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Alignment Overview

Query: NF12168_high_2 (Length: 335)

Name: NF12168_high_2
Description: NF12168
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12168_high_2
NF12168_high_2
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (22-320)||(20995207-20995499)
chr5 (49-237)||(7286348-7286531)
chr5 (49-320)||(20350552-20350812)
chr5 (49-237)||(33706112-33706299)
chr5 (22-237)||(2195832-2196042)
chr5 (20-320)||(27066489-27066778)
chr5 (54-237)||(287074-287255)
chr5 (54-320)||(3149951-3150206)
chr5 (49-237)||(30690001-30690184)
chr5 (22-237)||(21030803-21031013)
chr5 (49-237)||(3029448-3029631)
chr5 (49-237)||(17997262-17997445)
chr5 (49-237)||(33610505-33610688)
chr5 (49-237)||(34373725-34373908)
chr5 (54-237)||(12419925-12420107)
chr5 (22-237)||(26320415-26320625)
chr5 (55-320)||(19448612-19448866)
chr5 (49-216)||(41781627-41781794)
chr5 (22-188)||(10511693-10511859)
chr5 (49-233)||(34726736-34726919)
chr5 (93-319)||(1851346-1851561)
chr5 (52-237)||(20758639-20758819)
chr5 (49-320)||(35539266-35539526)
chr5 (54-188)||(38935188-38935322)
chr5 (54-188)||(30142270-30142404)
chr5 (55-184)||(34717361-34717490)
chr5 (49-180)||(25696896-25697027)
chr5 (49-184)||(41691047-41691182)
chr5 (22-147)||(4882959-4883084)
chr5 (49-190)||(33930966-33931100)
chr5 (256-320)||(4882889-4882953)
chr5 (54-149)||(3396496-3396593)
chr5 (55-113)||(19395576-19395634)
chr5 (256-320)||(3029372-3029435)
chr5 (268-320)||(3396686-3396738)
chr5 (256-320)||(17997185-17997249)
chr5 (258-320)||(34373924-34373986)
chr5 (256-320)||(287268-287332)
chr5 (256-320)||(20758562-20758626)
chr5 (256-320)||(41781459-41781523)
chr5 (197-237)||(41781536-41781576)
chr5 (256-319)||(33930432-33930495)
chr5 (256-306)||(38935093-38935143)
chr5 (268-320)||(12420147-12420199)
chr5 (54-110)||(31295614-31295670)
chr5 (268-320)||(33706324-33706376)
chr5 (197-237)||(33930509-33930549)
chr5 (256-320)||(10511903-10511967)
chr5 (268-320)||(21030726-21030778)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (22-237)||(41983560-41983775)
chr4 (22-320)||(53343081-53343367)
chr4 (52-237)||(21353767-21353947)
chr4 (49-320)||(55998071-55998331)
chr4 (54-320)||(37700962-37701216)
chr4 (49-237)||(17740789-17740976)
chr4 (49-237)||(47556781-47556968)
chr4 (22-237)||(5271630-5271840)
chr4 (54-320)||(33502365-33502620)
chr4 (53-237)||(22115414-22115593)
chr4 (49-237)||(36514699-36514882)
chr4 (49-320)||(39742354-39742613)
chr4 (22-237)||(2777025-2777235)
chr4 (22-320)||(38008932-38009221)
chr4 (57-235)||(14828901-14829074)
chr4 (51-237)||(34055947-34056128)
chr4 (22-188)||(54331098-54331264)
chr4 (52-237)||(23479626-23479806)
chr4 (22-320)||(17699847-17700134)
chr4 (49-320)||(19830756-19831016)
chr4 (50-235)||(19109117-19109297)
chr4 (49-233)||(2116579-2116763)
chr4 (49-233)||(46104653-46104836)
chr4 (22-180)||(15642391-15642549)
chr4 (64-320)||(35494978-35495220)
chr4 (49-233)||(12682158-12682340)
chr4 (49-233)||(40622900-40623081)
chr4 (49-237)||(28973811-28973994)
chr4 (24-237)||(13628803-13629008)
chr4 (49-184)||(39714900-39715035)
chr4 (22-188)||(36857848-36858015)
chr4 (49-184)||(52800796-52800931)
chr4 (54-188)||(7643169-7643302)
chr4 (54-118)||(28134766-28134830)
chr4 (256-320)||(19109312-19109376)
chr4 (256-319)||(7643347-7643410)
chr4 (105-143)||(14828865-14828903)
chr4 (256-322)||(21353688-21353754)
chr4 (256-320)||(2776948-2777012)
chr4 (268-320)||(13628726-13628778)
chr4 (54-116)||(740367-740429)
chr4 (259-320)||(22115609-22115670)
chr4 (275-320)||(36857739-36857784)
chr4 (256-320)||(28973733-28973797)
chr4 (256-320)||(36514895-36514959)
chr4 (268-320)||(40622822-40622874)
chr4 (256-320)||(41983788-41983852)
chr4 (268-320)||(47556993-47557045)
chr4 (54-113)||(15520989-15521048)
chr4 (256-320)||(7847695-7847759)
chr4 (205-237)||(7847773-7847805)
chr4 (272-320)||(17740712-17740760)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (49-237)||(52462270-52462458)
chr3 (49-237)||(8243230-8243418)
chr3 (22-237)||(50770587-50770797)
chr3 (22-320)||(54648208-54648495)
chr3 (49-237)||(19406681-19406864)
chr3 (23-320)||(54513435-54513727)
chr3 (49-237)||(55294121-55294308)
chr3 (22-320)||(18741545-18741832)
chr3 (49-237)||(52842310-52842497)
chr3 (22-320)||(51248954-51249241)
chr3 (24-237)||(21698906-21699114)
chr3 (49-237)||(39093053-39093240)
chr3 (49-236)||(23194921-23195108)
chr3 (22-237)||(31368356-31368566)
chr3 (49-237)||(2839570-2839758)
chr3 (49-237)||(40824010-40824196)
chr3 (49-237)||(48520380-48520567)
chr3 (49-237)||(54934533-54934721)
chr3 (55-237)||(32756241-32756416)
chr3 (22-237)||(6103461-6103671)
chr3 (22-237)||(52852772-52852982)
chr3 (49-320)||(50742023-50742283)
chr3 (62-233)||(4138140-4138310)
chr3 (49-188)||(35087219-35087358)
chr3 (49-233)||(26777273-26777456)
chr3 (54-180)||(49113832-49113958)
chr3 (49-237)||(16342383-16342563)
chr3 (22-133)||(19353697-19353808)
chr3 (52-138)||(11597366-11597452)
chr3 (162-233)||(53800998-53801068)
chr3 (256-320)||(49113715-49113779)
chr3 (112-188)||(48977676-48977754)
chr3 (256-320)||(16342306-16342370)
chr3 (258-320)||(23194839-23194901)
chr3 (49-115)||(48988903-48988969)
chr3 (267-320)||(48977329-48977382)
chr3 (256-320)||(8243141-8243205)
chr3 (268-320)||(11597512-11597564)
chr3 (256-320)||(21699127-21699191)
chr3 (256-320)||(52852995-52853059)
chr3 (256-320)||(54934456-54934520)
chr3 (259-320)||(52462474-52462535)
chr3 (268-320)||(2843475-2843527)
chr3 (256-320)||(32756164-32756228)
chr3 (256-320)||(48520580-48520644)
chr3 (54-113)||(39796415-39796474)
chr3 (256-320)||(40824209-40824274)
chr3 (58-110)||(5252320-5252372)
chr3 (205-237)||(11597455-11597487)
chr3 (268-320)||(52842230-52842282)
chr3 (256-320)||(55294321-55294385)
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (49-237)||(45399550-45399738)
chr2 (22-237)||(26822360-26822570)
chr2 (51-320)||(36632393-36632656)
chr2 (49-237)||(11448493-11448681)
chr2 (49-237)||(5253097-5253280)
chr2 (22-320)||(19167177-19167464)
chr2 (49-236)||(45204350-45204537)
chr2 (49-237)||(4812286-4812477)
chr2 (22-237)||(19126028-19126238)
chr2 (49-237)||(1514327-1514514)
chr2 (49-237)||(21098429-21098612)
chr2 (49-212)||(42886164-42886326)
chr2 (54-235)||(33663117-33663292)
chr2 (49-237)||(16723718-16723901)
chr2 (22-237)||(11707377-11707587)
chr2 (49-320)||(33907917-33908177)
chr2 (49-320)||(26828185-26828445)
chr2 (55-320)||(30569902-30570154)
chr2 (49-237)||(18092076-18092252)
chr2 (49-188)||(10048372-10048511)
chr2 (49-184)||(4291029-4291164)
chr2 (49-237)||(35285639-35285820)
chr2 (49-180)||(9543995-9544126)
chr2 (140-237)||(27364267-27364364)
chr2 (49-122)||(27364197-27364270)
chr2 (22-108)||(18137828-18137914)
chr2 (270-320)||(33663352-33663402)
chr2 (256-320)||(11707300-11707364)
chr2 (256-320)||(42886060-42886124)
chr2 (54-113)||(28502440-28502499)
chr2 (269-320)||(45204574-45204625)
chr2 (258-320)||(11448417-11448479)
chr2 (49-119)||(28608446-28608516)
chr2 (52-113)||(6342785-6342846)
chr2 (256-319)||(35285833-35285896)
chr2 (256-320)||(1514527-1514591)
chr2 (54-110)||(1993012-1993068)
chr2 (54-110)||(14323271-14323327)
chr2 (256-320)||(45399473-45399537)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (22-237)||(47175192-47175407)
chr7 (22-237)||(42918596-42918810)
chr7 (51-237)||(17470463-17470644)
chr7 (51-237)||(17582570-17582751)
chr7 (23-237)||(33031589-33031798)
chr7 (49-237)||(33638018-33638205)
chr7 (54-237)||(23299072-23299254)
chr7 (22-237)||(8925254-8925464)
chr7 (49-237)||(27734395-27734580)
chr7 (49-233)||(4848834-4849017)
chr7 (49-320)||(42688209-42688469)
chr7 (49-237)||(9150056-9150244)
chr7 (49-233)||(49145636-49145819)
chr7 (68-237)||(5963417-5963581)
chr7 (51-191)||(14309618-14309758)
chr7 (54-237)||(42826706-42826887)
chr7 (54-188)||(19521912-19522046)
chr7 (49-320)||(11500514-11500767)
chr7 (49-188)||(39649328-39649467)
chr7 (49-184)||(17170797-17170932)
chr7 (88-237)||(23765849-23765993)
chr7 (49-180)||(48528138-48528269)
chr7 (49-180)||(31898169-31898300)
chr7 (124-319)||(17478569-17478753)
chr7 (124-319)||(17483004-17483188)
chr7 (124-319)||(17570026-17570210)
chr7 (124-319)||(17574461-17574645)
chr7 (258-319)||(33031514-33031575)
chr7 (54-110)||(6911421-6911477)
chr7 (268-320)||(9149979-9150031)
chr7 (268-320)||(23299279-23299331)
chr7 (256-320)||(27734593-27734657)
chr7 (256-320)||(42826901-42826965)
chr7 (54-110)||(47573399-47573455)
chr7 (256-315)||(42918523-42918582)
chr7 (256-320)||(17470386-17470450)
chr7 (256-320)||(17582764-17582828)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (53-236)||(48341052-48341235)
chr1 (49-237)||(45005506-45005693)
chr1 (54-237)||(47136010-47136192)
chr1 (54-237)||(10694138-10694320)
chr1 (54-237)||(17672187-17672370)
chr1 (22-237)||(38844502-38844712)
chr1 (49-237)||(34692828-34693011)
chr1 (49-237)||(34688300-34688483)
chr1 (49-237)||(36682775-36682962)
chr1 (54-237)||(16030946-16031128)
chr1 (22-237)||(31620402-31620612)
chr1 (49-237)||(50561785-50561970)
chr1 (49-237)||(41829405-41829588)
chr1 (49-237)||(52310570-52310757)
chr1 (54-233)||(5426715-5426893)
chr1 (49-237)||(44407096-44407279)
chr1 (49-233)||(16300781-16300965)
chr1 (49-237)||(18814932-18815115)
chr1 (49-237)||(52520972-52521155)
chr1 (49-237)||(12245227-12245408)
chr1 (49-233)||(51965188-51965361)
chr1 (49-184)||(4891871-4892006)
chr1 (49-184)||(29186481-29186616)
chr1 (52-237)||(41962294-41962465)
chr1 (49-184)||(33361474-33361609)
chr1 (88-188)||(17707277-17707377)
chr1 (49-113)||(39760074-39760138)
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chr1 (49-113)||(24294791-24294855)
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[»] chr8 (51 HSPs)
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[»] chr6 (37 HSPs)
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[»] scaffold0032 (4 HSPs)
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[»] scaffold0171 (2 HSPs)
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[»] scaffold0057 (1 HSPs)
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[»] scaffold0110 (2 HSPs)
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[»] scaffold0169 (1 HSPs)
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[»] scaffold0009 (1 HSPs)
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 20995207 - 20995499
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20995207 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaaaag 20995306  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20995307 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtttgaattatgattaca 20995406  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20995407 tattatccaaaattataaaatagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 20995499  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7286531 - 7286348
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7286531 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttgtgagattagg 7286432  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| |||     |||||||||||||||||||||    
T  7286431 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtaaat-----ttacatattatccaaaattat 7286348  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20350812 - 20350552
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20350812 tctttgaaagaagtgatgctaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataagcagtttatgagattagg 20350713  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||| |               
T  20350712 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtg 20350618  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20350617 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 20350552  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 33706112 - 33706299
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33706112 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 33706211  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33706212 aattgagataatatttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 33706299  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2196042 - 2195832
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2196042 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 2195943  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  2195942 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 2195848  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  2195847 tattatccaaaattat 2195832  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 20 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27066778 - 27066489
Alignment:
Q  20 atgttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaag 119  Q
    ||||||| |||||||||||||        |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27066778 atgttcagtaacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaagagatggtaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatagactgattaag 27066679  T
Q  120 agagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgatta 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||    
T  27066678 agagcatataatcagtttatgagattaggaattaatataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----tta 27066584  T
Q  220 catattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||||||||||||                  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27066583 catattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatagccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaa 27066490  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 287074 - 287255
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| | |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  287074 gaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 287173  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  287174 acataatatttaggatgaaaacaattggaacca--aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 287255  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 320
Target Start/End: Original strand, 3149951 - 3150206
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3149951 gaaagaagagatgttaaaacgaattaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagataaggaattg 3150050  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnn 253  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     || |||||||||||||||||                    
T  3150051 acataatatttagaatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatt-----tatatattatccaaaattataaaaaagagtgt---- 3150141  T
