View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12261_low_3 (Length: 690)

Name: NF12261_low_3
Description: NF12261
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12261_low_3
NF12261_low_3
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (15-682)||(13833625-13834298)
chr7 (17-682)||(27974006-27974691)
chr7 (17-682)||(566965-567646)
chr7 (17-656)||(29024325-29024951)
chr7 (183-682)||(4949641-4950146)
chr7 (313-656)||(27436160-27436510)
chr7 (292-682)||(5207177-5207579)
chr7 (17-263)||(27436511-27436757)
chr7 (17-280)||(5206887-5207150)
chr7 (343-682)||(8812594-8812937)
chr7 (540-682)||(1900166-1900309)
chr7 (29-164)||(38412256-38412391)
chr7 (541-682)||(13491232-13491371)
chr7 (243-674)||(12586519-12586955)
chr7 (538-656)||(15186452-15186571)
chr7 (538-656)||(29082879-29082998)
chr7 (538-656)||(16146569-16146688)
chr7 (540-682)||(13268539-13268681)
chr7 (295-682)||(840315-840693)
chr7 (295-682)||(847491-847869)
chr7 (295-682)||(1205495-1205873)
chr7 (584-682)||(34136937-34137035)
chr7 (540-672)||(23884753-23884885)
chr7 (293-565)||(4829916-4830193)
chr7 (39-171)||(3428700-3428832)
chr7 (220-463)||(1959468-1959706)
chr7 (59-152)||(12587035-12587128)
chr7 (540-682)||(804909-805054)
chr7 (614-682)||(16270644-16270710)
chr7 (415-472)||(16270442-16270498)
chr7 (603-682)||(3430724-3430803)
chr7 (343-481)||(13268344-13268479)
chr7 (361-481)||(23884567-23884692)
chr7 (610-663)||(16228645-16228699)
chr7 (634-682)||(9463104-9463151)
chr7 (634-682)||(16400050-16400097)
chr7 (634-682)||(30376543-30376590)
chr7 (243-280)||(803203-803240)
chr7 (243-280)||(16292070-16292107)
chr7 (234-279)||(34136598-34136643)
chr7 (589-656)||(2549856-2549923)
chr7 (603-682)||(16293858-16293937)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (17-682)||(15950317-15950986)
chr2 (17-682)||(24287742-24288385)
chr2 (13-682)||(35140749-35141426)
chr2 (17-682)||(42571801-42572479)
chr2 (17-682)||(21857383-21858050)
chr2 (17-682)||(16275554-16276245)
chr2 (206-682)||(25493980-25494466)
chr2 (326-675)||(21112150-21112506)
chr2 (292-682)||(3764018-3764418)
chr2 (17-280)||(3763728-3763991)
chr2 (540-682)||(26730967-26731110)
chr2 (540-682)||(34541156-34541299)
chr2 (292-494)||(30691456-30691664)
chr2 (547-658)||(24701129-24701241)
chr2 (559-682)||(40388514-40388637)
chr2 (547-658)||(24692290-24692402)
chr2 (582-682)||(21767056-21767154)
chr2 (415-493)||(24701289-24701366)
chr2 (538-604)||(42386963-42387029)
chr2 (415-493)||(24692449-24692526)
chr2 (234-280)||(24692661-24692707)
chr2 (541-572)||(12377267-12377298)
chr2 (555-618)||(20278855-20278918)
chr2 (234-280)||(24701501-24701547)
chr2 (234-278)||(19990255-19990297)
chr2 (627-656)||(42386926-42386955)
chr2 (343-407)||(20278671-20278734)
chr2 (634-682)||(22942907-22942954)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (17-682)||(39842868-39843531)
chr8 (17-682)||(17680211-17680876)
chr8 (18-682)||(6665875-6666544)
chr8 (437-682)||(6673537-6673777)
chr8 (540-682)||(16761728-16761871)
chr8 (540-682)||(19837545-19837686)
chr8 (343-682)||(20735863-20736209)
chr8 (540-682)||(20740901-20741043)
chr8 (343-682)||(20744421-20744767)
chr8 (503-663)||(22104942-22105104)
chr8 (546-682)||(32001904-32002040)
chr8 (543-682)||(22160921-22161060)
chr8 (559-682)||(23917521-23917644)
chr8 (296-675)||(24709061-24709436)
chr8 (584-682)||(25857102-25857200)
chr8 (343-481)||(22160721-22160856)
chr8 (343-440)||(20741148-20741251)
chr8 (239-280)||(32002307-32002348)
chr8 (234-280)||(25856759-25856805)
chr8 (345-407)||(25856869-25856930)
[»] chr3 (65 HSPs)
chr3 (13-682)||(41000421-41001098)
chr3 (13-682)||(41009203-41009880)
chr3 (13-682)||(8202817-8203499)
chr3 (17-682)||(25265673-25266342)
chr3 (29-611)||(17928027-17928609)
chr3 (17-656)||(10719996-10720658)
chr3 (292-682)||(9552601-9552993)
chr3 (381-684)||(15682786-15683093)
chr3 (343-682)||(14420436-14420777)
chr3 (27-674)||(3242630-3243272)
chr3 (17-263)||(15682448-15682694)
chr3 (351-672)||(8608327-8608652)
chr3 (540-682)||(15697794-15697936)
chr3 (540-682)||(12557195-12557336)
chr3 (350-682)||(30093459-30093798)
chr3 (362-682)||(11183583-11183903)
chr3 (344-682)||(14885413-14885754)
chr3 (540-663)||(14890876-14891000)
chr3 (540-682)||(18881266-18881408)
chr3 (343-672)||(12477128-12477456)
chr3 (234-663)||(70314-70729)
chr3 (538-682)||(7095802-7095946)
chr3 (234-682)||(15622593-15623041)
chr3 (343-682)||(23285736-23286071)
chr3 (52-279)||(27881584-27881810)
chr3 (415-672)||(8806485-8806741)
chr3 (508-672)||(15912056-15912220)
chr3 (540-672)||(21609933-21610065)
chr3 (540-682)||(18960552-18960683)
chr3 (13-82)||(9552489-9552558)
chr3 (559-682)||(13109591-13109714)
chr3 (540-682)||(15599553-15599688)
chr3 (343-682)||(6196558-6196889)
chr3 (589-682)||(8618616-8618708)
chr3 (589-682)||(15535066-15535158)
chr3 (589-682)||(46398513-46398605)
chr3 (39-171)||(3679627-3679759)
chr3 (39-171)||(30016197-30016329)
chr3 (609-663)||(17919962-17920016)
chr3 (582-682)||(6970197-6970295)
chr3 (343-481)||(33568206-33568341)
chr3 (361-493)||(21610113-21610250)
chr3 (292-600)||(27881251-27881564)
chr3 (603-682)||(30014230-30014309)
chr3 (540-682)||(41433823-41433968)
chr3 (234-280)||(12477020-12477066)
chr3 (234-280)||(14885303-14885349)
chr3 (603-682)||(3677659-3677738)
chr3 (627-663)||(4436511-4436547)
chr3 (603-682)||(20436660-20436739)
chr3 (86-202)||(26384076-26384192)
chr3 (634-682)||(46373802-46373849)
chr3 (438-493)||(14396298-14396353)
chr3 (610-656)||(24215391-24215438)
chr3 (234-280)||(8806886-8806932)
chr3 (350-411)||(8618870-8618929)
chr3 (234-279)||(14420843-14420888)
chr3 (243-280)||(20438484-20438521)
chr3 (234-279)||(23285626-23285671)
chr3 (243-280)||(41435649-41435686)
chr3 (627-663)||(5143701-5143737)
chr3 (634-682)||(5957518-5957565)
chr3 (589-656)||(11932154-11932221)
chr3 (540-572)||(26384530-26384562)
chr3 (351-407)||(46398287-46398341)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (13-682)||(31542081-31542758)
chr1 (17-682)||(2387295-2387963)
chr1 (17-663)||(13470882-13471530)
chr1 (381-682)||(31554281-31554592)
chr1 (17-262)||(31554693-31554938)
chr1 (540-682)||(13452956-13453098)
chr1 (343-672)||(22430075-22430404)
chr1 (292-663)||(1957985-1958356)
chr1 (415-684)||(14817945-14818202)
chr1 (589-675)||(2341525-2341610)
chr1 (567-663)||(19370984-19371081)
chr1 (370-682)||(6202787-6203100)
chr1 (362-481)||(19371138-19371260)
chr1 (234-582)||(35071822-35072165)
chr1 (535-682)||(27168225-27168373)
chr1 (234-280)||(6202651-6202697)
chr1 (415-481)||(2341361-2341427)
chr1 (234-280)||(14817763-14817809)
chr1 (610-663)||(22473489-22473543)
chr1 (634-682)||(5635719-5635766)
chr1 (234-280)||(22430466-22430512)
chr1 (243-280)||(19371337-19371374)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (13-682)||(24962560-24963236)
chr5 (17-682)||(21993638-21994291)
chr5 (292-682)||(20378632-20379025)
chr5 (17-250)||(28846480-28846712)
chr5 (292-682)||(28846073-28846460)
chr5 (17-441)||(23638462-23638889)
chr5 (17-441)||(23833998-23834427)
chr5 (421-682)||(21866131-21866389)
chr5 (17-280)||(12178351-12178616)
chr5 (17-280)||(27231425-27231688)
chr5 (292-682)||(12178647-12179047)
chr5 (292-682)||(33842911-33843311)
chr5 (292-682)||(26087416-26087816)
chr5 (292-682)||(11811500-11811901)
chr5 (17-280)||(33842621-33842884)
chr5 (17-280)||(26087120-26087383)
chr5 (17-280)||(11811197-11811460)
chr5 (436-675)||(23638203-23638439)
chr5 (436-675)||(23834451-23834687)
chr5 (386-682)||(22956781-22957078)
chr5 (425-682)||(27231843-27232101)
chr5 (345-682)||(29895244-29895576)
chr5 (343-636)||(20097251-20097550)
chr5 (343-682)||(25528337-25528673)
chr5 (540-682)||(36450393-36450535)
chr5 (295-682)||(26871190-26871568)
chr5 (415-682)||(7259793-7260060)
chr5 (589-682)||(1800288-1800380)
chr5 (589-682)||(12393443-12393535)
chr5 (589-682)||(21690733-21690825)
chr5 (578-682)||(29890230-29890334)
chr5 (39-171)||(37580755-37580887)
chr5 (540-663)||(358860-358983)
chr5 (607-682)||(20395672-20395746)
chr5 (234-280)||(7259625-7259671)
chr5 (222-279)||(21865921-21865978)
chr5 (343-493)||(36450583-36450730)
chr5 (631-674)||(37578782-37578825)
chr5 (234-280)||(29895640-29895686)
chr5 (634-682)||(15791307-15791354)
chr5 (634-682)||(36382575-36382622)
chr5 (634-682)||(37007247-37007294)
chr5 (234-280)||(22956632-22956678)
chr5 (234-280)||(25528734-25528780)
chr5 (350-407)||(7789240-7789295)
chr5 (350-407)||(12393225-12393280)
chr5 (370-411)||(21690984-21691024)
chr5 (243-280)||(34464032-34464069)
chr5 (589-656)||(3490920-3490987)
chr5 (634-682)||(5446797-5446844)
chr5 (634-682)||(7788983-7789030)
chr5 (634-682)||(11951010-11951057)
chr5 (241-277)||(21691131-21691167)
chr5 (634-682)||(31513825-31513872)
chr5 (603-682)||(34462205-34462284)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (13-661)||(25503768-25504426)
chr6 (17-682)||(16636282-16636956)
chr6 (292-682)||(28269987-28270386)
chr6 (292-682)||(28348737-28349136)
chr6 (292-682)||(28304954-28305355)
chr6 (292-682)||(27056372-27056773)
chr6 (13-159)||(5006783-5006929)
chr6 (17-280)||(27056064-27056327)
chr6 (351-682)||(22326025-22326361)
chr6 (343-682)||(620927-621270)
chr6 (540-682)||(27538305-27538448)
chr6 (343-682)||(27071864-27072204)
chr6 (540-682)||(25700474-25700616)
chr6 (343-663)||(19715822-19716143)
chr6 (538-682)||(18219274-18219418)
chr6 (540-672)||(20056100-20056231)
chr6 (538-656)||(18112836-18112955)
chr6 (343-663)||(20457035-20457358)
chr6 (538-682)||(23981842-23981986)
chr6 (540-682)||(3694321-3694465)
chr6 (589-682)||(27512121-27512213)
chr6 (584-656)||(22777010-22777082)
chr6 (378-481)||(27512302-27512407)
chr6 (589-682)||(16823023-16823115)
chr6 (609-661)||(18911256-18911308)
chr6 (415-477)||(20055967-20056028)
chr6 (540-656)||(28266931-28267047)
chr6 (540-656)||(28345680-28345796)
chr6 (350-450)||(22776802-22776905)
chr6 (634-682)||(9143000-9143047)
chr6 (234-280)||(18946917-18946963)
chr6 (234-280)||(27071751-27071797)
chr6 (350-407)||(20045665-20045720)
chr6 (598-682)||(20045908-20045988)
chr6 (241-277)||(27512506-27512542)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (29-682)||(73906-74566)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (17-682)||(1849-2516)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (293-682)||(12103-12491)
scaffold0056 (17-196)||(12567-12746)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (222-682)||(144300-144762)
scaffold0023 (454-682)||(131477-131706)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (233-682)||(6752-7217)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (17-276)||(21528930-21529189)
chr4 (17-250)||(8100380-8100612)
chr4 (292-682)||(21529217-21529586)
chr4 (292-682)||(8100633-8101020)
chr4 (381-656)||(26218314-26218595)
chr4 (17-263)||(26217977-26218224)
chr4 (546-682)||(3386336-3386471)
chr4 (538-682)||(14736116-14736260)
chr4 (540-682)||(1888796-1888938)
chr4 (343-682)||(20556056-20556393)
chr4 (415-682)||(16725868-16726133)
chr4 (343-675)||(14883695-14884022)
chr4 (18-202)||(12510293-12510477)
chr4 (343-682)||(15900530-15900867)
chr4 (540-682)||(3841888-3842030)
chr4 (594-657)||(9187022-9187085)
chr4 (27-117)||(12511465-12511555)
chr4 (589-682)||(18038434-18038526)
chr4 (589-682)||(22706146-22706238)
chr4 (351-473)||(15077321-15077447)
chr4 (27-117)||(12511038-12511128)
chr4 (378-481)||(18038616-18038721)
chr4 (343-682)||(15079619-15079961)
chr4 (292-477)||(3359573-3359761)
chr4 (559-659)||(17304043-17304144)
chr4 (415-481)||(3841764-3841828)
chr4 (234-280)||(14919898-14919944)
chr4 (234-277)||(16725687-16725730)
chr4 (234-280)||(3386030-3386076)
chr4 (39-152)||(15077014-15077127)
chr4 (589-656)||(10787570-10787637)
chr4 (234-280)||(9187384-9187430)
chr4 (636-682)||(23994001-23994047)
chr4 (234-279)||(20556457-20556502)
chr4 (370-411)||(22706397-22706437)
chr4 (241-277)||(3841582-3841618)
chr4 (343-407)||(9187258-9187321)
chr4 (241-277)||(22706531-22706567)
[»] scaffold2162 (2 HSPs)
scaffold2162 (17-280)||(452-715)
scaffold2162 (292-682)||(5-407)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (292-674)||(4881-5268)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (343-659)||(192297-192620)
scaffold0004 (42-152)||(192001-192111)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (350-682)||(19394-19728)
scaffold0019 (234-280)||(18481-18527)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (343-682)||(17178-17520)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (374-682)||(30575-30886)
[»] scaffold0551 (3 HSPs)
scaffold0551 (351-682)||(5047-5385)
scaffold0551 (234-280)||(4929-4975)
scaffold0551 (234-280)||(11043-11089)
[»] scaffold1818 (1 HSPs)
scaffold1818 (540-682)||(92-234)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (234-658)||(31033-31463)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (346-672)||(10309-10630)
scaffold0138 (26-101)||(10861-10936)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (540-682)||(8459-8601)
scaffold0357 (343-476)||(8665-8804)
scaffold0357 (234-280)||(8869-8915)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (415-672)||(31714-31970)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (540-682)||(2430-2574)
[»] scaffold0320 (2 HSPs)
scaffold0320 (540-672)||(4146-4278)
scaffold0320 (343-481)||(3947-4090)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (540-663)||(20756-20880)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (343-682)||(17784-18122)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (539-682)||(38679-38815)
[»] scaffold0478 (3 HSPs)
scaffold0478 (543-672)||(314-443)
scaffold0478 (239-280)||(2-43)
scaffold0478 (351-477)||(115-246)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (350-682)||(98758-99089)
[»] scaffold0441 (2 HSPs)
scaffold0441 (540-682)||(9183-9326)
scaffold0441 (240-475)||(9390-9622)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (18-202)||(10000-10184)
scaffold0157 (27-117)||(9352-9442)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (535-659)||(301177-301297)
scaffold0005 (59-197)||(301586-301724)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (502-674)||(11374-11545)
scaffold0125 (82-152)||(11857-11926)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (540-682)||(8134-8270)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (540-674)||(16685-16811)
scaffold0243 (234-277)||(17062-17105)
[»] scaffold0362 (3 HSPs)
scaffold0362 (540-672)||(1872-1998)
scaffold0362 (27-173)||(1382-1528)
scaffold0362 (234-280)||(1580-1625)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (343-481)||(25380-25522)
[»] scaffold0435 (2 HSPs)
scaffold0435 (589-672)||(14601-14684)
scaffold0435 (240-280)||(14277-14317)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (343-473)||(3834-3968)
scaffold0393 (540-682)||(3626-3768)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (540-682)||(291-433)
scaffold0364 (343-407)||(96-159)
[»] scaffold0068 (3 HSPs)
scaffold0068 (589-682)||(23085-23177)
scaffold0068 (370-407)||(22886-22922)
scaffold0068 (241-277)||(22743-22779)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (234-473)||(37076-37319)
scaffold0104 (594-672)||(37438-37516)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (540-672)||(208-340)
[»] scaffold0866 (1 HSPs)
scaffold0866 (582-682)||(4586-4684)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (594-682)||(299420-299507)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (342-481)||(33885-34029)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (535-682)||(185841-185989)
scaffold0014 (82-152)||(184024-184094)
scaffold0014 (243-280)||(184177-184214)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (46-105)||(29015-29074)
scaffold0031 (540-682)||(29511-29653)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (610-663)||(84320-84374)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (415-481)||(152039-152104)
[»] scaffold0782 (1 HSPs)
scaffold0782 (243-280)||(5901-5938)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (634-682)||(22701-22748)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13834298 - 13833625
Alignment:
Q  15 tggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatc 114  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13834298 tggccatcaatgaagatattaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgcagctcatggacctcttgctcaagccgatc 13834199  T
Q  115 catttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaaca 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13834198 catttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattaaccttttgctagtagaaaca 13834099  T
Q  215 aaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn--------gaaggacttatcaaa 306  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                   |||||||||||||||    
T  13834098 aaatatgaaacacatactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagttttgttttttttttttttgaaggacttatcaaa 13833999  T
Q  307 gtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13833998 gtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaa 13833899  T
Q  407 agagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgt 506  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||       |||||    
T  13833898 agagtacaaaagctaaagcttagttaa-aatttttgaagttgtatctctttgtgttcattcttacaaagtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgt 13833800  T
Q  507 ctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtcc 606  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13833799 ctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttattataaagtacatagaatacatgatgaggttaagtcc 13833701  T
Q  607 acaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13833700 acaatgttggagtcaaggataacaacgccacttggtaaagactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 13833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 27974006 - 27974691
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27974006 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 27974105  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
      |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |||     
T  27974106 acttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacctttttatgg-agaagacac 27974204  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag-----------nnnnnnnnnnngaaggacttatca 304  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                      ||||||||| | |    
T  27974205 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagatttttttttttttttttttttgaaggacttgtta 27974304  T
Q  305 aagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaaga-cgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaag 403  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||   || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27974305 aagtgaaatgtaaacatggcagaggaacattgtttca-tttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaag 27974403  T
Q  404 gaaagagt------acgaaagct-aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnn 496  Q
    |||| |||      ||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       
T  27974404 gaaaaagttctttaacataagctaaaagcttagttaaga-ttttggaagttgtatttcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-ac 27974501  T
Q  497 nnnnncttgtctaagtccttcaa-----ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacat 591  Q
         ||||||||||||||||||     ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27974502 aaaaacttgtctaagtccttcaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtggatagaatacat 27974600  T
Q  592 gatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    | ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  27974601 ggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaacgtacctgtatcacgggttct 27974691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 566965 - 567646
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  566965 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 567064  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  567065 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 567163  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag---------nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaa 306  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                    ||||||||| | |||    
T  567164 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagatttttttttttttttttttgaaggacttgttaaa 567263  T
Q  307 gtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaaga-cgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga 405  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||   || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  567264 gtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttca-tttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga 567362  T
Q  406 aagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttg 505  Q
    |  ||| |   | |  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||    
T  567363 agaagttctttaacataagcttagttaaga-ttttggaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttg 567460  T
Q  506 tctaagtccttc----------aattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatg 595  Q
    ||||||||||||          ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||    
T  567461 tctaagtccttcaaaaaaaaaaaattttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtggatagaatacatggtg 567559  T
Q  596 aggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| |||| ||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  567560 agggtaagttccacgacgttggagtcaaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 567646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29024951 - 29024325
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  29024951 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacctcttgctcaagccggtcca 29024852  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||  ||||| || |||||||||||||||  |||| |||||||    
T  29024851 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgacccctttaatgttggattgaccttttgtaggtaaaaacaaa 29024752  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaat----agnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa 311  Q
    ||||||| || | || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||||                  |||||||||||||||| ||    
T  29024751 atatgaggcatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcagaaatgtactatttttttttttaaaggacttatcaaagttaa 29024652  T
Q  312 -ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagag 410  Q
     || |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  29024651 tttttaaacattgtagagaaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg-tcctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaag 29024554  T
Q  411 t-----acgaaagctaaagcttagttaaga------ttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnn 499  Q
    |     || ||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          
T  29024553 ttcttaacaaaagctaaaacttagttaagagattttttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatgttt-acaaa 29024455  T
Q  500 nncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggt 599  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||                |||||||||||||||         |||||||||||||    
T  29024454 aacttgtctaaatccttcaa-tttttgatggaaaaagttgtttatga----------------atggttatgctaaag---------tacatgatgaggt 29024381  T
Q  600 taagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29024380 taagtccac-atgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 29024325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 183 - 682
Target Start/End: Original strand, 4949641 - 4950146
Alignment:
Q  183 actgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnn 282  Q
    ||||||||||||||||||||  | || | ||| |  || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||      
T  4949641 actgatggattgaccttttgtagataaagacacatgataagacacatactagaaactatgaatgcaaaatgaggcatgatatgcttatgcaaaaatagat 4949740  T
Q  283 nnnnnnnnn-----gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctt 377  Q
                  |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  | ||||||    
T  4949741 ttttttttttttttgaaggacttatcaa-gtgaattgtaaacatggcagacgaacatgatttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaatagattcctt 4949838  T
Q  378 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttaca 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     || |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4949839 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagttctaaacaaaagttaaagcttagttaagattttta-aagttgtatctcttggtgttcattcttaca 4949937  T
Q  473 aggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaag--tccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttat 570  Q
    |||||  ||  | ||||||||        ||||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4949938 aggtcattattcgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagagtccttcaatttttgg-tggaaa-agttgtttatgaatgaatgcatgtatacatggttat 4950034  T
Q  571 gctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctg 669  Q
    |||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  4950035 gctaaaattcataaaatatatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgtttttaaa-tgtacctg 4950133  T
Q  670 tatcacaggttct 682  Q
    |||||| ||||||    
T  4950134 tatcacgggttct 4950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 313 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 27436510 - 27436160
Alignment:
Q  313 tgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt- 411  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27436510 tgtaaacacagtagaggaacatggtttcattt-gaaaattttaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtt 27436412  T
Q  412 ----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtc 507  Q
        || |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||         || ||    
T  27436411 cttaacaaaagttaaagcttagttaagatttt--gaagctgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgtttacaaaaat-ttatc 27436315  T
Q  508 taagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata------gaatacatgatgaggtta 601  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||||||||| ||||||||    
T  27436314 taagtccttcaattttt-gatggaaaaagttattcatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgttaaagtacatatacatagaatacatggtgaggtta 27436216  T
Q  602 agtcc-acaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27436215 agtcccacaatgttggagccaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 27436160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 5207177 - 5207579
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  5207177 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 5207275  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  5207276 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 5207374  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa--------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaa 575  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||        ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5207375 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaattttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-a 5207472  T
Q  576 agtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    |||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5207473 agtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatca 5207571  T
Q  675 caggttct 682  Q
    | ||||||    
T  5207572 cgggttct 5207579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27436757 - 27436511
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  27436757 gccatcaatgaggatactaggctagctaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcctggacttcttgctcaagctgatcca 27436658  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||  |||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  27436657 tgtttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgacgacatctgacccctttactgttggattgacctcttgtaggtaaaaacaaa 27436558  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 263  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27436557 atatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagtgatggatgata 27436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 5206887 - 5207150
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5206887 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacttctccccgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 5206986  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  5206987 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 5207085  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5207086 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 5207150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8812937 - 8812594
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  8812937 tttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 8812839  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaata- 535  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| |     
T  8812838 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaaa 8812741  T
Q  536 --gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacg 633  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  8812740 aagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctgaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcgagggtaacaatg 8812642  T
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  8812641 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 8812594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 1900166 - 1900309
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  1900166 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 1900265  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1900266 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 1900309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38412391 - 38412256
Alignment:
Q  29 gatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctattt 128  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38412391 gatacaagactagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagttcccgtacttcttgctcaagtcgatccatttttcctgttt 38412292  T
Q  129 gcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatg 164  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38412291 gcacgagtgtttgcatatgcgagccggacttggatg 38412256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 541 - 682
Target Start/End: Original strand, 13491232 - 13491371
Alignment:
Q  541 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttg 640  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13491232 ttatgaatggatgcatgcatgcatgattatgctaaaatacatggaatacataatgaggttaagtccac-atgttggagtcaagggtaacaacgccatttg 13491330  T
Q  641 gtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  13491331 gtaaggactatggttttaaa-tatacctgtatcacgggttct 13491371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 243 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 12586955 - 12586519
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcat 342  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||           |||||| || ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12586955 aatgcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaaaatagacacattttttgaaggatttgtcaaagt-atttggaaacattatagaggaacatggtttcat 12586859  T
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttccttttt-caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    ||  || ||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||     || |||||||||||||||||||||     
T  12586858 ttaaaa-attgtaaagatattgcaataggttccttttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 12586761  T
Q  437 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccat--acccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaa 533  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||| |  | |  |||||||||       ||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  12586760 tttttgaagtttgaatttcttggtgttcttccttacaaggtccgttcatctgtgatgtttg-taaaaacttgtctaaatccttcga-tgtttgatggaaa 12586663  T
Q  534 tagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgagg--ttaagtccacaatgttggagtcaa-gggc 626  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| |    ||| ||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||| |||     
T  12586662 aatttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gcacaaatggtgaaaacatggtgaggttttaggtccacaatgatggagtcaaggggt 12586566  T
