View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12231_low_1 (Length: 920)

Name: NF12231_low_1
Description: NF12231
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12231_low_1
NF12231_low_1
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-911)||(33965-34858)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (18-911)||(32430877-32431770)
chr8 (18-911)||(7341235-7342128)
chr8 (18-911)||(8421868-8422761)
chr8 (18-911)||(32376920-32377813)
chr8 (18-903)||(30303622-30304507)
chr8 (22-903)||(35964765-35965642)
chr8 (25-903)||(43370931-43371806)
chr8 (22-899)||(2145018-2145897)
chr8 (22-903)||(7169064-7169922)
chr8 (424-834)||(22581061-22581471)
chr8 (566-903)||(43688731-43689068)
chr8 (560-901)||(45455542-45455883)
chr8 (731-903)||(1115936-1116108)
chr8 (22-258)||(43683256-43683492)
chr8 (271-573)||(43686418-43686717)
chr8 (22-230)||(22581991-22582199)
chr8 (22-232)||(22585851-22586062)
chr8 (750-903)||(39751772-39751925)
chr8 (572-732)||(45116582-45116742)
chr8 (571-732)||(44321173-44321334)
chr8 (592-766)||(14401359-14401532)
chr8 (621-737)||(17316787-17316903)
chr8 (116-168)||(17317379-17317431)
chr8 (628-711)||(13781580-13781663)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (18-911)||(43622147-43623040)
chr7 (18-911)||(30787695-30788588)
chr7 (18-911)||(45764535-45765428)
chr7 (20-911)||(616763-617654)
chr7 (22-903)||(18106552-18107433)
chr7 (22-903)||(42500571-42501452)
chr7 (22-794)||(15067162-15067934)
chr7 (22-903)||(47062047-47062926)
chr7 (94-903)||(43826697-43827503)
chr7 (52-675)||(12116418-12117038)
chr7 (22-555)||(8401016-8401546)
chr7 (22-408)||(10707697-10708081)
chr7 (647-903)||(8400750-8401006)
chr7 (790-903)||(15060777-15060890)
chr7 (572-732)||(1297321-1297481)
chr7 (573-757)||(16795663-16795847)
chr7 (517-732)||(40445076-40445291)
chr7 (572-732)||(47867065-47867225)
chr7 (517-732)||(43378819-43379034)
chr7 (572-732)||(16794179-16794339)
chr7 (572-732)||(40794258-40794418)
chr7 (572-732)||(45172475-45172635)
chr7 (588-732)||(46791660-46791804)
chr7 (517-745)||(8193790-8194019)
chr7 (22-162)||(3762832-3762971)
chr7 (22-56)||(12113572-12113606)
chr7 (517-818)||(3762154-3762455)
chr7 (107-168)||(25569735-25569796)
chr7 (107-168)||(46792245-46792306)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (18-911)||(5348323-5349216)
chr2 (18-911)||(41561168-41562061)
chr2 (18-911)||(211453-212346)
chr2 (18-911)||(10622466-10623359)
chr2 (18-905)||(38946925-38947812)
chr2 (22-903)||(39795134-39796015)
chr2 (22-903)||(27274376-27275257)
chr2 (22-903)||(24750822-24751704)
chr2 (22-818)||(7264229-7265025)
chr2 (185-903)||(3801745-3802463)
chr2 (22-903)||(24604108-24604986)
chr2 (66-903)||(1097889-1098723)
chr2 (22-901)||(45476524-45477400)
chr2 (22-903)||(9655320-9656197)
chr2 (22-903)||(12906511-12907389)
chr2 (25-903)||(43948305-43949179)
chr2 (25-903)||(41006998-41007877)
chr2 (22-903)||(34919801-34920679)
chr2 (22-903)||(436475-437362)
chr2 (22-903)||(11691849-11692712)
chr2 (22-710)||(24940669-24941354)
chr2 (22-903)||(17996206-17997069)
chr2 (22-520)||(28347416-28347911)
chr2 (653-903)||(28354549-28354799)
chr2 (22-189)||(3797817-3797984)
chr2 (22-168)||(25618105-25618251)
chr2 (517-749)||(21535507-21535733)
chr2 (593-757)||(28423061-28423225)
chr2 (104-171)||(28422550-28422617)
chr2 (619-710)||(3353894-3353985)
chr2 (22-168)||(24683970-24684115)
chr2 (865-903)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (18-911)||(44466738-44467631)
chr1 (18-911)||(20350612-20351505)
chr1 (18-911)||(38774126-38775020)
chr1 (18-911)||(3946473-3947366)
chr1 (22-903)||(29354704-29355585)
chr1 (22-903)||(5079099-5079980)
chr1 (22-903)||(13630580-13631461)
chr1 (22-903)||(12648595-12649476)
chr1 (22-903)||(50115782-50116660)
chr1 (28-903)||(37016078-37016950)
chr1 (311-911)||(3984269-3984870)
chr1 (223-903)||(41455001-41455681)
chr1 (22-903)||(38690958-38691836)
chr1 (25-903)||(51663422-51664297)
chr1 (22-903)||(13174945-13175823)
chr1 (116-903)||(46974328-46975112)
chr1 (22-820)||(19497483-19498277)
chr1 (18-315)||(3991357-3991654)
chr1 (25-474)||(36074820-36075267)
chr1 (619-903)||(21942977-21943261)
chr1 (517-896)||(32106165-32106533)
chr1 (808-903)||(44619905-44620000)
chr1 (22-108)||(46976765-46976851)
chr1 (572-732)||(36360086-36360246)
chr1 (742-896)||(26466006-26466160)
chr1 (572-732)||(45472687-45472847)
chr1 (517-732)||(28863225-28863440)
chr1 (572-732)||(7403953-7404115)
chr1 (572-705)||(27283402-27283535)
chr1 (572-732)||(18887360-18887520)
chr1 (22-168)||(32105687-32105833)
chr1 (862-903)||(7980068-7980109)
chr1 (572-705)||(20240037-20240170)
chr1 (104-168)||(27283960-27284024)
chr1 (229-279)||(32105897-32105947)
chr1 (110-168)||(36359603-36359661)
chr1 (714-811)||(25231558-25231655)
chr1 (617-730)||(31445866-31445979)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (18-903)||(2045-2930)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (18-903)||(19071669-19072554)
chr4 (22-903)||(3404954-3405835)
chr4 (26-903)||(4769298-4770172)
chr4 (22-903)||(4977977-4978851)
chr4 (287-903)||(9891186-9891802)
chr4 (22-903)||(38462856-38463734)
chr4 (22-903)||(4976919-4977796)
chr4 (416-903)||(41024363-41024852)
chr4 (187-903)||(11502670-11503383)
chr4 (555-911)||(49565013-49565369)
chr4 (364-903)||(21471958-21472497)
chr4 (461-903)||(44049774-44050216)
chr4 (719-903)||(51643211-51643395)
chr4 (472-870)||(6182875-6183273)
chr4 (22-197)||(51643023-51643198)
chr4 (25-189)||(17238850-17239014)
chr4 (22-126)||(9891813-9891917)
chr4 (792-903)||(18580117-18580225)
chr4 (573-732)||(32716628-32716787)
chr4 (572-705)||(4617919-4618052)
chr4 (572-732)||(1591168-1591328)
chr4 (22-104)||(11503387-11503470)
chr4 (461-749)||(13897238-13897526)
chr4 (572-732)||(17916521-17916681)
chr4 (572-732)||(46517000-46517160)
chr4 (571-697)||(17496893-17497019)
chr4 (104-168)||(13896850-13896914)
chr4 (22-167)||(6183584-6183728)
chr4 (110-167)||(20970619-20970675)
chr4 (104-156)||(17497455-17497507)
chr4 (598-711)||(34979909-34980022)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (18-911)||(3949899-3950792)
chr3 (22-911)||(8158999-8159888)
chr3 (18-911)||(30945654-30946547)
chr3 (18-903)||(6742051-6742936)
chr3 (22-903)||(13745737-13746618)
chr3 (22-903)||(16445784-16446665)
chr3 (22-903)||(36815532-36816413)
chr3 (22-903)||(14399719-14400602)
chr3 (22-903)||(48248885-48249764)
chr3 (22-901)||(46991264-46992141)
chr3 (22-903)||(6503974-6504852)
chr3 (22-903)||(21954258-21955135)
chr3 (22-859)||(29949193-29950026)
chr3 (22-859)||(29998347-29999180)
chr3 (22-901)||(77039-77915)
chr3 (203-903)||(7838760-7839456)
chr3 (500-903)||(7841511-7841912)
chr3 (683-903)||(9428510-9428730)
chr3 (612-859)||(29908027-29908273)
chr3 (547-708)||(28610460-28610621)
chr3 (573-725)||(9556331-9556483)
chr3 (571-732)||(51548098-51548259)
chr3 (572-732)||(2284623-2284783)
chr3 (572-732)||(4120360-4120520)
chr3 (572-732)||(33940190-33940350)
chr3 (572-732)||(40467774-40467934)
chr3 (572-732)||(12491422-12491582)
chr3 (855-903)||(29930532-29930580)
chr3 (855-903)||(29979686-29979734)
chr3 (107-171)||(4511042-4511106)
chr3 (112-168)||(40467293-40467349)
chr3 (105-168)||(8118509-8118572)
chr3 (123-170)||(24148288-24148335)
chr3 (107-168)||(2284136-2284197)
chr3 (572-749)||(8117907-8118084)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (18-911)||(1610763-1611656)
chr6 (22-828)||(28357557-28358363)
chr6 (22-903)||(31147486-31148364)
chr6 (22-903)||(18607160-18608031)
chr6 (22-903)||(21357369-21358244)
chr6 (22-903)||(23961351-23962226)
chr6 (464-903)||(29287411-29287845)
chr6 (22-346)||(254427-254751)
chr6 (829-903)||(28251060-28251134)
chr6 (572-732)||(9095463-9095623)
chr6 (827-903)||(24220332-24220408)
chr6 (104-168)||(26684103-26684167)
chr6 (22-81)||(34110720-34110779)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (18-903)||(37818889-37819774)
chr5 (22-903)||(38858206-38859087)
chr5 (22-903)||(11031468-11032349)
chr5 (22-903)||(27865861-27866742)
chr5 (98-903)||(34078944-34079749)
chr5 (25-903)||(13566126-13566988)
chr5 (22-903)||(25895113-25895998)
chr5 (14-903)||(1036515-1037404)
chr5 (22-903)||(7799034-7799903)
chr5 (61-903)||(18536395-18537233)
chr5 (26-473)||(28884458-28884905)
chr5 (499-903)||(28884901-28885305)
chr5 (455-903)||(4202388-4202836)
chr5 (22-453)||(7019982-7020413)
chr5 (545-903)||(7020419-7020777)
chr5 (24-896)||(20287439-20288311)
chr5 (22-459)||(4198922-4199356)
chr5 (665-896)||(20286180-20286410)
chr5 (517-732)||(11819551-11819766)
chr5 (572-732)||(27013235-27013395)
chr5 (572-732)||(42343826-42343985)
chr5 (572-732)||(6553124-6553284)
chr5 (572-732)||(43295549-43295709)
chr5 (106-171)||(25054192-25054257)
chr5 (652-757)||(25053043-25053148)
chr5 (107-168)||(27012749-27012810)
chr5 (588-675)||(9376353-9376440)
chr5 (107-168)||(11820136-11820197)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (22-903)||(15373-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (374-903)||(17233-17762)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (314-663)||(25254-25603)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (750-903)||(12426-12580)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (560-656)||(4-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (572-732)||(28452-28612)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (105-170)||(2101-2166)
[»] scaffold0542 (1 HSPs)
scaffold0542 (104-162)||(1168-1226)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (588-705)||(4198-4315)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 865; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 865; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 34858 - 33965
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34858 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 34759  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34758 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 34659  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34658 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 34559  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  34558 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 34459  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 34359  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34358 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 34259  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34258 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 34159  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 34059  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34058 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 33965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 865; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 865; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 32430877 - 32431770
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32430877 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 32430976  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32430977 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 32431076  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431077 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 32431176  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  32431177 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 32431276  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431277 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 32431376  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431377 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 32431476  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431477 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 32431576  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431577 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 32431676  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32431677 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32431770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 857; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 7342128 - 7341235
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7342128 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcct 7342029  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7342028 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 7341929  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341928 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 7341829  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  7341828 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 7341729  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341728 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 7341629  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341628 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaagcaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 7341529  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341528 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 7341429  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341428 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 7341329  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7341328 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 7341235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 857; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 8421868 - 8422761
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421868 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 8421967  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8421968 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 8422067  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422068 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 8422167  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  8422168 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 8422267  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422268 attcaatgcataactttctggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 8422367  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422368 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 8422467  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8422468 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatataatggatgt 8422567  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422568 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 8422667  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8422668 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8422761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 853; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 32376920 - 32377813
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376920 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 32377019  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377020 gcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 32377119  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377120 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 32377219  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  32377220 cccgattgatcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 32377319  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377320 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 32377419  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377420 agaagtttacgcaaaattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 32377519  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377520 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 32377619  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377620 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 32377719  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32377720 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32377813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 845; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 903
Target Start/End: Original strand, 30303622 - 30304507
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30303622 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttttggtcct 30303721  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303722 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30303821  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30303822 ctacatgaatctttgaactccactaatacatttgcatataattgttgattgggagattcaaccataactttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 30303921  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  30303922 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataaca 30304021  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304022 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 30304121  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304122 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 30304221  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304222 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 30304321  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304322 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 30304421  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304422 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 30304507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 583; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 35964765 - 35965642
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  35964765 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagtatttcttcaataaagcatgagctgattcgacc-tgttcgtggtcctgaaa 35964863  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  35964864 tcaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgatcatgacataatttttgaaaattggaaaatcactac 35964963  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||  ||||  |    
T  35964964 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtggacgattcaaccatagcttttcatgccctcattatcttcttgacagcatcgtg 35965063  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  35965064 attactcacctctttcccatccttttttt---ccaaaagatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 35965160  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35965161 attgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcagtaacaatcaccttaggcatattcatatttgacgaaagaa 35965260  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  35965261 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagggacccc 35965360  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35965361 aactacctcaaatattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 35965460  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35965461 tgagcccaaaagatatcttcaactgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 35965560  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965561 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 35965642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 43371806 - 43370931
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  43371806 tattttcttccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaacca 43371707  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||    
T  43371706 agatgcatcacatggtctctccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactacatg 43371607  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgatt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  | ||||| |||||    
T  43371606 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgccaacatcgcgatt 43371507  T
Q  325 gctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaat 424  Q
     |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||| |    
T  43371506 actcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacataaaagtaacaattcatt 43371410  T
Q  425 gcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtt 524  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  43371409 gcataactttctgggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttagacatatttatctttgacgtaagaagtt 43371310  T
Q  525 tacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaac 624  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43371309 tacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaac 43371210  T
Q  625 tacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 724  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43371209 tacctcaaacgttgacatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatga 43371110  T
Q  725 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 824  Q
    |||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  43371109 gcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgact 43371010  T
Q  825 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371009 tcttgtcagctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43370931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 560; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 899
Target Start/End: Original strand, 2145018 - 2145897
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2145018 atgtattttctcccaacaagtacctaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttggtggtcctgcaa 2145117  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  2145118 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcactgcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 2145217  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| || |||||  |    
T  2145218 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttaagtgggcaattcaaccatagctttccattccctcattatcttcttgacaacatcgtg 2145317  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  2145318 attactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 2145414  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2145415 attgcataactttctgggaaaatatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 2145514  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2145515 gtttacgcaacattttttaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 2145614  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2145615 aactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttgga 2145714  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  2145715 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaaca 2145814  T
Q  822 gcttcttgtcacccc-----tatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 899  Q
     |||||||||||| |     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145815 acttcttgtcacctctattatatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 2145897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 7169922 - 7169064
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  7169922 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaa 7169823  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||| || |||      |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  7169822 ccaagatgcaaccca-ggt------atgccctcactattttctccttcacttcttccaaggtggtcatggcataatttaagaaaattgggaaatcattac 7169730  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| |||||  ||  |||||||||     || | ||| ||    
T  7169729 atgtatcttggaactccactaatgcatttgcatataattattgagtgtgcgattcaaccatagctttccgagccctcattatctaa---acaatatcgcg 7169633  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||| || |||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  7169632 aggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacatt-gtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 7169537  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7169536 attgcataactttcggggaaaatatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 7169437  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||     
T  7169436 gtttaggcaacatttttaaaactcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccct 7169337  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7169336 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 7169237  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||    
T  7169236 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg 7169137  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
             |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7169136 ---------cacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtct 7169064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 424 - 834
Target Start/End: Complemental strand, 22581471 - 22581061
Alignment:
Q  424 tgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagt 523  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  22581471 tgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcacctttggcatattcatctttgacgtaggaagt 22581372  T
Q  524 ttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaa 623  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  22581371 ttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcgcaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaa 22581272  T
Q  624 ctacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatg 723  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22581271 ctacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatg 22581172  T
Q  724 agcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggc 823  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22581171 agcccaaaagatattttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgga 22581072  T
Q  824 ttcttgtcacc 834  Q
    |||||||||||    
T  22581071 ttcttgtcacc 22581061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 566 - 903
Target Start/End: Original strand, 43688731 - 43689068
Alignment:
Q  566 tcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacg 665  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  43688731 tcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtagg 43688830  T
Q  666 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgt 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||  ||||||    
T  43688831 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggattttggatgagcccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgt 43688930  T
Q  766 tcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttca 865  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688931 tcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttca 43689030  T
Q  866 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689031 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43689068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 560 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 45455883 - 45455542
Alignment:
Q  560 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 659  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45455883 tctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccaaatatgtcaaatcgatcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttt 45455784  T
Q  660 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 759  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||||      
T  45455783 tgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaattttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaaaatatatttgattgtggtactttcact 45455684  T
Q  760 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 859  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45455683 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttgttga 45455584  T
Q  860 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 901  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45455583 cgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggt 45455542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 731 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 1116108 - 1115936
Alignment:
Q  731 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 830  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116108 aaaacatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 1116009  T
Q  831 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116008 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1115936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 258
Target Start/End: Original strand, 43683256 - 43683492
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||    
T  43683256 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcataagcagattcgaccctgttggttgtcatgcaa 43683355  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |   |||| ||||||||||||||    
T  43683356 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacttaatttttgaaaagtgggaaatcactac 43683455  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataa 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43683456 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataa 43683492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 271 - 573
Target Start/End: Original strand, 43686418 - 43686717
Alignment:
Q  271 agattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaa 370  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  43686418 agattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcgaggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaa 43686514  T
Q  371 ttcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagaca 470  Q
    |  ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||       ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43686515 tctaagacgcgcatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagaca 43686614  T
Q  471 tatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatg 570  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43686615 tatccctgtcggtcacaatcaccttagtcatattcatctttggcgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaaattttcctctttctcatg 43686714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22582199 - 22581991
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  22582199 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgcaa 22582100  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22582099 acaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcataatttaggaaaattgggaaatcactac 22582000  T
Q  222 atgaatctt 230  Q
    |||||||||    
T  22581999 atgaatctt 22581991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22586062 - 22585851
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaa-gtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgca 120  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||    
T  22586062 atgtattttctcccaacaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtgattctgca 22585963  T
Q  121 accaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcacta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  22585962 accaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtagtcatggcataatttaggaaaattgggaaatcacta 22585863  T
Q  221 catgaatctttg 232  Q
    ||||||||||||    
T  22585862 catgaatctttg 22585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 750 - 903
Target Start/End: Original strand, 39751772 - 39751925
Alignment:
Q  750 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 849  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39751772 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttcca 39751871  T
Q  850 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751872 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39751925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45116742 - 45116582
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  45116742 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45116643  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45116642 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 44321334 - 44321173
Alignment:
Q  571 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 670  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  44321334 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaataacattctatacaagttggttttgtacgtggaa 44321235  T
Q  671 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  44321234 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 592 - 766
