View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12160_low_9 (Length: 406)

Name: NF12160_low_9
Description: NF12160
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12160_low_9
NF12160_low_9
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (13-406)||(45429179-45429570)
chr2 (13-404)||(39948189-39948578)
chr2 (13-406)||(28469229-28469620)
chr2 (13-404)||(45136401-45136787)
chr2 (13-247)||(22686967-22687201)
chr2 (13-208)||(32955648-32955843)
chr2 (233-406)||(10828096-10828268)
chr2 (185-406)||(17421286-17421508)
chr2 (231-406)||(29400691-29400864)
chr2 (261-406)||(15831969-15832114)
chr2 (261-406)||(3939816-3939961)
chr2 (261-406)||(30496023-30496168)
chr2 (261-406)||(43979371-43979516)
chr2 (261-406)||(5352806-5352951)
chr2 (261-394)||(43538826-43538959)
chr2 (233-404)||(36655486-36655648)
chr2 (286-403)||(25514980-25515097)
chr2 (154-218)||(17421155-17421219)
chr2 (200-241)||(25515143-25515184)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (13-396)||(42165751-42166133)
chr3 (13-406)||(3976295-3976686)
chr3 (13-406)||(50963542-50963937)
chr3 (13-406)||(47073300-47073691)
chr3 (34-404)||(49268364-49268732)
chr3 (13-353)||(4007469-4007807)
chr3 (65-404)||(597541-597878)
chr3 (34-400)||(50216036-50216403)
chr3 (13-403)||(30255099-30255486)
chr3 (13-403)||(20917113-20917499)
chr3 (13-403)||(20926075-20926461)
chr3 (36-403)||(42756762-42757128)
chr3 (41-404)||(49195561-49195922)
chr3 (13-326)||(48889323-48889633)
chr3 (37-404)||(48563539-48563908)
chr3 (13-404)||(44230302-44230679)
chr3 (233-406)||(36128406-36128577)
chr3 (233-406)||(2274017-2274188)
chr3 (13-173)||(42805586-42805745)
chr3 (233-406)||(16611891-16612062)
chr3 (233-406)||(22047191-22047362)
chr3 (259-406)||(52390482-52390629)
chr3 (233-404)||(20351413-20351582)
chr3 (233-404)||(17567191-17567361)
chr3 (262-406)||(29009712-29009856)
chr3 (233-404)||(41613142-41613311)
chr3 (261-406)||(42903266-42903411)
chr3 (261-406)||(49143539-49143684)
chr3 (261-406)||(34046227-34046372)
chr3 (261-406)||(46701102-46701247)
chr3 (261-406)||(50479883-50480028)
chr3 (116-232)||(54682060-54682171)
chr3 (261-406)||(46389802-46389947)
chr3 (261-394)||(54386975-54387108)
chr3 (366-403)||(48889636-48889673)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (23-406)||(31782820-31783202)
chr1 (23-404)||(52802730-52803110)
chr1 (41-404)||(47502901-47503262)
chr1 (13-403)||(51321302-51321681)
chr1 (65-404)||(2424304-2424641)
chr1 (34-404)||(19524288-19524650)
chr1 (34-404)||(19525136-19525498)
chr1 (34-404)||(19525797-19526159)
chr1 (34-404)||(19526271-19526633)
chr1 (34-403)||(45825486-45825853)
chr1 (41-404)||(23275218-23275579)
chr1 (13-397)||(35257992-35258357)
chr1 (65-404)||(22524871-22525196)
chr1 (41-214)||(49857281-49857454)
chr1 (185-406)||(30890775-30890994)
chr1 (233-406)||(97015-97186)
chr1 (187-403)||(49857065-49857278)
chr1 (13-168)||(11196270-11196424)
chr1 (261-406)||(19156851-19156996)
chr1 (233-404)||(50343087-50343256)
chr1 (13-152)||(19526702-19526840)
chr1 (34-152)||(19524906-19525024)
chr1 (34-152)||(19525567-19525685)
chr1 (13-152)||(19526889-19527027)
chr1 (261-394)||(13639109-13639243)
chr1 (34-152)||(19524719-19524837)
chr1 (261-406)||(3731457-3731602)
chr1 (261-406)||(26876494-26876639)
chr1 (287-403)||(38126602-38126717)
chr1 (259-403)||(47656678-47656822)
chr1 (261-356)||(2366064-2366159)
chr1 (320-404)||(21141748-21141832)
chr1 (188-218)||(30890676-30890706)
[»] chr8 (31 HSPs)
chr8 (13-406)||(43212094-43212485)
chr8 (13-406)||(39252591-39252979)
chr8 (13-406)||(15035821-15036212)
chr8 (41-404)||(41249203-41249564)
chr8 (13-404)||(39846093-39846483)
chr8 (35-406)||(39938312-39938680)
chr8 (13-403)||(34822112-34822500)
chr8 (13-364)||(45064819-45065170)
chr8 (108-406)||(39602271-39602567)
chr8 (34-399)||(43188658-43189020)
chr8 (34-403)||(40076353-40076723)
chr8 (41-404)||(5303335-5303696)
chr8 (185-406)||(42484676-42484894)
chr8 (178-406)||(488795-489024)
chr8 (233-406)||(34369631-34369802)
chr8 (233-406)||(34370959-34371130)
chr8 (233-404)||(20858071-20858240)
chr8 (261-406)||(1053376-1053521)
chr8 (261-406)||(23021397-23021542)
chr8 (261-406)||(26660298-26660443)
chr8 (261-394)||(24626-24759)
chr8 (213-403)||(37327612-37327799)
chr8 (259-403)||(35552475-35552619)
chr8 (67-199)||(2984721-2984850)
chr8 (187-403)||(2984874-2985096)
chr8 (286-399)||(5677896-5678009)
chr8 (286-401)||(45128576-45128692)
chr8 (63-144)||(37327300-37327381)
chr8 (200-241)||(45128489-45128530)
chr8 (188-218)||(489057-489087)
chr8 (190-218)||(42484957-42484985)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (13-406)||(37021171-37021562)
chr4 (13-406)||(21021982-21022373)
chr4 (13-406)||(40357374-40357765)
chr4 (41-404)||(50275332-50275693)
chr4 (34-403)||(50902088-50902444)
chr4 (13-403)||(55406884-55407271)
chr4 (13-404)||(51683791-51684179)
chr4 (34-314)||(48255758-48256035)
chr4 (154-406)||(1088817-1089069)
chr4 (185-406)||(30725885-30726105)
chr4 (195-406)||(1308247-1308456)
chr4 (13-214)||(68109-68306)
chr4 (233-406)||(3184802-3184973)
chr4 (233-406)||(44679151-44679322)
chr4 (233-404)||(50194264-50194433)
chr4 (261-406)||(41798071-41798216)
chr4 (261-406)||(6180866-6181011)
chr4 (261-394)||(31422540-31422673)
chr4 (261-406)||(49165885-49166030)
chr4 (261-400)||(49091272-49091411)
chr4 (213-403)||(46436990-46437175)
chr4 (261-373)||(9892387-9892499)
chr4 (233-339)||(3185018-3185122)
chr4 (286-403)||(11083108-11083225)
chr4 (259-403)||(30704833-30704977)
chr4 (187-347)||(11049726-11049892)
chr4 (286-401)||(41932754-41932869)
chr4 (187-399)||(10752540-10752759)
chr4 (187-399)||(10966309-10966528)
chr4 (187-318)||(14316131-14316252)
chr4 (74-164)||(21537868-21537958)
chr4 (233-335)||(50022741-50022841)
chr4 (154-218)||(30726162-30726226)
chr4 (100-199)||(11049916-11050012)
chr4 (63-144)||(46436761-46436842)
chr4 (166-215)||(10752761-10752810)
chr4 (166-215)||(10966530-10966579)
chr4 (188-218)||(1308542-1308572)
chr4 (286-348)||(21537621-21537683)
chr4 (185-223)||(21537762-21537799)
chr4 (189-241)||(41932915-41932967)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (13-406)||(17835665-17836056)
chr7 (13-403)||(37340893-37341281)
chr7 (13-404)||(27452714-27453103)
chr7 (13-404)||(34738955-34739341)
chr7 (13-404)||(9493900-9494280)
chr7 (76-406)||(10517546-10517874)
chr7 (34-356)||(36978207-36978526)
chr7 (36-324)||(47672271-47672547)
chr7 (185-406)||(15073361-15073582)
chr7 (185-406)||(42507170-42507391)
chr7 (34-173)||(47776943-47777082)
chr7 (233-406)||(46739606-46739777)
chr7 (143-404)||(39461169-39461435)
chr7 (233-404)||(16677837-16678006)
chr7 (233-404)||(17652073-17652242)
chr7 (233-404)||(19798081-19798250)
chr7 (233-404)||(5540670-5540838)
chr7 (34-158)||(14689405-14689529)
chr7 (261-406)||(17462381-17462526)
chr7 (261-406)||(17590688-17590833)
chr7 (261-406)||(41881342-41881487)
chr7 (261-406)||(48404209-48404354)
chr7 (221-404)||(47777047-47777228)
chr7 (261-394)||(9370478-9370611)
chr7 (261-406)||(35609502-35609647)
chr7 (259-403)||(14689254-14689397)
chr7 (63-144)||(556121-556202)
chr7 (154-218)||(42507448-42507512)
chr7 (154-218)||(15073649-15073713)
chr7 (41-97)||(39461126-39461182)
chr7 (361-404)||(47672217-47672260)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (13-406)||(14715-15106)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (13-406)||(8579599-8579990)
chr5 (34-406)||(13890-14259)
chr5 (13-403)||(8701320-8701708)
chr5 (13-406)||(7757913-7758285)
chr5 (13-403)||(42941583-42941971)
chr5 (13-401)||(28877231-28877617)
chr5 (13-403)||(38968687-38969075)
chr5 (34-404)||(42537758-42538126)
chr5 (34-403)||(17658931-17659294)
chr5 (185-395)||(28240927-28241138)
chr5 (189-406)||(27672745-27672958)
chr5 (233-404)||(5197748-5197917)
chr5 (233-406)||(30705911-30706082)
chr5 (261-406)||(19040193-19040338)
chr5 (213-403)||(40624023-40624211)
chr5 (301-403)||(19228043-19228145)
chr5 (63-144)||(40624389-40624470)
chr5 (188-218)||(28241227-28241257)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (36-383)||(6319680-6320025)
chr6 (13-245)||(31769294-31769526)
chr6 (13-214)||(24088066-24088266)
chr6 (187-403)||(24087849-24088063)
chr6 (261-406)||(27617567-27617712)
chr6 (261-406)||(6202000-6202145)
chr6 (261-406)||(11688967-11689112)
chr6 (261-406)||(22302032-22302177)
chr6 (261-406)||(30828728-30828873)
chr6 (262-403)||(24722705-24722846)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (41-403)||(10881-11238)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (14-136)||(7937-8059)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (185-296)||(1-107)
scaffold0293 (154-218)||(164-228)
[»] scaffold0238 (1 HSPs)
scaffold0238 (287-404)||(18051-18168)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 45429179 - 45429570
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429179 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 45429278  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429279 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 45429378  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429379 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 45429476  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45429477 aggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 45429570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Original strand, 39948189 - 39948578
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39948189 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttatt 39948288  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948289 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatggtcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 39948388  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39948389 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttttttattt--tttgtgtagatatggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggt 39948486  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39948487 aggcgtgcgatgactcaaagccaccggagggaaaggcagagcggccacatcccaaagaggggtaaaggtcggaggggagatggttcagggag 39948578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 28469229 - 28469620
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28469229 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 28469328  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28469329 gtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtagttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaat 28469428  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28469429 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtttattttat--tttattttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagataattggtggt 28469526  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28469527 aggcgtgcgatgacccagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 28469620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 45136787 - 45136401
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45136787 gatggacacaaatgattaagt-gtatataaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 45136689  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45136688 gtaatgatgattatattgaatgattttagg-tatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgag-ttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 45136591  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  45136590 gtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgttcaatctaagatgattggtggt 45136493  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  45136492 aggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagagacaaagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggatggatggttcagggag 45136401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 22686967 - 22687201
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22686967 gatggacacaaattatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttgattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttatt 22687066  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22687067 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaat 22687166  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22687167 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt 22687201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32955843 - 32955648
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955843 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 32955744  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32955743 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 32955648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10828268 - 10828096
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  10828268 aatgatgttaattttattatttttt-tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgattcaaag 10828170  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828169 ccaccggagggagaggcagagcggtcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 10828096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 406
Target Start/End: Original strand, 17421286 - 17421508
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccgatcaggac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||   | | | ||||||||||||||||||||    
T  17421286 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatataaatttt-ttatttttattttttatagatatggccgatcaggac 17421384  T
Q  283 ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtc 382  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17421385 cccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccacatcccaaagaggggtagaggtc 17421484  T
Q  383 ggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    | || |||||||| ||||| ||||    
T  17421485 gaagaggagatggctcaggaagct 17421508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 231 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29400864 - 29400691
Alignment:
Q  231 gaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcag 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29400864 gaaatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatagccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcag 29400767  T
Q  331 agccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29400766 agccaccggagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggaagct 29400691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 15831969 - 15832114
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  15831969 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 15832068  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15832069 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 15832114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3939961 - 3939816
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  3939961 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcaaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 3939862  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3939861 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 3939816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30496168 - 30496023
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  30496168 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 30496069  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30496068 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 30496023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 43979371 - 43979516
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  43979371 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgctatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 43979470  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43979471 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 43979516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 5352806 - 5352951
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  5352806 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 5352905  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5352906 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 5352951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 43538959 - 43538826
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||    
T  43538959 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcatggagagacagagtgcccac 43538860  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43538859 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 43538826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 36655648 - 36655486
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||     
T  36655648 aatgatgttaattttataattttttttgt--agatatggccgatcaggatctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgaattaga- 36655552  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
