View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12155_low_4 (Length: 463)

Name: NF12155_low_4
Description: NF12155
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12155_low_4
NF12155_low_4
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (141-446)||(2566965-2567270)
chr3 (140-446)||(21006059-21006365)
chr3 (140-446)||(52684443-52684749)
chr3 (233-446)||(19878799-19879011)
chr3 (233-446)||(47642215-47642428)
chr3 (233-446)||(7899415-7899627)
chr3 (233-446)||(20509852-20510065)
chr3 (233-445)||(45056998-45057210)
chr3 (233-448)||(25700970-25701187)
chr3 (233-446)||(28968720-28968933)
chr3 (233-446)||(13352891-13353104)
chr3 (142-446)||(25936249-25936560)
chr3 (142-446)||(48123460-48123772)
chr3 (142-446)||(45532234-45532544)
chr3 (286-446)||(22311105-22311276)
chr3 (233-428)||(19421625-19421826)
chr3 (288-444)||(29916034-29916191)
chr3 (288-444)||(29965187-29965344)
chr3 (233-446)||(38888793-38888995)
chr3 (142-438)||(52505002-52505305)
chr3 (233-352)||(30787351-30787470)
chr3 (254-446)||(22610448-22610650)
chr3 (286-446)||(28882251-28882422)
chr3 (142-428)||(1678869-1679163)
chr3 (300-446)||(48333216-48333362)
chr3 (233-446)||(212715-212916)
chr3 (233-446)||(983395-983592)
chr3 (286-446)||(35390125-35390293)
chr3 (288-446)||(22289440-22289597)
chr3 (300-446)||(28548300-28548446)
chr3 (300-446)||(48334159-48334305)
chr3 (286-446)||(50286918-50287089)
chr3 (317-440)||(25322219-25322342)
chr3 (348-446)||(42464311-42464409)
chr3 (288-446)||(19349317-19349480)
chr3 (288-446)||(2122951-2123109)
chr3 (233-339)||(21157531-21157638)
chr3 (286-446)||(52121537-52121710)
chr3 (358-446)||(10224330-10224418)
chr3 (366-446)||(21157456-21157536)
chr3 (142-225)||(10224550-10224633)
chr3 (371-446)||(13748216-13748291)
chr3 (317-444)||(47750631-47750758)
chr3 (361-446)||(33241195-33241280)
chr3 (378-446)||(30787282-30787350)
chr3 (264-428)||(28705493-28705670)
chr3 (360-428)||(1528891-1528959)
chr3 (142-225)||(28705373-28705456)
chr3 (379-446)||(45347907-45347974)
chr3 (254-355)||(37996565-37996665)
chr3 (288-443)||(39664657-39664815)
chr3 (254-355)||(7327968-7328068)
chr3 (233-304)||(55268854-55268925)
chr3 (396-446)||(41741863-41741913)
chr3 (233-298)||(6134226-6134291)
chr3 (288-352)||(42229906-42229970)
chr3 (30-79)||(52684323-52684372)
chr3 (279-330)||(1528802-1528853)
chr3 (30-79)||(2567345-2567394)
chr3 (231-284)||(28548251-28548304)
chr3 (360-428)||(7328086-7328145)
chr3 (360-428)||(37996487-37996547)
chr3 (233-267)||(2122918-2122952)
chr3 (30-63)||(22611347-22611380)
chr3 (26-59)||(37996778-37996811)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (140-446)||(45158872-45159178)
chr2 (236-446)||(31235882-31236092)
chr2 (233-444)||(34146389-34146600)
chr2 (233-446)||(35342527-35342739)
chr2 (288-446)||(14824381-14824539)
chr2 (233-446)||(3545277-3545489)
chr2 (142-438)||(22484903-22485207)
chr2 (288-446)||(1005754-1005912)
chr2 (288-446)||(4562031-4562189)
chr2 (142-446)||(4169693-4170004)
chr2 (289-446)||(4355555-4355712)
chr2 (142-446)||(40308008-40308320)
chr2 (288-446)||(24585777-24585936)
chr2 (142-446)||(6124801-6125119)
chr2 (233-446)||(2319484-2319696)
chr2 (142-446)||(6496844-6497154)
chr2 (288-446)||(40431740-40431897)
chr2 (286-446)||(18301357-18301521)
chr2 (233-446)||(10573703-10573905)
chr2 (287-446)||(28746378-28746538)
chr2 (288-446)||(5588280-5588438)
chr2 (288-434)||(8482647-8482793)
chr2 (288-446)||(44156840-44156997)
chr2 (286-446)||(5371337-5371508)
chr2 (286-441)||(12819577-12819743)
chr2 (329-446)||(35996814-35996931)
chr2 (327-444)||(40536498-40536615)
chr2 (323-446)||(12206264-12206387)
chr2 (312-446)||(3564106-3564239)
chr2 (300-446)||(20537115-20537274)
chr2 (233-446)||(21104691-21104894)
chr2 (254-428)||(7807045-7807231)
chr2 (317-412)||(9293655-9293750)
chr2 (396-444)||(14216955-14217003)
chr2 (30-79)||(45159256-45159305)
chr2 (233-284)||(9293314-9293365)
chr2 (233-267)||(44156807-44156841)
chr2 (288-352)||(1776249-1776312)
chr2 (233-265)||(4355521-4355553)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (141-446)||(24784489-24784794)
chr4 (147-446)||(52721477-52721776)
chr4 (140-446)||(39957804-39958110)
chr4 (231-446)||(24823472-24823687)
chr4 (233-446)||(24793427-24793640)
chr4 (233-444)||(3109003-3109214)
chr4 (233-446)||(17892457-17892670)
chr4 (233-438)||(36943878-36944083)
chr4 (233-446)||(44521742-44521955)
chr4 (233-446)||(55900844-55901057)
chr4 (233-446)||(42630174-42630393)
chr4 (288-446)||(31945945-31946102)
chr4 (142-446)||(52572826-52573133)
chr4 (233-440)||(49470489-49470692)
chr4 (142-446)||(41146241-41146551)
chr4 (300-446)||(47607355-47607501)
chr4 (142-438)||(14795643-14795947)
chr4 (288-446)||(1177219-1177378)
chr4 (142-414)||(53322976-53323255)
chr4 (293-446)||(51859042-51859195)
chr4 (286-446)||(5835205-5835376)
chr4 (286-446)||(28377272-28377445)
chr4 (300-446)||(2586592-2586737)
chr4 (288-446)||(40694312-40694470)
chr4 (293-444)||(258789-258941)
chr4 (142-428)||(8063282-8063579)
chr4 (142-428)||(3402762-3403056)
chr4 (317-444)||(30683380-30683507)
chr4 (288-446)||(51675031-51675188)
chr4 (142-428)||(31226974-31227270)
chr4 (288-446)||(36511648-36511809)
chr4 (310-446)||(43509608-43509755)
chr4 (348-438)||(5325197-5325287)
chr4 (321-444)||(7952831-7952954)
chr4 (233-403)||(46431685-46431842)
chr4 (311-405)||(37992293-37992387)
chr4 (254-428)||(38491965-38492136)
chr4 (288-446)||(14614746-14614897)
chr4 (19-79)||(24784350-24784410)
chr4 (234-331)||(722441-722538)
chr4 (26-79)||(39957682-39957735)
chr4 (234-319)||(754380-754465)
chr4 (233-284)||(2586545-2586596)
chr4 (240-282)||(37992394-37992436)
chr4 (142-202)||(52122361-52122421)
chr4 (233-267)||(14614713-14614747)
chr4 (233-267)||(51859004-51859038)
chr4 (26-59)||(8064076-8064109)
chr4 (26-59)||(19738815-19738848)
chr4 (30-63)||(52572310-52572343)
chr4 (26-63)||(53322455-53322492)
chr4 (26-62)||(52122833-52122869)
chr4 (26-70)||(52721382-52721426)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (140-446)||(40412659-40412965)
chr8 (140-444)||(8170804-8171108)
chr8 (235-446)||(27108891-27109102)
chr8 (233-446)||(7411811-7412024)
chr8 (267-446)||(27968338-27968514)
chr8 (142-446)||(28875737-28876049)
chr8 (288-446)||(3892206-3892364)
chr8 (279-446)||(20182622-20182789)
chr8 (267-446)||(27886423-27886599)
chr8 (267-446)||(27945081-27945257)
chr8 (267-446)||(28025324-28025500)
chr8 (142-438)||(45216400-45216704)
chr8 (142-446)||(5540056-5540368)
chr8 (254-441)||(32638391-32638589)
chr8 (286-446)||(32877830-32878003)
chr8 (142-446)||(36484059-36484369)
chr8 (286-446)||(6028865-6029038)
chr8 (286-446)||(19436627-19436798)
chr8 (286-446)||(19572776-19572947)
chr8 (288-446)||(37372502-37372652)
chr8 (142-446)||(37669204-37669514)
chr8 (254-446)||(41098663-41098855)
chr8 (142-428)||(4246563-4246857)
chr8 (254-446)||(32760098-32760300)
chr8 (142-441)||(12579706-12580019)
chr8 (286-446)||(25022529-25022700)
chr8 (233-413)||(38388876-38389054)
chr8 (306-446)||(28737780-28737920)
chr8 (142-428)||(34900556-34900853)
chr8 (233-423)||(32425130-32425316)
chr8 (286-446)||(42949444-42949615)
chr8 (288-444)||(5818051-5818207)
chr8 (348-446)||(43770876-43770974)
chr8 (300-446)||(32856-33005)
chr8 (286-446)||(19947547-19947718)
chr8 (142-225)||(43771115-43771198)
chr8 (254-428)||(22201008-22201194)
chr8 (271-373)||(29355865-29355967)
chr8 (30-79)||(8171186-8171235)
chr8 (26-63)||(32759491-32759528)
chr8 (30-73)||(40412536-40412579)
chr8 (279-330)||(43771004-43771055)
chr8 (233-267)||(3892173-3892207)
chr8 (233-267)||(5818206-5818240)
chr8 (26-59)||(22201304-22201337)
chr8 (26-59)||(34901349-34901382)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (147-446)||(3212692-3212991)
chr6 (140-446)||(32018220-32018518)
chr6 (233-446)||(10894214-10894428)
chr6 (233-446)||(6707736-6707950)
chr6 (233-446)||(7255130-7255340)
chr6 (233-446)||(11105495-11105709)
chr6 (233-446)||(13061071-13061283)
chr6 (142-438)||(7187957-7188262)
chr6 (233-446)||(13045078-13045285)
chr6 (288-446)||(27084216-27084374)
chr6 (254-446)||(26327525-26327717)
chr6 (288-446)||(19128395-19128554)
chr6 (142-433)||(22988838-22989109)
chr6 (142-433)||(23799287-23799558)
chr6 (142-446)||(8357516-8357827)
chr6 (286-446)||(32130230-32130401)
chr6 (288-446)||(234551-234715)
chr6 (321-446)||(3299334-3299459)
chr6 (142-428)||(1036001-1036298)
chr6 (233-434)||(13607489-13607694)
chr6 (286-437)||(31740394-31740558)
chr6 (254-416)||(31195551-31195725)
chr6 (379-446)||(4153258-4153325)
chr6 (238-344)||(31079813-31079924)
chr6 (233-267)||(27084183-27084217)
chr6 (26-59)||(1036793-1036826)
chr6 (30-62)||(8357080-8357112)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (147-446)||(9283557-9283856)
chr7 (147-446)||(25969627-25969926)
chr7 (147-446)||(9250007-9250304)
chr7 (233-446)||(23078805-23079018)
chr7 (233-446)||(15878120-15878333)
chr7 (233-444)||(33454276-33454487)
chr7 (233-446)||(35160070-35160285)
chr7 (233-446)||(36763488-36763705)
chr7 (233-438)||(1399972-1400177)
chr7 (233-446)||(36757708-36757925)
chr7 (233-446)||(36767232-36767449)
chr7 (147-278)||(47719952-47720083)
chr7 (288-446)||(48153784-48153942)
chr7 (288-446)||(21409629-21409787)
chr7 (142-440)||(36661100-36661405)
chr7 (279-446)||(19820694-19820861)
chr7 (279-446)||(44269972-44270139)
chr7 (142-315)||(11058563-11058734)
chr7 (288-446)||(23969848-23970002)
chr7 (142-446)||(11830324-11830634)
chr7 (288-446)||(36413609-36413766)
chr7 (286-446)||(16563926-16564097)
chr7 (286-446)||(16601565-16601736)
chr7 (242-446)||(38064881-38065089)
chr7 (288-446)||(554608-554766)
chr7 (264-446)||(47237922-47238116)
chr7 (235-446)||(21180044-21180237)
chr7 (286-446)||(1042751-1042924)
chr7 (286-446)||(26773264-26773437)
chr7 (142-438)||(27397298-27397599)
chr7 (286-446)||(19510887-19511051)
chr7 (311-438)||(44959041-44959168)
chr7 (301-446)||(24956501-24956644)
chr7 (142-428)||(40096293-40096590)
chr7 (349-441)||(47719856-47719948)
chr7 (290-446)||(4291937-4292103)
chr7 (286-446)||(8029071-8029244)
chr7 (288-446)||(26973296-26973458)
chr7 (331-446)||(40053573-40053688)
chr7 (254-428)||(16851046-16851232)
chr7 (358-446)||(39521422-39521510)
chr7 (317-444)||(35136297-35136424)
chr7 (358-446)||(11058745-11058833)
chr7 (233-304)||(40041584-40041655)
chr7 (254-428)||(48163671-48163849)
chr7 (254-428)||(27555043-27555221)
chr7 (254-355)||(27354184-27354284)
chr7 (233-284)||(44959993-44960044)
chr7 (26-79)||(25969513-25969566)
chr7 (32-79)||(9250367-9250414)
chr7 (26-65)||(48163523-48163562)
chr7 (233-267)||(21409596-21409630)
chr7 (233-267)||(24956457-24956491)
chr7 (26-60)||(42897106-42897140)
chr7 (30-63)||(11829808-11829841)
chr7 (26-59)||(27354036-27354069)
chr7 (26-59)||(27555336-27555369)
chr7 (26-59)||(40095765-40095798)
chr7 (26-62)||(38263114-38263150)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (147-446)||(30777106-30777405)
chr5 (140-446)||(6242726-6243045)
chr5 (140-432)||(11907407-11907699)
chr5 (233-446)||(26691825-26692039)
chr5 (233-446)||(26961557-26961771)
chr5 (233-438)||(27085558-27085762)
chr5 (233-446)||(17137952-17138163)
chr5 (288-446)||(26716515-26716673)
chr5 (288-446)||(26986255-26986413)
chr5 (233-442)||(5722186-5722395)
chr5 (279-445)||(3701319-3701484)
chr5 (233-446)||(30284296-30284514)
chr5 (300-446)||(21251738-21251884)
chr5 (233-446)||(22738047-22738253)
chr5 (288-444)||(27938401-27938557)
chr5 (288-446)||(25749848-25750006)
chr5 (233-445)||(18001675-18001875)
chr5 (233-428)||(34032571-34032754)
chr5 (293-446)||(7629293-7629446)
chr5 (278-431)||(15066445-15066598)
chr5 (142-446)||(39689901-39690213)
chr5 (288-446)||(1795635-1795794)
chr5 (288-446)||(3934505-3934663)
chr5 (142-446)||(1638963-1639271)
chr5 (287-446)||(1921023-1921183)
chr5 (142-428)||(9792932-9793226)
chr5 (286-446)||(10657220-10657393)
chr5 (233-446)||(41233515-41233717)
chr5 (288-446)||(43357478-43357635)
chr5 (288-446)||(14836574-14836733)
chr5 (317-444)||(39796664-39796791)
chr5 (161-373)||(9729405-9729613)
chr5 (307-446)||(5985648-5985800)
chr5 (300-446)||(42365819-42365970)
chr5 (348-446)||(30918994-30919092)
chr5 (233-339)||(5612244-5612351)
chr5 (366-446)||(5612169-5612249)
chr5 (358-446)||(26794172-26794260)
chr5 (142-225)||(26794392-26794475)
chr5 (142-225)||(12852746-12852829)
chr5 (322-444)||(9654026-9654148)
chr5 (376-446)||(9728106-9728176)
chr5 (142-225)||(33830397-33830480)
chr5 (396-446)||(35746112-35746162)
chr5 (26-79)||(30777468-30777521)
chr5 (398-446)||(11694466-11694514)
chr5 (254-344)||(33830505-33830593)
chr5 (30-84)||(6243109-6243163)
chr5 (30-75)||(11907283-11907328)
chr5 (254-330)||(12852854-12852930)
chr5 (142-202)||(32707323-32707383)
chr5 (233-284)||(11694412-11694461)
chr5 (233-267)||(3934662-3934696)
chr5 (26-59)||(39690730-39690763)
chr5 (26-58)||(32624995-32625027)
chr5 (26-62)||(32707795-32707831)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (233-446)||(24851679-24851892)
chr1 (233-448)||(36551593-36551807)
chr1 (233-446)||(24589820-24590033)
chr1 (233-414)||(47654873-47655054)
chr1 (234-446)||(32380776-32380989)
chr1 (243-446)||(3707994-3708185)
chr1 (288-446)||(9528562-9528720)
chr1 (288-446)||(34432133-34432291)
chr1 (288-446)||(10822636-10822794)
chr1 (142-446)||(25257242-25257549)
chr1 (142-446)||(28948379-28948691)
chr1 (292-446)||(14167315-14167469)
chr1 (142-446)||(5984811-5985121)
chr1 (288-446)||(29168189-29168347)
chr1 (264-446)||(28658573-28658768)
chr1 (286-446)||(13012568-13012732)
chr1 (303-446)||(37922471-37922614)
chr1 (291-446)||(9781887-9782044)
chr1 (142-446)||(3427474-3427792)
chr1 (286-446)||(31652987-31653158)
chr1 (286-446)||(14334533-14334704)
chr1 (142-446)||(30324344-30324654)
chr1 (286-446)||(43190019-43190192)
chr1 (142-428)||(6916049-6916346)
chr1 (288-446)||(34096270-34096429)
chr1 (142-428)||(38331073-38331370)
chr1 (288-446)||(29862039-29862200)
chr1 (317-444)||(32797462-32797589)
chr1 (142-428)||(52894888-52895185)
chr1 (142-428)||(8132806-8133100)
chr1 (286-446)||(37346528-37346698)
chr1 (233-395)||(2472682-2472832)
chr1 (254-428)||(37104382-37104568)
chr1 (233-361)||(38218592-38218718)
chr1 (233-389)||(41675743-41675899)
chr1 (292-400)||(10763899-10764009)
chr1 (254-428)||(36367376-36367554)
chr1 (233-384)||(33039819-33039960)
chr1 (322-402)||(15417692-15417772)
chr1 (377-444)||(33040711-33040777)
chr1 (279-428)||(36363252-36363405)
chr1 (405-444)||(15417928-15417967)
chr1 (415-446)||(38218733-38218764)
chr1 (26-59)||(6916841-6916874)
chr1 (26-59)||(28949208-28949241)
chr1 (26-59)||(36367669-36367702)
chr1 (26-59)||(38218501-38218534)
chr1 (26-59)||(38330545-38330578)
chr1 (26-59)||(38948850-38948883)
chr1 (409-446)||(47656062-47656099)
chr1 (26-59)||(52895680-52895713)
chr1 (142-202)||(1036892-1036951)
chr1 (142-202)||(1043798-1043857)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (142-438)||(43784-44088)
scaffold0005 (288-446)||(202479-202630)
scaffold0005 (233-267)||(202629-202663)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (254-446)||(13608-13799)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (286-441)||(5906-6070)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (142-439)||(41276-41566)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (358-446)||(29815-29903)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (142-323)||(27092-27268)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (142-202)||(25041-25101)
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (142-202)||(7579-7639)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 141 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 2567270 - 2566965
Alignment:
Q  141 taattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2567270 taattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgt 2567171  T
Q  241 taactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  2567170 taactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtataacacatacaatgttcttttt 2567071  T
Q  341 ggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2567070 ggatatagcatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 2566971  T
Q  441 tgatgt 446  Q
    ||||||    
T  2566970 tgatgt 2566965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21006365 - 21006059
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21006365 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatattgttgatggaaatggtggagaggagattgagacgattaatg 21006266  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21006265 ttaaataaaataacttaactattgagtatcgatgtgttcttttttcgatataatgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttt 21006166  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21006165 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattcatg 21006066  T
Q  440 ttgatgt 446  Q
    |||||||    
T  21006065 ttgatgt 21006059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Original strand, 52684443 - 52684749
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52684443 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccaaatttggaagcagttttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 52684542  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52684543 ttaactaaaataactcaactattgagtactaatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttt 52684642  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52684643 tggatatagtataacaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatg 52684742  T
Q  440 ttgatgt 446  Q
    |||||||    
T  52684743 ttgatgt 52684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19879011 - 19878799
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||     
T  19879011 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatataatgtttcttttttggatcgatataatatatcactaacaata 19878912  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19878911 ttccttttggatatattatagcactggtggtgctctttttgg-atatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 19878813  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  19878812 atttatgttgatgt 19878799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 47642215 - 47642428
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47642215 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaatatagcgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 47642314  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47642315 ttctttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgtgatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 47642414  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  47642415 atttatgttgatgt 47642428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 7899627 - 7899415
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7899627 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttta-atatagtgcttctcgtttggatcgatatagtatagcactagcaatg 7899529  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7899528 tttcttttggatgtagtataacactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 7899429  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  7899428 atttatgttgatgt 7899415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 20510065 - 20509852
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  20510065 attaatgttgactaaaataacttaactcttgaatagtgatgtattcttttatggatatagtgcttcttttttggatcgacatagtataacactaacaatg 20509966  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20509965 ttcattttggatatagtatatcattgatggtgctccttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcactattatttat 20509866  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  20509865 atttatgttgatgt 20509852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 45057210 - 45056998
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  45057210 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactaatgtgttcttttttggatataatgcttattttttggatcgatatagtacaacactaacaatg 45057111  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  45057110 tttcttttgtatatagtatagcactgctggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattgttgatattatttat 45057011  T
Q  433 atttatgttgatg 445  Q
    |||||||||||||    
T  45057010 atttatgttgatg 45056998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 25700970 - 25701187
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcct-ttttagatcgatatagtatagcactaacaa 330  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| ||  | ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  25700970 attaatgtttactaaaataacttaactcttgagtacttatgtgttttttttttttatatagtgttttttattttttatcgatatagtataacactaacaa 25701069  T
Q  331 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 430  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25701070 tgttccttttggatatagtatagcactgacggtgctctttttgggatatattgtgtttgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattt 25701169  T
Q  431 atatttatgttgatgtcc 448  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25701170 atatttatgttgatgtcc 25701187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 28968720 - 28968933
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  28968720 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatataatataacactaacaatg 28968819  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28968820 ttcattttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggttaataatcactctattaattgtcaatattatttat 28968919  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    |||||| |||||||    
T  28968920 atttatattgatgt 28968933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13353104 - 13352891
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13353104 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgacacagtatagcactaacaatg 13353005  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||   |||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||| ||||||||||||||    
T  13353004 ttccttttggatatagtatatcattaatggtgttgtttttaggatatattgtgtatgtaattgactaattatcatacttttaatcctcaatattatttat 13352905  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    || |||||||||||    
T  13352904 atctatgttgatgt 13352891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 25936560 - 25936249
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  ||| || |||| |||||  | ||| |||  |||    
T  25936560 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttagaagctgatttgtatcttgatgatgagaatagatgagatgagatgtaaacg-tta--gtt 25936464  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25936463 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 25936368  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25936367 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactaatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattg 25936268  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  25936267 tttatatttatgttaatgt 25936249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 48123460 - 48123772
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  48123460 aatttagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgagaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 48123556  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||| ||||| |||| |||    
T  48123557 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtggtcattttttggatatagtgattcttttttgaatcgacatagtataacacaaacaa-gttccttt 48123652  T
Q  340 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||||||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48123653 tggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 48123752  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  48123753 atttatatttatgttaatgt 48123772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 45532544 - 45532234
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  45532544 aattgagttagcagagttgtctttggatgaacttgatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 45532448  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  45532447 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggattgatataatatagcactaacaa-gttcctttt 45532352  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45532351 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccaccctcttaatcgtcaatatta 45532253  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  45532252 tttatatttatgttaatgt 45532234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 22311105 - 22311276
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  22311105 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttgg 22311204  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22311205 tatatcttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 22311276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 19421625 - 19421826
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  19421625 attaatgttaaccaaaataacttaactcttgagcactgatgtattcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaatg 19421724  T
Q  333 ttctttttg------gatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||| || ||       ||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  19421725 ttccttatgaatataaatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaagcatcaatttt 19421824  T
Q  427 at 428  Q
    ||    
T  19421825 at 19421826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Original strand, 29916034 - 29916191
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  29916034 tatagtgcttctgttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgttta 29916133  T
Q  388 tgtaattgactaat-caccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29916134 tgtaatcgactaatccatcactctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgat 29916191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Original strand, 29965187 - 29965344
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  29965187 tatagtgcttctgttttagatcgatatagtataacactaacaatgttcattttggatatagtataacactgatggtgttctttttgggatatattgttta 29965286  T
Q  388 tgtaattgactaat-caccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29965287 tgtaatcgactaatccatcactctcttgatcgacaatattatttatatttatgttgat 29965344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 38888995 - 38888793
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgtt-cttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||     
