View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF12283_low_3 (Length: 307)

Name: NF12283_low_3
Description: NF12283
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF12283_low_3
NF12283_low_3
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (19-289)||(8522430-8522700)
[»] chr5 (9 HSPs)
chr5 (28-289)||(42122807-42123068)
chr5 (19-286)||(34233286-34233553)
chr5 (19-286)||(34241059-34241326)
chr5 (32-289)||(42128202-42128458)
chr5 (63-286)||(42117059-42117285)
chr5 (32-297)||(41618164-41618430)
chr5 (32-297)||(41572525-41572791)
chr5 (171-289)||(41714168-41714286)
chr5 (28-120)||(41714060-41714152)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (32-289)||(11117464-11117727)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (32-289)||(25523540-25523800)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (19-289)||(11994893-11995167)
chr2 (19-289)||(12247763-12248036)
chr2 (169-287)||(9423378-9423496)
chr2 (213-289)||(32682381-32682457)
chr2 (154-198)||(32682349-32682393)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 19 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8522700 - 8522430
Alignment:
Q  19 caataatcgtcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttg 118  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8522700 caataatcgtcttgtgggagaaatacctcagggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcttatgaaggaaacttggatttatgtggattacccttg 8522601  T
Q  119 tcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522600 tcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaacaacttttgcagtgaagagaagtttgaatttggatggaaaccagtggcaattggat 8522501  T
Q  219 acggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522500 acggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 8522430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 9)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42123068 - 42122807
Alignment:
Q  28 tcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatg 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||      
T  42123068 tcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcagttcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaattcagggttatgtggattacccttgtcaaaaaaa 42122969  T
Q  128 tgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  42122968 tgtggacctgaacaacattctccaccttcagccaagaactcttggagtgaagagaaatttagatttggatggaaaccagtggcgattggatatggatgtg 42122869  T
Q  228 gatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42122868 gatttgtgattggaatatgcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 42122807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Original strand, 34233286 - 34233553
Alignment:
Q  19 caataatcgtcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttg 118  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34233286 caataaccatcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcttataaagggaacttggggttatgtggattacccttg 34233385  T
Q  119 tcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggat 218  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34233386 tcaaagaaatgtggaccggaacaacattctccaccttcagccaacaacttttggagtgaagagaaatttggctttggatggaaaccagtggcaattggtt 34233485  T
Q  219 acggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatgg 286  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34233486 atggatgtggatttgtgtttggaataggccttggatattatatgtttttaattggaaagcctagatgg 34233553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 286
Target Start/End: Original strand, 34241059 - 34241326
Alignment:
Q  19 caataatcgtcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttg 118  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34241059 caataaccatcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcttataaagggaacttggggttatgtggattacccttg 34241158  T
Q  119 tcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggat 218  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34241159 tcaaagaaatgtggaccggaacaacattctccaccttcagccaacaacttttggagtgaagagaaatttggctttggatggaaaccagtggcaattggtt 34241258  T
Q  219 acggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatgg 286  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34241259 atggatgtggatttgtgtttggaataggccttggatattatatgtttttaattggaaagcctagatgg 34241326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 32 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 42128458 - 42128202
Alignment:
Q  32 gtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatgtgtg 131  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  42128458 gtgggagaaatacctcaaggaccgcaattcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaacttggggttatgtggatttcccttgtcaaagaattgtg 42128359  T
Q  132 gacctgaacaacattctgcacct-tcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtggat 230  Q
    |||||||||||  |||  ||  | |  | |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42128358 gacctgaacaa--ttccacaattctttgacaacaactcttggagtgaagagaaatttagatttggatggaaaccagtggcgattggatatggatgtggat 42128261  T
Q  231 ttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42128260 ttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattgaaaagtctagatggctt 42128202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 42117285 - 42117059
Alignment:
Q  63 atacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaa 162  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||    
T  42117285 atacatttccaaatgattcctacaaaggaaacttgggtttatgtggatttccgttgtcaaagatttgtggacctgaacatcattctccaatttcagccaa 42117186  T
Q  163 ccac---ttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattat 259  Q
    | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42117185 caacagcttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaagcagtggcaattggatatggatgtggatttgtgattggaataggcattggatatttt 42117086  T
Q  260 atgtttttaattggaaagcctagatgg 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  42117085 atgtttttaattggaaagcctagatgg 42117059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Original strand, 41618164 - 41618430
Alignment:
Q  32 gtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatgtgtg 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  41618164 gtgggagaaatacctcaaggaaaacagttcaatacattttccaatgactcatatgaaggaaacttgggattatgcggatttcccttgtcaaagaaatgtg 41618263  T
Q  132 gacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtggatt 231  Q
     |||||||||||||||| | | | || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  41618264 aacctgaacaacattctccgcttccacccaacaacctttggagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggctattggatatggatgtggaat 41618363  T
Q  232 tgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt-tgatgatg 297  Q
     || |||||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41618364 ggttattggaataggccttggatgttttgtgttgttaattggaaagcctagatggcttgtgatgatg 41618430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 297
