View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12198_high_7 (Length: 320)

Name: NF12198_high_7
Description: NF12198
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12198_high_7
NF12198_high_7
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (1-201)||(7107-7307)
scaffold0433 (237-293)||(7015-7071)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (1-201)||(2328-2528)
scaffold0234 (1-201)||(11219-11419)
scaffold0234 (237-293)||(2564-2620)
scaffold0234 (237-293)||(11455-11511)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (1-201)||(29327784-29327984)
chr7 (1-201)||(11536069-11536269)
chr7 (1-201)||(11542987-11543187)
chr7 (1-199)||(18561009-18561207)
chr7 (1-199)||(15148144-15148342)
chr7 (1-199)||(15152445-15152643)
chr7 (1-195)||(12738542-12738736)
chr7 (9-199)||(12750828-12751018)
chr7 (9-199)||(18257857-18258047)
chr7 (13-195)||(13392157-13392338)
chr7 (9-179)||(2364917-2365086)
chr7 (237-294)||(2653275-2653332)
chr7 (237-294)||(12738442-12738499)
chr7 (9-168)||(7396221-7396381)
chr7 (237-293)||(11543223-11543279)
chr7 (108-195)||(39111819-39111905)
chr7 (237-293)||(11536305-11536361)
chr7 (237-293)||(12750733-12750789)
chr7 (237-293)||(15152350-15152406)
chr7 (238-293)||(29327690-29327745)
chr7 (237-293)||(15148049-15148105)
chr7 (86-127)||(3132748-3132789)
chr7 (52-151)||(10234179-10234278)
chr7 (238-293)||(13392030-13392085)
chr7 (169-201)||(2653207-2653239)
chr7 (237-293)||(18258087-18258143)
chr7 (122-172)||(29982995-29983045)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (1-201)||(24695473-24695673)
chr5 (1-201)||(18569870-18570070)
chr5 (1-199)||(19714505-19714703)
chr5 (1-195)||(19707225-19707419)
chr5 (13-196)||(27347497-27347679)
chr5 (9-195)||(22547031-22547217)
chr5 (16-197)||(17285754-17285935)
chr5 (92-201)||(39537962-39538071)
chr5 (1-135)||(18807041-18807175)
chr5 (16-197)||(17298907-17299088)
chr5 (237-293)||(24695709-24695765)
chr5 (92-195)||(31886537-31886640)
chr5 (237-293)||(19714742-19714798)
chr5 (237-293)||(19707462-19707518)
chr5 (237-293)||(27347722-27347778)
chr5 (1-81)||(39538708-39538788)
chr5 (86-175)||(33477390-33477479)
chr5 (237-285)||(18570108-18570156)
chr5 (238-293)||(39537870-39537925)
chr5 (86-151)||(11479420-11479486)
[»] chr4 (46 HSPs)
chr4 (1-201)||(19926767-19926967)
chr4 (1-201)||(10621340-10621540)
chr4 (1-201)||(26970463-26970663)
chr4 (1-201)||(55612683-55612883)
chr4 (1-201)||(5707320-5707520)
chr4 (1-201)||(10628419-10628619)
chr4 (1-201)||(26963640-26963840)
chr4 (1-199)||(28393141-28393339)
chr4 (1-201)||(5713948-5714148)
chr4 (1-201)||(868597-868797)
chr4 (1-199)||(18262214-18262412)
chr4 (1-199)||(4426611-4426808)
chr4 (1-199)||(18269070-18269273)
chr4 (3-189)||(8845215-8845401)
chr4 (3-189)||(8858179-8858365)
chr4 (86-201)||(12357136-12357251)
chr4 (2-193)||(20311299-20311491)
chr4 (9-195)||(5668140-5668327)
chr4 (1-195)||(10677562-10677753)
chr4 (1-195)||(10891202-10891393)
chr4 (2-199)||(5616215-5616414)
chr4 (1-195)||(35223576-35223760)
chr4 (237-294)||(19927003-19927060)
chr4 (237-293)||(5713856-5713912)
chr4 (237-293)||(26963548-26963604)
chr4 (237-293)||(26970371-26970427)
chr4 (9-175)||(21454152-21454319)
chr4 (237-293)||(5707228-5707284)
chr4 (237-293)||(10621576-10621632)
chr4 (237-293)||(12357044-12357100)
chr4 (237-291)||(868507-868561)
chr4 (237-294)||(17142372-17142429)
chr4 (237-293)||(10628655-10628711)
chr4 (237-293)||(55612594-55612650)
chr4 (237-295)||(4426847-4426905)
chr4 (239-293)||(28393380-28393434)
chr4 (237-293)||(18268976-18269032)
chr4 (2-163)||(56516094-56516255)
chr4 (86-152)||(39074279-39074346)
chr4 (237-286)||(55992680-55992729)
chr4 (92-151)||(11161913-11161972)
chr4 (12-63)||(39074218-39074269)
chr4 (237-278)||(5668371-5668412)
chr4 (237-285)||(8845118-8845166)
chr4 (237-285)||(8858082-8858130)
chr4 (237-277)||(18262136-18262176)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (1-201)||(18252030-18252230)
chr1 (1-201)||(27131416-27131616)
chr1 (1-201)||(18532521-18532721)
chr1 (1-199)||(16359042-16359240)
chr1 (1-199)||(27310584-27310782)
chr1 (1-199)||(21171240-21171438)
chr1 (9-195)||(36816648-36816834)
chr1 (1-201)||(3855926-3856126)
chr1 (9-201)||(22657236-22657429)
chr1 (1-195)||(27277564-27277756)
chr1 (9-167)||(12006554-12006712)
chr1 (2-167)||(12014292-12014457)
chr1 (3-189)||(9917927-9918106)
chr1 (237-294)||(18251935-18251992)
chr1 (237-294)||(18532757-18532814)
chr1 (237-293)||(27310821-27310877)
chr1 (237-293)||(16359280-16359336)
chr1 (94-171)||(3403248-3403325)
chr1 (94-171)||(3443494-3443571)
chr1 (237-293)||(21171479-21171535)
chr1 (244-293)||(22657472-22657521)
chr1 (126-195)||(30720625-30720694)
chr1 (244-285)||(36816885-36816926)
chr1 (237-293)||(3856164-3856220)
chr1 (237-293)||(27131652-27131704)
chr1 (237-293)||(27277800-27277856)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-201)||(6110064-6110264)
chr3 (1-201)||(10572599-10572799)
chr3 (1-199)||(16482490-16482688)
chr3 (1-195)||(17781125-17781319)
chr3 (1-199)||(18522665-18522863)
chr3 (1-201)||(15600891-15601091)
chr3 (1-201)||(15607436-15607636)
chr3 (15-201)||(8490488-8490674)
chr3 (1-198)||(13211305-13211502)
chr3 (1-201)||(13248607-13248807)
chr3 (1-195)||(19089752-19089946)
chr3 (1-201)||(15357593-15357793)
chr3 (1-195)||(10579362-10579556)
chr3 (1-199)||(13516813-13517011)
chr3 (1-199)||(18519980-18520175)
chr3 (1-199)||(17200191-17200389)
chr3 (1-195)||(32056907-32057101)
chr3 (1-182)||(15342226-15342407)
chr3 (40-201)||(18640792-18640953)
chr3 (9-195)||(1647536-1647726)
chr3 (9-201)||(29924971-29925163)
chr3 (9-201)||(29974124-29974316)
chr3 (13-199)||(16200128-16200313)
chr3 (13-199)||(16200434-16200619)
chr3 (1-194)||(24253395-24253589)
chr3 (1-95)||(17136465-17136559)
chr3 (138-199)||(18534758-18534819)
chr3 (237-293)||(6109972-6110028)
chr3 (237-293)||(8490396-8490452)
chr3 (237-293)||(13248515-13248571)
chr3 (237-293)||(13211211-13211267)
chr3 (237-293)||(18640989-18641045)
chr3 (244-293)||(10579604-10579653)
chr3 (154-199)||(18510924-18510969)
chr3 (237-293)||(17136137-17136193)
chr3 (244-293)||(10572841-10572890)
chr3 (237-293)||(15607672-15607729)
chr3 (244-293)||(17200434-17200483)
chr3 (237-293)||(15351237-15351293)
chr3 (237-293)||(15357829-15357885)
chr3 (237-293)||(16482727-16482782)
chr3 (237-293)||(18519885-18519941)
chr3 (237-294)||(1647768-1647825)
chr3 (237-293)||(15601127-15601184)
chr3 (237-293)||(13516719-13516775)
chr3 (249-293)||(17781370-17781414)
chr3 (249-293)||(19089997-19090041)
chr3 (237-293)||(32057144-32057200)
chr3 (237-293)||(18510829-18510885)
chr3 (237-293)||(18522570-18522626)
chr3 (237-285)||(18534671-18534719)
chr3 (237-293)||(29924879-29924935)
chr3 (237-293)||(29974032-29974088)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (1-199)||(16566327-16566525)
chr6 (1-201)||(29308890-29309090)
chr6 (1-201)||(29315850-29316050)
chr6 (1-201)||(17691447-17691647)
chr6 (1-201)||(27381259-27381459)
chr6 (1-201)||(27471642-27471842)
chr6 (1-199)||(188984-189182)
chr6 (1-199)||(17684476-17684674)
chr6 (1-199)||(11651725-11651923)
chr6 (1-199)||(25537166-25537364)
chr6 (11-199)||(13359286-13359474)
chr6 (9-182)||(8509941-8510115)
chr6 (9-178)||(27925772-27925946)
chr6 (237-291)||(17691683-17691737)
chr6 (244-293)||(27381502-27381551)
chr6 (244-293)||(27471885-27471934)
chr6 (237-293)||(29308798-29308854)
chr6 (237-293)||(29315758-29315814)
chr6 (1-162)||(20553594-20553755)
chr6 (237-293)||(17684712-17684768)
chr6 (239-293)||(11651630-11651684)
chr6 (237-293)||(25537405-25537461)
chr6 (139-194)||(31258065-31258120)
chr6 (1-163)||(17850502-17850663)
chr6 (1-163)||(20736610-20736773)
chr6 (237-285)||(13359512-13359560)
chr6 (237-285)||(16566563-16566611)
chr6 (237-295)||(189221-189282)
chr6 (86-163)||(28605854-28605931)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (1-201)||(993-1193)
scaffold0657 (237-294)||(900-957)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (1-201)||(6941-7141)
scaffold0390 (1-201)||(13957-14157)
scaffold0390 (237-293)||(7177-7233)
scaffold0390 (237-293)||(14193-14249)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (1-201)||(21940665-21940865)
chr8 (1-199)||(28554885-28555083)
chr8 (1-199)||(22171491-22171687)
chr8 (2-195)||(6094129-6094322)
chr8 (1-195)||(24642655-24642849)
chr8 (68-195)||(24636860-24636987)
chr8 (1-189)||(38232384-38232570)
chr8 (10-171)||(32872857-32873019)
chr8 (237-294)||(22070107-22070164)
chr8 (237-293)||(21940573-21940629)
chr8 (244-293)||(24642556-24642605)
chr8 (237-293)||(6094031-6094087)
chr8 (237-293)||(22171396-22171452)
chr8 (237-293)||(28554791-28554847)
chr8 (100-163)||(10920234-10920297)
chr8 (122-180)||(2375027-2375085)
chr8 (1-79)||(14983927-14984004)
