View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12160_high_7 (Length: 384)

Name: NF12160_high_7
Description: NF12160
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12160_high_7
NF12160_high_7
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (96-367)||(25611359-25611630)
chr7 (98-367)||(3962292-3962561)
chr7 (96-367)||(23362161-23362432)
chr7 (96-345)||(14160358-14160607)
chr7 (104-367)||(30466540-30466805)
chr7 (96-367)||(9360614-9360885)
chr7 (96-367)||(4595026-4595297)
chr7 (96-367)||(40187230-40187502)
chr7 (96-367)||(42851837-42852111)
chr7 (96-281)||(8150851-8151036)
chr7 (131-296)||(28423910-28424075)
chr7 (150-367)||(24267772-24267989)
chr7 (98-287)||(9026516-9026702)
chr7 (96-248)||(5866208-5866360)
chr7 (96-214)||(6596171-6596289)
chr7 (98-365)||(35827441-35827708)
chr7 (96-269)||(2405142-2405314)
chr7 (96-275)||(21946920-21947086)
chr7 (174-271)||(33336091-33336188)
chr7 (108-174)||(12152749-12152816)
chr7 (299-367)||(5866104-5866172)
chr7 (296-345)||(21947085-21947134)
chr7 (201-257)||(12152671-12152727)
chr7 (104-152)||(21223042-21223090)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (96-367)||(186998-187269)
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (96-367)||(9609498-9609769)
chr5 (96-367)||(30796794-30797065)
chr5 (96-367)||(29242104-29242375)
chr5 (104-365)||(1721845-1722106)
chr5 (96-241)||(39860924-39861069)
chr5 (96-216)||(36978727-36978850)
chr5 (216-364)||(27452586-27452733)
chr5 (96-177)||(4052904-4052985)
chr5 (193-271)||(4052831-4052909)
chr5 (96-153)||(16007128-16007185)
chr5 (134-187)||(27452529-27452582)
chr5 (1-53)||(16040976-16041028)
chr5 (47-85)||(16040917-16040955)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (96-367)||(25663377-25663648)
chr8 (96-367)||(32577909-32578194)
chr8 (96-364)||(5839640-5839908)
chr8 (98-261)||(11503067-11503230)
chr8 (108-367)||(36531008-36531267)
chr8 (98-248)||(32282841-32282991)
chr8 (101-248)||(10342353-10342504)
chr8 (96-296)||(14219792-14219992)
chr8 (98-233)||(40395245-40395378)
chr8 (103-152)||(31037703-31037752)
chr8 (104-152)||(26006781-26006829)
chr8 (298-345)||(32283002-32283049)
chr8 (104-148)||(43234222-43234266)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (96-367)||(26429188-26429459)
chr4 (96-367)||(35853031-35853302)
chr4 (96-367)||(2536975-2537246)
chr4 (98-367)||(33846180-33846449)
chr4 (96-367)||(17423818-17424089)
chr4 (96-365)||(26006081-26006350)
chr4 (96-367)||(48446518-48446789)
chr4 (99-367)||(9034770-9035025)
chr4 (96-367)||(52759123-52759394)
chr4 (96-367)||(12274052-12274323)
chr4 (104-367)||(54552478-54552740)
chr4 (96-353)||(25058300-25058557)
chr4 (96-367)||(8169321-8169591)
chr4 (98-367)||(22359239-22359507)
chr4 (99-335)||(19396165-19396401)
chr4 (96-367)||(791817-792066)
chr4 (104-265)||(6839751-6839912)
chr4 (131-229)||(23860023-23860121)
chr4 (137-265)||(652872-653000)
chr4 (325-367)||(23860120-23860162)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (96-367)||(32957310-32957581)
chr6 (96-366)||(7435612-7435882)
chr6 (96-367)||(7597432-7597703)
chr6 (96-253)||(7608464-7608621)
chr6 (104-243)||(6192539-6192678)
chr6 (96-367)||(12523483-12523733)
chr6 (96-361)||(13405996-13406261)
chr6 (98-335)||(31797974-31798211)
chr6 (104-213)||(34183125-34183234)
chr6 (103-178)||(29025239-29025314)
chr6 (274-367)||(7607760-7607853)
chr6 (267-331)||(6192479-6192543)
chr6 (202-281)||(32814052-32814131)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (96-367)||(6585-6856)
[»] scaffold0577 (1 HSPs)
scaffold0577 (96-367)||(2195-2466)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (104-367)||(55218650-55218913)
chr3 (120-367)||(39133532-39133777)
chr3 (96-367)||(51191868-51192139)
chr3 (104-367)||(51951808-51952071)
chr3 (96-367)||(8457769-8458040)
chr3 (96-367)||(43018351-43018622)
chr3 (96-367)||(13443990-13444262)
chr3 (105-367)||(21689611-21689871)
chr3 (96-287)||(39383404-39383595)
chr3 (96-365)||(26400050-26400319)
chr3 (108-218)||(7622657-7622766)
chr3 (292-367)||(39371369-39371444)
chr3 (96-180)||(19396816-19396900)
chr3 (207-359)||(23487937-23488089)
chr3 (203-265)||(42515701-42515763)
chr3 (96-129)||(39135493-39135526)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (99-367)||(5163-5431)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (96-367)||(23769771-23770042)
chr2 (96-367)||(24477472-24477743)
chr2 (96-367)||(45085981-45086252)
chr2 (109-367)||(10213690-10213948)
chr2 (96-317)||(22605840-22606061)
chr2 (96-367)||(38451689-38451959)
chr2 (96-367)||(23407745-23408016)
chr2 (96-209)||(11616661-11616774)
chr2 (135-353)||(40074065-40074280)
chr2 (99-358)||(27177605-27177864)
chr2 (97-218)||(31411362-31411483)
chr2 (96-365)||(1604730-1604998)
chr2 (96-160)||(20214282-20214346)
chr2 (96-223)||(32025536-32025662)
chr2 (108-192)||(28317799-28317883)
chr2 (128-161)||(2599233-2599266)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (96-367)||(26934-27205)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (96-367)||(58271-58543)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (126-367)||(216334-216575)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (96-241)||(48522162-48522307)
chr1 (96-367)||(25070822-25071072)
chr1 (96-365)||(19956407-19956676)
chr1 (112-350)||(11079830-11080068)
chr1 (96-232)||(26347349-26347485)
chr1 (239-367)||(48518933-48519061)
chr1 (112-246)||(31592302-31592436)
chr1 (155-287)||(25698542-25698674)
chr1 (107-165)||(15393510-15393568)
chr1 (209-254)||(15327478-15327523)
chr1 (112-181)||(20621463-20621532)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (104-187)||(5316-5399)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (96-174)||(20695-20773)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (232-345)||(148059-148172)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 25611359 - 25611630
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611359 acaaaaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 25611458  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611459 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacattcattaataactg 25611558  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611559 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 25611630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Original strand, 3962292 - 3962561
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3962292 aagaagaagcttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatacgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 3962391  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcg 297  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3962392 aaagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacatctacaatcattaataactgcg 3962491  T
Q  298 ctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3962492 ctaaaattagagacgccactattactaccataaagactgtctaccacaattttggagtcgagctcaaagt 3962561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23362432 - 23362161
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362432 acaagaagaaatttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 23362333  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23362332 gcaaagctatgagcgactttgttggcttgtctccgaatgaaccttacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactg 23362233  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23362232 cgctaaaattagagacaccacttttcctaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaatctcaaagt 23362161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 96 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14160607 - 14160358
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14160607 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagaaggaatcctaatatgaatacgcaaactagcatgacgcaaagccactcta 14160508  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  14160507 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataattg 14160408  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccaca 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14160407 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccaca 14160358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 30466805 - 30466540
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaa--taatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  30466805 aaacttattgcatttcattcaaaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcataacgcaaagccactctagcaaaa 30466706  T
Q  202 ctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30466705 ctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacttcagaggttactatatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactgcgctaa 30466606  T
Q  302 aattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30466605 aattagagacgccacttttactatcataaagactgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagt 30466540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9360885 - 9360614
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9360885 acaagaagaaacttattgtatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaactactcta 9360786  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  9360785 gcaaaactatgatcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaaacagaagctaacaggcgtctacagtcattgattactg 9360686  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  9360685 cgctaaaattagaaacgccacttttactgccataaagactatctatcacatttttggaatcaagctcaaagt 9360614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 4595026 - 4595297
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  4595026 acaagaataaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacagaaaaccactcta 4595125  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||    
T  4595126 gcaaaactatgagcgacttcgttggtttgtctccgaacaaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacagtcattgattattg 4595225  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||| ||||||||||||||||   | || ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  4595226 cgcttaaattagagacgccacattttctgccataaagactatataccacaattttggaatcaagcttaaagt 4595297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40187502 - 40187230
