View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12191_high_2 (Length: 294)

Name: NF12191_high_2
Description: NF12191
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12191_high_2
NF12191_high_2
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (16-294)||(7478-7756)
scaffold0143 (16-294)||(30811-31089)
scaffold0143 (16-294)||(19588-19866)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (16-294)||(3793066-3793344)
chr5 (15-294)||(18497081-18497360)
chr5 (16-294)||(33878655-33878933)
chr5 (16-294)||(40469907-40470185)
chr5 (16-294)||(9321001-9321279)
chr5 (16-294)||(24586899-24587177)
chr5 (16-294)||(26483919-26484197)
chr5 (16-294)||(8661832-8662110)
chr5 (16-294)||(12135700-12135978)
chr5 (16-294)||(30155556-30155834)
chr5 (19-294)||(33519905-33520180)
chr5 (15-294)||(43081780-43082059)
chr5 (16-294)||(9547066-9547344)
chr5 (16-294)||(11327162-11327440)
chr5 (16-294)||(24727494-24727772)
chr5 (16-294)||(31434989-31435267)
chr5 (16-294)||(31822764-31823042)
chr5 (16-294)||(33296053-33296331)
chr5 (16-294)||(37767348-37767626)
chr5 (15-294)||(28652767-28653046)
chr5 (16-294)||(11552880-11553158)
chr5 (16-294)||(13183150-13183428)
chr5 (16-294)||(23629495-23629773)
chr5 (16-294)||(29887554-29887832)
chr5 (16-294)||(30032953-30033231)
chr5 (16-294)||(37667843-37668121)
chr5 (16-294)||(41678230-41678508)
chr5 (15-294)||(34620043-34620322)
chr5 (16-294)||(15655115-15655393)
chr5 (16-294)||(18371891-18372169)
chr5 (16-294)||(25203803-25204081)
chr5 (16-294)||(25267958-25268236)
chr5 (16-294)||(37355000-37355278)
chr5 (17-294)||(22891988-22892265)
chr5 (16-294)||(6877830-6878108)
chr5 (16-294)||(22995474-22995752)
chr5 (16-294)||(37758508-37758786)
chr5 (15-294)||(32592630-32592909)
chr5 (16-294)||(2514587-2514865)
chr5 (16-294)||(15755209-15755487)
chr5 (16-294)||(24973431-24973709)
chr5 (16-294)||(30171994-30172272)
chr5 (16-294)||(30938160-30938438)
chr5 (16-294)||(33781014-33781288)
chr5 (16-294)||(13439040-13439318)
chr5 (16-294)||(18124773-18125051)
chr5 (16-294)||(28956142-28956420)
chr5 (19-294)||(5641313-5641588)
chr5 (22-294)||(13321193-13321465)
chr5 (211-294)||(24684697-24684780)
chr5 (58-294)||(3483602-3483838)
chr5 (58-269)||(11943821-11944032)
chr5 (58-269)||(5439624-5439835)
chr5 (58-269)||(15784124-15784335)
chr5 (58-269)||(17957647-17957858)
chr5 (108-271)||(34469170-34469333)
chr5 (58-227)||(36375361-36375530)
chr5 (58-227)||(37000015-37000184)
chr5 (58-269)||(31520857-31521068)
chr5 (115-233)||(20388445-20388563)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (16-294)||(27779751-27780029)
chr2 (16-294)||(27819508-27819786)
chr2 (19-294)||(34158361-34158636)
chr2 (16-294)||(3786010-3786288)
chr2 (16-294)||(13932996-13933274)
chr2 (16-294)||(22924597-22924875)
chr2 (16-294)||(27120041-27120319)
chr2 (16-294)||(11631633-11631911)
chr2 (16-294)||(31889940-31890218)
chr2 (16-294)||(40237025-40237303)
chr2 (15-294)||(31879803-31880082)
chr2 (16-294)||(257102-257380)
chr2 (16-294)||(19412950-19413228)
chr2 (16-294)||(21673624-21673902)
chr2 (16-294)||(32053320-32053598)
chr2 (16-294)||(37682344-37682622)
chr2 (16-294)||(37697609-37697887)
chr2 (15-294)||(9346434-9346713)
chr2 (19-294)||(16825790-16826065)
chr2 (19-294)||(16895415-16895690)
chr2 (16-294)||(34865201-34865479)
chr2 (16-294)||(37928886-37929164)
chr2 (16-294)||(34294671-34294949)
chr2 (15-294)||(39048267-39048546)
chr2 (16-294)||(12590325-12590603)
chr2 (16-294)||(20841430-20841708)
chr2 (16-294)||(27807220-27807498)
chr2 (16-294)||(12659053-12659331)
chr2 (16-294)||(39893586-39893864)
chr2 (16-294)||(12713050-12713328)
chr2 (16-294)||(21699620-21699898)
chr2 (16-294)||(27430890-27431168)
chr2 (15-294)||(16164997-16165276)
chr2 (16-294)||(23125018-23125295)
chr2 (16-294)||(37381194-37381472)
chr2 (16-294)||(37948311-37948589)
chr2 (16-276)||(34271369-34271629)
chr2 (16-294)||(27395079-27395357)
chr2 (16-269)||(28885821-28886074)
chr2 (16-294)||(19452872-19453150)
chr2 (142-294)||(27827977-27828129)
chr2 (22-294)||(34701593-34701865)
chr2 (210-294)||(28885724-28885808)
chr2 (58-294)||(42394052-42394288)
chr2 (58-233)||(22949971-22950146)
chr2 (58-269)||(12384202-12384413)
chr2 (56-271)||(21760104-21760319)
chr2 (115-233)||(34533991-34534109)
chr2 (115-233)||(26723824-26723942)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (15-294)||(29504931-29505210)
chr6 (16-294)||(13520595-13520873)
chr6 (16-294)||(14141797-14142075)
chr6 (16-294)||(26789331-26789609)
chr6 (16-294)||(27197700-27197978)
chr6 (16-294)||(27251257-27251535)
chr6 (16-294)||(28164006-28164284)
chr6 (19-294)||(30554422-30554697)
chr6 (15-294)||(33372833-33373112)
chr6 (16-294)||(4761278-4761556)
chr6 (16-294)||(27358513-27358791)
chr6 (16-294)||(27448856-27449134)
chr6 (16-294)||(29576529-29576807)
chr6 (16-294)||(34460909-34461187)
chr6 (16-294)||(27011246-27011524)
chr6 (16-294)||(27061021-27061299)
chr6 (15-294)||(16677655-16677934)
chr6 (16-294)||(4528800-4529078)
chr6 (16-294)||(13295354-13295632)
chr6 (16-294)||(16753336-16753614)
chr6 (16-294)||(27626114-27626392)
chr6 (16-294)||(29553072-29553350)
chr6 (16-294)||(4776395-4776673)
chr6 (16-294)||(24867231-24867509)
chr6 (16-294)||(26112815-26113093)
chr6 (16-294)||(26921892-26922170)
chr6 (16-294)||(27022651-27022929)
chr6 (16-294)||(28210969-28211247)
chr6 (16-294)||(3699598-3699876)
chr6 (16-294)||(8902106-8902384)
chr6 (16-294)||(27179971-27180249)
chr6 (16-294)||(27268990-27269268)
chr6 (16-294)||(4542177-4542455)
chr6 (16-294)||(4720538-4720816)
chr6 (16-294)||(16940430-16940708)
chr6 (16-294)||(27488648-27488926)
chr6 (16-294)||(22931287-22931565)
chr6 (16-294)||(23853732-23854010)
chr6 (16-286)||(24302160-24302430)
chr6 (16-294)||(26775030-26775308)
chr6 (16-294)||(27286767-27287045)
chr6 (16-294)||(15420723-15421001)
chr6 (16-294)||(17088846-17089124)
chr6 (16-294)||(20172062-20172340)
chr6 (16-294)||(22163651-22163929)
chr6 (109-294)||(22455610-22455795)
chr6 (16-135)||(15408936-15409055)
chr6 (208-294)||(26992310-26992396)
chr6 (58-294)||(18119984-18120220)
chr6 (58-230)||(18212114-18212286)
chr6 (22-294)||(23971179-23971451)
chr6 (58-269)||(9135798-9136009)
chr6 (115-233)||(27545478-27545596)
chr6 (55-175)||(25707645-25707765)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (15-294)||(18797073-18797352)
chr4 (16-294)||(5009406-5009684)
chr4 (16-294)||(6573389-6573667)
chr4 (16-294)||(27159777-27160055)
chr4 (16-294)||(36340977-36341255)
chr4 (16-294)||(40102097-40102375)
chr4 (16-294)||(54836922-54837200)
chr4 (19-294)||(21973232-21973507)
chr4 (19-294)||(31122975-31123250)
chr4 (15-294)||(39854168-39854447)
chr4 (16-294)||(14102074-14102352)
chr4 (16-294)||(20334881-20335159)
chr4 (16-294)||(14759766-14760044)
chr4 (16-294)||(17016577-17016855)
chr4 (16-294)||(30757291-30757569)
chr4 (16-294)||(34185420-34185698)
chr4 (16-294)||(1903785-1904063)
chr4 (16-294)||(18313638-18313916)
chr4 (16-294)||(24116193-24116471)
chr4 (16-294)||(15231403-15231681)
chr4 (16-294)||(24588821-24589099)
chr4 (16-294)||(33670260-33670538)
chr4 (16-294)||(14668547-14668825)
chr4 (16-294)||(15281397-15281675)
chr4 (126-294)||(15387948-15388116)
chr4 (16-141)||(5698219-5698344)
chr4 (15-132)||(15384807-15384924)
chr4 (22-294)||(14725265-14725537)
chr4 (58-294)||(19767870-19768106)
chr4 (115-294)||(12515763-12515942)
chr4 (56-271)||(55784686-55784901)
chr4 (115-233)||(1881658-1881776)
chr4 (115-185)||(18044699-18044769)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (16-294)||(44564501-44564779)
chr8 (16-294)||(18713001-18713279)
chr8 (16-294)||(31358045-31358323)
chr8 (16-294)||(15771091-15771369)
chr8 (16-294)||(19204783-19205061)
chr8 (16-294)||(28358373-28358651)
chr8 (22-294)||(33262251-33262523)
chr8 (15-294)||(9358142-9358421)
chr8 (17-294)||(27605327-27605604)
chr8 (16-294)||(12089144-12089422)
chr8 (16-294)||(19691615-19691893)
chr8 (22-294)||(29832843-29833115)
chr8 (16-294)||(2133681-2133959)
chr8 (16-294)||(14561141-14561419)
chr8 (16-294)||(18794221-18794499)
chr8 (16-294)||(19677964-19678242)
chr8 (16-294)||(31486292-31486570)
chr8 (16-285)||(19657762-19658031)
chr8 (16-294)||(21344592-21344870)
chr8 (16-286)||(33245894-33246164)
chr8 (16-294)||(22077346-22077610)
chr8 (22-294)||(22412455-22412727)
chr8 (22-294)||(19844684-19844956)
chr8 (58-294)||(14212556-14212792)
chr8 (115-233)||(16768901-16769019)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (16-294)||(16747862-16748140)
chr7 (16-294)||(26512041-26512319)
chr7 (16-294)||(26681451-26681729)
chr7 (16-294)||(31127422-31127700)
chr7 (16-294)||(39209484-39209762)
chr7 (16-294)||(2776769-2777047)
chr7 (16-294)||(26316193-26316471)
chr7 (16-294)||(45390735-45391013)
chr7 (16-294)||(26271431-26271709)
chr7 (16-294)||(26666259-26666537)
chr7 (15-294)||(5143684-5143963)
chr7 (16-294)||(2158089-2158367)
chr7 (16-294)||(4202904-4203182)
chr7 (16-294)||(10913214-10913492)
chr7 (16-294)||(11421124-11421402)
chr7 (16-294)||(31560735-31561013)
chr7 (16-294)||(2106508-2106786)
chr7 (16-294)||(4141591-4141869)
chr7 (16-294)||(16514775-16515053)
chr7 (15-294)||(26534217-26534496)
chr7 (16-294)||(3448821-3449099)
chr7 (16-294)||(11444402-11444680)
chr7 (16-294)||(22145710-22145988)
chr7 (16-294)||(31086967-31087245)
chr7 (16-294)||(5131511-5131789)
chr7 (16-294)||(26438772-26439050)
chr7 (19-294)||(24588882-24589157)
chr7 (16-294)||(16446351-16446629)
chr7 (16-285)||(5161907-5162176)
chr7 (16-294)||(16044833-16045108)
chr7 (16-294)||(26516307-26516585)
chr7 (16-294)||(45734828-45735100)
chr7 (16-294)||(10842339-10842617)
chr7 (16-294)||(10845135-10845413)
chr7 (22-294)||(29090031-29090303)
chr7 (58-294)||(2557050-2557286)
chr7 (58-294)||(15193598-15193834)
chr7 (78-294)||(16127225-16127441)
chr7 (56-271)||(797908-798123)
chr7 (58-269)||(16392821-16393032)
chr7 (58-269)||(30369333-30369544)
chr7 (58-269)||(9469860-9470071)
chr7 (56-271)||(16286764-16286979)
chr7 (115-233)||(1893019-1893137)
chr7 (53-175)||(25727130-25727252)
chr7 (22-162)||(16238112-16238252)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (16-294)||(5714552-5714830)
chr3 (16-294)||(5725462-5725740)
chr3 (16-294)||(5766628-5766906)
chr3 (16-294)||(32294107-32294385)
chr3 (16-294)||(8215214-8215492)
chr3 (16-294)||(28112457-28112735)
chr3 (16-294)||(5605817-5606095)
chr3 (16-294)||(21678182-21678460)
chr3 (15-294)||(5017193-5017472)
chr3 (19-294)||(18228675-18228950)
chr3 (16-294)||(4627264-4627542)
chr3 (16-294)||(5592860-5593138)
chr3 (16-294)||(22384081-22384359)
chr3 (16-294)||(31032739-31033017)
chr3 (16-294)||(51785502-51785780)
chr3 (19-294)||(6205382-6205657)
chr3 (16-294)||(18246220-18246498)
chr3 (16-294)||(24331642-24331920)
chr3 (16-294)||(47026932-47027210)
chr3 (15-294)||(20573345-20573624)
chr3 (15-294)||(29661472-29661751)
chr3 (16-294)||(4793138-4793416)
chr3 (16-294)||(7076685-7076963)
chr3 (16-294)||(8000039-8000317)
chr3 (16-294)||(8285973-8286251)
chr3 (16-294)||(10646552-10646830)
chr3 (16-294)||(18304157-18304435)
chr3 (16-294)||(31960958-31961236)
chr3 (16-294)||(32442630-32442908)
chr3 (15-294)||(28024761-28025040)
chr3 (16-294)||(4725110-4725388)
chr3 (16-294)||(8299450-8299728)
chr3 (16-294)||(11106862-11107140)
chr3 (16-294)||(15737597-15737875)
chr3 (16-294)||(15889208-15889486)
chr3 (16-290)||(18273555-18273829)
chr3 (16-290)||(18288856-18289130)
chr3 (16-294)||(19697969-19698247)
chr3 (16-294)||(28342656-28342934)
chr3 (16-294)||(35884245-35884523)
chr3 (17-294)||(10399623-10399900)
chr3 (19-294)||(18334109-18334384)
chr3 (16-294)||(4420394-4420672)
chr3 (16-294)||(4687134-4687412)
chr3 (16-294)||(5470467-5470745)
chr3 (16-294)||(17981452-17981730)
chr3 (16-294)||(20069519-20069797)
chr3 (16-294)||(22867351-22867629)
chr3 (16-294)||(22882410-22882688)
chr3 (16-294)||(29145259-29145537)
chr3 (16-294)||(48469406-48469684)
chr3 (16-294)||(4343179-4343457)
chr3 (16-294)||(6539245-6539523)
chr3 (16-294)||(18054741-18055019)
chr3 (16-285)||(5653573-5653842)
chr3 (16-294)||(16620993-16621271)
chr3 (108-294)||(17992526-17992712)
chr3 (16-112)||(17973364-17973460)
chr3 (22-294)||(11924867-11925139)
chr3 (58-294)||(6571833-6572069)
chr3 (22-294)||(7088536-7088808)
chr3 (58-230)||(16431948-16432120)
chr3 (58-294)||(22959932-22960168)
chr3 (115-269)||(15919021-15919175)
chr3 (56-271)||(20443619-20443834)
chr3 (115-269)||(15592513-15592667)
chr3 (22-294)||(15704952-15705224)
chr3 (58-269)||(5950347-5950558)
chr3 (58-269)||(46380838-46381049)
chr3 (58-269)||(37260254-37260465)
chr3 (115-185)||(4450363-4450433)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (16-294)||(9540-9818)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (16-294)||(10966185-10966463)
chr1 (16-294)||(28153256-28153534)
chr1 (15-294)||(10948597-10948876)
chr1 (16-294)||(28588505-28588783)
chr1 (15-294)||(3644655-3644935)
chr1 (16-294)||(16204494-16204772)
chr1 (16-294)||(51641738-51642016)
chr1 (16-294)||(41789770-41790048)
chr1 (16-282)||(20336876-20337142)
chr1 (16-285)||(21894208-21894477)
chr1 (16-294)||(20464496-20464774)
chr1 (53-294)||(22489541-22489782)
chr1 (58-269)||(5628500-5628711)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (16-294)||(9554-9832)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (16-294)||(11388-11666)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (19-294)||(22654-22929)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (16-294)||(16099-16377)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (16-294)||(3585-3863)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (16-294)||(11467-11745)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (16-294)||(13089-13367)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (16-294)||(9563-9841)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (16-294)||(5639-5917)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (16-294)||(5131-5409)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (24-294)||(43181-43464)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (16-171)||(22757-22912)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (16-169)||(118793-118946)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (115-275)||(34799-34959)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (58-294)||(10736-10972)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (115-294)||(4969-5148)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (58-269)||(29713-29924)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (21-112)||(1979-2070)


Alignment Details
Target: scaffold0143 (Bit Score: 263; Significance: 1e-147; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7756 - 7478
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7756 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 7657  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7656 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 7557  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7556 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 7478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31089 - 30811
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  31089 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 30990  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  30989 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 30890  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30889 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 30811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19866 - 19588
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  19866 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 19767  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19766 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 19667  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19666 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 19588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3793344 - 3793066
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3793344 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 3793245  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793244 tctcaaagatatacttgatcgggtccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 3793145  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3793144 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 3793066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 18497081 - 18497360
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18497081 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagct 18497180  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497181 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 18497280  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18497281 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 18497360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33878933 - 33878655
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33878933 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 33878834  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878833 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 33878734  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878733 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 33878655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 40469907 - 40470185
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  40469907 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 40470006  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470007 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 40470106  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470107 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 40470185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9321279 - 9321001
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9321279 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 9321180  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9321179 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 9321080  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9321079 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 9321001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24587177 - 24586899
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24587177 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 24587078  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24587077 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 24586978  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24586977 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 24586899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26484197 - 26483919
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26484197 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 26484098  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26484097 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 26483998  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26483997 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 26483919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 8661832 - 8662110
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8661832 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 8661931  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8661932 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 8662031  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8662032 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 8662110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12135978 - 12135700
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12135978 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacataatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 12135879  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12135878 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 12135779  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12135778 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 12135700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30155834 - 30155556
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30155834 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 30155735  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30155734 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 30155635  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30155634 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 30155556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33520180 - 33519905
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33520180 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 33520081  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33520080 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 33519981  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  33519980 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 33519905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43082059 - 43081780
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  43082059 tgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 43081960  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081959 ttctcaaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 43081860  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  43081859 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 43081780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 9547066 - 9547344
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9547066 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 9547165  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  9547166 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 9547265  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9547266 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 9547344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11327440 - 11327162
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  11327440 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 11327341  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327340 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 11327241  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  11327240 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 11327162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24727772 - 24727494
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  24727772 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctt 24727673  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24727672 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 24727573  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24727572 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 24727494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31435267 - 31434989
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31435267 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 31435168  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435167 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 31435068  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31435067 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 31434989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31822764 - 31823042
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  31822764 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 31822863  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31822864 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 31822963  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31822964 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 31823042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33296331 - 33296053
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33296331 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 33296232  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  33296231 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 33296132  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33296131 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 33296053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 37767348 - 37767626
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  37767348 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 37767447  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767448 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 37767547  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37767548 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37767626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28653046 - 28652767
