View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12218_low_3 (Length: 575)

Name: NF12218_low_3
Description: NF12218
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12218_low_3
NF12218_low_3
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (18-575)||(8765544-8766106)
chr8 (401-575)||(34237673-34237847)
chr8 (401-575)||(39349265-39349439)
chr8 (401-575)||(3734641-3734815)
chr8 (401-575)||(4718654-4718828)
chr8 (401-575)||(28193483-28193657)
chr8 (407-575)||(21603245-21603413)
chr8 (401-575)||(2618195-2618369)
chr8 (401-575)||(20305917-20306091)
chr8 (401-575)||(21092550-21092724)
chr8 (408-575)||(15259424-15259591)
chr8 (402-575)||(264418-264590)
chr8 (402-575)||(651331-651503)
chr8 (402-575)||(837066-837238)
chr8 (413-571)||(20469938-20470095)
chr8 (401-575)||(42328014-42328187)
chr8 (401-575)||(19471618-19471793)
chr8 (401-575)||(19542542-19542717)
chr8 (401-575)||(19589979-19590154)
chr8 (408-575)||(32879295-32879462)
chr8 (401-575)||(42643136-42643310)
chr8 (415-572)||(4698744-4698901)
chr8 (415-575)||(14632977-14633137)
chr8 (447-575)||(6953026-6953153)
chr8 (401-575)||(27746353-27746527)
chr8 (401-550)||(18532116-18532265)
chr8 (409-575)||(28088303-28088469)
chr8 (401-575)||(24018391-24018566)
chr8 (445-575)||(10292108-10292237)
chr8 (415-571)||(2166722-2166875)
chr8 (450-571)||(25248407-25248526)
chr8 (415-575)||(34610705-34610865)
chr8 (408-574)||(28964049-28964214)
chr8 (503-575)||(2639429-2639501)
chr8 (447-550)||(24999289-24999392)
chr8 (401-555)||(8042663-8042806)
chr8 (408-574)||(21667566-21667731)
chr8 (401-575)||(26168867-26169040)
chr8 (401-571)||(7557973-7558135)
chr8 (452-574)||(1219409-1219531)
chr8 (447-575)||(18128568-18128696)
chr8 (420-574)||(12312874-12313027)
chr8 (408-516)||(34639284-34639391)
chr8 (408-488)||(34694681-34694761)
chr8 (409-519)||(9047352-9047462)
chr8 (401-482)||(3794800-3794881)
chr8 (415-574)||(3403521-3403680)
chr8 (409-519)||(36848823-36848933)
chr8 (492-568)||(28908922-28908999)
[»] chr7 (59 HSPs)
chr7 (401-575)||(7275286-7275460)
chr7 (401-575)||(2751280-2751454)
chr7 (401-575)||(7175880-7176054)
chr7 (401-575)||(21835160-21835334)
chr7 (401-575)||(22119897-22120071)
chr7 (401-575)||(40542928-40543102)
chr7 (409-574)||(22703503-22703668)
chr7 (408-575)||(10091204-10091371)
chr7 (401-575)||(21217851-21218025)
chr7 (408-575)||(11997865-11998032)
chr7 (401-572)||(2103064-2103234)
chr7 (409-575)||(17212070-17212236)
chr7 (401-575)||(18044116-18044290)
chr7 (401-575)||(19421240-19421414)
chr7 (407-575)||(17196968-17197136)
chr7 (398-574)||(42913532-42913708)
chr7 (401-568)||(2344308-2344475)
chr7 (401-575)||(27009368-27009543)
chr7 (401-575)||(27312161-27312335)
chr7 (444-574)||(29861722-29861852)
chr7 (434-575)||(654723-654863)
chr7 (401-575)||(28089825-28090002)
chr7 (432-575)||(16374034-16374177)
chr7 (401-572)||(23012529-23012700)
chr7 (401-575)||(39145670-39145844)
chr7 (401-575)||(9718005-9718179)
chr7 (401-519)||(7799906-7800024)
chr7 (401-524)||(13332492-13332615)
chr7 (408-575)||(31197607-31197773)
chr7 (467-572)||(23092171-23092276)
chr7 (410-575)||(27704020-27704184)
chr7 (475-575)||(3851840-3851940)
chr7 (419-575)||(31273941-31274096)
chr7 (401-575)||(31712920-31713087)
chr7 (401-559)||(28950877-28951038)
chr7 (407-489)||(22299864-22299946)
chr7 (409-519)||(42814881-42814991)
chr7 (447-575)||(41907532-41907659)
chr7 (400-575)||(9683834-9684009)
chr7 (401-567)||(28646978-28647144)
chr7 (408-575)||(22638308-22638471)
chr7 (424-574)||(36772322-36772471)
chr7 (401-571)||(43785321-43785491)
chr7 (407-575)||(32849606-32849774)
chr7 (401-464)||(23854405-23854468)
chr7 (420-574)||(22643361-22643515)
chr7 (420-529)||(14199730-14199839)
chr7 (472-570)||(21373790-21373888)
chr7 (409-487)||(25333436-25333514)
chr7 (506-575)||(25102827-25102895)
chr7 (408-489)||(40332115-40332196)
chr7 (508-575)||(25333519-25333586)
chr7 (407-567)||(23330765-23330925)
chr7 (401-458)||(28003845-28003902)
chr7 (401-465)||(21370606-21370670)
chr7 (401-487)||(22696329-22696415)
chr7 (401-486)||(12211642-12211727)
chr7 (401-568)||(21574127-21574295)
chr7 (405-441)||(24686133-24686169)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (401-575)||(5100-5274)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (401-575)||(15360116-15360290)
chr6 (401-575)||(11448876-11449050)
chr6 (401-575)||(34147351-34147525)
chr6 (401-575)||(34159967-34160141)
chr6 (401-575)||(9238980-9239154)
chr6 (401-574)||(11007170-11007343)
chr6 (419-571)||(654168-654320)
chr6 (401-575)||(1344942-1345114)
chr6 (401-575)||(3222654-3222826)
chr6 (436-571)||(12390465-12390600)
chr6 (401-575)||(21982339-21982512)
chr6 (402-575)||(21148529-21148701)
chr6 (402-574)||(5360090-5360262)
chr6 (401-575)||(9690656-9690830)
chr6 (401-575)||(28672072-28672246)
chr6 (408-575)||(9843950-9844117)
chr6 (408-559)||(17081088-17081239)
chr6 (401-519)||(12591642-12591760)
chr6 (403-575)||(14212899-14213061)
chr6 (408-575)||(9208264-9208431)
chr6 (410-571)||(11840915-11841075)
chr6 (401-567)||(33499479-33499646)
chr6 (401-500)||(13753245-13753344)
chr6 (401-479)||(22576072-22576150)
chr6 (415-568)||(17149481-17149634)
chr6 (419-482)||(17706418-17706481)
chr6 (401-515)||(31039025-31039139)
chr6 (415-557)||(28968078-28968220)
chr6 (540-575)||(33718487-33718522)
chr6 (475-575)||(14504100-14504200)
chr6 (408-480)||(33718571-33718643)
chr6 (447-568)||(10377766-10377888)
chr6 (495-574)||(15730514-15730593)
chr6 (490-564)||(22721790-22721865)
chr6 (541-570)||(12591770-12591799)
chr6 (527-568)||(17225797-17225838)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (401-575)||(35492916-35493090)
chr3 (401-575)||(45529772-45529946)
chr3 (401-575)||(53424195-53424368)
chr3 (401-575)||(8456168-8456342)
chr3 (401-575)||(25379766-25379940)
chr3 (402-575)||(26174119-26174292)
chr3 (401-575)||(46576353-46576527)
chr3 (407-575)||(49258280-49258448)
chr3 (408-575)||(53233928-53234095)
chr3 (401-575)||(15566518-15566691)
chr3 (401-575)||(30257629-30257803)
chr3 (401-575)||(40133467-40133641)
chr3 (408-575)||(25289733-25289899)
chr3 (401-575)||(30807171-30807345)
chr3 (401-568)||(48977393-48977560)
chr3 (401-575)||(34492593-34492767)
chr3 (401-575)||(52455667-52455841)
chr3 (402-575)||(52821654-52821826)
chr3 (415-575)||(10190760-10190920)
chr3 (401-575)||(18176905-18177079)
chr3 (401-575)||(21362948-21363122)
chr3 (401-575)||(29915288-29915461)
chr3 (401-575)||(29964441-29964614)
chr3 (401-575)||(45272434-45272608)
chr3 (415-575)||(10083837-10083997)
chr3 (407-549)||(26108303-26108445)
chr3 (418-575)||(39041870-39042027)
chr3 (408-575)||(40940837-40941004)
chr3 (436-575)||(8097297-8097436)
chr3 (401-575)||(31537856-31538030)
chr3 (401-575)||(32151429-32151603)
chr3 (407-565)||(7470244-7470401)
chr3 (409-575)||(7485549-7485709)
chr3 (401-574)||(25344077-25344249)
chr3 (410-571)||(53288735-53288895)
chr3 (413-575)||(8958053-8958216)
chr3 (420-575)||(33398486-33398641)
chr3 (425-575)||(1692863-1693012)
chr3 (401-575)||(4462638-4462811)
chr3 (409-503)||(55287816-55287910)
chr3 (401-575)||(51532794-51532968)
chr3 (447-575)||(2511315-2511443)
chr3 (415-575)||(14343307-14343466)
chr3 (444-575)||(24407309-24407440)
chr3 (401-575)||(11390607-11390781)
chr3 (492-575)||(24165733-24165815)
chr3 (410-568)||(49167070-49167231)
chr3 (401-575)||(19857057-19857230)
chr3 (401-502)||(50582997-50583097)
chr3 (490-575)||(54475775-54475860)
chr3 (415-568)||(26158837-26158983)
chr3 (419-517)||(38732989-38733087)
chr3 (505-575)||(48104986-48105056)
chr3 (493-573)||(33698726-33698806)
chr3 (420-482)||(9853640-9853702)
chr3 (450-519)||(48972785-48972854)
chr3 (526-575)||(53848452-53848501)
chr3 (507-575)||(55371312-55371380)
chr3 (401-575)||(4252414-4252588)
chr3 (423-498)||(25017542-25017617)
chr3 (521-574)||(32414595-32414648)
chr3 (459-562)||(1242036-1242139)
chr3 (401-464)||(36660775-36660838)
chr3 (502-568)||(6127559-6127625)
chr3 (408-482)||(9842933-9843006)
chr3 (415-568)||(34844397-34844549)
chr3 (484-571)||(17579157-17579245)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (401-575)||(27498749-27498923)
chr5 (407-575)||(15641123-15641291)
chr5 (401-568)||(32059465-32059632)
chr5 (401-575)||(8484679-8484853)
chr5 (401-575)||(38684213-38684386)
chr5 (401-575)||(11926519-11926694)
chr5 (415-575)||(18207226-18207386)
chr5 (415-575)||(19456229-19456387)
chr5 (401-568)||(4603782-4603949)
chr5 (401-575)||(33709521-33709693)
chr5 (401-575)||(6014298-6014472)
chr5 (409-575)||(7085644-7085810)
chr5 (401-575)||(13038473-13038646)
chr5 (401-575)||(13108468-13108641)
chr5 (415-575)||(30485847-30486007)
chr5 (409-564)||(15971151-15971306)
chr5 (401-575)||(23270540-23270714)
chr5 (401-575)||(31287964-31288138)
chr5 (402-575)||(42193491-42193662)
chr5 (401-575)||(34310147-34310321)
chr5 (401-530)||(25586937-25587066)
chr5 (405-575)||(37495056-37495233)
chr5 (419-575)||(10869583-10869739)
chr5 (401-575)||(11464926-11465099)
chr5 (415-575)||(12398466-12398626)
chr5 (401-500)||(38631054-38631153)
chr5 (401-571)||(22392706-22392863)
chr5 (401-575)||(27487572-27487747)
chr5 (401-575)||(36954823-36954997)
chr5 (418-575)||(21236380-21236537)
chr5 (415-573)||(34049841-34049988)
chr5 (401-500)||(1827623-1827722)
chr5 (401-575)||(19145430-19145603)
chr5 (401-549)||(15931064-15931211)
chr5 (472-575)||(35425089-35425192)
chr5 (401-575)||(5049142-5049315)
chr5 (401-516)||(25750686-25750803)
chr5 (401-574)||(12317174-12317342)
chr5 (407-575)||(26009282-26009450)
chr5 (408-575)||(10399785-10399953)
chr5 (415-500)||(7151348-7151433)
chr5 (410-571)||(28614508-28614667)
chr5 (475-575)||(9659329-9659429)
chr5 (448-568)||(24158191-24158311)
chr5 (403-575)||(36895432-36895604)
chr5 (479-575)||(13659263-13659359)
chr5 (523-575)||(22693062-22693114)
chr5 (505-575)||(41351122-41351191)
chr5 (408-463)||(5067313-5067368)
chr5 (408-503)||(22253235-22253330)
chr5 (524-575)||(38630997-38631048)
chr5 (408-465)||(37397725-37397782)
chr5 (527-575)||(5067392-5067440)
chr5 (415-499)||(17015507-17015591)
chr5 (401-447)||(3715055-3715101)
chr5 (546-575)||(3600016-3600045)
chr5 (542-575)||(10631307-10631340)
chr5 (414-490)||(29075806-29075883)
chr5 (415-479)||(14656629-14656693)
chr5 (539-575)||(15971107-15971143)
chr5 (415-463)||(16616138-16616186)
chr5 (409-441)||(21042677-21042709)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (401-575)||(4621255-4621429)
chr1 (401-575)||(24674398-24674572)
chr1 (401-575)||(7766745-7766919)
chr1 (409-575)||(17935782-17935948)
chr1 (409-575)||(24122036-24122202)
chr1 (401-559)||(8077652-8077810)
chr1 (401-575)||(15059420-15059594)
chr1 (401-575)||(18646858-18647032)
chr1 (401-568)||(46607815-46607982)
chr1 (408-575)||(27454882-27455051)
chr1 (407-571)||(7578420-7578584)
chr1 (415-571)||(45859065-45859221)
chr1 (401-572)||(7197268-7197438)
chr1 (401-575)||(30677181-30677355)
chr1 (401-573)||(2272349-2272521)
chr1 (415-575)||(9500373-9500533)
chr1 (401-575)||(34778347-34778518)
chr1 (415-575)||(23734135-23734296)
chr1 (415-575)||(23741327-23741488)
chr1 (415-558)||(33905545-33905688)
chr1 (420-574)||(8779755-8779909)
chr1 (401-575)||(21726734-21726908)
chr1 (401-568)||(32729550-32729716)
chr1 (420-575)||(36155906-36156061)
chr1 (415-568)||(37351478-37351639)
chr1 (409-574)||(1378911-1379075)
chr1 (401-574)||(32930754-32930927)
chr1 (401-502)||(46113493-46113594)
chr1 (402-566)||(168207-168371)
chr1 (405-564)||(7946853-7947011)
chr1 (444-575)||(8254770-8254901)
chr1 (401-568)||(29057363-29057529)
chr1 (401-574)||(18533743-18533916)
chr1 (407-550)||(23232304-23232451)
chr1 (409-482)||(20487301-20487374)
chr1 (401-568)||(1486425-1486592)
chr1 (407-482)||(14258538-14258613)
chr1 (450-568)||(16899557-16899675)
chr1 (447-567)||(2537749-2537864)
chr1 (496-575)||(26513166-26513244)
chr1 (401-487)||(24216983-24217069)
chr1 (419-568)||(9926171-9926322)
chr1 (492-564)||(12876965-12877037)
chr1 (402-482)||(25496599-25496679)
chr1 (512-575)||(48699875-48699938)
chr1 (415-465)||(1818753-1818803)
chr1 (420-506)||(25237077-25237162)
chr1 (415-568)||(37047011-37047164)
chr1 (505-570)||(22909980-22910045)
chr1 (410-512)||(19034467-19034569)
chr1 (401-566)||(1138584-1138748)
chr1 (526-568)||(35138118-35138160)
chr1 (415-489)||(39964531-39964605)
chr1 (401-441)||(6776149-6776189)
chr1 (401-441)||(47091695-47091735)
chr1 (511-575)||(50202661-50202725)
[»] chr4 (57 HSPs)
chr4 (401-575)||(40058870-40059044)
chr4 (401-575)||(52983624-52983798)
chr4 (402-575)||(19660550-19660723)
chr4 (409-575)||(27528813-27528979)
chr4 (401-575)||(34844776-34844950)
chr4 (401-575)||(32986202-32986376)
chr4 (401-575)||(5609220-5609394)
chr4 (401-575)||(33696297-33696471)
chr4 (401-575)||(54127360-54127534)
chr4 (401-575)||(35229173-35229347)
chr4 (401-575)||(46714397-46714572)
chr4 (401-575)||(45787722-45787895)
chr4 (415-575)||(20078002-20078162)
chr4 (401-575)||(20566354-20566529)
chr4 (410-575)||(49287872-49288036)
chr4 (401-575)||(25852219-25852394)
chr4 (415-575)||(44343533-44343693)
chr4 (401-571)||(13873317-13873487)
chr4 (401-543)||(33992631-33992773)
chr4 (445-575)||(34723848-34723978)
chr4 (407-575)||(1985847-1986014)
chr4 (401-575)||(13584272-13584446)
chr4 (449-575)||(32990488-32990614)
chr4 (401-574)||(51535618-51535799)
chr4 (401-575)||(35674766-35674933)
chr4 (415-574)||(7391984-7392141)
chr4 (420-575)||(12500077-12500231)
chr4 (408-575)||(32942382-32942549)
chr4 (409-571)||(36131532-36131694)
chr4 (401-510)||(22625153-22625262)
chr4 (401-567)||(18875543-18875708)
chr4 (447-575)||(9517659-9517787)
chr4 (400-575)||(13550212-13550387)
chr4 (408-574)||(34835541-34835707)
chr4 (407-519)||(2351024-2351136)
chr4 (407-575)||(55961772-55961928)
chr4 (415-519)||(30879239-30879343)
chr4 (475-568)||(22488053-22488146)
chr4 (415-571)||(20527056-20527211)
chr4 (408-500)||(43719158-43719250)
chr4 (443-571)||(21387509-21387635)
chr4 (434-575)||(27574356-27574497)
chr4 (422-575)||(25969521-25969673)
chr4 (415-534)||(13771541-13771661)
chr4 (474-568)||(53787082-53787177)
chr4 (505-575)||(4912035-4912105)
chr4 (408-568)||(9646241-9646401)
chr4 (401-465)||(42245751-42245815)
chr4 (527-571)||(55158365-55158409)
chr4 (447-506)||(22630274-22630332)
chr4 (540-575)||(23639768-23639803)
chr4 (540-575)||(23645426-23645461)
chr4 (409-448)||(34722183-34722222)
chr4 (414-480)||(38869793-38869860)
chr4 (525-571)||(4064989-4065035)
chr4 (526-574)||(9978528-9978576)
chr4 (539-575)||(52494631-52494667)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (401-574)||(44976172-44976346)
chr2 (408-575)||(44946071-44946238)
chr2 (401-575)||(33827591-33827765)
chr2 (408-575)||(11941228-11941395)
chr2 (427-575)||(35171831-35171979)
chr2 (415-575)||(43374348-43374503)
chr2 (401-575)||(15037964-15038138)
chr2 (401-575)||(30466848-30467022)
chr2 (409-571)||(10582014-10582174)
chr2 (401-575)||(17324771-17324944)
chr2 (415-575)||(36242330-36242490)
chr2 (415-568)||(5394036-5394189)
chr2 (415-575)||(1191532-1191692)
chr2 (401-571)||(24196009-24196177)
chr2 (407-534)||(27290599-27290726)
chr2 (409-574)||(41314005-41314169)
chr2 (415-575)||(34516432-34516586)
chr2 (408-575)||(25293178-25293338)
chr2 (415-574)||(45271403-45271562)
chr2 (407-575)||(19054036-19054205)
chr2 (401-550)||(4567480-4567629)
chr2 (424-575)||(8258925-8259076)
chr2 (401-575)||(36390587-36390758)
chr2 (410-575)||(19849847-19850012)
chr2 (401-575)||(41329848-41330021)
chr2 (409-575)||(27269362-27269534)
chr2 (401-568)||(8192377-8192543)
chr2 (415-575)||(13266509-13266668)
chr2 (450-564)||(19174817-19174930)
chr2 (472-571)||(28668949-28669048)
chr2 (401-495)||(18976524-18976617)
chr2 (401-499)||(32845096-32845194)
chr2 (447-568)||(3943791-3943912)
chr2 (474-574)||(714144-714244)
chr2 (443-571)||(2140508-2140633)
chr2 (401-481)||(4852563-4852643)
chr2 (420-568)||(18708501-18708649)
chr2 (415-571)||(5608056-5608212)
chr2 (447-519)||(23787082-23787154)
chr2 (415-465)||(6714409-6714459)
chr2 (402-549)||(3405195-3405343)
chr2 (401-500)||(918790-918891)
chr2 (401-519)||(4618759-4618877)
chr2 (401-488)||(19605950-19606037)
chr2 (408-519)||(40997424-40997535)
chr2 (415-519)||(1845728-1845835)
chr2 (415-488)||(28194238-28194311)
chr2 (507-575)||(9400979-9401047)
chr2 (527-575)||(18976473-18976521)
chr2 (514-574)||(32845194-32845254)
chr2 (415-462)||(44610093-44610140)
chr2 (496-575)||(44610139-44610218)
chr2 (492-574)||(4769262-4769344)
chr2 (521-575)||(18692085-18692139)
chr2 (415-519)||(13747579-13747683)
chr2 (523-568)||(14486952-14486997)
chr2 (415-496)||(29361573-29361653)
chr2 (507-575)||(45132398-45132466)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (415-575)||(161828-161988)
[»] scaffold0623 (1 HSPs)
scaffold0623 (401-575)||(1074-1248)
[»] scaffold0366 (2 HSPs)
scaffold0366 (401-575)||(9317-9491)
scaffold0366 (401-575)||(12019-12192)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (401-575)||(7327-7501)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (401-575)||(40330-40503)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (401-575)||(41662-41836)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (407-575)||(52889-53057)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (401-568)||(97391-97558)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (401-575)||(10712-10885)
[»] scaffold0717 (1 HSPs)
scaffold0717 (398-550)||(1-153)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (435-575)||(39131-39271)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (408-568)||(66774-66926)
[»] scaffold0328 (2 HSPs)
scaffold0328 (401-575)||(14996-15169)
scaffold0328 (455-575)||(13065-13182)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (420-575)||(20246-20400)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (450-575)||(32342-32467)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (401-488)||(8512-8599)
[»] scaffold1175 (1 HSPs)
scaffold1175 (484-567)||(2452-2535)
[»] scaffold0460 (1 HSPs)
scaffold0460 (409-482)||(8290-8363)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (407-463)||(12884-12940)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (408-499)||(27788-27879)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (407-567)||(29169-29328)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 433; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8766106 - 8765544
Alignment:
Q  18 attttagaatttgaatatttagtataatttagtttcacaaaactagctcgagtgatagatgtctcttaagtcttaacacattaccacatgtttaggagtt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8766106 attttagaatttgaatatttagtataatttagtttcacaaaactagctcgagtgatagatgtctcttaagtcttaacacattaccacatgtttaggagtt 8766007  T
Q  118 aggttttcatatctagagggttatccaagtgtaatgatagacctaaaa-gctaaaataaattatcatacgatacggtaagatacgcc-cccacttatcac 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8766006 aggttttcatatctagagggttatccaagtgtaatgacagacctaaaaggctaaaataaattatcatacgatacggtaagatacgcctcccacttatcac 8765907  T
Q  216 attatttatgtcatatcacgtttatagtgaaagagcactaacatttgaaaatcgtcaatctgaaattgtatgtgaacttctgtgtaataatactcctaac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8765906 attatttatgtcatatcacgtttatagtgaaagagcactaacatttgaaaatcgtcaatctgaaattgtatgtgaacttctgtgtaataatactcctaac 8765807  T
Q  316 ataaccattattatgattggatgagnnnnnnnncacaatatcgtatt---tttacagtgtttgacaatattgttgctgtcaattattcggttgacctagt 412  Q
    |||||||||||| ||||||||||||        ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |    
T  8765806 ataaccattattgtgattggatgagaaaaaaaacacaatatcgtatttaatttacagtgtttgacaatattgttgccgtcaattattgggttgagctaat 8765707  T
Q  413 gattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctg 512  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  8765706 gattggcttgagatcttggagtttgctcccccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccatacagagcttgctctg 8765607  T
Q  513 gctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8765606 gctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 8765544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34237847 - 34237673
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34237847 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 34237748  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34237747 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 34237673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 39349265 - 39349439
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  39349265 ggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 39349364  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39349365 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 39349439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3734815 - 3734641
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3734815 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 3734716  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3734715 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 3734641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 4718654 - 4718828
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4718654 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 4718753  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4718754 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 4718828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 28193483 - 28193657
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  28193483 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccataca 28193582  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28193583 gagcttgctctggctttaaacggggcccctacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 28193657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Original strand, 21603245 - 21603413
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| | ||||||| || ||    
T  21603245 cctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagcccatacagagctt 21603344  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21603345 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 21603413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 2618195 - 2618369
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  2618195 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttgggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccataca 2618294  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2618295 gagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 2618369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 20305917 - 20306091
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20305917 ggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtccataca 20306016  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  20306017 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttg 20306091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 21092550 - 21092724
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21092550 ggttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtctcagtttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtccataca 21092649  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  21092650 gagcttgctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgatccttg 21092724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15259591 - 15259424
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  15259591 ctagtggttggtttgggatcttggattttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 15259492  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15259491 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgtaattggtcccctcgaattagtcgattcttg 15259424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 264590 - 264418
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  264590 gttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtctatacat 264491  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  264490 agcttgctctggctttaaac-gggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttg 264418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Original strand, 651331 - 651503
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  651331 gttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtctatacat 651430  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  651431 agcttgctctggctttaaac-gggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttg 651503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Original strand, 837066 - 837238
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  837066 gttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtctatacat 837165  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  837166 agcttgctctggctttaaac-gggcccccacaaatgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttg 837238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 413 - 571
Target Start/End: Original strand, 20469938 - 20470095
Alignment:
Q  413 gattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  20469938 gattggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagagccaatttagatgggctaagtccatacagagcttgctctg 20470037  T
Q  513 gctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  20470038 gctttaaacagagcccccgcaagtgggcggtgggattggt-tcctcggattagtcgatt 20470095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 42328014 - 42328187
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42328014 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagttt-ctcctccagaggtgtcaggtttgattccctctgttgccaatttcggtgggctaagtccataca 42328112  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||  || |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  42328113 gagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtggacgatgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 42328187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 19471618 - 19471793
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||| |||||||||    
T  19471618 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtccataca 19471717  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19471718 gagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttg 19471793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 19542542 - 19542717
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||| |||||||||    
T  19542542 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtccataca 19542641  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19542642 gagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttg 19542717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19590154 - 19589979
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| | || |||| |||||||||    
T  19590154 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaattttggtgagctaagtccataca 19590055  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  19590054 gagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcgaattagtcgatacttg 19589979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 32879295 - 32879462
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||| || |||    
T  32879295 ctagtggttgacttgggatcttcgagtttggtcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttg 32879394  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | |||| | |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32879395 ctctgacattaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 32879462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42643310 - 42643136
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42643310 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataca 42643211  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| ||| || | ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  42643210 gagcttgctctgtcttgaaacgggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgcattagttgattcttg 42643136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 415 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 4698901 - 4698744
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||  | |  ||||||||||    
T  4698901 ttggtttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatgaagaacttgctctggc 4698802  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattc 572  Q
    ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4698801 tttaaacggagcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattc 4698744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 14632977 - 14633137
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  14632977 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggc 14633076  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| | | | ||  || ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14633077 tttgaacggagcgtccacaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttg 14633137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 447 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6953153 - 6953026