          |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  36655551 ------gagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatgtttcagggag 36655486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 286 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 25515097 - 25514980
Alignment:
Q  286 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||   ||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  25515097 attgatccatctaagataattggtggtaggcgtgcgatgacacaaagccaccggaatgagaggcaagacgggcacatcccaaagaggggaagaggttgga 25514998  T
Q  386 ggggagatggttcaggga 403  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25514997 ggggggatggttcaggga 25514980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Original strand, 17421155 - 17421219
Alignment:
Q  154 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17421155 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 17421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25515184 - 25515143
Alignment:
Q  200 gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25515184 gtttaggtttaatgtttttgattaggttatggaaatgatgtt 25515143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 396
Target Start/End: Original strand, 42165751 - 42166133
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165751 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 42165850  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165851 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 42165950  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165951 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattatttt-tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 42166049  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggt 396  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42166050 aggcgtacgatgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggt 42166133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 3976295 - 3976686
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3976295 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatggtggacataaattttatt 3976394  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976395 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 3976494  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3976495 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 3976592  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3976593 aggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagaggagatggttcagggagct 3976686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 50963542 - 50963937
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattat----tgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattt 108  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50963542 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattgagtgtacgttaattatatattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatagacataaattt 50963641  T
Q  109 tattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963642 tattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtt 50963741  T
Q  209 taatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattgg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50963742 taatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggtcgatcaggaccccattgatccatctaagatgattgg 50963839  T
Q  309 tggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50963840 tggtaggcgtgcgatgactcagagctaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 50963937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47073691 - 47073300
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  47073691 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattctatt 47073592  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47073591 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttggtttaggtttaat 47073492  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47073491 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttagttttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattggtagt 47073394  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47073393 aggtgtgcgatgactcagagtcaccggagggagaggcagagcagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 47073300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49268732 - 49268364
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  49268732 tgtatagaaatgattatgtgtatgttaattattggatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattaaattgtaatgatgattatattgaat 49268633  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49268632 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 49268533  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49268532 atgatgttaattttattattttgt--gtgtagatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagc 49268435  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49268434 caccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaacaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggag 49268364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4007807 - 4007469
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007807 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 4007708  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007707 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 4007608  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4007607 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtatagatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggt 4007510  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagag 353  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4007509 aggcgtacgatgactcagagccaccggatggagaggcagag 4007469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 65 - 404
Target Start/End: Original strand, 597541 - 597878
Alignment:
Q  65 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  597541 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 597640  T
Q  165 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  597641 tatacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttgtgta 597738  T
Q  265 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  597739 gatatggccgaccaggaccccattgatccatctaaaatgatttgtggtaggcgagcgatgacctagagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcc 597838  T
Q  365 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597839 caaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 597878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 50216403 - 50216036
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  50216403 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaatgatgaataatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgta-tgttgattatattgaat 50216305  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  50216304 gatttaaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttagtgagtttgattatgtttatgtttagtttagatttaatgtgtttgattatgttatggaa 50216205  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgt--gtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcaga 331  Q
    |||||||||||||| || |||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50216204 atgatgttaattttttttttttttttttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaa 50216105  T
Q  332 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcag 400  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50216104 gtcatcggagggacaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcag 50216036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30255486 - 30255099
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255486 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 30255388  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  30255387 gtaatgatgattatatcgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgttaaatgatgtttatgtttagtttaggtttaat 30255288  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255287 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattt--tttgtgcagatatgaccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 30255190  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||| || ||||||| || |||||  ||| ||||||||| || || ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30255189 aggtgtgcgatgacccaaagccattggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagaagggaagaggtcggaggggagatggttcaggga 30255099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20917499 - 20917113
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917499 gatggacacaaatgattaagt-gtacagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 20917401  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20917400 gcaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgatcatgcttatgtttagtttaggtttaat 20917301  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||| | ||| || |||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20917300 gtgtttgatta-gttatggaaatgatgttaattt--tttttttttttgtgtagatatgtctgataagaacccggttgatccatctaagatgattgctggt 20917204  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20917203 aggcgtgcgatgactcagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggtggatggttcaggga 20917113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20926461 - 20926075
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20926461 gatggacacaaatgattaagt-gtacagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 20926363  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  20926362 gcaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgatcatgcttatgtttagtttaggtttaat 20926263  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||| | ||| || |||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20926262 gtgtttgatta-gttatggaaatgatgttaattt--tttttttttttgtgtagatatgtctgataagaacccggttgatccatctaagatgattgctggt 20926166  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  20926165 aggcgtgcgatgactcagagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaagggtggatggttcaggga 20926075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 36 - 403
Target Start/End: Original strand, 42756762 - 42757128
Alignment:
Q  36 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756762 tatagaaatgattaagcgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 42756861  T
Q  136 ttttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 235  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42756862 ttttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttaaaaaatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 42756961  T
Q  236 gatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcca 335  Q
    |||||||||||| || | || | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  42756962 gatgttaatttt-ttttattttttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagcca 42757060  T
Q  336 ccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  42757061 ccggaaggagagacaaagcgggcacatcccaaagaagggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 42757128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 41 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 49195922 - 49195561
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49195922 aaatgattaagtgtatgtaaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 49195823  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49195822 ggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 49195723  T
Q  241 taa-ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgg 339  Q
    ||| |||||  | |||   |||||||||||| | |||||| | |   ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49195722 taatttttaaaaattt---tgtgtagatatgtctgatcagaatccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgtgcgatgactcagagccaccgg 49195626  T
Q  340 agggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    | ||||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49195625 aaggagagcgaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 49195561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 326
Target Start/End: Original strand, 48889323 - 48889633
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889323 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgcagtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 48889421  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48889422 gtaatgatgattatattgaattattttaggttatggaaatgatgttcattgctttacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaat 48889521  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48889522 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattt--tttgtgtagatatggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggt 48889619  T
Q  313 aggcgttcgatgac 326  Q
    |||||| |||||||    
T  48889620 aggcgtgcgatgac 48889633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 37 - 404
Target Start/End: Original strand, 48563539 - 48563908
Alignment:
Q  37 atagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563539 atagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttatgttattatgaaaatgatgggcataaattttattgtaatgatgattatattgaatgat 48563638  T
Q  137 tttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatg 236  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48563639 tttaagttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatg 48563738  T
Q  237 atgttaa--ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcc 334  Q
    |||||||  ||||| | |||| | |||||||||||    |||||| ||     | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  48563739 atgttaattttttaattttttttttgtgtagatatttatgatcagaactcgggtaatccatctaagatgattggtggtaggcatgcgataactcaaagcc 48563838  T
Q  335 accggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  48563839 accggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaataggggaagaggtcggagggtggatggttcaaggag 48563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Original strand, 44230302 - 44230679
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  44230302 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattacggaaattatggacataaattttatt 44230400  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||    
T  44230401 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcaatgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttat-----------gtttaat 44230489  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |       |||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44230490 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttagtttta--aaaaaaattgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaaaatgattgctggt 44230587  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     ||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44230588 cggcgagcaatgactcagagcaaccggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 44230679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Original strand, 36128406 - 36128577
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  36128406 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggctgattaggacctcattgattcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcggag 36128503  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36128504 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 36128577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2274188 - 2274017
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  2274188 aatgatattaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaccccattgattcatctaagatgattgggggtaggcgtgcgataactcagag 2274091  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2274090 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 2274017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42805745 - 42805586
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42805745 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgatggacataaattttatt 42805647  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtactttt 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42805646 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtactttt 42805586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Original strand, 16611891 - 16612062
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16611891 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattagtggtaggcgtgcgatgactcagag 16611988  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16611989 ccaccagaggcagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtacaggtcggaggggagatggttcagggagct 16612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22047362 - 22047191
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22047362 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaagaccccattgatccatctaagatgattagtggtaggcgtgcgatgactcagag 22047265  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22047264 ccaccagaggcagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtacaggtcggaggggagatggttcagggagct 22047191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 259 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 52390629 - 52390482