chr8 (256-293)||(24636605-24636642)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (5-201)||(21330259-21330455)
chr2 (1-201)||(18796506-18796706)
chr2 (3-199)||(18619807-18620002)
chr2 (56-195)||(19692598-19692737)
chr2 (9-137)||(20977956-20978084)
chr2 (1-167)||(36270199-36270366)
chr2 (237-294)||(21330493-21330550)
chr2 (9-167)||(18822115-18822275)
chr2 (1-81)||(18852066-18852146)
chr2 (237-293)||(19692773-19692829)
chr2 (10-165)||(36802664-36802820)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (1-201)||(18288-18488)
scaffold0220 (237-293)||(18196-18252)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (1-201)||(25997-26197)
scaffold0186 (238-293)||(26231-26286)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (1-199)||(5531-5729)
scaffold0063 (237-285)||(5444-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (18-199)||(230365-230545)
scaffold0008 (237-293)||(230584-230640)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (138-201)||(8447-8510)
scaffold0176 (237-293)||(8546-8602)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (237-293)||(23769-23825)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (245-293)||(16523-16571)
scaffold0326 (168-201)||(16615-16648)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (237-293)||(41-97)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (237-293)||(8944-9000)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (257-298)||(1-42)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (237-291)||(10202-10256)
scaffold0565 (151-182)||(10127-10158)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (244-293)||(5878-5927)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (100-172)||(92194-92267)


Alignment Details
Target: scaffold0433 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7307 - 7107
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7307 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 7208  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7207 tctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaataccttg 7108  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  7107 t 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7015
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 2328 - 2528
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2328 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 2427  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 2527  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  2528 t 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11219 - 11419
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11219 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 11318  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 11418  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  11419 t 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2620
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11511
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29327984 - 29327784
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29327984 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 29327885  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327884 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29327785  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29327784 t 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11536069 - 11536269
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11536069 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11536168  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536169 tctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 11536268  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  11536269 t 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 11542987 - 11543187
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11542987 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 11543086  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11543087 tctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattg 11543186  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  11543187 t 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18561207 - 18561009
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18561207 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgtttaacgggg 18561108  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561107 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15148342 - 15148144
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15148342 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 15148243  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15148242 tctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15152643 - 15152445
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  15152643 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgtttaacgggg 15152544  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15152543 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaatgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12738736 - 12738542
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||    
T  12738736 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaacaagg 12738637  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738636 tctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12751018 - 12750828
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  12751018 acataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgtttaacgaggtctcacaa 12750919  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750918 ttaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 18257857 - 18258047
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||    
T  18257857 acataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgtttaatggggtctcacaa 18257956  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257957 ttaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||||| |||||||  |||||||| |||||| | || ||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    || | |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2365086 - 2364917
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| || ||| |||||| | ||||||||  ||| ||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |    
T  2365086 acatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagtttaatgggttctcacga 2364988  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 179  Q
    |||||  | |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2364987 ttaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653332
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 2653332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738442
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacat 12738442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||  | ||| || ||| ||||||||||| ||  ||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattattttg 168  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543279
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 11543279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39111905 - 39111819
Alignment:
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111905 attaagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536361
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaaca 11536361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750733
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaaca 12750733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152350
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 15152350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327690
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 29327690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 3132789 - 3132748
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132789 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 10234278 - 10234179
Alignment:
Q  52 aagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattcta 151  Q
    |||||||||||||  || ||| | | |||| || |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  10234278 aagcttgactacatttattttaatattagtgtctttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392030
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 13392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 201
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  169 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29983045 - 29982995
Alignment:
Q  122 aatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaac 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||    
T  29983045 aatgttccattaaacagattaactgttctaaagactttattactttgaaac 29982995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 24695473 - 24695673