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||    
T  6953153 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagttggcggtggg 6953054  T
Q  547 attgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6953053 attggt-ccctcggattagtcgattcttg 6953026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27746527 - 27746353
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27746527 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 27746428  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaat-gagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||  |||| |||| ||| | | ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27746427 gagcttgctctggctttaa-aaggggccccacaagtggggcgatggaattagtcccctcggattagtcgattcttg 27746353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 401 - 550
Target Start/End: Original strand, 18532116 - 18532265
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  18532116 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcagatgtcaatttcggtgggctaagtccataca 18532215  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattg 550  Q
     |  ||||||||| ||||| | ||||||| |||| || |||||| |||||    
T  18532216 gaacttgctctggatttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgagattg 18532265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Original strand, 28088303 - 28088469
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||| |||| || ||||||||| || ||||    
T  28088303 tagtggttgacttgggatcttggagtttgttcatccagaggtctcagattcgattccctttggtgtcaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgc 28088402  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| ||||||   ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28088403 tctgactttaaatggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcagaatagtcgattcttg 28088469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 24018391 - 24018566
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||  || |||||||  ||||||| |||||||||    
T  24018391 ggttgatctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctgaggttcgatttcctctaatgtcaatttcagtgggctaagtccataca 24018490  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggc-ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || | |||| ||| || |||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||    
T  24018491 gagcttgctctggctttaaacgggcctccccacaagtgggcggtgagattggtccccttgaattagtcggttcttg 24018566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 445 - 575
Target Start/End: Original strand, 10292108 - 10292237
Alignment:
Q  445 agaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtg 544  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||||| || || ||||||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||    
T  10292108 agaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctgagtccat-cagagattgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtg 10292206  T
Q  545 ggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  10292207 ggattggtcccttcggattagttgattcttg 10292237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Original strand, 2166722 - 2166875
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||  | ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  2166722 ttggtttgggatcttggagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgattcc--ctcgtgccaatttcagtaggctaagtccatacagagcttgctctggc 2166819  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    |||||  |  | |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2166820 tttaaata-agaccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgatt 2166875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 450 - 571
Target Start/End: Original strand, 25248407 - 25248526
Alignment:
Q  450 tctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggatt 549  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||    
T  25248407 tctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagtc-atacagagtttgctctggctttaaac-gggccctcgcaagtgggcggtgggatt 25248504  T
Q  550 gatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  25248505 ggtcccctcggattagtcgatt 25248526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34610865 - 34610705
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  34610865 ttggcttaggattttggagtttgttcatccagatgtctgaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggtctaagtctatacagagcttgctctggc 34610766  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| |  | ||| ||||| || ||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34610765 tttaaacgagcccctcgcaagtgggcggtagaattggtcccctcgaattagtcgattcttg 34610705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 408 - 574
Target Start/End: Original strand, 28964049 - 28964214
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |   |||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  || |      
T  28964049 ctagtggttggtttgagatcttagagtttgctcctcttaaggtttcatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagctat 28964148  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28964149 gtctggctttaaacggggcccccgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt 28964214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2639501 - 2639429
Alignment:
Q  503 gtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2639501 gtttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 2639429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 447 - 550
Target Start/End: Original strand, 24999289 - 24999392
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || |||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  24999289 aggtcttaggttcgattccctctgatgccaattttgatgggctaagttcatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggg 24999388  T
Q  547 attg 550  Q
    ||||    
T  24999389 attg 24999392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 555
Target Start/End: Original strand, 8042663 - 8042806
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||       || ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  8042663 ggttgacctagtgcttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcaggttcga-------tggtgccaattttggtgggctatgtccataca 8042755  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatccc 555  Q
     ||||||  |||||||| |  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8042756 gagtttg--ctggctttta--atggtccccgcaaatgaacggtgggattggtccc 8042806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 408 - 574
Target Start/End: Original strand, 21667566 - 21667731
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||| | | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  21667566 ctagtggttggcttggaatcttggaggttgctcctccaaagatttcaggttcgatttcctttggtgctaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 21667665  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||| |||||| | | ||  |||||| || ||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  21667666 ctctgcctttaaacggagcatccgcaagtgggcggtggaattggt-ccctcagattagtcgattctt 21667731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26169040 - 26168867
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || ||||||    
T  26169040 ggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggtttgattcctcctgatgccaatttcggtgggc-aagttcataca 26168942  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||| |||||||||||    | ||| ||||| || | | || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26168941 gagcttgttctggctttaaatgagcccctcgcaagtgggggatgagattggtcccctcggagtagtcgattcttg 26168867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 401 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 7558135 - 7557973
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| ||||         
T  7558135 ggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcagattcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagtcc----- 7558041  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
      | ||| ||||||||||| | || ||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  7558040 --gcttgttctggctttaaac-ggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgatt 7557973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 452 - 574
Target Start/End: Original strand, 1219409 - 1219531
Alignment:
Q  452 tcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattga 551  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||  ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||  || || ||||| |||| |     
T  1219409 tcaggttcgattccctctgatatcaatttcagtgggctaagtccatacagaatttgttctggctttaaacggggcccccataagtgggcggtaggatcgg 1219508  T
Q  552 tcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  1219509 tcccttcggattagtcgattctt 1219531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 575
Target Start/End: Original strand, 18128568 - 18128696
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgg 545  Q
    |||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||||| |  |||||| | || |||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  18128568 aggtcttagattcgattctctctggtgccaatttcggtgggcgaa-tccataaagagctttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgg 18128666  T
Q  546 gattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||    
T  18128667 gattggtcctctcagattagtcggttcttg 18128696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 574
Target Start/End: Original strand, 12312874 - 12313027
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggcttta 518  Q
    |||||||||||||||||||||  |   |  ||||| |||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||| | ||||||||    
T  12312874 ttgggatcttggagtttgctcttctcaaaatctcaagttcgatttcctctggtgccaattttgatgggcaagg-ccacacaaagctttgatttggcttta 12312972  T
Q  519 agcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |   |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12312973 aat-gggcccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcggttctt 12313027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 34639391 - 34639284
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-ttt 506  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || |||    
T  34639391 ctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggctcga-tccctctggtgccaatttcggtggg-taagtccatacagagcttt 34639294  T
Q  507 gctctggctt 516  Q
    ||||||||||    
T  34639293 gctctggctt 34639284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 34694761 - 34694681
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggc 488  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  34694761 ctagtggttgacttgtgatcttggagtttgctcctctcaaggtcttaggttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc 34694681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 409 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 9047462 - 9047352
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||| | | ||| |||||| |||  ||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |    
T  9047462 tagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggttttaagtttgattccctctaatgccaattttggtggactaagtccatacaaagcttac 9047363  T
Q  509 tctggctttaa 519  Q
    |||| ||||||    
T  9047362 tctgactttaa 9047352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 482
Target Start/End: Original strand, 3794800 - 3794881
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||| |   |||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  3794800 ggttgacctaatggttggcttaggatcttgaagtttgctcctctcaaggtctcatgttcggttccctctggtgccaatttcg 3794881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 3403680 - 3403521
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac-aaagtttgctctgg 513  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |   |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| | |||    
T  3403680 ttggcctgagatcttggagtttgctcatctcaaggtcttatgttcgattccatctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacaaaactttgttttgg 3403582  T
Q  514 ctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||||   |||||| || || || |||||| | ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  3403581 ctttaaatggggccctcgtaagtgggcggtgaggttggtcccctcgaattagtcaattctt 3403521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 409 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 36848933 - 36848823
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||||||||||| |   |||| | || ||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||    
T  36848933 tagtggttgacttgggtttttggagtttgctcctctcaaggttttagattccatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacggagtttgc 36848834  T
Q  509 tctggctttaa 519  Q
    || ||||||||    
T  36848833 tcgggctttaa 36848823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 568
Target Start/End: Original strand, 28908922 - 28908999
Alignment:
Q  492 gtccatacaaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||| | |||| ||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  28908922 gtccatacagagctttgttctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcgatgtgattgatcccctcagattagtcg 28908999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 59)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 7275286 - 7275460
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7275286 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 7275385  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7275386 gagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 7275460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 2751280 - 2751454
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2751280 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 2751379  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2751380 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 2751454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7176054 - 7175880
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7176054 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 7175955  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7175954 gagcttgctctggctttaaacaggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 7175880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 21835160 - 21835334
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21835160 ggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 21835259  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21835260 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 21835334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 22119897 - 22120071
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22119897 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 22119996  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22119997 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 22120071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40543102 - 40542928
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40543102 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 40543003  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40543002 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 40542928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 409 - 574
Target Start/End: Original strand, 22703503 - 22703668
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  22703503 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 22703602  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22703603 tctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt 22703668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 10091204 - 10091371
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  10091204 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 10091303  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091304 ctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 10091371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21218025 - 21217851
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21218025 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtccataca 21217926  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||| ||||||| | || ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21217925 gagcttgctctagctttaaacgggccccccacaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagttgattcttg 21217851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 11997865 - 11998032
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| || |||    
T  11997865 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacatagcttg 11997964  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11997965 ctctggctttaaactgggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 11998032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 572
Target Start/End: Original strand, 2103064 - 2103234
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  2103064 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 2103163  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattc 572  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2103164 gagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattc 2103234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Original strand, 17212070 - 17212236
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  17212070 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagattgc 17212169  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| || | || |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17212170 tctggcttaaaacgggacccctgcaagtgagtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 17212236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 18044116 - 18044290
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18044116 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcccaggttcgattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagtccataca 18044215  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||| ||| || | ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18044216 gagcttgctctggctttaaacggggcccccacaagtgggtggtggaattggtcccctcagattagtcgattcttg 18044290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 19421240 - 19421414
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19421240 ggttgacttagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcttctggtgtcaatttcgatgggctaagtccataca 19421339  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| ||||||   |||| ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19421340 gagcttgctctgactttaaatggggcgcccacaagtgggcggtgggattggtctcctcggattagtcgattcttg 19421414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17197136 - 17196968
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || ||    
T  17197136 cctagtggttggtttgcgatcttggagtttgctcctccataggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtccatacagagctt 17197037  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17197036 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 17196968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 398 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 42913708 - 42913532
Alignment:
Q  398 ttcggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccat 497  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||| || ||||||    
T  42913708 ttcggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgatttcatatggtgccaatttcgatgggataagtccat 42913609  T
Q  498 acaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||  |  ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42913608 acggaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagttgattctt 42913532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 2344308 - 2344475
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  2344308 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagctctcagattcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagtccataca 2344407  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || ||  | ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2344408 gagctttttttggctttaaacgggacccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcg 2344475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 27009368 - 27009543
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27009368 ggttggcctagtggttggcttcggatcttggagtttgctcatccagaggtctcaggttcgatcccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 27009467  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaa-tgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  27009468 gagcttgctctgactttaaacggggcccctgcaaagtggacggtgggattggtcccctcaaattagtcgattcttg 27009543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 27312161 - 27312335
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||||||    
T  27312161 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtttcaggttcgattccctctagtgccaatttcgatgtgccaagtccataca 27312260  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |  ||||| |||||| | | |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27312261 gagctacctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttg 27312335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 444 - 574
Target Start/End: Original strand, 29861722 - 29861852
Alignment:
Q  444 cagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggt 543  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  29861722 cagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 29861821  T
Q  544 gggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29861822 gggattgatcccctcgaattagtcgattctt 29861852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 434 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 654863 - 654723
Alignment:
Q  434 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgca 533  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  654863 tttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaac-gggcccccgca 654765  T
Q  534 aatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  654764 agtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttg 654723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 28089825 - 28090002
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  28089825 ggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgataccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 28089924  T
Q  501 aagt----ttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||    |||||||||||||||   |||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28089925 aagtgagcttgctctggctttaa-atgggcccccgcaagtgggcgatgagattggtcccctcggattagtcgattcttg 28090002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 432 - 575
Target Start/End: Original strand, 16374034 - 16374177
Alignment:
Q  432 agtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccg 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||| ||||||||| | || ||||||    
T  16374034 agtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagaatttgctatggctttaaacgggacccccg 16374133  T
Q  532 caaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16374134 caaatggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 16374177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 401 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 23012700 - 23012529
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23012700 ggttggcccagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtcttaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataca 23012601  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattc 572  Q
     || |||||||||||||||   |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23012600 gagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcaattc 23012529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39145844 - 39145670
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccat-ac 499  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  39145844 ggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagatgtcttcggttcgattccctgtggtgccaatttcggtgggctaagtcaataac 39145745  T
Q  500 aaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | || ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39145744 agagcttgctctggctttaaac-gggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 39145670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9718179 - 9718005
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| |    
T  9718179 ggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccataga 9718080  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  9718079 gagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagtcggttcttg 9718005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 7800024 - 7799906
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||| |    
T  7800024 ggttgacctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggttaagtccataga 7799925  T
Q  501 aagtttgctctggctttaa 519  Q
     || ||||| |||||||||    
T  7799924 gagcttgctatggctttaa 7799906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 13332615 - 13332492
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13332615 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctcctgaggtctcaggtacgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 13332516  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagg 524  Q
     || || |||||||||||| ||||    
T  13332515 gagcttactctggctttaaacagg 13332492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 31197607 - 31197773
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||| || ||| | |||||||| |||  || ||||||||| |  |||    
T  31197607 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccagatgtctcaggtttgattcattatgt-gtcaatttcggtggattaagtccatacagatcttg 31197705  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31197706 ctcttgctttaaacggggcccccgcaagtggtcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttg 31197773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 467 - 572
Target Start/End: Original strand, 23092171 - 23092276
Alignment:
Q  467 tctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagt 566  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  23092171 tctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagt 23092270  T
Q  567 cgattc 572  Q
    ||||||    
T  23092271 cgattc 23092276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 27704020 - 27704184
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgct 509  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||||| ||||||| | || |||||    
T  27704020 agtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctacagaggtctcaggttcgatttcctttggtgccaatttcggtgggctaagtccatagagagcttgct 27704119  T
Q  510 ctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||||   || ||||||||| || | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27704120 ttggctttaa-atggacccccgcaagtgggtggtgtgattgatcccctcagattagtcgattcttg 27704184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 475 - 575
Target Start/End: Original strand, 3851840 - 3851940
Alignment:
Q  475 caatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3851840 caatttcggtgggctaagtccatatagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 3851939  T
Q  575 g 575  Q
    |    
T  3851940 g 3851940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 419 - 575
Target Start/End: Original strand, 31273941 - 31274096
Alignment:
Q  419 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggcttta 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||  || |||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  31273941 cttgggatcttggagtttgctcctccagagctctcaagttcgattccctctggagctaatttcggcgggctaagtccatacagagcttgctctggcttta 31274040  T
Q  519 agcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | | ||| | |||||| || || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31274041 aac-ggggctccgcaagtgggcagtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttg 31274096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31713087 - 31712920
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| | |||| |||||||        | || |||||||||    
T  31713087 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggattgatttcctctggtgccaata-------gataagtccataca 31712995  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | | || |||||||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31712994 acgcttactctggctttaagcgggaccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 31712920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 401 - 559
Target Start/End: Original strand, 28950877 - 28951038
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagt---ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccat 497  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||   |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||    
