32043780 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtttgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 32043872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276970
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 32276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569707
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 32569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 307
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812814
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7531725 - 7531641
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7531725 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttcttgt 7531641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611779
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 67
Target Start/End: Original strand, 25985500 - 25985560
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 67  Q
    |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25985500 gacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 25985560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324057
Alignment:
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35324057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362651
Alignment:
Q  155 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 254  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||| | |     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  35362703 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 191 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41444456 - 41444336
Alignment:
Q  191 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 290  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || | |||||| |||||||||| | || ||||| ||  |||    
T  41444456 agaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaata 41444357  T
Q  291 atgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41444356 atgcttggtcgttgttgttgt 41444336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 230 - 310
Target Start/End: Original strand, 43733410 - 43733490
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  43733410 gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 305
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776434
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824187
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgttg 10824187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Original strand, 16351578 - 16351653
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 302  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  16351578 atggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 308
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363768
Alignment:
Q  193 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 292  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    | ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||     
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  293 gcttggttgttgttgt 308  Q
     |||||||||||||||    
T  26363753 acttggttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30198365 - 30198262
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | ||||   |  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30198365 aatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T
Q  309 tgtc 312  Q
    ||||    
T  30198265 tgtc 30198262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 311
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065005
Alignment:
Q  261 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985839
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta 25985839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 304
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212149
Alignment:
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta--gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttgtc 41212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518400
Alignment:
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Original strand, 9695631 - 9695708
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||||||    
T  9695631 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 311
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921504
Alignment:
Q  258 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 16921504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646930
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 133
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143472
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||  ||||| | || ||| | |||| |||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaa 36143466  T
Q  128 atggag 133  Q
    ||||||    
T  36143467 atggag 36143472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901815
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttgtc 38901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103326
Alignment:
Q  30 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat 82  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttaggtgttttagacat 7103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978159
Alignment:
Q  267 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 306
Target Start/End: Original strand, 16917352 - 16917462
Alignment:
Q  195 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 294  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||  |    
T  16917352 aagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagac 16917450  T
Q  295 ttggttgttgtt 306  Q
    |||||| |||||    
T  16917451 ttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Original strand, 25439479 - 25439530
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 231  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25439479 gagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  155 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 254  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |||||| || || | |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||| | |     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaactta 282  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39651081 - 39651026
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39651081 atttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Original strand, 1313773 - 1313843
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| |||| | | |||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313773 tgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11130004 - 11129951
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11130004 tttgatccatgtagccta-ccaacttaatgagataatacttggttgttgttgttg 11129951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgat--agaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 68
Target Start/End: Original strand, 13986494 - 13986536
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  13986494 ggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 14903744 - 14903846
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  | || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14903744 aatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  14903844 tgt 14903846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 213 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 307
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  198 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 297  Q
    |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| | || ||||| ||  ||||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  298 gttgttgttg 307  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||| ||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  257 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Original strand, 4955345 - 4955473
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||| ||| | ||| |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||  ||    
T  4955345 gagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtagtcgatctcac 4955444  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4955445 ttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985975
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 12985975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 225 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30456377 - 30456329
Alignment:
Q  225 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  30456377 atattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 30456488 - 30456452
Alignment:
Q  32 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30456488 gcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactta 30456452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783077
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattat 30783102  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||    
T  30783101 gaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085134
Alignment:
Q  259 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttgt 35085134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982893
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40982893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42493514 - 42493426
Alignment:
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| | || | |||||  || || |||||||||||| |||||||    
T  42493514 aatatggtatttaatagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttgtc 42493426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44681319 - 44681251
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  44681319 ggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45512654 - 45512558
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaaca 244  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45512654 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45512777 - 45512709
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||| ||| | ||| || ||||||||    
T  45512777 ggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5258440 - 5258145
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5258440 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaaga 5258341  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  5258340 agagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagc 5258241  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5258240 tagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgt 5258145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 28085366 - 28085661
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||  || ||||||    
T  28085366 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaaga 28085465  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28085466 agagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 28085565  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28085566 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 24 - 305