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40187502 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcaagacgcaaaaccactcta 40187403  T
Q  196 gcaaag-ctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataact 294  Q
     ||||  ||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||    
T  40187402 acaaaaactatgagtgttttcgttggcttgtctccaaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaagttaacaagcgtctacagtcattgattact 40187303  T
Q  295 gcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40187302 gcgctaaaattagagacgccacttttattgccataaagactatctaccacaattttggaatcaagctcaaagt 40187230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 42852111 - 42851837
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagta---gagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccact 192  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  42852111 acaagaagaaacttattccatttcattcataataataataatagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaactaacatgacgcaaagccacg 42852012  T
Q  193 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataa 292  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||| || |    
T  42852011 ttagcaaaactatgagcgacttcgttggattgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaagtcagaagctaacacgcgtctacagtcattgatta 42851912  T
Q  293 ctgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  42851911 ctgcactaaaattagatacgccacttttaataccataaagactatctaccacggttttggaatcaagctcaaagt 42851837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 96 - 281
Target Start/End: Original strand, 8150851 - 8151036
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  8150851 acaagaagaaacttattacatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatttggaaactagtatgacgcaaagtcacgcta 8150950  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctaca 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  8150951 gcaaaactatgagcgacttcgtttgcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctaca 8151036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 131 - 296
Target Start/End: Original strand, 28423910 - 28424075
Alignment:
Q  131 tagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccg 230  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28423910 tagttgagatacaagatggaattctgatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagccactctagcgaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccg 28424009  T
Q  231 aatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgc 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28424010 aatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagaagtctacaatcattaataactgc 28424075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 367
Target Start/End: Original strand, 24267772 - 24267989
Alignment:
Q  150 aatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagag 249  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  24267772 aatcctaacataaatatggaaactaacatgacgcaaagtcatcctagcaaaactatgagcgacttcattgacttgtctctgaataaacctaacattagag 24267871  T
Q  250 gttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttt 349  Q
    |||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||| |||    
T  24267872 gttactaaatcagaaactaacaagcgtctacaatcattaattactgcgctaaaattagagacgccacttttaccaccataaagactatccaccacaattt 24267971  T
Q  350 tggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  24267972 tggaatcaagcacaaagt 24267989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9026702 - 9026516
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9026702 aagaagaaacttatttcatttcattcataataatag---agatacaagatggaatcttaatatgaatatggaaattagcatgacgcaaatccactctagc 9026606  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcatt 287  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||    
T  9026605 aaaactatgagcgacttcgttgacttgtctctgaataaacctaacatcataagttactaaatcagaagctaaccggcgtctacaatcatt 9026516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5866360 - 5866208
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||    
T  5866360 acaagaagaaatttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaattaacatgacacgaagccactcta 5866261  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcaga 248  Q
    | |||||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5866260 ggaaagctatgagcaattttgtttgcttgtctccgaataaacctaacatcaga 5866208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6596289 - 6596171
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6596289 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagatatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaaccactcta 6596190  T
Q  196 gcaaagctatgagcgactt 214  Q
     |||| ||||||| |||||    
T  6596189 acaaaactatgagtgactt 6596171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 35827708 - 35827441
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||| | ||||  |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||   || ||| ||||||    
T  35827708 aagaagaaatttattgcattttatttataatataaagagagatacaagatgaaatcttaatatgaatatggaaattagcatgacatgaatccattctagc 35827609  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcg 297  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||  || |||| ||  |||||  ||| || | ||||| || |||||     
T  35827608 aaagctatgagcaactttgtaggcttgtctcagaataaacctaacataagagattgttagatcataaactaacatgcgtttataatcattgatcactgca 35827509  T
Q  298 ctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaa 365  Q
    ||| ||||||| || |||||  | |||| ||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  35827508 ctataattagaaacaccacttttgctactatagagactatccaccacaattttggaatcaagctcaaa 35827441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 2405314 - 2405142
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| || |||||||| |    
T  2405314 acaagaaaaaacttattgtatttcatttataataatatgagagatataagatggaatcttaatataaatacgaaaactagcatgacacagagccactcga 2405215  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaa 269  Q
    || || | || |  |||||||||| | ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2405214 gcgaaacaataaatgacttcgttgacatgtctcctaataaccctaacatca-aggttactaaatcagaagttaa 2405142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Original strand, 21946920 - 21947086
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |       |||| ||||| |||||| ||  |||    
T  21946920 acaagaagaaacttattccatttcatttataataatagtagatatacaagatgagatcttaatatgga-------actaacatgatgcaaagtcatccta 21947012  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacg 275  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||      | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21947013 gcaaaactatgagcgactttgttggcttgtctccgaataaac------ttagaggttactaaatcagaagctaacagacg 21947086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Original strand, 33336091 - 33336188
Alignment:
Q  174 agcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaaca 271  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  33336091 agcatgacgcgaagccaccctagcaaacttatgagcaacttcgttggcttgtctctgaataaacctaatactagaggttgctaaatcagaagctaaca 33336188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12152816 - 12152749
Alignment:
Q  108 ttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcct-aatatgaatatggaaacta 174  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  12152816 ttattgcatttcatttaaaataatagtagagatatacgatggaatcttaaatatcaatatggaaacta 12152749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5866172 - 5866104
Alignment:
Q  299 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  5866172 taaaattagagacgccacatttactaccataaagattatctaccacaattttagaatcaagctcaaagt 5866104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 345
Target Start/End: Original strand, 21947085 - 21947134
Alignment:
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccaca 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  21947085 cgctaaaattagagacgtcacttttactatcataaagactatctaccaca 21947134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12152727 - 12152671
Alignment:
Q  201 gctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaa 257  Q
    |||||||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12152727 gctatgagcgactttgtttgtttgcctccgaataaacctaacagcagatgttactaa 12152671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 152
Target Start/End: Original strand, 21223042 - 21223090
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaat 152  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21223042 aaacttaatgtatttcatttaaaataagaatagagatacaagatggaat 21223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 187269 - 186998
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  187269 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactata 187170  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  187169 gcaaagctatgagcgaattcgttggcttgtctccgaatgaacctaacattagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataattg 187070  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  187069 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 186998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 9609498 - 9609769
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609498 acaagaagaaacttattgcatttcatacaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagccactcta 9609597  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9609598 gcgaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactg 9609697  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9609698 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacaattttggagtcaagctcaaagt 9609769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 30796794 - 30797065
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30796794 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatgcaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcaagacgcaaagccactcta 30796893  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30796894 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaatagacgtctacaatcattaataactg 30796993  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30796994 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacaattttggagtcaagctcaaagt 30797065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 29242104 - 29242375