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695473 gtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 24695572  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695573 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 24695672  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  24695673 t 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18569870 - 18570070
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  18569870 gtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgtttaacgggg 18569969  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18569970 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 18570069  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18570070 t 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 19714505 - 19714703
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  19714505 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19714604  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19714605 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19707225 - 19707419
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  19707225 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgtttaacgggg 19707324  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19707325 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaatg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 196  Q
    || | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 22547031 - 22547217
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||| |  ||||||| | |||| | ||  ||| ||||||| | |||||| |    
T  22547031 acataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatatttaatgagatctcacga 22547130  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22547131 ttaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaatg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  16 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagtt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| ||| |||||||| | |||||   ||||||| |||||| | |||||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  192 aatgccttgt 201  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 18807041 - 18807175
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagt-ttcattatgtttaatggg 99  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||| ||||||||     
T  18807041 gtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tttaatggt 18807139  T
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 135  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807140 gtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  16 agtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagtt 115  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||| | |||||   ||||||| |||||| | |||||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  116 atacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 197  Q
      ||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695765
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 24695765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 191  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  192 aatg 195  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707518
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19707518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 39538788 - 39538708
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagt 81  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||    
T  39538788 gtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagt 39538708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Original strand, 33477390 - 33477479
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477390 ttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570156
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagctta 18570156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11479486 - 11479420
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattcta 151  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||| ||||| |||||||    
T  11479486 ttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 46)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 19926767 - 19926967
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19926767 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 19926866  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926867 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 19926966  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  19926967 t 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10621340 - 10621540
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  10621340 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10621439  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621440 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10621539  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  10621540 t 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26970663 - 26970463
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26970663 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26970564  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970563 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 26970464  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26970463 t 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55612883 - 55612683
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  55612883 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 55612784  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612783 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 55612684  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  55612683 t 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5707520 - 5707320
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5707520 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5707421  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707420 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 5707321  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  5707320 t 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10628419 - 10628619
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  10628419 gtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 10628518  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628519 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10628618  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  10628619 t 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 26963840 - 26963640
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26963840 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26963741  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963740 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 26963641  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26963640 t 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 28393141 - 28393339
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28393141 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 28393240  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28393241 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5714148 - 5713948
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5714148 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 5714049  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714048 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 5713949  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  5713948 t 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 868797 - 868597
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  868797 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 868698  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  868697 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 868598  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  868597 t 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18262412 - 18262214
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18262412 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18262313  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18262312 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 4426611 - 4426808
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  4426611 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagttcc-ttatgtttaacgggg 4426709  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426710 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18269273 - 18269070
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18269273 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 18269174  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||    