Q  254 ngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3150142 --tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 3150206  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30690184 - 30690001
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30690184 tctttgaaagaagagatgttaaaacgaaggaacatcgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 30690085  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  30690084 aattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 30690001  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21031013 - 21030803
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||| |   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21031013 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttagaaagaagagatgttaaaacaacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 21030914  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  21030913 agcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaactaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 21030819  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  21030818 tattatccaaaattat 21030803  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3029631 - 3029448
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  3029631 tcttcgaaagaagaaatgttaaaacgaaggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataattagtttatgaaattaga 3029532  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  3029531 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 3029448  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17997445 - 17997262
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  17997445 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataattagtttatgagattcga 17997346  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||||||||    
T  17997345 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattacccaaaattat 17997262  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 33610505 - 33610688
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33610505 tctttgaaagaatagatgttaaaacgacggaacattgtgattcgtcataaaatacgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 33610604  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  33610605 aattgacataatatttaagatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 33610688  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 34373725 - 34373908
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  34373725 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagaataca 34373824  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  34373825 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 34373908  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 12419925 - 12420107
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| | |||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12419925 gaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattttgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 12420024  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420025 acataatatttaggatgaaaataattggaaccaa-aaaggaaccaatgatatgtgaattatgattacatattatccaaaattat 12420107  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 26320415 - 26320625
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26320415 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttaaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggcctgattaagag 26320514  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||||||||||     |||||    
T  26320515 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaagaaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 26320609  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  26320610 tattatccaaaattat 26320625  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19448866 - 19448612
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattga 154  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19448866 aaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatggattgattaagagagcatataatcagtttataagattatgaattga 19448767  T
Q  155 gataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnn 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||     |||||||||||||||||||||                     
T  19448766 cataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaatgaactaatgatatgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgt----- 19448677  T
Q  255 gtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19448676 -tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagtaaag 19448612  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 41781794 - 41781627
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781794 tcttcgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 41781695  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatga 216  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  41781694 aattgacataatatttaggaagaaaataattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatga 41781627  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 188
Target Start/End: Original strand, 10511693 - 10511859
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10511693 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 10511792  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10511793 aacatataatcagtttatgagattagtaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 10511859  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 34726736 - 34726919
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  34726736 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataaacagtttatgagattaga 34726835  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34726836 aattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 34726919  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 319
Target Start/End: Original strand, 1851346 - 1851561
Alignment:
Q  93 tcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaa 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  1851346 tcataaaatatgtataggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaag 1851445  T
Q  193 gaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgataccca 292  Q
    |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  1851446 gaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgataccca 1851534  T
Q  293 tatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  1851535 tatttacatcaaatgaaatcaaacaaa 1851561  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20758819 - 20758639
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  20758819 ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataattagtttatgagattagaaat 20758720  T
Q  152 tgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||| ||||||||||||    
T  20758719 taacataatatttatgatgaaaacagttggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatataatccaaaattat 20758639  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 35539266 - 35539526
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  35539266 tctttgaaagaaaagatattaaaacgacggaacattgtgactcatcataaaatatgtatgagctaattaagagagcatataatcaatttatgagaataca 35539365  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  35539366 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaaaagtg 35539460  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35539461 t------tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 35539526  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 38935322 - 38935188
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38935322 gaaagaagggatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattg 38935223  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38935222 acataatatttaggatgaaaacgattggaaccaat 38935188  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30142404 - 30142270
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| |||||||||||| |   || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30142404 gaaagaaaagatgttaaaacaacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 30142305  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30142304 acataatatttaggatgaaaataattgaaaccaat 30142270  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 34717490 - 34717361
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattga 154  Q
    |||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34717490 aaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattga 34717391  T
Q  155 gataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34717390 cataatttttagaatgaaaacaattgaaac 34717361  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 25696896 - 25697027
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25696896 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcctaaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 25696995  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25696996 aattgacataatttttaggatgaaaacaattg 25697027  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41691182 - 41691047
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41691182 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaga 41691083  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41691082 aattgacataatttttagaatgaaaacaattgaaac 41691047  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 4883084 - 4882959
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  4883084 gttcaataacgtattcgatgaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgcttcatcgtaaaatatgtaaaggctggttaagag 4882985  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattag 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  4882984 agcatataatcagtttatgagattag 4882959  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33931100 - 33930966
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||      
T  33931100 tcttcgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattctgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagag-------ttagtttatgagattata 33931008  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataa 190  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33931007 atttgacataatatttatgatgaaaacaattgaaaccaataa 33930966  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4882953 - 4882889
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  4882953 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 4882889  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Original strand, 3396496 - 3396593
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcatt--catcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagga 149  Q
    |||||||||||||||||||| |   || ||||| |||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  3396496 gaaagaagagatgttaaaactacagaacattgtgattttcatcataaaatatggatgggtttattaagagagcatataatcagtttataatattagga 3396593  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 19395634 - 19395576
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19395634 aaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctg 19395576  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3029435 - 3029372
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  3029435 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacat-aaatgaaatcaagcaaag 3029372  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 3396686 - 3396738
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3396686 gttaccaaaaaatgattgatatccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 3396738  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17997249 - 17997185
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  17997249 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 17997185  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Original strand, 34373924 - 34373986
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34373924 ttgttatagagttaccaaaaagggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 34373986  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 287268 - 287332
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  287268 tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 287332  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20758626 - 20758562
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  20758626 tgttgttatagagttactaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 20758562  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41781523 - 41781459
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  41781523 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 41781459  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41781576 - 41781536
Alignment:
Q  197 caataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41781576 caatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 41781536  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33930495 - 33930432
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  33930495 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttaaaacagatgaaatcaagcaaa 33930432  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 38935143 - 38935093
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaat 306  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38935143 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaat 38935093  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 12420147 - 12420199
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  12420147 gttaccgaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 12420199  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 31295614 - 31295670
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  31295614 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggg 31295670  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 33706324 - 33706376
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||    
T  33706324 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttacattagatgaaatcaaacaaag 33706376  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 197 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33930549 - 33930509
Alignment:
Q  197 caataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33930549 caatgatgtgtgaattatgattacatattattcaaaattat 33930509  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 10511903 - 10511967
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  10511903 tgttgttgtagggttaccaaaaaaggattgatactcataattacttcaaatgaaatcaagcaaag 10511967  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21030778 - 21030726
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  21030778 gttaccaaaaaaggattgatagccatatttacatcagatgaaatcaagtaaag 21030726  T