Target Start/End: Original strand, 30031254 - 30031535
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  30031254 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtaga 30031353  T
Q  124 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 223  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |    
T  30031354 tcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattta 30031453  T
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30031454 aatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 32755911 - 32756206
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||  |||  |||||    
T  32755911 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataaga 32756010  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756011 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 32756110  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    
T  32756111 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttgt 32756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21352129 - 21351872
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| |||    
T  21352129 agagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttaga 21352030  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||  ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21352029 agaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagc 21351930  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  21351929 tggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 27 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35043722 - 35043441
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  35043722 gggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatca 35043623  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
    ||||||  |||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  35043622 aatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaat 35043523  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  35043522 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 608138 - 608442
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  608138 gacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcc 608237  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaa----gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagattta 202  Q
     ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  608238 tttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagattta 608337  T
Q  203 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 302  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||    
T  608338 gagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgt 608437  T
Q  303 tgttg 307  Q
    |||||    
T  608438 tgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 5631812 - 5632064
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  5631812 agagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaaga 5631911  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    | || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||  | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631912 atagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 5632011  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5632012 tggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 9706766 - 9707052
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||      ||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  9706766 agagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt------gtagagagaagacccatagaagccgttgttaga 9706859  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||    
T  9706860 agagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagt 9706959  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9706960 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20427928 - 20427633
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20427928 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaaga 20427829  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| | ||||||| |||  ||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20427828 agagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagt 20427730  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg-cttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20427729 tggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgt 20427633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Original strand, 12890575 - 12890860
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||         ||| ||||| |||| |||||||    
T  12890575 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------cccatagatgccgtcgtaagaa 12890665  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| |||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12890666 gagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagacgtcaatgagtt 12890765  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12890766 agatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12890860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 311
Target Start/End: Original strand, 14030805 - 14031080
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||    
T  14030805 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtaga 14030904  T
Q  124 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 223  Q
    |||||| | | |||  | | |||||||||||||||||||| ||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14030905 tcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatcca 14030992  T
Q  224 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14030993 aatatgatttttgatagaatactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 14031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 310
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  37 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  137 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 236  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||          || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10100160 - 10099993
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10100160 gacaccattagagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgcc 10100061  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 174  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100060 gttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 10099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143762
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156378
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  127 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33497062 aatgaaggagt--caagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206456
Alignment:
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  289 taatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgt 3206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9593988 - 9593709
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||    
T  9593988 ggggtagcaccattagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatc 9593889  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | |||||| |||  ||  |   |||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| ||    
T  9593888 agatggaggagagtcaaat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaa 9593791  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9593790 tatggtttatgatagaacattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 199 - 311
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819116
Alignment:
Q  199 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  299 ttgttgttgttgt 311  Q
    |||| ||||||||    
T  31819104 ttgtggttgttgt 31819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934830
Alignment:
Q  197 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  297 ggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||    
T  34934841 ggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  91 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 190  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  191 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
      |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 7133800 - 7133923
Alignment:
Q  80 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7133800 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7133899  T
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttag 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7133900 gagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 7136723 - 7136846
Alignment:
Q  80 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7136723 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7136822  T
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttag 203  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7136823 gagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 308
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  32 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 131  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  132 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 231  Q
    || |||  || || |||||||||      ||| |||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  232 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    || | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 308
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  148 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 247  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |   |||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  248 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789071
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 30789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28027108 - 28026896
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| || ||| |||||| | || ||| |||||| | |||    
T  28027108 ggggtagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatc 28027010  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    | |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  || ||||    
T  28027009 agatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaa 28026910  T
Q  226 tatggtttttgata 239  Q
    |||||||| |||||    
T  28026909 tatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098893
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| || ||    
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgttgt 10098893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34502
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | | | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 34502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245869