T  18269173 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 18269074  T
Q  196 cctt 199  Q
    ||||    
T  18269073 cctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8845401 - 8845215
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  8845401 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8845302  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845301 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8858365 - 8858179
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  8858365 ctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggatc 8858266  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858265 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  186 taaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20311491 - 20311299
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||||||||||||||    
T  20311491 tctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgtttaatggggt 20311392  T
Q  102 ctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20311391 ctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 5668140 - 5668327
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagata--cttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcac 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||||| | || ||   ||||||||| ||||||    
T  5668140 acataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcac 5668238  T
Q  107 aattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
     ||||| | | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5668239 gattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10677562 - 10677753
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||     
T  10677562 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcac--taaagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10677658  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10677659 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10677753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10891202 - 10891393
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||  ||||||||||     
T  10891202 gtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcac--taaagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgtttaatggg- 10891298  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10891299 tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaatg 10891393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5616414 - 5616215
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagc--ttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 99  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||  |||||| |  ||||| || |||||||| |||||| | || |   |||||| |||    
T  5616414 tctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtttaacggg 5616315  T
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
     |||||  ||| ||| | |||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5616314 atctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaaatgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35223760 - 35223576
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||   ||  |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | || ||  |||            
T  35223760 gtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgtt-------- 35223669  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
      | || ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35223668 --ttacgattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaatg 35223576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927060
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 19927060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713856
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5713856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963548
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26963548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970371
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 26970371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 175
Target Start/End: Original strand, 21454152 - 21454319
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||| ||| ||||| ||| || |||| || ||| |||||||| ||||||| ||||| ||| | |||| | |||||||  ||||||||||||||  |    
T  21454152 acataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataattaatggggtctcaata 21454251  T
Q  109 ttaagttatactt-aatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 175  Q
    |||||| | | || ||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454252 ttaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621632
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142429
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaacat 17142429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426905
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacatt 295  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaacatt 4426905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  239 tgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268976
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 18268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 56516255 - 56516094
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagt-ttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    ||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||| | |||  |||| ||||||  |    
T  56516255 tctacctacataatagtctctatgttttaatactatcgttattcacaataaagcttgactatagatacttcaagaataatgttctatatg-ttaatgaag 56516157  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 163  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| |||||  |  || | |||||||| |||||||||||    
T  56516156 tctcacaattaagtcacaattaatgtttcattactctaaccatctattctaaggactttatta 56516094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 152
Target Start/End: Original strand, 39074279 - 39074346
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctag 152  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||    
T  39074279 ttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 286  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  92 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattcta 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 63
Target Start/End: Original strand, 39074218 - 39074269
Alignment:
Q  12 taatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactac 63  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  39074218 taatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactac 39074269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 278
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 278  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 277  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18252230 - 18252030
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18252230 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18252131  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252130 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18252031  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18252030 t 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27131416 - 27131616
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27131416 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 27131515  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131516 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27131615  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27131616 t 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 18532521 - 18532721
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18532521 gtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18532620  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532621 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18532720  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18532721 t 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16359042 - 16359240
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16359042 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16359141  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359142 tctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 27310584 - 27310782
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||    
T  27310584 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttcaacgtgg 27310683  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310684 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 21171240 - 21171438
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||    
T  21171240 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttcaacgggg 21171339  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171340 tctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 36816648 - 36816834