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Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 41983560 - 41983775
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41983560 gttcaataacgtattcgataaaaaatttctttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgcttcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 41983659  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41983660 agaatataatcagtttatgagattatgaattgaaataatatttaggatggaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattaca 41983759  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  41983760 tattatccaaaattat 41983775  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 53343367 - 53343081
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53343367 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 53343268  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  53343267 agcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 53343173  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53343172 tattatccaaaattataaaaagagtgt-------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacacatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 53343081  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21353947 - 21353767
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21353947 ttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaat 21353848  T
Q  152 tgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||     |||||||||||||||||||||    
T  21353847 tgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaagaaccaatgatgtgttaat-----ttacatattatccaaaattat 21353767  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 55998071 - 55998331
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  55998071 tctttgaaagaagagatattaaaacgaaggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgtttaagagagcatataatcagtttatgatattagg 55998170  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  55998171 aattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 55998265  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  55998266 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgtttgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 55998331  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 320
Target Start/End: Original strand, 37700962 - 37701216
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37700962 gaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtaattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaaattaggtattg 37701061  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnn 253  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     || |||||||||||||||||                    
T  37701062 acataatatataggatgaaaacaattgaaaccaataaa-gaaccaatgatgtgtgaatt-----tatatattatccaaaattatagaaaatagtgt---- 37701151  T
Q  254 ngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37701152 --tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 37701216  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17740976 - 17740789
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17740976 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgatttagagatcatataatcagtttatgagattaga 17740877  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17740876 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 17740789  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 47556781 - 47556968
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47556781 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgaactgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 47556880  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47556881 aattgagataatatttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 47556968  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 5271630 - 5271840
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5271630 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgaaattcatcataaaatatgtatggactgattaagag 5271729  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  5271730 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaatgaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 5271824  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  5271825 tattatccaaaattat 5271840  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 320
Target Start/End: Original strand, 33502365 - 33502620
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33502365 gaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctaattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 33502464  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnn 253  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||                    
T  33502465 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaaaaaccaatgatgtgtgaatt-----tacatattatccaaaattataaaaaagagtgt---- 33502555  T
Q  254 ngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
      ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33502556 --tgttgttatagagttatcaaaaaatgattgatatccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 33502620  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 53 - 237
Target Start/End: Original strand, 22115414 - 22115593
Alignment:
Q  53 tgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaatt 152  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22115414 tgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaatt 22115513  T
Q  153 gagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  22115514 gacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 22115593  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 36514699 - 36514882
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  36514699 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagaacatataatcagtttatgagattaga 36514798  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||     |||||||| ||||||||||||    
T  36514799 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtctgaat-----ttacatataatccaaaattat 36514882  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 39742354 - 39742613
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39742354 tctttgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 39742453  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||               
T  39742454 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaatcaataaatgaaccaatgatgtgtgaatt-----tacatattatccaaaattataaaaaagagtg 39742548  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  39742549 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacat-aaatgaaatcaagcaaag 39742613  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2777235 - 2777025
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2777235 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagag 2777136  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||     |||||    
T  2777135 agcatataattagtttatgagattagaaattaacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatatgtgaat-----ttaca 2777041  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  2777040 tattatccaaaattat 2777025  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38009221 - 38008932
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38009221 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaaggg 38009122  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  38009121 agcatataatcaatttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 38009027  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||| |||||| ||                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38009026 tattatgcaaaataataaaaaaaaaagtgt----tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacacatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 38008932  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Original strand, 14828901 - 14829074
Alignment:
Q  57 agaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14828901 agaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgaca 14829000  T
Q  157 taatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  14829001 taatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatt 14829074  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 237
Target Start/End: Original strand, 34055947 - 34056128
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34055947 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagaacatataatcagtttatgagattaggaa 34056046  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  34056047 ttgatataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 34056128  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 188
Target Start/End: Original strand, 54331098 - 54331264
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54331098 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 54331197  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54331198 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 54331264  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23479806 - 23479626
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23479806 ttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttataagattaggaat 23479707  T
Q  152 tgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  23479706 tgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaagaaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 23479626  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17700134 - 17699847
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17700134 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaatagatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagag 17700035  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||     |||||    
T  17700034 agcatataataagtttatgagattaggaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccagtaaaggaaccaataatgtgtgaat-----ttaca 17699940  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                   |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17699939 tattatccaaaattataaaaaagagtgac------gttgttatagagttaccaaaaaatgattgatgcccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 17699847  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 19830756 - 19831016
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19830756 tcttcgaaagatgagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaatagagcatataatcagtttatgagattagg 19830855  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
     ||| | ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  19830856 tattaacataatgtataggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagaatg 19830950  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19830951 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 19831016  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 19109117 - 19109297
Alignment:
Q  50 ctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagga 149  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  19109117 ctttgaaagaagtgatgctaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataaacaatttatgaaattagga 19109216  T
Q  150 attgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatt 235  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  19109217 attgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatt 19109297  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2116763 - 2116579
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2116763 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattatg 2116664  T
Q  149 aattgagat-aatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2116663 aattgacataaatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 2116579  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46104836 - 46104653
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46104836 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcattataaaatatgtatgggctgatttagagataatataatcagtttatgagattagg 46104737  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46104736 aattgacataatgtttaggatgaaaataattgaaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 46104653  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 180
Target Start/End: Original strand, 15642391 - 15642549
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15642391 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 15642490  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15642491 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacaattg 15642549  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 320
Target Start/End: Original strand, 35494978 - 35495220
Alignment:
Q  64 atgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatt 163  Q
    |||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35494978 atgttaaaacgacggaacattgtgattcatcagaaaatat--atgggctgattaagagagcatataattagtttatgagattaggaattgacataata-t 35495074  T
Q  164 taggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgtta 263  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||                  ||||||||    
T  35495075 taggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgtta 35495163  T
Q  264 tggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35495164 tagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 35495220  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 12682158 - 12682340
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12682158 tcttcgaaagaaaagatgtttaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgatttagagatcatttaatcagtttatgagattagg 12682257  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682258 aattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaacca--aaaaggatcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 12682340  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40623081 - 40622900
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |  ||| |||||||||||||||||| |    
T  40623081 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctaatctagata--atacaatcagtttatgagattaag 40622984  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40622983 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaactaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 40622900  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28973994 - 28973811
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||      
T  28973994 tcttcgaaagaagagatattaaaatgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgataataca 28973895  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||     | |||||||||||||||||||||    
T  28973894 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtga-----gtttacatattatccaaaattat 28973811  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13629008 - 13628803
Alignment:
Q  24 tcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagag 123  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||    
T  13629008 tcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagctgttaaaacgacggatcattgtgattcatcataaaaaatgta--ggctgattaagatag 13628911  T
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||     |||||||    
T  13628910 catataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttaggat-aaaacaattagaaccaataaaggaaccaatgatgtttgaat-----ttacata 13628817  T
Q  224 ttatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||    
T  13628816 ttatccaaaattat 13628803  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 39714900 - 39715035
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39714900 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 39714999  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39715000 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 39715035  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 36858015 - 36857848
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||||| | |||||||| | | || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36858015 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagaaacgttaaaacaacggaacattgtgatttatcataaaatatgtataggctgattaagag 36857916  T
Q  122 agc-atataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36857915 agccatataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 36857848  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 52800931 - 52800796
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52800931 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 52800832  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  52800831 aattgacataatttttagaatgaaaacaattgaaac 52800796  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Original strand, 7643169 - 7643302
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7643169 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtaattcatcataaaatatgtatgagcttatta-gagagcatataatcagtttatgagattagaaattg 7643267  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7643268 acataatatttaggatgaaaacaatcggaaccaat 7643302  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 28134766 - 28134830
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28134766 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaa 28134830  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 19109312 - 19109376
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19109312 tgttgttatagagttaacaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 19109376  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 319
Target Start/End: Original strand, 7643347 - 7643410
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||    
T  7643347 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacacatatttacataaaatgaaatcaagcaaa 7643410  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 14828865 - 14828903
Alignment:
Q  105 tatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14828865 tatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaga 14828903  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21353754 - 21353688
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaagtg 322  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||    
T  21353754 tgttgttatagagttactaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaagtg 21353688  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2777012 - 2776948
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  2777012 tgttgttatagagttactaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 2776948  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13628778 - 13628726
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  13628778 gttaccaaaaaatgattgctacccatatttacgtcaaatgaaatcaagcaaag 13628726  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 116
Target Start/End: Original strand, 740367 - 740429
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgatt 116  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  740367 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggttgatt 740429  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Original strand, 22115609 - 22115670
Alignment:
Q  259 tgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  22115609 tgttatagagttactaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 22115670  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36857784 - 36857739
Alignment:
Q  275 aaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36857784 aaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 36857739  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 28973797 - 28973733
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  28973797 tgttgttatagagttaccgaaaaaggattgatacccatatttacatcaaaagaaatcaagtaaag 28973733  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 36514895 - 36514959
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  36514895 tgttgttatagagttactaaaaaatgattgatactcatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 36514959  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 40622874 - 40622822
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  40622874 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacattagatgaaatcaagcaaag 40622822  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 41983788 - 41983852
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  41983788 tgttgttatagagttaccaaaaaagaattgatatccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 41983852  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 47556993 - 47557045
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  47556993 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaaacaaag 47557045  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15521048 - 15520989
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  15521048 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatatatgggctg 15520989  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7847759 - 7847695
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||    
T  7847759 tgttgttatagagttaccaagaaaggattgatacccatatttaaaacaattgaaatcaagtaaag 7847695  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7847805 - 7847773
Alignment:
Q  205 tgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7847805 tgtgaattatgattagatattatccaaaattat 7847773  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17740760 - 17740712
Alignment:
Q  272 ccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  17740760 ccaaaaaagaattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 17740712  T