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgt 4245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 310
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 287  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  288 ataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818813
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 31818784  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||    
T  31818785 ttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 273
Target Start/End: Original strand, 24665965 - 24666058
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24665965 gagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6055933 - 6055806
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||     
T  6055933 aaaaaaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 6055834  T
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||    
T  6055833 tacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 306
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  187 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 286  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  | | |||||  ||| |||||||| || ||||||||     
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  287 gataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119642
Alignment:
Q  222 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615223
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  34 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 579615 - 579703
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| |||  ||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  579615 aaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 33084048 - 33084128
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  33084048 agagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 12133973 - 12133901
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12133973 atagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgtt 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9109582 - 9109507
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9109582 tgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttg 9109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6293491 - 6293389
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||| || | |||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  6293491 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgt 6293392  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  6293391 tgt 6293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 267  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 305
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39056
Alignment:
Q  231 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 39056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 309
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||  | ||| |||| ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 94
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 24 - 59
Target Start/End: Original strand, 5080853 - 5080888
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 59  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5080853 tgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 257 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6906878 - 6906819
Alignment:
Q  257 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 316  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  6906878 ttgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataagactttgatgttgttgtcgtcgtct 6906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 305
Target Start/End: Original strand, 21089606 - 21089676
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21089606 tgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3127306 - 3127273
Alignment:
Q  278 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3127306 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4878327 - 4878294
Alignment:
Q  278 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4878327 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 4878294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 6641691 - 6641650
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6641691 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 6641650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 89
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 89  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 311
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568983
Alignment:
Q  211 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| | | ||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14389447 - 14389380
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||  | |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14389447 ggtagcacctatcgtagaaaagatggtggaaacaa-acttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 30642998 - 30643054
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  30642998 atttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttgt 30643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 104)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 301
Target Start/End: Original strand, 38684957 - 38685242
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  38684957 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 38685056  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38685057 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 38685156  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 301  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  38685157 tggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 3301834 - 3302126
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3301834 agagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttaga 3301933  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3301934 agaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagt 3302033  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3302034 tggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 4496374 - 4496669
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4496374 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4496473  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4496474 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 4496573  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4496574 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4496669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16347670 - 16347380
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  16347670 agagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaaga 16347571  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16347570 agagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatt 16347471  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16347470 tggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12492679 - 12492381
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcaccta---tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgta 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  12492679 agagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgtta 12492580  T
Q  113 agaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatg 212  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12492579 agaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatg 12492480  T
Q  213 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12492479 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28977160 - 28976856
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||| || ||    
T  28977160 gacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgcc 28977061  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || |||||||| | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28977060 gtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagg 28976961  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28976960 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 28976861  T
Q  307 gttgt 311  Q
    |||||    
T  28976860 gttgt 28976856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 1287871 - 1287578
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  1287871 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaaga 1287772  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1287771 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 1287672  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    | ||||||||| |||| | |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  1287671 tggatccaaatttggtgtatgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Original strand, 24178500 - 24178793
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24178500 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 24178599  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24178600 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagt 24178699  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    | ||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24178700 tggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 14665704 - 14665997
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14665704 agagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaaga 14665803  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||    
T  14665804 agagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagt 14665903  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665904 tggatccaaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14665997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 307
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  129 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 228  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  229 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    | | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Original strand, 10639314 - 10639587
Alignment:
Q  36 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  10639314 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggagga 10639413  T
Q  136 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 235  Q
    |   || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |    
T  10639414 gt--caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 10639511  T
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10639512 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 10639587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2075766 - 2075475