Target Start/End: Original strand, 14401359 - 14401532
Alignment:
Q  592 cgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttgga 691  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| || || ||| |||| || | ||||||  | | |    
T  14401359 cgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaacaatgacatcctatacgtgttggttttataggtgaagtcgatgaacaaaactatcgaa 14401458  T
Q  692 aaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgtt 766  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||   |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14401459 aaattattaaacaacttaacagattcaggatgagcccaaaatatatcatgaatagta-tactttcacattgtgtt 14401532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 621 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 17316903 - 17316787
Alignment:
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| | | ||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||  |||    
T  17316903 caactatctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaattcatgatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaacttaaatgattgtgg 17316804  T
Q  721 atgagcccaaaaaatat 737  Q
     ||||| ||||||||||    
T  17316803 gtgagctcaaaaaatat 17316787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 17317431 - 17317379
Alignment:
Q  116 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17317431 ctgcacccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttttcctt 17317379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 711
Target Start/End: Original strand, 13781580 - 13781663
Alignment:
Q  628 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 711  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||||||    
T  13781580 ctcaaacaacggcattcgatagatgttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgttgagcaatttaat 13781663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 865; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 865; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 43622147 - 43623040
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622147 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 43622246  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622247 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 43622346  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622347 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 43622446  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  43622447 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 43622546  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622547 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 43622646  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622647 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 43622746  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622747 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 43622846  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622847 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 43622946  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43622947 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 43623040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 857; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 30788588 - 30787695
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788588 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 30788489  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788488 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30788389  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788388 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 30788289  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  30788288 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 30788189  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788188 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 30788089  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788088 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 30787989  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787988 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 30787889  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787888 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 30787789  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30787788 aacggcttcttgtcacccctatttgctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctggttct 30787695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 853; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 45765428 - 45764535
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765428 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 45765329  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765328 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 45765229  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765228 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 45765129  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  45765128 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 45765029  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45765028 attcaatgcataactttccggaaaaatatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 45764929  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764928 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 45764829  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764828 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgctggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 45764729  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764728 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 45764629  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45764628 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 45764535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 827; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 911
Target Start/End: Original strand, 616763 - 617654
Alignment:
Q  20 tgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgc 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  616763 tgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgc 616862  T
Q  120 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcact 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  616863 aaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcact 616962  T
Q  220 acatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  616963 acatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttaagtgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcc 617062  T
Q  320 cgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaat 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  617063 cgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaat 617162  T
Q  420 tcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaag 519  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617163 tcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaag 617262  T
Q  520 aagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacc 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617263 aagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacc 617362  T
Q  620 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  617363 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttg 617462  T
Q  720 gatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaa 819  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617463 gatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaa 617562  T
Q  820 cggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  617563 cggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 617654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 801; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 18107433 - 18106552
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107433 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 18107334  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107333 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 18107234  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18107233 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 18107134  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  18107133 attgctcacctctttcccatcctttttaaagctcaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 18107034  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18107033 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcaccaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 18106934  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106933 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 18106834  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18106833 aactacctcaaacattagcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 18106734  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106733 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 18106634  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106633 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18106552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 789; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 42501452 - 42500571
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  42501452 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccatgtttgtggtcatgcaa 42501353  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501352 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatctacaaaaattgggaaatcactac 42501253  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  42501252 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 42501153  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  42501152 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 42501053  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42501052 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 42500953  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500952 gtttacacaatatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 42500853  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42500852 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 42500753  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42500752 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 42500653  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500652 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 42500571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 688; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15067934 - 15067162
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067934 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcatccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 15067835  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15067834 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctaaaaaaattgggaaatcactac 15067735  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15067734 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 15067635  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  15067634 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 15067535  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067534 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 15067435  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067434 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 15067335  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15067334 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 15067235  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067234 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 549; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 47062926 - 47062047
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47062926 atgtattttcttccaacaagtacccaaatcacctacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 47062827  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     |||| ||||||||||||||    
T  47062826 ccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataattattgaaaagtgggaaatcactac 47062727  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||| ||    
T  47062726 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccataccctcattatcttctccacaacatcgcg 47062627  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  47062626 aggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatccaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 47062530  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  47062529 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccgtaggcatattcatctttgacgtaagaa 47062430  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaa-cccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47062429 gtttacgcaacaattttaaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccc 47062330  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||    
T  47062329 caactacctcaaacattggcatcttgtacattttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaattttttaaacaacttaacggatgttgg 47062230  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  47062229 atgagcccgaaagatatcttcaattgtagtactttcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaac 47062131  T
Q  821 ggcttcttgtc-acccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062130 ggcttcttgtcaacctctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 47062047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 94 - 903
Target Start/End: Original strand, 43826697 - 43827503
Alignment:
Q  94 cgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggca 193  Q
    |||||| |||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43826697 cgattctaccctgttggtagttctacaaccaagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggcggtcatggca 43826796  T
Q  194 taatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatg 293  Q
    || | ||  ||||  ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  43826797 tactttaggaaaagcgggaaatcactacaaacatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatg 43826896  T
Q  294 cgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaac 393  Q
    | |||||||||||||||||  |||| |||    ||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||  ||||  || |||||||||||    
T  43826897 cattcattatcttcttcacaccatcgcgaggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaagatatttacaatctaagatgcatctttgtttaac 43826993  T
Q  394 attagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcacc 493  Q
    ||| |||||||||||       ||||||| |||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||||    
T  43826994 atttgcttgcacatgaaaataacaattcattgcataactttcggggaaaacatttccaaccgctttcatcaaagacatatccctgctagtgacaatcacc 43827093  T
Q  494 ttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccg 593  Q
    ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43827094 ttaagcatattcatctttaacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagtttttatctttctcatatgtcacaaatccaaacccaaccg 43827193  T
Q  594 aatatgtcaaatcggttgaa-gtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaa 692  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43827194 aatatgtcaaatcggtcgaaagtgacccaaactacctcaaacattggcatcttgtacacgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaa 43827293  T
Q  693 aattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctc 792  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43827294 aattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatattttcaattgtagtactttcactttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctc 43827393  T
Q  793 ctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatg 892  Q
     | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43827394 attcaacttcgaga-tagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatg 43827492  T
Q  893 caatgtggtct 903  Q
    |||||||||||    
T  43827493 caatgtggtct 43827503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 52 - 675
Target Start/End: Original strand, 12116418 - 12117038
Alignment:
Q  52 acccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgcc 151  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12116418 acccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccctgttagtggtcctgcaaccaagatgcagcacatggtctgtccatgcc 12116517  T
Q  152 ctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttg 251  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12116518 ctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatgtttgaaaagtgggaaatcaccacatgaatcttggaactccactaatgcatttg 12116617  T
Q  252 catataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaa 351  Q
    || |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||| |||    || ||||||||| |||||||||       
T  12116618 caaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttctatgccctcattatcttcttcacaacatcgcgacgtttcgcctctttcctatcctttttt-- 12116715  T
Q  352 gcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgca 451  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||    
T  12116716 -cccaaaggatatttacaatcgaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgca 12116814  T
Q  452 accgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaa 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12116815 accgctttcatcaaagacatatccatgtcagtcacaatcaccttaggcatatttatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaactcaaacaa 12116914  T
Q  552 agttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacat 651  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12116915 agttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggccgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacat 12117014  T
Q  652 gttggtcttgtacgtggagtccat 675  Q
    |||||| ||||| |||||||||||    
T  12117015 gttggttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 8401546 - 8401016
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  8401546 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgtccaaatatttcattactaaagcatgagctgattctaccatgttggtggttctgcaa 8401447  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| | ||  |||| ||| ||||||||||    
T  8401446 ctaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcattcaaggtggtcatgacatactttaggaaaagtggaaaatcactac 8401347  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||       
T  8401346 aaaaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgtc 8401247  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  8401246 atgtttcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 8401150  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||| |||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8401149 attgcataaattttggggaaaacattttcaaccgctttcatcaaagacatatcattgtcagtcacaatcaccttaggcatcttcatctttgacgtaagaa 8401050  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagtt 555  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8401049 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagtt 8401016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 22 - 408
Target Start/End: Original strand, 10707697 - 10708081
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcga-ccctgtttgtggtcctgca 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  10707697 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgca 10707796  T
Q  121 accaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcacta 220  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||    
T  10707797 acatagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaatcacta 10707896  T
Q  221 catgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatccc 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |    
T  10707897 catgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagcattccatgccttcattatcttcttcacaacatcgc 10707996  T
Q  321 gattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatg 408  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10707997 gaggtttcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacattttcttgcacatg 10708081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 647 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 8401006 - 8400750
Alignment:
Q  647 tacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatag 746  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8401006 tacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaattg 8400907  T
Q  747 tattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcctt 846  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  8400906 tagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttgcctt 8400807  T
Q  847 ccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8400806 ccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtct 8400750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 790 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060777
Alignment:
Q  790 ctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 889  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  890 atgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtct 15060777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1297481 - 1297321
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  1297481 gtcataaatgaaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtggctccaactatttcaaaaaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 1297382  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  1297381 ccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttggatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 573 - 757
Target Start/End: Original strand, 16795663 - 16795847
Alignment:
Q  573 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 672  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || |||||| |||| ||    
T  16795663 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaagtgagttcaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatc 16795762  T
Q  673 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 757  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |  |||| || ||| |||||||||    
T  16795763 cattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaataagtcttgaacagttttactttca 16795847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 517 - 732
Target Start/End: Original strand, 40445076 - 40445291
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||  |||||| || || |||||   |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  40445076 aagaagtttaagcaacatttgcaaagcccaagtaaagttatcctccttctccgatgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtg 40445175  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||| || |  ||||    
T  40445176 actccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaatccattatcaaaacagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatg 40445275  T
Q  717 ttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||||||| ||||||    
T  40445276 ttggatgagtccaaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 47867065 - 47867225
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  47867065 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagt 47867164  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||| | ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  47867165 ccattatcaaagcagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 517 - 732
Target Start/End: Original strand, 43378819 - 43379034
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||| ||||||||   ||| |||||  |||||| || || ||||||   ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || ||     
T  43378819 aagaagtttaagcaacatttacaaagcccaagtaaagttatcctccttctcagacgtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtg 43378918  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    || |||||||  ||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||    
T  43378919 actccaactatttcaaacaatagaatcctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatg 43379018  T
Q  717 ttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||||||| ||||||    
T  43379019 ttggatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 16794179 - 16794339
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |    
T  16794179 gtcataaatgaaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaat 16794278  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||| |||||| ||||||    
T  16794279 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttactgatgtttgatgagtccaaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 40794418 - 40794258
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  40794418 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttaaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaat 40794319  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||   |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40794318 ccattctcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 45172475 - 45172635
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||| || | |||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  45172475 gtcataaatgcaaaatcaactgaatatgtcaaataggtcgaagtgactcaaactatttcaaataatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45172574  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    | || | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45172575 caattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 46791804 - 46791660
Alignment:
Q  588 caaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 687  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  46791804 caaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagt 46791705  T
Q  688 tggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
     |||||| ||||||| || || |  ||||||||||||| ||||||    
T  46791704 cggaaaagtgttaaataactttactgatgttggatgagtccaaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 517 - 745
Target Start/End: Original strand, 8193790 - 8194019
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaat-ccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagt 615  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||  |||||| || || |||||    ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||  ||||| ||    
T  8193790 aagaagtttaagcaacatttgtaaagcccaagtaaagttatcatccttctccgacgtcataaatgcctaaccaaaccgaatatgtcatattagttgaggt 8193889  T
Q  616 caccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggat 715  Q
     || | |||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||| | ||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |   ||    
T  8193890 gactctaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaatgcattatcaaaacagtcggaaaattattaaacaactttaccaat 8193989  T
Q  716 gttggatgagcccaaaaaatatcttcaata 745  Q
    |||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  8193990 gttggatgagtccaaaatatgtcttgaata 8194019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3762971 - 3762832
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||  | |||| |||  | | ||  |||| ||||| |||||     
T  3762971 atgtattttatcccaacaagtacc-aagtcatccacactagtgctcaaatatttcttcaacctaccatgagcccctacaactgtgttggtggttctgcag 3762873  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 162  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3762872 ccaagatgcaagacatggtctgaccatgcccccactatttt 3762832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 56
Target Start/End: Original strand, 12113572 - 12113606
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12113572 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcaccca 12113606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 3762455 - 3762154
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||| | |||||||   ||||||||||  |||||| || || ||||||  | ||| |||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||| ||     
T  3762455 aagaagttgaagcaacatccgtaaaacccaagtaaagttatcctccttctcaactatcagaaatgcaaaagcaaccgaatatttcatatcggttgaggtg 3762356  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    | ||||| || |||||||| | ||||| | |||| |||||| || || ||||||||||| | ||||||  |  | |||| ||||||||| ||||  |||     
T  3762355 aacccaattatctcaaacaattgcatcatgtacaagttggttttataggtggagtccatgatcaaaactttcaggaaatcgttaaacaacttaaccgatt 3762256  T
Q  717 ttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattg 816  Q
      | |||||||||||| || || | |||||||  ||| |||  ||||||||||| | |||||  ||| |||| ||| |||||||| || | |||||| ||    
T  3762255 cggaatgagcccaaaatatgtcctgaatagtagaactctcacattgtgttcttgtgaaataaacatatttgtactcttccaactttgacactagaaactg 3762156  T
Q  817 ca 818  Q
    ||    
T  3762155 ca 3762154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 25569735 - 25569796
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  25569735 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 25569796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 46792306 - 46792245
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  46792306 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 46792245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 865; Significance: 0; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 865; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 5349216 - 5348323
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349216 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 5349117  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349116 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 5349017  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349016 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 5348917  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  5348916 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 5348817  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348816 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 5348717  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348716 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 5348617  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348616 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 5348517  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348516 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 5348417  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5348416 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 5348323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 865; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 41562061 - 41561168
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41562061 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 41561962  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561961 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 41561862  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561861 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 41561762  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  41561761 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 41561662  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561661 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 41561562  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561561 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 41561462  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561461 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 41561362  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561361 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 41561262  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41561261 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 41561168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 861; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 211453 - 212346