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Target: chr3 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 52462270 - 52462458
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  52462270 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagaatataatcagtttatgagattaag 52462369  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52462370 aattgaaataatatttaggatggaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 52462458  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8243418 - 8243230
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243418 tcttcgaaagaatagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 8243319  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8243318 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 8243230  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 50770587 - 50770797
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50770587 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 50770686  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  50770687 agcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 50770781  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  50770782 tattatccaaaattat 50770797  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 54648208 - 54648495
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  54648208 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtataggttgattaagag 54648307  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  54648308 agcatgtaatcagtttatgagattagtaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 54648402  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54648403 tattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttattatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 54648495  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 19406681 - 19406864
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19406681 tctttaaaaaaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattcatcataaaatatatatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 19406780  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  19406781 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 19406864  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 23 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54513727 - 54513435
Alignment:
Q  23 ttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaga 122  Q
    ||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54513727 ttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatat-tatgggctgattaagaga 54513629  T
Q  123 g--catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattac 220  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  54513628 gagcatataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgcgtgaattatgattac 54513529  T
Q  221 atattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
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T  54513528 atattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 54513435  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 55294121 - 55294308
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55294121 tcttcgaaagaaaagattttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgcatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 55294220  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55294221 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 55294308  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 18741545 - 18741832
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18741545 gttcaataacgtattcgataaaaaaattttttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 18741644  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     || |    
T  18741645 agcatataatcagtttataagattaggaattgacataatatttagaatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatt-----taaa 18741739  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  18741740 tattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgcaatcaagcaaag 18741832  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52842497 - 52842310
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52842497 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 52842398  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52842397 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgacgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 52842310  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 51249241 - 51248954
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51249241 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagagatgctaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 51249142  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     || |    
T  51249141 agcacataatcaatttatgagattatgaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatt-----tata 51249047  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  51249046 tattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacctcaaatgaaatcaagcaaag 51248954  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 237
Target Start/End: Original strand, 21698906 - 21699114
Alignment:
Q  24 tcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagag 123  Q
    |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21698906 tcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagag 21699005  T
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||||     |||||||    
T  21699006 catataatcagtttatgagattagaaattgacataatatttaggatgaaaacaatttgaaccaataaaggaactaatgatgtgtgaat-----ttacata 21699100  T
Q  224 ttatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||    
T  21699101 ttatccaaaattat 21699114  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39093240 - 39093053
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39093240 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 39093141  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39093140 aattgacataatatttaggatgcaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 39093053  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23195108 - 23194921
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23195108 tcttcgaaagaagagattttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattaga 23195009  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatta 236  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195008 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggagctaataaagaaatcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatta 23194921  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 31368356 - 31368566
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31368356 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagag 31368455  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  31368456 agcatataatcagtttatgaaattaggaattgacataatatttagaatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 31368550  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  31368551 tattatccaaaattat 31368566  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 2839570 - 2839758
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  2839570 tctttgagagaagagatgttaaaacgacggaacattgtaattcattataaaatatatatgagttgattaagagaacatataatcagtttatgagattaag 2839669  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2839670 aattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaatcaatgatgtgttaattatgattatatattattcaaaattat 2839758  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 40824010 - 40824196
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  40824010 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagaaaatataaacagtttatgagattagg 40824109  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40824110 aattgacataatattt-ggatgaaaacaatttgaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 40824196  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 48520380 - 48520567
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||   || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48520380 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattgatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 48520479  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520480 aattgacataatatttagaatgaaaacaattggaaccaa-aaagtaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 48520567  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 54934721 - 54934533
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |    
T  54934721 tctttaaaagaagagatgttaaaacgaaggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagaaagcatatcattagtttatgagattaag 54934622  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  54934621 aattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaatcatgattatatattatccaaaattat 54934533  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32756416 - 32756241
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattga 154  Q
    |||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||    
T  32756416 aaagaagagatggtaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagag-------ttagtttatgagattaggaattga 32756324  T
Q  155 gataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756323 cataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 32756241  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 6103461 - 6103671
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||   || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6103461 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaaaagatgttaaaacgacagaacattatgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagat 6103560  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  6103561 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 6103655  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  6103656 tattatccaaaattat 6103671  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 52852772 - 52852982
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  52852772 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagatatgttaaaacaatggaatattatgattcattataaaatatgtatgagctgattaagag 52852871  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  52852872 agcatataatcagtttatgaaattaggaattaacataatatttaggatgaaaacaattagaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 52852966  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  52852967 tattatccaaaattat 52852982  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 50742283 - 50742023
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50742283 tctttaaaagaagtgatgctaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggataattaagagagcatataaacagtttatgagattagg 50742184  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||| |               
T  50742183 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaacaaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtg 50742089  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50742088 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 50742023  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 4138140 - 4138310
Alignment:
Q  62 agatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataata 161  Q
    |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  4138140 agatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagaaattgacataatg 4138239  T
Q  162 tttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138240 tttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaagaaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4138310  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 35087219 - 35087358
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35087219 tctttaaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcgtaaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 35087318  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35087319 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 35087358  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 26777273 - 26777456
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26777273 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttcgagatcatataatcagtttatgagattagg 26777372  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26777373 aattggcataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaactaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 26777456  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 49113958 - 49113832
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49113958 gaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcaatttatgagattaggaattg 49113859  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  49113858 acataatatttaggataaaaacaattg 49113832  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16342563 - 16342383
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||      
T  16342563 tctttgaaagaagagtaattaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagatcatataatcagtttatgagaataaa 16342464  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  16342463 aattgacataatatttaggatgaaaacaa---gaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 16342383  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19353808 - 19353697
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19353808 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatggattgattaagag 19353709  T
Q  122 agcatataatca 133  Q
    ||||||||||||    
T  19353708 agcatataatca 19353697  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 138
Target Start/End: Original strand, 11597366 - 11597452
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagttta 138  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11597366 ttgaaagaaaagatattaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgatttagagatcatataatcagttta 11597452  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 162 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 53801068 - 53800998
Alignment:
Q  162 tttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53801068 tttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 53800998  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 49113779 - 49113715
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  49113779 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 49113715  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 48977754 - 48977676
Alignment:
Q  112 tgattaagagagcatataatcagttt--atgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  48977754 tgatcaagagagcatataatcagtttttatgagattttgaattgacataatttttaggatgaaaacaattggaaccaat 48977676  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16342370 - 16342306
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16342370 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatagccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 16342306  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23194901 - 23194839
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  23194901 ttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaattaagcaaag 23194839  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 48988969 - 48988903
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgat 115  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48988969 tcttcgaaagaagtgatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgat 48988903  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 48977382 - 48977329
Alignment:
Q  267 tgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48977382 tgttaccaaaaaataatcgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 48977329  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 8243205 - 8243141
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  8243205 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatactcatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 8243141  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 11597512 - 11597564
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  11597512 gttaccaaaaaaagattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 11597564  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 21699127 - 21699191
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  21699127 tgttgttataaagttacgaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcgagcaaag 21699191  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 52852995 - 52853059
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  52852995 tgttgttataaagttactaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 52853059  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 54934520 - 54934456
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||    
T  54934520 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 54934456  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 320
Target Start/End: Original strand, 52462474 - 52462535
Alignment:
Q  259 tgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  52462474 tgttatagagttaccaaaaaaggattgatactcatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 52462535  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 2843475 - 2843527
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||    
T  2843475 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacctcagatgaaatcaagcaaag 2843527  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 32756228 - 32756164
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||    
T  32756228 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatactcatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 32756164  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 48520580 - 48520644
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  48520580 tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaaacaaag 48520644  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Original strand, 39796415 - 39796474
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  39796415 gaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctg 39796474  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 40824209 - 40824274
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaa-aatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  40824209 tgttgttgtagagttaccaaaaaaatgattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagtaaag 40824274  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 110
Target Start/End: Original strand, 5252320 - 5252372
Alignment:
Q  58 gaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5252320 gaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggg 5252372  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 237
Target Start/End: Original strand, 11597455 - 11597487
Alignment:
Q  205 tgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11597455 tgtgaattatgattacatattatccaaagttat 11597487  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52842282 - 52842230
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||    
T  52842282 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacataagatgaaatcaaacaaag 52842230  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 55294321 - 55294385
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||    
T  55294321 tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacataagatgaaatcaaacaaag 55294385  T

