View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12220_low_2 (Length: 461)

Name: NF12220_low_2
Description: NF12220
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12220_low_2
NF12220_low_2
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (46-447)||(35176657-35177049)
chr1 (21-444)||(49452417-49452837)
chr1 (17-444)||(47370923-47371347)
chr1 (21-441)||(3593562-3593980)
chr1 (17-429)||(25253865-25254288)
chr1 (18-444)||(42303749-42304159)
chr1 (17-444)||(49236360-49236775)
chr1 (25-249)||(32759440-32759665)
chr1 (20-386)||(48965873-48966225)
chr1 (187-393)||(28403501-28403707)
chr1 (34-230)||(19863426-19863621)
chr1 (40-195)||(28403325-28403481)
chr1 (93-251)||(2292702-2292860)
chr1 (93-251)||(8122465-8122620)
chr1 (105-247)||(15927574-15927715)
chr1 (40-248)||(5208690-5208899)
chr1 (288-444)||(32759723-32759879)
chr1 (195-350)||(19863274-19863427)
chr1 (17-256)||(8147829-8148069)
chr1 (40-256)||(41353908-41354124)
chr1 (40-256)||(26758103-26758319)
chr1 (17-256)||(11578495-11578734)
chr1 (40-256)||(1242701-1242915)
chr1 (21-251)||(42637520-42637748)
chr1 (72-251)||(226411-226580)
chr1 (17-119)||(15928237-15928339)
chr1 (19-156)||(49971046-49971183)
chr1 (19-156)||(52182629-52182765)
chr1 (21-121)||(27257615-27257715)
chr1 (47-142)||(50038036-50038131)
chr1 (40-160)||(4005930-4006051)
chr1 (37-216)||(40431778-40431958)
chr1 (74-160)||(18246993-18247080)
chr1 (74-160)||(51107765-51107852)
chr1 (76-246)||(46042389-46042558)
chr1 (44-160)||(9174453-9174570)
chr1 (287-362)||(226316-226391)
chr1 (16-66)||(2292620-2292670)
chr1 (102-156)||(35193691-35193745)
chr1 (173-245)||(21447210-21447281)
chr1 (21-108)||(33886350-33886437)
chr1 (21-108)||(33957815-33957902)
chr1 (40-96)||(43855068-43855124)
chr1 (289-357)||(46042298-46042366)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (17-444)||(24965845-24966270)
chr4 (18-429)||(32890213-32890623)
chr4 (16-429)||(29509414-29509825)
chr4 (16-394)||(46862297-46862674)
chr4 (96-444)||(33139117-33139471)
chr4 (18-335)||(26490631-26490945)
chr4 (17-391)||(50517490-50517841)
chr4 (18-249)||(12754822-12755055)
chr4 (106-389)||(35517960-35518232)
chr4 (125-251)||(14334826-14334952)
chr4 (105-251)||(26955764-26955910)
chr4 (18-256)||(29469630-29469868)
chr4 (21-150)||(53573698-53573827)
chr4 (40-248)||(41206795-41207003)
chr4 (40-256)||(42936999-42937214)
chr4 (316-444)||(46287033-46287162)
chr4 (82-216)||(22480176-22480311)
chr4 (40-256)||(8084658-8084874)
chr4 (21-156)||(872101-872236)
chr4 (18-96)||(33140992-33141070)
chr4 (82-243)||(40317098-40317257)
chr4 (82-243)||(40327172-40327331)
chr4 (74-236)||(23671015-23671179)
chr4 (21-99)||(4511416-4511494)
chr4 (16-121)||(55165995-55166100)
chr4 (22-142)||(24454187-24454307)
chr4 (72-251)||(21305826-21306004)
chr4 (29-103)||(26972983-26973057)
chr4 (88-132)||(2326463-2326507)
chr4 (18-66)||(17503268-17503316)
chr4 (40-108)||(25013988-25014056)
chr4 (361-444)||(53574002-53574084)
chr4 (287-332)||(24454027-24454072)
chr4 (309-362)||(25842626-25842679)
chr4 (195-251)||(4511521-4511577)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (21-431)||(49458701-49459111)
chr3 (17-430)||(4962064-4962474)
chr3 (21-428)||(7436915-7437310)
chr3 (21-442)||(33693590-33694012)
chr3 (18-441)||(43173228-43173640)
chr3 (52-388)||(21385878-21386210)
chr3 (19-251)||(1666394-1666626)
chr3 (15-256)||(53836425-53836666)
chr3 (40-256)||(49296581-49296797)
chr3 (17-119)||(24063942-24064043)
chr3 (55-216)||(9030497-9030658)
chr3 (82-217)||(27162864-27162999)
chr3 (105-216)||(32766503-32766614)
chr3 (22-140)||(30237957-30238075)
chr3 (40-194)||(22488484-22488639)
chr3 (21-121)||(25050208-25050308)
chr3 (34-142)||(25932028-25932135)
chr3 (89-150)||(21718190-21718251)
chr3 (21-66)||(32766616-32766661)
chr3 (22-66)||(27988295-27988339)
chr3 (74-119)||(1545266-1545311)
chr3 (44-119)||(8599560-8599635)
chr3 (21-108)||(47466876-47466962)
chr3 (287-332)||(21718358-21718403)
chr3 (175-216)||(30238099-30238140)
chr3 (40-96)||(27163017-27163073)
chr3 (40-108)||(27261896-27261963)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (17-444)||(29716256-29716679)
chr5 (93-251)||(15285950-15286108)
chr5 (18-241)||(35701748-35701970)
chr5 (40-216)||(31913917-31914093)
chr5 (40-216)||(3032651-3032828)
chr5 (42-245)||(4840884-4841090)
chr5 (17-251)||(5650170-5650405)
chr5 (40-256)||(37797536-37797752)
chr5 (296-444)||(34218754-34218901)
chr5 (40-256)||(28622585-28622802)
chr5 (103-251)||(16497370-16497518)
chr5 (49-216)||(36180045-36180213)
chr5 (82-216)||(31561412-31561546)
chr5 (40-216)||(16801125-16801299)
chr5 (18-142)||(29759236-29759359)
chr5 (17-160)||(7124269-7124413)
chr5 (18-217)||(21490141-21490332)
chr5 (19-142)||(16548570-16548693)
chr5 (21-108)||(25869313-25869400)
chr5 (304-363)||(36196016-36196075)
chr5 (287-362)||(5650424-5650499)
chr5 (129-212)||(40766846-40766929)
chr5 (287-325)||(21490055-21490093)
chr5 (309-362)||(15286137-15286190)
chr5 (288-349)||(31913805-31913866)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (17-436)||(9731275-9731698)
chr2 (17-444)||(31846520-31846945)
chr2 (21-444)||(40829956-40830375)
chr2 (18-444)||(34342566-34342990)
chr2 (17-279)||(42242285-42242546)
chr2 (21-238)||(18726975-18727192)
chr2 (109-444)||(38295180-38295502)
chr2 (18-322)||(2307910-2308212)
chr2 (93-251)||(30850870-30851028)
chr2 (40-256)||(18899321-18899537)
chr2 (16-121)||(38295062-38295167)
chr2 (47-216)||(28546229-28546398)
chr2 (108-216)||(37654841-37654949)
chr2 (74-236)||(15224523-15224686)
chr2 (287-401)||(18727263-18727377)
chr2 (54-251)||(37810300-37810496)
chr2 (287-362)||(32294259-32294334)
chr2 (130-216)||(2103814-2103900)
chr2 (18-165)||(43304630-43304777)
chr2 (27-156)||(3857911-3858040)
chr2 (289-362)||(37810514-37810587)
chr2 (18-66)||(43618147-43618195)
chr2 (43-142)||(24026394-24026493)
chr2 (17-66)||(32241840-32241889)
chr2 (37-136)||(2104259-2104359)
chr2 (21-85)||(13908629-13908693)
chr2 (309-357)||(24026204-24026252)
chr2 (22-129)||(37790322-37790427)
chr2 (287-332)||(3858321-3858366)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (21-436)||(27974323-27974737)
chr8 (21-436)||(28031592-28032006)
chr8 (18-444)||(12737437-12737861)
chr8 (18-429)||(42423542-42423952)
chr8 (17-393)||(8029207-8029578)
chr8 (22-324)||(6387259-6387559)
chr8 (19-444)||(12521762-12522183)
chr8 (23-391)||(3007178-3007534)
chr8 (18-324)||(41394306-41394610)
chr8 (72-359)||(44977138-44977419)
chr8 (17-406)||(24082559-24082935)
chr8 (103-390)||(27869376-27869663)
chr8 (16-238)||(18984857-18985079)
chr8 (197-444)||(27878144-27878389)
chr8 (197-444)||(28018325-28018570)
chr8 (197-444)||(27915088-27915333)
chr8 (197-444)||(27961507-27961752)
chr8 (50-201)||(27876479-27876630)
chr8 (50-201)||(28016660-28016811)
chr8 (40-256)||(19484680-19484896)
chr8 (40-251)||(33177265-33177472)
chr8 (21-109)||(26619984-26620072)
chr8 (21-105)||(27869131-27869215)
chr8 (40-246)||(4870542-4870747)
chr8 (22-142)||(35879986-35880106)
chr8 (138-247)||(35446919-35447028)
chr8 (316-444)||(6387748-6387876)
chr8 (47-142)||(24067422-24067517)
chr8 (289-362)||(33177492-33177565)
chr8 (287-332)||(7760954-7760999)
chr8 (287-332)||(17234873-17234918)
chr8 (287-332)||(35879826-35879871)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (17-400)||(23017350-23017731)
chr7 (21-394)||(21486508-21486880)
chr7 (17-394)||(42610884-42611265)
chr7 (49-444)||(16709860-16710237)
chr7 (49-444)||(17684096-17684473)
chr7 (21-444)||(43172388-43172819)
chr7 (72-337)||(31445774-31446035)
chr7 (21-225)||(5771541-5771743)
chr7 (40-249)||(37915475-37915684)
chr7 (40-216)||(1253906-1254082)
chr7 (40-256)||(14741918-14742134)
chr7 (22-216)||(6268976-6269170)
chr7 (99-216)||(42813708-42813825)
chr7 (180-251)||(42043815-42043886)
chr7 (40-256)||(4639296-4639508)
chr7 (298-404)||(5771747-5771852)
chr7 (40-156)||(33496794-33496910)
chr7 (21-156)||(27149293-27149428)
chr7 (22-120)||(26201210-26201308)
chr7 (21-108)||(21024590-21024677)
chr7 (287-325)||(33497002-33497040)
chr7 (309-362)||(1254162-1254215)
chr7 (40-108)||(14731775-14731843)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (16-426)||(16439041-16439440)
chr6 (40-444)||(28900209-28900609)
chr6 (22-251)||(31975112-31975341)
chr6 (20-394)||(31534463-31534826)
chr6 (187-436)||(2607238-2607485)
chr6 (17-180)||(24202688-24202851)
chr6 (93-228)||(32567757-32567892)
chr6 (289-429)||(33640896-33641036)
chr6 (17-210)||(2607485-2607678)
chr6 (289-444)||(24194794-24194949)
chr6 (72-251)||(21010341-21010520)
chr6 (180-251)||(24195562-24195633)
chr6 (182-251)||(15381124-15381193)
chr6 (18-156)||(28041995-28042130)
chr6 (40-160)||(6788943-6789064)
chr6 (25-99)||(32567663-32567737)
chr6 (406-444)||(31534823-31534861)
chr6 (42-107)||(1462807-1462872)
chr6 (21-85)||(31995709-31995773)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (72-444)||(89606-89977)
[»] scaffold0573 (1 HSPs)
scaffold0573 (40-444)||(9185-9585)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (17-201)||(136086-136270)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (40-119)||(16214-16293)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (100-160)||(38396-38456)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (21-66)||(4946-4991)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 46 - 447
Target Start/End: Original strand, 35176657 - 35177049
Alignment:
Q  46 gagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgattt 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35176657 gagtttacctaaaattaaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgattt 35176756  T
Q  146 aattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||    
T  35176757 aattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaa---------tcataa 35176847  T
Q  246 gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35176848 gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccaaaaaaagcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaa 35176947  T
Q  346 tttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccctc 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  35176948 tttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaacgtaaccctaaccggcgtcgcaatcaccgacgtcgaaatctgaatttccaccgtcggaatcgcaaccctc 35177047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 444
Target Start/End: Original strand, 49452417 - 49452837
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49452417 gtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcaggacatatataagttaatataatattgtaaat 49452516  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49452517 aggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaagataaattatatcaaactaccgtaataaaatattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatta 49452616  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaa 320  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  49452617 acgcaccaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatccaaaaaa--caagtttcacaagttcctaaatttgttaataaa 49452713  T
Q  321 actatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaat 420  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| | || ||||||||| ||| |    
T  49452714 actatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaacgacaacaaacactaccaccgcaaccctaaccggcgtcgcaataaacggcgtcgaaatatgact 49452813  T
Q  421 ttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| | |||| |||||||    
T  49452814 ttccaccgttggaatcgcaaccct 49452837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 47370923 - 47371347
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47370923 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatata-gttaatataatattgt 47371021  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47371022 aaatatgtcaataatgcaaaatatgacttaattaaaacggcaaattataccaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaacataaaa 47371121  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  47371122 attaacgcacaaaattataagtttcataagtct-ataagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcttaaagttgttaa 47371219  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |    
T  47371220 taaaacaatctaaaaaacaaactagttaatttcttcaaaaggtcaacgaacaccaccgccacaaccctaaccggcattgcaatcaccggcgtcgaaatct 47371319  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
     | ||||||||||||||||  |||||||    
T  47371320 aagtttccaccgtcgaaattgcaaccct 47371347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 3593980 - 3593562
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3593980 gtaaacttgacttgagaattcgtacgagattatctaaaattaaaattatataaaaattattatatgcatgacatatataagctaaaataatattgtaaat 3593881  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
      || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  3593880 tggtcaataattcaaaatatgacttaattacaaaggcaaattataccaaactaccataataaaacataatgttcaacttaacaccaaaatacaaaaatta 3593781  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaa 320  Q
      ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||||||       | ||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  3593780 gtgcacacaatcataagtttcttaagtctc-taagtttaagtcgttcataaaaccatcc-aaaaaagtaagtttcacaagtccgtaaagttgttaataaa 3593683  T
Q  321 actatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaat 420  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||  | ||||||||| |||||    
T  3593682 actatctaaaaaataaacttgttaatttcttcaaaaggtaaacaaacaccaacaccgcaaccctaaccggtgtcgcaatcattggcgtcgaaatctgaat 3593583  T
Q  421 ttccaccgtcgaaatcacaac 441  Q
    |||||| |||  |||||||||    
T  3593582 ttccactgtcagaatcacaac 3593562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25254288 - 25253865
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25254288 ctaggtaaactcgactcgagaacttgtacgagtttacctaaat-taaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctgatataatactgt 25254190  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactacca-----------taataaaatgttatgctcaacttagcatc 205  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25254189 aaataagtcaatattgcaaaatatgacttaattacaaaggcacattataccaaactaccaaaatgttatgctaataaaatgttatgctcaacttagcatc 25254090  T
Q  206 aaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcat 305  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||| |        |||||||| ||||||       
T  25254089 aaaaaacaaaaattagcgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagttcaagtcattcataaaaccat-caaaaataacaagtttctcaagtttcc 25253992  T
Q  306 aatgttgttaataaaactatctaaaa---attaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcac 402  Q
    || |||||||||||||||||||||||   | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||   | |||| |||||||    
T  25253991 aaagttgttaataaaactatctaaaaaataataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctatttgacgtcgcaatcac 25253892  T
Q  403 cgacgtcgaaatttgaatttccaccgt 429  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||    
T  25253891 cggcgtcgaaatatgaatttccaccgt 25253865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Original strand, 42303749 - 42304159
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatat--gcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42303749 taggtaaattcgactcgagaactcgtatgactttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatgcatgacatatgtaagttaatataatattg 42303848  T
Q  116 taaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42303849 taaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaagacaaattata--------ccataataaaatgttatgctcaacttagcttcaaaatacaaa 42303940  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgtta 315  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||          ||||||| || || ||||||||||||||       | ||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  42303941 aattaacgcacaaaatcataagtctc----------taagtttaagccatccataaaaccatccaaaaaaagaaagtttcacaagttcctaaagttatta 42304030  T
Q  316 ataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatt 415  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||     
T  42304031 ataaaactatctaaaaaataaagtagttaatttcttcaaaacgtcaacaaacaccaccacaacaaccctaaccagtgtcacaatcaccggcgttgaaata 42304130  T
Q  416 tgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42304131 tgaatttccaccgtctgaatcacaaccct 42304159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 49236360 - 49236775
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||  ||||||          ||||||||||||||    
T  49236360 ctaggtaaactcgactcgaaaactcgtacgagtttacataaaattaaaattatataaaatttattatacacatgac----------taatataatattgt 49236449  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49236450 aaataggtcaatagtgcaaaatatggcttaataacaaagaaaaattatactaaactaccataataaaacgttatgctctacttagcatcaaaatacaaaa 49236549  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||||       | |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  49236550 attaacgtccaaaatcataagtttcataagtc-cctaagtttaagccatccataaaaccatcc-aaaaaagaaagtttcataagttcctaaagttgttaa 49236647  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||| ||||  |||||| |||||||||||| |    
T  49236648 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttctttaaaaggtcaacaaataccaccacagcaaccataaccagcgttgcaatcatcgacgtcgaaatct 49236747  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  49236748 gaattttcaccgtcgaaatcgcaaccct 49236775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 249
Target Start/End: Original strand, 32759440 - 32759665
Alignment:
Q  25 actcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatga-tccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataag 123  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  32759440 actcgactcgagaattcgtacgaatttacctaaaataaaaattaatataaaatttattatatgcaagatatatataagctaatataatatcgtaaatagg 32759539  T
Q  124 ttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacg 223  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32759540 tcaatagtacaaaatatgacttaattacaaaggcaaattataccaaactaccataataaaacgttatgctaaacttagcatcaaaatacaaaaattaacg 32759639  T
Q  224 cacaaaatcataagtttcataagtct 249  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  32759640 cacaaaatcatatgtttcataagtct 32759665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 20 - 386
Target Start/End: Original strand, 48965873 - 48966225
Alignment:
Q  20 ggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaa 119  Q
    ||||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  48965873 ggtaaactcaactcgagaactcctacgagttaacctaaaattaaaattatataaaatttac-atatgcaagacatatgtaaactaatataatattgtaaa 48965971  T
Q  120 taagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatt 219  Q
    ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  48965972 tagatcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcaaattatactaaactaccataataaaacattatgttcaacttagcatcaaaatacaaaaa-- 48966069  T
Q  220 cacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc---nnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
         | ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||          | ||||||||||| ||       | | |||    
T  48966070 -----ataaaatcataagtttcataagtct-ttaagtttaagccatccat-aaaccatccaaaaaaaaaaggaagtttcacaattt-------tcgctaa 48966155  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaa 386  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  48966156 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaa 48966225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 393
Target Start/End: Original strand, 28403501 - 28403707
Alignment:
Q  187 ttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc-nnnnnn 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||           
T  28403501 ttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaatcataattttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatccaaaaaaa 28403599  T
Q  286 ngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaacccta 385  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||    