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  28653046 tgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 28652947  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652946 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 28652847  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28652846 aacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 28652767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11553158 - 11552880
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11553158 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 11553059  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  11553058 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 11552959  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11552958 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgttctttc 11552880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 13183150 - 13183428
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13183150 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattaagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 13183249  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  13183250 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 13183349  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13183350 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgatctttc 13183428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23629773 - 23629495
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23629773 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 23629674  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  23629673 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 23629574  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23629573 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 23629495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 29887554 - 29887832
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  29887554 gcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagagtgcaatcttcccagtaacaacagctt 29887653  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29887654 tctcaaagatatacttgataggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaggctagagcaca 29887753  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887754 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 29887832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30033231 - 30032953
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  30033231 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagcct 30033132  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30033131 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctaaagcaca 30033032  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30033031 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 30032953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 37667843 - 37668121
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  37667843 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctt 37667942  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37667943 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 37668042  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37668043 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37668121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41678508 - 41678230
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41678508 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 41678409  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  41678408 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 41678309  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  41678308 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 41678230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34620322 - 34620043
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  34620322 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgct 34620223  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620222 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 34620123  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34620122 aacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 34620043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 15655115 - 15655393
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  15655115 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagccgctt 15655214  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||    
T  15655215 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcagcccaggccagagcaca 15655314  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15655315 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 15655393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 18371891 - 18372169
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18371891 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctt 18371990  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371991 tctcaaagatatacttgatctgatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 18372090  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18372091 acaagtcttttcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 18372169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25204081 - 25203803
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25204081 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 25203982  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  25203981 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 25203882  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25203881 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttc 25203803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25268236 - 25267958
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25268236 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 25268137  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  25268136 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaaaaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 25268037  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25268036 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtatatagcatgttctttc 25267958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 37355000 - 37355278
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  37355000 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 37355099  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355100 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 37355199  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37355200 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37355278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22892265 - 22891988
Alignment:
Q  17 caagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagcttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22892265 caagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagcttt 22892166  T
Q  117 ctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  22892165 ctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttttatgattcaccaaatagtgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcacaa 22892066  T
Q  217 caagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892065 caagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 22891988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6878108 - 6877830
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  6878108 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctt 6878009  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  6878008 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 6877909  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6877908 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 6877830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22995474 - 22995752
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22995474 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 22995573  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  22995574 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 22995673  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22995674 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 22995752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37758786 - 37758508
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  37758786 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctt 37758687  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  37758686 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 37758587  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37758586 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37758508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 32592630 - 32592909
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  32592630 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 32592729  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592730 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 32592829  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32592830 aacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 32592909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2514865 - 2514587
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  2514865 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctt 2514766  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  2514765 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 2514666  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2514665 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 2514587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 15755209 - 15755487
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  15755209 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 15755308  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755309 tctcaaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 15755408  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15755409 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaaatagtagatagcatgctctttc 15755487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24973709 - 24973431
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24973709 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 24973610  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | || |||    
T  24973609 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaaggaca 24973510  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24973509 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 24973431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30172272 - 30171994
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30172272 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctt 30172173  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  30172172 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 30172073  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30172072 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 30171994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30938438 - 30938160
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30938438 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 30938339  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  30938338 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 30938239  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  30938238 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 30938160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33781288 - 33781014
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33781288 gcaagaatgctacctttgattgccttttg----ttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 33781193  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  33781192 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 33781093  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33781092 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 33781014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 13439040 - 13439318
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13439040 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctt 13439139  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  13439140 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 13439239  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13439240 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 13439318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 18124773 - 18125051
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18124773 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaacagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 18124872  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  || |  |||||    
T  18124873 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgttttgcggcccgggccaaggcaca 18124972  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18124973 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 18125051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 28956142 - 28956420
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28956142 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctt 28956241  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| ||    
T  28956242 tctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgca 28956341  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28956342 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 28956420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5641588 - 5641313
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5641588 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 5641489  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  5641488 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 5641389  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  5641388 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttc 5641313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 13321193 - 13321465
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  13321193 atgctacctttgatcgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctcaa 13321292  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321293 agatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 13321392  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  13321393 cttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagataacatgctctttc 13321465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 211 - 294
Target Start/End: Original strand, 24684697 - 24684780
Alignment:
Q  211 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24684697 gcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 24684780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Original strand, 3483602 - 3483838
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  3483602 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 3483701  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  3483702 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 3483801  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  3483802 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 3483838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 11943821 - 11944032
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  11943821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 11943920  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  11943921 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 11944020  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  11944021 aaacttcttgct 11944032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 5439624 - 5439835
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  5439624 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5439723  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  5439724 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5439823  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  5439824 aaacttcttgct 5439835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 15784124 - 15784335
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  15784124 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 15784223  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    | || || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  15784224 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 15784323  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  15784324 aaacttcttgct 15784335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17957858 - 17957647
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| ||||  | | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||| ||    
T  17957858 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctatcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagatatcagcc 17957759  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  17957758 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 17957659  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  17957658 aaacttcttgct 17957647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34469333 - 34469170
Alignment:
Q  108 agcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 207  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||| | | || ||| ||||| || ||||||||||||||  ||    
T  34469333 agcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaaccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttggcagcccagact 34469234  T
Q  208 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctca 271  Q
    || || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||    
T  34469233 agtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgctca 34469170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 36375361 - 36375530
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || || || || ||||||||| | |||| || ||    
T  36375361 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 36375460  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctc 227  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36375461 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctc 36375530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 227
Target Start/End: Original strand, 37000015 - 37000184
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || || || || ||||||||| | |||| || ||    
T  37000015 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 37000114  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctc 227  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37000115 aagtagtgtgattgatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctc 37000184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31521068 - 31520857
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    ||||||||||| || |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  31521068 atatcatattccgatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 31520969  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  31520968 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 31520869  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  31520868 aaacttcttgct 31520857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 20388445 - 20388563
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || ||  | |||||||| || | ||| |    
T  20388445 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcatagcagcccatgccaaagcgc 20388544  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
     ||| || |||||||||||    
T  20388545 gacaggttttctcaagcat 20388563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27780029 - 27779751
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27780029 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 27779930  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779929 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27779830  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779829 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 27779751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27819786 - 27819508
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27819786 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 27819687  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819686 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27819587  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819586 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 27819508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34158636 - 34158361
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  34158636 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctttct 34158537  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158536 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 34158437  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158436 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 34158361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3786288 - 3786010
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3786288 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 3786189  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3786188 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccaca 3786089  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3786088 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 3786010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 13932996 - 13933274
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13932996 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 13933095  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933096 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgccgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 13933195  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933196 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 13933274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22924597 - 22924875
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  22924597 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 22924696  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22924697 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccaca 22924796  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924797 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 22924875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27120319 - 27120041
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  27120319 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatcttcccagtaacagcagctt 27120220  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120219 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27120120  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120119 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 27120041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 11631633 - 11631911
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11631633 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 11631732  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11631733 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 11631832  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11631833 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 11631911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31889940 - 31890218
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  31889940 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctt 31890039  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31890040 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaacaca 31890139  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890140 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 31890218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40237303 - 40237025
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  40237303 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 40237204  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237203 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 40237104  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40237103 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 40237025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31880082 - 31879803
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31880082 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagct 31879983  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31879982 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcac 31879883  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31879882 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 31879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 257102 - 257380
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  257102 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctt 257201  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257202 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 257301  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  257302 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 257380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 19412950 - 19413228