T  28950877 ggttggcctagtggttggcttggggtcttggagtagtttgctccttcagaggtctcaggttcgactccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcat 28950976  T
Q  498 acaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcg 559  Q
    | | || ||||||||||||||| | || ||| ||||| |  |||||||||||| ||||||||    
T  28950977 atagagcttgctctggctttaaacgggtccctcgcaagtcggcggtgggattggtcccctcg 28951038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 407 - 489
Target Start/End: Original strand, 22299864 - 22299946
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggct 489  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22299864 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggct 22299946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 519
Target Start/End: Original strand, 42814881 - 42814991
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  42814881 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcttgaagtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgc 42814980  T
Q  509 tctggctttaa 519  Q
    |||| ||||||    
T  42814981 tctgactttaa 42814991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 447 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41907659 - 41907532
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||| || | ||||||    
T  41907659 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagaggttgctctggctttaaacgtggcccccgcaagtgggtggtggg 41907560  T
Q  547 attgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  41907559 attggtcccc-cagattagtcgattcttg 41907532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 575
Target Start/End: Original strand, 9683834 - 9684009
Alignment:
Q  400 cggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9683834 cggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatac 9683933  T
Q  500 aaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
      || || |||||||||||| | ||| |||| ||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  9683934 cgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttg 9684009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 567
Target Start/End: Original strand, 28646978 - 28647144
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||    
T  28646978 ggttggcctagtgattgacttgggatcttggagtgtgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagtcaataca 28647076  T
Q  501 aag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtc 567  Q
     || |||||||||||||  | | |||||||| ||| || |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  28647077 gagttttgctctggcttataacggggcccccacaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtc 28647144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 22638308 - 22638471
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| || || || |    | |||    
T  22638308 ctagtggttgacttgagatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggttaagttcaga----gcttg 22638403  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22638404 ctctggctttaaacggggcctccgcaagtgggcggtgggattgatctcctcgaattagtcgattcttg 22638471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 424 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 36772471 - 36772322
Alignment:
Q  424 gatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcag 523  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |  ||  ||||||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||||||||| | |    
T  36772471 gatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggtttgatttcccct-atgccaatttcggtgggctaagttcatacagagcttgctctggctttaaacgg 36772373  T
Q  524 ggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||||||  | || ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||    
T  36772372 ggcccccgggagtgggcggtggaattagtcctctcggattagtcgattctt 36772322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 43785491 - 43785321
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||  ||| ||||||  ||| ||| |||||||||    
T  43785491 ggttgacctaatggttggcttgggatctttgagattgctcctccaaaggtctcaagttcgattcccacttgtgctaatttcagtggactaagtccataca 43785392  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
     || || |||||| ||||| | ||||| |||||| ||  ||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  43785391 gagcttactctggttttaaacggggcctccgcaagtggacggtgagattggtccccttggattagtcgatt 43785321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Original strand, 32849606 - 32849774
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||  |  |||||| | ||||||| ||||| ||  || ||    
T  32849606 cctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcgggtttgattccctctagtctcaattttggtgggctaagtccacactgagctt 32849705  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||||   || | |||  || || || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32849706 gctctggctttaaatgggactcccataagtgggcagtgggattggtcccctcagattagtcgattcttg 32849774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 464
Target Start/End: Original strand, 23854405 - 23854468
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 464  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23854405 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattc 23854468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 22643515 - 22643361
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||| | |||||||| | |||| || |||||||| | ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  22643515 ttgggatcttgaagtttactccactagaggtcttatgttcgatttcctctgatgtcaatttcggtaggctaagtccatacagagcttgctctgactttaa 22643416  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     | | |||| ||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  22643415 acggagccctcgcaagtggccggtgtgattagtcccctcggattaatcgattctt 22643361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 420 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 14199839 - 14199730
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||| ||| | || |||||||| ||||||    
T  14199839 ttggaatcttggagtttcctcctccagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaattttggtgggctaagtctatatagagcttgctctgcctttaa 14199740  T
Q  520 gcagggcccc 529  Q
     | |||||||    
T  14199739 acggggcccc 14199730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 472 - 570
Target Start/End: Original strand, 21373790 - 21373888
Alignment:
Q  472 tgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgat 570  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  21373790 tgccaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgagattggtcctcacggattagtcgat 21373888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 487
Target Start/End: Original strand, 25333436 - 25333514
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatggg 487  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| ||||    
T  25333436 tagtggttggcttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcaggttcgataccctctggcaccaatttcgttggg 25333514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25102895 - 25102827
Alignment:
Q  506 tgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  25102895 tgctctggctttaaacagggcccccgcaagtga-cggtgggattggttccttcggattagtcgattcttg 25102827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 489
Target Start/End: Original strand, 40332115 - 40332196
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggct 489  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||    
T  40332115 ctagtggttggcttgaaatcttggagtttgctcctctaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgtcaatttcgatgggct 40332196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 508 - 575
Target Start/End: Original strand, 25333519 - 25333586
Alignment:
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25333519 ctctgactttaaacaggccccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 25333586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 407 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 23330925 - 23330765
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tt 505  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |   ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||    
T  23330925 cctagtggttggcttgggattttagagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgactccctccggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagctt 23330827  T
Q  506 tgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtc 567  Q
    ||||||||||| || | || || |||||| || |||||  ||||| |||||||  |||||||    
T  23330826 tgctctggcttaaaacgggacctccgcaagtgggcggtaagattggtcccctcaaattagtc 23330765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 458
Target Start/End: Original strand, 28003845 - 28003902
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggtt 458  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  28003845 ggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtcttaggtt 28003902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 465
Target Start/End: Original strand, 21370606 - 21370670
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattcc 465  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  21370606 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttactccttcagatgtctcaggttcgattcc 21370670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 487
Target Start/End: Original strand, 22696329 - 22696415
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatggg 487  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  22696329 ggttggcctagtggttgatttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtggg 22696415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12211727 - 12211642
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgg 486  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |   || ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||    
T  12211727 ggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtgtgctcctctcaagatctcaggtttgatttcctctggtgccaatttcgatgg 12211642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 21574295 - 21574127
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattcct-tctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |   ||||| |||||||||||||  | || |||||| |||| ||||| || |||||||    
T  21574295 ggttggcctagtggttggtttgggattttggagtgtgctcctctcaaggtcacaggttcgattcccctttggtgccaacttcggtgggcaag-tccatac 21574197  T
Q  500 aaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    | || ||||| | |||||  | | |||||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21574196 agagctttgcccaggcttagaacggggcccccacaagtaggcggtgagattggtcccctcggattagtcg 21574127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 24686169 - 24686133
Alignment:
Q  405 gacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcc 441  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24686169 gacctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcc 24686133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5274 - 5100
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5274 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 5175  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5174 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15360290 - 15360116
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15360290 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 15360191  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15360190 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 15360116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 11448876 - 11449050
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11448876 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 11448975  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11448976 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 11449050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 34147351 - 34147525
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34147351 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 34147450  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34147451 gagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 34147525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 34159967 - 34160141
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34159967 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccagaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 34160066  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34160067 gagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 34160141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 9238980 - 9239154
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||||||| |    
T  9238980 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatata 9239079  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||| |||||||||   |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9239080 gagcttgctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 9239154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Original strand, 11007170 - 11007343
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||| |||||||||    
T  11007170 ggttgatctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcactctgctctcaatttcggtgggctaagtccataca 11007269  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11007270 aagcttgctctagctttaagcggggcccccgcaagtgggcggtgggattggccccctcggattagtcgattctt 11007343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 419 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 654320 - 654168
Alignment:
Q  419 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggcttta 518  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  654320 cttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggcttta 654221  T
Q  519 agcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    | | |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  654220 aacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 654168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 1344942 - 1345114
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  1344942 ggttgacctagtggttgg--tgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccataca 1345039  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1345040 aagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttg 1345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3222826 - 3222654
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3222826 ggttggcctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctc-agaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 3222728  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| |||||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3222727 gagcttgctctgtctttaaac-ggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 3222654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 436 - 571
Target Start/End: Original strand, 12390465 - 12390600
Alignment:
Q  436 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaa 535  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12390465 tgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaag 12390564  T
Q  536 tgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12390565 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 12390600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21982512 - 21982339
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  21982512 ggttggcctagtggttggcttgggatcttgaagtttgctcctccagaggtctgaggttcgattcccgatggtgccaatttcagtgggctaagtccataca 21982413  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21982412 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttg 21982339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21148701 - 21148529
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  21148701 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctttttcagaggtctcaagttcgattccctctagtgccaatttcgatgggctaagtccatacag 21148602  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || |||||||| |||||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21148601 agcttgctctgactttaaac-ggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 21148529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 402 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 5360262 - 5360090
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  5360262 gttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgcttctcaagaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagtccatacag 5360163  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    || |||||||| |||||| | |  ||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5360162 agcttgctctgactttaaacggaacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt 5360090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9690830 - 9690656
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||  || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  9690830 ggttgacctagtggttggtttgagattttggagtttgctcttccagaggtcttaggttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 9690731  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9690730 gagcttgctctggctttaaacggggccctcacaagtggacggtgggattggtcctctcggattagtcgattcttg 9690656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 28672072 - 28672246
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| || |||||| | ||||||| |||||||||    
T  28672072 ggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctctagaggtcttaggttcgattccctctggtgtcaattttggtgggctaagtccataca 28672171  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||| | ||||||||| | || ||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28672172 gagcttgttttggctttaaacgggcccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 28672246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 9843950 - 9844117
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | | |||| || |||||| | |||| || ||||||||| || |||    
T  9843950 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgacttcctctggtgtcaattttggtgggttaagtccatacagagcttg 9844049  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     ||||||||||| | |||||||| ||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9844050 ttctggctttaaacggggccccctcaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttg 9844117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 17081239 - 17081088
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  17081239 ctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagatgtctcaagtttgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 17081140  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcg 559  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  17081139 ctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 17081088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 519
Target Start/End: Original strand, 12591642 - 12591760
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  12591642 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctcgtgccaatttcagtgggctaagtccataca 12591741  T
Q  501 aagtttgctctggctttaa 519  Q
     || |||||||||||||||    
T  12591742 gagcttgctctggctttaa 12591760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 403 - 575
Target Start/End: Original strand, 14212899 - 14213061
Alignment:
Q  403 ttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaa 502  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  14212899 ttgacctaatggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagtccatataga 14212998  T
Q  503 gtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
              ||||||| | ||| |||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14212999 ----------gctttaaacgggggccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttg 14213061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 9208264 - 9208431
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-ttt 506  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||    
T  9208264 ctagtggttggattgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattccccctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagcctt 9208362  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||| || |||||||||||| || |||| || |||||||||||||    
T  9208363 gctttggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcagaatagtcgattcttg 9208431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Original strand, 11840915 - 11841075
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgct 509  Q
    |||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||    
T  11840915 agtggttggcttgggatattagaatttgctcctccagaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacaaagcttgct 11841014  T
Q  510 ctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
     ||| ||||| | ||| ||||  || ||  ||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  11841015 ttggttttaaac-ggggccccataagtggacggtgggattagtcccctcgaattagtcgatt 11841075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 567
Target Start/End: Original strand, 33499479 - 33499646
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttc-gattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  33499479 ggttggcctggtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcagattccctctggtgtcaatttcggtgggcta-gtccatac 33499577  T
Q  500 aaa-gtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtc 567  Q
    |||  |||||| |||||||||   || || || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33499578 aaatctttgctttggctttaaatgggccctccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 33499646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 500
Target Start/End: Original strand, 13753245 - 13753344
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  13753245 ggttggcctagtggttggctttggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattctctctggtgccaatttcggtgggctaaatccataca 13753344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 479
Target Start/End: Original strand, 22576072 - 22576150
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatt 479  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  22576072 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatt 22576150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 17149634 - 17149481
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagt-ttgctctgg 513  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| || |||||||| ||  ||||| |||    
T  17149634 ttggtttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggttggcaag-tccatacagagccttgctttgg 17149536  T
Q  514 ctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17149535 ctttaaatggggcccccgcaagtgaacggtgggattggtcccctcgaattagtcg 17149481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17706481 - 17706418
Alignment:
Q  419 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  17706481 cttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaagttcgattccttctggtgtcaatttcg 17706418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 401 - 515
Target Start/End: Original strand, 31039025 - 31039139
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |||||| |||  |  |||||||||||||||| |||||||||    
T  31039025 ggttgacccagtagttggctttgaatcttggagtttgctccaccaaagatctcaagtttgattccctctagtatcaatttcgatgggctaagtccataca 31039124  T
Q  501 aagtttgctctggct 515  Q
     |||||||| |||||    
T  31039125 gagtttgctatggct 31039139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 28968220 - 28968078
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  |||   | |||||||| |||| || ||||||||| |  || ||||| |    
T  28968220 ttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcagattcgattctctctagcgtcaatttcggtgggttaagtccatacagaacttactctgcc 28968121  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccct 557  Q
    ||||| | | ||||  | ||||  |||||||||||| ||||||    
T  28968120 tttaaacggtgcccatgtaaataggcggtgggattggtcccct 28968078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 540 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33718522 - 33718487
Alignment:
Q  540 cggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33718522 cggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 33718487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 475 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14504200 - 14504100
Alignment:
Q  475 caatttcgatgggctaggtccatacaaagttt-gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattct 573  Q
    ||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||| |||||   ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  14504200 caatttcgatggg-taagtccatacagtgttttgctctggttttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatcctctcgaattagtcgatcct 14504102  T
Q  574 tg 575  Q
    ||    
T  14504101 tg 14504100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 33718643 - 33718571
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaattt 480  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||    
T  33718643 ctagtggttggtttgggatcttggagtttacttctccagagatctcaggttcgattctctctggtgcaaattt 33718571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 568
Target Start/End: Original strand, 10377766 - 10377888
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtg 544  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| ||||| | ||||||||| || ||||||||| ||| || | ||| ||||| ||| || ||||||    
T  10377766 aggtctcaggttcaattccctatggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacatagctttgctctgacttaaaacggggccccccacaagtgggcggtg 10377864  T
Q  545 ggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    | |||| |||||||||| ||||||    
T  10377865 gcattggtcccctcggagtagtcg 10377888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 495 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 15730593 - 15730514
Alignment:
Q  495 catacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| |  ||||||| ||  || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15730593 catacagagcttgttctggctttaaacgtggcccccacacgtgggcggtgggattggtcacctcggattagtcgattctt 15730514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 564
Target Start/End: Original strand, 22721790 - 22721865
Alignment:
Q  490 aggtccatacaaagttt-gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggatta 564  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  22721790 aggttcatacaaagttttgttctggctttaaacagagcccctgcaagtgagcggtgggattggtccactcgaatta 22721865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 570
Target Start/End: Original strand, 12591770 - 12591799
Alignment:
Q  541 ggtgggattgatcccctcggattagtcgat 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12591770 ggtgggattgatcccctcggattagtcgat 12591799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 527 - 568
Target Start/End: Original strand, 17225797 - 17225838
Alignment:
Q  527 ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17225797 ccccgcaaatgggcggtgggattgatctcctcagattagtcg 17225838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 35492916 - 35493090
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35492916 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 35493015  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35493016 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 35493090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45529946 - 45529772
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  45529946 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcgatgggctaagtccataca 45529847  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45529846 gagcttgctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 45529772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 53424368 - 53424195
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  53424368 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 53424269  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53424268 gagtttgctatggctttaaac-gggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 53424195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8456342 - 8456168
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8456342 ggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 8456243  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8456242 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 8456168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 25379766 - 25379940
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||    
T  25379766 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggagggctaagtccataca 25379865  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25379866 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagcgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 25379940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Original strand, 26174119 - 26174292