Alignment:
Q  259 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52390629 tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagagccaccggagggagaagcagagcggcc 52390530  T
Q  359 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52390529 acatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaaggagct 52390482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 20351413 - 20351582
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20351413 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgataaggaccccgttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 20351510  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20351511 ccacctgagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 20351582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17567361 - 17567191
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtgg-taggcgttcgatgactcaga 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  17567361 aatgatgttaattttataattttttgtgt--agatatggccgatcagaaccccattgatccatctaagatgattggggggtaggcgtgcgatgactcaga 17567264  T
Q  332 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17567263 gccaccggagggagagtcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggag 17567191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 262 - 406
Target Start/End: Original strand, 29009712 - 29009856
Alignment:
Q  262 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29009712 gtagatatggccgatcaggaccccattgatcaatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagcggccaca 29009811  T
Q  362 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29009812 tcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 29009856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 41613142 - 41613311
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41613142 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccaatcaggaccccattgatccacccaagatgattggtggtaggcctgcgatgactcagag 41613239  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  41613240 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggatggtggatagttcagggag 41613311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42903411 - 42903266
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  42903411 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 42903312  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42903311 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 42903266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 49143684 - 49143539
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  49143684 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 49143585  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49143584 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 49143539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 34046227 - 34046372
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  34046227 tgtagatatggccgatcaggaccccattaatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 34046326  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34046327 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 34046372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 46701247 - 46701102
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  46701247 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 46701148  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46701147 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 46701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 50480028 - 50479883
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  50480028 tgtagatatgaccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 50479929  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50479928 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 50479883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Original strand, 54682060 - 54682171
Alignment:
Q  116 atgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54682060 atgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtac-----atgagtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaatgtg 54682154  T
Q  216 tttgattaggttatgga 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  54682155 tttgattaggttatgga 54682171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 46389802 - 46389947
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  46389802 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcatgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 46389901  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46389902 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 46389947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Original strand, 54386975 - 54387108
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||    
T  54386975 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcggggagagacagagtgcccac 54387074  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54387075 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 54387108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 403
Target Start/End: Original strand, 48889636 - 48889673
Alignment:
Q  366 aaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  48889636 aaagaggggaagaggtcggaggagagatggttcaggga 48889673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31783202 - 31782820
Alignment:
Q  23 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31783202 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 31783103  T
Q  123 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31783102 ttatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttagttttaatgtgtttgatt 31783003  T
Q  223 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31783002 aggttatggaaatgatgttaattttattatttt-tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 31782904  T
Q  323 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31782903 tgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaagggagatggttcagggagct 31782820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 404
Target Start/End: Original strand, 52802730 - 52803110
Alignment:
Q  23 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatga 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52802730 aatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtgtgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgattgacataaattttattgtaatgatga 52802829  T
Q  123 ttatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatt 222  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52802830 ttatattgaatgattttatgttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagcgtaggtttaatgtgtttgatt 52802929  T
Q  223 aggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcga 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52802930 aggttatggaaatgatgttaattttattattttttgtgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcga 52803029  T
Q  323 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52803030 tgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaaga-gggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 52803110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 41 - 404
Target Start/End: Original strand, 47502901 - 47503262
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47502901 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 47503000  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 240  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47503001 tgttatggaaatgatattcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaatatgtttgattaggttatggaaatgatgt 47503100  T
Q  241 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 340  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47503101 taattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggattccattgatcgatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccgga 47503198  T
Q  341 gggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47503199 gggagagacaaagcggccacatctcaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggag 47503262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 51321302 - 51321681
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321302 gatggacacaaatgattaagt-gtataaaaatgattaagcgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 51321400  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321401 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 51321500  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321501 gtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattt----------tttgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 51321590  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51321591 aggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcaggga 51321681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 65 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 2424641 - 2424304
Alignment:
Q  65 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2424641 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgt 2424542  T
Q  165 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||    
T  2424541 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattt--tttgtgta 2424444  T
Q  265 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 364  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  2424443 gatatggccgaccatgaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgagcgatgacccagagccaccggagggagaggtagagcgcccacatcc 2424344  T
Q  365 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2424343 caaagaggggtagaggtcggaggggagatgattcagggag 2424304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19524650 - 19524288
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19524650 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19524551  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19524550 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19524457  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19524456 atgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19524359  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19524358 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaaggggagaggtcggaggggagatggttcagggag 19524288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19525498 - 19525136
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525498 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19525399  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525398 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19525305  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19525304 atgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19525207  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525206 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 19525136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19526159 - 19525797
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526159 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19526060  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526059 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19525966  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19525965 atgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19525868  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19525867 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 19525797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 19526633 - 19526271
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526633 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19526534  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19526533 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttttattatgttta------gtttaggtttaatgtgttttattaggttatggaa 19526440  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19526439 atgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggaatccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagc 19526342  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526341 caccggagagagaggcagagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 19526271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 403
Target Start/End: Original strand, 45825486 - 45825853
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825486 tgtataaaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 45825585  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45825586 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 45825685  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||  |||  || | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45825686 atgatgttaattt--ttaaattttttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagc 45825783  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||||||| |||||| || || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  45825784 caccggaaggagagacaaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggttggatggttcaggga 45825853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 41 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23275579 - 23275218
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275579 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 23275480  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 240  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23275479 agttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 23275380  T
Q  241 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 340  Q
    ||| ||| | ||||  | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |    
T  23275379 taaatttttaattt--tttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccatcgaa 23275282  T
Q  341 gggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  23275281 aggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtggatggttcagggag 23275218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 35258357 - 35257992
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||    
T  35258357 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggtt-----ggaaatgatggacataaaatttatt 35258264  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35258263 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattttgtttatgtttagtttaggtttaat 35258164  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||          | ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35258163 gtgtttgattaggttatggaaataatgttaattt----------tttgtgtagatatg---gatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 35258077  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggtt 397  Q
    ||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  35258076 aggtgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaaaggaagaggtcggaggggagatggtt 35257992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 404
Target Start/End: Original strand, 22524871 - 22525196
Alignment:
Q  65 ttgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 164  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22524871 ttgaataatgtttaggttattatggaaatggtggatataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatg-aaatgatgttcattgt 22524969  T
Q  165 tgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgta 264  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |    
T  22524970 tgtacttttaaggagtttgattatgtttatgttta-----------atgtgtttgattaggttatggaaatgatgctaattttattattttttctgt--a 22525056  T
Q  265 gatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 364  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22525057 gatatggccgaccaggatcccattaatccatctagaatgattggtggtaggcgagcgatgaccaagagccaccgaagggagaggcagagcgtccacatcc 22525156  T
Q  365 taaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22525157 caaagaggggtagaggtcggaagggagatggttcagggag 22525196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 41 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 49857454 - 49857281
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49857454 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatggtggacataaattttattgcaatgatgattatattgaatgatttta 49857355  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49857354 ggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgt 49857281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 185 - 406
Target Start/End: Original strand, 30890775 - 30890994
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||  |||||||||||||||||||      
T  30890775 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttgt--agatatggccgatcaggactc 30890872  T
Q  285 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30890873 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaaggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 30890972  T
