View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12142_low_3 (Length: 768)

Name: NF12142_low_3
Description: NF12142
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12142_low_3
NF12142_low_3
[»] scaffold0143 (6 HSPs)
scaffold0143 (224-755)||(30325-30856)
scaffold0143 (228-755)||(19102-19629)
scaffold0143 (224-448)||(7299-7523)
scaffold0143 (17-226)||(31337-31546)
scaffold0143 (17-226)||(8004-8213)
scaffold0143 (17-226)||(20114-20323)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (224-755)||(14560655-14561186)
chr8 (224-755)||(18793735-18794266)
chr8 (224-751)||(27605559-27606086)
chr8 (224-755)||(29832357-29832888)
chr8 (224-755)||(9357656-9358187)
chr8 (224-755)||(2133914-2134445)
chr8 (224-755)||(12089377-12089908)
chr8 (224-755)||(19205016-19205547)
chr8 (224-751)||(19691133-19691660)
chr8 (228-755)||(28358610-28359137)
chr8 (228-755)||(18712515-18713042)
chr8 (225-755)||(19677478-19678008)
chr8 (224-755)||(33261765-33262296)
chr8 (224-755)||(31357559-31358090)
chr8 (224-755)||(31486525-31487056)
chr8 (228-755)||(22077569-22078096)
chr8 (494-755)||(16286432-16286694)
chr8 (17-226)||(16286996-16287205)
chr8 (17-223)||(33246416-33246622)
chr8 (17-226)||(9358668-9358877)
chr8 (17-226)||(19657305-19657514)
chr8 (17-226)||(19692141-19692350)
chr8 (17-226)||(19913126-19913335)
chr8 (17-226)||(28357916-28358125)
chr8 (224-448)||(15770912-15771136)
chr8 (17-226)||(21344135-21344344)
chr8 (23-226)||(27604875-27605078)
chr8 (17-226)||(14561667-14561876)
chr8 (17-226)||(15771617-15771826)
chr8 (17-226)||(33262777-33262986)
chr8 (17-226)||(44565027-44565236)
chr8 (18-226)||(31358571-31358779)
chr8 (228-448)||(44564322-44564542)
chr8 (228-435)||(21344829-21345036)
chr8 (17-226)||(18794747-18794956)
chr8 (17-226)||(22136953-22137162)
chr8 (17-220)||(29833374-29833577)
chr8 (17-226)||(2133224-2133433)
chr8 (17-226)||(18713527-18713736)
chr8 (18-226)||(12088688-12088896)
chr8 (18-226)||(19678490-19678698)
chr8 (17-226)||(19204326-19204535)
chr8 (17-226)||(31485835-31486044)
chr8 (24-226)||(22076896-22077098)
chr8 (224-699)||(22412025-22412500)
chr8 (224-699)||(14212126-14212601)
chr8 (224-730)||(19844223-19844729)
chr8 (452-699)||(16768410-16768657)
chr8 (224-260)||(19657995-19658031)
chr8 (224-261)||(33245894-33245931)
[»] chr6 (100 HSPs)
chr6 (224-755)||(27022165-27022696)
chr6 (224-751)||(13295587-13296114)
chr6 (224-755)||(29552586-29553117)
chr6 (224-755)||(15420956-15421487)
chr6 (224-751)||(22931520-22932047)
chr6 (224-751)||(23853965-23854492)
chr6 (224-755)||(27010760-27011291)
chr6 (224-751)||(27287000-27287527)
chr6 (224-751)||(24866749-24867276)
chr6 (224-755)||(27060535-27061066)
chr6 (224-755)||(28210483-28211014)
chr6 (225-755)||(26921406-26921936)
chr6 (224-755)||(26113048-26113579)
chr6 (224-751)||(27269223-27269750)
chr6 (228-751)||(27626351-27626874)
chr6 (224-755)||(4720771-4721302)
chr6 (228-755)||(4760792-4761319)
chr6 (224-755)||(16940663-16941194)
chr6 (224-755)||(29576043-29576574)
chr6 (228-755)||(34461146-34461673)
chr6 (225-755)||(16752850-16753380)
chr6 (224-755)||(3699112-3699643)
chr6 (224-755)||(4542410-4542941)
chr6 (224-755)||(27488162-27488693)
chr6 (224-755)||(4775909-4776440)
chr6 (228-755)||(29504445-29504972)
chr6 (224-755)||(4528314-4528845)
chr6 (224-755)||(16677169-16677700)
chr6 (224-755)||(30554652-30555183)
chr6 (224-676)||(27179564-27180016)
chr6 (224-755)||(17089079-17089610)
chr6 (228-649)||(20171682-20172103)
chr6 (228-649)||(22163888-22164309)
chr6 (224-483)||(26992096-26992355)
chr6 (225-466)||(33373068-33373309)
chr6 (228-448)||(27358750-27358970)
chr6 (228-448)||(27449093-27449313)
chr6 (224-439)||(28163836-28164051)
chr6 (228-448)||(26775267-26775487)
chr6 (17-226)||(15408479-15408688)
chr6 (17-226)||(15420266-15420475)
chr6 (17-226)||(13294897-13295106)
chr6 (17-226)||(22930830-22931039)
chr6 (17-226)||(23853275-23853484)
chr6 (17-226)||(27625657-27625866)
chr6 (17-226)||(29505457-29505666)
chr6 (17-226)||(29553598-29553807)
chr6 (224-439)||(8902339-8902554)
chr6 (17-226)||(13520140-13520349)
chr6 (17-226)||(24867757-24867966)
chr6 (17-226)||(26922418-26922627)
chr6 (17-226)||(27061547-27061756)
chr6 (17-226)||(34460452-34460661)
chr6 (232-448)||(22455758-22455974)
chr6 (17-226)||(16678181-16678390)
chr6 (17-226)||(24301703-24301912)
chr6 (17-226)||(26774573-26774782)
chr6 (21-226)||(27286314-27286519)
chr6 (17-226)||(28164532-28164741)
chr6 (17-226)||(29577055-29577264)
chr6 (224-448)||(13520828-13521051)
chr6 (228-448)||(14142034-14142254)
chr6 (228-448)||(26789152-26789372)
chr6 (579-755)||(26991922-26992098)
chr6 (228-448)||(27197521-27197741)
chr6 (228-448)||(27251494-27251714)
chr6 (17-231)||(8901649-8901863)
chr6 (17-226)||(4720081-4720290)
chr6 (17-226)||(4761804-4762013)
chr6 (17-226)||(4776921-4777130)
chr6 (17-226)||(16753862-16754071)
chr6 (17-226)||(17088389-17088598)
chr6 (17-226)||(26789857-26790066)
chr6 (17-226)||(27023178-27023387)
chr6 (17-226)||(27489174-27489383)
chr6 (18-226)||(3700124-3700332)
chr6 (18-226)||(4541721-4541929)
chr6 (18-226)||(26112359-26112567)
chr6 (18-226)||(27198226-27198434)
chr6 (18-226)||(27250801-27251009)
chr6 (17-220)||(27358056-27358259)
chr6 (17-220)||(33372377-33372580)
chr6 (17-226)||(14141340-14141549)
chr6 (18-226)||(4529326-4529534)
chr6 (18-226)||(27011772-27011980)
chr6 (18-226)||(28211495-28211703)
chr6 (17-226)||(16939973-16940182)
chr6 (17-226)||(30553962-30554171)
chr6 (17-226)||(20172588-20172797)
chr6 (17-226)||(22163194-22163403)
chr6 (224-699)||(18119554-18120029)
chr6 (224-699)||(18212305-18212780)
chr6 (452-699)||(23971634-23971881)
chr6 (234-688)||(9135999-9136453)
chr6 (224-349)||(23971406-23971531)
chr6 (452-699)||(27544987-27545234)
chr6 (452-712)||(25707083-25707343)
chr6 (651-755)||(20163649-20163753)
chr6 (651-755)||(22169078-22169182)
chr6 (228-261)||(24302397-24302430)
[»] chr3 (129 HSPs)
chr3 (224-755)||(4793371-4793902)
chr3 (224-755)||(5606050-5606581)
chr3 (224-755)||(22384314-22384845)
chr3 (224-755)||(8286206-8286737)
chr3 (224-755)||(8298964-8299495)
chr3 (225-751)||(15889442-15889968)
chr3 (228-755)||(21677696-21678223)
chr3 (224-755)||(35883759-35884290)
chr3 (224-755)||(4724624-4725155)
chr3 (224-755)||(6204896-6205427)
chr3 (224-755)||(7076199-7076730)
chr3 (224-755)||(15737830-15738361)
chr3 (224-755)||(18054255-18054786)
chr3 (224-755)||(18304390-18304921)
chr3 (224-755)||(18273788-18274319)
chr3 (224-755)||(18289089-18289620)
chr3 (224-751)||(18333627-18334154)
chr3 (224-751)||(20069037-20069564)
chr3 (224-755)||(29145492-29146023)
chr3 (224-755)||(5469981-5470512)
chr3 (228-755)||(5593097-5593624)
chr3 (224-755)||(28112690-28113221)
chr3 (224-751)||(32442148-32442675)
chr3 (224-755)||(7999553-8000084)
chr3 (224-755)||(10399137-10399668)
chr3 (224-755)||(4343412-4343943)
chr3 (224-755)||(10646066-10646597)
chr3 (224-755)||(28024275-28024806)
chr3 (224-755)||(31961191-31961722)
chr3 (224-755)||(4419908-4420439)
chr3 (224-755)||(6539478-6540009)
chr3 (224-755)||(22867584-22868115)
chr3 (224-755)||(22882643-22883174)
chr3 (224-755)||(51785016-51785547)
chr3 (224-755)||(17981685-17982216)
chr3 (224-755)||(18228189-18228720)
chr3 (224-755)||(18245734-18246265)
chr3 (228-755)||(20573583-20574110)
chr3 (224-755)||(24331156-24331687)
chr3 (228-755)||(28342170-28342697)
chr3 (224-755)||(47026446-47026977)
chr3 (228-755)||(29661710-29662237)
chr3 (228-755)||(48468920-48469447)
chr3 (224-755)||(11107095-11107619)
chr3 (224-755)||(5016707-5017238)
chr3 (228-755)||(8214728-8215255)
chr3 (224-751)||(19697487-19698014)
chr3 (231-755)||(16621233-16621757)
chr3 (224-565)||(4686838-4687179)
chr3 (228-448)||(4627085-4627305)
chr3 (228-448)||(5714373-5714593)
chr3 (228-448)||(5725283-5725503)
chr3 (228-448)||(5766865-5767085)
chr3 (17-226)||(5654090-5654299)
chr3 (17-226)||(28343182-28343391)
chr3 (17-226)||(29144802-29145011)
chr3 (17-226)||(5017719-5017928)
chr3 (17-226)||(15888751-15888960)
chr3 (17-226)||(22383624-22383833)
chr3 (224-448)||(31032972-31033196)
chr3 (224-448)||(32293928-32294152)
chr3 (23-226)||(28112006-28112209)
chr3 (17-226)||(4627790-4627999)
chr3 (17-226)||(4687660-4687869)
chr3 (17-226)||(5605360-5605569)
chr3 (17-226)||(6205909-6206118)
chr3 (17-226)||(7077211-7077420)
chr3 (17-226)||(8000565-8000774)
chr3 (17-226)||(8285516-8285725)
chr3 (17-226)||(8299976-8300185)
chr3 (17-226)||(10647078-10647287)
chr3 (17-226)||(16620536-16620745)
chr3 (17-226)||(20070045-20070254)
chr3 (17-226)||(21678708-21678917)
chr3 (17-226)||(29661016-29661225)
chr3 (17-226)||(32294633-32294842)
chr3 (17-226)||(32443156-32443365)
chr3 (17-226)||(51786028-51786237)
chr3 (17-226)||(5592403-5592612)
chr3 (17-226)||(11106405-11106614)
chr3 (17-226)||(17972907-17973116)
chr3 (17-226)||(18055267-18055476)
chr3 (17-226)||(18273098-18273307)
chr3 (17-226)||(18288399-18288608)
chr3 (17-226)||(18303700-18303909)
chr3 (17-226)||(18334635-18334844)
chr3 (17-226)||(19698495-19698704)
chr3 (17-226)||(24332168-24332377)
chr3 (17-226)||(28025286-28025495)
chr3 (17-226)||(31032282-31032491)
chr3 (17-226)||(35884771-35884980)
chr3 (228-448)||(17992671-17992891)
chr3 (18-226)||(31960502-31960710)
chr3 (17-226)||(4342722-4342931)
chr3 (17-226)||(4792681-4792890)
chr3 (17-214)||(15737140-15737337)
chr3 (17-226)||(17980995-17981204)
chr3 (17-226)||(18229201-18229410)
chr3 (17-226)||(48469932-48470141)
chr3 (18-226)||(6538789-6538997)
chr3 (17-226)||(4725636-4725844)
chr3 (17-226)||(10400149-10400358)
chr3 (17-226)||(18246746-18246955)
chr3 (17-226)||(22866894-22867103)
chr3 (17-226)||(22881953-22882162)
chr3 (18-226)||(4420920-4421128)
chr3 (17-226)||(47027458-47027667)
chr3 (17-220)||(8215746-8215949)
chr3 (17-226)||(5715078-5715287)
chr3 (17-226)||(5725988-5726197)
chr3 (17-226)||(5766171-5766380)
chr3 (17-226)||(20572889-20573098)
chr3 (17-226)||(5470993-5471202)
chr3 (224-699)||(7088763-7089238)
chr3 (224-699)||(6571403-6571878)
chr3 (224-699)||(11925094-11925569)
chr3 (224-699)||(16431454-16431929)
chr3 (224-699)||(22959502-22959977)
chr3 (224-699)||(15704522-15704997)
chr3 (234-673)||(46380409-46380848)
chr3 (234-688)||(5950548-5951002)
chr3 (452-730)||(4446453-4446731)
chr3 (459-675)||(20443190-20443406)
chr3 (459-675)||(41440316-41440532)
chr3 (690-755)||(18533376-18533441)
chr3 (224-363)||(6963169-6963308)
chr3 (93-226)||(20444122-20444255)
chr3 (483-730)||(6963428-6963675)
chr3 (224-260)||(5653573-5653609)
[»] scaffold0089 (4 HSPs)
scaffold0089 (224-755)||(3099-3630)
scaffold0089 (411-755)||(43871-44215)
scaffold0089 (482-755)||(32096-32369)
scaffold0089 (17-226)||(4111-4320)
[»] chr5 (113 HSPs)
chr5 (224-755)||(11552394-11552925)
chr5 (224-755)||(23629009-23629540)
chr5 (224-751)||(33295571-33296098)
chr5 (224-755)||(33780528-33781059)
chr5 (224-755)||(15655348-15655879)
chr5 (224-755)||(22995707-22996238)
chr5 (224-751)||(24684735-24685262)
chr5 (224-755)||(28652281-28652812)
chr5 (224-755)||(9320515-9321046)
chr5 (224-755)||(12135214-12135745)
chr5 (224-751)||(24972949-24973476)
chr5 (224-755)||(31434503-31435034)
chr5 (224-755)||(37355233-37355764)
chr5 (225-755)||(41677744-41678274)
chr5 (224-755)||(26483433-26483964)
chr5 (224-755)||(30937674-30938205)
chr5 (224-755)||(37668076-37668607)
chr5 (228-755)||(40470144-40470671)
chr5 (228-755)||(3792580-3793107)
chr5 (224-755)||(18372124-18372655)
chr5 (224-755)||(24727008-24727539)
chr5 (224-755)||(28956375-28956906)
chr5 (228-755)||(31823001-31823528)
chr5 (224-755)||(37767581-37768112)
chr5 (228-755)||(43081294-43081821)
chr5 (224-755)||(13321420-13321951)
chr5 (228-755)||(18497319-18497846)
chr5 (224-755)||(30032467-30032998)
chr5 (224-755)||(30155070-30155601)
chr5 (224-755)||(37758022-37758553)
chr5 (224-752)||(24586416-24586944)
chr5 (228-755)||(2514101-2514628)
chr5 (224-755)||(30171508-30172039)
chr5 (224-755)||(32592864-32593395)
chr5 (224-755)||(33519419-33519950)
chr5 (224-755)||(34619557-34620088)
chr5 (224-755)||(15755442-15755973)
chr5 (224-755)||(5640827-5641358)
chr5 (224-755)||(8662065-8662596)
chr5 (228-755)||(6877344-6877871)
chr5 (228-755)||(22891502-22892029)
chr5 (228-751)||(25203321-25203844)
chr5 (228-751)||(25267476-25267999)
chr5 (308-751)||(23895249-23895692)
chr5 (225-466)||(13183384-13183625)
chr5 (224-448)||(18125006-18125230)
chr5 (224-439)||(13439273-13439488)
chr5 (17-226)||(23895926-23896135)
chr5 (17-226)||(25204329-25204538)
chr5 (17-226)||(25268484-25268693)
chr5 (17-226)||(24973957-24974166)
chr5 (17-226)||(3793592-3793801)
chr5 (17-226)||(8661375-8661584)
chr5 (17-226)||(18124316-18124525)
chr5 (17-226)||(22892514-22892723)
chr5 (17-226)||(24587425-24587634)
chr5 (17-226)||(29887097-29887306)
chr5 (17-226)||(30156082-30156291)
chr5 (17-226)||(30172520-30172729)
chr5 (225-448)||(9547300-9547523)
chr5 (17-226)||(12136226-12136435)
chr5 (17-226)||(13320730-13320939)
chr5 (17-226)||(13438583-13438792)
chr5 (17-226)||(15754752-15754961)
chr5 (17-226)||(18371434-18371643)
chr5 (17-226)||(23630021-23630230)
chr5 (17-226)||(24728020-24728229)
chr5 (17-226)||(26484445-26484654)
chr5 (17-226)||(33296579-33296788)
chr5 (17-226)||(33781536-33781745)
chr5 (17-226)||(33879179-33879388)
chr5 (17-226)||(34620569-34620778)
chr5 (17-226)||(37667386-37667595)
chr5 (17-226)||(2515113-2515322)
chr5 (17-226)||(6878356-6878565)
chr5 (17-226)||(9546609-9546818)
chr5 (17-226)||(11553406-11553615)
chr5 (17-226)||(18496625-18496834)
chr5 (17-226)||(22995017-22995226)
chr5 (17-226)||(30033479-30033688)
chr5 (17-226)||(30938686-30938895)
chr5 (17-226)||(37759034-37759243)
chr5 (17-226)||(40469450-40469659)
chr5 (224-448)||(33878477-33878700)
chr5 (17-226)||(5641839-5642048)
chr5 (227-448)||(11326983-11327204)
chr5 (17-226)||(13182693-13182902)
chr5 (17-226)||(31822307-31822516)
chr5 (17-226)||(32592174-32592383)
chr5 (17-226)||(41678756-41678965)
chr5 (17-226)||(43082306-43082515)
chr5 (228-448)||(29887791-29888011)
chr5 (17-226)||(28955685-28955894)
chr5 (17-226)||(31435515-31435724)
chr5 (17-226)||(37766891-37767100)
chr5 (18-226)||(37354544-37354752)
chr5 (17-226)||(9321527-9321736)
chr5 (17-226)||(33520431-33520640)
chr5 (17-226)||(28653293-28653503)
chr5 (17-226)||(11327688-11327897)
chr5 (17-226)||(15654658-15654867)
chr5 (234-673)||(11944022-11944461)
chr5 (224-699)||(3483793-3484268)
chr5 (234-673)||(31520428-31520867)
chr5 (234-688)||(15784325-15784779)
chr5 (234-673)||(36375562-36376001)
chr5 (234-673)||(37000216-37000655)
chr5 (224-730)||(351805-352311)
chr5 (234-673)||(5439825-5440264)
chr5 (336-673)||(17957217-17957554)
chr5 (468-675)||(34468741-34468948)
chr5 (537-730)||(20388892-20389085)
chr5 (93-226)||(34469673-34469806)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (224-755)||(34185653-34186184)
chr4 (224-755)||(54836436-54836967)
chr4 (224-755)||(17016091-17016622)
chr4 (228-755)||(5008920-5009447)
chr4 (224-755)||(14759999-14760530)
chr4 (228-755)||(6572903-6573430)
chr4 (224-751)||(14668065-14668592)
chr4 (224-751)||(24115711-24116238)
chr4 (224-755)||(24589054-24589585)
chr4 (224-755)||(30756805-30757336)
chr4 (224-755)||(14101588-14102119)
chr4 (228-755)||(18313875-18314402)
chr4 (224-755)||(18797307-18797838)
chr4 (224-755)||(27160010-27160541)
chr4 (225-755)||(33670494-33671024)
chr4 (228-755)||(39853682-39854209)
chr4 (224-755)||(31123205-31123736)
chr4 (228-754)||(36341214-36341740)
chr4 (224-755)||(21972746-21973277)
chr4 (224-755)||(40102330-40102861)
chr4 (224-676)||(20335114-20335566)
chr4 (228-749)||(15230923-15231444)
chr4 (228-755)||(1903299-1903826)
chr4 (228-755)||(15281634-15282152)
chr4 (228-755)||(15388075-15388602)
chr4 (17-226)||(34184963-34185172)
chr4 (17-226)||(54837448-54837657)
chr4 (17-228)||(15231875-15232086)
chr4 (21-226)||(1904311-1904516)
chr4 (17-226)||(17017103-17017312)
chr4 (17-226)||(24116719-24116928)
chr4 (17-226)||(33669803-33670012)
chr4 (17-226)||(6573915-6574124)
chr4 (17-226)||(18313181-18313390)
chr4 (17-226)||(30757817-30758026)
chr4 (17-226)||(39854694-39854903)
chr4 (17-223)||(14755495-14755701)
chr4 (17-226)||(40101640-40101849)
chr4 (17-226)||(5009932-5010141)
chr4 (17-226)||(5698592-5698801)
chr4 (17-226)||(14102600-14102809)
chr4 (17-226)||(15278630-15278839)
chr4 (17-226)||(18796617-18796826)
chr4 (17-226)||(14669073-14669282)
chr4 (17-226)||(21973758-21973967)
chr4 (17-226)||(24588364-24588573)
chr4 (17-226)||(27159320-27159529)
chr4 (17-226)||(31122515-31122724)
chr4 (17-226)||(36340520-36340729)
chr4 (17-226)||(20334424-20334633)
chr4 (98-226)||(15384432-15384560)
chr4 (224-699)||(14725492-14725967)
chr4 (224-699)||(19767440-19767915)
chr4 (224-699)||(22146262-22146737)
chr4 (412-466)||(24459636-24459690)
chr4 (452-699)||(1882020-1882267)
chr4 (93-226)||(55785189-55785322)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (224-755)||(10913447-10913978)
chr7 (224-751)||(2106741-2107268)
chr7 (224-755)||(5131025-5131556)
chr7 (224-751)||(2157607-2158134)
chr7 (228-755)||(5143922-5144449)
chr7 (224-755)||(11421357-11421888)
chr7 (224-755)||(26271664-26272195)
chr7 (227-755)||(26534454-26534982)
chr7 (224-755)||(26316426-26316957)
chr7 (224-751)||(16515008-16515535)
chr7 (224-755)||(31560968-31561499)
chr7 (228-755)||(26515821-26516348)
chr7 (224-755)||(45390249-45390780)
chr7 (228-754)||(4202419-4202945)
chr7 (228-755)||(4141828-4142355)
chr7 (228-755)||(11443916-11444443)
chr7 (224-755)||(24589112-24589643)
chr7 (224-755)||(26666492-26667023)
chr7 (228-755)||(26438286-26438813)
chr7 (228-755)||(3448335-3448862)
chr7 (224-755)||(16748095-16748626)
chr7 (228-755)||(10844649-10845176)
chr7 (228-755)||(16446588-16447115)
chr7 (224-631)||(22145348-22145755)
chr7 (228-751)||(16044352-16044874)
chr7 (228-755)||(10842576-10843103)
chr7 (406-755)||(9621679-9622028)
chr7 (17-226)||(16445894-16446103)
chr7 (17-226)||(16045356-16045565)
chr7 (17-226)||(2777295-2777504)
chr7 (17-226)||(45391261-45391470)
chr7 (17-226)||(2106051-2106260)
chr7 (17-226)||(2158615-2158824)
chr7 (17-226)||(26680994-26681203)
chr7 (225-439)||(45734658-45734872)
chr7 (17-226)||(3449347-3449556)
chr7 (17-226)||(5162424-5162633)
chr7 (17-226)||(10912757-10912966)
chr7 (17-226)||(26270974-26271183)
chr7 (17-226)||(26315736-26315945)
chr7 (17-226)||(26665802-26666011)
chr7 (228-448)||(2776590-2776810)
chr7 (228-448)||(31087204-31087424)
chr7 (23-226)||(31086516-31086719)
chr7 (17-226)||(4203430-4203639)
chr7 (17-226)||(10845661-10845870)
chr7 (17-226)||(11420667-11420876)
chr7 (17-226)||(16514318-16514527)
chr7 (17-226)||(26511584-26511793)
chr7 (228-448)||(31127243-31127463)
chr7 (17-226)||(4141134-4141343)
chr7 (17-226)||(5132037-5132246)
chr7 (17-226)||(10841882-10842091)
chr7 (17-226)||(24588422-24588631)
chr7 (17-226)||(26439298-26439507)
chr7 (17-226)||(26516833-26517042)
chr7 (17-226)||(31127948-31128157)
chr7 (17-226)||(31560278-31560487)
chr7 (17-226)||(39209027-39209236)
chr7 (17-226)||(45735348-45735557)
chr7 (228-448)||(26512278-26512498)
chr7 (228-448)||(26681688-26681908)
chr7 (228-448)||(39209721-39209941)
chr7 (17-226)||(11444928-11445137)
chr7 (17-226)||(16747405-16747614)
chr7 (17-226)||(26533761-26533970)
chr7 (17-226)||(5143228-5143437)
chr7 (603-755)||(17526563-17526715)
chr7 (224-699)||(16127396-16127871)
chr7 (224-699)||(2556620-2557095)
chr7 (224-699)||(15193168-15193643)
chr7 (224-699)||(29089601-29090076)
chr7 (234-673)||(30369534-30369973)
chr7 (224-698)||(16237567-16238041)
chr7 (234-673)||(9469431-9469870)
chr7 (234-673)||(16393022-16393461)
chr7 (452-730)||(1893381-1893659)
chr7 (224-699)||(25726582-25727057)
chr7 (468-675)||(16287201-16287408)
chr7 (93-226)||(797487-797620)
chr7 (459-675)||(798336-798552)
chr7 (224-260)||(5161907-5161943)
chr7 (93-226)||(16286343-16286476)
chr7 (142-220)||(22146235-22146308)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (224-755)||(12603-13134)
scaffold0336 (17-226)||(13615-13824)
[»] scaffold0418 (2 HSPs)
scaffold0418 (228-755)||(9068-9595)
scaffold0418 (17-226)||(10080-10289)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (228-755)||(12589839-12590366)
chr2 (224-751)||(12658571-12659098)
chr2 (224-755)||(23125250-23125781)
chr2 (224-755)||(39893100-39893631)
chr2 (228-755)||(40236539-40237066)
chr2 (224-755)||(11631866-11632397)
chr2 (224-755)||(12713283-12713814)
chr2 (224-755)||(28885238-28885769)
chr2 (225-755)||(9346669-9347199)
chr2 (224-755)||(20840944-20841475)
chr2 (224-755)||(34294185-34294716)
chr2 (228-755)||(13933233-13933760)
chr2 (224-751)||(27431123-27431650)
chr2 (224-755)||(34864715-34865246)
chr2 (228-755)||(37948548-37949075)
chr2 (228-755)||(39048505-39049032)
chr2 (224-755)||(21673857-21674388)
chr2 (228-755)||(27806734-27807261)
chr2 (224-755)||(32052834-32053365)
chr2 (224-755)||(37682577-37683108)
chr2 (224-755)||(37697842-37698373)
chr2 (224-755)||(19413183-19413714)
chr2 (224-755)||(37928400-37928931)
chr2 (224-755)||(16826020-16826551)
chr2 (224-755)||(16894929-16895460)
chr2 (224-755)||(31879317-31879848)
chr2 (228-755)||(21699857-21700383)
chr2 (228-676)||(257339-257787)
chr2 (228-755)||(19453109-19453636)
chr2 (228-755)||(27394593-27395120)
chr2 (224-565)||(37380898-37381239)
chr2 (228-448)||(27779572-27779792)
chr2 (228-448)||(27819329-27819549)
chr2 (224-448)||(16164818-16165042)
chr2 (17-231)||(31889483-31889697)
chr2 (17-226)||(12659579-12659788)
chr2 (17-226)||(20841956-20842165)
chr2 (17-226)||(28886322-28886531)
chr2 (17-226)||(32053846-32054055)
chr2 (17-226)||(34158887-34159096)
chr2 (17-226)||(34865727-34865936)
chr2 (17-226)||(37681887-37682096)
chr2 (17-226)||(37697152-37697361)
chr2 (17-226)||(37929412-37929621)
chr2 (228-448)||(27119862-27120082)
chr2 (17-226)||(21699163-21699372)
chr2 (17-226)||(27430433-27430642)
chr2 (17-226)||(27807746-27807955)
chr2 (17-226)||(39047811-39048020)
chr2 (228-448)||(22924834-22925054)
chr2 (17-226)||(12590851-12591060)
chr2 (17-226)||(12712593-12712802)
chr2 (17-226)||(34295197-34295406)
chr2 (562-755)||(37378202-37378395)
chr2 (17-226)||(37381720-37381929)
chr2 (228-448)||(3785831-3786051)
chr2 (228-448)||(31890177-31890397)
chr2 (17-220)||(3786542-3786745)
chr2 (23-226)||(34270918-34271121)
chr2 (17-226)||(11631176-11631385)
chr2 (17-226)||(16165523-16165732)
chr2 (17-226)||(27780277-27780486)
chr2 (17-226)||(27820034-27820243)
chr2 (228-405)||(27827841-27828018)
chr2 (18-226)||(22924141-22924349)
chr2 (17-220)||(9345978-9346181)
chr2 (17-226)||(23124561-23124770)
chr2 (18-226)||(21673168-21673376)
chr2 (18-226)||(39894112-39894320)
chr2 (17-226)||(16825330-16825539)
chr2 (17-226)||(16895941-16896150)
chr2 (17-226)||(19412493-19412702)
chr2 (17-226)||(27395605-27395814)
chr2 (17-226)||(31880329-31880538)
chr2 (17-226)||(37947854-37948063)
chr2 (17-226)||(40237551-40237760)
chr2 (228-448)||(34158182-34158402)
chr2 (17-220)||(27120573-27120776)
chr2 (17-226)||(13932539-13932748)
chr2 (17-226)||(19452415-19452624)
chr2 (17-226)||(256645-256854)
chr2 (224-699)||(42393622-42394097)
chr2 (224-699)||(34701163-34701638)
chr2 (234-673)||(12383773-12384212)
chr2 (452-730)||(26724186-26724464)
chr2 (234-673)||(22949506-22949945)
chr2 (687-755)||(34289125-34289193)
chr2 (681-755)||(257892-257966)
chr2 (114-226)||(21759704-21759816)
chr2 (452-699)||(34534353-34534600)
chr2 (483-675)||(21760556-21760748)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (224-755)||(10981-11512)
scaffold0038 (18-226)||(11993-12201)
[»] scaffold0254 (2 HSPs)
scaffold0254 (224-751)||(15617-16144)
scaffold0254 (17-220)||(16631-16835)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (224-755)||(10965699-10966230)
chr1 (224-755)||(28588019-28588550)
chr1 (224-755)||(51641252-51641783)
chr1 (224-755)||(10948111-10948642)
chr1 (224-755)||(41790003-41790534)
chr1 (228-755)||(16204731-16205258)
chr1 (228-676)||(3644245-3644696)
chr1 (228-755)||(20464010-20464537)
chr1 (224-559)||(21894441-21894777)
chr1 (254-550)||(20339024-20339320)
chr1 (17-226)||(16204037-16204246)
chr1 (17-226)||(51642264-51642473)
chr1 (224-448)||(28153077-28153301)
chr1 (18-226)||(21893752-21893960)
chr1 (17-226)||(10949123-10949332)
chr1 (17-226)||(10966711-10966920)
chr1 (17-218)||(20336419-20336620)
chr1 (17-226)||(28589031-28589240)
chr1 (17-226)||(20465022-20465231)
chr1 (17-226)||(28153782-28153991)
chr1 (18-226)||(41789314-41789522)
chr1 (17-226)||(3645184-3645395)
chr1 (224-699)||(22489111-22489586)
chr1 (234-673)||(5628701-5629140)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (224-755)||(11621-12152)
scaffold0237 (17-226)||(10931-11140)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (224-755)||(9050-9585)
scaffold0415 (17-226)||(10066-10275)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (224-755)||(22884-23415)
scaffold0144 (17-226)||(22194-22403)
[»] scaffold0159 (5 HSPs)
scaffold0159 (224-755)||(5872-6403)
scaffold0159 (483-755)||(22911-23183)
scaffold0159 (17-226)||(10020-10229)
scaffold0159 (17-226)||(12176-12385)
scaffold0159 (17-220)||(5182-5385)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (228-751)||(9081-9604)
scaffold0322 (17-226)||(10089-10298)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (228-755)||(5368-5895)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (218-720)||(43413-43939)
scaffold0099 (26-214)||(42704-42899)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (254-550)||(1347-1643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (480-755)||(33491-33770)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (27-226)||(2326-2525)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (444-594)||(1116-1266)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (24-226)||(23160-23362)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (17-157)||(1844-1984)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (224-699)||(10306-10781)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (234-688)||(29269-29723)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (528-698)||(50245-50415)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (459-699)||(35168-35408)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (495-730)||(4879-5114)
scaffold0031 (224-352)||(4608-4736)


Alignment Details
Target: scaffold0143 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30856 - 30325
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30856 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 30757  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30756 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 30657  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30656 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 30557  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30556 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 30457  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30456 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 30357  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30356 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 30325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 19629 - 19102
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  19629 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 19530  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  19529 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 19430  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19429 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 19330  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19329 aaacctctaacttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcccggacattatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagc 19230  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  19229 ctagtaatttttcagatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 19130  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19129 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 19102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 7523 - 7299
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7523 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 7424  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7423 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 7324  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  7323 cattccatacaataggctgattctt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31546 - 31337
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31546 gtgcagctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgtctcgcataatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 31447  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  31446 ttgatgacgagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatacttcatactcagccatat 31347  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  31346 tgtttgtaca 31337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8213 - 8004
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8213 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8114  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8113 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 8014  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  8013 tgttggtaca 8004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20323 - 20114
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  20323 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatctcggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcgccctttatctgg 20224  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  20223 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcggccatat 20124  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  20123 tgtttgtaca 20114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 14561186 - 14560655
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14561186 acaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 14561087  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14561086 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 14560987  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14560986 cattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 14560887  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14560886 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 14560787  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14560786 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 14560687  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14560686 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 14560655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18794266 - 18793735
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18794266 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18794167  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18794166 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18794067  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18794066 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgccc 18793967  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18793966 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 18793867  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18793866 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatact 18793767  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18793766 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 18793735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 27605559 - 27606086
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27605559 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 27605658  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27605659 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27605758  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605759 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 27605858  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27605859 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27605958  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27605959 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 27606058  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27606059 caacatgttgctcctcatctgttgactt 27606086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29832888 - 29832357
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29832888 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 29832789  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29832788 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 29832689  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29832688 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 29832589  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29832588 caggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 29832489  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  29832488 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 29832389  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29832388 caacatgctgcccctcatctgttgacttcaca 29832357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9358187 - 9357656
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9358187 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 9358088  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9358087 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 9357988  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  9357987 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcc 9357888  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357887 caggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 9357788  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  9357787 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 9357688  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357687 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 9357656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 2133914 - 2134445
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2133914 acaatcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttccttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 2134013  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  2134014 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcat 2134113  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2134114 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 2134213  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2134214 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 2134313  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2134314 aaacctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 2134413  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2134414 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 2134445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 12089377 - 12089908
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089377 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 12089476  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12089477 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 12089576  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12089577 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 12089676  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12089677 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 12089776  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  12089777 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 12089876  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12089877 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 12089908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 19205016 - 19205547
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19205016 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 19205115  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19205116 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 19205215  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19205216 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 19205315  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19205316 gaggaagcctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 19205415  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  19205416 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 19205515  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19205516 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 19205547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 19691660 - 19691133
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19691660 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 19691561  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19691560 gccaaatacataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 19691461  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  19691460 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtcc 19691361  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19691360 gaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgataatg 19691261  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  19691260 aagcctaataactttccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatact 19691161  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19691160 caacatgttgctcctcatctgttgactt 19691133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 28358610 - 28359137
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28358610 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgcca 28358709  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28358710 aatacataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 28358809  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28358810 ccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 28358909  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28358910 aagcctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 28359009  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28359010 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 28359109  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28359110 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 28359137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18713042 - 18712515
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18713042 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 18712943  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18712942 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcatt 18712843  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18712842 ccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgagg 18712743  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712742 aaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 18712643  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  18712642 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgtcaaatattcaac 18712543  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712542 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 18712515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 19678008 - 19677478
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678008 caatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 19677909  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  19677908 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatc 19677809  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19677808 attccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccg 19677709  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19677708 aggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 19677609  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  19677608 agcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattc 19677509  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19677508 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 19677478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33262296 - 33261765
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262296 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 33262197  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33262196 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 33262097  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33262096 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 33261997  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33261996 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 33261897  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33261896 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 33261797  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33261796 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 33261765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31358090 - 31357559
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  31358090 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 31357991  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31357990 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31357891  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31357890 cattccatacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 31357791  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31357790 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 31357691  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31357690 aagcctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31357591  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31357590 caacatgctgctcttcatctgctgacttcaca 31357559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 31486525 - 31487056
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486525 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 31486624  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31486625 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31486724  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31486725 cattccatacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgccc 31486824  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31486825 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatccggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 31486924  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31486925 aagcctaataacttcccggatctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31487024  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31487025 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 31487056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 22077569 - 22078096
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  22077569 tcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 22077668  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  22077669 agtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattatt 22077768  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077769 ccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 22077868  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22077869 aaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgccggcatctctctgatggcccggaatttgtcaagatcgacttcaatgcccttttggctaacaatgaagc 22077968  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||  |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  22077969 ctagcagttttccggatctgacaccgaacgtacacttgttggggttcagccgaagcttgtactttctcaacctttctaacatttttgtcaaatactcaac 22078068  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22078069 atgctgttcctcatcttttgacttcaca 22078096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 494 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286432
Alignment:
Q  494 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcagg 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcagg 16286595  T
Q  593 atcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtatttt 692  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16286594 atcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatttt 16286495  T
Q  693 ctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16286494 ctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatactcaacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 16286432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16287205 - 16286996
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16287205 gtgcagctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 16287106  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16287105 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 16287006  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16287005 tgtttgtaca 16286996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 33246622 - 33246416
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33246622 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33246523  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33246522 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 33246423  T
Q  217 tgtttgt 223  Q
    |||||||    
T  33246422 tgtttgt 33246416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9358877 - 9358668
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358877 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 9358778  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9358777 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 9358678  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  9358677 tgtttgtaca 9358668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 19657305 - 19657514
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19657305 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccttttatctgg 19657404  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19657405 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcaatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 19657504  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  19657505 tgtttgtaca 19657514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19692350 - 19692141
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692350 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 19692251  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19692250 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 19692151  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  19692150 tgtttgtaca 19692141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 19913126 - 19913335
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913126 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 19913225  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19913226 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 19913325  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  19913326 tgtttgtaca 19913335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 28357916 - 28358125
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357916 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 28358015  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28358016 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 28358115  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  28358116 tgttggtaca 28358125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15771136 - 15770912
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  15771136 acaatcggtaaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 15771037  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15771036 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 15770937  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  15770936 cgttccatacaataggctgattctt 15770912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 21344135 - 21344344
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344135 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 21344234  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21344235 ttgatcacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 21344334  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  21344335 tgtttgtaca 21344344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 27604875 - 27605078
Alignment:
Q  23 ctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27604875 ctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcaccctttatctgattgatg 27604974  T
Q  123 acaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttg 222  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27604975 acgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatattgtttg 27605074  T
Q  223 taca 226  Q
    ||||    
T  27605075 taca 27605078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14561876 - 14561667
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14561876 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcatcctttatctga 14561777  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14561776 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 14561677  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  14561676 tgtttgtaca 14561667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 15771826 - 15771617
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15771826 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 15771727  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15771726 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 15771627  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  15771626 tgtttgtaca 15771617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33262986 - 33262777
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262986 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33262887  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33262886 ttgatgacgagcgcagagtctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 33262787  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  33262786 tgttggtaca 33262777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44565236 - 44565027
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44565236 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 44565137  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44565136 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 44565037  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  44565036 tgttggtaca 44565027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31358779 - 31358571
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358779 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 31358680  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31358679 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtccattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 31358580  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  31358579 gttggtaca 31358571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44564542 - 44564322
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  44564542 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 44564443  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  44564442 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 44564343  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||| || |||||    
T  44564342 ctatacaataggctgattctt 44564322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 228 - 435
Target Start/End: Original strand, 21344829 - 21345036
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  21344829 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 21344928  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21344929 aatacaaaatcgaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcatt 21345028  T
Q  428 ccatacaa 435  Q
    || |||||    
T  21345029 ccctacaa 21345036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18794956 - 18794747
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18794956 gtgcagctcaacctttataaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 18794857  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18794856 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18794757  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  18794756 tgtttgtaca 18794747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22137162 - 22136953
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22137162 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatttgg 22137063  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |    
T  22137062 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcctcatactcggccatat 22136963  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  22136962 tgtttgtaca 22136953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29833577 - 29833374
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29833577 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 29833478  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29833477 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 29833378  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  29833377 tgtt 29833374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 2133224 - 2133433
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133224 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 2133323  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  2133324 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcaaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatat 2133423  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  2133424 tgttggtaca 2133433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18713736 - 18713527
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713736 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 18713637  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  18713636 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatattcagccatat 18713537  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18713536 tgttggtaca 18713527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 12088688 - 12088896
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12088688 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattccccctttatctgat 12088787  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12088788 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 12088887  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  12088888 gttggtaca 12088896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19678698 - 19678490
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19678698 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 19678599  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19678598 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 19678499  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  19678498 gttggtaca 19678490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 19204326 - 19204535
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19204326 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 19204425  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19204426 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 19204525  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  19204526 tgttggtaca 19204535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 31485835 - 31486044
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31485835 gtgcagctcaacctttgtgaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 31485934  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31485935 ttaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 31486034  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31486035 tgttggtaca 31486044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Original strand, 22076896 - 22077098
Alignment:
Q  24 tcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatga 123  Q
    ||||||||||| ||||| | || || ||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| || || |    
T  22076896 tcaacctttgtgaaatatgacaacagacggctcacataatcacggtaaggaaccagcttgtcatgatgggtcatccattcaccctttatctggttaataa 22076995  T
Q  124 caagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttgt 223  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22076996 caagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgctcccacaatccccaagatacatgcttcgtactcagccatgttatttgt 22077095  T
Q  224 aca 226  Q
    |||    
T  22077096 aca 22077098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 22412500 - 22412025
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  22412500 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 22412401  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  22412400 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 22412301  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  22412300 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 22412201  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  22412200 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 22412101  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22412100 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 22412025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 14212601 - 14212126
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  14212601 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtact 14212502  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  14212501 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 14212402  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  14212401 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 14212302  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  14212301 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 14212202  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14212201 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 14212126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 224 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 19844729 - 19844223
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || ||||||    
T  19844729 acaatcggtgaacttcttactcaaatagtagatagcttgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatggaatcttccaatact 19844630  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| |  || ||||| | ||| || |  |||||    |||||||| |  |||||  |||    
T  19844629 gttaaatacatgatcaaaggtcttccatcaactggaggaacaagaactggaggttctaacagatattctttgatttggtcaaaagccttctggcaatcat 19844530  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||  |||    ||| |  || |  |||| |||||| ||||| || || || || ||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  19844529 cattccactcaaccccttgatctttgcgaagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctacc 19844430  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||  | ||| || || ||||| |||||||| || || || ||||| ||     
T  19844429 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggttccgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttgtgactgacgata 19844330  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    || || |  |  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  | || |||||||  |||||| |    
T  19844329 aaacccaggagtttaccggatctaacaccgaatgtacatttgttaggattcaaacggagcttgtactttctcaagcgctgaaacatctttaacaaatact 19844230  T
Q  724 caacatg 730  Q
    |||||||    
T  19844229 caacatg 19844223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 16768657 - 16768410
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |  || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  16768657 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 16768558  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
    | |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || |    
T  16768557 tttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatccacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacac 16768458  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  16768457 cgaaggtacacttattaggattcaaacggagtttgtactttctcaacc 16768410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Original strand, 19657995 - 19658031
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657995 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33245931 - 33245894