Q  627 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12586565 aaatacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatca 12586519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 538 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15186571 - 15186452
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15186571 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 15186472  T
Q  637 tttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15186471 tttggtaaggactatggttt 15186452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 538 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29082998 - 29082879
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29082998 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 29082899  T
Q  637 tttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29082898 tttggtaaggactatggttt 29082879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 538 - 656
Target Start/End: Original strand, 16146569 - 16146688
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16146569 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 16146668  T
Q  637 tttggtaaggactatggttt 656  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  16146669 tctggtaaggactatggttt 16146688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 13268539 - 13268681
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  13268539 tttatgaatgaatgcttgtatgcatgattatgctaaggaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatt 13268638  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13268639 tggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 13268681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 840693 - 840315
Alignment:
Q  295 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 394  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||| |||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  840693 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttattt-gaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaa-ggtaagaac 840596  T
Q  395 gaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 489  Q
    ||||||||||||| |||     || |||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  840595 gaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 840497  T
Q  490 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 588  Q
    ||||        ||| |||||||||||| ||  |  ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||     
T  840496 gttt-acaaaaacttatctaagtccttcgataatagtga-gaaaatggtt--ttatcaatgaatgcatgtatgcatgattatgc--------atcgaatg 840409  T
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  840408 catggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggcagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 840315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 847869 - 847491
Alignment:
Q  295 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 394  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||| |||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  847869 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttattt-gaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaa-ggtaagaac 847772  T
Q  395 gaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 489  Q
    ||||||||||||| |||     || |||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  847771 gaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 847673  T
Q  490 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 588  Q
    ||||        ||| |||||||||||| ||  |  ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||     
T  847672 gttt-acaaaaacttatctaagtccttcgataatagtga-gaaaatggtt--ttatcaatgaatgcatgtatgcatgattatgc--------atcgaatg 847585  T
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  847584 catggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggcagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 847491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 1205873 - 1205495
Alignment:
Q  295 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 394  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||| |||||   |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  1205873 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttattt-gaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaa-ggtaagaac 1205776  T
Q  395 gaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 489  Q
    ||||||||||||| |||     || |||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  1205775 gaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 1205677  T
Q  490 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 588  Q
    ||||        ||| |||||||||||| ||  |  ||| | |||| |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||        || ||||     
T  1205676 gttt-acaaaaacttatctaagtccttcgataatagtga-gaaaatggtt--ttatcaatgaatgcatgtatgcatgattatgc--------atcgaatg 1205589  T
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1205588 catggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggcagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 1205495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 584 - 682
Target Start/End: Original strand, 34136937 - 34137035
Alignment:
Q  584 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  34136937 gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaacaacaccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaaaggttct 34137035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 540 - 672
Target Start/End: Original strand, 23884753 - 23884885
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||||| | || || ||||||||||||    
T  23884753 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatgatggagcttaaaggtaacaacgccatt 23884852  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  23884853 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 23884885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 293 - 565
Target Start/End: Original strand, 4829916 - 4830193
Alignment:
Q  293 aaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 392  Q
    ||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4829916 aaggatttgtcaaagt-aattggaaacattatagaggaacgtgatttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaaga 4830013  T
Q  393 acgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccca- 485  Q
    ||||||||||||||| |||     |  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||||||| | |  |     
T  4830014 acgaaaccaaggaaaaagttcttaataaaagctaaggcttagttaaga-tttttgaagtttgaatttcttggtgttcttcctttcaaggtccgttcatat 4830112  T
Q  486 -tgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatgga-aatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatg 565  Q
     |||||||||       ||||||||| |||||| | | ||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830113 gtgatgtttgcaaaaaacttgtctaaatccttcga-tatttgataaacaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatg 4830193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Original strand, 3428700 - 3428832
Alignment:
Q  39 tagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctc-aagtcgatccatttttcctatttgcacgagtg 137  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3428700 tagttaacttctctacctcggcccgaagtacagttacttcttcacgaagctcgtggacctctt-ctctaagtcgatccattttttgtgtttgcacgagtg 3428798  T
Q  138 tctgcatatgcgagccgaacttggatggagacat 171  Q
    | ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||    
T  3428799 tttgcatgtgtgagctgaagttgaatgaagacat 3428832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 463
Target Start/End: Original strand, 1959468 - 1959706
Alignment:
Q  220 tgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaac 319  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||             ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1959468 tgagacacgaactagaaactatgaatgcaaaataatgcattgtatgtttatgcaaaaatgtaggatttttccgaagggcctatcaaagtgaattgtaaac 1959567  T
Q  320 attgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acg 414  Q
    |||||||||||||||  ||| | |||||| ||||||||||  |||||| | ||||        ||| ||||||||||||||||||||  |||     ||     
T  1959568 attgtagaggaacataacttta-tttgaaaattgtaaagatattgcaatcagttc--------aaaagtaagaacgaaaccaaggaagaagttcttaaca 1959658  T
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttc 463  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  1959659 aaagctaaagtttaattaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttc 1959706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12587128 - 12587035
Alignment:
Q  59 gcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagc 152  Q
    |||||||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  12587128 gcccgaagcgttgtcacttctttacgaagctcgtggacctcttgttcaagttgatccattttatgtgtttgcacgagtgtttgcatatgcgagc 12587035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 804909 - 805054
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggtt--aagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaac 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||    
T  804909 tttatggatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaatggtgaaaacatggtgaggttttaggtccacaatgatggagtcaaagggtaaacac 805005  T
Q  633 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  805006 gccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 805054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 614 - 682
Target Start/End: Original strand, 16270644 - 16270710
Alignment:
Q  614 tggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16270644 tggagtcaaggggtataacgccatttggtaaggactatggtttc--attgtacttgtatcacaggttct 16270710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 472
Target Start/End: Original strand, 16270442 - 16270498
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttaca 472  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16270442 aaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttcttccttaca 16270498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 682
Target Start/End: Original strand, 3430724 - 3430803
Alignment:
Q  603 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  3430724 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgccatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 3430803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 481
Target Start/End: Original strand, 13268344 - 13268479
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  13268344 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaagaaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 13268441  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||    
T  13268442 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccata 13268479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 481
Target Start/End: Original strand, 23884567 - 23884692
Alignment:
Q  361 gttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga--gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatct 453  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||     || |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |    
T  23884567 gttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggttttt-gagtttgtattt 23884664  T
Q  454 cttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23884665 cttggtgttccttcttacaagatccata 23884692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 16228699 - 16228645
Alignment:
Q  610 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16228699 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 16228645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9463151 - 9463104
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9463151 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 9463104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 16400050 - 16400097
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16400050 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 16400097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 30376543 - 30376590
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  30376543 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 30376590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Original strand, 803203 - 803240
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  803203 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 803240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Original strand, 16292070 - 16292107
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16292070 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 16292107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Original strand, 34136598 - 34136643
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 279  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34136598 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 34136643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 2549923 - 2549856
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2549923 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaataacgccatttggtaaggactaaggttt 2549856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 682
Target Start/End: Original strand, 16293858 - 16293937
Alignment:
Q  603 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  16293858 gtccacattgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 16293937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 15950317 - 15950986
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950317 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 15950416  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950417 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcaagctgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 15950516  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaat-----agnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtga 310  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||     |            ||||||||||||||||| |    
T  15950517 atatgagatacagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcattatatatttatgcaaaaatgtacaattttttttttttgaaggacttatcaaagtta 15950616  T
Q  311 attgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga 409  Q
    ||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15950617 atttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaaaga 15950715  T
Q  410 gtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtcta 509  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||       ||||||||    
T  15950716 gtacaaaagctaaagcttagttaa-attttttgaagttgtatctctttgtgtttattcttacaaagtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtcta 15950814  T
Q  510 agtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccaca 609  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950815 agtccttcaatttt-tgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccaca 15950913  T
Q  610 atgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15950914 atgttggagtcaaggataacaacgccacttggtaaagactatggtttcaaaatgtacctgtatcacgggttct 15950986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24288385 - 24287742
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24288385 gccatcactgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcga 24288286  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24288285 tttttcttgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattgaccctttgctggtagaaacaaa 24288186  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag---nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaatt 313  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||||    
T  24288185 atatgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatgtgcttatgcaaaaatagataaaaaaaattttgaaggacttatcaaagtgaatt 24288086  T
Q  314 gtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  24288085 gtaaacattatagaggaacatggtttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaacc------------- 24287999  T
Q  414 gaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtc 513  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||        ||||||| ||||    
T  24287998 --------aagcttagttaaga-tttttgaagttgtatatcttggtgttcattcttacaaggtccatatctgtgatgtttacaaaaaacttgtcttagtc 24287908  T
Q  514 cttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatg 612  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||     
T  24287907 cttcaa-tttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagaacatagaatacatggtggcgttaagttccacaata 24287810  T
Q  613 ttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||    
T  24287809 ttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtt--caagtgtacctgtatcacgggttct 24287742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 35141426 - 35140749
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141426 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 35141327  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  35141326 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaag 35141227  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag--nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtg 309  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||||||||||||||    
T  35141226 caaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtg 35141127  T
Q  310 aattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  35141126 aattgtaaacattgtcgaggaacatagtttca-tttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-cttttttaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaa 35141029  T
Q  410 gt-----acgaaagctaaagcttagttaaga--ttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnc 502  Q
     |     || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |    
T  35141028 cttcttaacaaaagctaaggcttagttaagattttttttgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaac 35140930  T
Q  503 ttgtctaagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggtta 601  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35140929 ttgcctaagtccttcaa-tttttgatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggtta 35140831  T
Q  602 ag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  35140830 agttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtattacgggttct 35140749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 42571801 - 42572479
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571801 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 42571900  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571901 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttacggatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 42572000  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgca-------aaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagt 308  Q
    |||||||| ||  || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||   |||||||       |||||             |||||||||||||||||    
T  42572001 atatgagatacagactagaaa-tatgaatgcaaagatgatgaatgatatatttatgcaaaaatgtaaaattttttttttttttgaaggacttatcaaagt 42572099  T
Q  309 gaa-ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
     || || ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42572100 taatttttaaacatggtagagaaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaaaatcgaaaccaaggaaa 42572198  T
Q  408 gagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnc 502  Q
     |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       |    
T  42572199 aagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccataatgtttgcaaaaaac 42572298  T
Q  503 ttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatga-ggtta 601  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || | |||    
T  42572299 ttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttatgaataaatgcatgtatgcatggttataataaagtacattgaatacatgaggatgttta 42572397  T
Q  602 ag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42572398 agttccacaatgttggagtcaagggtaacaacatcatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 42572479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 21857383 - 21858050
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  21857383 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacctcttgctcaagccggtcca 21857482  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    |  ||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||     
T  21857483 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgacgacatctggcccctttattgacggattgacctttta-tgg-agaggacac 21857580  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn-------gaaggacttatcaaagt 308  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |                   ||||||||||||||||     
T  21857581 aatgtaagacacggactagaaactatgaatacaaaatgatgcatgatatgcttatgaaaaaaaaaaaagataataatttttttgaaggacttatcaaagc 21857680  T
Q  309 gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaag 408  Q
    ||| ||||||||  |||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21857681 gaaatgtaaacacagtac--gaatatggtttcattttgaatattgtaaagacgtcgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaa 21857778  T
Q  409 agtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtct 508  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||| ||    
T  21857779 agtacaaaagctaaagctcagttaagattttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatgttt-acaaaaacttgact 21857876  T
Q  509 aagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-cca 607  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21857877 aagtccttcaatttt-tgatggaaaaagttgtttatgaatggatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccca 21857975  T
Q  608 caatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21857976 taatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtaccggtgtcacgggttct 21858050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16276245 - 16275554
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16276245 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 16276146  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    | |||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| |||||||||||  ||| || || | |    
T  16276145 tcttttgtgtttgctcgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacctttttatgg-ag-aagaca 16276048  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag-----------nnnnnnnnnnngaaggacttatcaa 305  Q
     | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                      ||||||||| | ||    
T  16276047 gtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagatttttttttttttttttttttgaaggacttgttaa 16275948  T
Q  306 agtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaaga-cgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagg 404  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||   || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275947 agtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttca-tttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagg 16275849  T
Q  405 aaagagt------acgaaagct-aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnn 497  Q
    ||  |||      ||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        
T  16275848 aagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaaga-ttttggaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-aca 16275751  T
Q  498 nnnncttgtctaagtccttc-------------aattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatag 584  Q
        ||||||||||||||||             || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  16275750 aaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaaaaaaaaaatttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtggatag 16275652  T
Q  585 aatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16275651 aatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 16275554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 206 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25494466 - 25493980
Alignment:
Q  206 gtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaat----agnnnnnnnnnnngaaggactt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||    |            |||||||||    
T  25494466 gtagaaacaaaatatgagatacagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcaaaaatgtacaaaacttttttttgaaggactt 25494367  T
Q  301 atcaaagt-gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaac 399  Q
     ||||||| || || ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25494366 gtcaaagttgatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggtccttttttcaaaaggtaagaacgaaac 25494268  T
Q  400 caaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 493  Q
    |||||||| |||     || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494267 caaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 25494168  T
Q  494 gnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatga 593  Q
    |       ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25494167 gcaaaaaacttgtcttagtccttcaa-tttttgatgaaaaaagatgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagtacatagaatacatgg 25494069  T
Q  594 tgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  25494068 tgagggcaagttccacaatgttggagctaagggtaacaacaccatctggtaaggactatggtttc-aagtgtacctgtatcacgggttct 25493980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 326 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 21112506 - 21112150
Alignment:
Q  326 gaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac-----gaaagct 420  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |     ||||||     
T  21112506 gaggaacatggttttattttgaaaattgtaaagatgtcgcaaacgattcctttttcaacaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaatgaaagcg 21112407  T
Q  421 aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt--ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttca 518  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||        ||||||||||||||| |    
T  21112406 aaagcttagttaagattttt-gaagttgtatctcttttggtgttcattcttacaaaatccatattcatgatgtttacaaaaaacttgtctaagtccttaa 21112308  T
Q  519 atttt--ttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttgg 616  Q
    |||||  | |||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21112307 attttaatggatggaaaaaaatatttatggatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatagaaaacatggtgaagttaagtccacaatgttgg 21112208  T
Q  617 agtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21112207 agtcaagggtaacaacgtcatttggtaaggactatggtttcata-tgtacctgtatcac 21112150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 3764018 - 3764418
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  3764018 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 3764116  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  3764117 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 3764215  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 577  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3764216 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 3764313  T
Q  578 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 676  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  3764314 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 3764412  T
Q  677 ggttct 682  Q
    ||||||    
T  3764413 ggttct 3764418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 3763728 - 3763991
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3763728 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 3763827  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  3763828 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 3763926  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3763927 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 3763991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 26730967 - 26731110
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  26730967 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 26731066  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26731067 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 26731110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 34541156 - 34541299
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  34541156 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 34541255  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34541256 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 34541299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 292 - 494
Target Start/End: Original strand, 30691456 - 30691664
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30691456 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 30691554  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttt-ttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 484  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30691555 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 30691654  T
Q  485 atgatgtttg 494  Q
    ||||||||||    
T  30691655 atgatgtttg 30691664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 547 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24701241 - 24701129
Alignment:
Q  547 atgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaag 645  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  24701241 atgaatgtatgtatgcatgcttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaag 24701142  T
Q  646 gactatggtttca 658  Q
    |||||||||||||    
T  24701141 gactatggtttca 24701129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 559 - 682
Target Start/End: Original strand, 40388514 - 40388637
Alignment:
Q  559 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 658  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40388514 atgcatgattatgctaaaatacagagaatacatggtgaggttaggtccacaatgttggagttaggggtaacaacaccatttggtaaggactatggtttcc 40388613  T
Q  659 aattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || ||||||| |||||| ||||||    
T  40388614 aaatgtacctatatcacgggttct 40388637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 547 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 24692402 - 24692290
Alignment:
Q  547 atgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaag 645  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  24692402 atgaatgtatgtatgcatctttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacaccatttgataag 24692303  T
Q  646 gactatggtttca 658  Q
    |||||||||||||    
T  24692302 gactatggtttca 24692290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 582 - 682
Target Start/End: Original strand, 21767056 - 21767154
Alignment:
Q  582 tagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttc 681  Q
    ||||| ||||| | ||||| | |||| || |||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21767056 tagaaaacatggtaaggttgaatccataaggttggagtcaagggta-caatgctatttggtaaggactatggttt-aaattgtacttgtatcacaggttc 21767153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24701366 - 24701289
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 493  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  24701366 aaagctaaagtctagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt 24701289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 538 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 42387029 - 42386963
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt 604  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  42387029 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacaaggtgagggtaagt 42386963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 24692526 - 24692449
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 493  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  24692526 aaagctaaagtctagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggtccatatctttgatgttt 24692449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24692707 - 24692661
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24692707 gaaattatgaatgcaaaatgatgcacgatatgcttatgcaaaaatag 24692661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 12377298 - 12377267
Alignment:
Q  541 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 572  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12377298 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 12377267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 555 - 618
Target Start/End: Original strand, 20278855 - 20278918
Alignment:
Q  555 atgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag 618  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20278855 atgtatgcatgattatgctacagaacatggaatgcatggtgagattaagtccataatgttggag 20278918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 24701547 - 24701501
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  24701547 gaaattatgaatgcaaaatgatgcacgatatgtttatgcaaaaatag 24701501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19990297 - 19990255