Q  385 aggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  30890973 aggggagatggctcaggaagct 30890994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 97186 - 97015
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  97186 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggctgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgactcagag 97089  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  97088 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggtgagatggttcagggagct 97015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 49857278 - 49857065
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 286  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  49857278 atgtttatgtttagtctaggtttaatgtgttttattaggttatggaaatgatgtttattttttttattttt-tgtgtagatatggccgatcaagacccca 49857180  T
Q  287 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 386  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||| |||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49857179 ttgatccatctaagatgattggtgataggcgtgtgatgacccaaagccatcggaag--gaggcaaagcgggcacatcctaaagaggggaagaggtcggag 49857082  T
Q  387 gggagatggttcaggga 403  Q
    |||||||||||||||||    
T  49857081 gggagatggttcaggga 49857065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 11196270 - 11196424
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11196270 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgtttaagtgtatattaattattgaatgatgtttaggttattatggaactaatggacataaattttatt 11196368  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgta 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11196369 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgta 11196424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 19156851 - 19156996
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156851 tgtagatatggccgatcatgaccccattgatccatcaaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 19156950  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19156951 atcccaaagaggggtagaggtcggatgggagatggctcaggaagct 19156996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 50343256 - 50343087
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  50343256 aatgatgttaattttataattttttctgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggtctgcgatgactcagag 50343159  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  50343158 ccaccggagggagcggcaaagcggccacatcccaaagaggggtagaggccggagggtggatggttcagggag 50343087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19526840 - 19526702
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526840 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 19526742  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaat 152  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19526741 gtaatgttgattatattgaatgattttaggttatggaaat 19526702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19525024 - 19524906
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525024 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19524925  T
Q  134 gattttaggttatggaaat 152  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19524924 gattttaggttatggaaat 19524906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19525685 - 19525567
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19525685 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19525586  T
Q  134 gattttaggttatggaaat 152  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19525585 gattttaggttatggaaat 19525567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19527027 - 19526889
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19527027 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgtaaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 19526929  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaat 152  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19526928 gtaatgttgattatattgaatgattttaagttatggaaat 19526889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13639243 - 13639109
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga-gggagaggcagagcggcca 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  13639243 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaggggagagacagagcggcca 13639144  T
Q  360 catcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13639143 catcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 13639109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19524837 - 19524719
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19524837 tgtatataaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttatgttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattgaat 19524738  T
Q  134 gattttaggttatggaaat 152  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19524737 gattttaggttatggaaat 19524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3731602 - 3731457
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  3731602 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 3731503  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3731502 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 3731457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 26876494 - 26876639
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||    
T  26876494 tgtagatatggccgatcaggaccccatttatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaacgcagggagagacagagtgcccac 26876593  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26876594 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 26876639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 38126717 - 38126602
Alignment:
Q  287 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38126717 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggag 38126618  T
Q  387 gggagatggttcaggga 403  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38126617 ggg-gatggttcaggga 38126602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 403
Target Start/End: Original strand, 47656678 - 47656822
Alignment:
Q  259 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 358  Q
    |||||||||||| | |||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || |    
T  47656678 tgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccagctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagtgggc 47656777  T
Q  359 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||    
T  47656778 acatcccaaagaggggaagaggtcggaggtgggatgattcaggga 47656822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 261 - 356
Target Start/End: Original strand, 2366064 - 2366159
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcgg 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2366064 tgtagatattgccgatcaggaccccattgatccatctcagatgattggtggtaggcgtgccatgactcatagccaccgtagggagaggcagagcgg 2366159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 404
Target Start/End: Original strand, 21141748 - 21141832
Alignment:
Q  320 cgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  21141748 cgatgacttagagccaccggagggagaggcaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtctgagggtggatggttcagggag 21141832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Original strand, 30890676 - 30890706
Alignment:
Q  188 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30890676 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 30890706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 43212094 - 43212485
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212094 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttatt 43212193  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212194 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtgcttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 43212293  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212294 gtgtttgattaggttatgaagatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 43212391  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43212392 aggtgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 43212485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 39252591 - 39252979
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252591 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgatcaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 39252690  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252691 gtaatgatgattatatt-aatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 39252789  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252790 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt----tgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 39252885  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    || ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39252886 agacgtgcaatgactcagagccaccagagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 39252979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15036212 - 15035821
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15036212 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttatt 15036113  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15036112 gtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatcagtttgattttgtttatgtttagtttaggttgaat 15036013  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15036012 gtgtttgattaggttatgaaaatgatattaattttatt-ttttgt-tttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 15035915  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15035914 aggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 15035821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 41 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 41249564 - 41249203
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41249564 aaatgattaagtgtatgttaattaatgagtgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 41249465  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 240  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41249464 ggttatggaaatgatgttcattgctgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttaattaggttatggaaatgatgt 41249365  T
Q  241 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 340  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  41249364 taattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccgga 41249267  T
Q  341 gggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41249266 gggagaggcagagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcggaggggagatagttcagggag 41249203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 39846483 - 39846093
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39846483 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacatacattttatt 39846385  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846384 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 39846285  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39846284 ttgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 39846187  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagg--gagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |  ||||||||||||||    
T  39846186 aggcgtgcaatgactcagagccatcggaggaagagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggtaaaggtcgtagtgtggatggttcagggag 39846093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 35 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39938680 - 39938312
Alignment:
Q  35 gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatg 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39938680 gtatagaaatgattaagtgtgtgttaattaatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggaaataaattttattgtaatgttgattatattgaatg 39938581  T
Q  135 attttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaa 234  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39938580 aatttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgcttatgtttatgtttagtttatgtttaatgtgtttgattaggttatgaaaa 39938481  T
Q  235 tgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcc 334  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  39938480 tgatgttaattttattattt--tttgtgtagata-ggccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgactcagagtc 39938384  T
Q  335 accggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39938383 accggagggagaggtagagcggccacgtcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 39938312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 34822500 - 34822112
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34822500 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 34822402  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34822401 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 34822302  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||    
T  34822301 ttgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taattttgtttttgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgatatgtggt 34822203  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  34822202 aggcgtgcgatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 34822112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 45064819 - 45065170
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45064819 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttatt 45064918  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttat-----gtttagtttaggt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||     |||||||||||||    
T  45064919 gtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttagtttaggt 45065018  T
Q  208 ttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattg 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45065019 ttaatgtgtttgattaggttatagaaatgatgttaatttttttttttt-----tgtagatatggctgatcaggaccccattgatccatctaagatgattg 45065113  T
Q  308 gtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcc 364  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45065114 gtggtaggcgtgcgatgactcagagtcaccggagggagaggcagagcggccacatcc 45065170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 108 - 406
Target Start/End: Original strand, 39602271 - 39602567
Alignment:
Q  108 ttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39602271 ttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggt 39602370  T
Q  208 ttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattg 307  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39602371 ttaatgtgtttgattaggttatcgaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtaggtatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattg 39602468  T
Q  308 gtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39602469 gtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttaagggagct 39602567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 399
Target Start/End: Original strand, 43188658 - 43189020
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43188658 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatgaacataaattttattgtaatgatgattattttgaat 43188757  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43188758 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtactttcaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaa 43188857  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    || ||||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43188858 ataatgttaattttttaattt--tttgtgaagatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcagagc 43188955  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttca 399  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  43188956 ca-gggatggagaggcaaagcggccacatcccaaagaagggtagaggtcggagggtggatggttca 43189020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40076723 - 40076353
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076723 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaagttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 40076624  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40076623 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 40076524  T
Q  234 atgatgttaa-ttttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    |||||||||| |||| || |||| | |||||||||||| | |||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  40076523 atgatgttaatttttttttttttttttgtgtagatatgtctgatcagaatctggttgatccatctaaaatgattggtggtaggcgtgtgatgactcaaag 40076424  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| | ||||||||| ||| | ||||| | ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  40076423 ccaccgaaaggagaggcaaagcaggcacattccaaataggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 40076353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 41 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5303696 - 5303335