T  38888995 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactggtgtgtttcttttttggatatagtgcttattttttggattgataaagtatagcactaacaa- 38888897  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
               || ||||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  38888896 -----------atgtagtataacattgatgatgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactgtcttaatcgtcaatattattta 38888808  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  38888807 tatttatgttgatgt 38888793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 52505305 - 52505002
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  52505305 aattgagttagcagagttgtctttggatga-ccggatttgaaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 52505210  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  52505209 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 52505114  T
Q  340 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||||||||||             |||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52505113 tggatatagtgtagcattgatgtatagcactaatggtgctctttttagtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 52505014  T
Q  427 atttatatttat 438  Q
    ||||||||||||    
T  52505013 atttatatttat 52505002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30787470 - 30787351
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30787470 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttattttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 30787371  T
Q  333 ttctttttggatatagtata 352  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  30787370 ttccttttagatatagtata 30787351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22610650 - 22610448
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata------ 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||          
T  22610650 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtag 22610553  T
Q  348 -------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 440  Q
           ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22610552 cattgatgtataacactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgt 22610454  T
Q  441 tgatgt 446  Q
    | ||||    
T  22610453 taatgt 22610448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28882422 - 28882251
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  28882422 gatatagtgcttctttttatgatcgatatagtatagcattaacaatgtttcttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttgg 28882323  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28882322 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 28882251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1679163 - 1678869
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||  | | |||    
T  1679163 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg--tca-gtt 1679067  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  1679066 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacag-gttcattt 1678971  T
Q  340 tggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    || ||||||| |||||             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1678970 tgaatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 1678871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 48333216 - 48333362
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||     
T  48333216 tttttggatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtataacactgatggtgttcttttcgggatatattgtgtatgtagttgactg 48333315  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    | |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48333316 accgtcactctcttaattgtcaatattatatatatttatgttgatgt 48333362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 212715 - 212916
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||| ||||||  ||  |         
T  212715 attaatgtcaactaaaattatttaactcttgagtattgatgtgttcttttttggataaaatgcttctttttttgatcgataaagtatactacgga----- 212809  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
           |||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  212810 -------tggatatagtatagcactcatgttgctctttttgagatatattatgtatgtaattgactaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 212902  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||||||||    
T  212903 atttacgttgatgt 212916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 983395 - 983592
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  || ||||||||                   
T  983395 attaatgttaactaaaacaacttaactcttgagtacttatgtgttcttttttggatatagtgtttcttttttgaatggatatagt--------------- 983479  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
     || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  983480 -tccttttggacatagtatagcactgatggtgctctttttatgatatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttattcgtcaatattatttat 983578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 35390125 - 35390293
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat--------ggtgctctttttggtat 377  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||        |||||||||||||||||    
T  35390125 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatatgacactggtgctctttttggtat 35390224  T
Q  378 atattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35390225 attttacgtatgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 35390293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 22289597 - 22289440
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||| |||||||  |||    
T  22289597 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtacaacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtt-tttttgggatatattcggta 22289499  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22289498 tgtaattgaataatcatcactctattaatcgtcaatattatttatatttacgttgatgt 22289440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 28548300 - 28548446
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| |||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||    
T  28548300 tttttggatcgatatagcatagcactaacaatgttctttttgaatatagcatatcactgatgttgctctttttgagttatagtgtatatgtaattgacta 28548399  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28548400 attatcactctcttaatcggtaatattatttatatttatgttgatgt 28548446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 48334159 - 48334305
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||||  ||||||     
T  48334159 tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacacggatggtgttcttttcgggatatattgtgcatgtcgttgactg 48334258  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    | |   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48334259 accgttaccctcttaatcgtcaatattatatatatttatgttgatgt 48334305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 50287089 - 50286918
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  50287089 gatatagtgtttcttttttggatcgatatagtatagcatcaataatgttccttttggatatagtataacattgatataacactgatggtgctctttttgg 50286990  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50286989 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttaatgt 50286918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 317 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 25322342 - 25322219
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25322342 tatagcaataacaatgttccttttggatatagtataacattgatagtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 25322243  T
Q  417 cgtcaatattatttatatttatgt 440  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  25322242 cgtcaatattacttatatttatgt 25322219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 42464409 - 42464311
Alignment:
Q  348 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42464409 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 42464311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19349480 - 19349317
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatat-----att 382  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| | ||| |  ||| |     |||    
T  19349480 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgttttttattttattttatgtatt 19349381  T
Q  383 gtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19349380 gtgtatgtaattgactaatcgtcgctctcttaatcgtcaatataatttatatttatgttgatgt 19349317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 2122951 - 2123109
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||||||||||  ||||  ||| | ||||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  2122951 tatagtgcttctatttttaatcaaaatagtataagactaacaatctttcttttggatataatataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgaa 2123050  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
     ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2123051 agtaattgactaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 2123109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21157638 - 21157531
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21157638 attaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattgatgtgttctttttttggatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcactaacaat 21157539  T
Q  332 gttctttt 339  Q
    ||||||||    
T  21157538 gttctttt 21157531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 52121537 - 52121710
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-------------caccgatggtgctcttttt 372  Q
    |||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||              ||  |||||||||||||||    
T  52121537 gatatagtgctctttttttggatcgatataatatagcactaacaatgttccttttggatgtagtataatattgatgtataacagtgatggtgctcttttt 52121636  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  52121637 gatatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtaaataatatttatatttatgttaatgt 52121710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 10224418 - 10224330
Alignment:
Q  358 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10224418 gatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgt 10224330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 366 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 21157536 - 21157456
Alignment:
Q  366 tctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21157536 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgt 21157456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10224633 - 10224550
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  10224633 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaagagat 10224550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13748291 - 13748216
Alignment:
Q  371 ttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748291 ttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 13748216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 47750758 - 47750631
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47750758 tataacactaacaatattccttttggatatagtataatattgatggtgctcttttgggataatattgtatatgtaattgattaatcatcactctcttaat 47750659  T
Q  417 cgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  47750658 cttcaatattacttatatttatgttgat 47750631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 361 - 446
Target Start/End: Original strand, 33241195 - 33241280
Alignment:
Q  361 ggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33241195 ggtgctcttttttatatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 33241280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 378 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30787350 - 30787282
Alignment:
Q  378 atattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30787350 atattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgt 30787282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 428
Target Start/End: Original strand, 28705493 - 28705670
Alignment:
Q  264 agtactgatgtgttcttttttcga-tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg- 361  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||     
T  28705493 agtacggatgtgttctttttttgaatatagtgattcttttttggatcgatatagaatatcactaacaa-gttcattttggatatagtgtagcattgatgt 28705591  T
Q  362 ------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
                ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28705592 ataacattgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattgtctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 28705670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Original strand, 1528891 - 1528959
Alignment:
Q  360 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1528891 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 1528959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 28705373 - 28705456
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28705373 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccgtatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagat 28705456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 379 - 446
Target Start/End: Original strand, 45347907 - 45347974
Alignment:
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347907 tattgtgtttgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 45347974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37996665 - 37996565
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  37996665 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 37996568  T
Q  353 gca 355  Q
    |||    
T  37996567 gca 37996565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 443
Target Start/End: Original strand, 39664657 - 39664815
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt----atatattg 383  Q
    ||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||  | |||||  |    ||||||||    
T  39664657 tatagtgcttcttttttgtattgatatagtataacactgacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtatttttttttttttggatatattg 39664756  T
Q  384 tgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttga 443  Q
    | ||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39664757 t-tatataattgacaaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttga 39664815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Original strand, 7327968 - 7328068
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  7327968 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgta 7328065  T
Q  353 gca 355  Q
    |||    
T  7328066 gca 7328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 55268925 - 55268854
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttccttttt 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  55268925 attaatgttaactaaaataacttaagtcttgagtactgatgtgttattttttggatatagttcttctttttt 55268854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 396 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41741913 - 41741863
Alignment:
Q  396 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41741913 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 41741863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6134291 - 6134226
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttc 298  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||    
T  6134291 attaatgttgactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtttttttatggatataatgcttc 6134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Original strand, 42229906 - 42229970
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  42229906 tatattgcttcttttttgaatcgatatagtatagcactaacaatattccttttggatatagtata 42229970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 52684323 - 52684372
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52684323 aaaaaataattatccgatattttccgatacgtcctggatacgcaaaggat 52684372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 330
Target Start/End: Original strand, 1528802 - 1528853
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 330  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1528802 ttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa 1528853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2567394 - 2567345
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  2567394 aaaaaataattatccgatactttccgatacatcccgaatacgcgaaggat 2567345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Original strand, 28548251 - 28548304
Alignment:
Q  231 cgattaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 284  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  28548251 cgataaatgttaactaaaataacttaactcttgagtcttaatgtgttctttttt 28548304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Original strand, 7328086 - 7328145
Alignment:
Q  360 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  7328086 tggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaat---------accactctcttaatcgtcaatattat 7328145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 37996547 - 37996487
Alignment:
Q  360 tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37996547 tggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcatcaatattat 37996487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 2122918 - 2122952
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2122918 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 2122952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22611380 - 22611347
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22611380 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 22611347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 37996811 - 37996778
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37996811 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 37996778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 45159178 - 45158872
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45159178 gtaattgagttagtagaattgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 45159079  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45159078 ttaactaaaataattcaactcttcagtacttatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaaaaatgttctttt 45158979  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45158978 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 45158879  T
Q  440 ttgatgt 446  Q
    |||||||    
T  45158878 ttgatgt 45158872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 236 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31236092 - 31235882
Alignment:
Q  236 aatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttc 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31236092 aatgttaactaaaataacttaactcttcagtactgatgtgtttttttttggatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttc 31235993  T
Q  336 tttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatt 435  Q
     |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31235992 cttttggatatagtatatcattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatt 31235893  T
Q  436 tatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||    
T  31235892 tatgttgatgt 31235882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 444
Target Start/End: Original strand, 34146389 - 34146600
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34146389 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtattgatttgttcttttttggatataatgcttattttttagattgatatagtatagcactaacagtg 34146488  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34146489 ttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtaggtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 34146588  T
Q  433 atttatgttgat 444  Q
    ||||||||||||    
T  34146589 atttatgttgat 34146600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 35342527 - 35342739
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35342527 attaatgttaactaaaataacttaactcttgattactgatgtgttctttttta-atatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 35342625  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  35342626 ttccttttggatataatataacactgatgatgctctttttaggatatattgtgtatgtaattggctaataatcaatctcttaatcgtcaatattatttat 35342725  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    |||||| |||||||    
T  35342726 atttattttgatgt 35342739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 14824381 - 14824539
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14824381 tataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgta 14824480  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14824481 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 14824539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3545489 - 3545277
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||||| |||     
T  3545489 attaatgttaattaaaataacttaattcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgctttttatttt-atcgatatagtatagcactaataata 3545391  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||  |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3545390 tttcttttggatatagtataccactgatgatgctccttttaggatatattgtgtatgtaattgattaattatcactctcttaatcgtcaatattatttat 3545291  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  3545290 atttatgttgatgt 3545277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 22484903 - 22485207
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  22484903 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 22484999  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  22485000 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 22485095  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggt-------------gctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||  |||| |             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22485096 tggatatagtgtagcattgatgtttatctttgatgttgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 22485195  T
Q  427 atttatatttat 438  Q
    ||||||||||||    
T  22485196 atttatatttat 22485207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 1005754 - 1005912
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1005754 tatagtgtttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatattccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttaggatatattgtgta 1005853  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1005854 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 1005912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 4562031 - 4562189
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4562031 tatagtgcttcttttttggattgatatagtatatcactaacaatgttccttttggatatagtatagtacttatggtactctttttgggatatattgtgta 4562130  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4562131 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 4562189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4170004 - 4169693
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||    
T  4170004 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctgatttgtatcttgatgatggaaatggaggagaggagattgaaatg-tta--gtt 4169908  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  4169907 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgcttcatttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 4169812  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    | ||||||             ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4169811 ttgatatagtttagcattggtgtatagcactgatggtgctcttttt-gtacatattgcgtatgtaattgactaatgactactctcttaatcgtcaatatt 4169713  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  4169712 atttatatttatgttaatgt 4169693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 289 - 446
Target Start/End: Original strand, 4355555 - 4355712
Alignment:
Q  289 atagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtat 388  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  4355555 atagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggggctctttttgggatatattatgtat 4355654  T
Q  389 gtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4355655 gtaattgactaatcatcactctcttagtcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 4355712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 40308320 - 40308008
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  40308320 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 40308224  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  40308223 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 40308128  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatgg-------------tgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||  ||||              ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40308127 tggatatagtgtagcattgatgtataacattgatgatgctcttttcggtatatattgagtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 40308028  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  40308027 atttatatttatgttaatgt 40308008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 24585777 - 24585936
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt-ctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgt 386  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  24585777 tatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttctttttggatatagtatagcacttatggtactctttttgggatatattctgt 24585876  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24585877 atgtaattgactaatcttcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtttatgt 24585936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 6124801 - 6125119
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  6124801 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 6124897  T
Q  242 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc-------gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt 334  Q
    | ||    |   ||||||||| |||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6124898 a-cttgtttgtgttaactctt-agtagtgatgtgttctttttttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gtt 6124994  T
Q  335 ctttttggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtca 421  Q
    ||||||  |||||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6124995 ctttttatatatagtgtagcattgatgtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtca 6125094  T
Q  422 atattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  6125095 atattatttatatttatgttaatgt 6125119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 2319484 - 2319696
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2319484 attaatgttaactaaaataacttaactattgagtactgatgcatttttttatggatatagtgcttcttttttggattgatatagtataacactaacaatg 2319583  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  2319584 ttccttttggatatagtatatccatgat-gtgctctttttgggatatattttctaattaattgactaatcatcattcttttaatcgtcaatattatttat 2319682  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||| |||| |||||    