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcat 261  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33245931 acaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcat 33245894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 100)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27022696 - 27022165
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27022696 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 27022597  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27022596 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27022497  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27022496 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgccc 27022397  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27022396 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27022297  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27022296 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatact 27022197  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27022196 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 27022165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 13295587 - 13296114
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13295587 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 13295686  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13295687 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcat 13295786  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13295787 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 13295886  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13295887 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 13295986  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13295987 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 13296086  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13296087 caacatgttgctcctcatctgttgactt 13296114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29553117 - 29552586
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29553117 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacagcccatggattcatcaaatact 29553018  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29553017 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 29552918  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552917 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 29552818  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29552817 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 29552718  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  29552717 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtatatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatact 29552618  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29552617 caacatgttgttcctcatctgttgacttcaca 29552586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 15420956 - 15421487
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15420956 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 15421055  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15421056 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 15421155  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15421156 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 15421255  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15421256 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 15421355  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  15421356 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatact 15421455  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15421456 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 15421487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 22931520 - 22932047
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22931520 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 22931619  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22931620 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 22931719  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931720 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 22931819  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22931820 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 22931919  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  22931920 aagcctaataactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 22932019  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22932020 caacatgttgctcctcatctgttgactt 22932047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 23853965 - 23854492
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23853965 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 23854064  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23854065 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 23854164  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854165 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 23854264  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23854265 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 23854364  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  23854365 aagcctaataactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 23854464  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23854465 caacatgttgctcctcatctgttgactt 23854492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27011291 - 27010760
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011291 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 27011192  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27011191 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27011092  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27011091 cattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 27010992  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27010991 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27010892  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  27010891 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 27010792  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27010791 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 27010760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 27287000 - 27287527
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27287000 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 27287099  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27287100 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27287199  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287200 cattccatacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 27287299  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287300 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 27287399  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27287400 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 27287499  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  27287500 caacatgttgttcctcatctgttgactt 27287527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 24867276 - 24866749
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24867276 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacaaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 24867177  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24867176 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24867077  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24867076 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24866977  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24866976 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24866877  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  24866876 aagcctagtaactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 24866777  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24866776 caacatgttgctcctcatctgttgactt 24866749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27061066 - 27060535
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061066 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 27060967  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27060966 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27060867  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  27060866 cgttccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtcc 27060767  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27060766 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27060667  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27060666 aagcctaataatttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaaacgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 27060567  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060566 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 27060535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28211014 - 28210483
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211014 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 28210915  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28210914 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 28210815  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28210814 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 28210715  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28210714 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 28210615  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  28210614 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 28210515  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28210514 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 28210483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26921936 - 26921406
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26921936 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactg 26921837  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  26921836 ccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatt 26921737  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26921736 attccaaacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccg 26921637  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921636 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 26921537  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26921536 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatattc 26921437  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26921436 aacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 26921406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 26113048 - 26113579
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113048 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 26113147  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26113148 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 26113247  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26113248 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 26113347  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26113348 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 26113447  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  26113448 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttagatatt 26113547  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26113548 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 26113579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 27269223 - 27269750
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27269223 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 27269322  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27269323 gccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcat 27269422  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269423 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 27269522  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27269523 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcctggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27269622  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  27269623 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 27269722  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||    
T  27269723 caacatgttgttcctcatctgttgactt 27269750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 751
Target Start/End: Original strand, 27626351 - 27626874
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27626351 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 27626450  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27626451 agtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 27626550  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27626551 ccacacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 27626650  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626651 aaacctctgacttgcttctcggtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 27626750  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  27626751 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaac 27626850  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27626851 atgctgctcctcatctgttgactt 27626874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 4720771 - 4721302
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720771 acaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 4720870  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4720871 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4720970  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4720971 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 4721070  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4721071 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4721170  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4721171 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 4721270  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4721271 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 4721302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4761319 - 4760792
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4761319 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 4761220  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4761219 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 4761120  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  4761119 ccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 4761020  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4761019 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggaccttatcgggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 4760920  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4760919 ctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 4760820  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4760819 atgctgctcctcatctgctgacttcaca 4760792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 16940663 - 16941194
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940663 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 16940762  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16940763 gctaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 16940862  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16940863 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 16940962  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16940963 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttgactgacaatg 16941062  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16941063 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 16941162  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16941163 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 16941194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29576574 - 29576043
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576574 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 29576475  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29576474 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 29576375  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29576374 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 29576275  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29576274 caggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 29576175  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29576174 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 29576075  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29576074 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 29576043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 34461146 - 34461673
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34461146 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 34461245  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34461246 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 34461345  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461346 ccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 34461445  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34461446 aaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 34461545  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  34461546 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgtcaaatactcaac 34461645  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  34461646 atgttgttcctcatctgttgacttcaca 34461673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16753380 - 16752850
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16753380 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactg 16753281  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16753280 ccaaatacataatcagaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatc 16753181  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  16753180 attccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccg 16753081  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16753080 aggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 16752981  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16752980 agcctaataatttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatactc 16752881  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16752880 aacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 16752850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3699643 - 3699112
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699643 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 3699544  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3699543 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 3699444  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699443 cattccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 3699344  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3699343 gaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 3699244  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  3699243 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatact 3699144  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  3699143 caacatgttgttcctcatctgttgacttcaca 3699112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 4542410 - 4542941
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542410 acaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 4542509  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4542510 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4542609  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542610 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 4542709  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4542710 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4542809  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4542810 aagcctaataactttccggacctgacactgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 4542909  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4542910 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 4542941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27488693 - 27488162
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488693 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 27488594  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27488593 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27488494  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27488493 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 27488394  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27488393 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27488294  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |    
T  27488293 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgttaaatatt 27488194  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27488193 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 27488162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4776440 - 4775909
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776440 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 4776341  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4776340 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4776241  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4776240 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 4776141  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4776140 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcaacttcaatgcccttttggctgacaatg 4776041  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4776040 aagcctaataactttccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 4775941  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4775940 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 4775909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 29504972 - 29504445
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29504972 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 29504873  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29504872 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 29504773  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29504772 ccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccagg 29504673  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29504672 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 29504573  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  29504572 ctaataacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 29504473  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29504472 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 29504445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4528845 - 4528314
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528845 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 4528746  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4528745 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4528646  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4528645 catcccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 4528546  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4528545 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4528446  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4528445 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcagtcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 4528346  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4528345 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 4528314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16677700 - 16677169
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16677700 acaatcagtgaacttcttgctcaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 16677601  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16677600 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 16677501  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677500 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 16677401  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  16677400 gaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaccg 16677301  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16677300 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatatt 16677201  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16677200 caacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 16677169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 30554652 - 30555183
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  30554652 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 30554751  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30554752 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 30554851  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30554852 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 30554951  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30554952 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgataatg 30555051  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30555052 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 30555151  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30555152 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 30555183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 27180016 - 27179564
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27180016 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 27179917  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27179916 gccaaatacataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcat 27179817  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179816 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 27179717  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27179716 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27179617  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaa 676  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27179616 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaa 27179564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 17089079 - 17089610
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  17089079 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtcccatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcgaacact 17089178  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  17089179 gacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcat 17089278  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089279 cgttccacacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 17089378  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17089379 gaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtggggccggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 17089478  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  17089479 aagcctagcaactttcccgatctgacaccgaacgtacatttattaggattcaatcggagcctgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaagtatt 17089578  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  17089579 cgacatgttgctcctcatcttttgacttcaca 17089610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 228 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 20172103 - 20171682
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||| ||||| |    
T  20172103 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgcca 20172004  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  20172003 aatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 20171904  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20171903 ccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgagg 20171804  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20171803 aaacctctaacttgtttctcagtctgcggaaccggcatttctcggatggcgcggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 20171704  T
Q  628 ctaataactttccggatctgac 649  Q
    |||  | |||||| ||||||||    
T  20171703 ctagcagctttccagatctgac 20171682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 228 - 649
Target Start/End: Original strand, 22163888 - 22164309
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| ||||| ||||| |    
T  22163888 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcctacgaattcgtcaaacactgcca 22163987  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22163988 aatacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 22164087  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22164088 ccacacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgagg 22164187  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164188 aaacctctaacttgtttctcagtctgcggaaccggcatttctcggatggcgcggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 22164287  T
Q  628 ctaataactttccggatctgac 649  Q
    |||  | |||||| ||||||||    
T  22164288 ctagcagctttccagatctgac 22164309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 224 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 26992355 - 26992096
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26992355 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 26992256  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  26992255 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 26992156  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcgg 483  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26992155 cattccatagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 225 - 466
Target Start/End: Original strand, 33373068 - 33373309
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33373068 caatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 33373167  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33373168 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatc 33373267  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagat 466  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33373268 attccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagat 33373309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 27358750 - 27358970
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27358750 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgcca 27358849  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27358850 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 27358949  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27358950 ccatacaataggctgattctt 27358970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 27449093 - 27449313
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27449093 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactgcca 27449192  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27449193 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 27449292  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27449293 ccatacaataggctgattctt 27449313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 224 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 28164051 - 28163836
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28164051 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatact 28163952  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28163951 gccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 28163852  T
Q  424 cattccatacaatagg 439  Q
    ||||||||||||||||    
T  28163851 cattccatacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 26775267 - 26775487
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26775267 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 26775366  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26775367 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 26775466  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  26775467 ccatacaataggctgattctt 26775487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 15408479 - 15408688
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15408479 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 15408578  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15408579 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 15408678  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  15408679 tgtttgtaca 15408688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 15420266 - 15420475
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420266 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 15420365  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15420366 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 15420465  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  15420466 tgtttgtaca 15420475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 13294897 - 13295106
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13294897 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 13294996  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13294997 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 13295096  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  13295097 tgtttgtaca 13295106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22930830 - 22931039
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22930830 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccctttatctga 22930929  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22930930 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 22931029  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  22931030 tgtttgtaca 22931039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 23853275 - 23853484
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23853275 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccctttatctga 23853374  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23853375 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 23853474  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  23853475 tgtttgtaca 23853484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 27625657 - 27625866
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  27625657 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacggtaaggaatcaacttgtcatgatgggtcacccattcaccctttatctgg 27625756  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27625757 ttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcgtattcagccatat 27625856  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  27625857 tgtttgtaca 27625866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29505666 - 29505457
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29505666 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 29505567  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29505566 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 29505467  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  29505466 tgtttgtaca 29505457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29553807 - 29553598
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553807 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 29553708  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29553707 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 29553608  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  29553607 tgttggtaca 29553598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 224 - 439
Target Start/End: Original strand, 8902339 - 8902554
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||| |||    
T  8902339 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagatgcatcaaacact 8902438  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8902439 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 8902538  T
Q  424 cattccatacaatagg 439  Q
    ||||||||||||||||    
T  8902539 cattccatacaatagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 13520140 - 13520349
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520140 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 13520239  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13520240 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 13520339  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  13520340 tgttggtaca 13520349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24867966 - 24867757
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24867966 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccctttatctga 24867867  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24867866 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 24867767  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24867766 tgtttgtaca 24867757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26922627 - 26922418
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26922627 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 26922528  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26922527 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26922428  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26922427 tgttggtaca 26922418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27061756 - 27061547
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061756 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 27061657  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27061656 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 27061557  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  27061556 tgtttgtaca 27061547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 34460452 - 34460661
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34460452 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 34460551  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34460552 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcctcatactcagccatgt 34460651  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  34460652 tgttggtaca 34460661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 232 - 448
Target Start/End: Original strand, 22455758 - 22455974
Alignment:
Q  232 tgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaata 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||||    
T  22455758 tgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcaccaaacactgacaaata 22455857  T
Q  332 cataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccat 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||     
T  22455858 cataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccac 22455957  T
Q  432 acaataggttggttctt 448  Q
    ||||||||||| |||||    
T  22455958 acaataggttgattctt 22455974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16678390 - 16678181
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16678390 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgcctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 16678291  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16678290 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 16678191  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  16678190 tgttggtaca 16678181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 24301703 - 24301912
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24301703 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 24301802  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24301803 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 24301902  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24301903 tgtttgtaca 24301912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26774573 - 26774782
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26774573 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 26774672  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26774673 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaaatacatgcttcatactcagccatgt 26774772  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26774773 tgttggtaca 26774782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 27286314 - 27286519
Alignment:
Q  21 aactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattga 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27286314 aactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtcttgcgtaatcacggtaaggaattagcttggcatggtgggtctcccattctccctttatctgattga 27286413  T
Q  121 tgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtt 220  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27286414 tgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatattgtt 27286513  T
Q  221 tgtaca 226  Q
    ||||||    
T  27286514 tgtaca 27286519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28164741 - 28164532
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164741 gtgcaactcaaccttcgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 28164642  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28164641 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 28164542  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  28164541 tgtttgtaca 28164532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 29577264 - 29577055
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29577264 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 29577165  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29577164 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 29577065  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  29577064 tgttggtaca 29577055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Original strand, 13520828 - 13521051
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  13520828 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 13520927  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  13520928 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcat 13521026  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  13521027 cgttccatacaataggctgattctt 13521051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 14142034 - 14142254
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  14142034 tcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 14142133  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  14142134 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 14142233  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  14142234 ccatacaataggctgattctt 14142254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 26789372 - 26789152
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  26789372 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 26789273  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26789272 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 26789173  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  26789172 ccatacaataggctgattctt 26789152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 579 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26992098 - 26991922
Alignment:
Q  579 cggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaacc 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26992098 cggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatc 26991999  T
Q  679 gaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26991998 gaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 26991922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27197741 - 27197521
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  27197741 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 27197642  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27197641 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 27197542  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27197541 ccatacaataggctgattctt 27197521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 27251494 - 27251714
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  27251494 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 27251593  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27251594 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 27251693  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27251694 ccatacaataggctgattctt 27251714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Original strand, 8901649 - 8901863
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8901649 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8901748  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  8901749 ttaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatactcagccatat 8901848  T
Q  217 tgtttgtacaatcgg 231  Q
    |||| ||||| ||||    
T  8901849 tgttggtacattcgg 8901863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 4720081 - 4720290
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4720081 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4720180  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4720181 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4720280  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  4720281 tgttggtaca 4720290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4762013 - 4761804
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4762013 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4761914  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4761913 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 4761814  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  4761813 tgttggtaca 4761804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4777130 - 4776921
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4777130 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4777031  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4777030 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 4776931  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  4776930 tgttggtaca 4776921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16754071 - 16753862
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754071 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 16753972  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16753971 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtagaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 16753872  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  16753871 tgttggtaca 16753862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 17088389 - 17088598
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||||||| |||||||| || || |||| || ||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17088389 gtgcaactctacctttgttaattatgtcatcatacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtttcccattcaccctttatctgg 17088488  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17088489 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatattcagccatgt 17088588  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  17088589 tgtttgtaca 17088598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26790066 - 26789857
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790066 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 26789967  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26789966 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26789867  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26789866 tgttggtaca 26789857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27023387 - 27023178
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27023387 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgttagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 27023288  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27023287 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 27023188  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  27023187 tgtttgtaca 27023178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27489383 - 27489174
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27489383 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 27489284  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27489283 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 27489184  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  27489183 tgttggtaca 27489174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3700332 - 3700124
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3700332 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 3700233  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3700232 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 3700133  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  3700132 gttggtaca 3700124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 4541721 - 4541929
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4541721 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 4541820  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4541821 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 4541920  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  4541921 gttggtaca 4541929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 26112359 - 26112567
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112359 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 26112458  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26112459 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 26112558  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    |||||||||    
T  26112559 gtttgtaca 26112567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27198434 - 27198226
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27198434 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 27198335  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27198334 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 27198235  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  27198234 gttggtaca 27198226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 27250801 - 27251009
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250801 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 27250900  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27250901 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 27251000  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  27251001 gttggtaca 27251009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 27358056 - 27358259
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358056 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 27358155  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27358156 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 27358255  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  27358256 tgtt 27358259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 33372377 - 33372580
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372377 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33372476  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33372477 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 33372576  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  33372577 tgtt 33372580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 14141340 - 14141549
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14141340 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttctctaa 14141439  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14141440 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 14141539  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  14141540 tgttggtaca 14141549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4529534 - 4529326
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4529534 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 4529435  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4529434 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgctccctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 4529335  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    |||||||||    
T  4529334 gtttgtaca 4529326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27011980 - 27011772
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27011980 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctgat 27011881  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27011880 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 27011781  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  27011780 gttggtaca 27011772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28211703 - 28211495
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28211703 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattccccctttatctgat 28211604  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28211603 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 28211504  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  28211503 gttggtaca 28211495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16939973 - 16940182
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16939973 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 16940072  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  16940073 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatat 16940172  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16940173 tgtttgtaca 16940182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 30553962 - 30554171
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30553962 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 30554061  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  30554062 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 30554161  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  30554162 tgttggtaca 30554171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20172797 - 20172588
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  20172797 gtgcaactcgaccttcgtaaagtaagtcaacaatcgtcttgcataatcacggtatgggatcaacttggcatgatgagtctcccattcaccctttatctgg 20172698  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  20172697 ttgatgacaagtgctgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcaagttaattgcttcctcaattccaaagatacatgcttcgtattcggccatat 20172598  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  20172597 tgtttgtaca 20172588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22163194 - 22163403
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| || || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  22163194 gtgcaactcgaccttcgtaaagtaagtcaacaatcgtcttgcataatcacggtatgggatcaacttggcatgatgagtctcccattcaccctttatctgg 22163293  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  22163294 ttgatgacaagtgctgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcaagttaattgcttcctcaattccaaagatacatgcttcgtattcggccatat 22163393  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  22163394 tgtttgtaca 22163403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 18120029 - 18119554
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  18120029 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtact 18119930  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  18119929 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 18119830  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  18119829 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 18119730  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  18119729 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 18119630  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18119629 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 18119554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 18212305 - 18212780
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  18212305 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 18212404  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  18212405 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 18212504  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | |||||  ||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  18212505 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaatttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 18212604  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  18212605 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacctttttgactgacgata 18212704  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18212705 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 18212780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 452 - 699
Target Start/End: Original strand, 23971634 - 23971881
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||| |||||| |||||||  |  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  23971634 gagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatgtgagagataaatctggagatataattcagtctaccaagaaaacctctgacttgcttctctgtc 23971733  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
    | |||| | |||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || |||||||  |  || || |||||||| |    
T  23971734 tttggaacaggcatttctctgatggctttgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagcctaggagtttaccagatctgacac 23971833  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23971834 cgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 23971881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 688
Target Start/End: Original strand, 9135999 - 9136453
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || |  |||| ||  ||||    
T  9135999 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtaca 9136098  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  9136099 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 9136198  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  9136199 aataccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 9136297  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  9136298 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 9136397  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgta 688  Q
    | |||||||||||| || || || || |||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  9136398 agctttccggatctaacaccaaaagtgcatttgttgggattcagacgaagtttgta 9136453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 349
Target Start/End: Original strand, 23971406 - 23971531
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  23971406 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatatcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaacacacagcccatggaatcttccagtact 23971505  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttcc 349  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||    
T  23971506 gttaagtacatgatcaaaggtcttcc 23971531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 452 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 27545234 - 27544987
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |  || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  27545234 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 27545135  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
      |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || || | ||| |||||||| || |    
T  27545134 cttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcaggatctacttcaatacccttctggctgacgataaaacccaagagcttgccggatctaacac 27545035  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  27545034 cgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtactttctcaacc 27544987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 452 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 25707343 - 25707083
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  || || || ||||| ||||| ||||  |||    
T  25707343 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcaatcttcctagaaagcctctaacttgtttctatgtc 25707244  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
      |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || |    
T  25707243 cttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacac 25707144  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctt 712  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || || ||||||    
T  25707143 caaaggtacacttcttaggattcaaccgaagtttgtacattctcaaccgttgaaacatctt 25707083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 20163753 - 20163649
Alignment:
Q  651 ccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgact 750  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||  || || ||||| |||||||||||  | ||||    
T  20163753 ccgaacgtacatttgttaggattcaagcgaagcttgtactttctacacctttcgaacatcttcgtcaggtattcgacatgttgctcctcatccctcgact 20163654  T