T  28403600 atcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatttaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccactaccgcaatccta 28403699  T
Q  386 accggcgt 393  Q
    ||||||||    
T  28403700 accggcgt 28403707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 34 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19863621 - 19863426
Alignment:
Q  34 gagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgc 133  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||     
T  19863621 gagaactcgtacgagtttaactaaaattaaaattatataaaatt-attatatgcatgacatacataagctaatataatattgtaaatagatcaatagtgt 19863523  T
Q  134 aaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaa 230  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19863522 aaaatatgacataattacaaagacaaattatattaaactaccataataaaatgttatgctcaacttaacatcaaaatacaaaaattaatgcacaaaa 19863426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 195
Target Start/End: Original strand, 28403325 - 28403481
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaat-ataatattgtaaataagttaatagtgcaaaat 138  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28403325 tcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaattataatattgtaaatatgtcaatagtgcaaaat 28403424  T
Q  139 atgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctca 195  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28403425 atgacttaattacaaagaaaaattataccaaactaccataataaaactttatgctca 28403481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 251
Target Start/End: Original strand, 2292702 - 2292860
Alignment:
Q  93 atatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgc 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||     
T  2292702 atatataagctaataaaatattttaaataggtcaatattgcaaaatatgacttaattacaaatgcaaactataccaaactaccataataaaacgttatgt 2292801  T
Q  193 tcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  2292802 tcaacttagcgtcaaaatacaaaaattaacgcacaaaatcacaagtttcttgagtctct 2292860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8122620 - 8122465
Alignment:
Q  93 atatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgc 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||    
T  8122620 atatataaggtaatataatattgtaaacaggtcaatagtgtaaaatatgacttacttacaaaggcaaattataccaaactactattataaaacgttatgc 8122521  T
Q  193 tcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  8122520 tcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacac---aaatcataagtttcacaagtctct 8122465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15927715 - 15927574
Alignment:
Q  105 atataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcat 204  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  15927715 atataatattgtaaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaagacaaattataccaaactactataataaaatg-tattctcaatttagcat 15927617  T
Q  205 caaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagt 247  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15927616 caaaatataaaaattaacgcaaaaaatcataaatttcataagt 15927574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Original strand, 5208690 - 5208899
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||||    
T  5208690 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatgtgcatgacatatataagctaatataatatcgtaaaaagattaatagtgaaaaata 5208789  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||    
T  5208790 tagacttaattataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataagt 5208889  T
Q  239 ttcataagtc 248  Q
    ||||||||||    
T  5208890 ttcataagtc 5208899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 288 - 444
Target Start/End: Original strand, 32759723 - 32759879
Alignment:
Q  288 caagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaac 387  Q
    ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||    
T  32759723 caagttttacaagttcaaaaaattgttaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaatggtcaacaaacaccacccccgcaaccctaac 32759822  T
Q  388 cggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  32759823 cgatgtcgcaatcaccggcgtcgaaatctgaattttcaccgtcggaatcgcaaccct 32759879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19863427 - 19863274
Alignment:
Q  195 aacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagttt 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||    
T  19863427 aacttaacatcaaaatacaaaaattaatgcacgaaatcataagtttcataaatc-cctaagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagttt 19863330  T
Q  295 cacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttct 350  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  19863329 cacaagttcctaaagttgttaataaaactatctaaaaaataaactagtaaatttct 19863274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8148069 - 8147829
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||    
T  8148069 ctaggtaaactcgaatcgtaaactcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataataccgt 8147971  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaa-tgttatgctcaacttagcatcaaaatacaa 214  Q
    ||| |  | ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  8147970 aaaaagatcaatagtgaaaaatatagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaa 8147871  T
Q  215 aaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  8147870 aaattaacacacaaaagcataggtttcataagtctctaaagt 8147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41354124 - 41353908
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  41354124 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 41354026  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| | | ||||| || | ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  41354025 tagacttacttatatatgcaaagtaaaccaaactaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 41353926  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  41353925 ttcataagtctctaaagt 41353908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26758319 - 26758103
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  26758319 tcgtacaagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 26758221  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| | ||| |||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  26758220 tagacttacttataaatgcaaagtgtagaaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 26758121  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  26758120 ttcataagtctctaaagt 26758103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 256
Target Start/End: Original strand, 11578495 - 11578734
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||| | |  || |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||  ||     
T  11578495 ctaggtaaactcgaatcgtaaactcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatggaagctaatataatgctgg 11578593  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    ||| |  | ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  11578594 aaaaagatcaatagtgaaaaatatagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaa 11578693  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagt 256  Q
    |||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  11578694 aattaacacacaaaagcataggtttcataagtctctaaagt 11578734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 1242701 - 1242915
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  |  | ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  1242701 tcgtacgagtttacctaagattaaaattttatacaatttattatatgcat---atatgtaagctaatataattctgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 1242797  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  1242798 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 1242897  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  1242898 ttcataagtctctaaagt 1242915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Original strand, 42637520 - 42637748
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||| |||  || ||||| |||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  42637520 gtaaactcgaattgtaaactcgtatgagtttacctaaaattaaaattatataaa-tttattatatacatgacatatataagctaatataatattacaaat 42637618  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagca-aactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatt 219  Q
    | || ||||||  ||||||| | || |||| ||||  ||| ||| ||| ||||||  |||||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42637619 aggtcaatagtataaaatataacttgattataaagataaaatat-gcataactacggtaataaagagttacgttcaacttagcatcaaaatac-aaaatt 42637716  T
Q  220 cacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
     ||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  42637717 aacttgcaaaatcataagtttcataagactct 42637748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 226580 - 226411
Alignment:
Q  72 aaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaac 171  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||| || | ||         || |    
T  226580 aaaatttattatatacgtgacatatataagctaatataatattgcaaataggtcaatagtgcaaaatatgacttgattataatgaca---------aagc 226490  T
Q  172 taccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
     |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  226489 caccataataaagagttatgttcaacttagcatcaaaatac-aaaattaacttgcaaaatcataagtttcataagactct 226411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15928339 - 15928237
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  15928339 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattagaattatataaaatttaatatatgcaagacatatacaagctaatataatattct 15928240  T
Q  117 aaa 119  Q
    |||    
T  15928239 aaa 15928237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 49971046 - 49971183
Alignment:
Q  19 aggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaa 118  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||| || | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  49971046 aggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattaaataaagtttattatttacatgacatatgtaaactaatatagtattgtaa 49971145  T
Q  119 ataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    |||    |||||| |||||||||| | ||||| |||||    
T  49971146 atagtcgaatagtacaaaatatgactaaattataaagg 49971183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52182765 - 52182629
Alignment:
Q  19 aggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaa 118  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||||||  ||||| |||||| |   ||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  52182765 aggtaaactcgattcgagaacttgtacgagtttatttaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgacatatgtaaactaatataatattgtaa 52182666  T
Q  119 ataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    |||   ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  52182665 atagtctaatagtgc-aaatatgattaaattataaagg 52182629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 27257615 - 27257715
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    |||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27257615 gtaaactcgactcgagaactcttacgagtttacctaaaattaaaattaaattaaatttattatttacatgacatatctaaactaatataatattgtaaat 27257714  T
Q  121 a 121  Q
    |    
T  27257715 a 27257715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 50038036 - 50038131
Alignment:
Q  47 agtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatga 142  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||    
T  50038036 agtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacatgacatatgtaagctggtataatattacaaacatgttaatagtgcaaaatatga 50038131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4006051 - 4005930
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  4006051 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 4005952  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaa 160  Q
    | || ||||||| ||| |||||    
T  4005951 tagacttaattataaatgcaaa 4005930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Original strand, 40431778 - 40431958
Alignment:
Q  37 aattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataa-tattgtaaataagttaatagtgcaa 135  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||| ||   |||||||| |||| | || |||||||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  40431778 aatttgtacgagtttatctaaaattaaaattatatcaaatttattatatacgtggcatatataaaataatctaaatattataaataggtcaatagtgcaa 40431877  T
Q  136 aatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| | | ||||| | ||||||| ||||   ||| | |||||||||  |||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  40431878 aatattactcaattatagaggcaaaatatattcaacaatcataataaagcgttatgtttaacttaacatcaaaatacaaaa 40431958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 160
Target Start/End: Original strand, 18246993 - 18247080
Alignment:
Q  74 aatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaa 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  18246993 aatttattatatgcatgacatatataagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaatatagacttaattataaatgcaaa 18247080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 51107852 - 51107765
Alignment:
Q  74 aatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaa 160  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  51107852 aatttattatatgcatgacatatataagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaatatagacttaattataaatgcaaa 51107765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 46042558 - 46042389
Alignment:
Q  76 tttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactacc 175  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||| || ||| |||||| |||  | ||||||| |||| |||| ||||   ||| | |    
T  46042558 tttattatatacatgacatgtgtaagctaatataatattgctaataggtcaatggtgcaacataaaacttaattataaagacaaagtatacataaccatc 46042459  T
Q  176 ataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataag 246  Q
    |||| |||  |||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||    
T  46042458 ataacaaagagttatgtttaacttaacatcaaaatacaaaaa-taacttgcaaaatcataagtttcataag 46042389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9174570 - 9174453
Alignment:
Q  44 acgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatat-ga 142  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||| ||    
T  9174570 acgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaatataga 9174471  T
Q  143 tttaattacaaaggcaaa 160  Q
     ||||||| ||| |||||    
T  9174470 cttaattataaatgcaaa 9174453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 226391 - 226316
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    |||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  226391 gcaagtttcataagtttctaaagttgttaataaacctatctaaaaaataaactagttaattttttcaaaagttcaa 226316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 66
Target Start/End: Original strand, 2292620 - 2292670
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2292620 tctaggtaaactcgactcgggaactcgtacgagtttacctaaaattaaaat 2292670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35193745 - 35193691
Alignment:
Q  102 ctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  35193745 ctaatataatattgtaaatagtttaatagtgcaaaatatgactaaattataaagg 35193691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21447281 - 21447210
Alignment:
Q  173 accataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataa 245  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||| || | || |||||||||||||||||    
T  21447281 accataataaagcgatatgctcaacttagcatcaaaata-aacaattaactcgcataatcataagtttcataa 21447210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 33886350 - 33886437
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  33886350 gtaaattcgacttgtaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatatagcatatgtaagctaatat 33886437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 33957902 - 33957815
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  33957902 gtaaattcgacttgtaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatatagcatatgtaagctaatat 33957815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 43855124 - 43855068
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatat 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||  ||| ||||||||||    
T  43855124 tcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttatagtatacatgacatat 43855068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 289 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 46042366 - 46042298
Alignment:
Q  289 aagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaag 357  Q
    ||||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  46042366 aagtttcacaattttctaaagttgttaataaacctatccaaaaaataaactagttaatttcgtcaaaag 46042298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 24965845 - 24966270
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24965845 ctaggtaaactcgactcgagaactcatacgagtttatctaaaattaaaataatataaaatttattatatgcatgacatatata-gctaatataatattgt 24965943  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24965944 aaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaacgacaaattataccaaactaccataataaaacgttatgctcaacttaacatcaaaataccaaa 24966043  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24966044 attaacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagtttaaatcatccataaaaccatccaaaaaaa-caagtttcacaagttcctaaagttgttaa 24966142  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  ||||| ||| ||||||||| |    
T  24966143 taaaactatctaaaaaacaaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaaccggcattgcaatctccggcgtcgaaatct 24966242  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||    
T  24966243 aagtttccaccgtcgaaatcgcaaccct 24966270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32890623 - 32890213
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| |||||||    
T  32890623 taggtaaactcgacttgataactcgtacgagtttacctaaaattaaaattattttaaatttattatatgcaagatatatgtaagctaatatattattgta 32890524  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    |||| || ||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890523 aataggtcaatagtgcaaaatataacttaattacaaggacaaattataccaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 32890424  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc-nnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||        | |||||||| || ||| ||| ||||||||    
T  32890423 ttaacgcccaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccat-aaaccatccaaaaaaaaggaagtttcaaaatttcctaaagttgttaa 32890326  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32890325 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaaccggcgtcgcaatcaccgacgtcgaaatat 32890226  T
Q  417 gaatttccaccgt 429  Q
    |||||||||||||    
T  32890225 gaatttccaccgt 32890213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 16 - 429
Target Start/End: Original strand, 29509414 - 29509825
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  29509414 tctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatattaaatttattatatgcaagacatatgtaagctaatatattattg 29509513  T
Q  116 taaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29509514 taaataggtcaatagtgcaaaatataacttaattacaagggcaaattataccaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 29509613  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgtta 315  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||       | ||||||||||| ||| | | |||||||    
T  29509614 aattaacgcccaaaatcataagtttcatgagtctc-taagtttaagtcatccat-aaaccatccaaaaaaaggaagtttcacaatttccttaagttgtta 29509711  T
Q  316 ataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatt 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |     
T  29509712 ataaaactatctaaaaaataaaccagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaactggcgtcgcaatcaccggcgttgaactc 29509811  T
Q  416 tgaatttccaccgt 429  Q
    ||||||||||||||    
T  29509812 tgaatttccaccgt 29509825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 394
Target Start/End: Original strand, 46862297 - 46862674