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  19990297 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatg--acgcttatgcaaaaat 19990255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 42386955 - 42386926
Alignment:
Q  627 aacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386955 aacaacgccatttggtaaggactatggttt 42386926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 20278671 - 20278734
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  20278671 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaactaaggaaa 20278734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 22942954 - 22942907
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  22942954 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 22942907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 39842868 - 39843531
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39842868 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 39842967  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39842968 tttttcctattttcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 39843067  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa-ttg 314  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||             ||||||||||||||||| || ||     
T  39843068 atatgagatacagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcaaaaatgtacaatttttttgaaggacttatcaaagttaatttt 39843167  T
Q  315 taaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg 414  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39843168 taaacatggtagagaaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg-ccctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtaca 39843265  T
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 514  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||       |||||||||||||    
T  39843266 aaaggtaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcactcgtacaaggtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagtcc 39843364  T
Q  515 ttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgt 613  Q
    ||||| ||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39843365 ttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgcatggttatactaaagtacattgaatacatgaggaggttaagttccacaatgt 39843463  T
Q  614 tggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39843464 tggagtcgagggtaacaacaccacttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 39843531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 17680211 - 17680876
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680211 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctgcacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 17680310  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680311 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 17680410  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaa--tagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa-t 312  Q
    |||||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||  ||             |||||||||||||||| || |    
T  17680411 atatgagatacaaactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcaaaaatgtacaattttttttttaaggacttatcaaagttaatt 17680510  T
Q  313 tgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagta 412  Q
    | ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680511 tttaaacatggtagagaaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg-tcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagta 17680608  T
Q  413 cgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagt 512  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||       |||||||||||    
T  17680609 caaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcactcgtacaaggtccatatccataatgtttgcaaaaaacttgtctaagt 17680707  T
Q  513 ccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaat 611  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17680708 ccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgcatggttatactaaagtacactgaatacatgaggaggttaagttccacaat 17680806  T
Q  612 gttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17680807 gttggagtcgagggtaacaacgccacttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 17680876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6666544 - 6665875
Alignment:
Q  18 ccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccat 117  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  6666544 ccatcaatgaagatactaggtcagttaacttttctacctcagcccaaagtgttgttacctctccacgcagctcatggacctcttgctcaagccgatccgt 6666445  T
Q  118 ttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaaa 216  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || ||| | | |||||| | || |||| ||||| |||||||||| |   | | |||| |||      
T  6666444 ttttcctgtctgcacgagtgtcttcatatgcgagccaaagttgaaagaagacatcggaccacttcactgacggattgacctctcttttggagaagacacg 6666345  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa-tagnnnnnnnnnnn-------gaaggacttatcaaagt 308  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||                  |||||| ||||||||||    
T  6666344 gtgtgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaaatagataattctttttttttttgaaggatttatcaaagt 6666245  T
Q  309 gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaag 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||     
T  6666244 gaaatgtaaacattgtagaggaaaatggtttcattttaaacattgtaaggatgttgcaaacgattccttttttcaaa---aagaacgaaaccaaggaaaa 6666148  T
Q  409 agt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnct 503  Q
    |||     || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||         |    
T  6666147 agttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaatttgcatctcttggtgttccttcttacaatgtccatatccgtgatgtttacaaaaat-t 6666050  T
Q  504 tgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag 603  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||    
T  6666049 cgtctaagtccttcaatttt--gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatggtgagatagag 6665952  T
Q  604 tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||    
T  6665951 tccac-atgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttccaa-tgtgcatgtatcacgggttct 6665875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 437 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6673777 - 6673537
Alignment:
Q  437 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatag 536  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||         | |||||||||||||||||||  |||||||| ||    
T  6673777 tttttgaatttgcatctcttggtgttccttcttacaatgtccatatccgtgatgtttacaaaaat-tcgtctaagtccttcaatttt--gatggaaaaag 6673681  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6673680 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatggtgagatagagtccac-atgttggagtcaagggtaacaacgcca 6673582  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||| ||||||    
T  6673581 tttggtaaggactatggtttccaa-tgtgcatgtatcacgggttct 6673537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16761871 - 16761728
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  16761871 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 16761772  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16761771 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 16761728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 19837686 - 19837545
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  19837686 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgcttatgttaaagtacatagaataaatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaggtaacaatgccattt 19837587  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19837586 ggtgaggactacggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 19837545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20736209 - 20735863
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||     
T  20736209 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 20736111  T
Q  437 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattt---tttgatggaa 532  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||  || |  ||||||||        ||| ||||||| |||| || |   |  ||   ||    
T  20736110 tttttgaagtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtctgtatctttgatgttt-acaaacacttatctaagtacttcgatattagtgagaaaaaa 20736012  T
Q  533 atagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaac 632  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||    
T  20736011 aaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggggaggttaagtccacaaagttggagccaagggtaacgac 20735913  T
Q  633 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20735912 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 20735863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20741043 - 20740901
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||    
T  20741043 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaatttggagccaagggtaacgatgccattt 20740944  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20740943 ggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 20740901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20744767 - 20744421
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||     
T  20744767 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 20744669  T
Q  437 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattt---tttgatggaa 532  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||  || |  ||||||||        ||| ||||||| |||| || |   |  ||   ||    
T  20744668 tttttgaagtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtctgtatctttgatgttt-acaaacacttatctaagtacttcgatattagtgagaaaaaa 20744570  T
Q  533 atagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaac 632  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |     
T  20744569 aaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaatttggagccaagggtaacgat 20744471  T
Q  633 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20744470 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 20744421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 503 - 663
Target Start/End: Original strand, 22104942 - 22105104
Alignment:
Q  503 ttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcta-aagtacatagaatacatgatgagg-tt 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||   ||| ||||| || || ||    
T  22104942 ttgtctaagtccttcaattttttgatggaaagagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctacacaaacggtgaaaacatggtggggttt 22105041  T
Q  601 aagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105042 aagtccataaagttggagttaagggtaaaaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 22105104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 546 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 32002040 - 32001904
Alignment:
Q  546 aatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaa 644  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||     
T  32002040 aatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaacgcatggtgaggttaagcccacaaagttggagcttaagggtaacaacgccatttggtag 32001941  T
Q  645 ggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32001940 ggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 32001904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 543 - 682
Target Start/End: Original strand, 22160921 - 22161060
Alignment:
Q  543 atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttgg 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  22160921 atgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttgg 22161020  T
Q  642 taaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || | |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22161021 taggtactacggtttcaaa-tgtacatgtatcacgggttct 22161060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 559 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 23917644 - 23917521
Alignment:
Q  559 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 657  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23917644 atgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggggaagttaagttccataatgttggagtcaattgtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 23917545  T
Q  658 aaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  23917544 aaa-tgtacctgtatcacgggttct 23917521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 296 - 675
Target Start/End: Original strand, 24709061 - 24709436
Alignment:
Q  296 gacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacg 395  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || | || ||| ||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||   |||||||    
T  24709061 gacttttcaaagtaaattgtagacattgcagaggaacatggttttaatt-gaaaattgtaaagatattgcaatcggttcccttttcaaaaaacaagaacg 24709159  T
Q  396 aaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 490  Q
    || ||||||||  | |     || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    |||||    
T  24709160 aagccaaggaagaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggcccatatatgtgatg 24709258  T
Q  491 ttt--gnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 588  Q
    |||          |||| ||||||||||||| | || |||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     | ||||    
T  24709259 tttacaacaaaaacttgactaagtccttcaa-tattggatggaaa-aattatttatgaatgagtgcatgtatgcatgattatgctaaag-----aaaata 24709351  T
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
      || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||| | | ||||| |||||| ||||||| | |||||||| |||||    
T  24709352 ggtg-tgaggttaagtccataatgttggagtaaagggaaaacacgtcgtatggtagggactacggtttcaca-tgtacctgaatcac 24709436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 584 - 682
Target Start/End: Original strand, 25857102 - 25857200
Alignment:
Q  584 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25857102 gaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 25857200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 481
Target Start/End: Original strand, 22160721 - 22160856
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  22160721 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcataacaaaagctaaagcttagttaag-gt 22160818  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||    
T  22160819 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccata 22160856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20741251 - 20741148
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||    
T  20741251 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttctaaacaaaagctaaagcttagttaagat 20741152  T
Q  437 tttt 440  Q
    ||||    
T  20741151 tttt 20741148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 32002348 - 32002307
Alignment:
Q  239 tatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32002348 tatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 32002307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 25856759 - 25856805
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25856759 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 25856805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 345 - 407
Target Start/End: Original strand, 25856869 - 25856930
Alignment:
Q  345 tgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25856869 tgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 25856930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 65)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 41001098 - 41000421
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41001098 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 41000999  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  41000998 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaag 41000899  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag---nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagt 308  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              |||||||||||||||||    
T  41000898 caaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagt 41000799  T
Q  309 gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaag 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41000798 gaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttca-tttgaaaattgtaaagatattggaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaa 41000701  T
Q  409 agt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttt-tgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnc 502  Q
    | |     || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |    
T  41000700 acttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttatgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaac 41000602  T
Q  503 ttgtctaagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggtta 601  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41000601 ttgcctaagtccttcaa-tttttgatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggtta 41000503  T
Q  602 ag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41000502 agctccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtattacgggttct 41000421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 41009880 - 41009203
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41009880 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 41009781  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  41009780 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaag 41009681  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag---nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagt 308  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              |||||||||||||||||    
T  41009680 caaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagt 41009581  T
Q  309 gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaag 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||| ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  41009580 gaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttca-tttgaaaattgtaaagatattggaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaa 41009483  T
Q  409 agt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttt-tgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnc 502  Q
    | |     || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |    
T  41009482 acttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttatgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaac 41009384  T
Q  503 ttgtctaagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggtta 601  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41009383 ttgcctaagtccttcaa-tttttgatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggtta 41009285  T
Q  602 ag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  41009284 agctccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtattacgggttct 41009203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Original strand, 8202817 - 8203499
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8202817 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccaaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaaatcga 8202916  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  8202917 tccattttttgtgtttgcacgagtgactgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatcgaaccactttactgacgtattgaccttttgctgatggaaa 8203016  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaat------agnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaa 306  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                   |||||| ||| ||||    
T  8203017 caaaatatgagacacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatgtacaattttttttttatcgaaggatttaccaaa 8203116  T
Q  307 gtgaa-ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga 405  Q
     | || || |||||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||||||  ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8203117 cttaatttataaacattttaaaggaacatggattcatttt-aaaattgtaaagatattgcaataggttcttttttcaaaaggtaagaatgaaaccaagga 8203215  T
Q  406 aagagt------acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttg-nnnn 498  Q
    || |||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||         
T  8203216 aaaagttcttaatcaaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttgatgttcattcttacacggtccatatccataatgtttgcaaaa 8203315  T
Q  499 nnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgagg 598  Q
       ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8203316 aaacttgtgtaagtccttcaa-tttttgatggagaaagttgtttgtgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagtacatagagtacatggtgagg 8203414  T
Q  599 ttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8203415 ttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgtcatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 8203499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25266342 - 25265673
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25266342 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 25266243  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |||     
T  25266242 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacctttttatgg-agaagacac 25266144  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgt 315  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||||| | |||||||| |||    
T  25266143 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag---atttttttgaaggacttgttaaagtgaaatgt 25266047  T
Q  316 aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaaga-cgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt--- 411  Q
    |||||| | ||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||   || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||       
T  25266046 aaacatggcagaggaatatggtttca-tttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttct 25265948  T
Q  412 ---acgaaagct-aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtc 507  Q
       ||  ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||    
T  25265947 ttaacataagctaaaagcttagttaa-aattttggaagttgtatttcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtc 25265850  T
Q  508 taagtccttcaatttt---ttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag- 603  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||||     
T  25265849 taagtccttcaattttttatttatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct-aagtggatagaatacatggtgagggtaagt 25265751  T
Q  604 tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25265750 tccacaatgttggagtcaatggtaacaacgtcatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 25265673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 17928609 - 17928027
Alignment:
Q  29 gatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctattt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||  | |||    
T  17928609 gatacaaggctagttaacttctctacctcaacccgaagtgttattacctctccacgaagttcctggacttcttgctcaagttgatccatcttttgtgttt 17928510  T
Q  129 gcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacg 228  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  17928509 acacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatcgaaccactttactgacggattgaccttttgtaggtagaaacaaaatatgagacatg 17928410  T
Q  229 taccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa-tagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtag 326  Q
     || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |            ||||||||||||||||      |||||||| | ||    
T  17928409 gactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaaggaatttttttttttgaaggacttatcaaag------gtaaacatggcag 17928316  T
Q  327 aggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagg--aaagagt-----acgaaagc 419  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||   ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||     ||||||||    
T  17928315 aggaacatggtttca-tttgaaaattgtaaagatattgcaatatgtttccttttcacaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaaaagtacttaacgaaagc 17928217  T
Q  420 taaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa 519  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||| ||||||||    
T  17928216 gaaagcttaattaaga-tttttgaagttctatctcttggtgttcattcttacaaggtccataaccgtgatgtttgcaaaaaatttgtctaaatccttcaa 17928118  T
Q  520 ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaat 611  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17928117 -gttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtattcctagttatgttaaagtacatagaatacatgatgaggttaagttcacaat 17928027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 656
Target Start/End: Original strand, 10719996 - 10720658
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10719996 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 10720095  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  10720096 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 10720194  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag-----------nnnnnnnnnnngaaggacttatca 304  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                      ||||||||| | |    
T  10720195 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagatttttttttttttttttttttgaaggacttgtta 10720294  T
Q  305 aagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaaga-cgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaag 403  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||   || |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720295 aagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttca-tttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaag 10720393  T
Q  404 gaaagagt------acgaaagct-aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnn 496  Q
    |||  |||      ||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       
T  10720394 gaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaaga-ttttggaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-ac 10720491  T
Q  497 nnnnncttgtctaagtccttc-------aattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatac 589  Q
         ||||||||||||||||       ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  10720492 aaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaaattttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtggatagaatac 10720590  T
Q  590 atgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720591 atggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 10720658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 9552601 - 9552993
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  9552601 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatagtttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaataggttc-tttttcaaaagttaag 9552698  T
Q  392 aacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccca 485  Q
    ||| |||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||      
T  9552699 aactaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatatttttgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaagttccatacctt 9552798  T
Q  486 tgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacataga 585  Q
    ||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9552799 tgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagttttttatgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacataga 9552896  T
Q  586 atacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| || |||||||    
T  9552897 atatatggtgaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaatgtacttgtaacaaaggttct 9552993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 381 - 684
Target Start/End: Original strand, 15682786 - 15683093
Alignment:
Q  381 caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaag 474  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||     || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15682786 caaaaggtaagatcaaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcatccttacaag 15682885  T
Q  475 gtccatacccatgatgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct 573  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15682886 gtccatacccatgatgtttgcaaaaaaacttgtgtaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagtagtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct 15682984  T
Q  574 aaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatc 673  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15682985 aaagtacatagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatc 15683082  T
Q  674 acaggttctgc 684  Q
    || ||||||||    
T  15683083 acgggttctgc 15683093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 14420777 - 14420436
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||     || ||||||||||||||||||||||    
T  14420777 tttgaaaattgtgaagatgttgctattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 14420678  T
Q  437 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatag 536  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||        |||||  || ||||||||||||| |||||||| ||    
T  14420677 tttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtacaaatccttcaattttt-gatggaaaaag 14420581  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14420580 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtgatgctaaagtacatagaatacatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaggtaacaacgcca 14420481  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14420480 tttggtaatgactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 14420436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 674
Target Start/End: Original strand, 3242630 - 3243272
Alignment:
Q  27 aagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctat 126  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||    
T  3242630 aagatactagtttagttaacttctctaactcggcccgaagtgttgtcacctcttcgcgaagctcgtggacctcttgttcaagctgatccattttttgtat 3242729  T
Q  127 ttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagaca 226  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  |||||   || |||||||||||||||| |||||||  | | | | ||| | | |||||||    
T  3242730 ttgcacgagagtttgcatgtgcgagccgaatttggatgaggacatcagaccactttactgatggattaacctttt-attgaaaagacacagtgtgagaca 3242828  T
Q  227 cgtaccagaaactatgaatg-caaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag-nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgt 324  Q
    || || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||||||| |            ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||     
T  3242829 cggactagaaactatgaatgaaaaaacgatgcatgatatgtttatgcaaaaatggacaattttttttgaagggcttgttaaagttaattgtaaacattgc 3242928  T
Q  325 agaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagc 419  Q
    | |||||||||| || | |||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||  |||     || |||||    
T  3242929 ataggaacatggtttta-tttgaaaattgtaaagatattgcaatcggttccattttcaaaa-gcaagaaagaagccaaggaagaagttcttaacaaaagc 3243026  T
Q  420 taaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa 519  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||        |||||||||||||||| |    
T  3243027 aaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggttcatacctttgatgtttacaaaaaacttgtctaagtccttcga 3243125  T
Q  520 ttttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatg--atgaggttaagtccacaatgttgg 616  Q
      | |||||| |||| |||| ||||| |        || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||   ||| |||| ||| | |||| |||    
T  3243126 --tattgatgagaaaaagttatttatca--------atctatgcatgattatgctaaagaacatagaaaacatggtgtgaagttaggtctataatgatgg 3243215  T
Q  617 agtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    ||||||||| ||  ||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3243216 agtcaagggtaaacacgccacatggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatca 3243272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 15682448 - 15682694
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  15682448 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacttcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacctcttgctcaagccggtcca 15682547  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| ||||||||  ||| |||| |||     
T  15682548 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatgtgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatggatggacctttttatgg-agaagacac 15682646  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 263  Q
    | | ||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15682647 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 15682694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 351 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 8608652 - 8608327
Alignment:
Q  351 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8608652 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 8608554  T