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  2075766 agagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 2075667  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgag 214  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2075666 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgag 2075567  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    || ||||||||| |||| | |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2075566 ttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Original strand, 1275264 - 1275549
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| |||||    
T  1275264 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatc 1275363  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    |||||||| |||  || ||||| || |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||    
T  1275364 aaatggaggagagtcaagttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaa 1275463  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  1275464 tttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttgt 1275549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 115 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561384
Alignment:
Q  115 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 13561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915493
Alignment:
Q  84 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 183  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  184 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 283  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  284 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgt 2915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 34273017 - 34273297
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||    
T  34273017 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaaga 34273116  T
Q  116 agagaaga-tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 214  Q
    |||| ||| ||||               ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34273117 agaggagagtcaa---------------gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 34273201  T
Q  215 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  34273202 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 311
Target Start/End: Original strand, 14911267 - 14911457
Alignment:
Q  121 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 220  Q
    |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14911267 agatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggat 14911366  T
Q  221 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  14911367 ccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgttcttgt 14911457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 311
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816667
Alignment:
Q  157 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 256  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  257 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29816667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26884979 - 26884686
Alignment:
Q  18 agagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||   || |||||||    
T  26884979 agagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaa 26884880  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| |||||| |||||| |||  | ||| ||||||||||||||| || ||| |||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||     
T  26884879 gagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggatgagctaggaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtc 26884782  T
Q  217 agatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  26884781 ggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgt 26884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 170 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  170 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 269  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  270 ccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 309
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  199 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 298  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  299 ttgttgttgtt 309  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 311
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393161
Alignment:
Q  187 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  287 gataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgttgt 2393161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749542
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||     
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaagg 14749396  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||  ||  | |  | ||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| || |  || ||| ||||| | || ||||    
T  14749397 agagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagt 14749496  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 261  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14749497 tggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 311
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213860
Alignment:
Q  206 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  306 tgttgt 311  Q
    ||||||    
T  30213855 tgttgt 30213860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 309
Target Start/End: Original strand, 28002 - 28165
Alignment:
Q  146 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 245  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28002 aaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacac 28101  T
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || || | |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  28102 tatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  66 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 165  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| | || ||||| |    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  166 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    || || ||| ||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    | || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  266 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 268
Target Start/End: Original strand, 36215489 - 36215730
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 116  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||| | || ||||| |||| || |||| ||  ||||| |||||    
T  36215489 gagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaa 36215588  T
Q  117 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 216  Q
    ||| |||||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||          |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  36215589 gagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag----------gaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaatt 36215678  T
Q  217 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 268  Q
      ||||||| |||  || ||||||||||||||||  | ||||||| ||||||    
T  36215679 gaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276523
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 28276523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 309
Target Start/End: Original strand, 18855799 - 18855890
Alignment:
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18855799 gatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 311
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041041
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  288 ataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgtagttgt 39041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418031
Alignment:
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 288  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  289 taatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||  |||||  ||||||||||||    
T  418053 tatggcttgaatgttgttgttgt 418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442123
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  32442125 tgt 32442123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 277
Target Start/End: Original strand, 32516537 - 32516806
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| | || ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||| |||| ||| || ||  |||||| |     
T  32516537 gacaacattagagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattct 32516636  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || ||| | |||| |||||  ||| || | || ||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||||  ||||||||||     
T  32516637 gtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagaga 32516735  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca 277  Q
    | ||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||| || || ||||||||    
T  32516736 ttaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatcgatataaccgatcca 32516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31636202 - 31636129
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31636202 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgt 31636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 33667216 - 33667286
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  33667216 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43557947 - 43557833
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  43557947 aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagg 43557848  T
Q  294 cttggttgttgttgt 308  Q
    | |||||||||||||    
T  43557847 cctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408492
Alignment:
Q  237 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Original strand, 14667939 - 14668056
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||      
T  14667939 aaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaga 14668038  T
Q  294 cttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14668039 cttggttgtagttgttgt 14668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 296
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235316
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccac 9235299  T
Q  280 ttagtgtgataatgctt 296  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9235300 ttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 310
Target Start/End: Original strand, 11675683 - 11675814
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 278  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| || |    
T  11675683 gagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccca 11675782  T
Q  279 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11675783 cttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 189 - 308