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    |||||||||| |||| | ||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |   ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46862297 tctaggtaaattcgattcgagaactctgacgagtttacctaaaattaaaattacagaaaatttactatatgcaagacatatataagctaatataatattg 46862396  T
Q  116 taaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    |||||| || || | | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46862397 taaataggtcaacaatacaaaatatgacttaattacaaaggcaaattatatcaaactaccataataaaacattatactcaacttagcatcaaaatacaaa 46862496  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgtta 315  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  46862497 gattaacacacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaatcatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcttaaagttgtta 46862594  T
Q  316 ataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttc-aaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtc 394  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  46862595 ataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaaggtcaacaaacactaccaccgcaaccctaaccgacgtc 46862674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 96 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 33139471 - 33139117
Alignment:
Q  96 tataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattata-------gcaaactaccataataaaatgtt 188  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||| |||    
T  33139471 tataaactaatataatattatagataggtcaataatgcaaaatatgacttaattacaaaggaaaattataccaaactgcaaactaccataataaaacgtt 33139372  T
Q  189 atgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngc 288  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||  |||||||||||||       ||    
T  33139371 atgctcaacgtagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaatcataagtttcataagtctct-aagtttaatccatgcataaaaccatccaaaata-gc 33139274  T
Q  289 aagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaat-taaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaac 387  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  33139273 aagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatctaaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaac 33139174  T
Q  388 cggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||  |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33139173 cggcgttgcaatcatcggagtcgaaatctgaatttccaccgtcggaatcacaaccct 33139117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 335
Target Start/End: Original strand, 26490631 - 26490945
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  26490631 taggtaaactcgattcgagaactcatacgagtttacctaaaattaaaattatataaagtttattatatgcatgacatatataagctaatatgatattgt- 26490729  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaa---actaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaa 214  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||   ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  26490730 aataggttaatagtgtaaaatatgacttaattacaaagaaaaattatgtcaaactactaccataataaaatgtta---tcaacttaacatcaaaatacaa 26490826  T
Q  215 aaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgtt 314  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26490827 aaattaatgtacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgtt 26490924  T
Q  315 aataaaactatctaaaaatta 335  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26490925 aataaaactatctaaaaatta 26490945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 50517841 - 50517490
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||| |||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  50517841 ctaggtaaactcgactcgagaactcatatgagtttatctaaaattaaaattatataaaatttatcatatgcaagacatatataagctaatataatattat 50517742  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50517741 aaatagatcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcgaattacattaaactaccataataaaatattatgctcaacttaacatcaaaatacaaaa 50517642  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| || ||||||||||||||||||          ||||||| || || ||| ||||             |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  50517641 attaacacacaaaatcataagtttc----------taagtttaagccatccaaaaaa-------------gcaaatttcacaagttcctaaagttgttaa 50517565  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggc 391  Q
    |||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50517564 taaatccatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaaccggc 50517490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12755055 - 12754822
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacat--atataagctaatataatattg 115  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||  |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  12755055 taggtaaactcgactcgagacctcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattgtatgcatgccatgtatataaggtaatataatattg 12754956  T
Q  116 taaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  12754955 taaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaatttcaaaggcaaattataccaaactaccataataaaacgttacgctcaacctaacatcaaaatacaaa 12754856  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtct 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12754855 aattaacgcacaaaatcataagtttcataagtct 12754822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 389
Target Start/End: Original strand, 35517960 - 35518232
Alignment:
Q  106 tataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatc 205  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35517960 tataatattgtaaatagattaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcaagttaaaccagattaccataataaaatattatgttcaacttagcatc 35518059  T
Q  206 aaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcat 305  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |  |||||||||||         ||     |||| ||  |    
T  35518060 aaaatacaaaaattagcacataaaatcataagtttcataagtctc-taaatttaagtcatctgtaaaaccatccaaaa-----aa-----acaaatttct 35518148  T
Q  306 aatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccg 389  Q
    || |||||||||||||||||  || || |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  35518149 aaagttgttaataaaactattcaataaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaataccaccaccgcaaccctaaccg 35518232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 125 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14334952 - 14334826
Alignment:
Q  125 taatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgc 224  Q
    ||||| || ||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  14334952 taatattgtaaattatgacttacttacaaaggcaaattatatcaaactaccattataaaacgttatgctcaactaagcatcaaaatacaaaaattaatgc 14334853  T
Q  225 acaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  14334852 aaaaaatcataagtttcataagtctct 14334826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26955910 - 26955764
Alignment:
Q  105 atataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcat 204  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26955910 atataatagtgtaaataggtcaaaagtgcaaaatatgacttaattacaaagataaaatatatcaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcat 26955811  T
Q  205 caaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  26955810 caaaatataaaaactaacgcacaaaatcataatcttcttaagtctct 26955764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29469868 - 29469630
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29469868 taggtaaactcgactcgtaaactcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgta 29469770  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    || |  | ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  29469769 aaaagatcaatagtgaaaaatatagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaa 29469670  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  29469669 attaacacacaaaagcataggtttcataagtctctaaagt 29469630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 150
Target Start/End: Original strand, 53573698 - 53573827
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53573698 gtaaactcgacttaagaactcgtacgagtttacctagaaataaaattatatacaatttattatatgcatgacatatgtaaactaatataatattgtaaat 53573797  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaatta 150  Q
    |    ||||||||||||||||| |||||||    
T  53573798 agaacaatagtgcaaaatatgacttaatta 53573827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 40 - 248
Target Start/End: Original strand, 41206795 - 41207003
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||| ||  | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||    
T  41206795 tcgtacgagtttacttaatattaaaattatgtacaatttattatatacatgacatatgtaagctaatataatattgtaaatatgtcaatattataaaata 41206894  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtt 239  Q
    ||| || |||| || | || | |||| | ||  | | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  41206895 tgacttgattataatgacagagtatacccaatcatcttaataaagtgttatgttcaacttaacatcaaaacataaaaattaacgcataaaataataagtt 41206994  T
Q  240 tcataagtc 248  Q
    |||||||||    
T  41206995 tcataagtc 41207003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 42936999 - 42937214
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||  | | ||||||| ||||||    
T  42936999 tcgtacgagtctacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatggcatatgtaaactaatataatactgtaaaaga-tcaatagtgaaaaata 42937097  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  42937098 tagacttaattataaatgcaaagtataccaaactaccataaaaaaatgt-atgcttcacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 42937196  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  42937197 tacataagtctctaaagt 42937214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 46287162 - 46287033
Alignment:
Q  316 ataaaactatctaaaaat-taaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaat 414  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||| |  ||||||||    
T  46287162 ataaaactatctaaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacatcaccaccgcaaccctaaccgacgtcgcaatcacgggagtcgaaat 46287063  T
Q  415 ttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  46287062 ttgaatttccatcgttggaatcgcaaccct 46287033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22480311 - 22480176
Alignment:
Q  82 atatgcatgacatatataagctaatataa-tattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataat 180  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||   ||||||| ||||    
T  22480311 atatacatgacatatgtaagccaatataaatattgtaaatatgtcaattgtgcaaaatatgacttaattataaagacaaagtatatacaactaccgtaat 22480212  T
Q  181 aaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22480211 aaaacattatgctcaacttatcatcaaaatacaaaa 22480176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8084874 - 8084658
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | || |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |  | ||||||| ||||||    
T  8084874 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaacttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactataaaaagatcaatagtgaaaaata 8084776  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| | ||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  8084775 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccatcataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 8084676  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  8084675 ttcataagtctctaaagt 8084658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 872236 - 872101
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |   ||| ||||| || | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  872236 gtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattaaaaaaattttattatttacatgagatatgtaaactaatataatattgtaaat 872137  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    |    ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  872136 agtccaatagtgcaaaatatgactaaattataaagg 872101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 33141070 - 33140992
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatat 96  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  33141070 taggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatat 33140992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 40317098 - 40317257
Alignment:
Q  82 atatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataata 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||  |||   ||| || ||||||    
T  40317098 atatacatgacatatgtaagctaatataatattgcaaataggtcaatagtgcaaaatataacttaattataaa-acaaagcatacataaccactataata 40317196  T
Q  182 aaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcat 243  Q
    ||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  40317197 aatagttatgttcaacttagaatcaaaatac-aaaattaacttgcaaaatcataagtttcat 40317257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 243
Target Start/End: Original strand, 40327172 - 40327331
Alignment:
Q  82 atatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataata 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||  ||||  |||   ||| || ||||||    
T  40327172 atatacatgacatatgtaagctaatataatattgcaaataggtcaatagtgcaaaatataacttaattataaa-acaaagcatacataaccactataata 40327270  T
Q  182 aaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcat 243  Q
    ||  |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||    
T  40327271 aatagttatgttcaacttagaatcaaaatac-aaaattaacttgcaaaatcataagtttcat 40327331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 236
Target Start/End: Original strand, 23671015 - 23671179
Alignment:
Q  74 aatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaact 172  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||| ||| ||||||| || ||||||| ||| | ||| |||| |||||     
T  23671015 aatttattatatccatgacatatgtaagctaatataatattgtaaaaagatcaattgtgaaaaatatagacttaattataaatgtaaagtataccaaacc 23671114  T
Q  173 accataataaaa-tgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataa 236  Q
    || |||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  23671115 actataaaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataa 23671179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Original strand, 4511416 - 4511494
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatata 99  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4511416 gtaaactcgtcttgagaaatcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttactatatgcatgacatatata 4511494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 55166100 - 55165995
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   ||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  55166100 tctaggtaaactagatttgagaactcgtatgagtttacttaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgacatatataaactaatataaaattg 55166001  T
Q  116 taaata 121  Q
    ||||||    
T  55166000 taaata 55165995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24454307 - 24454187
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |   ||||||||| || | |||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||    
T  24454307 taaactcgacttgagaactcgtacgagtttatctaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgacatatgtaaactactgtaatattgaaaata 24454208  T
Q  122 agttaatagtgcaaaatatga 142  Q
      | ||||||||| |||||||    
T  24454207 gttcaatagtgcataatatga 24454187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Original strand, 21305826 - 21306004
Alignment:
Q  72 aaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaac 171  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| | || |||||| |||||||  ||||| |  ||| ||| |||||||||  |||||| |||| |||| ||||   ||     
T  21305826 aaaatttattatatacataacatttgtatgctaatgtaatattaaaaataggccaatggtgaaaaatatgacataattataaagacaaagtatacataat 21305925  T
Q  172 taccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
     |||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||| |||||    
T  21305926 caccataataaagagttgtgttcaacttagcgtcaaaatac-aaaattaacttacaaaatcgtaagtttcataaatctct 21306004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 26973057 - 26972983
Alignment:
Q  29 gacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagct 103  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  26973057 gactcgagaactcgtacgagtttaccttaaattaaaattatataaaatttatcatttgcatgatatatataagct 26972983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 132
Target Start/End: Original strand, 2326463 - 2326507
Alignment:
Q  88 atgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  2326463 atgacatatataagctaatataatattataaataggtcaatagtg 2326507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Original strand, 17503268 - 17503316
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17503268 taggtaaactcgactcgagaactcgtatgagtttacctaaaattaaaat 17503316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25014056 - 25013988
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||    
T  25014056 tcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatataacatatttaagctaatat 25013988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 444
Target Start/End: Original strand, 53574002 - 53574084
Alignment:
Q  361 aacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  53574002 aacaaacaccaccaccgcaacc-taaccggcgtagcaatcaacaatgtcgaaatcggaatttccaccgtcggaatcagaaccct 53574084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24454072 - 24454027
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaa 332  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24454072 gcaagtttcacacgttcctaacgttgttaataaaactatataaaaa 24454027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Original strand, 25842626 - 25842679
Alignment:
Q  309 gttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  25842626 gttgttaataaagctatccaaaaaataaactagttaatttcttcaaaagatcaa 25842679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 251
Target Start/End: Original strand, 4511521 - 4511577
Alignment:
Q  195 aacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4511521 aacttaacatcaaaatacaaaaattaactaaaaaaatcatgagttttataagtctct 4511577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 21 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 49459111 - 49458701
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatata--agctaatataatattgtaa 118  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49459111 gtaaacttgactcgagaattcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcaagccatatatataagctaatataatattgtaa 49459012  T
Q  119 ataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaat 218  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49459011 ataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaagggaaattatatcaaactaccatagtaaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaat 49458912  T
Q  219 tcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaata 318  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  49458911 taacgcacaaaatcataaatttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatccaaaaaat-caagtttcacaagttcctaaagttgttaata 49458814  T
Q  319 aaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttga 418  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||    
T  49458813 aaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacactaccaccacaaccctaaccggcgacgcaatcaccgacgtcgatatatga 49458714  T
Q  419 atttccaccgtcg 431  Q
    |||||||||||||    
T  49458713 atttccaccgtcg 49458701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 430
Target Start/End: Original strand, 4962064 - 4962474
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4962064 ctaggtaaactcgactcgagaacttg-acgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 4962162  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4962163 aaataggtcaataatgcaaaatatgacttaattaccaagataaattataccaaactaccgtaataaaatgttatgttcaacttagcatcaaaatacaaaa 4962262  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  4962263 attaacgcacaaaatcataagtttcacaagtctc-taagtttaagccttccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgtcaa 4962360  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||||| ||| |||||||  |    