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5303696 aaatgattaagtgtatgttaattattgaaagatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattaaattgaatgatttta 5303597  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 240  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5303596 agttacggaaatgatgttcattgttgtacttttaatatgtttgattatgtttatgtttagttttggtttaatgtgtttgattagcttatggaaatgatgt 5303497  T
Q  241 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 340  Q
    ||| ||| | ||||  | |||||||||||| | |||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5303496 taaatttttaattt--tttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatctatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagccaccgga 5303399  T
Q  341 gggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     ||||||||| ||||| ||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5303398 aggagaggcaaagcgggcacatcccaaagatgagaagaggtcggagggtggatggttcagggag 5303335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42484894 - 42484676
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||| |   |||||||||||||||||||||||     
T  42484894 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattatgttattgaaatgatgttaatttttttttttttt---tgtagatatggccgatcaggaccc 42484798  T
Q  285 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42484797 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagaacggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 42484698  T
Q  385 aggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  42484697 aggggagatggctcaggaagct 42484676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 489024 - 488795
Alignment:
Q  178 agtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccga 275  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | |||||||||||||||    
T  489024 agtttaattaggtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatattaatttt-ttatttttattttttgtagatatggccga 488926  T
Q  276 tcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggt 375  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  488925 tcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccacatcccaaagaggggt 488826  T
Q  376 agaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  488825 agaggtcggaggggagatggctcaggaagct 488795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34369802 - 34369631
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34369802 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgattaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 34369705  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34369704 tcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 34369631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34371130 - 34370959
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34371130 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgattaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 34371033  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34371032 tcaccggagggagaggcagagcgaccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 34370959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 20858071 - 20858240
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20858071 aatgatgttaattttataaatttttgtg--tagatatggccgatcagaaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 20858168  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  20858169 ccaccggagggagaggcaaagcggtcacatcccaaagaggggaagaggtcggagagtggatggttcagggag 20858240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 1053376 - 1053521
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  1053376 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 1053475  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1053476 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 1053521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23021542 - 23021397
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  23021542 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 23021443  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23021442 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 23021397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 26660298 - 26660443
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  26660298 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 26660397  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26660398 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 26660443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 24759 - 24626
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | ||||    
T  24759 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcccac 24660  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24659 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 24626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Original strand, 37327612 - 37327799
Alignment:
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  || | |||||||||||| | || || ||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  37327612 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtaaattttttaa--ttatttgtgtagatatgtctgagcatgacccgattgatccatctaagatgattggtgat 37327709  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37327710 aggcgtgcgatgactcagagtcatcggaaagagaggcaaag-gggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatggttcaggga 37327799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 403
Target Start/End: Original strand, 35552475 - 35552619
Alignment:
Q  259 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 358  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |    
T  35552475 tgtgtagatatgtctgatcagaacctggttgatccatctaagatgattggtggtagacgtgcgatgactcaaagccaccggaagaagaggcaaagcgggc 35552574  T
Q  359 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  35552575 acatcccaaagaggggaagaggtcggaggggggatggttcaggga 35552619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 199
Target Start/End: Original strand, 2984721 - 2984850
Alignment:
Q  67 gaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttg 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||       
T  2984721 gaatgatgtttaggttatgatggaaatgatgcacacaaattatattgaaatgatgattatatggaatggttttaggttatggaaatgatgttcattgg-- 2984818  T
Q  167 tacttttaatgagtttgattatgtttatgttta 199  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2984819 -aattttaatgtgtttgattatgtttatgttta 2984850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 403
Target Start/End: Original strand, 2984874 - 2985096
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||| | |||||||||        
T  2984874 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taattt--tttgtgtagatatgtctgatcaggaccagg 2984970  T
Q  283 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtag 377  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| || ||||| | || | ||||| | | ||  || || |  |||||||| ||    
T  2984971 ggcagctgattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtggtatgacacaaagccatcagaagaagaggaaaaacgcacaaataccgaagaggggaag 2985070  T
Q  378 aggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  2985071 aggtcggaggggggatggttcaggga 2985096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 399
Target Start/End: Original strand, 5677896 - 5678009
Alignment:
Q  286 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5677896 attgatccatctaagatgattggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggtaaagcgggaacatcccaaagaggggaagaggtcgga 5677995  T
Q  386 ggggagatggttca 399  Q
    |||| |||||||||    
T  5677996 ggggggatggttca 5678009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 286 - 401
Target Start/End: Original strand, 45128576 - 45128692
Alignment:
Q  286 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  45128576 attgatccatctaagatgattggtgataggcgtgagatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcaga 45128675  T
Q  386 ggggag-atggttcagg 401  Q
    |||| | ||||||||||    
T  45128676 ggggggaatggttcagg 45128692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Original strand, 37327300 - 37327381
Alignment:
Q  63 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 144  Q
    |||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37327300 tattcaataatgtttatgttatgatggaaatgatgcacataaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 37327381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Original strand, 45128489 - 45128530
Alignment:
Q  200 gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 241  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45128489 gtttatgtttaatgtttttgattaggttatggaaatgatgtt 45128530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 489087 - 489057
Alignment:
Q  188 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  489087 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 489057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42484985 - 42484957
Alignment:
Q  190 tttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42484985 tttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 42484957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37021562 - 37021171
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37021562 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 37021463  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021462 ataatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 37021363  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37021362 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtttattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 37021265  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37021264 aggcgtgcgatgactcagagccatcggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcagaggggagatggttcagggagct 37021171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21022373 - 21021982
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21022373 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 21022274  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21022273 gtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaat 21022174  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022173 gtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattt--tttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 21022076  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21022075 aggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggaagct 21021982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40357765 - 40357374
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40357765 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 40357666  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40357665 gtaatgatgattatattaaatgattttaggttatcgaaatgatgttcgttgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaat 40357566  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40357565 gtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattt--tttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 40357468  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  40357467 aggcgtgcgatggctcagggccactgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggcagatggctcaggaagct 40357374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 41 - 404
Target Start/End: Original strand, 50275332 - 50275693
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  50275332 aaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgttgattatattaaatgatttta 50275431  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 240  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275432 ggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgttcatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgt 50275531  T
Q  241 taattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccgga 340  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||  |||    
T  50275532 taattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaaaatgattggtggttggcgtgcgatgacccaaagccattgga 50275629  T
Q  341 gggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50275630 gggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 50275693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 403
Target Start/End: Original strand, 50902088 - 50902444
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50902088 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 50902187  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50902188 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattat-----------gtttaggtttaatgtgtttgattaggttatagaa 50902276  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  50902277 atgatgttaatcttattattt--tttttgtagatatgaccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaagcgtgcgatgactcagagc 50902374  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  50902375 caccagagggagaggcaaagcagccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 50902444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 55407271 - 55406884
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  55407271 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattgtggaaattattgacataaattttatt 55407173  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55407172 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 55407073  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  55407072 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-taaatttttg-gtgtagatatgtctgatcagaacccatttgatccatctaagatgattgctggt 55406975  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  55406974 aggtgtgcgatgactcagagccaccggaaggagaggcaaatcgggcacatcccaaagatgggaagaggtcggagggtggatggttcaggga 55406884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Original strand, 51683791 - 51684179
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683791 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 51683889  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51683890 gtaatgatgattatattgaatgattttaagttatggaaatgatgttcattgttgtacttttagtgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 51683989  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||  | | |||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  51683990 gtatttgattaggttatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttatgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggt 51684087  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| | ||||||||| || || | ||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  51684088 aggcgtgcgatgactcaaagctaccgaaaggagaggcaaagtgggcgcatcccaaagaggggaagaggtcagagggtggatggttcagggag 51684179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 34 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48256035 - 48255758
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48256035 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 48255936  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48255935 gattttaggttatggaaatgatgttcgttgttgtacttttaacgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 48255836  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtag 314  Q
    |||||||||||||| | ||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48255835 atgatgttaattttttaattt--tttgtgtatatatggccgatcaggacc-cattgatccatctaagatgattggtggtag 48255758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 154 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1089069 - 1088817
Alignment:
Q  154 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattatt 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  1089069 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaatttttttttt 1088970  T
Q  254 ttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagag 353  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1088969 ttttttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagag 1088870  T
Q  354 cggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1088869 cagccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 1088817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30726105 - 30725885
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  30726105 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaatttttttttttttttt-tgtagatatggccgatcaggaccc 30726007  T
Q  285 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 384  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30726006 cattgatccatcgaagataattggtggtaggcgcgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 30725907  T
Q  385 aggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||    
T  30725906 aggggagttggctcaggaagct 30725885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 195 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1308456 - 1308247
Alignment:
Q  195 gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatcca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1308456 gtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattattttttttgt--agatatggtcgatcaggaccccattgatcca 1308359  T