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19412950 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacggcagctt 19413049  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19413050 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 19413149  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19413150 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 19413228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 21673624 - 21673902
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21673624 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 21673723  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21673724 tctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 21673823  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21673824 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 21673902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32053598 - 32053320
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053598 gcaagaatgctacctttgattgccttctgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 32053499  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32053498 tctcaaagatatacttaatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 32053399  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32053398 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 32053320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 37682344 - 37682622
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37682344 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 37682443  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37682444 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 37682543  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37682544 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37682622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 37697609 - 37697887
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37697609 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 37697708  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37697709 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 37697808  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37697809 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37697887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 9346434 - 9346713
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  9346434 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 9346533  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346534 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 9346633  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9346634 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 9346713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 16825790 - 16826065
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16825790 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 16825889  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825890 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 16825989  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  16825990 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 16826065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16895690 - 16895415
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16895690 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 16895591  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16895590 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 16895491  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  16895490 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 16895415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34865479 - 34865201
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  34865479 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 34865380  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34865379 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 34865280  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34865279 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 34865201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37929164 - 37928886
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37929164 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctt 37929065  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37929064 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 37928965  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37928964 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37928886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34294949 - 34294671
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34294949 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 34294850  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34294849 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 34294750  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||    
T  34294749 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttaagtagtagatagcatgctctttc 34294671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 39048267 - 39048546
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  39048267 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagct 39048366  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39048367 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagctagagcac 39048466  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||    
T  39048467 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttaggtagtagatagcatgctctttc 39048546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12590603 - 12590325
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  12590603 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctt 12590504  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12590503 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcaca 12590404  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12590403 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 12590325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20841708 - 20841430
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20841708 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 20841609  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20841608 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 20841509  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20841508 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 20841430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27807498 - 27807220
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  27807498 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctt 27807399  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27807398 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcaca 27807299  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27807298 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 27807220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12659331 - 12659053
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12659331 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 12659232  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  12659231 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 12659132  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12659131 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 12659053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39893864 - 39893586
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  39893864 gcaagaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 39893765  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39893764 tctcaaagatatactttatcgggtccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 39893665  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39893664 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 39893586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 12713050 - 12713328
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  12713050 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctt 12713149  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12713150 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagccaaagcaca 12713249  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12713250 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 12713328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 21699620 - 21699898
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21699620 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcatgcaatcttcccagtaacagcagctt 21699719  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  21699720 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 21699819  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21699820 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgttctttc 21699898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27430890 - 27431168
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27430890 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattccgacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 27430989  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  27430990 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 27431089  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27431090 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27431168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16165276 - 16164997
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  16165276 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgct 16165177  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||    
T  16165176 ttctcaaagatatactttatcggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcac 16165077  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16165076 aacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 16164997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 23125018 - 23125295
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23125018 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagtttgaa-cacaatatcgtattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 23125116  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  23125117 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 23125216  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23125217 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 23125295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37381472 - 37381194
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  37381472 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaccgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 37381373  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  37381372 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 37381273  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37381272 acaagtcttctcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 37381194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 37948311 - 37948589
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  37948311 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 37948410  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  37948411 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 37948510  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37948511 acaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 37948589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 276
Target Start/End: Original strand, 34271369 - 34271629
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34271369 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 34271468  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  34271469 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 34271568  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatag 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  34271569 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatag 34271629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27395357 - 27395079
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  27395357 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacaaaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctt 27395258  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395257 tctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcacccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27395158  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27395157 acaagtcttctcaagcatcgtataccgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 27395079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28886074 - 28885821
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  28886074 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaattttcccagtaacagcagctt 28885975  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  28885974 tctcaaagatatactatatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 28885875  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgct 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28885874 acaagttttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgct 28885821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 19452872 - 19453150
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  19452872 gcaagaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 19452971  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  19452972 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttatatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttggcggcccaggccggagcaca 19453071  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453072 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagataatagatagcatgttctttc 19453150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 142 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27828129 - 27827977
Alignment:
Q  142 attctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtatacc 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828129 attctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtatacc 27828030  T
Q  242 gagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27828029 gagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttc 27827977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34701865 - 34701593
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || | |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  34701865 atgctacctttgattgctttctgagtgcgatactcgatatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 34701766  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34701765 atatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagt 34701666  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  34701665 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 34701593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28885808 - 28885724
Alignment:
Q  210 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28885808 agcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 28885724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42394288 - 42394052
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  42394288 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 42394189  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  42394188 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 42394089  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  42394088 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 42394052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22950146 - 22949971
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  22950146 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 22950047  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22950046 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcat 22949971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12384413 - 12384202
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  12384413 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 12384314  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    | || || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  12384313 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 12384214  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  12384213 aaacttcttgct 12384202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 271
Target Start/End: Original strand, 21760104 - 21760319
Alignment:
Q  56 caatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaa 155  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||| || || ||  |||| || | ||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  21760104 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 21760203  T
Q  156 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcg 255  Q
    |||||| |||||| | | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||| || ||     
T  21760204 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatca 21760303  T
Q  256 gtgaacttcttgctca 271  Q
    || |||||||||||||    
T  21760304 gtaaacttcttgctca 21760319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 34533991 - 34534109
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  34533991 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 34534090  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || |||||||||||    
T  34534091 aacaggttttctcaagcat 34534109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 26723824 - 26723942
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  26723824 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 26723923  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || |||||||||||    
T  26723924 aacaggttttctcaagcat 26723942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29505210 - 29504931
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29505210 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagct 29505111  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505110 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 29505011  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29505010 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 29504931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 13520595 - 13520873
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13520595 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 13520694  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520695 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 13520794  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520795 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 13520873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 14141797 - 14142075
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  14141797 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 14141896  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141897 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 14141996  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14141997 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttc 14142075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26789609 - 26789331
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26789609 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 26789510  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26789509 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcagcccaagctagagcaca 26789410  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789409 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 26789331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27197978 - 27197700
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27197978 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 27197879  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27197878 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcaca 27197779  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197778 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 27197700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27251257 - 27251535
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27251257 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 27251356  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27251357 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagctcaagctagagcaca 27251456  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251457 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 27251535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28164284 - 28164006
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28164284 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 28164185  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164184 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 28164085  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28164084 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 28164006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 30554422 - 30554697
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30554422 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 30554521  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30554522 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 30554621  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  30554622 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 30554697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 33372833 - 33373112
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33372833 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagct 33372932  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372933 ttctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 33373032  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33373033 aacaagtcttctcaagcagtgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 33373112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4761556 - 4761278
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4761556 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 4761457  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761456 tctcaaagatatactttatcggatccattctatatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 4761357  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4761356 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 4761278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27358513 - 27358791
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  27358513 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 27358612  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358613 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27358712  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27358713 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 27358791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27448856 - 27449134
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  27448856 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 27448955  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27448956 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27449055  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27449056 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 27449134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29576807 - 29576529
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29576807 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 29576708  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29576707 tctcaaagatatacttgattggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 29576608  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29576607 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 29576529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 34460909 - 34461187
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34460909 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 34461008  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461009 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 34461108  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34461109 acaagtcctctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 34461187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27011524 - 27011246
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27011524 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 27011425  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011424 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27011325  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27011324 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 27011246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27061299 - 27061021