Q  751 tcaca 755  Q
    |||||    
T  20163653 tcaca 20163649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 651 - 755
Target Start/End: Original strand, 22169078 - 22169182
Alignment:
Q  651 ccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgact 750  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| ||||  || || ||||| |||||||||||  | ||||    
T  22169078 ccgaacgtacatttgttaggattcaagcgaagcttgtactttctacacctttcgaacatcttcgtcaggtattcgacatgttgctcctcatccctcgact 22169177  T
Q  751 tcaca 755  Q
    |||||    
T  22169178 tcaca 22169182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 228 - 261
Target Start/End: Original strand, 24302397 - 24302430
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcat 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24302397 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 24302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 456; Significance: 0; HSPs: 129)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 4793371 - 4793902
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4793371 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 4793470  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4793471 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4793570  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793571 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 4793670  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4793671 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgttgagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4793770  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4793771 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatact 4793870  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4793871 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 4793902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 5606050 - 5606581
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606050 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 5606149  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5606150 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 5606249  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5606250 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 5606349  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5606350 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 5606449  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5606450 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 5606549  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5606550 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 5606581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 22384314 - 22384845
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22384314 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 22384413  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22384414 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 22384513  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22384514 cattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttc 22384613  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22384614 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 22384713  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22384714 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 22384813  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22384814 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 22384845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 8286206 - 8286737
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8286206 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 8286305  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8286306 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 8286405  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286406 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 8286505  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286506 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 8286605  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  8286606 aagcctaataactttccggatctgacgtcgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 8286705  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8286706 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 8286737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 8299495 - 8298964
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8299495 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccaatctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 8299396  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  8299395 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 8299296  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8299295 cattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 8299196  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8299195 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 8299096  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8299095 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 8298996  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8298995 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 8298964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 751
Target Start/End: Original strand, 15889442 - 15889968
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15889442 caatcggtgaacttcttgcttatatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactg 15889541  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15889542 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatc 15889641  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15889642 attccatacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccg 15889741  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15889742 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 15889841  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15889842 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattc 15889941  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15889942 aacatgttgctcctcatctgttgactt 15889968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21678223 - 21677696
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21678223 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 21678124  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21678123 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcatt 21678024  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678023 ccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 21677924  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21677923 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 21677824  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  21677823 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcagtcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaac 21677724  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21677723 atgttgctcctcgtctgttgacttcaca 21677696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 35884290 - 35883759
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35884290 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 35884191  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35884190 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 35884091  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35884090 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 35883991  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35883990 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 35883891  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  35883890 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 35883791  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35883790 caacatgttgctcctcatctattgacttcaca 35883759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4725155 - 4724624
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4725155 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 4725056  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4725055 gccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4724956  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724955 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 4724856  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4724855 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4724756  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  4724755 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 4724656  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4724655 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 4724624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 6205427 - 6204896
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6205427 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 6205328  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6205327 gccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 6205228  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205227 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 6205128  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6205127 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttcttggatggcccgaactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 6205028  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6205027 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 6204928  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6204927 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 6204896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 7076730 - 7076199
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7076730 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 7076631  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7076630 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 7076531  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7076530 cattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 7076431  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7076430 gaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 7076331  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  7076330 aagcctaataacttcccggacctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcagcctttcaaacatctttgtcaaatatt 7076231  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7076230 caacatgctgctcctcatctgtcgacttcaca 7076199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 15737830 - 15738361
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15737830 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 15737929  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15737930 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 15738029  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738030 cattccatacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 15738129  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15738130 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggattgacttcaatgcccttttggctgacaatg 15738229  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  15738230 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatact 15738329  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15738330 cgacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 15738361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18054786 - 18054255
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18054786 acaatcggtgaacttcttacttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18054687  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18054686 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 18054587  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054586 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 18054487  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18054486 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcagatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 18054387  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18054386 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 18054287  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18054286 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 18054255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 18304390 - 18304921
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18304390 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18304489  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18304490 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18304589  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18304590 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 18304689  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18304690 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 18304789  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |    
T  18304790 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatatt 18304889  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18304890 caacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 18304921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 18273788 - 18274319
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18273788 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18273887  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18273888 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18273987  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18273988 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 18274087  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18274088 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 18274187  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |    
T  18274188 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatatt 18274287  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18274288 caacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 18274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 18289089 - 18289620
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18289089 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttccttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18289188  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18289189 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18289288  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18289289 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 18289388  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18289389 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 18289488  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |    
T  18289489 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatatt 18289588  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18289589 caacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 18289620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 18334154 - 18333627
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18334154 acaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18334055  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18334054 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18333955  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333954 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 18333855  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18333854 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggtgctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 18333755  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  18333754 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatatt 18333655  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18333654 caacatgttgctcctcatctgttgactt 18333627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 20069564 - 20069037
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20069564 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 20069465  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20069464 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 20069365  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20069364 cattccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgccc 20069265  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20069264 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 20069165  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20069164 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttggcattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 20069065  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20069064 caacatgttgctcctcatctgttgactt 20069037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 29145492 - 29146023
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29145492 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 29145591  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29145592 gccaaatacataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 29145691  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29145692 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 29145791  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29145792 gaggaaacctctaacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatacccttttggctgacaatg 29145891  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29145892 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatttccttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 29145991  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  29145992 caacatgttgctcctcatttgttgacttcaca 29146023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5470512 - 5469981
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470512 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 5470413  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5470412 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 5470313  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5470312 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 5470213  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5470212 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttttcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 5470113  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5470112 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtatttcctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 5470013  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5470012 taacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 5469981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 5593097 - 5593624
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5593097 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 5593196  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5593197 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcatt 5593296  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593297 ccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 5593396  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5593397 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 5593496  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  5593497 ctaataacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 5593596  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593597 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 5593624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 28112690 - 28113221
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28112690 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 28112789  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28112790 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcat 28112889  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28112890 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 28112989  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28112990 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccgtactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 28113089  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28113090 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 28113189  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28113190 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 28113221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 32442675 - 32442148
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32442675 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 32442576  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32442575 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 32442476  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32442475 cattccatacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 32442376  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32442375 gaggaaacctctgacttgcttctcgatccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 32442276  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32442275 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatatacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatact 32442176  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32442175 caacatgttgctcctcatctgttgactt 32442148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 8000084 - 7999553
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8000084 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcgtcaaatact 7999985  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7999984 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 7999885  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7999884 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 7999785  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  7999784 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 7999685  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  7999684 aagcctaacaacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 7999585  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7999584 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 7999553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10399668 - 10399137
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10399668 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 10399569  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10399568 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 10399469  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10399468 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 10399369  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10399368 gaggaaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 10399269  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  10399268 aagcctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatact 10399169  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  10399168 caacatgttgttcctcatctgttgacttcaca 10399137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 4343412 - 4343943
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4343412 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 4343511  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4343512 accaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4343611  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4343612 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 4343711  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4343712 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4343811  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4343812 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 4343911  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4343912 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 4343943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10646597 - 10646066
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10646597 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatctcatggattcgtcaaatact 10646498  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10646497 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 10646398  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10646397 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 10646298  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10646297 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 10646198  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  10646197 aagcctaacaacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 10646098  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10646097 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 10646066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28024806 - 28024275
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024806 acaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 28024707  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28024706 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcat 28024607  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28024606 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgccc 28024507  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28024506 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 28024407  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  28024406 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttatattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 28024307  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024306 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 28024275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 31961191 - 31961722
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961191 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 31961290  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31961291 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31961390  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31961391 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 31961490  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31961491 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggacggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 31961590  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31961591 aagcctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgctgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31961690  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31961691 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 31961722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 4420439 - 4419908
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420439 acaatcggtgaacttcttgcttagataatagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 4420340  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4420339 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4420240  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4420239 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 4420140  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4420139 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 4420040  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  4420039 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 4419940  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  4419939 caacatgttgctcctcatctgctgacttcaca 4419908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 6539478 - 6540009
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539478 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatact 6539577  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6539578 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 6539677  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6539678 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 6539777  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6539778 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 6539877  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  6539878 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 6539977  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6539978 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 6540009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 22867584 - 22868115
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22867584 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 22867683  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22867684 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 22867783  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22867784 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 22867883  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22867884 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcgatgcccttttggctgacaatg 22867983  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  22867984 aagcctaataactttccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 22868083  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22868084 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 22868115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 22882643 - 22883174
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22882643 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggttttatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 22882742  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22882743 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 22882842  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22882843 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 22882942  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22882943 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcgatgcccttttggctgacaatg 22883042  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  22883043 aagcctaataactttccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 22883142  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22883143 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 22883174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 51785547 - 51785016
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51785547 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 51785448  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51785447 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 51785348  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51785347 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 51785248  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51785247 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 51785148  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  51785147 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 51785048  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51785047 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 51785016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 17981685 - 17982216
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981685 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 17981784  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17981785 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 17981884  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17981885 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 17981984  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17981985 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 17982084  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  17982085 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 17982184  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17982185 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 17982216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18228720 - 18228189
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228720 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 18228621  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18228620 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18228521  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18228520 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 18228421  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18228420 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 18228321  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18228320 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 18228221  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18228220 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 18228189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18246265 - 18245734
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246265 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 18246166  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18246165 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18246066  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18246065 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 18245966  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18245965 caagaaacctctgacttgcttctctatctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 18245866  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |    
T  18245865 aagcctaataactttcctgacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgttaaatatt 18245766  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18245765 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 18245734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 20573583 - 20574110
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573583 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 20573682  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  20573683 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcatt 20573782  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573783 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 20573882  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20573883 aaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 20573982  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  20573983 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaac 20574082  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20574083 atgttgctcctcgtctgttgacttcaca 20574110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 24331687 - 24331156
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  24331687 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacact 24331588  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24331587 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcat 24331488  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24331487 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24331388  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24331387 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24331288  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  24331287 aaacctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 24331188  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24331187 caacatgctgttcctcatctgttgacttcaca 24331156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28342697 - 28342170
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  28342697 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgcca 28342598  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28342597 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 28342498  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  28342497 ccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 28342398  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28342397 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 28342298  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  28342297 ctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 28342198  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28342197 atgctgttcctcatctgttgacttcaca 28342170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 47026977 - 47026446
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  47026977 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 47026878  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47026877 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 47026778  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47026777 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 47026678  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47026677 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 47026578  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  47026577 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 47026478  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47026477 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 47026446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 29661710 - 29662237
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29661710 tcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 29661809  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29661810 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 29661909  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29661910 ccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 29662009  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29662010 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggggctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 29662109  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  29662110 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatcttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaac 29662209  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  29662210 atgttgctcttcgtctgttgacttcaca 29662237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 48469447 - 48468920
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48469447 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 48469348  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  48469347 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattatt 48469248  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48469247 ccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 48469148  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  48469147 aaacctatgacttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 48469048  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  48469047 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcagtcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaac 48468948  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48468947 atgttgctcctcatctgttgacttcaca 48468920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 11107095 - 11107619
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11107095 acaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 11107194  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||       || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11107195 gccaaatacatgatcaacggccttccttcca-------gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattctt 11107287  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107288 cattccatacaataggctgactctttctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 11107387  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11107388 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 11107487  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  11107488 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 11107587  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11107588 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 11107619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5017238 - 5016707
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  5017238 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 5017139  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5017138 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 5017039  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5017038 cattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 5016939  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5016938 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 5016839  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  5016838 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 5016739  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5016738 caacatgctgctcctcctctgctgacttcaca 5016707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 8215255 - 8214728
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8215255 tcggtgaacttcttgcttagatagtaggtagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggactcatcaaatactgcca 8215156  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8215155 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 8215056  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| |||| ||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  8215055 ccacacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccagg 8214956  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8214955 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 8214856  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  8214855 ctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaac 8214756  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8214755 atgttgctcctcatctattgacttcaca 8214728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 19698014 - 19697487
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  19698014 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcgaacact 19697915  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  19697914 gacaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcat 19697815  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  19697814 cgttccatacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtcc 19697715  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19697714 gaggaaacctctgacttgtttctcggtccttggagctggcatttcttggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttctggctgacaatg 19697615  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  19697614 aagcctagtaactttctggatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaagtatt 19697515  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19697514 caacatgtttctcctcatctgttgactt 19697487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 231 - 755
Target Start/End: Original strand, 16621233 - 16621757
Alignment:
Q  231 gtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaat 330  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||    
T  16621233 gtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgacaaat 16621332  T
Q  331 acataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattcca 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  431 tacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 530  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  531 cctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagccta 630  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16621533 cctctgacttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcgaatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagccta 16621632  T
Q  631 ataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
     ||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||    
T  16621633 gtaactttccagatctgaccccgaacgtacacttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgacatg 16621732  T
Q  731 ctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  16621733 ttgctcctcatcttttgacttcaca 16621757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 224 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4687179 - 4686838
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4687179 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 4687080  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4687079 gccaaatacataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 4686980  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4686979 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 4686880  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcat 565  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4686879 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcat 4686838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4627305 - 4627085
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4627305 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcgaatactgcca 4627206  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4627205 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 4627106  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  4627105 ccatacaataggctgattctt 4627085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5714593 - 5714373
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5714593 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 5714494  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5714493 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 5714394  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  5714393 ccatacaataggctgattctt 5714373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5725503 - 5725283
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5725503 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 5725404  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5725403 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 5725304  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  5725303 ccatacaataggctgattctt 5725283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 5766865 - 5767085
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5766865 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 5766964  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  5766965 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 5767064  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  5767065 ccatacaataggctgattctt 5767085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5654299 - 5654090
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  5654299 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcgtaatcacggtaagggatcagcttggcatggtcggtctcccattcaccctttatctgg 5654200  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5654199 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttccttgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 5654100  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  5654099 tgtttgtaca 5654090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28343391 - 28343182
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28343391 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 28343292  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28343291 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 28343192  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  28343191 tgtttgtaca 28343182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 29144802 - 29145011
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29144802 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 29144901  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29144902 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 29145001  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  29145002 tgtttgtaca 29145011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5017928 - 5017719
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017928 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 5017829  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5017828 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 5017729  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5017728 tgttggtaca 5017719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 15888751 - 15888960
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888751 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 15888850  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15888851 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 15888950  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  15888951 tgtttgtaca 15888960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22383624 - 22383833
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383624 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 22383723  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22383724 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 22383823  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  22383824 tgtttgtaca 22383833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Original strand, 31032972 - 31033196
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  31032972 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 31033071  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  31033072 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 31033171  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | ||||||| |||||| || |||||    
T  31033172 cgttccatataataggctgattctt 31033196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 32294152 - 32293928
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  32294152 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 32294053  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  32294052 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 32293953  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  32293952 cgttccatacaataggctgattctt 32293928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 28112006 - 28112209
Alignment:
Q  23 ctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28112006 ctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatg 28112105  T
Q  123 acaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttg 222  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28112106 acgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgttgttgg 28112205  T
Q  223 taca 226  Q
    ||||    
T  28112206 taca 28112209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4627999 - 4627790
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4627999 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4627900  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4627899 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattgtcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4627800  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  4627799 tgttggtaca 4627790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4687869 - 4687660
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4687869 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcaccctttatctga 4687770  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4687769 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4687670  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  4687669 tgtttgtaca 4687660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 5605360 - 5605569
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5605360 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 5605459  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5605460 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 5605559  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  5605560 tgtttgtaca 5605569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6206118 - 6205909
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6206118 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 6206019  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6206018 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 6205919  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  6205918 tgttggtaca 6205909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7077420 - 7077211
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7077420 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 7077321  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7077320 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgacgtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 7077221  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  7077220 tgttagtaca 7077211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8000774 - 8000565
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8000774 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8000675  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8000674 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 8000575  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  8000574 tgttggtaca 8000565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 8285516 - 8285725
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8285516 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacatctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8285615  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8285616 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 8285715  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  8285716 tgtttgtaca 8285725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8300185 - 8299976
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8300185 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8300086  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8300085 ttgatgacgagcgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatagcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 8299986  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  8299985 tgtttgtaca 8299976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10647287 - 10647078
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10647287 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10647188  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10647187 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 10647088  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  10647087 tgttggtaca 10647078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16620536 - 16620745
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16620536 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgttagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 16620635  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16620636 ttgatgacaagtgccgaatctccgtagatgttgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagccatgt 16620735  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16620736 tgtttgtaca 16620745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20070254 - 20070045
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20070254 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 20070155  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20070154 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatagcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 20070055  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  20070054 tgttggtaca 20070045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21678917 - 21678708
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21678917 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctga 21678818  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678817 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcgtactcagccatgt 21678718  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  21678717 tgttggtaca 21678708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 29661016 - 29661225
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29661016 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 29661115  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29661116 ttgatgacgagagcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatctcaaagatacatgcttcatactcagccatgt 29661215  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  29661216 tgttggtaca 29661225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32294842 - 32294633
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32294842 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 32294743  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32294742 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 32294643  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  32294642 tgttggtaca 32294633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32443365 - 32443156
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32443365 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 32443266  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32443265 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 32443166  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  32443165 tgtttgtaca 32443156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51786237 - 51786028
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51786237 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 51786138  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51786137 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 51786038  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  51786037 tgttggtaca 51786028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 5592403 - 5592612
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5592403 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 5592502  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5592503 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 5592602  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5592603 tgttggtaca 5592612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 11106405 - 11106614
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11106405 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 11106504  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11106505 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 11106604  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  11106605 tgttggtaca 11106614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 17972907 - 17973116
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17972907 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatagtgggtctcccactcaccctttatctga 17973006  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17973007 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 17973106  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  17973107 tgttggtaca 17973116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18055476 - 18055267
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055476 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 18055377  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18055376 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18055277  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18055276 tgttggtaca 18055267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18273098 - 18273307
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18273098 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctccctttatctga 18273197  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18273198 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18273297  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  18273298 tgtttgtaca 18273307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18288399 - 18288608
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18288399 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctccctttatctga 18288498  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18288499 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18288598  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  18288599 tgtttgtaca 18288608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18303700 - 18303909
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  18303700 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctccctttatctga 18303799  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18303800 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18303899  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  18303900 tgtttgtaca 18303909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18334844 - 18334635