Q  445 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttta 543  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||         || |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| ||||    
T  8608553 gttgtatttcttggtgttccttcttacaaggacaatatctttgatgtttacaagaat-ttatctaagtccttcgatattagtgaggaaaaaagtt-ttta 8608456  T
Q  544 tgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggt 642  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  8608455 tgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgagattaagtccataatgttggagcttaagggtaacaacgccaattggt 8608356  T
Q  643 aaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8608355 aaggactatggtttcaaa-tgtacctgtat 8608327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15697936 - 15697794
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15697936 tttatgcatgaatgcatgtatggatgattatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccatt 15697837  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||    
T  15697836 tggtaaggactatggttt-aaaatatacctgtatcacgggttct 15697794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 12557336 - 12557195
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  12557336 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccccaatgttggagccaagggtaacaatgccattt 12557237  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  12557236 ggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctttatcactggttct 12557195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 350 - 682
Target Start/End: Original strand, 30093459 - 30093798
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagattttttga 443  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |      |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30093459 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcttaagaaaagctaaagcttagttaagattttt-ga 30093556  T
Q  444 agtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtt 541  Q
    |||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| ||||||||||||||| ||  ||| | ||| |||| ||    
T  30093557 agtttggatttcttggtgttctttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcaatattagtga-gaaaaaagttttt 30093654  T
Q  542 t---atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccat 637  Q
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  30093655 atcaatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccat 30093754  T
Q  638 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  30093755 ttggtagggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 30093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 362 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 11183903 - 11183583
Alignment:
Q  362 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt 456  Q
    ||||||| |||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  11183903 ttgcaaatggttacctcttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttctt 11183806  T
Q  457 ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgca 555  Q
     |||||| ||||| ||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| || |||| |||||||||||||    
T  11183805 agtgttccttcttgcaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga--gaaaaaggtgtt-atgaatgaatgca 11183710  T
Q  556 tgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggt 654  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| | ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11183709 tgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgagattaagtccataatgttggagcttaaggataacaatgccatttggtagggactatggt 11183610  T
Q  655 ttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11183609 ttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 11183583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 344 - 682
Target Start/End: Original strand, 14885413 - 14885754
Alignment:
Q  344 ttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattt 438  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||     || |||| |||| ||||||||||||||    
T  14885413 ttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcctttt-caaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagataaa-cttagttaagattt 14885510  T
Q  439 tttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt 537  Q
    || ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| |      
T  14885511 tt-gaaattgcatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgtttacaagaaccttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaaag 14885609  T
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcca 636  Q
    | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  14885610 tttttatgaatgaaagaatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtaatgttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgcca 14885709  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  14885710 tttggtaaggactatggttt-aatttgcacttgtatcacgggttct 14885754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 540 - 663
Target Start/End: Original strand, 14890876 - 14891000
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  14890876 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacatcgccatt 14890975  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14890976 tggtaaggactatggtttcaaattg 14891000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 18881266 - 18881408
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18881266 tttatggatggatgcatgtgtgtatgattatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatt 18881365  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18881366 tggtaaggactatgg-ttcaaaatgtacctgcatcacgggttct 18881408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 672
Target Start/End: Original strand, 12477128 - 12477456
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac----gaaagctaaagcttagttaagattt 438  Q
    |||||| ||||| |||| | |||||  |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  12477128 tttgaaaattgtgaagatgctgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgagaccaaggaaaaagttcttaagaaagctaaagcttagttaagattt 12477226  T
Q  439 tttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt 537  Q
    |  |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||    
T  12477227 t--gaagttttattttttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagt 12477322  T
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgcca 636  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||| |||||    
T  12477323 t-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatgaaatgcatggtgaggttaagtccaaaatgttggaggcaaagggtaacaccgcca 12477421  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  12477422 tttggtaaggactatcgcttc-atttgtacctgtat 12477456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 70729 - 70314
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaaca 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||           ||||||||| ||||||| | |||||||| |  || |||||||    
T  70729 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttgaaggacttgtcaaagtca-ttgtaaacttgata-aggaaca 70632  T
Q  334 tggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagctta 428  Q
    | | || |||| ||| ||||| || | |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||     
T  70631 ttgttttattt-gaaaattgtgaaaatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa-agttcttaacaaaagctaaagcttg 70535  T
Q  429 gttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tga 527  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||| |||    
T  70534 gttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatatttgtga 70437  T
Q  528 tggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggc 626  Q
     | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||            |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  70436 -gaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatg------------gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggt 70351  T
Q  627 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70350 aacatcgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 70314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 538 - 682
Target Start/End: Original strand, 7095802 - 7095946
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7095802 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaattacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 7095901  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||||    
T  7095902 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgcatcacgggttct 7095946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 15623041 - 15622593
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn---gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagagga 330  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || ||||    
T  15623041 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-agga 15622944  T
Q  331 acatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagc 425  Q
    |||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||    
T  15622943 acattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa-agttcttaacaaaagctaaagc 15622847  T
Q  426 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt- 524  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||      
T  15622846 ttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccctatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattag 15622749  T
Q  525 tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaa 622  Q
    |||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | |   ||| || || ||| |||| ||||||||||| |||| | ||    
T  15622748 tga--gaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctacacaaacggtgaaaacgtggtgatgttaggtccacaatgtcggagcttaa 15622652  T
Q  623 gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15622651 gggtaacaacgccatttggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 15622593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Original strand, 23285736 - 23286071
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | |     || ||||||||| |||||||||| ||    
T  23285736 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaaaattctttacaaaagctaaaacttagttaaggtt 23285834  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 536  Q
    ||| |||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| ||    
T  23285835 ttt-gaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaag 23285926  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 635  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  23285927 tt-tttacgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtaaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgcc 23286025  T
Q  636 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  23286026 atttggtaaggactatggttt-aatttgcacttgtatcacgggttct 23286071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27881810 - 27881584
Alignment:
Q  52 tacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgag 151  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  ||||| |||||  |||| || |||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  27881810 tacctcagcccgaagtgttgttgcctctctacgaagctcaaggaattcttgttcaagctgatcaatcttttgtgtttgtacgagtgtctgcatatgcgag 27881711  T
Q  152 ccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaa 251  Q
    ||||||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||  ||||||  |  ||||||| | ||||||| ||| || ||||||||||||||| | |    
T  27881710 ccgaacttggatgaagacatcagaccactttactgacggattggacttttgtagacagaaacagagtatgagatacggactagaaactatgaatgc-aca 27881612  T
Q  252 tgatgcatgataggcttatgcaaaaata 279  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  27881611 tgatgcatgaaatgcttatgtaaaaata 27881584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 415 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 8806741 - 8806485
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 514  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||    
T  8806741 aaagcaaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttgatgttccttcttacaaagaccatatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtcc 8806644  T
Q  515 ttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgt 613  Q
    ||| || ||  |||  |||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| ||||     
T  8806643 ttcgatattagtgagagaaaaaagtttttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatga 8806544  T
Q  614 tggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  8806543 tggagcttaaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 8806485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 508 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 15912220 - 15912056
Alignment:
Q  508 taagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatg--aggttaagt 604  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  15912220 taagtccttcgatattttgatgagaaaaagtt--ttatgaatgaatg-atgtatgcatgattatgctaaaaaacatagaaaacatggtgtgaggttaagt 15912124  T
Q  605 ccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15912123 ccacaatgttggagcttaagggtaataacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 15912056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 540 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 21610065 - 21609933
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||| ||||| | || || ||||||||||||    
T  21610065 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatgatggagcttaaaggtaacaacgccatt 21609966  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21609965 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 21609933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 18960552 - 18960683
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||         ||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||    
T  18960552 tttatgaatggatgcatgcatgcatgattatgctaaaatacata---------atgaggttaagtccaca-tgttggagttaaaggtaacaacgccattt 18960641  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18960642 ggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 18960683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 82
Target Start/End: Original strand, 9552489 - 9552558
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctcca 82  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9552489 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagtccgaagtgttgttacctctcca 9552558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 559 - 682
Target Start/End: Original strand, 13109591 - 13109714
Alignment:
Q  559 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 657  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  13109591 atgcatgattatgctaaggaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatttggtagggactatggtttt 13109690  T
Q  658 aaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  13109691 aaa-tgtacctgtatcacgggttct 13109714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 15599553 - 15599688
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |      | ||||||||||||||| ||  ||| |||||    
T  15599553 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttta------agtgttggagtcaagggtaaagacgtcattt 15599646  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15599647 ggtaaggactacggtttcaga-tgtacctgtatcacgggttct 15599688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 6196889 - 6196558
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  6196889 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 6196791  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-- 535  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || |  ||||||||        ||| |||||||||||| || |||||||| ||| |      
T  6196790 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccgtatctttgatgttt-acgaaaacttatctaagtccttcgatattttgatgaaaaaaaa 6196693  T
Q  536 ------gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaac 629  Q
          ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||                 ||| |||||||| ||||||||||||||||   || | |||    
T  6196692 aaaaaagttttttatggatgaatgcatgtatgcatgatcatgc-----------------atggtgaggttaggtccacaatgttggagcttagagtaac 6196610  T
Q  630 aacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  6196609 aatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 6196558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8618708 - 8618616
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  8618708 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 8618616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 15535066 - 15535158
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15535066 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 15535158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 46398513 - 46398605
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  46398513 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 46398605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 3679759 - 3679627
Alignment:
Q  39 tagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctc-aagtcgatccatttttcctatttgcacgagtg 137  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3679759 tagttaacttctctaccccggcccgaagtacagttacttcttcacgaagctcgtggacctctt-ctctaagtcgatccattttttgtgtttgcacgagtg 3679661  T
Q  138 tctgcatatgcgagccgaacttggatggagacat 171  Q
    | ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||    
T  3679660 tttgcatgtgtgagctgaagttgaatgaagacat 3679627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30016329 - 30016197
Alignment:
Q  39 tagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctc-aagtcgatccatttttcctatttgcacgagtg 137  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  30016329 tagttaacttctctacctcggcccgaagtacagttacttcttcacgaagctcatggacctctt-ctctaagtcgatccattttttgtgtttgcacgagtg 30016231  T
Q  138 tctgcatatgcgagccgaacttggatggagacat 171  Q
    | ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||    
T  30016230 tttgcatgtgtgagctgaagttgaatgaagacat 30016197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 609 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 17920016 - 17919962
Alignment:
Q  609 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17920016 aatgttggagtcaagggtaacaacaccatttggtaaggactaaggtttcaaattg 17919962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 582 - 682
Target Start/End: Original strand, 6970197 - 6970295
Alignment:
Q  582 tagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttc 681  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||| || |||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6970197 tagaaaacatggtgaggttgaatccataaggttggagtcaagggta-caatgttatttggtaaggactatggttt-aaattgtacttgtatcacaggttc 6970294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 33568341 - 33568206
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  33568341 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 33568244  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    |||||||||||||      ||||||| |||||||||||||||||    
T  33568243 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccata 33568206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21610250 - 21610113
Alignment:
Q  361 gttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga--gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatct 453  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||     || |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| |    
T  21610250 gttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggttttt-gagtttgtattt 21610153  T
Q  454 cttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 493  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  21610152 cttggtgttccttcttacaagatccatatctttgatgttt 21610113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 27881564 - 27881251
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacat-tgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    |||||| || |||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||| ||  |||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  27881564 gaaggatttgtcaaagcgaatagtaagcatcgtagatgaacatggtttcattt-gaaaatctgtaaggatattgcgatcggttctattttcaaaaggtaa 27881466  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat-tttttgaagttgtatctctt--ggtgttcattcttacaaggtccatac 482  Q
    ||| |||||||| | |  |||     || ||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| || |    
T  27881465 gaatgaaaccaatggagaagttctcaacaaaagcaaaagcttggtcaagatgtttttgaagttatatgtcttttggtgttcattcttacaaggtctattc 27881366  T
Q  483 ccatgatgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtaca 581  Q
    |  ||||||||         |||| |||||||||||||| ||| |||||||| |  | || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||   |    
T  27881365 ctttgatgtttacaaaaaaacttggctaagtccttcaatattt-gatggaaaaaaatattcatgattgaatgcatgtgtgcatgattatgctaaag---a 27881270  T
Q  582 tagaatacatgatgaggtt 600  Q
    ||||| | |||||||||||    
T  27881269 tagaaaatatgatgaggtt 27881251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 30014309 - 30014230
Alignment:
Q  603 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  30014309 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgccatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 30014230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 41433968 - 41433823
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggtt--aagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaac 632  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| |||||||  | |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||    
T  41433968 tttatggatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaatggtgaaaacatggtgaggttttaggtccacaatgatggagtcaaagggtaaacac 41433872  T
Q  633 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    | |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  41433871 gtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 41433823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 12477020 - 12477066
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12477020 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 12477066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 14885303 - 14885349
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14885303 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 14885349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 603 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3677738 - 3677659
Alignment:
Q  603 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  3677738 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 3677659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 4436547 - 4436511
Alignment:
Q  627 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4436547 aacaacgccatttggtaaggactaaggtttcaaattg 4436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 603 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20436739 - 20436660
Alignment:
Q  603 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  20436739 gtccacaatgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 20436660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Original strand, 26384076 - 26384192
Alignment:
Q  86 agctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttact 185  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||  |||| |||| |  ||| |||  || |||||||| || ||||||||    
T  26384076 agcttgtggacctcttgttcaagttgatccattctttgtgtttgcacgagtgttcgcatgtgcgggttgaatttgagtgaagacattggaccactttact 26384175  T
Q  186 gatggattgaccttttg 202  Q
     ||||||||||| ||||    
T  26384176 aatggattgaccctttg 26384192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 46373849 - 46373802
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  46373849 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 46373802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 438 - 493
Target Start/End: Original strand, 14396298 - 14396353
Alignment:
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 493  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  14396298 ttttgaagttgtatttctcggtgttcctttttacaaggtccatacctctgatgttt 14396353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 610 - 656
Target Start/End: Original strand, 24215391 - 24215438
Alignment:
Q  610 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24215391 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttt 24215438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8806932 - 8806886
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  8806932 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgtcatgcttatgcaaaaatag 8806886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8618929 - 8618870
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 411  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  8618929 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagt 8618870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14420888 - 14420843
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 279  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14420888 gaaattatgaatgaaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 14420843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20438521 - 20438484
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20438521 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 20438484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Original strand, 23285626 - 23285671
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 279  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23285626 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 23285671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41435686 - 41435649
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41435686 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 41435649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 663
Target Start/End: Original strand, 5143701 - 5143737
Alignment:
Q  627 aacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5143701 aacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 5143737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 5957518 - 5957565
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||    
T  5957518 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtattacgggttct 5957565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 656
Target Start/End: Original strand, 11932154 - 11932221
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11932154 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaataacgccatttggtaaggactaaggttt 11932221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 540 - 572
Target Start/End: Original strand, 26384530 - 26384562
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 572  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26384530 tttatgaatgtatgcatgtatgcatggttatgc 26384562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 407
Target Start/End: Original strand, 46398287 - 46398341
Alignment:
Q  351 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46398287 ttgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 46398341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31542758 - 31542081
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542758 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttcactacctcatcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 31542659  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||  |||||||     
T  31542658 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattggaccactttattgatggattgaccttttgtaggtagaag 31542559  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag---nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagt 308  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              |||||||||||||||||    
T  31542558 caaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagt 31542459  T
Q  309 gaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaag 408  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31542458 gaattgtaaacattgtcgaggaacatagtttca-tttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaa 31542361  T
Q  409 agt-----acgaaagctaaagcttagttaaga-ttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnc 502  Q
    | |     || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        |    
T  31542360 acttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaac 31542262  T
Q  503 ttgtctaagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggtta 601  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31542261 ttgcctaagtccttcaa-tttttgatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggtta 31542163  T
Q  602 ag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31542162 agctccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtattacaggttct 31542081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 2387963 - 2387295
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2387963 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctaccttggcccgaagcgttgttacctctccacgaagcgcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 2387864  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| ||  |||| |||     
T  2387863 tttttcctgtttgcatgagtgtctgtatatgcgagccgaacttggataaagacatcgaaccactttactgacggattaaccttttgatg--agaagacac 2387766  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn-----gaaggacttatcaaagtga 310  Q
    ||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                 |||||||||||| |||| |    
T  2387765 aaggtaagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatatataaatttttatttttgaaggacttatcgaagtta 2387666  T
Q  311 attg-taaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga 409  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2387665 atttctaaacattgtagaggaacatggtttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaagctaagaacgaaaccaaggaaaga 2387566  T
Q  410 gtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtcta 509  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||| ||    
T  2387565 gtacaaaagcttaagcttagttaagat-ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgtttacaaaaaacttgttta 2387467  T
Q  510 agtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccac 608  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  2387466 agctcttcaa-tttttgatggaaaaatttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccac 2387368  T
Q  609 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  2387367 aatgttggagccaagggtaacaacgtcatttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 2387295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 13471530 - 13470882
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13471530 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccaaagtgttgttaaatctcaacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 13471431  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||| | ||||||| ||| |    |||| |||     
T  13471430 tcttttgtgtttgcacgagtgtctacatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgaccacttgactgacgaattgaccatttacaa--agaagacac 13471333  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnng----aaggacttatcaaagtgaa 311  Q
      | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                |||||||| ||||||||||    
T  13471332 ggtgtgagacactgactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacatttttttttttttaaggacttgtcaaagtgaa 13471233  T
Q  312 ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagag 410  Q
     ||||||||| | || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  13471232 atgtaaacatggcagcggaacatggtttcattt-gaaaattgtaaagatattgacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaag 13471134  T
Q  411 t------acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnctt 504  Q
    |      ||  ||| |||||||||| |       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        |||    
T  13471133 ttctttaacagaagttaaagcttagat-------tttgcagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgtttacaaaaaactt 13471041  T
Q  505 gtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag- 603  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
T  13471040 gtctaagtccttcaatttttt-atggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttagaccaaagtacatagaatatatggtgagggtacgt 13470942  T
Q  604 tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13470941 tccacaatgttggagtcaaggataacaacgccatttggtaaggactaaggtttcaaattg 13470882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 381 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31554592 - 31554281
Alignment:
Q  381 caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaag 474  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||     || |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31554592 caaaaggtaagatcaaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaag 31554493  T