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Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45399738 - 45399550
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45399738 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataattagtttatgagattagg 45399639  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45399638 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 45399550  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26822570 - 26822360
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822570 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 26822471  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  26822470 agcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 26822376  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  26822375 tattatccaaaattat 26822360  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Original strand, 36632393 - 36632656
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36632393 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatatatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaa 36632492  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnn 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||                 
T  36632493 ttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaatgaaccaatgatgtttgaattatgattacatattatcccaaattataaaatagagtgt- 36632591  T
Q  251 nnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
         | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  36632592 -----tattgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaataaagcaaag 36632656  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11448681 - 11448493
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11448681 tcttcgaaaaaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagaaagcaaataatcagtttataagattagg 11448582  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448581 aattgacataatatttaagatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 11448493  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5253280 - 5253097
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5253280 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaga 5253181  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  5253180 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 5253097  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 19167177 - 19167464
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19167177 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcattataaaatatgtatgggctgattaagag 19167276  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||     ||||    
T  19167277 aacatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccattgatgtgtgaatt-----taca 19167371  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  ||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19167372 tattatccaaaattataaaaaagaatgt------tgttgttatagaattatcaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 19167464  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 236
Target Start/End: Original strand, 45204350 - 45204537
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |    
T  45204350 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaaagcatctaatcagtttctgagattacg 45204449  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatta 236  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45204450 aattgacataatatttaaaatgaaaacaattggaactaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatta 45204537  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4812477 - 4812286
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatat---gtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagatt 145  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812477 tcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatcatgtatgggatgattaagagagcatataatcagtttatgagatt 4812378  T
Q  146 aggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4812377 agaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatcgaaaattat 4812286  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 19126028 - 19126238
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19126028 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagag 19126127  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||     |||||    
T  19126128 agcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaaggaaccaatgatatgtgaat-----ttaca 19126222  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  19126223 tattatccaaaattat 19126238  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 1514327 - 1514514
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1514327 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcatgaaatatgtatgggttgatttagagatcatataatcagtttatgagattaag 1514426  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1514427 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaagaaccaatgatgtgtgaattacgattacatgttatccaaaattat 1514514  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21098612 - 21098429
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21098612 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 21098513  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||| ||| |||| ||||||| ||     |||||||||| ||||||||||    
T  21098512 aattgacataatatttatgatgaaaattattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtggat-----ttacatattacccaaaattat 21098429  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 42886326 - 42886164
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42886326 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagcgcatataatcagtttatgagattagg 42886227  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaatt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| ||||||    
T  42886226 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaatg-accaatgatgtatgaatt 42886164  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 235
Target Start/End: Original strand, 33663117 - 33663292
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||||| ||||||||| || | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33663117 gaaagaagatatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagtaattg 33663216  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatt 235  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  33663217 acataatattta-gatgaaaacaattgaaaccaataaatgaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatt 33663292  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 16723718 - 16723901
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16723718 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggcctgatttagagagcatataatcagtttatgagattagg 16723817  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||     |||||||||||| ||||||||    
T  16723818 aattgacataatatttagaatgaaaactatttgaaccaataaaagaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatcgaaaattat 16723901  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11707587 - 11707377
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11707587 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagag 11707488  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||     |||||    
T  11707487 agcatataatcagtttatgagaatacaaattggcataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 11707393  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  11707392 tattatccaaaattat 11707377  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 33908177 - 33907917
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||      
T  33908177 tcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagtatataatcagtttatgagaataca 33908078  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  33908077 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 33907983  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33907982 t------tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 33907917  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 26828445 - 26828185
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||      
T  26828445 tcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataattagtttatgagaataca 26828346  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  26828345 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaactaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 26828251  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26828250 t------tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 26828185  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 320
Target Start/End: Original strand, 30569902 - 30570154
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattga 154  Q
    ||||||||| |||||||| || | || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30569902 aaagaagagctgttaaaatgaaggaacattgtgattcatcataaaaaatgta--ggctgattaagagagcatataatcagtttataagattaggaattga 30569999  T
Q  155 gataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnn 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||                     
T  30570000 cataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatt-----tacatattatccaaaattataaaaaagagtgt----- 30570089  T
Q  255 gtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  30570090 -tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgttactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 30570154  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 18092076 - 18092252
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18092076 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctaatttagagatcatataatcagtttatgaaattagg 18092175  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||            |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18092176 aattgacataatatttaggatgaaaacaattg------------gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 18092252  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 10048372 - 10048511
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10048372 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 10048471  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10048472 aattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaat 10048511  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 4291029 - 4291164
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4291029 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 4291128  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4291129 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 4291164  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 35285639 - 35285820
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       | |||||||| |||| |     
T  35285639 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagag-------ttagtttatgtgattgga 35285731  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35285732 atttgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgggaattatgattacatattattcaaaattat 35285820  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 9543995 - 9544126
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9543995 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 9544094  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9544095 aattgacataatttttaggatgaaaacaattg 9544126  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Original strand, 27364267 - 27364364
Alignment:
Q  140 gagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27364267 gagattaggaattgacatcatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 27364364  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 122
Target Start/End: Original strand, 27364197 - 27364270
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaga 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  27364197 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagatgattaagaga 27364270  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 18137914 - 18137828
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatg 108  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18137914 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatg 18137828  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 320
Target Start/End: Original strand, 33663352 - 33663402
Alignment:
Q  270 taccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33663352 taccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 33663402  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11707364 - 11707300
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  11707364 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacattaaatgaaatcaagcaaag 11707300  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42886124 - 42886060
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  42886124 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaagtgaaatcaagcaaag 42886060  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 28502499 - 28502440
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28502499 gaaagaagatatgttaaaacgacggaatattatgattcatcataaaatatgtatgggctg 28502440  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 320
Target Start/End: Original strand, 45204574 - 45204625
Alignment:
Q  269 ttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45204574 ttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 45204625  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11448479 - 11448417
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11448479 ttgttatggagttaccaaaaaagaattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 11448417  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 28608516 - 28608446
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaag 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28608516 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgactaag 28608446  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 113
Target Start/End: Original strand, 6342785 - 6342846
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  6342785 ttgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctg 6342846  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 319
Target Start/End: Original strand, 35285833 - 35285896
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  35285833 tgttgttataaagttaccaaaaaatgattgatacccatatttaaaacagatgaaatcaagcaaa 35285896  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 1514527 - 1514591
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  1514527 tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgataccgatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 1514591  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 1993012 - 1993068
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1993012 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcatcataaaatatgtatggg 1993068  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 14323271 - 14323327
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14323271 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggg 14323327  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45399537 - 45399473
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||| ||||||||    
T  45399537 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttaaaacagatgaaatgaagcaaag 45399473  T

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Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47175407 - 47175192
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47175407 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagag 47175308  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47175307 agcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaattatgattaca 47175208  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  47175207 tattatccaaaattat 47175192  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42918810 - 42918596
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42918810 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtaccggctgattaagag 42918711  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  42918710 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattatgattaca 42918612  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
     |||||||||||||||    
T  42918611 cattatccaaaattat 42918596  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17470644 - 17470463
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17470644 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaa 17470545  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  17470544 ttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 17470463  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 51 - 237
Target Start/End: Original strand, 17582570 - 17582751
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17582570 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaa 17582669  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  17582670 ttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 17582751  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33031798 - 33031589
Alignment:
Q  23 ttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaga 122  Q
    ||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33031798 ttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaga 33031699  T
Q  123 gcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacat 222  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     ||||||    
T  33031698 gcatataatcagtttatgagattcagaattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacat 33031604  T
Q  223 attatccaaaattat 237  Q
    |||||||||||||||    
T  33031603 attatccaaaattat 33031589  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 33638018 - 33638205
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  33638018 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcttataatcagtttattagattagg 33638117  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33638118 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 33638205  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 23299072 - 23299254
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| ||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23299072 gaaagaaaagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 23299171  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23299172 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaatcaatgatatgtgaattatgattacatattatccaaaattat 23299254  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 8925254 - 8925464
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8925254 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatcaagag 8925353  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||| |||||     |||||    
T  8925354 agcatataatcagtttatgatattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtatgaat-----ttaca 8925448  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  8925449 tattatccaaaattat 8925464  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 27734395 - 27734580
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27734395 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattg--attcattataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 27734492  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27734493 aattgacataataattaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 27734580  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4849017 - 4848834
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4849017 tcttcgaaagaaaagatcttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 4848918  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4848917 aattgacataatgtttaagttgaaaacaattggaaccaa-aaaagaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4848834  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42688469 - 42688209
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42688469 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcgtaaaatatgtatgggctgtttaagagaacatataatcagtttatgagattagg 42688370  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||     ||||||||||| |||||||||               
T  42688369 aattgacataatatttatgatgaaaacaatttgaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattattcaaaattataaaaaagggtg 42688275  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  42688274 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacacatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 42688209  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9150244 - 9150056
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| ||||||  |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9150244 tcttcgaaagaaaagatgtataaacgaaggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 9150145  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaatt-gaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9150144 aattgacataatatttaggatgaaaacaaaaaggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 9150056  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 49145636 - 49145819
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  49145636 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgatttagagatcatataatcagtttatttgattagg 49145735  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49145736 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatatgtgaattatgattacatattatccaaaa 49145819  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 68 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5963581 - 5963417
Alignment:
Q  68 taaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttagg 167  Q
    |||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5963581 taaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcaatttatgagattaggaattgacataatatttagg 5963482  T
Q  168 atgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  5963481 atgaaaacaattagaaccaataaaggaaccaatgaagtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 5963417  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14309758 - 14309618
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14309758 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacatcgtgattcatcatagaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 14309659  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaa 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14309658 ttgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaa 14309618  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 42826706 - 42826887
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||| |||||    
T  42826706 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgattaagagagcgtgtaa--aatttatgagattagaaattg 42826803  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  42826804 acataatatttaggataaaaataattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacacattattcaaaattat 42826887  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 19522046 - 19521912
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19522046 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataaccagtttatgagattatgaattg 19521947  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    | |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19521946 acataatatttaggttgaaaacaattggaaccaat 19521912  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11500767 - 11500514
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||  ||| ||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500767 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataa--tatttatg-----attaacagagcatataatcagtttatgagattagg 11500675  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  11500674 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaactaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 11500580  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  11500579 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 11500514  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Original strand, 39649328 - 39649467
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39649328 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 39649427  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39649428 aattgacataatatttaggatgaaaataattgaaaccaat 39649467  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17170932 - 17170797
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17170932 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 17170833  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17170832 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 17170797  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 237
Target Start/End: Original strand, 23765849 - 23765993
Alignment:
Q  88 attcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaa 187  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23765849 attcatcataaaatatgtatgacctgatttagaaagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaa 23765948  T
Q  188 taaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||| ||||||||    
T  23765949 taaatgaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatcgaaaattat 23765993  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 48528138 - 48528269
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48528138 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 48528237  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48528238 aattgacataatttttaggatgaaaacaattg 48528269  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Original strand, 31898169 - 31898300
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||  ||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31898169 tcttcgaaagaaaggatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 31898268  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31898269 aattgacataatttttaggatgaaaacaattg 31898300  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17478753 - 17478569
Alignment:
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||     |||||||    
T  17478753 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaat-----ttacata 17478659  T
Q  224 ttatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    |||||||||||| |                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17478658 ttatccaaaattgtaaaaaagaatgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaa 17478569  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 17483188 - 17483004
Alignment:
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||     |||||||    
T  17483188 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaat-----ttacata 17483094  T
Q  224 ttatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||||||||                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17483093 ttatccaaaattataaaaaagaatgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaa 17483004  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Original strand, 17570026 - 17570210
Alignment:
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||     |||||||    
T  17570026 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggataaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaat-----ttacata 17570120  T
Q  224 ttatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||||||||                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17570121 ttatccaaaattataaaaaagaatgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaa 17570210  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 319
Target Start/End: Original strand, 17574461 - 17574645
Alignment:
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||     |||||||    
T  17574461 catataatcagtttattagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaataatgatgtgtgaat-----ttacata 17574555  T
Q  224 ttatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    |||||||||||| |                  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17574556 ttatccaaaattgtaaaaaagaatgt------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaa 17574645  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33031575 - 33031514
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  33031575 ttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatattgacatcaaatgaaatcaagcaaa 33031514  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 6911421 - 6911477
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6911421 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcatcataaaatatgtatggg 6911477  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9150031 - 9149979
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  9150031 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaaacaaag 9149979  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 23299279 - 23299331
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  23299279 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcacatgaaatcaagtaaag 23299331  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 27734593 - 27734657
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  27734593 tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaaacaaag 27734657  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 42826901 - 42826965
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |  | || |||||||||||||    
T  42826901 tgttgttatagagttaccaaaaaaagattgatacccatatttaaaatagatgaaatcaagcaaag 42826965  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 47573399 - 47573455
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  47573399 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcatcataaaatatgtatggg 47573455  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 42918582 - 42918523
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaag 315  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||||||    
T  42918582 tgttgttatagagttaccaaaaaaagattgatactcatatttacatcagatgaaatcaag 42918523  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17470450 - 17470386
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||    
T  17470450 tgttgttattgagttattaaaaaatgattgatacccatattcacataaaatgaaatcaaacaaag 17470386  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 17582764 - 17582828
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||    
T  17582764 tgttgttattgagttattaaaaaatgattgatacccatattcacataaaatgaaatcaaacaaag 17582828  T