T  4962361 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggttaacaaacaccaccaccgcaaccctaaccaacgtcgcaatcatcgatgtcgaaacat 4962460  T
Q  417 gaatttccaccgtc 430  Q
    ||||||||||||||    
T  4962461 gaatttccaccgtc 4962474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 428
Target Start/End: Original strand, 7436915 - 7437310
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7436915 gtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 7437014  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7437015 aagtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaagacaaattatatcaaactaccataataaaacgttatgcttaacttagcatcaaaatacaaaaatta 7437114  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaa 320  Q
    |||||||||||||||||| |          |||||||| || || ||||||||||||||        ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  7437115 acgcacaaaatcataagtct----------ttaagtttaagccatccataaaaccatccaaaaaa--caagtttaacaagttcctaaagttgttaataaa 7437202  T
Q  321 actatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaat 420  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  7437203 actatctaaaaaataaactagttaattacttcaaaaagtaaacaaacaccaccaccgcaactctaaccagcgtcgcaatcactgacgtcgaaatctgaat 7437302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33694012 - 33693590
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33694012 gtaaactcaactcgagaactcgtacgagtttaccaaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 33693913  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaa---tgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  33693912 agggcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcaaattataccaaactatcataataaaacgtcgttatactcaacttaacatcaaaatacaaaaa 33693813  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaat 317  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33693812 ttaacgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagccatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaat 33693715  T
Q  318 aaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttg 417  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||  ||||||| ||||||| | | | ||||| ||    
T  33693714 aaaactatctaaaaaataaactacttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccactgcaaccgtagtcggcgtcgcaatcacaggcattgaaatctg 33693615  T
Q  418 aatttccaccgtcgaaatcacaacc 442  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||    
T  33693614 aattttccccgtcgaaattacaacc 33693590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 43173640 - 43173228
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43173640 taggtaaactcgactcgagaactcgtatgagtttacataaaattaaaattacataaaatttattatatgcatgacatgtataagctaatataatattgta 43173541  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    |||| || ||||||||||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43173540 aataggtcaatagtgcaaaatatgacttgaatacaaaagcaaaatataacaaactaccatgataaaacgttatgctcaacttaacatcaaaatacgaaaa 43173441  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaat 317  Q
    || |||||||||||||||||||||          ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  43173440 ttaacgcacaaaatcataagtttc----------taagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcaccagttcctaaagttgttaat 43173352  T
Q  318 aaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttg 417  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| || ||||||||  ||||||||| ||    
T  43173351 aaaactatctaaaaaataaattagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccgccgccgcaaccctaaccggcatcgcaatcaccagcgtcgaaatatg 43173252  T
Q  418 aatttccaccgtcgaaatcacaac 441  Q
    | |||| | ||||| |||| ||||    
T  43173251 agtttctatcgtcggaatcgcaac 43173228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 52 - 388
Target Start/End: Original strand, 21385878 - 21386210
Alignment:
Q  52 acctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattac 151  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21385878 acctaaaattaaaattatatgaaatttattatacgcatgacatatat--gctaatataatattgcaaataggttaatagtgaaaaatatgacttaattac 21385975  T
Q  152 aaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21385976 aaaggaaaattataccaaactaccataataaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaataataagtttcataagtctc- 21386074  T
Q  252 taagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttctt 351  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||| ||||||||    
T  21386075 taagtttaagtcatccataaaaccatcc-gaaaaagcaagtttcacaagttcgtaaagttgttaataaaactgtccaaaaaataaactagttaatttctt 21386173  T
Q  352 caaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaacc 388  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  21386174 caaaaggtcatcaaacaccaccaccgcaaccctaacc 21386210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1666626 - 1666394
Alignment:
Q  19 aggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaa 118  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1666626 aggtaaattcgactcgaaaactcgtacgagtttatctaaaatgaaaattatgtaaaatttattatatgcatgaaatatataacctaatataatattgtaa 1666527  T
Q  119 ataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaat 218  Q
    ||| || |||| || |||||||||  || ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1666526 ataggtcaataatgtaaaatatgacatacttacaaaggtaaattataacaaactatcattataaaatattatgcttaacttagcatcaaaatacaaaaat 1666427  T
Q  219 tcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1666426 taacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 1666394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53836666 - 53836425
Alignment:
Q  15 atctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatatt 114  Q
    |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  53836666 atctagataaactcgactcgaaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattttatacaatttattatatgcat-acatatctaagctaatataatact 53836568  T
Q  115 gtaaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaataca 213  Q
    ||||| |  | ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  53836567 gtaaaaatatcaatagtgaaaaatatagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaataga 53836468  T
Q  214 aaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagt 256  Q
    |||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  53836467 aaaattaacacacaaaagcataggtttcataagtctctaaagt 53836425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49296797 - 49296581
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | |||| || ||||||    
T  49296797 tcgtacgagtttacctaaaattaaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaataatgaaaaata 49296699  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  49296698 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 49296599  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  49296598 ttcataagtctctaaagt 49296581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 24064043 - 24063942
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24064043 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtatgagtttacctaaat-taaaattatataaaatttattatatgcacgacatatataagctaatataatattgt 24063945  T
Q  117 aaa 119  Q
    |||    
T  24063944 aaa 24063942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 216
Target Start/End: Original strand, 9030497 - 9030658
Alignment:
Q  55 taaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaa 154  Q
    ||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  9030497 taaaattaaaattatataaaatttattatatccatgacataagtaagctaatataatattgcaaatatgtcaataattcaaaatatgacttaattacaaa 9030596  T
Q  155 ggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    | |||| ||||   ||| |||||||||||  ||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  9030597 gacaaagtatacataaccaccataataaagagttgtgttcggcttagcatcaaaatacaaaa 9030658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27162999 - 27162864
Alignment:
Q  82 atatgcatgacatatataagctaatataa-tattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataat 180  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||| | ||| ||||||||    
T  27162999 atatacatgaaatatgtaagctaataaaaatattgtaaataggtcaatagtgcaaaatataacttaattataaagacaaagtatacccaaccaccataat 27162900  T
Q  181 aaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27162899 aaagtgttatgctc-acttagcatcaaaataaaaaaa 27162864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32766614 - 32766503
Alignment:
Q  105 atataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcat 204  Q
    |||||| ||||||||||  | | || |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  32766614 atataaaattgtaaatagatcattaatgcaaaatatgacttaattgcaaagacaaattatactaatctaccataataaaacgttatgctcaacttaacat 32766515  T
Q  205 caaaatacaaaa 216  Q
    ||||||||||||    
T  32766514 caaaatacaaaa 32766503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Original strand, 30237957 - 30238075
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||| |||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30237957 taaactcgacttgtaaatttgtacgagtttacctaaaattaaaagtatataaaatttattatatacaagacatatgttagctaatataatattgcaaata 30238056  T
Q  122 agttaatagtgcaaaatat 140  Q
     || |||||||||||||||    
T  30238057 ggtcaatagtgcaaaatat 30238075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 194
Target Start/End: Original strand, 22488484 - 22488639
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | || |||| ||||||    
T  22488484 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatattgtaaaaagatcaaaagtgaaaaata 22488583  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctc 194  Q
    | || ||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22488584 tagacttaattataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtgatatgctc 22488639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 25050308 - 25050208
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| || |   ||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25050308 gtaaactcgactcgagaactcggacgagtttacctaaaattaatattaaataaaatttattatttacatgacatatgtaaactaatataatattgtaaat 25050209  T
Q  121 a 121  Q
    |    
T  25050208 a 25050208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25932135 - 25932028
Alignment:
Q  34 gagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatata--agctaatataatattgtaaataagttaatagt 131  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   | ||  ||||||||| |||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25932135 gagaactcgtacgagtttacttaaaaata---ttatataaaatttattatatacatgatatatatataagctaatataatattgtaaatatgtcaatagt 25932039  T
Q  132 gcaaaatatga 142  Q
    |||| ||||||    
T  25932038 gcaatatatga 25932028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 21718190 - 21718251
Alignment:
Q  89 tgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaatta 150  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  21718190 tgacatatgtaacctaatataatattgtaaataatccaatagtgcaaaatatgattaaatta 21718251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 32766661 - 32766616
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  32766661 gtaaactcgacttgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaat 32766616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 66
Target Start/End: Original strand, 27988295 - 27988339
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27988295 taaactcgatttgagaattcgtacgagtttacctaaaattaaaat 27988339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1545311 - 1545266
Alignment:
Q  74 aatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaa 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1545311 aatttattatatgcatgacatatgtaagttaatataatattgtaaa 1545266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 8599635 - 8599560
Alignment:
Q  44 acgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaa 119  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8599635 acgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgatatatgtaagctaatataatactgtaaa 8599560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 47466876 - 47466962
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  47466876 gtaaactcgacttgtaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattat-taaaatttattatatatatagcatatgtaagctaatat 47466962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Original strand, 21718358 - 21718403
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaa 332  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||    
T  21718358 gcaagtttcacaagttcttaaaattgttaataaaactatataaaaa 21718403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 216
Target Start/End: Original strand, 30238099 - 30238140
Alignment:
Q  175 cataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30238099 cataataaagagttatgttcaacttagcatcaaaatacaaaa 30238140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 27163073 - 27163017
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatat 96  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  27163073 tcgtacaagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacatgacatat 27163017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 27261963 - 27261896
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||  || |||||| |||||||||||    
T  27261963 tcgtacgagtttacctaaaattaaatt-atataaaatttatgatatatataacatatgtaagctaatat 27261896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 29716256 - 29716679
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29716256 ctaggtaaactcgactcgagatcccgtacgagtttacctaaaattaaaattgtataaaatttattatatggatgacatatataagctaatataatattgt 29716355  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29716356 aaatatgtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcaaattataccaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatataaaa 29716455  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| |       ||||||| ||||||||| ||| ||| ||||    
T  29716456 attaa--cacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccacaaaaccattc-aaaaaagcaagttacacaagttcctaaagtttttaa 29716551  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  |||||||  |    
T  29716552 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaagcaccaccaccgtaaccctaaccgacgtcgtaatcatcggtgtcgaaaact 29716651  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29716652 gaatttccaccgtcgaaatcgcaaccct 29716679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 251
Target Start/End: Original strand, 15285950 - 15286108
Alignment:
Q  93 atatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaa-ttatagcaaactaccataataaaatgttatg 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||||    
T  15285950 atatatatgctaatataatattgtaaataggtcaatattgcaaaatatgacttaattacaaaggaaaaattataccaagctaccataataaac-gttatg 15286048  T
Q  192 ctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  15286049 ctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaaggcacaaaatcttaagtttcttaattctct 15286108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35701970 - 35701748
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||| ||| |  || | |||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35701970 taggtaaactcaactcgtaaacttgtacgagtttacctaaaattaaaattataaaaaaattattatatacatgacatatataagctaatataatactgta 35701871  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||| | ||  |||| |||||   |||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  35701870 aataggttaataatgcaaaatatgacctaattaaaaaggcaaagtatacccaatcaccaaaataatgcgttatgctcaacttagcatttaaatac-aaaa 35701772  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttc 241  Q
    || || ||||||||||||||||||    
T  35701771 ttaactcacaaaatcataagtttc 35701748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31914093 - 31913917
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31914093 tcgtacgagtatacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacatgatatatgtaagctaatataatattgcaaataagtcaatagtgcaaaata 31913994  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||| ||||||| |||| |||| ||||   ||| |||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31913993 tgacttaattataaagacaaagtatacataaccaccataataaagagttatgtttaacttagcatcaaaatacaaaa 31913917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3032828 - 3032651
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataa-tattgtaaataagttaatagtgcaaaat 138  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||     
T  3032828 tcgtacgagtttacctaaaatcaaaattatataaaatttattatatacatgacatatgtaagctaatataaatattataaatatgtcaattgtgcaaaaa 3032729  T
Q  139 atgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    |||| ||||||| |||  |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3032728 atgacttaattataaatacaaaatatacccaactaccataataaagtgttatgctcaacttagaatcaaaatacaaaa 3032651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 245
Target Start/End: Original strand, 4840884 - 4841090
Alignment:
Q  42 gtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatg 141  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||  | ||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  4840884 gtacgagtttaactaaaattaaaattatatacaatttattatatacatgatatatgtgagctaatataatattgtaaataggtcaatagtgcaaaatatg 4840983  T
Q  142 atttaatta-caaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatt--cacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | |||||||  ||||||||| ||||   |||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| || |||||||||    
T  4840984 acttaattataaaaggcaaagtatacataactacaataataaagtgaaatgctcaacttagcataaaaacacaaaaattaacacgcaaaatatcataagt 4841083  T
Q  239 ttcataa 245  Q
    |||||||    
T  4841084 ttcataa 4841090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 5650170 - 5650405
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5650170 ctaggtaaactcgactcataaactcgtacgagtttacctaaaattgaaattgtatacaatttattatatgaatgacatatgtaagctaatataatattgt 5650269  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    ||| |  | |||| |  ||||||| || ||||||| ||| |||||  ||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  5650270 aaaaagatcaataataaaaaatatagacttaattataaatgcaaagcataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaa 5650369  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5650370 aattaactcacaaaagcataagtttcataagtctct 5650405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 37797536 - 37797752
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  37797536 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 37797634  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||    
T  37797635 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataagt 37797734  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  37797735 ttcataagtctctaaagt 37797752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34218901 - 34218754
Alignment:
Q  296 acaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtca 395  Q
    |||||||| | | |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||    
T  34218901 acaagttcttgaagttgttgataaaactatctagaaaataaattagttaatttcttcaaa-gatcaacaaacaccaccaccgcaaccctaactgacgtca 34218803  T
Q  396 caatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||    
T  34218802 caatcaccggcgtcgaaatctgaatttccaccgtcggaattgcaaccct 34218754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 28622585 - 28622802
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||  ||||| |  | ||||||| ||||||    
T  28622585 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctgatataataccgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 28622683  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaa-tgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataag 237  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |    
T  28622684 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcatagg 28622783  T