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211453 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 211552  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211553 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 211652  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211653 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 211752  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  211753 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 211852  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  211853 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttatgcatattcatctttgacgaa 211952  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211953 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 212052  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212053 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 212152  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212153 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 212252  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  212253 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 212346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 861; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 10622466 - 10623359
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622466 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 10622565  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622566 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 10622665  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622666 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 10622765  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  10622766 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 10622865  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622866 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 10622965  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622966 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 10623065  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623066 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 10623165  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623166 tagatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 10623265  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10623266 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 10623359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 811; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 905
Target Start/End: Complemental strand, 38947812 - 38946925
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947812 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 38947713  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947712 gcaaccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 38947613  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947612 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgattgggcgattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 38947513  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  38947512 cccgattgctcacccctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 38947413  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947412 attcaatgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 38947313  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38947312 aaaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagttgaagtca 38947213  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38947212 ccccaactacctcaaacattggcatcttatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgt 38947113  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947112 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 38947013  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctct 905  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38947012 aacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctct 38946925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 769; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 39796015 - 39795134
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  39796015 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaa 39795916  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795915 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgctctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 39795816  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39795815 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactattgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 39795716  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  39795715 attgctcacctctatcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 39795616  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795615 attgcataacttcccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 39795516  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795515 gtttacgcaacatctttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 39795416  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39795415 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 39795316  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39795315 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactatcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 39795216  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795215 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39795134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 765; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 27274376 - 27275257
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27274376 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 27274475  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  27274476 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 27274575  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  27274576 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatcgcg 27274675  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  27274676 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 27274775  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274776 attgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 27274875  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274876 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 27274975  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27274976 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 27275075  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275076 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 27275175  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275176 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 27275257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 702; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 24751704 - 24750822
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24751704 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 24751605  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24751604 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 24751505  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||| ||    
T  24751504 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaaaacatcgcg 24751405  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  24751404 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 24751305  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751304 attgcataactttcggaaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 24751205  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24751204 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 24751105  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctat-acatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24751104 aactacctcaaacattggcatcctataacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgg 24751005  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24751004 atgagcccaaaagatatctttgatcgtattactttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 24750905  T
Q  821 ggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750904 ggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24750822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 7265025 - 7264229
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7265025 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaa 7264926  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7264925 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatcactac 7264826  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7264825 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 7264726  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||    
T  7264725 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaactc 7264626  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264625 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgataacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 7264526  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264525 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 7264426  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  7264425 aactacatcaaacattggcatcctatacatgttaattttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtttaactacttaatggatgttgga 7264326  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 818  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264325 tgagcctaaaaaatatcttcaatggtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 587; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 185 - 903
Target Start/End: Original strand, 3801745 - 3802463
Alignment:
Q  185 gtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatag 284  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  3801745 gtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatag 3801844  T
Q  285 ttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacct 384  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3801845 atttccatgccttcattatcttcttcaccacttcgcgattgctcacctctttctcatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatctaagacacacct 3801944  T
Q  385 ttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggta 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3801945 ttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggta 3802044  T
Q  485 acaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaa 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3802045 acaatcaccttaggcatattcatctttgacaaaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaaattttcctctttctcatgtgtcataaatccaa 3802144  T
Q  585 acccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaa-cattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaa 683  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3802145 acccaactgaatatgtcaagtcggttgaagtcaccc-aactacctcaaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa 3802243  T
Q  684 ccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtata 783  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802244 ccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtata 3802343  T
Q  784 gttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaca 883  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3802344 gttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcaca 3802443  T
Q  884 tttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  3802444 tttgtcatgcaatgtggtct 3802463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 24604108 - 24604986
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24604108 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaa 24604207  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | ||||||| |||||    
T  24604208 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttgaaaagt-gggaaataactac 24604306  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgt-tcattatcttcttcaccacatccc 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |  ||||| |    
T  24604307 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgcgcctcattatcttcttgagaacatcgc 24604406  T
Q  321 gattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaatt 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||        |||||    
T  24604407 gattactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacattaaagtaacaatt 24604503  T
Q  421 caatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 520  Q
    || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24604504 cattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagaaatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaaga 24604603  T
Q  521 agtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  24604604 agtttacgcaacatttttaaaactcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccc 24604703  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  24604704 caactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttgg 24604803  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604804 atgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 24604903  T
Q  821 ggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604904 ggcttcttgtcacctctatttgtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24604986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 903
Target Start/End: Original strand, 1097889 - 1098723
Alignment:
Q  66 ccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtc 165  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  1097889 ccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctaccaattttgtc 1097988  T
Q  166 cttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttga 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1097989 cttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaattgggaaatcactacatgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttga 1098088  T
Q  266 ttgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatt 365  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||    
T  1098089 gtgggcgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatgtt 1098185  T
Q  366 tacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaa 465  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       | ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1098186 tacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacgattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaa 1098285  T
Q  466 agacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttc 565  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1098286 agacaattccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcctctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttc 1098385  T
Q  566 tcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacg 665  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  1098386 tcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgattatgtcaaatcggtcgatgtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagg 1098485  T
Q  666 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgt 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||  ||||||    
T  1098486 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcggttgtagtactttcactttgtgt 1098585  T
Q  766 tcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttca 865  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098586 tcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttca 1098685  T
Q  866 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098686 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1098723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 548; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 45477400 - 45476524
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45477400 atgtattttctccaaacaagtacccaaatcacccacactattttccaaatatttattcactaaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 45477301  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  45477300 ccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcgctattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgagaaatcactac 45477201  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||    
T  45477200 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgcccttattatcttcttcacaacatcacg 45477101  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  45477100 aggtttcacctctttcccatccttttttt--cccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 45477003  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  45477002 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgcttttatcaaagacatatcactgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttgatgtaagaa 45476903  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  45476902 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcagatcgtttgaagtgacccc 45476803  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  45476802 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttgga 45476703  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45476702 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 45476603  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 901  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476602 gcttcttgtcacctctatttgccttccata-ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 45476524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 9656197 - 9655320
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  9656197 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctacaa 9656098  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  9656097 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 9655998  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||   |    
T  9655997 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccgtcattatcttcttgacaacattggg 9655898  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||       ||||||    
T  9655897 attactcacttctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcctgcacatgaaagtaacaattc 9655801  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9655800 attgcataactttcggggaaaacatttgcaactgctttcatcatagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggtatattaatctttgacgtaagaa 9655701  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||    
T  9655700 gtttatgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcct-tttctcatgtgttacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaatgacccc 9655602  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9655601 aactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 9655502  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  9655501 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacg 9655402  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9655401 acttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtct 9655320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 12906511 - 12907389
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12906511 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaaacatgagccgattcaaccctgttggtggtcctgcaa 12906610  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  12906611 ccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaatcactac 12906710  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  12906711 atgaatcttggaactccaccaatgcatttgcatataactcttgagtaggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 12906810  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  12906811 aggtttcacctctttcccatcctttttt---ccgaaaggatatttacaatataagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagcaacaattc 12906907  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12906908 attgcataactttcgggaaaaatatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcactgtcagtcataatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 12907007  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12907008 gtttacgcaatatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 12907107  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12907108 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 12907207  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||| |||||| |||| ||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12907208 tgagtccaaaagatattttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacg 12907307  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907308 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12907389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 903
Target Start/End: Original strand, 43948305 - 43949179
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43948305 tattttctcctaacaagtacccaaatcacccacactattgcccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaacca 43948404  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| | | ||| |||||| |||    
T  43948405 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttgaaaagtggagaa-tcactatatg 43948503  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgatt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| |||||  ||      
T  43948504 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgcccccattatcttcttcacaacatcgtgagg 43948603  T
Q  325 gctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaat 424  Q
      ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||        |||||| |    
T  43948604 tttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaagaattcatt 43948700  T
Q  425 gcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtt 524  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43948701 gcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatctctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaattt 43948800  T
Q  525 tacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaac 624  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  43948801 tacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtagaagtgaccccaac 43948900  T
Q  625 tacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 724  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43948901 tacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatga 43949000  T
Q  725 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 824  Q
    |||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  43949001 gcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggct 43949100  T
Q  825 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949101 tcttgtcacctatatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43949179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 903
Target Start/End: Original strand, 41006998 - 41007877
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  41006998 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtgatcctgcaacca 41007097  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |   |||| ||||||| |||  ||||    
T  41007098 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtgattatggcataatttttgaaaagtgggaaaacacatcatg 41007197  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgatt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||  ||||     
T  41007198 aatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggcgattcaaccatagtttttcatgtcctcattatcttcttcacaacattgcgatg 41007297  T
Q  325 gctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaat 424  Q
      |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||| |    
T  41007298 tttcacctctttcccatccttttgt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcatt 41007394  T
Q  425 gcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatat----ccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 520  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41007395 gcataattttcgggaaaaatatttgcaaccgctttcatcaatgacatatatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaaga 41007494  T
Q  521 agtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  41007495 agtttacgcaacatttttaaaacctaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatcgaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcgaagtgaccc 41007594  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  41007595 caactacctcaaacattggcatcctgtacatgttagttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgttaaacaacttaacagatgttgg 41007694  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007695 atgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 41007794  T
Q  821 ggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007795 ggcttcttgtcacctctatttgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41007877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 34919801 - 34920679
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  34919801 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaa 34919900  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||  |||||||| |||||| |   |||| ||| |||||||| |    
T  34919901 ccaagatgcaacgcatggtctgtccatgctctcactattttctccttcacttcattcaatatggtcatgacataattttggaaaagtggaaaatcactgc 34920000  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  34920001 atgaatcttggaactccactaatacatttgcatataacttttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 34920100  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
         ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||        |||||    
T  34920101 tggtttcacctctttcccatccttttttt---ccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaataattc 34920197  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34920198 attgcataactttcggggaaaacatttgcatccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcatcataggcatattcatctttgacgtaagaa 34920297  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||    
T  34920298 gtttacgcaacatttttaaaactcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcaaagtgacccc 34920397  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  34920398 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgttaaacaacttaacagatgttgga 34920497  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34920498 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacg 34920597  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920598 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 34920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 437362 - 436475
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |  ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  437362 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaaacatgagaagattcaaccatgttggtggtcctgcaa 437263  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  437262 ccaagatgcaacacatgatatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 437163  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcat--------ataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcacc 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||     
T  437162 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcattattgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcaca 437063  T
Q  314 acatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnn 413  Q
    ||||| |||    |||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||||   || || ||||||||||||||||| |||||||||||         
T  437062 acatcgcgaggtttcacctctttcccatcatttttt---cctaaaggatatttacaacctaatacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagt 436966  T
Q  414 nncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 513  Q
      ||||||| |||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  436965 aacaattcattgcataactttcggggaaaatatttgcaaccactttcataaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttaa 436866  T
Q  514 cgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaa 613  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  436865 cgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacggaatatgtcaaatcggtcgaa 436766  T
Q  614 gtcaccccaactacctcaaac-attggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatg 712  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  436765 gtgaccccaactacctcaaaccattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaa 436666  T
Q  713 gatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaa 812  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  436665 gatgttagatgagcccaaaagatatcttagattgtagtactttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagat 436566  T
Q  813 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436565 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 436475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 11691849 - 11692712
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11691849 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggtcctgcaa 11691948  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||    
T  11691949 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctaactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaagtgggaaatcactac 11692048  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |   ||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| || ||||  ||    
T  11692049 aaacatcttggagctccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccataactttccatgctctcattatcttcttgacaacattgcg 11692148  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||  || |  ||||| |||||||||||  ||| ||||||       ||||||    
T  11692149 attactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttataatctaatatgcacctatgtttaacattttcttacacatgaaagtaacaattc 11692245  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11692246 attgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccactttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatattcaactttgacgtaagaa 11692345  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11692346 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaactgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 11692445  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||| |||||||||||               ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  11692446 aactaccttaaacattggca---------------tcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttgga 11692530  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    || |||||||| |||||||| || ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  11692531 tgggcccaaaatatatcttctattgtagtaatttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacg 11692630  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692631 gcttcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11692712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 710
Target Start/End: Original strand, 24940669 - 24941354
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24940669 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtagtcctgcaa 24940768  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||| |||||    
T  24940769 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat-tttgaaaagtgggaaataactac 24940867  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcg-ttcattatcttcttcaccacatccc 320  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||| |  ||||| |    
T  24940868 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaatcatagctttgcatgcgcctcattatcttcttgagaacatcgc 24940967  T
Q  321 gattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaatt 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||        |||||    
T  24940968 gattactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacataaaagtaacaatt 24941064  T
Q  421 caatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 520  Q
    || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941065 cattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagaaatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaaga 24941164  T
Q  521 agtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  24941165 agtttacgcaacatttttaaaactcaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccc 24941264  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941265 caactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 24941354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 17996206 - 17997069
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||| ||| || || ||||||    
T  17996206 atgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctacccggttggtcgttctgcaa 17996305  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||||    
T  17996306 tcaagatgcaacacatggtctgtccatgcc---------------ttcacttcatccaaggtggtcatggcataggttaggaaaattgggaaatcactac 17996390  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |   ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |     
T  17996391 aaacatcttggaactccaataatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaacaatagttttccatgtgctcgttatcttcttcactacatcacc 17996490  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||   ||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||| |||| |  ||||  |||||||||||||||||   |||||||||       ||||||    
T  17996491 atgtttcacctccttcccattctttttt---cccaaaggatatctacagtctaagatgcacctttgtttaacatttttttgcacatgaaagtaacaattc 17996587  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || | ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||    |||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17996588 attgcataactttcagggagaacatttgcaaccgcattcataaaagacatatctctgtcaaacacagccaccctaggcatattcatctttgacgtaagaa 17996687  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || |||||    
T  17996688 gtttacgcatcatttgtaaaaaccacacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaggtgacccc 17996787  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  17996788 aactatctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgttaaacaacgtaacggatgttgga 17996887  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||     
T  17996888 tgagcctaaaagatatcttcaatagtagtactttcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattagaaactacaaca 17996987  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
     | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  17996988 tcgtcttgtcacctctatttgacttccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtct 17997069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 22 - 520
Target Start/End: Original strand, 28347416 - 28347911
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28347416 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctattggtggtcctgcaa 28347515  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  28347516 ccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcaattcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactac 28347615  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||    
T  28347616 atgaatcttggaactccactaattcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgcg 28347715  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  28347716 attactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 28347812  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 520  Q
    | |||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28347813 attgcataacttttggggaaaacattttcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttagacatattcatctttgacgtaaga 28347911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 653 - 903
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354799
Alignment:
Q  653 ttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattac 752  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  753 tttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatat 852  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatat 28354748  T
Q  853 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28354749 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtct 28354799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 22 - 189
Target Start/End: Original strand, 3797817 - 3797984
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3797817 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 3797916  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcat 189  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3797917 cctagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcat 3797984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 25618105 - 25618251
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||| |||| |  |||| ||| || ||||| || ||||| |||||  ||||     
T  25618105 atgtattttctcccaacaagtacccagatcacccacactattactcaaatatatctttactaaagtatgagctgattcaactctgttggtggttatgcag 25618204  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  25618205 ccaagatgcaacacatggtctttccatgccctcactattttatcctt 25618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 517 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 21535733 - 21535507
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||   |||||| || || ||||||   |||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||     
T  21535733 aagaagtttaagcaacatttgtaaagcccaggtaaagttatcctccttctcacccgtcatatatgcaaaaccaaccgaatatgtcatatcagttgaggtg 21535634  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||| || |      |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||     
T  21535633 accccaactatctcaaatagtggcatcatgtacatgttggttttat------agtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaccaacctaactgatt 21535540  T
Q  717 ttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 749  Q
      |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21535539 gaggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtat 21535507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 593 - 757
Target Start/End: Original strand, 28423061 - 28423225
Alignment:
Q  593 gaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaa 692  Q
    |||||||||| ||||||||| || || |||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||| || || |    
T  28423061 gaatatgtcacatcggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcggga 28423160  T
Q  693 aattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 757  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||    
T  28423161 aattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttgactttca 28423225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 28422550 - 28422617
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 171  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28422550 ctgtttgtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtctatccatgccctcactattttgtccttcac 28422617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 619 - 710
Target Start/End: Original strand, 3353894 - 3353985
Alignment:
Q  619 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 710  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3353894 cccaactatctcaaacaataacatcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaa 3353985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24684115 - 24683970
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||   | |||| |||  ||| ||  |||||||||| ||||||    
T  24684115 atgtattttatcctaacaa-tacttaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaatttaccatgagccccttcaactttgtttgtggttctgcaa 24684017  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    | ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24684016 ctaagatgcaagacacggtgtgtccatgccctcactattttttcctt 24683970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 865 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264196
Alignment:
Q  865 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtct 7264196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 865; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 865; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 44467631 - 44466738
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467631 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 44467532  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467531 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 44467432  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467431 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 44467332  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  44467331 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 44467232  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467231 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 44467132  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467131 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 44467032  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467031 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 44466932  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466931 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 44466832  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44466831 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 44466738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 857; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 20351505 - 20350612
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351505 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 20351406  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351405 gcaaccaagatgcaatacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 20351306  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20351305 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatattcttcaccacat 20351206  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  20351205 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 20351106  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351105 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 20351006  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351005 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 20350906  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350905 cccaaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 20350806  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350805 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 20350706  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20350705 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 20350612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 850; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 38774126 - 38775020
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774126 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 38774225  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774226 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 38774325  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774326 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 38774425  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnn-c 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  38774426 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaac 38774525  T
Q  417 aattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacga 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774526 aattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacga 38774625  T
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774626 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 38774725  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774726 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 38774825  T
Q  717 ttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattg 816  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774826 ttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattg 38774925  T
Q  817 caacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38774926 caacggcttcttgtcacccatatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 38775020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 849; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 3946473 - 3947366
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946473 tgtgatgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 3946572  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3946573 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatca 3946672  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946673 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 3946772  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  3946773 cccgattgctcacctctttcccgtcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 3946872  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946873 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 3946972  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3946973 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 3947072  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947073 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 3947172  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947173 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 3947272  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3947273 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3947366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 817; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 29354704 - 29355585
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354704 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 29354803  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29354804 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 29354903  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29354904 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 29355003  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  29355004 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 29355103  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355104 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 29355203  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355204 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 29355303  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29355304 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 29355403  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355404 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 29355503  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355504 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29355585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 777; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 5079980 - 5079099
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5079980 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaattatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccttgtttgtggtcctgcaa 5079881  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079880 cctagatgcaacacatggtctgtccatgccttcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 5079781  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5079780 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 5079681  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  5079680 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaattc 5079581  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079580 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 5079481  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079480 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 5079381  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5079380 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 5079281  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079280 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 5079181  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079180 gcttcttgtcacccctatctgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 5079099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 773; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 13631461 - 13630580
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13631461 atgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 13631362  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631361 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 13631262  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13631261 atgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 13631162  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  13631161 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 13631062  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13631061 attgcataactttccggaaaaatatgtgcaaccgctgtcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 13630962  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630961 gtttacgcaacatctttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 13630862  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13630861 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 13630762  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13630761 tgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 13630662  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630661 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13630580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 677; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 12648595 - 12649476
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12648595 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 12648694  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12648695 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 12648794  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |||||  |    
T  12648795 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgtg 12648894  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  12648895 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 12648994  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12648995 attgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 12649094  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12649095 gtttacacaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 12649194  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12649195 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 12649294  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||    
T  12649295 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacg 12649394  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
     |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649395 acttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12649476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 615; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 50115782 - 50116660
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  50115782 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaaaaaagcatgagacaaatcgaccctgttagtggtcctgcaa 50115881  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||     
T  50115882 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatataaaaaaattgggaaatcactaa 50115981  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || | ||| ||    
T  50115982 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaatatcgcg 50116081  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||       ||||||    
T  50116082 attactcacctatttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgtttgcatatgaaagtaacaattc 50116178  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50116179 attgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaagcatattcatctttgacgaaagaa 50116278  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50116279 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 50116378  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  50116379 aactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttaga 50116478  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  50116479 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacg 50116578  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116579 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 50116660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 601; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 37016950 - 37016078
Alignment:
Q  28 tttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaaga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37016950 tttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaaccaaga 37016851  T
Q  128 tgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||||||| |||| ||| |||||||    
T  37016850 tgcaacacatggtctgtccatgccctaacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaattggaaaattactgcatgaat 37016751  T
Q  228 ctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgct 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  37016750 cttggaactccactaatgcatttgcatataactgctgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgcgattact 37016651  T
Q  328 cacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgca 427  Q
    || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||| ||||    
T  37016650 cagctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgca 37016554  T
Q  428 taactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttac 527  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016553 taactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgttggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttac 37016454  T
Q  528 gcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactac 627  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  37016453 gcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactac 37016354  T
Q  628 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcc 727  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  37016353 ctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcc 37016254  T
Q  728 caaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttct 827  Q
    ||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37016253 caaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttct 37016154  T
Q  828 tgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016153 tgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 37016078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 569; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 311 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 3984870 - 3984269
Alignment:
Q  311 accacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnn 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  3984870 accacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaa 3984771  T
Q  411 nnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgg-taacaatcaccttaggcatattcatct 509  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3984770 aaaaacaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcgggtaacaatcaccttaggcatattcatct 3984671  T
Q  510 ttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggt 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984670 ttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggt 3984571  T
Q  610 tgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattta 709  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984570 tgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattta 3984471  T
Q  710 atggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagatta 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984470 atggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagatta 3984371  T
Q  810 gaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgctt 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3984370 gaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggtt 3984271  T
Q  910 ct 911  Q
    ||    
T  3984270 ct 3984269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 564; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 223 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 41455681 - 41455001
Alignment:
Q  223 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccga 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  41455681 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatcgcga 41455582  T
Q  323 ttgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattca 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  41455581 ttgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaattca 41455482  T
Q  423 atgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaag 522  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41455481 ttgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggtatattcatctttgacgaaagaag 41455382  T
Q  523 tttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccca 622  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41455381 tttacgcaacatttgtaaaacccaaacaaaattttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgacccca 41455282  T
Q  623 actacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggat 722  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41455281 actacctcaaacattggcatcctttacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggat 41455182  T
Q  723 gagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgg 822  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455181 gagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgg 41455082  T
Q  823 cttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455081 cttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41455001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 38690958 - 38691836
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | | |||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||    
T  38690958 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaaatatttcttccatagaacatgagcctattctactctgttggtggtcctgcaa 38691057  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||     
T  38691058 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttttccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatttttgaaaagtgggaaatcactaa 38691157  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  38691158 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 38691257  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    |||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  38691258 aggattcacgtctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 38691354  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  38691355 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcacctcaggcatatttatctttgacgtaagaa 38691454  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38691455 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 38691554  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  38691555 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacagatgttgga 38691654  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38691655 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacg 38691754  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691755 gcttcttgtcatctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 38691836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 51664297 - 51663422
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51664297 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttatccaataaagcatgagccgattcgaccctgttagtggtcctgcaacca 51664198  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||    
T  51664197 agatgcaacatatggtttgtccatgccttcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactacatg 51664098  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgatt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||| | |      
T  51664097 aatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccatcattatcttcttcacagcatcgctagg 51663998  T
Q  325 gctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaat 424  Q
      ||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||       ||||||| |    
T  51663997 tttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatctacaatctaagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcatt 51663901  T
Q  425 gcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtt 524  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51663900 gcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcactgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtt 51663801  T
Q  525 tacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaac 624  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  51663800 tacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacatattcaaactcaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaac 51663701  T
Q  625 tacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 724  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51663700 tacctcaaacactggcattttatacatgttggttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaggatgttggatga 51663601  T
Q  725 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 824  Q
    |||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51663600 gcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgact 51663501  T
Q  825 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663500 tattgtcacctctatttgccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 51663422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 13175823 - 13174945
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||   ||||||||||||  ||||| |||||    
T  13175823 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacaccattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagctagttcgaccctgttgatggtcttgcaa 13175724  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  13175723 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcattgcataattttggaaaagtgggaaatcactac 13175624  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  13175623 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggacgattcaaccatagttttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 13175524  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    || |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  13175523 aggtttctcctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgtacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 13175427  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13175426 attgcataactttcggggaaaacatttacaaccactttcatcaaagacatatccctgtcagtcacagtcaccttaggcatattcatctttgacgtaataa 13175327  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13175326 gtttacgcaacatttttgaaactcaaacaaatttttcctctttctcatgggtcacaaatccacacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 13175227  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13175226 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgatggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgttaaacaacttagcggatgttgga 13175127  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13175126 tgagcacaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacg 13175027  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175026 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13174945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 46975112 - 46974328
Alignment:
Q  116 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||    
T  46975112 ctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcactattttcttcttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaat 46975013  T
Q  216 cactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccac 315  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | ||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  46975012 cactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcaaataactcttgagtgggcgtttcaaccataactttccatgccctcgttatcttcttcacaac 46974913  T
Q  316 atcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnn 415  Q
    |||  ||    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||           
T  46974912 atcgtgaggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaa 46974816  T
Q  416 caattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacg 515  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974815 caattcattgcataacttccggggaaaacatttgcaaccactttaattaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacg 46974716  T
Q  516 aaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagt 615  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46974715 taagaagtttgcgcaacatttttaaaacccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcgattgaagt 46974616  T
Q  616 caccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggat 715  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  46974615 gaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacctgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgttaaacaacttaacggat 46974516  T
Q  716 gttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaatt 815  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  46974515 gttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatatt 46974416  T