T  2319683 attaatgtggatgt 2319696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6497154 - 6496844
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  6497154 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 6497058  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6497057 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataggactaacaa-gttcctttt 6496962  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||             ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  6496961 ggatatagtgtagcattgatgtataacactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctttcaatcgtcaatatta 6496863  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  6496862 tttatatttatgttaatgt 6496844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 40431897 - 40431740
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  40431897 tatagtgct-cctttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatggtgctctttttaggatattttgtgta 40431799  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40431798 tgtaattgactaagcatcactctgttaatcatcaatattatttgtatttatgttgatgt 40431740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 18301357 - 18301521
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg----gtgctctttttggtatatat 381  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||    |||||||||||||||||| |    
T  18301357 gatacagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactagcaatgttccttttggatataatataacattgatgtatggtgctctttttggtatattt 18301456  T
Q  382 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18301457 tgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgt 18301521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 10573703 - 10573905
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| |||||| |||||||        
T  10573703 attaatgttaaccaaaataacttaactattgagtagtgatgtgttcttttttggatatagtgcttattttttggatcgataaagtataacactaac---- 10573798  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaata-ttattta 431  Q
            |||||||||||| ||  | ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10573799 --------ggatatagtatatcattggtggtgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcacttaatcgtcaatatttattta 10573890  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  10573891 tatttatgttgatgt 10573905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28746538 - 28746378
Alignment:
Q  287 atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttg-gtatatattgtg 385  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  | ||||||||||    
T  28746538 atatagttcttcttttttggatcgatatagtataacaataacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttggatatattgtg 28746439  T
Q  386 tatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28746438 tatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgctgatgt 28746378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 5588280 - 5588438
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||  |||||||||| || || ||||||||||||    
T  5588280 tatagtgcttattttttggatcgatataatataacactaacaatgtttcttttgcatacagtatatcacttatggtgctctcttcgggatatattgtgta 5588379  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5588380 tgtaattgactaatcatcattctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 5588438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 8482793 - 8482647
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  8482793 tataatgcttcttttttggatcgatataatataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcaccgatggtgctcgttttgggatatattgtgtt 8482694  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatat 434  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8482693 tgtaattgaccaataatcactctcttaatcgacaatattatctatat 8482647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 44156840 - 44156997
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |||   |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  44156840 tataatgcttcttttttggatcgatataatatagaactaacaatgtttcttctggatatagtataacacttgtggtgctctttttggg-tatgttgtgta 44156938  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44156939 tgtaattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 44156997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 5371337 - 5371508
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||           | ||||||| | |||||||    
T  5371337 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataaaatagcattcatataacactgatggtgttttttttgg 5371436  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5371437 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatgttaatgt 5371508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 286 - 441
Target Start/End: Original strand, 12819577 - 12819743
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||           ||||||||||||||    
T  12819577 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatattccttttggatatagtatagcattgatataacactggtggtgctctttttgg 12819676  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 441  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12819677 tatattttacgtatgtaattgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatgtt 12819743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 329 - 446
Target Start/End: Original strand, 35996814 - 35996931
Alignment:
Q  329 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35996814 aatgttcattttggatatagtataacacttatggtgctccttttgggatatattgtgcatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattat 35996913  T
Q  429 ttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35996914 ttatatttatgttgatgt 35996931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 327 - 444
Target Start/End: Original strand, 40536498 - 40536615
Alignment:
Q  327 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40536498 acaatgttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttggaatatattgtatatgtaattgactaatcatcactcttttaatcgtcaatatt 40536597  T
Q  427 atttatatttatgttgat 444  Q
    | ||||||||||||||||    
T  40536598 acttatatttatgttgat 40536615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 323 - 446
Target Start/End: Original strand, 12206264 - 12206387
Alignment:
Q  323 actaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaa 422  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12206264 actaacaatgttccttttggatataatataacattgatggtgctttttttcggatatattttgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaa 12206363  T
Q  423 tattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12206364 tattatttatatttatgttgatgt 12206387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 312 - 446
Target Start/End: Original strand, 3564106 - 3564239
Alignment:
Q  312 tatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctc 411  Q
    |||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3564106 tatagtatagcattaacaatgcttcttttggatatagtataacagttatgatgctctttttgggatatattgtgtatgcaattgactaatcatcactctc 3564205  T
Q  412 ttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3564206 ttaatcgtcaatatta-ttatatttatgttgatgt 3564239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 20537115 - 20537274
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgt 386  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||             |||||||||||| ||||| |||  |    
T  20537115 tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgtataacactgattgtgctctttttgatatattttgctt 20537214  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20537215 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 20537274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 21104691 - 21104894
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  21104691 attaatgttaactaaaataacttaacttttgagtattgatgtgtactttttttgaatatagtgcttcatttttgtatcgatatagtatatcactaacaat 21104790  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
     ||| ||||||||           | |||| |  | ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21104791 attccttttggat----------gctgatgatattgtttttgggatatattgtgtatgtaattg-gttataatcactctcttaatcgtcaatattattta 21104879  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    | |||||||||||||    
T  21104880 tgtttatgttgatgt 21104894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7807231 - 7807045
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||| ||    
T  7807231 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaaa-ttccttttgaatatagtgta 7807134  T
Q  353 gcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7807133 gcattgatgtataacattgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattttctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 7807045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 317 - 412
Target Start/End: Original strand, 9293655 - 9293750
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| | || || |||||||||||||| ||||||||    
T  9293655 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggatataatatgcatttaattgactaatcatcactctct 9293750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 396 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 14217003 - 14216955
Alignment:
Q  396 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14217003 actaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 14216955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 45159305 - 45159256
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45159305 aaaaaatacttatccgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 45159256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Original strand, 9293314 - 9293365
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 284  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9293314 attaatgttaactaaaataactcaactattgagtaccgatgtgttctttttt 9293365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 44156807 - 44156841
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44156807 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 44156841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1776312 - 1776249
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  1776312 tatagtgcttcttttttggatcgatataat-tagcacggacaatgtttcttttggatatagtata 1776249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 265
Target Start/End: Original strand, 4355521 - 4355553
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgag 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4355521 attaatgttaactaaaataacttaactcttgag 4355553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 141 - 446
Target Start/End: Original strand, 24784489 - 24784794
Alignment:
Q  141 taattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgt 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24784489 taattgagttagtaaagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagagaagattgagacgattaatgt 24784588  T
Q  241 taactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24784589 taactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagattgatatagtatagcactatcaatgttcttttt 24784688  T
Q  341 ggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 440  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24784689 ggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 24784788  T
Q  441 tgatgt 446  Q
    ||||||    
T  24784789 tgatgt 24784794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 147 - 446
Target Start/End: Original strand, 52721477 - 52721776
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52721477 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttgaaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 52721576  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  52721577 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 52721676  T
Q  347 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52721677 agtatatcattgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 52721776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Original strand, 39957804 - 39958110
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39957804 gtaattgagctaatagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctagtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggatattgagacgattaatg 39957903  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39957904 ttaactaaaataacttaattcttgaatactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 39958003  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39958004 tagatatagtataacaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 39958103  T
Q  440 ttgatgt 446  Q
    | |||||    
T  39958104 tcgatgt 39958110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 231 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24823687 - 24823472
Alignment:
Q  231 cgattaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 330  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24823687 cgattaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcttttttagattgatatagtatagcactatcaa 24823588  T
Q  331 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24823587 tgttctttttggatatagtatagcaccgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 24823488  T
Q  431 atatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||    
T  24823487 atatttatgttgatgt 24823472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24793640 - 24793427
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24793640 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttaaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 24793541  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24793540 ttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatctaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 24793441  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  24793440 atttatgttgatgt 24793427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 3109214 - 3109003
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3109214 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 3109115  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3109114 ttccttttggatatagtataacacagatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactcttttaatcgtcaatattatttat 3109015  T
Q  433 atttatgttgat 444  Q
    ||||||||||||    
T  3109014 atttatgttgat 3109003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 17892457 - 17892670
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17892457 attaatgttaacaaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaatg 17892556  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17892557 ttccttttgaatatagtataacactgatgatgctctttttggtttatattgtgtatgtaattgtctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 17892656  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  17892657 atttatgttgatgt 17892670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 438
Target Start/End: Original strand, 36943878 - 36944083
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36943878 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataatactaacaatg 36943977  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  36943978 ttccttttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcaatctcttaatcgtcaatattatttat 36944077  T
Q  433 atttat 438  Q
    ||||||    
T  36944078 atttat 36944083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 44521955 - 44521742
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  44521955 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactaatgtgttcttttttgaatataatgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatg 44521856  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44521855 ttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgagatattttgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatgttatttat 44521756  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    |||||||| |||||    
T  44521755 atttatgtagatgt 44521742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 55901057 - 55900844
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  55901057 attaatggtgactaaaaaaacttaactcttgagtactgatgtgttcttttatggatataatgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 55900958  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| | ||| ||||||    
T  55900957 ttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctcgtaatcgtgagtataatttat 55900858  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  55900857 atttatgttgatgt 55900844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 42630393 - 42630174
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc------gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcacta 326  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||       |||||| |||||| |||||  |||||| ||||||| |||||    
T  42630393 attaatgttaactaaaataactgaactcttcagtacttatgtgttcttttttttttttggatataatgcttcttttttgaatcgatgtagtataacacta 42630294  T
Q  327 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42630293 acaatgttccttttggatagagtataacactgatgatgcttttttttggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatatt 42630194  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42630193 atttatatttatgttgatgt 42630174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31946102 - 31945945
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31946102 tatagtgcttcttttttggatcgatat-gtatagcactaacaatgttccttttagatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgta 31946004  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31946003 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 31945945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 52572826 - 52573133
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||  | ||| |||  |||    
T  52572826 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccatatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagagtagatgtaaacg-tta--gtt 52572922  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  52572923 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgctt----tttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 52573014  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52573015 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatactgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 52573114  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  52573115 tttatatttatgttaatgt 52573133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 440
Target Start/End: Original strand, 49470489 - 49470692
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||  ||| ||  ||||||  ||||||||||||  |||||||||||    
T  49470489 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactcatgtaaacttttttggata--gtgtttttttttta--tcgatatagtatgtcactaacaatg 49470584  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49470585 ttccttttggatatagtatagcattgatgatgcactttttggaaaatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 49470684  T
Q  433 atttatgt 440  Q
    ||||||||    
T  49470685 atttatgt 49470692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 41146241 - 41146551
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  41146241 aattgagttagcagagttgtctttggatgatccggatttggaagctgatttgtatcttgattatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 41146337  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  41146338 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaa-gttcctttt 41146433  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41146434 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaattgtcaatatta 41146532  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  41146533 tttatatttatgtttatgt 41146551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 47607355 - 47607501
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47607355 tttttggatcgatataatatagcaccaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgacta 47607454  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47607455 attatcactatcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 47607501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Original strand, 14795643 - 14795947
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  14795643 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatgaaggagaggagatataaacg-tta--gtt 14795739  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  14795740 acttgt--tagtgttaactctt-agtattgatgtgttctttttttggatatagtgattctttttcggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 14795835  T
Q  340 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||| |||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14795836 tggatacagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 14795935  T
Q  427 atttatatttat 438  Q
    ||||||||||||    
T  14795936 atttatatttat 14795947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 1177219 - 1177378
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt-ggtatatattgtgt 386  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  1177219 tataatgcttcttttttggattgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtacttttttttgggatatattgtgt 1177318  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1177319 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 1177378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 414
Target Start/End: Original strand, 53322976 - 53323255
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  53322976 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctaatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 53323072  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53323073 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatacagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 53323168  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctctta 414  Q
    |||||||             ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53323169 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctctta 53323255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 293 - 446
Target Start/End: Original strand, 51859042 - 51859195
Alignment:
Q  293 tgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaa 392  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  51859042 tgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgtgatatattgtgaaagtaa 51859141  T
Q  393 ttgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51859142 ttgactaatcatcacccacttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 51859195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 5835205 - 5835376
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||           |||||||||||||     
T  5835205 gatatagtgcttctttttttgatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataacattgatggtgctctttttga 5835304  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5835305 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 5835376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 28377272 - 28377445
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctcttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||             | |||||||||||||||    
T  28377272 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctcttttt 28377371  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28377372 gttatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgccaatattatttatatttatgttaatgt 28377445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 2586592 - 2586737
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||    
T  2586592 tttttagatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatataatataacactgatgatgctcttttgagg-tatattgtgtatgtaattggcta 2586690  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2586691 ataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 2586737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 40694312 - 40694470
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  40694312 tataatgcttcttttttgaatcgatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatataatatatcacttatgatgctctttttgggatatattacgta 40694411  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40694412 tgtaattgactaatcatcactctcttaattgtcgatattatttatatttatgttgatgt 40694470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 293 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 258941 - 258789
Alignment:
Q  293 tgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttct-ttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgta 391  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  258941 tgcttcttttttggatcaatatagtatagcagtaacaatgttccgttttggatatagtataacacttatggtactctttttgagatatattgtgtatgta 258842  T
Q  392 attgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  258841 attgactaattatcactctcttaatcgtcactattatttatatttaagttgat 258789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 8063579 - 8063282
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  8063579 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 8063483  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  8063482 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 8063387  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8063386 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 8063287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 3403056 - 3402762
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  3403056 aattgagttagcaaagttgtccttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 3402960  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  3402959 actt--gctagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttccttt 3402864  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3402863 tggatatagtgtagcattgatgtataacacttattgtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcatcaatatt 3402764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 30683507 - 30683380
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30683507 tatagcactaacaatgttccttttgaatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactctcttaat 30683408  T
Q  417 cgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30683407 cgtcgatattatttatatttatgttgat 30683380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 51675031 - 51675188
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||| |||  ||| | |||||||||| ||||||||| ||    
T  51675031 tatagtgcttcttttttggatagatatagtatatcactaacaatattcctttctaatatagtataacacttatgattctctttttgg-atatattgtata 51675129  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51675130 tgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 51675188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 31226974 - 31227270