Q  475 gtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtt 568  Q
    ||||||| || ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31554492 gtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaattttttttgatggaaaaggtagtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtt 31554394  T
Q  569 atgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacc 667  Q
    ||||||| ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31554393 atgctaa-gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacc 31554296  T
Q  668 tgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||| ||||||    
T  31554295 tgtatcacgggttct 31554281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 31554938 - 31554693
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31554938 gccatcaatgaagatacaaggctagttaaattctctacctcagccctaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 31554839  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |||     
T  31554838 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacctttttatgg-agaagacac 31554740  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgat 262  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31554739 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgat 31554693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 13453098 - 13452956
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13453098 tttatggatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatt 13452999  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13452998 tggtaaggactaaggtttcaaa-tgtacctgcatcacaggttct 13452956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 343 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 22430404 - 22430075
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtac----gaaagctaaagcttagttaagattt 438  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  22430404 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagc-aagaacgaaatcaaggaaaaagttcttaagaaagctaaagcttagttaagattt 22430306  T
Q  439 tttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt 537  Q
    |  |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| |||    
T  22430305 t--gaagttgtatattttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaataacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaagt 22430209  T
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcca 636  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |     
T  22430208 t-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaaaatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgtcc 22430110  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22430109 tttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 22430075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 292 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 1958356 - 1957985
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 391  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| | |||||||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  1958356 gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgaaaaggaacattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taag 1958261  T
Q  392 aacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 484  Q
    |||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  1958260 aacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagtttggatttcttggtgttctttcttacaaggtccgtatct 1958162  T
Q  485 atgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 583  Q
     ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  1958161 ttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaat-gtt--ttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatg 1958066  T
Q  584 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1958065 gaatgtatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagagtaacagcgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 1957985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 415 - 684
Target Start/End: Original strand, 14817945 - 14818202
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| ||||| |||    
T  14817945 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatttcttggtgtttcttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaaatcc 14818043  T
Q  515 ttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgtt 614  Q
    ||| || ||  | || ||| |||| ||||||||||||||||||         ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  14818044 ttcgatatt--ggtgaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatga--------ttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaaagtt 14818132  T
Q  615 ggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttctgc 684  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||    
T  14818133 ggagccaagggtaacgacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaagggttctgc 14818202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 675
Target Start/End: Original strand, 2341525 - 2341610
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2341525 catggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcac 2341610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 567 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19371081 - 19370984
Alignment:
Q  567 ttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19371081 ttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 19370984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 370 - 682
Target Start/End: Original strand, 6202787 - 6203100
Alignment:
Q  370 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttca 464  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  6202787 ggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttatgattttt-gaagttgtatttcttggtgttcc 6202884  T
Q  465 ttcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgca 563  Q
    |||||| |||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||| ||| || ||  |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6202885 ttcttataaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtcattcgatattagtga--gaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgca 6202980  T
Q  564 tggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 661  Q
    || |||||||| |  | |   ||| ||| | ||| |||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  6202981 tgattatgctacacaaacggtgaaaacacggtgatgttaggtccacaatgtcggagcttaagggtaacaacgccatttggtcgggactatggtttcaaa- 6203079  T
Q  662 tgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  6203080 tgtacctgtatcacgggttct 6203100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 362 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 19371260 - 19371138
Alignment:
Q  362 ttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctctt 456  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||     || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19371260 ttgcaaacggttccttcttcaaa-gataagaacgaaatcaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttctt 19371163  T
Q  457 ggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||    
T  19371162 ggtgttccttcttacaaggaccata 19371138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 35072165 - 35071822
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag--nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              |||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||    
T  35072165 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacttttttttttaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaa 35072068  T
Q  332 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagct 426  Q
    ||| | || | |||||| ||||  |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |     || ||||||||| ||    
T  35072067 cattgtttta-tttgaaaattgagaagatgttgcaattggttcccttttcaaaa-gtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaaact 35071970  T
Q  427 tagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat-ttttt 525  Q
    ||||||||  ||||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |    
T  35071969 tagttaag-gtttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagt 35071878  T
Q  526 gatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacat 582  Q
    ||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35071877 gagaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacat 35071822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 27168373 - 27168225
Alignment:
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggttaa--gtccacaatgttggagtcaagggcaa 628  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| ||||||| |  | ||| || | |||||||||||| |     
T  27168373 agttatttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaacggtgaaaacatggtgaggtttaaggcccataacgatggagtcaagggtat 27168277  T
Q  629 caacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  27168276 -aacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 27168225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 6202651 - 6202697
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6202651 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 6202697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Original strand, 2341361 - 2341427
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2341361 aaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagtttggatttcttggtgttctttcttacaaggaccata 2341427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 14817763 - 14817809
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14817763 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 14817809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 22473543 - 22473489
Alignment:
Q  610 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22473543 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 22473489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 5635719 - 5635766
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  5635719 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 5635766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22430512 - 22430466
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22430512 gaaattatgaatacaaaatgatgcatggtatgcttatgcaaaaatag 22430466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19371374 - 19371337
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19371374 aatgcaaaatggtgcatgatatgcttatgcaaaaatag 19371337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Original strand, 24962560 - 24963236
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24962560 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 24962659  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||     
T  24962660 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattggaccactttactgatggattgaccttttgtaggtagaag 24962759  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag--nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtg 309  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||||||||||||||    
T  24962760 caaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtg 24962859  T
Q  310 aattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga 409  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24962860 aattgtaaacattgtcgaggaacatagtttca-tttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaa 24962957  T
Q  410 gt-----acgaaagctaaagcttagttaaga-ttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnnct 503  Q
     |     || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||        ||    
T  24962958 cttcttaacaaaagctaaggcttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaaaact 24963056  T
Q  504 tgtctaagtccttcaattttttgatg-gaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaa 602  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24963057 tgcctaagtccttcaa-tttttgatgaaaaaaagttgtttacgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtaaggttaa 24963155  T
Q  603 g-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    | | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24963156 gtttcacgatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtattacgggttct 24963236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Original strand, 21993638 - 21994291
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  21993638 gccatcaatgaagatacaaggctagttaatttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagatcctggacttcttgctcaagccgatcca 21993737  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||| |||     
T  21993738 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctaaccacttgactgacggattgacctttta-tgg-agaagacac 21993835  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaa-atagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattg 314  Q
    ||| | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||            |||||||||||||||| ||| ||    
T  21993836 aatgtaagacacggactagaaactatgaatacaaaatgatgcatgatatgcttatgaaaaagata-ataatttttttgaaggacttatcaaagcgaaatg 21993934  T
Q  315 taaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg 414  Q
    ||||||  |||   ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21993935 taaacacagtac--gaatatggtttcattttgaatattgtaaagacgtcgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagtaca 21994032  T
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 514  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||| ||||||||    
T  21994033 aaagctaaagctcagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatgttt-acaaaaacttgactaagtcc 21994130  T
Q  515 ttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgt 613  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21994131 ttcaa-tttttgatggaaaaagttgt-------tggatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtcccataatgt 21994222  T
Q  614 tggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  21994223 tggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaagactatggtttcaaattgtaccggtgtcacgggttct 21994291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20379025 - 20378632
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  20379025 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttc-tttttcgaaaggtaa 20378928  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 484  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20378927 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 20378828  T
Q  485 atgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata-gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 583  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20378827 atgatgtttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaattttt-gatggaaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 20378729  T
Q  584 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20378728 gaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccattcggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 20378632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28846712 - 28846480
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28846712 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 28846613  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28846612 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 28846513  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa 250  Q
    |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  28846512 atatgagatacagactagaaa-tatgaatgcaaa 28846480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 28846460 - 28846073
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  28846460 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggt-cctttttcaaaaggtaa 28846363  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 490  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||    
T  28846362 gaacgaaaccaaggaaaaagtacaaaagctaaagctcagttaagat-ttttgaagttgtatctcttggtgttcactcgtacaaggtccatatccataatg 28846264  T
Q  491 tttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaataca 590  Q
    ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  28846263 tttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgcatgtttatactaaagttcattgaataca 28846165  T
Q  591 tgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  28846164 tgaggaggttaagttctacaatgttggagtcgagggtaacaacgccacttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 28846073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 23638889 - 23638462
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  23638889 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacctcttgctcaagccggtcca 23638790  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |    
T  23638789 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactgttggattgaccttttgtaggtaaaaacaga 23638690  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaa-ata-gnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa-t 312  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||  ||             ||||||||||||||||| || |    
T  23638689 atatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgat----ttatgcaaaatgtacaattttttttttgaaggacttatcaaagttaatt 23638594  T
Q  313 tgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt- 411  Q
    | |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||     
T  23638593 tttaaacattgtagataaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg-tcctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaagtt 23638496  T
Q  412 ----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt 441  Q
        || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23638495 cttaacaaaagttaaagcttagttaagatttttt 23638462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 441
Target Start/End: Original strand, 23833998 - 23834427
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  23833998 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacctcttgctcaagccggtcca 23834097  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |    
T  23834098 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactgttggattgaccttttgtaggtaaaaacaga 23834197  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaa----aatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaa 311  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||    |  |            ||||||||||||||||| ||    
T  23834198 atatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgat----ttatgcaaaatgtacaattttttttttttgaaggacttatcaaagttaa 23834293  T
Q  312 -ttgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagag 410  Q
     || |||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||| ||||  ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  23834294 tttttaaacattgtagataaacatggtttca-tttgaaaattgtgaagatattgcaaaagg-tcctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaag 23834391  T
Q  411 t-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt 441  Q
    |     || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23834392 ttcttaacaaaagttaaagcttagttaagatttttt 23834427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 421 - 682
Target Start/End: Original strand, 21866131 - 21866389
Alignment:
Q  421 aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat 520  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||        |||||||||||||||||||    
T  21866131 aaagcttagttaagatttttttaagttgtatctcttggtgttcattcttacaagatccatatccctgatattt-acaaaaacttgtctaagtccttcaat 21866229  T
Q  521 tttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagt 619  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||     
T  21866230 ttt--gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagaacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttgaagc 21866327  T
Q  620 caagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21866328 caagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 21866389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 12178351 - 12178616
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12178351 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttatttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 12178450  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaac-aa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||    
T  12178451 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactgttggattgaccttttgtaggtaaaaacaaa 12178550  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12178551 aatatgagacatggactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 12178616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 27231425 - 27231688
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||    
T  27231425 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacctcttgctcaagccggtcca 27231524  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||| |||     
T  27231525 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatggatcgaccttttgatgg-agaagacac 27231623  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27231624 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27231688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 12178647 - 12179047
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  12178647 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 12178745  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  12178746 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 12178844  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 577  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12178845 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 12178942  T
Q  578 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 676  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12178943 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 12179041  T
Q  677 ggttct 682  Q
    ||||||    
T  12179042 ggttct 12179047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 33842911 - 33843311
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  33842911 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaa 33843009  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  33843010 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 33843108  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 577  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33843109 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaagttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 33843206  T
Q  578 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 676  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  33843207 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 33843305  T
Q  677 ggttct 682  Q
    ||||||    
T  33843306 ggttct 33843311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 26087416 - 26087816
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  26087416 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 26087514  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  26087515 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 26087613  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 577  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26087614 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaattttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aag 26087711  T
Q  578 tacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 676  Q
    |  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  26087712 tggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacg 26087810  T
Q  677 ggttct 682  Q
    ||||||    
T  26087811 ggttct 26087816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 11811500 - 11811901
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  11811500 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 11811598  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11811599 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 11811697  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa-------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaa 576  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11811698 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaattttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aa 11811795  T
Q  577 gtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    ||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11811796 gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcac 11811894  T
Q  676 aggttct 682  Q
     ||||||    
T  11811895 gggttct 11811901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 33842621 - 33842884
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33842621 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 33842720  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  33842721 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 33842819  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33842820 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 33842884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 26087120 - 26087383
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26087120 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttatttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 26087219  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  26087220 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 26087318  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26087319 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 26087383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 11811197 - 11811460
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11811197 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttatttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 11811296  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  11811297 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatatgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 11811395  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11811396 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 11811460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 436 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 23638439 - 23638203
Alignment:
Q  436 ttttttgaagttgtatctctt-ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaat 534  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  23638439 ttttttgaagttggatctctttggtgttcattcttgtaaggtccatatccacgatgtttgcaaaaa-cttgtctaagtccttccattttt-gatagaaaa 23638342  T
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgc 634  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||     
T  23638341 cgttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttagtctaaagtatatagaatacatgatgaggttaagtccac-atgttggagtcaaaggtaacaacgt 23638243  T
Q  635 catttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  23638242 catttggtaaggactacggtctcaaa-tgtagctgtatcac 23638203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 436 - 675
Target Start/End: Original strand, 23834451 - 23834687
Alignment:
Q  436 ttttttgaagttgtatctctt-ggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaat 534  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||       |||||||||||||||| |||||| ||| ||||     
T  23834451 ttttttgaagttggatctctttggtgttcattcttgtaaggtccatatccacgatgtttgcaaaaa-cttgtctaagtccttccattttt-gatagaaaa 23834548  T
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgc 634  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||     
T  23834549 cgttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttagtctaaagtatatagaatacatgatgaggttaagtccac-atgttggagtcaaaggtaacaacgt 23834647  T
Q  635 catttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  23834648 catttggtaaggactacggtctcaaa-tgtagctgtatcac 23834687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 386 - 682
Target Start/End: Original strand, 22956781 - 22957078
Alignment:
Q  386 ggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccat 480  Q
    |||||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22956781 ggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttagaaggtccat 22956879  T
Q  481 acccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 579  Q
    | |  ||||||||        ||| ||||||| |||| || ||  ||| | ||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22956880 atctttgatgttt-acaagaacttatctaagtgcttcgatattagtga-gaaaaaagtt-tttctgaacgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaa 22956976  T
Q  580 catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggt 679  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22956977 catggaatgcatggtgaggttaagtccacaaagttggagtcaagggtaaagacgccatttggtaaggactattgtttcaaa-tgtacctgtatcacaggt 22957075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 425 - 682
Target Start/End: Original strand, 27231843 - 27232101
Alignment:
Q  425 cttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat---t 521  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||        ||||||||||||||||||    |    
T  27231843 cttagttaagattttg-gaagttgtatttcttgatgttcattcttacaagatccatatctgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaat 27231940  T
Q  522 ttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtc 620  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  27231941 ttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggtcatgctaa-gtggatagaatacatggtgagggtgagttccacaatgttggagtc 27232039  T
Q  621 aagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  27232040 tatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttaaaaacgtacctgtatcacgggttct 27232101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 345 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 29895576 - 29895244
Alignment:
Q  345 tgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttt 439  Q
    |||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||||||||||||||| ||||    
T  29895576 tgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttt 29895478  T
Q  440 ttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagtt 538  Q
    | |||||||||      ||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| ||||    
T  29895477 t-gaagttgta------ggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga--gaaaaagtt 29895388  T
Q  539 gtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag--tcaagggcaacaacgcca 636  Q
     ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  29895387 -tttatgaatgaatgcatgtttgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagctttaagggtaacaacgcca 29895289  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29895288 tttagtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 29895244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 343 - 636
Target Start/End: Original strand, 20097251 - 20097550
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  20097251 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 20097349  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 536  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| ||||||||||||||| ||  ||| | ||| ||    
T  20097350 ttt-gaagttgtatttcttggtgttctttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcaatattagtga-gaaaaaag 20097446  T
Q  537 ttgttt---atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaac 632  Q
    || ||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  20097447 tttttatcaatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaac 20097546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25528673 - 25528337
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |      |||||||||||||||||||||||    
T  25528673 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaa-agttcttagcaaaagctaaagcttagttaagatt 25528576  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagt 537  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |   |||| |||    
T  25528575 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatatta-gcgagaaa-agt 25528480  T
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccat 637  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||   |||| |||||||||||    
T  25528479 t-tttgtgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaggtccacaaagttggagcttagggtaacaacgccat 25528381  T
Q  638 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| ||||||    
T  25528380 ttggtaaggactatggttt-aatttgcacttgtatcacgggttct 25528337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 36450535 - 36450393
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  36450535 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaggaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaacgccatt 36450436  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36450435 tggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 36450393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 26871568 - 26871190