Q  816 gcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46974415 gcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 46974328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 820
Target Start/End: Original strand, 19497483 - 19498277
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||| |    
T  19497483 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaaaatttctttactaaagcatgagcctattctaccctgttggtggttctgcca 19497582  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  19497583 ccaagatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 19497682  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| || | ||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  19497683 atgcatctaggaactccactaatgcatttccatataactcttgagtgtgcgattcaaccataacttttcatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 19497782  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  19497783 aggtttcacctcttttccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 19497879  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19497880 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagatatatccctgtctgtcacaatcaccttaggcatatttatctttgacgtaagaa 19497979  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19497980 gtttacgcaatatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagcctaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 19498079  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19498080 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgtttgttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 19498179  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    ||||||| |||| ||||||  || ||| ||||||||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19498180 tgagccc-aaaagtatctttgattgtagtactttcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 3991654 - 3991357
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991654 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 3991555  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991554 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 3991455  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccac 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3991454 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccac 3991357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 25 - 474
Target Start/End: Original strand, 36074820 - 36075267
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcga-ccctgtttgtggtcctgcaacc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||     
T  36074820 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattttatccctgttggtggtcctgcaaca 36074919  T
Q  124 aagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacat 223  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| |||||||| || ||||    
T  36074920 tagatgcaacgcatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttggaaaagtgggaaattaccacat 36075019  T
Q  224 gaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgat 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||     
T  36075020 gaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcgag 36075119  T
Q  324 tgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaa 423  Q
       ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||       |||||||     
T  36075120 gtttcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaatatttgcttgcacatgaaactaacaattcat 36075216  T
Q  424 tgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatc 474  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36075217 tgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaaaacatatc 36075267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 619 - 903
Target Start/End: Original strand, 21942977 - 21943261
Alignment:
Q  619 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgtt 718  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||| |    
T  21942977 cccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaacttaacgaatgat 21943076  T
Q  719 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 818  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21943077 ggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 21943176  T
Q  819 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    || | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21943177 acagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtct 21943261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 517 - 896
Target Start/End: Original strand, 32106165 - 32106533
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||  | ||     
T  32106165 aagaagtttaagcatcatttgtaaaacccaaacaaagttgtcatctttctcatgtgtcaaaaatccaaaatcaactgaatatgtcaaatcagtcaaggtg 32106264  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32106265 accccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataacc-----------aaaattgttaaacaacttaatggatg 32106353  T
Q  717 ttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattg 816  Q
    ||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  32106354 ttggatgagcttaaaatatgtcttcaatagtagtactttcactttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatg 32106453  T
Q  817 caacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 896  Q
    || |  | |||||||||| || || | |||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| ||||||    
T  32106454 catcatcgtcttgtcacctctgttcgacttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaat 32106533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 808 - 903
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44620000
Alignment:
Q  808 tagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 46976851 - 46976765
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtt 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||    
T  46976851 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattctaccttgtt 46976765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 36360086 - 36360246
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| || || | |||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  36360086 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatatcaaataggttgaggtgactcaaactatttcaaacagtgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 36360185  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  36360186 ccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 742 - 896
Target Start/End: Original strand, 26466006 - 26466160
Alignment:
Q  742 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 841  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | | || | ||| || | |    
T  26466006 aatagtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtat 26466105  T
Q  842 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 896  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  26466106 gacttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 26466160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 45472847 - 45472687
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  45472847 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggat 45472748  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45472747 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 517 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 28863440 - 28863225
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||| || || |||||    ||| ||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| ||     
T  28863440 aagaagtttaagcaacatttgtaaagcccaagcaaagttatcctccttctccgacgtcgtaaatgcaaaaccaatcaaatatgtcaaataggttgaggtg 28863341  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||| | |||||| || | |||| ||||||||||||| | | |||    
T  28863340 actccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaattttacgaatg 28863241  T
Q  717 ttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28863240 ttggatgagtccaaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 7404115 - 7403953
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacatt--ggcatcctatacatgttggtcttgtacgtgga 669  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  7404115 gtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatatggcattctatacaagttggttttgtacgtgga 7404016  T
Q  670 gtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
     ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  7404015 atccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 27283535 - 27283402
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  27283535 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactattttaaataatggcatcctatacaagttggttttgtgcgtggaat 27283436  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 705  Q
    |||  |  ||||| || |||||||||||||||||    
T  27283435 ccaatattaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 27283402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 18887360 - 18887520
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||| |||||| ||| ||  |||||||||| |    
T  18887360 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaagttagttctgtacgtggaat 18887459  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||   | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  18887460 ccattatcaaaaaaatcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagaccaaaa 18887520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Original strand, 32105687 - 32105833
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||| |  | |||||| |||  ||| || ||||| ||||| ||| |     
T  32105687 atgtattttctctcagcaagtacccaaatcacccacattattgctcgaatatttctttattatagcatgagccccttcaactctgttggtggttctgtat 32105786  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  32105787 ccaagatgcaagacatgatatgtccatgccctcactatttcgtcctt 32105833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 862 - 903
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980109
Alignment:
Q  862 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 20240170 - 20240037
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||| || ||| |||| | || || |||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  20240170 gtcataaatgcaaaatcaatcgaatatttcgaataggttaaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctatacaagttggttttgtacgtggaat 20240071  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 705  Q
    |||| | |||| | ||  ||||||||||||||||    
T  20240070 ccattatcaaagcagtcagaaaattgttaaacaa 20240037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 27284024 - 27283960
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  27284024 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactaatttgtcctt 27283960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 229 - 279
Target Start/End: Original strand, 32105897 - 32105947
Alignment:
Q  229 tttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaac 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||||    
T  32105897 tttgaactccactaatgcaattgcatataattcttgtgtgggtgattcaac 32105947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 168
Target Start/End: Original strand, 36359603 - 36359661
Alignment:
Q  110 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  36359603 gtggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 36359661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 714 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 25231655 - 25231558
Alignment:
Q  714 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 811  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||  || |||| | | | |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25231655 atgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattttgagattaga 25231558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 617 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 31445979 - 31445866
Alignment:
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||  ||||| || | ||||||||| || | |||||| |||| |||| |||||||||| || || |||     
T  31445979 accctaactaccttaaacaatgacattcaatacacattggttttatgcgtggagtctatgatcaaaactgttgaaaaagtgttaaacaactttatagatt 31445880  T
Q  717 ttggatgagcccaa 730  Q
    ||||||||||||||    
T  31445879 ttggatgagcccaa 31445866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 861; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 861; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 2930 - 2045
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2930 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 2831  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2830 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 2731  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2730 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 2631  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  2630 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 2531  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 2431  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2430 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 2331  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2330 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 2231  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2230 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 2131  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2130 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 861; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 861; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 903
Target Start/End: Original strand, 19071669 - 19072554
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071669 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 19071768  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071769 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 19071868  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19071869 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 19071968  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  19071969 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 19072068  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072069 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 19072168  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072169 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 19072268  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072269 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 19072368  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072369 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 19072468  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072469 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 19072554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 777; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 3405835 - 3404954
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3405835 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctatttgtggtcctgcaa 3405736  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405735 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 3405636  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3405635 atgaatctttgaactccactaatgcatttggatataactgtcgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 3405536  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  3405535 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 3405436  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405435 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 3405336  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405335 gtttacgcaaaatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgccataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 3405236  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3405235 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 3405136  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405135 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 3405036  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3405035 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 3404954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 547; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 4770172 - 4769298
Alignment:
Q  26 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  4770172 attttctcccaacaagtatccaaatcacccacactgttgtccaaatatttcttcactaaagcatgagccgattcgaccttgttggtggtcctgcaaccaa 4770073  T
Q  126 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatga 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| |||||||||||||||| |    
T  4770072 gatgcaacacatggtttgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatgacataattttggaaaagtgggaaatcactacatta 4769973  T
Q  226 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattg 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||||| ||||| ||||      
T  4769972 atcttggaactccactaatgcatttgcatataaatcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcgttattttcttcacaacatcgcgatgt 4769873  T
Q  326 ctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatg 425  Q
     ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||       ||||||| ||    
T  4769872 ttcacctctttcccatccttttttt---ccaaaggatatttacaatctaagacacacatttgtttaatatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattg 4769776  T
Q  426 cataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagttt 525  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4769775 cataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagatt 4769676  T
Q  526 acgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaact 625  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4769675 acgcaacatttttaaaacccaaacaaagtttttctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaact 4769576  T
Q  626 acctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 725  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4769575 acctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgag 4769476  T
Q  726 cccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggctt 825  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4769475 cccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggctt 4769376  T
Q  826 cttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769375 cttgtcacctctatttgccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4769298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 4977977 - 4978851
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4977977 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcactcacactattgaccaaatacttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgctggtggtcctgcaa 4978076  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  4978077 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcaaaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgtcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 4978176  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||    
T  4978177 atgaatcttgaaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgcg 4978276  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  4978277 attactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 4978373  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4978374 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatcattgacgtaagaa 4978473  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  4978474 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtatcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccct 4978573  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  4978574 aactacctcaaacattgacatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgttaaacaacttaacagacgttgga 4978673  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
     |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  4978674 agagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacg 4978773  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978774 gcttcttgtcacc----tttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4978851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 287 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 9891802 - 9891186
Alignment:
Q  287 ttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacaccttt 386  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  9891802 ttccatgccttcattatcttcttcaccgcatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaagatatttacaatccaagacacgccttt 9891703  T
Q  387 gtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaac 486  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9891702 gtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattcattgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacacatccctatcggtaac 9891603  T
Q  487 aatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaac 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891602 aatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagttcacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaac 9891503  T
Q  587 ccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891502 ccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccg 9891403  T
Q  687 ttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagtt 786  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891402 ttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagtccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagtt 9891303  T
Q  787 gtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891302 gtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt 9891203  T
Q  887 gtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||    
T  9891202 gtcatgcaatgtggtct 9891186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 38462856 - 38463734
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  38462856 atgtattttctcccaaaaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttgctggtcctgcaa 38462955  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  38462956 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgagaaatcactac 38463055  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  38463056 atgaattttggaactccactgatgcatttgcatataactcttgagtgggcaattcgaccatagcttttcatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 38463155  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  38463156 aggtttcacctctttcccatcccttttt---cccaaaggatatttaaaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaaataacaattc 38463252  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | || ||||||||  || |||| || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38463253 attgtataacttttggggaaaatattttcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatttttgacgtaagaa 38463352  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  38463353 gtttacgcaatatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgactcc 38463452  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  38463453 aactacctcaaacattagcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttgga 38463552  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38463553 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 38463652  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38463653 acttcttgtcacctctatttgccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtct 38463734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 4977796 - 4976919
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4977796 atgtattttctcccaacaagtacacaaatcacccatactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 4977697  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |   |||| || |||||||||||    
T  4977696 ccaagatgcatcacacagtctgtccatgccctcacaattttgtcattcacttcattcaaggtggtcatgacataattttttaaaagtgagaaatcactac 4977597  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||| |||||||||    ||||||||||| || |||||  |    
T  4977596 atgaatattggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtggccgattcaaccatagctttccatgccca-attatcttcttgacaacatcgtg 4977498  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
     || ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||        |||||    
T  4977497 gtttctcacctctttcccatcatttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaataattc 4977401  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||    
T  4977400 attgcataactttcgaggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctga-acgtaagaa 4977302  T
Q  522 gtttacgcaacattgtt-aaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4977301 gtttacgcaacattttttaaaaaccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccc 4977202  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  4977201 caactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttgg 4977102  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4977101 atgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaac 4977002  T
Q  821 ggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977001 gacttcttgtcacctctatttgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4976919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 416 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 41024852 - 41024363
Alignment:
Q  416 caattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatat--ccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 513  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024852 caattcattgcataacttttcggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 41024753  T
Q  514 cgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaa 613  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024752 cgaaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaa 41024653  T
Q  614 gtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatgg 713  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024652 gtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatgg 41024553  T
Q  714 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaa 813  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024552 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaa 41024453  T
Q  814 ttgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024452 ttgcaacgactttttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41024363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 187 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 11503383 - 11502670
Alignment:
Q  187 catggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagtt 286  Q
    ||||||||||| |   |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |    
T  11503383 catggcataatttttgaaaagtgggaaatcgctacatgaatcttggaactccactaatgcattttcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagct 11503284  T
Q  287 ttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacaccttt 386  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||    |||||||||||||||| |||||    ||||||| |||||||||||  ||||   ||||||    
T  11503283 ttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgtgagatttcacctctttcccatcgttttt---tcccaaagaatatttacaatctaagatggaccttt 11503187  T
Q  387 gtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaac 486  Q
    |||||||||| |||||||||||       ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| | | ||| ||    
T  11503186 gtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccactttcatcaaggacatatccatgttggtcac 11503087  T
Q  487 aatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaac 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  11503086 aatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacacaacatttttaaaacccaaacaaagtattcctctttctcatgtgtcacaaattcaaac 11502987  T
Q  587 ccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11502986 ccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccg 11502887  T
Q  687 ttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagtt 786  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11502886 ttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtttgatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttctctttgtgttcttgagtaataagtatagtt 11502787  T
Q  787 gtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt 886  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11502786 gtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacattt 11502687  T
Q  887 gtcatgcaatgtggtct 903  Q
     ||||||||||||||||    
T  11502686 atcatgcaatgtggtct 11502670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 555 - 911
Target Start/End: Original strand, 49565013 - 49565369
Alignment:
Q  555 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565013 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 49565112  T
Q  655 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565113 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 49565212  T
Q  755 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565213 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 49565312  T
Q  855 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49565313 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 49565369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 364 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 21472497 - 21471958
Alignment:
Q  364 tttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatc 463  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||     
T  21472497 tttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatt 21472398  T
Q  464 aaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctt 563  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21472397 aaagacatatctctgtcggtcacaatctccttagtcatatttatctttgatgtaagaagtttacgcaacatttttaaaactcaaacaaagttttcctctt 21472298  T
Q  564 tctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtctt-gt 662  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||    
T  21472297 tctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggtgtttgt 21472198  T
Q  663 acgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttg 762  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  || ||||||||  |||    
T  21472197 aggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctttgattttagtactttcactttg 21472098  T
Q  763 tgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgt 862  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21472097 tgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgt 21471998  T
Q  863 tcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21471997 tcattgtacacttgcttcacattt-ttatccaatgtggtct 21471958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 461 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 44050216 - 44049774
Alignment:
Q  461 atcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttctt 560  Q
    |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  44050216 atcaaaaacatatccctgtcgatcacaatcaccttaggcacattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcct 44050117  T
Q  561 ctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtctt 660  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44050116 ctttctcatgtgtcacaaatttaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggtttt 44050017  T
Q  661 gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagt 760  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||  |    
T  44050016 gtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtagtttcactt 44049917  T
Q  761 tgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgac 860  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44049916 tgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgac 44049817  T
Q  861 gttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049816 gttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44049774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 719 - 903
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643395
Alignment:
Q  719 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 818  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  819 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51643311 acggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtct 51643395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 472 - 870
Target Start/End: Complemental strand, 6183273 - 6182875
Alignment:
Q  472 atccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgt 571  Q