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29242104 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaatatggaatcctaatataaatatggaaactagcatgatgtaaagccactcta 29242203  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29242204 gcaaagctatgagcgacttcattggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaagtcagaagctaacagacgtctacaatcattaatatctg 29242303  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  29242304 cgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagactgtctaccatagttttggagtcaatctcaaagt 29242375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 104 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1722106 - 1721845
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  1722106 aaacttattgcatttctttcataataataatagagatacaagatgaaattttaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccactctagccaaact 1722007  T
Q  204 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  1722006 atgagcgacttcgttggcttgtctccaaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagttaacaggcgtttacaatcattgatcactgcgctaaaa 1721907  T
Q  304 ttagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaa 365  Q
    ||| |||||||||   |  ||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  1721906 ttaaagacgccacatttcttaccataaagactatctaccacagtcttggaatcaagctcaaa 1721845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39861069 - 39860924
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39861069 acaagaaaaaacttattgcatttctttcataataatagtagagatacaagattgaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccacccta 39860970  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaa 241  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  39860969 gcaaaattatgagcgacttccttggcttgtctccgaataaacctaa 39860924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36978850 - 36978727
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccact--- 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||       
T  36978850 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatataaatatgaaaactagcatgacgcgaaaccacttaa 36978751  T
Q  193 ctagcaaagctatgagcgacttcg 216  Q
     || ||||||||||||||||||||    
T  36978750 ttaacaaagctatgagcgacttcg 36978727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 364
Target Start/End: Original strand, 27452586 - 27452733
Alignment:
Q  216 gttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgcca 315  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  27452586 gttggcttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagt-gtctacaatcattgattattgcgctaaaattagagacgcca 27452684  T
Q  316 ctagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaa 364  Q
    ||  |||| ||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||||    
T  27452685 cttctactgccataaagactatccaccacaggtttggaatcaagctcaa 27452733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 96 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4052985 - 4052904
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagca 177  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4052985 acaagaaaaaatttattgcatttcattcataataatggtagagatataagatggaatcctaaaatgaatatggaaactagca 4052904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4052909 - 4052831
Alignment:
Q  193 ctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaaca 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  4052909 ctagcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaaca 4052831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Original strand, 16007128 - 16007185
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatc 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16007128 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatc 16007185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 187
Target Start/End: Original strand, 27452529 - 27452582
Alignment:
Q  134 tagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaag 187  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27452529 tagagatacaagatgaaattctaatatgaatatggaaactagcataacacaaag 27452582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16041028 - 16040976
Alignment:
Q  1 atgttgtaggaatataacccttacacgatacttaagaattaaattttaagaaa 53  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16041028 atgttataggaatataacccttacccaatacttaagaaataaattttaagaaa 16040976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16040955 - 16040917
Alignment:
Q  47 taagaaatatatgaaagttgttacagattagaatattag 85  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16040955 taagaaatatatcaaagttgtcacagattagaatattag 16040917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25663648 - 25663377
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25663648 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataataggagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaaatagcatgacgcaaatccactcta 25663549  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25663548 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactg 25663449  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25663448 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacaattttagagtcaagctcaaagt 25663377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32578194 - 32577909
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagcca----- 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  32578194 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccattcta 32578095  T
Q  191 ---------ctctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctaca 281  Q
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32578094 gcaaagccactctagcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctaca 32577995  T
Q  282 ttcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32577994 ttcattaataactgcactaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 32577909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 96 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5839908 - 5839640
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5839908 acaagaagaaacttattgcatttcattcatgataatagtagagatacaagatgaaattctaatattaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 5839809  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5839808 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccaaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactg 5839709  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaa 364  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5839708 cgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagttaagctcaa 5839640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 98 - 261
Target Start/End: Original strand, 11503067 - 11503230
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11503067 aagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 11503166  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatca 261  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11503167 gaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatca 11503230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 36531267 - 36531008
Alignment:
Q  108 ttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatga 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||| |||| |    
T  36531267 ttattgcatttcattcataataatagtagagaaacaagatggaatcctaatatgaatatggaaattagcatgacacaaaactattctagcaaaactataa 36531168  T
Q  208 gcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattag 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||    | | || ||| || ||||| || |||| |||||||||||    
T  36531167 gcgacttcgtttgcttgtctccgaataaacctaacatcagaggtttctaaataaaaaaactaaatacatctgcagtcattgattactgtgctaaaattag 36531068  T
Q  308 agacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36531067 agataccacttttactaccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 36531008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 248
Target Start/End: Original strand, 32282841 - 32282991
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32282841 aagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgatgcaaagtcactctagc 32282940  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcaga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  32282941 aaagctatgagcgacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcaga 32282991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10342504 - 10342353
Alignment:
Q  101 aataaacttattgcatttcattcaa-aataatagtagagatacaagatggaatcctaata---tgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctag 196  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||    
T  10342504 aataaatttattgtatttcattcattaataatagtagagatataagatggaatcctaataatatgaatatgaaaactagcatgacacaaagccattttag 10342405  T
Q  197 caaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcaga 248  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10342404 caaagctatgagcgatttcgttggtttgtctccaaataaacctaacatcaga 10342353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 296
Target Start/End: Original strand, 14219792 - 14219992
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||  ||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  || ||||||     
T  14219792 acaagaagaaatttattgtatttcatttaaaataatagtagaaatgtaagctgaaatcttaatatgaatatggaaactaacatgacacggagtcactctg 14219891  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    || ||  ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  14219892 gcgaaattatgaccgactttgttggtttgtctcctaataaacctaacatcagatattactaaatcaaaagctaacagacgtctacaatcattgatcactg 14219991  T
Q  296 c 296  Q
    |    
T  14219992 c 14219992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40395378 - 40395245
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  40395378 aagaagaaatttattgtatttcattcaa--taatagtagagatacaagataaaattctaatatgaatatggaaactaacatgacgcgaatccactctagc 40395281  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaat 233  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  40395280 aaagctatgagtgacttagttgacttgtctccgaat 40395245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 152