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  31226974 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 31227070  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc---ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctt 337  Q
    |  |    || | |||||||||  ||||||||||||||   ||||||  |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31227071 actt--gttagtgttaactctt-tgtactgatgtgttctttttttttttatatagtaattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcct 31227166  T
Q  338 tttggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaata 424  Q
    ||||||||||             |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31227167 tttggatatagtgtagcattgatgtatagcactcatgatgctctttttggtatgtattgcgcatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaata 31227266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36511809 - 36511648
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt---atatattgt 384  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||  |   ||||||| |    
T  36511809 tatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaagaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgtttttttttttttgatatatttt 36511710  T
Q  385 gtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  36511709 gtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttgtattgatgt 36511648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 310 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43509755 - 43509608
Alignment:
Q  310 gatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgact 398  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||           | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43509755 gatatagtatagcattaacaatgttccttttagatataatatagcattgatataatactgatggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgact 43509656  T
Q  399 aatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43509655 aatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 43509608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 348 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5325287 - 5325197
Alignment:
Q  348 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 438  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5325287 gtatagcacttatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 5325197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 321 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 7952954 - 7952831
Alignment:
Q  321 gcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtc 420  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||  |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  7952954 gcactaacaatgttccttttggatatagtataacattgatgacgctccttttgggatatattatatatgtaattgattaatcatcactcttttaatcgtc 7952855  T
Q  421 aatattatttatatttatgttgat 444  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  7952854 aatattacttatatttatgttgat 7952831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 46431842 - 46431685
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||        
T  46431842 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatactactt-ctttttggatcgataaagtatagcactaac---- 46431748  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatca 403  Q
            ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46431747 --------ggatacagtatagcactaatggttctctttttgaaatatatcgtgtgtgtaattgactaatca 46431685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 37992387 - 37992293
Alignment:
Q  311 atatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacc 405  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  37992387 atatagtataggactaacaatgttccttttggatataatatagcactaatggtgctctttttgggatatattgggtatgtaatcgactaatcacc 37992293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 38492136 - 38491965
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  38492136 ttaactctt-agtaatgatgtgttctttttttggatatagggattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 38492039  T
Q  353 gcaccga------tggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||  ||      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  38492038 gcattgatgtatctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 38491965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 14614746 - 14614897
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| ||   ||| || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  14614746 tataatgcttcttttttagatcaatataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtata 14614845  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14614846 tgtaattgactaatca-------tttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 14614897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 79
Target Start/End: Original strand, 24784350 - 24784410
Alignment:
Q  19 ttagaagttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24784350 ttagaagttttaaaaaataattatcagatactttccgatacatcctggatacgcgaaggat 24784410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 234 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 722538 - 722441
Alignment:
Q  234 ttaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  722538 ttaatgttaactaaactaacttaactcttgtgtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttggatagatatagtatgacactaacaat 722441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 39957682 - 39957735
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39957682 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 39957735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 319
Target Start/End: Original strand, 754380 - 754465
Alignment:
Q  234 ttaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtat 319  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  754380 ttaatgttaactaaactaacttaactcttgtgtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttggatagatatagtat 754465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Original strand, 2586545 - 2586596
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2586545 attaatgttaactaaaataacttaactcttcaggactgatgtgttctttttt 2586596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37992436 - 37992394
Alignment:
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttt 282  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37992436 ttaactaaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttctttt 37992394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52122421 - 52122361
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 202  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  52122421 aattgagttagcatagttgtctttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 52122361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 14614713 - 14614747
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14614713 attaatgttaactaaaataatttaactctcgagta 14614747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 51859004 - 51859038
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51859004 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 51859038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 8064109 - 8064076
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8064109 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 8064076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 19738815 - 19738848
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19738815 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 19738848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 52572310 - 52572343
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52572310 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 52572343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Original strand, 53322455 - 53322492
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53322455 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatatgtcc 53322492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 52122869 - 52122833
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  52122869 ttttaaaaaataattatctgatactttccgatacgtc 52122833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 70
Target Start/End: Original strand, 52721382 - 52721426
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatac 70  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  52721382 ttttataaaataattatccgatactttccgatacgtaccggatac 52721426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Original strand, 40412659 - 40412965
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  40412659 gtaattgagttagtagagttatctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatgaaggagaggagattgagacgactaatg 40412758  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40412759 ttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgctttttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctctt 40412858  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40412859 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 40412958  T
Q  440 ttgatgt 446  Q
    |||||||    
T  40412959 ttgatgt 40412965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 140 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 8171108 - 8170804
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8171108 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctgctttgtatcttgttgatggaaatagaggagaggagattgagacgattaatg 8171009  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8171008 ttaactaaaataacttaactcttgagtactgatatgctcttttttcgatatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaccaatgttctttt 8170909  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8170908 tggatattgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttacg 8170809  T
Q  440 ttgat 444  Q
    |||||    
T  8170808 ttgat 8170804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 235 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 27109102 - 27108891
Alignment:
Q  235 taatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27109102 taatgttaactaaaataacttaactgttaagtaccgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatttt 27109003  T
Q  335 ctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatat 434  Q
    | ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  27109002 ccttttggatatagtatagcacttattgtgctctttttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatag 27108903  T
Q  435 ttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||    
T  27108902 ttatgttgatgt 27108891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 7411811 - 7412024
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7411811 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagaaccgatgtgttcttttttgaacatagtgctttctttttggatcgatatagtataacactaacaatg 7411910  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||  |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7411911 tttattttagatataatatagcattgatggtgctatttttgggatatattgtttatgcaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttac 7412010  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| ||||    
T  7412011 atttatgtttatgt 7412024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 267 - 446
Target Start/End: Original strand, 27968338 - 27968514
Alignment:
Q  267 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27968338 actgatgtgttcttttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacactgatggtgct 27968434  T
Q  367 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27968435 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27968514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28876049 - 28875737
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  28876049 aattgagttagcagagttgtctttagatgaatcagatttggaagttgatttgtatcttgataatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 28875953  T
Q  242 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |   |   |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  28875952 acttgttagt-tttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 28875856  T
Q  341 ggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    ||||||||| |||||             | |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28875855 ggatatagtgtagcattgatgtttattcctgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 28875756  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  28875755 tttatatttatgttaatgt 28875737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 3892206 - 3892364
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  3892206 tatagtgcttcttttttggattgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctctttttaggatatattgtgta 3892305  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3892306 tgtaattgactaatcatcgctctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 3892364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 279 - 446
Target Start/End: Original strand, 20182622 - 20182789
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 378  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  20182622 tttttttgatatggtgcttcttttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggata 20182721  T
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20182722 tattgtttatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 20182789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 267 - 446
Target Start/End: Original strand, 27886423 - 27886599
Alignment:
Q  267 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 366  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  27886423 actgatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggct 27886519  T
Q  367 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27886520 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27886599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 267 - 446
Target Start/End: Original strand, 27945081 - 27945257
Alignment:
Q  267 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 366  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  27945081 actgatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggct 27945177  T
Q  367 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27945178 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27945257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 267 - 446
Target Start/End: Original strand, 28025324 - 28025500
Alignment:
Q  267 actgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgct 366  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||   |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  28025324 actgatgtgttattttttggatatagtgttttttttt---atcgatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacactgatggggct 28025420  T
Q  367 ctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28025421 ctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttgatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 28025500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45216704 - 45216400
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  45216704 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagtttatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 45216608  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  45216607 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 45216512  T
Q  340 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||||||||||             ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45216511 tggatatagtgtagcattgatgtatagcaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 45216412  T
Q  427 atttatatttat 438  Q
    ||||||||||||    
T  45216411 atttatatttat 45216400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 5540056 - 5540368
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  5540056 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatggtaatgaaggagaggagatgcaaacg-tta--gtt 5540152  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  5540153 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttccttt 5540248  T
Q  340 tggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||             | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5540249 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaataaactaatgaacactctcttaatcgtcaatatt 5540348  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  5540349 atttatatttatgttaatgt 5540368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 32638589 - 32638391
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagt---- 349  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||        
T  32638589 ttaactctt-agtactcatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatattgtatagcactaacaa-gttccttttgaatatagtgtag 32638492  T
Q  350 ---------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 440  Q
             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32638491 catcgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 32638392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 32877830 - 32878003
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagc-------------accgatggtgctcttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||             || |||||||||||||||    
T  32877830 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcgttgatgtataacactgatggtgctcttttt 32877929  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32877930 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctattaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 32878003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 36484059 - 36484369
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  36484059 aattgagttggcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 36484155  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  36484156 acttgt--tagtgttaactttt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 36484251  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||             ||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36484252 ggatatagtgtagcattgatgtataacactgatagtgctcttttt-atatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatatta 36484350  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  36484351 tttatatttatgttaatgt 36484369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 6028865 - 6029038
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  6028865 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctcttttt 6028964  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6028965 tgtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 6029038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 19436627 - 19436798
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||| ||||||||||    
T  19436627 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttgg 19436726  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19436727 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 19436798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 19572776 - 19572947
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||           | |||||| ||||||||||    
T  19572776 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtataacattgatataaccctgatggtactctttttgg 19572875  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19572876 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 19572947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 37372502 - 37372652
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||       ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37372502 tatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcact-------ttctttt-ggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggatatattgtgta 37372593  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37372594 tgtaattgactaatcatcattctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 37372652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 37669204 - 37669514
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  37669204 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 37669300  T
Q  242 aact-aaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |   ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  37669301 acttgttaata--ttaactctt-agtattgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcaatataatatagcactaacaa-gtttctttt 37669396  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||             |||||  || ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  37669397 ggatatactgtagcattgatgtataatactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatatta 37669495  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  37669496 tttatatttatgttaatgt 37669514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 41098855 - 41098663
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag 353  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| | ||| |||| |||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||     
T  41098855 ttaattctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgtttcttgtttggatcaatatagtataacattaacaatgtacattttagatatagtataa 41098756  T
Q  354 caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  41098755 cactaattgtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgt 41098663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 4246563 - 4246857
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | |||  | | |||    
T  4246563 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg--tca-gtt 4246659  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  4246660 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 4246755  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4246756 tggatatagtgtagcattgatgtataacaatgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 4246855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 446
Target Start/End: Original strand, 32760098 - 32760300
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata------ 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||          
T  32760098 ttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtag 32760195  T
Q  348 -------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgt 440  Q
           ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32760196 cattgatgtataacactgatagtgctcttttt-gtatatatttcgtatgtaattgactaatgaccactctctcaatcgtcaatattatttatatttatgt 32760294  T
Q  441 tgatgt 446  Q
    | ||||    
T  32760295 taatgt 32760300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 12580019 - 12579706
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  12580019 aattgagtcagcagagctgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 12579923  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12579922 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 12579827  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatata--------ttgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgt 419  Q
    |||||||             ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||        ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12579826 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatagtgctcttttt-gtatatattgcgatgttgcgtatgtaattgactaatgaacactctcttaatcgt 12579728  T
Q  420 caatattatttatatttatgtt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12579727 caatattatttatatttatgtt 12579706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 25022529 - 25022700
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||           | |||||||||||||||||    
T  25022529 gatatagtgtttcttttttggatcaatatagtatagcattatcaatgttctttttggatatagtgtagcattgatataacactgatggtgctctttttgg 25022628  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25022629 tatattttgcatatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 25022700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 413
Target Start/End: Original strand, 38388876 - 38389054
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  38388876 attaatgttgactaaaaaaacttaactctcgagtactgatgtgttcttttatggatgtagagtttcttttttgaatcgatatagtataacactaacaatg 38388975  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctctt 413  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38388976 ttcattttggataaaatatagcactcatgatgctc--tttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctctt 38389054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 306 - 446
Target Start/End: Original strand, 28737780 - 28737920
Alignment:
Q  306 gatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcacc 405  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28737780 gatcgatataatataccattaataatgtttcttttggatatagtatagcacttattgtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatc 28737879  T
Q  406 actctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28737880 actcttttaatcgtcaatgttatttatatttatgttgatgt 28737920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34900853 - 34900556
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  34900853 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 34900757  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  34900756 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 34900661  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34900660 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 34900561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 423
Target Start/End: Original strand, 32425130 - 32425316
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat- 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  32425130 attaatgttaactaaaataacttaactcttga-------tgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaata 32425222  T
Q  332 --gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
      |||||||||| |||||||||| ||  |||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  32425223 atgttctttttgaatatagtataacattgatgatgctattttggggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaat 32425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 42949444 - 42949615
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||  ||||||           |||||| ||||||||||||    
T  42949444 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatcgcactaacaatgtttatttttgatataaaatagcattgatataacaccgatgatgctctttttgg 42949543  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42949544 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatgtatatttatgttaatgt 42949615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 5818207 - 5818051