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27061299 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatataatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 27061200  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  27061199 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 27061100  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27061099 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27061021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16677934 - 16677655
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16677934 tgcaagaatgctacctttgattgccctttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagct 16677835  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16677834 ttctcaaagacatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcac 16677735  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16677734 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcagtgaacttcttgctcaggtagtagatagcatgctctttc 16677655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4529078 - 4528800
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4529078 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 4528979  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528978 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 4528879  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4528878 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 4528800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 13295354 - 13295632
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13295354 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 13295453  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  13295454 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 13295553  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13295554 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 13295632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16753614 - 16753336
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  16753614 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctt 16753515  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  16753514 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 16753415  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16753414 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttc 16753336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27626114 - 27626392
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27626114 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 27626213  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27626214 tctcaaagatatacttgattggatccattctagatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 27626313  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27626314 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttc 27626392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29553350 - 29553072
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29553350 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 29553251  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  29553250 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 29553151  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29553150 acaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 29553072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4776673 - 4776395
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  4776673 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 4776574  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776573 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 4776474  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4776473 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 4776395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24867509 - 24867231
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  24867509 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctt 24867410  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  24867409 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 24867310  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24867309 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 24867231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26112815 - 26113093
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  26112815 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 26112914  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112915 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 26113014  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26113015 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 26113093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26922170 - 26921892
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26922170 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgctt 26922071  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  26922070 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 26921971  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26921970 acaggtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 26921892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27022929 - 27022651
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27022929 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 27022830  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  27022829 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 27022730  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27022729 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27022651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28211247 - 28210969
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  28211247 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 28211148  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211147 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 28211048  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28211047 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 28210969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3699876 - 3699598
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3699876 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 3699777  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  3699776 tctcaaagatatactttattggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 3699677  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3699676 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 3699598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 8902106 - 8902384
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  8902106 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatattcccagtaacagcagctt 8902205  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  8902206 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 8902305  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8902306 acaagttttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 8902384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27180249 - 27179971
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27180249 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 27180150  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||    
T  27180149 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcaca 27180050  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27180049 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27179971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27268990 - 27269268
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27268990 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 27269089  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||    
T  27269090 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtggtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccagagcaca 27269189  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27269190 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27269268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 4542177 - 4542455
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4542177 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 4542276  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4542277 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 4542376  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  4542377 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttc 4542455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 4720538 - 4720816
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  4720538 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 4720637  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4720638 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 4720737  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  4720738 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcatgctctttc 4720816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 16940430 - 16940708
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  16940430 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 16940529  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  16940530 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 16940629  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16940630 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 16940708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27488926 - 27488648
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27488926 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 27488827  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  27488826 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaggttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 27488727  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27488726 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 27488648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22931287 - 22931565
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22931287 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 22931386  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||    
T  22931387 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcaca 22931486  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22931487 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttc 22931565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 23853732 - 23854010
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23853732 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 23853831  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||    
T  23853832 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcggttagcggcccaggccaaagcaca 23853931  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23853932 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatatcatgttctttc 23854010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Original strand, 24302160 - 24302430
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24302160 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 24302259  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  24302260 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 24302359  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 286  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302360 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacggtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 24302430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26775030 - 26775308
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26775030 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacgatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 26775129  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  26775130 tctcgaagatatactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 26775229  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26775230 acaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 26775308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27286767 - 27287045
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  27286767 gcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaatagcagctt 27286866  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  27286867 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccatgccaaagcaca 27286966  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27286967 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27287045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 15420723 - 15421001
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  15420723 gcaagaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctt 15420822  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||| ||    
T  15420823 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcgca 15420922  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15420923 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 15421001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 17088846 - 17089124
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||||    
T  17088846 gcaaggatgctacctttgattgccatttgagttttgaacacaatatcatattcggacaagagcatctgccatcgtgcaatcttccctgtaacagtcgctt 17088945  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  17088946 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 17089045  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17089046 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 17089124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20172340 - 20172062
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  20172340 gcaagaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccggtaacagcaggtt 20172241  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  20172240 tctcgaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcaca 20172141  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20172140 acaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 20172062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22163651 - 22163929
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||    
T  22163651 gcaagaatgctacctttgattgccttttgaaccttgaacacaatgtcatattcagataaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccggtaacagcaggtt 22163750  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  22163751 tctcgaagatgtactttatcggatccattttggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcaacccaggccagagcaca 22163850  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163851 acaagtcttctcaagcatagtataccgagtctcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 22163929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 109 - 294
Target Start/End: Original strand, 22455610 - 22455795
Alignment:
Q  109 gcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455610 gcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagcta 22455709  T
Q  209 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22455710 gagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 22455795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 15408936 - 15409055
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  15408936 gcaagaatgctacctttgattcccttttgagttttgaacacaacatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctt 15409035  T
Q  116 tctcaaagatatactttatc 135  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15409036 tctcaaagatatactttatc 15409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26992396 - 26992310
Alignment:
Q  208 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26992396 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 26992310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18120220 - 18119984
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  18120220 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18120121  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  18120120 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 18120021  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  18120020 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 18119984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Original strand, 18212114 - 18212286
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  18212114 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 18212213  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaag 230  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18212214 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaag 18212286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 23971179 - 23971451
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || || ||   | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||| |  || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  23971179 atgctacctttgattgctttctgggtgcgatacacaatatcatactcggacaataacatctgccatcaagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 23971278  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23971279 atatgtacttgattggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagt 23971378  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||    
T  23971379 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatatcatgctctttc 23971451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 9135798 - 9136009
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  9135798 atatcatactcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9135897  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  9135898 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9135997  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  9135998 aaacttcttgct 9136009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27545596 - 27545478
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  27545596 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 27545497  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || |||||||||||    
T  27545496 aacaggttttctcaagcat 27545478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25707765 - 25707645
Alignment:
Q  55 acaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatca 154  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || || ||  |||| || | |||||  |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  25707765 acaatatcatactcggacaatagcatctgccaacgagcaattcttcctgttaaagcaggcttctcaaaaatgtacttgattggatccattttggatatca 25707666  T
Q  155 accaagttgtatgattcacca 175  Q
    ||||||| || ||||| ||||    
T  25707665 accaagtagtgtgattaacca 25707645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 18797073 - 18797352
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18797073 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagct 18797172  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797173 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 18797272  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797273 aacaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 18797352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5009684 - 5009406
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5009684 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 5009585  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5009584 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagccagagcaca 5009485  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5009484 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 5009406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6573667 - 6573389
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6573667 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 6573568  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6573567 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaaactaaagcaca 6573468  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6573467 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 6573389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 27159777 - 27160055
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27159777 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 27159876  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27159877 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 27159976  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  27159977 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 27160055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 36340977 - 36341255
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  36340977 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 36341076  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341077 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 36341176  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36341177 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgttctttc 36341255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 40102097 - 40102375
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40102097 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 40102196  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40102197 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 40102296  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  40102297 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 40102375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 54837200 - 54836922
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  54837200 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 54837101  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54837100 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 54837001  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54837000 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 54836922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21973507 - 21973232
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21973507 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 21973408  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973407 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 21973308  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  21973307 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 21973232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 31122975 - 31123250
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31122975 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 31123074  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31123075 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 31123174  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  31123175 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 31123250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39854447 - 39854168
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  39854447 tgcaagaatgctacccttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 39854348  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854347 ttctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 39854248  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39854247 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 39854168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14102352 - 14102074
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14102352 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggcagctt 14102253  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14102252 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 14102153  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14102152 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 14102074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 20334881 - 20335159
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20334881 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 20334980  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||    
T  20334981 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggaggcccaggccaaagcaca 20335080  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20335081 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 20335159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 14759766 - 14760044
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14759766 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 14759865  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  14759866 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 14759965  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14759966 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 14760044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17016855 - 17016577
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17016855 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 17016756  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  17016755 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 17016656  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17016655 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 17016577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30757569 - 30757291