    |||||| || || |||| |||||||| ||||||  |||||||   |||||||||| |||   ||  ||||||||||||||| || || |||||| ||  |    
T  6183273 atccctgtcagtcacaaccaccttagacatattactctttgagttaagaagtttaagcattgtttctaaaacccaaacaaaattatcctctttcccagct 6183174  T
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||    
T  6183173 gtcaaaaatccaaaaccaactaaatttgtcaaatcggtcgagatgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagatggagt 6183074  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttga 771  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |     
T  6183073 tcataatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtagtactttcaatttgtgttatggt 6182974  T
Q  772 gtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgta 870  Q
    | |||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |  | |||||||||| || |||| |||  |||||| |||| ||||||||||    
T  6182973 gaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgcatcaccgtcttgtcacctctgtttgacttgaatattttttgatgttcattgta 6182875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 197
Target Start/End: Original strand, 51643023 - 51643198
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  51643023 atgtattttctcccaacaagtacacaaatcacctacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagtcgattctactctgttggtggtcctgcaa 51643122  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  51643123 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcatttcatttaaggtggtcatggcataat 51643198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 189
Target Start/End: Original strand, 17238850 - 17239014
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17238850 tattttctcccaacaagtacccaaaacacccacgctattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaacca 17238949  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcat 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  17238950 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttctttcaaggtggtcat 17239014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9891917 - 9891813
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891917 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 9891818  T
Q  122 ccaag 126  Q
    |||||    
T  9891817 ccaag 9891813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 792 - 903
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580225
Alignment:
Q  792 cctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 891  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  892 gcaatgtggtct 903  Q
    |||||| |||||    
T  18580214 gcaatgaggtct 18580225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 573 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 32716787 - 32716628
Alignment:
Q  573 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 672  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  32716787 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatc 32716688  T
Q  673 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  32716687 cattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 572 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 4618052 - 4617919
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4618052 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaat 4617953  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 705  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  4617952 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 4617919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 1591328 - 1591168
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |    
T  1591328 gtcacaaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaat 1591229  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || | ||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  1591228 ccattatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 11503470 - 11503387
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaa-caagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccc 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  11503470 atgtattttctcccaaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagctgattcgaccc 11503387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 461 - 749
Target Start/End: Original strand, 13897238 - 13897526
Alignment:
Q  461 atcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttctt 560  Q
    ||||||| | ||||||| || || |||||||||||||||||||   ||||||||  || ||||||| |||||||   |||| ||||   |||||| || |    
T  13897238 atcaaagtcgtatccctgtcagtcacaatcaccttaggcatatcactctttgacttaaaaagtttaagcaacatctgtaaagcccaggtaaagttatcct 13897337  T
Q  561 ctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtctt 660  Q
    | ||||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||| |||||||| || |||| | |||| |||||| ||    
T  13897338 ccttctcagtcgtcataaattcaaaacccaccgaatatgtcatatcgggtgaggtgactccaactatctcaaacaatgacatcatgtacaagttggtttt 13897437  T
Q  661 gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 749  Q
     |||| ||| ||||| | |||||| || |  |||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||||||| || | || ||||||||    
T  13897438 ctacgaggaatccatgatcaaaacagtcgagaaattgttaaacaacttaaccgattctggatgaccccaaaatatgtattgaatagtat 13897526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 17916681 - 17916521
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || || |||||||  ||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||| | |    
T  17916681 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaatgggttaaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaaaatggttttgtacgtgaaat 17916582  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  17916581 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 17916521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 46517000 - 46517160
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | |||| |||||| |    
T  46517000 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgtctccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgttcgtggaat 46517099  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
     ||| | |||||| || ||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  46517100 tcattatcaaaacagtcggaaaaacgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 46517160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 571 - 697
Target Start/End: Complemental strand, 17497019 - 17496893
Alignment:
Q  571 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 670  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  17497019 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtctaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaaattggttttgtacgtggaa 17496920  T
Q  671 tccataaccaaaaccgttggaaaattg 697  Q
    ||||| | |||||  || |||||||||    
T  17496919 tccattatcaaaatagtcggaaaattg 17496893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Original strand, 13896850 - 13896914
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  13896850 ctgttggtggttctgcagccaagatgcaacacacggtatgtccatgccttcacaattttttcctt 13896914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6183728 - 6183584
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||  | | |||| |||  ||| || ||||| ||||| ||| ||    
T  6183728 atgtattttctcccaacaagcatccaaatcaccagcactattgctcaaatatttcttcactataccatgagcc-tttcaactctgttagtggttctgtaa 6183630  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcct 167  Q
    ||||||||||| |||  || ||| |||||| |||| ||||| ||||    
T  6183629 ccaagatgcaagacacagtttgttcatgccgtcactattttctcct 6183584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Original strand, 20970619 - 20970675
Alignment:
Q  110 gtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcct 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  20970619 gtggtcctgcacccaagatgcaacacaaggtatgtccatg-cctcactattttgtcct 20970675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 17497507 - 17497455
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcac 156  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17497507 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtatgtccatgccctcac 17497455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 598 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 34980022 - 34979909
Alignment:
Q  598 tgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattg 697  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||| || |||  | ||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||  |   ||||||||    
T  34980022 tgtcatatcggttaaggtgaccccaactatctcaaacaatgacattatgtacatgttggttttataggtgaagtccatgaccaaaatagacagaaaattg 34979923  T
Q  698 ttaaacaatttaat 711  Q
    |||||||| |||||    
T  34979922 ttaaacaacttaat 34979909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 857; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 857; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 3950792 - 3949899
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3950792 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccttgtttgtggtcct 3950693  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950692 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 3950593  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950592 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 3950493  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  3950492 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 3950393  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950392 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 3950293  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950292 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaagcaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 3950193  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950192 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 3950093  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950092 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 3949993  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3949992 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3949899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 849; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 911
Target Start/End: Original strand, 8158999 - 8159888
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8158999 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 8159098  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8159099 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgagaaatcactac 8159198  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159199 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 8159298  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  8159299 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaacaattc 8159398  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159399 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 8159498  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159499 gtttacgcaacattgttaaaatccaaacaaagttttcttctttctcgtgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 8159598  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159599 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 8159698  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159699 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 8159798  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8159799 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8159888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 845; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 30945654 - 30946547
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945654 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtcaaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 30945753  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945754 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 30945853  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30945854 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 30945953  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  30945954 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 30946053  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946054 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccactttcatcaaagacatatccctatcggtaataatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 30946153  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946154 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttcgcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 30946253  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946254 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 30946353  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946354 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 30946453  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30946454 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 30946547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 841; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 6742936 - 6742051
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742936 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 6742837  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742836 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaagatggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 6742737  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742736 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattattgattaggagattcaaccataattttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 6742637  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  6742636 cccgattgctcacctcgttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 6742537  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742536 atttaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 6742437  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742436 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 6742337  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742336 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 6742237  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742236 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 6742137  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742136 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 6742051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 817; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 13745737 - 13746618
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745737 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 13745836  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13745837 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 13745936  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13745937 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 13746036  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  13746037 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 13746136  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746137 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 13746236  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746237 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 13746336  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13746337 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 13746436  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746437 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 13746536  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746537 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 773; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 16446665 - 16445784
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16446665 atgtattttctcccagcaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctgcaa 16446566  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446565 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 16446466  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16446465 atgaatctttgaactccactaatgcatttgaatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 16446366  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  16446365 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 16446266  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446265 attgcataactttccggaaaaatatgtgcaaccgctgtcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 16446166  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446165 gtttacgcaacatctttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 16446066  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16446065 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 16445966  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16445965 tgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 16445866  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445865 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 16445784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 737; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 36815532 - 36816413
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815532 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 36815631  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815632 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 36815731  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  36815732 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatcgcg 36815831  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  36815832 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 36815931  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36815932 attgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 36816031  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36816032 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 36816131  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36816132 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 36816231  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816232 tgagcccaaaagatatcttcgattgtattactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 36816331  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816332 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 36816413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 663; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 14400602 - 14399719
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14400602 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 14400503  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14400502 ccaagatgcaacacatggtctttctatgccctcataattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 14400403  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  14400402 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatcgcg 14400303  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||       ||||||    
T  14400302 attgctcacctatttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgttttatatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 14400203  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14400202 attgcataactttctggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatccccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 14400103  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaag-ttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca-cc 619  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  14400102 gtttacgcaacatttttaaaacacaaacaaagtttttgctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccc 14400003  T
Q  620 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttg 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14400002 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttg 14399903  T
Q  720 gatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaa 819  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14399902 gatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaa 14399803  T
Q  820 cggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399802 cggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 14399719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 48248885 - 48249764
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48248885 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccttgttcgtggtcctgcaa 48248984  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  48248985 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaattgggaaatcactac 48249084  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||    
T  48249085 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgcg 48249184  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  48249185 attactcacctctttcccatccttttt---tcccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 48249281  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48249282 attgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccttgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgatgaaagaa 48249381  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca-ccc 620  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| | |||    
T  48249382 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcaaccgaatatgtcaaattggtcaaagtgacccc 48249481  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48249482 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgg 48249581  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  48249582 atgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaac 48249681  T
Q  821 ggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249682 ggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 48249764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 610; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 901
Target Start/End: Original strand, 46991264 - 46992141
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46991264 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttcgtggtcctgcaa 46991363  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctaca-aaaattgggaaatcacta 220  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||    
T  46991364 ccaagatgcaacacatggcctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttttaaaattgggaaatcacta 46991463  T
Q  221 catgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatccc 320  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || ||||| |    
T  46991464 catgaatcttggaactccattaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttgacaacatcgc 46991563  T
Q  321 gattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaatt 420  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||    
T  46991564 gattactcacctctttcccatcctttttt---cctaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaatt 46991660  T
Q  421 caatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 520  Q
    || ||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991661 cattgcataattttcgggaaaaacatttgcaatcgttttcatcaaagacatatccatgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 46991760  T
Q  521 agtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  46991761 agtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccc 46991860  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgg 720  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  46991861 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgg 46991960  T
Q  721 atgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 820  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  46991961 atgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaac 46992060  T
Q  821 ggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 901  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46992061 ggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggt 46992141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 6503974 - 6504852
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||  |||||||||||    
T  6503974 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccactctattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccaatttgaacctgttgttggtcctgcaa 6504073  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||    
T  6504074 ccaagatgcaacacatggtatgtctatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaaaattaggaaatcactac 6504173  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| || ||||| ||    
T  6504174 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagatttccatttcctcattatcttcttgacaacatcgcg 6504273  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  6504274 attactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctgagacacacatttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 6504370  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6504371 attgcataactttcggggaaaccatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccgtgtcgttaacaatcaccttaggcatattcatctttaacgtaagaa 6504470  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  6504471 gtttacgcaacatttttaagacccaaacaaagttttcctcttcctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctc 6504570  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  6504571 aactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgttaaaaaacttaacggatgttgga 6504670  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6504671 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacg 6504770  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504771 gcttcttgtcacctctatgtgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 6504852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 21954258 - 21955135
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21954258 atgtattttctcccaacaagtacccaaattactcacattattgtccaattatttcttcaataaagcatgtgccgattcgactctgtttgtggtccttcaa 21954357  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||    
T  21954358 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggtataatttttgaaaattgggaaatcactac 21954457  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||| |  ||||| ||    
T  21954458 atgaatcttggaactccactaatgcaattgcatataaatgttgagtgggcgattcaacaatagctttccatgctctcattatgttcttgataacatcgcg 21954557  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  21954558 attactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagactctcttttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 21954654  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  21954655 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcgataacagtcaccttaggcaaattcatatttgacgtaagaa 21954754  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21954755 gtttacgcaatatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 21954854  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21954855 aactacctcaaatattggcatcctgtacatgttcgttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 21954954  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21954955 tgagcccaaaaggtatcttcgattgtggtactttcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacg 21955053  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955054 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 21955135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 29950026 - 29949193
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  29950026 atgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaa 29949927  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  29949926 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 29949827  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  29949826 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccctcattatcttattcacaacatcgcg 29949727  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  29949726 aggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 29949630  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29949629 attgcataactttcggggaaaacatttgcaacctctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 29949530  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  29949529 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgacccc 29949430  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29949429 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 29949330  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29949329 tgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacg 29949231  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 859  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29949230 acttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 527; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 29999180 - 29998347
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  29999180 atgtattttctcccaacaagtgcccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcaaccctgttggtggccctacaa 29999081  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  29999080 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 29998981  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||    
T  29998980 atgaatcttagaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagatttccatgccctcattatcttattcacaacatcgcg 29998881  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  29998880 aggtttcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 29998784  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29998783 attgcataactttcggggaaaacatttgcaacctctttcatcaaagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 29998684  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  29998683 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgacccc 29998584  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29998583 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 29998484  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  29998483 tgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacg 29998385  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 859  Q
     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29998384 acttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 525; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 901
Target Start/End: Original strand, 77039 - 77915
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  77039 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccgcactattgtccaaatatttctttactaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcaa 77138  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||    
T  77139 ccaagatgcaacacacggtatgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcatactttaggaaaggtgggaaatcactac 77238  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||  |||| ||    
T  77239 aagcatcttggaactccactaatgcatttacatataactcttgagtgggagattcaaccatagctttccatgccctcatgatcttcttgacaccatcacg 77338  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  77339 attactcacctcttttccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 77435  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||| |||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  77436 attgcataattttctggaaaaacaattccaaccgctttcatcaaagactcatccgtgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 77535  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  77536 gtttacgcaatatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcaaaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 77635  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||    
T  77636 aactacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacaaatgttgga 77735  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  77736 tgagcccaaaagatatcttcgatggtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 77835  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 901  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77836 acttcttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 77915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 203 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 7839456 - 7838760
Alignment:
Q  203 aaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcatta 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  7839456 aaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatgcatttgcataaaactcttgactgggcgattcaaccatagctttccatgccctcatta 7839357  T