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | || |||||||||| || |||||||||    
T  36816648 acataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgtttaacggagtctcacaa 36816747  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816748 ttaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 3855926 - 3856126
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | || |||||||||||||||    
T  3855926 gtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgtttaatgggg 3856025  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3856026 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaatgccttg 3856125  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  3856126 t 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 22657236 - 22657429
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||    
T  22657236 acatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgtttaaaggggtctcacaa 22657335  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22657336 ttaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaaatgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27277564 - 27277756
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | |||||  | ||||   ||    
T  27277564 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggttaa-aagg 27277662  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||| | ||||||| | || ||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27277663 tctcgcgattaagtcacac-taatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaatg 27277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 12006554 - 12006712
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||| | |||||| | ||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||  ||  ||| | |||| | || |||||||| |||||||||||| |    
T  12006554 acataacaatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgtttcatggggtctcacga 12006653  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006654 ttaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 12014292 - 12014457
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||||| |||| || |||||||| ||||| |||  ||| ||||||   ||||||||||||||||| |    
T  12014292 tctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgtttaatgggat 12014391  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    || || ||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014392 ctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 9917927 - 9918106
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| | || |||| ||||||||  ||    
T  9917927 ctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatatttaatgga-tc 9918025  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    ||   || |||||||||||||||||| |||||||| |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918026 tcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251935
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18251935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532814
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 18532814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  94 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 171
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  94 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171535
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaaca 21171535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 22657472 - 22657521
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  22657472 caaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaaca 22657521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 195
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  126 ttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 244 - 285
Target Start/End: Original strand, 36816885 - 36816926
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36816885 caaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggctta 36816926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856220
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaaca 3856220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 6110264 - 6110064
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6110264 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 6110165  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110164 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 6110065  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  6110064 t 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 10572599 - 10572799
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10572599 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10572698  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572699 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 10572798  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  10572799 t 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16482490 - 16482688
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16482490 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgtttaatgggg 16482589  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482590 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 17781125 - 17781319
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17781125 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 17781224  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781225 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18522863 - 18522665
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18522863 gtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 18522764  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522763 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15600891 - 15601091
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15600891 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15600990  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15600991 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15601090  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  15601091 t 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15607436 - 15607636
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15607436 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 15607535  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15607536 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15607635  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  15607636 t 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 15 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8490674 - 8490488
Alignment:
Q  15 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490674 tagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagt 8490575  T
Q  115 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490574 tatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13211502 - 13211305
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13211502 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13211403  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211402 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13248807 - 13248607
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13248807 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 13248708  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248707 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 13248608  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  13248607 t 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19089752 - 19089946
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19089752 gtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 19089851  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089852 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 15357593 - 15357793
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15357593 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15357692  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15357693 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 15357792  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  15357793 t 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10579362 - 10579556
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10579362 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 10579461  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579462 tctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13517011 - 13516813
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  13517011 gtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgtttaacgggg 13516912  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516911 tctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18520175 - 18519980