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18334844 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 18334745  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18334744 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18334645  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18334644 tgttggtaca 18334635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19698704 - 19698495
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19698704 gtgcgactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattctccctttatctgg 19698605  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19698604 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcacatcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 19698505  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  19698504 tgtttgtaca 19698495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24332377 - 24332168
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24332377 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 24332278  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24332277 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgttgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 24332178  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24332177 tgtttgtaca 24332168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28025495 - 28025286
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28025495 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 28025396  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28025395 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 28025296  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  28025295 tgttggtaca 28025286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 31032282 - 31032491
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032282 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 31032381  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31032382 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 31032481  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  31032482 tgtttgtaca 31032491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35884980 - 35884771
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884980 gtgcagcttaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 35884881  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  35884880 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 35884781  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  35884780 tgttggtaca 35884771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 17992671 - 17992891
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  17992671 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 17992770  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  17992771 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 17992870  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  17992871 ccatacaataggttgattctt 17992891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 31960502 - 31960710
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960502 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 31960601  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31960602 tgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgtt 31960701  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    |||||||||    
T  31960702 gtttgtaca 31960710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 4342722 - 4342931
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4342722 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcaggagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4342821  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4342822 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4342921  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  4342922 tgttggtaca 4342931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 4792681 - 4792890
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4792681 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcgtgatgggtctcccattcaccctttatctga 4792780  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4792781 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4792880  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  4792881 tgtttgtaca 4792890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Original strand, 15737140 - 15737337
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15737140 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 15737239  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccat 214  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15737240 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttccttgatcccaaagatacatgcttcatactcagccat 15737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 17980995 - 17981204
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17980995 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 17981094  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17981095 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 17981194  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  17981195 tgttggtaca 17981204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18229410 - 18229201
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18229410 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 18229311  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18229310 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18229211  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18229210 tgttggtaca 18229201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 48470141 - 48469932
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48470141 gtgcagctcaacctttgtgaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 48470042  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  48470041 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 48469942  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  48469941 tgttggtaca 48469932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 6538789 - 6538997
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6538789 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 6538888  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6538889 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 6538988  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  6538989 gttggtaca 6538997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4725844 - 4725636
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4725844 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcgcgata-ggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccttttatctga 4725746  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  4725745 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatgctcagccatat 4725646  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  4725645 tgtttgtaca 4725636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10400358 - 10400149
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400358 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10400259  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10400258 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 10400159  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  10400158 tgttggtaca 10400149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18246955 - 18246746
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246955 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 18246856  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18246855 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaagtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 18246756  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18246755 tgttggtaca 18246746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22866894 - 22867103
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22866894 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 22866993  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22866994 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 22867093  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  22867094 tgttggtaca 22867103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22881953 - 22882162
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22881953 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 22882052  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22882053 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 22882152  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  22882153 tgttggtaca 22882162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4421128 - 4420920
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4421128 tgcagctcaaccttcgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctgat 4421029  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4421028 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 4420929  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  4420928 gttggtaca 4420920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47027667 - 47027458
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47027667 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 47027568  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  47027567 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 47027468  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  47027467 tgttggtaca 47027458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8215949 - 8215746
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215949 gtgcagctcaacttttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8215850  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8215849 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 8215750  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  8215749 tgtt 8215746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5715287 - 5715078
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5715287 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 5715188  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5715187 ttgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 5715088  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5715087 tgttggtaca 5715078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5726197 - 5725988
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5726197 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 5726098  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5726097 ttgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 5725998  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5725997 tgttggtaca 5725988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 5766171 - 5766380
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5766171 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 5766270  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5766271 ttgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 5766370  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5766371 tgttggtaca 5766380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 20572889 - 20573098
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20572889 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 20572988  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  20572989 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcttcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 20573088  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  20573089 tgttggtaca 20573098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5471202 - 5470993
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  5471202 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcgccttttatctga 5471103  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5471102 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 5471003  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5471002 tgttggtaca 5470993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 7088763 - 7089238
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  7088763 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 7088862  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  7088863 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 7088962  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  7088963 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 7089062  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  7089063 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 7089162  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7089163 aagcctaggagtttaccagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 7089238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 6571878 - 6571403
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  6571878 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatggaatcttccagtact 6571779  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | || |||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  ||||| |  ||||||||||  || ||  |||    
T  6571778 gttagatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaatcggaggttctaacagatattctttgattcggtcaaaagctttctgacaatcat 6571679  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||| |||||| |||||||  |  ||    
T  6571678 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatgtgagagataaatctggagatataattcagtctacc 6571579  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  6571578 aagaaaacctctgacttgtttctctgtctttggagcaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 6571479  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6571478 aagcctaggagtttaccagatctgacactgaaggtacatttgttaggattcaaccggagtttgtactttctcaacc 6571403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 11925094 - 11925569
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  11925094 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 11925193  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  11925194 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 11925293  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||  | |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  11925294 cattccactccaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 11925393  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  11925394 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 11925493  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11925494 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtaaatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 11925569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 16431929 - 16431454
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  16431929 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagataacgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 16431830  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  16431829 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 16431730  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  16431729 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 16431630  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  16431629 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacctttttgactgacgata 16431530  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16431529 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 16431454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 22959977 - 22959502
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | |||     
T  22959977 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtaca 22959878  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  22959877 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 22959778  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||  | |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  22959777 cattccactccaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 22959678  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  22959677 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 22959578  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22959577 aagcctaggagtttaccagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 22959502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 15704997 - 15704522
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  15704997 acaatcagtgaatttcttactcaaatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgacctaacacacagcccatggaatcctccagtact 15704898  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattctt-gatgctatcaaaagcttcttggcatcca 422  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| | |||||| |||    ||||||||||  || ||  ||    
T  15704897 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggcggttctaacagat-attcttggatttggtcaaaagctttctgacaatca 15704799  T
Q  423 tcattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc 522  Q
     |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || || ||||| ||||| || || | |||||| || ||||  |  |    
T  15704798 acattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagagataaacctggagatatagttcagtctac 15704699  T
Q  523 cgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaat 622  Q
    | || |||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  ||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  15704698 caagaaaacctctaacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctaatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgat 15704599  T
Q  623 gaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
     ||||| |  |  || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15704598 aaagcccaggagtttaccagatctgacgccgaaggtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 15704522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 46380848 - 46380409
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || | ||  ||||    
T  46380848 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaatcttctaacaccgttaggtaca 46380749  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  46380748 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 46380649  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  || || || |||||    
T  46380648 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatataatttagtcgtccaagaaaacc 46380550  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  46380549 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 46380450  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  46380449 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 46380409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 688
Target Start/End: Original strand, 5950548 - 5951002
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || |  |||| ||  ||||    
T  5950548 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtaca 5950647  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  5950648 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcctcggtccacac 5950747  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  5950748 aataccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 5950846  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  5950847 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 5950946  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgta 688  Q
    | |||||||||||| || || || || |||||||| |||||||  ||||| |||||    
T  5950947 agctttccggatctaacaccaaaagtgcatttgttgggattcagacgaagtttgta 5951002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 452 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 4446731 - 4446453
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  || || || || || ||||| ||||| |||    
T  4446731 gagtaacttgaatatcggcccacacgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcaatcttcctagaaagcccctaacttgtttctctgtc 4446632  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
    | |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || |    
T  4446631 tttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacac 4446532  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||| || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  4446531 cgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcaacaaatactcaacatg 4446453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 459 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 20443406 - 20443190
Alignment:
Q  459 ttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggag 558  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || || || ||||| || || || || ||||    
T  20443406 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgcggag 20443307  T
Q  559 ctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgt 658  Q
    |||||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || || || ||    
T  20443306 ctggcatttctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacaccaaaagt 20443207  T
Q  659 acatttgttaggattca 675  Q
    ||||||||| |||||||    
T  20443206 acatttgttgggattca 20443190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 459 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 41440532 - 41440316
Alignment:
Q  459 ttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggag 558  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || || || ||||| || || || || ||||    
T  41440532 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgcggag 41440433  T
Q  559 ctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgt 658  Q
    |||||||||||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || || || ||    
T  41440432 ctggcatttctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacaccaaaagt 41440333  T
Q  659 acatttgttaggattca 675  Q
    ||||||||| |||||||    
T  41440332 acatttgttgggattca 41440316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 690 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 18533441 - 18533376
Alignment:
Q  690 tttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18533441 tttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcaacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 18533376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 363
Target Start/End: Original strand, 6963169 - 6963308
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||     
T  6963169 acaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacaca 6963268  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggaggga 363  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  6963269 gtcaagtacatgatcaaaggccttccttcaactggaggga 6963308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20444255 - 20444122
Alignment:
Q  93 gtctcccattcaccctttatctgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaga 192  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  || |||||||  || || ||||| ||||| || | ||    
T  20444255 gtctcccattctcctgtgatttgattgattacaagggctgagtcaccataaatgtcgaggttcttaattctcagatcgatggcttcttcgatacccatga 20444156  T
Q  193 tacatgcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20444155 tacacgcttcgtactctgccatgttgtttgtaca 20444122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 483 - 730
Target Start/End: Original strand, 6963428 - 6963675
Alignment:
Q  483 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccgga 582  Q
    ||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||||| |||| |||| | |||||||| | ||| ||   ||    
T  6963428 gtcatatgggagatgaatctggagatgtagttcaatcttcccaaaaaacctctaacttgtttctctgtctttggaaccggcatttccctgatagctttga 6963527  T
Q  583 ctttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaag 682  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||| || || || || || || || | ||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6963528 ctttgtcgggatctacttcaatacctttctgactaacgataaaacccaagagcttgccagatctaataccgaaggtacacttgttaggattcaaccggag 6963627  T
Q  683 cttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
     ||||| |||||||||| || || |||||||  |||||| ||| ||||    
T  6963628 tttgtactttctcaaccgttgaaacatctttaacaaatactcagcatg 6963675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5653609 - 5653573
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5653609 acaatcggtgagcttcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3630 - 3099
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3630 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 3531  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3530 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 3431  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3430 cgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 3331  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3330 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 3231  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  3230 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 3131  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3130 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 3099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 411 - 755
Target Start/End: Original strand, 43871 - 44215
Alignment:
Q  411 tcttggcatccatcattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgt 510  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43871 tcttgacattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgt 43970  T
Q  511 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgccttt 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43971 aattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgccctt 44070  T
Q  611 ttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatc 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||    
T  44071 ttggctgacaatgaagcctaataacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctctcgaacatc 44170  T
Q  711 tttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44171 tttgttaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 44215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 482 - 755
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32369
Alignment:
Q  482 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccgg 581  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccgg 32195  T
Q  582 actttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaa 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32196 actttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaa 32295  T
Q  682 gcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32296 gcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 32369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4320 - 4111
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4320 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgaaaaggaatcaacttagcatggtgggtcttccattcaccctttatctga 4221  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4220 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4121  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  4120 tgtttgtaca 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11552925 - 11552394
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11552925 acaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 11552826  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11552825 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 11552726  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552725 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 11552626  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11552625 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 11552526  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11552525 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttggggttcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 11552426  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11552425 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 11552394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 23629540 - 23629009
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23629540 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 23629441  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23629440 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 23629341  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23629340 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 23629241  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23629240 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 23629141  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23629140 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 23629041  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23629040 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 23629009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 33296098 - 33295571
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33296098 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 33295999  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33295998 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 33295899  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33295898 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 33295799  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33295798 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 33295699  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33295698 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 33295599  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33295598 caacatgttgctcctcatctgttgactt 33295571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33781059 - 33780528
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33781059 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 33780960  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33780959 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 33780860  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780859 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 33780760  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33780759 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 33780660  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  33780659 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 33780560  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33780559 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 33780528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 15655348 - 15655879
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15655348 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 15655447  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15655448 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 15655547  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15655548 cattccatacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 15655647  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15655648 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttcttggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 15655747  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||      
T  15655748 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatctttgtcaaatatc 15655847  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15655848 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 15655879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 22995707 - 22996238
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22995707 acaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 22995806  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  22995807 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 22995906  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995907 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 22996006  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22996007 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 22996106  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22996107 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatact 22996206  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22996207 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 22996238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 24684735 - 24685262
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24684735 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 24684834  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24684835 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24684934  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24684935 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24685034  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24685035 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24685134  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  24685135 aagcctaataactttccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatact 24685234  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24685235 caacatgttgctcctcatctgttgactt 24685262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28652812 - 28652281
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28652812 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 28652713  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28652712 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 28652613  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28652612 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 28652513  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652512 gaggaagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 28652413  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  28652412 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 28652313  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652312 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 28652281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9321046 - 9320515
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9321046 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 9320947  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9320946 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 9320847  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9320846 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 9320747  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9320746 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 9320647  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  9320646 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 9320547  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9320546 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 9320515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12135745 - 12135214
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12135745 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 12135646  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12135645 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 12135546  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12135545 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 12135446  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12135445 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 12135346  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12135345 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 12135246  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12135245 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 12135214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 24973476 - 24972949
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24973476 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 24973377  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24973376 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24973277  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
     ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  24973276 tattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtcc 24973177  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24973176 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24973077  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  24973076 aagcctaataactttccggatctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 24972977  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24972976 caacatgttgctcctcatctgttgactt 24972949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31435034 - 31434503
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31435034 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 31434935  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31434934 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31434835  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31434834 cattccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 31434735  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31434734 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 31434635  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31434634 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31434535  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31434534 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 31434503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 37355233 - 37355764
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355233 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 37355332  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37355333 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37355432  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37355433 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37355532  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37355533 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37355632  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37355633 aagcctaataactttccagacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37355732  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37355733 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 37355764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 41678274 - 41677744
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678274 caatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatactg 41678175  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41678174 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatc 41678075  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41678074 attccatacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccg 41677975  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41677974 aggaaacctctaacttgcttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 41677875  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41677874 agcctaataacttccctgatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattc 41677775  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41677774 aacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 41677744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26483964 - 26483433
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26483964 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcctgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 26483865  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26483864 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 26483765  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26483764 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 26483665  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26483664 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 26483565  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26483564 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 26483465  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26483464 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 26483433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30938205 - 30937674
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30938205 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 30938106  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30938105 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcat 30938006  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30938005 cgttccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 30937906  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30937905 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 30937806  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  30937805 aagcctaataactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatact 30937706  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30937705 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 30937674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 37668076 - 37668607
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668076 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 37668175  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37668176 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37668275  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37668276 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37668375  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37668376 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37668475  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37668476 aagcctaataactttccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37668575  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37668576 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 37668607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 40470144 - 40470671
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40470144 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgcca 40470243  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40470244 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcatt 40470343  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470344 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 40470443  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40470444 aaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 40470543  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  40470544 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 40470643  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40470644 atgttgctcttcatctgttgacttcaca 40470671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3793107 - 3792580
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  3793107 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaataccgcca 3793008  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  3793007 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcatt 3792908  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3792907 ccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3792808  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3792807 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 3792708  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  3792707 ctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 3792608  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792607 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 3792580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 18372124 - 18372655
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372124 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 18372223  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18372224 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 18372323  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  18372324 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 18372423  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18372424 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggattgacttcaatgcccctttggctgacaatg 18372523  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18372524 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 18372623  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18372624 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 18372655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 24727539 - 24727008
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24727539 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 24727440  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24727439 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24727340  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24727339 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24727240  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24727239 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24727140  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  24727139 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgtagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 24727040  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24727039 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 24727008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 28956375 - 28956906
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28956375 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatact 28956474  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28956475 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcat 28956574  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28956575 cattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgccc 28956674  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28956675 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 28956774  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  28956775 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 28956874  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28956875 caacatgctgctcctcatctgtcgacttcaca 28956906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 31823001 - 31823528
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  31823001 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgcccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 31823100  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31823101 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 31823200  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  31823201 ccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 31823300  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31823301 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 31823400  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  31823401 ctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 31823500  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31823501 atgctgctcctcatctgctgacttcaca 31823528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 37767581 - 37768112
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767581 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 37767680  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37767681 gccagatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37767780  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37767781 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37767880  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37767881 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37767980  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37767981 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtatcttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37768080  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37768081 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 37768112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 43081821 - 43081294
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  43081821 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgaca 43081722  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43081721 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 43081622  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43081621 ccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 43081522  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43081521 aagcctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 43081422  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||    
T  43081421 ctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcgac 43081322  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  43081321 gtgctgctcctcatctgttgacttcaca 43081294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 13321420 - 13321951
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321420 acaatcggtgaacttcttgcttagataatagataacatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 13321519  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13321520 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 13321619  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13321620 cattccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 13321719  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13321720 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 13321819  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  13321820 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 13321919  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13321920 caacatgctgctcttcatctgctgacttcaca 13321951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 18497319 - 18497846
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18497319 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 18497418  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18497419 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 18497518  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497519 ccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 18497618  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18497619 aaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 18497718  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  18497719 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaac 18497818  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18497819 atgttgctcctcgtctgttgacttcaca 18497846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30032998 - 30032467
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  30032998 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 30032899  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30032898 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 30032799  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30032798 cattccatacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 30032699  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30032698 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 30032599  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30032598 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 30032499  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30032498 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 30032467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30155601 - 30155070
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  30155601 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 30155502  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30155501 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 30155402  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30155401 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 30155302  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30155301 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 30155202  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30155201 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 30155102  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30155101 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 30155070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37758553 - 37758022
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||     
T  37758553 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatacc 37758454  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37758453 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37758354  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37758353 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37758254  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37758253 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37758154  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37758153 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37758054  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37758053 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 37758022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 24586944 - 24586416
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24586944 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 24586845  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24586844 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24586745  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586744 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24586645  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24586644 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24586545  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  24586544 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctccacctttccaacatctttgttaaatatt 24586445  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttc 752  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24586444 caacatgctggtcctcatctgctgacttc 24586416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 2514628 - 2514101
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2514628 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 2514529  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2514528 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatt 2514429  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  2514428 ccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 2514329  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2514328 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 2514229  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  2514228 ctaataactttccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 2514129  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2514128 atgctgctcctcatctgctgacttcaca 2514101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30172039 - 30171508
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  30172039 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 30171940  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  30171939 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcat 30171840  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171839 cattccatacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgccc 30171740  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30171739 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttcttggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 30171640  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30171639 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 30171540  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171539 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 30171508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 32592864 - 32593395
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592864 acaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccggtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 32592963  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32592964 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcat 32593063  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32593064 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgccc 32593163  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  32593164 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 32593263  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  32593264 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 32593363  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  32593364 caacatgttgctcttcatttgttgacttcaca 32593395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33519950 - 33519419
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  33519950 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 33519851  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33519850 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 33519751  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33519750 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 33519651  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33519650 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 33519551  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  33519550 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 33519451  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33519450 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 33519419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34620088 - 34619557
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||    
T  34620088 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcattaaacact 34619989  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  34619988 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcat 34619889  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34619888 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgccc 34619789  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34619788 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 34619689  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  34619688 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcaacttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 34619589  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619588 cgacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 34619557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 15755442 - 15755973
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15755442 acaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 15755541  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15755542 gctaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 15755641  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15755642 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 15755741  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15755742 caagaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 15755841  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  15755842 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagctggtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 15755941  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15755942 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 15755973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5641358 - 5640827
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641358 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatact 5641259  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5641258 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 5641159  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5641158 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 5641059  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5641058 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 5640959  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  5640958 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 5640859  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5640858 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 5640827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 8662065 - 8662596
