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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12221_low_2 (Length: 792)

Name: NF12221_low_2
Description: NF12221
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12221_low_2
NF12221_low_2
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (21-779)||(2222736-2223492)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 675; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 675; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 779
Target Start/End: Original strand, 2222736 - 2223492
Alignment:
Q  21 tatgcaaccacaccccataaaaaacaaatgcaataataaattctgtaagtctgtaannnnnnncacatacatataatgaaaccacaccataatattaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2222736 tatgcaaccacaccccataaaaaacaaatgcaataataaattctgtaagtctataatttttttcacatacatataatgaaaccacaccataatattaact 2222835  T
Q  121 tattatatttgttcctagaataattcacaaacctaaatagtgaaaattgaatgaatgcatatataaaaaagtttaatgttgaccgtgcatacaaaatcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2222836 tattatatttgttcctagaataattcacaaacctaaatagtaaaaattgaatgaatgcatatataaaaaagtttaatgttgaccgtgcatacaaaatcta 2222935  T
Q  221 taattaaaaaacatgaaccctattcatttacttcaaacnnnnnnnnccaaaagtttcaacatcacctccagtttgatatgaattgtacaaatataaattt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2222936 taattaaaaaacatgaaccctattcatttacttcaaacttttttttccaaaagtttcaacatcacctccagtttgatatgaattgtacaaatataaattt 2223035  T
Q  321 cttctactaaaaatccaatagaataagctttttggtactactaaaatataatgtttattatttatcaatgtaaaccatcacaacactatagataataaac 420  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  2223036 cttctagtaaaaatccaatagaataagctttttggtactactaaaatataatgtttattatttatcaatgtaaaccatcacaacacta--gataataaac 2223133  T
Q  421 aattttgaaacatatattaatgttatttaacaaacctagtggcttgtaaagaaattaatcacagatacaatcaaccaagcaattgaccaaacttatgtag 520  Q
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T  2223134 aattttgaaacatatattaatgttatttaacaaacctagtggcttgtaaagaaattaagcacagatacaatcaaccaagcaattgaccaaacttatgtag 2223233  T
Q  521 caacttggatgattcaagacgcaagagtaaccatcagttgtgcctttcttttcttatcaatttcatcagaatattctatactttcagaactaaccacatc 620  Q
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T  2223234 caacttggatgattcaagacgcaagagtaaccatcagttgtgcctttcttttcttatcaatttcatcagaatattctttactttcagaactaaccacatc 2223333  T
Q  621 accaacaaaatatttaatctaaagttattacacaagatgattgaacgtgtcaccccaaaaagaaaggttcaccccaaaaagaatatatgctttactttct 720  Q
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T  2223334 accaacaaaatatttaatctaaagttattacacaagatgattgaacgtgtcaccccaaaaagaaaggttcaccccaaaaagaatatatgctttacttttt 2223433  T
Q  721 agaagaagaaatctagatctatgatattttactttacaaataatctgttttttcccctc 779  Q
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T  2223434 agaggaagaaatctagatctatgatattttactttacaaataatctgttttttcccctc 2223492  T

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