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 288  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  289 taatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367178
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T
Q  309 tgt 311  Q
    |||    
T  20367176 tgt 20367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79620
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || |||||     
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagg 79602  T
Q  116 agagaagatcaaatggag 133  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  79603 agagtcgatcaaatggag 79620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 309
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090696
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 287  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | | |||||||||||||| |||| || | | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  288 ataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 309
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551429
Alignment:
Q  200 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 299  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || || |  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  300 tgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||    
T  36551420 tgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504293
Alignment:
Q  197 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 262  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 308
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 132  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  || | |  || || |||| |||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  133 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 232  Q
    | |||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| || |||  |||| | |||||||| ||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  233 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga-cca--ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Original strand, 6859578 - 6859666
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6859578 aaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgttgt 6859666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 309
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678760
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattat 7678699  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||  |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7678700 gaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411961
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 42199277 - 42199394
Alignment:
Q  15 cagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 114  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||    
T  42199277 cagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaag 42199374  T
Q  115 aagagaagatcaaatggaga 134  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  42199375 gagagtagatcacatggaga 42199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 311
Target Start/End: Original strand, 42576239 - 42576295
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42576239 atttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 303  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8082059 - 8081967
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 304  Q
    |||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8082059 aatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 11002499 - 11002424
Alignment:
Q  230 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11002499 gtttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 309
Target Start/End: Original strand, 2645187 - 2645273
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2645187 aaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10083030 - 10082952
Alignment:
Q  17 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  10083030 gagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 103
Target Start/End: Original strand, 15168791 - 15168869
Alignment:
Q  25 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||| |||| | |||| ||||||    
T  15168791 gggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgagaaatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 309
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132619
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 9121155 - 9121078
Alignment:
Q  231 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9121155 tttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667806
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 69  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttag 14667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 96
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  27 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 291
Target Start/End: Original strand, 30588615 - 30588712
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30588615 aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21193737 - 21193649
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21193737 aaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttgt 21193649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  30 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 227 - 310
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860118
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359259
Alignment:
Q  28 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 127  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  128 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt-agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 226  Q
    |||||| | |  ||  | |  ||||| |||||||   |||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 7359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366262
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Original strand, 2552936 - 2553002
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 246  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552936 gagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Original strand, 2712944 - 2713014
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  2712944 ggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 308
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234168
Alignment:
Q  246 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 17340550 - 17340500
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340550 aaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagaca-tgtagagagaagacccgtagat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 14725675 - 14725803
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca-actt 281  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||||    
T  14725675 aaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgacataattcgatctatgcagtc-atccacactt 14725773  T
Q  282 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14725774 aatatgataagactttgttgttgttgttgt 14725803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 314
Target Start/End: Original strand, 23980127 - 23980232
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||  | | || |||||||| ||||||  ||| || |||||||    
T  23980127 aatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgt 23980226  T
Q  309 tgtcgt 314  Q
    ||||||    
T  23980227 tgtcgt 23980232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 27386569 - 27386622
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27386569 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 234 - 311
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800113
Alignment:
Q  234 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 27800113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 236 - 309
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  236 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 273  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 93
Target Start/End: Original strand, 21952364 - 21952424
Alignment:
Q  33 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaag 93  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  21952364 cacctatagtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41200419 - 41200343
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || | | ||||||||||||    
T  41200419 tgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttgt 41200343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400795
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttg 9400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 228 - 303
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985360
Alignment:
Q  228 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 303  Q
    |||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 309
Target Start/End: Original strand, 38684648 - 38684763
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||  || || ||||||||  |||| |    
T  38684648 aaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaag 38684747  T
Q  294 cttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||    
T  38684748 cttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 209 - 284
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  209 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 284  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 311
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894358
Alignment:
Q  189 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt-------ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactt 281  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||       || ||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  282 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  41894329 agtgggataagactttgttgttgttgttgt 41894358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 270
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 270  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 308
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 311
Target Start/End: Original strand, 4653476 - 4653537
Alignment:
Q  250 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4653476 acataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttgt 4653537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 309
Target Start/End: Original strand, 5303681 - 5303730
Alignment:
Q  260 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5303681 atccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Original strand, 6888993 - 6889062
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 95  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  6888993 ggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9917530 - 9917458