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcacc-gatggtgctctttttggtatatattgtgt 386  Q
    |||||| ||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||    
T  5818207 tatagtacttctgttttggattgatgtagtatagcactaacaatgttccttttgaatatagtatagcatttgatggtgctcttttggg-atatattgtgt 5818109  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5818108 atgtagttgactaatcatcactttcttaatggacaatattatttatatttatgttgat 5818051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43770974 - 43770876
Alignment:
Q  348 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43770974 gtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 43770876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 32856 - 33005
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt---atatattgtgtatgtaattga 396  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| || | |||||  |   ||||||||| |||||||||||    
T  32856 tttttggatcaatatagtataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgttttttttttttggatatattgtatatgtaattga 32955  T
Q  397 ctaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32956 ctaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 33005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19947718 - 19947547
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| ||||||||| ||  |||           ||||||||||||||    
T  19947718 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaatgtttcttttgggtatagtataacattgatataacactggtggtgctctttttgg 19947619  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19947618 tatgttttgcgtatgtaattgactaatcaccactgtgttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 19947547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43771198 - 43771115
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43771198 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagat 43771115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22201194 - 22201008
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  22201194 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagtactaacaagtttctttt-ggatatagtgta 22201097  T
Q  353 gcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||  ||||             ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22201096 gcattgatgtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 22201008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 373
Target Start/End: Original strand, 29355865 - 29355967
Alignment:
Q  271 atgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttt 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||    
T  29355865 atgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttttattaatatagtataacactaacaatgtttcttttgaatatagtatagcactcatggtgctattt 29355964  T
Q  371 ttg 373  Q
    |||    
T  29355965 ttg 29355967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8171235 - 8171186
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8171235 aaaaaataattattcgataatttccgatacatcccggatacgcgaaggat 8171186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 63
Target Start/End: Original strand, 32759491 - 32759528
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 63  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32759491 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 32759528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 73
Target Start/End: Original strand, 40412536 - 40412579
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcg 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40412536 aaaaaataattatccgatacttttcgatacgtcccggatacgcg 40412579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 43771055 - 43771004
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 330  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  43771055 ttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa 43771004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 3892173 - 3892207
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3892173 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 3892207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5818240 - 5818206
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5818240 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 5818206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22201337 - 22201304
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22201337 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 22201304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 34901382 - 34901349
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34901382 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 34901349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 147 - 446
Target Start/End: Original strand, 3212692 - 3212991
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212692 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 3212791  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 346  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3212792 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 3212891  T
Q  347 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212892 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 3212991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Original strand, 32018220 - 32018518
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||       ||    
T  32018220 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccaaatttggaagctggtttgtatcttattgatggaaatggaagataggaaattgaga-------tg 32018312  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32018313 ttaactaaaataacttaactcttgagtact-atgtgttcttttttcgatatagtgtttcttttttagattgatatagtataacactaacaatgttctttt 32018411  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 439  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32018412 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatg 32018511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 10894428 - 10894214
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10894428 attaatgttaactaaaattacttaactctcgagtattgatgtgttctttgttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 10894329  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta-ttta 431  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10894328 ttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgtgatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttta 10894229  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||| ||||||    
T  10894228 tatttatgctgatgt 10894214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6707950 - 6707736
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttag-atcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  6707950 attaatgttgactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttcttttatggatataatgcttctttttttggatcaatatagtataacactaacaat 6707851  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6707850 gttcattttggatatagtatagcattgatggtgctccttttgggatgtattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 6707751  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  6707750 tatttatgttgatgt 6707736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 7255130 - 7255340
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaac-aat 331  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||    
T  7255130 attaatgttaacttaaataacttaactcttgagtactgatgtgttatttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacattaacaaat 7255229  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7255230 gttccttttggatatagtatagcactgattgtgctctttgtgggatatattg----tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 7255325  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||| ||||||||||    
T  7255326 tattaatgttgatgt 7255340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 11105495 - 11105709
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcga-tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11105495 attaatgttaaataaaataaattaattcttgagtattgatatgttcttttttttaatacagtgcttctcttttggattgatatagtataacactaacaat 11105594  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11105595 gttcattttggatataaaataacactgatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaattggctaataaccactctcttaatcgtcaatattattta 11105694  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  11105695 tatttatgttgatgt 11105709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13061283 - 13061071
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  13061283 attaatattaactaaaataacttaatttttgagtattgatgtgttattttttggatatagcgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaatgatc 13061184  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| | |||| ||||||||| ||| |||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13061183 ttcctcttgggtatagtataacactgatgctgtt-tttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 13061085  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  13061084 atttatgttgatgt 13061071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7188262 - 7187957
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  7188262 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 7188166  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc--gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttt 338  Q
    |  |    || | ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  7188165 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctt 7188070  T
Q  339 ttggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat 425  Q
    |||||||||||             ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7188069 ttggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattaactaatgatcactctcttaatcgtcaatat 7187970  T
Q  426 tatttatatttat 438  Q
    |||||||||||||    
T  7187969 tatttatatttat 7187957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13045285 - 13045078
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     || |||||| |||||||   ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  13045285 attaatgtcaactaaaataacttaactcttgagtactg-----ttattttttggatatagcatttcttttttggattgatatagtataacactaacgatc 13045191  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13045190 ttccttttggatatagtattgcactgatggtgcttttttagg-atatattgtgtatgtaattggctaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 13045092  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  13045091 atttatgttgatgt 13045078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 27084216 - 27084374
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27084216 tatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagaactaacaatgttcctttcggatatagtataacacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 27084315  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27084316 tgtaattgactaaccatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgt 27084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 446
Target Start/End: Original strand, 26327525 - 26327717
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag 353  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||     
T  26327525 ttaactctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttggatcaatatagtataacactaacaatgtacattttagatatagtataa 26327624  T
Q  354 caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||  || ||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  26327625 cactaattgtgctctttttgagatatattgtctatgtaactgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgttgatgt 26327717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 19128395 - 19128554
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttg-gtatatattgtgt 386  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||  | |||||||||||    
T  19128395 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttttttggatatattgtgt 19128494  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19128495 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaacattatttatatttatgttgatgt 19128554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 22989109 - 22988838
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaa---t 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||   |    
T  22989109 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgtgaatggaggagagaagattgagacaattaatatt 22989010  T
Q  239 gttaactaaaataa-tttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||                    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22989009 gttaactaaaataactttaactcttgagaac-gatgtgttct--------------------tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcct 22988931  T
Q  338 tttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttata 433  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22988930 tttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttgactaatcatcactcgcttaatcgtcaatattacttata 22988838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 433
Target Start/End: Original strand, 23799287 - 23799558
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaa---t 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||   |    
T  23799287 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgtgaatggaggagagaagattgagacaattaatatt 23799386  T
Q  239 gttaactaaaataa-tttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctt 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||                    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23799387 gttaactaaaataactttaactcttgagaac-gatgtgttct--------------------tttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcct 23799465  T
Q  338 tttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttata 433  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23799466 tttggatacagtataacactgatggtgttccttttgggatatattgtgtat---tttgactaatcatcactcgcttaatcgtcaatattacttata 23799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 8357516 - 8357827
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | | |||  |||    
T  8357516 aattgagttagcagagttgtctttggatgaacctgatttggaagcttatttgtatcttgatgatggtaatggaggagaggagatttaaatg-tta--gtt 8357612  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  8357613 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcaatataatatagtactaacaa-gttcctttt 8357708  T
Q  341 ggat-atagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||| |||||             |||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8357709 ggattatagtgcaacattgatgtatagtactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 8357807  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  8357808 atttatatttatgttaatgt 8357827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 32130401 - 32130230
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||           | |||||||||||||||||    
T  32130401 gatatagtgcttcttttttggatcaatatagtatagcattaacaatgttccttttggataaagtataacatttatataacactgatggtgctctttttgg 32130302  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32130301 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 32130230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 234551 - 234715
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggt------atatat 381  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||| | |||||  |      ||||||    
T  234551 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgtttttttttttttttttatatat 234650  T
Q  382 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  234651 tgtgtatgtagttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 234715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 321 - 446
Target Start/End: Original strand, 3299334 - 3299459
Alignment:
Q  321 gcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtc 420  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  3299334 gcacgaacaatgttccttttggatatattatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcattactctcttaatcgtt 3299433  T
Q  421 aatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3299434 aatgttatttatattcatgttgatgt 3299459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 1036298 - 1036001
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  1036298 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 1036202  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  1036201 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 1036106  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1036105 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 1036006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 233 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 13607694 - 13607489
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgat-------atagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcact 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||   |       |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  13607694 attaatgttaactaaaataacttaattcttgagtattgatgtgttttttttttttttttttttatagtgcttcttttttggatcgatttagtataacact 13607595  T
Q  326 aacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat 425  Q
     ||||| ||  ||||| ||||| |||| ||   ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  13607594 tacaatttttcttttgaatataatataaca---atgatgttctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatat 13607498  T
Q  426 tatttatat 434  Q
    | |||||||    
T  13607497 tgtttatat 13607489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 286 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 31740558 - 31740394
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata-------------gtatagcaccgatggtgctcttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||             ||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  31740558 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatataatataacattgatgtataacactgattgtgctattttt 31740459  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattta 437  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31740458 ggtatattttgcgtatgcaaatgactaatccccactctctttatcgtcaatattatttatattta 31740394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31195725 - 31195551
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 347  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         
T  31195725 ttaactctt-agtactgttgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 31195628  T
Q  348 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  31195627 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaat 31195551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 379 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 4153325 - 4153258
Alignment:
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4153325 tattgtgtaagtaattgagtgatcatcactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttgatgt 4153258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 344
Target Start/End: Original strand, 31079813 - 31079924
Alignment:
Q  238 tgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagat-----cgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||      ||||||||||| || ||||||||    
T  31079813 tgttaactaaaataacttaaatcttgaatactgatgtgttcttttttggatatagtgtttcttttttggattgatatgatatagtatatcattaacaatg 31079912  T
Q  333 ttctttttggat 344  Q
    ||| ||||||||    
T  31079913 ttccttttggat 31079924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 27084183 - 27084217
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27084183 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 27084217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 1036826 - 1036793
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1036826 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 1036793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 62
Target Start/End: Original strand, 8357080 - 8357112
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 62  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8357080 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtc 8357112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 147 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9283856 - 9283557
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283856 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 9283757  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9283756 aaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 9283657  T
Q  347 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283656 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 9283557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 147 - 446
Target Start/End: Original strand, 25969627 - 25969926
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25969627 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 25969726  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25969727 aaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 25969826  T
Q  347 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25969827 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 25969926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 147 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9250304 - 9250007
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9250304 agttagtagagttg-ctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 9250206  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9250205 aaataatttaactcttgagtaattatgtgt-ctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 9250107  T
Q  347 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9250106 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 9250007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23079018 - 23078805
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23079018 attaatgttaattaaaataacttaactcttaagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 23078919  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23078918 ttcctttttgatatagtatagcactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgagtaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 23078819  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  23078818 atttatgttgatgt 23078805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 15878333 - 15878120
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15878333 attaatattaactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttctttttttaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 15878234  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15878233 ttcattttggatatagtataacactgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaataatcactctcttaatcgtcaatattatttat 15878134  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  15878133 atttatgttgatgt 15878120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 444
Target Start/End: Original strand, 33454276 - 33454487
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33454276 attaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtacttatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 33454375  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||| ||||||    
T  33454376 ttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatcattctcttaatcgtcggtataatttat 33454475  T
Q  433 atttatgttgat 444  Q
    ||||||||||||    
T  33454476 atttatgttgat 33454487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 35160070 - 35160285
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaa----c 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |    
T  35160070 attaatgttaattaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttagata--gtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaattaac 35160167  T
Q  329 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||    
T  35160168 aatgttccttttggatatagtatagcactaatggtgctttttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaattattaatgttat 35160267  T
Q  429 ttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35160268 ttatatttatgttgatgt 35160285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36763705 - 36763488
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaa---- 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||        
T  36763705 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtcctttttttggatatagtgcctcttttttggatcgatatagtataacactaattaa 36763606  T
Q  328 caatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  36763605 caatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctttttttgg-atatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgtta 36763507  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36763506 tttatatttatgttgatgt 36763488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1400177 - 1399972
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1400177 attaatgttaattaaaataacttaactcttaagtattgatgtgttattttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 1400078  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1400077 ttccttttggatatagtataacattgatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaataatcactatcttaatcgtcaatattatttat 1399978  T
Q  433 atttat 438  Q
    ||||||    
T  1399977 atttat 1399972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36757925 - 36757708
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcact----aac 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    |||    
T  36757925 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtcattttttgtatatagtgcttattttttggatcgatatagtataacactgattaac 36757826  T
Q  329 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  36757825 aatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttat 36757726  T
Q  429 ttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36757725 ttatatttatgttgatgt 36757708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 36767449 - 36767232
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcact----aac 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    |||    
T  36767449 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgtcattttttgtatatagtgcttattttttggatcgatatagtataacactgattaac 36767350  T
Q  329 aatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  36767349 aatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgcttttcttgggatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatgttat 36767250  T
Q  429 ttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36767249 ttatatttatgttgatgt 36767232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 147 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47720083 - 47719952