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  8662065 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 8662164  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8662165 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 8662264  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8662265 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 8662364  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8662365 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 8662464  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |    
T  8662465 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaagtatt 8662564  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8662565 caacatgttgctcctcatctgctgacttcaca 8662596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 6877871 - 6877344
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  6877871 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 6877772  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6877771 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatc 6877672  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6877671 ccatacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 6877572  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6877571 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 6877472  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  6877471 ctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 6877372  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6877371 atgctgctcctcatctgctgacttcaca 6877344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 22892029 - 22891502
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||  |    
T  22892029 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcgtcaaacactgaca 22891930  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  22891929 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 22891830  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22891829 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgagg 22891730  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22891729 aaacctctgacttgtttctcggtttgaggggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 22891630  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  22891629 ctagtaactttccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 22891530  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22891529 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 22891502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 25203844 - 25203321
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  25203844 tcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 25203745  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  25203744 agtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgtt 25203645  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25203644 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgagg 25203545  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25203544 aaacctctgacttgtttctcggtctgcgaggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 25203445  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  25203444 ctagtaactttccggatctgacgtcgaacgtacatttgttagggttcaattgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattccac 25203345  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  25203344 atgttgctcctcatctgttgactt 25203321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 25267999 - 25267476
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  25267999 tcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttctttcccgtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 25267900  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||    
T  25267899 agtacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgtt 25267800  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25267799 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgagg 25267700  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25267699 aaacctctgacttgtttctcggtctgcgaggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 25267600  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  25267599 ctagtaactttccggatctgacgtcgaacgtacatttgttagggttcaattgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattccac 25267500  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  25267499 atgttgctcctcatctgttgactt 25267476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 308 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 23895692 - 23895249
Alignment:
Q  308 ggattcatcaaatactgctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaa 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23895692 ggattcatcaaatactgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataa 23895593  T
Q  408 gcttcttggcatccatcattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaga 507  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23895592 gcttcttggcattcatcgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaga 23895493  T
Q  508 tgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcc 607  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  23895492 tgtaattcaatcgtccgaggaaacctctgacttgtttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggctcggactttatcagggtcaacttcaatgcc 23895393  T
Q  608 tttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagc 707  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  23895392 cttttggctgacaatgaagcctagtaactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaac 23895293  T
Q  708 atctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23895292 atctttgtcaagtattcaacatgttgctcctcatctgttgactt 23895249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 225 - 466
Target Start/End: Original strand, 13183384 - 13183625
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13183384 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgatctttctttccagtttcatcttgttgaccaattacacatcccacggattcatcaaatactg 13183483  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  13183484 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatc 13183583  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagat 466  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13183584 gttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagat 13183625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Original strand, 18125006 - 18125230
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18125006 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 18125105  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18125106 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 18125205  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  18125206 cgttccatacaataggctgattctt 18125230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 224 - 439
Target Start/End: Original strand, 13439273 - 13439488
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13439273 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 13439372  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13439373 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 13439472  T
Q  424 cattccatacaatagg 439  Q
    | ||||||||||||||    
T  13439473 cgttccatacaatagg 13439488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23896135 - 23895926
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23896135 gtgcaactcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 23896036  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23896035 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 23895936  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  23895935 tgtttgtaca 23895926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25204538 - 25204329
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25204538 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggtatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 25204439  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25204438 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcggccatat 25204339  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  25204338 tgtttgtaca 25204329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25268693 - 25268484
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25268693 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggtatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 25268594  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25268593 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcggccatat 25268494  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  25268493 tgtttgtaca 25268484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24974166 - 24973957
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24974166 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 24974067  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24974066 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 24973967  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24973966 tgtttgtaca 24973957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3793801 - 3793592
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793801 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 3793702  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  3793701 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 3793602  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  3793601 tgtttgtaca 3793592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 8661375 - 8661584
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8661375 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 8661474  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8661475 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 8661574  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  8661575 tgttggtaca 8661584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18124316 - 18124525
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18124316 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccatttatctga 18124415  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18124416 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18124515  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  18124516 tgtttgtaca 18124525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22892723 - 22892514
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  22892723 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcgccctttatctgg 22892624  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22892623 ttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgtttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 22892524  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  22892523 tgtttgtaca 22892514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24587634 - 24587425
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24587634 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 24587535  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24587534 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 24587435  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24587434 tgtttgtaca 24587425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 29887097 - 29887306
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887097 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtcttgcgtaatcacggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 29887196  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29887197 ttgatgacgagtaccgaatctccataaatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatcgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 29887296  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  29887297 tgtttgtaca 29887306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30156291 - 30156082
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30156291 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 30156192  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30156191 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 30156092  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  30156091 tgttggtaca 30156082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30172729 - 30172520
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30172729 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 30172630  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30172629 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 30172530  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  30172529 tgttggtaca 30172520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 225 - 448
Target Start/End: Original strand, 9547300 - 9547523
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  9547300 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactg 9547399  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  9547400 acaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatc 9547499  T
Q  425 attccatacaataggttggttctt 448  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  9547500 gttccatacaataggctgattctt 9547523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12136435 - 12136226
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12136435 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 12136336  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12136335 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 12136236  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  12136235 tgttggtaca 12136226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 13320730 - 13320939
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320730 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 13320829  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13320830 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 13320929  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  13320930 tgttggtaca 13320939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 13438583 - 13438792
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13438583 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 13438682  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13438683 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 13438782  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  13438783 tgttggtaca 13438792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 15754752 - 15754961
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754752 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 15754851  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15754852 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactccgccatat 15754951  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  15754952 tgttggtaca 15754961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18371434 - 18371643
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371434 gtgcagctcaacctttgtgaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 18371533  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18371534 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18371633  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18371634 tgttggtaca 18371643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23630230 - 23630021
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23630230 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcaccctttatctga 23630131  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23630130 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 23630031  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  23630030 tgtttgtaca 23630021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24728229 - 24728020
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24728229 gtgcagctcaacttttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctga 24728130  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24728129 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 24728030  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24728029 tgtttgtaca 24728020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26484654 - 26484445
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484654 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 26484555  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26484554 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 26484455  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26484454 tgttggtaca 26484445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33296788 - 33296579
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296788 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaaccaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33296689  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33296688 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 33296589  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  33296588 tgtttgtaca 33296579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33781745 - 33781536
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33781745 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33781646  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33781645 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 33781546  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  33781545 tgttggtaca 33781536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33879388 - 33879179
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33879388 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33879289  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33879288 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 33879189  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  33879188 tgttggtaca 33879179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34620778 - 34620569
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620778 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 34620679  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34620678 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 34620579  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  34620578 tgttggtaca 34620569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 37667386 - 37667595
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37667386 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 37667485  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37667486 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 37667585  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  37667586 tgtttgtaca 37667595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2515322 - 2515113
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2515322 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 2515223  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2515222 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 2515123  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  2515122 tgttggtaca 2515113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6878565 - 6878356
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878565 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 6878466  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6878465 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 6878366  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  6878365 tgttggtaca 6878356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 9546609 - 9546818
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9546609 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 9546708  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9546709 ttgatgacgagcgcagaatctccatagacgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 9546808  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  9546809 tgttggtaca 9546818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11553615 - 11553406
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11553615 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 11553516  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11553515 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 11553416  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  11553415 tgttggtaca 11553406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18496625 - 18496834
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18496625 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattctccctttatctga 18496724  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18496725 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18496824  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18496825 tgttggtaca 18496834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22995017 - 22995226
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22995017 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 22995116  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  22995117 ttgatgacaagtgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatat 22995216  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  22995217 tgtttgtaca 22995226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30033688 - 30033479
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30033688 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 30033589  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  30033588 ttgatgatgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactccgccatat 30033489  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  30033488 tgttggtaca 30033479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30938895 - 30938686
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938895 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatgaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 30938796  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30938795 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 30938696  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  30938695 tgtttgtaca 30938686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37759243 - 37759034
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759243 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 37759144  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37759143 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 37759044  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37759043 tgttggtaca 37759034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 40469450 - 40469659
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469450 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 40469549  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40469550 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 40469649  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  40469650 tgttggtaca 40469659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 33878700 - 33878477
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  33878700 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 33878601  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  33878600 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttc-cggcattcat 33878502  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  33878501 cgttccatacaataggctgattctt 33878477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5642048 - 5641839
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5642048 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 5641949  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5641948 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 5641849  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5641848 tgttggtaca 5641839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 227 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 11327204 - 11326983
Alignment:
Q  227 atcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgct 326  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  | ||||||||| ||||      
T  11327204 atcggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacaggttcatcaaacactgac 11327105  T
Q  327 aaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcat 426  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  11327104 aaatacaaaatcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgt 11327005  T
Q  427 tccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  11327004 tccatacaataggttgattctt 11326983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 13182693 - 13182902
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13182693 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 13182792  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13182793 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaaatacatgcttcatactcagccatgt 13182892  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  13182893 tgttggtaca 13182902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 31822307 - 31822516
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31822307 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 31822406  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31822407 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 31822506  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31822507 tgttggtaca 31822516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 32592174 - 32592383
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32592174 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccctttatctga 32592273  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32592274 ttgatgacgagcgcaaaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 32592373  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  32592374 tgttggtaca 32592383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 41678965 - 41678756
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678965 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 41678866  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41678865 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 41678766  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  41678765 tgttagtaca 41678756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43082515 - 43082306
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082515 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgccagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 43082416  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43082415 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 43082316  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  43082315 tgttggtaca 43082306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 29887791 - 29888011
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  29887791 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttattgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 29887890  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  29887891 aatacaaaatcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 29887990  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  29887991 ccatacaataggctgattctt 29888011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 28955685 - 28955894
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28955685 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactctccctttatctga 28955784  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28955785 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 28955884  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  28955885 tgttggtaca 28955894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31435724 - 31435515
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31435724 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccttttatctga 31435625  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31435624 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 31435525  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31435524 tgttggtaca 31435515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 37766891 - 37767100
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37766891 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgcgtctcccattcaccctttatctga 37766990  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37766991 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 37767090  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37767091 tgttggtaca 37767100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 37354544 - 37354752
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||  | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37354544 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 37354643  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37354644 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatatt 37354743  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  37354744 gttggtaca 37354752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9321736 - 9321527
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9321736 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 9321637  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9321636 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 9321537  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  9321536 tgttggtaca 9321527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33520640 - 33520431
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33520640 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 33520541  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33520540 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 33520441  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  33520440 tgttggtaca 33520431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28653503 - 28653293
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  28653503 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgcctcgcataatcacaataaggaatcaacttagcatgatgtgtctcccattctccctttatctga 28653404  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgat-cccaaagatacatgcttcgtactcagccatg 215  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  28653403 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatccccaaagatacatgcttcatactcagccata 28653304  T
Q  216 ttgtttgtaca 226  Q
    ||||| |||||    
T  28653303 ttgttggtaca 28653293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11327897 - 11327688
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11327897 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtcttgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattccccctttatctga 11327798  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  11327797 ttaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagccatat 11327698  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  11327697 tgttggtaca 11327688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 15654658 - 15654867
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  15654658 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccactctccctttatctga 15654757  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15654758 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 15654857  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  15654858 tgttggtaca 15654867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 11944022 - 11944461
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  11944022 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 11944121  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  11944122 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 11944221  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  11944222 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 11944320  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||      
T  11944321 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaagcctaga 11944420  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  11944421 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 11944461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 3483793 - 3484268
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  3483793 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtact 3483892  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  3483893 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 3483992  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| || || |  |  ||    
T  3483993 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatatagttgagtctacc 3484092  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  3484093 aagaaaacctcttacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 3484192  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  3484193 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaacgtacatttgttaggattcaaccggagtttgtactttctcaacc 3484268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 31520867 - 31520428
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  31520867 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 31520768  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  31520767 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 31520668  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || ||||||||    
T  31520667 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagctgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatttagtcgtccaaggaaacc 31520569  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  31520568 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 31520469  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  31520468 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 31520428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 234 - 688
Target Start/End: Original strand, 15784325 - 15784779
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  15784325 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 15784424  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||| | ||  |||||||    
T  15784425 tgatcaaaggtctcccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcattcttcggtccatac 15784524  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  15784525 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 15784623  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||      
T  15784624 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcagggtctacttcgatgcctttctggctgacgatgaaacctaga 15784723  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgta 688  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  15784724 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatttaaacgaagtttgta 15784779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 36375562 - 36376001
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  36375562 aactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 36375661  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  36375662 tgatcaaaggtcttccttcaattggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgttgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 36375761  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  36375762 aataccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 36375860  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
    ||| ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||      
T  36375861 tcttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcgggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaagcctaga 36375960  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  36375961 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 36376001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 37000216 - 37000655
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || ||||||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  37000216 aactttttgcttaaataataaatggcgtgttcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 37000315  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||| | |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  37000316 tgatcaaaggtcttccttcaattggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgttgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 37000415  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  37000416 aataccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 37000514  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
    ||| ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||      
T  37000515 tcttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcgggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaagcctaga 37000614  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  37000615 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 37000655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 224 - 730
Target Start/End: Original strand, 351805 - 352311
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||     
T  351805 acaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacaca 351904  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| || || ||||| | ||  ||    |||||||||||||||||||  |||||  | |    
T  351905 gtcaaatacatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggcaatctt 352004  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |  |||| || ||    || |  || | ||||| |||||| || || || || || || ||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  352005 ccgtccaaacgatcccctgatctttacggagtaacttgaatatcggtccacatgtggcagtcatatgggagatgaatctggagatgtatttcaatcttcc 352104  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     |  || ||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  352105 caaaaagcctctaacttgtttctctgtctttggagccggcatttccctgatagctttgactttgtcaggatctacttcaatacctttctgactgacaatg 352204  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    || || || | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||| || || |||||||  |||||| |    
T  352205 aaacccaagagcttgccagatctaacaccgaaggtacacttgttaggatttaatcggagtttgtactttctcaaccgttgaaacatctttaacaaatact 352304  T
Q  724 caacatg 730  Q
    |||||||    
T  352305 caacatg 352311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 5439825 - 5440264
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || || | ||  ||||    
T  5439825 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacaccgttaggtaca 5439924  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  ||||  |    
T  5439925 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacgc 5440024  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  5440025 aataccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 5440123  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||      
T  5440124 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttaactttgtcaggatctacttcgatgcctttttggctgacgatgaagcctaga 5440223  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||| |||| || || || || |||||||| |||||    
T  5440224 agctttccgaatctaacaccaaaagtgcatttgttgggatt 5440264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 336 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 17957554 - 17957217
Alignment:
Q  336 atcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatacaa 435  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||||    
T  17957554 atcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacacaa 17957455  T
Q  436 taggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 534  Q
    ||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || ||||| |    
T  17957454 taccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacccc 17957356  T
Q  535 tgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataa 634  Q
    | ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |     
T  17957355 ttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaag 17957256  T
Q  635 ctttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  17957255 ctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 17957217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 468 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 34468948 - 34468741
Alignment:
Q  468 ggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcattt 567  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || || || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  34468948 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgtggagctggcattt 34468849  T
Q  568 ctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgtt 667  Q
    ||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |  | |||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  34468848 ctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaataaagcccagaagctttccagatctaacaccaaaagtacatttgtt 34468749  T
Q  668 aggattca 675  Q
     |||||||    
T  34468748 gggattca 34468741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 730
Target Start/End: Original strand, 20388892 - 20389085
Alignment:
Q  537 acttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataact 636  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || | ||    
T  20388892 acttgtttctctgtctttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagct 20388991  T
Q  637 ttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
    | |||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||| || || ||||||   |||||| ||||||||    
T  20388992 tgccggatctaacatcgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcaacaaatactcaacatg 20389085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34469806 - 34469673
Alignment:
Q  93 gtctcccattcaccctttatctgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaga 192  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||  || || ||||| ||||| || | ||    
T  34469806 gtctcccattctcctgtgatttgattgattacaagggctgagtcaccataaatgtcgaggttcttgattctcagatcgatggcttcttcgatacccatga 34469707  T
Q  193 tacatgcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34469706 tacacgcttcgtactctgccatgttgtttgtaca 34469673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 34185653 - 34186184
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34185653 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 34185752  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  34185753 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 34185852  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34185853 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 34185952  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34185953 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagcaggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 34186052  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  34186053 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 34186152  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34186153 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 34186184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 54836967 - 54836436
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836967 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 54836868  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54836867 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 54836768  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  54836767 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtcc 54836668  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54836667 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatagcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 54836568  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  54836567 aagcctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 54836468  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836467 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 54836436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17016622 - 17016091
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17016622 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 17016523  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17016522 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 17016423  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17016422 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 17016323  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17016322 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 17016223  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17016222 aagcctaataacttcccggatctgacgtcgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 17016123  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17016122 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 17016091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5009447 - 5008920
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5009447 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 5009348  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5009347 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 5009248  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5009247 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 5009148  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5009147 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatctctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 5009048  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  5009047 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 5008948  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5008947 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 5008920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 14759999 - 14760530
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14759999 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 14760098  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14760099 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 14760198  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14760199 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 14760298  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14760299 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 14760398  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| |    
T  14760399 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcatcaaatatt 14760498  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14760499 caacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 14760530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 6573430 - 6572903
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  6573430 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacaacccatggattcatcaaatactgcca 6573331  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6573330 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 6573231  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573230 ccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 6573131  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6573130 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttattaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 6573031  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  6573030 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatactcaac 6572931  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  6572930 atgttgttcctcatctgttgacttcaca 6572903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 14668592 - 14668065
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14668592 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 14668493  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14668492 tccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 14668393  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668392 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 14668293  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14668292 gaggaaatctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccgaactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 14668193  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  14668192 aagcctaataactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttttcaacctttcgaacatctttgtcaaatact 14668093  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14668092 caacatgttgctcctcatctgttgactt 14668065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 24116238 - 24115711
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24116238 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 24116139  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24116138 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24116039  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24116038 cattccatacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24115939  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24115938 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24115839  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24115838 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 24115739  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24115738 caacatgttgctcctcatctgttgactt 24115711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 24589054 - 24589585
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24589054 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagttatcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 24589153  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  24589154 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 24589253  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589254 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 24589353  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589354 gaggaaacctctgacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24589453  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24589454 aagcccaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatact 24589553  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24589554 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 24589585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 30757336 - 30756805
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30757336 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 30757237  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30757236 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 30757137  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  30757136 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcc 30757037  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30757036 caggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 30756937  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  30756936 aagcctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 30756837  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30756836 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 30756805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 14102119 - 14101588
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102119 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 14102020  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14102019 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 14101920  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  14101919 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 14101820  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14101819 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 14101720  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  14101719 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 14101620  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14101619 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 14101588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 18313875 - 18314402
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18313875 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 18313974  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  18313975 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 18314074  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314075 ccatacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 18314174  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18314175 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 18314274  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||    
T  18314275 ctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgttaaatattcaac 18314374  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18314375 atgctgctcctcatctgctgacttcaca 18314402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 18797307 - 18797838
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797307 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgtccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 18797406  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18797407 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 18797506  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797507 cattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 18797606  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18797607 gaggaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 18797706  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  18797707 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 18797806  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797807 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 18797838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 27160010 - 27160541
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27160010 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 27160109  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27160110 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27160209  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160210 cattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 27160309  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27160310 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27160409  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  27160410 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatatt 27160509  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  27160510 caacatgttgctcctcgtctgttaacttcaca 27160541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 755
Target Start/End: Original strand, 33670494 - 33671024
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670494 caatcggtaaacttcttgcttaggtagtagataacatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 33670593  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33670594 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatc 33670693  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33670694 attccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccg 33670793  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33670794 aggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 33670893  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  33670894 agcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattc 33670993  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33670994 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 33671024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 39854209 - 39853682
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39854209 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 39854110  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39854109 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 39854010  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854009 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 39853910  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39853909 aaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 39853810  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  39853809 ctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 39853710  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39853709 atgttgctcctcatctgttgacttcaca 39853682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 31123205 - 31123736
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  31123205 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 31123304  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31123305 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31123404  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31123405 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 31123504  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31123505 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 31123604  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31123605 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31123704  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31123705 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 31123736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 754
Target Start/End: Original strand, 36341214 - 36341740
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36341214 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgttctttctttccagtttcatcttgttgacccagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 36341313  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36341314 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcatt 36341413  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36341414 ccatacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 36341513  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  36341514 aaacctctgacttgtttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 36341613  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  36341614 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaac 36341713  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcac 754  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  36341714 atgttgctcctcgtctgtcgacttcac 36341740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 21973277 - 21972746
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21973277 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 21973178  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21973177 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 21973078  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21973077 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 21972978  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21972977 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 21972878  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  21972877 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 21972778  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21972777 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 21972746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 40102330 - 40102861
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40102330 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 40102429  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40102430 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 40102529  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40102530 cattccatacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 40102629  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40102630 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 40102729  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  40102730 aagcctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 40102829  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40102830 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 40102861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 676
Target Start/End: Original strand, 20335114 - 20335566
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335114 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 20335213  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20335214 gccaaatacataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 20335313  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20335314 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 20335413  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20335414 gaggaaacctctgacttgcttctcggtccgtggagctggcatttctcgaatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 20335513  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaa 676  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20335514 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaa 20335566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15231444 - 15230923