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| || |||||||||     
T  26174119 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacag 26174218  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26174219 agcttgctctggctttaaatagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 26174292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 46576353 - 46576527
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  46576353 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccataca 46576452  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  46576453 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtcggattggtccccttggattagtcgattcttg 46576527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 49258448 - 49258280
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  49258448 cctagtggttggcttgggatcttgcagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 49258349  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49258348 gctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 49258280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 53234095 - 53233928
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  53234095 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaagtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 53233996  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53233995 ctctggctctaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 53233928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15566691 - 15566518
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15566691 ggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccataca 15566592  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15566591 gagcttgctctggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttg 15566518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 30257629 - 30257803
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30257629 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggactaagtccataca 30257728  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30257729 gagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtggcattggtcccctcggattagtcgattcttg 30257803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40133641 - 40133467
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  40133641 ggttggcctagtggttggcttgggattttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccataca 40133542  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  40133541 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 40133467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25289899 - 25289733
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||    
T  25289899 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttg 25289800  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  25289799 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttg 25289733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30807345 - 30807171
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30807345 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 30807246  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30807245 gagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcggtaggattggt-ccctcggattagtcgattcttg 30807171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 48977393 - 48977560
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  48977393 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggttaagtccataca 48977492  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48977493 gagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 48977560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34492767 - 34492593
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34492767 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctgctgccaatttcgttgggctaagtccataca 34492668  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||    
T  34492667 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtccattcagattagttgattcttg 34492593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 52455841 - 52455667
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||    
T  52455841 ggttggcctagtggttggctagggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagtctacaca 52455742  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| |||||| | |||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52455741 gagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgactggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 52455667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 52821826 - 52821654
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||| |||||||||     
T  52821826 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgagctaagtccatacag 52821727  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || ||||||||||||||| | ||| ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52821726 agcttgctctggctttaaac-ggggccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 52821654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10190920 - 10190760
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  10190920 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 10190821  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10190820 tttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 10190760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18177079 - 18176905
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  18177079 ggttggcctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcttccagaggtatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccataca 18176980  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18176979 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcgattcttg 18176905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 21362948 - 21363122
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| | ||||| |||||||||    
T  21362948 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtaggctaagtccataca 21363047  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  21363048 gagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcggattaatcgattcttg 21363122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29915461 - 29915288
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  29915461 ggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagtacataca 29915362  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29915361 gagcttgccctggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29915288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29964614 - 29964441
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  29964614 ggttgacctaatggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcttctggtgccattttcggtgggctaagtacataca 29964515  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||| |||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29964514 gagcttgccctggctttaaac-gggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccatcgaattagtcgattcttg 29964441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45272608 - 45272434
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  45272608 ggttggcctagtcgttggcttgggatcttggagtttgctcctccagatgtctcagtttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacg 45272509  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  45272508 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttgactcttg 45272434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10083997 - 10083837
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  10083997 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagggctcaggtttgattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 10083898  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10083897 tttaaacggggcccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 10083837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 407 - 549
Target Start/End: Original strand, 26108303 - 26108445
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  26108303 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 26108402  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggatt 549  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||    
T  26108403 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggctgtgggatt 26108445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 418 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39042027 - 39041870
Alignment:
Q  418 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggcttt 517  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  39042027 gcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatgcagagcttgctctggcttt 39041928  T
Q  518 aagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || | |||||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39041927 aaacggggcccccgcaagtgggtggtgggattggtccactcggattagtcgattcttg 39041870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 40940837 - 40941004
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||    
T  40940837 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttg 40940936  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| |||||| | |||||||| ||| || | ||| |||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  40940937 ctctgactttaaacggggcccccacaagtgggtggtaggattggtcccctcgaattactcaattcttg 40941004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 436 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8097436 - 8097297
Alignment:
Q  436 tgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaa 535  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| | ||||||||||||     
T  8097436 tgctcctccagaggcctcaggttcgattccctcttgtgctaatttcgatgggctaagtccatacagagcatgctctggctttaaacggggcccccgcaag 8097337  T
Q  536 tgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8097336 tgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 8097297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31538030 - 31537856
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||    
T  31538030 ggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgtttgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtctataca 31537931  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || || |||||||||||| | | ||||| |||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  31537930 gagcttactctggctttaaacggagcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcaattcttg 31537856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 32151429 - 32151603
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| |  ||||||    
T  32151429 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtttcaaattcgattctctctagtgccaatttcggtgggctaagctcataca 32151528  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32151529 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttg 32151603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 407 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 7470401 - 7470244
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| || |||||| || ||    
T  7470401 cctagtggttgacttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctaatgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctt 7470302  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattag 565  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||| || || ||||||||| ||||||| ||||||    
T  7470301 gctctggctttaaac-ggggccctgcaagtgggcagtgggattggtcccctcagattag 7470244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7485709 - 7485549
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||    || |||     
T  7485709 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagttcat----agcttga 7485614  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7485613 tctggctttaaaca-ggcccctgcaagtggccggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttg 7485549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 25344249 - 25344077
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| | || || ||||||   ||| ||| |||||||||    
T  25344249 ggttggcctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggtttgattccctttggtgtcaatttttgtggtctaagtccataca 25344150  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  25344149 gagtttgctctggctttaaacggggcccccgctagtgggcgatgggattggt-tcctcggattagtcgattctt 25344077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 53288895 - 53288735
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgct 509  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||    
T  53288895 agtggttggtttgggatattagagtttgctcctccaaaggtctcaggctcgattccctctggtgccaatttcggtggactaagtccatacaaagcttgct 53288796  T
Q  510 ctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
     ||||||||| | ||| ||||||||| |  ||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  53288795 ttggctttaaac-ggggccccgcaaacggacggtgagattagtcccctcgaattagtcgatt 53288735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 413 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8958216 - 8958053
Alignment:
Q  413 gattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctg 512  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||| | |||| || |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||     
T  8958216 gattgacttgggatcttggagtctgctccttcaaaggtcttatgttcgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatacaaagcttgctcta 8958117  T
Q  513 gcttt-aagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| ||   |||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  8958116 gctttaaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattaatcgattcttg 8958053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 420 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33398641 - 33398486
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    ||||||||||| |||||||||  | | || ||||| |||||||||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||| || ||||||| |||||||    
T  33398641 ttgggatcttgtagtttgctcttctaaagatctcaagttcgattccctctagtgccaattttggtgggttatgtccatacagagcttgctctagctttaa 33398542  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     | |||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  33398541 acggggcccccgcaagtgggcggtgggattggttccctcgaattagtcgattcttg 33398486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 425 - 575
Target Start/End: Original strand, 1692863 - 1693012
Alignment:
Q  425 atcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagg 524  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||| ||| ||| ||| ||||| |  ||||||||||||||  || |    
T  1692863 atcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccatttagtgtcaatttcggtggactaagtctatacagaacttgctctggctttagaca-g 1692961  T
Q  525 gcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||    
T  1692962 gcccccgcaagtgggcggtgggatttgccccctcagattagtcgattcttg 1693012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 4462638 - 4462811
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  || | |||||| |||||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||    
T  4462638 ggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctacttcaaaagtctcatgttcgattccctctggcaccaatttcgatgggctaagttcataca 4462737  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || || |||| ||||||| | ||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  4462738 gagcttactctagctttaaac-ggggccccgcaagtggacggtgggattgatccactcggattagtttattcttg 4462811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 503
Target Start/End: Original strand, 55287816 - 55287910
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag 503  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55287816 tagtggttggcttggaatcttagagtttgctccttcagaggtttcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaggtccatacaaag 55287910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 51532794 - 51532968
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||||||| |  |||| ||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  51532794 ggttgacctattagttggtttgagattttggagtttgcttctccaaaggtctcatgttcgattctctctaatgccaatttcggtgggctaagtccataca 51532893  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||  ||||||   || ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  51532894 gagcttgctctaactttaaatgggacccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttg 51532968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 447 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2511443 - 2511315
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || |||||| || | |||||| |||||| | || || |||||| || ||||||||    
T  2511443 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacagagctcgctctgactttaaacgggacctccgcaagtgggcggtggg 2511344  T
Q  547 attgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  2511343 attggtctcctcgaattagtagattcttg 2511315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14343466 - 14343307
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||| |    
T  14343466 ttggtttgagatcttggagtttgctcctccagatgtctcagattcgatttcatctgacgccaatttcaatgggctaagtccatacagaacttgctctgcc 14343367  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||   ||| ||| |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14343366 tttaaac-ggtatcccacaagtgagcggtagaattgatccccttagattagtcgattcttg 14343307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Original strand, 24407309 - 24407440
Alignment:
Q  444 cagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggt 543  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||| ||| ||||||| |||| || ||  ||||| | ||||||||| |||||| | |||||  ||||| || |||||    
T  24407309 cagaggtctcagattcgattctctctggtgctaatttcggtgggttaagtatatacagaatttgctctgactttaaacggggccatcgcaagtgggcggt 24407408  T
Q  544 gggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24407409 gggattggtcccctcggattagtcgattcttg 24407440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 11390607 - 11390781
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| || | ||||||| |||| | |||| || |||||| | ||||||| |||||||||    
T  11390607 ggttggcctagtggttggtttgagatcttggagttttctcctccaaagatttcaggtttgatttcctctggtgtcaattttggtgggctaagtccataca 11390706  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| ||||||   || || ||||||||||   ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11390707 gagcttgctctgtctttaaatgggtcctccgcaaatgattcgtgagattattcccctcggattagtcgattcttg 11390781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24165815 - 24165733
Alignment:
Q  492 gtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24165815 gtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccc-gcaagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcgattcttg 24165733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 568
Target Start/End: Original strand, 49167070 - 49167231
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag---ttt 506  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||| ||||||||| ||   |||    
T  49167070 agtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaagatatcaggttcgattctctctggtgtcaatttcggtggactaagtccatacatagcgtttt 49167169  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||| || | |||||| ||| | |||| | ||||||||    
T  49167170 gctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggtggtggggttggttcccttgaattagtcg 49167231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 19857057 - 19857230
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||| ||||||| || ||   |    
T  19857057 ggttggcctggtggttggcttgg-atcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctttggtgtcaatttcggtgggctaagttcagtta 19857155  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||  ||||||   ||| | |||||| || ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||    
T  19857156 gagcttgctctaactttaaatggggtctccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcgcaatagtcgattcttg 19857230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 401 - 502
Target Start/End: Original strand, 50582997 - 50583097
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  50582997 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctcttaaggtttcaggttcgatttcctctgttgccaatttcgttggg-taagtccataca 50583095  T
Q  501 aa 502  Q
    ||    
T  50583096 aa 50583097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 490 - 575
Target Start/End: Original strand, 54475775 - 54475860
Alignment:
Q  490 aggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54475775 aggtccatacagagcttgctttggctttaaacggggccaccgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttg 54475860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Original strand, 26158837 - 26158983
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||||||||  ||||| | || ||||||||||| |||| || |||||||||      ||||||||    
T  26158837 ttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttcattccctttggtgccaatttcggtggg-taagtccataca------gctctggc 26158929  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||  | | | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26158930 ttagaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcg 26158983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 419 - 517
Target Start/End: Original strand, 38732989 - 38733087
Alignment:
Q  419 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggcttt 517  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||||  || |||||| || |||||||| ||||    
T  38732989 cttggaatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggtccgattctctctgttgtcaatttcggtgggctgagttcatacagaggttgctctgacttt 38733087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 505 - 575
Target Start/End: Original strand, 48104986 - 48105056
Alignment:
Q  505 ttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48104986 ttgctctggctttaaacagggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccttcggattagtcgattcttg 48105056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 33698806 - 33698726
Alignment:
Q  493 tccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattct 573  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  33698806 tccatatagagtttgctctggctttaaacggggctcccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcaaattagtcgattct 33698726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 420 - 482
Target Start/End: Original strand, 9853640 - 9853702
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  9853640 ttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattcccaccggtgccaatttcg 9853702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 450 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 48972854 - 48972785
Alignment:
Q  450 tctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || || |||| | ||||||||||| ||||||    
T  48972854 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgatgggttaagttcatatagagtttgctctgactttaa 48972785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 526 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 53848501 - 53848452
Alignment:
Q  526 cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53848501 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 53848452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 507 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55371380 - 55371312
Alignment:
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  55371380 gctctggcttaaaacggggccctcgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttg 55371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4252588 - 4252414
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |   |||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||  ||  | | |||||||||    
T  4252588 ggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaagtttgattccctctggtgccaatttcagtgatc-aagtccataca 4252490  T
Q  501 aag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| ||| |||||| ||  | | |  ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  4252489 aagctttactctggtttagaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcgatccttg 4252414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 498
Target Start/End: Original strand, 25017542 - 25017617
Alignment:
Q  423 ggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccata 498  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||  || |||||||| ||||||| |||||||    
T  25017542 ggatcttggagtttgctcctccaaagatcttaggttcgattccatctagtgtcaatttcggtgggctaagtccata 25017617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 521 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 32414648 - 32414595
Alignment:
Q  521 cagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  32414648 cagggctcccgcaaatgagcggtgagattgatccccttaaattagtcgattctt 32414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 562
Target Start/End: Original strand, 1242036 - 1242139
Alignment:
Q  459 cgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccct 557  Q
    ||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| | |||  ||||||| || ||||||| |||| ||||||    
T  1242036 cgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagctttgctctggctttaaac-ggggtcccgcaagtgggcggtggaattggtcccct 1242134  T
Q  558 cggat 562  Q
     ||||    
T  1242135 tggat 1242139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 464
Target Start/End: Original strand, 36660775 - 36660838
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattc 464  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||    
T  36660775 ggttgacctagtggttggtttaggatcttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcaattc 36660838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 502 - 568
Target Start/End: Original strand, 6127559 - 6127625
Alignment:
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  6127559 agtttgctctggttttaaacaggctccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcaaattagtcg 6127625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 482
Target Start/End: Original strand, 9842933 - 9843006
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||  ||| || ||||||||    
T  9842933 ctagtggttggtttgggatcttggagttttctcctccagaggtctc-gattcgattcccactggtgtcaatttcg 9843006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Original strand, 34844397 - 34844549
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctgg 513  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||| ||    |||||||||| ||| ||| || |||||| || |||||| |||    
T  34844397 ttggcttgagaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctccagagccaatttcggtggacta-gtacatacagagctttgctatgg 34844495  T
Q  514 ctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||   |||||||||||| ||   ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34844496 ctttaa-atgggcccccgcaagtggatggtgggattggacccctcggattagtcg 34844549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 484 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 17579245 - 17579157
Alignment:
Q  484 tgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggccc-ccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||| | || ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17579245 tgggctaagtccatacagagcttgctttagctttaaacgggaccctccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcgatt 17579157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27498923 - 27498749
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27498923 ggttgacctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 27498824  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27498823 tagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 27498749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15641291 - 15641123
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  15641291 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 15641192  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15641191 gctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 15641123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 32059632 - 32059465
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32059632 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 32059533  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32059532 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 32059465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8484853 - 8484679
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  8484853 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcataca 8484754  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8484753 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 8484679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 38684213 - 38684386
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38684213 ggttggcccagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 38684312  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38684313 gagcttgctctggctttaaac-gggcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 38684386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11926694 - 11926519