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  30757569 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctt 30757470  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30757469 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 30757370  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30757369 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 30757291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 34185420 - 34185698
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34185420 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 34185519  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  34185520 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttatcggcccaggccagagcaca 34185619  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34185620 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 34185698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1904063 - 1903785
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1904063 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 1903964  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1903963 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 1903864  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1903863 acaagtcttttcaagcatcatataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 1903785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 18313638 - 18313916
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  18313638 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 18313737  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  18313738 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 18313837  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18313838 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 18313916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24116471 - 24116193
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  24116471 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 24116372  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  24116371 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 24116272  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24116271 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 24116193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15231681 - 15231403
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15231681 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaacctttccagtaacagcagctt 15231582  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||    
T  15231581 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtggcccaggccagagcaca 15231482  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15231481 acaagtcttttcaagcatcgtataacgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagataacatgttctttc 15231403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 24588821 - 24589099
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24588821 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 24588920  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  24588921 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 24589020  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  24589021 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagttatcatgttctttc 24589099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 33670260 - 33670538
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33670260 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 33670359  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  33670360 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 33670459  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  33670460 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagataacatgttctttc 33670538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14668825 - 14668547
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14668825 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatatttagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctt 14668726  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||||||    
T  14668725 tctcaaagatatactttatcggatccatcttggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcagacgtttagcggcccaggccagagcaca 14668626  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14668625 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 14668547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 15281397 - 15281675
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| ||| |||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  15281397 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacataatgtcatatttggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 15281496  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||    
T  15281497 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcttttggcggcccaggccagagagca 15281596  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15281597 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 15281675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 126 - 294
Target Start/End: Original strand, 15387948 - 15388116
Alignment:
Q  126 atactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttc 225  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15387948 atacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttc 15388047  T
Q  226 tcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15388048 tcaagcatcgtatatcgggcttcgcagtcggtaaacttcttgctcaaatagtagatagcatgctctttc 15388116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5698344 - 5698219
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5698344 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 5698245  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatcc 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  5698244 tctcaaagatatacttgatcggatcc 5698219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 132
Target Start/End: Original strand, 15384807 - 15384924
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||    
T  15384807 tgcaagaatgctacctttgattgacttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagct 15384906  T
Q  115 ttctcaaagatatacttt 132  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15384907 ttctcaaagatatacttt 15384924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 14725265 - 14725537
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  14725265 atgctacctttgattgctttctgagtgcgatactcgatatcatattcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 14725364  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14725365 atatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagt 14725464  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  14725465 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 14725537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19768106 - 19767870
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  19768106 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 19768007  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| |  || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  19768006 aagttgtatgattaatcatataatgacggaaacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 19767907  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  19767906 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 19767870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12515942 - 12515763
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  12515942 ttctcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 12515843  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    | |||||||||||||| ||   ||||||||  || |  || || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  12515842 atcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttc 12515763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 55784901 - 55784686
Alignment:
Q  56 caatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaa 155  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||| || || ||  |||| || | ||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||    
T  55784901 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcgggtccatcttagatatcaa 55784802  T
Q  156 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcg 255  Q
    |||||| |||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||| || ||     
T  55784801 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcagcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgagcatggaatagcgagattcacaatca 55784702  T
Q  256 gtgaacttcttgctca 271  Q
    || |||||||||||||    
T  55784701 gtaaacttcttgctca 55784686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 1881658 - 1881776
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  1881658 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatataatgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 1881757  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || |||||||||||    
T  1881758 aacaggttttctcaagcat 1881776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18044769 - 18044699
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacg 185  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  18044769 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacg 18044699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44564779 - 44564501
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  44564779 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 44564680  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44564679 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagaccaca 44564580  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564579 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 44564501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18713279 - 18713001
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18713279 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 18713180  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18713179 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 18713080  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18713079 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttc 18713001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31358323 - 31358045
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31358323 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 31358224  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31358223 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 31358124  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31358123 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 31358045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15771369 - 15771091
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15771369 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 15771270  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771269 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 15771170  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15771169 acaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 15771091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 19204783 - 19205061
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19204783 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 19204882  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19204883 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 19204982  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19204983 acaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 19205061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 28358373 - 28358651
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  28358373 gcaagaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 28358472  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28358473 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 28358572  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28358573 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 28358651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33262523 - 33262251
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  33262523 atgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctttctcaa 33262424  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262423 agatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 33262324  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33262323 cttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 33262251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9358421 - 9358142
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  9358421 tgcaagaatgctacccttgattgccttttgagtcttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 9358322  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358321 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 9358222  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9358221 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 9358142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Original strand, 27605327 - 27605604
Alignment:
Q  17 caagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagcttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  27605327 caagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagcttt 27605426  T
Q  117 ctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||    
T  27605427 ctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcacaa 27605526  T
Q  217 caagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27605527 caagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 27605604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 12089144 - 12089422
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  12089144 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 12089243  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089244 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 12089343  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12089344 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 12089422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19691893 - 19691615
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19691893 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 19691794  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || | ||||||    
T  19691793 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgtaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 19691694  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19691693 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 19691615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29833115 - 29832843
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  29833115 atgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctttctcaa 29833016  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29833015 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 29832916  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29832915 cttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 29832843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 2133681 - 2133959
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  2133681 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaattttcccagtaacagcagctt 2133780  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  2133781 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 2133880  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2133881 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcgatgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 2133959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14561419 - 14561141
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14561419 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 14561320  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  14561319 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 14561220  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14561219 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 14561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18794499 - 18794221
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18794499 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 18794400  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  18794399 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 18794300  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18794299 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 18794221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19678242 - 19677964
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19678242 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 19678143  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  19678142 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 19678043  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19678042 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 19677964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31486292 - 31486570
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  31486292 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctt 31486391  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  31486392 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 31486491  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  31486492 acaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttc 31486570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 19657762 - 19658031
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  19657762 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaactt 19657861  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  19657862 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgatttaccaaataatggcgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 19657961  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 285  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19657962 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 19658031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 21344592 - 21344870
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21344592 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 21344691  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||| |||||||||| | | |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || | ||||||    
T  21344692 tctcagagatatacttgagctgggcggttctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcctaggccaaagcaca 21344791  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21344792 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 21344870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33246164 - 33245894
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  33246164 gcaagaatgctacctttgattgccttttaagctttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 33246065  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  33246064 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 33245965  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  33245964 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttagatagtagatagcat 33245894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22077346 - 22077610
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||| ||||||    
T  22077346 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacatcagctt 22077445  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||        ||      |||||||||||||||||    
T  22077446 tctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaatagtg--------gt------gcccaagctagagcaca 22077531  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22077532 acaagtcttctcaagcatcgtatattgggcttcgcagtcggtaaagttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 22077610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22412727 - 22412455
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || | |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  22412727 atgctacctttgattgctttctgagtgcgatactcgatatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 22412628  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22412627 atatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagt 22412528  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  22412527 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 22412455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19844956 - 19844684
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   |  ||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||| | ||| |  |||||||    
T  19844956 atgctacctttgattgctttctgagtgcgatgcacgatatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttctagttaaagctggcttctcaa 19844857  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  19844856 atatgtacttgattggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgtttggcagcccaggctaaatcacaacaagt 19844757  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  19844756 tttctcaagtaccgaatatcgggactcacaatcggtgaacttcttactcaaatagtagatagcttgctctttc 19844684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14212792 - 14212556
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  14212792 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 14212693  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  14212692 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 14212593  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  14212592 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 14212556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16769019 - 16768901
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  16769019 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 16768920  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || |||||||||||    
T  16768919 aacaggttttctcaagcat 16768901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 16747862 - 16748140
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16747862 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 16747961  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747962 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 16748061  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748062 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 16748140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26512041 - 26512319
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26512041 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 26512140  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512141 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 26512240  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512241 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 26512319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26681451 - 26681729
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  26681451 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgcccgcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 26681550  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681551 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 26681650  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681651 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 26681729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31127700 - 31127422
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  31127700 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 31127601  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127600 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 31127501  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127500 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 31127422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 39209484 - 39209762
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  39209484 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 39209583  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209584 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaatcaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 39209683  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209684 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 39209762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2777047 - 2776769
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  2777047 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagctttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 2776948  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776947 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 2776848  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776847 acaagtcttcgcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 2776769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26316193 - 26316471