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47720083 agttagtagagttgtctttggatgagccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 47719984  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttc 278  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47719983 aaataacttaactcttgagtactgatgtgttc 47719952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 48153784 - 48153942
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48153784 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 48153883  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  48153884 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaccattatttatatttatgttgatgt 48153942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 21409629 - 21409787
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21409629 tataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatatttcttttggatatagtatagcacttatgttgctctttttggaatatattgtgta 21409728  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21409729 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttacatttatgttgatgt 21409787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 440
Target Start/End: Original strand, 36661100 - 36661405
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  36661100 aattgagttagaagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatgcaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 36661196  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  36661197 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatacagtgcttcttttttggatcgataaagtataacactaacaa-gttcctttt 36661292  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36661293 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttggtatatattacgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 36661392  T
Q  428 tttatatttatgt 440  Q
    |||||||||||||    
T  36661393 tttatatttatgt 36661405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 279 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 19820861 - 19820694
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 378  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||  |||    
T  19820861 ttttttggatatagtgcttctttttcgaatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtataatactgatggtgctctttttgagata 19820762  T
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19820761 tattgtgcatgtaattgactaatcatcactattttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 19820694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 279 - 446
Target Start/End: Original strand, 44269972 - 44270139
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 378  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||    
T  44269972 tttttttgatatggtgcttcttttttttatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacattaatggtgctctttttgggata 44270071  T
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44270072 tattgtttatgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 44270139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 315
Target Start/End: Original strand, 11058563 - 11058734
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  11058563 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatgaaggagagaagattgagacaattaatgtt 11058662  T
Q  242 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatata 315  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||    
T  11058663 aactaaaataacttaactcttgtgtactgatgtgttcttttttggatatagttctt--tttttggatcgatata 11058734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23970002 - 23969848
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23970002 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcacttatggtgctctttttgggataaattgtgta 23969903  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  23969902 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcacta----ttatatttatgttgatgt 23969848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 11830324 - 11830634
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  11830324 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttgaaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 11830420  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11830421 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgacgtgttcttttttggatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 11830516  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||             ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  11830517 ggatataatgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgaccaatgaccactatcttaattgtcaatatta 11830615  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  11830616 tttatatttatgttaatgt 11830634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 36413609 - 36413766
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  36413609 tatagtgcttctttttt-gatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtataacaccgatgatgctctttttaggatatattgtgta 36413707  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36413708 tgtaattgattaagcatcactcacttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 36413766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 16564097 - 16563926
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-----------caccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  16564097 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttgg 16563998  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16563997 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 16563926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 16601565 - 16601736
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-----------caccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  16601565 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagtattgatataacactgatggtgctctttttgg 16601664  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16601665 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 16601736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 242 - 446
Target Start/End: Original strand, 38064881 - 38065089
Alignment:
Q  242 aactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc----gatatagtgcttcctttttag-atcgatatagtatagcactaacaatgttct 336  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |     ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||     
T  38064881 aactaaaataacttaacttttgagtactaatgtgtttttttgtgtgtggatatagtgcttctttttttggatcgatataatataacactaacaatgttcc 38064980  T
Q  337 ttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatattt 436  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  38064981 ttttggatatagtatagcact-atggtgctctttttgggatatattgcgtatgtaattgactaatcatgactatcttaatcatcaatattgtttatattt 38065079  T
Q  437 atgttgatgt 446  Q
    ||||||||||    
T  38065080 atgttgatgt 38065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 554766 - 554608
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  554766 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtatcttttagatatagtatatcacttatgatgctctttttgggatatattgtgta 554667  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  554666 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgttaatattacttatatttatgttgatgt 554608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 264 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 47238116 - 47237922
Alignment:
Q  264 agtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagt------------at 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||            ||    
T  47238116 agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagcattaacaatgtcccttttggatgtagttagcattgatgtat 47238017  T
Q  352 agcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47238016 agcactggtggtgctctttttggtatattttgcgtatgtaattgactaatcatcactttcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 47237922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 446
Target Start/End: Original strand, 21180044 - 21180237
Alignment:
Q  235 taatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtt 334  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||      ||||||||||         
T  21180044 taatgataactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttattttttggatcgata------agcactaaca----- 21180132  T
Q  335 ctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatat 434  Q
           ||||||||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180133 -------gatatagtataacactgatgatgttctttttgggatatattgtatatctaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatat 21180225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1042924 - 1042751
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctcttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||             | |||||||||||||||    
T  1042924 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatataatatagcattgatgtataacactgatggtgctcttttt 1042825  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1042824 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgt 1042751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 26773437 - 26773264
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 372  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  26773437 gatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatatagtatagcattgatgtataacactaatggtgctcttttt 26773338  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26773337 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 26773264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27397599 - 27397298
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | | |||  |||    
T  27397599 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttgaaagctaatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaatg-tta--gtt 27397503  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  27397502 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtttt-ttttttggatataatgcttcttttttggatcgatatattatagcactaacaa-gttcctttt 27397408  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    | |||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27397407 gaatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 27397309  T
Q  428 tttatatttat 438  Q
    |||||||||||    
T  27397308 tttatatttat 27397298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 19510887 - 19511051
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg----gtgctctttttggtatatat 381  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||    ||||||||||| |||||| |    
T  19510887 gatatagtgcttctttcttggatcgatataatataacactagcaatgttccttttggatatagtataacattgatgtatggtgctcttttttgtatattt 19510986  T
Q  382 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19510987 tgagtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttttgttaatgt 19511051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 311 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44959168 - 44959041
Alignment:
Q  311 atatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactct 410  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44959168 atatagtatagcactagcaatgttccttttggatatagtacaacactcatagtgctctttttgagatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactct 44959069  T
Q  411 cttaatcgtcaatattatttatatttat 438  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44959068 cttaatcgtcaatattatttatgtttat 44959041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 301 - 446
Target Start/End: Original strand, 24956501 - 24956644
Alignment:
Q  301 ttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccg-atggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24956501 ttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttgga---agtatagcactttatggtgctctctttgggatatattatgtatgtaattgacta 24956597  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24956598 atcatcactctattaattgtcaatattatttatatttatgttgatgt 24956644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 40096293 - 40096590
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  40096293 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 40096389  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  40096390 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatttttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 40096485  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40096486 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 40096585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 349 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 47719948 - 47719856
Alignment:
Q  349 tatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 441  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47719948 tatatcaccgatggtgctctttttggtatatattatgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 47719856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 290 - 446
Target Start/End: Original strand, 4291937 - 4292103
Alignment:
Q  290 tagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttggtata 378  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||           | |||| ||||||||||||||||    
T  4291937 tagtgcttc-tttttggatcgatatagtataacattaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatataacactgatgatgctctttttggtata 4292035  T
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  4292036 ttttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgttaatagtatttatatttatgttaatgt 4292103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 8029071 - 8029244
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctcttttt 372  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||             | |||||||||||||||    
T  8029071 gatatagtacttcttttttgaatcgatatactatagcactaacaatgtttcttttagatatagtatagcattgatgtataacactgatggtgctcttttt 8029170  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8029171 ggtatattttgcgtatgtaagtgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 8029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 26973296 - 26973458
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggt----gctctttttggtatatattg 383  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||  |||||    |  ||||||  |||||||||    
T  26973296 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtacaacacttatggtataagtgcttttttttatatattg 26973395  T
Q  384 tgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
      ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26973396 gatatgtaattgagtaattgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 26973458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 331 - 446
Target Start/End: Original strand, 40053573 - 40053688
Alignment:
Q  331 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattt 430  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  40053573 tgttccttttggatatagtataacactgatggtgctctttttgaggtatattgcatatgtaattgactaatcatcactctcttagtcatcaatattattt 40053672  T
Q  431 atatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||    
T  40053673 atatttatgttgatgt 40053688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Original strand, 16851046 - 16851232
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||    
T  16851046 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaagtttctttt-ggatatagtgta 16851143  T
Q  353 gcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||  ||||             |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16851144 gcattgatgtataatactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattatctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 16851232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 446
Target Start/End: Original strand, 39521422 - 39521510
Alignment:
Q  358 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39521422 gatgatgctcttttttgtatatattgcgtatgtaattgattaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 39521510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Original strand, 35136297 - 35136424
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||   ||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  35136297 tatagcactaataatgttcattttgaatatattatagcattaatgatgctctttttgagatatattgtatatgtaattgactaatcatcattctcttaat 35136396  T
Q  417 cgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||    
T  35136397 tgccaatattacttatatttatgttgat 35136424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 358 - 446
Target Start/End: Original strand, 11058745 - 11058833
Alignment:
Q  358 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11058745 gatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgacaaatcatcattctcttaatcgtcaatattacttatatttatgttgatgt 11058833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 304
Target Start/End: Original strand, 40041584 - 40041655
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttccttttt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  40041584 attaatgttaactaaaataatttaactattgagtactgatgtgttcttttttagatataatgcttctttttt 40041655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Original strand, 48163671 - 48163849
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         
T  48163671 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 48163768  T
Q  348 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  48163769 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 48163849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27555221 - 27555043
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||         
T  27555221 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggatatagtgta 27555124  T
Q  348 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  27555123 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 27555043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 355
Target Start/End: Original strand, 27354184 - 27354284
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtata 352  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  27354184 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 27354281  T
Q  353 gca 355  Q
    |||    
T  27354282 gca 27354284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44960044 - 44959993
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44960044 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 44959993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Original strand, 25969513 - 25969566
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25969513 ttttataaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 25969566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9250414 - 9250367
Alignment:
Q  32 aaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9250414 aaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 9250367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Original strand, 48163523 - 48163562
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctg 65  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  48163523 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacatcctg 48163562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 21409596 - 21409630
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21409596 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 21409630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Original strand, 24956457 - 24956491
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24956457 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 24956491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 60
Target Start/End: Original strand, 42897106 - 42897140
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacg 60  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42897106 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatacg 42897140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 63
Target Start/End: Original strand, 11829808 - 11829841
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcc 63  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11829808 aaaaaataattatccgatactttccgatacgtcc 11829841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 27354036 - 27354069
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27354036 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 27354069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 27555369 - 27555336
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27555369 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 27555336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 40095765 - 40095798
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40095765 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 40095798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Original strand, 38263114 - 38263150
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38263114 ttttaaaaaataattatctgatactttccgatacgtc 38263150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 147 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30777405 - 30777106
Alignment:
Q  147 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777405 agttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagctggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaacta 30777306  T
Q  247 aaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatat 346  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30777305 aaataatttaactcttgagtaattatgtgttctttttttgatatagtgcttattttttagatcgatatagtataacactaacaatgttctttttgaatat 30777206  T
Q  347 agtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777205 agtatatcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 30777106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 140 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 6243045 - 6242726
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6243045 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagattttgaagctggtgtgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 6242946  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-----------atatagtgcttcctttttagatcgatata--gtatagcacta 326  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||             |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  6242945 ttaactaaaacaatttaactcttaaatactgatgtgttctttttttttttttttttttatatagtgcttcttttttagatcgatatatagtataacacta 6242846  T
Q  327 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6242845 acaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctttttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatatt 6242746  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  6242745 atttatattaatgttgatgt 6242726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 140 - 432
Target Start/End: Original strand, 11907407 - 11907699
Alignment:
Q  140 gtaattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatg 239  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907407 gtaattgagttactagagttttctttggatgaaccacatttgaaagctgatttgtatcttgatgacgggaatggaggagaggagattgagacgattaatg 11907506  T
Q  240 ttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| | |||    
T  11907507 ttaactaaaataacttaactcctgagtactgatgtattctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatattataacaccaacaatgtaccttt 11907606  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11907607 tggatatagtataacactgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 11907699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 26691825 - 26692039
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  26691825 attaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgttatttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatagagtataacactaacaat 26691924  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26691925 gttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 26692024  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  26692025 tatttatgttgatgt 26692039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 26961557 - 26961771
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  26961557 attaatgttaactaaaataacttaagttttgagtactgatgtgttatttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatagagtataacactaacaat 26961656  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26961657 gttccttttggatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 26961756  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  26961757 tatttatgttgatgt 26961771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 438
Target Start/End: Original strand, 27085558 - 27085762
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27085558 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaacaatg 27085657  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27085658 ttcattttgaatatagtatagcactcgtggtgctctttttgg-atatattgtgtatgtaattgactaattatcactttcttaatcatcaatattatttat 27085756  T
Q  433 atttat 438  Q
    | ||||    
T  27085757 aattat 27085762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 17138163 - 17137952
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17138163 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggattgatataatatagcactaacaatg 17138064  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17138063 ttccttttgcatataatatagcattgatggtgctc-ttttgggatatattgtgtatatatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 17137965  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    | ||||||||||||    
T  17137964 a-ttatgttgatgt 17137952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 26716515 - 26716673
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26716515 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcattttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgta 26716614  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26716615 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 26716673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 26986255 - 26986413
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26986255 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttcattttggatatagtataacacctatggtgctctttttgggatatattgtgta 26986354  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26986355 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 26986413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 442
Target Start/End: Original strand, 5722186 - 5722395
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  5722186 attaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtacttatgtgttcttttatggatatagtgcttcttttttgaatcgatataggataacactaacaatg 5722285  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5722286 tttattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaatcgactaatcatcattctcttaatcgtcagtataatttat 5722385  T