Target Start/End: Original strand, 41572525 - 41572791
Alignment:
Q  32 gtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatgtgtg 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||    
T  41572525 gtgggagaaatacctcaaggaaaacagttcaatacattttccaatgactcatatgaaggaaacttgggattatgcggatttcccttgtcaaagaaatgtg 41572624  T
Q  132 gacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtggatt 231  Q
     |||||||||||||||| | | | || ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  41572625 aacctgaacaacattctccgcttccacccaacaacctttggagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggctattggatatggatgtggaat 41572724  T
Q  232 tgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt-tgatgatg 297  Q
     || |||||||||||| |||||| || | |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41572725 ggttattggaataggccttggatgttttgtgttgttaaccggaaagcctagatggcttgtgatgatg 41572791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 289
Target Start/End: Original strand, 41714168 - 41714286
Alignment:
Q  171 gcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaat 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  41714168 gcagtgcagagaaatttggatttggatggaaagcagtggcaattggatatggatgtggatttgtgattggaataggcattgggtattacatgtttttgat 41714267  T
Q  271 tggaaagcctagatggctt 289  Q
     ||||||||||||||||||    
T  41714268 cggaaagcctagatggctt 41714286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 120
Target Start/End: Original strand, 41714060 - 41714152
Alignment:
Q  28 tcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtc 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  41714060 tcttgtgggagaaatacctcaaggaaagcagttcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaacttggggttatgtggatttcccttgtc 41714152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 32 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11117727 - 11117464
Alignment:
Q  32 gtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatgtgtg 131  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  11117727 gtgggagaaatacctcaaggaaagcaattcaatacatttacaaatgattcctatgaaggaaattcagggttatgtggattacccttgtcaaagaaatgtg 11117628  T
Q  132 gacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccacttttgc------agtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatg 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |      | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  11117627 gacctgaacaacattctccaccttcagccaacaactcttcctcttggaatgaagagaaatttggatttggatggaaagcagtggcaattggatatgcatg 11117528  T
Q  226 tggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11117527 tggatttgtgattggaataagcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 11117464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 289
Target Start/End: Original strand, 25523540 - 25523800
Alignment:
Q  32 gtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttgtcaaaaatgtgtg 131  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
T  25523540 gtgggagaaatacctagaggaaagcaattcaacacatttacaaatgattcctatgaaggaaacttggggttatgtggatttcccttgtcaaagagatgtg 25523639  T
Q  132 gacctgaacaacattctgcaccttcagccaacca---cttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtgg 228  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  25523640 gacttgaacaacattctccaccttcacccaacaaaaacttttggagtgaagagaaatttggatttggatggataccggtggtaattggatatggatgtgg 25523739  T
Q  229 atttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25523740 atttctgattggaataggcattggatattgtatgtttttagttggaaagcctagatggctt 25523800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 289
Target Start/End: Original strand, 11994893 - 11995167
Alignment:
Q  19 caataatcgtcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattca-atacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattaccctt 117  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| || |||  | || ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11994893 caataaccatctagtgggagaaatacctcgaggaaaacagttccgagacattttcaaatgattcatatgtaggaaacttggagttatgtgaatttccctt 11994992  T
Q  118 gtcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccac---ttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaatt 214  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11994993 gtcaaagaagtgcggacctgaacaacgttctccaccttcacccaacaacagcttttcgagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaatt 11995092  T
Q  215 ggatacggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995093 ggatatggatgtggatttgtgattggaataggcctcggatattgtatgtttttaattggaaagcctagatggctt 11995167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12248036 - 12247763
Alignment:
Q  19 caataatcgtcttgtgggggaaatacctcaaggaaagcaattcaatacttttacaaatgattcctatgaaggaaacttagagttatgtggattacccttg 118  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||||| |||||| || ||| | || ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12248036 caataaccatctagtgggagaaatacctcgaggaaaacagttcgagacattttcaaatgattcatatgtaggaaacttggagttatgtggatttcccttg 12247937  T
Q  119 tcaaaaatgtgtggacctgaacaacattctgcaccttcagccaaccac---ttttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattg 215  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |||||  |||||||   ||| ||   ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12247936 tcaaagaagtgtggacctgaacaatattctcaaccttcacttaacaacagcttttggagcgacgcgaaatttggatttggatggaaaccggtggcaattg 12247837  T
Q  216 gatacggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12247836 gatatggatgtggatttgtgattggaataggcctcggatattgtatgtttttaattggaaagcctagatggctt 12247763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 287
Target Start/End: Original strand, 9423378 - 9423496
Alignment:
Q  169 ttgcagtgaagagaaatttggatttggatggaaaccagtggcaattggatacggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgttttta 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| |||||| || |||| | |||    
T  9423378 ttgcaatgaagagaaatttggatttggatggaaatcagtggcaattggatatggatgtggaatggtgcttggaaaaggccttggatgttgtatgctgtta 9423477  T
Q  269 attggaaagcctagatggc 287  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9423478 attggaaagcctagatggc 9423496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 213 - 289
Target Start/End: Original strand, 32682381 - 32682457
Alignment:
Q  213 ttggatacggatgtggatttgtgattggaataggcattggatattatatgtttttaattggaaagcctagatggctt 289  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32682381 ttggatatggatgtggatttgtgattggaataggcattggatactttatgtttttaattggaaagcctagatggctt 32682457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 198
Target Start/End: Original strand, 32682349 - 32682393
Alignment:
Q  154 ttcagccaaccacttttgcagtgaagagaaatttggatttggatg 198  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  32682349 ttcagccaacaactttcggagtgaagagaaatttggatatggatg 32682393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University