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26316193 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 26316292  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26316293 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 26316392  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26316393 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 26316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45391013 - 45390735
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45391013 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 45390914  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45390913 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 45390814  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45390813 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 45390735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26271431 - 26271709
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  26271431 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttcccgtaacaacagctt 26271530  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26271531 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 26271630  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26271631 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 26271709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 26666259 - 26666537
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26666259 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctt 26666358  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26666359 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 26666458  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26666459 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 26666537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 5143684 - 5143963
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  5143684 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggctgct 5143783  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5143784 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcac 5143883  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5143884 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 5143963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2158367 - 2158089
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2158367 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 2158268  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  2158267 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 2158168  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2158167 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 2158089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4203182 - 4202904
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4203182 gcaagaatgctacctttgatggccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 4203083  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4203082 tctcaaagatatatttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 4202983  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4202982 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcgtgctctttc 4202904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 10913214 - 10913492
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10913214 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 10913313  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  10913314 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 10913413  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10913414 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 10913492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 11421124 - 11421402
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11421124 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 11421223  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  11421224 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 11421323  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11421324 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 11421402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31560735 - 31561013
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  31560735 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 31560834  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560835 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 31560934  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31560935 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 31561013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 2106508 - 2106786
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  2106508 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 2106607  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  2106608 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 2106707  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2106708 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 2106786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 4141591 - 4141869
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4141591 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagccgctt 4141690  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  4141691 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 4141790  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4141791 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 4141869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 16514775 - 16515053
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16514775 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 16514874  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  16514875 tctcaaagatatactttatcggatctattctggatatcaaccacgttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 16514974  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16514975 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 16515053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 26534217 - 26534496
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26534217 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagct 26534316  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||    
T  26534317 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcac 26534416  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26534417 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcaccatcggtgaatttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 26534496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3449099 - 3448821
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  3449099 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctt 3449000  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  3448999 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 3448900  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3448899 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 3448821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11444680 - 11444402
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11444680 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 11444581  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  11444580 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 11444481  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  11444480 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttc 11444402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22145988 - 22145710
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22145988 gcaagaatgctacctttgattgcctttcgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 22145889  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  22145888 tctcaaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 22145789  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145788 acaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 22145710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31086967 - 31087245
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31086967 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 31087066  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  31087067 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 31087166  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  31087167 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 31087245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5131789 - 5131511
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5131789 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcagctt 5131690  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || ||||||||    
T  5131689 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacacaggcgtttagcggcctaggccagagcaca 5131590  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5131589 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 5131511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26439050 - 26438772
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  26439050 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 26438951  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  26438950 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 26438851  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26438850 acaagtcttctcgagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttc 26438772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 24588882 - 24589157
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24588882 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 24588981  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  24588982 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 24589081  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  24589082 agtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttc 24589157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 16446351 - 16446629
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  16446351 gcaaggatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaataccatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 16446450  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||||    
T  16446451 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttaacggcccaggccagagcaca 16446550  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446551 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 16446629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5162176 - 5161907
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  5162176 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 5162077  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  5162076 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 5161977  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5161976 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 5161907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16045108 - 16044833
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16045108 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctaccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 16045009  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||       
T  16045008 tctcaaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaagccagagc--- 16044912  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16044911 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 16044833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26516585 - 26516307
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  26516585 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgctt 26516486  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  26516485 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 26516386  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26516385 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 26516307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45735100 - 45734828
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45735100 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 45735001  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  45735000 tctcaaagata------atcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 45734907  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45734906 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 45734828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 10842339 - 10842617
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  10842339 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 10842438  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  10842439 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 10842538  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10842539 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 10842617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10845413 - 10845135
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  10845413 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcggacaagagcatttgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 10845314  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  10845313 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 10845214  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10845213 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 10845135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29090303 - 29090031
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || | |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  29090303 atgctacctttgattgctttctgagtgcgatactcgatatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 29090204  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29090203 atatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagt 29090104  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  29090103 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 29090031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2557286 - 2557050
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  2557286 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 2557187  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  2557186 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 2557087  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  2557086 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 2557050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15193834 - 15193598
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  15193834 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 15193735  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |  | ||| || |  || || || ||    
T  15193734 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaaatacagaatatcgggactcacaatcagt 15193635  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  15193634 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 15193598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Original strand, 16127225 - 16127441
Alignment:
Q  78 catctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaa 177  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  16127225 catctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcata 16127324  T
Q  178 taatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagt 277  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||    
T  16127325 taatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagt 16127424  T
Q  278 agatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||| || ||||||    
T  16127425 agatagcgtgctctttc 16127441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 271
Target Start/End: Original strand, 797908 - 798123
Alignment:
Q  56 caatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaa 155  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||| || || ||  |||| || | ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  797908 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcctagatatcaa 798007  T
Q  156 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcg 255  Q
    |||||| |||||| | | || ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||| | ||| |||| ||| || |||    
T  798008 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggaggcgtttggcggcccaggctagtgcgcaacaggtcttctcgaccatggaatagcgagattcacaatcg 798107  T
Q  256 gtgaacttcttgctca 271  Q
    || |||||||||||||    
T  798108 gtaaacttcttgctca 798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 16392821 - 16393032
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  16392821 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 16392920  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  16392921 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 16393020  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  16393021 aaacttcttgct 16393032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 30369333 - 30369544
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  30369333 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 30369432  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  30369433 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 30369532  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  30369533 aaacttcttgct 30369544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9470071 - 9469860
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  9470071 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 9469972  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    | || || ||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  9469971 acgtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtctggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 9469872  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  9469871 aaacttcttgct 9469860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 271
Target Start/End: Original strand, 16286764 - 16286979
Alignment:
Q  56 caatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaa 155  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||| || || ||  |||| || | ||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  16286764 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcgggtttctcaaagacgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 16286863  T
Q  156 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcg 255  Q
    ||| || |||||| | | || ||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| |||| ||| |||||     
T  16286864 ccatgtagtatgactaatcatatagtggcggaggcgttttgcagcccaggctagtgcacaacaggttttctcgagcatgggatagcgagattcacagtca 16286963  T
Q  256 gtgaacttcttgctca 271  Q
    || |||||||||||||    
T  16286964 gtaaacttcttgctca 16286979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 233
Target Start/End: Original strand, 1893019 - 1893137
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || |||||||| || | ||| |    
T  1893019 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacgaagacgcttagcagcccatgccaaagcgc 1893118  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcat 233  Q
    |||| || |||||||||||    
T  1893119 aacaggttttctcaagcat 1893137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 25727252 - 25727130
Alignment:
Q  53 acacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 152  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||  |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  25727252 acacaatatcatactcagacaataacatctgccagcgagcaattcttcctgttaaagccggcttctcaaaaatgtacttgatcgggtccattttggacat 25727153  T
Q  153 caaccaagttgtatgattcacca 175  Q
    ||||||||| || ||||| ||||    
T  25727152 caaccaagtagtgtgattaacca 25727130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16238252 - 16238112
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || || ||   | ||||||||||||| || ||||| | ||||||||| || || ||| ||||||| | ||  |  |||||||    
T  16238252 atgctacctttgattgctttctgggtgcgatacacaatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagttggcttctcaa 16238153  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtt 162  Q
    | || ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16238152 atatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagtt 16238112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5714830 - 5714552
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5714830 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 5714731  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5714730 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcaca 5714631  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5714630 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 5714552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5725740 - 5725462
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5725740 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 5725641  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5725640 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcaca 5725541  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5725540 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 5725462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 5766628 - 5766906
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5766628 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatactcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 5766727  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5766728 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcaca 5766827  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5766828 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 5766906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32294385 - 32294107
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32294385 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 32294286  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294285 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 32294186  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294185 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 32294107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8215492 - 8215214
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8215492 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 8215393  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215392 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 8215293  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  8215292 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtaggtagcatgctctttc 8215214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 28112457 - 28112735
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28112457 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 28112556  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28112557 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 28112656  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28112657 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 28112735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 5605817 - 5606095
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5605817 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcggacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 5605916  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5605917 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 5606016  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5606017 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 5606095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21678460 - 21678182
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  21678460 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 21678361  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678360 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcatccaagttgtatgatttaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 21678261  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21678260 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 21678182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5017472 - 5017193
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5017472 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagct 5017373  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5017372 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggtagcccaagctagagcac 5017273  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5017272 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 5017193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18228950 - 18228675
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18228950 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 18228851  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18228850 caaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 18228751  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  18228750 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 18228675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4627542 - 4627264