Target Start/End: Original strand, 31037703 - 31037752
Alignment:
Q  103 taaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaat 152  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31037703 taaagttactgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaat 31037752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 152
Target Start/End: Original strand, 26006781 - 26006829
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaat 152  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26006781 aaacttaatgcatttcatttaaaataagagtagagatgcaagatggaat 26006829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 345
Target Start/End: Original strand, 32283002 - 32283049
Alignment:
Q  298 ctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccaca 345  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  32283002 ctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccaca 32283049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 43234266 - 43234222
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatg 148  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43234266 aaacttaatgcatttgatttaaaataagagtagagatacaagatg 43234222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 26429188 - 26429459
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429188 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 26429287  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26429288 gcaaagctatgagcgactttgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataactg 26429387  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26429388 cgctaaaattaaagacgccactagtactaccataaagactgtttaccataattttggagtcaagctcaaagt 26429459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 35853302 - 35853031
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35853302 acaagaagaaacttattgcatttaattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 35853203  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  35853202 gcaaaactatgagcgacttcgttgacttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttattaaatcagaagctaacagaagtctacaatcactaataactg 35853103  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35853102 cgctaaaattagagatgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagt 35853031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 2536975 - 2537246
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2536975 acaagaagaaacttattgcattttattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaacatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactcta 2537074  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| || ||||    
T  2537075 gcaaagttataagagacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacagtcattgattactg 2537174  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2537175 cactaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 2537246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33846449 - 33846180
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846449 aagaagaaacttattgcatttcattcagaataatagtagaaatacaagatggaatcctaatgtgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 33846350  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcg 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||| || ||||||    
T  33846349 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacaccagaggttaccaaatcagaagctaacaaacgtctatagtcattgattactgcg 33846250  T
Q  298 ctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  33846249 ctaaaattagatatgccacttttactgccataaagactatctaccaaaattttggaatcaagctcaaagt 33846180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 17423818 - 17424089
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  17423818 acaagaagaaacttattgaatttcattcatgataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgactcgaagccactcta 17423917  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||  |||||||| ||||| || ||||    
T  17423918 gcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcataggttgccaaatcagaagctaacatgcgtctacagtcattgatcactg 17424017  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17424018 cgctaaaattagagacgccacaattactaccatagagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 17424089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Original strand, 26006081 - 26006350
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26006081 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcaa 26006180  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||| || ||||    
T  26006181 gcaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctctgaataaacctaacatcagaagttactacatcagaagctaacaggggtctacagtcattgattactg 26006280  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaa 365  Q
     | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  26006281 tgataaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacatttttgaaatcaagctcaaa 26006350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48446789 - 48446518
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48446789 acaagaagaaatttattgtatttcattcataataatagtagagatataagatggaaccataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactcta 48446690  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  48446689 gcaaagctatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatctgaagctaacagacgtctaccgtcattgattactg 48446590  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  48446589 cgctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttgaaatcaagttcaaagt 48446518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 99 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9035025 - 9034770
Alignment:
Q  99 agaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  9035025 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccact------ 9034932  T
Q  199 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgc 298  Q
           || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9034931 -------gaccgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacatctacaatcattaataactgcgc 9034839  T
Q  299 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9034838 taaaattagaaacgccaatattactaccataaagactatctaccacaattttggaatcaagctcaaagt 9034770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 52759123 - 52759394
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52759123 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtatagatacacgatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacacaaagccactcta 52759222  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||| || ||||    
T  52759223 acaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacatgcgtctacaatcattgattactg 52759322  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||| |||  ||||||| |||| ||||||||    
T  52759323 cgctaaaattagagacgccagttttaataccataaagactatctatcacggttttggaatcaaactcaaagt 52759394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12274323 - 12274052
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  12274323 acaagaaaaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatataaatatagaaactaacatgacacaaagttactcta 12274224  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||| || ||||    
T  12274223 gcaaagctaagagcgacttcgttggcttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaagcatctacagtcattgattactg 12274124  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12274123 cgctgaaattagaggtgccacttttactaccataaagactatcagccacagttttggaatcaagctcaaagt 12274052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 54552740 - 54552478
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54552740 aaacttattgcatttcattcataataatagcaaagatacaagaaggaatcctgatatgaatatgaaatctagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 54552641  T
Q  204 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaa 303  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || ||| ||||||||    
T  54552640 atgaccgacttcgttagcttgtatccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaataggcgtatacaatcatttattactacgctaaaa 54552541  T
Q  304 ttagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
     |||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  54552540 -tagagatgccatttttactaccataaagactatctacgacaattttgaaatcaagctcaaagt 54552478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 353
Target Start/End: Original strand, 25058300 - 25058557
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  25058300 acaagaagaaacttactatattttattcataataatagtagagatacaagattgaatcttaatatgaatatggaaactaacatgacgcgaagccagtcta 25058399  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25058400 acaaaactatgagcgacttcgttggcttgtctccaaataaacctaacatcagatgttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaattactg 25058499  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttgga 353  Q
    ||||||||||||| | |  |||  |||||||||||||| | |  ||||||||||||||    
T  25058500 cgctaaaattagatatgttacttttactaccataaagattattcaccacacttttgga 25058557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 8169321 - 8169591
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||    
T  8169321 acaagaagaaacttattgcatt-cattcataataatagtagagatataaggtggaattctaatatgaataatgaaactagcatgacgcgaagccatccta 8169419  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||| | ||    
T  8169420 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcatctacaatcattaattaatg 8169519  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||| | ||  ||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  8169520 cgctaaaataaaagacaccacttttactaccataaagattatccgccacagttttgaaatcaaactcaaagt 8169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 367
Target Start/End: Original strand, 22359239 - 22359507
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  22359239 aagaacaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacacaaagccactaaagc 22359338  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcg 297  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| | || ||| | ||| || |||| |    