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  18520175 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 18520079  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520078 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 17200191 - 17200389
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17200191 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgtttaaagggg 17200290  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200291 tatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 32056907 - 32057101
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32056907 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgtttaacgggg 32057006  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057007 tcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 15342226 - 15342407
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15342226 gtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgtttaatgggg 15342325  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342326 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 40 - 201
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  40 cacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacaga 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  140 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 1647536 - 1647726
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1647536 acataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaa 1647635  T
Q  109 ttaagtta----tacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647636 ttaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | || |||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | || |||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200128
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200434
Alignment:
Q  13 aatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaa 112  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  113 gttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 24253395 - 24253589
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||  |||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||    
T  24253395 gtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgtttgatgggg 24253494  T
Q  101 -tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24253495 atctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaaat 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17136559 - 17136465
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaa 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17136559 gtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18534819 - 18534758
Alignment:
Q  138 gactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534819 gactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109972
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 6109972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248515
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13248515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211211
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 13211211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 10579604 - 10579653
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579604 caaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 154 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  154 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 10572841 - 10572890
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10572841 caaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaaca 10572890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607729
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15607729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 17200434 - 17200483
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17200434 caaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 17200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351293
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15351293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357885
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 15357885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647825
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaacat 1647825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601184
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaaca 15601184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516719
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaaca 13516719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Original strand, 17781370 - 17781414
Alignment:
Q  249 ccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17781370 ccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17781414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 293
Target Start/End: Original strand, 19089997 - 19090041
Alignment:
Q  249 ccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19089997 ccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19090041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510829
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18510829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522570
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaaca 18522570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534671
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggctta 18534671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 16566327 - 16566525
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16566327 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 16566426  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566427 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29309090 - 29308890
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  29309090 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29308991  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308990 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29308891  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29308890 t 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29316050 - 29315850
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  29316050 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggc 29315951  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315950 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 29315851  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  29315850 t 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 17691447 - 17691647
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17691447 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 17691546  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691547 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 17691646  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  17691647 t 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27381259 - 27381459
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  27381259 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27381358  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381359 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27381458  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27381459 t 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 27471642 - 27471842
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  27471642 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgtttaatgggg 27471741  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471742 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 27471841  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  27471842 t 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 188984 - 189182
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  188984 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgtttaatgggg 189083  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189084 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 17684476 - 17684674
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17684476 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaacgggg 17684575  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684576 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11651923 - 11651725
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11651923 gtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttatttttaatgggg 11651824  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11651823 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaatgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 25537166 - 25537364
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25537166 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 25537265  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537266 tctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 13359286 - 13359474