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4627542 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 4627443  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4627442 tctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagctagagcaca 4627343  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4627342 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 4627264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 5592860 - 5593138
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5592860 gcaagaatgctacctttgattgccttttgcgttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 5592959  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5592960 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatattaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 5593059  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5593060 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 5593138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22384081 - 22384359
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22384081 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 22384180  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  22384181 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 22384280  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22384281 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 22384359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31032739 - 31033017
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31032739 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 31032838  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  31032839 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcaca 31032938  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31032939 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 31033017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51785780 - 51785502
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  51785780 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtgacagcagctt 51785681  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51785680 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 51785581  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51785580 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 51785502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6205657 - 6205382
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6205657 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 6205558  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  6205557 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccagagcacaaca 6205458  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6205457 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 6205382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18246498 - 18246220
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  18246498 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 18246399  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246398 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 18246299  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18246298 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 18246220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24331920 - 24331642
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  24331920 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 24331821  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24331820 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 24331721  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24331720 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 24331642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47027210 - 47026932
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47027210 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattctgacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacagcagctt 47027111  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47027110 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 47027011  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47027010 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 47026932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 20573345 - 20573624
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  20573345 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgct 20573444  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20573445 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaagtaatgacgcaggcgtttagcagcccaagctagggcac 20573544  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20573545 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 20573624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Original strand, 29661472 - 29661751
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||    
T  29661472 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccatcgtgcaatctttccagtaacggccgct 29661571  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29661572 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagggcac 29661671  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29661672 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 29661751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 4793138 - 4793416
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4793138 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 4793237  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  4793238 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgactcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 4793337  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4793338 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 4793416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7076963 - 7076685
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7076963 gcaagaatactacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 7076864  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  7076863 tctcaaagatatattttatcggatccattctggatgtcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 7076764  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7076763 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 7076685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8000317 - 8000039
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  8000317 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 8000218  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8000217 tctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 8000118  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8000117 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 8000039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 8285973 - 8286251
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  8285973 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagcagctt 8286072  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  8286073 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcaca 8286172  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8286173 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 8286251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10646830 - 10646552
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  10646830 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 10646731  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10646730 tctcaaagatatactttattggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 10646631  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10646630 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 10646552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 18304157 - 18304435
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18304157 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 18304256  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  18304257 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 18304356  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18304357 acaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 18304435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 31960958 - 31961236
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  31960958 gcaagaatgctgtctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 31961057  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31961058 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 31961157  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31961158 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 31961236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32442908 - 32442630
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  32442908 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccatcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 32442809  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  32442808 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 32442709  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32442708 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 32442630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28025040 - 28024761
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  28025040 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 28024941  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024940 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 28024841  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28024840 aacaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaattggtgaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 28024761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4725388 - 4725110
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4725388 gcaagaatgctacctttgatttccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 4725289  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  4725288 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 4725189  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4725188 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttc 4725110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8299728 - 8299450
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8299728 gcaagaattctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 8299629  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||    
T  8299628 tctcaaagatatactttatcggatccattatggatatcaaccaagttgtatgattcatcaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaagccaaagcaca 8299529  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8299528 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 8299450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 11106862 - 11107140
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11106862 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 11106961  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || | ||||||    
T  11106962 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagaggcccaggccaaagcaca 11107061  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11107062 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaatttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 11107140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 15737597 - 15737875
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15737597 gcaagaatgctacatttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 15737696  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  15737697 tctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 15737796  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15737797 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 15737875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 15889208 - 15889486
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  15889208 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 15889307  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  15889308 tctcaaagatatactttaccggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcaca 15889407  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15889408 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcaatcggtgaacttcttgcttatatagtagatagcatgttctttc 15889486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Original strand, 18273555 - 18273829
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18273555 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 18273654  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  18273655 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 18273754  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttc 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18273755 acaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttc 18273829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 290
Target Start/End: Original strand, 18288856 - 18289130
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18288856 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 18288955  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  18288956 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 18289055  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttc 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18289056 acaagccttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttc 18289130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19698247 - 19697969
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  19698247 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaagagcatctgccagcgggcaatcttcccagtaacagcagctt 19698148  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  19698147 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 19698048  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19698047 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 19697969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28342934 - 28342656
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  28342934 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 28342835  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  28342834 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 28342735  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28342734 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 28342656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35884523 - 35884245
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35884523 gcaagaatgctacctttaattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 35884424  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  35884423 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 35884324  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35884323 acaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 35884245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10399900 - 10399623
Alignment:
Q  17 caagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagcttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  10399900 caagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagccgcttt 10399801  T
Q  117 ctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||    
T  10399800 ctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaa 10399701  T
Q  217 caagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10399700 caagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttc 10399623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18334384 - 18334109
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18334384 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctttct 18334285  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  18334284 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcacaaca 18334185  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18334184 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtaaacttcttgcttaggtagtagatagcatgttctttc 18334109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4420672 - 4420394
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  4420672 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 4420573  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4420572 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 4420473  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  4420472 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagataatagatagcatgctctttc 4420394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4687412 - 4687134
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4687412 gcaagaatgctacctttgactgtcttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 4687313  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  4687312 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 4687213  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4687212 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgttctttc 4687134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5470745 - 5470467
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  5470745 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 5470646  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5470645 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccacgctagagcaca 5470546  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5470545 acaagtcttctctagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 5470467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 17981452 - 17981730
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17981452 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 17981551  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  17981552 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 17981651  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  17981652 acaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtaaatagcatgctctttc 17981730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20069797 - 20069519
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20069797 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacagcatctgctagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 20069698  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  20069697 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatttcaaccaagttgtatgattcaccagataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 20069598  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20069597 acaagtcttctcaagcattgcataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 20069519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22867351 - 22867629
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  22867351 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 22867450  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22867451 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcaca 22867550  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22867551 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttc 22867629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 22882410 - 22882688
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  22882410 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 22882509  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22882510 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagtgcaca 22882609  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22882610 acaagtcttttcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagataacatgctctttc 22882688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 29145259 - 29145537
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  29145259 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccggtaacagccgctt 29145358  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  29145359 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 29145458  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29145459 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 29145537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48469684 - 48469406
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  48469684 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgcgcaatctttccagtaacggccgctt 48469585  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  48469584 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatggttcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 48469485  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48469484 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 48469406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 4343179 - 4343457
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  4343179 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaacaacatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 4343278  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||    
T  4343279 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggctaaagcaca 4343378  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  4343379 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 4343457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 6539245 - 6539523
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||    
T  6539245 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttccccgtaacggccgctt 6539344  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6539345 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 6539444  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6539445 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 6539523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18055019 - 18054741
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18055019 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 18054920  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||||    
T  18054919 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagtcgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccagaccagagcaca 18054820  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  18054819 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttacttaaatagtagatagcatgttctttc 18054741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5653842 - 5653573
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  5653842 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcacctgtcagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 5653743  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| |    
T  5653742 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttagcggcccaggccagagcata 5653643  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5653642 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgagcttcttgcttagatagtagatagca 5653573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 16620993 - 16621271
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||    
T  16620993 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcctagtaacagcaggtt 16621092  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||    
T  16621093 tctcgaagatatactttatctgatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaagcgtttggcggcccagaccagagcaca 16621192  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621193 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcagtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 16621271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 108 - 294
Target Start/End: Original strand, 17992526 - 17992712
Alignment:
Q  108 agcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992526 agcagctttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagct 17992625  T
Q  208 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992626 agagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 17992712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 17973364 - 17973460
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcag 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17973364 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcag 17973460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 11924867 - 11925139
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || | |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  11924867 atgctacctttgattgctttctgagtgcgatactcgatatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 11924966  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11924967 atatgtacttgataggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagt 11925066  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  11925067 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 11925139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6572069 - 6571833
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  6572069 atatcatactcggacaataacatttgccagcgagcgatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatatcaacc 6571970  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||| ||||| || | |||||||||||| |||||||| |  | ||| ||||  || || || ||    