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9917530 tgatagaacagtataacatcgtttga---atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12576974 - 12576861
Alignment:
Q  194 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 293  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||  ||||||||| | ||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| |    
T  12576974 aaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaag 12576875  T
Q  294 cttggttgttgttg 307  Q
    ||||||||||||||    
T  12576874 cttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186782
Alignment:
Q  235 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 232
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200935
Alignment:
Q  183 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 232  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 36200935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  260 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 195 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15588503 - 15588399
Alignment:
Q  195 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 294  Q
    |||||||||||   |||||||| |||  ||| ||||| | ||| |||||| |||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15588503 aagatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggc 15588404  T
Q  295 ttggt 299  Q
    |||||    
T  15588403 ttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36123234 - 36123178
Alignment:
Q  256 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 312  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36123234 tttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtc 36123178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 310
Target Start/End: Original strand, 37065677 - 37065761
Alignment:
Q  227 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  37065677 atggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagcttagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 39322132 - 39322096
Alignment:
Q  255 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 291  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39322132 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 39322096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 149 - 249
Target Start/End: Original strand, 43035104 - 43035204
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  |  ||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||    
T  43035104 agaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattat 43035203  T
Q  249 g 249  Q
    |    
T  43035204 g 43035204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475347
Alignment:
Q  29 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| |  ||  |||||||||||| ||||||   || ||||| |||| |||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  129 tggag 133  Q
    |||||    
T  43475343 tggag 43475347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1249 - 945
Alignment:
Q  7 gacatcatcagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagatacc 106  Q
    |||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1249 gacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtagatgcc 1150  T
Q  107 gttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagagg 206  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1149 gtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagagg 1050  T
Q  207 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1049 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgtt 950  T
Q  307 gttgt 311  Q
    |||||    
T  949 gttgt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 31458 - 31753
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  31458 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaaga 31557  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    |||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31558 agagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 31657  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | ||||||||| |||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31658 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44150 - 44080
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  44150 ggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 82711 - 83000
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || ||||||    
T  82711 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaaga 82810  T
Q  116 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 215  Q
    || | | ||||||||||| |||    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  82811 agggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagaggaagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 82907  T
Q  216 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  82908 tggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 308
Target Start/End: Original strand, 16692 - 16860
Alignment:
Q  140 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 239  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16692 caggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 16791  T
Q  240 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 308  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16792 gaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 86877 - 86606
Alignment:
Q  40 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||      
T  86877 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagt 86778  T
Q  140 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 239  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||| | | |||||    
T  86777 caggttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgata 86678  T
Q  240 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  86677 gaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttgt 86606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 311
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4921
Alignment:
Q  96 ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaa 195  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   || |||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  196 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 295  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  296 tggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgttgt 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4553 - 4277
Alignment:
Q  26 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||| | |||||||| ||||||| ||||||  | || |||||||||| |||||    
T  4553 ggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatc 4454  T
Q  126 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 225  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||||| |||||          ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||    
T  4453 aaatggaggagaatcaagttaaaagaggtataggaa----------aactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaa 4364  T
Q  226 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  || | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4363 tttggtttataatagaacactatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25529
Alignment:
Q  154 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 253  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  254 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 25737 - 25683
Alignment:
Q  16 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 70  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25737 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11546
Alignment:
Q  68 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 167  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||| |||||||||| ||| | |||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  168 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 267  Q
     |||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  268 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttgt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11880 - 11810
Alignment:
Q  24 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11880 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 180 - 309
Target Start/End: Original strand, 485 - 614
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14868
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgttgt 14868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28886
Alignment:
Q  218 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58223
Alignment:
Q  149 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 248  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | || ||| |||||||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  249 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttgt 58223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 306
Target Start/End: Original strand, 7580 - 7720
Alignment:
Q  166 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 265  Q
    ||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7580 taagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccat 7679  T
Q  266 gtagccgatc-caacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    | |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7680 gcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1519
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |   |||| |  ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || ||    
T  1647 gagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccac 1551  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1550 ttattaagataaagcttggttgttgttgttgt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 160452 - 160325
Alignment:
Q  180 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 279  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||| | || ||    
T  160452 gagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccac 160353  T
Q  280 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 307  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  160352 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  220 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 306  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  223 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 309  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 311
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19202
Alignment:
Q  258 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 311  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttgt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 244
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39537
Alignment:
Q  188 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 244  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaaca 39537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University