T  22359339 aaaactatgagtgacttcgttggcttgtattcgaat-aaacaaacatcagagattactaaatcagaagctaacaggcatcgacaataattgattactgtg 22359437  T
Q  298 ctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||   ||||||||| | ||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  22359438 ctaaaattagagacgtcacttttactgttataaagactatataccacagttttgaaatcaaactcaaagt 22359507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 335
Target Start/End: Original strand, 19396165 - 19396401
Alignment:
Q  99 agaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  19396165 agaaaaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatacaatcttaatatgaatgtgaaaactagtatgacgcaaagccaccatagca 19396264  T
Q  199 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgc 298  Q
    || |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | |||| | ||| || | ||| |    
T  19396265 aaactataagcgactttattggcttgtctccgaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaagctaacaaacatttacaattatttattattgcac 19396364  T
Q  299 taaaattagagacgccactagtactaccataaagact 335  Q
    || ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  19396365 tataattagagacgacacttttacaaccataaagact 19396401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 792066 - 791817
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                         
T  792066 acaagaagaaatttattgcatttcattcataataat-gtagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaacta--------------------- 791989  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  791988 gcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaacagacgtctacaatcattgatcactg 791889  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  791888 cgctaaaattagagacaccacaattactaccatatagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 791817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 265
Target Start/End: Original strand, 6839751 - 6839912
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    ||| || ||| | || ||    
T  6839751 aaacttagtgcattttattcataataatcgtagagataaaagatggaattctaataaaaatgtggaaactagcatgacatggagctaccctatctaaact 6839850  T
Q  204 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaag 265  Q
    |||||| | ||| |||| |||||| | ||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  6839851 atgagcaatttcattggattgtcttctaatgaactttacatcagagttcactaaatcagaag 6839912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Original strand, 23860023 - 23860121
Alignment:
Q  131 tagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctcc 229  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  |||| |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  23860023 tagtagagatacgagatgaaatcgtaatatgaatatgaaaattattatgatgcaaaatcactctagtaaagctatgagcgatttcgttgacttatctcc 23860121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 653000 - 652872
Alignment:
Q  137 agatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaa 236  Q
    |||||||  ||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||   |||  || ||||| || |||||||| ||||| |||| |||| | ||| | ||    
T  653000 agatacattatggaattcaaataaaaatatggaaacaagcatgacattaagttaccctagctaaactatgagcaacttcattggattgtattcgactaaa 652901  T
Q  237 cctaacatcagaggttactaaatcagaag 265  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  652900 cctaacatcagaggtttctaaattagaag 652872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 367
Target Start/End: Original strand, 23860120 - 23860162
Alignment:
Q  325 ccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  23860120 ccataaagactgtctactacagttttggagtcaagttcaaagt 23860162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 32957581 - 32957310
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32957581 acaagaagaaacttatcgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 32957482  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32957481 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaatagacgtctacaatcattaataactg 32957382  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  32957381 cgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggaatcaatctcaaagt 32957310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 96 - 366
Target Start/End: Original strand, 7435612 - 7435882
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7435612 acaagaagaaatttattgcatttcgttcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 7435711  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||     
T  7435712 gcaaagctattagcgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacaggcgtctacagtcattgattacta 7435811  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaag 366  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7435812 cgctaaaattagagacgctaattttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaag 7435882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7597703 - 7597432
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  7597703 acaagaagaaatttattgcttttcattcataataagagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatcacgcaaagccactcta 7597604  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  7597603 gcaaagctatgagcgactttggtggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaataaaaaactaacatacgtctacagtcattgattactg 7597504  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||    
T  7597503 cgctaaatctagagacgccacttttactgccataaagactctctaccacaattttgaaatcaaactcaaagt 7597432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7608621 - 7608464
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7608621 acaagaagaaatttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaattataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactata 7608522  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggtta 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  7608521 gcaaagctatgagtgacttcgttggcttgtcttcgaataaacctaacatcaaaggtta 7608464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6192678 - 6192539
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |    
T  6192678 aaacttattgcatttcattcatgataatagtagaaatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcataacgtagagccactctagcaaagat 6192579  T
Q  204 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaaca 243  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192578 atgagtgatttcgttggcttgtctccgaatgaacctaaca 6192539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12523733 - 12523483
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||                         
T  12523733 acaagaagaaatttattgcatttcattcataataatggtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaacta--------------------- 12523655  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||| ||||| |||||| |||||| | ||||| || ||||    
T  12523654 gcaaaactatgagcaacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagattttgttaaattagaagctaacaggcgtctatagtcattgatcactg 12523555  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12523554 cgctaaaattagagacaccacaattactaccatatagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 12523483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13406261 - 13405996
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||  |||    
T  13406261 acaagaagaagcttattgtatttcatttaaaataagagtagagatacacgatcgaatcttaatatgattatggaaactagcatgactcgaagtcatccta 13406162  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||  ||||| |  | ||    
T  13406161 gcaaaactatgagtgacttaattggcttgtctccgaataaacataacatcagaggttgctaaatcagaagctaacatacgtttactatcattgagcattg 13406062  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagct 361  Q
      ||| ||||||| | | ||||  ||| |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  13406061 tactataattagaaatggcacttttaccaccataaagactatcaaccacagttttgaagtcaagct 13405996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 98 - 335
Target Start/End: Original strand, 31797974 - 31798211
Alignment:
Q  98 aagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagc 197  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||| |||| |  |||||    ||||    
T  31797974 aagaataaatttattgcattttattcataataatagcagagatacaagatgaaatcctaatatagatatgaaaactagaatgatgtgaagccgtcatagc 31798073  T
Q  198 aaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcg 297  Q
    |||  ||||||  |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||| || | ||| |||||     
T  31798074 aaatttatgagtaacttcgttagcttgtcttcaaataaacctaacatcagaggttactagatcaaaagctaacatatgtctacagtcttgaatcactgca 31798173  T
Q  298 ctaaaattagagacgccactagtactaccataaagact 335  Q
    ||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||||    
T  31798174 ctaaaattagagatgtcacatttaccaccataaagact 31798211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 104 - 213
Target Start/End: Original strand, 34183125 - 34183234
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34183125 aaacttattgcatttaattcataatagtagtagagatacaagatgaaatcccaatataaatatgaaaactaacatgacgcaaagccactctagcaaagct 34183224  T
Q  204 atgagcgact 213  Q
    ||||||||||    
T  34183225 atgagcgact 34183234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 178
Target Start/End: Original strand, 29025239 - 29025314
Alignment:
Q  103 taaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcat 178  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  29025239 taaacttattgcatttcattcataataatagtagtgatacaagatgaaatcttaatacgaatatggaacctagcat 29025314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7607853 - 7607760
Alignment:
Q  274 cgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  7607853 cgtctacagtcattgattactacgctaaaattagagacgccacttttactacaataaagactatctaccacaattttgaaatcaagctcaaagt 7607760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6192543 - 6192479
Alignment:
Q  267 taacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaa 331  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  6192543 taacagatgtccacaatcattattaactgcgctaaaattagagacgccacttttactaccataaa 6192479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 32814131 - 32814052
Alignment:
Q  202 ctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctaca 281  Q