Q  433 atttatgttg 442  Q
    ||||||||||    
T  5722386 atttatgttg 5722395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 279 - 445
Target Start/End: Original strand, 3701319 - 3701484
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtata 378  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  3701319 ttttttggatacagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgctctttttgg-ata 3701417  T
Q  379 tattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatg 445  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3701418 tattgtgcatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattttttatatttatgttgatg 3701484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 30284514 - 30284296
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  30284514 attaatgttaactaaaataacttaactcctgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgctt--tttttggatcgatatagtataacactaacaatg 30284417  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt-------ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatat 425  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||        | ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30284416 ttcattttggatatagtatagcactaatggtgttttttttttttttgtggatatattgtgtttctaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatat 30284317  T
Q  426 tatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30284316 tatttatatttatgttgatgt 30284296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 21251738 - 21251884
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta 399  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21251738 tttttggatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatagtatagcactgatggtgttctttttgcgatatattgtgtatgtaattgacta 21251837  T
Q  400 atcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251838 atcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 21251884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 22738047 - 22738253
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738047 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagcactgatgtgttctttttg-gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 22738145  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgacta---atcaccactctcttaatcgtcaatattatt 429  Q
    ||| |||||||||||||||| ||          ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22738146 ttccttttggatatagtataaca---------ttctttttgggatatattgtgtatgtaactgactaaatatcatcactctcttaatcgttaatattatt 22738236  T
Q  430 tatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||    
T  22738237 tatatttatgttgatgt 22738253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Original strand, 27938401 - 27938557
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27938401 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtgtagcactaacagtgttccttttggatatagtatagcacgtatggtgctctttttgggatatattgtgta 27938500  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27938501 tgtaattgactaattatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgat 27938557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 25749848 - 25750006
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25749848 tatagtgcttcttttttggatcgatgtaatatagcactaacaatgttcattttggatatagtgtagcacttatggtgctctttttgagatatattgtgta 25749947  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25749948 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcactattatttatatttatgttgatgt 25750006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 18001875 - 18001675
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||         
T  18001875 attaatgttaactaaaataacttaattattgagtactgatgtgttcttttttgaatatagtgcttcttttttggatcgataaagtatagcactaa----- 18001781  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
           ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  18001780 -------tggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattggatatgtaattgattaatcatcactctcttacttgtcaatattatttat 18001688  T
Q  433 atttatgttgatg 445  Q
    |||||||||||||    
T  18001687 atttatgttgatg 18001675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 34032571 - 34032754
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||        
T  34032571 attaatgttaactaaaataatttaacttttgagtactaatgtgttctttttttaatatagtgcttattttttggatcgataaagtatagcactaac---- 34032666  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34032667 --------ggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgattaatcatcactctcttaatcgtcaatattat 34032754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 293 - 446
Target Start/End: Original strand, 7629293 - 7629446
Alignment:
Q  293 tgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaa 392  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7629293 tgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtatcttttggatatagtatagcactaatgatgctctttttgggatatattgtgtatgtca 7629392  T
Q  393 ttgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7629393 ttgactaatcatcactctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgt 7629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 278 - 431
Target Start/End: Original strand, 15066445 - 15066598
Alignment:
Q  278 cttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtat 377  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15066445 cttttttggatataatgcttcttttttggatcaatatagtataacactaacaatgttcctttcggatatagtatagcactgatggtgctctttttgggat 15066544  T
Q  378 atattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15066545 atattgtgtatgtaattgactaatcattactctcttaatcgtcaatattattta 15066598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 39690213 - 39689901
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||  | ||| |||  |||    
T  39690213 aattgagttagcagagttgtctttggatgaatcggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgagaatggatgagaggagatgtaaacg-tta--gtt 39690117  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39690116 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 39690021  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39690020 tggatatagtgtagcattgatgtatagctatgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 39689921  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  39689920 atttatatttatgttaatgt 39689901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 1795635 - 1795794
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt-ggtatatattgtgt 386  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||||||||| |    
T  1795635 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatggtgcttttttttgggatatattgtat 1795734  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795735 atgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 1795794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3934663 - 3934505
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  3934663 tataatgcttcttttttggatcgatataatataacactaacaatgtttcttttggatatagtataacacttatgatgatctttttgagatatattgtgta 3934564  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3934563 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgt 3934505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 1639271 - 1638963
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  1639271 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttgcaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 1639175  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1639174 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttaggatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactaacaa-gttcatttt 1639079  T
Q  341 ggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||             ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  1639078 ggatataatgtagcattgatgtatatcactgacggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactct--taatcgtcaatatta 1638982  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  1638981 tttatatttatgttaatgt 1638963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 287 - 446
Target Start/End: Original strand, 1921023 - 1921183
Alignment:
Q  287 atatagtgcttcctttttagatcgatatagtat-agcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtg 385  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  1921023 atatagtgcttcttttttggatcgatataatattaacactaacaatgatccttttggatatagtatatcactgatgatgctctttttgggatatattttg 1921122  T
Q  386 tatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
     |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1921123 catgtaatatactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 1921183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 9792932 - 9793226
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||  | |||  | | |||    
T  9792932 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgagaatggaggagaggagatgtaaacg--tca-gtt 9793028  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  9793029 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 9793124  T
Q  340 tggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||             | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9793125 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 9793224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 10657220 - 10657393
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 372  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  10657220 gatataatgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccgtttggatatagtatagcattgatgtataacactaatggtgctcttttt 10657319  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10657320 ggtatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgt 10657393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 41233515 - 41233717
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttag-atcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||| |     
T  41233515 attaatgttaactaaaataacttaactgttgagtactaatgtgttcttttttggatatagtccttctttttttggattgataaagtatagcactaacga- 41233613  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
               ||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41233614 -----------atataatatagcactcctgatgctctttttggtatatatcgtatatgtaattgactaatcatcacgctcttaatcgtcaatattattta 41233702  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  41233703 tatttatgttgatgt 41233717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 43357635 - 43357478
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgc-tctttttggtatatattgtgt 386  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  43357635 tatagtgcttcttttttgaatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagtacttatggtgcttttttttgggatatattatgt 43357536  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43357535 atgtaattgac--atcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 43357478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 14836574 - 14836733
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttt-ttggtatatattgtgt 386  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||  ||||||| |||    
T  14836574 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatatcactaacaaagtttcttttggatatagtataacacttatggtgctttttattgagatatattttgt 14836673  T
Q  387 atgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836674 atgtaattgactaatcgtcactctcttaaccgtcaatattatttatatttatgttgatgt 14836733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 39796791 - 39796664
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39796791 tatagaactaacaatgttccttttagatatagtataacattgatggtgctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 39796692  T
Q  417 cgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39796691 cgtcaatattacttatatttatgttgat 39796664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9729613 - 9729405
Alignment:
Q  161 tctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgttaactaaaataatttaactc 260  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9729613 tctttggatgaaccgtatttggaagttgatttgtatcttgatgaccggaatggaggagaggagattgagacaattaatattaactaaaataacttaactc 9729514  T
Q  261 -ttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccga 359  Q
     || |||||| ||||||| ||||||  |||||||  ||  |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    ||| ||    
T  9729513 tttaagtactaatgtgtt-ttttttttatatagt--tt--tttttttatcgatatagtatagcattaacaatgttccttttggatatactgcgacactga 9729419  T
Q  360 tggtgctctttttg 373  Q
    ||||||||||||||    
T  9729418 tggtgctctttttg 9729405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 307 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5985800 - 5985648
Alignment:
Q  307 atcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaat 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||             | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5985800 atcgatatagtatagcactagcaatgttccttttggataaagtatagcattgatgtataacactgatgatgctctttttggtatattttgcgtatgtaat 5985701  T
Q  394 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5985700 tgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 5985648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 42365970 - 42365819
Alignment:
Q  300 tttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag-----caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaatt 394  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||      |||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  42365970 tttttggatcgatatagtatataactaagaatcttccttttggatatagtataatattacactcatggtgctctttttgggatatattgtgcatctaatt 42365871  T
Q  395 gactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42365870 gactaatcatcactctgttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 42365819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 348 - 446
Target Start/End: Original strand, 30918994 - 30919092
Alignment:
Q  348 gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30918994 gtataacactgatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 30919092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5612351 - 5612244
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5612351 attaatgttaattaaaataacttaactctcgagtattgatgtgttctttttttggatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcactaacaat 5612252  T
Q  332 gttctttt 339  Q
    ||||||||    
T  5612251 gttctttt 5612244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 366 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 5612249 - 5612169
Alignment:
Q  366 tctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5612249 tcttttggggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattcatatttatgttgatgt 5612169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 358 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 26794260 - 26794172
Alignment:
Q  358 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26794260 gatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgagcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgt 26794172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26794475 - 26794392
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  26794475 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaagagat 26794392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 12852746 - 12852829
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 225  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12852746 aattgagttagcatagttgtctttggatgaactggatttggaagttgatttgtatcttgatgatggaaatggaggagaggagat 12852829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 322 - 444
Target Start/End: Original strand, 9654026 - 9654148
Alignment:
Q  322 cactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtca 421  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||| || | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| || |    
T  9654026 cactaacaatattccttatggatatattataacatcaatggtgctctttttgtgatatattgtgtatgcaattgactaatcatcattttcttaattgtta 9654125  T
Q  422 atattatttatatttatgttgat 444  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  9654126 atattacttatatttatgttgat 9654148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 376 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9728176 - 9728106
Alignment:
Q  376 atatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9728176 atatattgtgtacgtaattgactaatcatcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 9728106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 225
Target Start/End: Original strand, 33830397 - 33830480
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagat 225  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33830397 aattgagttagcagagctgtctttggatgaaccggatttgaaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagat 33830480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 396 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 35746162 - 35746112
Alignment:
Q  396 actaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35746162 actaatcatcactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttgatgt 35746112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 30777521 - 30777468
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggat 79  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30777521 ttttataaaataattatccgatactttccgatacgtcccggatacgcgaaggat 30777468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 446
Target Start/End: Original strand, 11694466 - 11694514
Alignment:
Q  398 taatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  11694466 taatcatcactctcttaatcgtgaatattatttatacttatgttgatgt 11694514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 344
Target Start/End: Original strand, 33830505 - 33830593
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggat 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  33830505 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattt-tttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttttggat 33830593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 6243163 - 6243109
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaaggatgctta 84  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6243163 aaaaaataattatccgatatttttcgatacgtcccggatacgcgaaggatactta 6243109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 75
Target Start/End: Original strand, 11907283 - 11907328
Alignment:
Q  30 aaaaaataattattcgatactttccgatacgtcctggatacgcgaa 75  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11907283 aaaaaataattatccgatacttttcgatacgtcccggatacgcgaa 11907328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 12852854 - 12852930
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 330  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12852854 ttaactctt-agtacttatgtgttttttttttggatataatgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa 12852930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32707383 - 32707323
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 202  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  32707383 aattgagttagcatagttgtctttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 32707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 284
Target Start/End: Original strand, 11694412 - 11694461
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttctttttt 284  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11694412 attaatgttaa-taaaataacttaactctt-agtactgatgtgttctttttt 11694461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3934696 - 3934662
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3934696 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagta 3934662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 39690763 - 39690730
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39690763 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 39690730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 32624995 - 32625027
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgata 58  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32624995 ttttaaaaaataattatccgatactttccgata 32625027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 32707831 - 32707795
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatacgtc 62  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32707831 ttttaaaaaataattatctgatactttccgatacgtc 32707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Original strand, 24851679 - 24851892
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24851679 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtaatgatgtgttctttttttgatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatg 24851778  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24851779 ttcgttttggatatagtatagcacaaatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 24851878  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  24851879 atttatgttgatgt 24851892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Original strand, 36551593 - 36551807
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36551593 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtagtgatgtgttcttttttgaatatagtgtttcttttttagatcgatatagtataacactaacaatg 36551692  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551693 ttccttttggatataatataacactgat-atgctctttttgggatatattgtgtatgtaattggctaacaatcactctcttaatcgtcaatattatttat 36551791  T
Q  433 atttatgttgatgtcc 448  Q
    ||||||||||||||||    
T  36551792 atttatgttgatgtcc 36551807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 233 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 24590033 - 24589820
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtg-ttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24590033 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgcttcttttttgaatatagtgtttcttttttggatcgatatagtataacactaacaat 24589934  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattattta 431  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |  ||||  |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24589933 gttctttttgaatataatatataattgatgaagctctttttaagatatattgtgta-gtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattattta 24589835  T
Q  432 tatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||    
T  24589834 tatttatgttgatgt 24589820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 414
Target Start/End: Original strand, 47654873 - 47655054
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47654873 attaatgttgactaaaaaaacttaactcttgagtactgatgtgttcttttacggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatg 47654972  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctctta 414  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  47654973 ttcattttggatataatatagcactgatgatgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcatcattctctta 47655054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 32380989 - 32380776
Alignment:
Q  234 ttaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||| | ||||| |||||| |||||  ||  |||||||||| |||||||||||    
T  32380989 ttaatgttaactaaaataacttaactctagagcactgatgttttttttttttggatataatgcttcttttttgaataaatatagtataacactaacaatg 32380890  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttat 432  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32380889 ttccttttgaatatagtataacactaatggtgctctttttgggatatattatgtatgtaatcgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttat 32380790  T
Q  433 atttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||    
T  32380789 atttatgttgatgt 32380776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 243 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 3708185 - 3707994
Alignment:
Q  243 actaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttgg 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||            ||    
T  3708185 actaaaataacttaactcttgagtaccgatgtgttcttttttagatataatgcttcttttttggatcgataaagtatagcactaac------------gg 3708098  T
Q  343 atatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttg 442  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708097 atatagtatagcactggtggtcctctttttgggatatattgtgtatgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttg 3707998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9528720 - 9528562
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  9528720 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacgatgtttcttttggatatagtatagcacttatgatgtcctttttgggatatattgtgta 9528621  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9528620 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 9528562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34432291 - 34432133
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  34432291 tatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaatgtttctttgggatatagtatagtacttatggtgttctttttgagatatattgtgta 34432192  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34432191 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 34432133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 10822636 - 10822794
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  10822636 tataatgcttcttttttggatcgatataatatatcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttacggtgctctttttgggatatattgtgta 10822735  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10822736 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttcatgt 10822794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 25257242 - 25257549
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||  | ||| |||  |||    
T  25257242 aattgagttagaagagttgtctttggatgaaccggatttggaagctgatttgtatcttgatgatgggaatggaagagag-agatgtaaacg-tta--gtt 25257337  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25257338 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttcctttt 25257433  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25257434 ggatatagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaattgactaa--accactctcttaatcgtcaatatta 25257530  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  25257531 tttatatttatgttaatgt 25257549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28948691 - 28948379
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||  | ||| |||  |||    
T  28948691 aattgagttagcagagttgtctttggatgaatcggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgagaatggatgagaggagatgtaaacg-tta--gtt 28948595  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  28948594 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttccttt 28948499  T