Alignment:
Q  295 ggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaac 394  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||  | | || |||  || |||||   |||||||||| ||| | |||||| |||||||||    
T  26871568 ggacttgtcaaagtaatttgtaaacattgtagaagaacatggacttagtt-gaaatttataaaggtattgcaaacggctccctcttcaaa-ggtaagaac 26871471  T
Q  395 gaaaccaaggaaagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgat 489  Q
    ||||||||||||| ||| |      |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||    
T  26871470 gaaaccaaggaaaaagttcttaataaaagttgaagcttagttaagattttt-gaagttttatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgat 26871372  T
Q  490 gtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata 588  Q
    ||||        ||| |||||||||||  || ||  |||  |||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||         | ||||     
T  26871371 gttt-acaaaaacttatctaagtcctttgatattggtga--gaaaaaggt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgcg--------tggaatg 26871284  T
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26871283 catggtgatgttaagtccacaatgttggagctgaaggataacgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 26871190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 415 - 682
Target Start/End: Original strand, 7259793 - 7260060
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 514  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||    
T  7259793 aaagttaaaacttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtcc 7259890  T
Q  515 ttcaattttt-tgatggaaata--gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcta---aagtacatagaatacatgatgaggttaagtccac 608  Q
    ||| || ||  |||  |||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||   ||  ||   ||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7259891 ttcgatattaatgagagaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcgtgtatgcatgattacgctacgcaa--acggtgaaaacatggtgatgttaagtccac 7259987  T
Q  609 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  7259988 aatgttggagtcaagggtaaaaatgccagttggtagggactatggtttcaga-tgtacctgtatcacgggttct 7260060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 1800380 - 1800288
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  1800380 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 1800288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 12393443 - 12393535
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  12393443 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 12393535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 21690825 - 21690733
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  21690825 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 21690733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 578 - 682
Target Start/End: Original strand, 29890230 - 29890334
Alignment:
Q  578 tacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcaca 676  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||     
T  29890230 tacagagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagttaaggataacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaatgtacctgcatcacg 29890328  T
Q  677 ggttct 682  Q
    ||||||    
T  29890329 ggttct 29890334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 37580887 - 37580755
Alignment:
Q  39 tagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  37580887 tagttaacttctctacctcggcccgaagtatagtcacttcttcacgaagctcgtggacctcttctccaagtcgatccattttttgtgtttgcacgagtgt 37580788  T
Q  139 ctgcatatgcgagccgaacttggatggagacat 171  Q
     ||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||    
T  37580787 ttgcatgtgtgagctgaagttgaatgaagacat 37580755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 540 - 663
Target Start/End: Original strand, 358860 - 358983
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  358860 tttatggatggatgcatgtatgcatgataatactaaagcacataggatgcacggtgaggttaagttcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatt 358958  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||    
T  358959 tggtaaggactaaggttttaaattg 358983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 607 - 682
Target Start/End: Original strand, 20395672 - 20395746
Alignment:
Q  607 acaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20395672 acaatgttggagtcaaaggtaacaatgccatttggtaaggactacggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 20395746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 7259625 - 7259671
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7259625 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 7259671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 279
Target Start/End: Original strand, 21865921 - 21865978
Alignment:
Q  222 agacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 279  Q
    ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21865921 agacacgaactagaaactatgaacgcaaaatgatgcatgatatgcttacgcaaaaata 21865978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 36450730 - 36450583
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  36450730 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccatttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 36450633  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgttt 493  Q
    |||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  36450632 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatcattgatgttt 36450583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 631 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 37578825 - 37578782
Alignment:
Q  631 acgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37578825 acgccatttggtaaggactatggtttcattttgtacctgtatca 37578782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 29895686 - 29895640
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29895686 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 29895640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 15791307 - 15791354
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  15791307 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 15791354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 36382575 - 36382622
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  36382575 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 36382622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 37007247 - 37007294
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  37007247 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 37007294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 22956632 - 22956678
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22956632 gaaattatgaatacaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaatag 22956678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25528780 - 25528734
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  25528780 gaaattatgaatgcaatatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 25528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 7789295 - 7789240
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7789295 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 7789240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Original strand, 12393225 - 12393280
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12393225 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 12393280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21691024 - 21690984
Alignment:
Q  370 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21691024 ggttcctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagt 21690984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 34464069 - 34464032
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34464069 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 34464032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 656
Target Start/End: Original strand, 3490920 - 3490987
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3490920 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaataacgccatttggtaaggactaaggttt 3490987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 5446797 - 5446844
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  5446797 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 5446844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 7789030 - 7788983
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  7789030 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 7788983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 11951010 - 11951057
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  11951010 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 11951057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21691167 - 21691131
Alignment:
Q  241 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21691167 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 21691131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 31513872 - 31513825
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  31513872 ccatttggtaaggactatggtttc-gtttgtacctgtatcacgggttct 31513825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 603 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 34462284 - 34462205
Alignment:
Q  603 gtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||    
T  34462284 gtccacattgatggagtcaaagggtaaacacgtcatttggtaaggactatggtctc-atttgtacctgtatcacgggttct 34462205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 661
Target Start/End: Original strand, 25503768 - 25504426
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25503768 tgtggccatcaatgaagatactaggctggttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcatggacctcttgctcaagtcga 25503867  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaa 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  25503868 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattggaccactttactgatggattgaccctttgtaggtagaaa 25503967  T
Q  213 caaaatatgagacacgtaccag-aaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag------nnnnnnnnnnngaaggacttatcaa 305  Q
    |||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                 ||||||||||||||    
T  25503968 caaaatatgagacatggactagaaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataaaaaaataaaatttgaaggacttatcaa 25504067  T
Q  306 agtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25504068 agtgaattgtaaacattgtagaggaacatagtttca-tttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaactaaaccaagga 25504165  T
Q  406 aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnn 499  Q
    || |||     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||          
T  25504166 aaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatatttttgaagttgtatctcttggtgatcattcttaaaaggtccatacctttgatgttt-acaaa 25504264  T
Q  500 nncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggt 599  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25504265 aacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaagttttttatgaatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatatatggtgaggt 25504363  T
Q  600 taag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 661  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25504364 taagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttaaaat 25504426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 16636956 - 16636282
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16636956 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgcttaagttgatcca 16636857  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| |||||||||||  ||| |||| |||     
T  16636856 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacctttttatgg-agaagacac 16636758  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgt 315  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||           ||||||||| | |||||||| |||    
T  16636757 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag-atttttttttgaaggacttgttaaagtgaaatgt 16636659  T
Q  316 aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaaga-cgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt--- 411  Q
    |||||| | |||||||||||| |||| | |||| ||||| ||||   || |||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||       
T  16636658 aaacatggcagaggaacatggtttca-tatgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaagaagttct 16636560  T
Q  412 ---acgaaagct-aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtc 507  Q
       ||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||    
T  16636559 ttaacagaagctaaaagcttagttaaga-ttttggaagttgtatttcttggtgttcattcttacaaggtccatatccgtgatgttt-acaaaaacttgtc 16636462  T
Q  508 taagtccttc------aattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggtta 601  Q
    ||||||||||      ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  16636461 taagtccttcaaaaaaaattttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aagtggatagaatacatggtgagggta 16636363  T
Q  602 ag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||    
T  16636362 agttccacaatgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaaacgtacctgtatcacgggttct 16636282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 28270386 - 28269987
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28270386 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 28270288  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 484  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28270287 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 28270188  T
Q  485 atgatgtttgnnnnnnn-----cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 579  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28270187 atgatgtttgcaaaaaaaaaaacttgtctaagtccttcaattttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 28270088  T
Q  580 catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggt 679  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28270087 catagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggt 28269990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 28349136 - 28348737
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28349136 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 28349038  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 484  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28349037 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 28348938  T
Q  485 atgatgtttgnnnnnnn-----cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 579  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348937 atgatgtttgcaaaaaaaaaaacttgtctaagtccttcaattttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta 28348838  T
Q  580 catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggt 679  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28348837 catagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggt 28348740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 28305355 - 28304954
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28305355 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaa 28305257  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatttttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccataccc 484  Q
    || ||||||||| |||| |||     || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28305256 gatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaagtccataccc 28305157  T
Q  485 atgatgtttgnnnnnnn-------cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 577  Q
    ||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28305156 atgatgtttgcaaaaaaaaaaaaacttgtctaagtccttcaattttttgatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaag 28305057  T
Q  578 tacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacag 677  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28305056 tacatagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgg 28304959  T
Q  678 gttct 682  Q
    |||||    
T  28304958 gttct 28304954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 27056372 - 27056773
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  27056372 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 27056470  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  27056471 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 27056569  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa-------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaa 576  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27056570 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaaatttttttgatggaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgct-aa 27056667  T
Q  577 gtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    ||  |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27056668 gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcac 27056766  T
Q  676 aggttct 682  Q
     ||||||    
T  27056767 gggttct 27056773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 5006929 - 5006783
Alignment:
Q  13 tgtggccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcga 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5006929 tgtggccatcaatgaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaatctcgtggacctcttgctcaagtcga 5006830  T
Q  113 tccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaactt 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5006829 tccatttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaactt 5006783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Original strand, 27056064 - 27056327
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27056064 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 27056163  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  27056164 tcttttgtgtttgcacgagtgtttgcatatgtgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 27056262  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27056263 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27056327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 22326361 - 22326025
Alignment:
Q  351 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaag 445  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22326361 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaag 22326264  T
Q  446 ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttt-- 542  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| ||       
T  22326263 ttgtatttcttggtgttctttcttacaaggaccatatctatgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagtttttatc 22326166  T
Q  543 -atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttg 640  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  22326165 aatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccatttg 22326066  T
Q  641 gtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  22326065 gtagggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 22326025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Original strand, 620927 - 621270
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||     || |||||||||||||||||||| ||    
T  620927 tttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaag-tt 621024  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaata- 535  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| |     
T  621025 ttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaaa 621123  T
Q  536 --gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacg 633  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  621124 aagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctgaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcgagggtaacaatg 621222  T
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  621223 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 621270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 27538448 - 27538305
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtc-aagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||    
T  27538448 tttatgaatgaatgcatggatgcatgcttatgctgaagtacatagaatacataatgaggttaagtccacaatgttggagtcaaaaggtgacaacgccatt 27538349  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27538348 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacgggttct 27538305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Original strand, 27071864 - 27072204
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |       || |||||||||||||||||||| ||    
T  27071864 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaatcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtt 27071962  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 536  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   |||| |    
T  27071963 ttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaat-g 27072060  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 635  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||||||| | ||||| |||||||||    
T  27072061 tt--ttatgaatgaatgcgtgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagcctacaaagttggagcttaagggtaacaacgcc 27072158  T
Q  636 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27072159 atttggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 27072204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25700616 - 25700474
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  25700616 tttatggatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtgacaacaccatt 25700517  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25700516 tggtaaggactaaggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 25700474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 343 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 19716143 - 19715822
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||| ||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||     || ||| ||||||||||||||||||    
T  19716143 tttgaaaattgtgaagatgttgtaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaacctaaagcttagttaagat 19716045  T
Q  437 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatag 536  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||    ||  |||      
T  19716044 tttt-gaagttgtatttcttggtgttctttcttacgaggtccacatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtccttcgatattag--tgagaattt 19715949  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  19715948 tttcttatgtatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaatgtggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaaacacgcca 19715849  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19715848 tttggtaaggactatggtttcaaattg 19715822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 538 - 682
Target Start/End: Original strand, 18219274 - 18219418
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18219274 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 18219373  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  18219374 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 18219418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 540 - 672
Target Start/End: Original strand, 20056100 - 20056231
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  20056100 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctgaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtcgagggtgacaacgccattt 20056199  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20056200 ggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 20056231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 538 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 18112955 - 18112836
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18112955 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaaatacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 18112856  T
Q  637 tttggtaaggactatggttt 656  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18112855 tttggtaaggactatggttt 18112836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 343 - 663
Target Start/End: Original strand, 20457035 - 20457358
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||||    
T  20457035 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 20457133  T
Q  437 tttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaat 534  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||| | |||||||||||| || |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||||    
T  20457134 tttt-gaagtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtccgtatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaat 20457231  T
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacg 633  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||    
T  20457232 -gtt--ttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgtatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagagtaacagcg 20457328  T
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20457329 ccatttggtaagcactatggtttcaaattg 20457358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 538 - 682
Target Start/End: Original strand, 23981842 - 23981986
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  23981842 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagagtaacaacgtca 23981941  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  23981942 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 23981986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3694465 - 3694321
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcta--aagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || |  |   || |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3694465 tttatgcatgaatgcatgtatgcatgattgttttttcaattacagagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 3694366  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3694365 tttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 3694321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 27512213 - 27512121
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  27512213 catggtgaggttaagtccacaatgttggagccaaggatatcgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgcatcacgggttct 27512121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 584 - 656
Target Start/End: Original strand, 22777010 - 22777082
Alignment:
Q  584 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22777010 gaatgcatggtgaggttaagtccacagtgttggagtcaaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt 22777082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 27512407 - 27512302
Alignment:
Q  378 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 473  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27512407 tttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 27512310  T
Q  474 ggtccata 481  Q
    || |||||    
T  27512309 ggaccata 27512302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 16823023 - 16823115
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  16823023 catggtgaggttgagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 16823115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 609 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 18911308 - 18911256
Alignment:
Q  609 aatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaat 661  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18911308 aatgatggagtcaagggtaacaacgccattgggtaaggactatggtttcaaat 18911256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 477
Target Start/End: Original strand, 20055967 - 20056028
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtc 477  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  20055967 aaagctaaaacttagttaagatttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttctaacaaggtc 20056028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 656
Target Start/End: Original strand, 28266931 - 28267047
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28266931 tttatggatggatacatgtatgcatgataatactaaagcacataggatgcacggtgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatt 28267029  T
Q  639 tggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28267030 tggtaaggactaaggttt 28267047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 656
Target Start/End: Original strand, 28345680 - 28345796
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||| || |||||||||||| | || |||||| |||||| || || | ||||||||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28345680 tttatggatggatacatgtatgcatgataatactaaagcacataggatgcacggtgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatt 28345778  T
Q  639 tggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28345779 tggtaaggactaaggttt 28345796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 450
Target Start/End: Original strand, 22776802 - 22776905
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22776802 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gtttttgaa 22776899  T
Q  445 gttgta 450  Q
    ||||||    
T  22776900 gttgta 22776905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Original strand, 9143000 - 9143047
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  9143000 ccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 9143047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 18946917 - 18946963
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18946917 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 18946963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 27071751 - 27071797
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27071751 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 27071797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Original strand, 20045665 - 20045720
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20045665 attgtaaagacgttgcaattggttcccttt-caaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 20045720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 598 - 682
Target Start/End: Original strand, 20045908 - 20045988
Alignment:
Q  598 gttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20045908 gttaggtccacaatgtcggagcttaagggtaacaacgccattagg----gactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 20045988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27512542 - 27512506
Alignment:
Q  241 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27512542 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 27512506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 682
Target Start/End: Original strand, 73906 - 74566
Alignment:
Q  29 gatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctattt 128  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  73906 gatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagccgatccatttttcctgttt 74005  T
Q  129 gcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaaatatgagacacg 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  74006 gcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactgacggattgaccttttgtaggtagaaacaaaatacgagacacg 74105  T
Q  229 taccagaaactatgaatgcaaa-atgatgcatgataggcttatgcaaaaatag-------nnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaaca 320  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |                  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  74106 gactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatggacaaatttttttttttatgaaggacttatcaaagtgaattgtaaaca 74205  T
Q  321 ttgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acga 415  Q
    | | | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||     || |    
T  74206 tggcaaaggaacatggtttca-tttgaaaattgtaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccgaaaaaaaggttcttaacaa 74304  T
Q  416 aagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcct 515  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||       |||||| |||||||    
T  74305 aagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttaaaaggtc--tatccatgatgtttg-caaaaacttgtccaagtcct 74400  T
Q  516 tcaattttttgatgg-aaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgtt 614  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  74401 tcaa-tttttgatggaaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagaatatagattacatggtgaggttaagtccacaatgtt 74499  T
Q  615 ggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  74500 ggagtcaaatataacaatgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacaggttct 74566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 17 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 1849
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||    
T  2516 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagccctaagtgttgttacctctccacgaagctcatgaacttcttgctcaagccgttcca 2417  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||  |||| ||| |||  || ||||| |||     