    |||| ||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  32814131 ctataagcgactttattagcttgtcttcgaataaacctaacatcagagattactaaattagaagttaaaagacatctaca 32814052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 6856 - 6585
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6856 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccgctcta 6757  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  6756 gcaaagctatgagcgacttcgttgtcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaatagacgtttacaatcattaataactg 6657  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6656 cgctaaaattagagacgccatttttactaccataaaggctgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagt 6585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0577 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0577
Description:

Target: scaffold0577; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 2195 - 2466
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2195 acaagaataaacttcttgcatttcattcataataatagtagagatacaagatagaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactcta 2294  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  2295 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctgcgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataaccg 2394  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
     ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2395 tgctaaaattagagacgccatttttactaccataaagattgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagt 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Original strand, 55218650 - 55218913
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55218650 aaacttattgcatttcatttatgataatagtagaggtacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 55218749  T
Q  204 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55218750 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgtctacaatcattaataaatgcgctaaaa 55218849  T
Q  304 ttagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  55218850 ttagatacgccacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaaactcaaagt 55218913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 120 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39133777 - 39133532
Alignment:
Q  120 attcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39133777 attcaaaataatagtagagatacaagattgaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcactctagcaaagctatgagcgacttcgttg 39133678  T
Q  220 gcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||      
T  39133677 gcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaaacgtctacaatcattaattac--cgctaaaattagagacgtcacttt 39133580  T
Q  320 tactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39133579 tactaccataaagattatctaccacagttttggagtcaaactcaaagt 39133532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 51191868 - 51192139
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  51191868 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtacagatacaagatgaaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagtcaatcta 51191967  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || |||     
T  51191968 gcaaagctatgaacgacttcgttggcttgtctctgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagacgtctacagtcattgattacta 51192067  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  51192068 cactaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 51192139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 51952071 - 51951808
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagct 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51952071 aaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgtaaagccactctagcaaaact 51951972  T
Q  204 atgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaa 303  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  51951971 atgagcgaattcattggcttgtcttcgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaggcgtctacagtcattgattactgcgcaaaaa 51951872  T
Q  304 ttagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||| |||||  | ||  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  51951871 ttagagaccccacttttcctgtcataaagactatccaccacacttttagaatcaagctcaaagt 51951808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8458040 - 8457769
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  8458040 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaagccattata 8457941  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  8457940 gcaaagctataagcgacttcattggcttgtcttcgaataaacctaacatcagaggttactaaatcaaaagctaacaggtgtctacaatcattgataactg 8457841  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||||| || ||||||| | ||||||| |||||| ||||||    
T  8457840 cgctgaaattagagacgtcacttttactgccataaaggctatctaccataattttggaatcaagcacaaagt 8457769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 43018351 - 43018622
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43018351 acaagaagaaatttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcaaaaccactata 43018450  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| | || || || ||||    
T  43018451 gcaaaactatgagcaactttgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctatagtctttgattactg 43018550  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||||||  ||||| | |||| ||||||||    
T  43018551 cgctaaaattagagacgtcacttttaataccataaagactatctaccacggttttgaaatcaaactcaaagt 43018622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13444262 - 13443990
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtag-agatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactct 194  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |     
T  13444262 acaagaagaaacttattgtatttcattcataatgatagtaggagataaaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagaatgacgtgaagccaaccg 13444163  T
Q  195 agcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataact 294  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  13444162 aggaaagctatgagcgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaacatcagtggttgctaaatcagaagctaacagacgtctacagtcattaattact 13444063  T
Q  295 gcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||| ||||||| | |||||||||||    
T  13444062 gcgctaaaattagagacgccacttttactaccataaggactatccaccacaattttggaattaagctcaaagt 13443990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21689871 - 21689611
Alignment:
Q  105 aacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagcta 204  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21689871 aacttattgtatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcataatatgaatatggaaactaacatgacgcaaagccactctagcaaagct- 21689773  T
Q  205 tgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaat 304  Q
     ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21689772 -gagtgacttcgttgacttgtctctgaataaacctaacatcagaggttactagattagaagctaacaagcgtctacattcattgattactgcgctaaaat 21689674  T
Q  305 tagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  21689673 tagagacgtcacttttactaccataaaaactatctaccacagttttgaaatcaagctcaaagt 21689611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 39383595 - 39383404
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |    
T  39383595 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaaaatggaatcataatatgaatatggaaattaacatgacgcaaaaccactcga 39383496  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcatt 287  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || | |||||| |||||    
T  39383495 gcaaagctatgaacgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaacatcagaggttattaaattagaagctaataggcatctacaatcatt 39383404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 26400319 - 26400050
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    |||    
T  26400319 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaatatggaatcataatatgaatatggaaactagcatgacgcgaaactttccta 26400220  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||| ||  ||||||  ||||| || | ||    
T  26400219 gcaaaactatgagcgactttgttggcttgtctatgaataaacctaacatcagaggtttctaaatctaaaggtaagaggtgtctaccgtcattgatcaatg 26400120  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaa 365  Q
    | ||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||| | || || |||  |||||| |||||||||||    
T  26400119 cactataattagagatgtcacttttactaccataaagattatcaactacatgtttggaatcaagctcaaa 26400050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 7622766 - 7622657
Alignment:
Q  108 ttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatga 207  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||| |||| |    
T  7622766 ttattgcatttcatttataataatagtagagatacaagatgaaatcctaatatgaatatgaaaactagcat-acgcgaagccaccttagcaaatctataa 7622668  T
Q  208 gcgacttcgtt 218  Q
    |||| ||||||    
T  7622667 gcgatttcgtt 7622657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 39371444 - 39371369
Alignment:
Q  292 actgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | || |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  39371444 actgcgctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatttatcacaattttggaatcaatctcaaagt 39371369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19396900 - 19396816
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatga 180  Q
    |||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| | ||||  | || ||||||||||||||    
T  19396900 acaagagtaaatttagtgcattacattcataataattgttgagatacaagatggaattcgaataaaagtacggaaactagcatga 19396816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23488089 - 23487937
Alignment:
Q  207 agcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaatta 306  Q
    ||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||    || |||||||| ||| |||||  |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||    
T  23488089 agcgacttcgtaggcttgtctctgattaaacctaacatcatcaattgctaaatcacaagctaacatgcgtctacaatcaattataactgcactataatta 23487990  T
Q  307 gagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaag 359  Q
    |  |||  |||  | |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  23487989 gtaacgttactttttctaccatagagactatccaccacatttttggaatcaag 23487937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Original strand, 42515701 - 42515763