Alignment:
Q  11 ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaatt 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||| | |  ||||||||||||| || |||| |||    
T  13359286 ataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgtttaatggagtttcacgatt 13359385  T
Q  111 aagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13359386 aagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaatgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg-tctcaca 107  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||  |||||||||| |||||| ||||||| | ||||   || | || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  108 attaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27925946 - 27925772
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||  ||  ||||||||| ||||||| |    
T  27925946 acataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagtttaatggagtctcacga 27925847  T
Q  109 ttaagt--tatactta---atgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 178  Q
    ||||||   | |||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925846 ttaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 27381502 - 27381551
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381502 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27381551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Original strand, 27471885 - 27471934
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471885 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 27471934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308798
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29308798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315758
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 29315758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 20553594 - 20553755
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||||| |||||||  || ||||| ||| |||| |||||| | |  |||| |||||||||     
T  20553594 gtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatatttaatggga 20553693  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatt 162  Q
    |||||| |||||||  |||||||| || |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553694 tctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684768
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaaca 17684768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  239 tgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537461
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaaca 25537461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 194
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  139 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 194  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 17850502 - 17850663
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| |||   ||||| ||| ||||||||||||  |||| ||| |||||||| || || | |||||| ||     
T  17850502 gtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgtttttaattgga 17850600  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 163  Q
    | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850601 tatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 20736610 - 20736773
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatac-ttttagaatagt-ttcattatgtttaatgg 98  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||| |  ||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||||     
T  20736610 gtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccagttcttattaaagcttgactacagatacatttaagaataatgttctttatg-ttaatgt 20736708  T
Q  99 ggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 163  Q
      |||||  ||||||| | ||||||| | |||||| ||  |||| |||||||||| |||||||||    
T  20736709 aatctcatgattaagtcaaacttaatataccattacacgaactatctattctaggaactttatta 20736773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359560
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggactta 13359560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 295
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189282
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaacatt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaacatt 189282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 28605931 - 28605854
Alignment:
Q  86 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 163  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  28605931 ttatctttaacgaggtctcacaatttagtcacacttaaagtcccattaaacaaaataactattctagatactttatta 28605854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1193 - 993
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1193 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgtttaatgggg 1094  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1093 tctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 994  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  993 t 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 900
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7141
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  6941 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaataggg 7040  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7041 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 7140  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  7141 t 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13957 - 14157
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13957 gtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 14056  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14057 tctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 14156  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  14157 t 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7233
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 7233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 21940865 - 21940665
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21940865 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 21940766  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21940765 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcattg 21940666  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  21940665 t 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28555083 - 28554885
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28555083 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 28554984  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554983 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22171687 - 22171491
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  22171687 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgtttaatgggg 22171590  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22171589 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaatgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6094322 - 6094129
Alignment:
Q  2 tctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggt 101  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||    
T  6094322 tctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgtttaacggggt 6094223  T
Q  102 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094222 ctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24642849 - 24642655
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24642849 gtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgtttaacgggg 24642750  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642749 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 68 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  68 acttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 38232384 - 38232570
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||   |||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| | |  ||| ||||||||| |    
T  38232384 gtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaatggag 38232482  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 189  Q
    | |||  |||||||||||| |||   |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232483 tgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| ||| | | || | ||| | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  110 taagttatacttaatgttccat-taaacagactaactattctagggactttattattttgaaa 171  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070107
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 22070107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24642605 - 24642556
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24642605 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 24642556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171396
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22171396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554791