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11926694 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttagattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 11926595  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11926594 gagcttgctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 11926519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 18207226 - 18207386
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||    
T  18207226 ttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgttctggc 18207325  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| |  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18207326 tttaaacgaggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 18207386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19456387 - 19456229
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  19456387 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcga-tccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 19456289  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19456288 tttaaac-ggggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 19456229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 4603782 - 4603949
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4603782 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcaagttcgattccttctggtgccaatttcgatgggctaagtccataca 4603881  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || | ||||||||||||| | ||||||| |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4603882 gagctcgctctggctttaaacggggcccctgcaagtggacggtgggattggtcccctcggattagtcg 4603949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33709693 - 33709521
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33709693 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 33709594  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     ||   ||||||||||||| | || ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33709593 gag--agctctggctttaaacgggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 33709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6014472 - 6014298
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  6014472 ggttggcctagtgattggcttgggatcttggagtttgcttctccagagatctcaggttcgattacttctggtgccaatttcggtgggttaagtccataca 6014373  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| || ||||| || |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  6014372 gagcttgctctggctttaaacggggtccacgcaagtgggcggtgagattagtcccctcgaattagtcgattcttg 6014298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7085810 - 7085644
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  7085810 tagtggttggcttgggatcttggagttttctcctccagaggtctccggttcgattccctctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 7085711  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| |||||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7085710 tctgactttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 7085644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13038646 - 13038473
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  13038646 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagttcataca 13038547  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     ||   | | ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13038546 gagcaag-tatggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttg 13038473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13108641 - 13108468
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  13108641 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctggtgccaattttgatgggctaagttcataca 13108542  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     ||   | |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13108541 gagcaag-tctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcgaattagtcgattcttg 13108468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 30485847 - 30486007
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  30485847 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattcactctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 30485946  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| |   |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  30485947 tttaaacgatgcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttg 30486007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 409 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 15971306 - 15971151
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  15971306 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccatacatagcttgc 15971207  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggatta 564  Q
    |||| |||||| | || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  15971206 tctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgagattgatcccctcggatta 15971151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23270714 - 23270540
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||| | || | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23270714 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcatccaaaggtctcaagttcgatttcctccgatgccaatttcggtgggctaagtccataca 23270615  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||| ||||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23270614 gagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaaatggacggtgggattggtcccctcggattagttgattcttg 23270540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31288138 - 31287964
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  31288138 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcgattccctttggtgccaatttcggtgggttaagtccataca 31288039  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| ||||| || |||||| | |||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  31288038 aagcttgctttgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtctcctcgaattagtcggttcttg 31287964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Original strand, 42193491 - 42193662
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||     
T  42193491 gttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgcttccccagaggtctcaggttcgatttcctctgatgccaatttcggtgggctaagtctatacag 42193590  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| |||||||||  | || |||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42193591 agtttgctttggctttaa--atggaccccgcaagtgggcggtggggttggtcctctcggattagtcgattcttg 42193662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 34310147 - 34310321
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  34310147 ggttggcctagtggtcggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccataca 34310246  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || |||||  || ||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  34310247 gagcttgctctggctttaaacgggacccccataagtggacggtgggattggtcccctcgaattaatcgattcttg 34310321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 401 - 530
Target Start/End: Original strand, 25586937 - 25587066
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25586937 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 25587036  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggccccc 530  Q
     || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  25587037 gagcttgctctggctttaaacaggaccccc 25587066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 405 - 575
Target Start/End: Original strand, 37495056 - 37495233
Alignment:
Q  405 gacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagt 504  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||     
T  37495056 gacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccatacagagc 37495155  T
Q  505 ttgctctggctttaagcagggcc-------cccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||| |    ||       ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37495156 ttgctctggctttaaacgcccccccccccgcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 37495233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 419 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10869739 - 10869583
Alignment:
Q  419 cttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggcttta 518  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||    
T  10869739 cttgcgatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccatctggttccaatttcggtgggctaagtccacactgagcttgctctggcttta 10869640  T
Q  519 agcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |   ||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10869639 aatggggcctccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttg 10869583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11465099 - 11464926
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||| | ||||||| || ||||||    
T  11465099 ggttggcctagtgattggcttgaaatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgatttcctctggtgccaattttggtgggctaagttcataca 11465000  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || || |||||||||||| | ||| |||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11464999 gagcttactctggctttaaac-ggggccccgcaagtgggtggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 11464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12398626 - 12398466
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || || |||||||| ||| ||| || |||||| || ||||||||||    
T  12398626 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgtcaatttcggtggcctaagttcatacagagcttgctctggc 12398527  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||   |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  12398526 tttaaatggggcccccgcaaatggacggtgagattgatcctctcaaattagtcggttcttg 12398466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 38631153 - 38631054
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38631153 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcagattcgattccctctggtgccaatttcgatgggctaagtccataca 38631054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 401 - 571
Target Start/End: Original strand, 22392706 - 22392863
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||| |||          
T  22392706 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctc---tgccaatttcggtgggctaagtc------ 22392796  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
        ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  22392797 ----ttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtggaattggtcccctcagattagtcgatt 22392863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27487747 - 27487572
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || | || ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  27487747 ggttggcctagtggttgatttgggattttggagtttgctcttccagaggtctcaggtttgatcccatttggtgccaatttcggtggactaagtccataca 27487648  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagc-agggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||| ||||||| |  ||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27487647 gagcttgctctagctttaaacgggggcccttgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 27487572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 36954823 - 36954997
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||  | |||| |||||||||    
T  36954823 ggttggcctagtggttgccttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggttctaatttcggcgtgctaagtccataca 36954922  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||| |||||||||   || ||||||||| ||  | ||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  36954923 gagtttgctttggctttaaatgggccccccgcaagtggactgtgggattagtcccctcatattagtcgattcttg 36954997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 418 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21236537 - 21236380
Alignment:
Q  418 gcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggcttt 517  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||  |||  || ||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21236537 gcttaggatcttggagttttctccttcagaggtcttcggttcgattctctctagtgtcaatttcaatgggctaagtccatacagagttttctctgacttt 21236438  T
Q  518 aagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  21236437 aaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattagtcccctcagattagtcgattcttg 21236380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 415 - 573
Target Start/End: Original strand, 34049841 - 34049988
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||           | | ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  34049841 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttc-----------taggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 34049929  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattct 573  Q
    ||||| | |||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34049930 tttaaacggggcccccgcaagtggtcggtaggattggtcccctcggattagttgattct 34049988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 1827722 - 1827623
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||| || |||||||||    
T  1827722 ggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgataccaatttcggtgggttaagtccataca 1827623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19145603 - 19145430
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  19145603 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtatgctcctctcaaggtctccggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccataca 19145505  T
Q  501 aag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||||   || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  19145504 gagctttgctctggctttaa-atggtcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagttggttcttg 19145430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 401 - 549
Target Start/End: Original strand, 15931064 - 15931211
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |  || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  15931064 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgcttcttcacaagtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggt-ggctaagtccataca 15931162  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggatt 549  Q
     ||  |||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  15931163 gagcctgctctggctttaaacagggctctcgcaagtgggcggtgggatt 15931211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 472 - 575
Target Start/End: Original strand, 35425089 - 35425192
Alignment:
Q  472 tgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35425089 tgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctcgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcggattagtcgatt 35425188  T
Q  572 cttg 575  Q
    ||||    
T  35425189 cttg 35425192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 5049142 - 5049315
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||   | | ||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  5049142 ggttgacttaatgattgatttggaatcttgaagtttgcttttctaaaggtctcagattcaattccctctggtaccaatttcgatggtctaagttcataca 5049241  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  5049242 gagcttgctctggctttaaac-gggcccccgcaaatggacggtgggattggtcccatcgaattagtcgattcttg 5049315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 25750803 - 25750686
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcg--attccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccata 498  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  25750803 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttggatattccttctggtgccaatttcggtgggttaagtccata 25750704  T
Q  499 caaagtttgctctggctt 516  Q
     | || ||||||||||||    
T  25750703 tagagcttgctctggctt 25750686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 12317342 - 12317174
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| | |||| || |||||||| |||| || |||    ||    
T  12317342 ggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctcttgaggtctcgggtttgatttcatctggtgtcaatttcggtgggttaagtc----ca 12317247  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     || |||||||| |||||||| || ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12317246 gagcttgctctgactttaagcgggccccccgcaagtgggtggtgggattgat-ccctcggattagtcaattctt 12317174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26009450 - 26009282
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||| |||| | | |||| || ||||||||||| | || ||||||||||  ||||||| |||||| || || ||    
T  26009450 cctagtggttggtttgggatctcagagtttactcctcgaaaggtttccggttcgattccctttggtgccaatttcagtgggctaagtccatgcagagctt 26009351  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  26009350 actctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtagtgggattagtcccctcggattagtcggttcttg 26009282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 10399785 - 10399953
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |  || || | ||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||| ||||||||  ||  ||    
T  10399785 ctagtggttgactttggatcttggagtttgcttcttcaaagatttcaggtttgattctctctggcgccaatttcgatgggctaagtccatacggagcatg 10399884  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatc-ccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| |||||| | ||||||||| || ||  ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  10399885 ctctgactttaaacggggcccccgtaagtggacggtgggattggtcaccctcgaattagtcgattcttg 10399953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 415 - 500
Target Start/End: Original strand, 7151348 - 7151433
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||  | |||||||| ||||||| |||||||||    
T  7151348 ttggcttgggatcttggagtttgctcctcaagaggtcttaggttcgactccctctggcgtcaatttcggtgggctaagtccataca 7151433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 410 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 28614667 - 28614508
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgct 509  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||| || |||||||||||||| | |||| || ||||| || || | || |||||||||||| ||| |    
T  28614667 agtggttggcttgagatcttagagtttgttcctccaaagatctcaggttcgattacctctgatgtcaatt-cggtgagataagtccatacaaagcttgtt 28614569  T
Q  510 ctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||| |||||| | |||  |||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28614568 ctgactttaaac-gggatcccgcagatggacggtgggattgatcccctcgaattagtcgatt 28614508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 475 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9659429 - 9659329
Alignment:
Q  475 caatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||   || ||||||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  9659429 caatttcggtgggctaagtccatacacagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtggacggtgggattggtcccttcggattagttgattctt 9659330  T
Q  575 g 575  Q
    |    
T  9659329 g 9659329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 448 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 24158311 - 24158191
Alignment:
Q  448 ggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| || ||| |||||||||  | | ||||| | |||| || |||||| |    
T  24158311 ggtctcaggttcgattccttctggtgtcaatttcgatggg-taagtccatacatagctttactctggcttagaacggggcctctgcaagtgggcggtgag 24158213  T
Q  547 attgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  24158212 attggtcccctcagattagtcg 24158191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 575
Target Start/End: Original strand, 36895432 - 36895604
Alignment:
Q  403 ttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaa 502  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |   |||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  36895432 ttgacgtagtgattagcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtttcatgttcgattccctctggtaccaatttcggtggtc-aagtccatacaaa 36895530  T
Q  503 g-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | |||||||||||||  | |   ||| |||||| || |||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  36895531 gctttgctctggcttagaacgtagccgccgcaagtgggcggggggattgttctcctcgaattagtcggttcttg 36895604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 479 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13659359 - 13659263
Alignment:
Q  479 ttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||| || ||||||| | |  ||||| || |||||| | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13659359 ttcgatgggttaagtccatagagaacttgctttgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattaatcgattcttg 13659263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 575
Target Start/End: Original strand, 22693062 - 22693114
Alignment:
Q  523 gggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22693062 gggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 22693114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 505 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41351191 - 41351122
Alignment:
Q  505 ttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||| | |||| || |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41351191 ttgctctggctttaaacggggctcc-gcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 41351122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 463
Target Start/End: Original strand, 5067313 - 5067368
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 463  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5067313 ctagtggttgacttgggatcttcgagtttgctcctccagagatctcaggttcgatt 5067368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 22253330 - 22253235
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag 503  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |   || |||||||||||| |   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22253330 ctagtggttggcttgggatctttgactttgctcctctctagatctcaggttcgactttctctagtgccaatttcgatgggctaagtccatacaaag 22253235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 524 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38631048 - 38630997
Alignment:
Q  524 ggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  38631048 ggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttg 38630997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 465
Target Start/End: Original strand, 37397725 - 37397782
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattcc 465  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  37397725 ctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcctccaaaggtctaaggtttgattcc 37397782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 575
Target Start/End: Original strand, 5067392 - 5067440
Alignment:
Q  527 ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5067392 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctctgattagtcgattcttg 5067440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 17015591 - 17015507
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||   ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||||    
T  17015591 ttggcttgagatcttgaagtttcctctttcagaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcattgggataagtccatac 17015507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 3715101 - 3715055
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccaga 447  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  3715101 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccaga 3715055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 546 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3600045 - 3600016
Alignment:
Q  546 gattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3600045 gattgatcccctcggattagtcgattcttg 3600016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10631340 - 10631307
Alignment:
Q  542 gtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10631340 gtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 10631307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 490
Target Start/End: Original strand, 29075806 - 29075883
Alignment:
Q  414 attggcttgggatcttggagtttgctcc-cccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggcta 490  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||| |||||||||    
T  29075806 attggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcgagatctcatgttcgattctctctggtgccaatttagatgggcta 29075883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14656693 - 14656629
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatt 479  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  14656693 ttggcttgagaccttggagtttgctcctctcaaggtctcaggttcgattgtttctgatgccaatt 14656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 539 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15971143 - 15971107
Alignment:
Q  539 gcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15971143 gcggtggaattgatcccctcgaattagtcgattcttg 15971107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 463
Target Start/End: Original strand, 16616138 - 16616186
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  16616138 ttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaagatctcagattcgatt 16616186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 409 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 21042709 - 21042677
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcc 441  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21042709 tagtgattggtttgggatcttggagtttgctcc 21042677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4621429 - 4621255
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4621429 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 4621330  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4621329 gagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 4621255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 24674398 - 24674572
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24674398 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 24674497  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24674498 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttg 24674572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7766919 - 7766745
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  7766919 ggttggcctagtggttagcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttcggtgggctaagtccataca 7766820  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7766819 gagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 7766745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Original strand, 17935782 - 17935948
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  17935782 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttctagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgc 17935881  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17935882 tctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcgatgggattggtccactcggattagtcgattcttg 17935948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Original strand, 24122036 - 24122202
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  24122036 tagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 24122135  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24122136 tctggctttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 24122202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 559
Target Start/End: Original strand, 8077652 - 8077810
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  8077652 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 8077751  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcg 559  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  8077752 gagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcg 8077810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15059594 - 15059420
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15059594 ggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 15059495  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15059494 gagcttgctctggctttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcgaattagtcgattcttg 15059420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 18646858 - 18647032
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  18646858 ggttgacctagtggttggcttgtgatctttgagtttgcttctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtctataca 18646957  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||| | || || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18646958 aagtttgctctggctttaaacggagcccctgtaagtgggcggtgagattgatcccctcgaattagtcgattcttg 18647032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 46607815 - 46607982