Alignment:
Q  203 tatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaag 265  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42515701 tatgggcgactacgttggcttgtctctaaataaatctaacatcagagactactaaatcagaag 42515763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 39135526 - 39135493
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaata 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39135526 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaata 39135493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 99 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 5431 - 5163
Alignment:
Q  99 agaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||    
T  5431 agaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaattttaatatgaatatggaaattagcatgatgcaaagtcactatagca 5332  T
Q  199 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgc 298  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  5331 aagttatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcaaaagctaacaggcgtctacaatcattaataactgcgt 5232  T
Q  299 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5231 taaaattagagacgctacttttactaccataaagactgtctaccacagttttggagtcaagctcaaagt 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 23769771 - 23770042
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||    
T  23769771 acaagaacaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatagaattctaatatgaatatggaaactagcatgtaacaaagctactcta 23769870  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  23769871 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaattctgaagctaacagacgtctacaatcattgattactg 23769970  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23769971 cgctaaaattagagacgccacttttactgccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 23770042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 24477472 - 24477743
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24477472 acaagaagaaacttattgcatttcattcatcataatagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcataacgcaaagccactcta 24477571  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||| || ||||    
T  24477572 gcaaaactatgagcgacttcgttggtttatctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacatgcatctacagtcattcattactg 24477671  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24477672 cgctaaaattagagacgccacttttactaccataaagactatctaccacagttttggaatcaagctcaaagt 24477743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 45085981 - 45086252
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45085981 acaagaagaaacttatttcatttcattcataataatagtagagatataagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccactcta 45086080  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||| || || |    
T  45086081 gccaagctatgagcgactttgttggcttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcataagctaacagtcgtttacaatcattgatcacgg 45086180  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  45086181 cgctaaaattagagacgccacatttgctaccataaagactatctaccacattcttggaatcaagctcaaagt 45086252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 109 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10213948 - 10213690
Alignment:
Q  109 tattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgag 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10213948 tattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatgaaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacgcgaagccaccctagcaaaactatgag 10213849  T
Q  209 cgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattaga 308  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  10213848 cgacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacaagcgtctacaatcattagttactgcgctaaaattaga 10213749  T
Q  309 gacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
     ||||||||  |||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  10213748 tacgccacttttactaccataaagactatccaccacagttttggaatcaagctcaaagt 10213690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22606061 - 22605840
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||     
T  22606061 acaagaagaaactgattgcatttcattcataataattgtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaaaccactctc 22605962  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  22605961 gcaaagctatgagcgactccgttggcttgtctctgattgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagctaacagacgactacaatcattaataacta 22605862  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccact 317  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  22605861 cgcaaaaattagagacgccact 22605840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 38451689 - 38451959
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38451689 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagta-agatacaagatgaaattctaatatgaatatggaaactagcatggtgcaaagccactcta 38451787  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || | ||    
T  38451788 gcaaagctatgagcgatttcgttggcttgtctccgaaaaaacctaacattagaggttaataaatcagaagctaacaggcgtctacagtcattgattattg 38451887  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || || | |||  ||||||| |||||||||||||    
T  38451888 cgctaaaattagagacgccacttttactaccataaaggctatccatcacggttttggaatcaagctcaaagt 38451959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 23407745 - 23408016
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||    
T  23407745 acaagaagaaatttattgcatttcgttcataataatagtagagatataagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgatgcgaagacatccta 23407844  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
     |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||     
T  23407845 acaaaactatgagcgactttgtttgcttgtctccgaataaacctaacattagaggttactaaatcagaagctaacatgcgtctacaatcattaattacta 23407944  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
      ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||    
T  23407945 aactaaaattagagacgtcacttttactatcataaagactatccaccacagttttagaatcaagctcaaagt 23408016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11616774 - 11616661
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11616774 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatagaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgtaaagtcactcta 11616675  T
Q  196 gcaaagctatgagc 209  Q
    ||||||||||||||    
T  11616674 gcaaagctatgagc 11616661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 353
Target Start/End: Original strand, 40074065 - 40074280
Alignment:
Q  135 agagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatg 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||     
T  40074065 agagatacaagatggaatcttaatatgaatatgaaaactagcatgacgcgaagcca-tttagcaaaactatgagcgactttgttggcttgtct-ctaata 40074162  T
Q  235 aacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagac 334  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||  |||| || ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||    
T  40074163 aacctaacattagaggttgctaaatcagaagcaaacagacgtttacagccattgat-actgcactataattagaaacgccgcttttactaccataaagac 40074261  T
Q  335 tgtctaccacacttttgga 353  Q
    | || |||||| |||||||    
T  40074262 tatccaccacagttttgga 40074280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 27177864 - 27177605
Alignment:
Q  99 agaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagca 198  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||   ||||      
T  27177864 agaagaaacttattgtatttcaattaaaataatagtagagatacacaacggaatcttaatatgaatatggaaacaagaatgacacaaagccgtcctagtg 27177765  T
Q  199 aagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgc 298  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |    
T  27177764 aaactatgagctacttcgttggcttgtctcataataaacctgacatcaaaggttactaaatcaagagctaatagacgtctacaatcatcaatcactgcac 27177665  T
Q  299 taaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaa 358  Q
    || ||||| | || ||| |  ||| |||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  27177664 tataattaaaaacaccatttttaccaccatagagactatcgaccacagttttggaatcaa 27177605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 218
Target Start/End: Original strand, 31411362 - 31411483
Alignment:
Q  97 caagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctag 196  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31411362 caagaagaaacttattgtatttcattcataataataatagatatacaagatgaaatcctaatatgaatatggaaactagaatgacacaaagtcactctag 31411461  T
Q  197 caaagctatgagcgacttcgtt 218  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  31411462 caaagctatgaacgacttcgtt 31411483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1604998 - 1604730
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| | || ||||||||    
T  1604998 acaagaagaaacttattgcgtttcatttataataataagagatataaaagatggaatc-taatatgaatacgaaaactaacatgacactaatccactcta 1604900  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    || || |||||| |||||| ||||  |||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| || || || || ||| ||||| || | ||    
T  1604899 gcgaaactatgaacgactttgttgatttgtctcctaataaacctaatatcagatgttactaaatcagaagctagcacacatcaacaatcattgatcaatg 1604800  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaa 365  Q
    | ||  ||||||||||  ||||  ||| |||||||| ||| ||||||| | ||||| | |||| ||||||    
T  1604799 cactttaattagagacatcactcttaccaccataaatactatctaccatagttttgtaatcaaactcaaa 1604730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20214346 - 20214282
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatat 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20214346 acaagaagaaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaaaatgaaatcctaatat 20214282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32025662 - 32025536
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||| | |||||| ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||    
T  32025662 acaagaagaaacttatagcgttttatt-ataataattgtagagatataacatgaaattctaatataaatatggaaactagcatgacatgaagtcactcta 32025564  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggctt 223  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32025563 gcaaagctatgagcaacttcattggctt 32025536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28317883 - 28317799