Q  295 tctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1308358 tcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaagtcggaggggagatg 1308259  T
Q  395 gttcagggagct 406  Q
    | ||||| ||||    
T  1308258 gctcaggaagct 1308247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 68109 - 68306
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  68109 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgatggacacaaattttatt 68207  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  68208 gtaataatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttca---ttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaat 68304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Original strand, 3184802 - 3184973
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3184802 aatgatgttaattttattattttttgtg--tagatatggccaatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtatgcgtgcgatgactcagag 3184899  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3184900 ccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcagaggggagatggttcagggagct 3184973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44679322 - 44679151
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  44679322 aatgatgttaattttattattttttatgt--agatattgccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtagtaggcatgcgatgactcagag 44679225  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44679224 ccaccggagggagaggcagagtggccacatcccaaagaagggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 44679151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 50194264 - 50194433
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50194264 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatgaccgatcaggatcccattgatccatctaagatgattggtggtaggtgtacgatgactcagag 50194361  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  50194362 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 50194433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41798216 - 41798071
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41798216 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccac 41798117  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  41798116 atcccaaagaggggtagaggtcgaagaggagatggctcaggaagct 41798071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6181011 - 6180866
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  6181011 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 6180912  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6180911 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 6180866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Original strand, 31422540 - 31422673
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  31422540 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagtcaccgcagggagagacagagtgcccac 31422639  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422640 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 31422673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 49165885 - 49166030
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  49165885 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccttcgaagatgattggtggtaggcgtgccataactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 49165984  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49165985 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 49166030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 400
Target Start/End: Original strand, 49091272 - 49091411
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||||    
T  49091272 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcaaggagagacagattgcccac 49091371  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcag 400  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49091372 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcag 49091411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Original strand, 46436990 - 46437175
Alignment:
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||  || ||||||||||||   || ||||     ||||||| |||||||||||||||||||    
T  46436990 gtgtttgattcggttatggaaatgatgtaaattttttaatt--gtttgtgtagatatgtttgagcaggcg---attgatctatctaagatgattggtggt 46437084  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  46437085 aggcgtgcgatgactcagagctaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatgattcaggga 46437175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9892499 - 9892387
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9892499 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgtcatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccac 9892400  T
Q  361 atcctaaagaggg 373  Q
    |||| ||||||||    
T  9892399 atcccaaagaggg 9892387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 3185122 - 3185018
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3185122 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccaatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtatgcgtgcgatgactcagag 3185025  T
Q  333 ccaccgg 339  Q
    |||||||    
T  3185024 ccaccgg 3185018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 286 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11083225 - 11083108
Alignment:
Q  286 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  11083225 attgatccatctaagatgattggtggtaggagtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggcagaggtcaga 11083126  T
Q  386 ggggagatggttcaggga 403  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11083125 ggggggatggttcaggga 11083108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 403
Target Start/End: Original strand, 30704833 - 30704977
Alignment:
Q  259 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 358  Q
    |||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| | ||||||||| ||||| |    
T  30704833 tgtgtagatatgtctgatcagaacccaattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgttgactcaaaaccaccgaaaggagaggcaaagcgggc 30704932  T
Q  359 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  30704933 acatcccaaagaggggaagacgtgggaggggggatggttcaggga 30704977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11049892 - 11049726
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggac---- 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||   |||||||||||| | |||||||||        
T  11049892 atgtttatgttcagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtgaattttttaatttt---tgtgtagatatgtctgatcaggaccagg 11049796  T
Q  283 -----ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagag 347  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| | ||||||    
T  11049795 ggcaacccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgctatgacacaaagccaccgaaaggagag 11049726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 286 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41932869 - 41932754
Alignment:
Q  286 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgga 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  41932869 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacacaaagccaccggaaggagaggcaaggcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgga 41932770  T
Q  386 ggggagatggttcagg 401  Q
    |||| |||| ||||||    
T  41932769 ggggggatgtttcagg 41932754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10752759 - 10752540
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctc- 285  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||  ||||||| | ||||| ||||       
T  10752759 atgtttatgtttaatctaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttttaaatttttgtgt--agatatgtctgatcaagaccaag 10752662  T
Q  286 --------attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtag 377  Q
            | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  10752661 ggccaccgactgatccatctaagatgatcggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaag 10752562  T
Q  378 aggtcggaggggagatggttca 399  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  10752561 atgtcggaggggggatggttca 10752540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 10966528 - 10966309
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctc- 285  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||  ||||||| | ||||| ||||       
T  10966528 atgtttatgtttaatctaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttttaaatttttgtgt--agatatgtctgatcaagaccaag 10966431  T
Q  286 --------attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtag 377  Q
            | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  10966430 ggccaccgactgatccatctaagatgatcggtggtaggtgtgcgatgacacaaagccatcagaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaag 10966331  T
Q  378 aggtcggaggggagatggttca 399  Q
    | |||||||||| |||||||||    
T  10966330 atgtcggaggggggatggttca 10966309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 318
Target Start/End: Original strand, 14316131 - 14316252
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | |||||||||||| | ||||||||||  |    
T  14316131 atgtttatgtttagtctaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattt----------tttgtgtagatatgtctgatcaggaccgga 14316220  T
Q  287 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgt 318  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14316221 ttgatctatctgagatgattggtggtaggcgt 14316252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 74 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21537958 - 21537868
Alignment:
Q  74 gtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgt 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21537958 gtttaggttatgatggaaatgatgcacacaaattatattgaaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgtttattgt 21537868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 50022841 - 50022741
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  50022841 aatgatgttaattttataattttttgtgt--agatatgaccgatcaggaccccattgatccatttaagatgattggtggtaggcgtgcaatgactcaaag 50022744  T
Q  333 cca 335  Q
    |||    
T  50022743 cca 50022741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30726226 - 30726162
Alignment:
Q  154 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726226 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 30726162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11050012 - 11049916
Alignment:
Q  100 cataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgttta 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11050012 cataaattatattgtaatgatgatgatatggactagttttaggttatggaaatgatgttca---ttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgttta 11049916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Original strand, 46436761 - 46436842
Alignment:
Q  63 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46436761 tattgaatgatgtttatgttatgatggaaattatacacagaaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 46436842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10752810 - 10752761
Alignment:
Q  166 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 215  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752810 gtacttataatttgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 10752761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10966579 - 10966530
Alignment:
Q  166 gtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 215  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10966579 gtacttataatttgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtg 10966530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1308572 - 1308542
Alignment:
Q  188 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1308572 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 1308542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21537683 - 21537621
Alignment:
Q  286 attgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagagg 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| || || |||| || |||||||    
T  21537683 attgatccatctaagataattggtggtaggcgtgctatgacacaaagtcaccagaaggagagg 21537621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21537799 - 21537762
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgatta 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21537799 ttatgttta-gtttagtttaggtttaatgtgtttgatta 21537762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41932967 - 41932915
Alignment:
Q  189 gtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtt 241  Q
    |||||||||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41932967 gtttatgttatgtttaggtataacgttttttattaggttatggaaatgatgtt 41932915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 17835665 - 17836056
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835665 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttatttattgaataatatttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 17835764  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835765 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 17835864  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17835865 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggtcgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 17835962  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17835963 aggcgtgcgatgactcagagccaccggaggaagaggcagagcgaccacatcgcaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttgggggagct 17836056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 37340893 - 37341281
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340893 gatggacacaaatgattaagt-gtgtagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 37340991  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37340992 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 37341091  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37341092 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatttt-ttaatttttttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 37341190  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37341191 aagcgtgcgatgactcaaagccaccggaagcagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgaaggggggatggttcaggga 37341281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 27453103 - 27452714
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27453103 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatgaacataaattttatt 27453005  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27453004 ttaatgatgattatattgaatgatttttggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaagtttaat 27452905  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27452904 gtgtttgattaggttttggaaatgatgttaattttattatttt-tttgtatagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtgtt 27452806  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  27452805 aggcgtgtaatgactcagagccaccagagggagaggcaaagcggccacatcccaaaaaggggtagagatcggagggtggatggttcagggag 27452714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Original strand, 34738955 - 34739341
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34738955 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaaataatgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 34739053  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739054 gtaatattgattatattgaatgatt--aggttatggaaatgatgttcatcgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 34739151  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  34739152 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtaaatatggccgatcaggaccccgttgatccatctaaaatgattggtggt 34739249  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739250 aggcgtgcgatgacccaaagccaccagagggagaggcagagcggccacattccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 34739341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 9494280 - 9493900
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494280 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 9494182  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9494181 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttagatttaat 9494082  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9494081 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattt----------tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 9493992  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9493991 aggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcgatggggagatggttcagggag 9493900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Original strand, 10517546 - 10517874
Alignment:
Q  76 ttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10517546 ttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgaaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgaggttcattgttgtacttttaa 10517645  T
Q  176 tgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10517646 tgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccga 10517743  T