Q  303 tcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttg 402  Q
    |||| || || ||||| |||    |||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||| |    
T  7839356 tcttattgacaacatcgcgaggtttcacctctttcctatccttttt----cccaaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacatttgctag 7839261  T
Q  403 cacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcata 502  Q
    ||||||       ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  7839260 cacatgaaagtaacaattcattgcataactttcagggaaaacatttgcaaccgctttcatcacagacatatccctgtcggtcacaatcaccttaggcata 7839161  T
Q  503 ttcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtca 602  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7839160 ttcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttccactttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtca 7839061  T
Q  603 aatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaa 702  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7839060 aatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgttaaa 7838961  T
Q  703 caatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttc 802  Q
    ||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838960 caacttaacagatgtcggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttc 7838861  T
Q  803 gagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 902  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838860 aagattagatattgcaacggcttcttgccacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtc 7838761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 500 - 903
Target Start/End: Original strand, 7841511 - 7841912
Alignment:
Q  500 atattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatg 599  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7841511 atattcatctttgaagaaagaagtttacgcaacatt-ttaaaacccaaacaaagttttcctcgttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatg 7841609  T
Q  600 tcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 699  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841610 tcaaatcggtctaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctctacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt 7841709  T
Q  700 aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 799  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7841710 aaacaacttaacggatgttggatgaacccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaac 7841808  T
Q  800 ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 899  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841809 ttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 7841908  T
Q  900 gtct 903  Q
    ||||    
T  7841909 gtct 7841912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 683 - 903
Target Start/End: Original strand, 9428510 - 9428730
Alignment:
Q  683 accgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 782  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428510 accgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 9428609  T
Q  783 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428610 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 9428709  T
Q  883 atttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428710 atttgtcatgcaatgtggtct 9428730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 612 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 29908273 - 29908027
Alignment:
Q  612 aagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 711  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  29908273 aagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 29908174  T
Q  712 ggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 811  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  29908173 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattaga 29908075  T
Q  812 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 859  Q
     ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29908074 tattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 547 - 708
Target Start/End: Original strand, 28610460 - 28610621
Alignment:
Q  547 aacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatccta 646  Q
    ||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |     
T  28610460 aacaaagattttctctttctcatatgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaattggccgaagtgattccaactacctcaaacattgacatcttc 28610559  T
Q  647 tacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattt 708  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28610560 tacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaaccattt 28610621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 573 - 725
Target Start/End: Original strand, 9556331 - 9556483
Alignment:
Q  573 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 672  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||| | ||    
T  9556331 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatc 9556430  T
Q  673 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 725  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9556431 cattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 571 - 732
Target Start/End: Original strand, 51548098 - 51548259
Alignment:
Q  571 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 670  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  51548098 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaa 51548197  T
Q  671 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  |||||||||| || ||||||    
T  51548198 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggataagtccaaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 2284623 - 2284783
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  2284623 gtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 2284722  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  2284723 ccattatcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 4120360 - 4120520
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || || |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4120360 gtcataaatacaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttaatgtgactccaactatttcaaagaatgtcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 4120459  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  4120460 ccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 33940350 - 33940190
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  33940350 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 33940251  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |  ||| |||||||| | || |  ||||||||||||| ||||||    
T  33940250 ccattatcaaaacagtcgagaaagtgttaaacgactttaccgatgttggatgagtccaaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 40467774 - 40467934
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||||||||| |    
T  40467774 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatttcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattttatacaagttggttttgtacgtggaat 40467873  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40467874 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 12491582 - 12491422
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| || || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | ||||||| ||| |    
T  12491582 gtcataaatgcaaaaccaaccaaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaat 12491483  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  12491482 ccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 855 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930532
Alignment:
Q  855 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29930532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 855 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979686
Alignment:
Q  855 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29979686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4511106 - 4511042
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 171  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4511106 tttgtggtcctgcacccaagatgtaacagaaagtctgtccatgctctcactattttgtccttcac 4511042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 168
Target Start/End: Original strand, 40467293 - 40467349
Alignment:
Q  112 ggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40467293 ggtcctacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 40467349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8118572 - 8118509
Alignment:
Q  105 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||    
T  8118572 tgttggtggtcctgcatccaagatgcaatacaaggtatgcccatgccctcactattttttcctt 8118509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 24148335 - 24148288
Alignment:
Q  123 caagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 170  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24148335 caagatgcatcacatggtatgtccatgctctcacaattttttccttca 24148288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 2284136 - 2284197
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  2284136 tttgtggtcctacacccaagatgtagcacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 2284197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 572 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 8118084 - 8117907
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| ||||  |||| |||||| ||| || |||| | || || ||||| | ||||||||   ||||| | |||| |||||| ||||||||||| |    
T  8118084 gtcataaatgcaaaatcaactgaatatttcatattggtttaggtgactccaacaatctcaaacaacagcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaat 8117985  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 749  Q
     ||| | |||||| || || |||||||||||||| ||||  |||  |||||||| | |||| || |||| ||||||||    
T  8117984 tcattatcaaaacagtcgggaaattgttaaacaacttaactgattgtggatgagtctaaaatatgtcttgaatagtat 8117907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 853; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 853; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 911
Target Start/End: Original strand, 1610763 - 1611656
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610763 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 1610862  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1610863 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatca 1610962  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1610963 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagctttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 1611062  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  1611063 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaaaaaca 1611162  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611163 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 1611262  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611263 agaagtttacgcaacattgctaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 1611362  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611363 ccccaactacctcaaacattggcatcctataaatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 1611462  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611463 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 1611562  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctgcttct 911  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1611563 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 1611656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 682; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 28358363 - 28357557
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358363 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagtcgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 28358264  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28358263 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 28358164  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  28358163 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtggacgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatcgcg 28358064  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||    
T  28358063 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttgacattagcttgcacatgaaagtaacaattc 28357964  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357963 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 28357864  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28357863 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgacccc 28357764  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28357763 aactacctcaaacatttgcatcctatacatgttggtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 28357664  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357663 tgagcccaaaagatatcttcaattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 28357564  T
Q  822 gcttctt 828  Q
    |||||||    
T  28357563 gcttctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 571; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 31148364 - 31147486
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | || || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  31148364 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaatcgtgagctgattcgaccctcttggtggtcctgcaa 31148265  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |   |||||||| ||||||||||    
T  31148264 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacatattttttgaaaattggaaaatcactac 31148165  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||||| || ||||| ||    
T  31148164 atgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactgtcgagtgggcgattcaactatagctttccatgccctcaatatcttcttgacaacatcgcg 31148065  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||        ||||||    
T  31148064 attactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttgcaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatcaaagtagcaattc 31147968  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147967 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccactttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 31147868  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |    
T  31147867 gtttaccaaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaacac 31147768  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  31147767 aactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgta 31147668  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31147667 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 31147568  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31147567 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtct 31147486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 18608031 - 18607160
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18608031 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgacccagttggtggtcctgcaa 18607932  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||    
T  18607931 ccaagatgcaacacatggtctgttcatgccctcac-------tccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaagtgggaaatcactac 18607839  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  18607838 atgaatcttctaactccactaatgcatttccatataactcttgattgggtgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 18607739  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    |||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  18607738 aggtttcacctctttcccatcatttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacacatctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 18607642  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||   |||||||||||||| ||||     
T  18607641 attgcataactttcgggtaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccatgtcggtcacaatcacattaggttgattcatctttgacgtaagat 18607542  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18607541 gtttacacaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaatcgaatatgtcaaatctgtcgaagtgacccc 18607442  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18607441 aactacttcaaatattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttgga 18607342  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||    
T  18607341 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacg 18607242  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607241 gcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18607160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 21357369 - 21358244
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  21357369 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcag 21357468  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  21357469 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 21357568  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  21357569 atgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 21357668  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||       ||||||    
T  21357669 aggtttcacctctttcccatcctttttt---cccgaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattttcttgcacatgaaagcaacaattc 21357765  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | || || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21357766 attgcataactttcggggaaaacatttgcgaccgctttcatcaaagacatatctttgtcagtcacagtcaccctaggcatattcatccttgacgtaagaa 21357865  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  21357866 gtctacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccg 21357965  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21357966 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 21358065  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21358066 tgagcccaaaatatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacg 21358165  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21358166 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtct 21358244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 23961351 - 23962226
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||     
T  23961351 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacattattgtccaaatatttctttcctaaagcatgagccgattctaccctgttggtggttctgcag 23961450  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  23961451 ccaagatgcaacacatggtatgtccatgccctcactattttctctttcacttctttcaaggtggtcatggcataatttaggaaaagtgggaaatcactac 23961550  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || | ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  23961551 atgcatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgtgcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgcg 23961650  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    ||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||       ||||||    
T  23961651 aggtttcacctctttcccatcctttttt---cccgaaggatatttacaatctaagatgcacctttgtttaacattttcttgcacatgaaagcaacaattc 23961747  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | || || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  23961748 attgcataactttcggggaaaacatttgcgaccgctttcatcaaagacatatctttgtcagtcacagtcaccctaggcatattcatccttgacgtaagaa 23961847  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  23961848 gtctacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccg 23961947  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23961948 aactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 23962047  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  23962048 tgagcccaaaatatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacg 23962147  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23962148 gcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtct 23962226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 464 - 903
Target Start/End: Original strand, 29287411 - 29287845
Alignment:
Q  464 aaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctt 563  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29287411 aaagacatatccctatcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctt 29287510  T
Q  564 tctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgta 663  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29287511 tctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgta 29287610  T
Q  664 cgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgt 763  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||    
T  29287611 ggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaatt-ttaaacaaattaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgt 29287709  T
Q  764 gttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgtt 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287710 gttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga----gcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtt 29287805  T
Q  864 cattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29287806 cattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtct 29287845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 346
Target Start/End: Original strand, 254427 - 254751
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |  | |||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||     
T  254427 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctcaaatatttatttactatagcatgagccaattctaccttgttggtggttctgcat 254526  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||| ||   || |||  |||| ||||||  ||    
T  254527 ccaagatgcaacacatagtctgtccatgctctcattattttctccttaacaacatccaaggtggccatggcctaggttataaactttggaaaatcatgac 254626  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |   || || |||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||| |||||||| |||  || ||||||  |||||||||||||||| ||||  |     
T  254627 aaacattttggaactccactaatgcactttcatttaatttttgaatgggtgattcaacaataacttcccatgctctcattatcttcttcactacattacc 254726  T
Q  322 attgctcacctctttcccatccttt 346  Q
    ||   ||| ||||||||||||||||    
T  254727 atgtttcatctctttcccatccttt 254751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 829 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28251060
Alignment:
Q  829 gtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 28251060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 9095623 - 9095463
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  9095623 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaat 9095524  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  9095523 ccatgatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 827 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220332
Alignment:
Q  827 ttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtct 24220332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Original strand, 26684103 - 26684167
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26684103 ctgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccatgccctcattattttgtcctt 26684167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 81
Target Start/End: Original strand, 34110720 - 34110779
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaa 81  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  34110720 atgtattttctcccaacaagtatccaaatcatccacactattgctcaaatatttcttcaa 34110779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 785; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 785; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 903
Target Start/End: Original strand, 37818889 - 37819774
Alignment:
Q  18 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcct 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37818889 tgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattttccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcct 37818988  T
Q  118 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37818989 gcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtgttcatggcataatctacaaaaattgggaaatca 37819088  T
Q  218 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacat 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  37819089 ctacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatctttttcaccacat 37819188  T
Q  318 cccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnnca 417  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||    
T  37819189 cgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaatgatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataaca 37819288  T
Q  418 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaa 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37819289 attcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctctcggtaacaatcaccttaggcatattcagctttgacgaa 37819388  T
Q  518 agaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 617  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819389 agaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacctaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtca 37819488  T
Q  618 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgt 717  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37819489 ccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgt 37819588  T
Q  718 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819589 tggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgc 37819688  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819689 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 37819774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 777; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 38858206 - 38859087
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  38858206 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgactctgtttgtggtcctacaa 38858305  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858306 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatgacataatctacaaaaattgggaaatcactac 38858405  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38858406 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagcttttcatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 38858505  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  38858506 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 38858605  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858606 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 38858705  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858706 gtttacgcaacatctttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 38858805  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38858806 aactacctcaaacattggcatcctatatatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 38858905  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38858906 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 38859005  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859006 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 38859087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 773; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 11031468 - 11032349
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  11031468 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgatttgactctgtttgtggtcctacaa 11031567  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031568 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttttccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 11031667  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11031668 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgtcttcattatcttcttcaccacatcgcg 11031767  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  11031768 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattc 11031867  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031868 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 11031967  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11031968 gtttacgcaacatctttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 11032067  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11032068 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 11032167  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11032168 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 11032267  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032268 gtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11032349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 725; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 27865861 - 27866742
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27865861 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgatttgaccctgtttgtggtcctgcaa 27865960  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27865961 ctaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 27866060  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27866061 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgaccacatcacg 27866160  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  27866161 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 27866260  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866261 attgcataactttcgggaaaaacatgtgcaatcgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 27866360  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27866361 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgacccc 27866460  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27866461 aaccacctcaaacattggcctcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 27866560  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27866561 tgagcccaaaagatatcttcaattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaaag 27866660  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866661 gtttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 27866742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 681; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 98 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 34079749 - 34078944
Alignment:
Q  98 tcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34079749 tcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataat 34079650  T
Q  198 ctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgtt 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34079649 ctacaaaaattggaaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgcctt 34079550  T
Q  298 cattatcttcttcaccacatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacatta 397  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  34079549 cattatcttcttgaccacatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattt 34079450  T
Q  398 gcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttag 497  Q
    |||||||||||       ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079449 gcttgcacatgaaagtaacaattcattgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttag 34079350  T
Q  498 gcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaata 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079349 gcatattcatctttgacgaaagaagtttatgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaata 34079250  T
Q  598 tgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattg 697  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079249 tgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattg 34079150  T
Q  698 ttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctcca 797  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079149 ttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactttcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctcca 34079050  T
Q  798 acttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatg 897  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079049 acttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatg 34078950  T
Q  898 tggtct 903  Q
    ||||||    
T  34078949 tggtct 34078944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 677; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 25 - 903
Target Start/End: Original strand, 13566126 - 13566988
Alignment:
Q  25 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566126 tattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaacca 13566225  T
Q  125 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13566226 agatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaaatgggaaatcactacatg 13566325  T