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||  |    
T  15231444 tcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcattaaacactgaca 15231345  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  15231344 aatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 15231245  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15231244 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 15231145  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15231144 aaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 15231045  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  15231044 ctagcaactttccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 15230945  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgac 749  Q
    ||| |||||||||||| |||||    
T  15230944 atgttgctcctcatcttttgac 15230923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 1903826 - 1903299
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  1903826 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 1903727  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||    
T  1903726 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgtt 1903627  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903626 ccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 1903527  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  1903526 aaacctctgacttgtttctcggtctgtcgagctggcatttctcggatgacccggactttatcagggtcgacttcaatgctctcttgactgacaatgaagc 1903427  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  1903426 atagtaattttccgaatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcgac 1903327  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  1903326 atgttgctcctcatattttgacttcaca 1903299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 15281634 - 15282152
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||  |    
T  15281634 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacgaattcatcaaacactgaca 15281733  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  15281734 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 15281833  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15281834 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 15281933  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||         |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  15281934 aaacctctgacttgtttctcggtct---------gcatttctcggatggcgcggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagt 15282024  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  15282025 ctagtaactttccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 15282124  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15282125 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 15282152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 15388075 - 15388602
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |    
T  15388075 tcggtaaacttcttgctcaaatagtagatagcatgctctttctttccagtcttgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactatca 15388174  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  15388175 agtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattatt 15388274  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388275 ccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 15388374  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15388375 aaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgccggcatctctctgatggcccgaactttgtcaggatcgacttcaatgcccttttggctaacaatgaagc 15388474  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||  |  ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  15388475 ctagcagttttccagatctgacaccgaacgtacacttgttggggttcagccgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaaatactcaac 15388574  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  15388575 atgatgttcctcatcttttgacttcaca 15388602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 34184963 - 34185172
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34184963 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 34185062  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34185063 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 34185162  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  34185163 tgtttgtaca 34185172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54837657 - 54837448
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837657 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgcctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 54837558  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54837557 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 54837458  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  54837457 tgttggtaca 54837448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15232086 - 15231875
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15232086 gtgcaactcaaccttcgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcaccctttatctgg 15231987  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  15231986 ttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcggccatat 15231887  T
Q  217 tgtttgtacaat 228  Q
    ||||||||||||    
T  15231886 tgtttgtacaat 15231875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1904516 - 1904311
Alignment:
Q  21 aactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattga 120  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1904516 aactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctggttga 1904417  T
Q  121 tgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtt 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1904416 tgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatatcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatattgtt 1904317  T
Q  221 tgtaca 226  Q
    ||||||    
T  1904316 tgtaca 1904311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17017312 - 17017103
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017312 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 17017213  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17017212 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 17017113  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  17017112 tgtttgtaca 17017103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24116928 - 24116719
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116928 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 24116829  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  24116828 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatat 24116729  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  24116728 tgtttgtaca 24116719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 33669803 - 33670012
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33669803 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 33669902  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33669903 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 33670002  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  33670003 tgttggtaca 33670012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6574124 - 6573915
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6574124 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 6574025  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6574024 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 6573925  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  6573924 tgttggtaca 6573915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18313181 - 18313390
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313181 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 18313280  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18313281 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 18313380  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18313381 tgttggtaca 18313390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30758026 - 30757817
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30758026 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 30757927  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  30757926 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 30757827  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  30757826 tgttggtaca 30757817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39854903 - 39854694
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39854903 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 39854804  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39854803 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 39854704  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  39854703 tgttggtaca 39854694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 223
Target Start/End: Original strand, 14755495 - 14755701
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  14755495 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattctccctttatctga 14755594  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14755595 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 14755694  T
Q  217 tgtttgt 223  Q
    |||||||    
T  14755695 tgtttgt 14755701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 40101640 - 40101849
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  40101640 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 40101739  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40101740 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 40101839  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    | || |||||    
T  40101840 tattggtaca 40101849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5010141 - 5009932
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5010141 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 5010042  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5010041 ttgatgacgagcgcagaatctccaaaaatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 5009942  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5009941 tgttggtaca 5009932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5698801 - 5698592
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698801 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 5698702  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5698701 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcggccatat 5698602  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5698601 tgttggtaca 5698592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14102809 - 14102600
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102809 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 14102710  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  14102709 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatattcagccatat 14102610  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  14102609 tgttggtaca 14102600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 15278630 - 15278839
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  15278630 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcgccttttatctgg 15278729  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  15278730 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcggccatat 15278829  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  15278830 tgtttgtaca 15278839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 18796617 - 18796826
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796617 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 18796716  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  18796717 ttaatgacgagagcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 18796816  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  18796817 tgttggtaca 18796826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14669282 - 14669073
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14669282 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctctcaatcaccctttatctga 14669183  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14669182 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgttgaggtttttgattctcatgtcaattgcttcctcaatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 14669083  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  14669082 tgtttgtaca 14669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21973967 - 21973758
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21973967 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 21973868  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21973867 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 21973768  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  21973767 tgttggtaca 21973758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 24588364 - 24588573
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  24588364 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccctttatctgg 24588463  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24588464 ttgatgacgagcgcagaatctccgtagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 24588563  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    | ||||||||    
T  24588564 tatttgtaca 24588573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 27159320 - 27159529
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27159320 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 27159419  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27159420 ttgatgacgagcgccgaatctccatagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatgt 27159519  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  27159520 tgttggtaca 27159529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 31122515 - 31122724
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31122515 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 31122614  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31122615 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 31122714  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31122715 tgttggtaca 31122724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 36340520 - 36340729
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36340520 gtgcagctcaacctttgtaaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 36340619  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36340620 ttgatgatgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 36340719  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  36340720 tgttggtaca 36340729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 20334424 - 20334633
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20334424 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 20334523  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20334524 ttgatgacgagcgccgaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 20334623  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  20334624 tgttggtaca 20334633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 98 - 226
Target Start/End: Original strand, 15384432 - 15384560
Alignment:
Q  98 ccattcaccctttatctgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacat 197  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15384432 ccattcaccctttatctggttaataacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatccccaagatacat 15384531  T
Q  198 gcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15384532 gcttcgtactcagccatgttatttgtaca 15384560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 14725492 - 14725967
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  14725492 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 14725591  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  14725592 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 14725691  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  14725692 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 14725791  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || |  ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  14725792 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgttgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 14725891  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14725892 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 14725967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 19767915 - 19767440
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  19767915 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 19767816  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  19767815 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 19767716  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  19767715 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 19767616  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  19767615 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 19767516  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  19767515 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttttcaacc 19767440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 22146262 - 22146737
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||     
T  22146262 acaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcagcccatagaatcatccaacaca 22146361  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  || || || ||||| | ||  ||    |||||||||||||||||||  |||||  | |    
T  22146362 gtcaagtacatgatcaaaggccttccttcaactggagggaccagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggcaatctt 22146461  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |  |||| || ||    || |  || | ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| || || ||||||| ||||||||| ||||| |  ||    
T  22146462 ccgtccaaacgatcccctgatctttacggagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgggagatgaatctggagatgtagttcaatcttcc 22146561  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     |  || ||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||    
T  22146562 caaaaagcctctaacttgtttctctgtctttggagccggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatctacttcaatacctttctgactgacaatg 22146661  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    || || || | ||| || ||||| || | ||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  22146662 aaacccaagagcttgccagatctaacactgaaggtacacttgttaggattcaatcggagtttgtactttctcaacc 22146737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 466
Target Start/End: Original strand, 24459636 - 24459690
Alignment:
Q  412 cttggcatccatcattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagat 466  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24459636 cttggcattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagat 24459690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 452 - 699
Target Start/End: Original strand, 1882020 - 1882267
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| |||||| || || || |  || || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  1882020 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatatagtttaatcttcctagaaaccctctaacttgtttctctgtc 1882119  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
      |||||| |||||||||| ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| || || || || | ||| |||||||| || |    
T  1882120 cttggagcaggcatttctctgatagctttgactttgtcgggatctacttcaatacccttctggctgacgataaaacccaagagcttgccggatctaacac 1882219  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  1882220 cgaaggtacacttattaggattcaaacggagtttgtactttctcaacc 1882267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 55785322 - 55785189
Alignment:
Q  93 gtctcccattcaccctttatctgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaga 192  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||  || || ||||| ||||| || | ||    
T  55785322 gtctcccattctcctgtgatttgattgattacaagggctgagtcaccataaatgtcgaggttcttgattctcagatcgatggcttcttcgatacccatga 55785223  T
Q  193 tacatgcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  55785222 tacatgcttcatactctgcaatgttgtttgtaca 55785189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 448; Significance: 0; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 10913447 - 10913978
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10913447 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 10913546  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  10913547 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 10913646  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913647 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 10913746  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  10913747 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgataatg 10913846  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  10913847 aagcctaataactttccggatctgacgccggacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatact 10913946  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10913947 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 10913978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 2106741 - 2107268
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2106741 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaattacgcatcccatggattcatcaaatact 2106840  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2106841 gccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 2106940  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2106941 cattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 2107040  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107041 gaggaaacctctgacttgcttctcggtatgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 2107140  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  2107141 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 2107240  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2107241 caacatgttgctcctcatctgttgactt 2107268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 5131556 - 5131025
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5131556 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 5131457  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5131456 gccaaatacataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 5131357  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5131356 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 5131257  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5131256 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 5131157  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  5131156 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttattgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 5131057  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5131056 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 5131025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 2158134 - 2157607
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2158134 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttctagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatact 2158035  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2158034 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 2157935  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157934 cattccatacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 2157835  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2157834 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 2157735  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  2157734 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 2157635  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2157634 caacatgttgctcctcatctgttgactt 2157607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 5143922 - 5144449
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5143922 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 5144021  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  5144022 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcatt 5144121  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  5144122 ccatacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgagg 5144221  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5144222 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 5144321  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  5144322 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatttcctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 5144421  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5144422 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 5144449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 11421357 - 11421888
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11421357 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 11421456  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11421457 gccaaatacataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcat 11421556  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421557 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 11421656  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11421657 gaggaaccctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 11421756  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |    
T  11421757 aagcctaataactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatcttcgtcaaatact 11421856  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11421857 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 11421888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 26271664 - 26272195
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26271664 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 26271763  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26271764 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcat 26271863  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26271864 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 26271963  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26271964 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 26272063  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26272064 aagcctaacaacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 26272163  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26272164 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 26272195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 227 - 755
Target Start/End: Original strand, 26534454 - 26534982
Alignment:
Q  227 atcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgct 326  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26534454 atcggtgaatttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcc 26534553  T
Q  327 aaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcat 426  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26534554 aaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcat 26534653  T
Q  427 tccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgag 526  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26534654 tccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgag 26534753  T
Q  527 gaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaag 626  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26534754 gaaacctctgacttgcttctcggtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaag 26534853  T
Q  627 cctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaa 726  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26534854 cctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaa 26534953  T
Q  727 catgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534954 catgctgctcctcatctgttgacttcaca 26534982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 26316426 - 26316957
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26316426 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 26316525  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26316526 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 26316625  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  26316626 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 26316725  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26316726 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 26316825  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  26316826 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatttttgtcaaatatt 26316925  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26316926 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 26316957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 16515008 - 16515535
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16515008 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 16515107  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  16515108 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcat 16515207  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16515208 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtcc 16515307  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16515308 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 16515407  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  16515408 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcagatatt 16515507  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16515508 caacatgttgctcctcatctgttgactt 16515535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 31560968 - 31561499
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560968 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 31561067  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31561068 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31561167  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31561168 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 31561267  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31561268 caagaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 31561367  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31561368 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31561467  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31561468 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 31561499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26516348 - 26515821
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  26516348 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccgagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 26516249  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26516248 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 26516149  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26516148 ccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 26516049  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26516048 aaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 26515949  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  26515948 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaac 26515849  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515848 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 26515821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 45390780 - 45390249
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  45390780 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 45390681  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45390680 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 45390581  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45390580 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 45390481  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45390480 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttgactgacaatg 45390381  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  45390380 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 45390281  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45390280 caacatgctgctcctcatccgttgacttcaca 45390249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 4202945 - 4202419
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4202945 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgcca 4202846  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4202845 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 4202746  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4202745 ccatacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgagg 4202646  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4202645 aagcctctaacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 4202546  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4202545 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 4202446  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcac 754  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4202445 atgctgatcctcatctgttgacttcac 4202419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 4141828 - 4142355
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4141828 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgcca 4141927  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4141928 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 4142027  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  4142028 ccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 4142127  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4142128 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 4142227  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  4142228 ctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 4142327  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4142328 atgctgctcctcatctgctgacttcaca 4142355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11444443 - 11443916
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11444443 tcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 11444344  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11444343 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 11444244  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||    
T  11444243 ccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccagg 11444144  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11444143 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 11444044  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  11444043 ctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 11443944  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11443943 atgctgctcctcgtctgctgacttcaca 11443916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 24589112 - 24589643
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589112 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 24589211  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24589212 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 24589311  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24589312 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 24589411  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589412 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 24589511  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  24589512 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 24589611  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24589612 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 24589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 26666492 - 26667023
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  26666492 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 26666591  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26666592 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 26666691  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26666692 cattccatacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 26666791  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26666792 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 26666891  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  26666892 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 26666991  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26666992 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 26667023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 26438813 - 26438286
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26438813 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 26438714  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26438713 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 26438614  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26438613 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 26438514  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  26438513 aaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcgaatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctaacaacgaagc 26438414  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26438413 ctaataacttcccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 26438314  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438313 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 26438286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 3448862 - 3448335
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3448862 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 3448763  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3448762 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 3448663  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  3448662 ccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaag 3448563  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3448562 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 3448463  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  3448462 ctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 3448363  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3448362 atgttgctcctcatctgctgacttcaca 3448335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 16748095 - 16748626
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748095 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 16748194  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16748195 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 16748294  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16748295 cattccatacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 16748394  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16748395 gaggaagcctctgacttgcttctctgtttttggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttgactgacaatg 16748494  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16748495 aagcctaacaacttgccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 16748594  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16748595 caacgtgctgctcctcatctgttgacttcaca 16748626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10845176 - 10844649
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  10845176 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 10845077  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  10845076 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 10844977  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10844976 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 10844877  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10844876 aaacctctgacttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcacggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagc 10844777  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  10844776 ctagtaattttccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 10844677  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10844676 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 10844649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 16446588 - 16447115
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  16446588 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 16446687  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||    
T  16446688 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgtt 16446787  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16446788 ccatacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgagg 16446887  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  16446888 aaacctcttacttgtgtctcggtctgcgaagctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatccccttttggctgacaatgaagc 16446987  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  16446988 ctagtaactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 16447087  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16447088 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 16447115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 22145755 - 22145348
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145755 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 22145656  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22145655 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 22145556  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  22145555 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcc 22145456  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22145455 gaggaaacctctaacttgtttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 22145356  T
Q  624 aagcctaa 631  Q
    ||||||||    
T  22145355 aagcctaa 22145348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 16044874 - 16044352
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  16044874 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 16044775  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||    
T  16044774 aatacataatcaaaggc-ttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgtt 16044676  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16044675 ccatacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 16044576  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  16044575 aaacctctgacttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcccggactttatcagggtcgacttcaatgcccctttggctgacaataaagc 16044476  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16044475 ctagtaacttcccagatctgacgccgaacgtacatttattagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcaac 16044376  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||    
T  16044375 atgttgctcctcatctgttaactt 16044352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 10842576 - 10843103
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| || ||||  ||||||||||| ||||  |    
T  10842576 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgacctattacgcaccccacagattcatcaaacactgaca 10842675  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  10842676 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 10842775  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10842776 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgagg 10842875  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10842876 aaacctctaacttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcccggacattatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagc 10842975  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  10842976 ctagtaatttttcagatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 10843075  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10843076 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 10843103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 406 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9622028 - 9621679
Alignment:
Q  406 aagcttcttggcatccatcattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcggga 505  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9622028 aagcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgaga 9621929  T
Q  506 gatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatg 605  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9621928 gatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatg 9621829  T
Q  606 cctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaa 705  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  9621828 cccttttggctgacaatgaagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaa 9621729  T
Q  706 gcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
     ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9621728 acatctttgttaaatattcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 9621679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16445894 - 16446103
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16445894 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcaccctttatctgg 16445993  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16445994 ttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 16446093  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16446094 tgtttgtaca 16446103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16045565 - 16045356
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  16045565 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgagtctcccattcaccctttatctgg 16045466  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16045465 ttgatgacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 16045366  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16045365 tgtttgtaca 16045356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2777504 - 2777295
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2777504 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 2777405  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2777404 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 2777305  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  2777304 tgtttgtaca 2777295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45391470 - 45391261
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45391470 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 45391371  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45391370 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 45391271  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  45391270 tgttggtaca 45391261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 2106051 - 2106260
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106051 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctagcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 2106150  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2106151 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagccatgt 2106250  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  2106251 tgtttgtaca 2106260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2158824 - 2158615
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158824 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 2158725  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2158724 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 2158625  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  2158624 tgtttgtaca 2158615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26680994 - 26681203
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680994 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 26681093  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26681094 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26681193  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26681194 tgttggtaca 26681203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 225 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 45734872 - 45734658
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||    
T  45734872 caatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactg 45734773  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
      ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45734772 acaaatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatc 45734673  T
Q  425 attccatacaatagg 439  Q
    |||||||||||||||    
T  45734672 attccatacaatagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3449556 - 3449347
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3449556 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 3449457  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3449456 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 3449357  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  3449356 tgttggtaca 3449347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5162633 - 5162424
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5162633 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 5162534  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5162533 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 5162434  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  5162433 tgtttgtaca 5162424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 10912757 - 10912966
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10912757 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaagcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10912856  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10912857 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 10912956  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  10912957 tgtttgtaca 10912966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26270974 - 26271183
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26270974 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 26271073  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26271074 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 26271173  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26271174 tgttggtaca 26271183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26315736 - 26315945
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26315736 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 26315835  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26315836 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 26315935  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26315936 tgttggtaca 26315945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26665802 - 26666011
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26665802 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 26665901  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26665902 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26666001  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26666002 tgttggtaca 26666011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2776810 - 2776590
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  2776810 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 2776711  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  2776710 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 2776611  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  2776610 ccatacaataggctgattctt 2776590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 31087204 - 31087424
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  31087204 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 31087303  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31087304 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 31087403  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  31087404 ccatacaataggctgattctt 31087424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 31086516 - 31086719
Alignment:
Q  23 ctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31086516 ctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatg 31086615  T
Q  123 acaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttg 222  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |    
T  31086616 acgagcgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacaggcttcatactcagccatattgttgg 31086715  T
Q  223 taca 226  Q
    ||||    
T  31086716 taca 31086719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4203639 - 4203430
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4203639 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4203540  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  4203539 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 4203440  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  4203439 tgtttgtaca 4203430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10845870 - 10845661
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10845870 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 10845771  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  10845770 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcatcgatcccaaagatacacgcttcgtattcggccatat 10845671  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  10845670 tgtttgtaca 10845661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 11420667 - 11420876
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11420667 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 11420766  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11420767 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcaaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 11420866  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  11420867 tgttggtaca 11420876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16514318 - 16514527
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16514318 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 16514417  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16514418 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcttcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 16514517  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16514518 tgtttgtaca 16514527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26511584 - 26511793
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26511584 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 26511683  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26511684 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 26511783  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26511784 tgttggtaca 26511793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31127463 - 31127243
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  31127463 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 31127364  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  31127363 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 31127264  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  31127263 ccatacaataggctgattctt 31127243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 4141134 - 4141343
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141134 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 4141233  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  4141234 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatactcagccatat 4141333  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  4141334 tgtttgtaca 4141343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5132246 - 5132037
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5132246 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcgcgataaggaatcaacttagcatggtgagtctcccattcaccttttatctga 5132147  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5132146 ttgatgacgagcgcaaaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 5132047  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  5132046 tgtttgtaca 5132037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 10841882 - 10842091
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  10841882 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatctcggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcgccctttatctgg 10841981  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  10841982 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcgtattcggccatat 10842081  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  10842082 tgtttgtaca 10842091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 24588422 - 24588631
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24588422 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 24588521  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24588522 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 24588621  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  24588622 tgttggtaca 24588631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26439507 - 26439298
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26439507 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactctccctttatctga 26439408  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26439407 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26439308  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26439307 tgttggtaca 26439298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26517042 - 26516833
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26517042 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacatctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgt 26516943  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26516942 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26516843  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26516842 tgttggtaca 26516833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31128157 - 31127948
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31128157 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 31128058  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31128057 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 31127958  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31127957 tgttggtaca 31127948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 31560278 - 31560487
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560278 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 31560377  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31560378 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 31560477  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31560478 tgttggtaca 31560487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 39209027 - 39209236
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209027 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 39209126  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  39209127 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtacttagccatat 39209226  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  39209227 tgttggtaca 39209236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 45735557 - 45735348
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45735557 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcatgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 45735458  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45735457 ttgatgacgagcgcagaatcttcatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 45735358  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  45735357 tgttggtaca 45735348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 26512278 - 26512498
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  26512278 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 26512377  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26512378 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 26512477  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  26512478 ccatacaataggctgattctt 26512498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 26681688 - 26681908
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  26681688 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 26681787  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  26681788 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 26681887  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  26681888 ccatacaataggctgattctt 26681908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 39209721 - 39209941