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46607815 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 46607914  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || |||||||| ||||||   |  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46607915 gagcttgctctgactttaaaaggcccccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcg 46607982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27455051 - 27454882
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||| ||||||||| || |||    
T  27455051 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcactctgatgccaatttcggtgagctaagtccatacagagcttg 27454952  T
Q  508 ctctggctttaagcagg--gcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | ||   ||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27454951 ctctggctttaaacgggccccccccgcatgtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 27454882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 407 - 571
Target Start/End: Original strand, 7578420 - 7578584
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  7578420 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagctt 7578519  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    |||||| |||||| | |||||| ||||| || | |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  7578520 gctctgactttaaacggggccctcgcaagtgggtggtgggattggttccctcggattagttgatt 7578584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 45859221 - 45859065
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  | ||||||| ||    
T  45859221 ttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacatcgcttgctcttgc 45859122  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||| |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45859121 tttaaacagggcccccgcaagtgggtggtaggattggtcccctcggattagttgatt 45859065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 7197438 - 7197268
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||| |||||    
T  7197438 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtggg-taagtcaataca 7197340  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattc 572  Q
     |  ||||||||||||||| |  |||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  7197339 gaccttgctctggctttaaacgaggcccctgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattc 7197268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 30677181 - 30677355
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30677181 ggttgacctagtggttggtttgggatctaggagtttgctcctccaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 30677280  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||| |||||||||   || ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  30677281 gagcttgctttggctttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcggttcttg 30677355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 573
Target Start/End: Original strand, 2272349 - 2272521
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  2272349 ggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctacagaggtctcaggtttgattccctctgatgccaatttcgctgggctaagttcataca 2272448  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattct 573  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2272449 aagtttgctctgactttaaacggggcccctacaagggggcggtaggattgatcccatcggattagtcgattct 2272521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9500533 - 9500373
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  9500533 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 9500434  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | | |||||| ||| || |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||    
T  9500433 tttaaacggagcccccacaagtgggcggtgagattggtctcttcggattagtcgattcttg 9500373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 34778347 - 34778518
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| | |||| |   ||||||||    
T  34778347 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattccctctggtaccaattttggtgggtt---tccataca 34778443  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  34778444 gagtttgctttggctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtccccttggattagtcgattcttg 34778518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 23734135 - 23734296
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |    
T  23734135 ttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctatgcc 23734234  T
Q  515 tttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||| ||||||||| || ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23734235 tttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttg 23734296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 23741327 - 23741488
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || |    
T  23741327 ttggcttgggatcttagaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctatgcc 23741426  T
Q  515 tttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||| ||||||||| || ||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23741427 tttaaacggggccccccgcaagtgggcggtgaaattggtcccctcagattagtcgattcttg 23741488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 415 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 33905688 - 33905545
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||||||    
T  33905688 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtatcaatttcggtgggttaagtccatacagagtttgttctggc 33905589  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctc 558  Q
    ||||| | ||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  33905588 tttaaacggggcctccgtaagtggacggtgggattgatcccctc 33905545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 420 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 8779909 - 8779755
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||| ||||||| ||||||||| || || |||| |||||||    
T  8779909 ttgggatcttggagtttgcttctccagaggtctcagcttcgatttcttctagtgtcaatttcggtgggctaagtccatacacagcttactctagctttaa 8779810  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     | |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8779809 acggggcccccacaagtaggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattctt 8779755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 21726734 - 21726908
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||| |    
T  21726734 ggttgacctagtggttgatttgggttcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatgggttaagtccatata 21726833  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||| ||| ||||||| | || ||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21726834 gagcttgttctagctttaaacgggtcccccacaagtgggcggtggggttgatcccctcagattaatcgattcttg 21726908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 32729550 - 32729716
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |   | ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  32729550 ggttggcctagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctcaaagtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtgggcaag-tccataca 32729648  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || |||||||||||||||   ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32729649 gagcttgctctggctttaaatggggtccccgcaagtgggcggtgggattgatccccttggattagtcg 32729716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 420 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36156061 - 36155906
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||| || || ||||| | | |||||    
T  36156061 ttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgtcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggccaagtccatgcagagcttgctttagttttaa 36155962  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||    
T  36155961 acagggcccccgcaggtgggcggtgggattggtcccttcaaattagtcgattcttg 36155906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 37351639 - 37351478
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt-------- 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||            
T  37351639 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaatgtctcaggttcgattccttctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctgga 37351540  T
Q  507 -gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     ||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37351539 agctctggctttaaac-gggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 37351478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 409 - 574
Target Start/End: Original strand, 1378911 - 1379075
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||| | |||| || |||||||| ||||||| ||||||||| |  ||||    
T  1378911 tagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtctcatgttcgatttcctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacagaacttgc 1379010  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1379011 tctggctttaaac-gggcccccgcaagtggacggtgagattggtcccctcagattagtcgattctt 1379075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Original strand, 32930754 - 32930927
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||| | ||||||| |||||| ||    
T  32930754 ggttgacctagtggttggtttggaatcttggagtttactccttcagaggtctcaagttcgatttcctctggtgcccattttggtgggctaagtccatgca 32930853  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     || ||||||||||||||| | ||| ||| |||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32930854 gagcttgctctggctttaaacggggtccctgcaagtggatggtgggattgatcccctcagattaatcgattctt 32930927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 46113594 - 46113493
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  46113594 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtaccaatttcggtgggctaagtccataca 46113495  T
Q  501 aa 502  Q
    ||    
T  46113494 aa 46113493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 402 - 566
Target Start/End: Original strand, 168207 - 168371
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||     
T  168207 gttggcctagtggttggcttgggatcttagagtttgctctttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcatacag 168306  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagt 566  Q
    || ||| |||| |||||| | || | ||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  168307 agcttgttctgactttaaacgggactcccgctagtggccggtgggattggtcccctcggattagt 168371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 405 - 564
Target Start/End: Original strand, 7946853 - 7947011
Alignment:
Q  405 gacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagt 504  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||     
T  7946853 gacctagtggttggcttgagatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtctatacagagc 7946952  T
Q  505 ttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggatta 564  Q
    ||||||| |||||||   ||| |||||||| || | |||| ||||| ||||||| |||||    
T  7946953 ttgctctcgctttaa-atggggccccgcaagtgggtggtgagattggtcccctcagatta 7947011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 444 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8254901 - 8254770
Alignment:
Q  444 cagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggt 543  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| || |||||||| ||||||| || |||||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  8254901 cagaggtctcaggttcgattatctctggtgtcaatttcggtgggctaagttcatacagaacttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 8254802  T
Q  544 gggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8254801 gggattgatccccttgaattagtcgattcttg 8254770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 29057529 - 29057363
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||| |||||    
T  29057529 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctgctccaaaggtctcaggttcgattccctcttgtgccaatttcgat-ggtaaagtctataca 29057431  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || ||||||||||||| | | || |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  ||||||||    
T  29057430 gagcttgctctggctttcaacgggacccccgcaaatgggcgatgtgattggtcccctcaaattagtcg 29057363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 18533916 - 18533743
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||||  |||  ||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  18533916 ggttgacatagtggttgacttgagatcttagagtttgctcctccagaggtatcagatttgattctctctagtgccaatttcgatggactaagtccatata 18533817  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     || ||| |||| |||||| | ||||||| |||| || || ||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  18533816 gagcttgttctgactttaaacggggcccctgcaagtgggccgtgggattggtcccctcatattaatcgattctt 18533743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 407 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 23232451 - 23232304
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  23232451 cctagtggttgacttgggatcttgaagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 23232352  T
Q  507 ----gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattg 550  Q
        |||||||||||||   || ||||||||| || | ||||||||||    
T  23232351 gcaagctctggctttaaatgggacccccgcaagtgggtggtgggattg 23232304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20487374 - 20487301
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  20487374 tagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcg 20487301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Original strand, 1486425 - 1486592
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |   ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  1486425 ggttgacctagtggttggcttgggatcttggagt--gctactctcaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcgatggg-taagtccataca 1486521  T
Q  501 aag-tttgctctggctttaagcaggg--cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || ||||||||| |||  | | |||  ||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  1486522 gagctttgctctgacttagaacggggcccccccgcaagtggacggtgggatcggtcccctccgattagtcg 1486592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14258613 - 14258538
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||||||||    
T  14258613 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgttcctccagatgtctctggttcgattccctctggtaccaatttcg 14258538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 450 - 568
Target Start/End: Original strand, 16899557 - 16899675
Alignment:
Q  450 tctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggat 548  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||  | | ||||||| |||| ||  ||||| |||    
T  16899557 tctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcca-gtccatacaaagctttgctctggtttagaacggggcccctgcaagtggacggtgagat 16899655  T
Q  549 tgatcccctcggattagtcg 568  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16899656 tggtcccctcggattagtcg 16899675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 447 - 567
Target Start/End: Original strand, 2537749 - 2537864
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    |||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||     || ||||| ||||||||| | || ||||||||| || |||| |||    
T  2537749 aggtctcaggtttgattccatttggtgccaatttcggtgggctatgtcca-----agcttgctttggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggaggg 2537843  T
Q  547 attgatcccctcggattagtc 567  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  2537844 attggtcccctcggattagtc 2537864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 496 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26513244 - 26513166
Alignment:
Q  496 atacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| |||||||| |||||| | |||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26513244 atacaaagcttgctctgactttaaac-gggcccccacaagtgggcggtgggaatggtcccctcggattagtcgattcttg 26513166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 487
Target Start/End: Original strand, 24216983 - 24217069
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatggg 487  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||| | | || ||||||||||| ||||    
T  24216983 ggttgacctagtggttgacttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattacctttggtgccaatttcggtggg 24217069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 419 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 9926322 - 9926171
Alignment:
Q  419 cttgggatcttggagtttgctcccccagagg--tctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggct 515  Q
    |||||||||||||||| |||||| |   |||  |||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  9926322 cttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctctcagattcgattccttctggtgtcaattttggtgggc-aaatccatacaaagttttgctctggct 9926224  T
Q  516 ttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |  | | | |||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  9926223 tagaacggagcccccgcaactgggcggtgggattgatccctttagattagtcg 9926171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 12877037 - 12876965
Alignment:
Q  492 gtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggatta 564  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  12877037 gtccatacagagcttgctctagctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcggatta 12876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 402 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25496679 - 25496599
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||    
T  25496679 gttggcctagtgattggcttgggatcttggagattgctcctcttaaggtctcaagttcgattccctctagtgcctatttcg 25496599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 512 - 575
Target Start/End: Original strand, 48699875 - 48699938
Alignment:
Q  512 ggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  48699875 ggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattgttcccttcggattagtcgattcttg 48699938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 465
Target Start/End: Original strand, 1818753 - 1818803
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattcc 465  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  1818753 ttggcttaggatcttggagtttgctcttccagaggtttcaggttcgattcc 1818803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 420 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 25237162 - 25237077
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    |||||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||    
T  25237162 ttgggatcttggagtttgcttctctcaaggtctcaggttcgattccctctagtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagttt 25237077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Original strand, 37047011 - 37047164
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctgg 513  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||  ||| | | ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  37047011 ttggcttgggaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccccctggtacaaattttggtgggcta-gtccatacagagctttgctctag 37047109  T
Q  514 ctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||   |||||||| ||| ||  |||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  37047110 ctttaaatggggcccccacaagtggacggtgggattggacccctaggattagtcg 37047164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 505 - 570
Target Start/End: Original strand, 22909980 - 22910045
Alignment:
Q  505 ttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgat 570  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22909980 ttgctctgactttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggatttgtcccctcggattagtcgat 22910045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 19034569 - 19034467
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgc 508  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||||   |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||    
T  19034569 agtggttggtttgggatcttggagtttgttcctcaaaaggtttcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc-aagtccatacagagctttgc 19034471  T
Q  509 tctg 512  Q
    ||||    
T  19034470 tctg 19034467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 566
Target Start/End: Original strand, 1138584 - 1138748
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  1138584 ggttgacctagtggttggcttgagatcttggagtgtgctcctctcaaggtcttaggttcgaatctctctagtgccaatttcggtggac-aagtccataca 1138682  T
Q  501 aag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagt 566  Q
     || ||||||||| |||  | ||||||||  |||| || || |||| |||| | |||||||||||||    
T  1138683 gagctttgctctgacttagaacagggcccttgcaagtgggcagtggaattggt-ccctcggattagt 1138748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 526 - 568
Target Start/End: Original strand, 35138118 - 35138160
Alignment:
Q  526 cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35138118 cccccgcaagtgggcggtgggattgattccctcggattagtcg 35138160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 489
Target Start/End: Original strand, 39964531 - 39964605
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggct 489  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |   |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  39964531 ttggcttgcgaccttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggct 39964605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 441
Target Start/End: Original strand, 6776149 - 6776189
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcc 441  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6776149 ggttggcctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcc 6776189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 401 - 441
Target Start/End: Original strand, 47091695 - 47091735
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcc 441  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47091695 ggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcc 47091735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 50202661 - 50202725
Alignment:
Q  511 tggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||| | || ||| ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  50202661 tggctttaaacgggaccctcgcaagtgggcggtggaattggtcccctcggattaatcgattcttg 50202725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 57)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40059044 - 40058870
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40059044 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctctagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 40058945  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40058944 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 40058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 52983624 - 52983798
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  52983624 ggttggcctagtggttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccataca 52983723  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52983724 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 52983798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 402 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19660723 - 19660550
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||| || |||||||||     
T  19660723 gttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattctctctgatgcaaatttcggtgggataagtccatacag 19660624  T
Q  502 agtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660623 agcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 19660550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27528979 - 27528813
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  27528979 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 27528880  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||  | |||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27528879 tctggctttatacggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcccctcggattagtcgattcttg 27528813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34844950 - 34844776
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34844950 ggttggcctagtggtttgcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 34844851  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34844850 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 34844776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 32986202 - 32986376
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  32986202 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 32986301  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| ||||||   |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  32986302 gagcttgctctgactttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggaatagtcgattcttg 32986376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5609394 - 5609220
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5609394 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcattcagtggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 5609295  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5609294 gagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 5609220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33696471 - 33696297
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33696471 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 33696372  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  33696371 gagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcggattagtcaattcttg 33696297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 54127534 - 54127360
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  54127534 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcaattccctcttgtgccaatttcggtgggctaagtctataca 54127435  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54127434 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcggttcttg 54127360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 35229173 - 35229347
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35229173 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccttct-atgccaatttcggtgggctaagtccataca 35229271  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagg-gcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| |||||| | ||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  35229272 tagcttgctctgactttaaacgggtccccccacaagtgagcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 35229347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 46714397 - 46714572
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt-ccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  46714397 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttccctttggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 46714496  T
Q  500 aaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | || |||| || ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46714497 agagcttgcccttgctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcaattcttg 46714572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45787895 - 45787722
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  45787895 ggttggcctagtggttggcttggaatcttgga-tttgctcctccagagatctcaggttcgattccctctgatgccaatttcagtgggctaagtccataca 45787797  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  45787796 gagcttgctctggctttaaacagggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 45787722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20078162 - 20078002
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20078162 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcccactggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 20078063  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||||||||| || || |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20078062 tttaaacggggcccccgtaagtgggcggtgggattagttccctcggattagtcgattcttg 20078002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 20566354 - 20566529
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtc-tcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  20566354 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtgatcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaagtccatac 20566453  T
Q  500 aaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | || ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20566454 agagcttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggcgctgggattggtcccctcagattagtcgattcttg 20566529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 49287872 - 49288036
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgct 509  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  49287872 agtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaaatttgct 49287971  T
Q  510 ctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49287972 atggctttaaac-gggctcccgcaagtgggcgctgagattggtcccctcggattagtcgattcttg 49288036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 25852219 - 25852394
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25852219 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 25852318  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccc-cgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   ||| ||| ||||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25852319 gagcttgctctggctttaaaacgggaccctcgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcggttcttg 25852394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 44343533 - 44343693