Q  276 tcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggt 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10517744 tcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactgagagccaccatagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggt 10517843  T
Q  376 agaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10517844 agaggtcggaggggagatggttcagggagct 10517874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 36978207 - 36978526
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36978207 tgtatagaaatgattaagtgtatattaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataatttttattgtaatgatgattatgttgaat 36978306  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36978307 gattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtac-tttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgcaa 36978405  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||  |||||| || |||    
T  36978406 atgatgttaattttttaattt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccccattgatctatccaagatgattgacagtaggcgtgtgatgacccaaagc 36978503  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcgg 356  Q
    |||||||  |||||||| |||||    
T  36978504 caccggaatgagaggcaaagcgg 36978526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 47672547 - 47672271
Alignment:
Q  36 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47672547 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgttt----------ggaaatgatgaacataaattttattgtaatgatgattatatttaatga 47672458  T
Q  136 ttttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47672457 ttttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatgaaaat 47672358  T
Q  236 gatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatg 324  Q
    |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47672357 gatgttaattttataattt--tttgtgtagatatggccgatcaataccccattgatccatctaagatgattggttgtaggcgtgcgatg 47672271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15073582 - 15073361
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||||||     
T  15073582 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttttgtagatatggccgatcaggaccc 15073483  T
Q  285 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15073482 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcgg 15073383  T
Q  385 aggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  15073382 aggggagatggctcaggaagct 15073361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42507391 - 42507170
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||||| |||||||||||     
T  42507391 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttttttttttttttttgtagatatggtcgatcaggaccc 42507292  T
Q  285 cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcgg 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  42507291 cattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgcgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcag 42507192  T
Q  385 aggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  42507191 aggggagatggctcaggaagct 42507170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Original strand, 47776943 - 47777082
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47776943 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 47777042  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtactttt 173  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47777043 gattttaggttatggaaatgatgtttattgttgtactttt 47777082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 46739777 - 46739606
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  46739777 aatgatgttaattttattattttttgtgt--agatatggccgatcaggactccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgaatcagag 46739680  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46739679 ccaccggagggagagacagagcggccacatcccaaagcggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 46739606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 143 - 404
Target Start/End: Original strand, 39461169 - 39461435
Alignment:
Q  143 ttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgtta 242  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39461169 ttatggaaatgatgttcattgtcgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaacgtgtttgattaggttatggaaatgatgtta 39461268  T
Q  243 attt-----tattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccacc 337  Q
    ||||     ||  ||      |||||||||||| | |||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39461269 atttaaaaataaaataaaaattgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattgctggtaggcgagcgatgactcagagccacc 39461368  T
Q  338 ggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  39461369 ggagggagaggcaaagcgggcacatcccaaaaaggggaaaaggtcggagggtggattgttcagggag 39461435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 16677837 - 16678006
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16677837 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccattgatgcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 16677934  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16677935 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 16678006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 17652073 - 17652242
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17652073 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccattgatgcatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 17652170  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17652171 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 17652242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 19798081 - 19798250
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19798081 aatgatgttaattttataattttttgtg--tagatatggccgatcaggaccccatcgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 19798178  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  19798179 ccaccggagggagaggcaaagcggccacatcccaaagaggggaagaggtcggatggtggatggttcagggag 19798250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 5540838 - 5540670
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5540838 aatgatgttaattttataattttttctgt--agatatggccgatcaggccc-cattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 5540742  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5540741 ccaccggagggagaggaaaagtggccacatcccaaagaggggtagaggtcggagggtggatggttcagggag 5540670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 14689529 - 14689405
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14689529 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattatattgatt 14689430  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgtt 158  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||    
T  14689429 gatttgaggttatggaaatgatgtt 14689405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17462526 - 17462381
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17462526 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 17462427  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17462426 attccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 17462381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 17590688 - 17590833
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17590688 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccac 17590787  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17590788 attccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 17590833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 41881342 - 41881487
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  41881342 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 41881441  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41881442 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 41881487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 48404209 - 48404354
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  48404209 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 48404308  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  48404309 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 48404354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 221 - 404
Target Start/End: Original strand, 47777047 - 47777228
Alignment:
Q  221 ttaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttc 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  || ||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  47777047 ttaggttatggaaatgatgtttattgttgtactt--tttgtgtagatatggccgatcaggaccctattgatccatctaagatgattggtggtaggcatgc 47777144  T
Q  321 gatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
     |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  47777145 aatgactcaaagctaccggagcgagaggcaaagcggccacatcccaaagagaggtagaggtcggagggtggatggttcagggag 47777228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 9370611 - 9370478
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  9370611 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 9370512  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 394  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9370511 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatg 9370478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35609647 - 35609502
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||  | | ||    
T  35609647 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagattgcctac 35609548  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35609547 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 35609502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 259 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14689397 - 14689254
Alignment:
Q  259 tgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcc 358  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| || ||||||||| ||||| |    
T  14689397 tgtgaagatatggccgatcatgaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgtgatgacccaaaaccaccagaaggagaggcaaagcgggc 14689298  T
Q  359 acatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14689297 acatcc-aaaaaagggaagagatcggaggggagatggttcaggga 14689254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 556202 - 556121
Alignment:
Q  63 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 144  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  556202 tattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgttgcacacaaattatattgaaatgatgattatattgaatgattttaggtt 556121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 42507512 - 42507448
Alignment:
Q  154 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42507512 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 42507448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15073713 - 15073649
Alignment:
Q  154 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15073713 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttaggttgaatgtgttt 15073649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 41 - 97
Target Start/End: Original strand, 39461126 - 39461182
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39461126 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatatttaggttattatggaaatgatg 39461182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 361 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 47672260 - 47672217
Alignment:
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47672260 atcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggtttagggag 47672217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15106 - 14715
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15106 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 15007  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15006 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatggtgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 14907  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14906 gtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggtcgatcaagaccccattgatccatctaagatgattggtgat 14809  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14808 agacgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcgcccacatcccaaagaaggttagaggtcggaagggagatggttcagggagct 14715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8579990 - 8579599
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8579990 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatgaaaatgatagacataaattttatt 8579891  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8579890 gtaatgatgattatattaaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattttgtttatgtttagtttaggtttaat 8579791  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8579790 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtttatttttttattt--tttttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 8579693  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8579692 aggcgtgcgatgactcagagccaccgaagggagaggcagagcggccacatcccagagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 8579599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 34 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14259 - 13890
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14259 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattaaat 14160  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14159 gattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagttcgattttgtttatgtttagtttaggtttaatgcgtttgattaggttatggaa 14060  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||| || ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14059 atgatgttaatttttttttttt---tttgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacacagagc 13963  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13962 caccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaatggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8701708 - 8701320
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701708 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 8701610  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8701609 gtaataatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatattcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 8701510  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8701509 gtgtttgattaggttatgaaaatgatgttaatttt-ttaatttttttgtgtagatatgaccgatcaggaccccattgatcaatctaagatgattggtggt 8701411  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8701410 aggcgtgcgatgacctaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatccaaaagaggggaagaggtcggaggggatatggttcaggga 8701320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 406
Target Start/End: Original strand, 7757913 - 7758285
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7757913 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttagattattatggaaatgatggatataaattttatt 7758012  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
T  7758013 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcgttgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagt----------- 7758101  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7758102 --------ttaggttatggaaatgatgttaattttattattt--tttgtgtagatatggccgatcaggactccattgatcgatctaagatgattggtggt 7758191  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7758192 aggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggcgacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 7758285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 42941971 - 42941583
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42941971 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaattgtatgttaattattgaaggatgtttagattattgtggaaatgatggacataaattttatt 42941873  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42941872 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaatgatgttcatcgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 42941773  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42941772 gtgttttattaggttatggaaatgatgttaatttttttaattt-tttgtatacatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggt 42941674  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||||||  |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42941673 aggcgtgtgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggttggagaggagatggttcaggga 42941583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 401
Target Start/End: Original strand, 28877231 - 28877617
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28877231 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 28877330  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28877331 gtaatgatgattatattgaatgatttcaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttaatttaggtttaat 28877430  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||  | | |||||||||| | ||||||  ||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  28877431 gtgtttgattagattatggaaatgatgttaaatttttaattt--tttatgtagatatgtctgatcagatcccggttgatccatcgaagatgattggtggt 28877528  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagg 401  Q