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Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 53 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48341235 - 48341052
Alignment:
Q  53 tgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaatt 152  Q
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T  48341235 tgaaagaagagatgttaaaacgataaaatattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaaagcatctaatcagtttttgagattaggaatt 48341136  T
Q  153 gagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatta 236  Q
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T  48341135 gacataatatttagaatgaaaacaattggaactaataaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatta 48341052  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45005693 - 45005506
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
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T  45005693 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatggagcattgtgattcatcataaaatatgtataggctgattaagaaagcatataattagtttatgagattagg 45005594  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
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T  45005593 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat-aaagaaataatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 45005506  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 47136192 - 47136010
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
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T  47136192 gaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 47136093  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
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T  47136092 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 47136010  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 10694138 - 10694320
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
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T  10694138 gaaagaaaagatgttaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatacgtatgggctgattaagagatcatataatcagtttatgagattaagaattg 10694237  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10694238 acataatatttaggatgaaaacaattggaaacaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 10694320  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 17672370 - 17672187
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
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T  17672370 gaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcataaaattaatttatgagattaggaattg 17672271  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672270 acataatatttaggacgaaaaccattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 17672187  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 38844502 - 38844712
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38844502 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 38844601  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||     ||||     
T  38844602 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatctgtgaat-----ttacg 38844696  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  38844697 tattatccaaaattat 38844712  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34693011 - 34692828
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34693011 tctttgaaagaatagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 34692912  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  34692911 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 34692828  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34688483 - 34688300
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34688483 tctttgaaagaatagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 34688384  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  34688383 aattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 34688300  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36682962 - 36682775
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  36682962 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggagcattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagaaaacatataattagtttatgagattagg 36682863  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36682862 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggatccaat-aaagaaataaggatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 36682775  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 16030946 - 16031128
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16030946 gaaataagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagaatataattagtttatgagattaggaattg 16031045  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16031046 acataatatttaggatgaaaacaattggaactaataaaggaaacaatgatgtgtg-attatgattacatattatccaaaattat 16031128  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 31620612 - 31620402
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31620612 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 31620513  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  31620512 agcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatttttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 31620418  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  31620417 tattatccaaaattat 31620402  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 50561970 - 50561785
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  50561970 tcttcgaaataaaagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatatatgggctgatttagagatcatataatcagtttat--gattagg 50561873  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50561872 aattgacataatatttagaatgaaaacaattgaaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 50561785  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 41829405 - 41829588
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41829405 tctttgaaagaatagttgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 41829504  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  41829505 aattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 41829588  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 52310757 - 52310570
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52310757 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagatgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 52310658  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52310657 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtatgaattatgattacatattatctaaaattat 52310570  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5426893 - 5426715
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5426893 gaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattatgaattg 5426794  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5426793 acataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 5426715  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44407279 - 44407096
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  44407279 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaaaagagcatataatcagtttataagattaga 44407180  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  44407179 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaactaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 44407096  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16300965 - 16300781
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16300965 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 16300866  T
Q  149 aattgagataat-atttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16300865 aattgacataatgttttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 16300781  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18815115 - 18814932
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18815115 tctttgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggtctgttttagagatcatataatcagtttatgagattagg 18815016  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  18815015 aattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 18814932  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 52520972 - 52521155
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52520972 tctttgaaagaatagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatacgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatg 52521071  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||     ||||||||||| |||||||||    
T  52521072 aattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaaggaaccaatgatatgtgaat-----ttacatattattcaaaattat 52521155  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 12245227 - 12245408
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       | ||||||||||||||      
T  12245227 tcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagag-------ttagtttatgagattata 12245319  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12245320 atttgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattattcaaaattat 12245408  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 51965188 - 51965361
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaa-tatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattag 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51965188 tctttgaaaggaaagatgttaaaacgagagaacattgtgattcatcataaaaatatgtatgtgctgatttagagatcatataatcagtttatgagattag 51965287  T
Q  148 gaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||            |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51965288 gaattgacataatatttaggatgaaaacaattg------------gaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 51965361  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4892006 - 4891871
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4892006 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 4891907  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4891906 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 4891871  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 29186481 - 29186616
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29186481 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 29186580  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29186581 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 29186616  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Original strand, 41962294 - 41962465
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaat 151  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||    
T  41962294 ttgaaagaagagatgctaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaaga---------atcagtttatgagattaggaat 41962384  T
Q  152 tgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  41962385 tgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 41962465  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33361609 - 33361474
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33361609 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatttatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 33361510  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33361509 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 33361474  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 17707277 - 17707377
Alignment:
Q  88 attcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaa 187  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  17707277 attcattataaaatatatatgggctgattaagagtgcacataatcaatttatgagattatgaattgacataatatttaggatgaaaataatttgaaccaa 17707376  T
Q  188 t 188  Q
    |    
T  17707377 t 17707377  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 113
Target Start/End: Original strand, 39760074 - 39760138
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39760074 tcttcgaaagaagatatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgggctg 39760138  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 48341036 - 48340974
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  48341036 ttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 48340974  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24294855 - 24294791
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24294855 tcttcgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctg 24294791  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 38844746 - 38844799
Alignment:
Q  268 gttaccaaaa-aatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38844746 gttaccaaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 38844799  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 16031158 - 16031222
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  16031158 tgttgttatagagttaccaaaaaaagattgatacccatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 16031222  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44407083 - 44407019
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| |||||    
T  44407083 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatattcagatcagatgaaatcaaacaaag 44407019  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 43254614 - 43254670
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43254614 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggg 43254670  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 50395028 - 50395084
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  50395028 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggg 50395084  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 51965379 - 51965443
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  51965379 tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaaacaaag 51965443  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 52310545 - 52310493
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  52310545 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcatatgaaatcaaacaaag 52310493  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 10694363 - 10694415
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  10694363 gttaccaaaaaagaattgatacccatatttacatgagatgaaatcaagcaaag 10694415  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 319
Target Start/End: Original strand, 12245421 - 12245485
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatg-attgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  12245421 tgttgttatagagttaccaaaaaaaggattgatacccatatttaaaacagatgaaatcaagcaaa 12245485  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36682761 - 36682697
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||| | || || |||||||||||||    
T  36682761 tgttgttatagagttaccaaaaaagaattgatactcatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 36682697  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 45005493 - 45005429
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  |||||||| |||||||| | || || |||||||||||||    
T  45005493 tgttgttatagagttaccaaaaaagaattgatactcatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 45005429  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 50561760 - 50561708
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  50561760 gttatcaaaaaaggattgatactcatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 50561708  T

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Target: scaffold1634 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 377 - 637
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377 tcttcgaaagaagagatgttaacacgatggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 476  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||  ||||||||               
T  477 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatgtaaaattataaaaaagagtg 571  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  572 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 637  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 101626 - 101438
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  101626 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataattagtttatgagattagg 101527  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101526 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 101438  T

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Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 101423 - 101361
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | || || |||||||||||||    
T  101423 ttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttaaaacagatgaaatcaagcaaag 101361  T