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||| || |||||||| |    
T  44343533 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccaaaggactcaagttcgattccctctggtgctaattttggtgggctaagtccatacagagcttgctctgac 44343632  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | |||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44343633 tttaaacggggctcccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 44343693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 13873487 - 13873317
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  13873487 ggttggcctagtggtttgcttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtaggctaagttcataca 13873388  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
     |||||||||| |||| || |||||||||||||| || | ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  13873387 gagtttgctctagcttcaaacagggcccccgcaagtgggtggtggaattgatcctctgggattagtcgatt 13873317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 543
Target Start/End: Original strand, 33992631 - 33992773
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33992631 ggttgacctagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 33992730  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggt 543  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||    
T  33992731 tagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggt 33992773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 445 - 575
Target Start/End: Original strand, 34723848 - 34723978
Alignment:
Q  445 agaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtg 544  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| || | ||||    
T  34723848 agaggcctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacaaagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggtggtg 34723947  T
Q  545 ggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34723948 ggattggtcctctcggattagtcgattcttg 34723978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Original strand, 1985847 - 1986014
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||      
T  1985847 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgcgaatttcgatgggctaagtccatacagagtaa 1985946  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     |||||||||||| | | |||||| ||| || ||||||| |||| | |  |||||||||||||||||||    
T  1985947 actctggctttaaacggagcccccacaagtgggcggtggaattggt-ctatcggattagtcgattcttg 1986014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13584446 - 13584272
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||| |    
T  13584446 ggttggcctagtggttggcctgagatattggagtttgctcctccaaaagtctcaagttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccataga 13584347  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||| |||| || ||||| |||||||| ||||||    
T  13584346 gagcttgctctggctttaaacggggccctcacaaatgagcggtggaattggtctcctcgaattagtcggttcttg 13584272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 449 - 575
Target Start/End: Original strand, 32990488 - 32990614
Alignment:
Q  449 gtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggat 548  Q
    ||||||||||||||||| | |  ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||    
T  32990488 gtctcaggttcgattccctttagtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggat 32990587  T
Q  549 tgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    || |||||||||| |||||||||||||    
T  32990588 tggtcccctcggactagtcgattcttg 32990614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Original strand, 51535618 - 51535799
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggc----taggtcca 496  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||    || |||||    
T  51535618 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccacaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaattaagtcca 51535717  T
Q  497 tacaaagttt---gctctggctttaagcagggccccc-gcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||| || ||   ||||||||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  51535718 tacagagcttgcagctctggctttaaacggggcccccagcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattctt 51535799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35674933 - 35674766
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35674933 ggttggccaagtggttggcttgggatcttggagtttgctcttccaaaggtcacaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 35674834  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||| |||||| | |||||||||||| || ||||| ||||       ||||||||||||||||||||    
T  35674833 gagcttgctctgcctttaaacggggcccccgcaagtgggcggttggat-------ctcggattagtcgattcttg 35674766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 7392141 - 7391984
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| | || || ||||||||| |||||||||||||    
T  7392141 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggt-ggttaagtccatacagagtttgctctggc 7392043  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||   ||| ||||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7392042 tttaa-atgggacccccatagtgggcggtgggattgttcccctcggattagtcggttctt 7391984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 420 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12500231 - 12500077
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  12500231 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 12500132  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     | || ||||||||| || |||||   |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  12500131 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttg 12500077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 32942382 - 32942549
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||     
T  32942382 ctagtggttggcttgagatcttggagtttactcctccagaggtttaaggttcgattctctctgatgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctta 32942481  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | |  ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  32942482 ctctggctttaaacggcccccccacaagtggacggtgggattggtcccctcggataaatcgattcttg 32942549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 409 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 36131694 - 36131532
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||    
T  36131694 tagtggtttgcttgggattttggagttcgttcctccagatgtctcaggttcgattccctatggtgccaatttcggtggcctaagtccatacagagcttgc 36131595  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    | || |||||| | || |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36131594 tatgactttaaacgggacccccgtaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 36131532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22625262 - 22625153
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22625262 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttactcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 22625163  T
Q  501 aagtttgctc 510  Q
     || ||||||    
T  22625162 gagcttgctc 22625153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 18875708 - 18875543
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||| || ||||||| | |  || || |||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||    
T  18875708 ggttgacatagtggttggtttgggattttagagtttgtttcttcaaagatctcaggttcgattccctctgatgtcaatttcggtgggctaagtccataca 18875609  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtc 567  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||| ||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18875608 gagcttgctctggctttaaac-gggcccccacaagtgggtagtgggattgatcccctcggattagtc 18875543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 447 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9517787 - 9517659
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||  || | |||| |    
T  9517787 aggtctcaggttcgattctctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctgactttaaacggggcccccgcaggtgggtggtgag 9517688  T
Q  547 attgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9517687 attggtcccctcggattagtcgattcttg 9517659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 400 - 575
Target Start/End: Original strand, 13550212 - 13550387
Alignment:
Q  400 cggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    ||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13550212 cggttggcctagtggttgacttgagatctgggagtttgctcctctagaggtctcaggcctaattccctctagtgccaatttcggtgggctaagtccatac 13550311  T
Q  500 aaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
      || || |||||||||||| | ||| |||| ||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  13550312 cgagcttactctggctttaaacggggtccccacaagtgggcggtaggataggtcccctcggattaatcgattcttg 13550387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 408 - 574
Target Start/End: Original strand, 34835541 - 34835707
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||||||||  || |      
T  34835541 ctagtggttggcttgggatcttagagtttgctcctcttaaggtctcatgttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccatacggagctat 34835640  T
Q  508 ctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     |||||||||||  |||| ||||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34835641 gtctggctttaaatagggccccccgcaagtgggc-gtgagattggtcccctcggattagtcgattctt 34835707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 407 - 519
Target Start/End: Original strand, 2351024 - 2351136
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||  |||||||| || ||    
T  2351024 cctagtggttggcttggaatcttgaagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtcgactaaatccatacatagctt 2351123  T
Q  507 gctctggctttaa 519  Q
    | || ||||||||    
T  2351124 gttccggctttaa 2351136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55961928 - 55961772
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||          |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  55961928 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtct----------tcct-ctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 55961840  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||| |||||| | ||| |||| ||| || |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||    
T  55961839 gctctgactttaaac-ggggccccacaagtgggcggtgggattggttccttcggattaatcgattcttg 55961772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 415 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 30879343 - 30879239
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||  ||  ||| | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  30879343 ttggtttgggatcttgtagtttgctccttcatgggttttaggtttgattccctctggtgccaatttcgatgggttaaatccatacaaagtttgctctggc 30879244  T
Q  515 tttaa 519  Q
    |||||    
T  30879243 tttaa 30879239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 475 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 22488146 - 22488053
Alignment:
Q  475 caatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||| | || ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22488146 caatttcggtggactaagtccatatagagcttgttctggctttaaacggggcccccgcaaatgggcggtgggattgatcccctcaaattagtcg 22488053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 20527211 - 20527056
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||| | || ||| | | |     
T  20527211 ttggtttgagattttggagtttgttcctccagaggtctcaagtttgattccctctggcgccaatttcggtgggctaagtccatatagagcttgatttcgg 20527112  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  20527111 tttaaacaggg-ccccgtaagtgggcggtaggattggtctcctcggattagtcgatt 20527056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 408 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 43719250 - 43719158
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  43719250 ctagtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattctctctagtgctaatttcggtgggctaagtccataca 43719158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 443 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 21387635 - 21387509
Alignment:
Q  443 ccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcgg 542  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |  || |||||| | ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| | ||  |||||||| || ||||    
T  21387635 ccagagatctcaggttcgattccctatagtgtcaattttggtgggctaagtctatacagagcttgctctggctttaaacgggatccccgcaagtgggcgg 21387536  T
Q  543 tgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||    
T  21387535 tggg--tggtcccctcggattagtcgatt 21387509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 575
Target Start/End: Original strand, 27574356 - 27574497
Alignment:
Q  434 tttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgca 533  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||   |||  | ||||||||| | |||||  | |||||| || |||||||||||||||   |||||||||||    
T  27574356 tttgctcctccataggtctcaggttcgattttctcttattccaatttcggtaggctaaattcatacagagcttgctctggctttaaaaggggcccccgca 27574455  T
Q  534 aatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | || |||||| | ||| ||||||||||||| || |||||||    
T  27574456 agtgggcggtgagtttggtcccctcggattaatcaattcttg 27574497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 422 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25969673 - 25969521
Alignment:
Q  422 gggatcttggagtttgctcccccagaggtctc--aggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||| |  ||||| ||||||  ||| ||||||||||| | ||| | ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  25969673 gggatcttggagtttgctcctctcaaggtcccagaggttggattccccctggtgccaatttcggt-ggccaagtccatacagaacttgctctggctttaa 25969575  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  25969574 ac-gggcccccgtaagtgagcggtgggattggt-ccctcgaattagtcgattcttg 25969521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 13771661 - 13771541
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctgg 513  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |   ||||||||  ||||||||| |||| || |||| ||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||||    
T  13771661 ttggcttgggatcttgaagtttgctcatctcaaggtctcaaattcgattccctctgatgtcaatctcggtgggctaagtccatacgaagctatgctctgg 13771562  T
Q  514 ctttaagcagggcccccgcaa 534  Q
    |||||| | |||| |||||||    
T  13771561 ctttaaacggggctcccgcaa 13771541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 474 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 53787177 - 53787082
Alignment:
Q  474 ccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtt-tgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |  || | |||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  53787177 ccaatttcggtgggctaagtccatgcggagctatgctctggctttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggattagtcccctcagattagtcg 53787082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 575
Target Start/End: Original strand, 4912035 - 4912105
Alignment:
Q  505 ttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||| || | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  4912035 ttgctctggctttaaacggagcccccgcaagtgggtggtgtgattgatccccccgaattagtcgattcttg 4912105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 408 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 9646401 - 9646241
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-ttt 506  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||     |||||||| ||| |||||  |||| || ||||||| |||||| || || |||||  | |||    
T  9646401 ctagtggttggtttgggatctttgagtgtgctcctgtcaaggtctcatgtttgattctctctgatgacaatttcaatgggcaagttc-atacagtgcttt 9646303  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||||||  | | ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9646302 gctctggcttagaaccgggccaccgcaagtgggcagtgggattgatcccctcggattagtcg 9646241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 401 - 465
Target Start/End: Original strand, 42245751 - 42245815
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattcc 465  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||    
T  42245751 ggttggcctagtggttgacttgggatcttagagtttgctcctctaaaggtctcgggttcgattcc 42245815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 55158409 - 55158365
Alignment:
Q  527 ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55158409 ccccgcaaatgggtggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 55158365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 447 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22630332 - 22630274
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||    
T  22630332 aggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggc-aagtccatacaaagttt 22630274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 575
Target Start/End: Original strand, 23639768 - 23639803
Alignment:
Q  540 cggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23639768 cggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 23639803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 575
Target Start/End: Original strand, 23645426 - 23645461
Alignment:
Q  540 cggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23645426 cggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 23645461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 448
Target Start/End: Original strand, 34722183 - 34722222
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagag 448  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34722183 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagag 34722222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 480
Target Start/End: Original strand, 38869793 - 38869860
Alignment:
Q  414 attggcttgggatcttggagtttgctcccccaga-ggtctcaggttcgattccttctgttgccaattt 480  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38869793 attggcttgggatctgggagtgtgctcctcctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattt 38869860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 525 - 571
Target Start/End: Original strand, 4064989 - 4065035
Alignment:
Q  525 gcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4064989 gcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 4065035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 526 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 9978576 - 9978528
Alignment:
Q  526 cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  9978576 cccccgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagttgattctt 9978528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 539 - 575
Target Start/End: Original strand, 52494631 - 52494667
Alignment:
Q  539 gcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52494631 gcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 52494667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 401 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 44976346 - 44976172
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  44976346 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggggtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaattttggtgggctaagtccataca 44976247  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggc-ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
     |||||||||||||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44976246 gagtttgctctggctttaaacggggctccccgcaagtgggcggtgggattgatcccttcggattagtcgattctt 44976172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44946238 - 44946071
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||    
T  44946238 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagaacttg 44946139  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44946138 ctctggctttaaacgggccccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 44946071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33827765 - 33827591
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33827765 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagattgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcgttgggctaagtccataca 33827666  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | || |||| |||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  33827665 gagcttgctctggctttaaacgggacccctgcaagtgggcggtgggattggtccccttggattagtcgattcttg 33827591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11941395 - 11941228
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | |||| || ||||||||| || |||    
T  11941395 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctatggtgccaattttggtgggttaagtccatacagagcttg 11941296  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11941295 ctctggctttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 11941228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 427 - 575
Target Start/End: Original strand, 35171831 - 35171979
Alignment:
Q  427 cttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggc 526  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | ||||    
T  35171831 cttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggcaccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggc 35171930  T
Q  527 ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35171931 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 35171979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 43374503 - 43374348
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  43374503 ttggcttgggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtttatacaaagcttgctctggc 43374404  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||     |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43374403 tttaa-----gcccccgcaagtgagcggtgggattggtcccttcggattagtcgattcttg 43374348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 15037964 - 15038138
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15037964 ggttggcctagtggttgactcgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctttggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 15038063  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||| ||||||||| | | |||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15038064 gagcttgctttggctttaaacggagcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcagattagtcgattcttg 15038138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30467022 - 30466848
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  30467022 ggttggcctagtggttggtttgggatattggagtttgttcctctagaggtctcaggttcgattctctctgctgccaatttcggtgggctaagtccataca 30466923  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30466922 gagcttgctctggctttaaaccgggcccccgcaagtgggcagtgggattggtcccttcggattagtcgattcttg 30466848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 409 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10582174 - 10582014
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||    
T  10582174 tagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgc 10582075  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||| ||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10582074 tctagctttaaac-gggccctcgcaagtgggc-gtgggattggtcccctcgaattagtcgatt 10582014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 17324771 - 17324944
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17324771 ggttggcctagtggttggtttggtatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 17324870  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||| ||| || |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||    
T  17324871 gagcttgctctggctttaa-atgggcccccacaagtgggcggtgggattagtcccctcaaattagtcgattcttg 17324944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36242490 - 36242330
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||  || || ||||||||||    
T  36242490 ttggcttgggatcttgaaatttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtccagccagagcttgctctggc 36242391  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36242390 tttaaacggggtccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattaatcgattcttg 36242330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 415 - 568
Target Start/End: Original strand, 5394036 - 5394189
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  5394036 ttggcttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcgatgggctaagtccatacagagtttgctctgac 5394135  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |||||   ||||| |||||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  5394136 tttaaatggggccgccgcaagtgggcggtgggattggtccgttcggattagtcg 5394189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 1191532 - 1191692
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1191532 ttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgtttccctctagtaccaatttcggtgggctaagtccatacagagtttgctctggc 1191631  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | | | ||||| || ||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1191632 tttaaacggtgtccccgaaagtgaacggtggaattgttcccctcgaattagtcgattcttg 1191692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 401 - 571
Target Start/End: Original strand, 24196009 - 24196177
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  24196009 ggttggcctagtggttggcttgggattttggggttcgctcctccagaggtttcaggttcgattccctctggtgcaaatttcggtgggctaagtccataca 24196108  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
     |  |||||||||||||||  | || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24196109 gaacttgctctggctttaa--acgggccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 24196177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 407 - 534
Target Start/End: Original strand, 27290599 - 27290726
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  27290599 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattcccttcggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagctt 27290698  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaa 534  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||    
T  27290699 gctctggctttaaacgggccccccgcaa 27290726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 409 - 574
Target Start/End: Original strand, 41314005 - 41314169
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgc 508  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||    
T  41314005 tagtggttggtttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgggctaagtctatacagagcttgc 41314104  T
Q  509 tctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||| |||||| | |||  ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  41314105 tctgactttaaac-gggatcccgcaagtggacggtgggattggtcccctcagattaatcgattctt 41314169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34516586 - 34516432
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     | ||  ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||    
T  34516586 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtttcaggttcgattc-----ggtggtaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctcgc 34516492  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34516491 tttaaac-gggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 34516432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 25293178 - 25293338
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || ||||        |    
T  25293178 ctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctcgagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagttcata--------g 25293269  T
Q  508 ctctggctttaagcaggg-cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25293270 ctctggctttaaacggggccccccgcaagtgggcgatgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 25293338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 415 - 574
Target Start/End: Original strand, 45271403 - 45271562
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  45271403 ttggcttgggatcttagagtttgcttctccagaggtttcatgttcgattccctctggtgccaatttcagtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 45271502  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||| |   ||||| |||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  45271503 tttaaacgaagcccctgcaagtgagcggagagattgatcccctcaaattagtcgattctt 45271562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Original strand, 19054036 - 19054205
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  19054036 cctagtgattggcttgagatcttggagtctgctcctccaaaggtctcaggtttgattccttctggtgttaacttcggtgggctaagtccatacagagctt 19054135  T
Q  507 gctctggctttaagcaggg---cccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| |||||||||  | ||   ||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19054136 gctttggctttaa--atggaaccccccgcaagtgggcggtgggattggtccgctcggattagtcgattcttg 19054205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 401 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 4567629 - 4567480