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaaca 28554791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttatta 163  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2375085 - 2375027
Alignment:
Q  122 aatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 180  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375085 aatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 14983927 - 14984004
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaata 79  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||| ||||||    
T  14983927 gtctacccacataatagtccctattctt-aatgttatcccacttcacaataaattttgattatagatactttaagaata 14984004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  256 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Original strand, 21330259 - 21330455
Alignment:
Q  5 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21330259 acctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctc 21330358  T
Q  105 acaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21330359 acaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18796706 - 18796506
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||||||| || | ||    
T  18796706 gtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgttaaaagagg 18796607  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||    
T  18796606 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaattccttg 18796507  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18796506 t 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18620002 - 18619807
Alignment:
Q  3 ctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtc 102  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||| ||    
T  18620002 ctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgtttaatggg-tc 18619904  T
Q  103 tcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18619903 tcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaattcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 195
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  56 ttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctaggga 155  Q
    |||||||  |||||||| |||||| |||| ||  |||||||| | |||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  156 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 195  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977956
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| |||  ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  109 ttaagttatacttaatgttccattaaaca 137  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaaca 20977956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36270366 - 36270199
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||| || |||||||||| ||| |||  ||| |||||||| ||||| |||||||||  |    
T  36270366 gtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgtttaatgatg 36270267  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaac-agactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||| ||||||| | ||||||  || |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270266 tctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 294
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330550
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacat 21330550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18822275 - 18822115
Alignment:
Q  9 acataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaa 108  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||| ||  ||| |||||||| || || |||||||||| ||||||| |    
T  18822275 acataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgtttaatggtgtctcacga 18822176  T
Q  109 ttaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattatttt 167  Q
    |||||  | |||||| | ||||| ||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822175 ttaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Original strand, 18852066 - 18852146
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagt 81  Q
    ||||||| |||||||||||| ||   ||||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||    
T  18852066 gtctaccgacataatagtctatacaatttaatgttatcctacttcacaataaagttggactacatatactttaagaatagt 18852146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692829
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaaca 19692829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 165
Target Start/End: Original strand, 36802664 - 36802820
Alignment:
Q  10 cataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaat 109  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  || | || ||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||| |||||||||   |||  ||||    
T  36802664 cataataatctatatgctttaatgttatcccactttacactgaatcttgattacggatgttttaagaataatgtcattgtgtttaatgatatcttgcaat 36802763  T
Q  110 taagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattatt 165  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||  | ||||||||| | |||||||||||||    
T  36802764 taagtaacatttaatattccatttaaacgaattaactattcaaaggactttattatt 36802820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18488 - 18288
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18488 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 18389  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388 tctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 18289  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  18288 t 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 25997 - 26197
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25997 gtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg 26096  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26097 tctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttg 26196  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26197 t 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 293
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26286
Alignment:
Q  238 atgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaaca 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5729 - 5531
Alignment:
Q  1 gtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatgggg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||    
T  5729 gtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgtttaacgggg 5630  T
Q  101 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5629 tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaatgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5444
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 285  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggctta 5444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  18 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatacttttagaatagtttcattatgtttaatggggtctcacaattaagttat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  118 acttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 201
Target Start/End: Original strand, 8447 - 8510
Alignment:
Q  138 gactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8447 gactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8602
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23825
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 23825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16571 - 16523
Alignment:
Q  245 aaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16571 aaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 16523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  168 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Original strand, 41 - 97
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaaca 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 237 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 298
Target Start/End: Original strand, 1 - 42
Alignment:
Q  257 aatcaatatagattggctattagggcttattccaacattggt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaacagtggt 42  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 291
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  237 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 291  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 151 - 182
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  151 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 244 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5927 - 5878
Alignment:
Q  244 caaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 293  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  5927 caaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaaca 5878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  100 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacagactaactattctagggactttattattttgaaac 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University