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  39209721 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 39209820  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  39209821 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 39209920  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  39209921 ccatacaataggttgattctt 39209941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11445137 - 11444928
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11445137 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtcttgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 11445038  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11445037 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcaatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 11444938  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  11444937 tgttggtaca 11444928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16747405 - 16747614
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747405 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataagggatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 16747504  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  16747505 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatattcagccatat 16747604  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  16747605 tgttggtaca 16747614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 26533761 - 26533970
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26533761 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 26533860  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  26533861 ttgatgacgagcgcgaaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 26533960  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  26533961 tgttggtaca 26533970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 5143228 - 5143437
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5143228 gtgcagctcaacttttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctga 5143327  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5143328 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 5143427  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  5143428 tgttggtaca 5143437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 603 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 17526715 - 17526563
Alignment:
Q  603 atgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaaccttt 702  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17526715 atgcccttttgactgacaatgaagcctaacaacttgccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaaccttt 17526616  T
Q  703 caagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17526615 caaacatctttgttaaatattcaacgtgctgctcctcatctgttgacttcaca 17526563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Original strand, 16127396 - 16127871
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  16127396 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 16127495  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  16127496 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 16127595  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  16127596 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 16127695  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  16127696 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 16127795  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16127796 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 16127871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 2557095 - 2556620
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  2557095 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtact 2556996  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || || || | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  2556995 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggctctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 2556896  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  2556895 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 2556796  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  2556795 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacctttttgactgacgata 2556696  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2556695 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 2556620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 15193643 - 15193168
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  15193643 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttcttcccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 15193544  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  15193543 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 15193444  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  15193443 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 15193344  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  15193343 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 15193244  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15193243 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 15193168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 29090076 - 29089601
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  29090076 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 29089977  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  29089976 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 29089877  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  29089876 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 29089777  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  29089776 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 29089677  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  29089676 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttgggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 29089601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 30369534 - 30369973
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  30369534 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 30369633  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  30369634 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 30369733  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  30369734 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 30369832  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  30369833 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 30369932  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  30369933 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 30369973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 16238041 - 16237567
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  16238041 acaatcagtgaacttcttactcaaataggagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgatccaacacacagcccatggaatcttccagtact 16237942  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| |  || || |  |||||   ||||||||| |  || ||  ||     
T  16237941 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaatagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcaa 16237842  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  16237841 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatgtgagagataaatctggagatataattaagtctacc 16237742  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||| ||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  16237741 aagaaaacctttgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 16237642  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaac 698  Q
    |||||||  |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16237641 aagcctaggagtttaccagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaac 16237567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 9469870 - 9469431
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  9469870 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 9469771  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  9469770 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 9469671  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  9469670 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 9469572  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  9469571 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcagggtctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 9469472  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  9469471 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 9469431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 16393022 - 16393461
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || |  |||| ||  ||||    
T  16393022 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtaca 16393121  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  16393122 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 16393221  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  16393222 aatactttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 16393320  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  16393321 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 16393420  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  16393421 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 16393461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 452 - 730
Target Start/End: Original strand, 1893381 - 1893659
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |  || || |||||||| ||||| ||||| |||    
T  1893381 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttctctgtc 1893480  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
    | |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || |    
T  1893481 tttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatccacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacac 1893580  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||| || || |||||| | |||||| ||||||||    
T  1893581 cgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcgacaaatactcaacatg 1893659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 25727057 - 25726582
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || |  ||||| || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||     
T  25727057 acaatcagtgaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccaagcacacagcccatagaatcatctaacaca 25726958  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||| ||| || || ||||| | ||  ||    | |||||||||||||||||  |||||  | |    
T  25726957 gtcaaatacatgatcaacggccttccttcaactggatggacaagaatcggaggttctaacaaatacccttggatgctatcaaaagctttctggcaatctt 25726858  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |  |||| || ||   ||| |  || ||||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| |  ||    
T  25726857 ctgtccaaacgatcctttgatctttactgagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatataattcaaccttcc 25726758  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     |  |||||||| ||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| ||    ||||| |  ||||| |||||||| ||||| |||||||||||     
T  25726757 taaaaaacctctaacttgcttctcagtctttggaacaggcatttccctgatagctttaactttgttgggatctacttcaatacctttctggctgacaata 25726658  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    ||||| |  |  || |||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  25726657 aagcccaggagtttgccggatttaacaccgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtactttctcaacc 25726582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 468 - 675
Target Start/End: Original strand, 16287201 - 16287408
Alignment:
Q  468 ggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcattt 567  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || || || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  16287201 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgtggagctggcattt 16287300  T
Q  568 ctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgtt 667  Q
    ||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  16287301 ctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacaccaaaagtacacttgtt 16287400  T
Q  668 aggattca 675  Q
     |||||||    
T  16287401 gggattca 16287408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Original strand, 797487 - 797620
Alignment:
Q  93 gtctcccattcaccctttatctgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaga 192  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||  || || ||||| ||||| || | ||    
T  797487 gtctcccattctcctgtgatttgattgattacaagggctgagtcaccataaatgtcgaggttcttgattctcagatcgatggcttcttcgatacccatga 797586  T
Q  193 tacatgcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  797587 tacatgcttcgtactctgccatgttgtttgtaca 797620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 459 - 675
Target Start/End: Original strand, 798336 - 798552
Alignment:
Q  459 ttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggag 558  Q
    ||||| || ||||| || ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| || || || ||||| || || || || ||||    
T  798336 ttgaatatcggcccacatgttgcagtcatataagaaatgaaacgggagatgtagttcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgcggag 798435  T
Q  559 ctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgt 658  Q
    ||||||| |||| ||||||   ||| || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  | |||||||||||| || || || ||    
T  798436 ctggcatctctctgatggctttgaccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagctttccggatctaacaccaaaagt 798535  T
Q  659 acatttgttaggattca 675  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  798536 acacttgttgggattca 798552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5161943 - 5161907
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5161943 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 226
Target Start/End: Original strand, 16286343 - 16286476
Alignment:
Q  93 gtctcccattcaccctttatctgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaaga 192  Q
    ||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||  || || ||||| ||||| || |  |    
T  16286343 gtctcccattctcctgtgatttgattgattacaagggctgagtcaccataaatgtcgaggttcttgattctcagatcgatggcttcttcgatacccataa 16286442  T
Q  193 tacatgcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16286443 tacacgcttcatactctgccatgttgtttgtaca 16286476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22146308 - 22146235
Alignment:
Q  142 agatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtt 220  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  22146308 agatgtcgaggtgtt-gat-ctcatgtcaat-gct-cctcgatcccaaagatacatgc-tcatactcagccatattgtt 22146235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 444; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 444; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 13134 - 12603
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13134 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 13035  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13034 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 12935  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  12934 cattccatacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcc 12835  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12834 caggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 12735  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  12734 aagcctaataacttgccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 12635  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12634 caacatgctgctcctcatctattgacttcaca 12603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13824 - 13615
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13824 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 13725  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13724 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 13625  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  13624 tgtttgtaca 13615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9595 - 9068
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9595 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 9496  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  9495 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcatt 9396  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9395 ccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 9296  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9295 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 9196  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  9195 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatccttgtcaaatattcaac 9096  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9095 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 9068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10080
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10289 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10190  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10189 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 10090  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  10089 tgttggtaca 10080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 12590366 - 12589839
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12590366 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 12590267  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12590266 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgtt 12590167  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12590166 ccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 12590067  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12590066 aaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 12589967  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  12589966 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 12589867  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589866 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 12589839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 12659098 - 12658571
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12659098 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatact 12658999  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12658998 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 12658899  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  12658898 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtcc 12658799  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12658798 gaggaaacctctgacttgcttctcggtttgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 12658699  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  12658698 aagcctaataactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 12658599  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12658598 caacatgttgctcctcatctgttgactt 12658571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 23125250 - 23125781
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23125250 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcctgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 23125349  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23125350 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 23125449  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125450 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 23125549  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  23125550 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacg 23125649  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23125650 aagcctaataacttcccggatctaacgccgaatgtacatttgttggaattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 23125749  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23125750 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 23125781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 39893631 - 39893100
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39893631 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 39893532  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39893531 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 39893432  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39893431 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgccc 39893332  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39893331 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 39893232  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  39893231 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 39893132  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39893131 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 39893100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 40237066 - 40236539
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40237066 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttcccgtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 40236967  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  40236966 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattatt 40236867  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40236866 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 40236767  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  40236766 aaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 40236667  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||    
T  40236666 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaac 40236567  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236566 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 40236539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 11631866 - 11632397
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  11631866 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtaaacatcccatggattcatcaaacact 11631965  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11631966 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 11632065  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11632066 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 11632165  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11632166 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 11632265  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  11632266 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgccaaatatt 11632365  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11632366 caacatgctgctcctcatctgttgatttcaca 11632397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 12713283 - 12713814
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12713283 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 12713382  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12713383 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 12713482  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12713483 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 12713582  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12713583 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 12713682  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12713683 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttaggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 12713782  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12713783 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 12713814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28885769 - 28885238
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28885769 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatact 28885670  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  28885669 gccaaatacataaccaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcat 28885570  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28885569 cattccatacaataggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 28885470  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28885469 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 28885370  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  28885369 aagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtatatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgtcaaatatt 28885270  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28885269 caacatgttgctcctcatctgttgacttcaca 28885238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 225 - 755
Target Start/End: Original strand, 9346669 - 9347199
Alignment:
Q  225 caatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346669 caatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactg 9346768  T
Q  325 ctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatc 424  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  9346769 ccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatc 9346868  T
Q  425 attccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9346869 attccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccg 9346968  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9346969 aggaagcctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 9347068  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatc 724  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  9347069 agcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattc 9347168  T
Q  725 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347169 aacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 9347199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 20841475 - 20840944
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20841475 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggactcatcaaatact 20841376  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20841375 gccaagtacataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 20841276  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20841275 cattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 20841176  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20841175 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 20841076  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  20841075 aagcctaacaactttccggatctgacgccgaacgtacatttgttgggattcaatcggagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 20840976  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20840975 cagcatgttgctcctcatctgttgacttcaca 20840944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34294716 - 34294185
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294716 acaatcggtgaacttcttgcttaagtagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 34294617  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34294616 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 34294517  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34294516 cgttccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 34294417  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  34294416 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgccctttcggctgacaatg 34294317  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |    
T  34294316 aagcctaacaacttcccagatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcgaacctctttgtcaaatatt 34294217  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294216 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 34294185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 13933233 - 13933760
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13933233 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 13933332  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13933333 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 13933432  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933433 ccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 13933532  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933533 aaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 13933632  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  13933633 ctaacaacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttatattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 13933732  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13933733 atgctgctcctcgtctgttgacttcaca 13933760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Original strand, 27431123 - 27431650
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27431123 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcgccttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 27431222  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27431223 accaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 27431322  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  27431323 cattccatacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtcc 27431422  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27431423 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 27431522  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  27431523 aagcctaataactttccggatctgacaccgaatgtgcatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatctttgtcaaatatt 27431622  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27431623 caacatgttgctcctcatctgttgactt 27431650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34865246 - 34864715
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34865246 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 34865147  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34865146 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 34865047  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34865046 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 34864947  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34864946 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 34864847  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  34864846 aagcctaataactttccggacctgacaccaaatgtacatttgttgggattcaaacgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 34864747  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34864746 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 34864715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 37948548 - 37949075
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  37948548 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 37948647  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37948648 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 37948747  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37948748 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgagg 37948847  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  37948848 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 37948947  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  37948948 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatattctcaacctttcaaacatctttgtcaaatactcaac 37949047  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||    
T  37949048 atgttgttcctcatctgttgacttcaca 37949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 39048505 - 39049032
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  39048505 tcggtgaacttcttacttaggtagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 39048604  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39048605 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 39048704  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048705 ccatacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 39048804  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39048805 aaacctcttacttgcttctcagtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 39048904  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  39048905 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatattcaac 39049004  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39049005 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 39049032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 21673857 - 21674388
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673857 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 21673956  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21673957 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 21674056  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21674057 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 21674156  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21674157 caagaaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcaacttcaatgcccttttggctgacaatg 21674256  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |    
T  21674257 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaagtatt 21674356  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21674357 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 21674388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27807261 - 27806734
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27807261 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 27807162  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27807161 aatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 27807062  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807061 ccatacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 27806962  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27806961 aaacctctgacttgcttctctgtccgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagc 27806862  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  27806861 ctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacacttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaatattcaac 27806762  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27806761 atgttgctcctcgtctgttgacttcaca 27806734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 32053365 - 32052834
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32053365 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 32053266  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32053265 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 32053166  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32053165 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 32053066  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32053065 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 32052966  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  32052965 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 32052866  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32052865 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 32052834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 37682577 - 37683108
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  37682577 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 37682676  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37682677 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37682776  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37682777 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37682876  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37682877 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37682976  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37682977 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37683076  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37683077 caacatgctgttcctcatctgttgacttcaca 37683108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 37697842 - 37698373
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  37697842 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 37697941  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37697942 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37698041  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37698042 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37698141  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37698142 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37698241  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37698242 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37698341  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37698342 caacatgctgttcctcatctgttgacttcaca 37698373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 19413183 - 19413714
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19413183 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 19413282  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19413283 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 19413382  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19413383 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 19413482  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19413483 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 19413582  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  19413583 aaacctaataactttccggacctgacatcgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 19413682  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19413683 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 19413714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37928931 - 37928400
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  37928931 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 37928832  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37928831 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37928732  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37928731 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 37928632  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37928631 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 37928532  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  37928531 aagcctaataactttccggacttgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 37928432  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37928431 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 37928400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 16826020 - 16826551
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  16826020 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacact 16826119  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16826120 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 16826219  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16826220 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 16826319  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16826320 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 16826419  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16826420 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 16826519  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16826520 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 16826551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 16895460 - 16894929
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  16895460 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcctatggattcatcaaacact 16895361  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16895360 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 16895261  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16895260 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 16895161  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16895160 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 16895061  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  16895060 aagcctaataactttccagacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 16894961  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16894960 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 16894929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 31879848 - 31879317
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  31879848 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 31879749  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31879748 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 31879649  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31879648 cattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 31879549  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31879548 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagccggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 31879449  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  31879448 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 31879349  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31879348 caacatgctgctcctcctctgctgacttcaca 31879317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 21699857 - 21700383
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |    
T  21699857 tcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaatactgaca 21699956  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  21699957 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 21700056  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21700057 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 21700156  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21700157 aaacctctga-ttgtttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggcccgaactttattagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 21700255  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  21700256 ctagtaactttccagatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 21700355  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21700356 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 21700383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 676
Target Start/End: Original strand, 257339 - 257787
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |    
T  257339 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgctgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 257438  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  257439 aatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 257538  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257539 ccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 257638  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  257639 aaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 257738  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaa 676  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  257739 ctaacaacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaa 257787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 19453109 - 19453636
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  19453109 tcggtgaacttcttgctcagataatagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccaagtacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 19453208  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  19453209 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgtt 19453308  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19453309 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 19453408  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19453409 aaacctctgacttgtttctcggtctgcggggctggcatttctcggatggcacggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttgactgacaatgaagc 19453508  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || |     
T  19453509 ctagtaattttccagatctgacaccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtagtttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattccat 19453608  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19453609 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 19453636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 27395120 - 27394593
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  |    
T  27395120 tcggtaaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgaccgagtacacatcccatggattcatctaacactgtca 27395021  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  27395020 agtacataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattatt 27394921  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394920 ccacacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 27394821  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27394820 aaacctcggacttgcttttcggtctgtggtgccggcatctctctgatggcccggactttgtcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 27394721  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||  |  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  27394720 ctagcagttttccggatctgacaccgaacgtacacttgttggggttcagccgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaaatactcaac 27394621  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  27394620 atgctgctcctcatcttttgacttcaca 27394593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 224 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 37381239 - 37380898
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37381239 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccattgattcatcaaatact 37381140  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37381139 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 37381040  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  37381039 cattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtcc 37380940  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcat 565  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37380939 gaggaaacctctgacttgtttctcggtctgtggagctggcat 37380898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27779792 - 27779572
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  27779792 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgaca 27779693  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27779692 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 27779593  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27779592 ccatacaataggctgattctt 27779572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27819549 - 27819329
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  27819549 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacactgaca 27819450  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  27819449 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 27819350  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27819349 ccatacaataggctgattctt 27819329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16165042 - 16164818
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  16165042 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 16164943  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16164942 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 16164843  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  16164842 cgttccatacaataggctgattctt 16164818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 231
Target Start/End: Original strand, 31889483 - 31889697
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31889483 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 31889582  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31889583 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 31889682  T
Q  217 tgtttgtacaatcgg 231  Q
    |||| ||||| ||||    
T  31889683 tgttggtacattcgg 31889697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12659788 - 12659579
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659788 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataatgaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 12659689  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12659688 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 12659589  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  12659588 tgtttgtaca 12659579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20842165 - 20841956
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20842165 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 20842066  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20842065 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 20841966  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  20841965 tgtttgtaca 20841956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28886531 - 28886322
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28886531 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 28886432  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28886431 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 28886332  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  28886331 tgtttgtaca 28886322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 32054055 - 32053846
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32054055 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 32053956  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  32053955 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 32053856  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  32053855 tgttggtaca 32053846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34159096 - 34158887
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159096 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 34158997  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34158996 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 34158897  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  34158896 tgtttgtaca 34158887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34865936 - 34865727
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34865936 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccactcaccctttatctga 34865837  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34865836 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 34865737  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  34865736 tgtttgtaca 34865727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 37681887 - 37682096
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37681887 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 37681986  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37681987 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 37682086  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37682087 tgttggtaca 37682096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 37697152 - 37697361
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697152 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 37697251  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37697252 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 37697351  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37697352 tgttggtaca 37697361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37929621 - 37929412
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37929621 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 37929522  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37929521 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 37929422  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37929421 tgttggtaca 37929412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27120082 - 27119862
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  27120082 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 27119983  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27119982 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatt 27119883  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  27119882 ccatacaataggctgattctt 27119862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 21699163 - 21699372
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21699163 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcgtggtgggtctcccattcaccctttatctgg 21699262  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21699263 ttgatgaaaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 21699362  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  21699363 tgtttgtaca 21699372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 27430433 - 27430642
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430433 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 27430532  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27430533 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 27430632  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  27430633 tgtttgtaca 27430642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27807955 - 27807746
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27807955 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 27807856  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27807855 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 27807756  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  27807755 tgttggtaca 27807746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 39047811 - 39048020
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39047811 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 39047910  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  39047911 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 39048010  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  39048011 tgttggtaca 39048020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 22924834 - 22925054
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  22924834 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 22924933  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  22924934 aatacaaaatcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 22925033  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  22925034 ccatacaataggttgattctt 22925054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12591060 - 12590851
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12591060 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcagtttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 12590961  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  12590960 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 12590861  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  12590860 tgttggtaca 12590851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 12712593 - 12712802
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12712593 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 12712692  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12712693 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 12712792  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  12712793 tgttggtaca 12712802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34295406 - 34295197
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34295406 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 34295307  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  34295306 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaaatgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 34295207  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  34295206 tgtttgtaca 34295197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 562 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37378395 - 37378202
Alignment:
Q  562 gcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtaca 661  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37378395 gcatctctcggatggcccggaccttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaacaacttcccggatctgacgccgaatgtaca 37378296  T
Q  662 tttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37378295 tttgttgggattcaatcgaagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgtcaaatattcaacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 37378202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37381929 - 37381720
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37381929 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 37381830  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  37381829 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcttcatactcagccatat 37381730  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37381729 tgttggtaca 37381720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 3786051 - 3785831
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  3786051 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 3785952  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  3785951 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 3785852  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  3785851 ccatacaataggctgattctt 3785831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Original strand, 31890177 - 31890397
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  31890177 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 31890276  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  31890277 aatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgtt 31890376  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  31890377 ccatacaataggctgattctt 31890397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 3786745 - 3786542
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786745 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 3786646  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3786645 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggcgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 3786546  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  3786545 tgtt 3786542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 34270918 - 34271121
Alignment:
Q  23 ctcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatg 122  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34270918 ctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtttcccattcaccctttatctgattgatg 34271017  T
Q  123 acaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttg 222  Q
    |  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  34271018 atgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatattgtttg 34271117  T
Q  223 taca 226  Q
    ||||    
T  34271118 taca 34271121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 11631176 - 11631385
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11631176 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 11631275  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  11631276 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatat 11631375  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  11631376 tgtttgtaca 11631385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16165732 - 16165523
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165732 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaattaatttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 16165633  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16165632 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 16165533  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  16165532 tgttggtaca 16165523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27780486 - 27780277
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27780486 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 27780387  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27780386 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcctaaagatacatgcttcatactcagccatat 27780287  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  27780286 tgttggtaca 27780277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27820243 - 27820034
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27820243 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatgatgggtctcccattcaccctttatctga 27820144  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27820143 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcctaaagatacatgcttcatactcagccatat 27820044  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  27820043 tgttggtaca 27820034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 228 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 27828018 - 27827841
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27828018 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 27827919  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaa 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27827918 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 22924141 - 22924349