T  2416 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactgacagattaacccttttatg-tagaagacac 2318  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnng-aaggacttatcaaagtgaattg 314  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             |||||||| |||||||||| ||    
T  2317 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaatttttttttaaggacttgtcaaagtgaaatg 2218  T
Q  315 taaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt--- 411  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||       
T  2217 taaacacagtagaggaacatggtttcattt-gaaaattttaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacaaaaccaacgaaagagttct 2119  T
Q  412 --acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtcta 509  Q
      || | || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||       | ||| ||    
T  2118 taacaacagttaaaacttagttaagatttt--gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaatgtccaaatctatgatgtttgcaaaaaacatgtata 2021  T
Q  510 agtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccaca 609  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2020 agtccttcaattttttgatgaaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatggtaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccaca 1921  T
Q  610 atgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  1920 atgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttttaaa-tgtacctgtatcacgggttct 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 293 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12103
Alignment:
Q  293 aaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 392  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491 aaggacttgtcaaagtgaattgtaaacacagtagaggaacatggtttcattttgaatattgtaaagtcgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 12392  T
Q  393 acgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagc-ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgt 491  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||    
T  12391 acgaaaccaaggaaagagtacaaaagctaaagctttagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacatggtccatatccataacgt 12293  T
Q  492 ttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacat 591  Q
    |||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12292 ttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaagatgtttatgaatgaatacatgtatgcatggttatactaaagtacatagaatacat 12194  T
Q  592 gatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||    
T  12193 ggtgaggttaagttccacaatgttggagccaagggtaataacgccatttggtaaggactatggtttc-aagtgtacctgtattacgggttct 12103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12746 - 12567
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12746 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctccacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgttcaagtcgatcca 12647  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgac 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12646 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatttgcgagccgaacttggatgaagacattgaacaactttactgatggattgac 12567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 222 - 682
Target Start/End: Original strand, 144300 - 144762
Alignment:
Q  222 agacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnng--aaggacttatcaaagtgaattgtaaac 319  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||              ||||||| |||||||||||||||||||    
T  144300 agacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagaattatattttttcaaggactaatcaaagtgaattgtaaac 144399  T
Q  320 attgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagc 419  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  144400 attgtagtggaacatggcttcattttggacattgtaaagacgttgcaaacggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtactaaagc 144499  T
Q  420 taaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa 519  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||        ||||||||||||||||||    
T  144500 taaagcttagttaaga-tttttaaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatatgcatgatattt-acaaaaacttgtctaagtccttcaa 144597  T
Q  520 ttttttgatgg---aaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttg 615  Q
     ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  144598 -tttttgatggaaaaaaaagttgtttataaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagaaaacggaatacatggtgagggtaagttccataatgttg 144696  T
Q  616 gagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  144697 gagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 144762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 454 - 682
Target Start/End: Original strand, 131477 - 131706
Alignment:
Q  454 cttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaata---gttgtttatgaatga 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||||    
T  131477 cttggtgttcattcttacaaggtccatatccatgatattt-acaaaaacttgtctaagtccttcaatttttt-atggaaaaaaaagttgtttatgaatga 131574  T
Q  551 atgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggact 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  131575 atgcatgtatgcatggttatgctaaagaacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggact 131674  T
Q  650 atggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  131675 atggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 131706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 233 - 682
Target Start/End: Original strand, 6752 - 7217
Alignment:
Q  233 agaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn-gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 331  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  6752 agaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgtaaaaatagacaattttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacgttgtagaggga 6851  T
Q  332 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----------------acg 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||                 ||     
T  6852 catggtttcattttgaacattgtaaagacgttgcaa-cggttccctttttgaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtttttttttttttttttaaca 6950  T
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtcc 514  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||        |||||| ||||||    
T  6951 aaagctaaagcttagttacgattttt-gaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatattcgtgatgtttacaaaaaacttgtcgaagtcc 7049  T
Q  515 ttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgt 613  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  7050 ttcaatttt-tgatggaaaaagatgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgcgaaagtacatagaatacatgatgaggttaattcccataatgt 7148  T
Q  614 tggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7149 tggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 7217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 276
Target Start/End: Original strand, 21528930 - 21529189
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528930 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 21529029  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21529030 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaactacattactgatggattgaccttttgttggtggaaacaaa 21529129  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaa 276  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21529130 atatgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 21529189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 250
Target Start/End: Original strand, 8100380 - 8100612
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100380 gccatcaatgaagatactaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 8100479  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100480 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaaacaaa 8100579  T
Q  217 atatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaa 250  Q
    |||||||| ||  || ||||| ||||||||||||    
T  8100580 atatgagatacagactagaaa-tatgaatgcaaa 8100612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 21529217 - 21529586
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529217 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 21529316  T
Q  392 aacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgt 491  Q
    ||| |||||||                      |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21529317 aacaaaaccaat---------------------cttagttaagattttt-gaagttgtatatcttggtgttcattcttacaaggtccatatccataatgt 21529394  T
Q  492 ttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttat--gaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatac 589  Q
    |||       ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |  | | |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21529395 ttgcaaaaaacttatctaagtccttcaattttt-gatggaaaaatatatatatacgaatgaatgcatgtatgcatggttatactaaagtacattgaatac 21529493  T
Q  590 atgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21529494 atgaggaggttaagttccacaatgttggagccgagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 21529586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Original strand, 8100633 - 8101020
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgt-aaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8100633 gaaggacttatcaaagttaatttttaaacatggtagagaaacatggtttcattt-gaaaattgtgaagatattgcaaaaggt-cctttttcaaaaggtaa 8100730  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagtacgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatg 490  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||    
T  8100731 gaacgaaaccaaggaaaaagtacaaaagctaaagctcagttaaga-tttttgaagttgtatctcttggtgttcactcgtacaaggtccatatccataatg 8100829  T
Q  491 tttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaataca 590  Q
    ||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  8100830 tttgcaaaaaacttgtctaagtccttcaa-tttttgatggaaaaatatatttattaatgaatgcatgtatgcatgtttatactaaagttcattgaataca 8100928  T
Q  591 tgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8100929 tgaggaggttaagttctacaatgttggagtcgagggtaacaacgccacttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 8101020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 381 - 656
Target Start/End: Original strand, 26218314 - 26218595
Alignment:
Q  381 caaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaagg 475  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||     || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218314 caaaaggtaagatcaaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaagg 26218413  T
Q  476 tccatacccatgatgtttgnnnnnnn---cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgc 572  Q
    |||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26218414 tccatacccatgatgtttgcaaaaaaaaacttgtgtaagtccttcaatttt-tgatggaaaaagtagtttatggatgaatgcatgtatgcatggttatgc 26218512  T
Q  573 taaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26218513 taaagtacatagaatacatggtgatgttaagtccac-atgttggagtcgaaggtaacaacgtcatttggtaaggactatggttt 26218595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 263
Target Start/End: Original strand, 26217977 - 26218224
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||    
T  26217977 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacctctccccgaagttcctggacttcttgctcaagccgatcca 26218076  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattga-ccttttgctggtagaa-aca 214  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||| ||||| | ||| ||  ||| |||| |||    
T  26218077 tttttcctgtttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactgacggattaaccctctttatgg-agaagaca 26218175  T
Q  215 aaatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 263  Q
     | | ||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218176 cagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgata 26218224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 546 - 682
Target Start/End: Original strand, 3386336 - 3386471
Alignment:
Q  546 aatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaag 645  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3386336 aatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagttcacaatgttggagccaagggcaacaacgccatttggtaag 3386435  T
Q  646 gactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3386436 gactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 3386471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 538 - 682
Target Start/End: Original strand, 14736116 - 14736260
Alignment:
Q  538 tgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14736116 tgtttatgaatgaatgcatgtatgtatgataatgctcaagtacatagaatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacaacgcca 14736215  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  14736216 tttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 14736260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 1888796 - 1888938
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaag-tccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1888796 tttatggatgaatgcatgtatgcatgataatgctaaagtacatataatacatgatgagggtaagtttcacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatt 1888895  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||    
T  1888896 tggtaaggattatggttt-aaaatgtacctgcatcacgggttct 1888938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 20556393 - 20556056
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||||||||||||||| ||    
T  20556393 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtt 20556295  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaatttttt---gatggaaat 534  Q
    ||| |||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||     ||   |||     
T  20556294 ttt-gaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaaa 20556203  T
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacg 633  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  20556202 agtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatcgaatgcatggtgaggtcaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacg 20556104  T
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20556103 ccatttggtagggactacggtttcaaa-tgtacttgtatcacgggttct 20556056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 415 - 682
Target Start/End: Original strand, 16725868 - 16726133
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattctt-acaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtc 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  || |  ||||||||        ||| || |||||    
T  16725868 aaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttctttacaaggtctgtatctttgatgttt-acaagaacttatccaagtc 16725965  T
Q  514 cttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatg 612  Q
    |||| || ||  |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  16725966 cttcgatattagtgagaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaaggatatggaatatatggtgaggttaagtccaccata 16726064  T
Q  613 ttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| || |||||||    
T  16726065 ttggagccaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggttt-aaattgcacttgtaacaaaggttct 16726133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 343 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 14884022 - 14883695
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||      || |||||||||||||||||||||||    
T  14884022 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaacca-ggaaaaagctattaacaaaagctaaagcttagttaagatt 14883925  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 536  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||| ||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| ||    
T  14883924 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgaggttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaag 14883828  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 635  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||     |||||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  14883827 tt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcat-----ggttaagtccacaaagttggagcttaagggtaacgacgcc 14883734  T
Q  636 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcac 675  Q
    |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14883733 atttagtaagaactatggtttc-agttgtacctgtatcac 14883695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Original strand, 12510293 - 12510477
Alignment:
Q  18 ccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccat 117  Q
    |||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||    
T  12510293 ccatcagtgaagataccagattagttaacttctctacctcggcccgaagtgttgttacctcttcacgaacctcgtggacctcttgctcaagctaatccat 12510392  T
Q  118 ttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttg 202  Q
     |||  | |||| || ||||| ||||||||| ||| ||| ||| | | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  12510393 cttttgtgtttgtacaagtgtttgcatatgctagctgaagttgaaagaagacattagaccactttactgatggattgaccttttg 12510477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Original strand, 15900530 - 15900867
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtacg-----aaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |      |||||||||||||||||||||||    
T  15900530 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggctcccttttcaaaag-taagaacgaaaccgaggaaaaagttcttaataaaagctaaagcttagttaagatt 15900628  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 536  Q
    ||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| ||    
T  15900629 ttt-gaagttgtatttcttagtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaag 15900726  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 635  Q
    || ||||||||| ||||||||    |||| |||| |||||| |||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||    
T  15900727 tt-tttatgaataaatgcatg----catgattatactaaagaacatggaatgcatggagaggttaagtccacaatgttggagcttaaaggtaaaaacgcc 15900821  T
Q  636 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15900822 atttggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 15900867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 3841888 - 3842030
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  3841888 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgatgttaggtccataatgatggagtcaagggtaacaatgccaatt 3841987  T
Q  640 ggtaaggac-tatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  3841988 ggtagggacttatggtttc-agttgtacctgtatcacgggttct 3842030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 594 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 9187085 - 9187022
Alignment:
Q  594 tgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9187085 tgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 9187022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12511555 - 12511465
Alignment:
Q  27 aagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccat 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12511555 aagatactaggttaggtaacttctctacctcggcccgaagtgttgttttctcttcgcgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatccat 12511465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18038526 - 18038434
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18038526 catggtgaggttaagtccacaatgttggagccaaggatatcgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgcatcacgggttct 18038434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 22706238 - 22706146
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  22706238 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 22706146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 473
Target Start/End: Original strand, 15077321 - 15077447
Alignment:
Q  351 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15077321 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttt-tgaa 15077418  T
Q  445 gttgtatctcttggtgttcattcttacaa 473  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15077419 gttgtatttcttggtgttccttcttacaa 15077447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12511128 - 12511038
Alignment:
Q  27 aagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccat 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12511128 aagatactaggttaggtaacttctctacctcggcccgaagtgttgttttatcttcgcgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatccat 12511038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 378 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18038721 - 18038616
Alignment:
Q  378 tttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 473  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18038721 tttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 18038624  T
Q  474 ggtccata 481  Q
    || |||||    
T  18038623 ggaccata 18038616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Original strand, 15079619 - 15079961
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |        || ||||||||||||||||||||||    
T  15079619 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 15079717  T
Q  437 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaata 535  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||| |  |||||| |        ||| |||||||||||| || ||  |||   ||| |    
T  15079718 tttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaaaaccatatctttgatgtct-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaa 15079815  T
Q  536 gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatag--aatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacg 633  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | || |  || ||||| ||| |||| ||| | |||| |||||||||||  ||  | |    
T  15079816 gtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgccacacaa-atggtgaaaacatggtgatgttaggtctataatgatggagtcaaggaaaaacatg 15079913  T
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  15079914 ccatttggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 15079961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 292 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 3359761 - 3359573
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttc-aaaaggtaa 390  Q
    |||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| | ||||||| ||| ||||||||||  ||||||  ||||  |||||| |||||||||    
T  3359761 gaaggatttgtcaaagtga-ttggaaacattatagaagaacattgtttcattt-gaaaattgtaaagatattgcaataggtttttttttccaaaaggtaa 3359664  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtc 477  Q
    || |||| |||||| || |||     || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||    
T  3359663 gagcgaacccaagggaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat-ttttgaagttgtatttcttggcgttctttcttgcaaggtc 3359573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 559 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 17304144 - 17304043
Alignment:
Q  559 atgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaa-gtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttc 657  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | |  ||  ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  17304144 atgcatggttatgctaaaggacatagaatacatagtgaggttaaggtccaaaatgttggagtcgaagataaatacgtcatttgataatgactatggtttc 17304045  T
Q  658 aa 659  Q
    ||    
T  17304044 aa 17304043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Original strand, 3841764 - 3841828
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  3841764 aaagctaaagcttagttaagatttt--gaagttgtatttcttgatgttccttcttacaaggaccata 3841828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14919944 - 14919898
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14919944 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 14919898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 277
Target Start/End: Original strand, 16725687 - 16725730
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16725687 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 16725730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 3386030 - 3386076
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3386030 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 3386076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 152
Target Start/End: Original strand, 15077014 - 15077127
Alignment:
Q  39 tagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||   | ||| |||||||  ||  | |||||||||||||    
T  15077014 tagttaacttctctacctcggcccgaagtgtagtgacctcctcgcgaagctcatggacctcttctccgagttgatccatactttgtgtttgcacgagtgt 15077113  T
Q  139 ctgcatatgcgagc 152  Q
     |||||||| ||||    
T  15077114 ttgcatatgtgagc 15077127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 10787637 - 10787570
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggttt 656  Q
    |||||||||||||| | || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10787637 catgatgaggttaaattcata-tgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttt 10787570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 9187430 - 9187384
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9187430 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 9187384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 636 - 682
Target Start/End: Original strand, 23994001 - 23994047
Alignment:
Q  636 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  23994001 atttggtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaaaggttct 23994047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20556502 - 20556457
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaata 279  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  20556502 gaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 20556457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22706437 - 22706397
Alignment:
Q  370 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22706437 ggttcctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagt 22706397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Original strand, 3841582 - 3841618
Alignment:
Q  241 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3841582 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 3841618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 9187321 - 9187258
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9187321 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 9187258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22706567 - 22706531
Alignment:
Q  241 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22706567 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 22706531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162 (Bit Score: 133; Significance: 8e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold2162
Description:

Target: scaffold2162; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 452
Alignment:
Q  17 gccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatcca 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  715 gccatcaatgaagatacaaggctagttaacttctctacctcagcccgaagtgttgttacttctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatcca 616  T
Q  117 tttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttgctggtagaa-acaa 215  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||| ||||||| |||  ||| |||| |||     
T  615 tcttttgtgtttgcacgagtgtctgcatatttgagccgaacttggatgaagacatctgaccactttactaatgaattgacccttttatgg-agaagacac 517  T
Q  216 aatatgagacacgtaccagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    | | ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  516 agtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 292 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 407 - 5
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttg-caaacggttcctttttcaaaaggtaa 390  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||  ||  |||  |||| ||||||| ||||||||    
T  407 gaaggacttgttaaagtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcattt-gaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaa 309  T
Q  391 gaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaa-gcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacc 483  Q
    ||||||||||||||||  |||      ||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  308 gaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagctaaaagcttagttaagattttg-gaagttgtatttctcggtgttcattcttacaaggtccatatc 210  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaa--------ttttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaa 575  Q
    | ||||||||        ||||||||||||||||||        |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209 cgtgatgttt-acaaaaacttgtctaagtccttcaaaaaaatttttttttgatgaaaaaggttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaa 111  T
Q  576 agtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
     ||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  110 -gtggatagaatacatggtgagggtaagttccacaacgttggagtcaatggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatca 13  T
Q  675 caggttct 682  Q
    | ||||||    
T  12 cgggttct 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 292 - 674
Target Start/End: Original strand, 4881 - 5268
Alignment:
Q  292 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaag 391  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||| |||  ||||||| |  |||| |  |||||||||||  ||| |||||    
T  4881 gaaggatttgtcaaagt-aattggaaacattatagaggaatatggtttcattt-gaaagttgtaaatatattgcgataggttccttttttcaaaagtaag 4978  T
Q  392 aacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatac--c 483  Q
    |||||||||||||||| |||     || ||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| |  |||||| |||| | |  |    
T  4979 aacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaacctaaagcttagttaagattttt-gaagtttgaatttcttggtgttcttctttacaaagtccgttcatc 5077  T
Q  484 catgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata 583  Q
      |||||||||        |||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  5078 tgtgatgtttgcaaaaaatttgtctaaatccttcgatattt-gatggaaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctatagtacata 5176  T
Q  584 gaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5177 gaatacatggtgaggttaagttcacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttcattttgtacctgtatca 5268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 343 - 659
Target Start/End: Original strand, 192297 - 192620
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||     || |||||||||||||||||||||||    
T  192297 tttgaaaattgtgaagatgttgcaatttgttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 192395  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatg--atgtttgnnnnnnn-cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaat 534  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | |  |||  |||||||        ||||||||| |||||| || ||| |||| |||     
T  192396 ttt-gaagttgcatttcttggtgttctttcttacaaggtccgttcatatgtgatgtttggaaaaaaacttgtctaaatccttcgatcttt-gatgcaaaa 192493  T
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacg 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  |||    
T  192494 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacttagaatacatggtgaggttaaatccacaatgttggagtttaagggtaaagacg 192593  T
Q  634 ccattt-ggtaaggactatggtttcaa 659  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  192594 ccatttgggtaaggactatggtttcaa 192620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 42 - 152
Target Start/End: Original strand, 192001 - 192111
Alignment:
Q  42 ttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctg 141  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||| || |||||  |  ||||||||||||||||||   ||||| |||||||  ||  | |||||| |||||| ||    
T  192001 ttaacttctctacctcggcctgaagtgtagtcacctcctcgggaagctcgtggacctcttctccaagttgatccatactttgtgtttgcatgagtgtttg 192100  T
Q  142 catatgcgagc 152  Q
    |||||||||||    
T  192101 catatgcgagc 192111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 350 - 682
Target Start/End: Original strand, 19394 - 19728
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| | |     || |||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19394 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaa-ggtaagaacaaaaccaaggaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgga- 19491  T
Q  445 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttta 543  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| ||||    
T  19492 gttgtatttcttggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagtt-ttta 19588  T
Q  544 tgaatgaatgcatgtatgcatggtt-atgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggt 642  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  19589 tgaatgaatgcatgtatgcatgatttatgctaaagaacatggaatgtatggtgaagttaagtccacaaagttggagtcaagggtaaagacgccatttggt 19688  T