    |||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  28877529 aggcgtgccatgattcagagccaccgcagggagaggcagagtggccacatcccaaaaaggggtagaggtcggagggtggatggctcagg 28877617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 38968687 - 38969075
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38968687 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgaggtttaggttattatgaaaatgatggacataaattttatt 38968785  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968786 gtaatgaagattatattcaatgattttaggttatggaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgattgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 38968885  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38968886 gtgtttgattaagttatggaaatgatgttaaattttttaattt-tttgtttagatatggccgatcaggaccccattgatccatttaagatgattggtggt 38968984  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| ||| ||| || ||||||| ||  |||||||  || || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38968985 aggcgtgcgaagacccaaagccaccagaaagagaggctaagtgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcaggga 38969075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 404
Target Start/End: Original strand, 42537758 - 42538126
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42537758 tgtatataaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaatcttattgtaatgatgaatatattgaat 42537857  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42537858 gattttaagttatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 42537957  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    ||||||||||| || | ||||  | |||||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||    
T  42537958 atgatgttaatcttttaattt--tttgtgtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcatgcgatgactcaaagc 42538055  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42538056 caccggaaggagagacaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggagggtggatggttcagggag 42538126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 34 - 403
Target Start/End: Original strand, 17658931 - 17659294
Alignment:
Q  34 tgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaat 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17658931 tgtataaaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatatttagattattatggaaatgatggacataaatgttattgtaatgatgattatattgaat 17659030  T
Q  134 gattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaa 233  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17659031 gattttagattatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttagttttaatgtgtttgactaggttatggaa 17659130  T
Q  234 atgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagc 333  Q
    |||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  17659131 atgatgttaattttttaattt--tttgtgttgatatggccgatcaggacactattgattcatctaagatgattggtggtaggcgtgggatgacacaaagc 17659228  T
Q  334 caccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||||||    
T  17659229 caccggaaggagaggcaaagcgggtacatcccaaagaggggaagaggt----tgggagatggttcaggga 17659294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 28241138 - 28240927
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttg--tgtgtgtagatatggccgatcaggac 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  28241138 ttatgtttatgtttagtttaggtttaaagtgtttgattaggttattgaaatgatattaatttt-ttatttttattttttgtagatatggccgatcaggac 28241040  T
Q  283 ctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtc 382  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  28241039 cccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtggccacatcccaaagaggggtagaggtc 28240940  T
Q  383 ggaggggagatgg 395  Q
    |||||||||||||    
T  28240939 ggaggggagatgg 28240927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27672958 - 27672745
Alignment:
Q  189 gtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcatt 288  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| | ||  | | |||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27672958 gtttaggttttgtttaggtttagtgtttttgataaagtggttg-aatgatattaattttattatttt---tttgtagatatggccgatcaggaccccatt 27672863  T
Q  289 gatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggg 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27672862 gatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcccaaagaggggtagaggtcggaggg 27672763  T
Q  389 gagatggttcagggagct 406  Q
     |||||| ||||| ||||    
T  27672762 cagatggctcaggaagct 27672745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 404
Target Start/End: Original strand, 5197748 - 5197917
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5197748 aatgatgttaattttataattttttttgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 5197845  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggag 404  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5197846 ccatcggagggagaggcaaagcggccacatcccaaataggggtagaggtcggagggtggatggttcagggag 5197917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 406
Target Start/End: Original strand, 30705911 - 30706082
Alignment:
Q  233 aatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagag 332  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30705911 aatgatattaattttattattttttttgt--agatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcagag 30706008  T
Q  333 ccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30706009 ccaccgcaggaagaggcagagcagccacttcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 30706082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19040338 - 19040193
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19040338 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagaggcagggcggccac 19040239  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  19040238 atcccaaagaggggtagaggtcgaagaggagatggctcaggaagct 19040193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 213 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40624211 - 40624023
Alignment:
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  || |||||||||||| | || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40624211 gtgtttgattaggttatggaaatgatgtaaattttttaatt--gtttgtgtagatatgtctgagcaggacccgattgatccatttaagatgattggtggt 40624114  T
Q  313 aggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || | ||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40624113 aggcgtgcgatgacttagagccatcgaaaggagaggcaaagggggcacatcccaaagaggggtagaggtcggaggggggatggttcaggga 40624023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 301 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19228145 - 19228043
Alignment:
Q  301 atgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcag 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19228145 atgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggagatggttcag 19228046  T
Q  401 gga 403  Q
    |||    
T  19228045 gga 19228043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40624470 - 40624389
Alignment:
Q  63 tattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgattttaggtt 144  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40624470 tattgaatgatgtttaggttatgatagaaatgatgcacataaattatattgaaatgatgattatattgaatggttttaggtt 40624389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28241257 - 28241227
Alignment:
Q  188 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241257 tgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 28241227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 36 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 6320025 - 6319680
Alignment:
Q  36 tatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 135  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6320025 tatagaaataattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatga 6319926  T
Q  136 ttttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaat 235  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6319925 ttttaggttatggaaatgatattcattgttgtacttttaatgtgtttgattatattaatgtttagtttaggtttaacttgtttgattaggttatggaaat 6319826  T
Q  236 gatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagcca 335  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||  |||| || | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6319825 gatgttaatttttaaattttttgtgt--agatgtgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaagcca 6319728  T
Q  336 ccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcg 383  Q
     |||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  6319727 tcggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcg 6319680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 31769294 - 31769526
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31769294 gatggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatatttatgttattatggaaatgatggaaataaattttatt 31769393  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769394 ataatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtaattttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 31769493  T
Q  213 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatt 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769494 gtgtttgattaggttatggaaatgatgttaatt 31769526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24088266 - 24088066
Alignment:
Q  13 gatggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttatt 112  Q
    ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||     
T  24088266 gatggacacaaatgattaagt-gtatagaaatgattcagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttatgatggaaatgattgacacaaattttata 24088168  T
Q  113 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24088167 gtaatgatgattatattgaatgattttaggttatgaaaatgatgttcattgttgtacttttaatgtgtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaat 24088068  T
Q  213 gt 214  Q
    ||    
T  24088067 gt 24088066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 187 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24088063 - 24087849
Alignment:
Q  187 atgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacctca 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||    
T  24088063 atgtttatgtttagtctaggtttaaagtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttttaattttttgtgt--agatacggccgatcaggacccca 24087966  T
Q  287 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 386  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||| | | | ||||||| |||| |||| | ||||| |||    
T  24087965 ttgatctatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgacccaaagccaccggaaggagaggcaaaacaggcacatcccaaagcggggaaaaggtcagag 24087866  T
Q  387 gggagatggttcaggga 403  Q
    |||||||||||||||||    
T  24087865 gggagatggttcaggga 24087849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 27617567 - 27617712
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27617567 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaagatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgtagggagaggcagggcggccac 27617666  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  27617667 atcccaaagaggggtagaggtcgaagaggagatggctcaggaagct 27617712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 6202000 - 6202145
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  6202000 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 6202099  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6202100 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 6202145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 11688967 - 11689112
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  11688967 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 11689066  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11689067 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 11689112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Original strand, 22302032 - 22302177
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  22302032 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 22302131  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22302132 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 22302177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 261 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30828873 - 30828728
Alignment:
Q  261 tgtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccac 360  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||    
T  30828873 tgtagatatggccgatcaggaccccattgatccatcgaggatgattggtggtaggcgtgccatgactcagagccaccgcagggagagacagagtgcccac 30828774  T
Q  361 atcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcagggagct 406  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30828773 atcccaaagaggggtagaggtcggaggggagatggctcaggaagct 30828728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 262 - 403
Target Start/End: Original strand, 24722705 - 24722846
Alignment:
Q  262 gtagatatggccgatcaggacctcattgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccaca 361  Q
    ||||||||| | |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  24722705 gtagatatgtctgatcagaacccggttgatccatctaagatgattggtggtaggcgtgcgatgactcaaacccaccagaaggagaggcaaagcgggcaca 24722804  T
Q  362 tcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    | | ||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||    
T  24722805 ttccaaagaggggaagaggttagagaggggatggttcaggga 24722846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 403
Target Start/End: Original strand, 10881 - 11238
Alignment:
Q  41 aaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattgtaatgatgattatattgaatgatttta 140  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10881 aaataattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttagattat---------gatggacacaaactatattgtaatgatgattatactgaatggtttta 10971  T
Q  141 ggttatggaaataatgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgttt------agtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaa 234  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  10972 ggttatggaaatgatgttcattgt---acttttaatgtgtttgattatgtttatgtttctgtttagtttaggtttaatgtttttgattaggttatgaaaa 11068  T
Q  235 tgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatca-ggacctca--ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcaga 331  Q
    ||| ||||| ||| | | ||| |||||  ||||||| | ||| | || || |   |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| || |    
T  11069 tgaggttaagtttttaaatttttgtgt--agatatgtctgatgaagggccaccggttgatccatctaagatgattggtggtcggtgtgtgatgacacaaa 11166  T
Q  332 gccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggaggggagatggttcaggga 403  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11167 gccaccggaaggagaggcaaagcgggcacatcccaaagaggggaagaggtcggaggggtgatggttcaggga 11238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Original strand, 7937 - 8059
Alignment:
Q  14 atggacatcaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatggaaatgatggacataaattttattg 113  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7937 atggacacaaatgatttagttgtatagaaatgattaagtgtatgttaattattgaatgatgtttaggttattatcgaaatgatggacataaattttattg 8036  T
Q  114 taatgatgattatattgaatgat 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  8037 taatgatgattatattaaatgat 8059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 1
Alignment:
Q  185 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttatggaaatgatgttaattttattattttgtgtgtgtagatatggccgatcaggacct 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||     
T  107 ttatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgtttgattaggttattgaaatgatgttaattttattttttt-----tgtagatatggccgatcaggaccc 13  T
Q  285 cattgatccatc 296  Q
    ||||||||||||    
T  12 cattgatccatc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 164
Alignment:
Q  154 atgttcattgttgtacttttaatgagtttgattatgtttatgtttagtttaggtttaatgtgttt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  228 atgttcattgttgtacttttaatgagtttaattttgtttatgtttagtttatgtttaatgtgttt 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0238 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0238
Description:

Target: scaffold0238; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 18168 - 18051
Alignment:
Q  287 ttgatccatctaagatgattggtggtaggcgttcgatgactcagagccaccggagggagaggcagagcggccacatcctaaagaggggtagaggtcggag 386  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18168 ttgatacatctaagatgattgttggtaggcgtgcaatgactcaaagccaccggaaggagaggcaaagcgagcacatcctaaagaggggaagaggtcggag 18069  T
Q  387 gggagatggttcagggag 404  Q
    ||  | ||||||||||||    
T  18068 ggtgggtggttcagggag 18051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University