Q  238 tttcataagtctcttaagt 256  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  28622784 tttcataagtctctaaagt 28622802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 251
Target Start/End: Original strand, 16497370 - 16497518
Alignment:
Q  103 taatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattata-gcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttag 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||| ||||   |||| | |||||||||  |||||| |||||||||    
T  16497370 taatataatattgtaaatatgttaataatgcaagatatgacttaattataaagacaaagtatacataaaccatcataataaagagttatgttcaacttag 16497469  T
Q  202 catcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16497470 catcaaaatac-aaaattaacttgcaaaatcataagtttcataagactct 16497518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36180213 - 36180045
Alignment:
Q  49 tttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaat 148  Q
    |||| |||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||||  ||  | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  36180213 tttatctaaaattaaaattatataaaatttatcatatacatgatgtacgtgagctaatataatattgtaaatatgtcaatagtgcaaaatatgacttaat 36180114  T
Q  149 ta-caaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||  ||||||||| |||| |  |  || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36180113 tataaaaggcaaagtatacctgatcactataataaagcgttatgctcaacttagcatcaagatacaaaa 36180045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 216
Target Start/End: Original strand, 31561412 - 31561546
Alignment:
Q  82 atatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataata 181  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||   |||||||||||||    
T  31561412 atatgcaagacatatgtaagctaatataatattgaaaataggtcaataatacaaaatatgacttaattataaagacaaagtatacataactaccataata 31561511  T
Q  182 aaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||  ||| |  |||||||| ||||||| |||||||    
T  31561512 aagagttgtcttcaacttaacatcaaattacaaaa 31561546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16801299 - 16801125
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||| ||| || |||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||    
T  16801299 tcgtacaagtgtatctaaaattaaaattatataaaatttactatatgcattatatatgtaagctaatataatattgcaaataggtcaatattgcgaaata 16801200  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||    || |||| |||||||  ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  16801199 tgatttaattataaatgcaaagtatacatgaccaccaaaataaaa--ttatggtcaacttaacaacaaaatacaaaa 16801125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 29759359 - 29759236
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |   ||| ||||| || |  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29759359 taggtaaactcgactcgagaaatcgtacgagtttatctaaaattaaaattaaataaa-tttattatttaaatgacatatgtaaactaatataatattgta 29759261  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatga 142  Q
    ||||  | |||||||||||||||||    
T  29759260 aatagttcaatagtgcaaaatatga 29759236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 7124269 - 7124413
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||| | |  || ||| |||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7124269 ctaggtaaactcgaatcgtaaactcgcacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatactgt 7124368  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaa 160  Q
    ||| |  | ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  7124369 aaaaagatcaatagtgaaaaatatagacttaattataaatgcaaa 7124413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21490332 - 21490141
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| |||||| |||||| |||||| |   ||||||||| || |  ||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  21490332 taggtaaactcgattcgagaactcgtac-agtttatctaaaattaaaattaaataaaatttattatttatatgacatatataaactaatataatattaca 21490234  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    ||||    ||||||||||||||||| | ||||| |||||    || |    ||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  21490233 aatagtccaatagtgcaaaatatgactaaattataaagg----tttt---caactaccataataaaatattatgttcaactaaacatcaaaatacaaaaa 21490141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 16548570 - 16548693
Alignment:
Q  19 aggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaa 118  Q
    ||||||||| || | ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |   ||||||||| || | |||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16548570 aggtaaacttgagtcgagaactcgtacgaatttacctaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatggcatatgtaaactaatataatattgtaa 16548669  T
Q  119 ataagttaatagtgcaaaatatga 142  Q
    |||    ||| |||||||||||||    
T  16548670 atagtccaatcgtgcaaaatatga 16548693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 25869400 - 25869313
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  25869400 gtaaactcgactcgtaaattcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatatagcatatgtaagctaatat 25869313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 363
Target Start/End: Original strand, 36196016 - 36196075
Alignment:
Q  304 ataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaac 363  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  36196016 ataaagttgttaataaaactatccaaaaaataaactagttaatttcttcaaaagttcaac 36196075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 362
Target Start/End: Original strand, 5650424 - 5650499
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||  |||||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5650424 gcaagtttcacaagtttctaaacttgagaataaaactatcaaaaaaacaaattaggtaatttcttcaaaaggtcaa 5650499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 212
Target Start/End: Original strand, 40766846 - 40766929
Alignment:
Q  129 agtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatac 212  Q
    ||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||| | ||| | ||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  40766846 agtgcaaaaaataacttaattataaaggcaaaatatacccaaccatcataataaagtgttatattcaactttgcatcaaaatac 40766929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21490093 - 21490055
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactat 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21490093 gcaagtttcacaagttcttaaagttgttaataaaactat 21490055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Original strand, 15286137 - 15286190
Alignment:
Q  309 gttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  15286137 gttgttaataaaactatccaaaaaataaacaagttaatttcttcaaaagttcaa 15286190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31913866 - 31913805
Alignment:
Q  288 caagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttc 349  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||    
T  31913866 caagtttcacaagtttttaaagttgttaataaacctatccaaaaaataaactagttaatttc 31913805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 9731698 - 9731275
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcat-------gacatatataagctaatata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||     
T  9731698 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcataatgcatgacatatataagctaatatg 9731599  T
Q  110 atattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaa 209  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9731598 atattgtaaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaagcaaattataccaaactaccataataaaatgttatgctcaacttggcatcaaaa 9731499  T
Q  210 tacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatg 309  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||        |||||||||||| ||  ||| |    
T  9731498 tacaaaaattaatgcacaaaatcataagtttcgtaagtct-ttaagtttaagtcatccataaaaccatccaaaaaa--caagtttcacaaattactaaag 9731402  T
Q  310 ttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtc 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9731401 ttgttaataaaactatctaaaaaataaactaattaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaatcggcgtcgcaatcatcgacgtc 9731302  T
Q  410 gaaatttgaatttccaccgtcgaaatc 436  Q
     |||| |||||||||| ||||| ||||    
T  9731301 aaaatctgaatttccatcgtcggaatc 9731275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 444
Target Start/End: Original strand, 31846520 - 31846945
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31846520 ctaggtaaactcgacttgagaactcgtacgagtttacctaaatttaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataaactaatataatattgt 31846619  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31846620 aaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattataaaggtaaactataccaaactaccataatgaaacgttatgctcaacttagtattaaaatacaaaa 31846719  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| |       ||||||||  ||||||| ||| ||||||||    
T  31846720 atgaacgcacaaaatcataagtttcataagtctc-tacgtttaagtcatccataaaaccat-ctaaaaaagcaagttttgcaagttcctaaagttgttaa 31846817  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |    
T  31846818 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaacaagcgtcgcaatcactggcgttgaaatct 31846917  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
     |||||||| ||||| |||| |||||||    
T  31846918 aaatttccatcgtcggaatcgcaaccct 31846945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 40830375 - 40829956
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40830375 gtaaactcgacttcagaactcgtacgaatttacctaaaattaaaattatttaaaatttatgatatgcatgacatatataagctcatataatattgtaaat 40830276  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    | || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40830275 aggtcaatagtgtaaaatgtgacttaattacaaa-gcaaattataccaaactatcataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaattcaaaaatta 40830177  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaa 320  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||||       ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  40830176 gcgcacaaaatcataagtttcataaatctc-taagtttaagtcatccataaaatcatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctatagttgttaataaa 40830079  T
Q  321 actatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaat 420  Q
    || ||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||| |||||| |  ||| ||||| |||||    
T  40830078 accatctaaaacataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacactaccactgcaaccctaacc-gcgtcgcaatcatcagcgtggaaatctgaat 40829980  T
Q  421 ttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  40829979 ttccaccgtcaaaatcgcaaccct 40829956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 34342990 - 34342566
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34342990 taggtaaactcgactcaagaactcgtacgaatttacctaaat-taaaattatataaaatttattatatacatgacatatataaactaatataatattgta 34342892  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaacta-ccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    |||| || |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34342891 aataggtgaatattgtaaaatatgacttaattacaaagacaaattataacaaactacccataataaaatattatgttcaacttagcatcaaaatacaaaa 34342792  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || || | ||||||| ||||       ||||||||||||||||   || ||||||||    
T  34342791 attaacacacaaaatcataaatttcataagtctc-taagtttaagccatctataaaactatcc-aaaatagcaagtttcacaagttttcaaagttgttaa 34342694  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||| |||  ||||||||| |    
T  34342693 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttgaaaaggtcaacaaacaccaccaccacaaccctaaccgacgtcgcaattaccagcgtcgaaatat 34342594  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||    
T  34342593 gaatttccaccgttggaatcgcaaccct 34342566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42242546 - 42242285
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42242546 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagttgacctaaaattaaaattatgtaaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 42242447  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42242446 aaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattagaaatacaaattatactaaactaccataataaaaccttatgctcaacttatcatcaaaatacaaaa 42242347  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc 279  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||    
T  42242346 aataacgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaggtcatccataaaaccatcc 42242285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 18726975 - 18727192
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18726975 gtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatggatgacaaatataagctaatataatattgtaaat 18727074  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
     ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  18727075 tagtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcagattatatcaaactaccataataaaacgttatgttcaacttagcatcaaaatacaaaaatga 18727174  T
Q  221 acgcacaaaatcataagt 238  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18727175 acgcacaaaatcataagt 18727192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 109 - 444
Target Start/End: Original strand, 38295180 - 38295502
Alignment:
Q  109 aatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaa 208  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |    
T  38295180 aatattgtaaataggtcaatgatgcaaaatatgacttaattacaaagacaaattataccaaactaccataataaaacattatgctcaacttaacatcgta 38295279  T
Q  209 atacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataat 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||             | ||||||||||| ||| |||     
T  38295280 atacaaaaattaacgcacaaaatcataagtttcataagtct-ttaagtttaagccatccaaaaaa-------------gaaagtttcacaaattcctaaa 38295365  T
Q  309 gttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttc-aaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacg 407  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  38295366 gttgctaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaaggtcagcaaacaccaccaccgcaaccctaaccggcgtcacaatcaccgaca 38295465  T
Q  408 tcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  38295466 tcgaaatatgaatttccacagtcggaatcgcaaccct 38295502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 322
Target Start/End: Original strand, 2307910 - 2308212
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  2307910 taggtaaactcgactcgataactcttacgagtttacctacaactaaaattatataaaatttattatatgc--gccatgtataagttaatataatattgta 2308007  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    |||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2308008 aataggtcaatagtgcaaaatatgtcttaattacaaaggtaaattataccaaactaccataataaaacgttatgctacacttagcatcaaattacaaaaa 2308107  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc-nnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||||         |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2308108 ttaactcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagccatccataaaaacatccaataaaaaacaagtttcacaagttcctaaagttgttaa 2308206  T
Q  317 taaaac 322  Q
    ||||||    
T  2308207 taaaac 2308212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 93 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30851028 - 30850870
Alignment:
Q  93 atatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgc 192  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  30851028 atatataagctaatataatattataaatgggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaagacaaaatatatgaaactaccataataaaacgttatgc 30850929  T
Q  193 tcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  30850928 tcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacacacaaaatcataagtttcgtaaatctct 30850870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 18899321 - 18899537
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |  | ||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  18899321 tcgtacgagtttacttaaaattgaaattttatacaatttattatatgtat-acatatgtaaactaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 18899419  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  18899420 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaatcataggt 18899519  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  18899520 ttcataagtctctaaagt 18899537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Original strand, 38295062 - 38295167
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38295062 tctaggttaactcgactcgagaacttgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgatatatataagctaatttaatattg 38295161  T
Q  116 taaata 121  Q
    ||||||    
T  38295162 taaata 38295167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28546398 - 28546229
Alignment:
Q  47 agtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgattta 146  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||| || ||||||||| |||    
T  28546398 agtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacctaacatacataagctaatagaatattgcaaataggtcaataatgtaaaatatgactta 28546299  T
Q  147 attacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    |||  |||||||||  |||   ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28546298 attctaaaggcaaaacatacataaccaccttaataaagagttatgttcaacttagcatcaaaatacaaaa 28546229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 216
Target Start/End: Original strand, 37654841 - 37654949
Alignment:
Q  108 taatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaa 207  Q
    ||||||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37654841 taatattgtaaatagttcaatagtacaaaatatgacttaattataaatgcaaagtataccaaaccaccattataaaatattatgctcaacttaacatcaa 37654940  T
Q  208 aatacaaaa 216  Q
    |||||||||    
T  37654941 aatacaaaa 37654949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15224686 - 15224523
Alignment:
Q  74 aatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatat-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaact 172  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  | ||| ||| ||||||| || ||| ||| ||| ||||| |||| |||||     
T  15224686 aatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatattgtaaaaagatcaattgtgaaaaatatagacttatttataaatgcaaagtataccaaacc 15224587  T
Q  173 accataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataa 236  Q
    || |||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  15224586 actataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataa 15224523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 401
Target Start/End: Original strand, 18727263 - 18727377
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaa 386  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||| | || |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| ||    
T  18727263 gcaaggttcacaagttcgtaaagttgttaataaaactattcaaaaaatcaactagttaatttcttcaaaaggtcgtcaaacaccaccaccgcaaccccaa 18727362  T
Q  387 ccggcgtcacaatca 401  Q
    || ||||||||||||    
T  18727363 ccagcgtcacaatca 18727377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 251
Target Start/End: Original strand, 37810300 - 37810496
Alignment:
Q  54 ctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaa 153  Q
    |||||| |||||| ||  ||||||||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||| ||||||| ||    
T  37810300 ctaaaattaaaattatataaaatttattatacacatgacatatgtatgctaatataatattgtatataggtcaatattgtaaaatatgacttaattataa 37810399  T
Q  154 aggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    || |||  ||||   |||  || |||||||   ||| | |||||||| ||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37810400 agacaacgtatacataacccccgtaataaagaattacgttcaacttaacatcaaaatac-aaaattaacttacaaaatcataagtttcataagactct 37810496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 287 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32294334 - 32294259
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  32294334 gcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatccaaaaaataaactagttaatttcttcaaaagatcaa 32294259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 130 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 2103900 - 2103814
Alignment:
Q  130 gtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2103900 gtgcaaactatgacttaattataaagacaaagtatatcaaaccaccataataaaacattatgttcaacttagcatcaaaatacaaaa 2103814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 43304630 - 43304777
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||| |||  | ||||  ||| ||||||||||||| ||||||  |  | ||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  43304630 taggtaaactcaactcaaaaatttatacaagtttacctaaaattaaaattctatataatttattatatgcatgacatttgcaaactaatataatattgta 43304729  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattata 165  Q
    ||||  | || |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  43304730 aatagatcaacagtgcaaaatatgacttaattataaatgcaaagtata 43304777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 156
Target Start/End: Original strand, 3857911 - 3858040
Alignment:
Q  27 tcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagtta 126  Q
    |||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||| || || | ||||||||||  || |||||||||| |||||||||    |    
T  3857911 tcgactcgaaaactcgtactagtttacctaaaattaaaatgaaataaaattcattatttacatgacatatgaaaactaatataatgttgtaaatagtcca 3858010  T
Q  127 atagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  3858011 atagtgcaaaatatgactaaattataaagg 3858040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 362
Target Start/End: Original strand, 37810514 - 37810587
Alignment:
Q  289 aagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  37810514 aagtttcacatgttgataaagttgttaataaacctatccaaaaaataaactagttaatttcttcaaaagttcaa 37810587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 43618195 - 43618147
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43618195 taggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaat 43618147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24026493 - 24026394
Alignment:
Q  43 tacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatga 142  Q
    |||||| |||||||||  |||||  ||  ||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||||||    
T  24026493 tacgagattacctaaagttaaaaatatataaaatttactatatacatgacatatgtaagctaacataatactgtaaataggctaatagcgcaaaatatga 24026394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 32241840 - 32241889
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32241840 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgaatttacctaaaattaaaat 32241889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2104359 - 2104259
Alignment:
Q  37 aattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat-aatattgtaaataagttaatagtgcaa 135  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||  || |||||| ||||   ||| |||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||    
T  2104359 aattcgtacgagtttatctaaaattaaaattatataatatttattatatatgtgatatatgtaagctaatataaatattgaagataggttaatagtgcaa 2104260  T
Q  136 a 136  Q
    |    
T  2104259 a 2104259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 13908693 - 13908629
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatat 85  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  13908693 gtaaactcgactcgtaaattcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatat 13908629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24026252 - 24026204
Alignment:
Q  309 gttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaag 357  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  24026252 gttgttaataaaactatccaaaaaataaactagttaatttcttcaaaag 24026204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 37790427 - 37790322
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||| |||||| ||   ||| |||| ||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  37790427 taaactcgactcgtaaaatcgtacgagtttacgtaaaagtaaaattatattaaaattattatatagatgacatatata--ctaatataatactgtaaata 37790330  T
Q  122 agttaata 129  Q
     |||||||    
T  37790329 ggttaata 37790322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Original strand, 3858321 - 3858366
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  3858321 gcaagtttcacaagttcctatagttgttaataaaactatccaaaaa 3858366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 436
Target Start/End: Original strand, 27974323 - 27974737
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||  ||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27974323 gtaaactcgactcgagaactcgtataagtttacctaaaattaaaattatataaaaaaaattatatgcatgacatatataagctaacataatattgtaaat 27974422  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27974423 aggttaatagtgtaaaatatgacttaattacaacagcaaattacaccaaactaccataataaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatta 27974522  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataa-gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataa 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||    
T  27974523 acgcacaaaatcataagtttcataatgtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttgacaa 27974620  T
Q  320 aactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaa 419  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||| ||||| ||| | ||    
T  27974621 aactacctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtaaacaaacaccaccaccgaaatcctaaccggcatcgcaatcaccggcgtcggaatctaaa 27974720  T
Q  420 tttccaccgtcgaaatc 436  Q
    |||||||||||| ||||    
T  27974721 tttccaccgtcggaatc 27974737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 21 - 436
Target Start/End: Original strand, 28031592 - 28032006
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||  ||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28031592 gtaaactcgactcgagaactcgtataagtttacctaaaattaaaattatataaaaaaaattatatgcatgacatatataagctaacataatattgtaaat 28031691  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28031692 aggttaatagtgtaaaatatgacttaattacaacagcaaattacaccaaactaccataataaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatta 28031791  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataa-gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataa 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||| | ||    
T  28031792 acgcacaaaatcataagtttcataatgtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttgacaa 28031889  T
Q  320 aactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaa 419  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||| ||||| ||| | ||    
T  28031890 aactacctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtaaacaaacaccaccaccgaaatcctaaccggcatcgcaatcaccggcgtcggaatctaaa 28031989  T
Q  420 tttccaccgtcgaaatc 436  Q
    |||||||||||| ||||    
T  28031990 tttccaccgtcggaatc 28032006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 18 - 444
Target Start/End: Original strand, 12737437 - 12737861
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaa-tttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12737437 taggtaaactcgactcgagaagtcgtacgagttaacctaaaatgaaaattatataaaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 12737536  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12737537 aaatatatcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcatattata-ccaactaccctaataaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 12737635  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12737636 attaacgcacaaaatcataaatttcataagtctc-taagtttaaaccttccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaa 12737733  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    ||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| |||||| || | ||||||| |    
T  12737734 taatactatcttaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccactgcaaccctaaccaacgtcgcaatcatcggcatcgaaatct 12737833  T
Q  417 gaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  12737834 gaattttcaccgtcggaatcgcaaccct 12737861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 18 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42423952 - 42423542
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  42423952 taggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatattaaatttattatatgcaagacacatgtaagctaatatattattgta 42423853  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    |||| || |||| |||||||||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42423852 aataggtcaataatgcaaaatataacttaattacaagggaaaattataccaaactaccataataaaacattatgttcaacttaacatcaaaatacaaaaa 42423753  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc-nnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||        | ||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  42423752 ttaacgcccaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccat-aaaccatccaaaaaaaaggaagtttcacaatttcctaaagttgttaa 42423655  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaattt 416  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  42423654 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaactaacaccaccaccgcaaccctaactggcgtcgcaatcaccggcgtcgaaatct 42423555  T
Q  417 gaatttccaccgt 429  Q
    |||||||||||||    
T  42423554 gaatttccaccgt 42423542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 393
Target Start/End: Original strand, 8029207 - 8029578
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8029207 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttactatatgcaagacatatataagctaatataatattgt 8029306  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8029307 aaataggtcaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaaacaaattat-tcaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaag 8029405  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  8029406 attaacgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatcc--aaaaagcaagtttcacaagttcctaaaattgttaa 8029502  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgt 393  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| |  |||||||||||||||    
T  8029503 taaaactatctaaaaaataaactagttaatttctt-aaaaagtcaacaaacactaccaccacaaccctaaccggcgt 8029578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Original strand, 6387259 - 6387559
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6387259 taaactcgattcgagaattcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagttaatataatattgtaaata 6387358  T
Q  122 agttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattca 221  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6387359 ggttaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggaaaattatatgaaacttctataatgaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaa 6387458  T
Q  222 cgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaa 321  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||       |||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6387459 cgcacataattataagtttcataagtctc-taagtttaagtcatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagtttataaagttgttaataaaa 6387556  T
Q  322 cta 324  Q
    |||    
T  6387557 cta 6387559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 444
Target Start/End: Original strand, 12521762 - 12522183
Alignment:
Q  19 aggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaa 118  Q
    |||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12521762 aggtaaactcgattcgagaactcgtgcgagtttacctaaaattaaaattatataaa-tttattttattcatggcatatataagctaatatgatattgtaa 12521860  T
Q  119 ataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaat 218  Q
    |||  | ||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12521861 atagatcaataaggtaaaatatgacttaatttcaaaggcaa-ttataccaaactaccataataaaatattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaac 12521959  T
Q  219 tcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaata 318  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||| || ||       ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  12521960 taacgcaccaaatcataagtttcataagtct-ttaagtttaagtcatccat-aaatcaacccaaaaaagcatgtttcacaagttcctaaagttgttatta 12522057  T
Q  319 aaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttga 418  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| || || |  | |||||| || ||||| ||| |||    
T  12522058 aaactatcaaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccgccgcaacccaaatcgacaacgcaatcatcggcgtcgcaatctga 12522157  T
Q  419 atttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||| || |||| |||||||    
T  12522158 atttccaccgccggaatcgcaaccct 12522183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 23 - 391
Target Start/End: Original strand, 3007178 - 3007534
Alignment:
Q  23 aaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatga-tccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  3007178 aaactcgattcgagaattcgtacgagtttacctaaaattaaaatcaatataaaatttattatatgcaagaaatatataagctaatataacatcgtaaata 3007277  T
Q  122 agttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattca 221  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3007278 agtcaatagtgcaaaacatgacttaattacaaagacaaattataccaaactatcataataaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaa 3007377  T
Q  222 cgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaa 321  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||             || ||||| ||||||||         |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3007378 tgcacaaaattataagtttcataagtct-----------tccatccatagaaccatccaaaaaaa--aagttttacaagttcataaagttgttaataaaa 3007464  T
Q  322 ctatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggc 391  Q
    |||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  3007465 ctatataaaaaataaactagttaatttcttcaaatggtcaacaaacaacaccaccgcaactctaaccggc 3007534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41394610 - 41394306
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| | |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41394610 taggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacaaaaaatttaaattatataaaatttattatatgcatgacatgtataacctaatataatattgta 41394511  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaa 217  Q
    |||| || |||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  41394510 aataggtcaatagtgcaaaatatgacctaattactacggcaaattataccaaactaccataataaaatgttgtgtttaacttagcatcaaattacaaaaa 41394411  T
Q  218 ttcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaat 317  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||| |||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41394410 ttaatgcacaaaatcataagtttcataagtct-ataaacttaagtcatccataaaaccat-ctaaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaat 41394313  T
Q  318 aaaacta 324  Q
    |||||||    
T  41394312 aaaacta 41394306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 72 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44977419 - 44977138
Alignment:
Q  72 aaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaac 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    || || |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||    
T  44977419 aaaatttattatatgcatgacatata----cttatgtaatattgtaaataggtcattagtgcaaaatatgacttaattacaaagataaattataccaaac 44977324  T
Q  172 taccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataa 271  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  44977323 tactataataaaatgttatgttcaatttagcatcaaaatttaaaaattaacgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagttcaagtcatccataa 44977225  T
Q  272 aaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggt 359  Q
    |||||| |       ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  44977224 aaccattc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggt 44977138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24082935 - 24082559
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  24082935 ctaggtaaactcgactagagaactcgtacgagtttacctaaaattaatattatataaaatttattatatgcatgacatata--agttaatataatattgt 24082838  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  24082837 aaataggccaataatgcaaaatatgacttaattacaaaggaaaattataccaaactatcataataaaacgttatgttcaatttagcatcaaagtacaaaa 24082738  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||          ||||||| || || ||||||||  ||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24082737 atttacgcgcaaaatcataagtctc----------taagtttaagccatccataaaataatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcgtaaagttgttaa 24082649  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgac 406  Q
    | |||||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||   || || ||| ||| || ||||||||||||||    
T  24082648 ttaaactatctaaaaaataaactacttaatttcttcagaaggtcatcaaacaccactgccgcaatccttaccagcatcacaatcaccgac 24082559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 103 - 390
Target Start/End: Original strand, 27869376 - 27869663
Alignment:
Q  103 taatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagc 202  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  27869376 taatataatattgtaaatagatcaataatgtaaaatatgacttaattacaacgacaaattataccaaattaccacaataaaacgttatgctcaacttagc 27869475  T
Q  203 atcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcat-aagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatcc--nnnnnnngcaagtttcacaa 299  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||          ||||||||||||    
T  27869476 atcaaaa-actaaaattaacgcacaaaatcataagtttcataaagtctc-taagtttaagtcatctataaaaccatccaaaaaaaaaacaagtttcacaa 27869573  T
Q  300 gttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccgg 390  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27869574 gttcctaaagttgttaataaaactatctaaaaa-taaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaaccgg 27869663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 16 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18985079 - 18984857
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18985079 tctaggtaaacttgactcgagaactcgcacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatgtgcaagacatatataagctaatataatattg 18984980  T
Q  116 taaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18984979 taaataggtcaatagtgtaaaacatgactaaattacaaaggaaaattataccaaactaccataataaaacattttgctcaacttagcatcaaaatacaaa 18984880  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    ||||  | |||||||||||||||    
T  18984879 aattagcacacaaaatcataagt 18984857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 444
Target Start/End: Original strand, 27878144 - 27878389
Alignment:
Q  197 cttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataa-gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||       |||||||||    
T  27878144 cttaacatcaaaatacaaaaata-acgcacaaaatcataagtttcataaagtctct-aagtttaagtcatctataaaaccatccaaaaaa-gcaagtttc 27878240  T
Q  296 acaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtca 395  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  27878241 acaagttcctaaagttgataataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgcaaccctaaccgacataa 27878340  T
Q  396 caatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  27878341 caatcaccggcgtcgaaatctaaatttccactttcggaatgacaaccct 27878389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 197 - 444
Target Start/End: Original strand, 28018325 - 28018570
Alignment:
Q  197 cttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataa-gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||       |||||||||    
T  28018325 cttaacatcaaaatacaaaaata-acgcacaaaatcataagtttcataaagtctct-aagtttaagtcatctataaaaccatccaaaaaa-gcaagtttc 28018421  T
Q  296 acaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtca 395  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  28018422 acaagttcctaaagttgataataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgcaaccctaaccgacataa 28018521  T
Q  396 caatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  28018522 caatcaccggcgtcgaaatctaaatttccactttcggaatgacaaccct 28018570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 444
Target Start/End: Original strand, 27915088 - 27915333
Alignment:
Q  197 cttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataa-gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||       |||||||||    