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Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 51)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9761900 - 9761717
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9761900 tctttgaaagaagagatgttagaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 9761801  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  9761800 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 9761717  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 33423587 - 33423797
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33423587 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggactgattaagag 33423686  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  33423687 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 33423781  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  33423782 tattatccaaaattat 33423797  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 320
Target Start/End: Original strand, 22332061 - 22332319
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22332061 tttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 22332160  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnn 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||| |||||     |||||||||||||||||||||                 
T  22332161 ttgacataatatttaggatgaaaacaatttgaaccaataaaggaaccaatgatgtatgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtgt- 22332254  T
Q  251 nnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
         ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22332255 -----tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 22332319  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 44382128 - 44382315
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44382128 tcttcgaaagaaaagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 44382227  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44382228 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 44382315  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 14078158 - 14078368
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14078158 gttcaataacgtattcgataattattttttttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 14078257  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  14078258 agcatataaccagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 14078352  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  14078353 tattatccaaaattat 14078368  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 51 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42785799 - 42785618
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  42785799 tttgaaagaagatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaaattaagaa 42785700  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  42785699 ttgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 42785618  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Original strand, 36597367 - 36597627
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36597367 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgatgcatcataaaatatgtatgggttgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 36597466  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  36597467 aattgacataatatttaagatgaaaacaattggaactaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 36597561  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36597562 t------tgttgtaatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 36597627  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 19394867 - 19395154
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19394867 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttctaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggcagattaagag 19394966  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     ||||    
T  19394967 agcatataatcagtttatgagattaggaattgatataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaatt-----taca 19395061  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    | ||||||||||||||                  | ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19395062 ttttatccaaaattataaaaaagagtgt------tattgttatagagttaccaaaaaatgattgatgcccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 19395154  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 27273891 - 27273681
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27273891 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcaaaaaatatatatgggctgattaagag 27273792  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  27273791 agcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaatgaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 27273697  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  27273696 tattatccaaaattat 27273681  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19248810 - 19248596
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19248810 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaggaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgagctgatgaagag 19248711  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19248710 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattataattaca 19248612  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
     |||||||||||||||    
T  19248611 cattatccaaaattat 19248596  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19321994 - 19321780
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  19321994 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaggaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgagctgatgaagag 19321895  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  19321894 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattataattaca 19321796  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
     |||||||||||||||    
T  19321795 cattatccaaaattat 19321780  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 237
Target Start/End: Original strand, 23521994 - 23522175
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23521994 tttgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagaaa 23522093  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||     |||||||||||||||||||||    
T  23522094 ttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtttgaat-----ttacatattatccaaaattat 23522175  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 4465824 - 4466007
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  4465824 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcaatttatgagattatg 4465923  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4465924 aattgacataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4466007  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5836253 - 5836045
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5836253 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 5836154  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
      ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||     |||||    
T  5836153 --catataatcagttaatgagattaggaattgacataatatttatgaaaaaaacaattggaaccaataaaagaactaatgatgtgtgaat-----ttaca 5836061  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  5836060 tattatccaaaattat 5836045  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 45291791 - 45292005
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||||| | |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45291791 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagatacgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtacgggctgattaagag 45291890  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45291891 agcatataataagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattatcaccaa-aaaggaaccaatgatgtgagaattatgattaca 45291989  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
     |||||||||||||||    
T  45291990 cattatccaaaattat 45292005  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 52 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30827020 - 30826840
Alignment:
Q  52 ttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  30827020 ttgaaagaagagatgttaaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcaatttatacgattaggaat 30826921  T
Q  152 tgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  30826920 tgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaacaaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 30826840  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38962836 - 38962683
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962836 tctttgaaagaagtgatgttaaaacgacggaatattgtgattcatcataaaatatacatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 38962737  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataa 202  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38962736 aattgacataatttttaggatgaaaacaattggaaccaataaatgaaccaataa 38962683  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7015805 - 7015547
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  7015805 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagtgagcatataatcagtctat--gattagg 7015708  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  7015707 aattgacataatatttaagatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 7015613  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7015612 t------tgttgttatagagttatcaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 7015547  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 25615860 - 25616042
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25615860 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaatgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 25615959  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25615960 aattgacataatgtttaggatgataacaattggaaccaa-aaaggaatcaat-atgtctgaattatgattacatattatccaaaa 25616042  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 41533187 - 41533374
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41533187 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacaggacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcaatttatgagattagg 41533286  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41533287 aattgacataatatttaggaagaaagcaattggaacgaa-aaaggaaccaataatgtgtgaattatgattgcatattatccaaaattat 41533374  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44600356 - 44600096
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  44600356 tcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataatcagtttatgagaataca 44600257  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||               
T  44600256 aattgacataatatgtaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattataaaaaagagtg 44600162  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44600161 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 44600096  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7389886 - 7389704
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7389886 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatttaatcagtttatgagattagg 7389787  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389786 aattgacataatgtttaggaggaaaacaattggaacca--aaaaggatcaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 7389704  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38994340 - 38994079
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  38994340 tcttcgaaagaagagatattaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgattaagagagcatataatcagtttatgagaataca 38994241  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||||                
T  38994240 aattgacataatatgtaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatta-----ataaaaa 38994151  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38994150 agagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 38994079  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41978160 - 41977978
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  41978160 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacgttgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgaaattagg 41978061  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaa 232  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41978060 aatggacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaagaaaccaatgatgtgtgaagtatgattacatattattcaaa 41977978  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25345193 - 25345015
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| |||||||||||  | | || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  25345193 gaaagaaaagatgttaaaaaaacggaacattgtggttcatcataaaatatgtatgggctgattgaaagatcatataatctgtttatgagattaggaatta 25345094  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25345093 acataatgtttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 25345015  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41629527 - 41629393
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41629527 gaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagactaggaattg 41629428  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41629427 acaaaatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 41629393  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 25620134 - 25620317
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25620134 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcttaaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattggg 25620233  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25620234 aattggaataatgtttaggatgaaaacaattggaa-taaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 25620317  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 124 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 41157183 - 41157070
Alignment:
Q  124 catataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacata 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41157183 catataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacata 41157084  T
Q  224 ttatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||    
T  41157083 ttatccaaaattat 41157070  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 237
Target Start/End: Original strand, 22946140 - 22946315
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattga 154  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||       | ||||||||||||||| | ||||    
T  22946140 aaagtagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatatatgagctgattaagagag-------ttagtttatgagattagaatttga 22946232  T
Q  155 gataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22946233 cataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaaacaatgatgtgtgaattatgattacatattattcaaaattat 22946315  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3751749 - 3751599
Alignment:
Q  63 gatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatat 162  Q
    ||||||||||| | | || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3751749 gatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcaaaaaatatgtataggctgatttagagattatataatcagtttatgagattaggaattgacataatat 3751650  T
Q  163 ttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattat 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  3751649 ttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattat 3751599  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 98 - 237
Target Start/End: Original strand, 6476874 - 6477008
Alignment:
Q  98 aaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaacc 197  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  6476874 aaatatgtatgggatgattaatagagcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatataggataaaaacaattggaaccaataaaggaacc 6476973  T
Q  198 aataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  6476974 aataatgtgtgaat-----atacatattatccaaaattat 6477008  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12760883 - 12760752
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12760883 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtataggctgatttagagatcatataatctgtttatgagattagg 12760784  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattg 180  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  12760783 aattgacataatatataggatgaaaacaattg 12760752  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 212
Target Start/End: Original strand, 42810359 - 42810435
Alignment:
Q  136 ttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaatt 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  42810359 ttatgagattaggaattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaatt 42810435  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38962628 - 38962564
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38962628 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatatccatatttacatcaaataaaatcaagcaaag 38962564  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38992972 - 38992908
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38992972 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatatccatatttacatcaaataaaatcaagcaaag 38992908  T

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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41629348 - 41629284
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  41629348 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgataatcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 41629284  T

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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 42810462 - 42810525
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  42810462 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaat-gaatcaagcaaag 42810525  T

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Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 319
Target Start/End: Original strand, 22946328 - 22946391
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  22946328 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttaaaacaaatgaaatcaagcaaa 22946391  T

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Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 314
Target Start/End: Original strand, 6477021 - 6477079
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaa 314  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6477021 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaa 6477079  T

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Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 114
Target Start/End: Original strand, 42060725 - 42060785
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctga 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  42060725 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggctga 42060785  T

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Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19248575 - 19248510
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgatt-gatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  19248575 tgttgttatagagttaccaaaaaatgatttgatacccatatttacatcagatgaaatcaagaaaag 19248510  T

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Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19321759 - 19321694
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgatt-gatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  19321759 tgttgttatagagttaccaaaaaatgatttgatacccatatttacatcagatgaaatcaagaaaag 19321694  T

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Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3751561 - 3751509
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  3751561 gttaccaaaaaaggattgatactcatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 3751509  T

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Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 23522188 - 23522252
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  23522188 tgttgttatagagttactaaaaaatgattgatacctatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 23522252  T

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Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41157042 - 41156990
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||    
T  41157042 gttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaaacaaag 41156990  T

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Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 44382328 - 44382392
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||    
T  44382328 tgttgttgtagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacataagatgaaatcaagtaaag 44382392  T

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Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 44940499 - 44940443
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44940499 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggg 44940443  T

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Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Original strand, 45293111 - 45293163
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  45293111 gttaccaaaaaatgattgatatccatatttacatcatatgaaatcaagaaaag 45293163  T

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Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 6300547 - 6300602
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6300547 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgg 6300602  T

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Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37029895 - 37029836
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctg 113  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  37029895 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatatatgggctg 37029836  T

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Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 23966450 - 23966506
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatggg 110  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  23966450 gaaagaagatatgttaaaacgacggaacattataattcttcataaaatatgtatggg 23966506  T

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Target: chr6 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33814863 - 33814680
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33814863 tctttgaaagaagagatgataaaacgacgaaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggatgattaagagagcatataatcaatttatgagattagg 33814764  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  33814763 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 33814680  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 1072611 - 1072821
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072611 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgaaattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 1072710  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  1072711 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 1072805  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  1072806 tattatccaaaattat 1072821  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 14887273 - 14887496
Alignment:
Q  9 aacctgtgcgaatgttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatg 108  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  14887273 aacccgtgcgaaagttcaataacgtattcgataaaaaaaatctttgaaagaagagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtata 14887372  T
Q  109 ggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  14887373 ggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaagaattgacataatatttaggatgaaaactattgaaaccaataaaggaatcaatgatgtgtg 14887472  T
Q  209 aattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||     |||||||||||| ||||||||    
T  14887473 aat-----ttacatattatcaaaaattat 14887496  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 18598333 - 18598543
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        | ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18598333 gttcaataacgtattcgataaaaaaattatttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgcttaagag 18598432  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  18598433 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 18598527  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  18598528 tattatccaaaattat 18598543  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14832382 - 14832195
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14832382 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatatatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 14832283  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14832282 agttgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaacgaaccaatgatgtttgaattatgattacatattatccaaaattat 14832195  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17940415 - 17940155
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17940415 tcttcgaaagaagagatgctaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagagaacatataatcagtttatgagattagg 17940316  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnn 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||     ||||||||||||||||||| |               
T  17940315 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattgtaaaaaagagtg 17940221  T
Q  249 nnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
           ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17940220 t------tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 17940155  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18312685 - 18312502
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18312685 tctttgaaagaagagatgttgaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaga 18312586  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  18312585 aattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 18312502  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 35041982 - 35041800
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35041982 tctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaagattgtgattcatcataaaatatgtatgtgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaga 35041883  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  35041882 aattgacataatatttaggatg-aaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 35041800  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34856824 - 34856641
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | | || ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34856824 tctttgaaagaagagatgttaaaactacggaacattatgattcatcataaaatatgtatggactgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 34856725  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  34856724 aattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 34856641  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 22373168 - 22373378
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22373168 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagatatgttaaaactacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagag 22373267  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||||     |||||    
T  22373268 agcacataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaagatgaaaacaattagacccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttaca 22373362  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  22373363 tattatccaaaattat 22373378  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 55 - 320
Target Start/End: Original strand, 33320807 - 33321065
Alignment:
Q  55 aaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattga 154  Q
    |||||| ||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33320807 aaagaaaagatgttaaaacgacagaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattga 33320906  T
Q  155 gataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnn 254  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||                     
T  33320907 cataatatttaggatgaaaacaattagaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgttaattatgattacatgttatccaaaattataaaaaagagtgt----- 33321000  T
Q  255 gtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
     ||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33321001 -tgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttatatcagatgaaatcaagcaaag 33321065  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4108624 - 4108441
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4108624 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcattataaaatatgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaag 4108525  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4108524 aattgacataatatttaggatgaaaacaataggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 4108441  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 11932857 - 11933040
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11932857 tctttaaaagaagataagttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgacctgattaagagagtatataatcagtttaagagattagg 11932956  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  11932957 aattgacataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 11933040  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21800440 - 21800230
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21800440 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgtaaaaacgacggaacattgtgatgcatcataaaatatgtatgacctgattaagag 21800341  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  || |||| ||||||||||     |||||    
T  21800340 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaagaaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 21800246  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  21800245 tattatccaaaattat 21800230  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25540833 - 25540651
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    ||||||| |||| |||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25540833 gaaagaaaagatattaaaacgacaaaaaattatgattcatcataaaatatgtatggcctgatttagagatcatataatcagtttatgagattaggaattg 25540734  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25540733 acataatgtttaggatgaaaacaattggaa-caaaaaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 25540651  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15276521 - 15276348
Alignment:
Q  59 aagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgagata 158  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  15276521 aagagatgttaaaatgacggaatattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagatcatataatcagtttatgagattgggaattaacata 15276422  T
Q  159 atatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  15276421 atatttatgataaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 15276348  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 51 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 7223192 - 7223055
Alignment:
Q  51 tttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 150  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7223192 tttgaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatctgctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaa 7223093  T
Q  151 ttgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  7223092 ttgacataatatttaagatgaaaacatttgaaaccaat 7223055  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 4425372 - 4425198
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||         |||||    
T  4425372 tcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattatgattcatcataaaatatgtatgggttgattaagagagcatataatcag---------ttagg 4425282  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  4425281 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 4425198  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35158869 - 35158714
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35158869 tcttcgaaagaaaatatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatctgtatggactgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 35158770  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgt 205  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  35158769 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgt 35158714  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1220424 - 1220289
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1220424 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 1220325  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1220324 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 1220289  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24445833 - 24445698
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24445833 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 24445734  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24445733 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 24445698  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 34321983 - 34321844
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | || ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34321983 tcttcgaaagaagagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcatgaaatatgtacgggcagattaagagagcatataatcagtttatgagattaga 34321884  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaat 188  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34321883 aattggcataatatttaggatgaaaacaattggaaccaat 34321844  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 9979442 - 9979577
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9979442 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 9979541  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9979542 aattgacataatttttagaatgaaaacaattgaaac 9979577  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2522037 - 2521928
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || | || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2522037 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaatgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagttgattaagag 2521938  T
Q  122 agcatataat 131  Q
    ||||||||||    
T  2521937 agcatataat 2521928  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 28573342 - 28573418
Alignment:
Q  156 ataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 233  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28573342 ataatgtttaggatgaaaacgattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaa 28573418  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2521932 - 2521856
Alignment:
Q  156 ataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  2521932 ataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaattat 2521856  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 319
Target Start/End: Original strand, 22373393 - 22373454
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  22373393 ttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatattgacatcaaatgaaatcaagcaaa 22373454  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7222998 - 7222946
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7222998 gttaccaaaaaatgattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 7222946  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15276335 - 15276271
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  15276335 tgttgttatagagttaccaaaaagggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 15276271  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18312489 - 18312425
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  18312489 tgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 18312425  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25540618 - 25540567
Alignment:
Q  269 ttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  25540618 ttaccaaaaaatgattgatacccatatttaaatcagatgaaatcaagcaaag 25540567  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 116
Target Start/End: Original strand, 13456795 - 13456857
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgatt 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13456795 gaaagaagatatgttaaaacgatggaacattataattcatcataaaatatgtatgggttgatt 13456857  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 34321794 - 34321730
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  34321794 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagaaaag 34321730  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 30044905 - 30044843
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  30044905 ttgttatagagttaccaaaaaaggattgatactcatatttacatcaaaagaaatcaagcaaag 30044843  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4425185 - 4425120
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaa-tgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||    
T  4425185 tgttgttatagagttaccaaaaaaatgattgatacccagatttgcatcaaatgaaatcaagcaaag 4425120  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 34321851 - 34321807
Alignment:
Q  193 gaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34321851 gaaccaatgatgtgagaattatgattacacattatccaaaattat 34321807  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 35041775 - 35041723
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||    
T  35041775 gttactaaaaaataattgatacccatattcacatcaaatgaaatcaaacaaag 35041723  T