Q  225 aatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  13566326 aatctttgaactccactaatgcattttcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcatgaccacatcgcgatt 13566425  T
Q  325 gctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaat 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||| |    
T  13566426 gctcacctctttcccatcctttttaaaatccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttgacattagcttgcacatgaaagtaacaattcatt 13566525  T
Q  425 gcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtt 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566526 gcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtt 13566625  T
Q  525 tacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaac 624  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13566626 tacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaac 13566725  T
Q  625 tacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatga 724  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||                |||| ||||||||||||| ||||    
T  13566726 tacctcaaacattggcatcctagacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaacc----------------acaacttaatggatgttgaatga 13566809  T
Q  725 gcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 824  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566810 tcccaaaagatatcttcaattgtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggct 13566909  T
Q  825 tcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566910 tcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13566988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 652; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 25895113 - 25895998
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25895113 atgtattttctcccaacaactacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccatgttcgtggtcctgcaa 25895212  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25895213 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtagtcatggcataattttcaaaaattgggaaatcactac 25895312  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  25895313 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaatgttgagtggccgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttgacaacatcgcg 25895412  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  25895413 attgctcgcctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 25895512  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895513 attgcataactttcgggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctgtcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 25895612  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25895613 gtttacgcaacatttttaaaacccaaaaaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcacccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc 25895712  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25895713 aactacctcaagcattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttgga 25895812  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac----ttcgagattagaaattgc 817  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||| |||||    
T  25895813 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactctcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatatatagatattagatattgc 25895912  T
Q  818 aacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895913 aacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 25895998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 641; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 1037404 - 1036515
Alignment:
Q  14 aacctgtgatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtgg 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1037404 aacctgtcatgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattatccaagtatgtcttcaataaagtatgagccgattcgaccctgttcgtgg 1037305  T
Q  114 tcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  1037304 tcctgcaaccaagatgcaacacatggtctatccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatttttgaaaattgggaa 1037205  T
Q  214 atcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcacc 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||     
T  1037204 atcactacaggaatctttgaactccactaatgcatttgcatataacttttgagtgggtgattcaaccatagcttttcatgcctacattatcttcttgaca 1037105  T
Q  314 acatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnn 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||         
T  1037104 acatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacatctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagt 1037005  T
Q  414 nncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 513  Q
      | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1037004 aactattcattgcataactttcgggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 1036905  T
Q  514 cgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaa 613  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1036904 cgaaagaagtttatgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaa 1036805  T
Q  614 gtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatgg 713  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1036804 gtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttgattttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatgg 1036705  T
Q  714 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaa 813  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1036704 atgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagata 1036605  T
Q  814 ttgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1036604 ttgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtct 1036515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 551; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 7799034 - 7799903
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7799034 atgtattttctcccaacaagtacccaaattacccacaatattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 7799133  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  7799134 ccaagatgcatcacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcattgcataatttttgaaaagtgagaaatcactac 7799233  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||| |         | ||||| ||    
T  7799234 ttgaatcttggaactccactaatgcatttgcatataactcttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcatga---------caacatcgcg 7799324  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  7799325 attactcacctctttcccatcctttttt---cccaaaggatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 7799421  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | |||||||||||| || ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7799422 attgcataactttcggggaaaacatttgcatctgctttcatcgaagacatatccatgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaa 7799521  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  7799522 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtctcacaaatccaaacccaaccgaatatgttaaatcggtcgaagtgacccc 7799621  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7799622 aactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgga 7799721  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7799722 tgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 7799821  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799822 gcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7799903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 61 - 903
Target Start/End: Original strand, 18536395 - 18537233
Alignment:
Q  61 attgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatt 160  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  18536395 attgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgtttctacctcgtt-gtggtcctgcaaccaagatgcaacatatggtctgttcatgccctcactatt 18536493  T
Q  161 ttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataatt 260  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  18536494 ttctccttcacttcattcaatgtggtcatggcataatttttggaaagtgggaaatcactacatgaatcttggaactccactaatacatttgcaaataact 18536593  T
Q  261 gttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattgct-cacctctttcccatcctttttaaagcccaaag 359  Q
     |||| |||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| | || | | ||||||||| ||||  |||||    ||||||     
T  18536594 cttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccctcattatcttcttcacaacatcgc-atggtttcacctcttttccataatttttt---cccaaac 18536689  T
Q  360 gatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgcttt 459  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||       ||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  18536690 gatatttacaatctaagacgcacctttgtttaacttttacttgcacatgaaattaacaattcattgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgcttt 18536789  T
Q  460 catcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttct 559  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18536790 catcaaagacatatccttgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctctgatgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcc 18536889  T
Q  560 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 659  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |    
T  18536890 tctttctcatgcgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgttagttt 18536989  T
Q  660 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 759  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  18536990 tgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 18537089  T
Q  760 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18537090 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttga 18537189  T
Q  860 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537190 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18537233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 473
Target Start/End: Original strand, 28884458 - 28884905
Alignment:
Q  26 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884458 attttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaaccaa 28884557  T
Q  126 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactacatga 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28884558 gatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcaatacatga 28884657  T
Q  226 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccgattg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28884658 atctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgagtgggcgattcaaccatagttttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcgattg 28884757  T
Q  326 ctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatg 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  28884758 ctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaatccaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaaataacaattcattg 28884857  T
Q  426 cataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatat 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884858 cataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatat 28884905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 499 - 903
Target Start/End: Original strand, 28884901 - 28885305
Alignment:
Q  499 catattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatat 598  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  28884901 catattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacatttttaaaatccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaacggattat 28885000  T
Q  599 gtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgt 698  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885001 gtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatccaatacatgttggtttcgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgt 28885100  T
Q  699 taaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 798  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885101 taaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaa 28885200  T
Q  799 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 898  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885201 cttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgt 28885300  T
Q  899 ggtct 903  Q
    |||||    
T  28885301 ggtct 28885305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 455 - 903
Target Start/End: Original strand, 4202388 - 4202836
Alignment:
Q  455 gctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagt 554  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4202388 gctttcatcaaagacatatctctgtcggtcacaatcaccttaggcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagt 4202487  T
Q  555 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 654  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4202488 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacagaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcatgtacatgtt 4202587  T
Q  655 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 754  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  4202588 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 4202687  T
Q  755 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 854  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4202688 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 4202787  T
Q  855 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4202788 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 4202836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 7019982 - 7020413
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7019982 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaataatgcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 7020081  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7020082 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataatctaccgaaattgggaaatcactac 7020181  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  7020182 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataaccgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 7020281  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  7020282 attgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaattc 7020381  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaac 453  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7020382 attgcataactttccagaaaaacatgtgcaac 7020413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 545 - 903
Target Start/End: Original strand, 7020419 - 7020777
Alignment:
Q  545 caaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcc 644  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020419 caaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcc 7020518  T
Q  645 tatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaat 744  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7020519 tatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaat 7020618  T
Q  745 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 844  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020619 agtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc 7020718  T
Q  845 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020719 ttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7020777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 24 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 20288311 - 20287439
Alignment:
Q  24 gtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattg-tccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaac 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |  ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  20288311 gtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgctccaa-tatttatttactaaatcatgagccgattctaccctattggtggttctgcaac 20288213  T
Q  123 caagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactaca 222  Q
    ||||||  |||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| | |||||||||   ||  |||||||| |||||| ||||    
T  20288212 caagatataacacatggtttatccatgccctcactattttctccttaacaacatccaaggtagacatggcataggttaggaaaattggaaaatcattaca 20288113  T
Q  223 tgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggag--attcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatccc 320  Q
       || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |  ||||||  |||  || |||  |  ||||||||||||| || ||||| |    
T  20288112 aacatttttgaactccactaatgcatttgaatataattcttgagtgggtgtgattcaataataacttaccacactctcattatcttcttaactacatcac 20288013  T
Q  321 gattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaatt 420  Q
     ||   ||||||||||||||||||||||     ||| ||||||| |||| |  ||||  |||||   |||||||||    ||||||||       |||||    
T  20288012 catgtttcacctctttcccatccttttttg---ccataggatatctacagtctaagatgcacctgactttaacatttttctgcacatgaaagtaacaatt 20287916  T
Q  421 caatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaaga 520  Q
    || |||| ||||||| || | ||||| || ||| || |||||||||| | ||||| | || || |||| ||||||||| | ||||||| |||||| ||||    
T  20287915 cattgcaaaactttctgggagaacatttgaaactgcattcatcaaagtcgtatccttgtcagtcacaaccaccttaggaacattcatccttgacgtaaga 20287816  T
Q  521 agtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccc 620  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  20287815 agtttacacatcatttgtaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgcgtcacaaattcaaagccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccc 20287716  T
Q  621 caactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt-aaacaatttaatggatgttg 719  Q
    |||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  20287715 caactatctcaaacataggcatcttgtacatgttggtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgttaaaaaaacttaacggatgttg 20287616  T
Q  720 gatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaa 819  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |   | |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  20287615 gatgagcgcaaaatatgtcttcaatagtagtactttgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattagaaactggaa 20287516  T
Q  820 cggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 896  Q
    |  | |||||||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  20287515 ccccgtcttgtcacctctgtttgactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaat 20287439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 459
Target Start/End: Original strand, 4198922 - 4199356
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4198922 atgtattttctctcaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaaatatttcttcaataaagcatgagccgattcgaccctgttggtggtcctgcaa 4199021  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||| || |||||||||||    
T  4199022 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcactattttctccttcacttcattcaaggtggtcatggcataattttttaaaagtgagaaatcactac 4199121  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||   |||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  4199122 atgaatcttggaactccactaatgtatttgcatataactcttgaatggacaattcaaccatagctttccatgctctcattatcatcttcacaacatcgcg 4199221  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    |    |||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||||||    
T  4199222 agatttcacctctttcccatcattttt---tcccaaaggatatttataatctaagacgcacctttgtttaacatttgcttgcacatgaaagtaacaattc 4199318  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgcttt 459  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4199319 attgcataactttcggggaaaacatttgcaaccgcttt 4199356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 665 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 20286410 - 20286180
Alignment:
Q  665 gtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtg 764  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20286410 gtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagtactttcattttgtg 20286312  T
Q  765 ttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttc 864  Q
    || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20286311 ttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttc 20286212  T
Q  865 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 896  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20286211 attgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 20286180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 517 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 11819766 - 11819551
Alignment:
Q  517 aagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtc 616  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| |||||  |||||| || || |||||    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| | ||     
T  11819766 aagaagtttaagcaacattttcaaagcccaagtaaagttatcctccttctccgacgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttaaggtg 11819667  T
Q  617 accccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatg 716  Q
    || |||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  |||     
T  11819666 actccaactatttcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatt 11819567  T
Q  717 ttggatgagcccaaaa 732  Q
    ||||||||| ||||||    
T  11819566 ttggatgagtccaaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 27013235 - 27013395
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  27013235 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 27013334  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    | || | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  27013335 ctattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 42343985 - 42343826
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  42343985 gtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggttactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtatgtggaat 42343886  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  42343885 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaatatact-gatgttggatgagtccaaaa 42343826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 6553284 - 6553124
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || || ||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  6553284 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactcccactatttcaaacaatggcattctatacaaattggttttgtacgtggaat 6553185  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  || |||||||||| ||||||    
T  6553184 ccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgaagttggatgagtccaaaa 6553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 43295709 - 43295549
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  43295709 gtcataaatgcagaacaaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaataatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 43295610  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43295609 ccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 106 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 25054257 - 25054192
Alignment:
Q  106 gtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcac 171  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  25054257 gtttgtggtcctgcacccaagatgtaacacaagctctgtccatgctctcactattttgtcattcac 25054192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 652 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 25053148 - 25053043
Alignment:
Q  652 gttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtatta 751  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |||||| || |||| |||||| | |    
T  25053148 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagccggaaaattgttaaacagctttatcgatattggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttga 25053049  T
Q  752 ctttca 757  Q
    ||||||    
T  25053048 ctttca 25053043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Original strand, 27012749 - 27012810
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27012749 tttgtggtcctacacccaagatgtaacactaggtccgtccatgccctcactattttgtcctt 27012810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 675
Target Start/End: Original strand, 9376353 - 9376440
Alignment:
Q  588 caaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccat 675  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||| || || |||| ||||||    
T  9376353 caaccgaatatggcatatctgttgaggtgacctcaactatctcaaacaatggcatcttgtacatgttggttttataggtggggtccat 9376440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11820197 - 11820136
Alignment:
Q  107 tttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtcctt 168  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  11820197 tttgtggtactacacccaagatgtaacacaaggtccgtccatgccctcactagtttgtcctt 11820136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 757; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 757; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 903
Target Start/End: Original strand, 15373 - 16254
Alignment:
Q  22 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgggccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373 atgtattttctcccaacaagtacccaaatcacccacactattgtccaagtatttcttcaacaaagcatgagccgattcgaccctgtttgtggtcctgcaa 15472  T
Q  122 ccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttcacttcatccaaggtggtcatggcataatctacaaaaattgggaaatcactac 221  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15473 cctagatgcaacacatggtctgtccattccctcacaattttgtctttcacttcattcaaggtggtcatggcacaatctacaaaaattgggaaatcactac 15572  T
Q  222 atgaatctttgaactccactaatgcatttgcatataattgttgattgggagattcaaccatagttttccatgcgttcattatcttcttcaccacatcccg 321  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15573 atgaatctttgaactccagtaatgcatttgcatataactgttgagtgggcgattcaaccatagctttccatgccttcattatcttcttcaccacatcgcg 15672  T
Q  322 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  15673 attgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaatgatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagtaacaattc 15772  T
Q  422 aatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaa 521  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15773 attgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcacattcatctttgacgaaagaa 15872  T
Q  522 gtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 621  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15873 gtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccc 15972  T
Q  622 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15973 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttgga 16072  T
Q  722 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 821  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16073 tgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 16172  T
Q  822 gcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16173 gcttcttgtcacccctatttgcgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 16254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 17762 - 17233
Alignment:
Q  374 aagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnnnncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatat 473  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||       ||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17762 aagacgcacctttatttaacatttgcttgcacatgaaagtgacaattcattgcagaactttcggggaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatat 17663  T
Q  474 ccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttgacgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgt 573  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662 ccctgtcggtcacaatcaccttatgcatattcatctttgacgtaagaagtttacgcaacatttttaaaacccaaacaaagttttcctctttctcatgtgt 17563  T
Q  574 cataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtcc 673  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17562 cacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttttgtaggtggagtcc 17463  T
Q  674 ataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagt 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  17462 ataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcctaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgttcttgagt 17363  T
Q  774 aataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacac 873  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17362 aataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacac 17263  T
Q  874 ttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17262 ttgcttcacatttttcatgcaatgtggtct 17233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 314 - 663
Target Start/End: Original strand, 25254 - 25603
Alignment:
Q  314 acatcccgattgctcacctctttcccatcctttttaaagcccaaaggatatttacaattcaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgnnnnn 413  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  25254 acatcgcgattgctcacctctttcccatcctttttaaaacccaaaggatatttacaatctaagacacacctttgtttaacattagcttgcacatgaaagt 25353  T
Q  414 nncaattcaatgcataactttccggaaaaacatgtgcaaccgctttcatcaaagacatatccctatcggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 513  Q
      ||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354 aacaattcattgcataacttttaggaaaaacatttgcaaccgctttcatcaaagacatatcaatgtaggtaacaatcaccttaggcatattcatctttga 25453  T
Q  514 cgaaagaagtttacgcaacattgttaaaacccaaacaaagttttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaa 613  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  25454 cgaaagaagtttacgcaacatttttaaaaccaaaacaaagttttcctctttctcatatgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaattggtcgaa 25553  T
Q  614 gtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgta 663  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25554 gtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttttgta 25603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 750 - 903
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12426
Alignment:
Q  750 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc-ttcc 848  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  849 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 903  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 560 - 656
Target Start/End: Original strand, 4 - 100
Alignment:
Q  560 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttgg 656  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4 tctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatcttgg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 572 - 732
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28612
Alignment:
Q  572 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 671  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| || || || || |    
T  28452 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttttatgtagaat 28551  T
Q  672 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 732  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  28552 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 28612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Original strand, 2101 - 2166
Alignment:
Q  105 tgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaattttgtccttca 170  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2101 tgttcgtggtcctgcacccaagatgtaacacaaggtctgtccataccctcactattttgtccttca 2166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0542 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0542
Description:

Target: scaffold0542; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 162
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1226
Alignment:
Q  104 ctgtttgtggtcctgcaaccaagatgcaacacatggtctgtccatgccctcacaatttt 162  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1168 ctgttggtggttcggcagccaagatgcaagacatggtctgtccatgccctcactatttt 1226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 705
Target Start/End: Complemental strand, 4315 - 4198
Alignment:
Q  588 caaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 687  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || || |||||||  ||||||| ||||||  | |||| |||||| || || ||||| ||||| | |||||| ||    
T  4315 caaccgaatatgtcaaatatgttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattttctacaagttggttttatatgtggaatccattatcaaaacagt 4216  T
Q  688 tggaaaattgttaaacaa 705  Q
      ||||||||||||||||    
T  4215 cagaaaattgttaaacaa 4198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University