T  6571969 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcggcccaggccaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgagactcacaatcagt 6571870  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6571869 gaacttcttactcaaatagtagatagcatgctctttc 6571833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 7088536 - 7088808
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || |||||   | || | |||||||| ||  |||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||    
T  7088536 atgctacctttgattgctttctgagtacgatactcgatatcatactcgaacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaa 7088635  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7088636 atatgtacttgataggatccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagt 7088735  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  | ||| || |  || || || ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  7088736 tttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagtgaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 7088808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16432120 - 16431948
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  16432120 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 16432021  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaag 230  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16432020 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagctaaagcacaacaagttttctcaag 16431948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22960168 - 22959932
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  22960168 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 22960069  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  22960068 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 22959969  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  22959968 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 22959932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15919175 - 15919021
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  15919175 ttctcaaatatgtacttgattggatccattttggatatcaaccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggccagagcac 15919076  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgct 269  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||    
T  15919075 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaactttttgct 15919021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20443834 - 20443619
Alignment:
Q  56 caatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaa 155  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||| || || ||  |||| || | ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||    
T  20443834 caatatcatattcggataataacatctgccaccgggcaattcttcctgtcaaagcaggtttctcaaagatgtacttgatcggatccatcttagatatcaa 20443735  T
Q  156 ccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcg 255  Q
    |||||| |||||| | | || ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||| |||||     
T  20443734 ccaagtagtatgactaatcatatagtgacggagacgtttagcagcccaggctagtgcgcaacaagtcttctcgagcatggaatagcgagattcacagtca 20443635  T
Q  256 gtgaacttcttgctca 271  Q
    || |||||||||||||    
T  20443634 gtaaacttcttgctca 20443619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 269
Target Start/End: Original strand, 15592513 - 15592667
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| | | || ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15592513 ttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcaacccaggctagagcac 15592612  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgct 269  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||| | ||| || |||||||||||    
T  15592613 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcaccgtcagtaaacttcttgct 15592667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15705224 - 15704952
Alignment:
Q  22 atgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaa 121  Q
    ||||||||||||||||| || || ||   | |||| |||||||| || || || | |||||||||||| || ||| |||| || | ||| |  |||||||    
T  15705224 atgctacctttgattgctttctgggtgcgatacacgatatcatactcggataataacatctgccagcgagcaatccttccggttaaagctggcttctcaa 15705125  T
Q  122 agatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagt 221  Q
    | || ||||| || || |||||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15705124 atatgtacttgattgggtccatcttggatatcaaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcacaacaagt 15705025  T
Q  222 cttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     |||||||| |  |  || || |  || || || ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15705024 tttctcaagtacagagtatcgggactcacaatcagtgaatttcttactcaaatagtagatagcatgttctttc 15704952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 5950347 - 5950558
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  5950347 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5950446  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  5950447 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacacgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5950546  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  5950547 aaacttcttgct 5950558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 46381049 - 46380838
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| | ||||||||| || || || || ||||||||| | |||| || ||    
T  46381049 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtatttgattggatccattttagataccagcc 46380950  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  46380949 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 46380850  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  46380849 aaacttcttgct 46380838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 37260254 - 37260465
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  37260254 atatcatattcagatagtagcatttgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 37260353  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| |  ||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  37260354 aagtagcgtgattaattatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 37260453  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  37260454 aaacttcttgct 37260465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4450433 - 4450363
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacg 185  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||| |||||    
T  4450433 ttctcaaaaatgtacttgatcggatccattttggatatcaaccaagtagtgtgattaaccatatagtgacg 4450363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9818 - 9540
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9818 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 9719  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9718 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 9619  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9618 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 9540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10966463 - 10966185
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10966463 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 10966364  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10966363 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 10966264  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10966263 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 10966185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28153534 - 28153256
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  28153534 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcgtattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacagctt 28153435  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153434 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 28153335  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153334 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 28153256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10948876 - 10948597
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10948876 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagct 10948777  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10948776 ttctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcac 10948677  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10948676 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 10948597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28588783 - 28588505
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  28588783 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgctt 28588684  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588683 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 28588584  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28588583 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 28588505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3644935 - 3644655
Alignment:
Q  15 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagct 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  3644935 tgcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaatacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacggccgct 3644836  T
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644835 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 3644736  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgag-tttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644735 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagttttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 3644655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 16204494 - 16204772
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16204494 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatcttccagcgggcaatctttccagtaacagcagctt 16204593  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  16204594 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcctaggccagagcaca 16204693  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16204694 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 16204772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51642016 - 51641738
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51642016 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacagtatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 51641917  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51641916 tctcaaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatggttcaccaagtaatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 51641817  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51641816 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 51641738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 41789770 - 41790048
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  41789770 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgctt 41789869  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41789870 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcagccaagtcgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgcttagcagcccaagctagagcaca 41789969  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41789970 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgctctttc 41790048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 282
Target Start/End: Original strand, 20336876 - 20337142
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20336876 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagataagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 20336975  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20336976 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggcccaggccagagcaca 20337075  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 282  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337076 acaagttttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagata 20337142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 285
Target Start/End: Original strand, 21894208 - 21894477
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||    
T  21894208 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaatagcatctgccagcgtgcaaccttcccagtaacagccgctt 21894307  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  21894308 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcaca 21894407  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagca 285  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21894408 acaagtcctctcaaacattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagca 21894477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20464774 - 20464496
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  20464774 gcaagaatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcaggtt 20464675  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||    
T  20464674 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcattttgcggcccaggccagagcaca 20464575  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20464574 acaagtcttttcaagtatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 20464496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22489782 - 22489541
Alignment:
Q  53 acacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatat 152  Q
    |||| |||||||| || ||||| | ||||||||| || || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||    
T  22489782 acacgatatcatactcggacaataacatctgccatcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgattggatccatcttggatat 22489683  T
Q  153 caaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcag 252  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||| | || ||| || |  || ||     
T  22489682 caaccaagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaatcacaacaagttttctcaagtactgaatatcgggactcacaa 22489583  T
Q  253 tcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22489582 tcagtgaacttcttactcagatagtagatagcatgctctttc 22489541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Original strand, 5628500 - 5628711
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||| | |||| || ||    
T  5628500 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggtttctcaaatatgtacttgattggatccattttagataccagcc 5628599  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || || || | || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  5628600 aagtagtgtggttaatcatataatgacggaggcgcttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtagcgagattcacattcagt 5628699  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  5628700 aaacttcttgct 5628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9832 - 9554
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9832 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 9733  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9732 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttagcagcccaagctagagcaca 9633  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  9632 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatggcatgttctttc 9554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 11388 - 11666
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11388 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctt 11487  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11488 tctcaaagatatacttgatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctaaagcaca 11587  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11588 acaagtcttctcaagcattgtgtaccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Original strand, 22654 - 22929
Alignment:
Q  19 agaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22654 agaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacagaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtaacagcagctttct 22753  T
Q  119 caaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22754 caaagatgtactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaaca 22853  T
Q  219 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  22854 agtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcgtgctctttc 22929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16377 - 16099
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16377 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 16278  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16277 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgcttagcggcccaggccagagcaca 16178  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16177 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 16099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3863 - 3585
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3863 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacagcagctt 3764  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  3763 tctcaaagatatactttatcgaatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccagagcaca 3664  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3663 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11745 - 11467
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  11745 gcaagaatgctgcctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatcttcccagtaacggccgctt 11646  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11645 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatggcgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 11546  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11545 acaagtcttttcaagcattgtatatcgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 11467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13367 - 13089
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |    
T  13367 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacggccgcct 13268  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||||||    
T  13267 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagtggcccaggctaaagcaca 13168  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13167 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 13089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9841 - 9563
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9841 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaacatcatattcagacaagagcatctgccagcttgcaatcttcccagtaacagcagctt 9742  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  9741 tctcaaagatatattttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcggccaaggccagagcaca 9642  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9641 acaagtcttttcaagcatcgtataccgagtttcacagtcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 9563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 5639 - 5917
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  5639 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcaatctttccagtgacggcagctt 5738  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || | ||||||    
T  5739 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtgtgattcaccaaataatgacgcaggcgtttagcggcccaggccaaagcaca 5838  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5839 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgctctttc 5917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 294
Target Start/End: Original strand, 5131 - 5409
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |    
T  5131 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatctgccagtgtgcaatcttcccagtaacagcaggct 5230  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcaca 215  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5231 tctcgaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagtagtatgatttaccaggtaatgacgaaggcgtttggcagcccaggctagagcaca 5330  T
Q  216 acaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  5331 gcaagtcttctcaagcatcgtataccgaatttcgcagtcggtaaacttcttgcttagatagtagatggcatgctctttc 5409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 294
Target Start/End: Original strand, 43181 - 43464
Alignment:
Q  24 gctacctttgattgcctttt-gagtttta-aacacaatatc-atattcagacaaaa-gcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagcttt-ct 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  43181 gctacctttgattgcctttttgagtttttgaacacaatatctatattcagacaaaaagcatctgccaacgtgcaatcttcccagtaacagcagctttact 43280  T
Q  119 caaagatat-actttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattc-accaaataat-gacgcagg-cgtttggcagccca--agctagagc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||  | | | ||     
T  43281 caaagatattactttatcggatccattctggatatcaaccacgttgtatgattcaaccaaataatagacgcaggtcgtttagcggcccaggaccaaaagg 43380  T
Q  213 ac-aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttc-gcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43381 acaaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttctacaatcggtgaacttcttgcttagatagtagatagcatgttctttc 43464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22912 - 22757
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  22912 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttgaacacaatatcatattcagacaagagcatttgccaacgcgcaatttttccagtaacagcagctt 22813  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattc 171  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22812 tctcaaagatatacttgattggatccatcctggatatcaaccaagttgtatgattc 22757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 118793 - 118946
Alignment:
Q  16 gcaagaatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctt 115  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||    
T  118793 gcaagaatgctacctttgatagctttttgagccttgaacacaatgtcatattcagacaagagcatctgccagcgtgcaatcttcccagtaacaacaggtt 118892  T
Q  116 tctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgat 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  118893 tctcgaagatatactttatcggatccattctggatatcacccaagttgtatgat 118946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 275
Target Start/End: Original strand, 34799 - 34959
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34799 ttctcaaatatgtacttgatcggatccattttagatatcagccaagtagtatgactaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcac 34898  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagata 275  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  34899 aacaagtcctctcaagcatggaatagcgagattcacagtcagtaaacttcttgcttagata 34959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10972 - 10736
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||| ||||||| | ||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  10972 atatcatactcggacaataacatctgccagcgagcaatccttccagttaaagctggcttctcaaatatgtacttgataggatccatcttggatatcaacc 10873  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || || ||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |  | ||| || |  || || || ||    
T  10872 aagttgtatgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaagttaaagcacaacaagttttctcaagtacagaatatcgggactcacaatcagt 10773  T
Q  258 gaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  10772 gaacttcttactcaaatagtagatagcgtgctctttc 10736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 294
Target Start/End: Original strand, 4969 - 5148
Alignment:
Q  115 ttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaaccaagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcac 214  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| || || ||||||||||| |||| |||||    
T  4969 ttctcaaagacatacttgattggatccattttagatatcaaccaagtagtgtgattaatcatataatgacggagacgcttggcagcccaggctaaagcac 5068  T
Q  215 aacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggtgaacttcttgctcagatagtagatagcatgttctttc 294  Q
    | |||||||||||||| ||   ||||||||  || |  || || ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  5069 atcaagtcttctcaagtatgaaataccgagactcactatctgtaaacttcttgctcaaatagtaaataacatgttctttc 5148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29924 - 29713
Alignment:
Q  58 atatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcagctttctcaaagatatactttatcggatccattctggatatcaacc 157  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||| |||| || | ||| |  |||||||| || ||| | || ||||||||| | |||| || ||    
T  29924 atatcatattcagatagtagcatctgccaccgtgcaatccttcctgtcaaagcgggcttctcaaatatgtacctgattggatccattttagataccagcc 29825  T
Q  158 aagttgtatgattcaccaaataatgacgcaggcgtttggcagcccaagctagagcacaacaagtcttctcaagcattgtataccgagtttcgcagtcggt 257  Q
    |||| || ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |  || |||| ||| || || ||    
T  29824 aagtagtgtgattaatcatataatgacggaggcgtttggcagcccaggctagagcacaacatgtcttctcgagcatggagtatcgagattcacattcagt 29725  T
Q  258 gaacttcttgct 269  Q
     |||||||||||    
T  29724 aaacttcttgct 29713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 2070 - 1979
Alignment:
Q  21 aatgctacctttgattgccttttgagttttaaacacaatatcatattcagacaaaagcatctgccagcgtgcgatctttccagtaacagcag 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||    
T  2070 aatgctacctttgattgctttttgagccttgaacacaatgccatattcagacaagagcatctgccagcgtccaatcttcctagtaacagcag 1979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University