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22924141 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctgat 22924240  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  22924241 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 22924340  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  22924341 gttggtaca 22924349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 9345978 - 9346181
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9345978 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 9346077  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9346078 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 9346177  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  9346178 tgtt 9346181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 23124561 - 23124770
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23124561 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgttagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctaa 23124660  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23124661 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatat 23124760  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  23124761 tgttggtaca 23124770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21673168 - 21673376
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673168 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaaggcgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 21673267  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21673268 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 21673367  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  21673368 gttggtaca 21673376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39894320 - 39894112
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39894320 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcaaaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 39894221  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39894220 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 39894121  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  39894120 gttggtaca 39894112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16825330 - 16825539
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16825330 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 16825429  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16825430 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 16825529  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  16825530 tgttggtaca 16825539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16896150 - 16895941
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16896150 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 16896051  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16896050 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatgcatgcttcatactcagccatgt 16895951  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  16895950 tgttggtaca 16895941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 19412493 - 19412702
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19412493 gtgcagctcatcctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 19412592  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  19412593 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaatggcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatattcagccatat 19412692  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  19412693 tgttggtaca 19412702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27395814 - 27395605
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || || ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  27395814 gtgcaactcaacctttgtgaaatatgacaacagacgtctcgcataatcacggtaaggaaccagcttgccatgatgggtcacccattcaccctttatctag 27395715  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27395714 ttaataacaagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagccatgt 27395615  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  27395614 tgtttgtaca 27395605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 31880538 - 31880329
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31880538 gtgcagctcaacctttgtgaaatacgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 31880439  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  31880438 ttaatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatat 31880339  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  31880338 tgttggtaca 31880329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 37947854 - 37948063
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37947854 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 37947953  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37947954 ttgatgacgagagcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcttcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 37948053  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  37948054 tgttggtaca 37948063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40237760 - 40237551
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40237760 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaattaacttagcatggtgggtctcccattctcccttcatctga 40237661  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40237660 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 40237561  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  40237560 tgttggtaca 40237551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 228 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 34158402 - 34158182
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||  ||||||||||| ||||  |    
T  34158402 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatctcgttgaccgagcacgcatcccacagattcatcaaacactgaca 34158303  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  34158302 tatacaaaatcagaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgtt 34158203  T
Q  428 ccatacaataggttggttctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  34158202 ccatacaataggctgattctt 34158182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27120776 - 27120573
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27120776 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcacccttcatctga 27120677  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27120676 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatatcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatgt 27120577  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  27120576 tgtt 27120573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 13932539 - 13932748
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13932539 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 13932638  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  13932639 ttaatgacgagcgcagaatctccatagatgccgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 13932738  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  13932739 tgttggtaca 13932748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 19452415 - 19452624
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19452415 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgccaacaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 19452514  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |    
T  19452515 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgatcctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacacgcttcatattcggccatat 19452614  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  19452615 tgtttgtaca 19452624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 256645 - 256854
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  256645 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctga 256744  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  256745 ttgatgacgagcgcataatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatgcatgcctcatactcagccatat 256844  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  256845 tgttggtaca 256854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 42394097 - 42393622
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  42394097 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtact 42393998  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  42393997 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 42393898  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  42393897 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacacgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 42393798  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  42393797 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 42393698  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42393697 aagcctaggagtttaccagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 42393622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 34701638 - 34701163
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  34701638 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcatcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttccagtact 34701539  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  34701538 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 34701439  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||    |    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  34701438 cattccacttcaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctacc 34701339  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  34701338 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 34701239  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  34701238 aagcctaggagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttgggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 34701163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 12384212 - 12383773
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || |||| ||  ||||    
T  12384212 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacactgttaggtaca 12384113  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  12384112 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 12384013  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  12384012 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 12383914  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
    ||| ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  12383913 tcttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcagggtctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 12383814  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  12383813 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 12383773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 452 - 730
Target Start/End: Original strand, 26724186 - 26724464
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |  || || |||||||| ||||| || || |||    
T  26724186 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggcagtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaacctctaacttgtttttctgtc 26724285  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
    | |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || |    
T  26724286 tttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatccacttcaatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacac 26724385  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||||| || || |||||| | |||||| ||||||||    
T  26724386 cgaaggtacacttgttaggattcaaacggagtttgtactttctcaaccgttgaaacatcttcgacaaatactcaacatg 26724464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 22949945 - 22949506
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||| ||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || |  |||| ||  ||||    
T  22949945 aactttttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctagcactgttaggtaca 22949846  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  22949845 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttttttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 22949746  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  ||| |||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||    
T  22949745 aataccttg-ttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaacc 22949647  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||      
T  22949646 cctcacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacgatgaagcctaga 22949547  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | |||||||||||| || || || || |||||||| |||||    
T  22949546 agctttccggatctaacaccaaaagtgcatttgttgggatt 22949506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 687 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 34289193 - 34289125
Alignment:
Q  687 tattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34289193 tattttctcaacctttcgaacctctttgtcaaatattcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 34289125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 681 - 755
Target Start/End: Original strand, 257892 - 257966
Alignment:
Q  681 agcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  257892 agcttgtattttctcaacctttcaaacatcttcgttaaatattcaacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 257966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 226
Target Start/End: Original strand, 21759704 - 21759816
Alignment:
Q  114 tgattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagcca 213  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||  ||||||||||  || || ||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||    
T  21759704 tgattgattacaagggctgagtcaccataaatgtcgaggttcttgattctcagatcgatggcttcttcgatacccatgatacatgcttcgtactctgcca 21759803  T
Q  214 tgttgtttgtaca 226  Q
    |||||||||||||    
T  21759804 tgttgtttgtaca 21759816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 699
Target Start/End: Original strand, 34534353 - 34534600
Alignment:
Q  452 gagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtc 551  Q
    ||||| |||||| || ||||| || || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||  |  || || || ||||| ||||| ||||| |||    
T  34534353 gagtaacttgaatatcggcccacatgtggccgtcatatgagagatgaatctggagatgtagttcagtcttcctagaaaccctctaacttgtttctctgtc 34534452  T
Q  552 tgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgc 651  Q
    | |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||| ||||| || || || ||||||||||| || || || | ||| |||||||| || |    
T  34534453 tttggagcaggcatttccctgatagctttgactttgtcgggatccacttcgatacccttctggctgacaataaaacccaagagcttgccggatctaacac 34534552  T
Q  652 cgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  34534553 cgaaggtacacttattaggattcaaacggagtttgtactttctcaacc 34534600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 483 - 675
Target Start/End: Original strand, 21760556 - 21760748
Alignment:
Q  483 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccgga 582  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || || || ||||| || || || || ||||||||||||||||  |||||   ||    
T  21760556 gtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaacccccttacttgtttttctgtttgcggagctggcatttctcttatggctttga 21760655  T
Q  583 ctttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattca 675  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| |  |  ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||    
T  21760656 ccttgtctggatctacttcaatacctttctgactaacaatgaagcccagaagatttccggatctaacaccaaaagtacacttgttgggattca 21760748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 436; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 11512 - 10981
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11512 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 11413  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11412 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 11313  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11312 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 11213  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11212 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 11113  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  11112 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 11013  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11012 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 10981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12201 - 11993
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12201 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattccccctttatctgat 12102  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12101 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgtt 12002  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  12001 gttggtaca 11993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 428; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 16144 - 15617
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16144 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatact 16045  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16044 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 15945  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15944 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 15845  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15844 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 15745  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15744 aagcctaacaacttgccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgtcaaatatt 15645  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15644 caacatgttgctcctcatctgttgactt 15617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16835 - 16631
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaa-ggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctg 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16835 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctg 16736  T
Q  116 attgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatg 215  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  16735 attgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccata 16636  T
Q  216 ttgtt 220  Q
    |||||    
T  16635 ttgtt 16631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10966230 - 10965699
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10966230 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaacact 10966131  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10966130 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 10966031  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10966030 cattccatacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 10965931  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10965930 gaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 10965831  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  10965830 aagcctaataacttcccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 10965731  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965730 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 10965699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 28588550 - 28588019
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588550 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 28588451  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28588450 gccaaatacatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 28588351  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  28588350 cattccatacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgccc 28588251  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28588250 gaggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggaactggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 28588151  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  28588150 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 28588051  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28588050 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 28588019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 51641783 - 51641252
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  51641783 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 51641684  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51641683 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 51641584  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51641583 cattccatacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 51641484  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51641483 gaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 51641384  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  51641383 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 51641284  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51641283 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 51641252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 10948642 - 10948111
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  10948642 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 10948543  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10948542 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 10948443  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10948442 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 10948343  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10948342 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaaggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 10948243  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    
T  10948242 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcgaacatctttgttaaatatt 10948143  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10948142 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 10948111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 41790003 - 41790534
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790003 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 41790102  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41790103 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 41790202  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41790203 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 41790302  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41790303 gaggaagcctctgacttgcttctctgtttttggagctggcatttctcggatggctcggactttatcaggatcgacttcgatgcccttttgactgacaatg 41790402  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  41790403 aagcctaacaacttgccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgaagcttgtatcttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 41790502  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41790503 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 41790534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 16204731 - 16205258
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16204731 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaatactgcca 16204830  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||    
T  16204831 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgtt 16204930  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  16204931 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgagg 16205030  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16205031 aaacctctgacttgcttctcggtctttggagccggcatttctcggatggcccggaatttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 16205130  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  16205131 ctagtaattttccgaatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcaac 16205230  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16205231 atgttgctcctcatctattgacttcaca 16205258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 3644696 - 3644245
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3644696 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcca 3644597  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattctt-gatgctatcaaaagcttctt-ggcatccatca 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3644596 aatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatca 3644497  T
Q  426 ttccatacaataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 524  Q
    |||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644496 ttccatacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccg 3644397  T
Q  525 aggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatga 624  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3644396 aggaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatga 3644297  T
Q  625 agcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaa 676  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3644296 agcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacatttgttgggattcaa 3644245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 20464537 - 20464010
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  |    
T  20464537 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccacggattcatcaaacactgaca 20464438  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  20464437 aatacataattaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgtt 20464338  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20464337 ccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 20464238  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20464237 aaacctcagacttgtttctcggtctgcggggctgggatttctcggatggcccgaactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagc 20464138  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || || ||    
T  20464137 ctagtaactttccagatctgacgccgaacatacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtattcgac 20464038  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  20464037 atgttgctcctcatcttttgacttcaca 20464010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 224 - 559
Target Start/End: Original strand, 21894441 - 21894777
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca-tgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatac 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21894441 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcagtgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatac 21894540  T
Q  323 tgctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatcca 422  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21894541 tgccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattca 21894640  T
Q  423 tcattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc 522  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894641 tcattccatacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc 21894740  T
Q  523 cgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagc 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21894741 cgaggaaacctctgacttgcttctctgtttgtggagc 21894777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 254 - 550
Target Start/End: Original strand, 20339024 - 20339320
Alignment:
Q  254 gatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaatacataatcaaaggccttccttcc 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20339024 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 20339123  T
Q  354 acgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatacaataggttggttctttctga 453  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  20339124 acgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctga 20339223  T
Q  454 gtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20339224 gtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 16204037 - 16204246
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16204037 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgg 16204136  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16204137 ttgatgacgagtgcaaaatctccatagatgttgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatat 16204236  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  16204237 tgtttgtaca 16204246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51642473 - 51642264
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51642473 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 51642374  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  51642373 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 51642274  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  51642273 tgttggtaca 51642264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 224 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 28153301 - 28153077
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||    
T  28153301 acaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagcacgcatcccacagattcatcaaacact 28153202  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  28153201 gacaaatacaaaatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcat 28153102  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctt 448  Q
    | |||||||||||||| || |||||    
T  28153101 cgttccatacaataggctgattctt 28153077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 21893752 - 21893960
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893752 tgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 21893851  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21893852 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatatt 21893951  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  21893952 gttggtaca 21893960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10949332 - 10949123
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10949332 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgtgtctcccattcaccctttatctga 10949233  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10949232 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 10949133  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  10949132 tgttggtaca 10949123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10966920 - 10966711
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966920 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10966821  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10966820 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 10966721  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  10966720 tgttggtaca 10966711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Original strand, 20336419 - 20336620
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  20336419 gtgcaactcaacctttgtaaaatatgtcaacaaatgcctcgcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtggatctcccattcacccttgatctgg 20336518  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20336519 ttgataacaagtgcagaatctccttagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcggccatgt 20336618  T
Q  217 tg 218  Q
    ||    
T  20336619 tg 20336620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28589240 - 28589031
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28589240 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 28589141  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  28589140 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgaccccaaagatacatgcttcatactcagccatat 28589041  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  28589040 tgttggtaca 28589031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20465231 - 20465022
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20465231 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggagtcagcttgtcatgatgggtctcccattcaccctttatctgg 20465132  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  20465131 ttgatgacaagtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcggccatat 20465032  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  20465031 tgtttgtaca 20465022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28153991 - 28153782
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28153991 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcccgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattccccctttatctga 28153892  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    || ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28153891 ttaatgacgagcgcagaatctccacagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcagccatgt 28153792  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  28153791 tgtttgtaca 28153782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 226
Target Start/End: Original strand, 41789314 - 41789522
Alignment:
Q  18 tgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgat 117  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41789314 tgcagctcaaccttcgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcagcttagcatggtgtgtctcccattctccctttatctgat 41789413  T
Q  118 tgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgtt 217  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  41789414 tgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatatt 41789513  T
Q  218 gtttgtaca 226  Q
    ||| |||||    
T  41789514 gttggtaca 41789522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3645395 - 3645184
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaatag-gtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctccca-ttcaccctttatct 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3645395 gtgcagctcaacctttgtaaaataatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccacttcaccctttatct 3645296  T
Q  115 gattgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccat 214  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3645295 gattgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccat 3645196  T
Q  215 gttgtttgtaca 226  Q
    |||||| |||||    
T  3645195 gttgttggtaca 3645184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 22489586 - 22489111
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||| ||  | ||||||    
T  22489586 acaatcagtgaacttcttactcagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttggcccaacacacagcccatggaatctcccaatact 22489487  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||| || || ||||| | |||||| |  |||||    |||||||| |  |||||  |||    
T  22489486 gttaaatacatgatcaaaggtcttccttcaactggaggaacaagaattggaggttctaacaggtattctttgatttggtcaaaagccttctggcaatcat 22489387  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||  |||    ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || || ||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  ||    
T  22489386 cattccactcaaccccttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatgtgagagataaatctggagatataatttagtctacc 22489287  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||     
T  22489286 aagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgactttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgata 22489187  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
    |||||||  |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22489186 aagcctaggagtttaccagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 22489111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 673
Target Start/End: Original strand, 5628701 - 5629140
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| || || || || | ||  ||||    
T  5628701 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaatcttctaacaccgttaggtaca 5628800  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||  |||| ||    
T  5628801 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggatgagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcggtccacac 5628900  T
Q  434 aataggttggttcttt-ctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacc 532  Q
    ||||  || ||||||| | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  || || || |||||    
T  5628901 aatacctt-gttctttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatataatttagtcgtccaagaaaacc 5628999  T
Q  533 tctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaat 632  Q
     || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||      
T  5629000 ccttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctaga 5629099  T
Q  633 aactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggatt 673  Q
    | ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||    
T  5629100 agctttccggatctgacaccaaaagtgcatttgttgggatt 5629140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 416; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 11621 - 12152
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  11621 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttcttcccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 11720  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11721 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 11820  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11821 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 11920  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11921 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 12020  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  12021 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttctcaacctttcaaacatctttgttaaatatt 12120  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12121 caacatgctgctcctcatctgctgacttcaca 12152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 10931 - 11140
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10931 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 11030  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  11031 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcggccatat 11130  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  11131 tgttggtaca 11140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 9585 - 9050
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9585 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccggtttcatcttgttgaccaagcacacatcccatggattcatcaaatact 9486  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9485 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 9386  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9385 cattccatacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 9286  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggac-tttatcaggatcgacttcaatg-cctttttggctgacaa 621  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9285 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggacttttatcaggatcgacttcaatgccctttttggctgacaa 9186  T
Q  622 tgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtaca-tttgttaggattcaaccgaagcttgta-ttttctcaacctttcaagcatctttgtcaaa 719  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  9185 cgaagcctaataacttcccggatctgacgccgaatgtacactttgttgggattcaatcgaagcttgtatttttctcaatctttcaaacatcttcgtcaaa 9086  T
Q  720 taatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9085 tattcaacatgttgctcctcgtctgttgacttcaca 9050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10275 - 10066
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10275 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaaattagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10176  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10175 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgcttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 10076  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  10075 tgttggtaca 10066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 400; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 22884 - 23415
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  22884 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttctttccagtttcatcttgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaacact 22983  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22984 gccaaatacataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcat 23083  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  23084 cattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcc 23183  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23184 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 23283  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  23284 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 23383  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23384 caacatgctgctcttcatctgctgacttcaca 23415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 22194 - 22403
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22194 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgcctcgcataatcacgataaggaatcaatttagcatgatgtgtctcccattcaccctttatctga 22293  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22294 ttgatgacgagcgcggaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatat 22393  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    |||| |||||    
T  22394 tgttggtaca 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 392; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 224 - 755
Target Start/End: Original strand, 5872 - 6403
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5872 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttctttccagtttcatcctgttgaccaagcacgcatcccatggattcatcaaatact 5971  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  5972 gccaaatacatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcat 6071  T
Q  424 cattccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgccc 523  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6072 cattccatacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcc 6171  T
Q  524 gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatg 623  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6172 caagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaatg 6271  T
Q  624 aagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataat 723  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |    
T  6272 aagcctaataactttccggacctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcagcttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatatt 6371  T
Q  724 caacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  6372 caacatgttgttcctcatctgctgacttcaca 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 483 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 22911
Alignment:
Q  483 gtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccgga 582  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtggagctggcatttctcggatggcccgga 23084  T
Q  583 ctttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaag 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  23083 ctttatcaggatcgacttcaatgcccttttggctgacaacgaagcctaataacttgccggatctgacaccgaatgtacatttgttgggattcaatcgcag 22984  T
Q  683 cttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22983 cttgtattttcttaacctttcaaacatctttgttaaatattcaacatgttgttcctcatctgttgacttcaca 22911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 10020 - 10229
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10020 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 10119  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10120 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 10219  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  10220 tgtttgtaca 10229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 12176 - 12385
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12176 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 12275  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12276 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcatactcagccatgt 12375  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  12376 tgtttgtaca 12385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Original strand, 5182 - 5385
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5182 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagaagacgtctcgcataatcacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 5281  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5282 ttgatgacgagcgcagaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccgaagatacatgcttcatactcagccatgt 5381  T
Q  217 tgtt 220  Q
    ||||    
T  5382 tgtt 5385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 228 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 9604 - 9081
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |    
T  9604 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccagtctcatcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcatcaaacactgaca 9505  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||| ||    
T  9504 gatacataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgtt 9405  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
    |||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9404 ccatacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgagg 9305  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9304 aagcctctgacttgtttctcggtctgcggagctggcatttctcggatggctcggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggttgacaatgaagc 9205  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||    
T  9204 ctagtaactttctgcatctgacgccgaacgtacatttgttagggttcaatcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacatttttgtcaagtactcaac 9105  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgactt 751  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  9104 atgttgctcctcatctgttgactt 9081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10298 - 10089
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10298 gtgcaattcgacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcgtaatcacggtaaggaatcaacttggcatggtgggtctcccatccaccctttatctgg 10199  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 216  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10198 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatatcgaggtgtttgatcctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgt 10099  T
Q  217 tgtttgtaca 226  Q
    ||||||||||    
T  10098 tgtttgtaca 10089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 228 - 755
Target Start/End: Original strand, 5368 - 5895
Alignment:
Q  228 tcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgcta 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  5368 tcggtaaacttcttgcttagatagtagatggcatgctctttctttccagtctcgtcttgttgacccaatacacatcccatagattcatcaaacactgata 5467  T
Q  328 aatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcatt 427  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  5468 gatacatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatt 5567  T
Q  428 ccatacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 527  Q
     ||||| | |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||     
T  5568 tcataccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgaga 5667  T
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5668 aaacctctgacttgcttctcagtctgcggagctggcatttcgcggatagcccggactttatcaggatcgatttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 5767  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacctttcaagcatctttgtcaaataatcaac 727  Q
    |||  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||| |||| || |||| ||| || | ||| || ||||| || |||||    
T  5768 ctagcaacttcccggatctgacgtcgaatgtacacttgttagggtttaatcgaagcctgtacttcctcagcctctcgaacattttggtcaagtactcaac 5867  T
Q  728 atgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  5868 atgttgctcctcatcttctgacttcaca 5895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 262; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 218 - 720
Target Start/End: Original strand, 43413 - 43939
Alignment:
Q  218 gtttgtacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc-tttccggtttca-tcttgttgaccaagtacacatcccatggattcat 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43413 gtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttcttttccagtctcattcttgttgaccaagtacgcatcccatggattcat 43512  T
Q  316 caaatactgctaaatacat-aatc-aaaggccttccttccacgggagggataaggat-aggtggttccagcaggtaa-ttcttgatgctat--caaaagc 409  Q
    |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||    
T  43513 caaatactgccaaatacataaatcaaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagc 43612  T
Q  410 ttcttggcatcca--tcattccatacaatagg-ttggttctttct-gagtagcttgaagattggcccgcagg-ttgcggtcatgtgagatatgaatcggg 504  Q
    |||||||||| ||  | |||||||||||||||  || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43613 ttcttggcattcaattaattccatacaataggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcggg 43712  T
Q  505 agatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaacctctgacttgc-ttctcggtc-tgtggagctggcatttctcggatgg--cccggac-tttatcaggatcgac 598  Q
    |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  43713 agatgtaattttaagcgtccgaggaaacctctgacttgctttctcggtcttgtggagctggcatttctcggatgggccccggacttttatcaggatcgac 43812  T
Q  599 ttcaatg-cctttttggctgac-aatgaagcc-taataactttccggatctgacgccgaatg-tacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttct 694  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43813 ttcaatgccctttttggctgacaaatgaagccttaataactttccggatctgacaccgaatgttacatttgttaggattcaatcgaagcttgtactttct 43912  T
Q  695 caacc-tttcaagcatctttgtcaaat 720  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  43913 caaccttttcgaacatctttgtcaaat 43939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Original strand, 42704 - 42899
Alignment:
Q  26 aacctttgtaaaataggtcagcaaacgcct-cgcataat-cgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctccca-ttcacccttta-tctgattgat 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | || ||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42704 aacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctacgcataatacacgataaggaatcaacttagcatggtgggtctcccacttcaccctttactctgattgat 42803  T
Q  122 gacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtg-tttga-ttctcatgtcaattgcttcctcg-atcccaaagatacatgcttcgtactcagccat 214  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42804 gacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgttttgatttctcatgtcaattgcttcctcgaatcccaaagatacatgcttcatactcagccat 42899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 225; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 254 - 550
Target Start/End: Original strand, 1347 - 1643
Alignment:
Q  254 gatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaatacataatcaaaggccttccttcc 353  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1347 gatagcatgttctttctttcaagtttcatcttgttgaccaagtacacatcccacggattcatcaaacattgacaaatacataatcaaaggccttccttcc 1446  T
Q  354 acgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatacaataggttggttctttctga 453  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  1447 acgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctga 1546  T
Q  454 gtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggt 550  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1547 gtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 480 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33491
Alignment:
Q  480 gcggtcatgtgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacgccc-gaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatgg 576  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| ||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttgtttctcgtcctgcggggctggcatttctcgaatgg 33671  T
Q  577 cccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaa 676  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  33670 cccggactttatcagggtcgacttcaatgcccttttggctgacaatgaagcctaataacttcccggatctgacgtcgaacgtacatttgttagggttcaa 33571  T
Q  677 ccgaagcttgtattttctcaacctttcaagca-tctttgtcaaataatcaacatgctgctcctcatctgttgacttcaca 755  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||| || || ||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  33570 tcgaagcttgtactttctcaacctttcgaacattttttgtcaagtattcgacatgttgctccgcatcttttgacttcaca 33491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2326
Alignment:
Q  27 acctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatgacaa 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2525 acctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctctcgtaatcacggtaaggaatcagcttggcatggtgggtctcccattcaccctttatctggttgatgacaa 2426  T
Q  127 gtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttgtaca 226  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  2425 gtgccgaatctccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtattcggccatattatttgtaca 2326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 444 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 1266 - 1116
Alignment:
Q  444 ttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgct 543  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  1266 ttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgct 1167  T
Q  544 tctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggat 594  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1166 tctcggtctgtggagctggcatctctcggatggcccggactttatcaggat 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 24 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23362 - 23160
Alignment:
Q  24 tcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctgattgatga 123  Q
    ||||||||||| ||||| | || || ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||| || || |    
T  23362 tcaacctttgtgaaatatgacaacagacgtctcgcataatcacggtaaggaaccagcttgtcatgatgggtcatccattcaccctttatctggttaataa 23263  T
Q  124 caagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgtttgattctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttgtttgt 223  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23262 caagtacagaatctccatagatgtcgaggtgtgtgatcctcatgtcaattgcttcctcgatcccaaagatacatgcttcgtactcagccatgttatttgt 23163  T
Q  224 aca 226  Q
    |||    
T  23162 aca 23160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1984 - 1844
Alignment:
Q  17 gtgcaactcaacctttgtaaaataggtcagcaaacgcctcgcataatcgcggtaaggaatcagattggcatggtgggtctcccattcaccctttatctga 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  1984 gtgcagctcaacctttgtaaaatatgtcagcaaacgtctcgcataatcacgataaggaatcaagttggcatggtgggtctcccattcaccttttatctgg 1885  T
Q  117 ttgatgacaagtgcagaatccccatagatgtcgaggtgttt 157  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1884 ttgatgacgagtgcagaatctccatagatgtcgaggtgttt 1844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 10781 - 10306
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| ||||||||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || || | ||||    
T  10781 acaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttctttccggtttcgtcttgttgacccaaaacacagcccatggaatcttctagtact 10682  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccat 423  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| | ||| || || ||||| | ||| || |  |||||   ||||||||| |  || ||  |||    
T  10681 gttaaatacatgatcaaaggtcttccgtcaactggaggaacaagaattggaggttctaacagatattctttgatttgatcaaaagccttctgacaatcat 10582  T
Q  424 cattcca-tacaataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc 522  Q
    ||||||| | || |   ||| | ||| | ||||| |||||| ||||| || || || |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| |  |  |    
T  10581 cattccacttcactcc-ttgatccttgcggagtaacttgaaaattggtccacatgtggcggtcatgtgagagataaatctggagatataattgagtctac 10483  T
Q  523 cgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaat 622  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||    
T  10482 caagaaaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgat 10383  T
Q  623 gaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
     |||||||  |  || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  10382 aaagcctacgagtttaccagatctaacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaacc 10306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 29723 - 29269
Alignment:
Q  234 aacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatactgctaaataca 333  Q
    ||||||||||||| ||| || || || || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |  || || || | ||  ||||    
T  29723 aacttcttgcttaaataataaatggcgtgctcttttcttccggtttcatcttgttgtccgagcacacaacccatggaattttctaacaccgttaggtaca 29624  T
Q  334 taatcaaaggccttccttccacgggagggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcatccatcattccatac 433  Q
    | |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |  |||||  | ||| |||| ||    
T  29623 tgatcaaaggtcttccttcaactggagggataagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcagtccacac 29524  T
Q  434 aataggttggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacct 533  Q
    ||||  ||| || || | |||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||     
T  29523 aataccttgttttttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatttagtcgtccaagaaaaccc 29424  T
Q  534 ctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaata 633  Q
    || ||||  || || ||    ||||| ||||| |||| ||||||   |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  29423 cttacttctttttctgttctcggagcaggcatctctctgatggctttgactttgtcaggatctacttcgatgcctttctggctgacaatgaaacctagaa 29324  T
Q  634 actttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgta 688  Q
     |||||||| |||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  29323 gctttccggttctgacaccaaaagtgcatttgttgggatttaaacgaagtttgta 29269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 528 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 50415 - 50245
Alignment:
Q  528 aaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagc 627  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||| | ||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||    
T  50415 aaacctctgacttgcttctctgtctttggaacaggcatttctctgatggctctgaccttgtcgggatcaacttcaatacccttttgactgacgataaagc 50316  T
Q  628 ctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaac 698  Q
    |||  |  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50315 ctaggagtttaccagatctgacaccgaaagtacatttgttaggattcaaccggagcttgtactttctcaac 50245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 459 - 699
Target Start/End: Original strand, 35168 - 35408
Alignment:
Q  459 ttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggag 558  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| || ||||| ||||| || || ||||  ||||    
T  35168 ttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattcagtcgtccgagaaaccctcttacttgtttttctgtcttcggag 35267  T
Q  559 ctggcatttctcggatggcccggactttatcaggatcgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgt 658  Q
    | ||||| |||| ||| || |  ||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||  | ||| |||||||| || || || ||    
T  35268 caggcatctctctgatagctctaactttgtcgggatctacttcaatacctttctgactgacaatgaagcctagaagcttcccggatctaacaccaaaagt 35367  T
Q  659 acatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttctcaacc 699  Q
     || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||    
T  35368 gcacttgttgggattcagacgaagtttgtactttcttaacc 35408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 495 - 730
Target Start/End: Original strand, 4879 - 5114
Alignment:
Q  495 atgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtggagctggcatttctcggatggcccggactttatcaggat 594  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |  || |  |||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||||| | ||| ||   |||||| || ||||    
T  4879 atgaatctggagatgtagttcaatcttcccaaaaaacctctaacttgtttctctgtctttggagccggcatttcactgatagctttgactttgtcgggat 4978  T
Q  595 cgacttcaatgcctttttggctgacaatgaagcctaataactttccggatctgacgccgaatgtacatttgttaggattcaaccgaagcttgtattttct 694  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| || || || || | ||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||    
T  4979 ctacttcaatacctttctgactgacgataaaacccaagagcttgccagatctaacaccgaaggtacacttgttaggattcaactggagtttgtactttct 5078  T
Q  695 caacctttcaagcatctttgtcaaataatcaacatg 730  Q
    ||||| || || |||||||  |||||| ||| ||||    
T  5079 caaccgttgaaacatctttaacaaatactcatcatg 5114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 352
Target Start/End: Original strand, 4608 - 4736
Alignment:
Q  224 acaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttctttccggtttcatcttgttgaccaagtacacatcccatggattcatcaaatact 323  Q
    |||||| || |||||||| || |  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||     
T  4608 acaatcagtaaacttcttactcaagtagtaaatggcatgctctttctttccagtttcgtcttgttgaccaagcacgcaacccatagaatcatccaacaca 4707  T
Q  324 gctaaatacataatcaaaggccttccttc 352  Q
    |  || ||||| ||||||||| |||||||    
T  4708 gtcaagtacatgatcaaaggcattccttc 4736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University