Alignment:
Q  108 ttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccact 192  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||| || |||||| |||| |||||    
T  28317883 ttattgcattttatttaaaataatagtagagatataagatgaaatcttaatataaatatgaaaattatcatgacacaaaaccact 28317799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2599266 - 2599233
Alignment:
Q  128 taatagtagagatacaagatggaatcctaatatg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2599266 taatagtagagatacaagatgaaatcctaatatg 2599233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 26934 - 27205
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26934 acaagaaaaaacttattgcatttcattcataataatagcagagatacaagatgaaattctaatatgaatatgaaaactagcatgacgcaaagccactcta 27033  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  27034 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaataaacctaaaatcagaggttacgaaatcagaagataacaggcgtctacaatcattgattactg 27133  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    | |||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  27134 cactaaaattagagacaccatttatactgccataaagactatctaccatagttttggaatcaagctcaaagt 27205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 58543 - 58271
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  58543 acaagaagaaacttattgcatttcattcataataatagtagagatacaagatggaaccctaatatgaatatggaaactagcatgacataaagccactcga 58444  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| ||||| || |||     
T  58443 gcaaagctatgagagacttcgttggcttgtcttccaataaacctaacatcagaggttattaaatcagaagctaataggcgtctacagtcatttattacta 58344  T
Q  296 cgctaaaattagagacgcca-ctagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||| | |  |  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  58343 cgctaaaattagagacacgattttttactgccataaagactatctaccacaattttggaatcaatatcaaagt 58271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 126 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 216575 - 216334
Alignment:
Q  126 aataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgt 225  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  216575 aataatagtagagatattagatggaatcctaatatgaatatgaaaactagcatggcgcaaagccactctagcaaaggaatgagcgacttcgttggcttgt 216476  T
Q  226 ctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactac 325  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| || | ||||||||||||| ||| |||| |  |||| |    
T  216475 ctccgaataaacctaacatcaaaggttactaaatcagaatctaacatgcgtctacagtcattgattattgcgctaaaattaaagatgccatttttactgc 216376  T
Q  326 cataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  216375 cataaagactatctaccacaattttagaatcaagctcaaagt 216334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 48522307 - 48522162
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48522307 acaagaagaaacttattgcatttcatttataataatagtagagatataagatggaatcttaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 48522208  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaa 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48522207 gcaaagctatgagcgacttcgttgacttgtctccgaataaacctaa 48522162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 367
Target Start/End: Original strand, 25070822 - 25071072
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||                         
T  25070822 acaagaaaaaatttattgcatttcattcataataatggtagagatataagatggaatcctaaaatgaatatggaaacta--------------------- 25070900  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||| ||||| || ||||    
T  25070901 gcaaaactatgagcaacttcgttggtttgtctccgaataaacctaacatcagaggttgctaaattagaagctaacatgcgtctacagtcattgatcactg 25071000  T
Q  296 cgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25071001 cgctaaaattagagacaccacaataactaccatatagaccatctaccacaattttggaatcaaactcaaagt 25071072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19956676 - 19956407
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| | ||  | || || |||    
T  19956676 acaagaagaaacttattccatttcattcataataatattatagatacaagatggaatcctaatatgcatatgga---tagcaaggcgggaggcaacccta 19956580  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactg 295  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| || ||||||| |||||| ||||  ||||| || |||| | ||||| || ||||    
T  19956579 gcaaaactataagcgacttcgttggtttgtctccaaataaacttaaaataagaggttgctaaattagaaactaacaaacatctaaaatcattgatcactg 19956480  T
Q  296 cgctaaaatta---gagacgccactagtactaccataaagactgtctaccacacttttggagtcaagctcaaa 365  Q
    | ||| |||||   || || || ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  19956479 cactataattagacgacacaccgcttttgctaccataaagactatccaccacaattttggaatcaagctcaaa 19956407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11080068 - 11079830
Alignment:
Q  112 tgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcga 211  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||| |  || | | || || || |||| || ||    
T  11080068 tgcatttcatttataataatcgtagagatacaagatggaatcctgatatgaatacagaaactagcctgacacggagtcgcccttgctaaactataagaga 11079969  T
Q  212 cttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagac 311  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||  |||| |||||   ||||||| || ||||| ||| | ||| ||||||| ||    
T  11079968 cttcgttggtttgtctcctaatgaacctaacataagatgttattaaatttgaagctaacatgtgtctacaatcgttaatcacttcactataattagaaac 11079869  T
Q  312 gccactagtactaccataaagactgtctaccacactttt 350  Q
     ||||   |||||||||| ||||| || |||||| ||||    
T  11079868 accacatttactaccatatagactatccaccacaatttt 11079830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26347485 - 26347349
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactcta 195  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||| | ||||||||||||    
T  26347485 acaagaagaaatttattttattttattcataataatagtagagatacaagatggaatcataatataaatatagaaattagtatgatgtaaagccactcta 26347386  T
Q  196 gcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaa 232  Q
      || | ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  26347385 ataaggttatgagcgacttcattgatttgtctccgaa 26347349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 48519061 - 48518933
Alignment:
Q  239 taacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaagactgtc 338  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||  ||||| | ||    
T  48519061 taacatcagagattactaaatcagaagctaacagacgtctatagtcattgattattgcgctaaaatcagagacgtcacttttactgccgcaaagaatatc 48518962  T
Q  339 taccacacttttggagtcaagctcaaagt 367  Q
    ||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  48518961 taccacgattttggaatcaagttcaaagt 48518933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 31592436 - 31592302
Alignment:
Q  112 tgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcga 211  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||    ||| || ||||| || |||||||| |    
T  31592436 tgcatttcatttaaaaaaagagtagagatacaagatggaattcgaatgaaaatacggaaactagcatgacatggagctaccctagctaaactatgagcaa 31592337  T
Q  212 cttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatca 246  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  31592336 cttcattggcttgtctcctaataaacctcacatca 31592302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25698674 - 25698542
Alignment:
Q  155 taatatgaatatggaaactagcatgacgcaaagccactctagcaaagctatgagcgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttac 254  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||  |||||  ||  | || || ||||||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |    
T  25698674 taatataaatatgaaaactagcatgatacaaagttaccattgctaatctatgaaagacttcgttgacttgtctccaaataaacgtaacatcaaaggttgc 25698575  T
Q  255 taaatcagaagttaacagacgtctacattcatt 287  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  25698574 taaatcagaagttaacatatgtctacaatcatt 25698542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 165
Target Start/End: Original strand, 15393510 - 15393568
Alignment:
Q  107 cttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaata 165  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15393510 cttaatgcatttcatttataataacagtagagatacaagatgaaatcttaatatgaata 15393568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 209 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15327523 - 15327478
Alignment:
Q  209 cgacttcgttggcttgtctccgaatgaacctaacatcagaggttac 254  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15327523 cgacttcattggcttgtctcctaatgaacctaacatcagaagttac 15327478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 20621532 - 20621463
Alignment:
Q  112 tgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgac 181  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||| |||||    
T  20621532 tgcatttcctttataataaaagtagagatacaagatagaattttaatatgaatacgaaaactagtatgac 20621463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 187
Target Start/End: Original strand, 5316 - 5399
Alignment:
Q  104 aaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaactagcatgacgcaaag 187  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  5316 aaacttattgcatttcattcatgataatagtagagatacaagatggaatcttaatatgaatataaaaactaacatgacgcaaag 5399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20773 - 20695
Alignment:
Q  96 acaagaataaacttattgcatttcattcaaaataatagtagagatacaagatggaatcctaatatgaatatggaaacta 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  20773 acaagaagaaacttattgcatttcatttataataatagtagagatacaagatgtaatcttaatatgaatatagaaacta 20695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 345
Target Start/End: Original strand, 148059 - 148172
Alignment:
Q  232 atgaacctaacatcagaggttactaaatcagaagttaacagacgtctacattcattaataactgcgctaaaattagagacgccactagtactaccataaa 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||||||  ||| ||||  | |||||||| |    
T  148059 atgaacctaacataagaggttactaaatcagaaattatcagacgtctacgatcattaatcactgcactataattagtaacgtcacttttcctaccataga 148158  T
Q  332 gactgtctaccaca 345  Q
    |||| || ||||||    
T  148159 gactatccaccaca 148172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University