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  4567629 ggttggcctagtagttggcttgggatcttgaagtttgctccttcagaagtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtgggctaaatccataca 4567530  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattg 550  Q
     || ||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||    
T  4567529 gagcttgttctggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattg 4567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 424 - 575
Target Start/End: Original strand, 8258925 - 8259076
Alignment:
Q  424 gatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcag 523  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||| || ||||||||| |  ||| ||||||||||| | |    
T  8258925 gatcttggagtttgctcctccagatgtctcaggttcgattccctctgacgccaattttggtgggttaagtccatacagatcttgttctggctttaatcgg 8259024  T
Q  524 ggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||  | || |||||||||||||||||||    
T  8259025 ggcccccgcaagtaggcggtgggattagttccttcggattagtcgattcttg 8259076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36390758 - 36390587
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  36390758 ggttggcctagtggttggtttgggatct--gagtttgcttctccaaaggtctcaggttcgatttcctctggtgccaatttcggtggactaagtccataca 36390661  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| |||||||| ||||||   || ||||||||| || |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||    
T  36390660 aagcttgctctgactttaaatgggacccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggatcagtcgatacttg 36390587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 19849847 - 19850012
Alignment:
Q  410 agtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgct 509  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||| |  || |||||| ||||| ||| ||| ||||| || |||||    
T  19849847 agtggttggtttgagatcttggagtttgctcctccaaaggtcttaagttcgattccttttagtgtcaattttgatggactaagtctatacagagcttgct 19849946  T
Q  510 ctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||  |||| ||||||||||    
T  19849947 ctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcggtgagattggtcctctcaaattaatcgattcttg 19850012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 41329848 - 41330021
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |    
T  41329848 ggttggcctagtggttagtttgggatcttagagtttgctcctccaaaggtttcagattcgattccctctggtgccaattttggcgggctaagtccata-a 41329946  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  41329947 gagcttgctctggctttaaatggggcccccacaagtgggcggtgagattggtcccctcagattagtcggttcttg 41330021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 409 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27269534 - 27269362
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgcc------aatttcgatgggctaggtccatacaaa 502  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| | ||||| |||||| |||| || |      ||||||| ||||||| ||||||| | |    
T  27269534 tagtggttggcttgggatcttcgagtttgctcctctaaaggttttaggtttgattccctctggtgtcggtgtcaatttcggtgggctaagtccatataga 27269435  T
Q  503 gtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
      ||||||||||||||| |||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269434 acttgctctggctttaaacagccctcccgcaagtgggcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 27269362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 8192543 - 8192377
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | ||||||| |    
T  8192543 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtgtgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatgtcggtgggc-aagtccatata 8192445  T
Q  501 aag-tttgctctggctttaagcagggcccc-cgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || |||||||||||||  || | |||||| ||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8192444 gagctttgctctggctt--agaacggcccctcgcaagtgggcggtgggattgggcccctcggattagtcg 8192377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 13266509 - 13266668
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||  |||| |||||||| || ||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  13266509 ttggcttgagatcttggaatttgctcctttagaggtctcatgttcgattcactctggtgccaattccggtggactaagtccatacagagcttgctctggc 13266608  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| | ||| |||||||| || |   |||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  13266609 tttaaac-ggggccccgcaagtgggtaatgggattggtcccctcaaattagtcgattcttg 13266668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 450 - 564
Target Start/End: Original strand, 19174817 - 19174930
Alignment:
Q  450 tctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggat 548  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||  | | ||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  19174817 tctcaggttcgattccttctggtgccaatttcggtggg-taggtccatacagagctttgctctggcttagaac-ggagccccgtaaatgggcggtgggat 19174914  T
Q  549 tgatcccctcggatta 564  Q
    ||||||||||||||||    
T  19174915 tgatcccctcggatta 19174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 472 - 571
Target Start/End: Original strand, 28668949 - 28669048
Alignment:
Q  472 tgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28668949 tgccaatttcggtggactaagtccatacagagcttgctttggctttaaacggggcccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgatt 28669048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 18976617 - 18976524
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtcc 495  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||| ||||    
T  18976617 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcatgttcgattccctctg-agccaatttcggtggactaagtcc 18976524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 401 - 499
Target Start/End: Original strand, 32845096 - 32845194
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  32845096 ggttggcctagtagttagcttgggatcttggagtttgctcctccaaaagtttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatac 32845194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 447 - 568
Target Start/End: Original strand, 3943791 - 3943912
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtggg 546  Q
    ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||| ||||||| || | ||||||    
T  3943791 aggtctcagattcgattttctctggtgccaatttcggttggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggctcccgcaagtgggtggtggg 3943890  T
Q  547 attgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |||| |||||| ||||||||||    
T  3943891 attggtccccttggattagtcg 3943912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 474 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 714244 - 714144
Alignment:
Q  474 ccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattct 573  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  714244 ccaatttcggtgggctaagtccatagagagtttgctctgactttaaacggagcccccgcaaatgggcggtgggtttcgtcccctcagattagtcgattct 714145  T
Q  574 t 574  Q
    |    
T  714144 t 714144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 443 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 2140633 - 2140508
Alignment:
Q  443 ccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagg-gcccccgcaaatgagcg 541  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||     ||||||||| || |||||||||||||||   ||  ||||||||| || |||    
T  2140633 ccagaggtctcaggttcgattccctctggtgtcaatttcggtgga----gtccatacagagcttgctctggctttaaatgggcccccccgcaagtgggcg 2140538  T
Q  542 gtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2140537 gtgggattggtcccctcggattagtcgatt 2140508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 401 - 481
Target Start/End: Original strand, 4852563 - 4852643
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttc 481  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  4852563 ggttgacctagtggttgacttggaatcttggagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgctaatttc 4852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 420 - 568
Target Start/End: Original strand, 18708501 - 18708649
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctggcttta 518  Q
    ||||||||||||||| || ||| |   ||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||  ||||| | || |||||| || ||||||||| ||| |    
T  18708501 ttgggatcttggagtgtgttcctctcaaggtctcaggttcgactccctctgataccaatttcagtgggc-atgttcatacagagctttgctctgacttaa 18708599  T
Q  519 agcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    | | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18708600 aacgggacccccgcaaatggacggtgggattgatcccctcagattagtcg 18708649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 5608212 - 5608056
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||  |||| || |||||| | ||||||| ||||||| | || |||||||| |    
T  5608212 ttggcttgaaatcttggaatttgctccttcagaggtctcatattcgattctctctggtgtcaattttggtgggctaagtccatatagagcttgctctgac 5608113  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgatt 571  Q
    ||||| | | || ||| ||||||  ||| |||||||||||| || ||| ||||||||    
T  5608112 tttaaacggagctcccacaaatggtcggcgggattgatcccttcagatgagtcgatt 5608056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 447 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 23787154 - 23787082
Alignment:
Q  447 aggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23787154 aggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcggtgggctaaatccatacagagtttgctctgactttaa 23787082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 415 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6714459 - 6714409
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattcc 465  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6714459 ttggcttgagatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggtttgattcc 6714409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 402 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 3405343 - 3405195
Alignment:
Q  402 gttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaa 501  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||  |   ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| | ||||||||||    
T  3405343 gttgacctagtggttgacttgggatcttggaatgtgctcatctcaaggtcacaggttcgattccctctggtgccaattttaatgggc-aagtccatacaa 3405245  T
Q  502 ag-tttgctctggctttaagcagggcccccg-caaatgagcggtgggatt 549  Q
    || ||| |||| ||||||| |||| || ||| ||| |||| |||||||||    
T  3405244 agctttactctagctttaaacaggccctccgacaagtgagtggtgggatt 3405195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 401 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 918891 - 918790
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggt---tcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccat 497  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| || | ||||||||| ||   |||||||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  918891 ggttgacctagtggttggcttgggattttgaagtttgct-cctctgaggtctcaagttcgtcgattccctcttgtgccaatttcgttgggctaagtccat 918793  T
Q  498 aca 500  Q
    |||    
T  918792 aca 918790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 4618877 - 4618759
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac- 499  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||| |  ||| |||||||||||  |||| | ||||||||     
T  4618877 ggttggcctagtggttggcttggaatcttggagtatgctcctctcaaggtttcaggttcgatttcccctggtgccaatttcggcgggc-aagtccataca 4618779  T
Q  500 aaagtttgctctggctttaa 519  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  4618778 aaactttgctctggctttaa 4618759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 401 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19606037 - 19605950
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggc 488  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |   ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| |||||    
T  19606037 ggttgccctagtggttggcttgggatcttggagtgcgctcctctcaaggtctcaggttcgattccctctaatgctaatttcggtgggc 19605950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 408 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 40997535 - 40997424
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||  ||  | ||||||||| || | || ||| ||||| || |||    
T  40997535 ctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcatgttcaattccccctagtaccaatttcggtgagataagtcaatacagagcttg 40997436  T
Q  508 ctctggctttaa 519  Q
    ||||| ||||||    
T  40997435 ctctgactttaa 40997424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 1845835 - 1845728
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggc---taggtccatacaaagtttgctct 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | |  | |||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||   || |||||||||||  ||||| |    
T  1845835 ttggcttgggatcttggagtttgctcctctaaaaatttcagattcgattcattctgatgtcaatttcgataggctaataagtccatacaaaacttgcttt 1845736  T
Q  512 ggctttaa 519  Q
    ||||||||    
T  1845735 ggctttaa 1845728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28194311 - 28194238
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggc 488  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |   |||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  28194311 ttggcttgggatcttggagtgtgctcctcttaaggtcttaggttcgattctctctggtgccaatttcggtgggc 28194238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 507 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9401047 - 9400979
Alignment:
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |  |||  ||||||||||||||||    
T  9401047 gctctggctttaaacagggcccccgcaagtgggcagtgggattggtttccttagattagtcgattcttg 9400979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 527 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18976521 - 18976473
Alignment:
Q  527 ccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18976521 ccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 18976473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 574
Target Start/End: Original strand, 32845194 - 32845254
Alignment:
Q  514 ctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    |||||| ||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  32845194 ctttaaacagggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccttcgaattagtcgattctt 32845254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 462
Target Start/End: Original strand, 44610093 - 44610140
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgat 462  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  44610093 ttggcttgagatcttggagtttgctcttccaaaggtctcaggttcgat 44610140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 496 - 575
Target Start/End: Original strand, 44610139 - 44610218
Alignment:
Q  496 atacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||| || ||||||| |||||||   ||||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  44610139 atacagagcttgctctagctttaaatggggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccatcggattagtcggttcttg 44610218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 574
Target Start/End: Original strand, 4769262 - 4769344
Alignment:
Q  492 gtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattctt 574  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||  ||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  4769262 gtccatacagagcttgctctggctttaaacgggggccccgcaagtggacggtgaggttggtcccctcaaattagtcgattctt 4769344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 521 - 575
Target Start/End: Original strand, 18692085 - 18692139
Alignment:
Q  521 cagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18692085 caggacccccacaagtgggcggtgggattggtcccctcgtattagtcgattcttg 18692139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 13747683 - 13747579
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tttgctctgg 513  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||  |||||||||||| || |||  | | |||| |||||| ||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  13747683 ttggcttgggaccttggagtatgctcctcccaaggtctcaggtttgaatccccccggtgccgatttcggtgggcta-gtccatacagtgctttgctctgg 13747585  T
Q  514 ctttaa 519  Q
    ||||||    
T  13747584 ctttaa 13747579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 523 - 568
Target Start/End: Original strand, 14486952 - 14486997
Alignment:
Q  523 gggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14486952 gggcccctgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 14486997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 496
Target Start/End: Original strand, 29361573 - 29361653
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtcca 496  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| | |||| || |||||||| ||| ||| |||||    
T  29361573 ttggattgggatcttggagtttgctcctccaaagatctcagg-tcgatttcctctgatgtcaatttcggtggactaagtcca 29361653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 507 - 575
Target Start/End: Original strand, 45132398 - 45132466
Alignment:
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||| || || || |||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  45132398 gctctggctttaaacggggcccccacaagtgggcagtaggattggtcctctcggattaatcgattcttg 45132466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 415 - 575
Target Start/End: Original strand, 161828 - 161988
Alignment:
Q  415 ttggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  161828 ttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggc 161927  T
Q  515 tttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||| |   |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  161928 ttttaatggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 161988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0623 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0623
Description:

Target: scaffold0623; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1248 - 1074
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1248 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 1149  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1148 gagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 1074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0366
Description:

Target: scaffold0366; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9491 - 9317
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  9491 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 9392  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  9391 gagcttgctctggctttaaatggggcccccgcaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcgattcttg 9317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0366; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12192 - 12019
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12192 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 12093  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   ||| |||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  12092 gagcttgctctggctttaa-atggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 12019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7501 - 7327
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7501 ggttggcctagtagttggcttgggatcttggagtttgctcctccagagatctcaggttcgattccctccggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 7402  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || || |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7401 gagctttctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 40330 - 40503
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  40330 ggttggcctagtggttggcttaggatcttggagtttgctccttcagaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 40429  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40430 gagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggt-ccctcggattagtcgattcttg 40503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41836 - 41662
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| || |||| |||||||||    
T  41836 ggttggcctagtggttgacttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattccctcttgttccaatttcgttgtgctaagtccataca 41737  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || ||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41736 gagcttgctctggctttaaacggggcccctgcaagtgggcaatgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 41662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 407 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 53057 - 52889
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagttt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||    
T  53057 cctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggcttcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggcaaaatccatacagagctt 52958  T
Q  507 gctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  52957 gctctggctttaaacggggcccccgcaggtgggcggtaggattggtcctctcggattagtcgattcttg 52889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 401 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 97558 - 97391
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  97558 ggttggcctagtggttggcttgggatcttgtagtttgctcctccaaaggtctcaggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctaagtccataca 97459  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
     || |||||||| |||||| | || ||||||||| || |||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  97458 gagcttgctctgactttaaacgggacccccgcaagtgggcggtgggattggtcctctcgtattagtcg 97391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 83; Significance: 5e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10885 - 10712
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10885 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccataca 10786  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   ||| |||| ||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  10785 gagcttgctctggctttaa-atggggccccacaagtggacggtgggattggtcccctcgaattagtcaattcttg 10712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0717 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0717
Description:

Target: scaffold0717; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 398 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 153 - 1
Alignment:
Q  398 ttcggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccat 497  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||||    
T  153 ttcggttggcctagtggttggcttgtgatcttggagtttgctcgtccagaggtctcaggttcgattccctcttatgtcaatttcgatgggctaagtccat 54  T
Q  498 acaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattg 550  Q
    ||| |||||||||| ||||||| | |||||||| ||  || ||||||||||||    
T  53 acagagtttgctctagctttaaacggggcccccacatgtgggcggtgggattg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 435 - 575
Target Start/End: Original strand, 39131 - 39271
Alignment:
Q  435 ttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaa 534  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  39131 ttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcggtgggctatgtccatacagaacttgttctggctttaaacggggcccccgcaa 39230  T
Q  535 atgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39231 gtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcgattcttg 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 408 - 568
Target Start/End: Original strand, 66774 - 66926
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttg 507  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||        | |||    
T  66774 ctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccaaaggtctcacgttcgattccttctggtgccaattttggtgggctaagtc--------gcttg 66865  T
Q  508 ctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcg 568  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  66866 ctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtcg 66926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 401 - 575
Target Start/End: Original strand, 14996 - 15169
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccataca 500  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||| || |||||| ||    
T  14996 ggttggcctagtggttggcctgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcaattccctctggtgctaatttcggtgggttaagtccatcca 15095  T
Q  501 aagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     || |||||||||||||||   || ||||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15096 gagcttgctctggctttaaatgggccccccgcaagtgggcgg-gggattggtctcctcggattagtcaattcttg 15169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 455 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13182 - 13065
Alignment:
Q  455 ggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcc 554  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||||||||| || |||||    |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  13182 ggttcgattccctctggtgccaatttcggtgggttaagtccatacagagcttgcta---ctttaaacggggcccccgcaagtggacggtgggattgatcc 13086  T
Q  555 cctcggattagtcgattcttg 575  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  13085 cctcagattagttgattcttg 13065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 420 - 575
Target Start/End: Original strand, 20246 - 20400
Alignment:
Q  420 ttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaa 519  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  20246 ttgggatcttggagtttgctccttcaaaggtctcaggtttgattccctctggtgccaatttcaatgggctaagtccatacatagcttgctctggctttaa 20345  T
Q  520 gcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
     | || ||||||||| || |||||   |||||| | |||||||||||| |||||||    
T  20346 acgggacccccgcaagtgggcggtaaaattgat-ctctcggattagtcaattcttg 20400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 450 - 575
Target Start/End: Original strand, 32342 - 32467
Alignment:
Q  450 tctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggatt 549  Q
    |||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    ||||||||||| || | |||||||||    
T  32342 tctcaggttcgatttcctctggagccaatttcggtgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaatgtggcccccgcaagtgggtggtgggatt 32441  T
Q  550 gatcccctcggattagtcgattcttg 575  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  32442 ggtcccctcggattagtcgattcttg 32467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 401 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8599 - 8512
Alignment:
Q  401 ggttgacctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggc 488  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  8599 ggttggcctagtggttggcttgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaggttcgattatctctggtgccaatttcggtgggc 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1175 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1175
Description:

Target: scaffold1175; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 484 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2452
Alignment:
Q  484 tgggctaggtccatacaaagtttgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtc 567  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2535 tgggctaagtccatacagagcttgctctggctttaaacggggcccccgcaagtgggcggtgggattggtcccctcggattagtc 2452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0460 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0460
Description:

Target: scaffold0460; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 409 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8363 - 8290
Alignment:
Q  409 tagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcg 482  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  8363 tagtggttggctcgggatcttggagtttgctcctccagaggtctcaagttcgattccctctggtgccaatttcg 8290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 407 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 12940 - 12884
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgatt 463  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12940 cctagtggttgacttgggatcttggagttcgctcctccagagatctcaggttcgatt 12884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 408 - 499
Target Start/End: Original strand, 27788 - 27879
Alignment:
Q  408 ctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatac 499  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| | || |||||||||   ||||||| ||||||||    
T  27788 ctagtggttggtttgggattttggagtttgctcctctcaaggtctcgggttcgattccctgtggtgccaatttgagtgggctaagtccatac 27879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 29328 - 29169
Alignment:
Q  407 cctagtgattggcttgggatcttggagtttgctcccccagaggtctcaggttcgattccttctgttgccaatttcgatgggctaggtccatacaaag-tt 505  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||| |   |||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||| | || || ||||||||| || ||    
T  29328 cctagtggttggcttggaatcttgaagtgtgttcctctcaaggtcttaggttcgattcccgctgatgccattttcggtcgg-taagtccatacagagctt 29230  T
Q  506 tgctctggctttaagcagggcccccgcaaatgagcggtgggattgatcccctcggattagtc 567  Q
    ||||||||||| ||   || ||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29229 tgctctggcttaaaat-ggacccccgcaaatggacagtgggattggtcccctcagattagtc 29169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University