Q  340 tggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||||||| |||||  ||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28948498 tggatatagtgtagcattgatgtatagctatgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 28948399  T
Q  427 atttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  28948398 atttatatttatgttaatgt 28948379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 292 - 446
Target Start/End: Original strand, 14167315 - 14167469
Alignment:
Q  292 gtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgta 391  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14167315 gtgcttctttcttggatcgatatagtataacactaacaatgtatcttttggatatagtatagctcttatggtgctctttttgggatatattgtgtatgta 14167414  T
Q  392 attgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14167415 attgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 14167469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 5984811 - 5985121
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  5984811 aattgagttagcagagttgtctttggatgaactgaatttggaagctgatttgtatcttaatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 5984907  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  5984908 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactgacaa-gttcctttt 5985003  T
Q  341 ggatatagtatagca-------------ccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    ||||||||| |||||             | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5985004 ggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctctttttg-tatatattgcgtatgtaatttactaatgaccactctcttaatcgtcaatatta 5985102  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5985103 tttatatttatgttaatgt 5985121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 29168189 - 29168347
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  29168189 tataatgcttcttttttggatcaatatagtatagtactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatgatgctcttttttggatatattgtgta 29168288  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29168289 tgtaattgactaatcatcactctcttaatcgtcgatattatttatatttatgttgatgt 29168347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 28658768 - 28658573
Alignment:
Q  264 agtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagt------------at 351  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||            ||    
T  28658768 agtactgatgtgttctttttttgatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcatgatgtat 28658670  T
Q  352 agcaccgat--ggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| |||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28658669 agcactgatatggtgttctttttggtatatattgcatatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 28658573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13012732 - 13012568
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg----gtgctctttttggtatatat 381  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||    |||||||||||||||||| |    
T  13012732 gatatagtgcttcttttttggatcgatataatatagcactagcaatgttccttttagatatagtataacattgatgtatggtgctctttttggtatattt 13012633  T
Q  382 tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13012632 tgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaattgtcaatattatttatatttatgttaatgt 13012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 303 - 446
Target Start/End: Original strand, 37922471 - 37922614
Alignment:
Q  303 ttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatc 402  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     
T  37922471 ttagatagatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatggtgctctttttgggatatattgtgtatgtaattgattgatt 37922570  T
Q  403 accactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37922571 ataactctcttaatcgccaatattatttatatttatgttgatgt 37922614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 291 - 446
Target Start/End: Original strand, 9781887 - 9782044
Alignment:
Q  291 agtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt--ggtatatattgtgtat 388  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  || ||||||||||||     
T  9781887 agtgcttcttttttggatcgatacagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcacttatggtgctttttttttgggatatattgtgtac 9781986  T
Q  389 gtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9781987 gtaattgactaatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 9782044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 3427474 - 3427792
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  3427474 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 3427570  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttc-------gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgt 333  Q
    |  |    || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  3427571 acttgt--tagtgttaactctt-agtagtgatgtgttctttttttttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gt 3427666  T
Q  334 tctttttggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtc 420  Q
    || ||||  |||||||             ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  3427667 tcattttatatatagtgtagcattgatgtatagcacagatggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactcttttaatcgtc 3427766  T
Q  421 aatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3427767 aatattatttatatttatgttaatgt 3427792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31653158 - 31652987
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgat-----------ggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||           ||||||||||||||    
T  31653158 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcattaacaattttccttttggatatagtatagcattgatataacacttatggtgctctttttgg 31653059  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31653058 tatattttgcgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 31652987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 14334533 - 14334704
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||    
T  14334533 gatatggtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttggatatagtatagcattgatataacactgatggtgctctttttgg 14334632  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14334633 tatattttacgtatgtaattgactaatcaacactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 14334704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 446
Target Start/End: Original strand, 30324344 - 30324654
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  30324344 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaaggtgatttgtatctcgatgatgagaatggaggagaggagatataaacg-tta--gtt 30324440  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  30324441 acttgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-attcctttt 30324536  T
Q  341 ggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatta 427  Q
    |||||||||             ||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  30324537 ggatatagtgtagcattgatgcataacactgatagtgatcttttt-gtatatattgcgtacgtaattgactaatgaccactctcttattcgccaatatta 30324635  T
Q  428 tttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  30324636 tttatatttatgttaatgt 30324654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Original strand, 43190019 - 43190192
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatg-------------gtgctcttttt 372  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||             |||||||||||    
T  43190019 gatatagtgcttcttttttggatcgatatagtatagcactaacaatgttccttttggatatagtatagcattgatgtataacactgctcgtgctcttttt 43190118  T
Q  373 ggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
     |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43190119 tgtatattttgcgtatgtatttgactaatcatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 43190192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 6916346 - 6916049
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  6916346 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 6916250  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  6916249 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 6916154  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6916153 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 6916054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 34096429 - 34096270
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcac---cgatggtgctctttttggtatatattgt 384  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||   ||||| |  | ||||||| | |||||||    
T  34096429 tatagtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaacaatgtttcttttagatatagtatagcacttacgatgtt--tttttttgggacatattgt 34096332  T
Q  385 gtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34096331 gtatgtaattgattgatcgtcactctcttaatcatcaatattatttatatttatgttgatgt 34096270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 38331073 - 38331370
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  38331073 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 38331169  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  38331170 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 38331265  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    ||||||||             ||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38331266 tggatatagtgtagcattgatgtataacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 38331365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Original strand, 29862039 - 29862200
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctcttttt---ggtatatattgt 384  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||  || ||| | |||||   || |||||||||    
T  29862039 tatagtgcttcttttttggattgataaagtataccactaacaatgtttcttttggatatagtatatcacttatagtgtttttttttttgggatatattgt 29862138  T
Q  385 gtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29862139 gtatgtaattgactaatcgtcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 29862200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 317 - 444
Target Start/End: Original strand, 32797462 - 32797589
Alignment:
Q  317 tatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaat 416  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32797462 tataacactaataatgttcattttggatatagtatatcattgatggtgctctttttgggatatattatatatgtaattgactaatcatcactctcttaat 32797561  T
Q  417 cgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32797562 cgtcaatattacttatatttatgttgat 32797589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 52895185 - 52894888
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| | |  |||    
T  52895185 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tca--gtt 52895089  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttc-ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  52895088 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgatttttttttggatcgatatagtatatcactaacaa-gttcattt 52894993  T
Q  340 tggatatagtatag-------------caccgatggtgctct---ttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaat 423  Q
    |||||||||| |||             ||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52894992 tggatatagtgtagcattgatgtattacactgatggtgctcttaattttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaat 52894893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 428
Target Start/End: Original strand, 8132806 - 8133100
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | || || |  |||    
T  8132806 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatctgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaac-atca--gtt 8132902  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||    
T  8132903 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttctttttttgaatatagtgattcttttttggatcgatatagaatatcactaacaa-gttcattt 8132998  T
Q  340 tggatata-------------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    ||||||||             ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8132999 tggatatagtgtagcattgatgtataacagtgatggtgctctttttggtatatattgcatatgtaattggctaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 8133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 286 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37346698 - 37346528
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttct-ttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttg 373  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||           || |||||||||||||||    
T  37346698 gatatagtgcttctttttttgattgatatagtatagcattaacaatgttccctttttgatatagtatagcattgatataacaccaatggtgctctttttg 37346599  T
Q  374 gtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37346598 gtattt--tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttaatgt 37346528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 233 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 2472832 - 2472682
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||       
T  2472832 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtacgaatgtgttattttttggatatagtgcttctttttctgatcgataaagtatagcactaaca--- 2472736  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattg 395  Q
              |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2472735 ---------tatatagtatagcactgatggtgctctttttaggatatattgtgtatgtaattg 2472682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Original strand, 37104382 - 37104568
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||         
T  37104382 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gtttcttttggatatagtgta 37104479  T
Q  348 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
            ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37104480 gcattgatgtataacactgttggtgctatttttggtatatattgcgtatgtaattacctaatgaccactctcttaatcgtcaatattat 37104568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 361
Target Start/End: Original strand, 38218592 - 38218718
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatg 332  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  38218592 attaatattagctaaaataacttaactcttgagtattgatgtgttctttttttaatatagtgttt--tttttagatcgatataatataacactaacaatg 38218689  T
Q  333 ttctttttggatatagtatagcaccgatg 361  Q
    ||  ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  38218690 ttacttttggatataatataacactgatg 38218718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41675899 - 41675743
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgct-tcctttttagatcgatatagtatagcactaacaat 331  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | | || | | ||||||||||||||| || |||||||    
T  41675899 attaatgttaattaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttgaatataatgttatactatat-gatcgatatagtataacattaacaat 41675801  T
Q  332 gttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatg 389  Q
    |||  |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  41675800 gttgcttttagatatagtataacattgatgatgctctttttgaaatatattgtgtatg 41675743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 400
Target Start/End: Original strand, 10763899 - 10764009
Alignment:
Q  292 gtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgc--tctttttggtatatattgtgtatg 389  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||  |||||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  10763899 gtgcttcttttttagatcgatatagtatagcactaaaaatgtttcttttggatatagaatatcacttatggtgctttttttttggaatatattgtgtatg 10763998  T
Q  390 taattgactaa 400  Q
    |||||||||||    
T  10763999 taattgactaa 10764009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36367554 - 36367376
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata----- 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||         
T  36367554 ttaactctt-agtactgatgtgttctttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgta 36367457  T
Q  348 --------gtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
            ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  36367456 gcattgatgtataacactgctggtgctctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 36367376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 384
Target Start/End: Original strand, 33039819 - 33039960
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtg-cttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaa 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||||  ||||||| |||||||||||||       
T  33039819 attaatgttaactaaaataacttaactcttgagtactgatgtgttcttttttggaatatagtgtttttttttttttatcgataaagtatagcactaa--- 33039915  T
Q  331 tgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgt 384  Q
             ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33039916 ---------tggatatagtagagcactgatggtgctctttttgggatatattgt 33039960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 322 - 402
Target Start/End: Original strand, 15417692 - 15417772
Alignment:
Q  322 cactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatc 402  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15417692 cactaacaatgttcctttttgatatagtataacattgatggtcctctttttgggatatattgtatatgtaattgactaatc 15417772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 377 - 444
Target Start/End: Original strand, 33040711 - 33040777
Alignment:
Q  377 tatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33040711 tatattgtgtatgta-ttgaataataatcactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 33040777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 279 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36363405 - 36363252
Alignment:
Q  279 ttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatata-------------gtatagcaccgatggtgc 365  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||             ||||| ||| | ||||||    
T  36363405 ttttttggatatagtgattcttttttggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttttggatatagtgtagcattgatgtataacactgctggtgc 36363307  T
Q  366 tctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattat 428  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  36363306 tctttttggtatatattgcgtatgtaatt--------accactctcttaatcgtcaatattat 36363252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 444
Target Start/End: Original strand, 15417928 - 15417967
Alignment:
Q  405 cactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15417928 cactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgat 15417967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 446
Target Start/End: Original strand, 38218733 - 38218764
Alignment:
Q  415 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38218733 atcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 38218764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 6916874 - 6916841
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6916874 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 6916841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 28949241 - 28949208
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28949241 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 28949208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 36367702 - 36367669
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36367702 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 36367669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 38218501 - 38218534
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38218501 ttttaaaaaataattattcgatacttcccgatac 38218534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 38330545 - 38330578
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38330545 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 38330578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Original strand, 38948850 - 38948883
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38948850 ttttaaaaaataattatacgatactttccgatac 38948883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 446
Target Start/End: Original strand, 47656062 - 47656099
Alignment:
Q  409 ctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  47656062 ctcttaatcgtcagtataatttatatttatgttgatgt 47656099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 52895713 - 52895680
Alignment:
Q  26 ttttaaaaaataattattcgatactttccgatac 59  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52895713 ttttaaaaaataattatccgatactttccgatac 52895680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 1036892 - 1036951
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  1036892 aattgagttagcagagttgt-tttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 1036951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Original strand, 1043798 - 1043857
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  1043798 aattgagttagcagagttgt-tttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 1043857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 142 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 44088 - 43784
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  44088 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccggatttggaagttgatttgtatcttgatgatgggaatgaaggagaggagatataaacg-tta--gtt 43992  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcg-atatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttt 339  Q
    |  |    || | ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  43991 acttgt--tagtgttaactctt-agtattgatgtgttctttttttggatatagtgattctttttcggatcgatatagtatagcactaacaa-gttccttt 43896  T
Q  340 tggatatagt-------------atagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatatt 426  Q
    |||||| |||             ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43895 tggatacagtgtagcattgatgtatagcactgatggtgctctttttgatatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgtcaatatt 43796  T
Q  427 atttatatttat 438  Q
    ||||||||||||    
T  43795 atttatatttat 43784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 202630 - 202479
Alignment:
Q  288 tatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagcaccgatggtgctctttttggtatatattgtgta 387  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||| ||   ||| || ||||||||| ||||| ||| ||    
T  202630 tataatgcttcttttttagatcaatataatatagcactaacaatatttcttttggatataacataacatttatgatgttctttttgggatatactgtata 202531  T
Q  388 tgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202530 tgtaattgactaatca-------tttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 202479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 202663 - 202629
Alignment:
Q  233 attaatgttaactaaaataatttaactcttgagta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  202663 attaatgttaactaaaataatttaactctcgagta 202629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 446
Target Start/End: Original strand, 13608 - 13799
Alignment:
Q  254 ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatag 353  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||     
T  13608 ttaactctggagtaccgatgtgttcttttatggatatagtgcttc-tttttggatcaatatagtataacagtaacaatgtacattttagatatagtataa 13706  T
Q  354 caccgatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||  || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||    
T  13707 cactaattgtgctctttttgatatatattgtgtatgtcattgactaatcatcactctcttaatcgtcataattatttatattaatgtttatgt 13799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 286 - 441
Target Start/End: Original strand, 5906 - 6070
Alignment:
Q  286 gatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttctttttggatatagtatagca-----------ccgatggtgctctttttgg 374  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||           |||||||||||||||||||    
T  5906 gatatagtgcttctttttttgattgatatagtataacattaacaatgttcctttttgatatagtatagcattgatataacaccgatggtgctctttttgg 6005  T
Q  375 tatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 441  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6006 tattt--tgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgtt 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 41566 - 41276
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  41566 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccgaatttgcaagctgatttgtatcttgctgatggaaatgaaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 41470  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagcactaacaatgttcttttt 340  Q
    | ||    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  41469 acctgt--tagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatagtgcttcttttttggatcgatatagtataacactaacaa-gttcctttt 41374  T
Q  341 ggatatagtatagcaccgatg-gtgctctttttggt-atatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttat 438  Q
    ||||||| | |||  ||||||  |    ||  |||| || | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41373 ggatataatgtag--ccgatgtatagcattgatggtgatct-ttttgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttat 41277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 358 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 29903 - 29815
Alignment:
Q  358 gatggtgctctttttggtatatattgtgtatgtaattgactaatcaccactctcttaatcgtcaatattatttatatttatgttgatgt 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29903 gatgatgctctttttggtatatattgcgtatgtaattgactaatgaccactctcttaatcgttaatattatttatatttatgttaatgt 29815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27092
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgttgatggaaatggaggagaggagattgagacgattaatgtt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||| |||  |||    
T  27268 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagatttgaaagataatttgtatcttgatgatgggaatggaggagaggagatgtaaacg-tta--gtt 27172  T
Q  242 aactaaaataat-ttaactcttgagtactgatgtgttcttttttcgatatagtgcttcctttttagatcgatatagtatagca 323  Q
    |  |    || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27171 actt--gttagtgttaactctt-agtactgatgtgttcttttttggatatggtgcttcttttttggatcgatatagtatagca 27092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25101 - 25041
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  25101 aattgagttagcagagttgtctttggatgaaccagattaggaagctgatttgtatcttgtt 25041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7639 - 7579
Alignment:
Q  142 aattgagttagtagagttgtctttggatgaaccagatttggaagttggtttgtatcttgtt 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  7639 aattgagttagcagagttgtctttgaatgaaccggattaggaagctgatttgtatcttgtt 7579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University