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Target: scaffold0010 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 120847 - 120633
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        | ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  120847 gttcaataacgtattcgataaattttttttttaaaagaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggttaattaagag 120748  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  120747 agcatataatcagtttatgagattatgaattgatataatatttaagatg-aaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatgtgagaattatgattaca 120649  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  120648 tattatccaaaattat 120633  T

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Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 177174 - 177110
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  177174 tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacattaaatgaaatcaagcaaag 177110  T

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Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 120608 - 120556
Alignment:
Q  268 gttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  120608 gttaccaaaaaaggattgatacttatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 120556  T

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Target: scaffold0121 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 14647 - 14942
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14647 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttaaaagaagagatgttaaaatgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagag 14746  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||     ||||     
T  14747 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaaggaaccaatgatctgtgaat-----ttacg 14841  T
Q  222 tattatccaaaattat--nnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaa 319  Q
    ||||||||||||||||                    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14842 tattatccaaaattataaaaaaaaaaaaaagagtgttgttgttatagagttaccaaaaaatgattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaa 14941  T

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Target: scaffold0122 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 5413 - 5203
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5413 gttcaataacgtattcgataaaaatattctttgaaagaagagatgttaaaacaacggaacattgtaattcattataaaatatgtatgagctgattaagag 5314  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  5313 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 5219  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  5218 tattatccaaaattat 5203  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 12242 - 12456
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12242 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaaaagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatttagag 12341  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12342 atcatataatcagtttatgagattatgaattgacataatatttaggataaaaacaattagaaccaa-aagggaaccaatgatgtgtgaattatgattaca 12440  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  12441 tattatccaaaattat 12456  T

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Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 12469 - 12533
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | | |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  12469 tgttgttgtagagttagcaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaaccaagcaaag 12533  T

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Target: scaffold0047 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Original strand, 25712 - 25885
Alignment:
Q  57 agaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25712 agaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgaca 25811  T
Q  157 taatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  25812 taatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatt 25885  T

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Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 320
Target Start/End: Original strand, 25900 - 25964
Alignment:
Q  256 tgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25900 tgttgtaatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 25964  T

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Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Original strand, 25676 - 25714
Alignment:
Q  105 tatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25676 tatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaga 25714  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10808 - 10635
Alignment:
Q  57 agaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattgaga 156  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  10808 agaagagatgttaaaacgatggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattatgaattgaca 10709  T
Q  157 taatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaatt 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||||||||||||||||    
T  10708 taatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttacatattatccaaaatt 10635  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10844 - 10806
Alignment:
Q  105 tatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10844 tatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgaga 10806  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 4308 - 4495
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4308 tcttcgaaagaaccgatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataacatttgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 4407  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4408 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 4495  T

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Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Original strand, 10757 - 10944
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10757 tcttcgaaagaaccgatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataacatttgtatgggctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 10856  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10857 aattgacataatatttatgatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 10944  T

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Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 320
Target Start/End: Original strand, 4504 - 4569
Alignment:
Q  255 gtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  4504 gtgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 4569  T

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Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 320
Target Start/End: Original strand, 10953 - 11018
Alignment:
Q  255 gtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  10953 gtgttgttgtagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatcagatgaaatcaagcaaag 11018  T

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Target: scaffold1891 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1891
Description:

Target: scaffold1891; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 133
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  343 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaatgacggaactttgtgattcatcataaaatatatatgagctgattaagag 244  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||     |||||    
T  243 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaactattggaaccaataaaggaatcaatgatgtgtgaat-----ttaca 149  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
    ||||||||||||||||    
T  148 tattatccaaaattat 133  T

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Target: scaffold0079 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 10081 - 10263
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10081 gaaagaaaggatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgggctgatctagaggtcatataatcattttatgagattaggaattg 10180  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10181 acataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaaccaatgatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 10263  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3328 - 3142
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  3328 tcttcgaaagaaaggatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatggggtaatttagagatcatataatcagtttatga-attagg 3230  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3229 aattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaa-aaaggaacgaatgttgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 3142  T

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Target: scaffold0171 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 237
Target Start/End: Original strand, 29667 - 29876
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29667 gttcaataacgtattcgataaaaaaaatcttcgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcctcataaaatatgtacgggctgattaagag 29766  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||| |||| |||||     |||||    
T  29767 agcatataatcagtttatgagattaggaattgacataatatttaggatgaaaataattggaaccaa-aaaggaaacaatgatgtatgaat-----ttaca 29860  T
Q  222 tattatccaaaattat 237  Q
     |||||||||||||||    
T  29861 cattatccaaaattat 29876  T

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Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 303
Target Start/End: Original strand, 29885 - 29933
Alignment:
Q  255 gtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatca 303  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29885 gtgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatacccatatttacatca 29933  T

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Target: scaffold0242 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 320
Target Start/End: Original strand, 2737 - 3024
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        |||| |||||||||||| |||||| || | || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2737 gttcaataacgtattcgataaaaaaattcttcgaaagaagagatattaaaatgacggaacattgtgattcatcaaaaaatatgtatgagctgattaagag 2836  T
Q  122 agcatataatcagtttatgagattaggaattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||     ||||    
T  2837 agcatataatcagtttatgagaatgcaaattgacataatatttaggatgaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatgtgtgaatt-----taca 2931  T
Q  222 tattatccaaaattatnnnnnnnnnnnnnnnnngtgttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||||||||||||                  ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2932 tattatccaaaattataaaaaagagtgt------tgttgttatagagttaccaaaaaaggattgatactcatatttacatcaaatgaaatcaagcaaag 3024  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 18761 - 18896
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18761 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 18860  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18861 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 18896  T

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Target: scaffold0069 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13639 - 13504
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattagg 148  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13639 tcttcgaaggaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgatttagagatcatataatcagtttatgagattagg 13540  T
Q  149 aattgagataatatttaggatgaaaacaattgaaac 184  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13539 aattgacataatttttaggatgaaaacaattgaaac 13504  T

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Target: scaffold0110 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 237
Target Start/End: Original strand, 48586 - 48764
Alignment:
Q  54 gaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagagagcatataatcagtttatgagattaggaattg 153  Q
    |||||||||||| |||||| ||   || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |     
T  48586 gaaagaagagatattaaaatgacataacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagagagcatataatcagtttatgagaatacaaacta 48685  T
Q  154 agataatatttaggatgaaaacaattgaaaccaataaaagaaccaataatgtgtgaattatgattacatattatccaaaattat 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| || |||||     | |||||||||||||||||||||    
T  48686 acataatatttaggattaaaacaattggaaccaataaagaaaccaatgatatgtga-----gtttacatattatccaaaattat 48764  T

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Target: scaffold0110; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 320
Target Start/End: Original strand, 48778 - 48840
Alignment:
Q  258 ttgttatggtgttaccaaaaaatgattgatacccatatttatatcaaataaaatcaagcaaag 320  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  48778 ttgttatagagttaccaaaaaaagatttatactcatatttacatcaaaagaaatcaagcaaag 48840  T

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Target: scaffold0169 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 17092 - 16979
Alignment:
Q  22 gttcaataacgtattcgatnnnnnnnntctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaagag 121  Q
    |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17092 gttcaataacgtattcgataaaaaaattctttgaaagaagagatgttaaaacgacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgattaagag 16993  T
Q  122 agcatataatcagt 135  Q
    ||||||||||||||    
T  16992 agcatataatcagt 16979  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 231879 - 231809
Alignment:
Q  49 tctttgaaagaagagatgttaaaacgatgaaatattgtcattcatcataaaatatgtatgggctgattaag 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  231879 tcttcgaaagaaaagatgttaaaacaacggaacattgtgattcatcataaaatatgtatgagctgactaag 231809  T

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