Q  643 aaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  19689 aaggactatggtttcaaattgcacttgtatcacgggttct 19728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 18481 - 18527
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18481 gaaattatgaatacaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaatag 18527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 17520 - 17178
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| | ||| |||| |||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |     || |||||||||||||||||| ||||    
T  17520 tttgaaaaatgtgaagatgttgcaattggttccctttccaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttatgatt 17422  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatag 536  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| |  ||||||||        ||| |||||| ||||| || ||  |||   ||| |     
T  17421 ttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaagatcatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagcccttcgatattaatgagaaaaaaaa 17324  T
Q  537 ttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgcc 635  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  17323 gtttttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgcc 17224  T
Q  636 atttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17223 atttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacaggttct 17178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 374 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 30886 - 30575
Alignment:
Q  374 cctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaagtt-gtatctcttggtgttcatt 466  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||    
T  30886 cctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattttt-gaagtttggatttcttggtgttcctt 30789  T
Q  467 cttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatg 565  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30788 cttacaaggaccatatctttgatgttt-acaaaaacttatctaagtccttcgatattagtga-gaaaaaagtt-ttcatgaatgaatgcatgtatgcatg 30692  T
Q  566 gttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgt 664  Q
     ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  30691 attatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatgatttcaaa-tgt 30593  T
Q  665 acctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  30592 acctgtatcacgggttct 30575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 682
Target Start/End: Original strand, 5047 - 5385
Alignment:
Q  351 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    |||| |||| |||||||  | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||     || |||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  5047 ttgtgaagatgttgcaattgattcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagattttta-aa 5144  T
Q  445 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagt---tgt 540  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| ||    | |    
T  5145 gttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatcattgatgttt-acaggaacttatctaagtccttcgatattagtgagagaaaaagaaagttt 5243  T
Q  541 ttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttg 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||    
T  5244 ttatgaatgaatgcatgtatgcataattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagccaaggataacgacgccatttg 5343  T
Q  641 gtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  5344 gtaaggactatggtttcaaattgcacttgtaacaaaggttct 5385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 4929 - 4975
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4929 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 4975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 11043 - 11089
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11043 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 11089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1818 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1818
Description:

Target: scaffold1818; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 92 - 234
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  92 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgaatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 191  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  192 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 234 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 31463 - 31033
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 331  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || |||||    
T  31463 gaaattatgaatgtaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-aggaa 31366  T
Q  332 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagc 425  Q
    ||| | || |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||      || |||| | ||||    
T  31365 cattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-tgagaacgaaaccaaggaaaaagttctttaacaaaagttgaagc 31268  T
Q  426 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt- 524  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||      
T  31267 ttagttaagattttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattag 31170  T
Q  525 tgatggaaata---gttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tc 620  Q
    |||   ||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  31169 tgagaaaaaaaaaagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccgcaatgttggagctt 31071  T
Q  621 aagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 658  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31070 aaaggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttca 31033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 346 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10309
Alignment:
Q  346 gaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttt 440  Q
    ||||||||| |||| |||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     || |||| |||||||||||||||||||||    
T  10630 gaacattgttaagatgttgtaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggaaa-agttcttaacaaaaggtaaagcttagttaagattttt 10532  T
Q  441 tgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttg 539  Q
     |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||||||        ||  |||||||||||| || ||  |||  ||| |  ||     
T  10531 -gaagttgtatttcttggtgttcctttttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaactcatctaagtccttcgatattagtga--gaattttttt 10436  T
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  10435 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgtttatgctaatg------gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 10342  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10341 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 10309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 10936 - 10861
Alignment:
Q  26 aaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctctt 101  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  10936 aaagataccaggttggttcacttctctacctcggcccgaagtgtagtcacctcctcacgaagctcgtggacctctt 10861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8601 - 8459
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  8601 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagttcacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 8502  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  8501 tggtagggactatggtttcaaa-tctacctgtatcacgggttct 8459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8804 - 8665
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||     || |||||||||||||||||||||     
T  8804 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga- 8706  T
Q  437 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggt 476  Q
    ||||||||| ||| || ||| ||||||| | ||||||||||    
T  8705 tttttgaagtttggatttctgggtgttcttccttacaaggt 8665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 8915 - 8869
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  8915 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatag 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 415 - 672
Target Start/End: Original strand, 31714 - 31970
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttag-ttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtc 513  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||        ||  |||||||    
T  31714 aaagctaaagctttggttaagattttt-gaaattgtatttcttggtgttccttctcacaaggtccatatctttgatgtttgcaagaactttacctaagtc 31812  T
Q  514 cttcaattttt-tgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatg 612  Q
    |||| |||||  ||| | ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  31813 cttcgattttagtga-gaaaaaagtt-tttacgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatgctgaggttaagtccacaatg 31910  T
Q  613 ttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    |||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  31911 ttggagcttaagggtaacaacgacatttggtaaggactatgatttc-atttgtacctgtat 31970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 2430 - 2574
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaata--catgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgcca 636  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2430 tttatggatgaatgcatgcatgcatgataatgctaaagtacatagaatatacatggtgagggtaagttccacaatgttggagtcaagggtaacgacgcca 2529  T
Q  637 tttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  2530 tttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtattacgggttct 2574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 540 - 672
Target Start/End: Original strand, 4146 - 4278
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  4146 tttatgaatgaatgtatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatt 4245  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4246 tggtagggactatggtttc-atttgtacctgtat 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 481
Target Start/End: Original strand, 3947 - 4090
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||      |  ||||||| || ||||||||||     
T  3947 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaaaaaaaagctacagtttagttaaga- 4044  T
Q  437 tttttgaag-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4045 tttttgaagtttggatttcttggtgttccttcttacagggtccata 4090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 540 - 663
Target Start/End: Original strand, 20756 - 20880
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||    
T  20756 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagcgtaacaacgccatt 20855  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    | ||| |||||||||||||||||||    
T  20856 ttgtagggactatggtttcaaattg 20880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 343 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18122 - 17784
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagatt 437  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |     || ||||||||||||||||||||  |    
T  18122 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaag-gt 18025  T
Q  438 ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaat-tttttg---atggaaa 533  Q
    |||||||||||||      ||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  ||   |   |||    
T  18024 ttttgaagttgta------ggtgttccttcttacaaggtccatatctttgatgttt-acaagaacttatctaagtccttcgatattagtgagaaaaaaaa 17932  T
Q  534 tagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaac 632  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||    
T  17931 aagtt-tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatcaaatgcatggtgaggttaagtccataatgttggagcttaaggataacaac 17833  T
Q  633 gccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17832 gccatttggtagggacaatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 539 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 38815 - 38679
Alignment:
Q  539 gtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagt-ccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccat 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  38815 gtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattttgc--------atagaatacatggtgaggttaagttccacagtgttggagtcaaaggtaacaacgccat 38724  T
Q  638 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38723 ttggtaaggactatggtttcaaattttacctgtatcacgggttct 38679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0478
Description:

Target: scaffold0478; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 543 - 672
Target Start/End: Original strand, 314 - 443
Alignment:
Q  543 atgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttgg 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  314 atgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatcgaatggatggtgaggtcaagtccacaatgttggagtttaagggtaacaacgccatttgg 413  T
Q  642 taaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  414 taaggactatggtttc-atttgtacctgtat 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 280
Target Start/End: Original strand, 2 - 43
Alignment:
Q  239 tatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 43  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 351 - 477
Target Start/End: Original strand, 115 - 246
Alignment:
Q  351 ttgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    |||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  115 ttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggataaaagttcataacaaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaa 212  T
Q  445 g-ttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtc 477  Q
    | ||| || ||||||||||| | |||||||||||    
T  213 gtttggatttcttggtgttcttccttacaaggtc 246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 350 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 99089 - 98758
Alignment:
Q  350 attgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt-----acgaaagctaaagcttagttaagattttttgaa 444  Q
    ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |||     || |||| ||||| ||||||||||||||| |||    
T  99089 attgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaac-taagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagattagttaagattttt-gaa 98992  T
Q  445 gttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccatacccatgatgtttgnnnnnnncttgtctaagtccttcaattttt-tgatggaaatagttgttta 543  Q
     |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||        ||| |||||||||||| || ||  |||  |||| || | || |    
T  98991 attgtatttcttggtattccttcttacaaggtccatatgtttgatgttt-accagaacttatctaagtccttcgatattagtga--gaaaaaggt-ttaa 98896  T
Q  544 tgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggta 643  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |  ||| || ||||||||||    
T  98895 taaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaacgcatggtgaggttaagcccacaaagttggagccaaagataacgacaccatttggta 98796  T
Q  644 aggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  98795 aggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 98758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0441
Description:

Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9183
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgca-tggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccat 637  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||||| |||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9326 tttatgaatgaatgcatgtatgaaatgattatgccaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggcaacaacgccat 9227  T
Q  638 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||    
T  9226 ttggtagggactatggtttc-atttgtacttgtatcacgggttct 9183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 9622 - 9390
Alignment:
Q  240 atgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgca--aaaatagnnnnnnnnnnngaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatggc 337  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||           ||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||| |     
T  9622 atgaatgcaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaaaatagacacgtcttttgaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacattg- 9526  T
Q  338 ttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagga-aagagtacgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||  |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  |   |||||||||||||||||||     
T  9525 ttctatttgaaaattgtcaagatgttgcaattggttcccttttcaaga-gtaagaacgaaaccaaggataaaagctc-ttagctaaagcttagttaaga- 9429  T
Q  437 tttttgaagttgt-atctcttggtgttcattcttacaagg 475  Q
     ||||||| || | || ||||||||||| |||||||||||    
T  9428 -ttttgaaattttgatttcttggtgttccttcttacaagg 9390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10184 - 10000
Alignment:
Q  18 ccatcaataaagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccat 117  Q
    |||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   ||||||    
T  10184 ccatcagtgaagataccagattagttaacttctctacctcggcccgaagtgttgttacctcttcacgaacctcgtggacctcttgctcaagctaatccat 10085  T
Q  118 ttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattgaacgactttactgatggattgaccttttg 202  Q
     |||  | |||| || ||||| ||||||||| ||| ||| ||| | | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  10084 cttttgtgtttgtacaagtgtttgcatatgctagctgaagttgaaagaagacattagaccactttactgatggattgaccttttg 10000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Original strand, 9352 - 9442
Alignment:
Q  27 aagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccat 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9352 aagatactaggttaggtaacttctctacctcggcccgaagtgttgttttctcttcgcgaagctcgtggacctcttgctcaagttgatccat 9442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 535 - 659
Target Start/End: Complemental strand, 301297 - 301177
Alignment:
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgc 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  301297 agttgtttatgaatgaatgcatgtatga----tattgctaaagaacatagaacacatggtgaggttaaatccacaatattggagtcaagggtaacaacgc 301202  T
Q  635 catttggtaaggactatggtttcaa 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  301201 catttggtaaggactatggtttcaa 301177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 301724 - 301586
Alignment:
Q  59 gcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaact 158  Q
    ||||||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||| ||  | ||||||  |||||  |||| ||||||| ||| |    
T  301724 gcccgaagtcttgtcacttcttcacgaagctcgtcgaccttttgttcaagttgatccattctttgtgtttgcaatagtgttcgcatgtgcgagctgaatt 301625  T
Q  159 tggatggagacattgaacgactttactgatggattgacc 197  Q
    ||  || ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  301624 tgagtgaagagatcaaaccactttaccgatggattgacc 301586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 502 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 11545 - 11374
Alignment:
Q  502 cttgtctaagtccttcaattttttgatggaaatagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggtt 600  Q
    ||||||||| |||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||  ||| ||||| |||||||    
T  11545 cttgtctaaatccttcgatgttt-gatggcaaaagttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctacacaaacagtgaaaacatggtgaggtt 11447  T
Q  601 aagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    |||  || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11446 aagctcataatgttggagtcaagggtaaaaacgcaatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatca 11374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11926 - 11857
Alignment:
Q  82 acgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagc 152  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11926 acgaagctc-tggacctcttgttcaagttgatccattttatgtgtttgcacgagtgtttgcatatgtgagc 11857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8270 - 8134
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||     | ||||  |||||| ||||||    
T  8270 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaagtccataatgt-----ttaaggataacaacaccattt 8176  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8175 ggtagggactatggtttcaaa-tgtacctgtatcacgggttct 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 540 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 16811 - 16685
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||       ||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  16811 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaaagaacatggaatgcatggtgaggttaag-------tgttggagtcaagggtaaagtcgccattt 16719  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatca 674  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16718 ggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgtatca 16685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17105 - 17062
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17105 gaaattatgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 17062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 540 - 672
Target Start/End: Original strand, 1872 - 1998
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||    
T  1872 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctaatg------gaatgcatggtgaggttaagtccacaatgttggagtttaagggtaagagcgccatt 1965  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1966 tggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtat 1998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Original strand, 1382 - 1528
Alignment:
Q  27 aagatactaggctagttaacttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctat 126  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||   | |    
T  1382 aagataccaggttggttaacttctctacctcggcccaaagtgtagtcacctcctcacgaagctcatggacctcttgttcaaattgatccattttatgtgt 1481  T
Q  127 ttgcacgagtgtctgcatatgcgagccgaacttggatggagacattg 173  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||    
T  1482 ttgcacgagtgtttgcatatgcgagctgaagttgaatgaagacattg 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 280
Target Start/End: Original strand, 1580 - 1625
Alignment:
Q  234 gaaactatgaa-tgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1580 gaaactatgaaatgcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaaaatag 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 343 - 481
Target Start/End: Original strand, 25380 - 25522
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |      || ||||||||||||||||||||||    
T  25380 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 25478  T
Q  437 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25479 ttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaaggaccata 25522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 672
Target Start/End: Original strand, 14601 - 14684
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14601 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaacaacgccatttggtaaggactatggtttc-aattgtacctgtat 14684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 280
Target Start/End: Original strand, 14277 - 14317
Alignment:
Q  240 atgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14277 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 14317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 343 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3968 - 3834
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagcttagttaagat 436  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     || ||||||||||||||||||||||    
T  3968 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 3870  T
Q  437 tttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 473  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3869 tttt-gaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 3834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 3768 - 3626
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatag--aatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccat 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | || |  || ||||| ||| |||| ||| | |||| |||||||||||  ||  | |||||    
T  3768 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgccacacaa-atggtgaaaacatggtgatgttaggtctataatgatggagtcaaggaaaaacatgccat 3670  T
Q  638 ttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  3669 ttggtaaggactatggtttcaca-tgtacctgtatcacgggttct 3626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 291 - 433
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |  | |   ||| | ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  291 tttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgctgcacaaacggtgaaaaaatggtgatgttaggtccacaatgtcggagtcaagggtaacaacgccatt 390  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  391 tggtaaggactatggtttcata-tgtacctgtattacgggttct 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 343 - 407
Target Start/End: Original strand, 96 - 159
Alignment:
Q  343 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  96 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 23085 - 23177
Alignment:
Q  589 catgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  23085 catggtgaggttaagtccacaatgttggagcttagggtaacaatgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 23177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 407
Target Start/End: Original strand, 22886 - 22922
Alignment:
Q  370 ggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaa 407  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22886 ggttcctttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaa 22922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 277
Target Start/End: Original strand, 22743 - 22779
Alignment:
Q  241 tgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaa 277  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  22743 tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 22779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 234 - 473
Target Start/End: Original strand, 37076 - 37319
Alignment:
Q  234 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatagnnnnnnnnnnn--gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaa 331  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||             ||||||||| ||||||| ||||||| || |  || |||||    
T  37076 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacattttttatttgaaggacttgtcaaagt-aattgtagacttgataaaggaa 37174  T
Q  332 catggcttcattttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaga-gt-----acgaaagctaaagc 425  Q
    ||| | || |||| |||  |||| |||| |||||||   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||     || |||||||||||    
T  37175 cattgttttattt-gaaatttgtgaagatgttgcaattagttcccttttcaaaag-taagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagc 37272  T
Q  426 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaa 473  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37273 ttagttaagatttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttcttacaa 37319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 594 - 672
Target Start/End: Original strand, 37438 - 37516
Alignment:
Q  594 tgaggttaagtccacaatgttggag-tcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  37438 tgaggttaagtccacaatgttggagcttaagggtaaaaacgccatttggtaaggactacgatttc-atttgtacctgtat 37516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 540 - 672
Target Start/End: Original strand, 208 - 340
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagta-catagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatt 638  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  | |   ||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  208 tttatgaatgaaagcatgtatgcatgattatgctacacaaacggtgaaaacatgctgatgttaggtccacaatgtcgaagtcaagggtaacaacgccatt 307  T
Q  639 tggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtat 672  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  308 tggtaagaactatggtttc-atttgtacctgtat 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0866 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0866
Description:

Target: scaffold0866; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 582 - 682
Target Start/End: Original strand, 4586 - 4684
Alignment:
Q  582 tagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttc 681  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4586 tagaaaacatggtgaggttgagtccataaagttggagtcaaggg-tacaatgctatttggtaaggactatggttt-aaattgtacttgtatcacaggttc 4683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 594 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 299507 - 299420
Alignment:
Q  594 tgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  299507 tgaggttaacttcacaatgttggagccaaggatatcgacgccatttggtaaggactatggtttcaaa-tgtacctgcatcacgggttct 299420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 481
Target Start/End: Original strand, 33885 - 34029
Alignment:
Q  342 ttttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt------acgaaagctaaagcttagttaaga 435  Q
    ||||||| || || || |||||||||  |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||      || ||||||| |||||||||||||    
T  33885 ttttgaaaatcgtgaaaacgttgcaattggttcccttttcaaaag-taagaaggaaaccaaggaaaaagttctttaacaaaagctatagcttagttaaga 33983  T
Q  436 ttttttgaagtt-gtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33984 ttttt-gaagtttggatttcttggtgttctttcttacaaggtccata 34029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 535 - 682
Target Start/End: Original strand, 185841 - 185989
Alignment:
Q  535 agttgtttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacata----gaatacatgatgaggttaa--gtccacaatgttggagtcaagggcaa 628  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||| |    ||| ||||| ||||||| |  | ||| || | |||||||||||| |     
T  185841 agttatttatgaatgaatgcatgtatgcatgattatgct---gtacaaacggtgaaaacatggtgaggtttaaggcccataacgatggagtcaagggtat 185937  T
Q  629 caacgccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  185938 -aacgccatttggtaaggactatggtttc-atttgtacctgtatcacgggttct 185989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 152
Target Start/End: Original strand, 184024 - 184094
Alignment:
Q  82 acgaagctcgtggacctcttgctcaagtcgatccatttttcctatttgcacgagtgtctgcatatgcgagc 152  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||   | ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  184024 acgaagctcatggacctcttgttcaagttgatccattttatgtgtttgcacgagtgtttgcatatgtgagc 184094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Original strand, 184177 - 184214
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  184177 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 184214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 105
Target Start/End: Original strand, 29015 - 29074
Alignment:
Q  46 cttcactacctcagcccgaagtgttgttacctctccacgaagctcgtggacctcttgctc 105  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29015 cttctctatctcggcccgaagtgttgtcacctcttcacgaagctcgtggaccgcttgctc 29074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 540 - 682
Target Start/End: Original strand, 29511 - 29653
Alignment:
Q  540 tttatgaatgaatgcatgtatgcatggttatgctaaagtacatagaatacatgatgaggttaagtccacaatgttggagtcaagggcaacaacgccattt 639  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||  |||| ||||| || ||| | ||||| |||||||  | ||| || ||  | |||||||    
T  29511 tttatgaatgtatgcatgtatgaatgaatatgctaaagaacggagaaaacatggtgtggtgaggtccataatgttgtggccaatggtaaacatgccattt 29610  T
Q  640 ggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||| |||||||| ||||||    
T  29611 ggtaaggactatgattttcaaatgtacatgtatcacgggttct 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 610 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 84374 - 84320
Alignment:
Q  610 atgttggagtcaa-gggcaacaacgccatttggtaaggactatggtttcaaattg 663  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  84374 atgttggagtcaaagggtaacaacgccatttggtaaggactaaggttttaaattg 84320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 152104 - 152039
Alignment:
Q  415 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaaggtccata 481  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  152104 aaagctaaagtttagttaagactttt-gaagttgtatttcttggtgctcctttttacaaggtccata 152039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0782 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0782
Description:

Target: scaffold0782; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 5938 - 5901
Alignment:
Q  243 aatgcaaaatgatgcatgataggcttatgcaaaaatag 280  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5938 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 5901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 634 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 22748 - 22701
Alignment:
Q  634 ccatttggtaaggactatggtttcaaattgtacctgtatcacaggttct 682  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  22748 ccatttggtaaggactatggttt-tatttgtacctgtatcacgggttct 22701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University