T  27915088 cttaacatcaaaatacaaaaatt-acgcacaaaatcataagtttcctaaagtctct-aagtttaagtcatctataaaaccatccaaaaaa-gcaagtttc 27915184  T
Q  296 acaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtca 395  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  27915185 acaagttcctaaaattgttaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgcaaccctaaccgacataa 27915284  T
Q  396 caatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| | |  ||| ||||||||||||    
T  27915285 caatcaccggcgtcgaaatctaaattttcgctttcggaatcacaaccct 27915333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 444
Target Start/End: Original strand, 27961507 - 27961752
Alignment:
Q  197 cttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataa-gtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttc 295  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||       |||||||||    
T  27961507 cttaacatcaaaatacaaaaatt-acgcacaaaatcataagtttcctaaagtctct-aagtttaagtcatctataaaaccatccaaaaaa-gcaagtttc 27961603  T
Q  296 acaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtca 395  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |    
T  27961604 acaagttcctaaaattgttaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgcaaccctaaccgacataa 27961703  T
Q  396 caatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||| | |  ||| ||||||||||||    
T  27961704 caatcaccggcgtcgaaatctaaattttcgctttcggaatcacaaccct 27961752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 27876479 - 27876630
Alignment:
Q  50 ttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaatt 149  Q
    ||||||||||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  27876479 ttacctaaaataaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattataagtaggtcaatagtgtaaaatatgacttaatt 27876578  T
Q  150 acaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttag 201  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  27876579 acaaaagcaaattataccaaactaccgtaataatacgttatgctcaacttag 27876630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 28016660 - 28016811
Alignment:
Q  50 ttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaatt 149  Q
    ||||||||||  ||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  28016660 ttacctaaaataaaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattataagtaggtcaatagtgtaaaatatgacttaatt 28016759  T
Q  150 acaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttag 201  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  28016760 acaaaagcaaattataccaaactaccgtaataatacgttatgctcaacttag 28016811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19484896 - 19484680
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  19484896 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 19484798  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| | | ||||| || | ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  19484797 tagacttacttatatatgcaaagtaaaccaaactaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggt 19484698  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  19484697 ttcataagtctctaaagt 19484680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 251
Target Start/End: Original strand, 33177265 - 33177472
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| || |||  | |||||||    
T  33177265 tcgtaccagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacatgacatatgtaaactaatataaaattgcaaataggtcaatgatacaaaata 33177364  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtt 239  Q
     || ||||||| |||| |||| ||||   |||||||||||  |   |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||    
T  33177365 agacttaattataaagacaaaatatacataactaccataaaga---gttatgttcaacttagcatcaaaatac-aaaattaacttgcaaaatcataagtt 33177460  T
Q  240 tcataagtctct 251  Q
    ||||||| ||||    
T  33177461 tcataagactct 33177472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 109
Target Start/End: Original strand, 26619984 - 26620072
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatata 109  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26619984 gtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatggatgacatatataagctaatata 26620072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 27869131 - 27869215
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaa 105  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27869131 gtaaattcgactcgagaactcgaacgagtttacctaaaaataaaattatataaaatttattatatgcatgacatatataagctaa 27869215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 246
Target Start/End: Original strand, 4870542 - 4870747
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || ||  ||||||||| |||| | |||||||| ||||| || ||||||||| ||| | ||  || ||||||||||    
T  4870542 tcgtacgagtttacctaaaattaatattatataaaatttattatatacgtgacatatgtaagccaacataatattgcaaaaaggtcgattgtgcaaaata 4870641  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtt 239  Q
    |||  |||||| |||| |||| ||||   ||| |||||||||||  || ||| |||| ||| ||||||||||  |||||| ||   ||||||||||||||    
T  4870642 tgacataattataaagacaaagtatacataaccaccataataaagagtaatgttcaatttaacatcaaaata-gaaaattaacttgcaaaatcataagtt 4870740  T
Q  240 tcataag 246  Q
    |||||||    
T  4870741 tcataag 4870747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35880106 - 35879986
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |   ||||||||| || | |||||||||| ||| ||| | |||||||| |||||    
T  35880106 taaactcgacttgagaactcgtacgagtttatctaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgacatatgtaaactactgtaatattgaaaata 35880007  T
Q  122 agttaatagtgcaaaatatga 142  Q
      | ||||||||| |||||||    
T  35880006 gttcaatagtgcataatatga 35879986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 247
Target Start/End: Original strand, 35446919 - 35447028
Alignment:
Q  138 tatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataag 237  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||| ||||   ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||    
T  35446919 tatgacttaattataaaggtaaagtatattcaaccacaataataaagtgttatgttcaacttagcatcaaaacacaaaaattaacgcgcaaaattctaag 35447018  T
Q  238 tttcataagt 247  Q
    ||||| ||||    
T  35447019 tttcaaaagt 35447028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 316 - 444
Target Start/End: Original strand, 6387748 - 6387876
Alignment:
Q  316 ataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatt 415  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |  ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||  | || ||||||||| ||| | |||     
T  6387748 ataaaactatccaaaaaataaactggctaatttcttcaaaaagtcatcaaacaccaccaccgcaaccctaaccaacatcgcaatcaccggcgttgcaatc 6387847  T
Q  416 tgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
     |||||||| || |||||||| |||||||    
T  6387848 ggaatttcccccatcgaaatcgcaaccct 6387876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 24067517 - 24067422
Alignment:
Q  47 agtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatga 142  Q
    |||||| |||||| |||||| |   ||||||||| || | ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  24067517 agtttatctaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgatatatatagactaatataatattgtaaatagttcaatagtgcaaaatatga 24067422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 289 - 362
Target Start/End: Original strand, 33177492 - 33177565
Alignment:
Q  289 aagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  33177492 aagtttcacaagtttttaaagttgttaataaacctatccaaaaaataaactagttaattttttcaaaagttcaa 33177565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7760999 - 7760954
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaa 332  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  7760999 gcaagtttcacaagttcctagagttgttaataaaactatcttaaaa 7760954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17234918 - 17234873
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaa 332  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||    
T  17234918 gcaagtttcacaagttcacaaagttgttaatcaaactatcaaaaaa 17234873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35879871 - 35879826
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaa 332  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35879871 gcaagtttcacacgttcctaacgttgttaataaaactatataaaaa 35879826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 17 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 23017731 - 23017350
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23017731 ctagataaactcgacttgagaactcgtataagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcattacagatataagttaatataatattgt 23017632  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23017631 aaataggtcgatagtgtaaaatatgacttaattacaaaagcagattataccaaactaccataataaaacgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 23017532  T
Q  217 attcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaa 316  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  23017531 attaatgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcattcataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagtttctaaagttgttaa 23017434  T
Q  317 taaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatc 400  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||    
T  23017433 taaaactatctaaaaaataaactagttaattttttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgcaaccctaatcggcatcaaaatc 23017350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21486880 - 21486508
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21486880 gtaaactcgactcgagaactcgtatgagtttagctaaaattaaaattatgtagaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 21486781  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21486780 acgtcgatagtgcaaaatatgacttaattacaaagacaagttataccaaactaccataataaaacgttatactcaacttagcatcaaaatacaaaaatta 21486681  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaa 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21486680 acgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taagtttaagtcattcataaaactatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaa 21486583  T
Q  321 actatct-aaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtc 394  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||    
T  21486582 actatctaaaaaaataaactagttaattttttcaaaaggtcaacaaacaccaccactgcaatcctaaccggcgtc 21486508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 42611265 - 42610884
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42611265 ctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaagtttattatatgcatgacatatataagctaatatgatattgt 42611166  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaa---actaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaa-tac 212  Q
    ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||    
T  42611165 aaataggtcaatagtgcaaaatattacttaattacaaaggaaaattatgtcaaactactaccataataaaacattatgcttaacttagcatcaaaattac 42611066  T
Q  213 aaaaattcacgcacaaaatc--ataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgt 310  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||    
T  42611065 aaaaattaatgcacaaaatcatataagtttcataagtctc-taagtttaagtaatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagt 42610968  T
Q  311 tgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtc 394  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  42610967 tgttaataaaaccatctaaaaactagactagttaattttttcaaaaggtcaacaaacaccaccaccgtaatcctaatcggcgtc 42610884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 16710237 - 16709860
Alignment:
Q  49 tttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaat 148  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16710237 tttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcaagacatatataagctaataaaatattgtaaataagtcaatagtgcaaattatgacttaat 16710138  T
Q  149 tacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtc 248  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     ||||||||||| |||||||||||||    
T  16710137 tgcaaaggcaaattataccaaactatcataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaatatt-----cacaaaatcat-agtttcataagtc 16710044  T
Q  249 tcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaattt 348  Q
    |             || ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  16710043 t-----------tccatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataagactatctaaaaaataaacaagttaattt 16709956  T
Q  349 cttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16709955 cttcaaaaggtcaacaaacatcaccaccgcaaccctaactggtgtcgcaatcaccgacgttgaaatctgaatttccaccgtcggaatcgcaaccct 16709860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 17684473 - 17684096
Alignment:
Q  49 tttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaat 148  Q
    ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17684473 tttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcaagacatatataagctaataaaatattgtaaataagtcaatagtgcaaattatgacttaat 17684374  T
Q  149 tacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtc 248  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     ||||||||||| |||||||||||||    
T  17684373 tgcaaaggcaaattataccaaactatcataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaatatt-----cacaaaatcat-agtttcataagtc 17684280  T
Q  249 tcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaattt 348  Q
    |             || ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||    
T  17684279 t-----------tccatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataagactatctaaaaaataaacaagttaattt 17684192  T
Q  349 cttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17684191 cttcaaaaggtcaacaaacatcaccaccgcaaccctaactggtgtcgcaatcaccgacgttgaaatctgaatttccaccgtcggaatcgcaaccct 17684096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 43172819 - 43172388
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    ||||||| || | ||||| ||||||||| ||| ||||||  ||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43172819 gtaaacttgagtcgagaactcgtacgagattatctaaaataaaaattatataaaaattattatatgcatgacatatataagctaaaataatattgtaaat 43172720  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
      || |||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||     
T  43172719 tggtcaataattcaaaatatgacttaattacaaaggaaaattataccaaactaccataataaaacgtaatgttcaacttaacaccaaaatacaaaaatta 43172620  T
Q  221 acgcacaaaatcataagtttcat-aagtctct--------taagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgtt 311  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| |||        ||||||| ||||   || ||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||    
T  43172619 acgcacacaatcataagtttcttaaagtttcttaagtctctaagtttaagtcgttcacaaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagttcgtaaagtt 43172521  T
Q  312 gttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcga 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  43172520 gttaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacagacaccaccaccgcaaccctaaccggtgtcgcaatcatcggcgtcga 43172421  T
Q  412 aatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||| |||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  43172420 aatctgaatttccatcgtcagaatcgcaaccct 43172388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31446035 - 31445774
Alignment:
Q  72 aaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaac 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||     
T  31446035 aaaatttattatatgcatgacatatataagctaatataatattataaatagttcaatagtaccaa-tatgacttaattacaaagacaaattataccaaag 31445937  T
Q  172 taccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataa 271  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || || ||||||    
T  31445936 taccataataatacattatgctcaatctagcatcaaaatacaaaaattaatgcacaaaatcataagtttta-aagtctc-taagtttaagccatccataa 31445839  T
Q  272 aaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaa 337  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31445838 aaccatcc-aaaaatgcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatctaaaaaataaa 31445774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 5771541 - 5771743
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5771541 gtaaactcgactcgaaaattcgtacgagtttacctaaaattgaaattatataaaatt-attatatgcatgacatatataagctaatata-tatggtaaat 5771638  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattc 220  Q
    | || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  5771639 aggtcaatagtgaaaaatatgacttaattacaaaggcaaattataccaaactatcatagtaaaacgttatgatccacttaacatcaaaatacaaaaattt 5771738  T
Q  221 acgca 225  Q
    |||||    
T  5771739 acgca 5771743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 37915475 - 37915684
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||    
T  37915475 tcgtacgaatttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatactgtaaaaga-tcaatagttaaaaata 37915573  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| ||||  |    
T  37915574 tagacttaattataaatgcaaagtataccaaactaccataaaaaaatggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcatagat 37915673  T
Q  239 ttcataagtct 249  Q
    |||||||||||    
T  37915674 ttcataagtct 37915684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 40 - 216
Target Start/End: Original strand, 1253906 - 1254082
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  1253906 tcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacataagatatgtaagctaatataatattgtcaataggtcaatagtgcaaaata 1254005  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    ||| ||||||| |||| |||| ||||   ||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  1254006 tgacttaattataaagacaaagtatacataaccaccatattaaagagttatgttcaacttagcacaaaaatataaaa 1254082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14742134 - 14741918
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||  |  | ||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  14742134 tcgtacgagtttacttaaaattgaaattttatacaatttattatatgtat-acatatgtaaactaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 14742036  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagt 238  Q
    | || ||| ||| ||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| ||    
T  14742035 tagacttacttataaatgcaaagtataccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaaacataggt 14741936  T
Q  239 ttcataagtctcttaagt 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14741935 ttcataagtctctaaagt 14741918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6269170 - 6268976
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataag-ctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||| | ||||  ||  || ||||||||||| ||||    
T  6269170 taaacttgacttgtaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacattatatatgcaaaacttatataatattgcaaat 6269071  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||| | ||| | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6269070 aggtcaatagtgcaaaatatgacttaattataaagacaatgtata-ctaaccatcataataaatagttattttcaacttagcatcaaaatacaaaa 6268976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 42813708 - 42813825
Alignment:
Q  99 aagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaact 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||   ||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  42813708 aagctaatataatattgtaaataggttaataatgtaaaatatgacttaattataaagataaagtatactcaataaccaaaataaaatgttttgctcaact 42813807  T
Q  199 tagcatcaaaatacaaaa 216  Q
    || |||||||||||||||    
T  42813808 taacatcaaaatacaaaa 42813825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42043886 - 42043815
Alignment:
Q  180 taaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42043886 taaaatgttatgctcaagttagcatcaaaatacaaaaattaatgcacaaaatcataagttttataaatctct 42043815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 4639296 - 4639508
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  4639296 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcat-acatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 4639394  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtt 239  Q
    |     | ||| | | ||||| || | ||||| ||||||| ||| || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||| |||    
T  4639395 tag---acttatatatgcaaagtaaaccaaaccaccataaaaaagtggtatgcttaacttagtatcaaaatagaaaaattaacacacaaaagcataggtt 4639491  T
Q  240 tcataagtctcttaagt 256  Q
    |||||||||||| ||||    
T  4639492 tcataagtctctaaagt 4639508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 404
Target Start/End: Original strand, 5771747 - 5771852
Alignment:
Q  298 aagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcaca 397  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||     
T  5771747 aagttcgtaaagtttttaataaaactatcaaaaaaataaact-gttaatttcttcaaaaggtcatcaaacaccaccatcgcaactctaaccagcgtcacg 5771845  T
Q  398 atcaccg 404  Q
    |||||||    
T  5771846 atcaccg 5771852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 40 - 156
Target Start/End: Original strand, 33496794 - 33496910
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |   ||||||||| || | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  33496794 tcgtacgagtttatctaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgacatatgtaaactaatataatattgtaaatagtataatagtgcaaaata 33496893  T
Q  140 tgatttaattacaaagg 156  Q
    ||| | ||||| |||||    
T  33496894 tgactaaattataaagg 33496910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27149428 - 27149293
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |    |||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  27149428 gtaagctcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaatttaaattaaattaaatttattatttacatgacatatgtaaactaatataatattgtaaat 27149329  T
Q  121 aagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    |    ||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  27149328 agtccaatagtgcaaaatatgactaaattataaagg 27149293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 120
Target Start/End: Original strand, 26201210 - 26201308
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaat 120  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||| |||||| |   ||||||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  26201210 taaactcgactcgagaactcgtacaagtttaggtaaaattaaaattaaataaaatttattatttacatgacatatgtaatctaatataatattgtaaat 26201308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21024677 - 21024590
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  21024677 gtaaactcgactcgtaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatatagcatatgtaagctaatat 21024590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 325
Target Start/End: Original strand, 33497002 - 33497040
Alignment:
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactat 325  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33497002 gcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactat 33497040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 362
Target Start/End: Original strand, 1254162 - 1254215
Alignment:
Q  309 gttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaa 362  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  1254162 gttgttaataaacctatccaaaaaataaattagttagtttcttcaaaagttcaa 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 108
Target Start/End: Original strand, 14731775 - 14731843
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatat 108  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||  ||  ||||| |||||||||||    
T  14731775 tcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatatatagcatatgtaagctaatat 14731843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16439440 - 16439041
Alignment:
Q  16 tctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattg 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |     
T  16439440 tctaggtaaactcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattacatacatgacatatataagctaatataataata 16439341  T
Q  116 taaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 215  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16439340 taaataggtcaatagtgtaaaatatgacttaattacaaagataaattataccaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaa 16439241  T
Q  216 aattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgtta 315  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||          ||||||| || || ||||||||||||||       ||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16439240 aattaacgcacaaaatcagaagtctc----------taagtttcagacatccataaaaccatcc-aaaaaagcaagtttcacaagtttctaaagttgtta 16439152  T
Q  316 ataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatt 415  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||     
T  16439151 ataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccactgcaaccctaaccaacgtcgcaatcaccggcgtcgaaatc 16439052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 444
Target Start/End: Original strand, 28900209 - 28900609
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  28900209 tcgtacgagtttacctaaat-taaaattatataaaatttcttatatgcaagacatatataagctaatataatattgtaaataggtcaatagtgaaaaata 28900307  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaacta--------ccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaat 231  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28900308 tgacttaatttcaaagacaaattacatcaaactaacataaatccataataaaatattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaat 28900407  T
Q  232 cataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaa 331  Q
    ||||||| ||          ||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28900408 cataagtctc----------taagtttaagtcattcataaaaccatccaaaaaa-gcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatctaaaa 28900496  T
Q  332 attaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcg 431  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||| ||| |||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28900497 aataaactagttaatttcttcaaaaggacaacaaacactaccacaacaaccctaaccggtgtcgcaataaacggcgttgaaatatgaatttccaccgtcg 28900596  T
Q  432 aaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||    
T  28900597 aaatcacaaccct 28900609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Original strand, 31975112 - 31975341
Alignment:
Q  22 taaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaata 121  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31975112 taaactcgactcgagaactcgtacgattttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcaagacatatataagataatataatattgtaaata 31975211  T
Q  122 agttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattca 221  Q
      | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31975212 tatcaatagtgaaaaatatgacttaattacaaaggcaaattatatcaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaa 31975311  T
Q  222 cgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31975312 cgcacaaaatcataagtttcataagtctct 31975341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 20 - 394
Target Start/End: Original strand, 31534463 - 31534826
Alignment:
Q  20 ggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31534463 ggtaaactcgactcaagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatgcaagatatatttaagctaatataatattgtaaa 31534562  T
Q  120 taagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatt 219  Q
    |||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31534563 taagtcgatggtgcaaaatatgacttaattactaaggcaaattacaccaaactaccataataaaacattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaatt 31534662  T
Q  220 cacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataa 319  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  | |||||||||||       |||||||||         ||| |||||||||||    
T  31534663 agcgcacaaaatcataagtttcatatgtctc-taagtttaagtcattcgtaaaaccatcc-aaaaaagcaagtttc---------taaagttgttaataa 31534751  T
Q  320 aactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtc 394  Q
    |||||||||| || |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||  | || |||||||| |||||||    
T  31534752 aactatctaagaaataaactacttaatttcttcaaaagatcaacaaacaccatgaccgcaaccctaatcggcgtc 31534826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 187 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 2607485 - 2607238
Alignment:
Q  187 ttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnn 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||           
T  2607485 ttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaatcataagtttcataagtctct-aagtttaagtcatccataaaatcatccaaaaaa- 2607388  T
Q  287 gcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaa 386  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  2607387 gcaagttttacaagtttctaaagttgttaaaaaaactatctaaaaaagaaactagttaattttttcaaaaggtcaacaaacactaccaccacaaccctaa 2607288  T
Q  387 ccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatc 436  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2607287 ccggcgtcgcaatcaccgatgtcgaaatatgaatttccaccgtcggaatc 2607238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24202851 - 24202688
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24202851 ctaggtaaactcgacttgtgaattcgtacgagtttacctaaaattaaaattaaataaaatttattatatgcatgacatatataagttaatataatattat 24202752  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataat 180  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  24202751 aaataggtcaatagtgtaaaatatgacttaattagaaatggaaattataccaaactatcataat 24202688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 93 - 228
Target Start/End: Original strand, 32567757 - 32567892
Alignment:
Q  93 atatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgc 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  32567757 atatataagctaatataatattgtaaataagtaaatagtgcaaaatatgacttaattacaaaggcaaaatatatcaaactatcataataaaacgttatgc 32567856  T
Q  193 tcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaa 228  Q
    | || |||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  32567857 taaatttagcatcaaaataaaaaaattaatgcacaa 32567892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 289 - 429
Target Start/End: Original strand, 33640896 - 33641036
Alignment:
Q  289 aagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaacc 388  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||     
T  33640896 aagtttcacaatttcctaaagttgttaataaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcaactaacaccaccaccgcaaccctaact 33640995  T
Q  389 ggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgt 429  Q
     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33640996 tgcgtcgcaatcaccgacgtcgaaatctgaatttccaccgt 33641036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2607678 - 2607485
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    ||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||| || ||||||||||    
T  2607678 ctaggtaaaattaactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaactatataaaatttattatattcaaaacatatataagccaacataatattgt 2607579  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaat 210  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |  ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||    
T  2607578 aaataggtcaatagtgaaaaatacggcttaattataaagaaaaattatatcaaactaccataatattccattatgctcaacttagcatcaaaat 2607485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 289 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 24194949 - 24194794
Alignment:
Q  289 aagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaacc 388  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| || || |||||||    
T  24194949 aagtttcacaaattcctaaagttgttattaaaactatctaaaaaataaactagttaatttcttcaaaaggtcagcaaactccaccaccgcaatcctaacc 24194850  T
Q  389 ggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
     | ||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  24194849 agtgttgtaatcaccgacgtcaaaatatgaatttccaccgtcggagtcgcaaccct 24194794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 251
Target Start/End: Original strand, 21010341 - 21010520
Alignment:
Q  72 aaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaac 171  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||| || | |||| ||||   |||    
T  21010341 aaaatttaccatatacataacatatataagctaatatgatattgcaaatagatcaatagtgcaaaatatgacttaattataatgacaaagtatacataac 21010440  T
Q  172 taccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaataca-aaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||   ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21010441 taccataataaagagttatgttcaacttagcatc-aaatacacaaaattaacttgcaaaatcataaatttcataagactct 21010520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24195633 - 24195562
Alignment:
Q  180 taaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24195633 taaaaagttattctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaatcataagtttcataaatctct 24195562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Original strand, 15381124 - 15381193
Alignment:
Q  182 aaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctct 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15381124 aaatgttatgctcaactcagcatcaaaatacaaaaattaatgcacaaaatcataagtttcttaagtctct 15381193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28042130 - 28041995
Alignment:
Q  18 taggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgta 117  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| || | |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  28042130 taggtaaactcgactcgagaacttgtacgagtttacctaaaattaaaat-at--aaaatttattatttacatgtcatatgtaaactaatataatattata 28042034  T
Q  118 aataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaagg 156  Q
    ||||    |||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28042033 aatagtccaataatgcaaaatatgattaaattataaagg 28041995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6789064 - 6788943
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  | ||||||| ||||||    
T  6789064 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatactgtaaaaagatcaatagtgaaaaata 6788965  T
Q  140 t-gatttaattacaaaggcaaa 160  Q
    | || ||||||| ||| |||||    
T  6788964 tagacttaattataaatgcaaa 6788943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 99
Target Start/End: Original strand, 32567663 - 32567737
Alignment:
Q  25 actcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatata 99  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  32567663 actcaactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttgttatatgcatgatatatata 32567737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 444
Target Start/End: Original strand, 31534823 - 31534861
Alignment:
Q  406 cgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31534823 cgtcgaaatctgaatttccaccgtcgaaatcgcaaccct 31534861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 107
Target Start/End: Original strand, 1462807 - 1462872
Alignment:
Q  42 gtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaata 107  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1462807 gtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaata 1462872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 31995709 - 31995773
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatat 85  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||    
T  31995709 gtaaactcgactcgtaaactcgtacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatat 31995773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 72 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 89977 - 89606
Alignment:
Q  72 aaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaac 171  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||    
T  89977 aaaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatactgtaaataggtcagtagtgcaaaatatgacttaagtacaaagacaaattatacgaaac 89878  T
Q  172 taccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaatcataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataa 271  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||    
T  89877 taccataataaaatattatgcgcaacttagcatcaaaatacaaaaattaatgcacaaaatcataagtttcataagtctc-taaatttaagccatccataa 89779  T
Q  272 aaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaat-aaaactatctaaaaattaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacacc 370  Q
    ||||||||       | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  89778 aaccatcc-aaaaaagaaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaaactatctaaaaaataaactatttaatttcttcaaaaggtcaacaaagacc 89680  T
Q  371 accatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcgaaatcacaaccct 444  Q
    | ||  | ||||||||||||||||  |||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  89679 atcactgcaaccctaaccggcgtcgtaatcgcctacggcgaaatatgaatttccaccgtcggaatcgcaaccct 89606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0573 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0573
Description:

Target: scaffold0573; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 9585 - 9185
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaata 139  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  9585 tcgtacgagtttacctaaat-taaaattatataaaatttcttatatgcaagacatatataagctaatataatattgtaaataggtcaatagtgaaaaata 9487  T
Q  140 tgatttaattacaaaggcaaattatagcaaacta--------ccataataaaatgttatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattcacgcacaaaat 231  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9486 tgacttaatttcaaagacaaattacatcaaactaacataaatccataataaaatattatgctcaacttagcatcaaaatacaaaaattaacgcacaaaat 9387  T
Q  232 cataagtttcataagtctcttaagttttagtcacccataaaaccatccnnnnnnngcaagtttcacaagttcataatgttgttaataaaactatctaaaa 331  Q
    ||||||| ||          ||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9386 cataagtctc----------taagtttaagtcattcataaaaccatccaaaaaa-gcaagtttcacaagttcctaaagttgttaataaaactatctaaaa 9298  T
Q  332 attaaattagtgaatttcttcaaaaggtcaacaaacaccaccatcgtaaccctaaccggcgtcacaatcaccgacgtcgaaatttgaatttccaccgtcg 431  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    |||||||||||| ||| |||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9297 aataaactagttaatttcttcaaaaggacaacaaacactaccacaacaaccctaaccggtgtcgcaataaacggcgttgaaatatgaatttccaccgtcg 9198  T
Q  432 aaatcacaaccct 444  Q
    |||||||||||||    
T  9197 aaatcacaaccct 9185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 136270 - 136086
Alignment:
Q  17 ctaggtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgt 116  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  136270 ctagataaactcgactcgagaactcgcacgagtttacctaaaattaaaattatataaaatttattatatacatgacatatataagctaatataatactat 136171  T
Q  117 aaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaattatagcaaactaccataataaaatgttatgctcaacttag 201  Q
    ||||| || |||||| ||||||| || |||||||||||  |||| |||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  136170 aaataggtcaatagtacaaaatacgacttaattacaaattcaaactataccaaactatagtaataaaacgttatgctcaacttag 136086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Original strand, 16214 - 16293
Alignment:
Q  40 tcgtacgagtttacctaaaaataaaatgatccaaaatttatgatatgcatgacatatataagctaatataatattgtaaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||  |  | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16214 tcgtacgagtttacctaaaattgaaattttatacaatttattatatgcatgacatatgtaagctaatataatactgtaaa 16293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38456 - 38396
Alignment:
Q  100 agctaatataatattgtaaataagttaatagtgcaaaatatgatttaattacaaaggcaaa 160  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  38456 agctaacataatattgaaaataagtcaatagtgcaaaatatgacataattataaagacaaa 38396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 66
Target Start/End: Original strand, 4946 - 4991
Alignment:
Q  21 gtaaactcgacttgagaattcgtacgagtttacctaaaaataaaat 66  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4946 gtaaattcgactcgagaactcgtacgagtttacctaaaattaaaat 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University